View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5236_high_3 (Length: 344)

Name: NF5236_high_3
Description: NF5236
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5236_high_3
NF5236_high_3
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (12-332)||(25429390-25429709)
chr5 (19-326)||(23526026-23526333)
chr5 (19-332)||(21882743-21883057)
chr5 (34-329)||(26735847-26736141)
chr5 (63-329)||(21332134-21332400)
chr5 (36-329)||(23460943-23461236)
chr5 (142-332)||(29473300-29473490)
chr5 (36-332)||(27665611-27665907)
chr5 (142-329)||(14996966-14997153)
chr5 (137-332)||(18782083-18782278)
chr5 (142-329)||(37288723-37288910)
chr5 (142-332)||(22137637-22137827)
chr5 (18-332)||(27613325-27613639)
chr5 (143-332)||(27682628-27682817)
chr5 (142-332)||(16359471-16359661)
chr5 (142-332)||(19772929-19773119)
chr5 (142-332)||(22330114-22330304)
chr5 (142-332)||(34569463-34569653)
chr5 (142-332)||(40711749-40711939)
chr5 (142-332)||(41773811-41774001)
chr5 (142-332)||(22350888-22351078)
chr5 (142-332)||(27521375-27521565)
chr5 (34-329)||(23474167-23474461)
chr5 (133-332)||(21631617-21631816)
chr5 (37-205)||(16258158-16258326)
chr5 (19-202)||(20803696-20803879)
chr5 (37-205)||(22591877-22592045)
chr5 (37-205)||(22595432-22595600)
chr5 (282-332)||(20803566-20803616)
chr5 (82-206)||(23669709-23669833)
chr5 (87-206)||(21983349-21983468)
chr5 (268-329)||(14884344-14884405)
chr5 (268-329)||(20345236-20345297)
chr5 (138-206)||(21561248-21561316)
chr5 (82-158)||(43122592-43122668)
[»] chr2 (33 HSPs)
chr2 (35-332)||(23105205-23105503)
chr2 (12-332)||(23065081-23065401)
chr2 (12-332)||(23074531-23074851)
chr2 (25-331)||(22733242-22733548)
chr2 (19-332)||(23028924-23029236)
chr2 (14-332)||(22742423-22742741)
chr2 (19-328)||(24678159-24678468)
chr2 (19-332)||(11351173-11351486)
chr2 (26-332)||(24704951-24705257)
chr2 (18-227)||(23040038-23040247)
chr2 (137-332)||(23204982-23205177)
chr2 (137-332)||(23676586-23676781)
chr2 (36-332)||(24657137-24657433)
chr2 (143-332)||(24265038-24265227)
chr2 (142-332)||(24712702-24712892)
chr2 (142-332)||(9338250-9338440)
chr2 (142-332)||(9486884-9487074)
chr2 (142-332)||(16983908-16984098)
chr2 (142-332)||(22322927-22323117)
chr2 (36-332)||(27373937-27374233)
chr2 (36-332)||(44383049-44383345)
chr2 (142-332)||(24874335-24874525)
chr2 (169-332)||(21322878-21323041)
chr2 (142-332)||(10871518-10871708)
chr2 (142-332)||(17001668-17001858)
chr2 (33-332)||(24817316-24817615)
chr2 (137-280)||(22463061-22463204)
chr2 (142-283)||(21139566-21139707)
chr2 (256-332)||(45673711-45673787)
chr2 (19-161)||(21320465-21320607)
chr2 (271-332)||(27220684-27220745)
chr2 (277-332)||(21142761-21142816)
chr2 (87-206)||(28350669-28350788)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (26-332)||(22401644-22401950)
chr1 (19-332)||(21752099-21752412)
chr1 (19-332)||(22496250-22496563)
chr1 (19-332)||(20081370-20081683)
chr1 (36-323)||(22435744-22436031)
chr1 (19-329)||(24784851-24785161)
chr1 (137-332)||(21228668-21228863)
chr1 (142-328)||(19109424-19109610)
chr1 (36-332)||(41350679-41350975)
chr1 (142-332)||(16347712-16347902)
chr1 (142-332)||(21842264-21842454)
chr1 (137-329)||(17042127-17042319)
chr1 (142-332)||(21833354-21833544)
chr1 (142-332)||(51330609-51330799)
chr1 (35-332)||(16379146-16379443)
chr1 (142-332)||(33388146-33388336)
chr1 (157-307)||(22400397-22400547)
chr1 (139-281)||(21176531-21176673)
chr1 (136-329)||(21045235-21045428)
chr1 (86-276)||(22116876-22117066)
chr1 (268-329)||(20074952-20075013)
chr1 (268-329)||(31537240-31537301)
chr1 (268-329)||(38910069-38910130)
chr1 (268-329)||(48425959-48426020)
chr1 (268-329)||(52988827-52988888)
chr1 (19-71)||(21176680-21176732)
chr1 (268-328)||(37680136-37680196)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (20-329)||(8292-8601)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (19-332)||(21391226-21391539)
chr8 (19-332)||(21780552-21780865)
chr8 (28-332)||(21254048-21254351)
chr8 (25-302)||(18881028-18881305)
chr8 (31-332)||(19981070-19981371)
chr8 (33-329)||(22421272-22421567)
chr8 (94-332)||(21163978-21164216)
chr8 (19-328)||(22990152-22990461)
chr8 (137-329)||(30310627-30310819)
chr8 (137-332)||(22031206-22031401)
chr8 (137-332)||(22042930-22043125)
chr8 (142-332)||(18859680-18859870)
chr8 (142-332)||(17671510-17671700)
chr8 (18-332)||(20015627-20015941)
chr8 (36-332)||(19481454-19481750)
chr8 (137-332)||(15536486-15536681)
chr8 (137-332)||(32603248-32603443)
chr8 (142-332)||(22126447-22126637)
chr8 (142-332)||(19115503-19115693)
chr8 (142-332)||(22117663-22117853)
chr8 (33-231)||(22523714-22523912)
chr8 (19-164)||(21671786-21671931)
chr8 (170-325)||(22129133-22129288)
chr8 (136-329)||(22245497-22245690)
chr8 (136-329)||(22245915-22246108)
chr8 (274-329)||(22523652-22523707)
chr8 (37-206)||(20391315-20391484)
chr8 (127-206)||(21982415-21982494)
chr8 (127-206)||(21998901-21998980)
chr8 (298-332)||(21785999-21786033)
chr8 (97-206)||(22374098-22374207)
chr8 (265-329)||(22375065-22375129)
chr8 (19-70)||(21163895-21163946)
chr8 (127-206)||(22004542-22004621)
chr8 (226-329)||(28984017-28984120)
chr8 (226-329)||(28989236-28989339)
chr8 (268-329)||(16268838-16268899)
chr8 (127-199)||(3274402-3274474)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (28-329)||(9016-9317)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (20-328)||(18405012-18405320)
chr6 (19-332)||(22436770-22437083)
chr6 (19-329)||(23081327-23081637)
chr6 (82-332)||(19867588-19867838)
chr6 (142-332)||(2871992-2872182)
chr6 (36-332)||(27559053-27559349)
chr6 (142-332)||(24292972-24293162)
chr6 (142-332)||(22829576-22829766)
chr6 (142-332)||(28260387-28260577)
chr6 (142-332)||(28285339-28285529)
chr6 (142-332)||(28339136-28339326)
chr6 (142-332)||(29589629-29589819)
chr6 (177-329)||(16924865-16925017)
chr6 (97-332)||(28312531-28312766)
chr6 (142-332)||(5836418-5836608)
chr6 (139-332)||(25115453-25115646)
chr6 (36-332)||(16574791-16575087)
chr6 (36-332)||(16620293-16620589)
chr6 (33-329)||(23084906-23085202)
chr6 (137-293)||(25756800-25756956)
chr6 (126-331)||(30678198-30678403)
chr6 (18-276)||(27205579-27205837)
chr6 (18-276)||(27243391-27243649)
chr6 (271-332)||(27190337-27190398)
chr6 (271-332)||(27258842-27258903)
chr6 (133-204)||(25958934-25959005)
chr6 (37-206)||(19486379-19486548)
chr6 (82-205)||(16813668-16813791)
chr6 (94-206)||(21474627-21474739)
chr6 (235-329)||(18182650-18182744)
chr6 (19-71)||(21764974-21765026)
chr6 (138-206)||(25770871-25770939)
chr6 (127-182)||(18325911-18325966)
chr6 (145-199)||(18659953-18660007)
chr6 (133-194)||(18182569-18182630)
chr6 (19-64)||(25756682-25756727)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (18-329)||(10804-11115)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (33-332)||(40446-40745)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (19-332)||(8476-8790)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (30-332)||(14977-15279)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (18-332)||(11330-11643)
scaffold0120 (12-332)||(14150-14470)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (12-332)||(2181-2501)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (33-332)||(3617-3916)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (18-332)||(17273-17587)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (12-332)||(296-616)
[»] scaffold0080 (5 HSPs)
scaffold0080 (28-332)||(54703-55007)
scaffold0080 (19-332)||(31949-32258)
scaffold0080 (26-332)||(37415-37717)
scaffold0080 (127-332)||(10272-10476)
scaffold0080 (127-332)||(12927-13131)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (19-332)||(83-396)
scaffold0621 (19-332)||(4500-4813)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (33-332)||(2055-2354)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (18-332)||(24636-24950)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (33-332)||(18716-19015)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (33-329)||(41701-41997)
scaffold0022 (33-329)||(75421-75717)
scaffold0022 (49-328)||(34670-34949)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (19-332)||(110832-111145)
scaffold0040 (34-204)||(18039-18209)
scaffold0040 (265-329)||(17947-18011)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (19-332)||(1048-1361)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (19-332)||(23870-24183)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (19-332)||(106-419)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (19-332)||(55396-55708)
scaffold0075 (19-203)||(47926-48109)
[»] chr4 (32 HSPs)
chr4 (19-332)||(15698-16010)
chr4 (35-332)||(14162507-14162804)
chr4 (33-329)||(16219228-16219524)
chr4 (33-329)||(16222548-16222844)
chr4 (49-328)||(15144584-15144863)
chr4 (18-332)||(8050284-8050598)
chr4 (137-329)||(13513390-13513582)
chr4 (142-332)||(19635173-19635363)
chr4 (36-332)||(23958784-23959080)
chr4 (36-332)||(8389449-8389745)
chr4 (36-332)||(19775472-19775768)
chr4 (36-332)||(27714373-27714669)
chr4 (142-332)||(14300764-14300954)
chr4 (142-332)||(17091934-17092124)
chr4 (142-332)||(12479637-12479827)
chr4 (142-332)||(40476077-40476267)
chr4 (140-329)||(18224229-18224418)
chr4 (19-203)||(8203-8386)
chr4 (142-332)||(16233777-16233967)
chr4 (142-329)||(14683607-14683794)
chr4 (137-332)||(16250630-16250825)
chr4 (137-332)||(18604599-18604794)
chr4 (218-328)||(16350415-16350525)
chr4 (146-329)||(14697141-14697324)
chr4 (37-206)||(8708840-8709009)
chr4 (82-204)||(13879274-13879396)
chr4 (268-329)||(3261965-3262026)
chr4 (268-329)||(7357307-7357368)
chr4 (268-329)||(11204403-11204464)
chr4 (268-329)||(15073399-15073460)
chr4 (268-329)||(29450708-29450769)
chr4 (12-72)||(13513647-13513707)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (12-288)||(1-277)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (19-332)||(21670-21983)
scaffold0081 (19-332)||(37094-37407)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (19-332)||(30499-30812)
scaffold0023 (33-208)||(43392-43567)
scaffold0023 (212-329)||(47101-47218)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (19-332)||(10852-11164)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (33-332)||(14042721-14043020)
chr7 (33-332)||(14352751-14353050)
chr7 (31-332)||(15145866-15146167)
chr7 (142-332)||(15158111-15158301)
chr7 (137-329)||(9591393-9591585)
chr7 (142-332)||(13689067-13689257)
chr7 (142-332)||(11234267-11234457)
chr7 (142-332)||(18180769-18180959)
chr7 (137-318)||(11984032-11984213)
chr7 (18-332)||(8710631-8710945)
chr7 (142-332)||(14335422-14335612)
chr7 (142-332)||(44788405-44788595)
chr7 (137-329)||(16726490-16726682)
chr7 (137-329)||(17703504-17703696)
chr7 (142-332)||(18587225-18587415)
chr7 (194-329)||(11550208-11550343)
chr7 (157-329)||(12690531-12690702)
chr7 (260-329)||(14957583-14957652)
chr7 (127-332)||(15627550-15627755)
chr7 (37-206)||(12203727-12203896)
chr7 (163-206)||(15114354-15114397)
chr7 (268-329)||(13965826-13965887)
chr7 (268-329)||(26091956-26092017)
chr7 (268-329)||(40924975-40925036)
chr7 (268-329)||(49155331-49155392)
chr7 (12-72)||(9591650-9591710)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (19-329)||(36745-37055)
scaffold0042 (133-332)||(26418-26617)
scaffold0042 (33-69)||(26681-26717)
[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (25-332)||(15065727-15066034)
chr3 (19-332)||(12843264-12843577)
chr3 (19-329)||(15262289-15262599)
chr3 (28-326)||(23079187-23079485)
chr3 (35-329)||(14578598-14578879)
chr3 (33-320)||(19727428-19727715)
chr3 (142-332)||(15713340-15713530)
chr3 (143-332)||(26790698-26790887)
chr3 (36-332)||(16804125-16804421)
chr3 (142-332)||(15345529-15345719)
chr3 (142-332)||(16638429-16638619)
chr3 (142-332)||(12889365-12889555)
chr3 (142-332)||(43165331-43165521)
chr3 (142-332)||(48428103-48428293)
chr3 (36-332)||(13255346-13255642)
chr3 (144-332)||(53382304-53382492)
chr3 (142-332)||(3688599-3688789)
chr3 (142-332)||(10008256-10008446)
chr3 (142-332)||(15358739-15358929)
chr3 (142-332)||(15586676-15586866)
chr3 (142-332)||(20059338-20059528)
chr3 (142-329)||(24185849-24186036)
chr3 (142-332)||(10908866-10909056)
chr3 (142-332)||(16753985-16754175)
chr3 (142-329)||(6603394-6603581)
chr3 (137-332)||(16694820-16695015)
chr3 (142-332)||(5422214-5422404)
chr3 (142-332)||(15399802-15399991)
chr3 (19-330)||(11861032-11861322)
chr3 (175-326)||(14873885-14874036)
chr3 (27-209)||(12501712-12501894)
chr3 (137-233)||(23415069-23415165)
chr3 (12-115)||(17497564-17497667)
chr3 (37-205)||(2037080-2037248)
chr3 (37-205)||(2040821-2040989)
chr3 (37-205)||(14039539-14039707)
chr3 (133-206)||(13028620-13028693)
chr3 (19-72)||(14873746-14873799)
chr3 (133-204)||(19039999-19040070)
chr3 (160-206)||(2247145-2247191)
chr3 (94-206)||(12857721-12857833)
chr3 (87-206)||(15008799-15008918)
chr3 (133-204)||(17738679-17738750)
chr3 (95-205)||(15230396-15230506)
chr3 (95-205)||(15236264-15236374)
chr3 (268-329)||(10408637-10408698)
chr3 (268-329)||(12509882-12509943)
chr3 (268-329)||(28756988-28757049)
chr3 (268-329)||(47126613-47126674)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (26-332)||(15511-15817)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (19-332)||(10083-10396)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (33-329)||(57553-57849)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (33-332)||(104293-104591)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (19-321)||(1-303)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (35-304)||(3636-3905)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (19-332)||(50270-50583)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (19-332)||(36564-36877)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (19-314)||(30371-30666)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (33-332)||(6939-7238)
scaffold0270 (33-332)||(14069-14368)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (34-329)||(23473-23768)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (20-274)||(1156-1410)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (82-332)||(194826-195076)
scaffold0017 (36-329)||(17008-17301)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (38-307)||(69366-69634)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (19-332)||(229777-230090)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (137-332)||(13167-13362)
scaffold0109 (142-332)||(41221-41411)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (142-332)||(3490-3680)
scaffold0044 (137-332)||(17226-17421)
scaffold0044 (19-71)||(17487-17539)
[»] scaffold2059 (1 HSPs)
scaffold2059 (137-332)||(812-1007)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (19-278)||(7582-7841)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (137-332)||(7822-8017)
scaffold0130 (82-206)||(3880-4004)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (34-329)||(216360-216655)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (27-332)||(28861-29166)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (19-332)||(11281-11594)
scaffold0177 (19-269)||(14966-15216)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (36-332)||(2930-3226)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (19-195)||(4480-4656)
scaffold0207 (189-329)||(7834-7974)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (137-332)||(14490-14685)
scaffold0010 (34-329)||(4984-5279)
scaffold0010 (268-329)||(39507-39568)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (37-332)||(424374-424669)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (36-328)||(171188-171480)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (34-329)||(496089-496384)
scaffold0001 (130-330)||(441721-441920)
scaffold0001 (268-329)||(514527-514588)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (142-332)||(22313-22503)
[»] scaffold0052 (1 HSPs)
scaffold0052 (142-332)||(7302-7492)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (36-332)||(207-503)
[»] scaffold1881 (1 HSPs)
scaffold1881 (137-332)||(523-718)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (34-332)||(15476-15774)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (169-332)||(10434-10597)
[»] scaffold0789 (1 HSPs)
scaffold0789 (142-332)||(4-194)
[»] scaffold0611 (1 HSPs)
scaffold0611 (12-166)||(9361-9515)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (133-329)||(14305-14501)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (194-329)||(8327-8462)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (142-329)||(11538-11725)
scaffold0028 (157-329)||(55073-55245)
scaffold0028 (270-329)||(18006-18065)
scaffold0028 (157-206)||(128600-128649)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (33-332)||(9290-9589)
scaffold0018 (133-332)||(23337-23536)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (35-261)||(1805-2031)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (35-261)||(4669-4895)
[»] scaffold1459 (1 HSPs)
scaffold1459 (169-330)||(1107-1268)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (133-332)||(15018-15217)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (19-221)||(291-493)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (133-329)||(13518-13714)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (137-296)||(5100-5259)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (39-329)||(48734-49024)
scaffold0007 (133-204)||(163044-163115)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (19-281)||(13957-14219)
[»] scaffold0357 (1 HSPs)
scaffold0357 (35-196)||(17918-18079)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (133-332)||(5154-5353)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (42-332)||(6179-6469)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (137-276)||(1-140)
[»] scaffold0575 (3 HSPs)
scaffold0575 (148-259)||(7796-7907)
scaffold0575 (19-146)||(9871-9998)
scaffold0575 (289-332)||(4649-4692)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (12-182)||(4-174)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (154-329)||(11097-11272)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (36-231)||(17-212)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (37-325)||(16552-16840)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (37-206)||(12020-12189)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (37-202)||(200420-200585)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (37-206)||(1131-1300)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (133-206)||(36023-36096)
[»] scaffold0848 (1 HSPs)
scaffold0848 (127-206)||(5032-5111)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (26-73)||(8539-8586)
[»] scaffold1600 (1 HSPs)
scaffold1600 (33-69)||(400-436)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (138-206)||(1316-1384)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (19-206)||(29719-29906)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (138-206)||(28329-28397)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (163-206)||(1092-1135)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (127-182)||(18389-18444)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (133-204)||(126-197)
scaffold0046 (133-204)||(12331-12402)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (268-329)||(4263-4324)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (268-329)||(30003-30064)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (268-329)||(67282-67343)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (268-329)||(41804-41865)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (19-71)||(63-115)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (127-199)||(1455-1527)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (268-328)||(531-591)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25429709 - 25429390
Alignment:
Q  12 tcctggagagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggt 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| || || || ||||| ||||||||||| |||    
T  25429709 tcctgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtcctg-ggatgtaaatagatgttttcgctgtggaaagaagggt 25429611  T
Q  112 catgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccag 211  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  25429610 catgcactagctgagggcaaacatgatgatatagtatgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacaatgcaagaagcctaagaaggcgccgg 25429511  T
Q  212 ctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctat 311  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25429510 ctactggtagagtttttgctttgactggtacacagacatagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctat 25429411  T
Q  312 tattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25429410 tattgatactggtgctacgca 25429390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23526333 - 23526026
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || || || || ||  ||||||| ||||| |||||||||     
T  23526333 gagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtcctagagaggtaaaaagatgtttcagatgtggtaagaagggtcatgcat 23526234  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||    ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  23526233 tagccaattgcaaccgtaatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcatattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactgg 23526134  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||| ||| | | || ||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23526133 tagagttttcgctttgattggtactcaaaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgat 23526034  T
Q  319 actggtgc 326  Q
    ||||||||    
T  23526033 actggtgc 23526026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21883057 - 21882743
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttc-gatgtggaaagaaaggtcatgca 117  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    || || ||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  21883057 gagattgtctgttttaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgcttgtccgggagaggtaaagagatgttttcagatgtggtaagaagggtcatgca 21882958  T
Q  118 ctagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactg 217  Q
     |||||| ||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||    
T  21882957 atagctgagtagaaacataatgacattgtgtgcttcaattgtaatgaagaaggtcacattggttctcagtgtaagcagcctaagaaggtgccgactactg 21882858  T
Q  218 gtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattga 317  Q
    |||| ||||| ||| |  ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  21882857 gtagggttttggctttggctggtacacagacaaagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttggtattattga 21882758  T
Q  318 tactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||    
T  21882757 tactggtgctacgca 21882743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 34 - 329
Target Start/End: Original strand, 26735847 - 26736141
Alignment:
Q  34 acttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaac 133  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||| ||||| | |||| | ||| |||| |||| ||| ||||    
T  26735847 acttgttgtgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctg-ggatgtgaaaaggtgctttcgttgtggtatgaaatggcatacacttgctgagtgtaaac 26735945  T
Q  134 atgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctct 233  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| |    
T  26735946 atgatgatgctgtgtgtttcaattgcaatgaggaaggtcacattggtttgcaatccaagaagcctaagaaggcgcagactactagtagagtttttgcttt 26736045  T
Q  234 aactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26736046 gactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctac 26736141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 329
Target Start/End: Original strand, 21332134 - 21332400
Alignment:
Q  63 tgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaat 162  Q
    ||||||||||  |||||| ||| |||||||||| || || ||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21332134 tgcttgtcctggggatgtaaagcggtgctttcgttgaggtaagaatggtcatacacttgctgagtgtaaacatgatgatgttgtgtgtttcaattgcaat 21332233  T
Q  163 gaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatc 262  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||||  ||||| |||||||    
T  21332234 gagaaaggtcacattggttcgcaatgcaagaagcctaagaaggtgcagactactgggagagtttttgctttgactggtactcagatagagaatgaggatc 21332333  T
Q  263 gcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21332334 gtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctac 21332400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23461236 - 23460943
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||| || ||||  || || || ||||| |||||  ||||| |  ||||||  ||||| |||    
T  23461236 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttccggtgtggcaagaagagtcatactttagctgaatgcaagcat 23461137  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |    
T  23461136 ggtgatattgtgtgtttcgattgcaaggaagagggtaatattggttcccagtgcaaacaacctaagaaggcgccgactactggtagagtttttgctttga 23461037  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||| |||  |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23461036 ctggtacttagaccgagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctgtattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctac 23460943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 29473300 - 29473490
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  29473300 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggta 29473399  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29473400 ctcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 29473490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Original strand, 27665611 - 27665907
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || |||  |||  | |||| |||  | || ||||| |||||||||||||   ||||||  ||||| |||    
T  27665611 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcat 27665710  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
       || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||| | |    
T  27665711 acagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttga 27665810  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||  || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27665811 ctgggactcagacagagaatgacgatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 27665907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Original strand, 14996966 - 14997153
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |||| ||    
T  14996966 attgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggta 14997065  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997066 cgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 14997153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18782278 - 18782083
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| || |||||| |||| |||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  18782278 atgatatcgtatgcttcaattgtaatgaagaggttcatattggttcccaatgcaagcagccgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggc 18782179  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18782178 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 18782083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Original strand, 37288723 - 37288910
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  37288723 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggta 37288822  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37288823 ctcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 37288910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22137827 - 22137637
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  22137827 attgtgtgttttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgaatactggtagagtctttgctttgactggta 22137728  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  22137727 ctcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgatacgca 22137637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27613639 - 27613325
Alignment:
Q  18 agagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgca 117  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  || |||   ||  | |||| |||  | || ||||| |||||||||||||      
T  27613639 agagattgtgtgtttcaattgtggtgagaagggccacaagagcaatgtctgccctgaagaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgtg 27613540  T
Q  118 ctagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactg 217  Q
     ||||||  ||||| | |   || ||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||    
T  27613539 gtagctgattgcaatcgtacggacattgtgtgctttaattgcaatggagaggctcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactg 27613440  T
Q  218 gtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattga 317  Q
    |||| || |||||| | ||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27613439 gtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattga 27613340  T
Q  318 tactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||    
T  27613339 tactggtgctacgca 27613325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 143 - 332
Target Start/End: Original strand, 27682628 - 27682817
Alignment:
Q  143 ttgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatac 242  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   | ||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |||| |||    
T  27682628 ttgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcatcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtac 27682727  T
Q  243 acagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27682728 tcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 27682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16359661 - 16359471
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  16359661 attgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 16359562  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16359561 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 16359471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19773119 - 19772929
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  19773119 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 19773020  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773019 ctcagacagagaatgaggatcttttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 19772929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 22330114 - 22330304
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  22330114 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcgcattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggta 22330213  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22330214 ctcagacagataacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 22330304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 34569653 - 34569463
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  34569653 attgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 34569554  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34569553 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 34569463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40711939 - 40711749
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  40711939 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 40711840  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711839 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatcttaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 40711749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41774001 - 41773811
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  41774001 attgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 41773902  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773901 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 41773811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22351078 - 22350888
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   | ||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |||| ||    
T  22351078 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcatcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggta 22350979  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22350978 ctcagacggagaacgatgatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgca 22350888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27521565 - 27521375
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  27521565 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 27521466  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27521465 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 27521375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23474461 - 23474167
Alignment:
Q  34 acttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaac 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||| | || ||||  || || |    
T  23474461 acttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctg-ggatgtgaaacggtgttttcgttgtggtaagaaggggcatactcttgctgaatgtaagc 23474363  T
