View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5245-Insertion-1 (Length: 985)

Name: NF5245-Insertion-1
Description: NF5245
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5245-Insertion-1
NF5245-Insertion-1
[»] chr5 (173 HSPs)
chr5 (8-523)||(4375997-4376498)
chr5 (589-985)||(21702465-21702864)
chr5 (589-981)||(17446037-17446432)
chr5 (556-985)||(34052480-34052912)
chr5 (556-985)||(21705272-21705711)
chr5 (554-985)||(23406966-23407400)
chr5 (589-985)||(34063141-34063540)
chr5 (556-985)||(19464491-19464925)
chr5 (589-985)||(36229259-36229658)
chr5 (589-985)||(42395504-42395903)
chr5 (589-985)||(17456653-17457052)
chr5 (556-985)||(19478521-19478955)
chr5 (556-985)||(20552335-20552768)
chr5 (589-985)||(36084981-36085380)
chr5 (589-985)||(8522361-8522761)
chr5 (589-985)||(43621234-43621634)
chr5 (589-985)||(23392921-23393320)
chr5 (556-985)||(20562845-20563277)
chr5 (589-985)||(1121243-1121642)
chr5 (612-985)||(37407168-37407543)
chr5 (589-985)||(1108485-1108884)
chr5 (589-985)||(20798216-20798616)
chr5 (619-985)||(24925508-24925879)
chr5 (595-985)||(43043016-43043411)
chr5 (556-985)||(24982721-24983160)
chr5 (589-985)||(22559957-22560354)
chr5 (589-985)||(27602761-27603158)
chr5 (589-985)||(34772430-34772830)
chr5 (589-985)||(5300489-5300887)
chr5 (555-985)||(30069208-30069644)
chr5 (589-985)||(31419183-31419583)
chr5 (589-985)||(34783375-34783775)
chr5 (589-985)||(5289918-5290316)
chr5 (589-982)||(27622110-27622504)
chr5 (589-985)||(16003234-16003631)
chr5 (589-954)||(23362662-23363028)
chr5 (589-985)||(6131311-6131708)
chr5 (589-931)||(9336531-9336872)
chr5 (589-931)||(9347118-9347459)
chr5 (589-985)||(15992672-15993069)
chr5 (589-931)||(36581900-36582241)
chr5 (589-985)||(40390877-40391274)
chr5 (589-985)||(40401539-40401936)
chr5 (589-985)||(22147043-22147439)
chr5 (589-931)||(36592455-36592796)
chr5 (589-985)||(23296797-23297196)
chr5 (589-985)||(23307365-23307764)
chr5 (589-985)||(23707962-23708361)
chr5 (589-985)||(30226837-30227236)
chr5 (589-985)||(30237364-30237763)
chr5 (589-985)||(33951141-33951540)
chr5 (589-985)||(39365001-39365400)
chr5 (589-956)||(42043333-42043703)
chr5 (589-956)||(42053908-42054278)
chr5 (589-985)||(22157626-22158022)
chr5 (589-915)||(7031499-7031823)
chr5 (589-985)||(23697304-23697703)
chr5 (556-985)||(31449074-31449507)
chr5 (589-985)||(40513330-40513729)
chr5 (589-985)||(39353008-39353408)
chr5 (563-985)||(31834003-31834429)
chr5 (589-985)||(14557358-14557757)
chr5 (589-985)||(14567995-14568394)
chr5 (589-985)||(31844481-31844881)
chr5 (556-985)||(37739874-37740308)
chr5 (589-956)||(22676666-22677036)
chr5 (589-956)||(22686557-22686927)
chr5 (589-985)||(10755012-10755411)
chr5 (556-985)||(14456919-14457353)
chr5 (589-985)||(37728591-37728992)
chr5 (589-985)||(39490291-39490690)
chr5 (589-985)||(39501481-39501880)
chr5 (589-985)||(27204312-27204708)
chr5 (589-946)||(6976369-6976728)
chr5 (589-946)||(6986859-6987218)
chr5 (589-985)||(14446340-14446741)
chr5 (589-985)||(35216026-35216424)
chr5 (589-985)||(35226610-35227008)
chr5 (589-985)||(9376801-9377202)
chr5 (589-985)||(14041117-14041518)
chr5 (589-985)||(15693371-15693772)
chr5 (589-985)||(24567609-24568010)
chr5 (589-985)||(24816225-24816626)
chr5 (589-985)||(24826813-24827214)
chr5 (589-985)||(27471080-27471481)
chr5 (589-985)||(17719437-17719839)
chr5 (589-985)||(17730089-17730491)
chr5 (589-985)||(24808432-24808833)
chr5 (589-985)||(27041551-27041952)
chr5 (589-985)||(27052175-27052576)
chr5 (589-985)||(27460681-27461082)
chr5 (619-985)||(15740488-15740856)
chr5 (619-985)||(15769648-15770016)
chr5 (589-931)||(14030620-14030965)
chr5 (589-985)||(31349053-31349456)
chr5 (589-985)||(36688214-36688617)
chr5 (589-985)||(36698780-36699183)
chr5 (589-985)||(17607579-17607983)
chr5 (589-985)||(17618194-17618598)
chr5 (589-985)||(31359667-31360070)
chr5 (554-920)||(20625354-20625720)
chr5 (589-946)||(106680-107038)
chr5 (556-917)||(21420071-21420431)
chr5 (589-920)||(32753288-32753617)
chr5 (556-930)||(20417481-20417854)
chr5 (145-322)||(4378599-4378774)
chr5 (556-915)||(13522418-13522779)
chr5 (556-912)||(35543694-35544053)
chr5 (589-872)||(13533208-13533492)
chr5 (589-915)||(36096215-36096543)
chr5 (589-915)||(36097672-36098000)
chr5 (558-915)||(20168630-20168989)
chr5 (721-920)||(20215693-20215897)
chr5 (721-913)||(40033321-40033519)
chr5 (720-920)||(40228013-40228219)
chr5 (721-913)||(23487908-23488104)
chr5 (721-920)||(23477732-23477935)
chr5 (589-715)||(24646550-24646676)
chr5 (654-913)||(1914734-1915000)
chr5 (356-426)||(5215560-5215629)
chr5 (589-668)||(13403537-13403618)
chr5 (473-527)||(29385390-29385444)
chr5 (740-804)||(6513128-6513193)
chr5 (363-419)||(19417442-19417498)
chr5 (733-801)||(21659581-21659649)
chr5 (363-419)||(29385390-29385446)
chr5 (473-527)||(1839970-1840024)
chr5 (800-915)||(13403702-13403817)
chr5 (473-527)||(19417444-19417498)
chr5 (720-920)||(25112454-25112660)
chr5 (720-920)||(25171545-25171751)
chr5 (727-805)||(26056184-26056262)
chr5 (727-800)||(7746396-7746469)
chr5 (731-792)||(31117245-31117306)
chr5 (757-806)||(31589637-31589686)
chr5 (740-800)||(13546223-13546283)
chr5 (354-426)||(36568802-36568873)
chr5 (741-800)||(9399318-9399377)
chr5 (720-801)||(10848127-10848210)
chr5 (741-800)||(19536999-19537058)
chr5 (369-419)||(1839974-1840024)
chr5 (363-425)||(7137743-7137805)
chr5 (720-920)||(32160103-32160309)
chr5 (740-800)||(11993265-11993326)
chr5 (727-800)||(25097528-25097601)
chr5 (727-800)||(25155498-25155571)
chr5 (393-426)||(34394692-34394725)
chr5 (740-800)||(90125-90185)
chr5 (774-826)||(26013259-26013310)
chr5 (747-802)||(26764887-26764943)
chr5 (757-800)||(643402-643445)
chr5 (393-424)||(20986463-20986494)
chr5 (720-801)||(28138959-28139042)
chr5 (720-801)||(28465036-28465119)
chr5 (720-801)||(35932706-35932789)
chr5 (589-668)||(40227845-40227924)
chr5 (50-92)||(4378470-4378512)
chr5 (449-527)||(7137640-7137718)
chr5 (356-426)||(12605653-12605714)
chr5 (727-800)||(17814326-17814400)
chr5 (758-800)||(22000729-22000771)
chr5 (740-806)||(26120517-26120583)
chr5 (856-913)||(32160274-32160332)
chr5 (363-420)||(4376447-4376504)
chr5 (498-527)||(5215691-5215720)
chr5 (393-426)||(5998556-5998589)
chr5 (362-423)||(7137637-7137698)
chr5 (741-801)||(13736773-13736834)
chr5 (760-820)||(22747821-22747880)
chr5 (727-800)||(23880428-23880501)
chr5 (727-800)||(26766537-26766610)
chr5 (741-801)||(33022040-33022101)
chr5 (769-806)||(39799536-39799573)
[»] chr2 (126 HSPs)
chr2 (556-985)||(18769324-18769755)
chr2 (554-985)||(26866448-26866881)
chr2 (563-985)||(26879046-26879470)
chr2 (589-985)||(24428005-24428404)
chr2 (589-985)||(28732321-28732721)
chr2 (589-985)||(24415440-24415839)
chr2 (589-985)||(21172885-21173287)
chr2 (556-985)||(28721735-28722168)
chr2 (611-985)||(2560920-2561297)
chr2 (556-985)||(27978801-27979231)
chr2 (556-985)||(38586506-38586938)
chr2 (589-985)||(43082066-43082463)
chr2 (556-985)||(28065330-28065760)
chr2 (589-985)||(43092675-43093072)
chr2 (589-985)||(16768355-16768752)
chr2 (589-985)||(1099614-1100011)
chr2 (589-985)||(4099226-4099623)
chr2 (589-985)||(4209301-4209698)
chr2 (589-985)||(4219893-4220290)
chr2 (589-985)||(22960751-22961148)
chr2 (589-931)||(40250605-40250946)
chr2 (589-985)||(7006226-7006624)
chr2 (589-985)||(29243633-29244031)
chr2 (589-985)||(29254212-29254610)
chr2 (589-985)||(9773723-9774119)
chr2 (589-985)||(22915283-22915680)
chr2 (589-985)||(40221744-40222141)
chr2 (589-985)||(18393056-18393455)
chr2 (589-931)||(34477340-34477682)
chr2 (589-985)||(9763187-9763583)
chr2 (589-985)||(17857856-17858252)
chr2 (589-985)||(32217284-32217683)
chr2 (611-985)||(11389228-11389603)
chr2 (589-985)||(24338823-24339223)
chr2 (556-985)||(35252356-35252791)
chr2 (556-985)||(35262965-35263400)
chr2 (556-985)||(35273590-35274025)
chr2 (589-985)||(11395591-11395990)
chr2 (589-985)||(11405907-11406306)
chr2 (589-985)||(24328153-24328554)
chr2 (556-954)||(27220755-27221159)
chr2 (589-985)||(36252263-36252662)
chr2 (554-866)||(30794185-30794497)
chr2 (589-930)||(21650981-21651322)
chr2 (589-955)||(30489273-30489643)
chr2 (589-985)||(34790636-34791034)
chr2 (589-985)||(34804779-34805177)
chr2 (589-956)||(9908610-9908981)
chr2 (589-982)||(9897996-9898393)
chr2 (589-985)||(43354430-43354832)
chr2 (611-985)||(43344841-43345217)
chr2 (589-985)||(10266402-10266803)
chr2 (589-985)||(10276979-10277380)
chr2 (589-985)||(36785218-36785616)
chr2 (589-931)||(39170570-39170912)
chr2 (556-930)||(24274404-24274777)
chr2 (589-985)||(967923-968321)
chr2 (556-931)||(22773734-22774111)
chr2 (554-920)||(22763027-22763395)
chr2 (589-920)||(1041560-1041890)
chr2 (589-985)||(17970689-17971087)
chr2 (589-920)||(19355726-19356060)
chr2 (556-913)||(19302918-19303278)
chr2 (556-913)||(19498457-19498820)
chr2 (556-915)||(19313482-19313843)
chr2 (589-753)||(20221035-20221197)
chr2 (721-915)||(38033296-38033495)
chr2 (589-731)||(5027893-5028033)
chr2 (589-735)||(38207600-38207744)
chr2 (722-920)||(23393210-23393412)
chr2 (721-899)||(20647121-20647302)
chr2 (589-697)||(28226924-28227029)
chr2 (738-915)||(22754871-22755054)
chr2 (721-848)||(38040522-38040654)
chr2 (722-920)||(24802090-24802293)
chr2 (733-805)||(14794452-14794523)
chr2 (733-805)||(19321021-19321093)
chr2 (722-920)||(24815057-24815260)
chr2 (733-805)||(22682798-22682871)
chr2 (740-800)||(24851329-24851389)
chr2 (445-524)||(12918535-12918614)
chr2 (733-796)||(22615252-22615315)
chr2 (473-527)||(39819062-39819116)
chr2 (740-800)||(22257575-22257635)
chr2 (363-419)||(39819060-39819116)
chr2 (739-806)||(24843578-24843645)
chr2 (727-800)||(21537852-21537925)
chr2 (589-665)||(20647379-20647454)
chr2 (758-806)||(21845554-21845602)
chr2 (836-913)||(19300477-19300553)
chr2 (741-800)||(26367074-26367133)
chr2 (741-800)||(28141268-28141327)
chr2 (449-527)||(5913524-5913601)
chr2 (369-419)||(12918536-12918586)
chr2 (747-797)||(26623123-26623173)
chr2 (727-800)||(10010418-10010491)
chr2 (727-800)||(24376467-24376540)
chr2 (741-806)||(24838480-24838545)
chr2 (758-826)||(27766146-27766213)
chr2 (760-808)||(8685016-8685062)
chr2 (491-527)||(12918508-12918544)
chr2 (356-424)||(12918633-12918700)
chr2 (740-800)||(18702114-18702174)
chr2 (740-800)||(22271504-22271564)
chr2 (740-800)||(25828536-25828595)
chr2 (356-400)||(39819186-39819230)
chr2 (759-806)||(10899171-10899218)
chr2 (492-527)||(12918656-12918691)
chr2 (759-806)||(15671234-15671281)
chr2 (761-800)||(27296835-27296874)
chr2 (492-527)||(39819186-39819221)
chr2 (720-801)||(44839786-44839869)
chr2 (856-913)||(1083537-1083595)
chr2 (363-413)||(5913522-5913571)
chr2 (740-806)||(22382859-22382925)
chr2 (740-801)||(22782279-22782341)
chr2 (740-801)||(22801845-22801907)
chr2 (589-671)||(23393501-23393583)
chr2 (369-426)||(8940464-8940521)
chr2 (393-426)||(18182529-18182562)
chr2 (727-800)||(19539777-19539850)
chr2 (757-806)||(21911489-21911538)
chr2 (747-800)||(23184968-23185021)
chr2 (747-800)||(23596231-23596284)
chr2 (747-800)||(24778753-24778806)
chr2 (727-800)||(40781837-40781910)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (589-985)||(11046-11445)
scaffold0068 (556-985)||(8199-8638)
[»] chr4 (159 HSPs)
chr4 (589-985)||(16316785-16317184)
chr4 (589-985)||(16304561-16304960)
chr4 (589-985)||(15207793-15208191)
chr4 (556-915)||(47152528-47152886)
chr4 (589-985)||(19580695-19581094)
chr4 (589-985)||(14836508-14836907)
chr4 (611-985)||(40470993-40471371)
chr4 (589-985)||(5872828-5873224)
chr4 (589-985)||(40454755-40455159)
chr4 (668-985)||(10908941-10909261)
chr4 (668-985)||(10695175-10695494)
chr4 (589-985)||(25656587-25656989)
chr4 (589-985)||(27815351-27815748)
chr4 (563-985)||(3370140-3370569)
chr4 (563-969)||(3389876-3390292)
chr4 (633-920)||(25008394-25008681)
chr4 (589-985)||(450033-450430)
chr4 (589-985)||(15561485-15561882)
chr4 (589-894)||(19143504-19143809)
chr4 (589-985)||(21995870-21996267)
chr4 (589-985)||(22006468-22006865)
chr4 (589-985)||(30926900-30927297)
chr4 (589-985)||(48370586-48370985)
chr4 (589-985)||(14844059-14844456)
chr4 (589-985)||(19955368-19955765)
chr4 (589-956)||(52703245-52703613)
chr4 (589-955)||(30937508-30937875)
chr4 (589-985)||(19944733-19945130)
chr4 (589-985)||(27656055-27656454)
chr4 (589-985)||(27666628-27667027)
chr4 (556-985)||(10299957-10300388)
chr4 (589-985)||(17917508-17917906)
chr4 (589-931)||(17928156-17928498)
chr4 (589-985)||(18130645-18131045)
chr4 (589-931)||(460614-460955)
chr4 (589-985)||(4947794-4948191)
chr4 (589-931)||(16255323-16255663)
chr4 (589-931)||(16265916-16266256)
chr4 (556-985)||(18752895-18753325)
chr4 (589-985)||(18763505-18763902)
chr4 (556-985)||(24639667-24640102)
chr4 (589-985)||(24028491-24028893)
chr4 (556-985)||(5022158-5022590)
chr4 (589-985)||(18078312-18078711)
chr4 (589-985)||(29042062-29042463)
chr4 (589-985)||(55756269-55756666)
chr4 (589-985)||(55745658-55746055)
chr4 (589-829)||(19570472-19570711)
chr4 (556-985)||(11535268-11535698)
chr4 (589-985)||(36017789-36018190)
chr4 (589-985)||(36028342-36028743)
chr4 (589-985)||(49517588-49517989)
chr4 (589-931)||(10741056-10741401)
chr4 (589-931)||(10954825-10955170)
chr4 (589-931)||(10751630-10751975)
chr4 (589-931)||(10965399-10965744)
chr4 (655-928)||(24712947-24713221)
chr4 (553-985)||(31267198-31267630)
chr4 (556-854)||(10290048-10290345)
chr4 (759-985)||(4986816-4987045)
chr4 (589-985)||(11514491-11514888)
chr4 (589-809)||(17199074-17199295)
chr4 (553-930)||(49002444-49002819)
chr4 (556-920)||(55650746-55651108)
chr4 (589-810)||(9920958-9921177)
chr4 (589-809)||(28050019-28050238)
chr4 (589-809)||(49509431-49509652)
chr4 (555-783)||(20649445-20649674)
chr4 (551-915)||(23508559-23508926)
chr4 (589-783)||(3188988-3189183)
chr4 (721-848)||(8183486-8183613)
chr4 (589-915)||(16819825-16820159)
chr4 (589-781)||(29030156-29030349)
chr4 (589-745)||(43347079-43347233)
chr4 (705-920)||(19241589-19241807)
chr4 (721-896)||(18775179-18775357)
chr4 (654-915)||(14711253-14711521)
chr4 (654-915)||(14778917-14779185)
chr4 (721-874)||(18775518-18775674)
chr4 (589-715)||(25067314-25067437)
chr4 (721-899)||(18007582-18007763)
chr4 (721-913)||(36210587-36210784)
chr4 (721-826)||(39532269-39532376)
chr4 (589-715)||(49503366-49503492)
chr4 (589-682)||(20579523-20579614)
chr4 (720-920)||(33377763-33377968)
chr4 (721-796)||(18775930-18776005)
chr4 (920-985)||(4987060-4987127)
chr4 (799-893)||(8997740-8997831)
chr4 (727-826)||(24619079-24619181)
chr4 (747-826)||(7221926-7222007)
chr4 (589-668)||(14711544-14711624)
chr4 (740-800)||(15015064-15015124)
chr4 (589-649)||(18066035-18066094)
chr4 (705-800)||(13693185-13693280)
chr4 (619-697)||(17276226-17276301)
chr4 (760-826)||(19052738-19052803)
chr4 (363-426)||(46321433-46321496)
chr4 (589-668)||(14779208-14779289)
chr4 (740-806)||(19889651-19889717)
chr4 (473-527)||(31846896-31846950)
chr4 (740-800)||(14190088-14190149)
chr4 (740-800)||(11900564-11900624)
chr4 (597-665)||(17994518-17994586)
chr4 (589-665)||(18007840-18007915)
chr4 (363-419)||(31846896-31846952)
chr4 (370-426)||(41306622-41306678)
chr4 (740-800)||(55379683-55379743)
chr4 (741-800)||(12600134-12600193)
chr4 (720-801)||(16939353-16939436)
chr4 (759-805)||(17527016-17527063)
chr4 (727-801)||(19884093-19884168)
chr4 (727-800)||(15135089-15135163)
chr4 (721-787)||(17994362-17994427)
chr4 (854-915)||(18775129-18775191)
chr4 (742-800)||(23749899-23749957)
chr4 (589-631)||(25152238-25152280)
chr4 (758-826)||(32491438-32491508)
chr4 (757-806)||(16325167-16325216)
chr4 (727-800)||(16476056-16476129)
chr4 (740-800)||(16847921-16847982)
chr4 (740-800)||(16852877-16852938)
chr4 (727-800)||(17788718-17788791)
chr4 (836-915)||(17994267-17994345)
chr4 (589-685)||(18775401-18775495)
chr4 (855-914)||(13890350-13890410)
chr4 (740-800)||(29681194-29681254)
chr4 (356-400)||(31846782-31846826)
chr4 (727-799)||(41115436-41115508)
chr4 (720-801)||(6516840-6516923)
chr4 (741-800)||(8686121-8686180)
chr4 (772-826)||(13977914-13977968)
chr4 (759-806)||(14903084-14903131)
chr4 (358-425)||(15031965-15032032)
chr4 (727-806)||(18473427-18473506)
chr4 (747-801)||(19611009-19611064)
chr4 (727-806)||(20571666-20571745)
chr4 (727-798)||(22089646-22089717)
chr4 (727-801)||(22676198-22676273)
chr4 (363-422)||(32224282-32224340)
chr4 (727-801)||(45832747-45832822)
chr4 (472-523)||(46321439-46321490)
chr4 (363-422)||(53937897-53937956)
chr4 (727-801)||(54679288-54679363)
chr4 (758-800)||(6641075-6641117)
chr4 (720-800)||(14154672-14154754)
chr4 (485-527)||(15031972-15032014)
chr4 (727-800)||(16631800-16631874)
chr4 (358-424)||(32008336-32008402)
chr4 (473-527)||(32139812-32139866)
chr4 (589-671)||(33377595-33377677)
chr4 (727-800)||(36470329-36470403)
chr4 (363-417)||(54613030-54613084)
chr4 (740-801)||(55731221-55731283)
chr4 (396-425)||(5036353-5036382)
chr4 (393-426)||(11392396-11392429)
chr4 (855-915)||(19889514-19889575)
chr4 (370-423)||(33380714-33380767)
chr4 (369-426)||(55382505-55382562)
[»] chr3 (216 HSPs)
chr3 (592-982)||(4403712-4404104)
chr3 (589-982)||(4433196-4433591)
chr3 (589-985)||(11217125-11217525)
chr3 (556-985)||(38314097-38314528)
chr3 (589-985)||(11206474-11206875)
chr3 (589-985)||(9391604-9392003)
chr3 (589-985)||(14258464-14258864)
chr3 (554-985)||(19887754-19888187)
chr3 (556-985)||(933027-933462)
chr3 (556-985)||(1784471-1784904)
chr3 (589-985)||(11163267-11163664)
chr3 (589-985)||(1794884-1795284)
chr3 (589-985)||(9381058-9381457)
chr3 (589-985)||(9535043-9535444)
chr3 (589-956)||(13262102-13262470)
chr3 (554-985)||(29472465-29472902)
chr3 (556-985)||(23635110-23635544)
chr3 (589-985)||(29461613-29462015)
chr3 (589-985)||(24706955-24707357)
chr3 (589-985)||(7804918-7805316)
chr3 (589-985)||(7795007-7795405)
chr3 (589-985)||(17910402-17910805)
chr3 (655-985)||(48336743-48337076)
chr3 (556-985)||(14322092-14322521)
chr3 (589-893)||(13601669-13601973)
chr3 (589-985)||(13557012-13557409)
chr3 (589-985)||(23767332-23767729)
chr3 (589-985)||(6180928-6181325)
chr3 (589-985)||(13121100-13121497)
chr3 (589-985)||(14475659-14476056)
chr3 (589-985)||(19788460-19788857)
chr3 (589-985)||(37865883-37866280)
chr3 (589-985)||(4175157-4175554)
chr3 (589-931)||(5537477-5537818)
chr3 (589-931)||(5548061-5548402)
chr3 (589-985)||(6221102-6221499)
chr3 (589-985)||(13131342-13131739)
chr3 (589-985)||(23756736-23757133)
chr3 (589-985)||(37885016-37885413)
chr3 (556-985)||(27882787-27883217)
chr3 (556-985)||(12238013-12238446)
chr3 (589-985)||(19777823-19778220)
chr3 (589-985)||(20684179-20684575)
chr3 (589-985)||(9994293-9994692)
chr3 (617-896)||(28168574-28168853)
chr3 (589-985)||(10627341-10627742)
chr3 (589-985)||(10655663-10656064)
chr3 (589-859)||(19121370-19121640)
chr3 (589-985)||(5866096-5866495)
chr3 (589-985)||(5876695-5877094)
chr3 (589-985)||(11272784-11273183)
chr3 (548-985)||(38194115-38194559)
chr3 (589-985)||(23647187-23647584)
chr3 (556-985)||(39382090-39382525)
chr3 (589-985)||(12249839-12250239)
chr3 (589-985)||(5580034-5580433)
chr3 (556-985)||(9982285-9982717)
chr3 (589-985)||(10098505-10098903)
chr3 (589-985)||(24383919-24384318)
chr3 (556-931)||(28314689-28315069)
chr3 (556-985)||(6501403-6501831)
chr3 (589-956)||(12297231-12297601)
chr3 (589-985)||(20673594-20673991)
chr3 (589-985)||(39371486-39371888)
chr3 (589-985)||(8740526-8740922)
chr3 (555-985)||(8774055-8774492)
chr3 (556-985)||(38204658-38205095)
chr3 (589-985)||(5628418-5628816)
chr3 (589-985)||(18483478-18483879)
chr3 (556-985)||(6490749-6491177)
chr3 (589-956)||(12287409-12287779)
chr3 (556-931)||(8996413-8996787)
chr3 (589-985)||(37759106-37759504)
chr3 (589-985)||(5510132-5510531)
chr3 (589-985)||(5520310-5520709)
chr3 (589-985)||(13373066-13373468)
chr3 (589-985)||(20720546-20720948)
chr3 (589-920)||(28325315-28325651)
chr3 (589-985)||(13383660-13384062)
chr3 (589-985)||(13394254-13394656)
chr3 (589-931)||(29906638-29906980)
chr3 (556-931)||(9006965-9007339)
chr3 (589-985)||(504568-504969)
chr3 (589-985)||(526934-527335)
chr3 (589-985)||(4743172-4743573)
chr3 (589-985)||(4753759-4754160)
chr3 (589-985)||(41683112-41683513)
chr3 (589-985)||(41693681-41694082)
chr3 (656-911)||(15194516-15194772)
chr3 (589-985)||(16385512-16385910)
chr3 (589-985)||(35186809-35187212)
chr3 (589-931)||(16076364-16076707)
chr3 (589-931)||(24659333-24659679)
chr3 (589-931)||(24669913-24670259)
chr3 (654-985)||(39673283-39673616)
chr3 (589-946)||(1053145-1053503)
chr3 (586-920)||(1063571-1063904)
chr3 (589-896)||(8784703-8785014)
chr3 (589-985)||(17281835-17282232)
chr3 (589-854)||(33650636-33650901)
chr3 (553-985)||(13199646-13200084)
chr3 (589-799)||(7608861-7609072)
chr3 (589-830)||(11530235-11530474)
chr3 (589-808)||(13076327-13076547)
chr3 (589-931)||(29947803-29948146)
chr3 (589-931)||(29996957-29997300)
chr3 (556-920)||(29934029-29934393)
chr3 (556-920)||(29983183-29983547)
chr3 (589-920)||(15663205-15663537)
chr3 (742-897)||(18857426-18857580)
chr3 (556-920)||(15651570-15651935)
chr3 (589-809)||(35579002-35579223)
chr3 (633-946)||(2245839-2246159)
chr3 (558-920)||(14580541-14580906)
chr3 (785-920)||(16671630-16671766)
chr3 (727-854)||(24393356-24393483)
chr3 (721-899)||(27172428-27172610)
chr3 (589-874)||(21735608-21735888)
chr3 (589-742)||(30390732-30390883)
chr3 (721-920)||(31114459-31114662)
chr3 (721-911)||(51989627-51989821)
chr3 (589-753)||(27244987-27245149)
chr3 (721-913)||(10528733-10528931)
chr3 (589-715)||(14465102-14465225)
chr3 (589-715)||(40456973-40457096)
chr3 (721-920)||(17006553-17006757)
chr3 (554-795)||(17960803-17961043)
chr3 (721-913)||(17017389-17017586)
chr3 (721-920)||(22150605-22150809)
chr3 (720-920)||(15832766-15832971)
chr3 (589-697)||(40287580-40287685)
chr3 (654-920)||(41045034-41045306)
chr3 (720-920)||(13953621-13953826)
chr3 (589-715)||(14353862-14353982)
chr3 (720-920)||(49989619-49989824)
chr3 (854-985)||(15663107-15663242)
chr3 (720-899)||(15848500-15848683)
chr3 (720-913)||(45862162-45862361)
chr3 (720-913)||(13147651-13147851)
chr3 (727-805)||(27849590-27849668)
chr3 (720-914)||(37411993-37412193)
chr3 (730-805)||(13931364-13931439)
chr3 (740-896)||(12753243-12753404)
chr3 (741-806)||(13410752-13410817)
chr3 (446-527)||(29081598-29081679)
chr3 (740-800)||(14063710-14063770)
chr3 (705-800)||(3238036-3238130)
chr3 (858-985)||(15651472-15651603)
chr3 (712-826)||(17769645-17769763)
chr3 (712-826)||(19070946-19071064)
chr3 (841-913)||(14580858-14580929)
chr3 (356-426)||(22893891-22893960)
chr3 (485-527)||(49159495-49159537)
chr3 (727-800)||(2560551-2560624)
chr3 (728-805)||(8693512-8693589)
chr3 (728-805)||(9045399-9045476)
chr3 (727-800)||(23538884-23538957)
chr3 (555-665)||(51989914-51990024)
chr3 (740-792)||(20724466-20724518)
chr3 (740-803)||(50299613-50299677)
chr3 (740-806)||(6252799-6252866)
chr3 (739-806)||(14078029-14078096)
chr3 (855-913)||(18006022-18006081)
chr3 (742-797)||(22804746-22804801)
chr3 (589-668)||(41044932-41045011)
chr3 (740-806)||(11078134-11078200)
chr3 (556-671)||(15832565-15832680)
chr3 (473-527)||(20286903-20286957)
chr3 (760-826)||(20736609-20736673)
chr3 (740-806)||(22770571-22770637)
chr3 (589-631)||(23413894-23413936)
chr3 (740-801)||(47207083-47207145)
chr3 (757-806)||(6174731-6174780)
chr3 (727-800)||(12963806-12963879)
chr3 (727-800)||(17239643-17239716)
chr3 (727-800)||(26418397-26418470)
chr3 (369-422)||(29081602-29081655)
chr3 (393-426)||(29081697-29081730)
chr3 (747-792)||(52919850-52919895)
chr3 (740-792)||(6090105-6090157)
chr3 (356-424)||(11512487-11512554)
chr3 (589-665)||(13147483-13147558)
chr3 (363-419)||(20286901-20286957)
chr3 (589-665)||(22150436-22150512)
chr3 (742-801)||(49669207-49669267)
chr3 (741-800)||(13939275-13939334)
chr3 (739-806)||(19198588-19198655)
chr3 (747-798)||(20645539-20645590)
chr3 (492-527)||(22893900-22893935)
chr3 (484-527)||(25790889-25790932)
chr3 (727-801)||(28581471-28581546)
chr3 (722-896)||(51340340-51340519)
chr3 (712-826)||(1463736-1463853)
chr3 (856-913)||(12753195-12753253)
chr3 (856-913)||(13953791-13953849)
chr3 (894-985)||(14465332-14465426)
chr3 (589-665)||(17017221-17017296)
chr3 (740-806)||(21316932-21316998)
chr3 (740-797)||(21640245-21640303)
chr3 (740-801)||(30054898-30054960)
chr3 (363-409)||(49159493-49159539)
chr3 (727-800)||(49554216-49554290)
chr3 (392-426)||(53299826-53299860)
chr3 (774-826)||(4768229-4768281)
chr3 (856-893)||(8710418-8710455)
chr3 (856-893)||(9062305-9062342)
chr3 (741-801)||(13823446-13823507)
chr3 (733-805)||(15647145-15647218)
chr3 (757-806)||(15961340-15961388)
chr3 (727-800)||(29952157-29952230)
chr3 (727-800)||(30001311-30001384)
chr3 (741-801)||(31302728-31302789)
chr3 (393-426)||(32385385-32385418)
chr3 (363-424)||(48342214-48342274)
chr3 (856-920)||(51340509-51340574)
chr3 (740-800)||(52283168-52283229)
[»] chr6 (158 HSPs)
chr6 (556-985)||(18926175-18926606)
chr6 (589-985)||(25787088-25787486)
chr6 (589-985)||(20030315-20030716)
chr6 (589-985)||(20063066-20063467)
chr6 (589-985)||(7376169-7376572)
chr6 (556-985)||(12827048-12827477)
chr6 (553-985)||(32756753-32757183)
chr6 (589-985)||(16123946-16124344)
chr6 (589-985)||(9123543-9123940)
chr6 (589-985)||(9112906-9113303)
chr6 (552-985)||(31571765-31572199)
chr6 (589-895)||(10404043-10404350)
chr6 (589-985)||(5844467-5844871)
chr6 (589-985)||(3671435-3671832)
chr6 (589-985)||(12854409-12854806)
chr6 (589-985)||(12864935-12865332)
chr6 (589-985)||(12717247-12717646)
chr6 (589-985)||(12727896-12728295)
chr6 (589-985)||(17982912-17983311)
chr6 (589-985)||(25985468-25985867)
chr6 (589-985)||(3660771-3661168)
chr6 (589-985)||(17985121-17985520)
chr6 (556-985)||(27505293-27505727)
chr6 (556-985)||(27372183-27372617)
chr6 (556-985)||(27462533-27462967)
chr6 (619-985)||(17746195-17746565)
chr6 (589-985)||(26043598-26043997)
chr6 (589-985)||(34818203-34818602)
chr6 (589-985)||(29384139-29384537)
chr6 (589-985)||(32962345-32962746)
chr6 (589-985)||(32972964-32973363)
chr6 (589-985)||(34807571-34807972)
chr6 (589-985)||(26864172-26864571)
chr6 (589-985)||(26874796-26875195)
chr6 (589-985)||(33198715-33199113)
chr6 (556-882)||(11147708-11148033)
chr6 (589-985)||(16929835-16930236)
chr6 (589-985)||(26024843-26025244)
chr6 (589-985)||(26035417-26035818)
chr6 (589-985)||(27341078-27341479)
chr6 (589-985)||(27401818-27402219)
chr6 (589-985)||(27412477-27412878)
chr6 (589-985)||(31983037-31983438)
chr6 (589-985)||(32301454-32301855)
chr6 (589-985)||(32312143-32312544)
chr6 (589-896)||(12352964-12353277)
chr6 (612-985)||(27166854-27167229)
chr6 (589-920)||(27503703-27504033)
chr6 (589-920)||(27383821-27384151)
chr6 (589-920)||(27474205-27474535)
chr6 (589-985)||(4630253-4630656)
chr6 (589-985)||(16959006-16959407)
chr6 (554-891)||(25583262-25583600)
chr6 (556-920)||(28357188-28357554)
chr6 (556-920)||(18835112-18835474)
chr6 (589-920)||(28252041-28252374)
chr6 (622-920)||(7751714-7752015)
chr6 (556-809)||(30120483-30120736)
chr6 (721-985)||(29765053-29765320)
chr6 (619-985)||(22308203-22308573)
chr6 (678-920)||(18826717-18826959)
chr6 (556-920)||(25687229-25687594)
chr6 (550-930)||(17742173-17742553)
chr6 (589-854)||(12416902-12417168)
chr6 (556-915)||(18554650-18555010)
chr6 (589-915)||(31930834-31931163)
chr6 (589-809)||(1902118-1902340)
chr6 (555-754)||(17573068-17573268)
chr6 (589-882)||(9934131-9934422)
chr6 (556-851)||(22292246-22292541)
chr6 (556-913)||(11205325-11205683)
chr6 (589-809)||(27819055-27819279)
chr6 (555-920)||(11234846-11235213)
chr6 (589-787)||(18720101-18720297)
chr6 (672-913)||(17047052-17047297)
chr6 (589-787)||(12575773-12575968)
chr6 (619-915)||(12953586-12953885)
chr6 (553-752)||(11021309-11021509)
chr6 (589-753)||(18576117-18576279)
chr6 (721-946)||(25518201-25518431)
chr6 (556-899)||(17063582-17063923)
chr6 (589-750)||(5521748-5521906)
chr6 (721-920)||(7586742-7586945)
chr6 (721-920)||(21127591-21127794)
chr6 (733-826)||(14757752-14757848)
chr6 (589-796)||(25678797-25679001)
chr6 (589-773)||(27720755-27720937)
chr6 (721-920)||(17608892-17609095)
chr6 (720-920)||(20635080-20635285)
chr6 (727-806)||(15551392-15551471)
chr6 (589-664)||(33866530-33866607)
chr6 (710-805)||(18027387-18027483)
chr6 (721-920)||(19453107-19453312)
chr6 (721-830)||(21119169-21119284)
chr6 (740-806)||(17927171-17927237)
chr6 (619-715)||(3390782-3390875)
chr6 (720-800)||(22386163-22386244)
chr6 (854-956)||(27503997-27504101)
chr6 (589-675)||(9817970-9818055)
chr6 (727-800)||(3680479-3680552)
chr6 (800-915)||(19289837-19289950)
chr6 (556-665)||(21127391-21127499)
chr6 (749-800)||(19625198-19625249)
chr6 (727-806)||(25929844-25929923)
chr6 (727-801)||(13435251-13435325)
chr6 (742-800)||(18434919-18434977)
chr6 (589-751)||(19289957-19290118)
chr6 (733-805)||(15478450-15478522)
chr6 (747-800)||(20113347-20113400)
chr6 (556-665)||(21118967-21119077)
chr6 (356-424)||(2543735-2543802)
chr6 (589-665)||(7587038-7587113)
chr6 (900-985)||(12353252-12353340)
chr6 (740-800)||(14101148-14101208)
chr6 (758-806)||(21034428-21034476)
chr6 (740-800)||(24116206-24116266)
chr6 (758-806)||(24719437-24719485)
chr6 (741-801)||(29917407-29917467)
chr6 (555-671)||(20634878-20634994)
chr6 (898-985)||(4292420-4292510)
chr6 (740-806)||(12347471-12347537)
chr6 (356-426)||(16193827-16193888)
chr6 (740-801)||(18377821-18377883)
chr6 (740-801)||(19482131-19482193)
chr6 (740-801)||(21234538-21234600)
chr6 (854-915)||(25687204-25687266)
chr6 (854-920)||(27474499-27474564)
chr6 (354-391)||(369543-369580)
chr6 (740-800)||(16528689-16528750)
chr6 (758-806)||(14883651-14883699)
chr6 (740-800)||(15301594-15301654)
chr6 (727-791)||(19623345-19623409)
chr6 (741-800)||(21624471-21624531)
chr6 (742-801)||(22801521-22801581)
chr6 (492-527)||(2543744-2543779)
chr6 (739-806)||(7811387-7811454)
chr6 (720-801)||(12422622-12422705)
chr6 (747-806)||(17303976-17304035)
chr6 (741-804)||(19470047-19470110)
chr6 (757-826)||(30372752-30372823)
chr6 (740-801)||(10631513-10631575)
chr6 (757-799)||(15395333-15395375)
chr6 (740-801)||(15954077-15954139)
chr6 (740-801)||(17380956-17381018)
chr6 (740-797)||(19952282-19952340)
chr6 (740-801)||(26588977-26589039)
chr6 (712-818)||(31720245-31720354)
chr6 (740-800)||(9717222-9717283)
chr6 (740-800)||(12716132-12716193)
chr6 (740-792)||(14052099-14052152)
chr6 (757-806)||(18172925-18172974)
chr6 (757-806)||(18226827-18226876)
chr6 (757-806)||(19875235-19875284)
chr6 (733-801)||(21617618-21617687)
chr6 (760-809)||(21689533-21689580)
chr6 (759-800)||(25592020-25592061)
chr6 (854-915)||(27384115-27384175)
chr6 (854-915)||(27474528-27474588)
[»] chr1 (155 HSPs)
chr1 (556-985)||(20441760-20442192)
chr1 (556-985)||(18382347-18382779)
chr1 (556-985)||(39586301-39586733)
chr1 (555-985)||(7677172-7677607)
chr1 (589-985)||(5973119-5973521)
chr1 (589-985)||(4251008-4251413)
chr1 (555-956)||(17956570-17956973)
chr1 (589-985)||(154732-155135)
chr1 (589-916)||(47194567-47194894)
chr1 (589-985)||(35012292-35012691)
chr1 (589-985)||(39194537-39194942)
chr1 (589-985)||(19178325-19178722)
chr1 (589-985)||(7689903-7690305)
chr1 (589-985)||(4177281-4177678)
chr1 (589-985)||(19187204-19187601)
chr1 (589-985)||(10998228-10998625)
chr1 (589-985)||(12614760-12615157)
chr1 (589-985)||(35649135-35649534)
chr1 (589-985)||(36247420-36247819)
chr1 (589-985)||(38094440-38094839)
chr1 (589-985)||(38105065-38105464)
chr1 (589-985)||(33083927-33084325)
chr1 (589-985)||(5650711-5651108)
chr1 (589-985)||(12624225-12624622)
chr1 (589-912)||(23580816-23581137)
chr1 (589-985)||(51656892-51657294)
chr1 (589-985)||(21863024-21863424)
chr1 (589-985)||(12729913-12730310)
chr1 (589-985)||(12740506-12740903)
chr1 (589-985)||(35404836-35405235)
chr1 (589-985)||(36236873-36237272)
chr1 (556-985)||(51629631-51630065)
chr1 (589-985)||(5640154-5640552)
chr1 (589-985)||(12898425-12898825)
chr1 (589-985)||(2537901-2538299)
chr1 (589-985)||(21877129-21877530)
chr1 (589-985)||(12944574-12944972)
chr1 (589-985)||(3170984-3171385)
chr1 (589-985)||(3181586-3181987)
chr1 (589-985)||(7506666-7507065)
chr1 (589-985)||(7517263-7517662)
chr1 (589-985)||(47608375-47608775)
chr1 (589-985)||(47618983-47619383)
chr1 (589-930)||(20196193-20196534)
chr1 (589-931)||(35638538-35638878)
chr1 (589-985)||(5832583-5832981)
chr1 (589-985)||(5843185-5843583)
chr1 (590-985)||(11195512-11195908)
chr1 (589-848)||(16710199-16710456)
chr1 (556-930)||(18311474-18311850)
chr1 (589-946)||(674811-675168)
chr1 (767-985)||(148657-148879)
chr1 (589-930)||(14388629-14388972)
chr1 (589-946)||(41133103-41133461)
chr1 (589-833)||(4717497-4717739)
chr1 (591-985)||(22610419-22610818)
chr1 (747-896)||(9050994-9051143)
chr1 (589-810)||(36551159-36551378)
chr1 (554-809)||(13223380-13223637)
chr1 (589-807)||(9749843-9750062)
chr1 (589-809)||(36099900-36100124)
chr1 (589-915)||(46181367-46181698)
chr1 (589-809)||(24049120-24049342)
chr1 (589-810)||(25218042-25218261)
chr1 (589-920)||(5928938-5929271)
chr1 (589-915)||(45071117-45071445)
chr1 (854-985)||(47194891-47195025)
chr1 (563-752)||(5234525-5234715)
chr1 (589-753)||(10256310-10256477)
chr1 (589-742)||(11958363-11958514)
chr1 (834-985)||(4166868-4167022)
chr1 (589-753)||(19087872-19088034)
chr1 (721-913)||(20251163-20251361)
chr1 (589-714)||(46687603-46687725)
chr1 (589-692)||(23160800-23160906)
chr1 (721-920)||(23926421-23926626)
chr1 (589-715)||(34190108-34190231)
chr1 (761-915)||(28473660-28473818)
chr1 (721-896)||(19170869-19171048)
chr1 (721-899)||(22018690-22018872)
chr1 (720-920)||(22642221-22642427)
chr1 (721-920)||(28379352-28379557)
chr1 (654-796)||(19037299-19037441)
chr1 (721-920)||(26548775-26548979)
chr1 (721-920)||(17370400-17370604)
chr1 (800-915)||(20884370-20884483)
chr1 (589-675)||(24211201-24211286)
chr1 (853-920)||(19965761-19965828)
chr1 (722-800)||(21541164-21541243)
chr1 (721-796)||(23058953-23059028)
chr1 (733-805)||(23975486-23975558)
chr1 (727-805)||(31358730-31358809)
chr1 (742-800)||(22202376-22202434)
chr1 (372-426)||(44291146-44291200)
chr1 (740-800)||(2328076-2328137)
chr1 (355-424)||(50754824-50754892)
chr1 (363-423)||(718988-719048)
chr1 (720-800)||(7309176-7309256)
chr1 (722-920)||(34256035-34256238)
chr1 (854-920)||(47194861-47194928)
chr1 (473-527)||(6539664-6539718)
chr1 (740-830)||(7745657-7745752)
chr1 (369-419)||(9884844-9884894)
chr1 (370-420)||(10449552-10449601)
chr1 (356-426)||(28045417-28045486)
chr1 (762-865)||(44200443-44200549)
chr1 (721-787)||(52351269-52351335)
chr1 (884-985)||(9050931-9051036)
chr1 (727-805)||(22639682-22639762)
chr1 (363-419)||(6539664-6539720)
chr1 (356-424)||(9884941-9885008)
chr1 (740-800)||(12283800-12283860)
chr1 (740-800)||(12625195-12625255)
chr1 (740-800)||(22427980-22428040)
chr1 (856-915)||(23926591-23926651)
chr1 (589-665)||(52351426-52351502)
chr1 (727-806)||(22601219-22601297)
chr1 (449-527)||(10449529-10449606)
chr1 (727-800)||(26702771-26702845)
chr1 (356-426)||(44381908-44381978)
chr1 (740-801)||(44824399-44824461)
chr1 (356-426)||(47557359-47557429)
chr1 (757-806)||(18614312-18614361)
chr1 (851-911)||(19037499-19037560)
chr1 (747-800)||(22465452-22465505)
chr1 (741-801)||(23037145-23037206)
chr1 (360-425)||(49200057-49200122)
chr1 (836-915)||(52351174-52351252)
chr1 (589-665)||(22018545-22018621)
chr1 (740-803)||(25449196-25449260)
chr1 (720-801)||(1577224-1577307)
chr1 (473-524)||(9884843-9884894)
chr1 (741-800)||(10756803-10756862)
chr1 (720-801)||(21215316-21215399)
chr1 (727-801)||(22600826-22600901)
chr1 (492-527)||(28045442-28045477)
chr1 (393-424)||(28810060-28810091)
chr1 (727-801)||(32786578-32786653)
chr1 (492-527)||(50754847-50754882)
chr1 (733-795)||(8698265-8698327)
chr1 (473-527)||(9379817-9379871)
chr1 (740-801)||(10250367-10250429)
chr1 (740-806)||(17017969-17018035)
chr1 (750-792)||(17025614-17025656)
chr1 (740-801)||(21121704-21121766)
chr1 (727-800)||(21192506-21192580)
chr1 (740-801)||(21983974-21984036)
chr1 (727-800)||(22153220-22153294)
chr1 (720-798)||(26702971-26703049)
chr1 (740-801)||(38281763-38281825)
chr1 (740-801)||(42284019-42284081)
chr1 (485-527)||(44381917-44381959)
chr1 (757-806)||(16233759-16233808)
chr1 (769-806)||(18130613-18130650)
chr1 (727-800)||(28492924-28492996)
[»] chr8 (120 HSPs)
chr8 (556-985)||(18153150-18153583)
chr8 (589-985)||(23469895-23470295)
chr8 (589-985)||(19417797-19418198)
chr8 (589-985)||(40213602-40214000)
chr8 (589-985)||(19428372-19428773)
chr8 (589-985)||(19224378-19224780)
chr8 (556-985)||(16746412-16746846)
chr8 (589-985)||(30315130-30315535)
chr8 (556-985)||(18157669-18158102)
chr8 (589-985)||(20161665-20162067)
chr8 (623-985)||(18769571-18769937)
chr8 (556-985)||(31214425-31214858)
chr8 (556-985)||(6318950-6319387)
chr8 (589-985)||(3220081-3220478)
chr8 (589-985)||(26110680-26111077)
chr8 (589-985)||(43247774-43248171)
chr8 (589-985)||(19128195-19128594)
chr8 (589-956)||(210616-210986)
chr8 (589-956)||(241271-241641)
chr8 (589-956)||(251856-252226)
chr8 (589-956)||(724239-724609)
chr8 (589-956)||(794626-794996)
chr8 (589-956)||(849430-849800)
chr8 (589-931)||(32088759-32089101)
chr8 (589-985)||(13689002-13689401)
chr8 (589-985)||(26120354-26120755)
chr8 (589-931)||(32078186-32078528)
chr8 (556-830)||(23270531-23270805)
chr8 (612-985)||(9856911-9857285)
chr8 (589-985)||(19138726-19139126)
chr8 (589-985)||(29076179-29076577)
chr8 (589-985)||(29086430-29086828)
chr8 (589-985)||(18448819-18449216)
chr8 (589-916)||(13697185-13697512)
chr8 (589-985)||(36077382-36077783)
chr8 (589-985)||(36087968-36088369)
chr8 (589-896)||(20195429-20195739)
chr8 (611-956)||(36292390-36292738)
chr8 (611-956)||(36302993-36303341)
chr8 (556-827)||(26735573-26735844)
chr8 (589-985)||(3349061-3349460)
chr8 (589-985)||(3359658-3360057)
chr8 (589-985)||(6150520-6150914)
chr8 (589-985)||(6160475-6160869)
chr8 (589-985)||(44480536-44480937)
chr8 (589-985)||(44491152-44491553)
chr8 (589-985)||(9340589-9340990)
chr8 (589-985)||(9367733-9368134)
chr8 (589-985)||(15791733-15792133)
chr8 (589-985)||(15781144-15781546)
chr8 (589-837)||(15998801-15999050)
chr8 (556-930)||(3842937-3843310)
chr8 (589-839)||(23290346-23290596)
chr8 (589-930)||(23363576-23363920)
chr8 (556-985)||(22167458-22167893)
chr8 (589-920)||(7018919-7019252)
chr8 (589-985)||(20260053-20260445)
chr8 (589-985)||(21046683-21047075)
chr8 (672-985)||(22136293-22136613)
chr8 (555-913)||(19460406-19460767)
chr8 (555-913)||(19558084-19558445)
chr8 (589-915)||(22211869-22212197)
chr8 (589-777)||(21547515-21547702)
chr8 (556-913)||(23271689-23272048)
chr8 (589-715)||(34275363-34275486)
chr8 (723-913)||(29378961-29379157)
chr8 (611-715)||(27392105-27392208)
chr8 (556-899)||(17519675-17520022)
chr8 (589-715)||(23580589-23580715)
chr8 (556-715)||(23800829-23800987)
chr8 (720-920)||(40002577-40002783)
chr8 (721-796)||(15969520-15969595)
chr8 (724-915)||(8031410-8031608)
chr8 (728-805)||(12541041-12541118)
chr8 (712-826)||(17687363-17687479)
chr8 (884-985)||(20195697-20195802)
chr8 (733-826)||(24498761-24498857)
chr8 (854-930)||(7018878-7018956)
chr8 (740-830)||(28902839-28902934)
chr8 (727-800)||(15934381-15934454)
chr8 (727-800)||(19706874-19706947)
chr8 (727-806)||(24679101-24679180)
chr8 (556-668)||(15969686-15969794)
chr8 (727-800)||(19942594-19942667)
chr8 (727-800)||(26832434-26832507)
chr8 (354-426)||(31470842-31470915)
chr8 (757-826)||(1210399-1210470)
chr8 (556-664)||(8031204-8031313)
chr8 (758-826)||(24634774-24634847)
chr8 (747-806)||(16376048-16376107)
chr8 (720-801)||(22673150-22673233)
chr8 (740-802)||(30422117-30422180)
chr8 (472-527)||(32857076-32857131)
chr8 (356-426)||(16687512-16687582)
chr8 (758-800)||(19153422-19153464)
chr8 (727-797)||(20383060-20383130)
chr8 (364-422)||(31470743-31470800)
chr8 (740-801)||(43773491-43773553)
chr8 (757-806)||(17928476-17928525)
chr8 (727-800)||(19957057-19957130)
chr8 (763-802)||(14990196-14990235)
chr8 (720-801)||(22662437-22662520)
chr8 (747-806)||(23192484-23192543)
chr8 (760-826)||(23433607-23433672)
chr8 (762-801)||(33560932-33560971)
chr8 (747-801)||(40846106-40846161)
chr8 (758-800)||(18772081-18772123)
chr8 (856-913)||(21287924-21287982)
chr8 (360-426)||(32857070-32857136)
chr8 (763-801)||(43639177-43639215)
chr8 (856-913)||(45568489-45568547)
chr8 (486-527)||(5667195-5667236)
chr8 (357-414)||(5729228-5729285)
chr8 (757-806)||(18557439-18557487)
chr8 (589-662)||(22148333-22148405)
chr8 (727-800)||(25163429-25163502)
chr8 (589-642)||(29378791-29378843)
chr8 (740-800)||(29692683-29692744)
chr8 (472-525)||(31470848-31470901)
chr8 (740-800)||(45539155-45539215)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (553-985)||(37174-37610)
[»] chr7 (164 HSPs)
chr7 (589-985)||(588633-589032)
chr7 (589-985)||(15888809-15889208)
chr7 (589-985)||(21770423-21770822)
chr7 (589-985)||(1367048-1367449)
chr7 (556-985)||(9169573-9170005)
chr7 (589-985)||(31116991-31117390)
chr7 (591-985)||(30048941-30049339)
chr7 (589-985)||(9159150-9159550)
chr7 (556-985)||(40055234-40055664)
chr7 (589-985)||(3165152-3165554)
chr7 (589-985)||(20490427-20490826)
chr7 (589-985)||(21003489-21003886)
chr7 (589-896)||(38594256-38594560)
chr7 (589-985)||(166317-166714)
chr7 (589-985)||(176909-177306)
chr7 (589-985)||(5684941-5685338)
chr7 (589-985)||(6867706-6868103)
chr7 (589-985)||(6878338-6878735)
chr7 (589-985)||(9432686-9433083)
chr7 (589-985)||(14746150-14746550)
chr7 (589-985)||(20989076-20989472)
chr7 (589-985)||(48710972-48711369)
chr7 (589-985)||(22099160-22099557)
chr7 (589-985)||(26653806-26654203)
chr7 (589-985)||(26700135-26700532)
chr7 (589-985)||(26294510-26294908)
chr7 (589-985)||(468062-468459)
chr7 (589-985)||(9443282-9443679)
chr7 (589-985)||(22088545-22088942)
chr7 (589-985)||(40042589-40042988)
chr7 (589-985)||(40053138-40053537)
chr7 (589-985)||(24931084-24931482)
chr7 (589-985)||(37343621-37344019)
chr7 (589-985)||(17961205-17961604)
chr7 (589-985)||(9084703-9085103)
chr7 (589-985)||(9094417-9094817)
chr7 (589-985)||(17950599-17950998)
chr7 (589-985)||(8627369-8627768)
chr7 (589-985)||(8616807-8617205)
chr7 (589-985)||(2706093-2706493)
chr7 (589-985)||(24734173-24734572)
chr7 (589-985)||(24744120-24744519)
chr7 (556-985)||(11004567-11005004)
chr7 (589-985)||(26390577-26390977)
chr7 (589-985)||(26401219-26401619)
chr7 (589-985)||(1986958-1987359)
chr7 (589-985)||(1997579-1997980)
chr7 (589-985)||(42865245-42865646)
chr7 (589-985)||(42875871-42876272)
chr7 (589-985)||(2716697-2717097)
chr7 (589-896)||(44279941-44280251)
chr7 (589-985)||(8002546-8002947)
chr7 (589-985)||(8013191-8013592)
chr7 (589-848)||(25212471-25212732)
chr7 (589-896)||(540535-540840)
chr7 (589-974)||(17064021-17064408)
