View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5236_high_4 (Length: 336)

Name: NF5236_high_4
Description: NF5236
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5236_high_4
NF5236_high_4
[»] chr6 (43 HSPs)
chr6 (1-328)||(27284175-27284502)
chr6 (1-328)||(27623520-27623849)
chr6 (1-328)||(13518007-13518334)
chr6 (1-328)||(4763821-4764148)
chr6 (1-328)||(27355924-27356251)
chr6 (1-328)||(16755878-16756206)
chr6 (1-328)||(28166552-28166880)
chr6 (1-328)||(8899512-8899839)
chr6 (1-328)||(27063540-27063866)
chr6 (1-328)||(34458321-34458646)
chr6 (1-328)||(27491191-27491518)
chr6 (1-328)||(33370244-33370571)
chr6 (1-328)||(26110224-26110550)
chr6 (1-328)||(16680197-16680525)
chr6 (1-328)||(29507474-29507803)
chr6 (3-328)||(4539571-4539896)
chr6 (1-328)||(26772442-26772768)
chr6 (1-328)||(29555616-29555943)
chr6 (1-328)||(22928694-22929023)
chr6 (3-328)||(28213515-28213840)
chr6 (1-328)||(26791874-26792201)
chr6 (1-328)||(29579073-29579399)
chr6 (1-328)||(30551813-30552140)
chr6 (3-328)||(4778941-4779266)
chr6 (3-328)||(27200247-27200571)
chr6 (3-328)||(27248662-27248986)
chr6 (1-328)||(13292764-13293085)
chr6 (1-328)||(16937838-16938164)
chr6 (1-328)||(14139213-14139534)
chr6 (1-328)||(4531346-4531673)
chr6 (24-328)||(26666471-26666774)
chr6 (1-328)||(27013791-27014111)
chr6 (1-328)||(26926826-26927137)
chr6 (1-328)||(27208962-27209285)
chr6 (1-328)||(27239943-27240266)
chr6 (1-328)||(27031081-27031405)
chr6 (1-328)||(24869768-24870089)
chr6 (1-328)||(27025203-27025526)
chr6 (1-328)||(24299573-24299895)
chr6 (3-328)||(15406346-15406666)
chr6 (3-328)||(15418133-15418453)
chr6 (1-314)||(20174607-20174930)
chr6 (1-314)||(22161061-22161384)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (1-328)||(18369298-18369625)
chr5 (1-328)||(30174533-30174861)
chr5 (1-328)||(11555422-11555748)
chr5 (1-328)||(33881194-33881521)
chr5 (1-328)||(3795606-3795934)
chr5 (1-328)||(18494534-18494860)
chr5 (1-328)||(37352410-37352737)
chr5 (1-328)||(40467319-40467646)
chr5 (1-328)||(28655310-28655638)
chr5 (1-328)||(9544473-9544802)
chr5 (1-328)||(37746088-37746421)
chr5 (3-328)||(13180559-13180879)
chr5 (1-328)||(37761050-37761378)
chr5 (1-328)||(6880372-6880699)
chr5 (1-328)||(8659238-8659565)
chr5 (1-328)||(30158102-30158429)
chr5 (1-328)||(43084326-43084653)
chr5 (1-328)||(11329705-11330034)
chr5 (1-328)||(13318594-13318920)
chr5 (3-328)||(13436440-13436770)
chr5 (1-328)||(9323546-9323871)
chr5 (1-328)||(12138245-12138570)
chr5 (1-328)||(23632037-23632366)
chr5 (1-328)||(41680772-41681100)
chr5 (1-328)||(22894484-22894810)
chr5 (1-328)||(33298601-33298932)
chr5 (1-328)||(24730038-24730365)
chr5 (1-328)||(31820176-31820501)
chr5 (3-328)||(34622589-34622914)
chr5 (1-328)||(28953546-28953873)
chr5 (1-328)||(37665252-37665579)
chr5 (1-328)||(2517133-2517461)
chr5 (1-328)||(5643868-5644193)
chr5 (1-328)||(30035494-30035820)
chr5 (1-328)||(32590042-32590368)
chr5 (1-328)||(15752624-15752945)
chr5 (1-328)||(33522450-33522778)
chr5 (1-328)||(18122182-18122509)
chr5 (1-328)||(26486465-26486780)
chr5 (1-328)||(31437532-31437852)
chr5 (3-328)||(25206348-25206679)
chr5 (3-328)||(25270504-25270835)
chr5 (1-328)||(15652526-15652851)
chr5 (1-328)||(22992890-22993209)
chr5 (1-328)||(23897942-23898263)
chr5 (1-328)||(33783555-33783877)
chr5 (3-328)||(24608316-24608636)
chr5 (1-328)||(24975917-24976238)
chr5 (3-328)||(30940707-30941025)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-328)||(3647209-3647536)
chr1 (1-328)||(10968728-10969056)
chr1 (1-304)||(51644283-51644588)
chr1 (1-328)||(10951154-10951482)
chr1 (1-328)||(28591146-28591472)
chr1 (1-328)||(28155789-28156118)
chr1 (3-328)||(41787175-41787501)
chr1 (1-328)||(20334281-20334610)
chr1 (1-328)||(16201893-16202228)
chr1 (1-328)||(20466840-20467175)
chr1 (1-328)||(21891628-21891941)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (1-328)||(5717092-5717420)
chr3 (1-328)||(5728002-5728330)
chr3 (1-328)||(5764038-5764366)
chr3 (1-328)||(47029477-47029805)
chr3 (1-328)||(31958364-31958693)
chr3 (1-328)||(5603222-5603551)
chr3 (1-328)||(24334197-24334526)
chr3 (1-328)||(32296653-32296981)
chr3 (3-328)||(4790542-4790867)
chr3 (1-328)||(10649095-10649422)
chr3 (1-328)||(29658877-29659204)
chr3 (1-328)||(4340585-4340912)
chr3 (1-328)||(28109860-28110191)
chr3 (1-328)||(4422942-4423269)
chr3 (1-328)||(5473012-5473338)
chr3 (1-328)||(51788046-51788373)
chr3 (1-328)||(17970775-17971100)
chr3 (1-328)||(10402173-10402499)
chr3 (1-328)||(8217656-8217985)
chr3 (1-328)||(5590270-5590597)
chr3 (1-328)||(18248762-18249089)
chr3 (1-328)||(22381490-22381816)
chr3 (1-328)||(16422206-16422534)
chr3 (1-328)||(20072057-20072386)
chr3 (1-328)||(48471951-48472282)
chr3 (1-328)||(29142663-29142993)
chr3 (1-328)||(18286264-18286590)
chr3 (1-328)||(18301565-18301891)
chr3 (1-328)||(4629809-4630135)
chr3 (1-328)||(21680725-21681051)
chr3 (1-328)||(28345195-28345521)
chr3 (1-328)||(28027315-28027640)
chr3 (1-328)||(11104270-11104598)
chr3 (1-328)||(22864757-22865082)
chr3 (1-328)||(22879816-22880141)
chr3 (1-328)||(5019737-5020063)
chr3 (1-328)||(6536652-6536979)
chr3 (1-328)||(17978859-17979187)
chr3 (1-328)||(7079246-7079578)
chr3 (1-328)||(18231217-18231544)
chr3 (1-328)||(20570755-20571082)
chr3 (1-327)||(16618399-16618729)
chr3 (3-328)||(18057287-18057614)
chr3 (1-328)||(31030154-31030474)
chr3 (3-328)||(6207927-6208247)
chr3 (3-328)||(18336655-18336973)
chr3 (1-328)||(19700510-19700849)
chr3 (1-328)||(4727657-4727978)
chr3 (1-328)||(32445178-32445496)
chr3 (1-328)||(15735009-15735331)
chr3 (3-328)||(35886791-35887111)
chr3 (3-328)||(4689678-4689996)
chr3 (1-328)||(8283367-8283705)
chr3 (1-328)||(5658158-5658482)
chr3 (77-328)||(15886650-15886895)
chr3 (3-48)||(15886894-15886940)
chr3 (5-84)||(27561022-27561101)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (1-328)||(20332288-20332616)
chr4 (1-328)||(40099502-40099830)
chr4 (1-328)||(39856709-39857034)
chr4 (3-328)||(24586227-24586552)
chr4 (1-328)||(27157178-27157507)
chr4 (1-328)||(14104615-14104941)
chr4 (1-328)||(30759836-30760161)
chr4 (1-328)||(33667669-33667994)
chr4 (1-328)||(18794483-18794810)
chr4 (1-328)||(54839463-54839789)
chr4 (3-328)||(5700615-5700939)
chr4 (1-328)||(14753360-14753686)
chr4 (1-328)||(34182830-34183155)
chr4 (3-328)||(5011952-5012277)
chr4 (1-328)||(21975776-21976103)
chr4 (1-328)||(36338392-36338711)
chr4 (1-328)||(31120376-31120704)
chr4 (1-328)||(24118735-24119061)
chr4 (1-328)||(1906324-1906656)
chr4 (1-328)||(15233888-15234219)
chr4 (19-328)||(36324183-36324484)
chr4 (1-327)||(15380105-15380431)
chr4 (1-328)||(6575934-6576253)
chr4 (1-328)||(15276495-15276825)
chr4 (1-328)||(1673932-1674260)
chr4 (3-328)||(17019127-17019447)
chr4 (3-328)||(14671091-14671412)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (1-328)||(37945721-37946049)
chr2 (1-328)||(12661598-12661924)
chr2 (1-328)||(22921999-22922328)
chr2 (1-328)||(27809760-27810089)
chr2 (1-328)||(254508-254835)
chr2 (1-328)||(39896128-39896454)
chr2 (3-328)||(37383739-37384063)
chr2 (1-328)||(19410340-19410669)
chr2 (1-328)||(12592869-12593200)
chr2 (1-328)||(16167537-16167864)
chr2 (1-328)||(27122584-27122909)
chr2 (1-328)||(13930400-13930729)
chr2 (1-328)||(3788553-3788879)
chr2 (1-328)||(34867742-34868068)
chr2 (1-328)||(9343843-9344170)
chr2 (1-328)||(39045678-39046005)
chr2 (1-328)||(37931431-37931765)
chr2 (1-328)||(31868642-31868968)
chr2 (1-328)||(34160903-34161232)
chr2 (1-328)||(40239568-40239894)
chr2 (3-328)||(37679747-37680073)
chr2 (3-328)||(37695012-37695338)
chr2 (1-328)||(27782291-27782618)
chr2 (1-328)||(31882346-31882672)
chr2 (1-328)||(32055861-32056187)
chr2 (1-328)||(12710457-12710784)
chr2 (3-328)||(21671026-21671353)
chr2 (1-328)||(16823193-16823520)
chr2 (1-328)||(16897960-16898287)
chr2 (1-328)||(11629041-11629367)
chr2 (1-328)||(21697029-21697359)
chr2 (1-328)||(34297215-34297535)
chr2 (1-327)||(27396382-27396718)
chr2 (1-328)||(34268782-34269104)
chr2 (1-328)||(19450274-19450610)
chr2 (1-328)||(28888338-28888660)
chr2 (3-328)||(23122434-23122753)
chr2 (1-328)||(27428309-27428629)
chr2 (3-328)||(20843974-20844298)
chr2 (139-328)||(23116993-23117182)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-328)||(12097-12423)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (1-328)||(9360683-9361009)
chr8 (1-328)||(28355778-28356107)
chr8 (3-328)||(18796770-18797095)
chr8 (1-328)||(31483698-31484027)
chr8 (1-328)||(31360589-31360916)
chr8 (1-328)||(33248427-33248753)
chr8 (1-328)||(19680510-19680835)
chr8 (1-328)||(29835384-29835710)
chr8 (1-328)||(44567042-44567371)
chr8 (1-328)||(15773635-15773962)
chr8 (1-328)||(18715541-18715870)
chr8 (3-328)||(21341998-21342323)
chr8 (3-328)||(12086551-12086876)
chr8 (1-328)||(19910990-19911319)
chr8 (1-289)||(33264792-33265079)
chr8 (1-328)||(19202203-19202518)
chr8 (1-327)||(22074758-22075085)
chr8 (3-328)||(19655175-19655495)
chr8 (1-328)||(27602742-27603062)
chr8 (1-328)||(2131096-2131417)
chr8 (3-328)||(22138970-22139288)
chr8 (1-198)||(16260284-16260480)
chr8 (3-328)||(19694159-19694479)
chr8 (1-328)||(14569217-14569542)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (1-328)||(4138997-4139326)
chr7 (1-328)||(24586287-24586613)
chr7 (1-328)||(5164442-5164769)
chr7 (1-328)||(26678856-26679184)
chr7 (1-328)||(26441311-26441639)
chr7 (1-328)||(26663664-26663992)
chr7 (1-328)||(5141086-5141414)
chr7 (1-328)||(31558146-31558473)
chr7 (1-328)||(39206891-39207218)
chr7 (1-328)||(5154142-5154468)
chr7 (1-328)||(26518851-26519176)
chr7 (1-328)||(16745272-16745600)
chr7 (3-304)||(26509471-26509773)
chr7 (1-328)||(45737359-45737688)
chr7 (25-328)||(26595750-26596055)
chr7 (1-328)||(4205448-4205774)
chr7 (1-328)||(26268837-26269168)
chr7 (1-328)||(11418531-11418858)
chr7 (1-328)||(26313601-26313926)
chr7 (1-328)||(2160628-2160957)
chr7 (1-328)||(16443755-16444083)
chr7 (3-328)||(31084374-31084699)
chr7 (1-328)||(45393277-45393604)
chr7 (1-328)||(11446946-11447273)
chr7 (1-328)||(16047373-16047697)
chr7 (1-328)||(3451376-3451704)
chr7 (1-328)||(2779310-2779631)
chr7 (1-328)||(31129963-31130284)
chr7 (1-328)||(10847641-10847970)
chr7 (1-328)||(10910678-10910999)
chr7 (1-326)||(16512194-16512513)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (1-328)||(9508-9834)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-328)||(3045-3374)
scaffold0159 (83-328)||(17949-18196)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (3-328)||(4469-4795)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (3-328)||(18649-18975)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-328)||(8795-9121)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (1-328)||(9975-10301)
scaffold0143 (3-328)||(33361-33682)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (3-328)||(1721-2045)
scaffold0322 (1-328)||(12107-12445)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (3-328)||(14013-14338)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-328)||(15630-15964)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (1-327)||(25176-25510)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (3-328)||(6130-6451)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (3-328)||(24772-25092)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (154-328)||(1-175)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (1-100)||(438-537)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (1-84)||(26243-26326)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (219-328)||(40495-40606)
scaffold0099 (3-105)||(40729-40838)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 43)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27284502 - 27284175
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27284502 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 27284403  T
Q  101 actctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284402 -ctctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 27284304  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284303 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 27284204  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284203 acaggctcttccccaggatagtctgtggt 27284175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27623849 - 27623520
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623849 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 27623750  T
Q  101 actctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27623749 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttaaaaattgaaaac 27623650  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623649 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtatatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 27623550  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623549 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 27623520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13518334 - 13518007
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518334 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 13518235  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518234 actctattttttttccactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 13518135  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13518134 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaag 13518035  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | || ||||||||||||||    
T  13518034 caggttctcctccgggatagtctgtggt 13518007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 4763821 - 4764148
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4763821 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctttgcttttgtttgaaa 4763920  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4763921 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 4764019  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764020 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 4764119  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  4764120 gcaggttctccttcaggatagtctgtggt 4764148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27356251 - 27355924
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27356251 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 27356152  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  27356151 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacc 27356053  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356052 tttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 27355953  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27355952 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27355924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 16755878 - 16756206
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16755878 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 16755977  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacat--tttgaaaattgaaaac 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  16755978 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatattttgacaattgaaaac 16756076  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16756077 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttaca 16756176  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16756177 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16756206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 28166552 - 28166880
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166552 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 28166651  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaac 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28166652 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 28166750  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28166751 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttaca 28166850  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28166851 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28166880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8899839 - 8899512
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899839 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 8899740  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899739 actctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 8899641  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8899640 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 8899541  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
     |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8899540 acaggttctcctccaggatagtctgtggt 8899512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 27063540 - 27063866
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27063540 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaa 27063638  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27063639 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 27063737  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27063738 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 27063837  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27063838 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27063866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34458646 - 34458321
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34458646 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 34458547  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458546 actctatttt-cttctattttctaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatggttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 34458448  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458447 tt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 34458349  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  34458348 caggttctcctccaggatagtctgtggt 34458321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 27491191 - 27491518
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27491191 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 27491290  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  27491291 -ctctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacc 27491389  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27491390 tttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 27491489  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||||||    
T  27491490 gcaagttctcctccaggatagtctgtggt 27491518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33370571 - 33370244
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33370571 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 33370472  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |    
T  33370471 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaagcattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaattt 33370373  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33370372 ttttgtctattttgaaaagcgaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 33370273  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33370272 gcaggctctcctccaggatagtctgtggt 33370244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26110550 - 26110224
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26110550 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 26110451  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
     ||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110450 -ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 26110352  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  26110351 tttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttccatatatgttacaag 26110252  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  26110251 caggttctcctccaagataatctgtggt 26110224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 16680197 - 16680525
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16680197 ataaaattaccattttccaagctttgaaaatccgtggagtcacgccgtcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 16680296  T
Q  101 actctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680297 -ctctattttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 16680395  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680396 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 16680495  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  16680496 agcgggttctcctccaggatagtctgtggt 16680525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 29507474 - 29507803
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29507474 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 29507573  T
Q  101 actctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaa 197  Q
     ||||  |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29507574 -ctctgctttctttttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaa 29507672  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29507673 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatggaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttac 29507772  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  29507773 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 29507803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4539896 - 4539571
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |    
T  4539896 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-c 4539798  T
Q  103 tctatttttcttct-actttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttt 201  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539797 tctatttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttt 4539698  T
Q  202 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4539697 ttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagc 4539598  T
Q  302 aggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4539597 aggttctcctccaagataatctgtggt 4539571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26772768 - 26772442
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26772768 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 26772669  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26772668 t-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaact 26772571  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  26772570 ttttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaa 26772471  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26772470 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26772442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 29555616 - 29555943
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  29555616 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa 29555715  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
     |||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  29555716 -ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttagaaaattaaaagct 29555814  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29555815 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 29555914  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  29555915 gcaggttcccctccaggatagtctgtggt 29555943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22929023 - 22928694
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22929023 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgtttgaaa 22928924  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
     ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22928923 -ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 22928825  T
Q  199 -tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928824 gtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaatagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 22928725  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928724 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 22928694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 28213515 - 28213840
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |    
T  28213515 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-c 28213613  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28213614 tctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacttt 28213713  T
Q  202 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 301  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28213714 ttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagc 28213813  T
Q  302 aggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  28213814 aggttctcctccaagataatctgtggt 28213840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 26791874 - 26792201
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26791874 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggaatcacgcctttggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 26791973  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26791974 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 26792072  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  26792073 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaa 26792172  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  26792173 gcaggttctccttcaggatagtctgtggt 26792201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 29579073 - 29579399
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29579073 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa 29579172  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaact 199  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29579173 -ctctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaact 29579270  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  29579271 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaa 29579370  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  29579371 gcaggttctccttcaggatagtctgtggt 29579399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 30552140 - 30551813
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  30552140 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa 30552041  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
     |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30552040 -ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 30551942  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  30551941 ttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaa 30551842  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30551841 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30551813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 4778941 - 4779266
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  4778941 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaac 4779039  T
Q  103 tctatttttcttctactttc-aaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4779040 tctatttttcttctactttcaaaagctgtatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactt 4779139  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  4779140 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaag 4779238  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4779239 caggttctcctccaagataatctgtggt 4779266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 27200247 - 27200571
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||    
T  27200247 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaac 27200345  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27200346 tctatttt-cttctactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactt 27200444  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  27200445 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaag 27200544  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  27200545 caggttctcctccagg-tagtctgtggt 27200571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27248986 - 27248662