Q  134 atgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctct 233  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||| ||||||||||   ||||| | |||||||||||  |    
T  23474362 atgattatgttgtgtgtttcaattgcaatgaagaaggttatattggttcgcaatgtaagaagcccaagaaggcgcagactactaggagagtttttgcatt 23474263  T
Q  234 aactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
     |||| ||  ||||| || || |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23474262 gactggtatgcagacagaaaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgattgtacacctttagttgctattattgataccggtgctac 23474167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 332
Target Start/End: Original strand, 21631617 - 21631816
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||| ||| | ||| ||||||     
T  21631617 catgatgatgtggtgtgtttcaactgcaatgaagaaggtcatattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcagactagtgggaaagtgtttgctt 21631716  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| ||||||||| | ||| ||||| || ||||| |||||||| || ||  |||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21631717 tgactggtacacagacagtgaatgaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattaatactggtgctacgca 21631816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Original strand, 16258158 - 16258326
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |   || |  |||| |||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||  ||||| | ||    
T  16258158 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtg 16258257  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaagg 205  Q
     ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16258258 gtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaaggtcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 16258326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20803879 - 20803696
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||| | || ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||  ||| || ||||  || ||  | ||||| ||||| |||||| |      
T  20803879 gagattgtctgtttcaattatggtgagaaaggccacaagagaaatgtttgccctgaggaggtgaagaaatgtttctggtgtggcaagaagggtcatactt 20803780  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaaga 202  Q
    ||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||| |||||  |||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20803779 tagctgactgcaagcatagtgatattgtgtgcttcaatggcaaggaagagagtcatattggttctcagtgcaagcagcctaaga 20803696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Original strand, 22591877 - 22592045
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |   || |  |||| |||||| ||||| || |||||||| ||| || ||||||  ||||| | ||    
T  22591877 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgggggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtg 22591976  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaagg 205  Q
     ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22591977 gtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaaggtcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 22592045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Original strand, 22595432 - 22595600
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |   || |  |||| |||||| ||||| || |||||||| ||| || ||||||  ||||| | ||    
T  22595432 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgggggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtg 22595531  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaagg 205  Q
     ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22595532 gtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaaggtcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 22595600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20803616 - 20803566
Alignment:
Q  282 ctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20803616 ctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgca 20803566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 82 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 23669833 - 23669709
Alignment:
Q  82 aagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggtt 181  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||| | || ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||| || | |    
T  23669833 aagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaaatgtgacgaagaaggtcaccttagct 23669734  T
Q  182 cacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    | ||||||||||| |||||||||||    
T  23669733 cgcagtgcaagaatcctaagaaggc 23669709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 206
Target Start/End: Original strand, 21983349 - 21983468
Alignment:
Q  87 gtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacag 186  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| |  |||| |  ||||| | || ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||  || |||| |||    
T  21983349 gtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagcggaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcag 21983448  T
Q  187 tgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  21983449 tgcaggaagcctaagaaggc 21983468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 14884344 - 14884405
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14884344 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 14884405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20345297 - 20345236
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20345297 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 20345236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Original strand, 21561248 - 21561316
Alignment:
Q  138 tgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||  || |||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  21561248 tgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcataagaaggc 21561316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 43122668 - 43122592
Alignment:
Q  82 aagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattg 158  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||  ||||| | || ||||||||| |||||||||||    
T  43122668 aagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatgcgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattg 43122592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 33)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 35 - 332
Target Start/End: Original strand, 23105205 - 23105503
Alignment:
Q  35 cttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaaca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23105205 cttgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgtccttaagacgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaaca 23105304  T
Q  135 tgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaaga-aggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  23105305 tgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagaggtcacattggttcacagtgtaagcagcctaagaaggcgccgactactggtagagtttttgcttt 23105404  T
Q  234 aactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23105405 gactggtacacagactgagaacgaggatcgtttgaccagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgttactggtgctacgca 23105503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23065401 - 23065081
Alignment:
Q  12 tcctggagagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggt 111  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| || || || ||||| ||||||||||| |||    
T  23065401 tcctgcagagattgtctattttacttatggtgagaagggccacaagagctattcttgtcctggggatgtcaaaagatgttttcgctgtggaaagaagggt 23065302  T
Q  112 catgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccag 211  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  23065301 catgcactggctgaatgcaaacatgatgatatagtatgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaaaaagcctaagaaggcgccga 23065202  T
Q  212 ctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctat 311  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23065201 ctactggcagagttttttctttcactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctat 23065102  T
Q  312 tattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23065101 tattgatactggtgctacgca 23065081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23074851 - 23074531
Alignment:
Q  12 tcctggagagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggt 111  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| || || || ||||| ||||||||||| |||    
T  23074851 tcctgcagagattgtctattttacttatggtgagaagggccacaagagctattcttgtcctggggatgtcaaaagatgttttcgctgtggaaagaagggt 23074752  T
Q  112 catgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccag 211  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  23074751 catgcactggctgaatgcaaacatgatgatatagtatgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaaaaagcctaagaaggcgccga 23074652  T
Q  212 ctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctat 311  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23074651 ctactggcagagttttttctttcactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacatttagttgctat 23074552  T
Q  312 tattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23074551 tattgatactggtgctacgca 23074531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 25 - 331
Target Start/End: Original strand, 22733242 - 22733548
Alignment:
Q  25 gtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||| || || | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22733242 gtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgtttacaatgtggaaagaagggtcatgcactagctg 22733341  T
Q  125 tgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagt 224  Q
     |||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||    
T  22733342 agtgcaaacatgatgataaagtatgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaaacctaagaaggtgccgactactggtagagt 22733441  T
Q  225 ttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggt 324  Q
    |||| || | |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22733442 ttttactttgactggtacatagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggt 22733541  T
Q  325 gctacgc 331  Q
    |||||||    
T  22733542 gctacgc 22733548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 23028924 - 23029236
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  23028924 gagattgtctgtttta-ttgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtcctggagaggtaaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcac 23029022  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  23029023 tagctgattgcaaacataatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttctcagtgcaagcaacctaagaaggcgccgactactgg 23029122  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||| || ||  |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23029123 tagagttttcgctttgactggtactcaaaccaagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatcttatattaataatactcccttagttgctattattgat 23029222  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  23029223 actggtgctacgca 23029236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Original strand, 22742423 - 22742741
Alignment:
Q  14 ctggagagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtca 113  Q
    |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    || || || || || || ||||| || ||||| |||||    
T  22742423 ctggtgagattgtctgctttaattgtggtgagaaatgccacaagagcaatgcttgtccgggagaggtaaatagatgtttccgatgcggtaagaagggtca 22742522  T
Q  114 tgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagct 213  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  ||    
T  22742523 tgcactagctgagtgcaaacataatgacattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttcgcagtgtaagcagcctaagaaggcgccgact 22742622  T
Q  214 actggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctatta 313  Q
    ||||||| |||||| ||| | |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22742623 actggtaaagttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctatta 22742722  T
Q  314 ttgatactggtgctacgca 332  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  22742723 ttggtactggtgctacgca 22742741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24678468 - 24678159
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||    
T  24678468 gagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtccgggagaggttaagagatgtttccgttgtggtaagaagggtcatgcac 24678369  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| |||||| | | |||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  24678368 tagctgagtgcaagcgtaatgacattgtgtgcttcaattgcattgaagagagtcacataggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactgg 24678269  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24678268 tagagttttcgctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatatgaataatactcctttagttgctattaatgat 24678169  T
Q  319 actggtgcta 328  Q
    ||||||||||    
T  24678168 actggtgcta 24678159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 11351173 - 11351486
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||| ||  |||  || ||  | ||||| ||||| |||||| ||     
T  11351173 gagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccaaaggaggtagagaaatgtttctggtgtggcaagaagggtcatacat 11351272  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| || |||  |||||||    
T  11351273 tagctgattgcaagcatagtgatattgtgtgcttcaattgcaaggaagagggtcacattggttctcagtccaagcagcctaagagggtgccgactactgg 11351372  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11351373 tagggtttttgctctggctggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgat 11351472  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  11351473 actggtgctacgca 11351486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 26 - 332
Target Start/End: Original strand, 24704951 - 24705257
Alignment:
Q  26 tctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgt 125  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| || ||||  || || |  ||||| ||||| |||||  |  ||||||     
T  24704951 tctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaggaggtaaagaaatgtttccagtgtggcaagaagggtcacactttagctga 24705050  T
Q  126 gtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtt 225  Q
     ||||| | | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||| |||    
T  24705051 ttgcaagcgtaatgacattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcacataggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactagtagggtt 24705150  T
Q  226 tttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 325  Q
    |||||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24705151 tttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgatattattgatactggtg 24705250  T
Q  326 ctacgca 332  Q
    |||||||    
T  24705251 ctacgca 24705257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Original strand, 23040038 - 23040247
Alignment:
Q  18 agagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgca 117  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  23040038 agagattgtctgtttttcttgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgtttccgatgtggaaagaagggtcatgca 23040137  T
Q  118 ctagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactg 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || || || || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23040138 ctagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgttttaactgcaatgaagagcgtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagcaactg 23040237  T
Q  218 gtagagtttt 227  Q
    ||||| ||||    
T  23040238 gtagattttt 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23205177 - 23204982
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  23205177 atgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcccaatgcaagcagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggc 23205078  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23205077 tggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgca 23204982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23676781 - 23676586
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  23676781 atgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcccaatgcaagcagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggc 23676682  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23676681 tggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctacgca 23676586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Original strand, 24657137 - 24657433
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || |||||||  ||| || |||| ||| || || ||||| ||||| |||||  || ||||||  |||||||||    
T  24657137 ttgtggtgagaaaggccacaagagtactgtttgtcctgaggaggtgaagaagtgtttccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgattgcaaacat 24657236  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
    | |||||| ||||| || ||| |||| || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||      
T  24657237 ggtgatatcgtgtgttttaatggcaaagaggagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctgg 24657336  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    ||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  24657337 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactccattagttgctattattgatacagctgctacgca 24657433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24265227 - 24265038
Alignment:
Q  143 ttgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatac 242  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |||| |||    
T  24265227 ttgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtac 24265128  T
Q  243 acagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24265127 tcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 24265038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24712892 - 24712702
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  24712892 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 24712793  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712792 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 24712702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9338440 - 9338250
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  9338440 attgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 9338341  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9338340 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 9338250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9487074 - 9486884
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  9487074 attgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 9486975  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486974 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 9486884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16984098 - 16983908
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  16984098 attgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 16983999  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16983998 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 16983908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 22322927 - 22323117
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||  | |||||| | ||||  |    
T  22322927 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtaggatctttgctttgactggga 22323026  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22323027 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 22323117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27374233 - 27373937
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||  |||  | |||| |||  | || ||||| |||||||||||||   ||||||  ||||| | |    
T  27374233 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgtggtagctgattgcaatcgt 27374134  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
       || ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |    
T  27374133 acagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttga 27374034  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||  || ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27374033 ctgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagatgtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 27373937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Original strand, 44383049 - 44383345
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||  | |||| |||  | || ||||| |||||||||||||   ||||||  ||||| | |    
T  44383049 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgt 44383148  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
       ||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| |||||   |||| ||||| || |||||| | |    
T  44383149 acggacgttgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgctgactacgggtagggtctttgctttga 44383248  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44383249 ctgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 44383345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 24874335 - 24874525
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| |   ||||||||| |||||   |||||||||| || |||||| | |||| ||    
T  24874335 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcaaattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgctgactactggtagggtctttgctttgactggta 24874434  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24874435 ctcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgca 24874525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Original strand, 21322878 - 21323041
Alignment:
Q  169 ggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttga 268  Q
    ||||||||||||||||| || | | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || | ||| ||||| ||||| ||||||||| | |    
T  21322878 ggtcacattggttcacaatgtacgcaacctaagaaggcgccaactactggtagagtttttgcattgaccggtactcagaccgagaatgaggatcgcctaa 21322977  T
Q  269 tcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21322978 tcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 21323041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10871708 - 10871518
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  10871708 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcatagtgtacccagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 10871609  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871608 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 10871518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17001858 - 17001668
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  17001858 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcatagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 17001759  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17001758 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 17001668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Original strand, 24817316 - 24817615
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| || ||| |  |  | |  || ||     
T  24817316 tacttgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgtactggagatgtgaaacggtgcttccgttgtggtaagaaggggcatactattacagaatgtaag 24817415  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||| ||||| ||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||| | ||||| ||||||     
T  24817416 cattatgatgttgtgtgttttaactgcaatgaggaaggtcatattggttcacaatgcaagaagcctaagaaggcgcagaccactaggagagtgtttgctt 24817515  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  || |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24817516 tgactggtacacagatagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgca 24817615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 280
Target Start/End: Original strand, 22463061 - 22463204
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| |||| ||||||  |||  ||| |||||||||||||  |    
T  22463061 atgatattgtgtgcttcaattgcaacgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagccgaagagggcgcctactatgggtcgagtttttgctctggc 22463160  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtactt 280  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22463161 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtactt 22463204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 283
Target Start/End: Original strand, 21139566 - 21139707
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||| | |||| ||    
T  21139566 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaatagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggta 21139665  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgct 283  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21139666 ctcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgct 21139707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 332
Target Start/End: Original strand, 45673711 - 45673787
Alignment:
Q  256 gaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  45673711 gaggatcgattgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataatggagctacgca 45673787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 21320465 - 21320607
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    || || || || || ||||| ||||| |||||||| ||| |||    
T  21320465 gagattgtctgttttaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgcttgtccgggagaggtaaaaagatgttttcgctgtgggaagaaaggacatacac 21320564  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaa 161  Q
    |||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||    
T  21320565 tagctgagtgtaaacgtaatgatattgtgtgctttaattgcaa 21320607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27220745 - 27220684
Alignment:
Q  271 agaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27220745 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 27220684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 332
Target Start/End: Original strand, 21142761 - 21142816
Alignment:
Q  277 acttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21142761 acttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgca 21142816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 28350788 - 28350669
Alignment:
Q  87 gtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacag 186  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| |  ||||||  ||||| | || ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||  |  |||| |||    
T  28350788 gtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatctcagttcgcag 28350689  T
Q  187 tgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28350688 tgcaagaagcctaagaaggc 28350669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 26 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22401950 - 22401644
Alignment:
Q  26 tctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgt 125  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||     
T  22401950 tctgttttacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgttttcgctgtggaaagaaggatcatgcactagctga 22401851  T
Q  126 gtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtt 225  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22401850 gtgcaaacatgatgatatagtatgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgccggctactggtagagtt 22401751  T
Q  226 tttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 325  Q
    |||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22401750 tttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagagatacttgttatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 22401651  T
Q  326 ctacgca 332  Q
    |||||||    
T  22401650 ctacgca 22401644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21752412 - 21752099
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  21752412 gagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccaaaagagcaatgcttgtactggggatgttaagaggtgttttcgctgtggtaagaagggtcatgcac 21752313  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||    
T  21752312 tagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgtttcaattgcaacgaggaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggtgcagactactgg 21752213  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||||||  | |||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21752212 tagagtttttgcattgactagtactcagactgagaacgaggatcacttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgat 21752113  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    | ||||||||||||    
T  21752112 attggtgctacgca 21752099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 22496250 - 22496563
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| |||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  22496250 gagattgtctgctttaattatggtgagaaaggccacaagagcgatgcttgtccgggagaggtaaagagatgttttcgatgtggtaagaagggtcacgcac 22496349  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  22496350 tagctgagtgcaaacataatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattagttcgcagtgtaagcagcctaagaaggcgccgactactgg 22496449  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22496450 tagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgat 22496549  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  22496550 actggtgctacgca 22496563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 20081370 - 20081683
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || ||||| || ||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  20081370 gagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtccgggagaggtaaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtcatacac 20081469  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    || ||| ||| || | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||  |||||||    
T  20081470 tatctgagtgtaagcgtaatgacattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcgcagtgtacgcggcctaagaaggcgccgactactgg 20081569  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||| ||  | |||  ||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20081570 tagagttttcgcgttgactagtactcagaccgagaataaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgat 20081669  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    |||||| |||||||    
T  20081670 actggtactacgca 20081683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 323
Target Start/End: Original strand, 22435744 - 22436031
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||| || ||||  || || |||||||| ||||| |||||| || ||||||  ||||| |||    
T  22435744 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtaaagaaatgtttccgatgtggcaagaagggtcatacattagctgattgcaagcat 22435843  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||      
T  22435844 agtgatattgtgtgcttcaattgcaaggaagagggtcacattggttctcagtgcaagcaacctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctctgg 22435943  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactgg 323  Q
    ||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22435944 ctggtacagagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactgg 22436031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 329
Target Start/End: Original strand, 24784851 - 24785161
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||  | ||||  ||    || ||||| ||||| |||||| |      
T  24784851 gagattgtctgtttcaattatggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggagataaagaaatgtgcccggtgtggcaagaagggtcatacgg 24784950  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  24784951 tagctgactgcaagcgtaatgatattgtgtgtttcaattgcaatgaagagggtcacattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactgg 24785050  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||| ||||||||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24785051 tagggtttttgctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgat 24785150  T
Q  319 actggtgctac 329  Q
    ||| |||||||    
T  24785151 acttgtgctac 24785161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Original strand, 21228668 - 21228863
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  | || ||| ||||||||||| |  |    
T  21228668 atgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagagggcgcctacaacgggtcgagtttttgctttggc 21228767  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21228768 tggtactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaatattactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 21228863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19109610 - 19109424
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | |||| ||    
T  19109610 attgtgtgttttaactgcaatgaagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactggta 19109511  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 328  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19109510 ctcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggtgcta 19109424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Original strand, 41350679 - 41350975
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||  |||  | |||| |||  | || ||||| ||||| |||||||   ||||||  ||||| | |    
T  41350679 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtcgtagctgattgcaatcgt 41350778  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
