View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF5243-Insertion-2 (Length: 749)
Name: NF5243-Insertion-2
Description: NF5243
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF5243-Insertion-2 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 633; Significance: 0; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 633; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 729
Target Start/End: Original strand, 37401121 - 37401845
Alignment:
| Q |
5 |
acaaggacatcttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagt |
104 |
Q |
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| T |
37401121 |
acaaggagatcttccaattccaccttctggcattgaatacttttcactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgcaatgcaagt |
37401220 |
T |
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| Q |
105 |
tccctttataccctcaatttggctcacaacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttca |
204 |
Q |
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| T |
37401221 |
tcccttcgtaccctcaatttggctcacaacaactttcaaggagatcttccaattccaccttctggcattcaatacttttcactctcaaataacaacttca |
37401320 |
T |
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| Q |
205 |
caggatacatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaac |
304 |
Q |
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| T |
37401321 |
caggatacatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgacaggtatgattccacaatgcctgggaac |
37401420 |
T |
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| Q |
305 |
attaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttg |
404 |
Q |
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| T |
37401421 |
attaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccaaaggaaatgcatttgagactataaagttg |
37401520 |
T |
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| Q |
405 |
aatggcaaccaattggaaggagcattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttc |
504 |
Q |
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| T |
37401521 |
aatggcaaccaattggaaggaccattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttc |
37401620 |
T |
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| Q |
505 |
ctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcc |
604 |
Q |
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| T |
37401621 |
ctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcc |
37401720 |
T |
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| Q |
605 |
caagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagc |
704 |
Q |
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| T |
37401721 |
caagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacaat |
37401820 |
T |
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| Q |
705 |
caaattggtttgcaatacaagggtg |
729 |
Q |
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| T |
37401821 |
aacactggtttgcaatacatgggtg |
37401845 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 620; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 37639782 - 37639059
Alignment:
| Q |
6 |
caaggacatcttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagtt |
105 |
Q |
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| T |
37639782 |
caaggacatcttccaattccacctgatggcattgtatactttttactctcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattccgcaacgcaagtt |
37639683 |
T |
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| Q |
106 |
ccctttataccctcaatttggctcacaacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttcac |
205 |
Q |
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| T |
37639682 |
ccctttataccctcaatttggctcacaacaactttcaaggagatcttccaattccaccttctggcattaaatacttttcactctcaaataacaacttcac |
37639583 |
T |
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| Q |
206 |
aggatacatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaaca |
305 |
Q |
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| T |
37639582 |
aggatacatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgacaggtatgattccacaatgcctgggaaca |
37639483 |
T |
|
| Q |
306 |
ttaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttga |
405 |
Q |
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| T |
37639482 |
ttaacttctcttactgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttctccaaaggaaatgcatttgagactataaagttga |
37639383 |
T |
|
| Q |
406 |
atggcaaccaattggaaggagcattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcc |
505 |
Q |
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| T |
37639382 |
atggcaaccaattggaaggaccattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcc |
37639283 |
T |
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| Q |
506 |
tgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttccc |
605 |
Q |
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| T |
37639282 |
tgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttccc |
37639183 |
T |
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| Q |
606 |
aagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagcc |
705 |
Q |
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| T |
37639182 |
aagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacaata |
37639083 |
T |
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| Q |
706 |
aaattggtttgcaatacaagggtg |
729 |
Q |
| |
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| T |
37639082 |
acactggtttgcaatacatgggtg |
37639059 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 602; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 6 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 37711540 - 37710823
