View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5226_low_2 (Length: 612)

Name: NF5226_low_2
Description: NF5226
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5226_low_2
NF5226_low_2
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (11-593)||(6572243-6572825)
chr4 (11-593)||(14760608-14761190)
chr4 (11-593)||(24589663-24590245)
chr4 (11-593)||(36341819-36342401)
chr4 (11-593)||(54835776-54836358)
chr4 (11-593)||(34186262-34186844)
chr4 (11-593)||(39853022-39853604)
chr4 (11-593)||(17015431-17016013)
chr4 (11-593)||(14667401-14667983)
chr4 (11-593)||(18797916-18798498)
chr4 (11-593)||(24115047-24115629)
chr4 (11-593)||(27160619-27161201)
chr4 (11-593)||(30756145-30756727)
chr4 (11-593)||(33671102-33671684)
chr4 (11-593)||(18314480-18315062)
chr4 (11-593)||(5008260-5008842)
chr4 (11-593)||(14100928-14101510)
chr4 (11-593)||(21972086-21972668)
chr4 (11-593)||(40102939-40103521)
chr4 (11-593)||(31123814-31124396)
chr4 (13-593)||(15230259-15230839)
chr4 (11-593)||(1902638-1903221)
chr4 (13-593)||(15282230-15282810)
chr4 (15-574)||(15388699-15389258)
chr4 (180-556)||(19766893-19767269)
chr4 (180-556)||(14726138-14726514)
chr4 (408-557)||(22146907-22147056)
chr4 (180-557)||(1882437-1882814)
chr4 (180-244)||(22147221-22147285)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (11-593)||(18711855-18712437)
chr8 (11-593)||(27606168-27606750)
chr8 (11-593)||(18793076-18793657)
chr8 (11-592)||(2134524-2135105)
chr8 (11-593)||(14559995-14560577)
chr8 (11-593)||(19676818-19677400)
chr8 (11-593)||(19690469-19691051)
chr8 (11-593)||(28359215-28359797)
chr8 (11-593)||(33261105-33261687)
chr8 (11-593)||(31356899-31357481)
chr8 (11-593)||(9356996-9357578)
chr8 (11-593)||(19205625-19206207)
chr8 (11-593)||(29831697-29832279)
chr8 (11-593)||(31487134-31487717)
chr8 (11-525)||(16285814-16286328)
chr8 (11-593)||(12089986-12090568)
chr8 (11-292)||(16279921-16280202)
chr8 (15-574)||(22078193-22078751)
chr8 (11-174)||(3327186-3327349)
chr8 (180-556)||(14211579-14211955)
chr8 (184-556)||(22411482-22411854)
chr8 (180-592)||(16767863-16768275)
chr8 (180-556)||(19843707-19844083)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (11-593)||(18289698-18290280)
chr3 (11-593)||(7075539-7076121)
chr3 (11-593)||(18274397-18274979)
chr3 (11-593)||(18304999-18305581)
chr3 (11-593)||(29146101-29146683)
chr3 (11-593)||(20068373-20068955)
chr3 (11-593)||(48468260-48468842)
chr3 (11-593)||(4723964-4724546)
chr3 (11-593)||(6204236-6204818)
chr3 (11-593)||(15738439-15739021)
chr3 (11-593)||(22868193-22868775)
chr3 (11-593)||(22883252-22883834)
chr3 (11-593)||(32441484-32442066)
chr3 (11-592)||(22384924-22385505)
chr3 (11-593)||(4793980-4794562)
chr3 (11-593)||(35883099-35883681)
chr3 (11-593)||(10398477-10399059)
chr3 (11-593)||(18053595-18054177)
chr3 (11-593)||(18332970-18333545)
chr3 (11-593)||(8214068-8214650)
chr3 (11-593)||(8298304-8298886)
chr3 (11-593)||(20574188-20574770)
chr3 (11-593)||(8286815-8287397)
chr3 (11-593)||(11107697-11108279)
chr3 (11-593)||(21677036-21677618)
chr3 (11-593)||(15890050-15890632)
chr3 (11-593)||(47025786-47026368)
chr3 (11-593)||(29662315-29662897)
chr3 (11-593)||(31961800-31962382)
chr3 (11-593)||(5593702-5594284)
chr3 (11-593)||(7998893-7999475)
chr3 (11-593)||(4344021-4344603)
chr3 (11-593)||(51784356-51784938)
chr3 (11-593)||(6540087-6540669)
chr3 (11-593)||(18245074-18245656)
chr3 (11-593)||(28113299-28113881)
chr3 (11-593)||(17982294-17982876)
chr3 (11-593)||(28023615-28024197)
chr3 (11-593)||(5016047-5016629)
chr3 (11-593)||(24330496-24331078)
chr3 (11-593)||(10645406-10645988)
chr3 (11-593)||(4419248-4419830)
chr3 (11-593)||(5469321-5469903)
chr3 (11-593)||(18227529-18228111)
chr3 (11-593)||(5606659-5607241)
chr3 (11-593)||(18532716-18533298)
chr3 (12-593)||(28341511-28342092)
chr3 (13-593)||(16621835-16622415)
chr3 (11-593)||(19696824-19697405)
chr3 (11-174)||(36994962-36995125)
chr3 (180-556)||(22958955-22959331)
chr3 (180-556)||(11925740-11926116)
chr3 (189-575)||(41439754-41440140)
chr3 (180-556)||(16430907-16431283)
chr3 (180-574)||(15918019-15918413)
chr3 (189-575)||(20442628-20443014)
chr3 (180-553)||(24208959-24209332)
chr3 (180-574)||(15593275-15593669)
chr3 (180-593)||(7089372-7089785)
chr3 (393-586)||(5951154-5951347)
chr3 (393-586)||(46380049-46380242)
chr3 (408-553)||(15704203-15704348)
chr3 (180-557)||(6963814-6964191)
chr3 (408-544)||(6571084-6571220)
chr3 (450-557)||(4446207-4446314)
chr3 (180-244)||(4442594-4442658)
chr3 (180-283)||(6570856-6570959)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (11-593)||(33779868-33780450)
chr5 (11-593)||(15655957-15656539)
chr5 (11-593)||(22996316-22996898)
chr5 (11-592)||(41677084-41677665)
chr5 (11-593)||(11551734-11552316)
chr5 (11-593)||(33294907-33295489)
chr5 (11-593)||(18497924-18498506)
chr5 (11-593)||(30937015-30937596)
chr5 (11-593)||(37668685-37669267)
chr5 (12-593)||(40470749-40471330)
chr5 (11-593)||(30170848-30171430)
chr5 (11-593)||(24972285-24972867)
chr5 (11-589)||(32593477-32594055)
chr5 (11-593)||(28651621-28652203)
chr5 (11-593)||(23628348-23628931)
chr5 (11-593)||(13322029-13322611)
chr5 (11-593)||(24685344-24685926)
chr5 (11-593)||(31823606-31824188)
chr5 (11-593)||(31433843-31434425)
chr5 (11-593)||(43080634-43081216)
chr5 (11-593)||(24726348-24726930)
chr5 (11-593)||(2513441-2514023)
chr5 (11-593)||(9319855-9320437)
chr5 (12-593)||(3791921-3792502)
chr5 (11-593)||(12134554-12135136)
chr5 (11-593)||(23894585-23895167)
chr5 (11-593)||(34618897-34619479)
chr5 (11-593)||(5640167-5640749)
chr5 (11-593)||(18372733-18373315)
chr5 (11-593)||(28956984-28957566)
chr5 (11-593)||(37355842-37356424)
chr5 (11-593)||(6876684-6877266)
chr5 (11-593)||(8662674-8663256)
chr5 (11-593)||(26482773-26483355)
chr5 (11-593)||(30154410-30154992)
chr5 (11-593)||(33518759-33519341)
chr5 (11-593)||(15756051-15756633)
chr5 (11-593)||(30031807-30032389)
chr5 (11-593)||(37768190-37768772)
chr5 (11-593)||(37757362-37757944)
chr5 (13-593)||(22890846-22891424)
chr5 (66-593)||(25202712-25203239)
chr5 (66-593)||(25266867-25267394)
chr5 (11-509)||(24683821-24684319)
chr5 (180-575)||(34468170-34468565)
chr5 (180-553)||(3484442-3484815)
chr5 (393-586)||(37000822-37001015)
chr5 (390-586)||(15784931-15785127)
chr5 (393-586)||(31520068-31520261)
chr5 (393-586)||(36376168-36376361)
chr5 (180-557)||(352450-352827)
chr5 (393-586)||(5440431-5440624)
chr5 (393-586)||(17956857-17957050)
chr5 (180-592)||(20389189-20389601)
chr5 (393-586)||(11944628-11944813)
chr5 (11-70)||(25201411-25201470)
chr5 (11-70)||(25265566-25265625)
[»] scaffold0089 (6 HSPs)
scaffold0089 (11-593)||(44293-44875)
scaffold0089 (132-593)||(2560-3021)
scaffold0089 (265-593)||(32447-32775)
scaffold0089 (132-267)||(37727-37862)
scaffold0089 (11-100)||(37861-37950)
scaffold0089 (67-100)||(2528-2561)
[»] chr6 (42 HSPs)
chr6 (11-593)||(22932129-22932711)
chr6 (11-593)||(23854574-23855156)
chr6 (11-593)||(26920746-26921328)
chr6 (11-593)||(15421565-15422147)
chr6 (11-593)||(16676509-16677091)
chr6 (11-593)||(16752190-16752772)
chr6 (11-593)||(24866085-24866667)
chr6 (11-593)||(27021505-27022087)
chr6 (11-593)||(3698452-3699034)
chr6 (11-593)||(13296196-13296778)
chr6 (11-593)||(34461751-34462333)
chr6 (12-593)||(27287609-27288190)
chr6 (11-593)||(26991258-26991844)
chr6 (11-593)||(27269832-27270414)
chr6 (11-593)||(27010100-27010682)
chr6 (11-593)||(27487502-27488084)
chr6 (11-593)||(27626956-27627538)
chr6 (11-593)||(4775249-4775831)
chr6 (11-593)||(29575383-29575965)
chr6 (11-593)||(29503785-29504367)
chr6 (11-593)||(16941272-16941854)
chr6 (11-592)||(4760132-4760713)
chr6 (11-593)||(4543019-4543601)
chr6 (11-593)||(26113657-26114239)
chr6 (11-593)||(30555261-30555843)
chr6 (11-593)||(4527653-4528236)
chr6 (11-593)||(28209823-28210405)
chr6 (11-593)||(4721380-4721962)
chr6 (177-593)||(29552092-29552508)
chr6 (11-589)||(17089692-17090270)
chr6 (11-593)||(20162989-20163571)
chr6 (11-593)||(22169260-22169842)
chr6 (11-283)||(27046756-27047028)
chr6 (308-593)||(27060172-27060457)
chr6 (11-172)||(29551849-29552011)
chr6 (180-556)||(18119007-18119383)
chr6 (180-556)||(18212951-18213327)
chr6 (393-586)||(9136605-9136798)
chr6 (184-556)||(23972052-23972424)
chr6 (180-592)||(27544440-27544852)
chr6 (40-111)||(29552016-29552087)
chr6 (180-244)||(25706625-25706689)
[»] scaffold0143 (5 HSPs)
scaffold0143 (11-593)||(29665-30247)
scaffold0143 (155-593)||(18585-19024)
scaffold0143 (155-331)||(17894-18071)
scaffold0143 (13-134)||(18069-18190)
scaffold0143 (13-134)||(18466-18587)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (11-593)||(5130365-5130947)
chr7 (11-593)||(2156943-2157525)
chr7 (11-593)||(10914056-10914638)
chr7 (9-593)||(26535060-26535644)
chr7 (11-593)||(11421966-11422548)
chr7 (11-593)||(26272273-26272855)
chr7 (11-593)||(26437626-26438208)
chr7 (11-592)||(2107351-2107932)
chr7 (11-592)||(16515618-16516199)
chr7 (11-593)||(5144527-5145109)
chr7 (11-593)||(26515161-26515743)
chr7 (11-589)||(11443256-11443834)
chr7 (11-593)||(9621019-9621601)
chr7 (11-593)||(4142433-4143015)
chr7 (11-593)||(4201758-4202340)
chr7 (11-593)||(26317035-26317617)
chr7 (11-593)||(31561577-31562159)
chr7 (11-593)||(3447675-3448257)
chr7 (11-593)||(16748704-16749286)
chr7 (11-593)||(17525903-17526485)
chr7 (11-593)||(24589721-24590303)
chr7 (11-593)||(26667101-26667683)
chr7 (11-593)||(45389589-45390171)
chr7 (11-593)||(16447193-16447775)
chr7 (11-593)||(16043688-16044270)
chr7 (11-506)||(17526816-17527311)
chr7 (11-530)||(16733714-16734230)
chr7 (155-593)||(10843181-10843619)
chr7 (155-593)||(10844133-10844571)
chr7 (180-575)||(798728-799123)
chr7 (180-556)||(15192621-15192997)
chr7 (180-575)||(16287584-16287979)
chr7 (180-556)||(2556073-2556449)
chr7 (13-134)||(10844014-10844135)
chr7 (180-556)||(29089054-29089430)
chr7 (180-592)||(16237019-16237431)
chr7 (390-586)||(9469068-9469264)
chr7 (13-134)||(10843617-10843738)
chr7 (393-586)||(16393628-16393821)
chr7 (393-586)||(30370140-30370333)
chr7 (408-556)||(25726263-25726411)
chr7 (180-592)||(1893763-1894175)
chr7 (408-523)||(25721027-25721142)
chr7 (11-61)||(16501113-16501163)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (11-593)||(20840284-20840866)
chr2 (11-593)||(23125859-23126441)
chr2 (11-593)||(28884578-28885160)
chr2 (11-593)||(37377542-37378124)
chr2 (11-593)||(9347277-9347859)
chr2 (11-593)||(27806074-27806656)
chr2 (11-593)||(40235879-40236461)
chr2 (11-593)||(12589179-12589761)
chr2 (11-593)||(12657907-12658489)
chr2 (11-593)||(27431732-27432314)
chr2 (11-589)||(39049114-39049692)
chr2 (11-593)||(258044-258626)
chr2 (11-593)||(13933838-13934420)
chr2 (11-593)||(11632475-11633057)
chr2 (11-593)||(12713892-12714474)
chr2 (11-593)||(32052174-32052756)
chr2 (11-593)||(37683186-37683768)
chr2 (11-593)||(37698451-37699033)
chr2 (11-593)||(19413792-19414374)
chr2 (11-593)||(31878657-31879239)
chr2 (11-593)||(16826629-16827211)
chr2 (11-593)||(16894269-16894851)
chr2 (11-593)||(34864055-34864637)
chr2 (11-593)||(37927740-37928322)
chr2 (11-593)||(21674466-21675048)
chr2 (11-593)||(39892440-39893022)
chr2 (11-593)||(21700461-21701043)
chr2 (13-593)||(19453714-19454294)
chr2 (15-574)||(27393937-27394496)
chr2 (404-592)||(34288858-34289046)
chr2 (404-592)||(34293918-34294106)
chr2 (11-148)||(34288720-34288857)
chr2 (11-148)||(34293780-34293917)
chr2 (180-556)||(42393075-42393451)
chr2 (180-556)||(34700616-34700992)
chr2 (189-575)||(21760924-21761310)
chr2 (393-586)||(22949146-22949339)
chr2 (393-586)||(12383413-12383606)
chr2 (180-592)||(26724568-26724980)
chr2 (180-592)||(34534735-34535147)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (11-593)||(11943-12525)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (11-593)||(14954-15535)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (11-593)||(10965039-10965621)
chr1 (11-593)||(51640592-51641174)
chr1 (11-593)||(10947451-10948033)
chr1 (11-593)||(41790612-41791194)
chr1 (11-593)||(28587359-28587941)
chr1 (11-593)||(16205336-16205915)
chr1 (13-593)||(20463352-20463932)
chr1 (180-592)||(22488564-22488976)
chr1 (393-586)||(5629307-5629500)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (11-593)||(23493-24075)
[»] scaffold0159 (3 HSPs)
scaffold0159 (11-593)||(6481-7063)
scaffold0159 (11-440)||(21968-22397)
scaffold0159 (258-593)||(22498-22833)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (11-593)||(12230-12812)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (11-593)||(8384-8971)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (11-593)||(32831-33413)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (11-593)||(10321-10903)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (13-593)||(8419-8999)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (11-593)||(5973-6555)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (303-593)||(8700-8990)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (14-593)||(44064-44678)
[»] scaffold1697 (1 HSPs)
scaffold1697 (11-322)||(1-312)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (180-556)||(9759-10135)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (297-575)||(35560-35838)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (393-586)||(28924-29117)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (405-592)||(49922-50109)
scaffold0046 (180-568)||(49697-50085)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (374-567)||(4992-5185)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (450-557)||(5253-5360)
scaffold0031 (180-244)||(5566-5630)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 519; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 519; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 6572243 - 6572825
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6572243 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 6572342  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6572343 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccgggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 6572442  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6572443 tgagaaggactcatccagatatggctctcaaaattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 6572542  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6572543 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 6572642  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6572643 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaag 6572742  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6572743 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 6572825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 14761190 - 14760608
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14761190 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 14761091  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14761090 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 14760991  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14760990 tgagaaggactcatccagatatggctctaaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 14760891  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14760890 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 14760791  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14760790 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 14760691  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  14760690 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaataaatgctggtgct 14760608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24590245 - 24589663
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24590245 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 24590146  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24590145 atttttgcatggtcgtatgaagatatgtcaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 24590046  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24590045 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 24589946  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589945 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 24589846  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589845 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 24589746  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24589745 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 24589663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 36342401 - 36341819
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36342401 cataggtaccgaggagaacaagtgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 36342302  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36342301 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 36342202  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  36342201 tgagaaggactcatccagatatggctctaaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 36342102  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36342101 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagataactttccatta 36342002  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36342001 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 36341902  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  36341901 atagagaaaagacgtcgtttatcactccttggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 36341819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 54835776 - 54836358
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54835776 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 54835875  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54835876 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctggatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 54835975  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  54835976 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 54836075  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836076 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagatctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 54836175  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54836176 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 54836275  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||||||    
T  54836276 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggcttgataaatgctggtgct 54836358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 34186844 - 34186262
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34186844 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaacttctccgggaatatccggat 34186745  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34186744 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 34186645  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34186644 tgagaaggactcgtccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggcttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 34186545  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34186544 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 34186445  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34186444 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 34186345  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34186344 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 34186262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 39853022 - 39853604
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39853022 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 39853121  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39853122 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 39853221  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39853222 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 39853321  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39853322 tgccaatattgtacctgtgcccaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 39853421  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39853422 cctcatatgtatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 39853521  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  39853522 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 39853604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 17015431 - 17016013
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17015431 catagataccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 17015530  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17015531 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 17015630  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  17015631 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagtggagtaccctgaatgggt 17015730  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17015731 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 17015830  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17015831 cctcatattgatgtgctcgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 17015930  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17015931 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgtcgttcggcctaataaatgctggtgct 17016013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 14667401 - 14667983
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14667401 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 14667500  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14667501 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagattctaagattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 14667600  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14667601 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 14667700  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14667701 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 14667800  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14667801 cctcatattgatgtgctcgttgataacactgctcagtctaaggtgttctcctttttggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 14667900  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  14667901 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaataaatgctggtgct 14667983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18798498 - 18797916
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18798498 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagattggtgctaccctagaggaaggggttaaacggaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 18798399  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18798398 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 18798299  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18798298 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 18798199  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18798198 tgccaatatagtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 18798099  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18798098 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 18797999  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18797998 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 18797916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 24115047 - 24115629
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24115047 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctaggggaaggggctaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccagat 24115146  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24115147 atttttgcatggtcgtatgaagatacgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcaaaaat 24115246  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24115247 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 24115346  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24115347 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 24115446  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  24115447 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctccggagg 24115546  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  24115547 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggcttaataaatgctggtgct 24115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27161201 - 27160619
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161201 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 27161102  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161101 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 27161002  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  27161001 tgagaaggactcatccagatatggccctcaagattaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcccgaatgggt 27160902  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160901 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaactttccatta 27160802  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27160801 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgaag 27160702  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27160701 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 27160619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 30756145 - 30756727
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30756145 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 30756244  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30756245 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 30756344  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30756345 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 30756444  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30756445 tgctaatattgtgcccgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 30756544  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  30756545 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggctataatcagatcaaaatgtctcctgaag 30756644  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30756645 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 30756727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 33671684 - 33671102
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33671684 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 33671585  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33671584 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcgaatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 33671485  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  33671484 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 33671385  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33671384 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgcgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 33671285  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33671284 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctccggaag 33671185  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33671184 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 33671102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18315062 - 18314480
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18315062 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaagggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 18314963  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18314962 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 18314863  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  18314862 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 18314763  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  18314762 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacagggccagtccaaaagacaactttccatta 18314663  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18314662 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 18314563  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18314562 atagagaaaagacatctttcatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggtctaatcaatgctggtgct 18314480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 5008260 - 5008842
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5008260 cataggtaccgaggagaacaagcgggaaatcaagatcggtgctgctctaggggaagaggttaaaagtaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 5008359  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5008360 atttttgcatggtcgtatgaagatatgcccggtctagatcctatgattgtggagcatcggatcccaaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 5008459  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5008460 tgagaaggactcatcctgacatggctctcaagatcaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 5008559  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5008560 tgctaatattgtaccagtgccgaagaaggatggtaaagtccggatgtgcgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 5008659  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  5008660 cctcatattgatgtgcttgttgataacactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgagg 5008759  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5008760 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaatcaatgctggtgct 5008842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 14100928 - 14101510
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14100928 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaggatcatccaactcctccgggaatatccagat 14101027  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14101028 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 14101127  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  14101128 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 14101227  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14101228 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 14101327  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14101328 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 14101427  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14101428 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 14101510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 21972086 - 21972668
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21972086 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 21972185  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21972186 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 21972285  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  21972286 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 21972385  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21972386 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaggtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccgaaagacaactttccatta 21972485  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21972486 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaagatgtctcctgaag 21972585  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21972586 acagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 21972668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 40103521 - 40102939
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40103521 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcattcaactcctccgggaatatccggat 40103422  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40103421 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 40103322  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  40103321 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaaaatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 40103222  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  40103221 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 40103122  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  40103121 cctcatatcgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgagg 40103022  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40103021 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 40102939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 31124396 - 31123814
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31124396 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccgactcctccgggaatatccggat 31124297  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31124296 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 31124197  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  31124196 tgagaaggacccatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacggttgagtatcccgaatgggt 31124097  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31124096 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaggtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccgaaagacaactttccatta 31123997  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  31123996 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaagatgtctcctgaag 31123897  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31123896 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 31123814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 593
Target Start/End: Original strand, 15230259 - 15230839
Alignment:
Q  13 taggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatat 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  15230259 taggtaccgaggagaacaagcgagagatcaaggtcggtgctgctctagaggaaagggttaaaaagaagatcatccagctcctccgagaatacccggatat 15230358  T
Q  113 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15230359 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattatggaacatcggatcccaacgaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattg 15230458  T
Q  213 agaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  15230459 agaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacagttgagtgtcctgaatgggttg 15230558  T
Q  313 ccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacc 412  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15230559 ccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggaaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacttgaacaaagccagtccaaaagacaacttcccattacc 15230658  T
Q  413 tcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagat 512  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15230659 tcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaagat 15230758  T
Q  513 agagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15230759 agagaaaaaacctcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 15230839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 1902638 - 1903221
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  1902638 cataggtaccgaagagaacaagcgagaaatcaaggtcggtgctgctctaaaggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgagaatacccggat 1902737  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1902738 atttttgcatggtcgtacgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggaacatcggatccccacaaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 1902837  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||    
T  1902838 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggt 1902937  T
Q  311 tgccaa-tattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatt 409  Q
    ||||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1902938 tgccaaccattgtacctgtgccaaagaaggatggaaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaacttcccatt 1903037  T
Q  410 acctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaa 509  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  1903038 accccatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaaggtgttctccttcatggacggcttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgag 1903137  T
Q  510 gatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  1903138 gatagagaaaagacatcttttatcaccccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaataaatactggtgct 1903221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15282810 - 15282230
Alignment:
Q  13 taggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatat 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  15282810 taggtaccgaggagaacaagcgagagatcaaggtcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaggaagatcttccagctcctccgaaaatacccggatat 15282711  T
Q  113 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15282710 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggaacatcggatcccaacaaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattg 15282611  T
Q  213 agaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||||    
T  15282610 agaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggttg 15282511  T
Q  313 ccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacc 412  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15282510 ccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggaaaagtccggatatgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaatttcccattacc 15282411  T
Q  413 tcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagat 512  Q
     ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15282410 ccatattgatgtgcttgtcgacaatactgctcagtccaaggtgttctccttcatggctggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaagat 15282311  T
Q  513 agagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15282310 agagaaaagacgtcttttatcaccccatggggtactttctgctacaaagtgatgtcgttcggcctaataaatgctggtgct 15282230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 15 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 15389258 - 15388699
Alignment:
Q  15 ggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatattt 114  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  15389258 ggtaccaaagaaaacaagcgagagatcaaggtcggtgctgctcttgaggagagggttaaaaagaagatcttccaacttctccgagagtatccggatattt 15389159  T
Q  115 ttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgag 214  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  15389158 ttgcatggtcatacgaagatatgccgggtctagatcctaagattgtggaacatcggataccgacaaagcctgaatgccctcccgttagacagaaattgag 15389059  T
Q  215 aaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgcc 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||    
T  15389058 aaggactcgtccagatatggctctcaagattaagaatgaggttcaaaaacagattgatgcgggttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggttgcc 15388959  T
Q  315 aatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctc 414  Q
    || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||| ||||||| | ||| |   ||||  | || ||||  |||||||| || || || ||||    
T  15388958 aacattgtacccgtgccaaagaaagatgggaaagttcggatgtgtgttgattacagggatttgaataaggctagtctcaaagacaatttccctttgcctc 15388859  T
Q  415 atattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatag 514  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  15388858 acattgatgtgcttgtcgataacactgctcagtccaaggtgttctccttcatggacggcttctccggttataaccagatcaaaatgtcacctgaagacag 15388759  T
Q  515 agaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcgg 574  Q
     |||||||| || || || || ||||||||||| || || | |||||  |||||||||||    
T  15388758 ggaaaagacatcgttcattaccccatggggcaccttatgttgcaaagcaatgccgttcgg 15388699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Original strand, 19766893 - 19767269
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  19766893 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgatgcaggt 19766991  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || ||||| |||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  19766992 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 19767091  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19767092 acaaggctagtccgaaggataattttcctttgcctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 19767191  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  19767192 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacaccctggggtgctttctgcta 19767269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 14726514 - 14726138
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| ||| |||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||||||||||||||||    
T  14726514 aagcctgagtgttctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcagattgatgcaggt 14726416  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||  | ||    || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || ||||| |||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  14726415 ttcctggtcacgtcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 14726316  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14726315 acaaggctagtccgaaggataattttcctttacctcacattgatgtattagttgataacactgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 14726216  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  14726215 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 14726138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 408 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 22147056 - 22146907
Alignment:
Q  408 ttacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctg 507  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||   |  |||||||||||||||||||| |  || ||||| || || |||||||| ||| |||| |    
T  22147056 ttacctcacattgatgtattggttgatagtactgctagatgcaaggtgttctccttcatggatgagttttccgggtataaccagatcaagatggctccgg 22146957  T
Q  508 aagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctac 557  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22146956 aagatagagaaaagacgtctttcatcacgccatggggcgctttctgctac 22146907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 1882814 - 1882437
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  1882814 aagcccgagtgtcctccagtcaagcagaagttaagaagatctcatccagatatggctctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgatgcaggt 1882716  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    ||| | || ||    ||||| ||| ||||| | ||||| || || || || || || || |||||||| ||| | ||| |||||||||   | |   |||    
T  1882715 ttcttgattacctccgaatatcctcaatggttggccaacatagtgcccgttccaaagaaagatggtaaggtcagaatgtgtgttgactatcgggatttga 1882616  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||   |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  1882615 acaaagctagtccgaaggatgatttccctttacctcacattgatgtattggttgatagtactgctagatgcaaggtattctccttcatggatgggttctc 1882516  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctac 557  Q
    ||| || || |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||    
T  1882515 cgggtataaccagatcaagatggctccagaggatagagaaaagacgtcgttcatcacgccttggggcgctttctgctac 1882437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22147285 - 22147221
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagat 244  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22147285 aagcccgagtgtcctccagtcaagcagaagttaagaagatctcatccagatatggctctcaagat 22147221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 515; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 515; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 18711855 - 18712437
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18711855 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 18711954  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18711955 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattatggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 18712054  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18712055 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 18712154  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712155 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 18712254  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712255 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 18712354  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18712355 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaattaatgctggtgct 18712437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27606750 - 27606168