    |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | |    
T  41350779 gcagacattgtgtgctttaattgtaatggagaaggtcacattagttctcagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttga 41350878  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41350879 ctgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 41350975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 16347712 - 16347902
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  16347712 attgtgtgctttaactgcaatggagaaggtcacattagttctcagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 16347811  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16347812 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 16347902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21842454 - 21842264
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |||| ||    
T  21842454 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcatagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggta 21842355  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21842354 cgcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgca 21842264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 137 - 329
Target Start/End: Original strand, 17042127 - 17042319
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||  |||| ||||||||| |||| |||| | ||||  |||| ||| |||||||||| ||| |    
T  17042127 atgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatataagttcccagtgcaagcagccgaagaggacgcctactacgggtcgagtttttgcactagc 17042226  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    || ||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17042227 tggtactcagacagagactgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 17042319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21833544 - 21833354
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||||| | ||||  |    
T  21833544 attgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactcgtagggtctttgctttgactggga 21833445  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21833444 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 21833354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 51330609 - 51330799
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  51330609 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 51330708  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51330709 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 51330799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 35 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16379443 - 16379146
Alignment:
Q  35 cttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaaca 134  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||| |||| ||   ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||| ||| | ||  | | ||| || ||    
T  16379443 cttgtggtgagaaaggccacaaaagtaatgtttgtactggagatgtgaaatggtgtttccgttgtggtaagaaaggacatacgcttccagagtgtaagca 16379344  T
Q  135 tgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctcta 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||| |||||||| |   ||||||||||||| |||||| |     
T  16379343 tgatgatattgtgtgtttcaattgcaatgaagagggtcacattgtttcgcaatgtaagaagccaaagaaggctcagactactggtagagtgtttgctttg 16379244  T
Q  235 actgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||| ||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| || ||  |||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16379243 actggtacgcaaacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatggtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgca 16379146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 33388146 - 33388336
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  33388146 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 33388245  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagagg-tacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33388246 ctcagacagagaatgaggatcg-ttgatcagagggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 33388336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 157 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22400547 - 22400397
Alignment:
Q  157 tgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacg 256  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||  | |||| ||| ||||| |||||||    
T  22400547 tgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgcattgactggtactcagacggagaacg 22400448  T
Q  257 aggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttg 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22400447 aggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttg 22400397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 139 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21176673 - 21176531
Alignment:
Q  139 gatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactg 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| | ||||  |||| | | |||| ||||||||  |||    
T  21176673 gatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagaggacgcctactacggatcgagtctttgctctggctg 21176574  T
Q  239 atacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttg 281  Q
     ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21176573 gtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttg 21176531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 329
Target Start/End: Original strand, 21045235 - 21045428
Alignment:
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
    |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| ||||||||| | |   ||| ||| ||||| |||||| | |    
T  21045235 gatgatgtggtgtgtttcaattacaatgaagaaggtcatattgtttcacaatgcgagaaacctaagaagactcagactagtggaagagtgtttgctttga 21045334  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||| ||||| | |||||| || ||  |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21045335 ctggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 21045428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 22117066 - 22116876
Alignment:
Q  86 ggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcaca 185  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||| | || ||||  || || ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  22117066 ggtgttttcgttgtggtaagaaagggcatactcttgctgaatgtaagcatgatgatgttgtatgtttcaattgcaatgaggaaggtcatattggatccca 22116967  T
Q  186 gtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggt 276  Q
     |||||||| || |||||| | |   ||||||| |||||||||||| | | || ||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  22116966 atgcaagaaaccgaagaagactcagactactgggagagtttttgctttgaatggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggt 22116876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 20074952 - 20075013
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20074952 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 20075013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 31537240 - 31537301
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31537240 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 31537301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 38910069 - 38910130
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38910069 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 38910130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 48426020 - 48425959
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48426020 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 48425959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 52988888 - 52988827
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52988888 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 52988827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21176732 - 21176680
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcc 71  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  21176732 gagattgtctgtattaattgtggtgagaaagtccacaagagcaatgtttgtcc 21176680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37680196 - 37680136
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 328  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37680196 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 37680136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8601 - 8292
Alignment:
Q  20 agatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcact 119  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8601 agattgtctgctttacttgtggtcagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctagggatgttaagaggtgttttcgctgtggaaagaagggtcatgcact 8502  T
Q  120 agctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggt 219  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8501 agctgagtgcaaacatgatgatatagtatgctttaattgcgatgaagaaggtcacattggttcacagtggaagaagcctaagaaggcgccggctactggt 8402  T
Q  220 agagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgata 319  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8401 agagtttttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattgtgatagtacgcctttagttgctattattgata 8302  T
Q  320 ctggtgctac 329  Q
    || |||||||    
T  8301 ctagtgctac 8292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 21391226 - 21391539
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21391226 gagattgtttgtttttcttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggacgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtcatgcac 21391325  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21391326 tagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcatagtgcaagaagcctaagaaggcgccgactactgg 21391425  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||| || |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21391426 tagggtctttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 21391525  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  21391526 actggtgctacgca 21391539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 21780552 - 21780865
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21780552 gagattgtttgtttttcttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggacgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtcatgcac 21780651  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21780652 tagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcatagtgcaagaagcctaagaaggcgccgactactgg 21780751  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||| || |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21780752 tagggtctttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 21780851  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  21780852 actggtgctacgca 21780865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21254351 - 21254048
Alignment:
Q  28 tgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgt 127  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||   ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||    
T  21254351 tgtttttcttgtggtgagaagggccataagagtaatccttgtcctggggataccaagagatg-tttcgatgtgggaagaagggttatgcactagctgagt 21254253  T
Q  128 gcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttt 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21254252 gcaaacatgatgatattgtttgctttaactgcaatgaatagggtcacatcggttcatagtgcaagaagcctaagaaggcgccggctactggtagtgtttt 21254153  T
Q  228 tgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgct 327  Q
    |||| | |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21254152 tgctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgct 21254053  T
Q  328 acgca 332  Q
    |||||    
T  21254052 acgca 21254048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 25 - 302
Target Start/End: Original strand, 18881028 - 18881305
Alignment:
Q  25 gtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18881028 gtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgttttcactgtggaaagaagggtcatgcactagctg 18881127  T
Q  125 tgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagt 224  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18881128 agtgcaaacatgatgatatagtatgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccggctactggtagagt 18881227  T
Q  225 ttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacaccttt 302  Q
    ||||||| | |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18881228 ttttgctttgactggtacacagacagagaacggggatcgcttgatcaaaggtacttgttatattgataatacaccttt 18881305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19981371 - 19981070
Alignment:
Q  31 tttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgca 130  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  || || || || || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19981371 tttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtccgagagaggtgaaaagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgca 19981272  T
Q  131 aacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgc 230  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |    
T  19981271 aacataatgacattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtagagttttcac 19981172  T
Q  231 tctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacg 330  Q
    | | |||| ||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19981171 tttgactggtactcagaccgagaatgaggatcggctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacg 19981072  T
Q  331 ca 332  Q
    ||    
T  19981071 ca 19981070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Original strand, 22421272 - 22421567
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||| ||| |||    
T  22421272 tacttgtggtgagaaaggccacaaaagtaatgcttgtcctggggatgtgaaacggtgctttcgttgtggcaagaagggacatacacttgctgagtgtaaa 22421371  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||   ||||||  ||||| ||||||     
T  22421372 catgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggacatattgggtcgcaatgcaagaagcctaagaaggcgcagactactgagagagtgtttgct- 22421470  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | |||| |||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22421471 tgactggtacttagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgatactggtgctac 22421567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 332
Target Start/End: Original strand, 21163978 - 21164216
Alignment:
Q  94 cgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaaga 193  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||   | |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||     
T  21163978 cgatgtggtaagaagggtcatgcactggctgattgcaactgtaatgacattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttctcaatgcaagc 21164077  T
Q  194 agcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataa 293  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  21164078 aacctaagaaggcgccaactactggtagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgatca 21164177  T
Q  294 tacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21164178 tactcctttagttgctattattgatactgatgctacgca 21164216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22990461 - 22990152
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||   ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||  || |||    
T  22990461 gagattgtctgctatacttgtggtgagaacggccacaagggtaatgcttgtcctggagatgtgaaaaggtgctttcgttgtggtaagaaagggaatacac 22990362  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    | |||| ||| || ||||||||| || | || |||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  22990361 ttgctgagtgtaagcatgatgatgttatctgtttcaattgcaatgaggaagaacatattgggtcacaatgcaagaagcctaagaaggcgcagactactgg 22990262  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
     |||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  22990261 gagagtttttgctttgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgacagtacacctttagttgctattattgat 22990162  T
Q  319 actggtgcta 328  Q
    ||| ||||||    
T  22990161 actagtgcta 22990152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 329
Target Start/End: Original strand, 30310627 - 30310819
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| |    
T  30310627 atgatattgtgtgcttcaattgcaacgaagagggtcatattggttcccaatgtaagcagccgaagaaggcgcctactacgggtcgagtttttgctctagc 30310726  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30310727 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 30310819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22031401 - 22031206
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||| |  |    
T  22031401 atgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagaaggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagagggcgcctactacaggtcgagtttttgctatggc 22031302  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22031301 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 22031206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22043125 - 22042930
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  22043125 atgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagagggcgcctactacaggtcgagtttttgctctggc 22043026  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22043025 tgctactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 22042930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18859870 - 18859680
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | | || ||    
T  18859870 attgtgtgttttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgagtggta 18859771  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18859770 ctcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 18859680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 17671510 - 17671700
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  17671510 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccaactactggtagggtctttgctttgactggga 17671609  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17671610 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 17671700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 332
Target Start/End: Original strand, 20015627 - 20015941
Alignment:
Q  18 agagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgca 117  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||| || |  || |||  |||  | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||||      
T  20015627 agagattgtgtgtttcaattgtggtgagaagggccacaagagtaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatgtt 20015726  T
Q  118 ctagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactg 217  Q
     ||||||  ||||| | |   || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||    
T  20015727 gtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactg 20015826  T
Q  218 gtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattga 317  Q
    |||| || |||||| | ||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20015827 gtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattga 20015926  T
Q  318 tactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||    
T  20015927 tactggtgctacgca 20015941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Original strand, 19481454 - 19481750
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||  |||  | |||| |||  | || ||||| ||||| |||||||   ||||||  ||||| | |    
T  19481454 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtcgtagctgattgcaatcgt 19481553  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
    |  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | |    
T  19481554 gcagacattgtgtgctttaattgtaatggagaaggtcacattagttctcagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttga 19481653  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19481654 ctgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 19481750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15536681 - 15536486
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| |||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  15536681 atgatactgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagccgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctcttgc 15536582  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15536581 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaatgatactccgttagttgctattattgatactggtgctacgca 15536486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32603443 - 32603248
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||| |||| | ||||  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  32603443 atgatattctgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatataggttcccagtgcaagcagccgaagaggacgcctactacgggtcgagtttttgctctggc 32603344  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32603343 tggtactcagacagagactgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 32603248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 22126447 - 22126637
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| |||| |||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  22126447 attgtgtgttttaactgcaatggagaaagtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggta 22126546  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22126547 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 22126637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19115693 - 19115503
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   |||| |||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  19115693 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagccaaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 19115594  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115593 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 19115503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 22117663 - 22117853
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  22117663 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggta 22117762  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117763 ctcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 22117853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22523912 - 22523714
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||   ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||     
T  22523912 tacttgtggcgagaaaggccacaggagtaatgcttgtcctggagatgtgaaacggtgtttccgttgtggtaagaaagggcatgcacttgctgagtgtaag 22523813  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgct 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||    
T  22523812 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcaatgcaagaagcctaagaaggcgcaaactattgggagagtctttgct 22523714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21671931 - 21671786
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||    
T  21671931 gagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggatgtgaagaggtgttttcgctgtggtaaaaagggtcatgcac 21671832  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatga 164  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21671831 tagctgagtgcaaagatgatgatattgtgtgctttaattgcaatga 21671786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 170 - 325
Target Start/End: Original strand, 22129133 - 22129288
Alignment:
Q  170 gtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgat 269  Q
    ||||||||||||| || |||||| | ||||||| ||||||  |||| |||  ||||||||||||  ||| ||| |||||  |||| |||||||| |||||    
T  22129133 gtcacattggttcccaatgcaagcaacctaagagggcgcctactacgggtcaagtttttgctctggctggtactcagacaaagaatgaggatcgtttgat 22129232  T
Q  270 cagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 325  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22129233 cagaggtacttgctagattaataatactgctttagttgctattattgatactggtg 22129288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 329
Target Start/End: Original strand, 22245497 - 22245690
Alignment:
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | | | ||| ||||||||| |||||| | |    
T  22245497 gatgatgtggtgtgtttcaattgcaatgaagaaggtcatattgggtcacaatgcaagaaacctaagaagactcaaactagtggtagagtgtttgctttga 22245596  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||  ||||||| ||| | |||||||    
T  22245597 ctggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatattagtgctac 22245690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 329
Target Start/End: Original strand, 22245915 - 22246108
Alignment:
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | | | ||| ||||||||| |||||| | |    
T  22245915 gatgatgtggtgtgtttcaattgcaatgaagaaggtcatattgggtcacaatgcaagaaacctaagaagactcaaactagtggtagagtgtttgctttga 22246014  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||| ||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||| |||||||||| ||  ||||||| ||| | |||||||    
T  22246015 ctggtacgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttaatttatattattcatattagtgctac 22246108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 22523707 - 22523652
Alignment:
Q  274 ggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22523707 ggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctac 22523652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20391484 - 20391315
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatgg--atgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaaca 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||  |||  || | |||||| |||||||| |||||||| ||| |  |||| |  ||||| |     
T  20391484 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgttt--ccaatggtgatgagaaaaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatactatagcggaatgcaagcg 20391387  T
Q  135 tgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    || ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20391386 tggtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggc 20391315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 21982415 - 21982494
Alignment:
Q  127 tgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||  || ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21982415 tgcaatcatgatgatgtagtttgctataactgcaaggaagaaggtcatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggc 21982494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 21998901 - 21998980
Alignment:
Q  127 tgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    ||||| ||||||||| | || ||||  || ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21998901 tgcaatcatgatgatgtagtttgctataactgcaaggaagaaggtcatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggc 21998980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 332
Target Start/End: Original strand, 21785999 - 21786033
Alignment:
Q  298 cctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21785999 cctttagttgctattattgatactggtgctacgca 21786033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 97 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 22374207 - 22374098
Alignment:
Q  97 tgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagc 196  Q
    |||||||||||||| ||  || ||||||  ||||| | || ||||||||| ||||  |||||  ||||||||||||| ||| | || ||||||| |||||    
T  22374207 tgtggaaagaaaggacacacattagctgattgcaagcgtggtgatattgtttgctataattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagc 22374108  T
Q  197 ctaagaaggc 206  Q
    ||||||||||    
T  22374107 ctaagaaggc 22374098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Original strand, 22375065 - 22375129
Alignment:
Q  265 ttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||||| |||||||| || ||  |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22375065 ttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 22375129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 21163895 - 21163946
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtc 70  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21163895 gagattgtctgttttaattgtggcgagaaagaccacaagagcaatgcttgtc 21163946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 22004542 - 22004621
Alignment:
Q  127 tgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||  || |||||  |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22004542 tgcaatcatgatgatatagtttgctataactgcaagcaagaaggtcatattagttcgcagtgcaagaagcctaagtaggc 22004621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28984120 - 28984017
Alignment:
Q  226 tttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 325  Q
    |||||||| |||| ||||||||||   || ||||| ||  | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28984120 tttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 28984021  T
Q  326 ctac 329  Q
    ||||    
T  28984020 ctac 28984017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 226 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28989339 - 28989236
Alignment:
Q  226 tttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 325  Q
    |||||||| |||| ||||||||||   || ||||| ||  | |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  28989339 tttgctctgactggtacacagactcctaatgaggaccgacttatcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtg 28989240  T
Q  326 ctac 329  Q
    ||||    
T  28989239 ctac 28989236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 16268838 - 16268899
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16268838 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 16268899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3274474 - 3274402
Alignment:
Q  127 tgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagccta 199  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  3274474 tgcaagcatgaagatgtggtgtgtttcaactgtaatgaagaaggtcacataggttctcagtgtaagaaaccta 3274402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9317 - 9016
Alignment:
Q  28 tgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgt 127  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||| || ||    
T  9317 tgtttttcttgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgtttccgatgtgggaagaagggtcatgcactagttgagt 9218  T
Q  128 gcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttt 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9217 gcaaacatgatgatattgtacgctttaactgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgtaagcagcctaagaaggcgccggctactggtagagtttt 9118  T
Q  228 tgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgct 327  Q
    |||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9117 tgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgct 9018  T
Q  328 ac 329  Q
    ||    
T  9017 ac 9016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 20 - 328
Target Start/End: Original strand, 18405012 - 18405320
Alignment:
Q  20 agatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcact 119  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  18405012 agattgtctgtttcacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggatgttaagaggtgttttcgctgtggtaagaagggtcatgcact 18405111  T
Q  120 agctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggt 219  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  18405112 agctgagtgcaaacatgaggatatagtatgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttctcagtgcaagaagcctaagaaggcgtcgactactggt 18405211  T
Q  220 agagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgata 319  Q
    |||||||||||| | |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18405212 agagtttttgctttgactagtacacagatagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagctgctattattgata 18405311  T
Q  320 ctggtgcta 328  Q
    |||||||||    
T  18405312 ctggtgcta 18405320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22437083 - 22436770
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22437083 gagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtccgggtgaggtaaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcac 22436984  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  22436983 tagctgagtgcaaacgtaatgacattgtgtgcttcaattgtaatgaagatggtcacattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactgg 22436884  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22436883 tagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggaccgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgat 22436784  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||| ||||||||||    
T  22436783 actagtgctacgca 22436770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23081637 - 23081327
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| || || || || ||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  23081637 gagattgtttgttatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggacgtgaaaagatgttttcgttgtggaaagaaagggcatacac 23081538  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    | | ||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||   |||||||    
T  23081537 ttgttgattgtaaacatgatgatattgtgtgtttcaattgcaatgagaaaggtcacattggttcgcagtacaagaagcctaagaaggcgcagactactgg 23081438  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
     |||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23081437 gagagtttttgctttgactgatactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgat 23081338  T
Q  319 actggtgctac 329  Q
    |||||||||||    
T  23081337 actggtgctac 23081327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19867838 - 19867588
Alignment:
Q  82 aagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggtt 181  Q
    ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19867838 aagagatgttttcgctgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaacataatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggtt 19867739  T
Q  182 cacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttg 281  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||| | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19867738 cgcagtgtaagcagcctaagaaggcgccgactactagtagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaacgaggatcgcttgatcaaaggtacatg 19867639  T
Q  282 ctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
     |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19867638 ttatattgataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgca 19867588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 2871992 - 2872182
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||| ||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  2871992 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcaccgactactggtagagtctttgctttgactggta 2872091  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872092 ctcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 2872182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Original strand, 27559053 - 27559349
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || |||||||  ||| || |||| ||| || || ||||| ||||| |||||  || ||||||  ||||| |||    
T  27559053 ttgtggtgagaaaggccacaagagtactgtttgtcctgaggaggtgaagaagtgtttccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgactgcaagcat 27559152  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
    | ||| || |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||||||||     
T  27559153 gctgacatcgtgtgctttaattgcaaagaggagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagagggcgcctactacgggttgagtttttgctctag 27559252  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    ||| ||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27559253 ctggtactcagacagagaatgaggatggtttgatcagaggtacttgttatattaataatactccatttgttgctattattgataatggtgctacgca 27559349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 24292972 - 24293162
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  24292972 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 24293071  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293072 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 24293162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 22829576 - 22829766
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||| ||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |||| ||    
T  22829576 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcaccgtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggta 22829675  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22829676 ctcagacggagaacggggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 22829766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 28260387 - 28260577
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |   |||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||| |    
T  28260387 attgtgtgctttaactgcaatggagagggtcacattagttctcagtgtactcagccgaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactgaga 28260486  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28260487 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgca 28260577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28285529 - 28285339
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |   |||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||| |    
T  28285529 attgtgtgctttaactgcaatggagagggtcacattagttctcagtgtactcagccgaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactgaga 28285430  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28285429 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgca 28285339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 28339136 - 28339326
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |   |||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | ||||| |    
T  28339136 attgtgtgctttaactgcaatggagagggtcacattagttctcagtgtactcagccgaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactgaga 28339235  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28339236 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatacccctttagttgctattattgatactggtgctacgca 28339326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 29589629 - 29589819
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  29589629 attgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 29589728  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589729 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 29589819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 177 - 329
Target Start/End: Original strand, 16924865 - 16925017
Alignment:
Q  177 tggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggt 276  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | || | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16924865 tggttcacagtgtactcagcctaagaaggcgccgactactggtagagtttttgctttgacgggtacacagacagagagcgaggatcgcttgatcagaggt 16924964  T
Q  277 acttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16924965 acttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 16925017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 28312766 - 28312531
Alignment:
Q  97 tgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagc 196  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||  ||||| | |   || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |   |||    
T  28312766 tgtggcaagaaaggtcatgtagtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagaaggtcacattagttctcagtgtactcagc 28312667  T
Q  197 ctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatac 296  Q
    | |||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  || ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28312666 cgaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 28312567  T
Q  297 acctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312566 tcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 28312531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 5836418 - 5836608
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  5836418 attgtgtgttttaactgcaacgaagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtttttgctttgactggta 5836517  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||||  | || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5836518 ctcagacatataatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgca 5836608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 139 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25115646 - 25115453
Alignment:
Q  139 gatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactg 238  Q
    ||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||  | ||||    
T  25115646 gatattgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgccttgactg 25115547  T
Q  239 atacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
     ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25115546 gtactcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtactacgca 25115453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16575087 - 16574791
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||  |||  | |||| |||  | || ||||| |||||||||||||   | ||||  ||||| | |    
T  16575087 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgtggtggctgattgcaatcgt 16574988  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
       || ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |    
T  16574987 acagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttga 16574888  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574887 cggggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 16574791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Original strand, 16620293 - 16620589
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||  |||  | |||| |||  | || ||||| |||||||||||||   | ||||  ||||| | |    
T  16620293 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgtggtggctgattgcaatcgt 16620392  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
       || ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |    
T  16620393 acagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttga 16620492  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16620493 cggggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 16620589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Original strand, 23084906 - 23085202
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||| ||| |  |  | |  || ||     
T  23084906 tacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgtgctagagatgtgaaacggtgtttccgttgtggtaagaaagggcatactattacagaatgtaag 23085005  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||||| ||||| ||||||     
T  23085006 catgatgatgttgtgtgttttaattgaaatgaagaggttcatattggttcgcagtgcaagaagcctatgaaggcgcagactactggaagagtgtttgctt 23085105  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | |||  ||  ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  23085106 tgactagtatgcagacagagaatgaggaccgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagtttctattattgaaactggtgctac 23085202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 293
Target Start/End: Original strand, 25756800 - 25756956
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||||  ||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  25756800 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaggagggtcatattggttcccaatgcaaacagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggc 25756899  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataa 293  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25756900 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataa 25756956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 331
Target Start/End: Original strand, 30678198 - 30678403
Alignment:
Q  126 gtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtt 225  Q
    |||||| |||||||||||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| | |       
T  30678198 gtgcaagcatgatgatatgatgtgtttcaactgtaatgaagaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcaggctagtgggaaaacg 30678297  T
Q  226 tttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 325  Q
    |||||| | |||| |||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||| || |   || ||| |||  ||||| ||||||||||||||| | |||    
T  30678298 tttgctttgactggtacacaaacagtgaatgaggatcggttgatcagaggtacatgtttctttaatagtacttctttaattgctattattgatatttgtg 30678397  T
Q  326 ctacgc 331  Q
    ||||||    
T  30678398 ctacgc 30678403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 27205837 - 27205579
Alignment:
Q  18 agagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgca 117  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||  |||  | |||| |||  | || ||||| |||||||||||||      
T  27205837 agagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgtt 27205738  T
Q  118 ctagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactg 217  Q
     ||||||  ||||| | |   || |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||    
T  27205737 gtagctgattgcaatcgttcggacattgtgtgcttcaattgcaatggagagggtcatattagttctcagtgtactcagcctaagagggcgccgactactg 27205638  T
Q  218 gtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggt 276  Q
    ||||||| |||||| | ||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27205637 gtagagtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggt 27205579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 276
Target Start/End: Original strand, 27243391 - 27243649
Alignment:
Q  18 agagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgca 117  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||| || || |||  |||  | |||| |||  | || ||||| |||||||||||||      
T  27243391 agagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgtt 27243490  T
Q  118 ctagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactg 217  Q
     ||||||  ||||| | |   || |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||    
T  27243491 gtagctgattgcaatcgttcggacattgtgtgcttcaattgcaatggagagggtcatattagttctcagtgtactcagcctaagagggcgccgactactg 27243590  T
Q  218 gtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggt 276  Q
    ||||||| |||||| | ||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  27243591 gtagagtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggt 27243649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27190398 - 27190337
Alignment:
Q  271 agaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27190398 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 27190337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 332
Target Start/End: Original strand, 27258842 - 27258903
Alignment:
Q  271 agaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27258842 agaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 27258903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 204
Target Start/End: Original strand, 25958934 - 25959005
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaag 204  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25958934 catgaagatatagtgtgtttcaactgcaatgaagaaggacacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaag 25959005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 19486379 - 19486548
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |   ||||  |||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |  |||| |  ||||| ||||    
T  19486379 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagcggaatgcaagcatg 19486478  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
     ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19486479 gtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggc 19486548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16813791 - 16813668
Alignment:
Q  82 aagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggtt 181  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||| | ||  || ||||||  ||||| | || ||||||||| || ||||||||  |||||||||||||  ||  ||    
T  16813791 aagaagtgcttccgatgtgggaagaaatggcacacaatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaattgtgatgaagaaggtcatcttactt 16813692  T
Q  182 cacagtgcaagaagcctaagaagg 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16813691 cacagtgcaagaagcctaagaagg 16813668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21474739 - 21474627
Alignment:
Q  94 cgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaaga 193  Q
    |||||||| |||||||| ||  || | |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||| |||| ||||||| ||    
T  21474739 cgatgtgggaagaaaggacacacattggctgagtgcaagcgtggtgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagttctcagtgcagga 21474640  T
Q  194 agcctaagaaggc 206  Q
    | |||||||||||    
T  21474639 aacctaagaaggc 21474627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 329
Target Start/End: Original strand, 18182650 - 18182744
Alignment:
Q  235 actgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||  ||||| |||||||| || ||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18182650 actggtacacagacagataatgaggatcatttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctac 18182744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21765026 - 21764974
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcc 71  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  21765026 gagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcc 21764974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 25770939 - 25770871
Alignment:
Q  138 tgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| | || ||||||| ||| |||||||||||    
T  25770939 tgatattgtgtgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctctcagtgcaggaaacctaagaaggc 25770871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 18325966 - 18325911
Alignment:
Q  127 tgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttc 182  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18325966 tgcaagcatgatgatgtggtgtgtttcaactgtaatgaagaaggtcacattggttc 18325911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18660007 - 18659953
Alignment:
Q  145 gtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagccta 199  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  18660007 gtgtgtttcaactgtaatgaagaaggtcacattggttctcagtgtaagaaaccta 18659953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 133 - 194
Target Start/End: Original strand, 18182569 - 18182630
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaa 194  Q
    ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  18182569 catgatgatgttgtatgctttaactgcaatgaagagggtcatattgggtcacaatgcaagaa 18182630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Original strand, 25756682 - 25756727
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatg 64  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25756682 gagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagtgcaatg 25756727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 329
Target Start/End: Original strand, 10804 - 11115
Alignment:
Q  18 agagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgca 117  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   || || || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  10804 agagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgtcctagggataccaacagatgtttccgatgtgggaagaagggtcatgca 10903  T
Q  118 ctagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactg 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10904 ctagctgagtgcaaacatgatgatattgtatgctttaactacaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccggctactg 11003  T
Q  218 gtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattga 317  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11004 gtagagtttttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagtttctattattga 11103  T
Q  318 tactggtgctac 329  Q
    |||| |||||||    
T  11104 tactagtgctac 11115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Original strand, 40446 - 40745
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  40446 tacttgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtcctggggatgttaagagatgtttttgctgtggaaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaa 40545  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||     
T  40546 catgatgatatagtatgttttaattgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggtgtcggctactggtagagtttttgctt 40645  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40646 tgactcgtacacagaaagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctattttgatagtacacctttagttgccattattgatactggtgctacgca 40745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8790 - 8476
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  8790 gagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgtcctagggataccaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtcatgctc 8691  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaag-aagcctaagaaggcgccagctactg 217  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  8690 tagctgagtgcaaacatgatgatattgtatgctttaactgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaaagcctaagaaggcgccgactactg 8591  T
Q  218 gtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattga 317  Q
    ||||||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8590 gtagagtgtttgctttgactggtacacagacagagaacgaggattgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattga 8491  T
Q  318 tactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||    
T  8490 tactggtgctacgca 8476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 30 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15279 - 14977
Alignment:
Q  30 ttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgc 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||   || || || || |||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  15279 tttttcttgtggtgagaagggccacaagggtaatgcttgtcctagggataccaatagatgtttccgatgtgggaagaagggttatgcactagctgagtgc 15180  T
Q  130 aaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttg 229  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  15179 aaacatgataatattgtatgctttaactgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgtcggctactggtagagtctttg 15080  T
Q  230 ctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15079 ctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 14980  T
Q  330 gca 332  Q
    |||    
T  14979 gca 14977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 18 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11330
Alignment:
Q  18 agagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgca 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11643 agagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcttggggatgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtcatgca 11544  T
Q  118 ctagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactg 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  11543 ctagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgttttaattgcaatgaagaggg-cacattggttcccagtgcaagaagcctaagaaggtgccggctactg 11445  T
Q  218 gtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattga 317  Q
    |||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11444 gtagagtttttgctttgactggtacatagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattga 11345  T
Q  318 tactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||    
T  11344 tactggtgctacgca 11330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14470 - 14150
Alignment:
Q  12 tcctggagagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggt 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |  |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  14470 tcctgcagagattgtctgttttacttgtggcgagaaaggccataagagtaatgcttgtcttggggatgttaagagatgttttcgctgtggaaagaagggt 14371  T
Q  112 catgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccag 211  Q
    ||| ||||||||| ||| || |||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14370 catacactagctgagtgtaagcatgttgatatagtatgttttaattgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccgg 14271  T
Q  212 ctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctat 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  14270 ctactggtagagtttttgctctgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttggtcagaggtacatgttatataaatagtacacctttagttgctat 14171  T
Q  312 tattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  14170 tattgatagtggtgctacgca 14150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 332
Target Start/End: Original strand, 2181 - 2501
Alignment:
Q  12 tcctggagagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggt 111  Q
    ||||| |||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||| || || |||||||| ||||| |||    
T  2181 tcctgtagagattgtttgtttttcttgtggtgacaagggccacaagagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgtttccgatgtgggaagaagggt 2280  T
Q  112 catgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccag 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||| |    
T  2281 catgcactagctgagtgcaaacatgatgatattgtatgctttaactacaatgaagagggtcacattggttcatagtgtaagtagcctaagaaggtgccgg 2380  T
Q  212 ctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctat 311  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2381 ctactggtagagtttttgctctgactggtacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatacacctttagttgctat 2480  T
Q  312 tattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2481 tattgatactggtgctacgca 2501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3916 - 3617
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3916 tacttatggtgtgaaagaccacaagagtaatgcttgtcctggggatgtgaagaggtgttttcgttgtggtaagaaaggtcatgcactagctgagtgcaaa 3817  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||      
T  3816 aatgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtagagtttttgcat 3717  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3716 tgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctatcattgatactggtgctacgca 3617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 18 - 332
Target Start/End: Original strand, 17273 - 17587
Alignment:
Q  18 agagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgca 117  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||| || || |||||||| ||||| |||||||||    
T  17273 agagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgtttccgatgtgggaagaagggtcatgca 17372  T
Q  118 ctagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactg 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  17373 ctagctgagtgcaaacatgatgatattgtatgctttaactgcaatgaagagggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagcaggcgccgactactg 17472  T
Q  218 gtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattga 317  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17473 gtagagtgtttgctttaactggtacacagacagaaaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatacacctttagttgctattattga 17572  T
Q  318 tactggtgctacgca 332  Q
    ||| |||||||||||    
T  17573 tacaggtgctacgca 17587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 332
Target Start/End: Original strand, 296 - 616
Alignment:
Q  12 tcctggagagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggt 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||| || || || ||||||||||| |||    
T  296 tcctgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtccttgggatgccaagagatgtttccgctgtggaaagaagggt 395  T
Q  112 catgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccag 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || || || |||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||||||||||||  || |    
T  396 catgcactagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgttttaactgcaatgaagagcgtcacattggtgcataatgcaagaagcctaagaaggtaccgg 495  T
Q  212 ctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctat 311  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  496 ctactggtagagtttttgctttgactggtacacagacatagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattgataatacacctttagttgctat 595  T
Q  312 tattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  596 tattgatactggtgctacgca 616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 5)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 55007 - 54703
Alignment:
Q  28 tgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgt 127  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  55007 tgtttttcttattgtgagaagggccacaagagtaatggttgtcctagggacgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaaaggtcatgcacgagctgagt 54908  T
Q  128 gcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttt 227  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  54907 gcaaacatgatgatattgtgtgttttaattgcaatgaagagggtcacattggttcgtagtgtaagaagcctaagaaggcgccggctactagtagagtatt 54808  T
Q  228 tgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgct 327  Q
    |||| | |||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54807 tgctttgactggttcacagaaagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatattggtgct 54708  T
Q  328 acgca 332  Q
    |||||    
T  54707 acgca 54703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32258 - 31949
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   || || || || || || || ||||| |||||  ||||||||     
T  32258 gagattgtctgttttaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgcttgtcctggagaggtaaaaagatgtttccggtgtggtaagaagagtcatgcat 32159  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  32158 tagctgattgcaaacataatgatattgtgtgtttcgatcgcaacgaagagggtcacattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactgg 32059  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32058 tagggtttttgctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgc----tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgat 31963  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||| ||||||    
T  31962 actggtgttacgca 31949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 26 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37717 - 37415
Alignment:
Q  26 tctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgt 125  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   || || || || || || || ||||| |||||  |||||||| ||||||     
T  37717 tctgttttaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgcttgtcctggagaggtaaaaagatgtttccggtgtggtaagaagagtcatgcattagctga 37618  T
Q  126 gtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtt 225  Q
     ||||||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  37617 ttgcaaacataatgatattgtgtgtttcgatcgcaacgaagagggtcacattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactggtagggtt 37518  T
Q  226 tttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 325  Q
    |||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37517 tttgctttgactggtacacagacagagaatgaggatcgc----tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtg 37422  T
Q  326 ctacgca 332  Q
     ||||||    
T  37421 ttacgca 37415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 332
Target Start/End: Original strand, 10272 - 10476
Alignment:
Q  127 tgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagttt 226  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||  |||  ||| ||||||    
T  10272 tgcaagcataatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaaga-ggtcacattggttcacaatgcacgcagcctaagagggcgcctactatgggtcgagttt 10370  T
Q  227 ttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgc 326  Q
    |||||||  ||| ||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10371 ttgctctggctggtactcagacagagaatgaggattgtttgatcagaggtacttgctatattaataacactcctttagttgctattattgatactggtgc 10470  T
Q  327 tacgca 332  Q
    ||||||    
T  10471 tacgca 10476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 127 - 332
Target Start/End: Original strand, 12927 - 13131
Alignment:
Q  127 tgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagttt 226  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||  |||  ||| ||||||    
T  12927 tgcaagcataatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaaga-ggtcacattggttcacaatgcacgcagcctaagagggcgcctactatgggtcgagttt 13025  T
Q  227 ttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgc 326  Q
    |||||||  ||| ||| ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13026 ttgctctggctggtactcagacagagaatgaggattgtttgatcagaggtacttgctatattaataaaactcctttagttgctattattgatactggtgc 13125  T
Q  327 tacgca 332  Q
    ||||||    
T  13126 tacgca 13131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 396 - 83
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  396 gagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggagatgtgaagagatggtttcgctgtggtaagaagggtcatgcac 297  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  296 tagctgagtccaaacatgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgtaagaagcctaagaaggcgcaggctactgg 197  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    |||||||||  |  | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  196 tagagttttcacattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgat 97  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  96 actggtgctacgca 83  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4813 - 4500
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  4813 gagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggagatgtgaagagatggtttcgctgtggtaagaagggtcatgcac 4714  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4713 tagctgagtccaaacatgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgtaagaagcctaagaaggcgcaggctactgg 4614  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    |||||||||  |  | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4613 tagagttttcacattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgat 4514  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  4513 actggtgctacgca 4500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2354 - 2055
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2354 tacttgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtcatggggatgttaataggtgttttcgctgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaa 2255  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||      
T  2254 catgaggatattgtgtgttttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaatgcgcagactactggtagagtttttgcat 2155  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154 tgactagtactcagaatgagaacgaggatcgcttgatcagaagtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 2055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 332
Target Start/End: Original strand, 24636 - 24950
Alignment:
Q  18 agagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgca 117  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||  ||||   ||||| || || || |||||||||||||||||||||    