Alignment:
| Q |
6 |
caaggacatcttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagtt |
105 |
Q |
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| T |
37711540 |
caaggagatcttccaattccaccatctggcattcaatacttttcactctcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattccgcaacgcaagtt |
37711441 |
T |
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| Q |
106 |
ccctttataccctcaatttggctcacaacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttcac |
205 |
Q |
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| T |
37711440 |
ccctttataccctcaatttggctcacaacaactttcaaggagatcttccaattccaccttctggcattcaatacttttcactctcaaataacaacttcac |
37711341 |
T |
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| Q |
206 |
aggatacatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaaca |
305 |
Q |
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| T |
37711340 |
aggatacatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctaggaaca |
37711241 |
T |
|
| Q |
306 |
ttaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttga |
405 |
Q |
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| T |
37711240 |
tttcctaatctctatgttttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccaaaggaaatgcatttgagactataaagttga |
37711141 |
T |
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| Q |
406 |
atggcaaccaattggaaggagcattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcc |
505 |
Q |
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| T |
37711140 |
atggcaaccaattggaaggatcattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcc |
37711041 |
T |
|
| Q |
506 |
tgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttccc |
605 |
Q |
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| T |
37711040 |
tgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttccc |
37710941 |
T |
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| Q |
606 |
aagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagcc |
705 |
Q |
| |
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| T |
37710940 |
aagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccagcatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaaggtgaatgacaaaa |
37710841 |
T |
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| Q |
706 |
aaattggtttgcaataca |
723 |
Q |
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| T |
37710840 |
aaattgatctgcaataca |
37710823 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 557; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 37594241 - 37593497
Alignment:
| Q |
5 |
acaaggacatcttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagt |
104 |
Q |
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| T |
37594241 |
acaaggagatcttccaattccaccttctggcattcaatacttttcactctcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagt |
37594142 |
T |
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| Q |
105 |
tccctttataccctcaatttggctcacaacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttca |
204 |
Q |
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| T |
37594141 |
tccctttataccctcaatttggctcacaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaactatttactctcaaacaacaatttca |
37594042 |
T |
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| Q |
205 |
caggatacatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaac |
304 |
Q |
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| T |
37594041 |
caggagatatatcttcaacattctgcaatgcaagttacctgaatgttctcaatttggctcacaacaatttaacaggtatgattccacaatgcctgggaac |
37593942 |
T |
|
| Q |
305 |
attaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttg |
404 |
Q |
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|
|
| T |
37593941 |
attaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaaacattcctagaaccttttccaaagaaaatgcatttcagactataaagttg |
37593842 |
T |
|
| Q |
405 |
aatggcaaccaattggaaggagcattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttc |
504 |
Q |
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| T |
37593841 |
aatggaaaccaattggaaggaccattaccacagtctttgtctcactgttcatttcttgaagttttggaccttggtgacaacaacatagaggacacatttc |
37593742 |
T |
|
| Q |
505 |
ctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcc |
604 |
Q |
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| T |
37593741 |
caaattggctagaaactctacaagagttacaagttctaagcttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacttgttctagcaccaagcattcatttcc |
37593642 |
T |
|
| Q |
605 |
caagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagc |
704 |
Q |
| |
|
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|
| T |
37593641 |
taagttgagaatttttgatgtttctatcaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagc |
37593542 |
T |
|
| Q |
705 |
caaattggtttgcaatacaagggtgtgggttattactataatgat |
749 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37593541 |
caaattggtttgcaatacaagggtgtgggttattactataatgat |
37593497 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 537; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 37696632 - 37695888
Alignment:
| Q |
5 |
acaaggacatcttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagt |
104 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
37696632 |
acaaggagatcttccaattccaccttctagcattggatacttttcactctcaaacaacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagt |
37696533 |
T |
|
| Q |
105 |
tccctttataccctcaatttggctcacaacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttca |
204 |
Q |
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|