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || |||||    
T  27248986 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgatt-aaaac 27248888  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27248887 tctatttt-cttctactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaactt 27248789  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  27248788 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtgtatttcaatgtatgttacaag 27248689  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | ||||| |||||||||||    
T  27248688 caggttctcctccagg-tagtctgtggt 27248662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13293085 - 13292764
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  13293085 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 13292987  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  13292986 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt 13292887  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  13292886 ttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataag 13292792  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  13292791 caggttctcctccaggatagtctgtggt 13292764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16938164 - 16937838
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  16938164 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 16938066  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16938065 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaattattttccttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaact 16937967  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  16937966 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttacca 16937867  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  16937866 gcaggttctcctccaagataatctgtggt 16937838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14139534 - 14139213
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  14139534 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 14139436  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14139435 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 14139336  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139335 ttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 14139241  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  14139240 caggttctcctccaggatagtctttggt 14139213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 4531346 - 4531673
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  4531346 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 4531444  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4531445 actctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattctctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 4531544  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctat-ttcaatatgtgttaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||||||| |||||||| |||||||    
T  4531545 ttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtgggtgtctatcttcaatatatgttaca 4531643  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4531644 agcaggttctcctccaagataatctgtggt 4531673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 24 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26666774 - 26666471
Alignment:
Q  24 ttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttca 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  26666774 ttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat-tctatttt-cttctactttca 26666677  T
Q  124 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26666676 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaagattgaaaactttttgtctattttgaaaaacaaa 26666577  T
Q  223 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 322  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26666576 cctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaagcaggttctcctccaggatagtc 26666477  T
Q  323 tgtggt 328  Q
    ||||||    
T  26666476 tgtggt 26666471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 27013791 - 27014111
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  27013791 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 27013889  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27013890 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 27013989  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27013990 tt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctattttaatatgtgttacaag 27014083  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  27014084 caggttctcctccaggatagtctttggt 27014111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 26926826 - 26927137
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  26926826 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 26926924  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26926925 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 26927023  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26927024 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaat---------------gagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 26927108  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  26927109 gcaggttctcctctaggatagtctgtggt 26927137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 27208962 - 27209285
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  27208962 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aa 27209060  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaa 195  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27209061 actctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaa 27209160  T
Q  196 aactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtt 295  Q
    ||  ||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27209161 aaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtt 27209252  T
Q  296 acaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27209253 acaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 27209285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27240266 - 27239943
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  27240266 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcgtgtgcttttgtttg-aa 27240168  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta---ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaa 195  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||   |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27240167 actctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaa 27240068  T
Q  196 aactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtt 295  Q
    ||  ||       ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27240067 aaagtt-------ttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatg-aacgtgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtt 27239976  T
Q  296 acaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27239975 acaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 27239943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 27031081 - 27031405
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27031081 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 27031179  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27031180 actctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 27031279  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
      |||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27031280 agttt----ttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttac 27031374  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27031375 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27031405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 24869768 - 24870089
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24869768 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 24869866  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    |||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24869867 actctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 24869966  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
      ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24869967 agtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttac 24870058  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  24870059 aagcagtttctcctccaggatagtctgtggt 24870089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 27025203 - 27025526
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27025203 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 27025301  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 196  Q
    |||||  |||  || ||||||||||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  27025302 actctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaa 27025401  T
Q  197 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 296  Q
    |  ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27025402 aagtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgagacatgcatgagctagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgtta 27025494  T
Q  297 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27025495 caagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27025526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24299895 - 24299573
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24299895 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 24299797  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    |||||  |||  || |||| |||||| ||| ||| ||||| ||| | |||| |||| |||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||     
T  24299796 actctgctttctttttactctcaaagttatgtacaaaaacgtttcccttcttttttaataatgacaaatgctcggaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 24299697  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
     ||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24299696 gtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagtaacagggtacattcaaatg-aacatgcataagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttaca 24299603  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24299602 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24299573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15406666 - 15406346
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15406666 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaac 15406568  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||      
T  15406567 tctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaa 15406468  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
     ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  15406467 gtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaa 15406375  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15406374 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15406346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15418453 - 15418133
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15418453 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaac 15418355  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||      
T  15418354 tctgctttctttttactttcaaagatatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatctggaaaattggaaaaa 15418255  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
     ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||    
T  15418254 gtt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgtatgttacaa 15418162  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15418161 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15418133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 20174607 - 20174930
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  20174607 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aa 20174705  T
Q  101 actctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaaacattttgaaa------a 190  Q
    |||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||      |    
T  20174706 actctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaata 20174805  T
Q  191 ttgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaata 289  Q
    |  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    |  |||| ||| ||||||    
T  20174806 tcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcatcaatgtatatctcaata 20174905  T
Q  290 tgtgttacaagcaggctcttcccca 314  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  20174906 tgtgttacaagcaagcttttcccca 20174930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22161384 - 22161061
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  22161384 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcccgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aa 22161286  T
Q  101 actctatttttcttc--tactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttg-aaacaaacattttgaaa------a 190  Q
    |||||||||||  ||  ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||      |    
T  22161285 actctattttttctctttacttccaaagttatgtacaaaaacattttctttctattttgatgatgacaatgcttgaaaacaaacattctaaaaaaaaata 22161186  T
Q  191 ttgaaaactttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaata 289  Q
    |  | || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    |  |||| ||| ||||||    
T  22161185 tcaagaagttttctgtctattttgaaaagcaaaccttagcaacaaggtactttcaagtgaaacatgcatgagcgagtgcgcatcaatgtatatctcaata 22161086  T
Q  290 tgtgttacaagcaggctcttcccca 314  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||    
T  22161085 tgtgttacaagcaagcttttcccca 22161061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18369625 - 18369298
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  18369625 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaccttcgcttttgtttgaaa 18369526  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369525 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 18369426  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369425 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 18369326  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18369325 caggttctcctccaggatagtctgtggt 18369298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 30174533 - 30174861
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174533 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 30174632  T
Q  101 actctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174633 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 30174732  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174733 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 30174832  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30174833 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30174861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 11555422 - 11555748
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11555422 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 11555521  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555522 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 11555620  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555621 cttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 11555720  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  11555721 caggttctcctccaggatagtcggtggt 11555748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 33881194 - 33881521
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881194 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 33881293  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881294 actctattttttttccactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 33881393  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33881394 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaag 33881493  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | || ||||||||||||||    
T  33881494 caggttctcctccgggatagtctgtggt 33881521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 3795606 - 3795934
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795606 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 3795705  T
Q  101 actctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3795706 attctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 3795805  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3795806 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataa 3795905  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3795906 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3795934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18494860 - 18494534
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494860 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggccgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 18494761  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494760 actccatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttactttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 18494662  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494661 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 18494562  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    | || ||| | |||||||||||||||||    
T  18494561 cgggttctcctccaggatagtctgtggt 18494534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37352737 - 37352410
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37352737 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 37352638  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352637 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 37352539  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  37352538 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaa 37352439  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  37352438 gcaggttctcctccaggataatctgtggt 37352410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40467646 - 40467319
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  40467646 ataaaattaccattttccaagctttataaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 40467548  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40467547 actctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 40467448  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40467447 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 40467348  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  40467347 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 40467319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 28655310 - 28655638
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28655310 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaa 28655408  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaac 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28655409 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttaataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 28655507  T
Q  199 tttt-tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28655508 ttttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttac 28655607  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28655608 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28655638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9544802 - 9544473
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  9544802 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 9544704  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaa 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  9544703 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaa 9544605  T
Q  197 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 296  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544604 actttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 9544505  T
Q  297 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  9544504 caagcaggttctcctccaggatagtctttggt 9544473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37746421 - 37746088
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746421 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 37746322  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746321 actctattttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 37746222  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagta------tgttgatgtctatttcaatatgtgt 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      |||| |||||||||||||||| |||    
T  37746221 tttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttaatgttaatgtctatttcaatatatgt 37746122  T
Q  295 tacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37746121 tacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37746088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13180879 - 13180559
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180879 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 13180780  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt 202  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  13180779 tccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt 13180680  T
Q  203 tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 302  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13180679 t-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 13180585  T
Q  303 ggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    || ||  | |||||||||||||||||    
T  13180584 ggttcccctccaggatagtctgtggt 13180559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 37761050 - 37761378
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761050 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 37761149  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37761150 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 37761248  T
Q  200 ttttgtctatttt-gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37761249 ttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttaca 37761348  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  37761349 agcaggttctcctccaggatagactgtggt 37761378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 6880372 - 6880699
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  6880372 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aag 6880470  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6880471 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 6880570  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6880571 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatgtgtgttacaa 6880670  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  6880671 gcaggttctcctccaagataatctgtggt 6880699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8659565 - 8659238
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8659565 ataaaattaccattcgccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgtttttgtttgaaa 8659466  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8659465 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 8659367  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  8659366 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaa 8659267  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8659266 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8659238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 30158102 - 30158429
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  30158102 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 30158200  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30158201 actctacctttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 30158300  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  30158301 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaa 30158400  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30158401 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30158429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 43084326 - 43084653
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084326 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 43084425  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43084426 actctatttt-cttctattttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaagttgaaaact 43084524  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  43084525 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgctacaa 43084624  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  43084625 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 43084653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 11329705 - 11330034
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11329705 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctttgcttttgttttaaa 11329804  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaa 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11329805 actctatttt-cttctactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttaaaaattgaaaa 11329903  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11329904 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttac 11330003  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  11330004 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 11330034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13318920 - 13318594
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13318920 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 13318821  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
     ||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318820 -ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 13318722  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13318721 tttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaag 13318622  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  13318621 caggttctcctccaagataatctgtggt 13318594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13436770 - 13436440
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  13436770 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-c 13436672  T
Q  103 tctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacatttt-ctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaa 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  13436671 tctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacatttttctttctattttgataatggcaacgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaa 13436572  T
Q  197 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13436571 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatatta 13436472  T
Q  297 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  13436471 caagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 13436440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 9323546 - 9323871
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  9323546 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 9323644  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9323645 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 9323743  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9323744 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaag 9323843  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  9323844 caggttctcctccaagataatctgtggt 9323871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 12138245 - 12138570
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  12138245 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 12138343  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12138344 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 12138442  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12138443 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaag 12138542  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  12138543 caggttctcctccaagataatctgtggt 12138570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 23632037 - 23632366