T  24636 agagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaaaagtaattcttgtcctggggataccaagagatgtttccgttgtggaaagaaaggtcatgca 24735  T
Q  118 ctagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactg 217  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||     
T  24736 ctagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgctttaactgcaatgaggagcgtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccgactactt 24835  T
Q  218 gtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattga 317  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  24836 gtagagtttttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcacttgatcagaggtacttgctatattgacaatacgcctttagttgctattattga 24935  T
Q  318 tactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||    
T  24936 tactggtgctacgca 24950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19015 - 18716
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19015 tacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcccggggatgtgaagaggtgttttcgctgtggtaagaagggtcatgcactagctgagtgcaaa 18916  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||      
T  18915 catgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgctgtgtaagaagcctaagaaggcgcagactattggtagagtttttgcat 18816  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18815 tgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgatattattgatactagtgctacgca 18716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41997 - 41701
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  41997 tacttgtggtgagaaaggtcacaagagtaatgcttgtcctggggacgtgaaaagatgctttcgttgtgggaagaaaggtcatgcacttgctgagtgtaaa 41898  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||     
T  41897 catgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtagagtttttgctt 41798  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41797 tgactgctactcagactgagaatgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctac 41701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 75717 - 75421
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||  ||| || || || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  75717 tacttgtggtgagaaaggtcacaagagtaatgcttgtcctggggacgtgaaaagatgctttcgttgtgggaagaaaggtcatgcacttgctgagtgtaaa 75618  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||     
T  75617 catgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactggtagagtttttgctt 75518  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | |||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75517 tgactgctactcagactgagaatgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctac 75421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 328
Target Start/End: Original strand, 34670 - 34949
Alignment:
Q  49 ggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||     || || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34670 ggccacaagagcaatgcttctctgggagaggtaaagagatgtttccgatgtggtaagaagggccatgcactagctgagtgcaaacataatgatattgtgt 34769  T
Q  149 gcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagac 248  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| | |||| ||| ||||     
T  34770 gcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcgcagtgtaagctgcctaagaaggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggtactcagat 34869  T
Q  249 tgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 328  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34870 cgagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 34949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 110832 - 111145
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||  | ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||    
T  110832 gagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcttggggacatgaagagatgttttcgatgtggtaagaaaggtcatacac 110931  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  110932 tagctgagtgtaaacatgatgatatagtatgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactactgg 111031  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  111032 tagagtttttgctttgactgaaactcagactgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttattttaatagtacacctttagttgctattattgat 111131  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  111132 actggtgctacgca 111145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18209 - 18039
Alignment:
Q  34 acttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaac 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||  |||||| ||| |||| || || ||||| |||||||| ||| | ||  | | ||| || |    
T  18209 acttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgttctggggatgtgaagcggtgtttccgttgtggtaagaaaggacatacgcttacagagtgtaagc 18110  T
Q  134 atgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaag 204  Q
    |||||||| |||| || || || || |||||||||||||| ||||  || || |||||||| |||||||||    
T  18109 atgatgatgttgtatgttttaactgtaatgaagaaggtcatattgagtcgcaatgcaagaaacctaagaag 18039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18011 - 17947
Alignment:
Q  265 ttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||||| |||||||| || ||  |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18011 ttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 17947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1361 - 1048
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||  ||||| |||||||||||| |||    
T  1361 gagattgtttgttatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggatgtaaagagatgttttccctgtggtaagaaaggtcatacac 1262  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| ||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1261 tagctgagtgtaagcacgatgacattgtgtgctttaattgcaattaggagggtcacattggttcacagtgtaagaagcctaagaaggcgccgactactgg 1162  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1161 tagagtttttgctttgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgattagagatacatgttatattaatagtacacctttagttgctattattgat 1062  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  1061 actggtgctacgca 1048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 23870 - 24183
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||| || || || || ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  23870 gagattgtctgttatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggacgtaaaaagatgttttcgatgtggtaagaaagatcatgcac 23969  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  23970 tagctgagtgcaaacatgatgatacagaatgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcaatgcaagaagcctaagaaggcgcagactactgg 24069  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
     |||||||| ||  |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24070 gagagttttagcattaactggtactcagactgagaacaaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgat 24169  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||| ||||||||||    
T  24170 actagtgctacgca 24183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 419 - 106
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || ||||| || || || |||| ||| ||||| |||||| |||    
T  419 gagattgtttgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtccgtgagaggttaaaagatgtttccgatttggtaagaagggtcattcac 320  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  319 tagctgagtgcaaacataatgacattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcacattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactgg 220  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  219 tagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggttcatgttatattgataatactcctttagttgctattattgat 120  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  119 actggtgctacgca 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 55396 - 55708
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||||| || || || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  55396 gagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttatcctg-ggatgtaaaaagatgttttcgctatggtaagaaaggtcatgcac 55494  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||   |||||||    
T  55495 tagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgctttaactgcaatgaggaaggtcatataagttcacaatgcaagaagcttaagaaggcgcagactactgg 55594  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
     |||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55595 gagagtttttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgat 55694  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  55695 actggtgctacgca 55708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 48109 - 47926
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| || || || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  48109 gagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctg-ggatgtaaaaagatgttttcgctatggtaagaaaggtcatgcac 48011  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaa 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||    
T  48010 tagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgctttaactgcaatgaggaaggtcatataggttcacaatgtaagaagccaaagaa 47926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 32)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 15698 - 16010
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||  |||||| || || || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  15698 gagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttatcctg-ggatgtaaaaagatgttttcgctatggtaagaaaggtcatgcac 15796  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||| |||||||||||   |||||||    
T  15797 tagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgctttaactgcaatgaggaaggtcatataagttcacaatgcaagaagcttaagaaggcgcagactactgg 15896  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
     |||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15897 gagagtttttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgat 15996  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  15997 actggtgctacgca 16010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 35 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14162804 - 14162507
Alignment:
Q  35 cttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaaca 134  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||  |||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||| || ||    
T  14162804 cttgtggtgtgaaaggccacaagagtgatgcttgtcctggggatgtgaagagatgttttcgctgtggtaagaaaggtcatacacttgctgagtgtaagca 14162705  T
Q  135 tgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctcta 234  Q
    ||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||||  |     
T  14162704 tgaagatgttgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaaacagcctaagaaggcgcagactactggtagagtttttgcattg 14162605  T
Q  235 actgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || | ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14162604 acgggtacccagactgagaacgaggatcgcctgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgataccggtgctacgca 14162507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16219524 - 16219228
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| | || ||| |||    
T  16219524 tacttgtggcgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctggggatgtgaaacggtgctttcgttgtggtaagaagggacatacacttgttgagtgtaaa 16219425  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||||||||     
T  16219424 catgatgatgttgtgtgctttaattgcaatgaagaaggtcatattggttcgcaatgcaagaagcctgagaaagcgccgactactgggagagtttttgctt 16219325  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | |||| |||  |||| || || |||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16219324 tgactggtacttagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctac 16219228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16222844 - 16222548
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||| ||||| ||||| || ||| |||| | || ||| |||    
T  16222844 tacttgtggcgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctggggatgtgaaacggtgctttcgttgtggtaagaagggacatacacttgttgagtgtaaa 16222745  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||||||||     
T  16222744 catgatgatgttgtgtgctttaattgcaatgaagaaggtcatattggttcgcaatgcaagaagcctgagaaagcgccgactactgggagagtttttgctt 16222645  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | |||| |||  |||| || || |||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16222644 tgactggtacttagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctac 16222548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 49 - 328
Target Start/End: Original strand, 15144584 - 15144863
Alignment:
Q  49 ggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgt 148  Q
    ||||||||||||||||||| ||     || || ||||| || || |||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15144584 ggccacaagagcaatgcttctctgggagaggtaaagagatgtttccgatgtggtaagaagggccatgcactagctgagtgcaaacataatgatattgtgt 15144683  T
Q  149 gcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagac 248  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||| | |||| ||| ||||     
T  15144684 gcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcgcagtgtaagctgcctaagaaggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggtactcagat 15144783  T
Q  249 tgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 328  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144784 cgagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 15144863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 332
Target Start/End: Original strand, 8050284 - 8050598
Alignment:
Q  18 agagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgca 117  Q
    |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |  || |||  |||  | |||| |||  |||| ||||| |||||||||||||      
T  8050284 agagattgtgtgtttcaattgtggtgagaagggccacaagagcaacgtctgccctgaggaaatcaagaagtgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatgtt 8050383  T
Q  118 ctagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactg 217  Q
     ||||||  ||||| | |   || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||    
T  8050384 gtagctgattgcaatcgtacagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactg 8050483  T
Q  218 gtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattga 317  Q
    ||||||| |||||| | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8050484 gtagagtctttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattga 8050583  T
Q  318 tactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||    
T  8050584 tactggtgctacgca 8050598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 137 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 13513582 - 13513390
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| || |||  |||||||| |||||||||||||  |    
T  13513582 atgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagagggtgcctactactggtcgagtttttgctctggc 13513483  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13513482 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 13513390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19635363 - 19635173
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  19635363 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagaaggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggta 19635264  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19635263 ctcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 19635173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23959080 - 23958784
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || |||  |||  | |||| |||  | || ||||| |||||||||||||   ||||||  ||||| | |    
T  23959080 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgt 23958981  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
       |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |    
T  23958980 acagatattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttga 23958881  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||  || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958880 ctgggactcagacagagaatgacgatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 23958784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8389745 - 8389449
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||  |||  | |||| |||  | || ||||| ||||| |||||||   ||||||  ||||| | |    
T  8389745 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaaccgt 8389646  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
       || ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |    
T  8389645 acagacattgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtacccagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttga 8389546  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8389545 ctgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 8389449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Original strand, 19775472 - 19775768
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || |||  |||  | |||| |||  | || ||||| |||||||||||||   ||||||  ||||| | |    
T  19775472 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgt 19775571  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
       || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||| | |    
T  19775572 acagacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttga 19775671  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||  || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775672 ctgggactcagacagagaatgacgatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 19775768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27714669 - 27714373
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || |||  |||  | |||| |||  | || ||||| |||||||||||||   ||||||  ||||| | |    
T  27714669 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcctgccctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatgttgtagctgattgcaatcgt 27714570  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
       || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   || |||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |    
T  27714569 acggacattgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagtctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttga 27714470  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27714469 ctgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 27714373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 14300764 - 14300954
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |   ||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||| | |||| ||    
T  14300764 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcatagtgtactcagcctaagagggcgccgactacaggtagagtctttgctttgactggta 14300863  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14300864 ctcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 14300954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 17091934 - 17092124
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  17091934 attgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 17092033  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092034 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 17092124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12479827 - 12479637
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  12479827 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 12479728  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12479727 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 12479637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40476267 - 40476077
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |    |||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |||| ||    
T  40476267 attgtgtgttttaactgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcggcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggta 40476168  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40476167 cgcagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 40476077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 140 - 329
Target Start/End: Original strand, 18224229 - 18224418
Alignment:
Q  140 atattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactga 239  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  | |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |||     
T  18224229 atattgtatgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcctaatgcaagcagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggctgg 18224328  T
Q  240 tacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18224329 tacttagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggatcttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 18224418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8386 - 8203
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| || || || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  8386 gagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctg-ggatgtaaaaagatgttttcgctatggtaagaaaggtcatgcac 8288  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaa 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||    
T  8287 tagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgctttaactgcaatgaggaaggtcatataggttcacaatgtaagaagccaaagaa 8203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 16233777 - 16233967
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  16233777 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 16233876  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16233877 ctcagacagagagtgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 16233967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14683794 - 14683607
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || || ||| ||||| |||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | |||| ||    
T  14683794 attgtgtgttttaactgcaatgaagagggacatattagttcatagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactggta 14683695  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | |||||  || | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14683694 ctcagacaaaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 14683607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Original strand, 16250630 - 16250825
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||| || | |||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  16250630 atgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatataggttcccaatgcaagcagtcgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggc 16250729  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16250730 tggtactcagacagagaatgacgattgtttgataagaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactaatgctacgca 16250825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Original strand, 18604599 - 18604794
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||||  ||| |||| || |||  ||||  || |||||||||||||  |    
T  18604599 atgatattgtgtgcttcaattgtaacgaggagggtcatattggttcccaatgcaagcggccgaagagggagcctactacaagtcgagtttttgctctggc 18604698  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||  ||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18604699 tggtactcagagagagaatgaggatcatttgattagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 18604794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 218 - 328
Target Start/End: Original strand, 16350415 - 16350525
Alignment:
Q  218 gtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattga 317  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16350415 gtagagtttttgctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattga 16350514  T
Q  318 tactggtgcta 328  Q
    |||| ||||||    
T  16350515 tactagtgcta 16350525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14697324 - 14697141
Alignment:
Q  146 tgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacaca 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |   ||| ||||||||| |||||| | |||| ||| ||    
T  14697324 tgtgtttcaattgcaatgaagaaggtcatattgggtcacaatgcaagaaacctaagaagactcagactagtggtagagtgtttgctttgactggtacgca 14697225  T
Q  246 gactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
     || ||||| |||||||| ||||| | |||||| || ||  |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14697224 aacagagaatgaggatcgtttgattataggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 14697141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 8709009 - 8708840
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |   ||||  |||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |  |||| |  ||||| | ||    
T  8709009 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgaaaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagcggaatgcaagcgtg 8708910  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
     ||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||  || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8708909 gtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggccatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggc 8708840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13879396 - 13879274
Alignment:
Q  82 aagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggtt 181  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||| | || | ||||||| |||||||||||  | |||||||||||  |  |||    
T  13879396 aagaagtgcttccgatgtggaaagaagggccatacgatagctgaatgcaagcgtggtcatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatctcagtt 13879297  T
Q  182 cacagtgcaagaagcctaagaag 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  13879296 cacagtgtaagaagcctaagaag 13879274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 3261965 - 3262026
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3261965 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 3262026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7357368 - 7357307
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7357368 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 7357307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 11204403 - 11204464
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11204403 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 11204464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15073460 - 15073399
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15073460 atcagaggtacttgtttctttaataatactcctttaattgctattatagatactggtgctac 15073399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 29450708 - 29450769
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29450708 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 29450769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 13513707 - 13513647
Alignment:
Q  12 tcctggagagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcct 72  Q
    ||||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  13513707 tcctgcagagattgtctgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcct 13513647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 277 - 1
Alignment:
Q  12 tcctggagagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggt 111  Q
    ||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  277 tcctgcagagattgtttgtttttcttgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgtcctggggatgtcaagagatgttttcgctgtggaaagaagggt 178  T
Q  112 catgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccag 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||      
T  177 catgcactagctgagtgcaaacatgatgatatagtatgcttcaattgtaatgaagatggtcacattggttcccagtgcaagaagcctaagaagacgccga 78  T
Q  212 ctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatatt 288  Q
    ||||||||| ||| |||||| | |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77 ctactggtatagtatttgctttgactagtacacagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 21983 - 21670
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||  | ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21983 gagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagatcaatgcttgtcctcgagagataaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcac 21884  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  21883 tagctgattgcaaccataatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttcttagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactgg 21784  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    |||| |||||||| | |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21783 tagactttttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgat 21684  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    |  |||||||||||    
T  21683 atcggtgctacgca 21670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37407 - 37094
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||  | ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  37407 gagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagatcaatgcttgtcctcgagagataaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcac 37308  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  37307 tagctgattgcaaccataatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttcttagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactgg 37208  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    |||| |||||||| | |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  37207 tagactttttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattaataatactcccttagttgctattattgat 37108  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    |  |||||||||||    
T  37107 atcggtgctacgca 37094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 30499 - 30812
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || ||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  30499 gagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtccaggagaggtaaagagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcac 30598  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||  ||||| |    
T  30599 tagctgattgcaaacataatgaccttgtgtgcttcaattgcaatgaagagggttacattggttctcagtgcaagcaatctaagaaggcgccgactactag 30698  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30699 tagagttttcgctttgactggtactcagactgagaatgaggatcgcttgatcagaggagcatgttatattgataatactcctttagttgctattattgat 30798  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  30799 actggtgctacgca 30812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 208
Target Start/End: Original strand, 43392 - 43567
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43392 tacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggagatgtgaagtggtgttttcattgtggtaagaaaggtcatgcactagctgagtgcaaa 43491  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgc 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  43492 catgatgatattgtgtgctttaattgcaatgagaaaggtcacattggttcacagtgcaagaatcctatgaaggcgc 43567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 329
Target Start/End: Original strand, 47101 - 47218
Alignment:
Q  212 ctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctat 311  Q
    |||||||||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| ||||    
T  47101 ctactggtagagtttttgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcgctttatcagaggtacttgttattttaatagtacacctttagttactat 47200  T
Q  312 tattgatactggtgctac 329  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  47201 tattgattctggtgctac 47218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 11164 - 10852
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| || || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  11164 gagattgtctgttatacttatggtgagaaatgccacaagagtaatgcttgtcctg-ggatgtgaaaagatgttttcgctgtggtaagaagggtcatgcac 11066  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||   ||||| |    
T  11065 tagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgtaagaagcctaagaaggtgcatactactag 10966  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||  ||  | |||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10965 tagagtttccgcattgactggtactcagatagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtacacctttagttgctattattgat 10866  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    | ||||||||||||    
T  10865 attggtgctacgca 10852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14043020 - 14042721
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||  | || || || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||    
T  14043020 tacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcatagggacatgaaaagatgatttagatgtggaaagaaaggacatacactagctgagtgtaaa 14042921  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||      
T  14042920 catgatgatatagtatgattaaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcacaaactactgggagagtttttgcat 14042821  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| ||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14042820 tgactggtactcagaccgagagtgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgca 14042721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14353050 - 14352751
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||  | || || || ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||    