chr7 (556-930)||(38403749-38404124)
chr7 (589-985)||(4222032-4222427)
chr7 (589-946)||(18440616-18440974)
chr7 (589-915)||(4211463-4211785)
chr7 (589-930)||(8932985-8933325)
chr7 (556-929)||(26210088-26210460)
chr7 (589-931)||(48381606-48381950)
chr7 (589-843)||(457618-457870)
chr7 (589-985)||(3476822-3477220)
chr7 (589-930)||(15215738-15216078)
chr7 (589-946)||(13681742-13682098)
chr7 (556-830)||(19986159-19986435)
chr7 (589-946)||(29589414-29589770)
chr7 (589-915)||(24882945-24883274)
chr7 (650-930)||(12734703-12734984)
chr7 (733-946)||(18418677-18418893)
chr7 (589-826)||(11015217-11015463)
chr7 (589-828)||(20967086-20967328)
chr7 (589-777)||(1251598-1251784)
chr7 (555-788)||(23643052-23643286)
chr7 (556-745)||(6169838-6170028)
chr7 (589-753)||(1775553-1775718)
chr7 (589-753)||(22499359-22499521)
chr7 (589-768)||(12220245-12220422)
chr7 (589-795)||(6044957-6045161)
chr7 (589-743)||(24072031-24072183)
chr7 (596-775)||(23303859-23304041)
chr7 (589-753)||(45930884-45931049)
chr7 (589-715)||(20327850-20327973)
chr7 (589-715)||(22392648-22392771)
chr7 (589-715)||(22467798-22467921)
chr7 (589-714)||(37556005-37556127)
chr7 (839-931)||(455336-455429)
chr7 (721-920)||(8999489-8999694)
chr7 (723-920)||(13175160-13175362)
chr7 (721-911)||(11087608-11087803)
chr7 (725-818)||(1878923-1879018)
chr7 (733-805)||(2501662-2501735)
chr7 (859-985)||(11095744-11095873)
chr7 (723-826)||(12223090-12223196)
chr7 (733-805)||(11572876-11572949)
chr7 (727-800)||(13259125-13259198)
chr7 (727-800)||(13266465-13266538)
chr7 (884-985)||(44280209-44280314)
chr7 (720-899)||(4433158-4433342)
chr7 (739-806)||(7488620-7488687)
chr7 (741-800)||(13261338-13261397)
chr7 (720-899)||(4412585-4412770)
chr7 (728-805)||(15871754-15871832)
chr7 (727-801)||(19711733-19711807)
chr7 (727-800)||(4820848-4820921)
chr7 (740-800)||(14187063-14187123)
chr7 (727-797)||(11318766-11318837)
chr7 (740-801)||(30946079-30946141)
chr7 (740-831)||(602139-602237)
chr7 (727-800)||(5001549-5001622)
chr7 (720-826)||(16105624-16105732)
chr7 (740-800)||(24787735-24787796)
chr7 (589-665)||(8999787-8999862)
chr7 (740-800)||(11792284-11792344)
chr7 (740-800)||(16317278-16317337)
chr7 (733-805)||(25806797-25806869)
chr7 (355-403)||(29681893-29681941)
chr7 (720-801)||(1292444-1292527)
chr7 (727-805)||(16464385-16464461)
chr7 (740-801)||(15087925-15087987)
chr7 (740-806)||(16308426-16308492)
chr7 (740-806)||(16411383-16411449)
chr7 (358-424)||(17272799-17272864)
chr7 (740-801)||(28623080-28623142)
chr7 (727-800)||(10883894-10883967)
chr7 (727-800)||(12367460-12367533)
chr7 (727-800)||(13302222-13302295)
chr7 (727-800)||(13645812-13645885)
chr7 (363-424)||(24532794-24532854)
chr7 (490-527)||(29681894-29681931)
chr7 (370-419)||(35418177-35418226)
chr7 (758-818)||(10257765-10257828)
chr7 (556-665)||(13175456-13175565)
chr7 (740-800)||(19237758-19237818)
chr7 (740-800)||(29936069-29936128)
chr7 (720-801)||(8182313-8182396)
chr7 (727-801)||(13138617-13138692)
chr7 (747-806)||(13173065-13173124)
chr7 (727-801)||(13879531-13879606)
chr7 (492-527)||(17272822-17272857)
chr7 (741-800)||(21211267-21211326)
chr7 (757-800)||(21691752-21691795)
chr7 (757-800)||(41843147-41843190)
chr7 (372-419)||(43499990-43500037)
chr7 (727-800)||(2499424-2499498)
chr7 (554-665)||(11087896-11088007)
chr7 (740-801)||(14424891-14424953)
chr7 (763-801)||(15467316-15467354)
chr7 (740-801)||(19339969-19340031)
chr7 (763-801)||(35954625-35954663)
chr7 (727-800)||(44466455-44466529)
chr7 (740-801)||(48237561-48237623)
chr7 (720-803)||(331004-331089)
chr7 (740-804)||(2914329-2914394)
chr7 (727-800)||(4493936-4494009)
chr7 (740-800)||(13034560-13034621)
chr7 (747-800)||(14425929-14425982)
chr7 (727-800)||(16310630-16310703)
chr7 (740-800)||(16546057-16546118)
chr7 (740-800)||(16619544-16619605)
chr7 (763-800)||(21284096-21284133)
chr7 (727-792)||(33604268-33604333)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (589-985)||(2658-3059)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (589-985)||(33342-33741)
scaffold0047 (589-985)||(40893-41290)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (589-985)||(13997-14399)
scaffold0028 (589-985)||(54563-54962)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (556-985)||(7324-7756)
[»] scaffold0133 (3 HSPs)
scaffold0133 (556-985)||(42960-43396)
scaffold0133 (589-985)||(30549-30948)
scaffold0133 (589-715)||(26720-26845)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (556-985)||(2073-2506)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (589-874)||(3-287)
scaffold0171 (727-800)||(28098-28172)
[»] scaffold0105 (2 HSPs)
scaffold0105 (589-985)||(7378-7777)
scaffold0105 (589-985)||(37398-37797)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (589-985)||(11777-12173)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (589-931)||(7338-7679)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (589-826)||(100037-100272)
scaffold0002 (723-920)||(475799-476001)
scaffold0002 (723-920)||(482319-482521)
scaffold0002 (759-826)||(111805-111874)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (589-847)||(8650-8908)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (589-985)||(12557-12955)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (555-985)||(39886-40317)
[»] scaffold0084 (4 HSPs)
scaffold0084 (556-930)||(57280-57656)
scaffold0084 (720-920)||(935-1141)
scaffold0084 (727-800)||(31952-32026)
scaffold0084 (727-800)||(48698-48772)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (556-985)||(4681-5111)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (589-778)||(7085-7274)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (563-808)||(1279-1524)
[»] scaffold1200 (1 HSPs)
scaffold1200 (555-844)||(1-290)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (589-818)||(4437-4667)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (589-854)||(23190-23453)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (556-985)||(15112-15543)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (556-930)||(15984-16363)
scaffold0012 (612-931)||(127080-127406)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (589-946)||(34952-35313)
[»] scaffold1409 (1 HSPs)
scaffold1409 (589-817)||(1630-1856)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (589-784)||(21233-21430)
[»] scaffold0017 (5 HSPs)
scaffold0017 (589-866)||(174799-175074)
scaffold0017 (721-920)||(59405-59608)
scaffold0017 (721-920)||(40859-41064)
scaffold0017 (556-665)||(41156-41263)
scaffold0017 (589-665)||(59700-59774)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (556-918)||(1-363)
scaffold0570 (589-913)||(2227-2556)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (637-985)||(18668-19039)
scaffold0099 (730-985)||(17396-17673)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (596-809)||(4153-4364)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (596-825)||(155682-155909)
[»] scaffold0738 (1 HSPs)
scaffold0738 (589-899)||(5331-5641)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (589-985)||(28887-29288)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (733-985)||(1554-1809)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (589-809)||(61136-61357)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (733-930)||(10785-10984)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (589-915)||(57779-58107)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (589-915)||(155-489)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (589-915)||(10275-10609)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (554-731)||(7052-7230)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (589-915)||(29282-29610)
scaffold0001 (589-753)||(411994-412158)
scaffold0001 (449-522)||(507720-507793)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (589-766)||(10201-10376)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (556-913)||(53-415)
scaffold0090 (556-913)||(4436-4795)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (589-791)||(52370-52574)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (556-703)||(12218-12371)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (721-915)||(1525-1723)
[»] scaffold0360 (1 HSPs)
scaffold0360 (589-753)||(17749-17911)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (589-899)||(38499-38810)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (589-915)||(646-976)
scaffold0752 (800-915)||(1478-1591)
[»] scaffold2071 (1 HSPs)
scaffold2071 (757-915)||(955-1117)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (654-915)||(60545-60813)
scaffold0005 (589-668)||(60441-60522)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (589-715)||(8614-8737)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (589-715)||(17691-17814)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (589-715)||(82731-82854)
[»] scaffold0398 (1 HSPs)
scaffold0398 (589-706)||(13208-13326)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (555-690)||(5270-5404)
[»] scaffold0382 (1 HSPs)
scaffold0382 (556-830)||(1883-2163)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (589-711)||(1-120)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (556-768)||(17715-17929)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (721-896)||(61090-61270)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (721-899)||(11091-11272)
[»] scaffold0349 (2 HSPs)
scaffold0349 (556-773)||(10140-10355)
scaffold0349 (767-896)||(13934-14068)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (654-920)||(32282-32555)
[»] scaffold0655 (2 HSPs)
scaffold0655 (720-920)||(4475-4681)
scaffold0655 (589-665)||(4304-4382)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (720-830)||(5761-5877)
[»] scaffold1507 (2 HSPs)
scaffold1507 (720-800)||(20-101)
scaffold1507 (589-665)||(194-272)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (722-830)||(19923-20037)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (720-920)||(20921-21126)
scaffold0177 (552-671)||(21212-21331)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (721-899)||(34977-35158)
[»] scaffold1321 (2 HSPs)
scaffold1321 (722-920)||(1483-1686)
scaffold1321 (589-671)||(1751-1833)
[»] scaffold1263 (2 HSPs)
scaffold1263 (722-920)||(1676-1879)
scaffold1263 (589-671)||(1944-2026)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (722-920)||(7031-7234)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (589-665)||(1590-1664)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (733-830)||(16338-16441)
[»] scaffold0827 (1 HSPs)
scaffold0827 (589-685)||(5428-5524)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (723-913)||(2338-2534)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (720-801)||(3337-3420)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (727-809)||(2443-2525)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (727-805)||(37412-37490)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (740-806)||(76625-76691)
[»] scaffold1281 (1 HSPs)
scaffold1281 (747-800)||(2056-2109)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (727-800)||(9272-9345)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (740-800)||(16800-16860)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (740-800)||(20141-20201)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (727-801)||(6359-6434)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (720-801)||(16385-16468)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (720-801)||(35415-35498)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (739-806)||(87788-87855)
scaffold0004 (741-800)||(378218-378277)
scaffold0004 (747-800)||(219626-219679)
scaffold0004 (727-800)||(244952-245025)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (759-826)||(9630-9699)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (740-806)||(268162-268228)
scaffold0009 (763-801)||(83796-83834)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (740-806)||(95-161)
scaffold0003 (763-801)||(90725-90763)
[»] scaffold1002 (1 HSPs)
scaffold1002 (589-649)||(3426-3489)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (757-806)||(19474-19523)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (727-800)||(14484-14557)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (740-800)||(73961-74022)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (728-804)||(251037-251114)
scaffold0011 (856-913)||(165156-165214)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (740-792)||(2040-2092)
scaffold0622 (758-806)||(4027-4075)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (740-830)||(113-210)
scaffold0211 (856-913)||(1-59)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (740-800)||(32457-32517)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (740-800)||(59459-59519)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (757-792)||(6815-6850)
scaffold0040 (854-895)||(8279-8320)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (740-801)||(2361-2423)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (756-806)||(1538-1588)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (740-801)||(24010-24072)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (759-805)||(17000-17046)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (853-899)||(59792-59838)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (759-800)||(720-761)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (759-800)||(650-691)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (747-800)||(1327-1380)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (740-800)||(9343-9404)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (740-800)||(7412-7473)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (720-792)||(9326-9399)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (740-800)||(5939-6000)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 173)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 523
Target Start/End: Original strand, 4375997 - 4376498
Alignment:
Q  8 ggttctcctttagctaagtatccacgtacgccaatttcaaaacttgttttcttcccttcacgcgtctttactacatcaccatgcaatatttctttcactc 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  4375997 ggttctcctttagctaagtatccacgtacgccaatttcaaaacttgttttcttcccttcacgcgtctttactacatcaccatgcaatatttc----actc 4376092  T
Q  108 atttgttaatcaataaataataaatttggtcgacattttatggctatcattaactcaaaaggcatgcaagaaatttactagtagtcaacagatataaaga 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4376093 atttgttaatcaataa-taataaatttggtcgacattttatggctatcattaactcaaaaggcatgcaagaaatttactagtagtcaacagatataaaga 4376191  T
Q  208 gtgagagtgatgatatatggacaacatataatatttgtataaaatgtattaacttcatatacttattttatagatttgatttctctaaaatagctagaga 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4376192 gtgagagtgatgatatatggacaacatataatatttgtataaaatgtattaactttatatacttattttatagatttgatttctctaaaatagctagaga 4376291  T
Q  308 gcaaagtaaatgatttcaattattagtaaaaataattagggaaaccatggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaac 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4376292 gcaaagtaaatgatttcaattattagtaaaaataattagggaaatgatggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgccattggtcaac 4376391  T
Q  408 cacaatgtcacaagtgtacnnnnnnnnnnnnnnnnnncttatgaaagagaacgaagaaaacgatttgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtca 507  Q
    |||||||||||||||||||                  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  4376392 cacaatgtcacaagtgtac---------aaaaaaaaacttatgaaagagaaagaagaaaaccatttgtgacattgttgttggtcattgtcaccaatgtca 4376482  T
Q  508 tcaaccacaatgtcac 523  Q
    ||||||||||||||||    
T  4376483 tcaaccacaatgtcac 4376498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 21702465 - 21702864
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702465 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 21702564  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21702565 cggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaaacgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 21702664  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  21702665 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgc 21702764  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21702765 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgat 21702864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 589 - 981
Target Start/End: Original strand, 17446037 - 17446432
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446037 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 17446136  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446137 cggaaatgatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 17446236  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17446237 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgc 17446335  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa--caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  17446336 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacact 17446432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 34052912 - 34052480
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  34052912 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatgatacttcagaagcagtttggaaatg 34052813  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||     
T  34052812 cttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataaaacacaaacagttatcctgattccttccacaaaa 34052713  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  34052712 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaa 34052614  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa--caaaa 951  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||    
T  34052613 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 34052514  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  34052513 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 34052480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 21705272 - 21705711
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21705272 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 21705371  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21705372 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaaacgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaat 21705471  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca-------aatgctcaatactttctaagtatgagacttc 848  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21705472 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagacttc 21705571  T
Q  849 tcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-a 945  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21705572 tcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaa 21705671  T
Q  946 acaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21705672 acaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgat 21705711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 554 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 23407400 - 23406966
Alignment:
Q  554 tctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  23407400 tctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcaaaagcagtttgtgaa 23407301  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23407300 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 23407201  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23407200 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 23407101  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  23407100 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttttgatcaaacaaa 23407001  T
Q  951 aatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23407000 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 23406966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 34063540 - 34063141
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34063540 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatagttcttctgatgatacttcagaagcagtttggaaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcag 34063441  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34063440 cggaaaagatcaaagcagacaaaagaagaataagacacaaacagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 34063341  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34063340 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgc 34063242  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa--caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  34063241 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttga 34063142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 19464925 - 19464491
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19464925 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatg 19464826  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19464825 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 19464726  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19464725 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagactactcaaa 19464626  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19464625 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 19464526  T
Q  951 aatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19464525 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 19464491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 36229658 - 36229259
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36229658 aattgtgttttctttctctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcaaaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 36229559  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36229558 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 36229459  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36229458 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgc 36229359  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36229358 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 36229259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 42395903 - 42395504
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42395903 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 42395804  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42395803 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 42395704  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  42395703 aagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 42395604  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  42395603 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgat 42395504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 17456653 - 17457052
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17456653 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 17456752  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17456753 cggaaatgatcaaagcagggaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccataaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 17456852  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17456853 gagatttcacgataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgc 17456951  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa--caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||    
T  17456952 tcaagcactaagtaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacaggggaatatgtttgacttgaacacttga 17457051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 19478955 - 19478521
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19478955 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatg 19478856  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19478855 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 19478756  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19478755 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgttcaatactctctaagtatgagactactcaaa 19478656  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19478655 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 19478556  T
Q  951 aatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19478555 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 19478521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 20552768 - 20552335
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20552768 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 20552669  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20552668 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaat 20552569  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20552568 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 20552469  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  20552468 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 20552369  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20552368 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 20552335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 36085380 - 36084981
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  36085380 aattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgaagaaatgatcagaatcagatatgcag 36085281  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36085280 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 36085181  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  36085180 gagatttcactataatcgcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 36085081  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  36085080 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 36084981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 8522761 - 8522361
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8522761 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttatgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 8522662  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522661 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 8522562  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctca-aaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8522561 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 8522462  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  8522461 ctcaagcattaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttga 8522362  T
Q  985 t 985  Q
    |    
T  8522361 t 8522361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 289; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 43621234 - 43621634
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  43621234 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcaggtatgcag 43621333  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621334 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacagatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 43621433  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43621434 gagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 43621533  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43621534 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttga 43621633  T
Q  985 t 985  Q
    |    
T  43621634 t 43621634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 23393320 - 23392921
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23393320 aattgtgttttccttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 23393221  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23393220 cgaaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 23393121  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  23393120 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtttgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaaaagtcttccaatgc 23393021  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  23393020 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacgcttgat 23392921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 20563277 - 20562845
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||| |||||||   |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20563277 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcgttttctctataaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 20563178  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20563177 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaataaaagcaag-cacaagcagttatcctggttccttccacaaat 20563079  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20563078 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 20562979  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  20562978 atgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 20562879  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20562878 atacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 20562845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 1121243 - 1121642
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  1121243 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcag 1121341  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1121342 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 1121441  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1121442 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 1121541  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  1121542 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttga 1121641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 612 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 37407543 - 37407168
Alignment:
Q  612 aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 711  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37407543 aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcaacggaaaagatcaaagcagagaaa 37407444  T
Q  712 agaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 811  Q
    |||| |   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37407443 agaaaagcgagacacaagcagttatcctcgttccttccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaag 37407344  T
Q  812 attacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttc 911  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37407343 attacaaatgttcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttc 37407245  T
Q  912 taatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgttt-aacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  37407244 taatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaa-atgtttgaccttgaacacttgat 37407168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 1108485 - 1108884
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  1108485 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcag 1108583  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1108584 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 1108683  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1108684 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatactcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 1108783  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  1108784 ctcaagcactaagcaaaagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttga 1108883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 20798616 - 20798216
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  20798616 aattgtgttttctttttctttctaaaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgct 20798517  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
     ||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798516 acggaaaagaacatagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 20798417  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20798416 ggatatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 20798317  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||    
T  20798316 ctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacacttga 20798217  T
Q  985 t 985  Q
    |    
T  20798216 t 20798216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 619 - 985
Target Start/End: Original strand, 24925508 - 24925879
Alignment:
Q  619 cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaa 718  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  24925508 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaag 24925607  T
Q  719 taagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-a 817  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24925608 caagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaa 24925707  T
Q  818 aatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa-atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatg 916  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24925708 aatgctcaatactctctaagtatgagatttctcaaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatg 24925807  T
Q  917 ctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24925808 ctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 24925879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 595 - 985
Target Start/End: Original strand, 43043016 - 43043411
Alignment:
Q  595 gttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa 693  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43043016 gttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaa 43043115  T
Q  694 aagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 792  Q
    |||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043116 aagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 43043215  T
Q  793 tttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaa 892  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43043216 tttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaa 43043315  T
Q  893 gcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||    
T  43043316 gcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaggaattaagtttgacttgaacacttgat 43043411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 24982721 - 24983160
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaata-----cttcttctgataatacttcagaagcagtttgg 650  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   ||||| |     ||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  24982721 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctttaaaaaaaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttct 24982820  T
Q  651 gaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctcca 750  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24982821 gagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagtggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttcca 24982920  T
Q  751 caaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttct 849  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  24982921 caaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagcatgagacttct 24983020  T
Q  850 caaaa-atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-a 945  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |    
T  24983021 caaaatatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaa 24983120  T
Q  946 acaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24983121 acaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 24983160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 22560354 - 22559957
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22560354 aattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagtagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcag 22560258  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22560257 cggaaaagaacaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaa 22560158  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22560157 ggagatttcactataatcataaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 22560058  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  22560057 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaaagaattgagtttgacttgaacacttga 22559958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 27602761 - 27603158
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  27602761 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 27602857  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27602858 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 27602957  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27602958 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 27603057  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  27603058 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 27603157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 34772830 - 34772430
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  34772830 aattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcag 34772731  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34772730 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactaccaa 34772631  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34772630 ggagatttcactataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 34772531  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  34772530 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 34772431  T
Q  985 t 985  Q
    |    
T  34772430 t 34772430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 5300489 - 5300887
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  5300489 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 5300585  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300586 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 5300685  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5300686 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 5300785  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| |||||||||||||    
T  5300786 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttg 5300885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 555 - 985
Target Start/End: Original strand, 30069208 - 30069644
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggga 652  Q
    ||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  30069208 ctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaat-cttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtga 30069306  T
Q  653 atgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccac 751  Q
     ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30069307 gtgcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 30069406  T
Q  752 aaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc- 850  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  30069407 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcaca 30069506  T
Q  851 aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aac 947  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||    
T  30069507 aaaaatgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaac 30069606  T
Q  948 aaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  30069607 aaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 30069644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 31419583 - 31419183
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  31419583 aattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcag 31419484  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31419483 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagaagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 31419384  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31419383 ggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 31419284  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||    
T  31419283 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacacttga 31419184  T
Q  985 t 985  Q
    |    
T  31419183 t 31419183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 34783775 - 34783375
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  34783775 aattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtgtttctgatgaaatgatcagaattagatatgcag 34783676  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34783675 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactaccaa 34783576  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  34783575 ggagatttcactataatcacaaaaattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 34783476  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  34783475 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 34783376  T
Q  985 t 985  Q
    |    
T  34783375 t 34783375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 5289918 - 5290316
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  5289918 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttatgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 5290014  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5290015 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 5290114  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5290115 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 5290214  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| |||||||||||||    
T  5290215 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttg 5290314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 982
Target Start/End: Original strand, 27622110 - 27622504
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  27622110 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 27622206  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622207 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 27622306  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27622307 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcataaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 27622406  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||    
T  27622407 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 27622504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 16003234 - 16003631
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  16003234 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 16003330  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16003331 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 16003430  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16003431 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 16003530  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  16003531 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 16003630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 589 - 954
Target Start/End: Complemental strand, 23363028 - 23362662
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  23363028 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 23362932  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23362931 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 23362832  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23362831 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 23362732  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaata 954  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  23362731 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 23362662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 6131708 - 6131311