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27606750 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 27606651  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27606650 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 27606551  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27606550 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 27606451  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27606450 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 27606351  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27606350 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 27606251  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27606250 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 27606168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 18793076 - 18793657
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18793076 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctattctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 18793175  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18793176 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 18793275  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18793276 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctga-tgggt 18793374  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18793375 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 18793474  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18793475 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 18793574  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18793575 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 18793657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 2135105 - 2134524
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2135105 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 2135006  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2135005 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 2134906  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2134905 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 2134806  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2134805 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 2134706  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2134705 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgcccagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgagg 2134606  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2134605 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgcaggtgc 2134524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 14559995 - 14560577
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14559995 cataggtaccgaggagaacaagcgtgaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 14560094  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14560095 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggtagaaat 14560194  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14560195 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 14560294  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14560295 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgatttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 14560394  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14560395 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgagg 14560494  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14560495 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 14560577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 19676818 - 19677400
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19676818 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 19676917  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19676918 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 19677017  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  19677018 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 19677117  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19677118 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 19677217  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19677218 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 19677317  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19677318 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 19677400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 19690469 - 19691051
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19690469 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctctgggaatatccggat 19690568  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19690569 atttttgcatggtcgtatgaggatatgccaggtctagatcctaaaattgtggagcatcggatacccacaaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 19690668  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  19690669 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaactgattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgagtgggt 19690768  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19690769 tgccaatattgtacctgtgccgaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 19690868  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19690869 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctctggttacaatcagatcaaaatgtctcctgagg 19690968  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  19690969 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaataaatgctggtgct 19691051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 28359797 - 28359215
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28359797 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggatggggttaaacagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 28359698  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28359697 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcagacagaaat 28359598  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28359597 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtaccctgaatgggt 28359498  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28359497 tgccaatattgtaccagtgccaaagaaggagggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 28359398  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28359397 cctcatatcgatgtgcttgttgacaatactgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaagatgtctcctgaag 28359298  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28359297 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 28359215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 33261105 - 33261687
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33261105 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 33261204  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33261205 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 33261304  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33261305 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 33261404  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  33261405 tgctaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 33261504  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33261505 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctccggaag 33261604  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33261605 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 33261687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 31356899 - 31357481
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31356899 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaaggtcatccagctcctccgggaatatccggat 31356998  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  31356999 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaagcaaaaat 31357098  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31357099 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 31357198  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31357199 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 31357298  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31357299 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgaag 31357398  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31357399 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 31357481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 9356996 - 9357578
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9356996 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagattggtgctgctctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 9357095  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9357096 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccgggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 9357195  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  9357196 tgagaaggactcatccagacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 9357295  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9357296 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 9357395  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9357396 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 9357495  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9357496 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 9357578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 19206207 - 19205625
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19206207 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctaggggaagaggttaaaagtaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 19206108  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19206107 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctacgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 19206008  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19206007 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 19205908  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19205907 tgccaatattgtaccagtgccaaagaaggatggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 19205808  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  19205807 cctcatatcgatgtgcttgttgacaatactgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgagg 19205708  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19205707 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 19205625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 29831697 - 29832279
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29831697 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagcttctccgggaatatccggat 29831796  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29831797 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 29831896  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  29831897 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 29831996  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  29831997 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 29832096  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29832097 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 29832196  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29832197 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 29832279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 31487717 - 31487134
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31487717 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaaggtcatccaactcctccgggaatatccggat 31487618  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  31487617 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcccgaatgtccccccgtcagacagaaat 31487518  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaa-gcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatggg 309  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  31487517 tgagaaggactcgtcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatggg 31487418  T
Q  310 ttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatt 409  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31487417 ttgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatt 31487318  T
Q  410 acctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31487317 acctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgaa 31487218  T
Q  510 gatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31487217 gatagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 31487134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 525
Target Start/End: Original strand, 16285814 - 16286328
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16285814 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcagtgctgctctagagtaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 16285913  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16285914 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctaagattgtggagcatcggatccccacaaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 16286013  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||    
T  16286014 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggcttcctcatgacagtagagtatcctgaatgggt 16286113  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16286114 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 16286213  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16286214 cctcatattgatgtgctcgttgataacactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 16286313  T
Q  511 atagagaaaagacgt 525  Q
    |||||||||||||||    
T  16286314 atagagaaaagacgt 16286328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 12090568 - 12089986
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12090568 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 12090469  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12090468 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 12090369  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  12090368 tgaggaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagatcgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 12090269  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12090268 tgccaatattgtgcctgtgccgaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgatttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 12090169  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12090168 ccccatattgacgcgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 12090069  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12090068 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgttacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgccggtgct 12089986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 11 - 292
Target Start/End: Original strand, 16279921 - 16280202
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16279921 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctctgggaatatccggat 16280020  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16280021 atttttgcatggtcgtacgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggaacatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagatat 16280120  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  16280121 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagt 16280202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 22078751 - 22078193
Alignment:
Q  15 ggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatattt 114  Q
    |||||| | ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  22078751 ggtaccaaagaaaacaagcgagagatcaaggtcggtgctgctcttgagaagagggttaaaaagaagatcttccaacttctccgagagtatccggatattt 22078652  T
Q  115 ttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgag 214  Q
    |||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  22078651 ttgcatggtcatacgaagatatgtcgggtctagatcctaagattgtggaacatcggataccgacaaagcctgaatc-cctcccgttagacagaaattgag 22078553  T
Q  215 aaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgcc 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||||| || || ||| |||||||||||    
T  22078552 aaggactcgtccagatatggctctcaagattaagaatgaggttcaaaaatagattgatgcgggttttctcatgacagtcgagtatcctaaatgggttgcc 22078453  T
Q  315 aatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctc 414  Q
    || |||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||| ||||||| | ||| |   ||||  | || ||||  |||||||| || || || ||||    
T  22078452 aacattgtacccgtgccaaagaaagatgggaaagttcggatgtgtgttgattacagggatttgaataaggctagtctcaaagacaatttccctttgcctc 22078353  T
Q  415 atattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatag 514  Q
    | |||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  22078352 acattgatgtgcttgtcgatgacactgctcagtccaaggtgttctccttcatggacggcttctccggttataaccagatcaaaatgtcacctgaagacag 22078253  T
Q  515 agaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcgg 574  Q
     |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||||    
T  22078252 ggaaaagacatcgttcattaccccatggggcaccttctgttgcaaagcaatgccgttcgg 22078193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3327349 - 3327186
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3327349 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 3327250  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatcc 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3327249 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatcc 3327186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Original strand, 14211579 - 14211955
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||||||||||||||||    
T  14211579 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcagattgatgcaggt 14211677  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || |||||||||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  14211678 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggtaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 14211777  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14211778 acaaggctagtccgaaggataattttcctttgcctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 14211877  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  14211878 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 14211955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 556
Target Start/End: Original strand, 22411482 - 22411854
Alignment:
Q  184 ctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcc 282  Q
    |||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  22411482 ctgagtgtcctccagtaaagcagaaattgagaagatctcatcccgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcagattgatgcaggtttcc 22411580  T
Q  283 taatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacga 382  Q
    || | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || ||||| |||||| | ||| ||||||| |   | | | ||||| |    
T  22411581 tagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttgaacaa 22411680  T
Q  383 agccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggt 482  Q
     || ||||| || || || || || |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  22411681 ggctagtccgaaggataatttccctttacctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctccggc 22411780  T
Q  483 tacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  22411781 tacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 22411854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 592
Target Start/End: Original strand, 16767863 - 16768275
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| || || | |||||| ||| ||||||||    
T  16767863 aagcccgagtgtcctccagtcaagcagaagttaagaagatctcatccagatatggctctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaatttatgcaggt 16767961  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    ||| | || ||   |||||| ||| ||||| | ||||| || || || || || || || |||||||| ||| | ||| |||||||||   | |   |||    
T  16767962 ttcttgattacctctgaatatcctcaatggttggccaacatagtgcccgttccaaagaaagatggtaaggtcagaatgtgtgttgactatcgggatttga 16768061  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||   |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  16768062 acaaagctagtccgaaggatgatttccctttacctcacattgatgtattggttgatagtactgctagatgcaaggtattctccttcatggatggattctc 16768161  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtcta 578  Q
    ||| || || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| | |||||||||  ||| |||||||| ||  |     
T  16768162 cgggtataaccagatcaagatggctccagaagatagagaaaagacgtcgttcatcacgccttggggcgcgttctgctacttagtaatgccgtttgggttg 16768261  T
Q  579 attaatgctggtgc 592  Q
    || |||||||||||    
T  16768262 ataaatgctggtgc 16768275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Original strand, 19843707 - 19844083
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtt 279  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||    || || || ||||| || ||||||||||    
T  19843707 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcccgatatggccctcaagattaaagaagaagtgcagaagcaaatcgatgcaggtt 19843806  T
Q  280 tcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaa 379  Q
    ||||  | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || || || || || || || || |||||| | ||| ||||||| |   | | | ||||    
T  19843807 tcctggtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcccgttccgaagaaagacggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacatgaa 19843906  T
Q  380 cgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctcc 479  Q
    | | || ||||| || || || ||||| |||||||| || |||||  | |||||||| |||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19843907 caaggctagtccgaaggataattttcctttacctcacatcgatgtattggttgataacactgctaaatgcaaggttttctccttcatggacggtttctcc 19844006  T
Q  480 ggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||||||||| || || |||||  | |||||  ||||||||||    
T  19844007 ggttacaatcagatcaggatggctcccgaagacagagaaaagacatcattcatcacagcctggggtgctttctgcta 19844083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 511; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18290280 - 18289698
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18290280 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 18290181  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18290180 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 18290081  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18290080 tgagaaggactcatccagatatggctctaaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 18289981  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289980 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 18289881  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289880 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 18289781  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18289780 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaataaatgctggtgct 18289698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 7075539 - 7076121
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7075539 cataggtaccgaggagagcaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 7075638  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7075639 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctggaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 7075738  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7075739 tgagaaggactcatccagatatggctcttaatattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 7075838  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7075839 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctaaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 7075938  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7075939 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctccggaag 7076038  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7076039 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 7076121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18274979 - 18274397
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18274979 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 18274880  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18274879 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 18274780  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18274779 tgagaaggactcatccagatatggctctaaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 18274680  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18274679 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 18274580  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18274579 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 18274480  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  18274479 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaataaatgctggtgct 18274397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18305581 - 18304999
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18305581 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 18305482  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18305481 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 18305382  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18305381 tgagaaggactcatccagatatggctctaaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 18305282  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18305281 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 18305182  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18305181 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 18305082  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  18305081 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaataaatgttggtgct 18304999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 29146683 - 29146101
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29146683 cataagtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 29146584  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29146583 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 29146484  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29146483 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 29146384  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29146383 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 29146284  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29146283 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 29146184  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29146183 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 29146101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 20068373 - 20068955
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20068373 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 20068472  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20068473 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagattctaagattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 20068572  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20068573 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 20068672  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20068673 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 20068772  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20068773 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttttccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 20068872  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20068873 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 20068955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 48468260 - 48468842
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48468260 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 48468359  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48468360 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 48468459  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  48468460 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 48468559  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48468560 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaactttccatta 48468659  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48468660 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 48468759  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  48468760 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgttggtgct 48468842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 4723964 - 4724546
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4723964 cataggtaccgatgagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 4724063  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4724064 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggaacatcggatccccaccaagcctgaatgccctcccgtcaggcagaaat 4724163  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4724164 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 4724263  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724264 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 4724363  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724364 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 4724463  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4724464 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 4724546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 6204236 - 6204818
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204236 cataggtaccgaggagaacaagcgagagatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 6204335  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204336 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 6204435  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6204436 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgtgggcttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 6204535  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6204536 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccgaaagacaactttccatta 6204635  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204636 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 6204735  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6204736 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 6204818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15739021 - 15738439
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15739021 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgcagctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 15738922  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15738921 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 15738822  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15738821 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcttcatgacagttgagtaccctgaatgggt 15738722  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15738721 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 15738622  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15738621 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctccggaag 15738522  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  15738521 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagcgatgccgttcggcctaataaatactggtgct 15738439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 22868775 - 22868193
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22868775 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 22868676  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22868675 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 22868576  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22868575 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 22868476  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22868475 tgctaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 22868376  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22868375 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 22868276  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22868275 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 22868193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 22883834 - 22883252
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883834 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 22883735  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883734 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 22883635  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22883634 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 22883535  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22883534 tgctaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 22883435  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22883434 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 22883335  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22883334 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 22883252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 32441484 - 32442066
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  32441484 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaatgggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggac 32441583  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32441584 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggattcccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 32441683  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32441684 tgagaaggactcatccagacatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 32441783  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32441784 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 32441883  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32441884 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 32441983  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32441984 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 32442066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 22385505 - 22384924
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22385505 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 22385406  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22385405 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 22385306  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22385305 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 22385206  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22385205 tgccaatattgtacctgtgccaaaaaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 22385106  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22385105 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatcgacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 22385006  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  22385005 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtattttctgctataaagtgatgccattcggcttaataaatgctggtgc 22384924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 4794562 - 4793980
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4794562 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctattctagaggaaggggttaaaaagaatatcatccaactcctccgggaatatccggat 4794463  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4794462 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 4794363  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4794362 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 4794263  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4794262 tgccaatattgtacctgtgccaaagaatgatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 4794163  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4794162 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctaaag 4794063  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4794062 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 4793980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 35883099 - 35883681
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35883099 cataggcaccgaggagaacaagcgagagatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgagaatatccggat 35883198  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35883199 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 35883298  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35883299 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 35883398  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35883399 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 35883498  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35883499 cctcatattgatgtgcttgttgataataccgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 35883598  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  35883599 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaataaatgctggtgct 35883681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 10398477 - 10399059
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10398477 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacggaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 10398576  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10398577 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccagggctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 10398676  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10398677 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggtccaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacggttgagtaccctgaatgggt 10398776  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  10398777 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccattg 10398876  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10398877 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 10398976  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10398977 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 10399059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 18053595 - 18054177
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18053595 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaggaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 18053694  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18053695 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggcctagattctaagattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 18053794  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18053795 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 18053894  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18053895 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagataactttccatta 18053994  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18053995 cctcatattgatgtgcttgttgataataatgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 18054094  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18054095 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 18054177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 18332970 - 18333545
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18332970 cataggtaccgatgagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 18333069  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18333070 atttttgcatggtcatatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 18333169  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18333170 tgagaaggactcatccagat-------tcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcaggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 18333262  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18333263 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 18333362  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18333363 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 18333462  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18333463 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 18333545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 8214068 - 8214650
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8214068 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacggaagatcatccaactcctccaggaatatccggat 8214167  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8214168 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 8214267  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8214268 tgagaaggactcatccagatatggccctcaagatcaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 8214367  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8214368 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaactttccgtta 8214467  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8214468 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 8214567  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  8214568 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaatcaatgctggtgct 8214650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 8298304 - 8298886
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8298304 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccggaaatatccggat 8298403  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8298404 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcttgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 8298503  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8298504 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagggcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 8298603  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8298604 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 8298703  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8298704 cctcatattgatgtgctcgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 8298803  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8298804 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtaccttctactacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 8298886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 20574770 - 20574188
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20574770 catagataccgaggagaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacggaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 20574671  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20574670 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 20574571  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20574570 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 20574471  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20574470 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaactttccatta 20574371  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20574370 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 20574271  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20574270 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 20574188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 8287397 - 8286815
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8287397 cataggtaccgaggagaacaagcgagagatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 8287298  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  8287297 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggagcatcggatccccacaaagcctgaatgtcctcctgttaggcagaaat 8287198  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8287197 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagatagatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 8287098  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8287097 ttccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgatttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 8286998  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286997 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 8286898  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8286897 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 8286815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 11108279 - 11107697
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11108279 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaagaggttaaacggaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 11108180  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11108179 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccactaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 11108080  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11108079 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 11107980  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  11107979 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccgaaagacaactttccgtta 11107880  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11107879 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 11107780  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11107779 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 11107697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 21677036 - 21677618