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23632037 ataaaattaccattttccaagcttcgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatgcatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 23632136  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--c 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |    
T  23632137 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatcttgaaaattgaaaaagc 23632235  T
Q  199 tttttgtctatttt-gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23632236 tttttgtctatttttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttat 23632335  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  23632336 aagccggttctcctccaggatagtctgtggt 23632366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 41680772 - 41681100
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680772 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgcccttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 41680871  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680872 actccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 41680971  T
Q  200 ttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  41680972 ttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttaca 41681070  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  41681071 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 41681100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 22894484 - 22894810
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22894484 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aa 22894582  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-ct 199  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  22894583 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaatattttctttctattttgataatgaccatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaggt 22894682  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22894683 ttttgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagtgtatgttgatgtctatttcgatatgtgttacaa 22894781  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22894782 gcagactcttccccaggatagtctgtggt 22894810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 33298601 - 33298932
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298601 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 33298700  T
Q  101 actcta-tttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298701 actccatttttttttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 33298800  T
Q  199 tttttgtctatttt--gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 296  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33298801 tttttgtctatttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgtta 33298900  T
Q  297 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33298901 caagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33298932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 24730038 - 24730365
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24730038 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaa 24730137  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaac 198  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24730138 t-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 24730235  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||    
T  24730236 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctaca 24730335  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  24730336 agcaggttctccttcaggatagtctgtggt 24730365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31820501 - 31820176
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  31820501 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 31820403  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31820402 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 31820304  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  31820303 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaag 31820204  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  31820203 caggttctccttcaggatagtctgtggt 31820176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 34622589 - 34622914
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  34622589 aaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-c 34622687  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttt 201  Q
    |||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  34622688 tctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaacttt 34622787  T
Q  202 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 301  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34622788 ttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagc 34622887  T
Q  302 aggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| ||||| | |||||||||||||||    
T  34622888 aggttcttctcaaggatagtctgtggt 34622914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28953873 - 28953546
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953873 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 28953774  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  28953773 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgggaattgaaaact 28953675  T
Q  200 ttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  28953674 ttttgtctatttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatttatgttaca 28953576  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28953575 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28953546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37665579 - 37665252
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  37665579 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 37665481  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  37665480 actctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacc 37665381  T
Q  200 ttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  37665380 ttttgtctatttttaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttaca 37665282  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    | |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37665281 aacaggttctcctccaggatagtctgtggt 37665252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 2517133 - 2517461
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  2517133 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccctcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaga 2517232  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaa 197  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  2517233 t-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaa 2517330  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2517331 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaacgtgtgttac 2517430  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  2517431 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 2517461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 5643868 - 5644193
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5643868 ataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 5643966  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5643967 actcta-ttttcttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaatcgaaaact 5644065  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5644066 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttaaaa 5644164  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  5644165 gcaggttctcctccaagataatctgtggt 5644193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 30035494 - 30035820
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  30035494 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 30035592  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30035593 attctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaact 30035691  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  30035692 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttacca 30035791  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||  ||| | ||| |||| ||||||||    
T  30035792 gcagattctcctccaagataatctgtggt 30035820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 32590368 - 32590042
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  32590368 ataaaattaccattttccaagctttgtgaattcgtggggtcatgcctttggccgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 32590270  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32590269 actctacttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttctttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaact 32590171  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32590170 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 32590071  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  32590070 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 32590042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15752945 - 15752624
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15752945 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 15752846  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15752845 t-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttct----tgataatgacaatacttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 15752752  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  15752751 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttaccag 15752652  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  15752651 caggttctcctccaagataatctgtggt 15752624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 33522450 - 33522778
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33522450 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa 33522549  T
Q  101 actctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
     |||| |||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33522550 -ctctgttttcttttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 33522648  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||    
T  33522649 cttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctaca 33522748  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33522749 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33522778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18122509 - 18122182
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  18122509 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 18122411  T
Q  101 actcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 198  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  18122410 actctatttttttttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgagaac 18122311  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18122310 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttaca 18122212  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  18122211 agcagtttctcctccaggatagtctgtggt 18122182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 26486465 - 26486780
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  26486465 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 26486563  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||||||||||           |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26486564 actctatttt-----------caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 26486652  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26486653 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaag 26486752  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  26486753 caggttctcctccaagataatctgtggt 26486780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 31437532 - 31437852
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  31437532 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 31437630  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31437631 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 31437730  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437731 tt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 31437824  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  31437825 caggttctcctccaggatagtctttggt 31437852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 25206348 - 25206679
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25206348 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaac 25206446  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-- 197  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  25206447 tctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaag 25206546  T
Q  198 ---ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgt 294  Q
        ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25206547 tttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgt 25206645  T
Q  295 tacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||  |||||||    
T  25206646 tacaagcaaattcttccctaggataaactgtggt 25206679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 25270504 - 25270835
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25270504 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaac 25270602  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-- 197  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  25270603 tctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaag 25270702  T
Q  198 ---ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgt 294  Q
        ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25270703 tttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgaacaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatatgtgt 25270801  T
Q  295 tacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||  |||||||    
T  25270802 tacaagcaaattcttccctaggataaactgtggt 25270835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15652851 - 15652526
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  15652851 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 15652753  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15652752 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 15652653  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||| | | |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15652652 tttttttttaaaaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaag 15652554  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15652553 caggttctcctccaggatagtctgtggt 15652526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22993209 - 22992890
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  22993209 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 22993111  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  22993110 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgatgatgctcgaaacaagcattttgaaaattgaaaaagt 22993011  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  22993010 tt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaag 22992918  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22992917 caggttctcctccaggatagtctgtggt 22992890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 23897942 - 23898263
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  23897942 ataaaattaccattttccaagctttgtaaattcatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 23898040  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac----aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaa 195  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23898041 actctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaacattttctttctattttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaa 23898140  T
Q  196 aactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtt 295  Q
    ||  |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23898141 aaagttttg----------aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgtt 23898230  T
Q  296 acaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
     |||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23898231 gcaagcagattcttctccaggatagtctgtggt 23898263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 33783555 - 33783877
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  33783555 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 33783653  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta--ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaa 196  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  33783654 actctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaa 33783753  T
Q  197 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 296  Q
    |  ||       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33783754 aagtt-------ttttgaaaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgtta 33783845  T
Q  297 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33783846 caagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33783877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 24608316 - 24608636
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  24608316 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgcttttgtttgaaa-c 24608414  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||   |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||      
T  24608415 tccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaag 24608514  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  24608515 tt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcaagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaa 24608607  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24608608 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24608636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 24975917 - 24976238
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  24975917 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttg-aa 24976015  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    |||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  24976016 actctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattggaaa 24976115  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
      |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||    
T  24976116 agt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttac 24976207  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  24976208 aagcaggttctcctccaggatagtatgtggt 24976238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 30940707 - 30941025
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||      
T  30940707 aaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcctgtgcttttgtttgaaat- 30940805  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||  |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||      
T  30940806 tctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaag 30940905  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  30940906 t--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaaag-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaa 30940996  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30940997 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 30941025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 3647209 - 3647536
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647209 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 3647308  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647309 actccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 3647408  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3647409 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgctacaag 3647508  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3647509 caggttctcctccaggatagtctgtggt 3647536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 10968728 - 10969056
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968728 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 10968827  T
Q  101 actctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968828 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 10968927  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10968928 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 10969027  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
     |||| ||| | ||||||| |||||||||    
T  10969028 acaggttctcctccaggatggtctgtggt 10969056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 51644283 - 51644588
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644283 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 51644382  T
Q  101 actcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac- 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51644383 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 51644482  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  51644483 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttaca 51644582  T
Q  299 agcagg 304  Q
    ||||||    
T  51644583 agcagg 51644588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 10951154 - 10951482
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951154 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 10951253  T
Q  101 actctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951254 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 10951353  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10951354 ttttgtctattttgaaaagtaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaa 10951453  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  10951454 gcaggttctcctccaagataatctgtggt 10951482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 28591146 - 28591472
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28591146 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 28591245  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
     ||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591246 -ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 28591344  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  28591345 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaag 28591444  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28591445 caggttctcctccaggatagtctgtggt 28591472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 28155789 - 28156118
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  28155789 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 28155887  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaa 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  28155888 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaa 28155986  T
Q  197 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28155987 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtta 28156086  T
Q  297 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28156087 caagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28156118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 41787501 - 41787175
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  41787501 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaac 41787403  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  41787402 tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaact 41787304  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41787303 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 41787204  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  41787203 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 41787175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20334610 - 20334281
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  20334610 ataaaattaccattttccaagccttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgaaattgtgcttttgtttgaaa 20334511  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
     ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20334510 -ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 20334412  T
Q  198 c-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 296  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334411 agtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 20334313  T
Q  297 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334312 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 20334281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16202228 - 16201893
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16202228 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 16202130  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-----aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattg 193  Q
    ||||||||||  || |||||||||||| || |||     ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16202129 actctattttctttttactttcaaagccatgtacaaaaaaaaacattttctttctatttttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattg 16202030  T
Q  194 aaaa---ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatat 290  Q
    ||||    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16202029 aaaaagttttttcgtctattttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgttgatgtctatttcaatat 16201931  T
Q  291 gtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16201930 atgttacaagcaggttcttctccaggatagtctgtggt 16201893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 20466840 - 20467175
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20466840 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 20466938  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaatt------ 192  Q
    |||||| |||  ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||          
T  20466939 actctactttctttccactttcaaagctatgtacaaaaaccattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatcttcaaaattagaaaa 20467038  T
Q  193 --gaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatat 290  Q
       |||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20467039 aaaaaaagttcctgtctattttg-aaagcaaacctgagcagcaaggtacattcaaacgaaacatgcgtgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatat 20467137  T
Q  291 gtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20467138 gtgttacaagcaggctcttccccatgatagtctgtggt 20467175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21891941 - 21891628
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21891941 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 21891843  T
Q  101 actcta-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    |||||| ||| | || ||  ||||           ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21891842 actctactttcttttttatgttca-----------aaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa 21891754  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
          || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21891753 ----aagttttttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgtcgatgtctatttcaatatatgttac 21891659  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  21891658 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 21891628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 297; Significance: 1e-167; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 5717092 - 5717420
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717092 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 5717191  T
Q  101 actctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717192 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 5717291  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717292 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 5717391  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5717392 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5717420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 5728002 - 5728330