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  6131708 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttggt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 6131612  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6131611 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 6131512  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6131511 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 6131412  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  6131411 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 6131312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 9336872 - 9336531
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  9336872 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 9336776  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9336775 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 9336676  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9336675 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 9336576  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9336575 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 9336531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 9347459 - 9347118
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  9347459 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 9347363  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9347362 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 9347263  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9347262 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 9347163  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9347162 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 9347118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 15992672 - 15993069
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  15992672 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 15992768  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15992769 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcattccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 15992868  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15992869 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 15992968  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  15992969 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 15993068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Original strand, 36581900 - 36582241
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  36581900 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 36581996  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36581997 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 36582096  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36582097 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 36582196  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36582197 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 36582241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 40391274 - 40390877
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  40391274 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 40391178  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40391177 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttacacttccaa 40391078  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40391077 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 40390978  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  40390977 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 40390878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 40401936 - 40401539
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  40401936 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 40401840  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40401839 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaa 40401740  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40401739 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 40401640  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  40401639 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 40401540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 22147439 - 22147043
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  22147439 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 22147343  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22147342 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 22147243  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22147242 ggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 22147144  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  22147143 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 22147044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Original strand, 36592455 - 36592796
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||    
T  36592455 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgcag 36592551  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36592552 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 36592651  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36592652 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 36592751  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36592752 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 36592796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 23297196 - 23296797
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  23297196 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 23297100  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23297099 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 23297000  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23296999 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 23296900  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  23296899 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 23296800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 23307764 - 23307365
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  23307764 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 23307668  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23307667 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 23307568  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23307567 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 23307468  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  23307467 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 23307368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 23708361 - 23707962
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  23708361 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 23708265  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23708264 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 23708165  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23708164 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 23708065  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  23708064 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 23707965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 30226837 - 30227236
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  30226837 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 30226933  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30226934 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 30227033  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30227034 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 30227133  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  30227134 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 30227233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 30237364 - 30237763
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  30237364 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 30237460  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30237461 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 30237560  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30237561 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 30237660  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  30237661 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 30237760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 33951141 - 33951540
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  33951141 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 33951237  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33951238 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 33951337  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33951338 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 33951437  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  33951438 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 33951537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 39365400 - 39365001
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa--tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  39365400 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 39365304  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39365303 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 39365204  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39365203 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 39365104  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  39365103 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacactt 39365004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 42043703 - 42043333
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  42043703 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 42043607  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42043606 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 42043507  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42043506 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 42043407  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  42043406 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaataca 42043333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 42054278 - 42053908
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  42054278 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 42054182  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42054181 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 42054082  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42054081 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 42053982  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  42053981 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaataca 42053908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 22158022 - 22157626
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  22158022 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 22157926  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22157925 cggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 22157826  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22157825 ggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 22157727  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  22157726 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 22157627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Original strand, 7031499 - 7031823
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  7031499 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 7031595  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7031596 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 7031695  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7031696 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 7031795  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaat 915  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7031796 ctcaagcactaagcaagagacttctaat 7031823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 23697703 - 23697304
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  23697703 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 23697607  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23697606 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 23697507  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  23697506 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcacgcacacacgcaagagtcttccaa 23697407  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  23697406 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 23697307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 31449507 - 31449074
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||    
T  31449507 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgggttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 31449408  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  31449407 cttttgatgaaatgatcaaaattagatatgcagcggaaaataacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 31449308  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  31449307 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaggattacaactgatcaatactttctaagtatgagacttcacaaag 31449208  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  31449207 atgctcaaccacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagaacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 31449108  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||| ||| || |||| |||||||||||||||    
T  31449107 atacaaagaattaagtttgacttgaacacttgat 31449074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 40513330 - 40513729
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  40513330 aattgtgttttctttttctcttaaataatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcag 40513427  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40513428 cggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 40513526  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40513527 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 40513626  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  40513627 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 40513726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 39353408 - 39353008
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc---ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || | |||||| ||    
T  39353408 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcaaagtcagat-tg 39353312  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39353311 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 39353212  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  39353211 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 39353112  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  39353111 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 39353012  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  39353011 tgat 39353008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 563 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 31834429 - 31834003
Alignment:
Q  563 gagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctga 662  Q
    ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  31834429 gagaaaaacacaagaatggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaa-tacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctga 31834333  T
Q  663 tgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaag 761  Q
    || ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||    
T  31834332 tgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaag 31834234  T
Q  762 tagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc----aaaaatg 857  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||    
T  31834233 tagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatg 31834134  T
Q  858 ctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaata 954  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  31834133 ctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaata 31834034  T
Q  955 caatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  31834033 cagagaattgagtttgaattgaacacttgat 31834003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 14557358 - 14557757
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||    
T  14557358 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgcag 14557454  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557455 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 14557554  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14557555 ggagatttcactttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 14557654  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  14557655 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 14557754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 14567995 - 14568394
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||    
T  14567995 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgcag 14568091  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14568092 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 14568191  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14568192 ggagatttcactttaatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 14568291  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  14568292 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 14568391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 31844881 - 31844481
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  31844881 aattgtgttttctttttctcttaaaaa-tacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 31844786  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844785 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 31844686  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc----aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcc 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  31844685 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 31844586  T
Q  884 aatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacac 980  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||    
T  31844585 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 31844486  T
Q  981 ttgat 985  Q
    |||||    
T  31844485 ttgat 31844481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 37739874 - 37740308
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaa-aaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||| ||||  | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  37739874 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcttcttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagt 37739973  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37739974 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 37740072  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37740073 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaa 37740171  T
Q  854 a--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aaca 948  Q
    |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  37740172 actatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 37740271  T
Q  949 aaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  37740272 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 37740308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 22677036 - 22676666
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  22677036 aattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 22676940  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22676939 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 22676840  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22676839 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 22676740  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  22676739 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaataca 22676666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 22686927 - 22686557
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  22686927 aattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 22686831  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686830 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 22686731  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  22686730 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 22686631  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  22686630 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaataca 22686557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 10755411 - 10755012
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10755411 aattgtgttttcttcttctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 10755312  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10755311 cggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcctttcacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 10755213  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  10755212 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcacgcacacacgcaagagtcttccaatg 10755113  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  10755112 ctcaagaactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 10755013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 14456919 - 14457353
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaa-aaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  14456919 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagt 14457018  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14457019 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 14457117  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
       ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14457118 cacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaa 14457216  T
Q  854 --aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aaca 948  Q
      |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||    
T  14457217 acaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaca 14457316  T
Q  949 aaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  14457317 aaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 14457353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 37728591 - 37728992
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaa-aaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||| ||||  | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  37728591 aattgtgttttcttcttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 37728690  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37728691 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 37728789  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  37728790 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 37728888  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  37728889 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 37728988  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  37728989 tgat 37728992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 39490291 - 39490690
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  39490291 aattgtgttttctttttctcttaattaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 39490387  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39490388 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 39490487  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39490488 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 39490587  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  39490588 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 39490687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 39501481 - 39501880
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  39501481 aattgtgttttctttttctcttaattaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 39501577  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39501578 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 39501677  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39501678 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 39501777  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  39501778 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 39501877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 27204708 - 27204312
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||    
T  27204708 aattgtgttttctttttctcttaaaaa-tacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgcag 27204613  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaata-agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27204612 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacagagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 27204513  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  27204512 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatg 27204413  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  27204412 ctcaaacactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 27204313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 589 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 6976728 - 6976369
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  6976728 aattgtgttttctttttctcttaattaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 6976632  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6976631 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 6976532  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6976531 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 6976432  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa 946  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  6976431 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaa 6976369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 589 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 6987218 - 6986859
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  6987218 aattgtgttttctttttctcttaattaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 6987122  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6987121 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 6987022  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6987021 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 6986922  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa 946  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  6986921 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaa 6986859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 14446340 - 14446741
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaa-aaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  14446340 aattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 14446439  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14446440 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttca 14446538  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14446539 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 14446637  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  14446638 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 14446737  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  14446738 tgat 14446741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 35216424 - 35216026
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| |||||| | ||| |||| |||||| |||||    
T  35216424 aattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcag 35216328  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216327 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 35216228  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35216227 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 35216129  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  35216128 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 35216029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 35227008 - 35226610
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| |||||| | ||| |||| |||||| |||||    
T  35227008 aattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcag 35226912  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35226911 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 35226812  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35226811 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 35226713  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  35226712 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 35226613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 9376801 - 9377202
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  9376801 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9376897  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9376898 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9376997  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9376998 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 9377096  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  9377097 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 9377196  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  9377197 cttgat 9377202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 14041518 - 14041117
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  14041518 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 14041422  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14041421 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 14041322  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14041321 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 14041223  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  14041222 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 14041123  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  14041122 cttgat 14041117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 15693371 - 15693772
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  15693371 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 15693467  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15693468 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 15693567  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15693568 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 15693666  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  15693667 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 15693766  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  15693767 cttgat 15693772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 24568010 - 24567609
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  24568010 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24567914  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24567913 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24567814  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24567813 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 24567715  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  24567714 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 24567615  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  24567614 cttgat 24567609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 24816225 - 24816626
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  24816225 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24816321  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24816322 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24816421  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24816422 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 24816520  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  24816521 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 24816620  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  24816621 cttgat 24816626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 24826813 - 24827214
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  24826813 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24826909  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826910 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24827009  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24827010 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 24827108  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  24827109 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 24827208  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  24827209 cttgat 24827214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 27471481 - 27471080
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  27471481 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27471385  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27471384 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27471285  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27471284 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 27471186  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  27471185 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 27471086  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  27471085 cttgat 27471080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17719839 - 17719437
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata----cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |    
T  17719839 aattgtgttttctttttctcttaaaaaagagattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-t 17719743  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  17719742 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 17719643  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17719642 ccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtctt 17719544  T
Q  882 ccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaac 978  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||    
T  17719543 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaac 17719444  T
Q  979 acttgat 985  Q
    |||||||    
T  17719443 acttgat 17719437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17730491 - 17730089
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata----cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |    
T  17730491 aattgtgttttctttttctcttaaaaaagagattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-t 17730395  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  17730394 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 17730295  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17730294 ccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtctt 17730196  T
Q  882 ccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaac 978  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||    
T  17730195 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaac 17730096  T
Q  979 acttgat 985  Q
    |||||||    
T  17730095 acttgat 17730089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 24808833 - 24808432
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaa---atacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  24808833 aattgtgttttctttttctcttaaaaagggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24808737  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24808736 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacatgcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24808637  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24808636 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatacttttaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 24808538  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  24808537 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 24808438  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  24808437 cttgat 24808432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 27041551 - 27041952
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  27041551 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27041647  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27041648 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaatacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27041747  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27041748 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 27041846  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  27041847 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 27041946  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  27041947 cttgat 27041952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 27052175 - 27052576
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  27052175 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27052271  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27052272 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaatacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27052371  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27052372 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 27052470  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  27052471 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 27052570  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  27052571 cttgat 27052576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 27461082 - 27460681
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  27461082 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaactttagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27460986  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27460985 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27460886  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27460885 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 27460787  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  27460786 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 27460687  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  27460686 cttgat 27460681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 619 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 15740856 - 15740488
Alignment:
Q  619 cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-ga 717  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  15740856 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 15740760  T
Q  718 ataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 817  Q
      |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15740759 caaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattaca 15740661  T
Q  818 aatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 915  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15740660 actgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 15740561  T
Q  916 gctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  15740560 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 15740488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 619 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 15770016 - 15769648
Alignment:
Q  619 cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-ga 717  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  15770016 cttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaga 15769920  T
Q  718 ataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattaca 817  Q
      |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15769919 caaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattaca 15769821  T
Q  818 aatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 915  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15769820 actgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 15769721  T
Q  916 gctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  15769720 gctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 15769648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 14030965 - 14030620
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  14030965 aattatgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 14030869  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030868 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 14030769  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14030768 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 14030670  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14030669 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 14030620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 31349456 - 31349053
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-----cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagata 683  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |     ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||||||     
T  31349456 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat- 31349360  T
Q  684 tgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcact 782  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  31349359 tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacagacagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcact 31349260  T
Q  783 tccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtct 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  31349259 tccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtct 31349161  T
Q  881 tccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaa 977  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||    
T  31349160 tccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaa 31349061  T
Q  978 cacttgat 985  Q
    ||||||||    
T  31349060 cacttgat 31349053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 36688617 - 36688214
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-----cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagata 683  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |     ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||||||     
T  36688617 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat- 36688521  T
Q  684 tgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcact 782  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  36688520 tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcact 36688421  T
Q  783 tccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtct 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||| |||||    
T  36688420 tccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtct 36688322  T