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677036 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagattggtgctaccctagagaaaggggttaaaaggaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 21677135  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21677136 atttttgcatggtcgtatgaagatatgtcagggctagaccctatgattgtggagcatcggattcccaccaagcctgaatgtcctcccgtcagacagaaat 21677235  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  21677236 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggcttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 21677335  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21677336 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaactttccatta 21677435  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21677436 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 21677535  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21677536 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 21677618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15890632 - 15890050
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15890632 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 15890533  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15890532 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccgggtctagatcctaagattgtagagcatcggatccccacaaagcctgaatgtcttcccgtcaggcagaaat 15890433  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15890432 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 15890333  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15890332 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaagatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 15890233  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15890232 cctcatattattgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 15890133  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15890132 ataaagaaaagacgtcttttatcactccgtggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 15890050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 47025786 - 47026368
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47025786 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 47025885  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47025886 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 47025985  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  47025986 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 47026085  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47026086 tgccaatattgtgcccgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 47026185  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47026186 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 47026285  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  47026286 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 47026368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 29662897 - 29662315
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29662897 cataggtatcgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacggaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 29662798  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29662797 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 29662698  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29662697 tgagaaggactcatccagacatggccctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagatcgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 29662598  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29662597 tgccaatatagtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 29662498  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29662497 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatatctcctgaag 29662398  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29662397 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 29662315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 31962382 - 31961800
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31962382 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaaggtcatccagctcctccgggaatatccggat 31962283  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31962282 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 31962183  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31962182 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 31962083  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  31962082 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 31961983  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31961982 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgaag 31961883  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31961882 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 31961800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 5594284 - 5593702
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5594284 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 5594185  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5594184 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctacgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 5594085  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5594084 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccccgaatgggt 5593985  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593984 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 5593885  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5593884 cctcatattgacgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 5593785  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5593784 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 5593702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 7998893 - 7999475
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7998893 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 7998992  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7998993 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtttagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagccggaatgtcctcccgtcaggcagaaat 7999092  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7999093 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 7999192  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7999193 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 7999292  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  7999293 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgaag 7999392  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7999393 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 7999475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 4344603 - 4344021
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4344603 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 4344504  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4344503 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 4344404  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  4344403 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagtgaagctcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 4344304  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4344303 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 4344204  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4344203 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 4344104  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4344103 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 4344021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 51784356 - 51784938
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51784356 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 51784455  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51784456 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggattcccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 51784555  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  51784556 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 51784655  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51784656 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 51784755  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51784756 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttctggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 51784855  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  51784856 atagagaaaagacatcttttatcactccatgggggactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaatcaatgctggtgct 51784938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 6540669 - 6540087
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6540669 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 6540570  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6540569 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 6540470  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6540469 tgagaaggactcatcctgacatggctctcaagatcaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 6540370  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| || ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6540369 tgctaacattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 6540270  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6540269 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 6540170  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6540169 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 6540087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 18245074 - 18245656
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18245074 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 18245173  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18245174 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 18245273  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  18245274 tgagaaggactcatcctgacatggctctcaagatcaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 18245373  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18245374 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 18245473  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18245474 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 18245573  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18245574 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgtttggtctaatcaatgctggtgct 18245656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 28113881 - 28113299
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28113881 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctaggggaagaggttaaaagtaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 28113782  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28113781 atttttgcatggtcatatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 28113682  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28113681 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagatcaagagcgaggtccaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 28113582  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28113581 tgctaatattgtgcccgtgccaaagaaggatggtaaagtcaggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 28113482  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28113481 cctcatgttgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaagatgtctcctgaag 28113382  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28113381 atagagaaaagacgtcttttatcacgccatggggtactttctgctacaaagtgatgtcgttcggcctaatcaatgctggtgct 28113299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 17982876 - 17982294
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17982876 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccgactcctccgggaatatccggat 17982777  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982776 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 17982677  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  17982676 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 17982577  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17982576 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaggtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccgaaagacaactttccatta 17982477  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17982476 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 17982377  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17982376 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 17982294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 28023615 - 28024197
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  28023615 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctaaaggaaggggttaaacagaagattgtccagctcctccgggaatatccggat 28023714  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28023715 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagagat 28023814  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28023815 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 28023914  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28023915 tgctaatattgtgcccgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 28024014  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28024015 cctcatattgatgtgctcgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcagaatgtctcctgaag 28024114  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28024115 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgttacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 28024197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 5016047 - 5016629
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5016047 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaggatcatccaactcctccgggaatatccagat 5016146  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5016147 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcgggtccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 5016246  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  5016247 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 5016346  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5016347 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaggtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 5016446  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5016447 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 5016546  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5016547 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 5016629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 24330496 - 24331078
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24330496 cataggtaccgaggagaataagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaagcagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 24330595  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24330596 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 24330695  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  24330696 tgagaaggactcatcccgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaaacagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcccgaatgggt 24330795  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24330796 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagcccaaaagacaactttccatta 24330895  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24330896 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaagatgtctcctgaag 24330995  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24330996 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttttgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 24331078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 10645406 - 10645988
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10645406 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccgactcctccgggaatatccggat 10645505  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10645506 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 10645605  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  10645606 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 10645705  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10645706 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 10645805  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10645806 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctctttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 10645905  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10645906 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgtcgttcggcctaatcaatgctggtgct 10645988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 4419248 - 4419830
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4419248 cataggtaccgaggagaacaagcgggaaatcaagatcggtgctgctctaggggaagaggttaaaagtaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 4419347  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4419348 attttcgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 4419447  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  4419448 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 4419547  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4419548 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 4419647  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4419648 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 4419747  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4419748 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 4419830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 5469321 - 5469903
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5469321 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctaccctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 5469420  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5469421 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 5469520  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  5469521 tgagaaggactcatccagacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 5469620  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5469621 tgccaatattgtgtctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccgaaagacaacttcccatta 5469720  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5469721 cctcatattgacgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgaag 5469820  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5469821 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgttacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 5469903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 18227529 - 18228111
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18227529 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccgactcctccgggaatatccggat 18227628  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18227629 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 18227728  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  18227729 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 18227828  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18227829 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaggtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccgaaagacaactttccatta 18227928  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  18227929 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaagatgtctcctgaag 18228028  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18228029 atagagagaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 18228111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 5607241 - 5606659
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5607241 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaaggtcatccagctcctccgggaatatccggat 5607142  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5607141 attttcgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 5607042  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5607041 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 5606942  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  5606941 tgctaatattgtgccagtgccgaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 5606842  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  5606841 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgaag 5606742  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5606741 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 5606659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 18532716 - 18533298
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  18532716 cataggtaccgaggagaacaagcgagagatcaaggtcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaggaagatcatccagctcctccgagaatacccggat 18532815  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18532816 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggaacatcggatcccaacaaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 18532915  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||    
T  18532916 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgaggtccaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggt 18533015  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18533016 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggaaaagtccggatgtgtgttgatttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaacttcccatta 18533115  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18533116 cctcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaag 18533215  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  18533216 atagagaaaagacgtcttttatcatcccatggggtactttctgctagaaagtgatgccgttcagcctaataaatgctggtgct 18533298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 593
Target Start/End: Original strand, 28341511 - 28342092
Alignment:
Q  12 ataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggata 111  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28341511 ataggtaccgaggagaacaagcgggaaatcaagatcggtgctgctctaggggaagaggttaaaagtaagatcatccagctcctccgggaatatccggata 28341610  T
Q  112 tttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaatt 211  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28341611 ttttcgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaatt 28341710  T
Q  212 gagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggtt 311  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28341711 gagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggtt 28341810  T
Q  312 gccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattac 411  Q
    || |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28341811 gctaatattgtgccagtgccgaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgttac 28341910  T
Q  412 ctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaaga 511  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  28341911 ctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgaaga 28342010  T
Q  512 tagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28342011 tagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 28342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 16622415 - 16621835
Alignment:
Q  13 taggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatat 112  Q
    |||||||||| || |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  16622415 taggtaccgaagagaacaagcgagagatcaaggtcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaggaagatcttccagctcctccgagaatacccggatat 16622316  T
Q  113 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16622315 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggaacatcggatcccaacaaagcctgaatatcctcccgtcaggcagaaattg 16622216  T
Q  213 agaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||| |    
T  16622215 agaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggtag 16622116  T
Q  313 ccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacc 412  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16622115 ccaatattgtccctgtgccaaagaaggatggaaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgatcaaagccagtccaaaagacaacttcccattacc 16622016  T
Q  413 tcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagat 512  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16622015 ccatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaaggtgttctccttcatggatggcttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaagat 16621916  T
Q  513 agagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16621915 agagaaaagacgtcttttatcaccccatagggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 16621835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 19696824 - 19697405
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||    
T  19696824 cataggtaccgaagagaacaagcgagaaattaagatcagtgctgctctag-ggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgagagtatccagat 19696922  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19696923 atttttgcatggttgtatgaagatatgtcaggtctagatcctaagattgtggagcatcggatccccacaaaacctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 19697022  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||    
T  19697023 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatgcaggttttctcatgacggttgagtatcctgaatgggt 19697122  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19697123 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggaaaagtctggatgtgtgttgactttagagacctgaacaaagtcagtccaaaagacaactttccatta 19697222  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19697223 cctcatattgatgtgctggttgacaatactgctcagtccaaggtgttctccttcatggatggcttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaag 19697322  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19697323 atagagaaaagacatcttttattaccccatggggtactttctgctacaaagtaatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 19697405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36995125 - 36994962
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36995125 cataggtaccgaggagaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggtcaaacagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 36995026  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatcc 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36995025 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatcc 36994962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Original strand, 22958955 - 22959331
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||||||||||||||||    
T  22958955 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcagattgatgcaggt 22959053  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || ||||| |||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  22959054 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 22959153  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22959154 acaaggctagtccgaaggataattttcctttacctcacattgatgtattggttgataatactgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 22959253  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  22959254 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 22959331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 11926116 - 11925740
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||||||||||||||||    
T  11926116 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcagattgatgcaggt 11926018  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || ||||| |||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  11926017 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 11925918  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11925917 acaaggctagtccgaaggataattttcctttgcctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgtaaggttttctccttcatggacggtttctc 11925818  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  11925817 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 11925740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 189 - 575
Target Start/End: Original strand, 41439754 - 41440140
Alignment:
Q  189 tgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatg 287  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||||||||| ||| || || || || ||||| ||||||||||||||  |     
T  41439754 tgtccgccggtcaagcagaaattaagaagaacccgccctgatatggccctcaagattaaagag-gaagtgcagaaacagatcgatgcaggtttcctcgtt 41439852  T
Q  288 acagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagcca 387  Q
    |||    |||||||| ||||| | ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||| | ||| ||||||| | | | | ||| ||| |||| |    
T  41439853 acatcaaaataccctcaatggctagccaacatagtgcctgttccgaagaaggatggcaaagtcagaatgtgtgttgattaccgtgaccttaacaaagcta 41439952  T
Q  388 gtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaa 487  Q
    |||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||  | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41439953 gtcccaaagatgattttccattacctcatattgatgtactggttgacagcactgcaaaatccaaagtgttctccttcatggatggtttctccggttacaa 41440052  T
Q  488 tcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggt 575  Q
    ||||||||| ||| | || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  41440053 tcagatcaagatggcgcccgaagacagagagaagacgtctttcatcacaccttggggcactttctgttacagagtaatgccgttcggt 41440140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Original strand, 16430907 - 16431283
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  16430907 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgatgcaggt 16431005  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || |||||||||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  16431006 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggtaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 16431105  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16431106 acaaggctagtccgaaggataattttcctttgcctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 16431205  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  16431206 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 16431283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 180 - 574
Target Start/End: Original strand, 15918019 - 15918413
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| || || || |||| ||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||| ||| || || || || ||||| || ||||||    
T  15918019 aagcctgagtgcccgccagtcaagcagaaattgagaagaacccgtcctgacatggctctcaagattaaagag-gaagtacagaaacagatcgacgcaggt 15918117  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||  | |||    | |||||| ||||| | |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| | ||| ||||||| | | | |  || |    
T  15918118 ttccttgtcacatcaaagtaccctcaatggctagccaatatagtgcctgttccaaagaaggatggtaaagtcagaatgtgtgttgattaccgggatctaa 15918217  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||||||||| || ||  | || || || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||  | || || || ||||| |||||||| ||||||||    
T  15918218 acaaagccagtcccaaggatgatttcccgttgcctcatattgatgtgttggttgatagtactgcaaaatccaaagtcttctcattcatggatggtttctc 15918317  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcgg 574  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  15918318 cggttataatcagatcaagatggcacccgaagatagagagaagacgtcttttattacaccttggggcactttctgttacagagtaatgccgttcgg 15918413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 189 - 575
Target Start/End: Original strand, 20442628 - 20443014
Alignment:
Q  189 tgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatg 287  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||| || |  || |||||||| ||||||||||| ||| || || || || ||||| ||||||||||||||  |     
T  20442628 tgtccgccggtcaagcagaaattaagaagaacccgccctgatatggccctcaagattaaagag-gaagtgcagaaacagatcgatgcaggtttcctcgtt 20442726  T
Q  288 acagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagcca 387  Q
    |||    |||||||| ||||| | ||||| || || ||||| |  || |||||||| |||||| | ||| ||||||| | | | | ||| ||| |||| |    
T  20442727 acatcaaaataccctcaatggctagccaacatagtgcctgttctgaagaaggatggcaaagtcagaatgtgtgttgattaccgtgaccttaacaaagcta 20442826  T
Q  388 gtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaa 487  Q
    |||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||  | || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20442827 gtcccaaagatgattttccattacctcatattgatgtactagttgacagcactgcaaaatccaaagtgttctccttcatggatggtttctccggttacaa 20442926  T
Q  488 tcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggt 575  Q
    ||||||||| ||| | || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  20442927 tcagatcaagatggcgcccgaagacaaagagaagacgtctttcatcacaccttggggcactttctgttacagagtaatgccgttcggt 20443014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 180 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24209332 - 24208959
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  24209332 aagcctgagtgtcctccggtaaaacagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgatgcaggt 24209234  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || |||||||||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  24209233 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggtaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 24209134  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24209133 acaaggctagtccgaaggataattttcctttgcctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 24209034  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctg 553  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||    
T  24209033 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctg 24208959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 8e-35
Query Start/End: Original strand, 180 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 15593669 - 15593275
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| || || || |||| ||||||||||||||| || | ||| || ||||||||||||||||| ||| || || || || ||||| || || |||    
T  15593669 aagcctgagtgcccgccagtcaagcagaaattgagaagaacccgtcctgacatggctctcaagattaaagag-gaagtacagaaacagatcgacgcgggt 15593571  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||  | |||    | |||||| ||||| | |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||| | ||| ||||||| | | | |  || |    
T  15593570 ttccttgtcacatcaaagtaccctcaatggctagccaatatagtgcctgttccaaagaaggatggtaaagtcagaatgtgtgttgattaccgggatctaa 15593471  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||||||||| || ||  | || || || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||  | || || || ||||| |||||||| ||||||||    
T  15593470 acaaagccagtcccaaggatgatttcccgttgcctcatattgatgtgttggttgatagtactgcaaaatccaaagtcttctcattcatggatggtttctc 15593371  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcgg 574  Q
    |||||| |||||| |||| ||| | || ||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  15593370 cggttataatcaggtcaagatggcacccgaagatagagagaagacgtcttttattacaccttggggcactttctgttacagagtaatgccgttcgg 15593275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 180 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 7089785 - 7089372
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| ||| |||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||||||||||||||||    
T  7089785 aagcctgagtgttctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcagattgatgcaggt 7089687  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||  | ||    || || ||| | ||| | ||||| || || || || || || || |||||||||||||| ||| ||||||| |   | |   |||    
T  7089686 ttcctggtcacgtcagagtatcctcattggttggccaacatagtgcccgttccaaagaaagatggtaaagtccgaatgtgtgttgattatcgggatttga 7089587  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||| ||||| || || || || || |||||||| ||||||||  | || ||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7089586 acaaagctagtccgaaggataatttccctttacctcacattgatgtattggtcgataacactgctaaatgcaaggggttctccttcatggacggtttctc 7089487  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtcta 578  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || || || ||||| || |||||| ||||||||||   ||| ||||| |||||  |     
T  7089486 cggttacaatcagatcaggatggctcctgaagatagagaaaaaacatcattcatcacgccttggggcgctttctgctatttagtaatgccattcggattg 7089387  T
Q  579 attaatgctggtgct 593  Q
    || ||||||||||||    
T  7089386 ataaatgctggtgct 7089372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5951347 - 5951154
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  5951347 aaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacagtactgcaaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggttataatcaaa 5951248  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  5951247 tcaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttattacaccttggggcactttctgttacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 5951154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Original strand, 46380049 - 46380242
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||| ||||| ||||| |    
T  46380049 aaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacagtactgccaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctctggttataatcaaa 46380148  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  46380149 tcaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttattacaccttggggcactttctgttacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 46380242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 408 - 553
Target Start/End: Original strand, 15704203 - 15704348
Alignment:
Q  408 ttacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctg 507  Q
    |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| | |  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||| |    
T  15704203 ttacctcacattgatgtattggttgataatactgctaaatgcaaggttttttccttcatggacggtttctccggttataatcagataaagatggctccag 15704302  T
Q  508 aagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctg 553  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||    
T  15704303 aagatagggaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctg 15704348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 6964191 - 6963814
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| || || | |||||| ||||| ||||||    
T  6964191 aagcccgagtgtcctccagtcaagcagaagttaagaagatctcatccagatatggctctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgacgcaggt 6964093  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgact-tcagaggcctg 377  Q
    ||| | || ||   |||||| ||| ||||| | ||||| || || || || || || || |||||||| ||| | ||| ||||||||| ||| ||   ||    
T  6964092 ttcttgattacctctgaatatcctcaatggttggccaacatagtgcccgttccgaagaaagatggtaaggtcagaatgtgtgttgactatca-agatttg 6963994  T
Q  378 aacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttct 477  Q
    ||| |||| ||||| || ||  | || ||  ||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||   |  |||||||||||||||||||| || || |    
T  6963993 aacaaagctagtccgaaggatgatttccctctacctcacattgatgtattggttgatagtactgctagatgcaaggtgttctccttcatggatgggtttt 6963894  T
Q  478 ccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctac 557  Q
    | || || || |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6963893 ctgggtataaccagatcaagatggctccggaagatagagaaaagacgtctttcatcacgccatggggcgctttctgctac 6963814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 408 - 544
Target Start/End: Original strand, 6571084 - 6571220
Alignment:
Q  408 ttacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctg 507  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||| | |  ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || ||| |||| |    
T  6571084 ttacctcacattgatgtattggttgataacactgctaaatgcaaggtattctccttcatggacggtttttccgggtataatcagataaagatggctccag 6571183  T
Q  508 aagatagagaaaagacgtcttttatcactccatgggg 544  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  6571184 aagatagagaaaagacgtccttcatcacgccttgggg 6571220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 450 - 557
Target Start/End: Original strand, 4446207 - 4446314
Alignment:
Q  450 aaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactt 549  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||   || || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||  |||    
T  4446207 aaggtattctccttcatggatggattctccaagtataaccagatcaagatggctccagaagatagagaaaagacgtcgttcatcacgccttggggtgctt 4446306  T
Q  550 tctgctac 557  Q
    ||||||||    
T  4446307 tctgctac 4446314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Original strand, 4442594 - 4442658
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagat 244  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  4442594 aagcccgagtgtcctccagtcaagcagaagttaagaagatctcatccagatatggctctcaagat 4442658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 180 - 283
Target Start/End: Original strand, 6570856 - 6570959
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagat-taagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||  || |||| || ||||| ||||||||  ||||| || || |  ||||||||||||||||||    
T  6570856 aagcctgaatgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctaatcccgagatggccctcaagatcaaagag-gaagtacgcaagcagattgatgcaggt 6570954  T
Q  279 ttcct 283  Q
    |||||    
T  6570955 ttcct 6570959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 507; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 507; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 33779868 - 33780450
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33779868 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 33779967  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33779968 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctaggtcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 33780067  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33780068 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 33780167  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780168 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 33780267  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33780268 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 33780367  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33780368 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 33780450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15656539 - 15655957
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656539 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 15656440  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656439 gtttttgcatggtcgtatgaagatatgccagggctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 15656340  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  15656339 tgagaaggactcatccagatatggctctaaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 15656240  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656239 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 15656140  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15656139 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 15656040  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15656039 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 15655957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 22996898 - 22996316