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728002 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 5728101  T
Q  101 actctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728102 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 5728201  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728202 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 5728301  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5728302 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5728330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5764366 - 5764038
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764366 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 5764267  T
Q  101 actctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764266 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 5764167  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764166 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 5764067  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5764066 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5764038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 47029477 - 47029805
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029477 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 47029576  T
Q  101 actctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029577 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 47029676  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029677 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 47029776  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  47029777 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 47029805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31958693 - 31958364
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958693 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 31958594  T
Q  101 actctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958593 attctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 31958494  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31958493 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttaca 31958394  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31958393 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31958364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5603551 - 5603222
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603551 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 5603452  T
Q  101 actctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603451 attctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 5603352  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5603351 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaataaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttaca 5603252  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5603251 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5603222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 24334197 - 24334526
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334197 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 24334296  T
Q  101 actctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334297 attctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 24334396  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24334397 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttaca 24334496  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24334497 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24334526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 32296653 - 32296981
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296653 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 32296752  T
Q  101 actctatttt-tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296753 attctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 32296852  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296853 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 32296952  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  32296953 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 32296981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4790867 - 4790542
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  4790867 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggattcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-c 4790769  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790768 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttt 4790669  T
Q  202 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790668 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 4790569  T
Q  302 aggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  4790568 aggttctcctccaggatagtctgtggt 4790542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 10649095 - 10649422
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649095 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 10649194  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649195 actctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 10649293  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649294 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 10649393  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10649394 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10649422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29659204 - 29658877
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29659204 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 29659105  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  29659104 -ctctatttttcttctactttcaaagttatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacc 29659006  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659005 tttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 29658906  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  29658905 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 29658877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4340912 - 4340585
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4340912 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 4340813  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4340812 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 4340714  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4340713 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 4340614  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  4340613 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 4340585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28110191 - 28109860
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110191 ataaaattaccattttccaagctttatgaatccgtggagtcatgccttgggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 28110092  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac----attttgaaaattgaaa 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||    
T  28110091 actccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacgttttttttgaaaattgaaa 28109992  T
Q  197 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28109991 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgtta 28109892  T
Q  297 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  28109891 caagcaggttctcctccaagataatctgtggt 28109860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 4422942 - 4423269
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4422942 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 4423041  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4423042 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaact 4423140  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4423141 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 4423240  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  4423241 gcaggttctccttcaggatagtctgtggt 4423269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 5473012 - 5473338
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5473012 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 5473111  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5473112 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 5473210  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5473211 ttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 5473309  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5473310 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5473338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 51788046 - 51788373
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51788046 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 51788145  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51788146 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 51788244  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  51788245 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaa 51788344  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  51788345 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 51788373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17971100 - 17970775
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  17971100 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 17971002  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17971001 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 17970903  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17970902 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgcgttacaag 17970803  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  17970802 caggttctcctccaggatagtctgtggt 17970775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 10402173 - 10402499
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  10402173 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaa 10402271  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10402272 attctattttt-ttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 10402370  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10402371 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 10402470  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10402471 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10402499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 8217656 - 8217985
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217656 ataaaattaccattttccaagctttgtggatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 8217755  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaa 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8217756 actctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttttgaaaattgaaaa 8217854  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8217855 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttac 8217954  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8217955 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8217985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5590597 - 5590270
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5590597 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa 5590498  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
     |||| ||||  || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590497 -ctctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 5590399  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5590398 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaataggtgttacaa 5590299  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  5590298 gcaggttctcctccaggatagtctatggt 5590270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 18248762 - 18249089
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18248762 ataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccatcactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttggaa 18248861  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18248862 -ctctatttttcttctactttcaaagctacatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacc 18248960  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18248961 tttggtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 18249060  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18249061 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18249089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22381816 - 22381490
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  22381816 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 22381718  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22381717 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 22381618  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22381617 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcgacagtgtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaa 22381519  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22381518 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22381490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 16422206 - 16422534
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422206 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 16422305  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
     ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16422306 -ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 16422404  T
Q  199 -tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422405 gtttttgtgtattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 16422503  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422504 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 16422534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 20072057 - 20072386
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  20072057 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 20072155  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaa 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  20072156 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaa 20072254  T
Q  197 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20072255 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtta 20072354  T
Q  297 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20072355 caagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20072386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 48471951 - 48472282
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  48471951 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacgccctcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 48472050  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg-----aaaattgaa 195  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||    
T  48472051 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttttaaaaattgaa 48472149  T
Q  196 aactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtt 295  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48472150 aactttctgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtt 48472249  T
Q  296 acaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  48472250 acaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 48472282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 29142993 - 29142663
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142993 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 29142894  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142893 actccattttttttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 29142794  T
Q  200 ttttgtctatttt--gaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29142793 ttttgtctatttttgaaaaaacaaacctgagcaacatggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttac 29142694  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  29142693 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 29142663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18286590 - 18286264
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  18286590 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaa 18286492  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18286491 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 18286393  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18286392 tttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttaca 18286294  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18286293 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18286264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18301891 - 18301565
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  18301891 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaa 18301793  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18301792 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 18301694  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18301693 tttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttaca 18301595  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18301594 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18301565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 4629809 - 4630135
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629809 ataaaattaccattttccaagctttgttaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 4629908  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629909 actctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 4630007  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  4630008 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaa 4630106  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  4630107 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 4630135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 21680725 - 21681051
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680725 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 21680824  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680825 actctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 21680923  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  21680924 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaa 21681022  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  21681023 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 21681051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 28345195 - 28345521
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  28345195 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctatgcttttgttt-aaa 28345293  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28345294 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaacc 28345392  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28345393 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaa 28345492  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  28345493 gcaggttctcctccaagataatctgtggt 28345521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 28027315 - 28027640
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  28027315 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcaggcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 28027413  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027414 attctatttt-cttctactttcaaagctatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 28027512  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28027513 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaag 28027612  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28027613 caggttctcctccaggatagtctgtggt 28027640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11104598 - 11104270
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11104598 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagccacgccttcggctgactaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa 11104499  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagcta--tatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
     |||||||||  || ||||||||||||||  |||||||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104498 -ctctattttctttttactttcaaagctaaatatacaatttattttccttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 11104400  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11104399 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttaca 11104300  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  11104299 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 11104270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22865082 - 22864757
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22865082 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 22864983  T
Q  101 actctatt-tttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
       ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864982 ---ctatgctttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 22864886  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22864885 ttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaa 22864786  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    || || ||| | ||||| |||||||||||    
T  22864785 gcgggttctcctccagggtagtctgtggt 22864757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22880141 - 22879816
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22880141 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgatcaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 22880042  T
Q  101 actctatt-tttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
       ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880041 ---ctatgctttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 22879945  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22879944 ttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaa 22879845  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    || || ||| | ||||| |||||||||||    
T  22879844 gcgggttctcctccagggtagtctgtggt 22879816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 5019737 - 5020063
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  5019737 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 5019835  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5019836 actctacttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacgaacatttttgaaaattgaaaact 5019934  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5019935 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 5020034  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  5020035 gcaggttctcctccgggatagtctgtggt 5020063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 6536979 - 6536652
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6536979 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 6536880  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
     ||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  6536879 -ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttttgaaaattaaaaact 6536781  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6536780 ttttgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaagcatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 6536681  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  6536680 gcaggttcttctcaaggatagtctgtggt 6536652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 17979187 - 17978859
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  17979187 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aa 17979089  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979088 actctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 17978989  T
Q  200 ttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17978988 ttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaaggaaatatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttaca 17978889  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  17978888 agcaggttctcctccaagataatctgtggt 17978859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 7079246 - 7079578
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  7079246 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctgaaa 7079345  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatata----caaaacattttctttctatt-ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaa 195  Q
     |||| ||||  || ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7079346 -ctctgttttctttttactttcaaagctatatatatacaaaacattttctttctattcttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattaaa 7079444  T
Q  196 aa-ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgt 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7079445 aaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgt 7079544  T
Q  295 tacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  7079545 tacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 7079578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 18231217 - 18231544
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18231217 ataaaattaccattttccaagatttgcgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaa 18231315  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18231316 actctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacc 18231415  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  18231416 ttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacagtcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaa 18231515  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18231516 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18231544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20571082 - 20570755
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20571082 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaa 20570983  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20570982 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaact 20570884  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20570883 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcaagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaa 20570784  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
     |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20570783 acaggttctcctccaggatagtctgtggt 20570755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16618729 - 16618399
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16618729 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa 16618630  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
     ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16618629 -ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 16618531  T
Q  198 c---tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgt 294  Q
        |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16618530 aaagtttttgtccattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgt 16618432  T
Q  295 tacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 327  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16618431 tacaaggaggctcttccccaggatagtctgtgg 16618399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 18057287 - 18057614
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  18057287 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttgaaa-c 18057385  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-t 199  Q
    |||  |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  18057386 tctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt 18057485  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057486 ttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 18057585  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18057586 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 18057614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31030474 - 31030154