Q  881 tccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaa 977  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||    
T  36688321 tccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaa 36688222  T
Q  978 cacttgat 985  Q
    ||||||||    
T  36688221 cacttgat 36688214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 36699183 - 36698780
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-----cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagata 683  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |     ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||||||     
T  36699183 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat- 36699087  T
Q  684 tgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcact 782  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  36699086 tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcact 36698987  T
Q  783 tccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtct 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  |||| |||||    
T  36698986 tccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacactcgcaagagtct 36698888  T
Q  881 tccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaa 977  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||    
T  36698887 tccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaa 36698788  T
Q  978 cacttgat 985  Q
    ||||||||    
T  36698787 cacttgat 36698780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17607983 - 17607579
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata------cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagat 682  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |      ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  17607983 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat 17607886  T
Q  683 atgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcac 781  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  17607885 -tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatactggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac 17607787  T
Q  782 ttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtc 879  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  17607786 ttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtc 17607688  T
Q  880 ttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttga 976  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||    
T  17607687 ttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattga 17607588  T
Q  977 acacttgat 985  Q
    |||||||||    
T  17607587 acacttgat 17607579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17618598 - 17618194
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata------cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagat 682  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |      ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  17618598 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat 17618501  T
Q  683 atgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcac 781  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  17618500 -tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatactggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac 17618402  T
Q  782 ttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtc 879  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||    
T  17618401 ttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtc 17618303  T
Q  880 ttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttga 976  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||    
T  17618302 ttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattga 17618203  T
Q  977 acacttgat 985  Q
    |||||||||    
T  17618202 acacttgat 17618194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 31360070 - 31359667
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-----cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagata 683  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |     ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||| ||||||     
T  31360070 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttatgatgaaatgatcagagtcagat- 31359974  T
Q  684 tgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcact 782  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  31359973 tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacagacagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcact 31359874  T
Q  783 tccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtct 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  31359873 tccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtct 31359775  T
Q  881 tccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaa 977  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||    
T  31359774 tccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaa 31359675  T
Q  978 cacttgat 985  Q
    ||||||||    
T  31359674 cacttgat 31359667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 554 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 20625720 - 20625354
Alignment:
Q  554 tctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| || ||||||||||||   ||||||     
T  20625720 tctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaatt-cttcttctggtattacttcagaagctagttgggag 20625622  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20625621 tgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaa 20625523  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctca 851  Q
    |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20625522 accggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc- 20625424  T
Q  852 aaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20625423 aaaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctca 20625354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 589 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 107038 - 106680
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  107038 aattgtgttttctttttctcttaaaaaat-cttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcag 106940  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106939 cggaataaaacagagcagagaaaagaaaga-aagacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 106841  T
Q  789 gaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  106840 gagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctc--aaattctcaagcacgcaggcgagagacttccaat 106743  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa 946  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  106742 gctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaa 106680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 556 - 917
Target Start/End: Original strand, 21420071 - 21420431
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||    
T  21420071 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaat-cttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtg 21420169  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | | || ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||      
T  21420170 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcaacggaataaaacagagcagagaaaagaaaga-aagacacaagcaattatcctggttccttccacaatc 21420268  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  |    
T  21420269 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaattctctcttagtatgagacttctc--a 21420366  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgc 917  Q
    |||| |||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21420367 aatggtcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgc 21420431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 589 - 920
Target Start/End: Original strand, 32753288 - 32753617
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  32753288 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 32753385  T
Q  689 cggaaa-agatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    | |||  | | || | ||||||||||||| | | |||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32753386 cagaatgaaaacagaacagagaaaagaaggaga-gacacaagcaattatcctgattccttccacaaactggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 32753484  T
Q  788 ggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || |||||||    
T  32753485 ggagatttccactaaaaatcacacagattacagatgctcaatactctct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaa 32753581  T
Q  886 tgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32753582 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctca 32753617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 556 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 20417854 - 20417481
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  20417854 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcttcttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatg 20417757  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa--aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||  || ||  || ||||||||||||  | | |||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20417756 cttctgatgtgatgttcagagtcagatatgcagcggaatgaaaatagaa-cagagaaaagaaagaga-gacataagcaattatcctggttccttccacaa 20417659  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctca 851  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  20417658 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagacttctc- 20417561  T
Q  852 aaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
     |||||||||||||| || || | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20417560 -aaatgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 20417481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 145 - 322
Target Start/End: Original strand, 4378599 - 4378774
Alignment:
Q  145 ttatggctatcattaactcaaaaggcatgcaagaaatttactagtagtcaacagatataaagagtgagagtgatgatatatggacaacatataatatttg 244  Q
    |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4378599 ttatggctatcattaactcaa--gtcatgcaagaaatttactagtagtgaacagatataaagtgtgagagtgatgatatatggacaacatataatatttg 4378696  T
Q  245 tataaaatgtattaacttcatatacttattttatagatttgatttctctaaaatagctagagagcaaagtaaatgatt 322  Q
    |||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4378697 tataaaatgtataaactctaaatacttagtttatagatttgatttcactaaaataactagagagcaaagtaaatgatt 4378774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 556 - 915
Target Start/End: Original strand, 13522418 - 13522779
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||  | ||||||||| | ||| || ||    
T  13522418 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcg-aaaatat-cttcttctgatatcaattcagaagctggttgagagtg 13522515  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || | || || |||||||| ||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13522516 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaataaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 13522614  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttc 848  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13522615 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtatgagacttc 13522713  T
Q  849 tcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
     |  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  13522714 cc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 13522779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 556 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 35544053 - 35543694
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||    
T  35544053 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggaggttgaattgtgttttctttttctcgtaaaa--ttcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtg 35543956  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa--aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||| |||  |||||| ||||| ||| |||||  || |  | ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  35543955 cttctgatgtgatgttcagaattagatacgcaacggaataaaaaatagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaa 35543857  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagactt 847  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  35543856 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtatgagactt 35543758  T
Q  848 ctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttct 912  Q
    | |  |||||||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35543757 ccc--aaatgctcaagcatgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttct 35543694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 589 - 872
Target Start/End: Original strand, 13533208 - 13533492
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||  | ||||||||| | ||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  13533208 aattgtgttttctttttctcg--aaaaattcttcttctgatatcaattcagaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 13533305  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || || ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13533306 cggaataaaaacagagtagagaaaagaa-agagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 13533404  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggc 872  Q
    |||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||    
T  13533405 ggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtatgaaacttccc--aaatgctcaagcacgcaggc 13533492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 36096543 - 36096215
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||  ||||||||||| | ||  || |||||||||||| |||  ||||||  |||| ||||    
T  36096543 aattgtgttttctttttctcggaaaa--ttcttcttctgatatcacttcagaagctggttaagagtgcttctgatgtgatgttcagaattggatacgcag 36096446  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || || ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36096445 cggaataaaaacagagtagagaaaagaa-acagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaa 36096347  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | || |||    
T  36096346 ggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagactt 36096250  T
Q  882 ccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36096249 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 36096215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 36098000 - 36097672
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||  ||||||||||| | ||  || |||||||||||| |||  ||||||  |||| ||||    
T  36098000 aattgtgttttctttttctcggaaaa--ttcttcttctgatatcacttcagaagctggttaagagtgcttctgatgtgatgttcagaattggatacgcag 36097903  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || || ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36097902 cggaataaaaacagagtagagaaaagaa-acagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaa 36097804  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | || |||    
T  36097803 ggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagactt 36097707  T
Q  882 ccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  36097706 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 36097672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 558 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 20168989 - 20168630
Alignment:
Q  558 aaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgct 657  Q
    |||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |  || || ||||    
T  20168989 aaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctc--agaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggatgagagtgct 20168892  T
Q  658 tctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaatt 756  Q
    |||||||| |||  || |||| |||| ||||||||| || | || || ||||||||||| |   ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||      
T  20168891 tctgatgtgatgttcaaaatccgatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaa-agagagacataagcaattatcctggttccttccacaaacc 20168793  T
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc 850  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |    
T  20168792 ggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacct-agtatgagacttccc 20168694  T
Q  851 aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
      |||||||||||||| ||||| | || ||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20168693 --aaatgctcaagcacgcaggcgagagactttctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 20168630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 20215897 - 20215693
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 815  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  20215897 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 20215798  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||      
T  20215797 caactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 20215700  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  20215699 atgctca 20215693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 721 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 40033519 - 40033321
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  40033519 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagatt 40033420  T
Q  815 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttct 912  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40033419 acaactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttct 40033322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Original strand, 40228013 - 40228219
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagat 813  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||    
T  40228013 aagacacaagcaattatactggttccttccacaaactagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagat 40228112  T
Q  814 tacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 911  Q
    ||||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || || ||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40228113 tacaactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagactccctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 40228210  T
Q  912 taatgctca 920  Q
      |||||||    
T  40228211 ctatgctca 40228219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 721 - 913
Target Start/End: Original strand, 23487908 - 23488104
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 815  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||  ||||||    
T  23487908 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacgcagatta 23488007  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23488008 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 23488104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Original strand, 23477732 - 23477935
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 815  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  23477732 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccctcttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 23477831  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||      
T  23477832 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 23477928  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  23477929 atgctca 23477935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 24646676 - 24646550
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  24646676 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24646580  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24646579 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 24646550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 654 - 913
Target Start/End: Original strand, 1914734 - 1915000
Alignment:
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcgga--aaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccac 751  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||  ||| | || || |||||||||||  | | |||||||||| ||||  ||||||| ||||     
T  1914734 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatattggttccttccat 1914832  T
Q  752 aaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgaga 844  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||    
T  1914833 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 1914932  T
Q  845 cttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||  ||| |||||||| |||||  | |||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1914933 ct--tcacaaatgctcgagcactaaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1915000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 426
Target Start/End: Original strand, 5215560 - 5215629
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  5215560 ggataatacttgggtgacattgtggttggtaacattggtgacatt-accaaccacaatgttacaagtgtac 5215629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 589 - 668
Target Start/End: Original strand, 13403537 - 13403618
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata--cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaat 668  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  13403537 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaatcttcttctgatattacttcagaagctgtttgagagtgcttctgatgtaat 13403618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 473 - 527
Target Start/End: Original strand, 29385390 - 29385444
Alignment:
Q  473 tgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29385390 tgtgacattgtggttggccaatgtcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 29385444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 6513193 - 6513128
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 804  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6513193 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactataat 6513128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 419
Target Start/End: Original strand, 19417442 - 19417498
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcaca 419  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19417442 acttgggtgacattgtggttggtgacattggtgacattggtcaactacaatgtcaca 19417498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 733 - 801
Target Start/End: Original strand, 21659581 - 21659649
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21659581 ttatactggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcactttcaaggagagttcactat 21659649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 29385446 - 29385390
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcaca 419  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29385446 acttgggtgacattgtggttggtgacattggtgacattggccaaccacaatgtcaca 29385390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 1840024 - 1839970
Alignment:
Q  473 tgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1840024 tgtgacattgtggttggccaatgtcatcaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 1839970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 800 - 915
Target Start/End: Original strand, 13403702 - 13403817
Alignment:
Q  800 ataatcacaaagattacaaatgctcaatacttt-ctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac-t 897  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||      
T  13403702 ataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacga 13403799  T
Q  898 aagcaagagtcttctaat 915  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  13403800 aagcaagagacttctaat 13403817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 19417498 - 19417444
Alignment:
Q  473 tgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19417498 tgtgacattgtagttgaccaatgtcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 19417444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 25112660 - 25112454
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 812  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  25112660 aagacacaagcaattatacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 25112561  T
Q  813 ttacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtctt 910  Q
    |||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| |  |||||  |||||||||||| ||||||||| |||    
T  25112560 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 25112464  T
Q  911 ctaatgctca 920  Q
    |  |||||||    
T  25112463 cctatgctca 25112454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 25171751 - 25171545
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 812  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  25171751 aagacacaagcaattatacaggttccttccacaaatcagaagtcagtcatgtcccccttgtacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 25171652  T
Q  813 ttacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtctt 910  Q
    |||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| |  |||||  |||||||||||| ||||||||| |||    
T  25171651 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagatacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 25171555  T
Q  911 ctaatgctca 920  Q
    |  |||||||    
T  25171554 cctatgctca 25171545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 26056262 - 26056184
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  26056262 aagcaattatcttggttccttccacaatccagaagtagtccagtcccccttgaacttccaatgatatttcactataatc 26056184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 7746469 - 7746396
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7746469 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 7746396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 731 - 792
Target Start/End: Original strand, 31117245 - 31117306
Alignment:
Q  731 agttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 792  Q
    |||||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31117245 agttatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 31117306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 757 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 31589686 - 31589637
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31589686 ggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 31589637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 13546283 - 13546223
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13546283 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13546223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 354 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 36568873 - 36568802
Alignment:
Q  354 atggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  36568873 atggataatacttatgtgacattgtggttggtgacattagtgaca-taatcaaccacaatgttacaagtgtac 36568802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 741 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 9399377 - 9399318
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9399377 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 9399318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Original strand, 10848127 - 10848210
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10848127 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 10848210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 741 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 19537058 - 19536999
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  19537058 gttccttccacaaatcggaagtagtcatgtcctccttgcacttccaaggagagttcacta 19536999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 419
Target Start/End: Original strand, 1839974 - 1840024
Alignment:
Q  369 gtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcaca 419  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1839974 gtgacattgtggttggtgacattgatgacattggccaaccacaatgtcaca 1840024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7137805 - 7137743
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgta 425  Q
    ||||| |||||||| | |||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7137805 acttgggtgacattatagttggtgacattgacgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgta 7137743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Original strand, 32160103 - 32160309
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 812  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  32160103 aagacacatgcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 32160202  T
Q  813 ttacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtctt 910  Q
    |||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||  ||||||||| |||    
T  32160203 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattactcaagcacacaggcaagagatttcctttgctcaagcacacaagcaagagactt 32160299  T
Q  911 ctaatgctca 920  Q
    |  |||||||    
T  32160300 cctatgctca 32160309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 11993265 - 11993326
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11993265 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11993326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 25097601 - 25097528
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25097601 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttccaaggagagttcacta 25097528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 25155571 - 25155498
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25155571 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttccaaggagagttcacta 25155498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 426
Target Start/End: Original strand, 34394692 - 34394725
Alignment:
Q  393 gtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34394692 gtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 34394725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 90185 - 90125
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  90185 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcacta 90125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 774 - 826
Target Start/End: Original strand, 26013259 - 26013310
Alignment:
Q  774 ccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 826  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26013259 ccttgcactttcaagg-gatttcactataatctcatagattacaaatgctcaa 26013310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 747 - 802
Target Start/End: Original strand, 26764887 - 26764943
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 802  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26764887 tccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactata 26764943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 757 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 643445 - 643402
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  643445 ggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 643402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 424
Target Start/End: Original strand, 20986463 - 20986494
Alignment:
Q  393 gtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20986463 gtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgt 20986494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Original strand, 28138959 - 28139042
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  28138959 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaaaggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 28139042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 28465119 - 28465036
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28465119 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccagaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 28465036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 35932789 - 35932706
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35932789 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 35932706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 668
Target Start/End: Original strand, 40227845 - 40227924
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaat 668  Q
    ||||||||||||||||||||  |||  |  ||||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  40227845 aattgtgttttctttttctcaaaaatgaatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttaagagtgcttctgatgtaat 40227924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Original strand, 4378470 - 4378512
Alignment:
Q  50 cttgttttcttcccttcacgcgtctttactacatcaccatgca 92  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4378470 cttgtttgcttcccttcacgcgtctctagtacatcaccatgca 4378512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 449 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 7137718 - 7137640
Alignment:
Q  449 tgaaagagaacgaagaaaacgatttgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||||| |||||||   | |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  7137718 tgaaagagaatgaagaaagtcacttgtgacattgtggttggtcaatgtcaccaatttcaccaactgcaatgtcacccaa 7137640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 356 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 12605714 - 12605653
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12605714 ggataatacttaagtgacattgtggttggt---------gacattggtcaaccacaatgtcacacgtgtac 12605653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 17814326 - 17814400
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17814326 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgctcttccaaggagagttcacta 17814400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 758 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 22000771 - 22000729
Alignment:
Q  758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22000771 gaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22000729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 26120583 - 26120517
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  26120583 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgtacttccaaggagaagtcactaaaatca 26120517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 856 - 913
Target Start/End: Original strand, 32160274 - 32160332
Alignment:
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32160274 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 32160332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 4376504 - 4376447
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaa 420  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  4376504 acttgagtgacattgtggttgatgacattggtgacaatgaccaacaacaatgtcacaa 4376447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 527
Target Start/End: Original strand, 5215691 - 5215720
Alignment:
Q  498 accaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5215691 accaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 5215720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 426
Target Start/End: Original strand, 5998556 - 5998589
Alignment:
Q  393 gtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5998556 gtgacattggtcaaccacaatgtcagaagtgtac 5998589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 362 - 423
Target Start/End: Original strand, 7137637 - 7137698
Alignment:
Q  362 tacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtg 423  Q
    |||||| |||||||||  |||||| | ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  7137637 tacttgggtgacattgcagttggtgaaattggtgacattgaccaaccacaatgtcacaagtg 7137698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 741 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 13736834 - 13736773
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13736834 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 13736773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 760 - 820
Target Start/End: Original strand, 22747821 - 22747880
Alignment:
Q  760 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaat 820  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  22747821 agtagtccagtcccc-ttgcacttccaagg-gatttcactataataacataggattacaaat 22747880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 23880428 - 23880501
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| | ||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23880428 aagcaattatacaggttcctttcacaaaccggatgtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 23880501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 26766610 - 26766537
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  26766610 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcatttccaagaagagttcacta 26766537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 741 - 801
Target Start/End: Original strand, 33022040 - 33022101
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  33022040 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttcactat 33022101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 769 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 39799573 - 39799536
Alignment:
Q  769 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  39799573 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 39799536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 126)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 18769755 - 18769324
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18769755 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggaaatg 18769656  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18769655 cttttgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggtttcttccacaaat 18769556  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  18769555 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctctctaagtatgagacttctc-aaaa 18769457  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaa 952  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18769456 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 18769357  T
Q  953 tacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18769356 tacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 18769324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 554 - 985
Target Start/End: Original strand, 26866448 - 26866881
Alignment:
Q  554 tctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26866448 tctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaa-atacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 26866546  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26866547 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 26866646  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26866647 aacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aa 26866745  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa--caa 949  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  26866746 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatcctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 26866845  T
Q  950 aaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26866846 aaatacagggaaatatgtttgacttgaacacttgat 26866881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 563 - 985
Target Start/End: Original strand, 26879046 - 26879470
Alignment:
Q  563 gagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctga 662  Q
    ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26879046 gagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaa-atacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctga 26879144  T
Q  663 tgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt 762  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  26879145 tgtaatgaccagaatcagatatgcagcggataagatcaaagcagaaaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagt 26879244  T
Q  763 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaa 862  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26879245 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaa 26879343  T
Q  863 gcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa--caaaaatacaat 958  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||| |      
T  26879344 gcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagttttctaatgctcaagcacgtaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatatagg 26879443  T
Q  959 gaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26879444 gaaatatgtttgacttgaacacttgat 26879470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 24428404 - 24428005
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24428404 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctaataaaactttagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 24428305  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24428304 cggacaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 24428205  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24428204 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 24428105  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||    
T  24428104 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagagataagtttgacttgaacacttgat 24428005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 28732721 - 28732321
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  28732721 aattgtgttttctttttctctctaaaaaaaatttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaaggatcagaatcagatatgca 28732622  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28732621 gcgaaaaagatcaaagcagagaaaagaaaggcaagacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 28732522  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28732521 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 28732422  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28732421 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttga 28732322  T
Q  985 t 985  Q
    |    
T  28732321 t 28732321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 24415839 - 24415440
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||    
T  24415839 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctattgaaatgatcagaatcagatatgcag 24415740  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24415739 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagttgtccagtcacccttgcacttccaag 24415640  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  24415639 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 24415540  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||    
T  24415539 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagagataagtttgacttgaacacttgat 24415440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 21173287 - 21172885
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21173287 aattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgtgatgaccagaatcagatatgcag 21173188  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21173187 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 21173088  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21173087 ggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 21172988  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21172987 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacactt 21172888  T
Q  983 gat 985  Q
    |||    
T  21172887 gat 21172885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 28722168 - 28721735