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| T |
37696532 |
tccctttataccctcaatttggctcacaacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaactatttactctcaaacaacaatttca |
37696433 |
T |
|
| Q |
205 |
caggatacatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaac |
304 |
Q |
| |
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| T |
37696432 |
caggagatatatcttcaacattctgcaatgcaagttacctgaatgttctcaatttggctcacaacaatttaacaggtatgattccacaatgcctgggaac |
37696333 |
T |
|
| Q |
305 |
attaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttg |
404 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37696332 |
attaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaaacattcctagaaccttttccaaagaaaatgcatttcagactataaagttg |
37696233 |
T |
|
| Q |
405 |
aatggcaaccaattggaaggagcattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttc |
504 |
Q |
| |
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| T |
37696232 |
aatggaaaccaattggaaggaccattaccacagtctttgtctcactgttcatttcttgaagttttggaccttggtgacaacaacatagaggacacatttc |
37696133 |
T |
|
| Q |
505 |
ctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcc |
604 |
Q |
| |
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| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |
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|
| T |
37696132 |
caaattggctagaaactctacaagagttacaagttctaagcttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacttgttctagcaccaagcattcatttcc |
37696033 |
T |
|
| Q |
605 |
caagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagc |
704 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37696032 |
taagttgagaatttttgatgtttctatcaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagc |
37695933 |
T |
|
| Q |
705 |
caaattggtttgcaatacaagggtgtgggttattactataatgat |
749 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37695932 |
caaattggtttgcaatacaagggtgacggttattactataatgat |
37695888 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 531; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 131 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 37823815 - 37823217
Alignment:
| Q |
131 |
caacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgc |
230 |
Q |
| |
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|
| T |
37823815 |
caacaagttacaaggagatcttccaattccaccttctggcattcaatacttttcactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgc |
37823716 |
T |
|
| Q |
231 |
aatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattggata |
330 |
Q |
| |
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|
| T |
37823715 |
aatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgacaggtatgattccacaatgcctgggaacattaaattctcttcatgtattggata |
37823616 |
T |
|
| Q |
331 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggagcatt |
430 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37823615 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccatt |
37823516 |
T |
|
| Q |
431 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
530 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37823515 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
37823416 |
T |
|
| Q |
531 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
630 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37823415 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
37823316 |
T |
|
| Q |
631 |
acaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagccaaattggtttgcaatacaagggtg |
729 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37823315 |
acaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgagtgacgaccaaattggtttgcaatacatgggtg |
37823217 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 455; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 131 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 37533011 - 37532393
Alignment:
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131 |
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230 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37533011 |
caacaagttacaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatacttttcactctcaaataacaacttcacaggagatatttcttcaacattctgc |
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T |
|
| Q |
231 |
aatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattggata |
330 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37532911 |
aatgcaagttacctgaatgttctcaatttggctcacaacaatttgacaggtatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattggata |
37532812 |
T |
|
| Q |
331 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggagcatt |
430 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37532811 |
tgcaaatgaacaacctctatggaaacattcctagaaccttttccaaagaaaatgcatttcagactataaagttgaatggaaaccaattggaaggaccatt |
37532712 |
T |
|
| Q |
431 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
530 |
Q |
| |
|
||| || |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37532711 |
accccagtctttgtctcactgttcatttcttgaagttttggaccttggtgacaacaacatagaggacacatttccaaattggctagaaactctacaagag |
37532612 |
T |
|
| Q |
531 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
630 |
Q |
| |
|
||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37532611 |
ttacaagttctaagcttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacttgttctagcaccaagcattcatttcctaagttgagaatttttgatgtttcta |
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T |
|
| Q |
631 |
acaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagccaaattggtttgcaatacaagggtgt |
730 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37532511 |