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22996898 cataggtaccgaggagaacaagcaagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 22996799  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22996798 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccagatctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 22996699  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22996698 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 22996599  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22996598 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 22996499  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22996498 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctccggaag 22996399  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22996398 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 22996316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 592
Target Start/End: Original strand, 41677084 - 41677665
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41677084 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 41677183  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41677184 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctggaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtccgcccgtcaggcagaaat 41677283  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  41677284 tgagaaggactcatccagacatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 41677383  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41677384 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 41677483  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41677484 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacgatttctccggttacaatcagatcagaatgtctcctgaag 41677583  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  41677584 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctataaagtgatgccattcggcttaataaatgctggtgc 41677665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 11551734 - 11552316
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551734 cataggtaccgaggagaacaaacgagagatcaaaatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 11551833  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551834 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 11551933  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11551934 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 11552033  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552034 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 11552133  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552134 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 11552233  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  11552234 atagagaaaagacgtcctttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgttggtgct 11552316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 33294907 - 33295489
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33294907 cataggtaccgaggagaacaagcaagagatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttataaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 33295006  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295007 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggaacatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 33295106  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33295107 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 33295206  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33295207 tgctaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagtcagtccaaaagacaactttccatta 33295306  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295307 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 33295406  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33295407 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 33295489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18498506 - 18497924
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18498506 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagattggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 18498407  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  18498406 atttttgcatggtcatatgaagatatgccgggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgagtgtcctcccatcaggcagaaat 18498307  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  18498306 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacggttgagtaccccgaatgggt 18498207  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18498206 tgccaatattgtgcctgtgccgaaaaaagatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaactttccgtta 18498107  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18498106 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 18498007  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18498006 atagagaaaagacatcttttatcactccatgggggactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 18497924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 30937015 - 30937596
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30937015 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 30937114  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30937115 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaagcagaaat 30937214  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30937215 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 30937314  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30937315 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 30937414  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30937415 cctcatattgatgtgctcgttgataatactgcttagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtct-ctgaag 30937513  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30937514 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 30937596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 37669267 - 37668685
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37669267 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 37669168  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37669167 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcattggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 37669068  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37669067 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 37668968  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37668967 tgctaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 37668868  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37668867 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 37668768  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37668767 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 37668685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 478; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 40471330 - 40470749
Alignment:
Q  12 ataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40471330 ataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggata 40471231  T
Q  112 tttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaatt 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40471230 tttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctacgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaatt 40471131  T
Q  212 gagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggtt 311  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  40471130 gagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggtt 40471031  T
Q  312 gccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattac 411  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40471030 gccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgttac 40470931  T
Q  412 ctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaaga 511  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40470930 ctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaaga 40470831  T
Q  512 tagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40470830 tagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 40470749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 30170848 - 30171430
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30170848 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 30170947  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30170948 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcagacagaaat 30171047  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  30171048 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 30171147  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30171148 tgccaatattgtgcctgtgccaaaaaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 30171247  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  30171248 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttctggttataatcagatcaaaatgtctcccgaag 30171347  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30171348 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 30171430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 24972285 - 24972867
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24972285 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagaccatccagctcctccgggaatatccggat 24972384  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24972385 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaaaattgtggagcatcggatccccacaaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 24972484  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24972485 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcaggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 24972584  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24972585 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttccgagacctgaacaaagccagtccaaaagataactttccatta 24972684  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24972685 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtccaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcaaatcaaaatgtctcctgaag 24972784  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24972785 atagagaaaagacatcttttatcaccccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaataaatgctggtgct 24972867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 32594055 - 32593477
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32594055 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 32593956  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32593955 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 32593856  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32593855 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 32593756  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||| || |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32593755 tgccaatatcgtgcctgtgccaaagaagggtggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaactttccgtta 32593656  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32593655 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 32593556  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctgg 589  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32593555 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctgg 32593477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 28651621 - 28652203
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28651621 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactttagaggaaggggttaaacggaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 28651720  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28651721 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 28651820  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28651821 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 28651920  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28651921 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaagatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 28652020  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28652021 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 28652120  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28652121 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 28652203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 23628348 - 23628931
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23628348 cataggtaccgaggagagcaagcgagaaatcaagatcggtgctattttagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaacttctccgggaatatccggat 23628447  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23628448 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 23628547  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23628548 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 23628647  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagcc-agtccaaaagacaactttccatt 409  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23628648 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagcctagtccaaaagacaactttccatt 23628747  T
Q  410 acctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23628748 acctcatattgatgtgcttgttgataacactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaa 23628847  T
Q  510 gatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  23628848 gatagagaaaagacgtcttttattactccatggggtgccttctgctacaaagtgatgccattcggcctaataaatgctggtgct 23628931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 13322611 - 13322029
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13322611 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaaaatcatccagctcctccgggaatatccggat 13322512  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13322511 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 13322412  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  13322411 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 13322312  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13322311 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 13322212  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13322211 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 13322112  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13322111 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 13322029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24685926 - 24685344
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685926 cataggtaccaaggagaacaagcgagagatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 24685827  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24685826 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggagcattggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaagcagaaat 24685727  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  24685726 tgagaaggactcatccaaatatggccctcaagattaagagcgaggttcaaaaacatattgatgcgggtttcctcatgatagttgagtaccctgaatgggt 24685627  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24685626 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 24685527  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24685526 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaag 24685427  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24685426 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 24685344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 31824188 - 31823606
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31824188 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaagcggaagattatccaactcctccgggaatatccggat 31824089  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824088 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 31823989  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31823988 tgagaaggactcatcccgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 31823889  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31823888 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 31823789  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31823788 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttctggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 31823689  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31823688 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 31823606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 31433843 - 31434425
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31433843 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 31433942  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31433943 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 31434042  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  31434043 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 31434142  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  31434143 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaggacaactttccatta 31434242  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31434243 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 31434342  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31434343 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctactacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 31434425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 43080634 - 43081216
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43080634 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 43080733  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43080734 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 43080833  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43080834 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggcttcctcatgacggttgaataccctgaatgggt 43080933  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43080934 tgccaatatagtacctgtgccaaagaaagatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 43081033  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43081034 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggttttttcggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 43081133  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43081134 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgttacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 43081216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 24726348 - 24726930
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24726348 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctaaaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 24726447  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24726448 atttttgcatggtcatatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgattgtcctcccgtcaggcagaaat 24726547  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24726548 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 24726647  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24726648 tgctaatattgtgcccgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 24726747  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24726748 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttctggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 24726847  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  24726848 atagagaaaagacatcttttatcactccatgggggactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaatcaatgctggtgct 24726930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 2513441 - 2514023
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2513441 cataggtaccgaggagaataagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaagcagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 2513540  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2513541 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgccctcccgtcaggcagaaat 2513640  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  2513641 tgagaaggactcaccctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 2513740  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2513741 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaattttccatta 2513840  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2513841 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 2513940  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2513941 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 2514023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 9319855 - 9320437
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9319855 cataggtaccgaggagaacaagcgggaaatcaagatcggtgctgctctaggggaagaggttaaaagtaagatcatccagctcctacgggaatatccggat 9319954  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9319955 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcaccggatccctaccaagcccgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 9320054  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9320055 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 9320154  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||    
T  9320155 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaaaacaactttccgtta 9320254  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9320255 cctcatatcgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaagatgtctcctgaag 9320354  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9320355 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 9320437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 450; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 593
Target Start/End: Original strand, 3791921 - 3792502
Alignment:
Q  12 ataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggata 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3791921 ataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggata 3792020  T
Q  112 tttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaatt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3792021 tttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcttcccgtcagacagaaatt 3792120  T
Q  212 gagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggtt 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3792121 gagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggtt 3792220  T
Q  312 gccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattac 411  Q
    || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3792221 gctaatattgtaccagtgccgaagaaggatggtaaagtccggatgtgcgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccattac 3792320  T
Q  412 ctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaaga 511  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3792321 ctcatattgatgtgctcgttgataatactgctcaatctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctccggaaga 3792420  T
Q  512 tagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3792421 tagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgttacaaagtgatgccgttcggcctaattaatgctggtgct 3792502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 12134554 - 12135136
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  12134554 cataggtaccgaggagaacaagcgggaaatcaagatcggtgctgctctaggggaagaggttaaaagtaagatcatccagctcctacgggaatatccggat 12134653  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12134654 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcaccggatccctaccaagcccgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 12134753  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12134754 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaatcgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 12134853  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12134854 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcaaggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 12134953  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12134954 cctcatatcgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaagatgtctcctgaag 12135053  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12135054 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 12135136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 23894585 - 23895167
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  23894585 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaggaagatcatccagctcctccgagaatacccggat 23894684  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23894685 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggagcatcggatccccacaaaacctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 23894784  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  23894785 tgagaaggacccatccagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 23894884  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23894885 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 23894984  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  23894985 cctcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaaggtgttctccttcatggatggcttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgagg 23895084  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23895085 atagagaaaatacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 23895167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 34618897 - 34619479
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||| ||||    
T  34618897 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaaaagaagattgtccagctcctccgggaatatctggat 34618996  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34618997 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 34619096  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  34619097 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 34619196  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34619197 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 34619296  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34619297 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctccggaag 34619396  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34619397 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgttacaaagtgatgtcgttcggcctaatcaatgctggtgct 34619479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 5640167 - 5640749
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5640167 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaggatcatccaactcctccgggaatatccagat 5640266  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640267 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 5640366  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  5640367 tgagaaggactcatcctgatatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 5640466  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640467 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 5640566  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5640567 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaagatgtctcctgaag 5640666  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5640667 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 5640749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 18373315 - 18372733
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18373315 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaggatcatccaactcctccgggaatatccagat 18373216  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18373215 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 18373116  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  18373115 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 18373016  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18373015 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 18372916  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18372915 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 18372816  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18372815 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 18372733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 28957566 - 28956984
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  28957566 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaaggttggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagattgtccagctcctccgggaatatccggat 28957467  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28957466 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 28957367  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28957366 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaaaagcgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 28957267  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28957266 tgctaatattgtgcccgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaattttccatta 28957167  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28957166 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctccggaag 28957067  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28957066 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtaatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 28956984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 37356424 - 37355842
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356424 cataggtaccgaagaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 37356325  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37356324 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 37356225  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  37356224 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 37356125  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37356124 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccacta 37356025  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37356024 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 37355925  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37355924 atagagaaaagacatcttttgtcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggtctaatcaatgctggtgct 37355842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 6876684 - 6877266
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6876684 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagattggtgctgctctagagaaaggggttaaacagaagatcatccggctcctccgggaatatccggat 6876783  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876784 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctacgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 6876883  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  6876884 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 6876983  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876984 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 6877083  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6877084 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttctggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 6877183  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  6877184 atagagaaaagacatcttttatcactccatgggggaccttctgctacaaagtgatgccattcggcctaatcaatgctggtgct 6877266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 8663256 - 8662674
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8663256 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 8663157  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8663156 atttttgcatggtcctatgaagatatgcccggtctagatcatatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgccctcccgtcaggcagaaat 8663057  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  8663056 tgagaaggactcatcccgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 8662957  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8662956 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccgaaagacaactttccatta 8662857  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  8662856 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaagatgtctcctgaag 8662757  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8662756 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 8662674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 26482773 - 26483355
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26482773 cataggtaccgaggagaacaaacgggaaatcaagatcggtgctgctctaggggaagaggttaaaagtaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 26482872  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26482873 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctacgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 26482972  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26482973 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagagcgaggtccaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 26483072  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26483073 tgccaatattgtaccagtgccaaagaaggatggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 26483172  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26483173 cctcatatcgatgtgcttgttgacaatactgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaagatgtctcctgaag 26483272  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26483273 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 26483355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 30154410 - 30154992
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30154410 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 30154509  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30154510 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 30154609  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  30154610 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaaaatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 30154709  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30154710 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagttcggatgtgtattgacttcagagacctgaacaaagccagcccaaaagacaactttccatta 30154809  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  30154810 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaagatgtctcctgaag 30154909  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30154910 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 30154992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 33518759 - 33519341
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33518759 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccgactcctccgggaatatccggat 33518858  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33518859 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcaccggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 33518958  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  33518959 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 33519058  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33519059 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaggtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccgaaagacaactttccatta 33519158  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  33519159 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaagatgtctcctgaag 33519258  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33519259 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 33519341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15756633 - 15756051
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15756633 cataggtaccgaggaaaataagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaagcagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 15756534  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15756533 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 15756434  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  15756433 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 15756334  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15756333 tgccaatattgtgcccgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 15756234  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  15756233 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaagatgtctcctgaag 15756134  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15756133 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 15756051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 30031807 - 30032389
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30031807 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgccactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 30031906  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30031907 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 30032006  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  30032007 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 30032106  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  30032107 tgccaatattgtgcccgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 30032206  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  30032207 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttttccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaagatgtctcctgaag 30032306  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30032307 atagggaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 30032389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 37768772 - 37768190
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37768772 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctaggggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggagtatccggat 37768673  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37768672 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 37768573  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  37768572 tgagaaggactcatcctgatatggccctcaagatcaagaatgaagtccaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 37768473  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37768472 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 37768373  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37768372 cctcatattgacgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgaag 37768273  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37768272 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggtctaatcaatgctggtgct 37768190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 37757362 - 37757944
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37757362 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctaggggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 37757461  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37757462 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 37757561  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| || || ||||||||    
T  37757562 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcttgacagttgagtatcccgaatgggt 37757661  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37757662 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacctgaacaaagccagtccgaaagacaacttcccatta 37757761  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37757762 cctcatattgacgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgaag 37757861  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37757862 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgttacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 37757944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 593
Target Start/End: Original strand, 22890846 - 22891424
Alignment:
Q  13 taggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatat 112  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  22890846 taggtaccgaagagaacaagcgagaaatcaaggtcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgagaatacctggatat 22890945  T
Q  113 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22890946 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggaacatcggatcccaacaaagcctgaatgtcctcccatcaggcagaaattg 22891045  T
Q  213 agaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttg 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||||    
T  22891046 agaaggactcatccagatatgactctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggttg 22891145  T
Q  313 ccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga-acgaagccagtccaaaagacaactttccattac 411  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||      
T  22891146 ccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggaaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgacacaaagccagtccaaaagacaacttcccatt-- 22891243  T
Q  412 ctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaaga 511  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22891244 -tcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtccaaggtattctccttcatggatggtttctctggttacaatcagatcaaaatatcccctgaaga 22891342  T
Q  512 tagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22891343 tagagaaaaggcgtctttcatcaccccctggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 22891424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 593
Target Start/End: Original strand, 25202712 - 25203239
Alignment:
Q  66 ggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatatttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagc 165  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  25202712 ggggttaaaaggaagattatccagctcctccgagagtatccggatatttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggaac 25202811  T
Q  166 atcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagca 265  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25202812 atcggatccccacaaagtctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcattcagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagca 25202911  T
Q  266 gattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgac 365  Q
    |||||||||  |||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25202912 gattgatgcgagttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggttgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgac 25203011  T
Q  366 ttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttca 465  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25203012 ttcagagacttgaacaaagccagtccaaaagacaacttcccattacctcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaaggtgttctccttca 25203111  T
Q  466 tggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgat 565  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25203112 tggacggcttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaagatagagaaaagacatcttttattaccccatggggtactttctgctacaaagtgat 25203211  T
Q  566 gccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  25203212 gccattcggcctaataaatgctggtgct 25203239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 66 - 593
Target Start/End: Original strand, 25266867 - 25267394
Alignment:
Q  66 ggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatatttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagc 165  Q
    |||||||||| || ||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  25266867 ggggttaaaaggaagattatccagctcctccgagagtatccggatatttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggaac 25266966  T
Q  166 atcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagca 265  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25266967 atcggatccccacaaagtctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcattcagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagca 25267066  T
Q  266 gattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgac 365  Q
    |||||||||  |||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25267067 gattgatgcgagttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggttgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgac 25267166  T
Q  366 ttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttca 465  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25267167 ttcagagacttgaacaaagccagtccaaaagacaacttcccattacctcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaaggtgttctccttca 25267266  T
Q  466 tggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgat 565  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25267267 tggacggcttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaagatagagaaaagacatcttttattaccccatggggtactttctgctacaaagtgat 25267366  T
Q  566 gccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  25267367 gccattcggcctaataaatgctggtgct 25267394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 509
Target Start/End: Original strand, 24683821 - 24684319