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31030474 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa 31030375  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31030374 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 31030276  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  31030275 ttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaagatatgttacaag 31030182  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31030181 caggttctcctccaggatagtctgtggt 31030154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 6207927 - 6208247
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6207927 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 6208026  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  6208027 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctatttttaataatgacaaaggctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt 6208126  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6208127 tt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaag 6208219  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6208220 caggctcttccccaggatggtctgtggt 6208247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 18336655 - 18336973
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |    
T  18336655 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-c 18336753  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||    
T  18336754 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattatgataatgataatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagttt 18336853  T
Q  203 tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 302  Q
    |     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18336854 t-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagca 18336947  T
Q  303 ggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    || ||| | |||||||||||| ||||    
T  18336948 ggttctcctccaggatagtctatggt 18336973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 19700510 - 19700849
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  19700510 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaagttaagcctgtgcttttgtttgaaa 19700609  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-----------cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaa 188  Q
     |||||||||  || ||||||||||||||| |||||||           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19700610 -ctctattttctttttactttcaaagctatgtacaaaaaaaaaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaa 19700708  T
Q  189 aattgaaaac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttca 286  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19700709 aattgaaaaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttca 19700807  T
Q  287 atatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19700808 atatgtgttacgagcagattcttccccaggatagtctgtggt 19700849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 4727657 - 4727978
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  4727657 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 4727755  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  4727756 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 4727855  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
     |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4727856 gttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttaca 4727948  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4727949 agcaggctcttccccaggatggtctgtggt 4727978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 32445178 - 32445496
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  32445178 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 32445276  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||  |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  32445277 actctgctttctttttactttcaaagttatatacaaaacattttctttctgttttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 32445376  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32445377 t-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaag 32445468  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  32445469 caggttctcctccaggatagtctgtggt 32445496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15735331 - 15735009
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15735331 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 15735233  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    |||||   |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15735232 actct-gctttcttttactttcaaagttatgtacaaaaacatttcccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa 15735134  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
      ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15735133 agtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttac 15735040  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15735039 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15735009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 35886791 - 35887111
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  35886791 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaac 35886889  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||  |||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||      
T  35886890 tctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaag 35886989  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||      |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35886990 ttt------ttttgaaaagcaaacctgtgtaacagggtacattcaaacg-aacatacatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaa 35887082  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  35887083 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 35887111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 4689678 - 4689996
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4689678 aaaattaccattttccaagcttcgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaac 4689776  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||   |||||| ||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||      
T  4689777 tct-gctttcttttactttctaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaag 4689875  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  4689876 tt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgcctatttcaatatatgttacaa 4689967  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  4689968 gcagattctcctccaggatagtctgtggt 4689996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 8283705 - 8283367
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  8283705 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcatgtgtttttgtttgaaa 8283606  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
     |||   |||  || ||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  8283605 -ctccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa 8283507  T
Q  198 ---------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaat 288  Q
              ||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  8283506 agttttttttttttttttttttttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaat 8283407  T
Q  289 atgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    || ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8283406 atatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8283367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 5658158 - 5658482
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatac--atcaatttgagcctttgcttttgtttga 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||     
T  5658158 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcaggccttcggctgaccaccactcttatacatatcattttgagcctgtgcttttgtttg- 5658256  T
Q  99 aaactctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaa 195  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  5658257 aaactctattttccttttactttcaacgttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaa 5658356  T
Q  196 aactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtt 295  Q
    ||  |||      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    ||||    
T  5658357 aaagttt------ttttgaaaagcaaacctaagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaacgcatgtt 5658449  T
Q  296 acaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  5658450 acaagcaggttctcctcaaggatagtctgtggt 5658482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 77 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15886895 - 15886650
Alignment:
Q  77 ttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttga-taatgacaa-tgcttga 173  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||| ||| |||||||  | |||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||    
T  15886895 ttgagcctgtgtttttgtttgaaa-ctctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaatactttccttctatttttaataatgacaaatgctcga 15886797  T
Q  174 aacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtt 273  Q
    | ||||||| ||||||||||||||  ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||    
T  15886796 agcaaacatcttgaaaattgaaaaagtttt-------ttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaa-catgcatgagcgagtgtatgtt 15886705  T
Q  274 gatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  15886704 ggtgtctatttcaatatatgttacaagcaggttctcctcccggatagtctgtggt 15886650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 15886940 - 15886894
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgt-gaatccgtggagtcacgcctt 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15886940 aaaattaccattttccaagctttgtaaaatccgtggagtcacgcctt 15886894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 27561101 - 27561022
Alignment:
Q  5 aattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacca-ctcttatacatcaatttgagcct 84  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| | || ||||||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27561101 aattaccattttccaaactttgtg-atctgtggtgccaagccttcggctggctaccatctcttttaaatcaatttgagcct 27561022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20332616 - 20332288
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332616 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 20332517  T
Q  101 actctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332516 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 20332417  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332416 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 20332317  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20332316 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20332288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40099830 - 40099502
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40099830 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaa 40099731  T
Q  101 actctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099730 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 40099631  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099630 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 40099531  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  40099530 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 40099502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 39856709 - 39857034
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39856709 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaa 39856807  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856808 actct-tttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 39856906  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856907 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 39857006  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39857007 caggttctcctccaggatagtctgtggt 39857034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24586552 - 24586227
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586552 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 24586453  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt 202  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586452 tccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataaggacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt 24586353  T
Q  203 tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24586352 tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaatagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagca 24586253  T
Q  303 ggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    || ||| | |||||||||||||||||    
T  24586252 ggttctcctccaggatagtctgtggt 24586227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27157507 - 27157178
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157507 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 27157408  T
Q  101 actctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157407 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 27157308  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157307 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 27157208  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27157207 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27157178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 14104615 - 14104941
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  14104615 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 14104713  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104714 actctgttttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttggtaatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 14104813  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104814 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 14104913  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  14104914 caggttctcctccaggatagtctgtggt 14104941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 30759836 - 30760161
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  30759836 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 30759934  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30759935 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 30760033  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30760034 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaag 30760133  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  30760134 caggttctcctccaggatagtctgtggt 30760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 33667994 - 33667669
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  33667994 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 33667896  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33667895 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 33667797  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33667796 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtactttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaag 33667697  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33667696 caggttctcctccaggatagtctgtggt 33667669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18794810 - 18794483
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18794810 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctttgcttttgtttgaaa 18794711  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatt-ttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18794710 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattcttgaaaattgaaaact 18794612  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18794611 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaa 18794512  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18794511 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18794483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 54839463 - 54839789
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  54839463 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgcttgaaa 54839562  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54839563 -ctctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 54839660  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54839661 ttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 54839760  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  54839761 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 54839789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 5700615 - 5700939
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||      
T  5700615 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat- 5700713  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  5700714 tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaacttt 5700812  T
Q  202 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5700813 ttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaagc 5700912  T
Q  302 aggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5700913 aggttctcctccaggatagtctgtggt 5700939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 14753686 - 14753360
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  14753686 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgatt-aaa 14753588  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca--ttttgaaaattgaaaac 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14753587 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 14753489  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14753488 tttttgtctattttgaaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttaca 14753390  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  14753389 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 14753360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34183155 - 34182830
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34183155 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccgctcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 34183056  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  34183055 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac- 34182958  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34182957 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaa 34182859  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  34182858 gcaggttctcctccaggataatctgtggt 34182830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 5011952 - 5012277
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  5011952 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaac 5012050  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttt 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5012051 tctacttttcttctactttcaaagctatatacaaatcattttctttctacttggataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaacttt 5012150  T
Q  202 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5012151 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggcacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagc 5012250  T
Q  302 aggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5012251 aggttctcctccaggatagtctgtggt 5012277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 21975776 - 21976103
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  21975776 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgcgcttttgtttgaaa 21975875  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
     |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21975876 -ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 21975974  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  21975975 ttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaa 21976074  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  21976075 gcaggttctcctccaggatagtctatggt 21976103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36338711 - 36338392
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  36338711 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 36338613  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  36338612 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 36338513  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36338512 tt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaag 36338420  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    | || ||| | |||||||||||||||||    
T  36338419 cgggttctcctccaggatagtctgtggt 36338392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31120704 - 31120376
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  31120704 ataaaattaccatttttcaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttg-aa 31120606  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31120605 actctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 31120506  T
Q  200 ttttgtcta-ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||    
T  31120505 ttttgtctatttttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctaca 31120406  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31120405 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31120376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 24118735 - 24119061
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||    
T  24118735 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtctg-aa 24118833  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24118834 actctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaact 24118933  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || |||||||||||| || ||||||||    
T  24118934 ttttgtctattttgaaaagcaaaccggagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgctggtgtctatttcaacatatgttacaa 24119032  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  24119033 gcaggttctcctccaggatagtccgtggt 24119061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 1906324 - 1906656
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1906324 ataaaattaccattttccaagctttgtatatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagtctgtgcttttgtttgaaa 1906423  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa----cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaa 195  Q
     ||||| | |  ||||||||||||||| || |||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1906424 -ctctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaagaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaa 1906522  T
Q  196 aac--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtg 293  Q
    ||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1906523 aaagttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtg 1906621  T
Q  294 ttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1906622 ttacaagcaggttcttccccaggatagtctgtggt 1906656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 15233888 - 15234219
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15233888 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtagagtcacgccttcggctaaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aa 15233986  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa--- 197  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||       
T  15233987 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaatttctttttatcttgataatgacaatgcttgaagcaaacatcttgaaacttgaaaaagt 15234086  T
Q  198 ---ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgt 294  Q
        ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15234087 tttttttttgtctattttg-aaagcaaacctgggcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgt 15234185  T
Q  295 tacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15234186 tacaagcaggttcttccccaggatagtctgtggt 15234219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 19 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 36324484 - 36324183
Alignment:
Q  19 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctatttttcttctac 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36324484 aagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-ctctatttttcttctac 36324386  T
Q  119 tttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaag 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||      ||||||||||    
T  36324385 tttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagttt------ttttgaaaag 36324292  T
Q  219 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggat 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||    
T  36324291 caaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaagcgggttctcctccaggat 36324193  T
Q  319 agtctgtggt 328  Q
    ||||||||||    
T  36324192 agtctgtggt 36324183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15380431 - 15380105
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15380431 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttgaaa 15380332  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
     ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||     
T  15380331 -ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaattaaaaaag 15380233  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15380232 tttttgtctgttttgaaa-gcaagcctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctttttcaatatgtgttaca 15380134  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtgg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15380133 agcaggctcttccccaggatagtctgtgg 15380105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 6575934 - 6576253
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  6575934 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 6576032  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  6576033 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 6576132  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6576133 tt------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaag 6576225  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  6576226 caggttctcctccaggatagtctgtggt 6576253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 15276825 - 15276495
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  15276825 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtttg-aa 15276727  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg---aa 195  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||    
T  15276726 actctattttctctctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 15276627  T
Q  196 aactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtt 295  Q
    || ||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15276626 aagtttttgtctgttttg-aaagtaaacttgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgtt 15276528  T
Q  296 acaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15276527 acaaacaggctcttccccaggatagtctgtggt 15276495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 1673932 - 1674260
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  1673932 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggtgtcactccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 1674030  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    |||||| | |  ||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1674031 actctactatctttctactttcaaagccatgtacaaaaaatattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 1674130  T
Q  198 --ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtt 295  Q
       ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||    
T  1674131 agttttttgtctattttg-aaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttgatgtctatttca--atgtgtt 1674227  T
Q  296 acaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1674228 acaagcaggttcttccctaggatagtctgtggt 1674260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 17019127 - 17019447
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17019127 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctatgcttttgtttg-aaac 17019225  T
Q  103 tctatttttcttctactttc-aaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||  |||  || ||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||      