acaacaattttagtgggcccttgccaatatcatgcatcaagaactttaaaggaatgatgaatgtgaatgacagccaaattggtttgcaatacaagggtgc |
37532412 |
T |
|
| Q |
731 |
gggttattactataatgat |
749 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37532411 |
gggttattactataatgat |
37532393 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 131 - 728
Target Start/End: Original strand, 37393126 - 37393723
Alignment:
| Q |
131 |
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230 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
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caacaagttacaaggtgatcttccaattccacctgatggcattgaagactttttactctcaaacaacaacttcacaggagatatttcttcaacattctgc |
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T |
|
| Q |
231 |
aatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattggata |
330 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||| | | ||||||| |
|
|
| T |
37393226 |
aatgctagttccctttatatcctcaatttggctcacaacaatttgacaggtatgattccacaatgtctaggaacattttcttatctctctattttggata |
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T |
|
| Q |
331 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggagcatt |
430 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37393326 |
tgcaaatgaacaacctctgtggaagcattcctggaaccttttccaaaggaaatatatttgagactataaaattgaatggaaaccaattggaaggaccatt |
37393425 |
T |
|
| Q |
431 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
530 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37393426 |
accacaatgtttggcttactgttcatatcttgaagtattggaccttggtgacaacaacatagaggatacttttcccaattggctagaaactctacaagag |
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T |
|
| Q |
531 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
630 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37393526 |
ttacaggtgctaagtttacgatcaaatcatcttcatgggtcaatcacatgttctagcaccaagcatccatttcctaagttgagaatttatgatgtctcta |
37393625 |
T |
|
| Q |
631 |
acaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagccaaattggtttgcaatacaagggt |
728 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37393626 |
gtaacaattttagtggccccttgccaacatcatgcttcaagaactttcaaggaatgatggatgtgaataacagccaaattggtttgcaatacatgggt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 141 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 37702584 - 37702023
Alignment:
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240 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37702584 |
caaggacatcttccaattccacctcatggcattgtacactttttactctcaaacaacaacttcacaggaaatatctcttcaacattctgcaatgcaagtt |
37702485 |
T |
|
| Q |
241 |
ccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaa |
340 |
Q |
| |
|
||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| | | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37702484 |
ccctttacattctcaatttggctcacaacaatttgacaggtatgattccacaatgtctgggaacatttcctcatctctctattttggatatgcaaatgaa |
37702385 |
T |
|
| Q |
341 |
caacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggagcattaccacaatct |
440 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37702384 |
caacctctatggaagcattcctagaaccttctccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccgcagtct |
37702285 |
T |
|
| Q |
441 |
ttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagagttacaggtga |
540 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37702284 |
ttggctcaatgttcaaatcttgaagtattggaccttggtgacaacaacatagaggatacatttcccaattggctagaaactttaccagagttacaggtgc |
37702185 |
T |
|
| Q |
541 |
taagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattt |
640 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37702184 |
tgagtttacgatcaaatcatcttcatggtgcaatcacttgttctagcaccaagcattcatttcctaagttgagaatttttgatgcctctaacaacaattt |
37702085 |
T |
|
| Q |
641 |
tagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgaca |
702 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
37702084 |
tagtggccccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgattaatgtaaatgaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 131 - 728
Target Start/End: Original strand, 37382575 - 37383172
Alignment:
| Q |
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230 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || |||| ||| |
|
|
| T |
37382575 |
caacaagttgcaaggagatcttccaatcccacgttatggcatttactactttttactctcgaacaacaacttcacaggaaacattgatttttcattgtgc |
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T |
|
| Q |
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aatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattggata |
330 |
Q |
| |
|
|| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37382675 |
aacgcaagttccctgaatgtgctcaatttggctcacaacaatttaactggcatgattccacaatgcttgggaacatttccttctctttcggtattggata |
37382774 |
T |
|
| Q |
331 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggagcatt |
430 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
37382775 |
tgcaaatgaacaacctctatggacacattcctagaaccttctccaaaggaaatgcatttgagacaataaagttgaatggaaaccgattggaaggaccatt |
37382874 |
T |
|
| Q |
431 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
530 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| ||||| || | || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||| |
|
|
| T |
37382875 |
accacagtctttggctcactgtacaaaactcgaagttttggaccttggagacaacaacgtagaggatacttttcccaattggcttgaaactctacaagaa |
37382974 |
T |
|
| Q |
531 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
630 |
Q |
| |
|
||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37382975 |
ttacaggtgctcagtttaagatcaaataaacttcatggcgcaatcacatgctctagcaccaaacatccatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