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24683821 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctaaaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 24683920  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24683921 atttttgcatggtcatatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgattgtcctcccgtcaggcagaaat 24684020  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24684021 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 24684120  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24684121 tgctaatattgtgcccgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcacagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 24684220  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaa 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  24684221 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaagtgttctcctttctggacgggttttctggttaaaatcagatcgaaatgtcgcctgaa 24684319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 575
Target Start/End: Original strand, 34468170 - 34468565
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||| || ||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  34468170 aagcccgaatgtccgccggtcaagcagaaattgagaagaacccgtcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcaaaaacagatcgatgcaggt 34468268  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    || ||  | |||    |||||||| ||||| | ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||| | ||| ||||||| | | | | ||| |    
T  34468269 tttctcgttacatcaaaataccctcaatggctagccaacatagtgcctgttccgaagaaggatggcaaagtcagaatgtgtgttgattaccgtgacctta 34468368  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||  | || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34468369 acaaagctagtcccaaagatgatttcccattacctcatattgatgtactggttgacagcactgcaaaatccaaagtgttctccttcatggatggtttctc 34468468  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggt 575  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  34468469 cggttacaatcagatcaagatggcacccgaagacagagagaagacgtctttcatcacaccttggggcactttctgttacagagtaatgccgttcggt 34468565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 180 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 3484815 - 3484442
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  3484815 aagcctgagtgtcctccggtaaaacagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgatgcaggt 3484717  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || |||||||||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  3484716 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggtaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 3484617  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3484616 acaaggctagtccgaaggataattttcctttgcctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 3484517  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctg 553  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||    
T  3484516 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctg 3484442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 37001015 - 37000822
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  37001015 aaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacagtactgcaaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggttataatcaaa 37000916  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  37000915 tcaagatggcacccgaagatagagagaaaacgtcatttattacaccttggggcactttctgttacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 37000822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 390 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 15785127 - 15784931
Alignment:
Q  390 ccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatc 489  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  15785127 ccaaaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacagtactgccaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggttataatc 15785028  T
Q  490 agatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    | ||||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  15785027 aaatcaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttattacaccttggggcactttttgctacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 15784931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Original strand, 31520068 - 31520261
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  31520068 aaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacagtactgcaaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggttataatcaaa 31520167  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  31520168 tcaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttattacaccttggggcactttttgctacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 31520261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 36376361 - 36376168
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || |||| |||||| ||||| |    
T  36376361 aaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacagtactgcaaagtctaaagtcttctcattcatggatggattcttcggttataatcaaa 36376262  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  36376261 tcaagatggcacccgaagatagagagaaaacgtcatttattacaccttggggcactttctgttacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 36376168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 352827 - 352450
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| || || | |||||| ||||| ||||||    
T  352827 aagcccgagtgtcctccagtcaagcagaagttaagaagatctcatccagatatggctctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgacgcaggt 352729  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    ||| | || ||   |||||| ||| ||||| | ||||| || || || || || || || |||||||| ||| | ||| |||||||||   | |   |||    
T  352728 ttcttgattacctctgaatatcctcaatggttggccaacatagtgcccgttccgaagaaagatggtaaggtcagaatgtgtgttgactatcgggatttga 352629  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||   |  |||||||||||||||||||| || || ||    
T  352628 acaaagctagtccgaaggatgatttccctttacctcacattgatgtattggttgatagtactgctagatgcaaggtgttctccttcatggatgggttttc 352529  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctac 557  Q
    ||| || || |||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  352528 cgggtataaccagatcaagatggctccggaagatagagaaaacacgtctttcatcacgccatggggcgctttctgctac 352450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5440624 - 5440431
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  5440624 aaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacagtactgcaaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggttataatcaaa 5440525  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  5440524 tcaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttattacaccttggggcactttttgttacaaagtaatgtcgttcggtttaatcaatgc 5440431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Original strand, 17956857 - 17957050
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||| ||| | || || | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  17956857 aaagacgacttccctttacctcatattgacgtgttggtcgacagtactgcaaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggttataatcaaa 17956956  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  17956957 tcaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttattacaccttggggcactttctgttacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 17957050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 20389601 - 20389189
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| || || | |||||| ||||| ||||||    
T  20389601 aagcctgagtgtcctccagtcaagcagaagttaagaagatctcatccagatatggctctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgacgcaggt 20389503  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    ||| | || ||    ||||| ||| ||||| | ||||| || || || || || || || |||||||| ||| | ||| ||||||| |   | |   |||    
T  20389502 ttcttgatcacctcggaatatcctcaatggttggccaacatagtgcccgttccaaagaaagatggtaaggtcagaatgtgtgttgattatcgggatttga 20389403  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||   |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  20389402 acaaagctagtccgaaagatgatttccctttacctcacattgatgtattggttgatagtactgctagatgcaaggtattctccttcatggatggattctc 20389303  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtcta 578  Q
    ||| || || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||  |||||||||||  ||| |||||||| ||  |     
T  20389302 cgggtataaccagatcaagatggctccagaagatagagaaaagacgtcgttcatcacgccttggggtgctttctgctacttagtaatgccgtttgggttg 20389203  T
Q  579 attaatgctggtgc 592  Q
    || |||||||||||    
T  20389202 ataaatgctggtgc 20389189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 11944813 - 11944628
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||        |    
T  11944813 aaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacaatactgcaaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggtt--------a 11944722  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    | || ||| | || ||||||||||| || || || |||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  11944721 taaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttatcacaccttggggcactttttgttacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 11944628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 70
Target Start/End: Original strand, 25201411 - 25201470
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggt 70  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25201411 cataggtaccgaagagaacaagcgagaaatcaaggtcggtgctgctctagaggagggggt 25201470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 70
Target Start/End: Original strand, 25265566 - 25265625
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggt 70  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25265566 cataggtaccgaagagaacaagcgagaaatcaaggtcggtgctgctctagaggagggggt 25265625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 503; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 44875 - 44293
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44875 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 44776  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44775 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 44676  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  44675 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 44576  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44575 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtctaaaagacaactttccatta 44476  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44475 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctccggaag 44376  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  44375 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 44293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 382; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 132 - 593
Target Start/End: Original strand, 2560 - 3021
Alignment:
Q  132 gatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagata 231  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2560 gatatgccaggtctagatcctaagattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagata 2659  T
Q  232 tggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcc 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2660 tggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcc 2759  T
Q  332 caaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgtt 431  Q
     || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2760 aaagaaggatggtaaagtccggatatgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgtt 2859  T
Q  432 gataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtctttta 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2860 gataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtctttta 2959  T
Q  532 tcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  2960 tcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccattcggcctaataaatgctggtgct 3021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 265 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 32775 - 32447
Alignment:
Q  265 agattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttga 364  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32775 agattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatatgtgttga 32676  T
Q  365 cttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttc 464  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32675 cttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttc 32576  T
Q  465 atggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtga 564  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  32575 atggatggtttctctggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtga 32476  T
Q  565 tgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  32475 tgccattcggcctaataaatgctggtgct 32447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 132 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 37862 - 37727
Alignment:
Q  132 gatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagata 231  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37862 gatatgccaggtctagatcctaagattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagata 37763  T
Q  232 tggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaga 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37762 tggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacaga 37727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 37950 - 37861
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccggga 100  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37950 cataggtaccaaagagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccggga 37861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 100
Target Start/End: Original strand, 2528 - 2561
Alignment:
Q  67 gggttaaaaagaggatcatccaactcctccggga 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2528 gggttaaaaagaagatcatccaactcctccggga 2561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 503; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 22932711 - 22932129
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22932711 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 22932612  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22932611 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 22932512  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  22932511 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgagtgggt 22932412  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22932411 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 22932312  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22932311 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 22932212  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22932211 atagagaaaagacgtctttcatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 22932129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 23855156 - 23854574
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23855156 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 23855057  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23855056 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 23854957  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  23854956 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgagtgggt 23854857  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854856 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 23854757  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854756 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 23854657  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854656 atagagaaaagacgtctttcatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 23854574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 26920746 - 26921328
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26920746 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 26920845  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26920846 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggaacatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcaaaaat 26920945  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26920946 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 26921045  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921046 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggacggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 26921145  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921146 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 26921245  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26921246 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgtcgttcggtctaattaatgctggtgct 26921328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 495; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 15422147 - 15421565
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15422147 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccaggaatatccggat 15422048  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15422047 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 15421948  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15421947 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 15421848  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15421847 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 15421748  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15421747 cctcatattgatgtgctcgttgataacactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 15421648  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15421647 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 15421565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 16676509 - 16677091
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16676509 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 16676608  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676609 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 16676708  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16676709 tgaggaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 16676808  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16676809 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaactttccatta 16676908  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16676909 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 16677008  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16677009 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 16677091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 16752190 - 16752772
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752190 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 16752289  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16752290 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatggcctcccgtcaggcagaaat 16752389  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16752390 tgagaatgaatcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 16752489  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752490 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggacggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctaaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 16752589  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16752590 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 16752689  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16752690 atagagaaaagacgtcttttatcactccgtggggtactttctgctacaaagtgatgctgttcggcctaattaatgctggtgct 16752772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 24866085 - 24866667
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24866085 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgggaatacccggat 24866184  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24866185 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagattctaagattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgttaggcagaaat 24866284  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24866285 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 24866384  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24866385 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaagatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 24866484  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24866485 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccagttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 24866584  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24866585 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 24866667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 27021505 - 27022087
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27021505 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtactattctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctctgggaatatccggat 27021604  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27021605 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 27021704  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27021705 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 27021804  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27021805 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 27021904  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27021905 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 27022004  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  27022005 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgctgttcggcctaataaatgctggtgct 27022087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 3698452 - 3699034
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3698452 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagatcggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 3698551  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3698552 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 3698651  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  3698652 tgaggaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 3698751  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3698752 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaactttccatta 3698851  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3698852 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 3698951  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  3698952 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 3699034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 13296778 - 13296196
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13296778 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccgaat 13296679  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13296678 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcgaatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 13296579  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13296578 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 13296479  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13296478 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtattgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttcaatta 13296379  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13296378 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccagttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 13296279  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  13296278 atagagaaaagacgtcttttatcaccccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 13296196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 34462333 - 34461751
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34462333 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaaaagaggattatccaactcctccgggaatatccggat 34462234  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34462233 attttcgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctacgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 34462134  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  34462133 tgagaaggactcatccagacatggccctcaagatcaagaatgaagtccaaaagcagattgatgcaggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 34462034  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  34462033 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccgaaagacaactttccgtta 34461934  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34461933 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 34461834  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34461833 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 34461751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 12 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27288190 - 27287609
Alignment:
Q  12 ataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  27288190 ataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggctaaaaagaagatcatccagctcctccgggaatatccggaca 27288091  T
Q  112 tttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27288090 tttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctaaaattgtggagcatcggatccccacaaagcctgaatgtcctcccgtcaggtagagatt 27287991  T
Q  212 gagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggtt 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27287990 gagaaggactcgtccagatatggctctcaagatcaagagcgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgaataccctgaatgggtt 27287891  T
Q  312 gccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattac 411  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27287890 gccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgcgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccattac 27287791  T
Q  412 ctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaaga 511  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287790 ctcatattgatgtgctcgttgataacactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaaga 27287691  T
Q  512 tagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27287690 tagagaaaagacgtcttttatcaccccatgggggactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 27287609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 465; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 26991258 - 26991844
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaag--aggatcatccaactcctccgggaatatccgg 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26991258 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaaagaaagatcatccaactcctccgggaatatccgg 26991357  T
Q  109 atatttttg--catggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcag 206  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26991358 atattttttgtcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggaacatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcag 26991457  T
Q  207 aaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  26991458 aaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcgtgaat 26991557  T
Q  307 gggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttcc 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26991558 gggttgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttcc 26991657  T
Q  407 attacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcct 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26991658 attacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcct 26991757  T
Q  507 gaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26991758 gaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 26991844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27270414 - 27269832
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27270414 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgggaatatccggac 27270315  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27270314 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctagaattgtggagcatcggatccccacaaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 27270215  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27270214 tgagaaggactcgtccagatatggctctcaagatcaagagcgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 27270115  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27270114 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgcgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 27270015  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  27270014 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaagtgttctccttcatggatggtttctccgggtacaatcaaatcaaaatgtctcctgaag 27269915  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27269914 atagagaaaagacgtctttcatcaccccatgggggactttctgttacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 27269832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 27010100 - 27010682
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27010100 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 27010199  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27010200 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 27010299  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  27010300 tgagaaggactcatcccgatatggctctcaagattaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 27010399  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27010400 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacctgaacaaagccagtccaaaggacaactttccatta 27010499  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27010500 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 27010599  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27010600 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 27010682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 27487502 - 27488084
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27487502 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaagggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 27487601  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27487602 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 27487701  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  27487702 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 27487801  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  27487802 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacagggccagtccaaaagacaactttccatta 27487901  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27487902 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 27488001  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27488002 atagagaaaagacatctttcatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggtctaatcaatgctggtgct 27488084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27627538 - 27626956
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  27627538 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgggaatatccggac 27627439  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27627438 atctttgcatggtcgtatgaggatatgccaggtctagatcctaaaattgtggagcatcggatccccacaaagcctgaatgtcctcccggcaggcagaaat 27627339  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27627338 tgagaaggactcatccagatatggctcttaagattaagagtgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgaataccctgaatgggt 27627239  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27627238 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacttgaacaaagccagtccaaaagacagcttcccatta 27627139  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27627138 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 27627039  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||    
T  27627038 atagagaaaagacatcttttatcaccccatgggggactttctgctacaaggtgatgccattcggcctaattaacgctggtgct 27626956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 4775249 - 4775831
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4775249 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 4775348  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4775349 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtagagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 4775448  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  4775449 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 4775548  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4775549 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 4775648  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4775649 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 4775748  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4775749 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgtcgttcggcctaatcaatgctggtgct 4775831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 29575383 - 29575965
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29575383 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacggaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 29575482  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29575483 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtagagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 29575582  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29575583 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaggttgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 29575682  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29575683 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 29575782  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29575783 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggatggtttttctggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 29575882  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  29575883 atagagaaaagacatcttttatcactccatgtgggactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaatcaatgctggtgct 29575965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 29503785 - 29504367
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29503785 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 29503884  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29503885 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctacgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcaaaaat 29503984  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29503985 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 29504084  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  29504085 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacttgaataaagccagtccaaaggacaactttccgtta 29504184  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  29504185 cctcatattgatgtgcttgtcgataatactactcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgagg 29504284  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29504285 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 29504367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 16941854 - 16941272
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16941854 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 16941755  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16941754 attttcgcatggtcatatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcctgtcaggcagaaat 16941655  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16941654 tgagaaggactcatccggatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgctggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 16941555  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16941554 tgctaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaggccagtccgaaagacaactttccatta 16941455  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16941454 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaagatgtctcctgaag 16941355  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16941354 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 16941272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 592
Target Start/End: Original strand, 4760132 - 4760713
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760132 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaagggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 4760231  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4760232 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 4760331  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  4760332 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 4760431  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4760432 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 4760531  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4760532 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 4760631  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgc 592  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  4760632 atagagaaaagacatcctttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgc 4760713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 4543601 - 4543019
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4543601 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 4543502  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4543501 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 4543402  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  4543401 tgaggaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagatcgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 4543302  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4543301 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 4543202  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4543201 cctcatattgatgtgattgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaag 4543102  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  4543101 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgttacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgccggtgct 4543019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26114239 - 26113657
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26114239 cataggtaccgaagaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 26114140  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26114139 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 26114040  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26114039 tgaggaggactcatcctgatatggccctcaagattaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccccgaatgggt 26113940  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26113939 tgccaatattgtgcctgtgccgaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgatttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 26113840  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26113839 ccccatattgacgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 26113740  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26113739 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgttacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 26113657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 30555843 - 30555261
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30555843 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaagaaggggttaaacagaagatcatccgactcctccgggaatatccggat 30555744  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30555743 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 30555644  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  30555643 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 30555544  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30555543 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaggtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccgaaagacaactttccatta 30555444  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  30555443 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaagatgtctcctgaag 30555344  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30555343 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 30555261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 4527653 - 4528236
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4527653 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctaccctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 4527752  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4527753 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 4527852  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttga-ataccctgaatggg 309  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  || || |||||||    
T  4527853 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagattaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagtggaggtatcccgaatggg 4527952  T
Q  310 ttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatt 409  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4527953 ttgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgactttagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtt 4528052  T
Q  410 acctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4528053 acctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaa 4528152  T
Q  510 gatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4528153 gatagagaaaagacatcttttatcacgccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 4528236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 28209823 - 28210405
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28209823 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 28209922  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28209923 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 28210022  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  28210023 tgaggaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagatcgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 28210122  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28210123 tgccaatattgtgcctgtgccgaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgatttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 28210222  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28210223 ccccatattgacgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 28210322  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  28210323 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgttacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgccggtgct 28210405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 4721962 - 4721380
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721962 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 4721863  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4721862 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 4721763  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  4721762 tgaggaggactcatcctgacatggccctcaagatgaagaatgaagttcaaaagcagatcgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 4721663  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  4721662 tgccaatattgtgcctgtgccgaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgatttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttctgtta 4721563  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4721562 ccccatattgacgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 4721463  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  4721462 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgttacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgccggtgct 4721380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 177 - 593
Target Start/End: Original strand, 29552092 - 29552508
Alignment:
Q  177 accaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcag 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  29552092 accaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgg 29552191  T
Q  277 gtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcct 376  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  29552192 gtttcctcatgacggttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagatct 29552291  T
Q  377 gaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttc 476  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29552292 gaacaaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttc 29552391  T
Q  477 tccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtc 576  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  29552392 tccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatgggggactttctgctacaaagtgatgccattcggcc 29552491  T