T  14353050 tacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcatagggacatgaaaagatgatttagatgtggaaagaaaggacatacactagctgagtgtaaa 14352951  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||      
T  14352950 catgatgatatagtatgattaaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcacaaactactgggagagtttttgcat 14352851  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| ||| ||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14352850 tgactggtactcagaccgagagtgaggatcacttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgttattattgatactggtgctacgca 14352751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 332
Target Start/End: Original strand, 15145866 - 15146167
Alignment:
Q  31 tttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgca 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||   ||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| |||| ||||||| | ||| |    
T  15145866 tttacttgtggtgagaaaggccacaggagtaatgcttgtcctggagatgtgaagaggtgttttcactgtggtaagaaagttcatacactagccgagtgta 15145965  T
Q  131 aacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgc 230  Q
    | |||||  | |||||||| || || ||| | || ||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||   ||||| |||||||||||||    
T  15145966 agcatgaaaaaattgtgtgttttaactgcgaggaggaaggtcacattggttcgcaatgcaaatagcctaagaaggtgcggactactagtagagtttttgc 15146065  T
Q  231 tctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacg 330  Q
    | | |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15146066 tttgactggtactcagactgagaatgaggatcgcttgagcagaggtacatgttatattaatagaacacctttagttgctattattgatactggtgctacg 15146165  T
Q  331 ca 332  Q
    ||    
T  15146166 ca 15146167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 15158111 - 15158301
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  15158111 attgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggta 15158210  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15158211 ctcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 15158301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9591585 - 9591393
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| |||| || |||  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  9591585 atgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagccgaagagggagcctactacaggtcgagtttttgctctggc 9591486  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9591485 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 9591393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13689257 - 13689067
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||| | | | ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  13689257 attgtgtgctttaattgcaacggatagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggta 13689158  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13689157 ctcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 13689067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 11234267 - 11234457
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  11234267 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggta 11234366  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11234367 ctcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattaatactggtgctacgca 11234457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18180959 - 18180769
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  18180959 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 18180860  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18180859 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgca 18180769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 137 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11984213 - 11984032
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||| ||||||||| |||  |    
T  11984213 atgatattgtgtgcttcaatttcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttggtctggc 11984114  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    || ||| ||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11984113 tggtactcagatagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgat 11984032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 8710945 - 8710631
Alignment:
Q  18 agagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgca 117  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||  |||  | |||| |||  | || ||||| |||||||||||||      
T  8710945 agagattgtgtgtttcaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaacgcctgtcctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaaaggtcatgtt 8710846  T
Q  118 ctagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactg 217  Q
     ||||||  ||||| | |   || ||||| ||||| |||||||| | | | ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||    
T  8710845 gtagctgattgcaatcgtacagacattgtttgctttaattgcaacggaaagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactg 8710746  T
Q  218 gtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattga 317  Q
    |||| || |||||| | ||||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8710745 gtagggtctttgctttgactgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattga 8710646  T
Q  318 tactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||    
T  8710645 tactggtgctacgca 8710631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14335612 - 14335422
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  14335612 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 14335513  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14335512 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 14335422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 44788405 - 44788595
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  44788405 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtacttagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 44788504  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44788505 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 44788595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 137 - 329
Target Start/End: Original strand, 16726490 - 16726682
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| |||| | ||||  |||  ||| ||||||||||| |  |    
T  16726490 atgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcccaatgcaagcagccgaagaggtcgcctactatgggtcgagtttttgctttggc 16726589  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16726590 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgatatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctac 16726682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 137 - 329
Target Start/End: Original strand, 17703504 - 17703696
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| |||| | ||||  |||  ||| ||||||||||| |  |    
T  17703504 atgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcccaatgcaagcagccgaagaggtcgcctactatgggtcgagtttttgctttggc 17703603  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17703604 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactagtgctac 17703696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 18587225 - 18587415
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||| |||| || |||||| | ||||  |    
T  18587225 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactagtagggtctttgctttgactggga 18587324  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18587325 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgttattattgatactggtgctacgca 18587415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 194 - 329
Target Start/End: Original strand, 11550208 - 11550343
Alignment:
Q  194 agcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataa 293  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11550208 agcctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactggtactcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataa 11550307  T
Q  294 tacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11550308 tactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11550343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 157 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12690702 - 12690531
Alignment:
Q  157 tgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacg 256  Q
    ||||||||||| || || ||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | |||| ||| ||||| ||| | |    
T  12690702 tgcaatgaagagggacatattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactggtactcagacagaggatg 12690603  T
Q  257 aggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  12690602 aggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattatt-atactagtgctac 12690531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 14957652 - 14957583
Alignment:
Q  260 atcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14957652 atcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 14957583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 127 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15627755 - 15627550
Alignment:
Q  127 tgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagttt 226  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | | ||| ||| | ||| |    
T  15627755 tgcaagcatgatgatgtggtgtgtttcaactgcaatgaagagggtcatattggttcgcagtgaaagtagcctaagaaggctcaaactagtgggaaagtgt 15627656  T
Q  227 ttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgc 326  Q
    ||||| | |||| ||| || || | ||| ||||| || ||||| | |||||| ||||   |||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||     
T  15627655 ttgctttgactggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgattataggtacatgcttctttgatagtactcctttaattactattattgatactggtga 15627556  T
Q  327 tacgca 332  Q
    ||||||    
T  15627555 tacgca 15627550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Original strand, 12203727 - 12203896
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |   ||||  || | ||||||  ||||||| |||||||| ||| |  ||||||  ||||| | ||    
T  12203727 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgtaatggtgatgagaaaaagtgcttctgatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtg 12203826  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  || | || || |||| |||||||||||||||    
T  12203827 atgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaagcctaagaaggc 12203896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15114397 - 15114354
Alignment:
Q  163 gaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15114397 gaagaaggtcatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggc 15114354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 13965826 - 13965887
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13965826 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 13965887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 26091956 - 26092017
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26091956 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 26092017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 40924975 - 40925036
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40924975 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 40925036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 49155392 - 49155331
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49155392 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 49155331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 9591710 - 9591650
Alignment:
Q  12 tcctggagagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcct 72  Q
    ||||| |||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9591710 tcctgcagagattgtctgtttcaactgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcct 9591650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 329
Target Start/End: Original strand, 36745 - 37055
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||  |  |||| || || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  36745 gagattgtctgttttaattgtggcgagaaaggccataagagcaatgcttgtcctagagagatacagagatgtttccgatgtggtaagaagggtcatgcac 36844  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    | || |  ||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  36845 tggccgattgcaaccgtaatgacattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttcttagtgcaagcaacctaagaaggcgccgactactgg 36944  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||||||| | |||  ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  36945 tagagtttttgctttgactagtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgatcatactcctttagttgctattattgat 37044  T
Q  319 actggtgctac 329  Q
    |||||||||||    
T  37045 actggtgctac 37055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26617 - 26418
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| ||||||||||||  | | ||| ||||| ||||||     
T  26617 catgatgaagttgtgtgttttaattgcaatgaagaaggtcatattggctcgctgtgcaagaagcataagaaggcgccgacgagtgggagagtgtttgctt 26518  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  || ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26517 ttactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtaaatgttattttgatagtactcttttagttgctattattgatattggtgctacgca 26418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 26717 - 26681
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgt 69  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26717 tacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgt 26681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 25 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15066034 - 15065727
Alignment:
Q  25 gtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctg 124  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    || || || || || || || ||||| ||||| ||||||||| || |||    
T  15066034 gtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagaggtaaaaagatgtttccggtgtggtaagaagggtcatgcattaactg 15065935  T
Q  125 tgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagt 224  Q
      ||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| ||    
T  15065934 attgcaagcataatgatattgtgttcttcaattgcaaagaagagggtcatattggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactacaggtagggt 15065835  T
Q  225 ttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggt 324  Q
    ||||||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  15065834 ttttgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcaaaggtacttgctatattaataatactcatttagttgctattattgatactggt 15065735  T
Q  325 gctacgca 332  Q
    ||||||||    
T  15065734 gctacgca 15065727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 12843264 - 12843577
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||  |||| || || ||||| |||||||| ||| |||    
T  12843264 gagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggagatgtgaaacggtgtttccgttgtggtaagaaagggcatacac 12843363  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    | |||| ||| ||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  12843364 ttgctgagtgtaaagatgatgatgttgtgttctttaattgcaatgaagaaggtcatattggttcgcaatgcaagaatcctaagaagtcgcaaactactgg 12843463  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
     |||||||| ||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12843464 gagagttttagctttgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttattttgatagtatacctttagttgctattattgat 12843563  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  12843564 actggtgctacgca 12843577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15262599 - 15262289
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||| || || ||||| |||||||| ||| |||    
T  15262599 gagattgtctgctatacttgtggtgagaaaggctataagagtaatgcttgtcctggggatgtgaaacggtgtttccgttgtggtaagaaagggcatacac 15262500  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    | |||| ||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  15262499 ttgctgagtgtaagcatgatgatgttgtgtgtttcaattgcaatgaggaaggacatattgggtcgcaatgcaagaagcctaaaaaggcgcagactactgg 15262400  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
     |||||||||||| | |||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15262399 gagagtttttgctttgactggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgat 15262300  T
Q  319 actggtgctac 329  Q
    |||||||||||    
T  15262299 actggtgctac 15262289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 326
Target Start/End: Original strand, 23079187 - 23079485
Alignment:
Q  28 tgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgt 127  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||| || ||||| || ||||| | ||| ||||| | |||||||||||||| ||    
T  23079187 tgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccgggggaggtaaagagatgttttcgctatggtaagaaggttcatgcactagctgagt 23079286  T
Q  128 gcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttt 227  Q
    | || ||| | || |||||||| || | ||  || ||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23079287 gtaagcataaggacattgtgtgttttagttctaaagaacaaggtcatattggttcacagtgtacaaagcctaagaaggcgccgactactggtagagtttt 23079386  T
Q  228 tgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgc 326  Q
     ||| | |||| ||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23079387 cgctttgactggtactcagaccgaaaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatacttgtgc 23079485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 35 - 329
Target Start/End: Original strand, 14578598 - 14578879
Alignment:
Q  35 cttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaaca 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||| |||| |||| ||| |||||    
T  14578598 cttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggatgtgaagaggtgtttccgttgtggtaagaaaggtcatacacttgctgagtgtaaaca 14578697  T
Q  135 tgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctcta 234  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||             || ||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||| |     
T  14578698 tgatgatatagtatgcttcaattgcaatgaggatgg-------------caatgcaagaagccgaagaaggcgcagactactggtagagtttttgctttg 14578784  T
Q  235 actgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  14578785 actggtactcagactgagaatgaggatcatttgatcagagctacatgttttattgataatacacctttagttactattattgatcctagtgctac 14578879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 33 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19727715 - 19727428
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||  |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |||| || |  || ||     
T  19727715 tacttgtggtgagaaaggccataagagtaacgcttgtcctggggatgtaaagaggtgttttcgttgtggtaagaagggacatacacttgccgaatgtaag 19727616  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||     
T  19727615 catgatgatgttgtatgtttcaattgcaatgaggaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagcctaagaaggcacagactactggaagagtttttgctt 19727516  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatac 320  Q
    | |||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19727515 tgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctatagttgctattattcatac 19727428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 15713340 - 15713530
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  15713340 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtacttagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggta 15713439  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15713440 ctcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 15713530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 143 - 332
Target Start/End: Original strand, 26790698 - 26790887
Alignment:
Q  143 ttgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatac 242  Q
    |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |||| |||    
T  26790698 ttgtgtgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagacggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggtac 26790797  T
Q  243 acagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26790798 tcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 26790887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Original strand, 16804125 - 16804421
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||   ||  | ||||  ||  | || ||||| ||||||||||||    ||||||  ||||| |      
T  16804125 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaagagatcaagaaatgtgtccggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgattgcaagcga 16804224  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
     |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||||||      
T  16804225 aatgatattgtgtgcttcaattttaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagaagtcgcctactacgggtcgagtttttgctctgg 16804324  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
     || ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16804325 atggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagatgtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 16804421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 15345529 - 15345719
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  15345529 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 15345628  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15345629 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 15345719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16638619 - 16638429
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | ||||  |    
T  16638619 attgtgtgctttaattgcaacggagaaggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggga 16638520  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16638519 ctcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 16638429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12889555 - 12889365
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  12889555 attgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 12889456  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12889455 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 12889365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 43165521 - 43165331
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  43165521 attgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 43165422  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43165421 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 43165331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48428293 - 48428103
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  48428293 attgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 48428194  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48428193 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 48428103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13255642 - 13255346
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||  |||  | |||| |||  | || ||||| ||||| |||||||   ||||||  ||||| | |    
T  13255642 ttgtggtgagaaaggccacaagagcaacgcttgttctgaggaaatcaagaagtgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgtggtagctgattgcaaccgt 13255543  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
       || ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||| |||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | |    
T  13255542 acagacattgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcatagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttga 13255443  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||  || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13255442 ctgggactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 13255346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 144 - 332
Target Start/End: Original strand, 53382304 - 53382492
Alignment:
Q  144 tgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgataca 243  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  ||     
T  53382304 tgtgtgctttaattgcaatgcagagggtcacattagttctcagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactgggact 53382403  T
Q  244 cagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53382404 cagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 53382492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3688789 - 3688599
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| || |||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  3688789 attgtgtgctttaactgcaatggagaaggtcacattagttctcagtgtactcagcctaagagggtgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 3688690  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3688689 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 3688599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10008446 - 10008256
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  10008446 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 10008347  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10008346 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 10008256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15358929 - 15358739
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |||| ||    
T  15358929 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcatagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggta 15358830  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15358829 cgcagacggagaacgaggatcatttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 15358739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 15586676 - 15586866
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  15586676 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 15586775  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15586776 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 15586866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 20059338 - 20059528
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  20059338 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 20059437  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20059438 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 20059528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24186036 - 24185849
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||||||| || || ||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | |||| ||    
T  24186036 attgtgtgttttaactgcaatgaagagggacatattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgactggta 24185937  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24185936 ctcagacagaggatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 24185849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10909056 - 10908866
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  10909056 attgtttgctttaattgcaacggagagggtcacattagttcccagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 10908957  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908956 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 10908866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 16753985 - 16754175
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| || || |   ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||| | ||||  |    
T  16753985 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttctcaatgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 16754084  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754085 ctcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 16754175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6603581 - 6603394
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | || ||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||| | ||||  |    
T  6603581 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagctctcagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 6603482  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | |||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6603481 cccagacaaagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 6603394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16695015 - 16694820
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| |||| ||||||  |||| ||| |||||||  ||||  |    
T  16695015 atgacattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagccgaagagggcgcctactacaggtcgagttttaactctggc 16694916  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16694915 tggtactcatacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcccttagttgttattattgatactggtgctacgca 16694820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 5422214 - 5422404
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||| | ||||  |    
T  5422214 attgtgtgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcatagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggttttcgctttgactggga 5422313  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5422314 ctcagacagagagtgacgatcgtttgatcaaaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 5422404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Original strand, 15399802 - 15399991
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| |||||||| | ||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |||| ||    
T  15399802 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacatag-ttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggta 15399900  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15399901 cgtagacggagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttggttgctattattgatactggtgctacgca 15399991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11861322 - 11861032
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||| || ||||  || ||  | ||||| ||||| |||||| |      
T  11861322 gagattgtctatttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttctggtgtggtaagaagggtcatactt 11861223  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  11861222 tagctgattgcaagcatagtgatattgtgtgcttcaattccaaggaagagggtcatattggttctcagtgcaagcagcctaagagggcgccgactactgg 11861123  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||                     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11861122 ta---------------------cacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgat 11861044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 175 - 326
Target Start/End: Original strand, 14873885 - 14874036
Alignment:
Q  175 attggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagag 274  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  14873885 attggttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactattggtagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatcgcttgatcatag 14873984  T
Q  275 gtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgc 326  Q
    |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14873985 gtacatgttatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgc 14874036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12501894 - 12501712
Alignment:
Q  27 ctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtg 126  Q
    |||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| || ||||  || || || ||||| ||||| |||||  || ||||||      
T  12501894 ctgtttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaggaggtaaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgat 12501795  T
Q  127 tgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgcc 209  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | |||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||    
T  12501794 tgcaagcatggtgatattgtgtgtttcaattgcaaggaagagggaaatattggttctcagtgcaagcagccgaagagggcgcc 12501712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Original strand, 23415069 - 23415165
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctct 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| || |||  |||| ||| |||||||||||||    
T  23415069 atgatattgtgtgcttcaattgcaacgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagagggtgcctactacgggtcgagtttttgctct 23415165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 17497667 - 17497564
Alignment:
Q  12 tcctggagagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggt 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||||| || ||||  ||||||||||| |||    
T  17497667 tcctgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggataccaagagatgttttcactgtggaaagaagggt 17497568  T
Q  112 catg 115  Q
    ||||    
T  17497567 catg 17497564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Original strand, 2037080 - 2037248
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |   || |  |||| |||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||  ||||| | ||    
T  2037080 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtg 2037179  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaagg 205  Q
     ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2037180 gtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaaggtcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 2037248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Original strand, 2040821 - 2040989
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |   || |  |||| |||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||  ||||| | ||    