37383074 |
T |
|
| Q |
631 |
acaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagccaaattggtttgcaatacaagggt |
728 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37383075 |
acaacaattttattgggcccttgccaacatcgtgcatcaagaattttcaaggaatgatgaatgtgaatgacaataacactggtttgcaatacatgggt |
37383172 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 131 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 37435621 - 37435024
Alignment:
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230 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
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T |
|
| Q |
231 |
aatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattggata |
330 |
Q |
| |
|
| || || ||| | | |||||| ||||||| |||||||| |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
37435521 |
caagcaagctccatgaacgtgctcaatttggcccacaacaaattgacaggcataattccaaaatgcctgggaacatttccttttctttccgttttggata |
37435422 |
T |
|
| Q |
331 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggagcatt |
430 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |
|
|
| T |
37435421 |
tgcaaatgaacaaccttaatggaagcatgcctaaaactttttccagaggaaatgccttcgagactataaagttgaatggcaaccaattagaaggaccatt |
37435322 |
T |
|
| Q |
431 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
530 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||| ||||| || | || || ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37435321 |
acctcaatctttggctcactgtacagaactcaaaattttggaccttggatacaacaacatagaggatacatttcccaattggctagaaactctacaagag |
37435222 |
T |
|
| Q |
531 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
630 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| | ||| | ||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37435221 |
ttacaggtactcagtttaagatcaaataaacttaatggttcaatcacctgttctaacaccaaccatcctttttctaagttaagaatttttgacatcttcg |
37435122 |
T |
|
| Q |
631 |
acaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagccaaattggtttgcaatacaagggt |
728 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37435121 |
gtaacaattttagtggatccttgccaacatcatgtatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgatagccagattggtttgcaatacatgggt |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 264 - 625
Target Start/End: Original strand, 37413547 - 37413908
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| Q |
264 |
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363 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
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cacaacaatttaacaggcatgattccacaatgcctaggaacatttccttctctttctatattggatatgcaaatgaacaacttgtatggaagctttccta |
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T |
|
| Q |
364 |
gaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggagcattaccacaatctttggctaactgttcatatcttga |
463 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| ||||||||| | || | ||||||| |
|
|
| T |
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gaaccttttccaaaggaaatacatttgagatgataaagttgaacggaaatcaattggaaggaccattaccacagtctttggcttagtgcataaatcttga |
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T |
|
| Q |
464 |
agttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatctt |
563 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37413747 |
agttctggaccttggtgacaacaatatagaggatacatttcccaattggctagaaactctacaagagttacaggtgctaagtttacgatcaaataatctt |
37413846 |
T |
|
| Q |
564 |
catggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgt |
625 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
37413847 |
catggtgcaatcacctgttctagcacaaagcatacatttcccaagttgagaatattttatgt |
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T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37823806 - 37823672
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5 |
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104 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
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acaaggagatcttccaattccaccttctggcattcaatacttttcactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgcaatgccagt |
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T |
|
| Q |
105 |
tccctttataccctcaatttggctcacaacaattt |
139 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37823706 |
tccctttatatgctcgatttggctcacaacaattt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 139
Target Start/End: Original strand, 37393143 - 37393269
Alignment:
| Q |
13 |
atcttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagttcccttta |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37393143 |
atcttccaattccacctgatggcattgaagactttttactctcaaacaacaacttcacaggagatatttcttcaacattctgcaatgctagttcccttta |
37393242 |
T |
|
| Q |
113 |
taccctcaatttggctcacaacaattt |
139 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37393243 |
tatcctcaatttggctcacaacaattt |
37393269 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37702584 - 37702451
Alignment:
| Q |
6 |
caaggacatcttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagtt |
105 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37702584 |
caaggacatcttccaattccacctcatggcattgtacactttttactctcaaacaacaacttcacaggaaatatctcttcaacattctgcaatgcaagtt |
37702485 |
T |
|
| Q |
106 |
ccctttataccctcaatttggctcacaacaattt |
139 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37702484 |
ccctttacattctcaatttggctcacaacaattt |
37702451 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 271
Target Start/End: Original strand, 37401112 - 37401252
Alignment:
| Q |
131 |
caacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgc |
230 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37401112 |
caacaagttacaaggagatcttccaattccaccttctggcattgaatacttttcactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgc |
37401211 |
T |
|
| Q |
231 |
aatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaa |
271 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37401212 |
aatgcaagttcccttcgtaccctcaatttggctcacaacaa |
37401252 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 131 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37696641 - 37696498
Alignment:
| Q |
131 |
caacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgc |
230 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37696641 |
caacaagttacaaggagatcttccaattccaccttctagcattggatacttttcactctcaaacaacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgc |
37696542 |
T |
|
| Q |
231 |
aatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaattt |
274 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37696541 |
aatgcaagttccctttataccctcaatttggctcacaacaattt |
37696498 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 37594250 - 37594110
Alignment:
| Q |
131 |
caacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgc |
230 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37594250 |
caacaagttacaaggagatcttccaattccaccttctggcattcaatacttttcactctcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgc |
37594151 |
T |
|
| Q |
231 |
aatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaa |
271 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37594150 |
aatgcaagttccctttataccctcaatttggctcacaacaa |
37594110 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 545 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 37428548 - 37428345
Alignment:
| Q |
545 |
tttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagt |
644 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||| || | ||||||| |
|
|
| T |
37428548 |
tttaagatcaaataaactgcatggtacaatcacttgttctatgaccaaacatccatt-cccaagttgagaattttcgacatctataataaaatttttagt |
37428450 |
T |
|
| Q |
645 |
gggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagccaaattggtttgcaatacaagggtgtgggttattactata |
744 |
Q |
| |
|
|| |||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||| |
|
|
| T |
37428449 |
ggtcccttgccgacaacatgcatcaggaattttcaaggaatgatgaatgtgaatgatagccaaattggtttgcagtacatgggtaaggccaattactata |
37428350 |
T |
|
| Q |
745 |
atgat |
749 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
37428349 |
atgat |
37428345 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 37533002 - 37532868
Alignment:
| Q |
5 |
acaaggacatcttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagt |
104 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37533002 |
acaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatacttttcactctcaaataacaacttcacaggagatatttcttcaacattctgcaatgcaagt |
37532903 |
T |
|
| Q |
105 |
tccctttataccctcaatttggctcacaacaattt |
139 |
Q |
| |
|
| ||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37532902 |
tacctgaatgttctcaatttggctcacaacaattt |
37532868 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 131 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37428651 - 37428578
Alignment:
| Q |
131 |
caacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttca |
204 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
37428651 |
caacaagttgcaaggagatcttccaattccaccttatggcattgaatactttttactctctaacaacaacttca |
37428578 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 139
Target Start/End: Original strand, 37382585 - 37382718
Alignment:
| Q |
6 |
caaggacatcttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagtt |
105 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| |||| || ||||||| | |||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||| || |||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
37382585 |
caaggagatcttccaatcccacgttatggcatttactactttttactctcgaacaacaacttcacaggaaacattgatttttcattgtgcaacgcaagtt |
37382684 |
T |
|
| Q |
106 |
ccctttataccctcaatttggctcacaacaattt |
139 |
Q |
| |
|
|||| || ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37382685 |
ccctgaatgtgctcaatttggctcacaacaattt |
37382718 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 6 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 37428641 - 37428578
Alignment:
| Q |
6 |
caaggacatcttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttca |
69 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| |
|
|
| T |
37428641 |
caaggagatcttccaattccaccttatggcattgaatactttttactctctaacaacaacttca |
37428578 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 26437777 - 26437679
Alignment:
| Q |
588 |
accaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatg |
686 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||| | | |||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
26437777 |
accaaccaaacatttcctaagttgagggtttttgatgtctccaacaataattttagtggctctttgcccacaacgtacatcaaaaactttaaaggaatg |
26437679 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 26451146 - 26451048
Alignment:
| Q |
588 |
accaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatg |
686 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||| | | |||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
26451146 |
accaaccaaacatttcctaagttgagggtttttgatgtctccaacaataattttagtggctctttgcccacaacgtacatcaaaaactttaaaggaatg |
26451048 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 464; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 723
Target Start/End: Original strand, 16843130 - 16843837
Alignment:
| Q |
16 |
ttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttatac |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | || |
|
|
| T |
16843130 |
ttccaattccatcttatggccttcaatacttttcgctctcaaacaacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagtttcttgaatgt |
16843229 |
T |
|
| Q |
116 |
cctcaatttggctcacaacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttcacaggatacatt |
215 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |
|
|
| T |
16843230 |
tctcaatttggctcacaacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattgtatacttttcactctcaaataacaacttcacaggagatatt |
16843329 |
T |
|
| Q |
216 |
tcttcaacattctgcaatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaacattaacttctc |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
16843330 |
tcttcaacattctgcaatgcaagtacccttaatttgcttaatttggctcacaacaatttgacaggtatgattccacaatgcctaggaacattaacttctc |
16843429 |
T |
|
| Q |
316 |
ttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaacca |
415 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16843430 |
ttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctaaaaccttttccaaaggaaatgcatttcagactataaagttgaatggaaacca |
16843529 |
T |
|
| Q |
416 |
attggaaggagcattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggcta |
515 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
16843530 |
attggaaggaccattaccacagtctttgtctcactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacatagaggatacatttcccagttggctt |
16843629 |
T |
|
| Q |
516 |
gaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaa |
615 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16843630 |
gaaactctacaagagttacaggtactcgttttacgatctaataatcttcatggagtaatcacttgttctagcaccaagcatccatttcctaagttgagaa |
16843729 |
T |
|
| Q |
616 |
tttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagccaaattggttt |
715 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
16843730 |
tttttgatgtctctaacaacaattttagtggcaccttgccaacatcatgcatccagaactttcaaggaatgatgaatgtggatgatagccagattggttt |
16843829 |
T |
|
| Q |
716 |
gcaataca |
723 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
16843830 |
gcaataca |
16843837 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 131 - 700
Target Start/End: Original strand, 16845909 - 16846481
Alignment:
| Q |
131 |
caacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgc |
230 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| | | || ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16845909 |
caacaaattgcaaggagacattccaattccatattatggcattaaatactttttgctctcaaacaacaacttcacagaagatatgtcttccacattctgc |
16846008 |
T |
|
| Q |
231 |
aatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgat----tccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattg |
326 |
Q |
| |
|
| ||| |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16846009 |
agtgcaagtttcctgattgttctcaatttggctcacaacaatttaatatgtatgatatattccacaatgcttgggaacattaacttctcttaatgtattg |
16846108 |
T |
|
| Q |
327 |
gatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggag |
426 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16846109 |
gatatgcaaatgaacaacctctttggaagcattcctagaaccttttccaaaggaaatgtgtttgtcactataaagttgaatggcaaccaattggaaggac |
16846208 |
T |
|
| Q |
427 |
cattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctacc |
526 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
16846209 |
cattaccacggtctttagctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacatagaggatacatttcccagttggcttgaaactctaca |
16846308 |
T |
|
| Q |
527 |
agagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtc |
626 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||| | |||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || || |
|
|
| T |
16846309 |
agagttacatgtactcagtttaaggtcaaataaactttatggttcaatcacatgttctagcaccaagcatccattt-ccaaattgagaattttggacatc |
16846407 |
T |
|
| Q |
627 |
tctaacaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatga |
700 |
Q |
| |
|
| | ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
16846408 |
ttcgataacaaattcagtggaccgttgccaacatcatgtatcaagaattttcaaggaatgatgaacgcgaatga |
16846481 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 131 - 728
Target Start/End: Original strand, 24217980 - 24218577
Alignment:
| Q |
131 |
caacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgc |
230 |
Q |
| |
|
|||||| || |||||||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| || | ||| |
|
|
| T |
24217980 |
caacaagttgcaaggagaccttccgattccaccctatggaattcaatacttttcactctcaaacaacaacttcacaggagacattgctttgtcactgtgc |
24218079 |
T |
|
| Q |
231 |
aatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattggata |
330 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24218080 |
aatgcaagttccctgaatttgctcaatttggctaacaacaatttaacaggaacgattccacaatgcctgggaacatttccttatctttctgtattggata |
24218179 |
T |
|
| Q |
331 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggagcatt |
430 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
24218180 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcatgcctaaaacattttcggaaggaaatgcattcgagactataaagttgaatggcaaccaattggagggaccatt |
24218279 |
T |
|
| Q |
431 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
530 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||| |
|
|
| T |
24218280 |
accacagtctttggctcactgcacacaacttgaagttttggaccttggagacaacatcataaacgatacatttcccaattggttagaagttctgcaagag |
24218379 |
T |
|
| Q |
531 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
630 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
24218380 |