T  17019226 tctgctttctttttactttcaaaagctatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgagaattgaaaaag 17019325  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  17019326 ttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaa 17019418  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  17019419 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 17019447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 14671091 - 14671412
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  14671091 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagttacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcccgtgcttttgtttg-aaac 14671189  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaa-aacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||  |||  || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||      
T  14671190 tctgctttctttttactttcaaagttatgtacaagaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaag 14671289  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14671290 ttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaa 14671383  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | | |||||||||||||||    
T  14671384 gcaggttctcctctaggatagtctgtggt 14671412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37946049 - 37945721
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37946049 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 37945950  T
Q  101 actctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945949 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 37945850  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945849 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtaagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 37945750  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37945749 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37945721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 12661598 - 12661924
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12661598 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 12661697  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661698 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 12661796  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12661797 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaag 12661896  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  12661897 caggttctcctccaggatagtctgtggt 12661924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22922328 - 22921999
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922328 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 22922229  T
Q  101 actctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922228 attctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 22922129  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22922128 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttaca 22922029  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22922028 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22921999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 27809760 - 27810089
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809760 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 27809859  T
Q  101 actctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809860 actctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 27809959  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809960 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggttacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 27810059  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27810060 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27810089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 254835 - 254508
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254835 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 254736  T
Q  101 actctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254735 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 254636  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254635 ttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 254537  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  254536 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 254508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 39896128 - 39896454
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  39896128 ataaaattaccattttccgagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 39896227  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39896228 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 39896326  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896327 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 39896426  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39896427 caggttctcctccaggatagtctgtggt 39896454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 37383739 - 37384063
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  37383739 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-c 37383837  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttt 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37383838 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttt 37383937  T
Q  203 tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37383938 tgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagca 37384037  T
Q  303 ggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    || ||| | |||||||||||||||||    
T  37384038 ggttctcctccaggatagtctgtggt 37384063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19410669 - 19410340
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410669 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 19410570  T
Q  101 actctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410569 attctattttgttcttctactttcaaagctatacacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 19410470  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19410469 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaggataccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttaca 19410370  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19410369 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 19410340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 12592869 - 12593200
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592869 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 12592968  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca----ttttgaaaattgaaa 196  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  12592969 actccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaa 12593068  T
Q  197 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12593069 actttttgtctattttggaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 12593168  T
Q  297 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  12593169 caagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 12593200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 16167537 - 16167864
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167537 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 16167636  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167637 actctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 16167735  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167736 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagggtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 16167835  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16167836 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16167864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 27122584 - 27122909
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27122584 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctttgcttttgttt-aaa 27122682  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122683 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 27122781  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27122782 tttgtctattttgagaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaag 27122881  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27122882 caggttctcctccaggatagtctgtggt 27122909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13930729 - 13930400
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930729 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcgtgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 13930630  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaac 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13930629 actccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaac 13930530  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  13930529 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatgtgttacg 13930430  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  13930429 agcaggttctcctccaagatagtctgtggt 13930400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 3788553 - 3788879
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788553 ataaaattaccattttccaagctttataaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 3788652  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788653 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 3788751  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3788752 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgaacgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaag 3788851  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3788852 caggttctcctccaggatagtctgtggt 3788879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 34867742 - 34868068
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  34867742 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtagagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 34867840  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34867841 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 34867939  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34867940 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 34868039  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  34868040 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 34868068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9344170 - 9343843
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  9344170 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 9344072  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9344071 actctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 9343972  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9343971 ttttgtccattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 9343872  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  9343871 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 9343843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39046005 - 39045678
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  39046005 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 39045907  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39045906 actctattttctttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttccattttaataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 39045807  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39045806 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 39045707  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39045706 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39045678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 37931431 - 37931765
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931431 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 37931530  T
Q  101 actctattttt------cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattg 193  Q
    |||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37931531 actctatttttttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattg 37931630  T
Q  194 aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtg 293  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  37931631 aaaactttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatg 37931730  T
Q  294 ttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||    
T  37931731 ttacaagcaggttctcctccgggatagtctgtggt 37931765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31868968 - 31868642
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  31868968 ataaaattaccatttttcaagcattgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 31868870  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31868869 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 31868771  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31868770 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 31868671  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31868670 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31868642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 34160903 - 34161232
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34160903 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 34161002  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaa 197  Q
     ||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  34161003 -ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaa 34161101  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34161102 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtcac 34161201  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  34161202 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 34161232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 40239568 - 40239894
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239568 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 40239667  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239668 actctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 40239766  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  40239767 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttacaa 40239865  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  40239866 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 40239894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37680073 - 37679747
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  37680073 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaac 37679975  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |    
T  37679974 tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattt 37679876  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37679875 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaa 37679776  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37679775 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37679747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 37695338 - 37695012
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  37695338 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaac 37695240  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |    
T  37695239 tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattt 37695141  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37695140 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttacaa 37695041  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  37695040 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 37695012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 27782291 - 27782618
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27782291 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagccgttgcttttgtttgaaa 27782390  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27782391 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 27782489  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  27782490 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaa 27782589  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
     |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27782590 acaggttctcctccaggatagtctgtggt 27782618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 31882346 - 31882672
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  31882346 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 31882445  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31882446 t-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattaaaaact 31882543  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  31882544 ttttttctattttgaaaagcaaacttgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagaatatgttaatgtctatttcaatatatgttacaa 31882643  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31882644 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31882672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 32055861 - 32056187
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  32055861 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgactaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 32055959  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  32055960 attctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaactgaaaact 32056058  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  32056059 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatatgttacca 32056158  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  32056159 gcaggttctcctccaagataatctgtggt 32056187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12710784 - 12710457
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12710784 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 12710685  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaac 198  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12710684 t-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 12710587  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||    
T  12710586 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctaca 12710487  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  12710486 agcaggttctccttcaggatagtctgtggt 12710457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21671353 - 21671026
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  21671353 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaaac 21671255  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |    
T  21671254 tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataaagacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaattt 21671156  T
Q  200 tttt-gtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21671155 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatgtatgttaca 21671056  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  21671055 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 21671026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16823520 - 16823193
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16823520 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa 16823421  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
     |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16823420 -ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 16823322  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  16823321 ttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaa 16823222  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16823221 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16823193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 16897960 - 16898287
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  16897960 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagactgtgcttttgtttgaaa 16898059  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
     |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16898060 -ctctgttttctttttactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 16898158  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || |||||    
T  16898159 ttttgtctattttgaaaagcaaacccgagcaacagggtacaatcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctacaa 16898258  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16898259 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 16898287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11629367 - 11629041
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  11629367 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaa 11629269  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaaca-ttttgaaaattgaaaac 198  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11629268 actcta-ttttcttttattttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaataaacatttttgaaaattgaaaac 11629170  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  11629169 tctttgtctattttgaaaaacaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttaca 11629071  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  11629070 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 11629041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21697359 - 21697029
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21697359 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa 21697260  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
     ||||| | |  | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21697259 -ctctactatcttcctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 21697161  T
Q  198 c--tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtt 295  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697160 agttttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgtt 21697062  T
Q  296 acaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21697061 acaagcaggttcttccccaggatagtctgtggt 21697029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 34297215 - 34297535
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||    
T  34297215 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatctgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 34297313  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  34297314 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacatttcgaaaattgaaaaagt 34297413  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34297414 tt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaag 34297507  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    | || ||| | |||||||||||||||||    
T  34297508 cgggttctcctccaggatagtctgtggt 34297535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 27396382 - 27396718
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27396382 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 27396480  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac--aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa- 197  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  27396481 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatctttataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 27396580  T
Q  198 ---------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaat 288  Q
              ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27396581 aaaaaaaagttttttgtcctttttg-aaagcaaacctaagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaat 27396679  T
Q  289 atgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27396680 atgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 27396718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 34269104 - 34268782
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||    
T  34269104 ataaaattaccattctccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcatgtgcttttgttt-aaa 34269006  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34269005 actctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttaaaaattgaaaa 34268906  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
      ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  34268905 agtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttac 34268813  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||  ||||| | |||||||||||||||    
T  34268812 aagcagattcttctctaggatagtctgtggt 34268782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19450610 - 19450274
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  19450610 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggaatcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaattcgagcatgtgcttttgtttg-aa 19450512  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-----aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattg-- 193  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| ||| |||     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  19450511 actctattttctctctactttcaaaggtatgtacaaaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaa 19450412  T
Q  194 ----aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaata 289  Q
        |||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19450411 aaaaaaaagtttttgtctgttttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaatgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttcaata 19450313  T
Q  290 tgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19450312 tgtgttataagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 19450274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 28888338 - 28888660
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  28888338 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 28888436  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    |||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28888437 actctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 28888536  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
      |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  28888537 agttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttac 28888629  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28888630 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28888660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 23122753 - 23122434
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23122753 aaaattaccattttccaagctttgcaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaac 23122655  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  23122654 tctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt 23122555  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  23122554 tt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgctacaag 23122462  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  23122461 caggttctcctccaggatagtctgtggt 23122434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27428629 - 27428309
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27428629 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaa 27428531  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||| |||    
T  27428530 actctattttctttttactttcaaagttatgtgcaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgttcgaaacaaacatcttgaaaattgcaaa 27428431  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
      |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27428430 agt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttac 27428340  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  27428339 aagcaggttctcccccaggatagtccgtggt 27428309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 20843974 - 20844298
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20843974 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctggacaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-c 20844072  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaa-gctatatacaaaa--cattttctttctattttga-taatgacaa-tgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    |||| |||  || ||| |||||| | ||| | |||||  ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  20844073 tctactttctttttaccttcaaaagttatgttcaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa 20844172  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
      ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  20844173 agtttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttac 20844267  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20844268 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 20844298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 139 - 328
Target Start/End: Original strand, 23116993 - 23117182
Alignment:
Q  139 cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggta 238  Q
    ||||||| | |||| || || |||||||||||||||  ||   ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23116993 cattttcctcctatcttcatcatgacaatgcttgaactaacgtttttgaccattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgggcaacagggta 23117092  T
Q  239 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  23117093 cattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 23117182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 12097 - 12423
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12097 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 12196  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12197 actctatttt-cttctactttcaaagctatatataaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 12295  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12296 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaag 12395  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  12396 caggttctcctccaggatagtctgtggt 12423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 9360683 - 9361009
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9360683 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 9360782  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360783 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 9360881  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9360882 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaag 9360981  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  9360982 caggttctcctccaggatagtctgtggt 9361009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 28356107 - 28355778
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356107 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 28356008  T
Q  101 actctattttt--cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356007 attctatttttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 28355908  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355907 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 28355808  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  28355807 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 28355778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 18796770 - 18797095
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  18796770 aaaattaccattttccaagctttataaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-c 18796868  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796869 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacttt 18796968  T
Q  202 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18796969 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 18797068  T
Q  302 aggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18797069 aggttctcctccaggatagtctgtggt 18797095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31484027 - 31483698
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31484027 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 31483928  T
Q  101 actctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483927 attctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 31483828  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  31483827 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacaaggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacg 31483728  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31483727 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31483698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 31360589 - 31360916
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360589 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 31360688  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaac-attttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360689 actctatttt-cttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 31360787  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360788 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 31360887  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  31360888 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 31360916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 33248427 - 33248753
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  33248427 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 33248525  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248526 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 33248625  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  33248626 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagcgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttataag 33248725  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33248726 caggttctcctccaggatagtctgtggt 33248753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 19680510 - 19680835
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  19680510 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 19680608  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19680609 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 19680707  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19680708 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaag 19680807  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19680808 caggttctcctccaggatagtctgtggt 19680835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 29835384 - 29835710
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29835384 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgtttgaaa 29835483  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29835484 actccatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 29835582  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  29835583 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacgag 29835682  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  29835683 caggttctcctccaagataatctgtggt 29835710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 44567042 - 44567371
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44567042 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaa 44567140  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaa 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  44567141 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaa 44567239  T
Q  197 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44567240 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtta 44567339  T
Q  297 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  44567340 caagcaggttctcctccaagataatctgtggt 44567371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 15773635 - 15773962
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15773635 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacgtcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 15773734  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
     ||||  |||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15773735 -ctctgctttctttttactttcagagctatatacaaaacattttctttctcttttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 15773833  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15773834 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 15773933  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15773934 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15773962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 18715541 - 18715870
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  18715541 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 18715639  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg----aaaattgaaa 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||    
T  18715640 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaaattgaaa 18715738  T
Q  197 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18715739 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgactatttcaatatatgtta 18715838  T
Q  297 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  18715839 caagcgggttctcctccaggatagtctgtggt 18715870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21342323 - 21341998
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  21342323 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttctgtttgaaa-c 21342225  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttt 201  Q
    |||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21342224 tctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaagcatttttgaaaattgaaaacttt 21342125  T
Q  202 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342124 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 21342025  T
Q  302 aggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  21342024 aggttctcctccagaatagtctgtggt 21341998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12086876 - 12086551
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |    
T  12086876 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-c 12086778  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12086777 tctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacttt 12086678  T
Q  202 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 301  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12086677 ttgtctgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagc 12086578  T
Q  302 aggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  12086577 aggttctcctccaagataatctgtggt 12086551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19911319 - 19910990
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  19911319 ataaaattacctttttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 19911221  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    |||||||||   || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  19911220 actctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 19911121  T
Q  199 -tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911120 gtttttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 19911021  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | ||| |||||||||||||    
T  19911020 aagcaggttctcctccaagatagtctgtggt 19910990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 33264792 - 33265079
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  33264792 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 33264891  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  33264892 t-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacgaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaact 33264989  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaata 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  33264990 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgtcaatgtctatttcaata 33265079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19202518 - 19202203
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  19202518 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 19202420  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||||||||||           |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19202419 actctatttt-----------caaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 19202331  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  19202330 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctgtttcaatatatgttacaag 19202231  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  19202230 caggttctcctccaagataatctgtggt 19202203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22075085 - 22074758
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  22075085 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctaggcttttgtttgaaa 22074986  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa---cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
     ||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||    
T  22074985 -ctctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacttcttgaaaataaaaaa 22074887  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
     ||||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22074886 gtttttgtctgttttgaaa-gcaagcatgagcaacaaggtacattcaaacgaaacgtgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttac 22074788  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22074787 aagcaggctcttccctaggatagtctgtgg 22074758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 19655495 - 19655175
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19655495 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtctcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaac 19655397  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||| |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19655396 tctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaagt 19655297  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19655296 ttt------ttttg-aaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacaaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaa 19655204  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19655203 gcagactcttccccaggatagtctttggt 19655175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 27603062 - 27602742
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27603062 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttagacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 27602964  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    |||||  |||  || ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  27602963 actctgctttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 27602864  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
     ||        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27602863 gtt--------ttttgaaaagcaaacctgtgcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatgtgttac 27602773  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  27602772 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 27602742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 2131417 - 2131096
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  2131417 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcgcgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 2131319  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    |||||| |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2131318 actctactttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 2131219  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
      ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2131218 agtt-------ctttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttac 2131127  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  2131126 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 2131096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 22138970 - 22139288
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  22138970 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttg-aaac 22139068  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||      
T  22139069 tctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacgtcttgaaaattgaaaaag 22139168  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |        ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22139169 t--------ttttg-aaagcaaacttgagcaacagggtacattgaaatgaaacgtgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttacaa 22139259  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  22139260 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 22139288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16260284 - 16260480
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260284 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgcggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 16260383  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16260384 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgcttgaaacaaacattttgaaaatcgaaaac 16260480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 19694159 - 19694479
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19694159 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgttt-aaaac 19694257  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||   |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||      
T  19694258 tccgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaaag 19694357  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  19694358 ttt------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaa 19694450  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| | ||| | |||||||||||||||||    
T  19694451 gcaagttctcctccaggatagtctgtggt 19694479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 14569217 - 14569542
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14569217 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 14569315  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctat-----atacaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattg 193  Q
    |||||  |||  || ||||||||||| |||     | | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  14569316 actctgctttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattg 14569415  T
Q  194 aaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtg 293  Q
    ||||  ||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||    
T  14569416 aaaaagtt-------ttttgaaagacaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatacatg 14569507  T
Q  294 ttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  14569508 ttacaagcaggttctcctccaggatattctgtggt 14569542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4139326 - 4138997
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139326 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 4139227  T
Q  101 actctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139226 attctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 4139127  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4139126 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttaca 4139027  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4139026 agcaggttctcctccaagataatctgtggt 4138997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24586613 - 24586287
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||     
T  24586613 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgctttcgttt-aag 24586515  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586514 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttcttcctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 24586415  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586414 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 24586315  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24586314 caggttctcctccaggatagtctgtggt 24586287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 5164442 - 5164769
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5164442 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 5164541  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagc-tatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5164542 -ctctatttttcttctactttcaaagcctatatacaaaacattttctttctattttgataataacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacc 5164640  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164641 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 5164740  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5164741 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5164769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26679184 - 26678856
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26679184 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaa 26679085  T
Q  101 actctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679084 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 26678985  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678984 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 26678885  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26678884 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26678856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 26441311 - 26441639
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26441311 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccgccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttaaaa 26441410  T
Q  101 actctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441411 actccattttttcttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 26441510  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26441511 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtgtgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 26441610  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26441611 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26441639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26663992 - 26663664
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26663992 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttacttttgtttgaaa 26663893  T
Q  101 actctattttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663892 actctattttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttatattttgataacgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 26663793  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663792 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacggggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 26663693  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  26663692 gcaggttcccctccaggatagtctgtggt 26663664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 5141414 - 5141086
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141414 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 5141315  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141314 actcta-ttttcttctactttcaaagttatatacaaaaatattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 5141216  T
Q  200 ttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5141215 ttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaatatatgttaca 5141116  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5141115 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 5141086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31558473 - 31558146
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31558473 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccacttttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 31558374  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31558373 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatacttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 31558275  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31558274 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 31558175  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  31558174 gcaggttctccttcaggatagtctgtggt 31558146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39207218 - 39206891
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39207218 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 39207119  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39207118 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaatattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 39207020  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39207019 ttttgtttattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaa 39206920  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  39206919 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 39206891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 5154142 - 5154468
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5154142 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 5154241  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
     ||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5154242 -ctctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 5154340  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154341 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacatccaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 5154440  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  5154441 caggttctcctccaggatagtctgtggt 5154468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 26518851 - 26519176
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  26518851 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 26518949  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26518950 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 26519048  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26519049 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaag 26519148  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26519149 caggttctcctccaggatagtctgtggt 26519176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16745600 - 16745272
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16745600 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 16745501  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt--gaaaattgaaaac 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16745500 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttgaaaattgaaaac 16745402  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745401 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtatattcaaacgaaacatgcatgaatgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 16745302  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| | ||| |  ||||||||||||||||    
T  16745301 agcaagttctccttcaggatagtctgtggt 16745272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26509773 - 26509471
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26509773 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaaac 26509674  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa-cttt 201  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26509673 tccatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaccttt 26509574  T
Q  202 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||    
T  26509573 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatacatgtcacaagc 26509474  T
Q  302 agg 304  Q
    |||    
T  26509473 agg 26509471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 45737359 - 45737688
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  45737359 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccacccctcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 45737457  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaaa 196  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  45737458 actctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaaa 45737556  T
Q  197 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  45737557 actttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatatctatttcaatatatgtta 45737656  T
Q  297 caagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  45737657 caagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 45737688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 25 - 328
Target Start/End: Original strand, 26595750 - 26596055