Q  577 taattaatgctggtgct 593  Q
    |||| ||||||||||||    
T  29552492 taataaatgctggtgct 29552508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 17090270 - 17089692
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  17090270 cataggtaccgaggagaacaagagagaaatcaaggtcggtgccactttagaggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccaggaatacccggat 17090171  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  17090170 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggactagatcctaagattgtggaacatcggatcccaacaaagcctgaatgccctcccgtcaagcagaaat 17090071  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  17090070 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacagtcgaatatcctgaatgggt 17089971  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  17089970 tgccaatattgttcctgtgccaaagaaagatggaaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtctaaaagacaacttcccacta 17089871  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  17089870 ccccacattgatgtacttgttgacaatactgctcagtccaaggtattctctttcatggatggcttttccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgagg 17089771  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctgg 589  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  17089770 atagagaaaagacatctttcatcaccccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcttaataaatgctgg 17089692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 20162989 - 20163571
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||| ||||| || ||||| ||     
T  20162989 cataggtactgaagagaacaagcgagaaatcaaggttggtgccactctagaggaaggggttaagaagaagatctttcaacttctccgagagtatccagac 20163088  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20163089 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagatcgtggaacatcgaatcccaaccaagcccgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 20163188  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||| | |||||    
T  20163189 tgagaagaactcgtccagatatggctctcaagatcaagagtgaggttcagaagcagattgatgcaggttttctcatgacagtcgagtatcctaagtgggt 20163288  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20163289 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatgggaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacctgaacagagccagtccaaaagacaacttcccatta 20163388  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20163389 cctcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcaatccaaagtgttctctttcatggatggcttctctggttacaatcagatcaagatgtcccctgaag 20163488  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||    
T  20163489 atagagaaaagacgtctttcatcaccccatggggtactctctgttacaaagtgatgtcgttcggcctgataaatgctagtgct 20163571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 22169842 - 22169260
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||| || || |||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||| ||||| || ||||| ||     
T  22169842 cataggtactgaagagaacaagcgagaaatcaaggttggtgccactctagaggaaggggttaagaagaagatctttcaacttctccgagagtatccagac 22169743  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22169742 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagatcgtggaacatcgaatcccaaccaagcccgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 22169643  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || || ||| | |||||    
T  22169642 tgagaagaactcgtccagatatggctctcaagatcaagagtgaggttcagaagcagattgatgcaggttttctcatgacagtcgagtatcctaagtgggt 22169543  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22169542 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatgggaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacctgaacagagccagtccaaaagacaacttcccatta 22169443  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  22169442 cctcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcaatccaaagtgttctctttcatggatggcttctctggttacaatcagatcaagatgtcccctgaag 22169343  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||| || || |||||| |||||    
T  22169342 atagagaaaagacgtctttcatcaccccatggggtactctctgttacaaagtgatgtcgttcggcctgataaatgctagtgct 22169260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 283
Target Start/End: Original strand, 27046756 - 27047028
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046756 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 27046855  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27046856 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 27046955  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcct 283  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27046956 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcct 27047028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 308 - 593
Target Start/End: Original strand, 27060172 - 27060457
Alignment:
Q  308 ggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttcca 407  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27060172 ggttgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtctgttgacttcagagatctgaacaaagccagtccaaaagacaactttcca 27060271  T
Q  408 ttacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctg 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27060272 ttacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctg 27060371  T
Q  508 aagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  27060372 aagatagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttttgctacaaagtgatgccgttcggcttgataaatgctggtgct 27060457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 172
Target Start/End: Original strand, 29551849 - 29552011
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgg-gaatatccgga 109  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29551849 cataggtaccaaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccggcgaatatccgga 29551948  T
Q  110 tatttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggat 172  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29551949 tatgtttgcatggtcgtatgaagattggccgcgtctagatcctatgattgtggagcatcggat 29552011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Original strand, 18119007 - 18119383
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  18119007 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgatgcaggt 18119105  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || |||||||||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  18119106 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggtaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 18119205  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18119206 acaaggctagtccgaaggataattttcctttgcctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 18119305  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  18119306 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 18119383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 18213327 - 18212951
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  18213327 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgatgcaggt 18213229  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || ||||||||| || | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  18213228 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggtaaaatcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 18213129  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18213128 acaaggctagtccgaaggataattttcctttgcctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 18213029  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  18213028 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 18212951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 9136798 - 9136605
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  9136798 aaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacagtactgcaaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggttataatcaaa 9136699  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  9136698 tcaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttattacaccttggggcactttctgttacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 9136605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 23972424 - 23972052
Alignment:
Q  184 ctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcc 282  Q
    |||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||| || || ||| || || | |||||||||||||||||||||||    
T  23972424 ctgagtgtcctccagtaaagcagaaattgagaagatctcatcccgatatgaccctcaaaatcaaagag-gaagtgcgaaagcagattgatgcaggtttcc 23972326  T
Q  283 taatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacga 382  Q
    || | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || || || || || || ||||| |||||| | ||| ||||||| |   | | | ||||| |    
T  23972325 tagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcccgttccaaagaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttgaacaa 23972226  T
Q  383 agccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggt 482  Q
     || ||||| || || || || || |||||||| ||||||||  | |||||||| || ||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  23972225 ggctagtccgaaggataatttccctttacctcacattgatgtattggttgataacaccgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctccggc 23972126  T
Q  483 tacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  23972125 tacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 23972052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 592
Target Start/End: Original strand, 27544440 - 27544852
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  27544440 aagcccgagtgtcctccagtcaagcagaagttaagaagatctcatccagatatggctctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgatgcaggt 27544538  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    ||| | || ||   |||||| ||| ||||| | ||||| || || || || || || || |||||||| ||| | ||| |||||||||   | |   |||    
T  27544539 ttcttgattacctctgaatatcctcaatggttggccaacatagtgcccgttccaaagaaagatggtaaggtcagaatgtgtgttgactatcgggatttga 27544638  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||   |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  27544639 acaaagctagtccgaaggatgatttccctttacctcacattgatgtattggttgatagtactgctagatgcaaggtattctccttcatggatggattctc 27544738  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtcta 578  Q
    ||| || || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| | |||||||||  ||| |||||||| ||  |     
T  27544739 cgggtataaccagatcaagatggctccagaagatagagaaaagacgtcgttcatcacgccttggggcgcgttctgctacttagtaatgccgtttgggttg 27544838  T
Q  579 attaatgctggtgc 592  Q
    || |||||||||||    
T  27544839 ataaatgctggtgc 27544852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 40 - 111
Target Start/End: Original strand, 29552016 - 29552087
Alignment:
Q  40 tcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggata 111  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29552016 tcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacggaagatcatccaactcctccgggaatatccggata 29552087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Original strand, 25706625 - 25706689
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagat 244  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  25706625 aagcccgagtgtcctccagtcaagcagaagttaagaagatctcatccagatatggctctgaagat 25706689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 499; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 29665 - 30247
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29665 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 29764  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29765 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 29864  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  29865 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 29964  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29965 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 30064  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30065 cctcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 30164  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30165 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 30247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 155 - 593
Target Start/End: Original strand, 18585 - 19024
Alignment:
Q  155 gattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgag 254  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18585 gattgtggaacatcggatcccaacaaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagggag 18684  T
Q  255 gttcaaaagcagattgatgcaggtttc-ctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccgg 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  18685 gttcaaaagcagattgatgcgggtttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggttgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggaaaagtccgg 18784  T
Q  354 atgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaagg 453  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18785 atgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaatttcccattacctcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaagg 18884  T
Q  454 tgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctg 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  18885 tgttctccttcatggatggcttctccggttacaatctgatcaaaatgtcccctgaagatagagaaaagacgtcttttatcaccccatgggatactttctg 18984  T
Q  554 ctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18985 ctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 19024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 155 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18071 - 17894
Alignment:
Q  155 gattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgag 254  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18071 gattatggaacatcggatcccaacaaagcctgaacgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgag 17972  T
Q  255 gttcaaaagcagattgatgcagg-tttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcc 331  Q
    |||||||||||||||||||| || ||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971 gttcaaaagcagattgatgcgggtttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcc 17894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 18190 - 18069
Alignment:
Q  13 taggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatat 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18190 taggtaccgaggagaacaagcgagagatcaaggtcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaggaagatcttccagctcctccgagaatacccggatat 18091  T
Q  113 ttttgcatggtcgtatgaagat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18090 ttttgcatggtcgtatgaagat 18069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 18466 - 18587
Alignment:
Q  13 taggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatat 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18466 taggtaccgaggagaacaagcgagagatcaaggtcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaggaagatcttccagctcctccgagaatacccggatat 18565  T
Q  113 ttttgcatggtcgtatgaagat 134  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  18566 ttttgcttggtcgtatgaagat 18587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 499; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 5130365 - 5130947
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5130365 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 5130464  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5130465 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 5130564  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5130565 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 5130664  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  5130665 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccattg 5130764  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5130765 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 5130864  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5130865 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 5130947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 2156943 - 2157525
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2156943 cataggtaccgaggagaacaagcgagagatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 2157042  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157043 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggagcatcggatccccacgaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 2157142  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2157143 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 2157242  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2157243 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 2157342  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2157343 cctcatattgatgtacttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 2157442  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2157443 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 2157525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 10914638 - 10914056
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10914638 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgcttctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 10914539  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10914538 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 10914439  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10914438 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 10914339  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10914338 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 10914239  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10914238 cctcatattgatgtgctcgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 10914139  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  10914138 atagagaaaagacgtcttttatcactccatgcggtactttctgctacaaagtgatgctgttcggcctaataaatgctggtgct 10914056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26535644 - 26535060
Alignment:
Q  9 agcataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccgg 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26535644 agcataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacggaagatcatccaactcctccgggaatatccgg 26535545  T
Q  109 atatttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26535544 atatttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctggatgtcctcccgtcaggcagaa 26535445  T
Q  209 attgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  26535444 attgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgg 26535345  T
Q  309 gttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccat 408  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |    
T  26535344 gtcgccaatattgtgcctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaatagagccagtccaaaagacaactttccgt 26535245  T
Q  409 tacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctga 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26535244 tacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctga 26535145  T
Q  509 agatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  26535144 agatagagaaaagacatcatttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgacattcggtctaattaatgctggtgct 26535060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 11422548 - 11421966
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11422548 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 11422449  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11422448 atttttgcatggtcgtatgaagatatgtcaggtctagatcctatgattgtggaacatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 11422349  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11422348 taagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 11422249  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11422248 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 11422149  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11422148 cctcacattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaagttgttctccttcatggacggtttctccggttacaaccagatcaaaatgtcttctgaag 11422049  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  11422048 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgtttggcctaataaatgctggtgct 11421966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26272855 - 26272273
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26272855 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacggaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 26272756  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26272755 atttttgcatggtcatatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcagacagaaat 26272656  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  26272655 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggcttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 26272556  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26272555 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 26272456  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26272455 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaaatcaaaatgtctcccgaag 26272356  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26272355 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaattaatgctggtgct 26272273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 26437626 - 26438208
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26437626 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacggaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 26437725  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26437726 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 26437825  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26437826 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccccgaatgggt 26437925  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| || |||    
T  26437926 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaatagagccagtccaaaagacaacttcccgtta 26438025  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26438026 cctcatatttatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 26438125  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26438126 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 26438208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 2107932 - 2107351
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2107932 cataggtaccgaggaaaacaagcaagagatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 2107833  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2107832 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 2107733  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2107732 tgagaaggactcatctagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 2107633  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2107632 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 2107533  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2107532 cctcatattgatgtgctcgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 2107433  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgc 592  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  2107432 atagggaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctataaagtgatgccattcggcttaataaatgctggtgc 2107351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 474; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 16516199 - 16515618
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16516199 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgccgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 16516100  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16516099 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtcgagcatcggatccccacaaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 16516000  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16515999 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcaaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 16515900  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16515899 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 16515800  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16515799 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctccggaag 16515700  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgc 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  16515699 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtggtgccattcggcctaataaatgctggtgc 16515618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 5145109 - 5144527
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5145109 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacggaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 5145010  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5145009 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccagggctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 5144910  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5144909 tgagaaggactcatccagatatggccctcaagatcaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 5144810  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||     
T  5144809 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaactttccattg 5144710  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5144709 cctcatattgatgtgcttgttgataacactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaaatcaaaatgtctcccgaag 5144610  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5144609 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 5144527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 26515161 - 26515743
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26515161 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggagggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 26515260  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26515261 atttttgcatggtcctatgaagatatgtcaggtctagaccctacgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 26515360  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26515361 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagtgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 26515460  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26515461 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccgaaagacaactttccatta 26515560  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26515561 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 26515660  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26515661 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 26515743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 589
Target Start/End: Original strand, 11443256 - 11443834
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11443256 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatctaactcctccgggaatatccggat 11443355  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11443356 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 11443455  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11443456 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacaaattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 11443555  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11443556 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtagagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccctta 11443655  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11443656 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 11443755  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctgg 589  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  11443756 atagagaaaagacatcttttatcactccatgggggactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaatcaatgctgg 11443834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 459; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 9621019 - 9621601
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9621019 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaggatcatccagctcctccgggaatatccggat 9621118  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9621119 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctacgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 9621218  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  9621219 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 9621318  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9621319 tgccaatattgtaccagtgccaaagaaggatggtaaagtccgaatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 9621418  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9621419 cctcatatcgatgtgcttgttgacaatactgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaagatgtctcctgaag 9621518  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9621519 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 9621601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 4143015 - 4142433
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4143015 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctaaaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 4142916  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4142915 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcagacagaaat 4142816  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4142815 tgagaaggactcctcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 4142716  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4142715 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 4142616  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4142615 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttctggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 4142516  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  4142515 atagagaaaagacatcttttatcactccatgggggaccttctgctacaaagtgatgccattcggcctaatcaatgctggtgct 4142433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 4201758 - 4202340
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4201758 cataggtaccgaggagaacaagcgggaaatcaagatcggtgctgctctaggggaagaggttaaaagtaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 4201857  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4201858 attttcgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 4201957  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4201958 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagatcaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgaataccctgaatgggt 4202057  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4202058 tgctaatattgtgcctgtgccgaagaaggatggtaaagtccggatgtgcgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 4202157  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4202158 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctccggaag 4202257  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4202258 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtaatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 4202340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26317617 - 26317035
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  26317617 cataggtaccgaggagaacaagcgggaaatcaagatcggtgctgctctaggggaagaggttaaaagtaagatcatccagctcctacgggaatatccggat 26317518  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26317517 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcaccggatccctaccaagcccgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 26317418  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26317417 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 26317318  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26317317 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 26317218  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26317217 cctcatatcgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaagatgtctcctgaag 26317118  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26317117 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 26317035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 31562159 - 31561577
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31562159 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 31562060  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31562059 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtagagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 31561960  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31561959 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagtgaagtacaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 31561860  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31561859 tgctaatattgtgcctgtgccgaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 31561760  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31561759 cctcatattgatgtgcttgttgataacactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 31561660  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31561659 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgtcgttcggcctaatcaatgctggtgct 31561577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 3447675 - 3448257
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3447675 cataggtaccgaggaaaataagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaagcagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 3447774  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3447775 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgccctcccgtcaggcagaagt 3447874  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3447875 tgagaaggactcatcccgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 3447974  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3447975 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 3448074  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3448075 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttctggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 3448174  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  3448175 atagagaaaagacatcttttatcactccatgggggaccttctgctacaaagtgatgccattcggcctaatcaatgctggtgct 3448257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 16749286 - 16748704
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16749286 cataggtaccgaggagaataagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaagcagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 16749187  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16749186 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 16749087  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16749086 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaagttcagaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 16748987  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16748986 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 16748887  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748886 cctcatatcgatgtgcttgttgacaatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 16748787  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16748786 atagagaaaagacatcttttatcactccatgggggactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 16748704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 17525903 - 17526485
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17525903 cataggtaccgaggagaataagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaagcagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 17526002  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17526003 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 17526102  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  17526103 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaagttcagaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 17526202  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17526203 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 17526302  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17526303 cctcatatcgatgtgcttgttgacaatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 17526402  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17526403 atagagaaaagacatcttttatcactccatgggggactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 17526485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24590303 - 24589721
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24590303 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaggatcatccaactcctccgggaatatccagat 24590204  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24590203 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 24590104  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  24590103 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 24590004  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24590003 tgccaatattgtgcctgtgccgaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 24589904  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24589903 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 24589804  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  24589803 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 24589721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 26667683 - 26667101
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26667683 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 26667584  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26667583 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 26667484  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  26667483 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaaaatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 26667384  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26667383 tgccaatattgtgcctgtaccaaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagcccaaaagacaactttccatta 26667284  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26667283 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaagatgtctcctgaag 26667184  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26667183 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 26667101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 45389589 - 45390171
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45389589 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaaggtcatccaactcctccgggaatatccggat 45389688  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45389689 atttttgcatggtcctatgaagatatgcccggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 45389788  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  45389789 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacggttgagtaccctgaatgggt 45389888  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45389889 tgctaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 45389988  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45389989 cctcatatcgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgaag 45390088  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  45390089 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 45390171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 16447775 - 16447193
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  16447775 cataggtaccgaagagaacaagcgagaaatcaaggtcggtgctgctctagaggaaagggttaaaaggaagatcatccagctcctccgagaatacccggat 16447676  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16447675 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggaacatcggatccccacaaagcctgaatgtcctctcgtcaggcagaaat 16447576  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||    
T  16447575 tgagaaggacccatccagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacggtcgagtatcctgaatgggt 16447476  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16447475 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggaaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaacttcccatta 16447376  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16447375 cctcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaaggtgttctccttcatggatggcttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaag 16447276  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16447275 atagagaaaagacgtcttttatcaccccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 16447193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 16043688 - 16044270
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  16043688 cataggtaccgaagagaacaagcgagaaattaaggtcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgagagtatccggat 16043787  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16043788 acttttgcatggtcgtatgaagatatgtcaggtctagatcctaagattgtggaacatcagattcccacgaagcctgaatgtcctcccgtcaggaagaaat 16043887  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||    
T  16043888 taagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggt 16043987  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16043988 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggaaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaacttcccatta 16044087  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16044088 cctcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaaggtgttctccttcatggacggcttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgagg 16044187  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16044188 atagagaaaagacatcttttatcaccccatggggtactttctgctacacagtgatgccgttcggtctaataaatgctggtgct 16044270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 17527311 - 17526816
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17527311 cataggtaccgaggagaataagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaagcagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 17527212  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17527211 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 17527112  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  17527111 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaagttcagaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 17527012  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17527011 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 17526912  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcct 506  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17526911 cctcatatcgatgtgcttgttgacaatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcct 17526816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 16734230 - 16733714
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16734230 cataggtaccgaggagaataagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaagcagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 16734131  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16734130 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 16734031  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  16734030 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaagttcagaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 16733931  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16733930 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaagatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 16733831  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16733830 cctcatatcgatgtgcttgttga-catactgctcagtctaa-gtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctg-ag 16733734  T
Q  511 atagagaaaagacgtctttt 530  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  16733733 atagagaaaagacatctttt 16733714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 155 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 10843619 - 10843181
Alignment:
Q  155 gattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgag 254  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10843619 gattgtggaacatcggatcccaacaaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagggag 10843520  T
Q  255 gttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccgga 354  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  10843519 gttcaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggttgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggaaaagtccgga 10843420  T