T  2040821 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtg 2040920  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaagg 205  Q
     ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  2040921 gtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaaggtcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 2040989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14039707 - 14039539
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |   || |  |||| |||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||  ||||| | ||    
T  14039707 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacaatagctgaatgcaagcgtg 14039608  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaagg 205  Q
     ||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14039607 gtgatattgtttgtttcaattgtgatgaggaaggtcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaagaagg 14039539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 206
Target Start/End: Original strand, 13028620 - 13028693
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13028620 catgaggatattgtgtgtttcaactgcaaagaggaaggacatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggc 13028693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 72
Target Start/End: Original strand, 14873746 - 14873799
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcct 72  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14873746 gagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccataagagcaatgcttgtcct 14873799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19040070 - 19039999
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaag 204  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  19040070 catgaagatgttgtgtgtttcaattgcaatgaagagggtcatattggttctcaatgcgagaaacctaagaag 19039999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 206
Target Start/End: Original strand, 2247145 - 2247191
Alignment:
Q  160 aatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2247145 aatgaagaaggtcatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggc 2247191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 206
Target Start/End: Original strand, 12857721 - 12857833
Alignment:
Q  94 cgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaaga 193  Q
    ||||||||||||||||| ||   | |||||| |||||| | |  ||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||| | ||  |||||| ||    
T  12857721 cgatgtggaaagaaaggacacataatagctgagtgcaagcgtcgtgatattgtttgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctcgtagtgcagga 12857820  T
Q  194 agcctaagaaggc 206  Q
    |||||||||||||    
T  12857821 agcctaagaaggc 12857833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 206
Target Start/End: Original strand, 15008799 - 15008918
Alignment:
Q  87 gtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacag 186  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||| | || ||||||||| || ||||| ||  |||||||||| ||  || |||| |||    
T  15008799 gtgcttccgatgtggaaagaaggggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgtttcaaatgtgatgaagaaggccatcttagttcgcag 15008898  T
Q  187 tgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  15008899 tgcaagaatcctaagaaggc 15008918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17738750 - 17738679
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaag 204  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |||||||||    
T  17738750 catgaagatgttgtgtgtttcaattgcaatgaagagggtcatattggatcgcaatgcgagaaacctaagaag 17738679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15230506 - 15230396
Alignment:
Q  95 gatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaa 194  Q
    ||||||| |||||||| ||| |  ||||||  ||||| | || ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  || | || || |||| |||    
T  15230506 gatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaa 15230407  T
Q  195 gcctaagaagg 205  Q
    |||||||||||    
T  15230406 gcctaagaagg 15230396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15236374 - 15236264
Alignment:
Q  95 gatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaa 194  Q
    ||||||| |||||||| ||| |  ||||||  ||||| | || ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||  || | || || |||| |||    
T  15236374 gatgtgggaagaaagggcatacgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttgcttcaattgtgatgaagaaggtcatcttagctcgcaatgcaggaa 15236275  T
Q  195 gcctaagaagg 205  Q
    |||||||||||    
T  15236274 gcctaagaagg 15236264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 10408698 - 10408637
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10408698 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 10408637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 12509882 - 12509943
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12509882 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 12509943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28757049 - 28756988
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28757049 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 28756988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 47126674 - 47126613
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47126674 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 47126613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 26 - 332
Target Start/End: Original strand, 15511 - 15817
Alignment:
Q  26 tctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgt 125  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||   ||| |  |||| ||| || || ||||| ||||| |||||| || ||||||     
T  15511 tctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatttttgtccagaggaggcaaagaagtgtttccggtgtggcaagaagggtcatacattagctga 15610  T
Q  126 gtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtt 225  Q
     ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15611 ttgcaagcacaatgacattgtgtgcttcaattgcaatgatgagggtcatatcggttctcagtgcaagcagcctaagagggcgccaactactggtagagtt 15710  T
Q  226 tttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 325  Q
    |||||| |  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15711 tttgctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgcaattattgatactggtg 15810  T
Q  326 ctacgca 332  Q
    |||||||    
T  15811 ctacgca 15817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 10083 - 10396
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    ||| || ||||  || || || ||||| ||||| |||||| ||     
T  10083 gagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtctagaggaggtaaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcatacat 10182  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  || || |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  10183 tagctgattgtaagcatagtgatattgtgtgcttcaattgcaaggaagagggtcacattggttctcagtgcaagcagcctaagagggcgccgactactgg 10282  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||||||| |  ||   |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10283 tagagtttttgctttggctaggacacagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgat 10382  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    |||||||| |||||    
T  10383 actggtgccacgca 10396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 329
Target Start/End: Original strand, 57553 - 57849
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||| ||||| |||||||| |||  ||| |||| ||| ||     
T  57553 tacttgtggcgagaaaggccataagagtaatgcttgtccttgggatgtgaaacggtgctttcgttgtggtaagaaagggcatagacttgctgagtgtaag 57652  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||     
T  57653 catgatgacgttgtgtgtttcaattgtaatgaagaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagcctaagaaggcgcagactactaggagagtttttgctt 57752  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | |||| ||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57753 tgactggtacgcagacagagaatgaggctcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctac 57849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 104591 - 104293
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |   || || || || |||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||| ||| |||    
T  104591 tacttgtggtgagaaaggccacaagagtaat-cttgtcttggagacgtgaaaagatgctttcgttgtggaaagaaagggcatacacttgctgagtgtaaa 104493  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| ||||||||     
T  104492 catgatgatattgcgtgtttcaattgcaatgaggaaggtcacattgagtcgcaatgcaagaagcctaagaaggcgcagactattgggagattttttgctt 104393  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  104392 tgactggtactcagactgggaacgaggatcgtttgattagaggtacatgttattttgatagtacacctttagtttctattattgataatggtgctacgca 104293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 303 - 1
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     || || ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  303 gagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtctgggagaggtaaagagatgttttcgctgtggtaagaagggtcatgcac 204  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| ||| || ||| | || ||||||||  | || ||| | || |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||    
T  203 tagctgagtgtaagcataaagacattgtgtgtcttaactgcgaagaggaaggtcatattagttcacagtgtacgaagcctaagaaggtgccgactactgg 104  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  103 tagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgat 4  T
Q  319 act 321  Q
    |||    
T  3 act 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3905 - 3636
Alignment:
Q  35 cttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaaca 134  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    ||||| || || || ||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||| ||| |||||    
T  3905 cttgtggtgagaaaggccacaaaagtaatgcttgtcccggagatgtgaaaagatgttttcgttgtgggaagaagggacatacacttgctgagtgtaaaca 3806  T
Q  135 tgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctcta 234  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||  |     
T  3805 tgatgatattgtattctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcgcagactacttgtagagtttttgcattg 3706  T
Q  235 actgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttag 304  Q
    |||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3705 actggtattcagactgagaactaggatcgcttgatcagaggtacttgttattttgataatacacctttag 3636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 50270 - 50583
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    || |  ||||| || ||||| ||||| ||||| || ||  |||    
T  50270 gagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaaaagcaatgcttgtccgggagagggaaagagatgttttcgctgtgggaagaagggacacacac 50369  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| ||| || | | |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||  |||||||    
T  50370 tagctgagtgtaagcgtaatgacattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcacaatgtacgaagcctaaaaaggcgccgactactgg 50469  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
     |||||||||||  | |||| ||| ||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50470 aagagtttttgcgttgactggtactcagatcgagaatgaggatcgcctgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattattgat 50569  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  50570 actggtgctacgca 50583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36877 - 36564
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   ||| || ||||  || || || ||||| ||||| |||||| |      
T  36877 gagatcgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcatacgt 36778  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||| | |  ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| ||  ||||| ||||||  |||||||    
T  36777 tagctgattgcaagcgtagtgatattgtgtgctttaattgcaaggaagagggtcatattggttctcaatgcaagcagtttaagagggcgccgactactgg 36678  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    ||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36677 tagagtttttgctttggctggtacacagaccgagaatgaggatcacttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgat 36578  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  36577 actggtgctacgca 36564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30666 - 30371
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    || || ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||| |||    
T  30666 gagattgtctgctttaattgtggtgagaaagaccacaagagcaatgcttgtccgggagaggtaaagagatgttttcgctgtggtaagaagggtcatacac 30567  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    |||||| ||| || ||| | || |||||||| || || ||| | || |||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||    
T  30566 tagctgagtgtaagcataaggacattgtgtgttttaactgcgaagaggaaggtcatattggttcacagtgtacggagcctaagaaggcgccgactactgg 30467  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattat 314  Q
    ||||||||| ||| | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30466 tagagttttcgctttgactggtactcagaccgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacatgttatattgataatactcctttagttgctattat 30371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7238 - 6939
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||   ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||| ||| ||     
T  7238 tacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctagggacgtgaaacagtgctttcgttgtggtaagaaagggcatacacttgctgagtgtaag 7139  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||     
T  7138 catgatgatgttgtgtgtttcaattgcaatgaggaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagcctaagaaggcacagactactgggagagtttttgctt 7039  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||  ||||  ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  7038 tgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgca 6939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14368 - 14069
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| || ||   ||||||||| ||||| |||||||| ||| |||| |||| ||| ||     
T  14368 tacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctagggacgtgaaacagtgctttcgttgtggtaagaaagggcatacacttgctgagtgtaag 14269  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||     
T  14268 catgatgatgttgtgtgtttcaattgcaatgaggaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagcctaagaaggcacagactactgggagagtttttgctt 14169  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||  ||||  ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  14168 tgactggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattgtgatcgtactcctttaactgttattattgatactggtgctacgca 14069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 34 - 329
Target Start/End: Original strand, 23473 - 23768
Alignment:
Q  34 acttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaac 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||| || |  || || |    
T  23473 acttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctggggatgtgaaacggtgttttcgttgtggtaagaaagggcatacacttgccgaatgtaagc 23572  T
Q  134 atgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctct 233  Q
    |||||||| |||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |    
T  23573 atgatgatgttgtatgttttaactgcaatgaggaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagcctaagaaggcgcagactactgggagagtttttgcttt 23672  T
Q  234 aactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
     |||| ||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23673 gactggtactcagacagagaatgaggatcatttgatcagaggtacatgttattttgatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctac 23768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 20 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1410 - 1156
Alignment:
Q  20 agatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcact 119  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||  ||||   ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1410 agattgtctgttttacgtgtggtgagaaaggtcacaagagtaatgcttatcctggggataccaagagatgttttcgctgtggaaagaagggtcatgcact 1311  T
Q  120 agctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggt 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |  || || || ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  1310 agctgagtgtaaacatgatgatatagaatgttttaactgcaatgaagagggtcacattggttcattgtgcatgaagcctaagaaggcgccgactaatggt 1211  T
Q  220 agagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagag 274  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1210 agagtttttgctttgactggtacacagacagagaacgaggatcgcttgattagag 1156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 82 - 332
Target Start/End: Original strand, 194826 - 195076
Alignment:
Q  82 aagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggtt 181  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||| | |||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||    
T  194826 aagagatgttttcgttgtgggaagaaaggacatacactagctgagtgtaaacgtaatgacattgtgtgctttaattgcaataaggagggtcacattggtt 194925  T
Q  182 cacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttg 281  Q
    |  |||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | || ||||| |||||  |||| ||||||||| |||| |||||||| ||    
T  194926 cgtagtgtacgcagcctaagaaggcgccgactactggtagagtttttgcgttgaccgatactcagaccaagaatgaggatcgcctgattagaggtacatg 195025  T
Q  282 ctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195026 ttatattgataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 195076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 36 - 329
Target Start/End: Original strand, 17008 - 17301
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||   ||| || ||||  || ||  | ||||| ||||| |||||  || ||||||  ||||| |||    
T  17008 ttgtggtgagaaaggccacaagagcactgtttgtccagaggaggtgaagaaatgtttctggtgtggcaagaagggtcacacattagctgactgcaagcat 17107  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
    | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||     
T  17108 ggtgatatcgtgtgtttcaactgcaaagaagagggtcatattgggtcccagtgtaagcagcctaagagggcgccgactacgggtagagttttttctctag 17207  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17208 ctggtactcagacagagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 17301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 307
Target Start/End: Original strand, 69366 - 69634
Alignment:
Q  38 gtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatga 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    || || || || || || |  ||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||| |    
T  69366 gtggtgagaaaggccacaagagcaatgcttgtccggaagaggtaaaaagatgtttccagtgtggtaagaagggtcatgcattagctgattgcaagcataa 69465  T
Q  138 tgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaact 237  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| ||||| ||| |  ||    
T  69466 t-atattgtgtgcttcaattgcaaagaagagggtcacattggttctcagtgcaagtagcctaagaaggtgccgactactggtagggttttggctttggct 69564  T
Q  238 gatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttg 307  Q
    | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  69565 ggtacacagacaaagaatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttg 69634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 229777 - 230090
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||  | ||||  ||  | || ||||| ||||| ||||||  |     
T  229777 gagattgtttgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtccggtgtggcaagaagggtcatataa 229876  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| |||| ||||||  |||| ||    
T  229877 tagctgattgcaagcttaatgatattgtgtgcttcaattgcaacgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagccgaagagggcgcctactacggg 229976  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
      || ||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  229977 acgaatttttgctctggctggtactcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgat 230076  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  230077 actggtgctacgca 230090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Original strand, 13167 - 13362
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||  |||  ||| |||||||||||||  |    
T  13167 atgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcgcaatgcacgcagcctaagagggcgcctactatgggtcgagtttttgctctggc 13266  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13267 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 13362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41411 - 41221
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | |||| ||    
T  41411 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggta 41312  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  41311 ctcagacggagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgacactggggctacgca 41221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3680 - 3490
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | |||| ||    
T  3680 attgtgtgttttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgactggta 3581  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3580 ctcagacagagaacgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 3490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17421 - 17226
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  | ||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  17421 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaaacaacctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggc 17322  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17321 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataaaactcctttagtttctattattgatactggtgctacgca 17226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 17539 - 17487
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcc 71  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  17539 gagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcc 17487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2059 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold2059
Description:

Target: scaffold2059; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Original strand, 812 - 1007
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| |||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||       
T  812 atgatattgtgtgcttcaattgtaacgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagccgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctgga 911  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  912 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 1007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 278
Target Start/End: Original strand, 7582 - 7841
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    || || ||||| |  || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  7582 gagattgtctgctttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatatttgtccggaagaggtaaagagatatttccgatgtggtaagaagggtcatgcac 7681  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  7682 tagatgagtgcaaacttaatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcacattggttctcggtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactgg 7781  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtac 278  Q
    ||| ||||| ||| | |||| ||| ||||| ||||| |||||| || |||||| ||||||    
T  7782 tagggttttcgctttgactggtactcagaccgagaatgaggatagcctgatcaaaggtac 7841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Original strand, 7822 - 8017
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||| |||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  7822 atgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcccaatgcaagcagccgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggc 7921  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| || || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7922 tggtactcagacagaaaatgaggatcgtttgatcagagttacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 8017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 206
Target Start/End: Original strand, 3880 - 4004
Alignment:
Q  82 aagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggtt 181  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||  ||||| | || ||||||||| | |||||||||  || ||||||||||  ||   |    
T  3880 aagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatgcgatagctgaatgcaagcgtggtgatattgtttacttcaattgtgataaagaaggtcatcttaact 3979  T
Q  182 cacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    | || |||| |||||||||||||||    
T  3980 cgcaatgcatgaagcctaagaaggc 4004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 329
Target Start/End: Original strand, 216360 - 216655
Alignment:
Q  34 acttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaac 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||| | ||  |||  || || |    
T  216360 acttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctagggatgtgaaacggtgttttcgttgtggtaagaaggggcatacgcttactgaatgtaagc 216459  T
Q  134 atgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctct 233  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| |    
T  216460 atgatgatgttgtgtgttttaactgcaatgaagaaggtcatattgggtcgcaatgcaagaagcctaagaaggcgcagactactgggagagtttttgcttt 216559  T
Q  234 aactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
     |||| ||| ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| || ||  |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  216560 gactggtacgcagacagagaatgaggatcaattgatcagaggtacatgttactttgatagtactactttaattgctattattgatactggtgctac 216655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 332
Target Start/End: Original strand, 28861 - 29166
Alignment:
Q  27 ctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtg 126  Q
    |||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| || ||||  || || || ||||| ||||| |||||  || ||||||      
T  28861 ctgtttcaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctaaggaggtaaagaaatgtttccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgaa 28960  T
Q  127 tgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagttt 226  Q
    ||||| |||| |||||||| ||| ||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||| | || |||| ||||||  |||| ||| ||||||    
T  28961 tgcaagcatggtgatattgcgtgtttcaactgcaaagtagagggtcatattggttcccaatgcaagcaaccaaagagggcgcctactacgggtcgagttt 29060  T
Q  227 ttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgc 326  Q
    |||||||  ||| ||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29061 ttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcaattgatcagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgataatggtgc 29160  T
Q  327 tacgca 332  Q
    ||||||    
T  29161 tacgca 29166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 332
Target Start/End: Original strand, 11281 - 11594
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||  | ||||  ||  | || ||||| ||||| ||||||  |     
T  11281 gagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtccggtgtggcaagaagggtcatatag 11380  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| | || |  |||| ||    
T  11381 tagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgattcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagaggacgtctactacggg 11480  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgat 318  Q
    | |||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11481 tcgagtttttgctctggctggtactcagacagagattgaggatcgtttgattagaggtacttgttatattaataatactcctttagtttctattattgat 11580  T
Q  319 actggtgctacgca 332  Q
    ||||||||||||||    
T  11581 actggtgctacgca 11594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 269
Target Start/End: Original strand, 14966 - 15216
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||  | ||||  ||  | || ||||| ||||| ||||||  |     
T  14966 gagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtccggtgtggcaagaagggtcatatag 15065  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| | || |  |||| ||    
T  15066 tagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgattcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagaggacgtctactacggg 15165  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgat 269  Q
    | |||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15166 tcgagtttttgctctggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgat 15216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3226 - 2930
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||  ||| ||  ||| ||| || || ||||| ||||| |||||  || ||||||  |||||||||    
T  3226 ttgtggtgagaaaggccacaagagtactgcttgtcctgaggaggtggagaagtgtttccggtgtggcaagaagggtcacacattagctgattgcaaacat 3127  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
    | ||| || |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||| | ||||||  |||| ||| |||||||||||||      
T  3126 gctgacatcgtgtgctttaattgcaaagaggagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaatagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctgg 3027  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    ||| |||  |||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3026 ctggtacttagacagagattgaggatcgtttgatcagaggtacttgttatattaataatactccattagttgctattattgatactggtgctacgca 2930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 4480 - 4656
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  4480 gagattgtctgctatacttgtggtgaaaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggatgtgaagagatgttttcgttgtggtaagaagggtcatgcac 4579  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaag 195  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  4580 tagctgagtgcaaacatgatgatattgtgtgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgtaagaag 4656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 189 - 329
Target Start/End: Original strand, 7834 - 7974
Alignment:
Q  189 caagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatatt 288  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||  | |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  7834 caagaagcctaagaaggcgcagactactggtagagttttcgcattgactggtactcagactgagaacgaggatcacttgatcagaggtacttgttatttt 7933  T
Q  289 gataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7934 gatagtacacctttagttgctattattgatactggtgctac 7974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14685 - 14490
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| |||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  14685 atgatatcgtatgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagccgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctggc 14586  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    ||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14585 tgatacttagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatattggtgctacgca 14490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5279 - 4984
Alignment:
Q  34 acttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaac 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||| ||||  ||||| ||||| || ||| | || ||||  || || |    
T  5279 acttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctggggatgtgaaacggtgttttcattgtggtaagaagggccatactcttgctgaatgtaagc 5180  T
Q  134 atgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctct 233  Q
    |||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||| | |   ||| ||| ||||||||| || |    
T  5179 atgatgatgttgtatgtttaaattgcaatgaagaaggtcatattgggtcgcaatgcaagaaacctaagaagactcagtctagtggaagagttttttcttt 5080  T
Q  234 aactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
     |||| ||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||| || ||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079 gactggtacgcagacagagaatgaggatcgattaattagaggtacatgttattttgatagtatacctttagttgctattattgatactggtgctac 4984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 39507 - 39568
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39507 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 39568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 424669 - 424374
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||   ||  ||||||  ||  | |||||||| ||||| ||||||    ||||||  ||||| | ||    
T  424669 tgtggtgtgaaaggccacaaaagcaatgtttgtcctgaagagattaagaaatgtgtccgatgtggcaagaagggtcatattgtagctgattgcaagcgtg 424570  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    | || |||||||| || || ||||||||||| ||||||||  |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||| | ||    
T  424569 aggacattgtgtgttttaactgcaatgaagagggtcacatcagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtttttgctttgac 424470  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  424469 ttgtactcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagtttctattattgatactggtgctacgca 424374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 36 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 171480 - 171188
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||  | ||||  ||  |||| ||||| ||||||||||||    ||||||  ||||| | |    
T  171480 ttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgtagagatcaagaaatgtgttcggtgtggcaagaaaggtcatattgtagctgattgcaagcgt 171381  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
     ||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || |||| | |||| |||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||      