Alignment:
Q  25 tgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttt-cttctactttca 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26595750 tgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaactctattttttcttctactttca 26595849  T
Q  124 aagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595850 aagctatatacaacacattttctttttattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaa 26595949  T
Q  223 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26595950 cctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagtgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggttctcctccaggatagtc 26596049  T
Q  323 tgtggt 328  Q
    ||||||    
T  26596050 tgtggt 26596055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 4205448 - 4205774
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  4205448 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 4205546  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaa-ttgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  4205547 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaaattgaaaacc 4205645  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4205646 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttggtgtctatttcaatatgtgttacaa 4205745  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  4205746 gcaggttctcctccaagataatctgtggt 4205774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26269168 - 26268837
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26269168 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa 26269069  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt----gaaaattgaa 195  Q
     |||| ||||  || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  26269068 -ctctgttttctttttactttcaaagctatgtacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttttttgaaaattgaa 26268970  T
Q  196 aactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgtt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26268969 aactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgtt 26268870  T
Q  296 acaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  26268869 acaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 26268837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 11418858 - 11418531
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  11418858 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcgatttgagcctgtgcttttgtttgaaa 11418759  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
     ||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11418758 -ctctactttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 11418660  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418659 ttctgtctgttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcacgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 11418560  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||  || | |||||||||||||||||    
T  11418559 gcaggtcctcctccaggatagtctgtggt 11418531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26313926 - 26313601
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  26313926 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 26313828  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26313827 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaacct 26313729  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26313728 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaag 26313629  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  26313628 caggttctcctccaagataatctgtggt 26313601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 2160628 - 2160957
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  2160628 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 2160726  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    |||||||||   || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2160727 actctatttcctttttactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 2160826  T
Q  199 -tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
     ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160827 gtttttgtctatttttgaaagcaaatctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 2160926  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2160927 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 2160957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 16444083 - 16443755
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16444083 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcgcctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgttt-aaa 16443985  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa--cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  16443984 actctactttctttctactttcaaagctatgtacaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 16443885  T
Q  199 -tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443884 gtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcatatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 16443786  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16443785 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 16443755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 31084699 - 31084374
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||      
T  31084699 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggttgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaat- 31084601  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  31084600 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatggcaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaattttt 31084501  T
Q  202 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31084500 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcataagcgagagtatgtcgatgtctatttcaatatatgttacaagc 31084401  T
Q  302 aggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  31084400 aggttctcctccaagataatctgtggt 31084374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 45393277 - 45393604
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  45393277 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttacacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaa 45393375  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45393376 actctacttttcttctactttcaaagctatacacaaatcattttccttctattttgataatgacaatgcctgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 45393475  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  45393476 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatggtgatgtccatttcagtatatgttacaa 45393575  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  45393576 gcaggttctccttcaggatagtctgtggt 45393604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 11446946 - 11447273
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11446946 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 11447045  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttg--aaaattgaaaac 198  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  11447046 t-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaaattgaaaac 11447143  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| || ||||    
T  11447144 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaagtgaaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctatttcaatatatgctaca 11447243  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  11447244 agcaggttctccttcaggatagtctgtggt 11447273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 16047373 - 16047697
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16047373 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttg-aa 16047471  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||| |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  16047472 actctactttctttctactgtcaaagctatgtacaaaa-attttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcctgaaaattgaaaagtt 16047570  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16047571 tttgtctattttg-aaagcaagcctgagcaacaggatacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatatgtgttacaag 16047669  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16047670 caggttcttccccgggatagtctgtggt 16047697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 3451376 - 3451704
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  3451376 ataaaattaccattttccaagttttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagctggtgcttttgtttgaaa 3451475  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaa 197  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  3451476 t-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaa 3451573  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  3451574 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacaatcaaatggaacatgcatgagcgagggtatgtgaatgtctattccaatatatgttac 3451673  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  3451674 aagcaggttctcctccaggatagtatgtggt 3451704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 2779310 - 2779631
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  2779310 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 2779408  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  2779409 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 2779508  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779509 ttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 2779603  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  2779604 caggttctcctccaggatagtctttggt 2779631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 31129963 - 31130284
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  31129963 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatctatttgagcttgtgcttttgtttg-aa 31130061  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    |||||  |||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31130062 actctgctttctttttactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgataatgctcgaaacaaacattttgaaaattgaaaaagt 31130161  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31130162 ttt-----ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgagacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaag 31130256  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||||||    
T  31130257 caggttctcctccaggataatctgtggt 31130284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 10847641 - 10847970
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||    
T  10847641 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcctgtgcttttgtctg-aa 10847739  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10847740 actctattttctctctactttcaaagctatgtacaaaaaaacattttctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 10847839  T
Q  198 ---ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgt 294  Q
        ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||||    
T  10847840 aagttttttgtctgttttg-aaagtaaacctgagcaacaaggtacgttcaaacgaaacgtgcatgagtgagcgtatgtcgatgtctatttca--atgtgt 10847936  T
Q  295 tacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10847937 tacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 10847970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 10910999 - 10910678
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  10910999 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aa 10910901  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    ||||||||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  10910900 actctattttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaagcatcttgaaaattgaaaa 10910801  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
      ||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10910800 agtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacatggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtatgttggtgtctatttcaatatatgttac 10910709  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10910708 aagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10910678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16512513 - 16512194
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  16512513 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttaagcctgtgcttttgtttg-aa 16512415  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    |||||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||    
T  16512414 actctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgataattggaaa 16512315  T
Q  198 ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttac 297  Q
      |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||||    
T  16512314 agt--------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaatatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacatatgttac 16512223  T
Q  298 aagcaggctcttccccaggatagtctgtg 326  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16512222 aagcaggttctcctccaggatagtctgtg 16512194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9834 - 9508
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9834 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgctttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 9735  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9734 -ctctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 9636  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  9635 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttataag 9536  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  9535 caggttctcctccaggatagtctgtggt 9508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 3374 - 3045
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3374 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 3275  T
Q  101 actctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3274 attctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 3175  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3174 cttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttaca 3075  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  3074 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 3045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 83 - 328
Target Start/End: Original strand, 17949 - 18196
Alignment:
Q  83 ctttgcttttgtttgaaaactctatttt--tcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 180  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17949 ctttgcttttgtttgaaaattctattttgttcttctactttcaaagctatatacaaaacattctctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaac 18048  T
Q  181 attttgaaaattgaaaactttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 280  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049 attttgaaaattgaaaaccttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtaccttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtct 18148  T
Q  281 atttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18149 atttcaatatatgttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 4795 - 4469
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |    
T  4795 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa-c 4697  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  4696 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtt 4597  T
Q  201 tttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 300  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4596 tttgtctatttttgaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaag 4497  T
Q  301 caggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496 caggctcttccccaggatagtctgtggt 4469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 18649 - 18975
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  18649 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggggtcacgcctccggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgttt-aaaac 18747  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt---gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  18748 tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgctcgaaacaaacatttttttgaaaattgaaaact 18846  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18847 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 18946  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18947 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 18975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 9121 - 8795
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9121 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgcctttggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 9022  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  9021 t-tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacgaacatttttgaaaattaaaaact 8924  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8923 ttttgtctattttgaaaagcaaacttgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 8824  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8823 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 8795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 9975 - 10301
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  9975 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccatgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcctgtgcttttgttt-aaa 10073  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaact 199  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10074 actctatttt-cttctattttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttgataatgacaatgtttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaact 10172  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10173 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcataagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatatgttacaa 10272  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10273 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 10301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 33361 - 33682
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33361 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaac 33459  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttctattttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaactt 200  Q
    ||| ||||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  33460 tctgttttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctattttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagt 33559  T
Q  201 tttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  33560 ttt-----ttttgtaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttacaa 33653  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  33654 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 33682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 1721 - 2045
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  1721 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttgaaa-c 1819  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1820 tctatttt-cttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttccattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacttt 1918  T
Q  202 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 301  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1919 ttgtttactttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacgatcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagc 2018  T
Q  302 aggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| ||| | || ||||||||||||||    
T  2019 aggttctcctccgggatagtctgtggt 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 12107 - 12445
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattt-gagcctttgcttttgtttgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12107 ataaaattaccattttccaagctttgtaaatccatggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattttgagcctgtgcttttgtttgaa 12206  T
Q  100 aactctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaa-----------cattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaa 188  Q
    | ||||| | |  |||||||||||||||||| || ||||           ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12207 a-ctctactatctttctactttcaaagctatgtaaaaaaaaaaaaaaaaacatttgctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaa 12305  T
Q  189 aattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaa 287  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12306 aattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagggtatgttgatgtctatttcaa 12404  T
Q  288 tatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12405 tatgtgttacaagcaggctcttctccaggatagtctgtggt 12445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 14013 - 14338
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||||| |    
T  14013 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgccttcggctgaccaccactcttatacatcaaattgagcttgtgctgttgtttgaaa-c 14111  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttt-gaaaattgaaaacttt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14112 tctatttttcttctactttcaaagctgtatacaaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacatttttgaaaattgaaaacttt 14211  T
Q  202 ttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagc 301  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  14212 ttgtgtgttttgaaaagcaagcctgagcaacagggtacgttcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttaatgtctatttcaatatatgttacaagc 14311  T
Q  302 aggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  14312 aggttctcctccaagataatctgtggt 14338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 328
Target Start/End: Original strand, 15630 - 15964
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15630 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcatgcctttggctgaccaccactcttatacatcaagttgagcctttgcttttgtttgaaa 15729  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttctttctatttt-gataatgacaatgcttgaaacaaaca------ttttgaaaattg 193  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||      ||||||||||||    
T  15730 actcta-ttttcttctactttcaaagctatatacaaaacattttccttctattttaaacgatgacaatgctcgaaacaaacattttttttttgaaaattg 15828  T
Q  194 aaaactttttgtctattttg-aaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgt 292  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15829 aaaactttttgtctattttgaaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatat 15928  T
Q  293 gttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  15929 gttacaagcaggttctcctccaggatagtctgtggt 15964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 25176 - 25510
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  25176 ataaaattgccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacaccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgcgcttttgtttg-aa 25274  T
Q  101 actctatttttcttctactttcaaagctatatac---aaaacattttctttctattttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaa 197  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25275 actctactttctttctactttcaaagctatgtacgaaaaaacattatctttctatcttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaa 25374  T
Q  198 -------ctttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatat 290  Q
            ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25375 aaaaaagttttttgtctgttttg-aaagcaaacctgagcaacaaggtacattcaaacgaaacatgcatgagcgagcgtatgtcgatgtctatttcaatat 25473  T
Q  291 gtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25474 gtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtgg 25510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Original strand, 6130 - 6451
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||    
T  6130 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcatattgagcctgtgcttttgtttg-aaac 6228  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatat--acaaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac 198  Q
    |||| |||  || ||||||||||| ||| |  | ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  6229 tctactttctttttactttcaaagttatgttcaaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaa 6328  T
Q  199 tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttaca 298  Q
     ||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  6329 gtt-------ttttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaatatatgttaca 6421  T
Q  299 agcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  6422 agcaggttctcctccaggatagtctgtggt 6451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25092 - 24772
Alignment:
Q  3 aaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaaac 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25092 aaaattaccattttccaagctttgtaaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctgtgcttttgtttg-aaac 24994  T
Q  103 tctatttttcttctactttcaaagctatatac-aaaacattttctttcta-ttttgataatgac-aatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaact 199  Q
    |||  |||  || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  24993 tctgctttctttttactttcaaagttatgtacaaaaacattttccttctatttttaataatgacaaatgctcgaaacaaacatcttgaaaattgaaaatt 24894  T
Q  200 ttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaacatgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaa 299  Q
    |||      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  24893 ttt------ttttgaaaagaaaacctgagcaacagggtacattcaaacg-aacatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctgtttcaatatatgttacaa 24801  T
Q  300 gcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  24800 gcaggttctcctccaggatagtctgtggt 24772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 154 - 328
Target Start/End: Original strand, 1 - 175
Alignment:
Q  154 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacattttgaaaattgaaaac-tttttgtctattttgaaaagcaaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaac 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1 ttgataatgacaatgcttgaaacaaacatcttgaaaattgaaaaagtttttgtctattttgaaa-gcaaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaac 99  T
Q  253 atgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatatgtgttacaagcaggctcttccccaggatagtctgtggt 328  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  100 atgcatgagcaagtgtatgttgatgtctatttcaatatgtgctacaagcaggctcttccctaggatagtctgtggt 175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 438 - 537
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcctttgcttttgtttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  438 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactctcatacatcaatttgagcttgtgcttttgtttgaaa 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 26326 - 26243
Alignment:
Q  1 ataaaattaccattttccaagctttgtgaatccgtggagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaatttgagcct 84  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26326 ataaaatttccatttttcaagctttgtaaatctgtgaagtcacgccttcggctgaccaccactcttatacatcaattcgagcct 26243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 219 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 40606 - 40495
Alignment:
Q  219 caaacctgagcaacagggtacattcaaatgaaa-catgcatgagcgagagtatgttgatgtctatttcaatat-gtgttacaagcaggctcttccccagg 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | |||||    
T  40606 caaacctgagcaacagggtacattcaaacgaaataatgcatgagcgagtgtgtgttggtgtctatttcaacataatgttacaagcaggttctcctccagg 40507  T
Q  317 atagtctgtggt 328  Q
    ||||| ||||||    
T  40506 atagtatgtggt 40495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 40838 - 40729
Alignment:
Q  3 aaaattaccatttt-ccaagcttt-gtgaatccgt-ggagtcacgccttcggct-gaccaccactcttatacatcaa-tttgagcctttgctttt--gtt 95  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||   ||    
T  40838 aaaattaccatttttccaagcttttgtaaatccgttggagtcacgccttcggcttgaccaccactcttatacatcaattttgagtctgtgctttttgttt 40739  T
Q  96 tgaaaactct 105  Q
    ||||||||||    
T  40738 tgaaaactct 40729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University