Q  355 tgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggt 454  Q
    || ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  10843419 tgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaatttcccattaccccatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaaggt 10843320  T
Q  455 gttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgc 554  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |    
T  10843319 gttctccttcatggatggtttctccgattacaatcatatcaaaatgtcccttgaagatagagaaaagacgtcttttatcaccccatggggtactttctac 10843220  T
Q  555 tacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  10843219 tacaaagtgatgccattcggcctaataaatgctggtgct 10843181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 155 - 593
Target Start/End: Original strand, 10844133 - 10844571
Alignment:
Q  155 gattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgag 254  Q
    |||| |||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10844133 gattatggaacatcggatcccaacaaagcctgaacgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgag 10844232  T
Q  255 gttcaaaagcagattgatgcaggtttc-ctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccgg 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  10844233 gttcaaaagcagattgatgcgggtttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggttgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggaaaagtccgg 10844332  T
Q  354 atgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaagg 453  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10844333 atgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaatttcccattacctcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaagg 10844432  T
Q  454 tgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctg 553  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  10844433 tgttctccttcatggatggcttctccggttacaatctgatcaaaatgtcccctgaagatagagaaaagacgtcttttatcac-ccatgggatactttctg 10844531  T
Q  554 ctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10844532 ctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 10844571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 180 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 799123 - 798728
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||| || ||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  799123 aagcccgaatgtccgccggtcaagcagaaattgagaagaacccgtcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcaaaaacagatcgatgcaggt 799025  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||  | |||    |||||||| ||||| | ||||| || ||  |||| || || |||||||| |||||| | ||| ||||||| | | | | ||| |    
T  799024 ttcctcgttacatcaaaataccctcaatggctagccaacatagtgtctgttccgaagaaggatggcaaagtcagaatgtgtgttgattaccgtgacctta 798925  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||| ||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||  | || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  798924 acaaagctagtcccaaagatgattttccattacctcatattgatgtactggttgacaacactgcaaaatccaaagtgttctccttcatggatggtttctc 798825  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggt 575  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  798824 cggttacaatcagatcaagatggcgcccgaagacaaagagaagacgtctttcatcacaccttggggcactttctgttacagagtgatgccgttcggt 798728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Original strand, 15192621 - 15192997
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||||||||||||||||    
T  15192621 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcagattgatgcaggt 15192719  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || ||||| |||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  15192720 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 15192819  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15192820 acaaggctagtccgaaggataattttcctttgcctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgtaaggttttctccttcatggacggtttctc 15192919  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  15192920 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 15192997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 6e-45
Query Start/End: Original strand, 180 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16287979 - 16287584
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    ||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||| || ||| || || ||||| ||||| |||||||||    
T  16287979 aagcccgaatgtccgccggtcaagcagaaattgagaagaacccgtcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcaaaaacagatcgatgcaggt 16287881  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    || ||  | |||    |||||||| ||||| | ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||| | ||| ||||||| | | | | ||| |    
T  16287880 tttctcgttacatcaaaataccctcaatggctagccaacatagtgcctgttccgaagaaggatggcaaagtcagaatgtgtgttgattaccgtgacctta 16287781  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||| ||||| |||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||  | || || ||||||||||||||||| |||| |||    
T  16287780 acaaagctagtcctaaagatgatttcccattacctcatattgatgtactggttgacagcactgcaaaatccaaagtgttctccttcatggatggttcctc 16287681  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggt 575  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  16287680 cggttacaatcagatcaagatggcgcccgaagacagagagaagacgtctttcatcacaccttggggcactttctgttacagagtaatgccgttcggt 16287584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Original strand, 2556073 - 2556449
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  2556073 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgatgcaggt 2556171  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || |||||||||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  2556172 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggtaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 2556271  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2556272 acaaggctagtccgaaggataattttcctttgcctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 2556371  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  2556372 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 2556449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 10844014 - 10844135
Alignment:
Q  13 taggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatat 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  10844014 taggtaccgaggagaacaagcgagagatcaaggtcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaggaagatcttccagctcctccgagaatacccggatat 10844113  T
Q  113 ttttgcatggtcgtatgaagat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10844114 ttttgcatggtcgtatgaagat 10844135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Original strand, 29089054 - 29089430
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  29089054 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgatgcaggt 29089152  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || ||||| |||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  29089153 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 29089252  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29089253 acaaggctagtccgaaggataattttcctttgcctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgcaaggttttctccttcgtggacggtttctc 29089352  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  29089353 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacaccctggggtgctttctgcta 29089430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 180 - 592
Target Start/End: Original strand, 16237019 - 16237431
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||| || || |  || |||||||||||||||    
T  16237019 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcccgagatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgcaaacagattgatgcaggt 16237117  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||  | |||   || |||||| | ||| | ||||| || || || || || || || ||||| |||||| | ||| ||||||| | | | | | |||    
T  16237118 ttcctggtcacatcagagtaccctcagtggttggccaacatagtgcccgttccaaagaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattaccgggacttga 16237217  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || || ||||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16237218 acaaggctagtccgaaggataatttcccattacctcacattgatgtattggttgataacactgctaaatgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 16237317  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtcta 578  Q
    |||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||  ||||||||| || ||  |     
T  16237318 cggttataatcagataaagatggctccggaagatagagaaaagacgtctttcatcacaccttggggcgcttactgctacttagtgatgccatttgggttg 16237417  T
Q  579 attaatgctggtgc 592  Q
    || |||||||||||    
T  16237418 ataaatgctggtgc 16237431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 390 - 586
Target Start/End: Original strand, 9469068 - 9469264
Alignment:
Q  390 ccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatc 489  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||    
T  9469068 ccaaaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacagtactgccaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggttataatc 9469167  T
Q  490 agatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    | ||||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  9469168 aaatcaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttattacaccttggggcactttttgctacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 9469264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 10843738 - 10843617
Alignment:
Q  13 taggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatat 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  10843738 taggtaccgaggagaacaagcgagagatcaaggtcggtgctgctctaaaggaaggggttaaagggaagatcttccagctcctccgagaatacccggatat 10843639  T
Q  113 ttttgcatggtcgtatgaagat 134  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  10843638 ttttgcttggtcgtatgaagat 10843617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 16393821 - 16393628
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  16393821 aaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacagtactgccaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggttataatcaaa 16393722  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  16393721 tcaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttattacaccttggggcactttttgctacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 16393628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 30370333 - 30370140
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  30370333 aaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacagtactgcaaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggttataatcaaa 30370234  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  30370233 tcaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttattacaccttggggcactttctgttacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 30370140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 408 - 556
Target Start/End: Original strand, 25726263 - 25726411
Alignment:
Q  408 ttacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctg 507  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  25726263 ttacctcacattgatgtattggttgataacactgctaaaagcaaggttttctccttcatggacagtttctccggttacaatcagatcaggatggctcctg 25726362  T
Q  508 aagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||  ||||||||||    
T  25726363 aagatagagaaaagacgtctttcatcacaccctagggtgctttctgcta 25726411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 1894175 - 1893763
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  1894175 aagcccgagtgtcctccagtcaagcagaagttaagaagatctcatccagatatggctctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgatgcaggt 1894077  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    ||| | || ||   |||||| ||| ||||| | ||||| || || || || || || || |||||||| ||| | ||| |||||||||   | |   |||    
T  1894076 ttcttgattacctctgaatatcctcaatggttggccaacatagtgcccgttccaaagaaagatggtaaggtcagaatgtgtgttgactatcgggatttga 1893977  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||   |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  1893976 acaaagctagtccgaaggatgatttccctttacctcacattgatgtattggttgatagtactgctagatgcaaggtattctccttcatggatggattctc 1893877  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtcta 578  Q
    ||| || || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| | |||||||||  ||| |||||||| ||  |     
T  1893876 cgggtataaccagatcaagatggctccagaagatagagaaaagacgtcgttcatcacgccttggggcgcgttctgctacttagtaatgccgtttgggttg 1893777  T
Q  579 attaatgctggtgc 592  Q
    || |||||||||||    
T  1893776 ataaatgctggtgc 1893763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 408 - 523
Target Start/End: Complemental strand, 25721142 - 25721027
Alignment:
Q  408 ttacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctg 507  Q
    |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  25721142 ttacctcacattgatgtattggttgataacactgctaaaagcaaggttttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaggatggctcctg 25721043  T
Q  508 aagatagagaaaagac 523  Q
    ||||||||||||||||    
T  25721042 aagatagagaaaagac 25721027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16501163 - 16501113
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctaga 61  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16501163 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgccgctctaga 16501113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 499; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 499; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 20840284 - 20840866
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20840284 cataggtaccgaggagaacaagcgagagatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 20840383  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20840384 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 20840483  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20840484 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 20840583  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20840584 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 20840683  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20840684 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 20840783  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  20840784 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaataaatgctggtgct 20840866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 23126441 - 23125859
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23126441 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctattctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 23126342  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23126341 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcaaaaat 23126242  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  23126241 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 23126142  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23126141 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaactttccatta 23126042  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23126041 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 23125942  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  23125941 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctactacaaagtgatgccattcggcctaataaatgctggtgct 23125859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 28884578 - 28885160
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884578 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctattctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 28884677  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884678 atttttgcatggtcgtatgaaaatatgccaggtctagatcctatggttgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 28884777  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28884778 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 28884877  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28884878 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 28884977  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28884978 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcccgaag 28885077  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  28885078 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgttggtgct 28885160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 487; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 37377542 - 37378124
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37377542 cataggtaccgaggagagcaagcaagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 37377641  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37377642 atttttgcatggtcgtatgaagatatgtcaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcgggcagaaat 37377741  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  37377742 tgagaaggactcatccagatatggctctaaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 37377841  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37377842 tgccaatattgtgcctgtgccaaaaaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagatctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 37377941  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37377942 cctcatattgatgtgcttgttgataacactgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 37378041  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37378042 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaattaatgctggtgct 37378124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 483; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 9347859 - 9347277
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9347859 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 9347760  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347759 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctacgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 9347660  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  9347659 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccccgaatgggt 9347560  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9347559 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaactttccgtta 9347460  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9347459 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 9347360  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9347359 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgttggtgct 9347277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 27806074 - 27806656
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27806074 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 27806173  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27806174 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctacgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 27806273  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27806274 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcnggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 27806373  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27806374 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagttcaaaagacaactttccatta 27806473  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27806474 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 27806573  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27806574 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 27806656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 40235879 - 40236461
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40235879 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaaaagaagatcattcaactcctccgggaatatccggat 40235978  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40235979 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccagggctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctaaatgtcctcccgtcaggcagaaat 40236078  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  40236079 tgaggaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 40236178  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40236179 tgccaatattgtgccggtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaactttccatta 40236278  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40236279 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaaatcaaaatgtctcctgaag 40236378  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40236379 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 40236461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 12589179 - 12589761
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12589179 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 12589278  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12589279 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 12589378  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  12589379 tgaggaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 12589478  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| || |||    
T  12589479 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaacttcccgtta 12589578  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12589579 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 12589678  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12589679 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 12589761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 12657907 - 12658489
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12657907 cataggtaccgaggagaacaagcgagagatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 12658006  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12658007 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 12658106  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12658107 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 12658206  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12658207 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgactttagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 12658306  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12658307 cctcatattgatgtgctcgttgataataccgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgagg 12658406  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||    
T  12658407 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggagtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcttgataaatgctggtgct 12658489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 27432314 - 27431732
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27432314 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgggaatatctggat 27432215  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27432214 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaaaattgtggagcatcggatccccacaaagcctgaatgtcctctcgtcaggcagaaat 27432115  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27432114 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 27432015  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27432014 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 27431915  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27431914 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctctggttacaatcagatcaaaatgtctccggaag 27431815  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27431814 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgcctttcggcctaattaatgctggtgct 27431732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 39049692 - 39049114
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39049692 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 39049593  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39049592 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 39049493  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  39049492 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 39049393  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39049392 tgccaatatcgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaagacaactttccgtta 39049293  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39049292 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 39049193  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctgg 589  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39049192 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctgg 39049114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 471; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 258626 - 258044
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  258626 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 258527  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  258526 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgttaggcagaaat 258427  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  258426 tgaggaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgacgcgggtttcctcatgacagttgagtatcctgaatgggt 258327  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  258326 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaagccagtccaaaggacaactttccatta 258227  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  258226 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 258127  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  258126 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 258044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 13934420 - 13933838
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13934420 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaggatcatccagctcctccgggaatatccggat 13934321  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13934320 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctacgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 13934221  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13934220 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcagaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 13934121  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13934120 tgctaatattgtaccagtgccgaagaaggatggtaaagtccggatgtgcgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 13934021  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  13934020 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcaaatcaaaatgtccccggaag 13933921  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13933920 atagagaaaagacgtcttttatcaccccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 13933838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 11633057 - 11632475
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11633057 cataggtaccgaggagaacaagcgggaaatcaagatcggtgctgctctaggggaagaggttaaaagtaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 11632958  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11632957 attttcgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaagt 11632858  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11632857 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagatcaagagcgaagttcaaaagcagattgacgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 11632758  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11632757 tgctaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 11632658  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11632657 cctcatattgatgtgcttgttgataacactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaagatgtctcctgaag 11632558  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  11632557 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 11632475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 12714474 - 12713892
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12714474 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 12714375  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714374 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggattcccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 12714275  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12714274 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 12714175  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714174 tgctaatattgtgcccgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgactttagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 12714075  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12714074 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttctggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 12713975  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  12713974 atagagaaaagacatcttttatcactccatgggggactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaatcaatgctggtgct 12713892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 451; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 32052174 - 32052756
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32052174 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccgactcctccgggaatatccggat 32052273  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32052274 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 32052373  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  32052374 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 32052473  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  32052474 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 32052573  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  32052574 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaagatgtctcctgaag 32052673  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32052674 acagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 32052756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 37683768 - 37683186
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37683768 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 37683669  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37683668 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 37683569  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  37683568 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaaaatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 37683469  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37683468 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagcccaaaagacaactttccatta 37683369  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  37683368 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaagatgtctcctgaag 37683269  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37683268 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 37683186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 37699033 - 37698451
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37699033 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 37698934  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37698933 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 37698834  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  37698833 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaaaatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 37698734  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37698733 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagcccaaaagacaactttccatta 37698634  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  37698633 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaagatgtctcctgaag 37698534  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37698533 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 37698451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 19414374 - 19413792
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19414374 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 19414275  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19414274 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggattcctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 19414175  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  19414174 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 19414075  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  19414074 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 19413975  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19413974 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaagatgtctcctgaag 19413875  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19413874 acagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaatcaatgctggtgct 19413792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 31878657 - 31879239
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31878657 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaggatcatccaactcctccgggaatatccagat 31878756  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31878757 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 31878856  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  31878857 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 31878956  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31878957 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 31879056  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31879057 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 31879156  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  31879157 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 31879239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 16827211 - 16826629
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16827211 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccgactcctccgggaatatccggat 16827112  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16827111 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 16827012  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  16827011 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 16826912  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16826911 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaggtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccgaaagacaactttccatta 16826812  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16826811 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaagatgtctcctgaag 16826712  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16826711 acagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 16826629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 16894269 - 16894851
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16894269 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccgactcctccgggaatatccggat 16894368  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894369 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 16894468  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  16894469 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 16894568  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16894569 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaggtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccgaaagacaactttccatta 16894668  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16894669 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaagatgtctcctgaag 16894768  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16894769 acagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 16894851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 34864055 - 34864637
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34864055 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 34864154  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34864155 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 34864254  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  34864255 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaaaatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 34864354  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34864355 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagcccaaaagacaactttccatta 34864454  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  34864455 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaagatgtctcctgaag 34864554  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  34864555 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaatcaatgctggtgct 34864637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 37927740 - 37928322
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37927740 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 37927839  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37927840 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 37927939  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  37927940 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaaaatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 37928039  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37928040 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagcccaaaagacaactttccatta 37928139  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  37928140 cctcatatcgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgagg 37928239  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  37928240 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 37928322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21675048 - 21674466
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21675048 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatctggat 21674949  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21674948 atttttgcatggtcctatgaagatatgcccggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgccctcccgtcaggcagaaat 21674849  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  21674848 tgagaaggactcatcccgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 21674749  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  21674748 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 21674649  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  21674648 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaagatgtctcctgaag 21674549  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21674548 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 21674466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 39892440 - 39893022
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  39892440 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggagggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccagat 39892539  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39892540 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgattgtcctcccgtcaggcagaaat 39892639  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  39892640 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 39892739  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  39892740 tgccaatattgtgcccgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 39892839  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  39892840 cctcatatcgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcaaatcaagatgtctcctgaag 39892939  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  39892940 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 39893022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 21701043 - 21700461
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  21701043 cataggtaccgaagagaacaagcgagaaattaaggtcggtgctgctctagaggaatgggttaaaaagaagatcatccagctcctccgagagtatccggat 21700944  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21700943 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggaacatcggattcccacgaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 21700844  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||    
T  21700843 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagaatgaggttcaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggt 21700744  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21700743 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggaaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaacttcccatta 21700644  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21700643 ctgcatattgatgtgcttgttgacaataatgctcagtccaaggtgttcttcttcatggatggcttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaag 21700544  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21700543 atagagaaaagacgtcttttatcaccccatggggtacgttctgctacaaagtgatgccgatcggtctaataaatgctggtgct 21700461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 19454294 - 19453714
Alignment:
Q  13 taggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatat 112  Q
    |||||||||||   |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||| || |||||    
T  19454294 taggtaccgagttgaacaagcgagagatcaaggtcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaggaagatcttccagctcctccgagaatacccagatat 19454195  T
Q  113 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19454194 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggaacatcggatcccaacaaagcctgaatgtcctcccgtcaagcagaaattg 19454095  T
Q  213 agaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | || || |||||||||||||    
T  19454094 agaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacaatcgagtatcctgaatgggttg 19453995  T
Q  313 ccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacc 412  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19453994 ccaatattgtacctgtgccaaagaagaatggaaaagtccgaatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaatttcccattacc 19453895  T
Q  413 tcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagat 512  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19453894 ccatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaaggtgttctccttcatggatggcttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaagat 19453795  T
Q  513 agagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19453794 agagaaaagacgtcttttatcaccccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgct 19453714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 574
Target Start/End: Original strand, 27393937 - 27394496
Alignment:
Q  15 ggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatattt 114  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  27393937 ggtaccgaagaaaacaagcgagagatcaaggtcggtgctgctcttgaggagagggttaaaaagaagatcttccaacttctccgagagtatccggatattt 27394036  T
Q  115 ttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgag 214  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  27394037 ttgcatggtcatacgaagatatgccgggtctagatcctaagattgtggaacatcgaataccgacaaagcctgaatgccctcccgttagacagaaattgag 27394136  T
Q  215 aaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgcc 314  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| || |||| ||| || || |||||||||||||||    
T  27394137 aaggactcgtccagatatggctctcaggattaagagtgaggttcaaaaacagattgatgcggattttctcatgatagtcgagtatcctgaatgggttgcc 27394236  T
Q  315 aatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctc 414  Q
    || |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||   ||||  |||| ||||  ||||||||||| || || ||||    
T  27394237 aacattgtacccgtgccaaagaaagatgggaaagtccggatgtgtgttgattacagagatttgaataaagctagtctcaaagacaacttccctttgcctc 27394336  T
Q  415 atattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatag 514  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||    
T  27394337 acattgatgtgcttgttgatagcactgctcagtccaaagtgttctccttcatggacggcttctccggttataaccagatcaaaatgtcgcctgaagacag 27394436  T
Q  515 agaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcgg 574  Q
     |||||||| || || || || ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||||    
T  27394437 ggaaaagacatcgttcattaccccatggggcaccttctgttgcaaagcaatgccgttcgg 27394496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 404 - 592
Target Start/End: Original strand, 34288858 - 34289046
Alignment:
Q  404 tccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtct 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34288858 tccattacctcatattgatgtgcttgttgataataccgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtct 34288957  T
Q  504 cctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgc 592  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34288958 cctgaagatagggaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgc 34289046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 404 - 592
Target Start/End: Original strand, 34293918 - 34294106
Alignment:
Q  404 tccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtct 503  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34293918 tccattacctcatattgatgtgcttgttgataataccgctcagtctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtct 34294017  T
Q  504 cctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgc 592  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34294018 cctgaagatagggaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaataaatgctggtgc 34294106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 148
Target Start/End: Original strand, 34288720 - 34288857
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34288720 cataggtaccgaggggaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 34288819  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34288820 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctaga 34288857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 148
Target Start/End: Original strand, 34293780 - 34293917
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34293780 cataggtaccgaggggaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 34293879  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctaga 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34293880 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctaga 34293917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Original strand, 42393075 - 42393451
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  42393075 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtacgaaagcaaattgatgcaggt 42393173  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || || || ||||| |||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  42393174 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggccaacatagtgcctgttccaaagaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 42393273  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42393274 acaaggctagtccgaaggataattttcctttacctcacattgatgtattggttgataatactgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 42393373  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  42393374 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagataaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 42393451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Original strand, 34700616 - 34700992
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| || || | |||||||||||||||||||    
T  34700616 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcagattgatgcaggt 34700714  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | | ||| || || ||||| || || || ||||| |||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  34700715 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttggtcaacatagtgcctgttccaaagaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 34700814  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34700815 acaaggctagtccgaaggataattttcctttgcctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 34700914  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  34700915 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 34700992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 189 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21761310 - 21760924
Alignment:
Q  189 tgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatg 287  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||| || | ||| |||||||| ||||||||||| ||| || || || || ||||| |||| |||||||||  |     
T  21761310 tgtccgccggtcaagcagaaattaagaagaacccgtcctgatatggccctcaagattaaagag-gaagtgcagaaacagatcgatgtaggtttcctcgtt 21761212  T
Q  288 acagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagcca 387  Q
    |||    |||||||| ||||| | ||||| || || ||||| || || |||||||| |||||| | ||| ||||||| | | | | ||| ||| |||| |    
T  21761211 acatcaaaataccctcaatggctagccaacatagtgcctgttccgaagaaggatggcaaagtcagaatgtgtgttgattaccgtgaccttaacaaagcta 21761112  T
Q  388 gtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaa 487  Q
    ||||||||||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| |  |||||  | || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21761111 gtccaaaagatgatttcccattacctcatattgatgtactggttgacagcactgcaaaatccaaagtgttctccctcatggatggtttctccggttacaa 21761012  T
Q  488 tcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggt 575  Q
    ||||||||| ||| | || ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||    
T  21761011 tcagatcaagatggcgcccgaagacaaagagaagacgtctttcatcacaccttggggcactttctattacagagtaatgccgttcggt 21760924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Original strand, 22949146 - 22949339
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  22949146 aaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacagtactgcaaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggttataatcaaa 22949245  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  22949246 tcaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttattacaccttggggcactttttgttacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 22949339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Original strand, 12383413 - 12383606
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  12383413 aaagacgactttcctttaccttatattgacgtgttggttgacagtactgccaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggttataatcaaa 12383512  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||    
T  12383513 tcaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttattacaccttggggcactttttgctacaaagtaatgtcgttcggtttaatcaatgc 12383606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 26724980 - 26724568
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  26724980 aagcccgagtgtcctccagtcaagcagaagttaagaagatctcatccagatatggctctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgatgcaggt 26724882  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    ||| | || ||   |||||| ||| ||||| | ||||| || || || || || || || |||||||| ||| | ||| |||||||||   | |   |||    
T  26724881 ttcttgattacctctgaatatcctcaatggttggccaacatagtgcccgttccaaagaaagatggtaaggtcagaatgtgtgttgactatcgggatttga 26724782  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||   |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  26724781 acaaagctagtccgaaggatgatttccctttacctcacattgatgtattggttgatagtactgctagatgcaaggtattctccttcatggatggattctc 26724682  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtcta 578  Q
    ||| || || |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| | |||||||||  ||| |||||||| ||  |     
T  26724681 cgggtataaccagatcaagatggctccagaagatagagaaaagacgtcgttcatcacgccttggggcgcgttctgctacttagtaatgccgtttgggttg 26724582  T
Q  579 attaatgctggtgc 592  Q
    || |||||||||||    
T  26724581 ataaatgctggtgc 26724568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 34535147 - 34534735
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    ||||| || |||||||| |||| |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| || || | |||||| ||||||||||||    
T  34535147 aagcccgagtgtcctccagtcaagcagaagttaagaagatctcatccagatatggctctcaagatcaaagag-gaagtgcgaaagcaaattgatgcaggt 34535049  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    ||| | || ||    ||||| ||| ||||| | ||||| || || || || || || || |||||||| ||| | ||| |||||||||   | |   |||    
T  34535048 ttcttgattacctccgaatatcctcaatggttggccaacatagtgcccgttccaaagaaagatggtaaggtcagaatgtgtgttgactatcgggatttga 34534949  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || |||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||   |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  34534948 acaaagctagtccgaaggatgatttccctttacctcacattgatgtattggttgatagtactgctagatgcaaggtattctccttcatggatgggttctc 34534849  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtcta 578  Q
    ||| || || |||||||| ||| |||| || |||||||||||||| || || ||||| || |||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||  |     
T  34534848 cgggtataaccagatcaagatggctccagaggatagagaaaagacatcgttcatcacgccttggggcgctttctgctacttagtaatgccgtttgggttg 34534749  T
Q  579 attaatgctggtgc 592  Q
    || |||||||||||    
T  34534748 ataaatgctggtgc 34534735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 479; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 11943 - 12525
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11943 cataggtaccgagaagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 12042  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12043 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 12142  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12143 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 12242  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12243 tgccaatatagtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagatctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 12342  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  12343 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcagaatgtctcctgaag 12442  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12443 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgttataaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 12525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 475; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 14954 - 15535
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14954 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctaggggaaggggttaaaa-gaggatcatccaactcctccgggaatatccagat 15052  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15053 atttttgcatggtcgtatgaagatacgccaggtctagatcctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcaaaaat 15152  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15153 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 15252  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15253 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 15352  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  15353 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctccggagg 15452  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||    
T  15453 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggcttaataaatgctggtgct 15535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 467; Significance: 0; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 10965039 - 10965621
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10965039 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctgctctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 10965138  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10965139 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccccaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 10965238  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10965239 tgagaaggactcatcctgacatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcaaatcgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 10965338  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10965339 tgctaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 10965438  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10965439 cctcatattgacgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 10965538  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  10965539 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccattcggcctaatcaatgctggtgct 10965621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 51640592 - 51641174
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51640592 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 51640691  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51640692 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 51640791  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  51640792 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 51640891  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51640892 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagcccaaaagacaactttccatta 51640991  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51640992 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttctggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 51641091  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51641092 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 51641174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 10947451 - 10948033
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10947451 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 10947550  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10947551 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtttagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 10947650  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  10947651 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgacgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 10947750  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10947751 tgccaatattgtgcccgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagcccaaaagacaactttccatta 10947850  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10947851 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttctggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 10947950  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10947951 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 10948033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 41791194 - 41790612
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41791194 cataggtaccgaggagaataagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaagcagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 41791095  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41791094 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgccctcccgtcaggcagaaat 41790995  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41790994 tgagaaggactcatcccgatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctaatgacagttgagtatcctgaatgggt 41790895  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41790894 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 41790795  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41790794 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttctggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 41790695  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  41790694 atagagaaaagacatcttttatcactccatgggggaccttctgctacaaagtgatgccattcggcctaatcaatgctggtgct 41790612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 28587359 - 28587941
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28587359 cataggtaccgaggagaataagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaagcagaagattatccaactcctccgggaatatccggat 28587458  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28587459 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 28587558  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  28587559 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 28587658  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28587659 tgccaatattgtgcccgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 28587758  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28587759 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttttccttcatggacggtttctccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgaag 28587858  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28587859 acagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 28587941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 16205915 - 16205336
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  16205915 cataggtaccgaagagaacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaaggggctaaaaagaagatcatccagctcctccgagaatacccggat 16205816  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16205815 atttttgcatggtcgtacgaagatatgtcaggtctagatcctaagattgtggaacatcggatccccacgaagcctgaatgtcctctcgtcaggcagaaat 16205716  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||||||||||    
T  16205715 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatgcgggttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggt 16205616  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  16205615 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatgg---agtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaacttcccatta 16205519  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16205518 cctcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtttaaggtgttctcctttatggacggcttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaag 16205419  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16205418 atagagaaaaaacatcttttattaccccatggggtactttctgctacaaagtgatgtcgttcggtctaataaatgctggtgct 16205336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 381; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 593
Target Start/End: Original strand, 20463352 - 20463932
Alignment:
Q  13 taggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatat 112  Q
    |||||||||| || |||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  20463352 taggtaccgaagagaacaagcgagagatcaaggtcgatgctgctctagaggaaggggttaaaaggaagatcatccagctcctccgagaatacccggatat 20463451  T
Q  113 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20463452 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggaacatcggatcccaacaaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattg 20463551  T
Q  213 agaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttg 312  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||| || || |||||||||||||    
T  20463552 agaaggactcatccaaatatggctctcaagattaagagtgaggttcaaaagcagattgatatgggttttctcatgacagtcgagtatcctgaatgggttg 20463651  T
Q  313 ccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacc 412  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20463652 ccaatattgtacttgtgccaaagaaggatggaaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaacttcccattacc 20463751  T
Q  413 tcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagat 512  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20463752 ccatattgatgtgcttgttgacaatactaatcagtccaaggtgttctccttcatggatggcttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccttgaagat 20463851  T
Q  513 agagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||    
T  20463852 agagaaaagacgtctttcatcaccccatggggtactttctgctacaaagtgatgtcgttcggcctaataaatgttggtgct 20463932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 180 - 592
Target Start/End: Original strand, 22488564 - 22488976
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||| || || | |||||||||||||||||||    
T  22488564 aagcctgagtgtcctccgataaagcagaaattgagaagatctcatccagatatggccctcaagatcaaagag-gaagtacgaaagcagattgatgcaggt 22488662  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||  | |||   || |||||| | ||| | ||||| || || || || || || || ||||| |||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  22488663 ttcctcgtcacatcagagtaccctcagtggttggccaacatagtgcccgttccaaagaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 22488762  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| ||||| || || || |||||||| ||||||||  | |||||||| |||||| | |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22488763 acaaggctagtccgaaagataatttccctttacctcacattgatgtattggttgataacactgctaaatgcaaggttttctccttcatggacggtttctc 22488862  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtcta 578  Q
    |||||| |||||||| || ||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||||||||||  ||||||||| || ||  |     
T  22488863 cggttataatcagataaagatggctccaggagatagagaaaagacgtctttcatcacaccttggggtgctttctgctacttagtgatgccatttggattg 22488962  T
Q  579 attaatgctggtgc 592  Q
    || |||||||||||    
T  22488963 ataaatgctggtgc 22488976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Complemental strand, 5629500 - 5629307
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||  | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| |    
T  5629500 aaagacgactttcctttacctcatattgacgtattggttgacagtactgcaaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggttataatcaaa 5629401  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || |||||||| || || || || ||||| || || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  5629400 tcaagatggcacccgaagatagggagaaaacatcatttattacaccttggggcactttctgttacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 5629307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 455; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 24075 - 23493
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24075 cataggtaccgaggaaaacaagcaagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccagctcctccgggaatatccggat 23976  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23975 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 23876  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23875 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccccgaatgggt 23776  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23775 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 23676  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23675 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 23576  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23575 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 23493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 447; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 7063 - 6481
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7063 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaaggtcatccagctcctccgggaatatccggat 6964  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6963 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 6864  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  6863 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaaaatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 6764  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6763 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 6664  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  6663 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggatggtttttccggttataatcaaatcaaaatgtctcctgaag 6564  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  6563 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtaccttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 6481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 21968 - 22397
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21968 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaaggtcatccagctcctccgggaatatccggat 22067  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22068 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 22167  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  22168 tgagaaggactcatcctgatatggctctcaaaatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 22267  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  22268 tgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaggccagtccaaaagacaactttccatta 22367  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatact 440  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22368 cctcatattgatgtgcttgttgataatact 22397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 258 - 593
Target Start/End: Original strand, 22498 - 22833
Alignment:
Q  258 caaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgg 357  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||     
T  22498 caaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgaatatcccgaatgggttgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagttcggatgt 22597  T
Q  358 gtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgtt 457  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22598 gtgttgacttcagagacctgaacaaagccagcccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgtt 22697  T
Q  458 ctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctac 557  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22698 ctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaagatgtctcctgaagatagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctac 22797  T
Q  558 aaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22798 aaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 22833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 443; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 12812 - 12230
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12812 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaggatcatccaactcctccgggaatatccagat 12713  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12712 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 12613  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  12612 tgagaaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 12513  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12512 tgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 12413  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12412 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 12313  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12312 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgctacaaggtgatgccgttcggcctaatcaatgctggtgct 12230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 8384 - 8971
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8384 cataggtaccgaggagaacaagcgagaaatcaagattggtgctgctctagaggaaggggttaaacagaagatcatccgactcctccgggaatatccggat 8483  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8484 atttttgcatggtcatatgaagatatgccgggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccccaccaagcctgagtgtcctcccatcaggcagaaat 8583  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  8584 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 8683  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaa-aaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaa-cgaagccagtcc-aaaagacaactttcca 407  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||   |||||||||| |||||||||||||||     
T  8684 tgccaatattgtgcctgtgccgaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaataaaagccagtccaaaaagacaactttccg 8783  T
Q  408 ttacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatc-aaaatgtctcct 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8784 ttacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaaatgtctcct 8883  T
Q  507 gaagatagag-aaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8884 gaagatagagaaaaagacatcttttatcactccatgggggactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaattaatgctggtgct 8971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 32831 - 33413
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaag-cgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccgga 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  32831 cataggtaccgaggagaacaaggcgagaaatcaaggtcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaagatcatccagctcctccgagaatacccgga 32930  T
Q  110 tatttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaa 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32931 tatttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaagattgtggaacatcggatccccacgaagcctgaatgttctcccgtcaggcagaaa 33030  T
Q  210 ttgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatggg 309  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33031 ttgagaaggactcatccaaatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaaacagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatggg 33130  T
Q  310 ttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatt 409  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33131 ttgccaatattgtacctgtgccaaagaaggatggtaaagtctgaatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagctagtccaaaagacaac-ttccatt 33229  T
Q  410 acctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaa 509  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33230 acctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaa 33329  T
Q  510 gatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  33330 gatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctactacaaagtgatgtcgttcggcctaataaatgctggtgct 33413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Original strand, 10321 - 10903
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10321 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagattggtgctactctagaggaaggggttaaacagaagatcatccaactcctccgggaatatccggat 10420  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10421 atttttgcatggtcctatgaagatatgccaggtctagaccctatgatcgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 10520  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||    
T  10521 tgaggaggactcatcctgacatggccctcaagatcaagaatgaagttcaaaagcagatcgatgcgggtttcctcatgacagttgagtatcccgaatgggt 10620  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10621 tgccaatattgtgcctgtgccgaagaaggatggtaaagttcggatgtgtgttgatttcagggacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccgtta 10720  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10721 ccccatattgacgtgcttgttgataatactgctcaatctaaggtgttctccttcatggacggtttttccggttataatcagatcaaaatgtctcctgaag 10820  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  10821 atagagaaaagacatcttttatcactccatggggtactttctgttacaaagtgatgccgttcggcctaatcaatgccggtgct 10903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 593
Target Start/End: Original strand, 8419 - 8999
Alignment:
Q  13 taggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggatat 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  8419 taggtaccgaggtgaacaagcgagaaatcaaggtcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaggaagatcatccagctcctccgagaatacccggatat 8518  T
Q  113 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  8519 ttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctatgattgtggaacatcggatccccacaaaccctgaataccctcccgtcaagcagaaattg 8618  T
Q  213 agaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttg 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||||||||||||    
T  8619 agaaggactcatctagatatggctctcaagattaagagtgagggtcaaaagcagattgatgcaggttttctcataacagtcgagtatcctgaatgggttg 8718  T
Q  313 ccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacc 412  Q
    | || |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  8719 ctaacattgtacctgtgccaaagaaggatggacaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccaatccaaaagacaacttcccattacc 8818  T
Q  413 tcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagat 512  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8819 tcatattgatgtgcttgttgacaatacagctcagtccaaggtgttctccttcatggatggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtcccctgaagat 8918  T
Q  513 agagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  8919 agtgaaaagacgtcttttattaccccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcttaataaatgctggtgct 8999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 339; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 6555 - 5973
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||| |||||||| || ||  | |||    
T  6555 cataggtaccaaggaggacaagcgagaaatcaagatcggtgctgctctagaggaagaggttaaagtaaagatcatccagctcctccgagagtacacagat 6456  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  6455 atttttgcatggtcgtacgaggatatgcccggtctagatcctaagatcgtggagcatcggatcccaacgaagcccgaatgccctcctgtcagacagaaat 6356  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    ||||||  ||||  ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  6355 tgagaataactcgcccagacatggctctcaagatcaagagtgaggtgcagaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagtcgagtatcctgagtgggt 6256  T
Q  311 tgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccatta 410  Q
    |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6255 tgccaacattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacttgaacaaagccagtccaaaagacaactttccatta 6156  T
Q  411 cctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaag 510  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  6155 cctcatattgatgtgcttgttgacaatactgctcagtccaaggtgttctccttcatggacggcttctccggttacaatcagattaaaatgtcccctgagg 6056  T
Q  511 atagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6055 atagagaaaagacatcttttatcaccccgtggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaataaatgctggtgct 5973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 303 - 593
Target Start/End: Original strand, 8700 - 8990
Alignment:
Q  303 gaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaagacaact 402  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8700 gaatgggttgccaatattgtgcctgtgccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttcagagacctgaacaaagccagtccaaaagacaact 8799  T
Q  403 ttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtc 502  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8800 ttccgttacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttataatcagatcaaaatgtc 8899  T
Q  503 tcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgct 593  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8900 tcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggtactttctgctacaaagtgatgccgttcggcctaattaatgctggtgct 8990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 14 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 44678 - 44064
Alignment:
Q  14 aggtaccgaggaa-aacaagcga-gaagtcaagatcggtgctgctctagagg-aaggggttaaaaagaggatca--tccaactcctcc-gggaatatccg 107  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |   |||| ||||||| |||||||||||    
T  44678 aggtaccgaggacgaacaagcgaagaaatcaagatcggtgctgctctagagggaaggggttaaaaagaagacccactccagctcctcccgggaatatccg 44579  T
Q  108 gata-tttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagac-cctatgatt-gtggagcatcggat-ccctaccaa-gcctgaatg--tcctcccgtc 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||   ||||||||||    
T  44578 gataatttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatacctaaaattagtggagcatcggataccccaccaaagcctgaatcgttcctcccgtc 44479  T
Q  201 aggc-agaaatt-gagaaggactcatccagatatgg-ctctcaagattaagagcgaggttcaaaag-cagattgatgcaggtttcctaatgac-agttga 295  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44478 aggctagaaattagagaaggactcatccagatatggtctctcaagattaagagcgaggttcaaaaaacagattgatgcaggtttcctcatgactagttga 44379  T
Q  296 ataccctg--aatgggttgcc-aatattgtacctgtgcccaaa-aaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagcc--agt 389  Q
     ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||  |||    
T  44378 gtacccttgtaatgggttgcctaatattgtacctgtgcccaaagaaggatggtaaagtccggatgtgtgttgacttccgagacctgaacaaagccctagt 44279  T
Q  390 cc-aaaaga-caactttcc-attacc-tcat-attgatgtg-cttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggtt 483  Q
    || ||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44278 ccaaaaagattaactttccaattaccttcataattgatgtgtcttgttgataatactgctcagtccaaggtgttctccttcatggatggtttctccggtt 44179  T
Q  484 acaatcagatc-aaaatgtctcct--gaagatagagaaaagacgtc-ttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaa 579  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44178 acaatcaaatcaaaaatgtctcctcgaaagatagagaaaagacatctttttatcaccccatggggtactttctgctacaaagtgatgccattcggtctaa 44079  T
Q  580 ttaa-tgctggtgct 593  Q
    | || ||||||||||    
T  44078 taaattgctggtgct 44064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1697 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold1697
Description:

Target: scaffold1697; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 1
Alignment:
Q  11 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaagtcaagatcggtgctgctctagaggaaggggttaaaaagaggatcatccaactcctccgggaatatccggat 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  312 cataggtaccgaggaaaacaagcgagaaatcaagatcggtgttgctctagaggaaggggttaaaaagaatatcatccagctcctccgggaatatccggac 213  T
Q  111 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagaccctatgattgtggagcatcggatccctaccaagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  212 atttttgcatggtcgtatgaagatatgccaggtctagatcctaaaattgtggagcatcggattcccacgaagcctgaatgtcctcccgtcagacagaaat 113  T
Q  211 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggtttcctaatgacagttgaataccctgaatgggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  112 tgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaagagtgaagttcagaagcagattgatgcgggtttcctcatgacagttgagtaccctgaatgggt 13  T
Q  311 tgccaatattgt 322  Q
    ||||||||||||    
T  12 tgccaatattgt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 180 - 556
Target Start/End: Original strand, 9759 - 10135
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagattaa-gagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  9759 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcctgatatggccctcaagatcaaagag-gaggtgcgaaagcagattgatgcaggt 9857  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||| | |||   || || ||| ||||| | ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  9858 ttcctagtcacatcagagtatcctcaatggttagccaacatagtgcctgttccaaaaaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 9957  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | |  ||||| || || || ||||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9958 acaagggtagtccgaaggataattttcctttgcctcacattgatgtattggttgataacactgctaagtgcaaggtcttctccttcatggacggtttctc 10057  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgcta 556  Q
    ||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||    
T  10058 cggctacaatcagatcaggatggctcctgaggatagagaaaagacgtctttcatcacgccctggggtgctttctgcta 10135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 297 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 35838 - 35560
Alignment:
Q  297 taccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctgaacgaagccagtccaaaag 396  Q
    |||||| ||||| | |||||| | || ||||| || || ||||||||||||||| | ||| ||||||| | | | |  || ||| |||||||||| ||||    
T  35838 taccctcaatggctagccaatgtagtgcctgttccaaagaaggatggtaaagtcagaatgtgtgttgattaccgggatctaaacaaagccagtcccaaag 35739  T
Q  397 acaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaa 496  Q
    |  | || ||  | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||  | || || || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35738 atgatttcccgctgcctcatattgatgtgttggttgatagtactgcaaaatccaaagtcttctcattcatggacggtttcttcggttacaatcagatcaa 35639  T
Q  497 aatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggt 575  Q
     ||| | || ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||    
T  35638 gatggcacccgaagatagagagaaaacgtcttttattacaccttggggcactttttgttacagagtaatgccgttcggt 35560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 393 - 586
Target Start/End: Original strand, 28924 - 29117
Alignment:
Q  393 aaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcaga 492  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||  ||||||| || ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |    
T  28924 aaagacgactttcctttacctcatattgacgtgttggttgacagtactgcaaagtctaaagtcttctcattcatggatggattctccggatataatcaaa 29023  T
Q  493 tcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgc 586  Q
    |||| ||| | || ||||||||||| || || || ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  29024 tcaagatggcacccgaagatagagagaaaacatcatttattacaccttggggcactttctgctacaaagtaatgccgttcggtttaatcaatgc 29117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 68; Significance: 5e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 405 - 592
Target Start/End: Original strand, 49922 - 50109
Alignment:
Q  405 ccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctc 504  Q
    ||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||| || | |  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| |||    
T  49922 ccattacctcacattgatgtattggttgataacactactaaatgcaaggttttctccttcatgaacggtttctccggttataatcagataaagatggctc 50021  T
Q  505 ctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgccgttcggtctaattaatgctggtgc 592  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| |||||||||||  ||||||||| || ||  | || |||||||||||    
T  50022 cggaagatagagaaaagacgtctttcatcacaccttagggcgctttctgctacttagtgatgccatttggattgataaatgctggtgc 50109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 568
Target Start/End: Original strand, 49697 - 50085
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagat-taagagcgaggttcaaaagcagattgatgcaggt 278  Q
    |||||||| |||||||| || | |||||||||||||||  ||||||| || ||||| ||||||||  ||||| || || |  || |||||||||||||||    
T  49697 aagcctgagtgtcctccggtaaagcagaaattgagaagatctcatcccgagatggccctcaagatcaaagag-gaagtgcgcaaacagattgatgcaggt 49795  T
Q  279 ttcctaatgacagttgaataccctgaatgggttgccaatattgtacctgtgcccaaaaaggatggtaaagtccggatgggtgttgacttcagaggcctga 378  Q
    |||||  | |||   || || ||| | ||| | ||||| || || || || || || || ||||| |||||| | ||| ||||||| |   | | | |||    
T  49796 ttcctggtcacatcagagtaacctcagtggttggccaacatagtgcccgttccaaagaaagatggcaaagtcagaatgtgtgttgattatcgggacttga 49895  T
Q  379 acgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggtttctc 478  Q
    || | || ||||| || || || || ||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||| || | |  ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  49896 acaaggctagtccgaaggataatttcccattacctcacattgatgtattggttgataacactactaaatgcaaggttttctccttcatgaacggtttctc 49995  T
Q  479 cggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgcc 568  Q
    |||||| |||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| |||||||||||  |||||||||    
T  49996 cggttataatcagataaagatggctccggaagatagagaaaagacgtctttcatcacaccttagggcgctttctgctacttagtgatgcc 50085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 374 - 567
Target Start/End: Original strand, 4992 - 5185
Alignment:
Q  374 cctgaacgaagccagtccaaaagacaactttccattacctcatattgatgtgcttgttgataatactgctcagtctaaggtgttctccttcatggacggt 473  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||  | |||||  | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| | || || || ||||| |||||||| |||    
T  4992 cctgaacaaagctagtcccaaagatgattttccgctgcctcatattgatgtgttggttgatagtactgctaaatcgaaagttttctctttcatggatggt 5091  T
Q  474 ttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactttctgctacaaagtgatgc 567  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||| | |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||    
T  5092 ttctccggttacactcaaatcaagatggcacctgaagacaaagaaaagacatctttcatcacaccttggggcactttttgttacaaagtgatgc 5185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 450 - 557
Target Start/End: Complemental strand, 5360 - 5253
Alignment:
Q  450 aaggtgttctccttcatggacggtttctccggttacaatcagatcaaaatgtctcctgaagatagagaaaagacgtcttttatcactccatggggcactt 549  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || || |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  5360 aaggtgttctccttcatggatggattctccgggtataaccagatcaagatggctccggaagatagagagaagacgtctttcatcacgccatggggcgctt 5261  T
Q  550 tctgctac 557  Q
    ||||||||    
T  5260 tctgctac 5253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000009
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5630 - 5566
Alignment:
Q  180 aagcctgaatgtcctcccgtcaggcagaaattgagaaggactcatccagatatggctctcaagat 244  Q
    ||||| || |||||||| |||| ||| || || |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5630 aagcccgagtgtcctccagtcaagcataagttaagaagatctcatccagatatggctctcaagat 5566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University