T  171380 aatgatattgcgtgcttcaactgtaatgaagagggtcatatcggttcccaatgcacgcagccgaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgctctgg 171281  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 328  Q
    ||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  171280 ctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagagttacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgcta 171188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 496384 - 496089
Alignment:
Q  34 acttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaac 133  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  | |||| ||   ||||||||| ||||| ||||| || ||| | ||  |||  || || |    
T  496384 acttgtggtgaaaaaggccataagagcaatgcttgtcctgggaatgtgaaacagtgctttcgttgtggtaagaaggggcatactcttactgaatgtaagc 496285  T
Q  134 atgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctct 233  Q
    |||||||| |||| || || || |||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| |    
T  496284 atgatgatgttgtatgttttaactgcaatgaggaaggttatattggttcacaatgtaagaagcctaagaaggcgcagactactcggagagtttttgcttt 496185  T
Q  234 aactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
     |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  496184 gactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttattttgatagtagacctttagttgctattattgatactagtgctac 496089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 130 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 441920 - 441721
Alignment:
Q  130 aaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttg 229  Q
    |||||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||  | ||||||||||    
T  441920 aaacatgatgatgttgtgtgttttaactgcaatgaagagggtcatattggttcgcaatgcaagaagcctaagaaggcgcaggctacatggagagtttttg 441821  T
Q  230 ctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    || | |||| ||| || || ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || ||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  441820 ctttgactggtac-catacagagaatgaggatcgattgattagaagtacatgttattttgacagtactcctttagttgctattattgatactggtgctac 441722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 514527 - 514588
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  514527 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 514588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22503 - 22313
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  22503 attgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 22404  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22403 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 22313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7492 - 7302
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||| | ||||  |    
T  7492 attgtttgctttaattgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgctttgactggga 7393  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7392 ctcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 7302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 36 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 503 - 207
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |  ||| || |||  ||| || || ||||| ||||| |||||  || ||| ||  ||||| |||    
T  503 ttgtggtgagaaaggccacaagagtactgcttgtcgtgaggaggtgaaggagtgtttccggtgtggcaagaagggtcacacattagttgattgcaagcat 404  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaa 235  Q
    | ||| || |||||||| |||||||| || || ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||  || | ||| |||||||||||||      
T  403 gctgacatcgtgtgctttaattgcaaagaggagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagaaggcgcctactgcgggtcgagtttttgctctgg 304  T
Q  236 ctgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    ||| |||  |||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  303 ctggtacttagaaagagaatgaggatcgtttgattagaggtacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1881 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1881
Description:

Target: scaffold1881; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 137 - 332
Target Start/End: Original strand, 523 - 718
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| |||| ||||||  |||| ||| |||||||| ||||  |    
T  523 atgatattgtgtgcttcaattttaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagccaaagagggcgcctactacgggtcgagttttttctctggc 622  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  623 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatactaataatactcattaagttgctattattgatactggtgctacgca 718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15774 - 15476
Alignment:
Q  34 acttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaac 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||| | || ||||  || || |    
T  15774 acttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctggggatgtgaaacggtgttttcgttgtggtaagaaggggcatactcttgctgaatgtaagc 15675  T
Q  134 atgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctct 233  Q
    |||| ||| |||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||| |    
T  15674 atgacgatgttgtatgttttaactgcaatgaagaaggtcatattggttcgtaatgtaagaagcctaagaaggctcagactactggaagagtttttgcttt 15575  T
Q  234 aactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
     |||| ||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15574 gactggtacgcaaacagagaatgaggatcgattgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattggtgctacgca 15476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 169 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10597 - 10434
Alignment:
Q  169 ggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttga 268  Q
    ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || |||| | | |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  10597 ggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttgttttgactggtacgcagacggagaacgaggatcgtttga 10498  T
Q  269 tcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10497 tcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacgca 10434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0789 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0789
Description:

Target: scaffold0789; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 142 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 194 - 4
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| | | || ||    
T  194 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagagtctttgctttgattggta 95  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  94 ctcagacagagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttaagtgctataattgatagtggtgctacgca 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0611 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:

Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Original strand, 9361 - 9515
Alignment:
Q  12 tcctggagagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggt 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || |||||  |||||||||| |||    
T  9361 tcctgcagagattgtctgttttacttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgcttgtcctggggatgtcaagagatgttttcgtagtggaaagaagggt 9460  T
Q  112 catgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaag 166  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  9461 catgcactagttgtgtgcaaacatgatgatatagtatgttttaattgcaatgaag 9515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 133 - 329
Target Start/End: Original strand, 14305 - 14501
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||     
T  14305 catgatgatgttgtatgtttcaattgcaatgaagaaggtcatattggttcgcaatgtaagaagcctaagaaggtgcagactactgggagagtttttgctt 14404  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | |||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||  |||||| ||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  14405 tgactggtacgcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatattactcctttaatagcttttattgatactggtgctac 14501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8462 - 8327
Alignment:
Q  194 agcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataa 293  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| ||| ||||| | |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8462 agcctaagagggcgccgactactggtagggttattgctttgactggtactcagactgaggatgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattaataa 8363  T
Q  294 tacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8362 tactcctttagttgctattattgatactggtgctac 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11725 - 11538
Alignment:
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
    |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |   ||||||||| || |||  |||||||||| || |||||| | | || ||    
T  11725 attgtgtgttttaactgcaatggagagggtcacattagttcacagtgtactcagcctaagagggtgccgactactggtagggtctttgctttgaatggta 11626  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11625 cgcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 11538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 157 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 55245 - 55073
Alignment:
Q  157 tgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacg 256  Q
    ||||||||||| || || ||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||| | ||||  || ||||| ||||| |    
T  55245 tgcaatgaagagggacatattagttctcagtgtactcagcctaagagggcgccaactactggtagggtctttgctttgactggaactcagacggagaatg 55146  T
Q  257 aggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55145 aggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 55073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 270 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 18065 - 18006
Alignment:
Q  270 cagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18065 cagaggtacttgctatattaataatactcctttaattgctattattgatactggtgctac 18006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 128649 - 128600
Alignment:
Q  157 tgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  128649 tgcaatgaagaaggacacattggttcgcagtgcaaggagcctaagaaggc 128600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Original strand, 9290 - 9589
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaa 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||| ||  ||||||| || ||||| ||||| || ||| |  |  | |  || ||     
T  9290 tacttgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgtactggagatgtgaaacggtgcttccgttgtggtaagaaggggcatactattacagaatgtaag 9389  T
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||| ||||| ||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | ||| | ||||| ||||||     
T  9390 cattatgatgttgtgtgttttaactgcaatgaggaaggtcatattggttcacaatgcaagaagcctaagaaggcgcagaccactaggagagtgtttgctt 9489  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||| ||  || |||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9490 tgactggtacacagatagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgtcattttgaaagtactcctttagttgatattattgatactggtgctacgca 9589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 332
Target Start/End: Original strand, 23337 - 23536
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||  ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||     
T  23337 catgatgacgttgtgtgttttaactgcaacgaagagggtcacattggttcgcaatgcaagaagcctaagaaggcgcagactactgggagagtttttgctt 23436  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| |||  || |  |||| |||||||| || ||||||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23437 tgactggtacgaaggcacagaatgaggatcgattaatcagaggtacgtgttattttgatagtactcctttagttgctattattgataatagtgctacgca 23536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 261
Target Start/End: Original strand, 1805 - 2031
Alignment:
Q  35 cttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaaca 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || ||  |||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||| |||||    
T  1805 cttgtggcgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctggggatgtgaaaagatgtcttcgttgtggtaagaaaggtcatacacttgctgagtgtaaaca 1904  T
Q  135 tgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctcta 234  Q
    ||| ||| ||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||| |     
T  1905 tgacgatgttgtgtgttttaactgcaatgaggaaggtcatattggttcgcaatgcaagaagcgtaagaaggcgcagactactgggagagtttttgctttg 2004  T
Q  235 actgatacacagactgagaacgaggat 261  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  2005 actggtactcagactgagaatgaggat 2031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 261
Target Start/End: Original strand, 4669 - 4895
Alignment:
Q  35 cttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaaca 134  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || ||  |||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||| |||||    
T  4669 cttgtggcgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctggggatgtgaaaagatgtcttcgttgtggtaagaaaggtcatacacttgctgagtgtaaaca 4768  T
Q  135 tgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctcta 234  Q
    ||| ||| ||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||| |     
T  4769 tgacgatgttgtgtgttttaactgcaatgaggaaggtcatattggttcgcaatgcaagaagcgtaagaaggcgcagactactgggagagtttttgctttg 4868  T
Q  235 actgatacacagactgagaacgaggat 261  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  4869 actggtactcagactgagaatgaggat 4895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1459 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1459
Description:

Target: scaffold1459; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 169 - 330
Target Start/End: Original strand, 1107 - 1268
Alignment:
Q  169 ggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttga 268  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||| | | |    
T  1107 ggtcatattggttctcagtgcaagcatccgaagagggcgccgactactggtagggtttttgctctagctggtacacagacagagaatgaggatctcctaa 1206  T
Q  269 tcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacg 330  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1207 tcagaggaacttgttatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctacg 1268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 133 - 332
Target Start/End: Original strand, 15018 - 15217
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||   | |||||||| ||||||||||||| | ||||  | ||||||||||||     
T  15018 catgatgatgttgtgtgttttaactgcaatgaagagggttacattggtttggaatgcaagaaacctaagaaggcgcaaactacaagaagagtttttgctt 15117  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15118 tgactggtacgcagacagagaatgaggatcgattgattagaggtacatgttattttgatagtactcctttagttgctattattaatactggtgctacgca 15217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 493 - 291
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |  || || || || || || |  ||||| ||||| |||||||||     
T  493 gagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttttccgaaagaggtaaaaagatgtttccagtgtggtaagaagggtcatgcat 394  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  393 tagctgattgcaagcataatgatattgtgtgcttcaattgcaaagaagagggtcatattagttctcagtgcaagcagcctaagaaggcgccgactactgg 294  T
Q  219 tag 221  Q
    |||    
T  293 tag 291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 329
Target Start/End: Original strand, 13518 - 13714
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |   ||| ||||||||| ||||||     
T  13518 catgatgatgtggtgtgtttcaattgcaatgaagaaggtcatattgggtcacaatgcaagaaacctaagaagactcagactagtggtagagtgtttgctt 13617  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | |||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||  |||||| ||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  13618 tgactggtacacaaacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatattgatgctac 13714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5259 - 5100
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| |||| ||| ||  |||| ||| |||||||||||||  |    
T  5259 atgatattgtgtggttcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagccgaagagggcacctactacgggtcgagtttttgctctggc 5160  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatac 296  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5159 tggtacccagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatac 5100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 49024 - 48734
Alignment:
Q  39 tggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgat 138  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||   ||  |||||| |||  | | |||||| ||||| ||||||  | ||||||  ||||| | | |     
T  49024 tggtgggaaaggccacaagagcaatggttgtcctgaagaaattaagaagtgtgtccaatgtggcaagaagggtcatatagtagctgattgcaagcgtcaa 48925  T
Q  139 gatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactg 238  Q
    || ||||| || || || ||||||||||| || || ||| |||| ||||| |   ||||||||| ||||||  |||||||||| || ||| || | ||||    
T  48924 gacattgtatgttttaactgcaatgaagagggacaaattagttctcagtgtactcagcctaagagggcgccgactactggtagggtctttcctttgactg 48825  T
Q  239 atacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
      || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48824 ggactcagacggagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttgctatattaataatactcctttagttgctattattgatactggtgctac 48734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 204
Target Start/End: Original strand, 163044 - 163115
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaag 204  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||| |||||||||    
T  163044 catgaagatgttgtgtgtttcaattgcaatgaagagggtcatattggttctcaatgcgagaaacctaagaag 163115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 281
Target Start/End: Original strand, 13957 - 14219
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    ||  | ||||  ||  |  | ||||| ||||| |||| |  |     
T  13957 gagattgtctgttttaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtccagaagagataaagaaatgtgtcaggtgtggcaagaagggtcgtatag 14056  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactgg 218  Q
    ||||||  ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||    
T  14057 tagctgattgcaagcgtaatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagagggcgcctactacagg 14156  T
Q  219 tagagtttttgctctaactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttg 281  Q
    |  |||||||||| |  ||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  14157 tcaagtttttgctatggctggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggtacttg 14219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 35 - 196
Target Start/End: Original strand, 17918 - 18079
Alignment:
Q  35 cttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaaca 134  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||   |||||| || || || ||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||| ||| |||||    
T  17918 cttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtccgggggatgtgaaaagatgttttcgttgtgggaagaagggacatacacttgctgagtgtaaaca 18017  T
Q  135 tgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagc 196  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18018 tgatgatattgtatactttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagc 18079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5353 - 5154
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctc 232  Q
    ||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | ||| ||||||     
T  5353 catgatgatgtggtgtgtttcaaatgcaatgaagaaggtcatattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggctcaaactagtgggaaagtgtttgctt 5254  T
Q  233 taactgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | |||| ||| |||||   |||  |||| || ||||| |||||||| || ||  |||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5253 tgactggtacgcagacattgaataaggaccggttgattagaggtacatgttactttgatagtactcttttaattgctattattgatactggtgctacgca 5154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6469 - 6179
Alignment:
Q  42 tgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatgatgat 141  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||| || |||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| || ||| | || |||   || || |||||||||    
T  6469 tgagaaaggccataagagtaatgcttgtcttagggatgtgaaacggtgttttcgttgtggtaagaaggggcatactcttgctaaatgtaagcatgatgat 6370  T
Q  142 attgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgata 241  Q
     |||| || || || ||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||| | |   ||| ||| ||||| |||| | | |||| ||    
T  6369 gttgtatgttttaactgcaatgaagaaggtcatattgggtcgcaatgcaagaaacctaagaagactcagactagtggaagagtgtttggtttgactggta 6270  T
Q  242 cacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    | || || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||  |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6269 cgcaaacagagaatgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcctttaattgctattattgatactgatgctacgca 6179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 140 - 1
Alignment:
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||| ||||||  |||  ||| |||||||||||||  |    
T  140 atgatattgtgtgcttcaactgtaatgaagagggtcacattggttcgcaatgcacgcagcctaagagggcgcctactatgggtcgagtttttgctctggc 41  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggt 276  Q
    || ||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  40 tggtactcagacagagaatgaggatcgtttgatcagaggt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7907 - 7796
Alignment:
Q  148 tgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacaga 247  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||||||||||||| | | || ||| ||||    
T  7907 tgctttaattgcaatgaggaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaaggcacagactactagtagagtttttgctttgattggtactcaga 7808  T
Q  248 ctgagaacgagg 259  Q
    ||||||| ||||    
T  7807 ctgagaatgagg 7796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9998 - 9871
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcac 118  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||  |||||| || || || ||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  9998 gagattgtatgttgtacttgtggtgagaaaggccataagagtaatgcttgtcctggggatgtgaaaagatgttttcgctgtggtaagaaaggtcatacac 9899  T
Q  119 tagctgtgtgcaaacatgatgatattgt 146  Q
    ||||||  || || ||||||||||||||    
T  9898 tagctgaatgtaagcatgatgatattgt 9871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 289 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4692 - 4649
Alignment:
Q  289 gataatacacctttagttgctattattgatactggtgctacgca 332  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4692 gatagtacacctttagttgctattattgatattggtgctacgca 4649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 174 - 4
Alignment:
Q  12 tcctggagagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggt 111  Q
    ||||| |||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  ||| || ||||   | |||||  |||| |||||||||    
T  174 tcctgcagagattgtctgtttcaattgtggtgagaaaggccacaagagcaatgtttgtcctgaggaggtgaagaaaagttttcggcgtggcaagaaaggt 75  T
Q  112 catgcactagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttc 182  Q
    ||| || ||| ||  ||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  74 catacattagttgattgcaagcgtaatgacattgtgtgcttcaattgcaatgaggagggtcatattggttc 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11272 - 11097
Alignment:
Q  154 aattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaactgatacacagactgaga 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||| || |||||||| ||||||||||| |    |||||||||||| |||||| | |||| ||| || || ||||    
T  11272 aattgcaatgaagaaggtcatatcagttcgcaatgcaagaaacctaagaaggctcagaatactggtagagtgtttgctttgactggtacgcaaacagaga 11173  T
Q  254 acgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || ||  |||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  11172 atgaggatcgtttgattagaggtacatgttactttgatagtactcatttaattgttattattgatactggtactac 11097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 36 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 17
Alignment:
Q  36 ttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacat 135  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| | ||  | ||||  ||  | || ||||| ||||| |||||||   ||||||  ||||| |      
T  212 ttgtggtgagaaaggccacaagagtaatgtttgtcctgtagagatcaagaaatgtgtccggtgtggtaagaagggtcatgttgtagctgattgcaagcga 113  T
Q  136 gatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgct 231  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||    
T  112 aatgatattgtgtgcttcaattgtaatgaagagggtcatattggttcccaatgcaagcagcctaagagggcgcctactacgggtcgagtttttgct 17  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 325
Target Start/End: Original strand, 16552 - 16840
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||  |||| || |  ||||| | |||||| ||| |  |    | ||||||  |||    
T  16552 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgtcctggtgatgtaaaacggtgtttccattgtggtaggaaagggcatactattatagagtgcaagaatg 16651  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggcgccagctactggtagagtttttgctctaac 236  Q
    |||||||  |||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  || | ||| | ||| |||||| | ||    
T  16652 atgatatgatgtgtttcaactataatgaagaaggtcacattggttcgcagtgcaagaagcctaagaagactcaggccagtgggaaagtgtttgctttgac 16751  T
Q  237 tgatacacagactgagaacgaggatcgcttgatcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtg 325  Q
    || ||| || || | ||| ||||| || |||||||||||||| || |   || ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16752 tggtacgcaaacagtgaatgaggaccggttgatcagaggtacatgtttctttaattgtactcctttaattgctattattgatactggtg 16840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12189 - 12020
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |   ||||  || | ||||||||||||||| |||||||| ||| |  |||| |  ||||| | ||    
T  12189 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgcaatggtgatgagaaaaagtgctttcgatgtgggaagaaagggcatacgatagcggaatgcaagcgtg 12090  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
     ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12089 gtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaggaagcctaagaaggc 12020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 200420 - 200585
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |   ||||  |||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |  |||| |  ||||| | ||    
T  200420 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgatgagaagaagtgcttccgatgtgggaagaaagggcatacgatagcggaatgcaagcgtg 200519  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaaga 202  Q
     ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||    
T  200520 gtgatattgtttgcttcaattgtgacgaagaaggtcatcttagttcgcagtgcaagaagcctaaga 200585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 1300 - 1131
Alignment:
Q  37 tgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgcactagctgtgtgcaaacatg 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||   |   || |  |||| |||||| |||||||||||||| || ||| |  ||||||  ||||| | ||    
T  1300 tgtggtgagaagggccacaagagtaatgtttgcaatggtgaggagaagaagtgcttccgatgtggaaagaaggggcatacgatagctgaatgcaagcgtg 1201  T
Q  137 atgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
     ||||||||| |||||||||||  | ||| |||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1200 gtgatattgtttgcttcaattgtgacgaataaggtcatctcagttcacagtgtaagaagcctaagaaggc 1131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 36096 - 36023
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    ||||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36096 catgaagacattgtgtgttacaactgcaatgaagagggacacattggttcgcagtgcaaggagcctaagaaggc 36023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0848 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0848
Description:

Target: scaffold0848; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 206
Target Start/End: Original strand, 5032 - 5111
Alignment:
Q  127 tgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    ||||| ||||||||| | || |||| ||| ||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5032 tgcaatcatgatgatgtggtttgctacaactgcaaggaagaaagtcatattagttcaaagtgcaagaagcctaagaaggc 5111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 8586 - 8539
Alignment:
Q  26 tctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtccta 73  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8586 tctgttttaattgtggcgagaaaggccacaagagcaatgcttgtccta 8539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1600 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1600
Description:

Target: scaffold1600; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 436 - 400
Alignment:
Q  33 tacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgt 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  436 tacttgtggtgagaagggccacaagagtaatgcttgt 400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Original strand, 1316 - 1384
Alignment:
Q  138 tgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||    
T  1316 tgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagctctcagtgcaggaagcctaagaaggc 1384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 29906 - 29719
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtc-ctatggatgttaagaggtgctttcgatgtggaaagaaaggtcatgca 117  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||| |||| ||||  | ||| |||  |||| ||| || || ||||| | |||||| ||  ||    
T  29906 gagatagtctatttcaagtgtggtgaaaagggccacaagagtaatgtttgtaaccatg-atgagaagaagtgtttccggtgtgggacgaaaggacacaca 29808  T
Q  118 ctagctgtgtgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
     |||||| |||||| | || |||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||    
T  29807 atagctgagtgcaagcgtggtgatgttgtttgctacaattgtgatgaagaaggtcatattagctcgcagtgcaggaagcctaagaaggc 29719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Original strand, 28329 - 28397
Alignment:
Q  138 tgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||    
T  28329 tgatattgtgtgctacaattgtgatgaagagggtcatattagctctcagtgcaggaagcctaagaaggc 28397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 206
Target Start/End: Original strand, 1092 - 1135
Alignment:
Q  163 gaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaaggc 206  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1092 gaagaaggtcatattagttcgcagtgcaagaagcctaagaaggc 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 127 - 182
Target Start/End: Original strand, 18389 - 18444
Alignment:
Q  127 tgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttc 182  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  18389 tgcaagcatgatgatgtggtgtgtttcaactgtaatgaagaaggtcacattggttc 18444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 197 - 126
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaag 204  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |||||||||    
T  197 catgaagatgttgtgtgtttcaattgcaatgaagagggtcatattgggtcgcaatgcgagaaacctaagaag 126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12402 - 12331
Alignment:
Q  133 catgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagcctaagaag 204  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||| |||| |||||||||    
T  12402 catgaagatgttgtgtgtttcaattgcaatgaagagggtcatattgggtcgcaatgcgagaaacctaagaag 12331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 4263 - 4324
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4263 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 4324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 30064 - 30003
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30064 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 30003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Original strand, 67282 - 67343
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  67282 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 67343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41865 - 41804
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgctac 329  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41865 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgctac 41804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 63
Alignment:
Q  19 gagatagtctgttttacttgtggtgagaagggccacaagagcaatgcttgtcc 71  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  115 gagattgtctgtttcatttgtggtgagaaaggccacaaaagcaatgtttgtcc 63  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 199
Target Start/End: Original strand, 1455 - 1527
Alignment:
Q  127 tgcaaacatgatgatattgtgtgcttcaattgcaatgaagaaggtcacattggttcacagtgcaagaagccta 199  Q
    ||||| ||||| ||| | ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||    
T  1455 tgcaagcatgaagatgtggtgtgtttcaactgtaatgaagaaggtcacataggttctcagtgtaagaaaccta 1527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 591 - 531
Alignment:
Q  268 atcagaggtacttgctatattgataatacacctttagttgctattattgatactggtgcta 328  Q
    |||||||||||||| |   || ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  591 atcagaggtacttgtttctttaatagtactcctttaattgctattattgatactggtgcta 531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University