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaata-cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  28722168 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagtagtttgtgaat 28722069  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28722068 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgaaaaagatcaaagcagagaaaagaaaggcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 28721969  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28721968 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattgcaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 28721869  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||| |||||||    
T  28721868 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaaaaggcttctgatcaaacaaaa 28721769  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  28721768 atacaatgatataagtttgacttgaacacttgat 28721735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 611 - 985
Target Start/End: Original strand, 2560920 - 2561297
Alignment:
Q  611 aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaa 710  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  2560920 aaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaa 2561018  T
Q  711 aagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2561019 aagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaa 2561118  T
Q  810 agattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtct 909  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561119 agattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtct 2561218  T
Q  910 tctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  2561219 tctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaaatttgacttgaacacttgat 2561297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 27979231 - 27978801
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27979231 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataatacttcagaagcagttttggaatg 27979134  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27979133 cttctgatgtaatgaacagaattagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcagttatcttggttccttccacaaat 27979034  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  27979033 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaa 27978935  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  27978934 atgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaa 27978835  T
Q  952 atacaatgaaatatgttt-aacttgaacacttgat 985  Q
    |||||  |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  27978834 atacagagaaa-atgtttgaccttgaacacttgat 27978801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 38586938 - 38586506
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38586938 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaatacttcttctgataatacttcagaatcagtttgggaatg 38586841  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  38586840 cttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcagttatcctggttcattccacaaaa 38586741  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctca--aa 853  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  38586740 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaagtgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaa 38586641  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| || || ||||||    
T  38586640 aatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagagacttatgttcaaacaaa 38586541  T
Q  951 aatacaatgaaatatgttt-aacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  38586540 aatacagagaaa-atgtttgaccttgaacacttgat 38586506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 43082066 - 43082463
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  43082066 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcag 43082162  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082163 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 43082262  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43082263 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 43082362  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  43082363 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 43082462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 28065760 - 28065330
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28065760 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataatacttcagaagcagttttggaatg 28065663  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||    
T  28065662 cttctgatgtaatgaacagaattagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcaattatcatagttccttccacaaat 28065563  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  28065562 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaa 28065464  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  28065463 atgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttctgttcaaacaaaa 28065364  T
Q  952 atacaatgaaatatgttt-aacttgaacacttgat 985  Q
    |||||  |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  28065363 atacagagaaa-atgtttgaccttgaacacttgat 28065330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 43092675 - 43093072
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  43092675 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcag 43092771  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43092772 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 43092871  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43092872 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 43092971  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  43092972 ctcaagcactaagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 43093071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 16768355 - 16768752
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  16768355 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 16768451  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16768452 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 16768551  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16768552 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 16768651  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  16768652 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 16768751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 1100011 - 1099614
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  1100011 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 1099915  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099914 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 1099815  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1099814 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 1099715  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  1099714 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 1099615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 4099226 - 4099623
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  4099226 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 4099322  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099323 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 4099422  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4099423 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 4099522  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  4099523 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 4099622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 4209301 - 4209698
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  4209301 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 4209397  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4209398 cggaaaggaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 4209497  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4209498 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 4209597  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  4209598 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 4209697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 4219893 - 4220290
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  4219893 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 4219989  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4219990 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 4220089  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4220090 ggagatttcactataatcacaaagattacaactactcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 4220189  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  4220190 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 4220289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 22961148 - 22960751
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  22961148 aattgtgttttctatttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 22961052  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22961051 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 22960952  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22960951 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 22960852  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  22960851 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 22960752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Original strand, 40250605 - 40250946
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  40250605 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 40250701  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40250702 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 40250801  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40250802 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 40250901  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40250902 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 40250946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 7006624 - 7006226
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaat-acttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  7006624 aattgtgttttctttttctcttaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 7006528  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7006527 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 7006428  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7006427 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 7006328  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  7006327 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttg 7006228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 29243633 - 29244031
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  29243633 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 29243729  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29243730 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 29243829  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  29243830 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 29243929  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  29243930 gctcaagcactaagaaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttg 29244029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 29254212 - 29254610
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  29254212 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 29254308  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29254309 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 29254408  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  29254409 aggagatttcactataataacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 29254508  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  29254509 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttg 29254608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 9774119 - 9773723
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  9774119 aattgtgttttctttttctcttaaaaa-tacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 9774024  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9774023 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 9773924  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9773923 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 9773824  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  9773823 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 9773724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 22915680 - 22915283
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  22915680 aattgtgttttctatttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 22915584  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915583 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 22915484  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22915483 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 22915384  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  22915383 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 22915284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 40221744 - 40222141
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  40221744 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 40221840  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40221841 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaa 40221940  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  40221941 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtataagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 40222040  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  40222041 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 40222140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 18393455 - 18393056
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  18393455 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 18393359  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18393358 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 18393259  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18393258 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 18393159  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  18393158 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 18393059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Original strand, 34477340 - 34477682
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  34477340 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 34477436  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477437 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 34477536  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  34477537 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 34477636  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34477637 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 34477682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 9763583 - 9763187
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  9763583 aattgtgttttctttttctcttaaaaa-tacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 9763488  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9763487 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 9763388  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9763387 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaaatatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 9763288  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  9763287 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 9763188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17858252 - 17857856
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| | ||| |||||| |||||    
T  17858252 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgtc-agagtcagat-tgcag 17858157  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17858156 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 17858057  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17858056 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatattttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 17857957  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  17857956 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 17857857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 32217284 - 32217683
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  32217284 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 32217380  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32217381 cggaaaagaacagagcaaagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 32217480  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc--aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32217481 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 32217580  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  32217581 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 32217680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 611 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 11389603 - 11389228
Alignment:
Q  611 aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaa 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  11389603 aaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaa 11389507  T
Q  711 aagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389506 aagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 11389407  T
Q  810 agattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtct 909  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11389406 agattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 11389307  T
Q  910 tctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  11389306 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 11389228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 24339223 - 24338823
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc---ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  24339223 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 24339127  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24339126 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 24339027  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24339026 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 24338927  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  24338926 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 24338827  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  24338826 tgat 24338823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 35252356 - 35252791
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  35252356 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 35252455  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35252456 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 35252554  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35252555 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 35252653  T
Q  853 aa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aac 947  Q
    ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  35252654 aactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 35252753  T
Q  948 aaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||  ||| |  ||| || |||||||||||||    
T  35252754 aaaaatacagagaattgagttgaatttgaacacttgat 35252791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 35262965 - 35263400
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  35262965 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 35263064  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35263065 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 35263163  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35263164 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 35263262  T
Q  853 aa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aac 947  Q
    ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  35263263 aactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 35263362  T
Q  948 aaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  35263363 aaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 35263400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 35273590 - 35274025
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  35273590 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 35273689  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35273690 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 35273788  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35273789 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 35273887  T
Q  853 aa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aac 947  Q
    ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  35273888 aactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 35273987  T
Q  948 aaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  35273988 aaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 35274025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 11395990 - 11395591
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  11395990 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 11395894  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11395893 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 11395794  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11395793 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 11395694  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  11395693 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 11395594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 11406306 - 11405907
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  11406306 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 11406210  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11406209 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 11406110  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11406109 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 11406010  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  11406009 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 11405910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 24328554 - 24328153
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc----ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| | |||| |    
T  24328554 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagttagat-t 24328458  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  24328457 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 24328358  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcc 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24328357 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 24328258  T
Q  884 aatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacac 980  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||    
T  24328257 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacac 24328158  T
Q  981 ttgat 985  Q
    |||||    
T  24328157 ttgat 24328153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 556 - 954
Target Start/End: Original strand, 27220755 - 27221159
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  27220755 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 27220854  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27220855 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 27220953  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27220954 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 27221052  T
Q  853 aa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aac 947  Q
    ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  27221053 aactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 27221152  T
Q  948 aaaaata 954  Q
    |||||||    
T  27221153 aaaaata 27221159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 36252662 - 36252263
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa--tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| || | |||||| |||    
T  36252662 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcaaagtcagat-tgc 36252566  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36252565 agcggaaaagaacaaagcagagaaaagaaagacaatgacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttcc 36252466  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  36252465 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgtaagagtcttccaa 36252366  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  36252365 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 36252266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 554 - 866
Target Start/End: Original strand, 30794185 - 30794497
Alignment:
Q  554 tctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  30794185 tctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttttttctctct-aaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaa 30794283  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30794284 tgcttctgatgaaaagatcagaataagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 30794383  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30794384 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 30794483  T
Q  853 aaatgctcaagcac 866  Q
    ||||||||||||||    
T  30794484 aaatgctcaagcac 30794497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 589 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 21651322 - 21650981
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  21651322 aattgtgttttctttttctcttaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 21651226  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21651225 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 21651126  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21651125 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 21651027  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21651026 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggc 21650981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 589 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 30489643 - 30489273
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaa-aaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30489643 aattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagactgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 30489544  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30489543 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 30489445  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || | |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30489444 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcaaaagactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 30489345  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatac 955  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  30489344 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 30489273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 34791034 - 34790636
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  34791034 aattgtgttttctttttctctttaaaaaatacttctactgataaaacaccagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgca 34790938  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34790937 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaccagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 34790838  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  34790837 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 34790738  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  34790737 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 34790638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 34805177 - 34804779
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||    
T  34805177 aattgtgttttctttttctctttaaaaaatacttctactgataaaacaccagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgca 34805081  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34805080 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacaccagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 34804981  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  34804980 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 34804881  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  34804880 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 34804781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 9908981 - 9908610
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||    
T  9908981 aattgtgttttcttttactcttaaaaaatacttcttctgataaaactccagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcag 9908885  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9908884 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttacacttccaa 9908785  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc---aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9908784 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9908685  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  9908684 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctaatcaaacaaaaataca 9908610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 589 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 9898393 - 9897996
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||    
T  9898393 aattgtgttttcttttactcttaaaaaatacttcttctgataaaactccagaagcagtttg--attgcttatgatgaaatgatcagagacagat-tgcag 9898297  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9898296 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccataacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaa 9898197  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc---aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9898196 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9898097  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||||| |||||||||    
T  9898096 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttaagttgaacact 9897997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 43354430 - 43354832
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc----ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |    
T  43354430 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-t 43354526  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  43354527 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 43354626  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  43354627 ccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtctt 43354725  T
Q  882 ccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaac 978  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||    
T  43354726 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaac 43354825  T
Q  979 acttgat 985  Q
    |||||||    
T  43354826 acttgat 43354832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 611 - 985
Target Start/End: Original strand, 43344841 - 43345217
Alignment:
Q  611 aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaa 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  43344841 aaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaa 43344937  T
Q  711 aagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    ||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43344938 aagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-a 43345036  T
Q  810 agattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagt 907  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43345037 agattacaactgctcaatactttctaagtatgagactacacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 43345136  T
Q  908 cttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  43345137 cttctaatgctcaagcacgcaggctagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 43345217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 10266402 - 10266803
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata---cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  10266402 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatgattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 10266498  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10266499 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 10266598  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10266599 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 10266697  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  10266698 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 10266797  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  10266798 cttgat 10266803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 10276979 - 10277380
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  10276979 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 10277075  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10277076 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 10277175  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10277176 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 10277274  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  10277275 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 10277374  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  10277375 cttgat 10277380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 36785616 - 36785218
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  36785616 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 36785519  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| |   || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785518 cggaataacacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 36785420  T
Q  789 gaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  36785419 gagattttcactaagaatcacaaaaattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaat 36785321  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacact 981  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||  |||| |||||| || |||||||||    
T  36785320 ggtcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaa-atgtttgactttgaacact 36785222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 39170912 - 39170570
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||     
T  39170912 aattgtgttttctttttctcttaattaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcaa 39170816  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39170815 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacatgcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 39170716  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39170715 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 39170617  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  39170616 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 39170570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 556 - 930
Target Start/End: Original strand, 24274404 - 24274777
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||    
T  24274404 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaat-cttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtg 24274502  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | || || |||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  24274503 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaaga-aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 24274601  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||  |    
T  24274602 cggaagtagtccagtccccctcgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactcact-agtatgagacttctc--a 24274698  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24274699 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 24274777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 968321 - 967923
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| | || ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  968321 aattgtgttttctttttctcttaaaaatt-cttcttccggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcag 968223  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  968222 cggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 968124  T
Q  789 gagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  968123 gagatttgctctaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaat 968026  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacact 981  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||||| || |||||||||    
T  968025 gctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaaa-atgtttgactttgaacact 967927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 556 - 931
Target Start/End: Original strand, 22773734 - 22774111
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||  | |  ||||||    
T  22773734 tgaaggtgagaaaaacacaagaagagggggttgaattgtgttttctttttctc--aaaaaattcttcttctgataacacttcagaagttggtaaggaatg 22773831  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| | | || || ||||| |||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  22773832 cttctgatgtgatgttcagaattagatatgcagcggaataaaacagagtagagagaagaaagaga-gacacaagcatttatcctggttccttccacaaac 22773930  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttct 849  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||     ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  22773931 cggaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagact--t 22774027  T
Q  850 caaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    || ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22774028 cacaaatgctcaagcacacaggaaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggca 22774111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 554 - 920
Target Start/End: Original strand, 22763027 - 22763395
Alignment:
Q  554 tctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |  ||||    
T  22763027 tctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggtaaggaa 22763124  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaa-agatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  | | || | ||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  22763125 tgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccaca 22763223  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagact 846  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22763224 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttacactaagaaataatc-cacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagact 22763322  T
Q  847 tctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22763323 tcacaaa--tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctca 22763395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 589 - 920
Target Start/End: Original strand, 1041560 - 1041890
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  1041560 aattgtgttttctttttctcttaaaaaat-cttcttctggtgttacttcagaagctagttgggagtgcttatgatgtaatgtttagaatcagatatgcag 1041658  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1041659 cggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 1041757  T
Q  789 gaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||| ||||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  1041758 gagattttcactaataatcttatagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaat 1041855  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1041856 gctcaagcactaaagcaagagtcttataatgctca 1041890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17971087 - 17970689
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  17971087 aattgtgtttttttttt-tctctaaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 17970989  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || |||||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17970988 cggaataaaaacagagcagagagaagaa-agagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaa 17970890  T
Q  788 ggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| | || |||||||    
T  17970889 ggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactaact-agtatgaaacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaa 17970793  T
Q  886 tgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacac 980  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||||| || ||||||||    
T  17970792 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaaa-atgtttgactttgaacac 17970694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 589 - 920
Target Start/End: Original strand, 19355726 - 19356060
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||  |||  |||||| ||||||| ||    
T  19355726 aattgtgttttctttttctcgtaaaaatt-cttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgagatgttcagaattagatatgtag 19355824  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19355825 cggaataaaagcagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggtttcttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 19355923  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  ||  |||||||||||||| ||||||| || |||    
T  19355924 ggagatttccactaacaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtatgagact--tcctaaatgctcaagcacgcaggcaagagactt 19356020  T
Q  882 ccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  19356021 ccaatgctcaggcactaaagcaagagacttccaatgctca 19356060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 556 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 19303278 - 19302918
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  19303278 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctc--agaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtg 19303181  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaa-tcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||| |||  ||||| || |||| ||||||||| || | ||  | |||||||| ||  | | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19303180 cttctgatgtgatgttcagaaatcggatacgcagcggaataaaaacagtgtagagaaaaaaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccctccacaa 19303082  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagactt 847  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  19303081 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactaccta-gtatgagactt 19302983  T
Q  848 ctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    | ||||  ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19302982 cacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19302918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 556 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 19498820 - 19498457
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||  | ||||||||| ||| | || ||    
T  19498820 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaaaacttcttctggtatcagttcagaagctgttagagagtg 19498721  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagca--gagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    |||||||||| |||  || |||| |||||||||||||| || | || || |  ||||||||||  | | ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19498720 cttctgatgtgatgttcaaaatctgatatgcagcggaataaaaacagagtaaagagaaaagaaagaga-gacacaagcagttatactggttccttccaca 19498622  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagact 846  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19498621 aaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtatgagact 19498523  T