ttacaggtactcagtttacgatcaaatcatcttcatggtggaatcacttgttctagcaccaaacaatcatttccgaagatgagaatttacgatgtctctg |
24218479 |
T |
|
| Q |
631 |
acaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagccaaattggtttgcaatacaagggt |
728 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| |||| |
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|
| T |
24218480 |
gtaataatttccgtggccccgtgccaacatcttgcctcaagaattttcaaggaatgattaatgtgaatgtcaataaatctggtttgcaatacatgggt |
24218577 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 6 - 139
Target Start/End: Original strand, 16843255 - 16843388
Alignment:
| Q |
6 |
caaggacatcttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagtt |
105 |
Q |
| |
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|
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| T |
16843255 |
caaggagatcttccaattccacctgatggcattgtatacttttcactctcaaataacaacttcacaggagatatttcttcaacattctgcaatgcaagta |
16843354 |
T |
|
| Q |
106 |
ccctttataccctcaatttggctcacaacaattt |
139 |
Q |
| |
|
||||| || || |||||||||||||||||||| |
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|
| T |
16843355 |
cccttaatttgcttaatttggctcacaacaattt |
16843388 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 274
Target Start/End: Original strand, 16843110 - 16843253
Alignment:
| Q |
131 |
caacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattggatactttttactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgc |
230 |
Q |
| |
|
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|
| T |
16843110 |
caacaaattgcaaggagacattccaattccatcttatggccttcaatacttttcgctctcaaacaacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgc |
16843209 |
T |
|
| Q |
231 |
aatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaattt |
274 |
Q |
| |
|
||||| |||| | | |||| ||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16843210 |
aatgcaagtttcttgaatgttctcaatttggctcacaacaattt |
16843253 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Original strand, 16845929 - 16846052
Alignment:
| Q |
16 |
ttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttatac |
115 |
Q |
| |
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| T |
16845929 |
ttccaattccatattatggcattaaatactttttgctctcaaacaacaacttcacagaagatatgtcttccacattctgcagtgcaagtttcctgattgt |
16846028 |
T |
|
| Q |
116 |
cctcaatttggctcacaacaattt |
139 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |
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| T |
16846029 |
tctcaatttggctcacaacaattt |
16846052 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 139
Target Start/End: Original strand, 24217990 - 24218123
Alignment:
| Q |
6 |
caaggacatcttccaattccaccttctggcattcaatactttttactcgcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagtt |
105 |
Q |
| |
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| T |
24217990 |
caaggagaccttccgattccaccctatggaattcaatacttttcactctcaaacaacaacttcacaggagacattgctttgtcactgtgcaatgcaagtt |
24218089 |
T |
|
| Q |
106 |
ccctttataccctcaatttggctcacaacaattt |
139 |
Q |
| |
|
|||| || |||||||||||| |||||||||| |
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| T |
24218090 |
ccctgaatttgctcaatttggctaacaacaattt |
24218123 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 225 - 728
Target Start/End: Complemental strand, 14553189 - 14552686
Alignment:
| Q |
225 |
ttctgcaatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtat |
324 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | | | |
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|
| T |
14553189 |
ttctgcaatgcaagttccctttatatgctcaatttggctcacaacaatttgacaggtatgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattt |
14553090 |
T |
|
| Q |
325 |
tggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccgaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaagg |
424 |
Q |
| |
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| T |
14553089 |
tggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaagg |
14552990 |
T |
|
| Q |
425 |
agcattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactcta |
524 |
Q |
| |
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| || ||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
14552989 |
accactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtgacaacagcatagaggatacatttcccaattggctagaaactcta |
14552890 |
T |
|
| Q |
525 |
ccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatg |
624 |
Q |
| |
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| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
14552889 |
caagagttacaagtgctaagtttacgatcaaatcatcttcacggagcaatcacctgttctagcatcaagcattcatttcctaagttgagaatttttgatg |
14552790 |
T |
|
| Q |
625 |
tctctaacaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaatgtgaatgacagccaaattggtttgcaatacaa |
724 |
Q |
| |
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| T |
14552789 |
tctctaacaacaattttagtggcaccttgccaacatcatgcatcaagaactttcaaggaatgatgaacgtgaatgacagccaaattggtttgcaatacat |
14552690 |
T |
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| Q |
725 |
gggt |
728 |
Q |
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| T |
14552689 |
gggt |
14552686 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 14553189 - 14553140
Alignment:
| Q |
90 |
ttctgcaatgcaagttccctttataccctcaatttggctcacaacaattt |
139 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
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| T |
14553189 |
ttctgcaatgcaagttccctttatatgctcaatttggctcacaacaattt |
14553140 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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