Q  847 tctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    || |  |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19498522 tccc--aaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19498457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 556 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 19313843 - 19313482
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  19313843 tgaaggtgagaaaaacacaagaagtgagggttgaattgtgttttctttttctc--agaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtg 19313746  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||| ||||||||| || | || || |||||||| ||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19313745 cttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcggaataaaaacagagtagagaaaaaaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 19313647  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttc 848  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| |||||| || |||||||||||  | | ||||||||||||    
T  19313646 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattataactgctcaatactaccga-gtatgagacttc 19313548  T
Q  849 tcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
     ||||  ||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  19313547 ccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagatttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 19313482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 589 - 753
Target Start/End: Original strand, 20221035 - 20221197
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  20221035 aattgtgttttttttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 20221131  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20221132 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 20221197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 721 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 38033495 - 38033296
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagatt 814  Q
    |||||||| || |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||||    
T  38033495 agacacaaacaattatactggttccttccacaaaccagaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 38033396  T
Q  815 acaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38033395 acaactgctcaatactaccta-gtatgagacttca-aaaaatgctcaagcacgcaggcaaaagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 38033298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 589 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 5028033 - 5027893
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  5028033 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 5027937  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagca 731  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  5027936 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagca 5027893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 589 - 735
Target Start/End: Original strand, 38207600 - 38207744
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  38207600 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gtttgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 38207696  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagtta 735  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  38207697 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagtta 38207744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 722 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 23393412 - 23393210
Alignment:
Q  722 gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta---taatcacaa-agattac 816  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||  ||||||    
T  23393412 gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagttaatcacaactgattac 23393313  T
Q  817 aaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaa 914  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  |    
T  23393312 aactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttccta 23393216  T
Q  915 tgctca 920  Q
    ||||||    
T  23393215 tgctca 23393210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 721 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 20647302 - 20647121
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  20647302 agacacaggcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 20647203  T
Q  815 acaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa 899  Q
    |||| |||| ||||||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  20647202 acaactgcttaatactacct-agtatgagact--tccaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 20647121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 589 - 697
Target Start/End: Original strand, 28226924 - 28227029
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  28226924 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 28227020  T
Q  689 cggaaaaga 697  Q
    |||||||||    
T  28227021 cggaaaaga 28227029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 738 - 915
Target Start/End: Original strand, 22754871 - 22755054
Alignment:
Q  738 ctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact- 830  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| | ||||| |||     
T  22754871 ctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaacttctcaacacta 22754970  T
Q  831 ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
      |  |||||||||||  ||| | ||||| |||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22754971 cacctagtatgagact--tcacagatgcttaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 22755054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 721 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 38040654 - 38040522
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    |||||||| || |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  38040654 agacacaaacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 38040555  T
Q  815 acaaatgctcaatactttctaagtatgagacttc 848  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||    
T  38040554 acaactgctcaatactacct-agtatgagacttc 38040522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 722 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 24802293 - 24802090
Alignment:
Q  722 gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac----tataatcacaa-agatta 815  Q
    |||||| ||| |||| |||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    | |||||||||  |||||    
T  24802293 gacacatgcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacaaagtttaatcacaactgatta 24802194  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||      
T  24802193 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaaatgctcatgcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 24802097  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  24802096 atgctca 24802090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 733 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 14794523 - 14794452
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14794523 ttatcctggttccttcaacaattcggaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagatttcactataatc 14794452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 733 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 19321093 - 19321021
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19321093 ttatcatggttccttccacaattcggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatc 19321021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 722 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 24815260 - 24815057
Alignment:
Q  722 gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 815  Q
    ||||||| || |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  24815260 gacacaaacaattataccggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 24815161  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||  | |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||      
T  24815160 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 24815064  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  24815063 atgctca 24815057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 733 - 805
Target Start/End: Original strand, 22682798 - 22682871
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 805  Q
    |||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22682798 ttatcctgtttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 22682871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 24851389 - 24851329
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24851389 ggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24851329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 445 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 12918614 - 12918535
Alignment:
Q  445 cttatgaaagagaacgaagaaaacgatttgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacc 524  Q
    ||||||||||| || ||| ||| | |  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12918614 cttatgaaagaaaaagaaaaaagccacatgtgacattgtggttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacc 12918535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 733 - 796
Target Start/End: Original strand, 22615252 - 22615315
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 796  Q
    |||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22615252 ttatactggttcattccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 22615315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 473 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 39819116 - 39819062
Alignment:
Q  473 tgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39819116 tgtgacattgtggttggccaatgtcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 39819062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 22257575 - 22257635
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22257575 ggttccttccacaaatcggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22257635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 419
Target Start/End: Original strand, 39819060 - 39819116
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcaca 419  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39819060 acttgggtgacattgtggttggtgacattggtgacattggccaaccacaatgtcaca 39819116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 739 - 806
Target Start/End: Original strand, 24843578 - 24843645
Alignment:
Q  739 tggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24843578 tggttccttccacaaaccggaagtagtccactccaccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24843645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 21537925 - 21537852
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21537925 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21537852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 20647454 - 20647379
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  20647454 aattgtgttttctttttctcttgaaaaat-cttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgcttctgatgt 20647379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 806
Target Start/End: Original strand, 21845554 - 21845602
Alignment:
Q  758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21845554 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21845602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 836 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 19300553 - 19300477
Alignment:
Q  836 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19300553 agtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 19300477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 741 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 26367133 - 26367074
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26367133 gttccttccacaaatcgaaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 26367074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 741 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 28141327 - 28141268
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28141327 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 28141268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 5913601 - 5913524
Alignment:
Q  449 tgaaagagaacgaagaaaacgatttgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||||| |||||||   |||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  5913601 tgaaagagaaagaagaaagacatttgtaagattgtggttggccaatgtcac-aatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 5913524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 419
Target Start/End: Original strand, 12918536 - 12918586
Alignment:
Q  369 gtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcaca 419  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12918536 gtgacattgtggttgatgacattggtgacattggccaaccacaatgtcaca 12918586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 747 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 26623173 - 26623123
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 797  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26623173 tccacaaactggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttca 26623123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 10010491 - 10010418
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  10010491 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttacactttcaaggagagttcacta 10010418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 24376467 - 24376540
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24376467 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttctaaggagagttcacta 24376540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 741 - 806
Target Start/End: Original strand, 24838480 - 24838545
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24838480 gttccttccacaaatcggaagttgttatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24838545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 758 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 27766213 - 27766146
Alignment:
Q  758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  27766213 gaagtagtccagtcccc-ttacacttccaagga-atttcactataatcacactagattacaattgctcaa 27766146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 760 - 808
Target Start/End: Original strand, 8685016 - 8685062
Alignment:
Q  760 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 808  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8685016 agtagtccagtcccc-ttgcacttccaagg-gatttcactataatcaca 8685062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 491 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 12918544 - 12918508
Alignment:
Q  491 caatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12918544 caatgtcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 12918508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 12918700 - 12918633
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgt 424  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||| |||| |||    
T  12918700 ggataatacttgggtgacattgtggttggtgacattggtgacatt-accaaccacaatgttacaaatgt 12918633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 18702114 - 18702174
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18702114 ggttccttccacaaaccgaaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 18702174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 22271504 - 22271564
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  22271504 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttggacttcaaaggagagttcacta 22271564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 25828536 - 25828595
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25828536 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctg-cccccttgcacttccaaggagagttcacta 25828595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 39819230 - 39819186
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacatt 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39819230 ggataatacttgggtgacattgtggttggtgacattggtgacatt 39819186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 759 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 10899218 - 10899171
Alignment:
Q  759 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10899218 aagtagtccactcctccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 10899171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 527
Target Start/End: Original strand, 12918656 - 12918691
Alignment:
Q  492 aatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12918656 aatgtcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 12918691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 759 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 15671281 - 15671234
Alignment:
Q  759 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15671281 aagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 15671234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 761 - 800
Target Start/End: Original strand, 27296835 - 27296874
Alignment:
Q  761 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27296835 gtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 27296874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 527
Target Start/End: Original strand, 39819186 - 39819221
Alignment:
Q  492 aatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39819186 aatgtcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 39819221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Original strand, 44839786 - 44839869
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44839786 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttacacttccaaggagaattcactat 44839869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 856 - 913
Target Start/End: Original strand, 1083537 - 1083595
Alignment:
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1083537 tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1083595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 363 - 413
Target Start/End: Original strand, 5913522 - 5913571
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaat 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5913522 acttgggtgacattgtggttggtgacatt-gtgacattggccaaccacaat 5913571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Original strand, 22382859 - 22382925
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||    
T  22382859 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtccccctggctcttccaaggagagttcactaaaatca 22382925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 22782341 - 22782279
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22782341 ggttccatccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 22782279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 22801845 - 22801907
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22801845 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagtgttcactat 22801907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 589 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 23393583 - 23393501
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgac 671  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||  |||||||||| |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||    
T  23393583 aattgtgttttctttttctcaagataaaatcttcttctgaaatcacttcagaagctgtttgaaaatgcttctgatgtgatgac 23393501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 426
Target Start/End: Original strand, 8940464 - 8940521
Alignment:
Q  369 gtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||||||||||||||  || ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8940464 gtgacattgtggttgaaaatatttgtggtattggtcaatcacaatgtcacaagtgtac 8940521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 426
Target Start/End: Original strand, 18182529 - 18182562
Alignment:
Q  393 gtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18182529 gtgacattggccaaccacaatgtcacaagtgtac 18182562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 19539777 - 19539850
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  19539777 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaaatagtcctgtcccgcttgaacttccaaggagagttcacta 19539850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 757 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 21911538 - 21911489
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  21911538 ggaagtagtcctgtcctccttgcacttccaaggagagtttactaaaatca 21911489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 747 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 23185021 - 23184968
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23185021 tccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 23184968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 747 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 23596284 - 23596231
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23596284 tccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 23596231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 747 - 800
Target Start/End: Original strand, 24778753 - 24778806
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  24778753 tccacaaactggaaatagtcttgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 24778806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 40781837 - 40781910
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  40781837 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaataagagttcacta 40781910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 11445 - 11046
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11445 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 11346  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11345 cggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaaacgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 11246  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  11245 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgc 11146  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11145 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgat 11046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 8638 - 8199
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8638 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 8539  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8538 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaaacgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaat 8439  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgct-------caatactttctaagtatgagacttc 848  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| | |||||||||||||||    
T  8438 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatgctcaatactctttaagtatgagacttc 8339  T
Q  849 tcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-a 945  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  8338 tcaaaaatgctcatgcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaa 8239  T
Q  946 acaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8238 acaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgat 8199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 159)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 16316785 - 16317184
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16316785 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaataatcagaatcagatatgcag 16316884  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16316885 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaag 16316984  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16316985 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgc 16317084  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16317085 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 16317184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 16304561 - 16304960
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  16304561 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaataattagaatcagatatgcag 16304660  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16304661 cggaaaagattaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaag 16304760  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16304761 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgc 16304860  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16304861 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaataaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 16304960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 15208191 - 15207793
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15208191 aattgtgttttctttttctctcaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagaagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 15208093  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15208092 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataaggcacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 15207993  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  15207992 gagatttcaccataatcactaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgc 15207894  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa--caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  15207893 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacacttga 15207794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 556 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 47152886 - 47152528
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47152886 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctttcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggattg 47152787  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47152786 cttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaat 47152687  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  47152686 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaa 47152588  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 915  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47152587 tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 47152528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 19580695 - 19581094
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19580695 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 19580794  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19580795 cggaaatgatcaaagcaaagaaaagaagaataagtcacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtctagtcccccttgcacttccaag 19580894  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19580895 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacacaggaaagagtcttccaatgc 19580993  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaacaa--aaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||  |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19580994 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcgggcaagagtcttttgatcaaaaaagaaatacagggaaatatgtttgacttgaacacttga 19581093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 14836907 - 14836508
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14836907 aattgtgttttctttttctctataaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 14836808  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14836807 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcatttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtccctcttgcacttccaag 14836708  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  14836707 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 14836608  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  14836607 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgat 14836508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 611 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 40471371 - 40470993
Alignment:
Q  611 aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaa 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40471371 aaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgttaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaa 40471272  T
Q  711 aagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40471271 aagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 40471172  T
Q  810 agattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtct 909  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40471171 agattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagact 40471072  T
Q  910 tctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||||    
T  40471071 tctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttgaacacttgat 40470993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 5872828 - 5873224
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5872828 aattgtgttttctttctctct--aaaaatacttctcctgataatacttcataagcattttaggagtgcttctgatgtaataaccagaatcagatatgcag 5872925  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5872926 tggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaaacgagacacaagcagttatcctggttcctcccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 5873025  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  5873026 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatactcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgc 5873124  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  5873125 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaaatatgtttgacttgaacacttgat 5873224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 40455159 - 40454755
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc----aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    |||||||||| ||||||||| |    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40455159 aattgtgtttcctttttctctcttaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgttaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatat 40455060  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40455059 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcactt 40454960  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcc 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40454959 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 40454860  T
Q  884 aatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacac 980  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||    
T  40454859 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttgaacac 40454760  T
Q  981 ttgat 985  Q
    |||||    
T  40454759 ttgat 40454755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 668 - 985
Target Start/End: Original strand, 10908941 - 10909261
Alignment:
Q  668 tgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtcc 767  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  10908941 tgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtcc 10909040  T
Q  768 agtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcaca 867  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909041 agtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcaca 10909140  T
Q  868 caggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaata 964  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  10909141 cacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaatta 10909240  T
Q  965 tgtttaacttgaacacttgat 985  Q
     |||| |||||||||||||||    
T  10909241 agtttgacttgaacacttgat 10909261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 668 - 985
Target Start/End: Original strand, 10695175 - 10695494
Alignment:
Q  668 tgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtcc 767  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  10695175 tgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtcc 10695274  T
Q  768 agtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcaca 867  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10695275 agtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcaca 10695373  T
Q  868 caggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaata 964  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  10695374 caagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaata 10695473  T
Q  965 tgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  10695474 tgtttgacttgaacacttgat 10695494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 25656587 - 25656989
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa--tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25656587 aattgtgttttctttttctctcaaaaaaattacctcttctgataaaactttagaagcagtttgttaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 25656686  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656687 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 25656786  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25656787 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaaacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 25656886  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| || |||| ||||||||||||    
T  25656887 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattaagtttgacttgaacactt 25656986  T
Q  983 gat 985  Q
    |||    
T  25656987 gat 25656989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 27815748 - 27815351
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  27815748 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcag 27815652  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27815651 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 27815552  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27815551 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 27815452  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  27815451 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 27815352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 563 - 985
Target Start/End: Original strand, 3370140 - 3370569
Alignment:
Q  563 gagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaa--aatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttct 660  Q
    ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||    
T  3370140 gagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagtagtttggaggtgcttct 3370239  T
Q  661 gatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaa 760  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3370240 gatgtaataatcagaatcagatatgcagcgcaaaagatcaaagtagagaaaagaaacacgagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaa 3370339  T
Q  761 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgct 859  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3370340 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgct 3370439  T
Q  860 caagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||    
T  3370440 caagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacttagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaataca 3370539  T
Q  957 atgaaatatgtttaact-tgaacacttgat 985  Q
      |||| |||||| | | ||||||||||||    
T  3370540 gagaaaaatgtttgattatgaacacttgat 3370569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 563 - 969
Target Start/End: Original strand, 3389876 - 3390292
Alignment:
Q  563 gagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaata------cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgc 656  Q
    ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| ||||||| |      |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||    
T  3389876 gagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaaaaaaaaaacttcttctgataatacttcagaagtagtttggaggtgc 3389975  T
Q  657 ttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaatt 756  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  3389976 ttctgatgtaataatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaacacgagacacgagcagttatcctggttccttccacaaatc 3390075  T
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaa 855  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  3390076 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaa 3390175  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaa 952  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  3390176 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcacttagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaa 3390275  T
Q  953 tacaatgaaatatgttt 969  Q
    ||||  |||| ||||||    
T  3390276 tacagagaaaaatgttt 3390292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 633 - 920
Target Start/End: Original strand, 25008394 - 25008681
Alignment:
Q  633 acttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcag 732  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  25008394 acttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcag 25008493  T
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatacttt 832  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25008494 ttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactct 25008593  T
Q  833 ctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25008594 ctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctca 25008681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 450033 - 450430
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  450033 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 450129  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  450130 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 450229  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  450230 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 450329  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  450330 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 450429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 15561882 - 15561485
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  15561882 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 15561786  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15561785 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 15561686  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15561685 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 15561586  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  15561585 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 15561486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 19143809 - 19143504
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19143809 aattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgatacaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 19143710  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19143709 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 19143610  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  19143609 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatgc 19143510  T
Q  889 tcaagc 894  Q
    ||||||    
T  19143509 tcaagc 19143504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 21995870 - 21996267
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  21995870 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 21995966  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21995967 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 21996066  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21996067 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 21996166  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  21996167 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 21996266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 22006468 - 22006865
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  22006468 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 22006564  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006565 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 22006664  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22006665 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 22006764  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  22006765 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 22006864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 30927297 - 30926900
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  30927297 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 30927201  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30927200 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 30927101  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30927100 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 30927001  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  30927000 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 30926901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 48370586 - 48370985
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa--tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || || ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  48370586 aattgtgttttttttttctctcaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgtttatgatgaaatgatcagaatcagat-tgc 48370682  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48370683 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 48370782  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  48370783 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 48370882  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||    
T  48370883 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacactt 48370982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 14844456 - 14844059
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  14844456 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 14844360  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14844359 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 14844260  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14844259 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 14844160  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  14844159 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 14844060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 19955765 - 19955368
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  19955765 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttattctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 19955669  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19955668 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 19955569  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19955568 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 19955469  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  19955468 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 19955369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Original strand, 52703245 - 52703613
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  52703245 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 52703341  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52703342 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaa 52703441  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  52703442 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 52703541  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgat-caacaaaaataca 956  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  52703542 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatgaaacaaaaataca 52703613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 589 - 955
Target Start/End: Complemental strand, 30937875 - 30937508
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  30937875 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 30937779  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30937778 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagttccccttgcacttccaa 30937679  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  30937678 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 30937579  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatac 955  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  30937578 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatac 30937508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 19945130 - 19944733
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  19945130 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 19945034  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19945033 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaaacagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 19944934  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19944933 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 19944834  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  19944833 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgttcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 19944734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 27656055 - 27656454
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  27656055 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 27656151  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27656152 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 27656251  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27656252 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 27656351  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  27656352 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 27656451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 27666628 - 27667027
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  27666628 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 27666724  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666725 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 27666824  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27666825 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 27666924  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  27666925 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 27667024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 10299957 - 10300388
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  10299957 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataatacttcagaagcaggttaggaatg 10300054  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10300055 cttctgatgtgatgataataatcagatatgcagcggaataaaacagcgcagagaaaagaaaagcgagacacaagcaattatcctggttccttccacaaat 10300154  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  10300155 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaa 10300253  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||    
T  10300254 atgctcaagcacgcaggctagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaa 10300353  T
Q  951 aatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  10300354 aatacagagaaaaatgtttgacttgaacacttgat 10300388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 17917508 - 17917906
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  17917508 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 17917604  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17917605 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 17917704  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa-tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17917705 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 17917804  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgc-tcagcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  17917805 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgcttaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttg 17917904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Original strand, 17928156 - 17928498
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  17928156 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 17928252  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928253 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 17928352  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa-tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17928353 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 17928452  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17928453 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 17928498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 18131045 - 18130645
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  18131045 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 18130949  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18130948 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 18130849  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18130848 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 18130749  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc--aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  18130748 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 18130649  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  18130648 tgat 18130645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Original strand, 460614 - 460955
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||    
T  460614 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaataatcagagtcagat-tgcag 460710  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  460711 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 460810  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  460811 ggagatttcactataatcacaaagattactactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 460910  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  460911 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 460955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 4947794 - 4948191
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||    
T  4947794 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaactccagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcag 4947890  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4947891 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 4947990  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4947991 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 4948090  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  4948091 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacacaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 4948190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Original strand, 16255323 - 16255663
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  16255323 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 16255419  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16255420 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 16255519  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16255520 ggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 16255618  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16255619 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 16255663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Original strand, 16265916 - 16266256
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  16265916 aattgtgttttttttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 16266012  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16266013 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 16266112  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16266113 ggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 16266211  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16266212 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 16266256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 18753325 - 18752895
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||    
T  18753325 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttatctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attg 18753228  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18753227 cttctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 18753129  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  18753128 acggaagtagtccagtcccccttgctcttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 18753029  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  18753028 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 18752929  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  18752928 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 18752895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 18763902 - 18763505
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||    
T  18763902 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcag 18763806  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763805 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 18763706  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18763705 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 18763606  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  18763605 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 18763506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 24639667 - 24640102
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||| |||  |  ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||     
T  24639667 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttctctgtctaaaaaaattcttcttttgataaaacttcagaagcagtttgagag 24639766  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24639767 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 24639865  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24639866 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 24639964  T
Q  853 aa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aac 947  Q
    ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  24639965 aactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaac 24640064  T
Q  948 aaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  24640065 aaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 24640102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 24028893 - 24028491
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata--cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  24028893 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 24028797  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24028796 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaatacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 24028697  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc---aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24028696 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 24028597  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  24028596 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaaca 24028497  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  24028496 cttgat 24028491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 5022158 - 5022590
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  || || ||    
T  5022158 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttatctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtg 5022257  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  5022258 attatgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 5022356  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  5022357 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataattacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 5022456  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  5022457 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 5022556  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  5022557 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 5022590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 18078711 - 18078312
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  18078711 aattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaaatttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 18078615  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078614 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 18078515  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| || |||||||    
T  18078514 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagaggcttccaa 18078415  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||||| |||    
T  18078414 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgacttgaacgctt 18078315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 29042463 - 29042062
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29042463 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 29042364  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29042363 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 29042265  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29042264 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 29042166  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  29042165 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 29042066  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  29042065 tgat 29042062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 55756666 - 55756269
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  55756666 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 55756570  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55756569 cggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 55756471  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  55756470 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 55756372  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| |  |||| | ||||||||||    
T  55756371 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacaaagaattgagtttgaattgaacactt 55756272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 55746055 - 55745658
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  55746055 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 55745959  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55745958 cggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 55745860  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  55745859 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 55745761  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  55745760 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 55745661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 589 - 829
Target Start/End: Original strand, 19570472 - 19570711
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19570472 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttct-ctgatagtacttcagaagcagtttggaaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 19570570  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19570571 cggaaatgatcaaagcagagaaaagaagaataagatacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 19570670  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac 829  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19570671 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac 19570711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 11535268 - 11535698
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||| ||    
T  11535268 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggagtg 11535365  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | | || || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11535366 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaggaaaga-aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaat 11535464  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  11535465 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaa 11535563  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||    
T  11535564 atgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaa 11535663  T
Q  951 aatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacacttgat 985  Q
    ||||||  |||| |||||| || |||||||||||||    
T  11535664 aatacagagaaa-atgtttgactttgaacacttgat 11535698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 36017789 - 36018190
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata---cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  36017789 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatgattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 36017885  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36017886 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36017985  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36017986 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 36018084  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  36018085 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 36018184  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  36018185 cttgat 36018190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 36028342 - 36028743
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  36028342 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 36028438  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36028439 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 36028538  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36028539 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 36028637  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  36028638 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 36028737  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  36028738 cttgat 36028743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 49517588 - 49517989
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  49517588 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 49517684  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49517685 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 49517784  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  49517785 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 49517883  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  49517884 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 49517983  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  49517984 cttgat 49517989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 10741401 - 10741056
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  10741401 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 10741305  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10741304 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 10741205  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10741204 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 10741106  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10741105 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 10741056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 10955170 - 10954825
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  10955170 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 10955074  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10955073 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 10954974  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10954973 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 10954875  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10954874 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 10954825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 10751975 - 10751630
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  10751975 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 10751879  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10751878 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 10751779  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10751778 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 10751680  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  10751679 caatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggca 10751630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 10965744 - 10965399
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  10965744 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 10965648  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10965647 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 10965548  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10965547 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 10965449  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  10965448 caatgctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggca 10965399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 655 - 928
Target Start/End: Original strand, 24712947 - 24713221
Alignment:
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24712947 gcttctgatgcaatgaacagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 24713046  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||    
T  24713047 tcggaagtagtccagtccccattgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttttc-aa 24713145  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcag 928  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24713146 aatgctcaagcacgcaggaaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcag 24713221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 553 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 31267630 - 31267198
Alignment:
Q  553 atctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggga 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||    
T  31267630 atctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttagga 31267534  T
Q  653 atgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31267533 atgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaa-agagagacacaagcaattatcctggttccttccaca 31267435  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc 850  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  31267434 aaccggaagtagtccagt-ccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcaaagattacaaatgctcaatattctctaagtatgagacttctc 31267336  T
Q  851 aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aa 946  Q
     ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||    
T  31267335 -aaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaa 31267237  T
Q  947 caaaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||  |||| |||||| || |||||||||||||    
T  31267236 caaaaatacagagaaa-atgtttgactttgaacacttgat 31267198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 556 - 854
Target Start/End: Original strand, 10290048 - 10290345
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  10290048 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctaataatacttcagaagcaggttaggaatg 10290145  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10290146 cttctgatgtgatgatcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcaattatcctggttccttccacaaat 10290245  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10290246 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 10290345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 759 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 4987045 - 4986816
Alignment:
Q  759 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgc 858  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4987045 aagtagtccagtcccccttacacttccaagcagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgc 4986946  T
Q  859 tcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatac 955  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  4986945 tcaaacacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatac 4986846  T
Q  956 aatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4986845 aatgaaatatgtttgagttgaacacttgat 4986816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 11514491 - 11514888
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||    
T  11514491 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgtag 11514588  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | | ||  |||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11514589 cggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gatgcaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 11514687  T
Q  789 gaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  11514688 gagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaat 11514785  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacact 981  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||  |||| |||||| || |||||||||    
T  11514786 gctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacatagaaa-atgtttgactttgaacact 11514884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 589 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 17199295 - 17199074
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17199295 aattgtgttttcattttctctcaaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttgaaaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgca 17199196  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17199195 gcggaaaagatcaaagtagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaa 17199096  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaa 809  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17199095 ggagatttcactataatcacaa 17199074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 553 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 49002819 - 49002444
Alignment:
Q  553 atctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggga 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||| ||||||||||| | || |||    
T  49002819 atctgaaggtgagaaaaacacaagaatggggg-ttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattctttttctgataacacttcagaagctggttagga 49002723  T
Q  653 atgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaa-agatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccac 751  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  | | || | ||||||||||||  | | ||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  49002722 atgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga-gacacaaccaattattctggttccttccac 49002624  T
Q  752 aaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttct 849  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  49002623 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctct-agtatgagacttct 49002525  T
Q  850 caaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    |  |||||||||||||| || || | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49002524 c--aaatgctcaagcacgcatgcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 49002444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 556 - 920
Target Start/End: Original strand, 55650746 - 55651108
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||     
T  55650746 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggaggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaata 55650843  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa--aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  || ||  || ||||||||||||  | | ||||||| || ||||||||||||| || ||||    
T  55650844 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaatagaa-cagagaaaagaaagaga-gacacaaacaattatcctggttccttctacaa 55650941  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctca 851  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||     
T  55650942 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaaatcacacagattacagatgctcaatactctct-agtatgagacttctc- 55651039  T
Q  852 aaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
     |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55651040 -aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctca 55651108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 589 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 9921177 - 9920958
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  9921177 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 9921081  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9921080 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 9920981  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaa 810  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  9920980 ggagatttcactataatcacaaa 9920958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 589 - 809
Target Start/End: Original strand, 28050019 - 28050238
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  28050019 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 28050115  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28050116 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 28050215  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaa 809  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  28050216 aggagatttcactataatcacaa 28050238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 589 - 809
Target Start/End: Original strand, 49509431 - 49509652
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  49509431 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 49509527  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49509528 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 49509627  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  49509628 caaggagatttcactataatcacaa 49509652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 555 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 20649674 - 20649445
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    ||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||  |||||||||||||||| || |    
T  20649674 ctgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggattgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 20649575  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20649574 gcttctgatgaaatgttcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 20649475  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
       |||||||||||||||||||||||||||    
T  20649474 cacggaagtagtccagtcccccttgcactt 20649445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 551 - 915
Target Start/End: Original strand, 23508559 - 23508926
Alignment:
Q  551 gtatctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgg 650  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  | |||||||||    ||     
T  23508559 gtatatgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctca-aaaaaattcttcttctgatatcaattcagaagcttggtga 23508657  T
Q  651 gaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctcc 749  Q
    || |||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||| || | || || ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  23508658 gagtgcttctgatatgatattcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaa-agagagacacaagcaattatcctggttcattcc 23508756  T
Q  750 acaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgag 843  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  23508757 acaaaccggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtatgag 23508855  T
Q  844 acttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23508856 acttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 23508926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 589 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 3189183 - 3188988
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaa-aaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3189183 aattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 3189084  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  3189083 gcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 3188988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 721 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 8183613 - 8183486
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 820  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8183613 agacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaat 8183514  T
Q  821 gctcaatactttctaagtatgagacttc 848  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||    
T  8183513 gctcaatactatctaagtatgagacttc 8183486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 16820159 - 16819825
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagat------ 682  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||  |||||||||||          
T  16820159 aattgtgttttctttttctcctaaaa--ttctttttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagattcaaat 16820062  T
Q  683 atgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcac 781  Q
    | ||||||||| || | || || |||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16820061 acgcagcggaataaaaacatagtagagaaaagaaacaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcac 16819963  T
Q  782 ttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaat 875  Q
    |||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |     
T  16819962 ttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactaact-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggcgag 16819866  T
Q  876 agtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16819865 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 16819825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 589 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 29030349 - 29030156
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29030349 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 29030250  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcac 781  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  29030249 gcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac 29030156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 589 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 43347233 - 43347079
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  43347233 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 43347137  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttcc 745  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  43347136 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcc 43347079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 705 - 920
Target Start/End: Original strand, 19241589 - 19241807
Alignment:
Q  705 agagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact---- 799  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||        
T  19241589 agagaaaagaaagataa-acacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcctccttgcacttccaaggagatttccactaaga 19241687  T
Q  800 -ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact- 897  Q
     ||||||||| ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||     
T  19241688 aataatcacacagattacaactgctcaatactacct-agtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcacta 19241784  T
Q  898 aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    ||||||||| ||||  |||||||    
T  19241785 aagcaagagacttcctatgctca 19241807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 721 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 18775357 - 18775179
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  18775357 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagatt 18775258  T
Q  815 acaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac 896  Q
    |||| |||||||||||  || |||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||    
T  18775257 acaactgctcaatactgcct-agtgggagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcac 18775179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 654 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 14711521 - 14711253
Alignment:
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcgga--aaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccac 751  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||  ||| | || || |||||||||||  | | |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  14711521 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatactggttccttccac 14711423  T
Q  752 aaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgaga 844  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||    
T  14711422 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 14711323  T
Q  845 cttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    ||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14711322 ct--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 14711253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 654 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 14779185 - 14778917
Alignment:
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcgga--aaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccac 751  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||  ||| | || || |||||||||||  | | |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  14779185 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatactggttccttccac 14779087  T
Q  752 aaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgaga 844  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||    
T  14779086 aaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 14778987  T
Q  845 cttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    ||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  14778986 ct--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 14778917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 721 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 18775674 - 18775518
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  18775674 agacacaaacaattatcctggttccttccacgaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaacgagatttccactatgaaataatcacacagatt 18775575  T
Q  815 acaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaa 874  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  18775574 acaactgctcaatactgcct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcaa 18775518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Original strand, 25067314 - 25067437
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  25067314 aattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 25067410  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  25067411 cggaaaagaacagagcagagaaaagaa 25067437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 721 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 18007763 - 18007582
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  18007763 agacacaggcaattatactggttctttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 18007664  T
Q  815 acaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa 899  Q
    |||| |||| ||||||  || |||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  18007663 acaactgcttaatactacct-agtatgagact--tccaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 18007582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 721 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 36210784 - 36210587
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagatta 815  Q
    |||||||| || |||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||    
T  36210784 agacacaaacaattatactggttcgttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 36210685  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| ||||||| |||   |  ||||||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36210684 caactgctcaagactacacctagtatgagaat--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 36210587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 721 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 39532376 - 39532269
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaa 818  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||    
T  39532376 agacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttacaaggagattttcactaaaaatcacacagattacaa 39532277  T
Q  819 atgctcaa 826  Q
    ||||||||    
T  39532276 atgctcaa 39532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Original strand, 49503366 - 49503492
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  49503366 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 49503462  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  49503463 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 49503492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 589 - 682
Target Start/End: Original strand, 20579523 - 20579614
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagat 682  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  20579523 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat 20579614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Original strand, 33377763 - 33377968
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agat 813  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||    
T  33377763 aagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccattacacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgat 33377862  T
Q  814 tacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 911  Q
    ||||| | |||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33377863 tacaacttctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 33377959  T
Q  912 taatgctca 920  Q
      |||||||    
T  33377960 ctatgctca 33377968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 721 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 18776005 - 18775930
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 796  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18776005 agacacaaacaattatcctggttccttccacgaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaacgagatttc 18775930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 920 - 985
Target Start/End: Original strand, 4987060 - 4987127
Alignment:
Q  920 agcacgcaggca-gagtcttctgatcaa-caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  4987060 agcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgagttgaacacttgat 4987127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 799 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 8997831 - 8997740
Alignment:
Q  799 tataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaag 893  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||    
T  8997831 tataatcacacagattacaattgctcaatactatcta-gtacgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaag 8997740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 826
Target Start/End: Original strand, 24619079 - 24619181
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgct 823  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  24619079 aagcaattatcctgattccttccataatttggaagtagtctagtcccccatgcacttccaatgagatttttcactttaatcacacaagattacaattgct 24619178  T
Q  824 caa 826  Q
    |||    
T  24619179 caa 24619181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 747 - 826
Target Start/End: Original strand, 7221926 - 7222007
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa---gattacaaatgctcaa 826  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  7221926 tccacaatctggaagtagtccagtccgccttgcactttcaatgagatttcactataatc-caaatttgattacaaatgctcaa 7222007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 14711624 - 14711544
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaat 668  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14711624 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgcttctgatgtaat 14711544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 15015124 - 15015064
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  15015124 ggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccctttgcacttccaaggagagttcacta 15015064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 18066035 - 18066094
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttg 649  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18066035 aattgtgttttctttt-ctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg 18066094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 705 - 800
Target Start/End: Original strand, 13693185 - 13693280
Alignment:
Q  705 agagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||| |||| | |||||| |||| ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13693185 agagaagagaagagaaagacacaagcaattatacaggttccttccataatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13693280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 619 - 697
Target Start/End: Original strand, 17276226 - 17276301
Alignment:
Q  619 cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaaga 697  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  17276226 cttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaaga 17276301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 760 - 826
Target Start/End: Original strand, 19052738 - 19052803
Alignment:
Q  760 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  19052738 agtagtccagtcccc-ttgcacttccaagg-gatttcactataatcacacaagattacaattgctcaa 19052803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 46321496 - 46321433
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  46321496 acttgagtgacattgtggttggtgatattggtgacattgaccaaccacaatgtcacaactgtac 46321433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 14779289 - 14779208
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata--cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaat 668  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  14779289 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgcttctgatgtaat 14779208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 19889717 - 19889651
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19889717 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 19889651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 527
Target Start/End: Original strand, 31846896 - 31846950
Alignment:
Q  473 tgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31846896 tgtgacattgtggttggccaatatcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 31846950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 14190149 - 14190088
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14190149 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14190088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 11900564 - 11900624
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11900564 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11900624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 597 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 17994586 - 17994518
Alignment:
Q  597 tttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  17994586 tttctttttctcttaaaaaatacttcttctgatatcacttcagaagctgtttgacagtgcttctgatgt 17994518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 18007915 - 18007840
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  18007915 aattgtgttttctttttctcttgaaaaat-cttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgcttctgatgt 18007840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31846952 - 31846896
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcaca 419  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31846952 acttgggtgacattgtggttggtgacattggtgatattggccaaccacaatgtcaca 31846896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 426
Target Start/End: Original strand, 41306622 - 41306678
Alignment:
Q  370 tgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41306622 tgacattgtggtttgtgacattggtgatattggtcaaccataatgtcacaagtgtac 41306678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 55379683 - 55379743
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55379683 ggttccttccacaaaacggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 55379743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 741 - 800
Target Start/End: Original strand, 12600134 - 12600193
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12600134 gttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgaacttccaaggagagttcacta 12600193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Original strand, 16939353 - 16939436
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16939353 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 16939436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 759 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 17527063 - 17527016
Alignment:
Q  759 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 805  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17527063 aagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 17527016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 801
Target Start/End: Original strand, 19884093 - 19884168
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19884093 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19884168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 15135089 - 15135163
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  15135089 aagcagttatacaggttccttccacaaaccggaagttagtccagtcccccttgcgcatccaaggagagttcacta 15135163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 721 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 17994427 - 17994362
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17994427 agacacaagcaattatactggttccttctacaaaccggaagtagtccagtccccc-tgcacttccaa 17994362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 854 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 18775191 - 18775129
Alignment:
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18775191 aatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 18775129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 742 - 800
Target Start/End: Original strand, 23749899 - 23749957
Alignment:
Q  742 ttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23749899 ttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 23749957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 25152280 - 25152238
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataa 631  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  25152280 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataa 25152238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 758 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 32491508 - 32491438
Alignment:
Q  758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc-acaaagattacaaatgctcaa 826  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  32491508 gaagtagttcagtccctcttgcactttcaaggagattttcactataatctacactgattacaaatgctcaa 32491438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 757 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 16325216 - 16325167
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16325216 ggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 16325167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16476129 - 16476056
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||||||| |  ||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16476129 aagcagttatacatgttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcacta 16476056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 16847921 - 16847982
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16847921 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16847982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 16852877 - 16852938
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16852877 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16852938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 17788791 - 17788718
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17788791 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcatttccaaggagagttcacta 17788718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 836 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 17994345 - 17994267
Alignment:
Q  836 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  17994345 agtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 17994267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 18775495 - 18775401
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  | ||||||| | | ||| ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||    
T  18775495 aattgtgttttctttttctc--agaaaattcttcttctgatatcaattcagaaactggttgagaatgcttctgatatgatgttcagaatcagatatg 18775401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 855 - 914
Target Start/End: Original strand, 13890350 - 13890410
Alignment:
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaa 914  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13890350 atgctcaagcacaaacacaatagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagtcttctaa 13890410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 29681254 - 29681194
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29681254 ggttccttccacaaaccagaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 29681194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 400
Target Start/End: Original strand, 31846782 - 31846826
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacatt 400  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31846782 ggataatacttgggtgacattatggttggtgacattcgtgacatt 31846826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 727 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 41115508 - 41115436
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 799  Q
    ||||| |||| | |||||| ||| ||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41115508 aagcaattatacaggttccttcctcaaaccggaagtagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcact 41115436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Original strand, 6516840 - 6516923
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6516840 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 6516923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 741 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 8686180 - 8686121
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  8686180 gttccttccacaaaccggaagtagtcctgccccccttgcactttcaaggagagttcacta 8686121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 772 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 13977968 - 13977914
Alignment:
Q  772 ccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aaagattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13977968 ccccttgcacttc-aaggaattttcactataatcactaaagattacaaatgctcaa 13977914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 759 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 14903131 - 14903084
Alignment:
Q  759 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14903131 aagtagtcctgtctcccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 14903084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 425
Target Start/End: Original strand, 15031965 - 15032032
Alignment:
Q  358 ataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgta 425  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||    
T  15031965 ataacacttgggtgacattgtggttgatgatattcgtgacattgaccaaccacaatatcataagtgta 15032032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 806
Target Start/End: Original strand, 18473427 - 18473506
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  18473427 aagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaatgagagttcactaaaatca 18473506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 747 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 19611064 - 19611009
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19611064 tccacaaactggaagtcagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19611009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 20571745 - 20571666
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  20571745 aagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggatagttcactaaaatca 20571666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 798
Target Start/End: Original strand, 22089646 - 22089717
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 798  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22089646 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaattagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 22089717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 22676273 - 22676198
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22676273 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22676198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Original strand, 32224282 - 32224340
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagt 422  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32224282 acttgcgtgacattgtggttggtgatatt-gtgacattgatcaactacaatgtcacaagt 32224340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 801
Target Start/End: Original strand, 45832747 - 45832822
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||| | |||||| |||| |||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45832747 aagcaattatacaggttccttccaaaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 45832822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 523
Target Start/End: Original strand, 46321439 - 46321490
Alignment:
Q  472 ttgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcac 523  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  46321439 ttgtgacattgtggttggtcaatgtcaccaatatcaccaaccacaatgtcac 46321490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 422
Target Start/End: Original strand, 53937897 - 53937956
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagt 422  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  53937897 acttgagtaacattgtggttagtgacattagtgatattgaccaaccacaatgtcacaagt 53937956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 801
Target Start/End: Original strand, 54679288 - 54679363
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54679288 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 54679363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 758 - 800
Target Start/End: Original strand, 6641075 - 6641117
Alignment:
Q  758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6641075 gaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 6641117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 720 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 14154754 - 14154672
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14154754 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagaattcacta 14154672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 485 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 15032014 - 15031972
Alignment:
Q  485 gttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15032014 gttggtcaatgtcacgaatatcatcaaccacaatgtcacccaa 15031972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 16631800 - 16631874
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16631800 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16631874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 358 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 32008402 - 32008336
Alignment:
Q  358 ataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgt 424  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||  |||||| ||||| ||||||||    
T  32008402 ataacacttgggtgacattgtggttggtgacattagtgatattgaccaaccaaaatgttacaagtgt 32008336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 473 - 527
Target Start/End: Original strand, 32139812 - 32139866
Alignment:
Q  473 tgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||| |||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32139812 tgtgatattgttgttggtcaatgccatcaatttcatcaaccacaatgtcacccaa 32139866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 589 - 671
Target Start/End: Original strand, 33377595 - 33377677
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgac 671  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||    
T  33377595 aattgtgttttctttttctcaagataaattcttcttctgagatcacttcagaagctgtttgaaaacgcttctgatgtgatgac 33377677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 36470329 - 36470403
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36470329 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 36470403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 363 - 417
Target Start/End: Original strand, 54613030 - 54613084
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtca 417  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  54613030 acttgggtgacattgtggttggtgacattagtggcattgaccaaccacaatgtca 54613084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 55731221 - 55731283
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55731221 ggttccttccacaaaccggaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 55731283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 396 - 425
Target Start/End: Original strand, 5036353 - 5036382
Alignment:
Q  396 acattggtcaaccacaatgtcacaagtgta 425  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5036353 acattggtcaaccacaatgtcacaagtgta 5036382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 11392429 - 11392396
Alignment:
Q  393 gtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11392429 gtgacattggccaaccacaatgtcacaagtgtac 11392396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 855 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 19889575 - 19889514
Alignment:
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaat 915  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  19889575 atgctcaagcacaaagacaagagtcttcctatgctcaagcacaaaagcaagagacttctaat 19889514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 370 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 33380767 - 33380714
Alignment:
Q  370 tgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtg 423  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  33380767 tgacattgtggttggtgatatttgtgacatttgtcaaccataatgtcataagtg 33380714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 369 - 426
Target Start/End: Original strand, 55382505 - 55382562
Alignment:
Q  369 gtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  55382505 gtgacattgttgttggtaatattggtgatatttgtcaaccacaatattacaagtgtac 55382562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 314; Significance: 1e-176; HSPs: 216)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 592 - 982
Target Start/End: Original strand, 4403712 - 4404104
Alignment:
Q  592 tgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcgg 691  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4403712 tgtgttttctttttctctaaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcgg 4403811  T
Q  692 aaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 791  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4403812 aaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 4403911  T
Q  792 atttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctca 891  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4403912 atttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctca 4404010  T
Q  892 agcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  4404011 agcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacactt 4404104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 589 - 982
Target Start/End: Original strand, 4433196 - 4433591
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4433196 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttgagaagcagtttggaaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 4433295  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4433296 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcttggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 4433395  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4433396 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgc 4433494  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  4433495 tcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacactt 4433591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 11217525 - 11217125
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11217525 aattgtgttttctttttctctcaaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcaatttgggaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgca 11217426  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11217425 gcggaaaagttcaaagcaaagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 11217326  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  11217325 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcactcacgcaagagtcttccaatg 11217226  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  11217225 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttga 11217126  T
Q  985 t 985  Q
    |    
T  11217125 t 11217125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 38314097 - 38314528
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38314097 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatg 38314196  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  38314197 cttatgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaa 38314296  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  38314297 cggaagtagtccagtcccccttgcagttccaaggagatttcactataaccacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaa 38314395  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaa 952  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  38314396 tgctcaagcacacagacaagagtctaccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 38314495  T
Q  953 tacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38314496 tacagggaaatatgtttgacttgaacacttgat 38314528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 11206875 - 11206474
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa--tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11206875 aattgtgttttctttttctctcaaaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcaatttgagaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgc 11206776  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11206775 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 11206676  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  11206675 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacatacgcaagagtcttccaat 11206576  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11206575 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttg 11206476  T
Q  984 at 985  Q
    ||    
T  11206475 at 11206474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 9392003 - 9391604
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9392003 aattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttctgataatacttcagaagcagtttgtaggtgcttctgatgtaataaccagaatcagatatgcag 9391904  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9391903 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaatagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagaagtccagtcccccttgcacttccaag 9391804  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  9391803 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcccatgc 9391704  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9391703 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 9391604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 14258864 - 14258464
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258864 aattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 14258765  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258764 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacataagcagttatccttgttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 14258665  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14258664 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctgaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgc 14258566  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa--caaaaatacaatg-aaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||    
T  14258565 tcaagcactaagcaggagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaaatacagggaaaatatctttgacttgaacacttg 14258466  T
Q  984 at 985  Q
    ||    
T  14258465 at 14258464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 554 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 19888187 - 19887754
Alignment:
Q  554 tctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19888187 tctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaa 19888089  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19888088 tgcttctaatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcttggttccttccacaa 19887989  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19887988 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 19887889  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19887888 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaatcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 19887789  T
Q  951 aatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19887788 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 19887754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 933027 - 933462
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccca-aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  933027 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggtggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaat 933126  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  933127 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 933226  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  933227 aacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 933326  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaa 949  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  933327 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaa 933426  T
Q  950 aaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  933427 aaatacaatgaaataggtttgacttgaacacttgat 933462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 1784904 - 1784471
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccca-aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||| ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1784904 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggcttgaattgtattttctttttctctcttaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaat 1784805  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1784804 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 1784705  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1784704 atggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcgatactctctaagtatgagacttctcaaaa 1784605  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctga-tcaacaaaa 951  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  1784604 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgattaaacaaaa 1784505  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||| |||||| |||| |||| ||||||||||    
T  1784504 atacaaagaaataagtttgacttaaacacttgat 1784471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 11163267 - 11163664
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11163267 aattgtgttttctttttctctcccaaa-tacttcttctaataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagataagcag 11163365  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11163366 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 11163465  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  11163466 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 11163564  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11163565 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacagggaaatatgtttgacttgaacacttgat 11163664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 1795284 - 1794884
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaa-aaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1795284 aattgtgttttctttttctctcttagaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 1795185  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1795184 gcggaaaggatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 1795085  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1795084 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 1794985  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||    
T  1794984 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttaaacacttga 1794885  T
Q  985 t 985  Q
    |    
T  1794884 t 1794884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 9381457 - 9381058
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9381457 aattgtgttttctttttctctcaaaaattacttcttccgataatacttcagaagcagtttgtaggtgcttctgatgtaataaccagaatcagatatgcag 9381358  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9381357 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaatagcaacacacaagcagttaccctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaat 9381258  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9381257 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcagtactatctaagtatgagacttcttaaaagtgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 9381158  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9381157 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 9381058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 9535043 - 9535444
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9535043 aattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 9535142  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9535143 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgtacttccaa 9535242  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  9535243 ggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 9535342  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  9535343 gctcaagcgctaagcaagagtcttctaatgctcaagcatgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttg 9535442  T
Q  984 at 985  Q
    ||    
T  9535443 at 9535444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 13262470 - 13262102
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13262470 aattgtgttttctttttctct--aaaaatacttcttctgataatacttcaaaagcagttttggaatgcttctgatgtaataaccagaatcagatatgcag 13262373  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13262372 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtccccgttgcacttccaag 13262273  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13262272 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgc 13262173  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||    
T  13262172 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaataca 13262102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 554 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 29472902 - 29472465
Alignment:
Q  554 tctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgg 650  Q
    |||||||| | ||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  29472902 tctgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgt 29472803  T
Q  651 gaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctcc 749  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  29472802 gagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttcc 29472704  T
Q  750 acaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttct 849  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29472703 acaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaatgagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttct 29472604  T
Q  850 caaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aa 946  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  29472603 caaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaa 29472504  T
Q  947 caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  29472503 caaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttgat 29472465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 23635110 - 23635544
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| || |    
T  23635110 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagt 23635209  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23635210 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 23635309  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23635310 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaa 23635409  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23635410 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 23635509  T
Q  951 aatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||| ||| || |||| |||||||||||||||    
T  23635510 aatacaaagaattaagtttgacttgaacacttgat 23635544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 29462015 - 29461613
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  29462015 aattgtgttttctttttctctcaaaaaaaactacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 29461917  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29461916 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 29461817  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29461816 caaggagatttcactataataacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 29461717  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  29461716 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacact 29461617  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  29461616 tgat 29461613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 24707357 - 24706955
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata--cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  24707357 aattgtgttttctttttctctcagaaaagattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaaagcttctaatgaaatgatcagaatcagatatgc 24707258  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24707257 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 24707158  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctca-aaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24707157 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 24707058  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||    
T  24707057 tgctcaagcactaagcaagagatttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacagtgaattaagtttgacttgaacactt 24706958  T
Q  983 gat 985  Q
    |||    
T  24706957 gat 24706955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 7805316 - 7804918
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  7805316 aattgtgttttctttttctct--aaaaatacttcttttgataaaacttcagaagcagtttgtaagtgcttctgatgaaatgatcaaaatcagatatgcag 7805219  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7805218 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 7805119  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattaca-aatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7805118 gagatttcactataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 7805019  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7805018 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatataatgaaataagtttgacttgaacacttga 7804919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 7795405 - 7795007
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7795405 aattgtgttttctttttctct--aaaaatacttcttttgataaaacttcagaagcagtttgtaagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 7795308  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7795307 tggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagtagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttcgaag 7795208  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattaca-aatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7795207 gagatttcactataatcacaaagattacacagtgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 7795108  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  7795107 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttga 7795008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17910805 - 17910402
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17910805 aattgtgttttctttttctctttaaagattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtaagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatacgcag 17910706  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17910705 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 17910606  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaa-tgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17910605 gagatttcactataatcacaaagattacaaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 17910506  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgat----caacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    ||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  17910505 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaagaaaaatacaatgaaatatttttgatttgaacact 17910406  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  17910405 tgat 17910402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 655 - 985
Target Start/End: Original strand, 48336743 - 48337076
Alignment:
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48336743 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 48336842  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48336843 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 48336942  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  48336943 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 48337042  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  48337043 atacaatgaaattagtttgacttgaacacttgat 48337076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 14322521 - 14322092
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14322521 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagttttggaatg 14322424  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14322423 cttctaatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagaacaaatcagagaaaagaaaagcgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaat 14322324  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  14322323 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaactatgagacttctc-aaaa 14322225  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaa 952  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| || ||||||||    
T  14322224 tgctcaaccacacaggcaagagtcttctaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggctagaggcttctgttcaaacaaaaa 14322125  T
Q  953 tacaatgaaatatgttt-aacttgaacacttgat 985  Q
    ||||  |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  14322124 tacagagaaa-atgtttgaccttgaacacttgat 14322092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 589 - 893
Target Start/End: Original strand, 13601669 - 13601973
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13601669 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttttgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 13601768  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13601769 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 13601868  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13601869 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 13601968  T
Q  889 tcaag 893  Q
    |||||    
T  13601969 tcaag 13601973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 13557012 - 13557409
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  13557012 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 13557108  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557109 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 13557208  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13557209 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 13557308  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  13557309 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 13557408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 23767332 - 23767729
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  23767332 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 23767428  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767429 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 23767528  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23767529 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 23767628  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  23767629 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 23767728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 6181325 - 6180928
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  6181325 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 6181229  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6181228 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 6181129  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6181128 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 6181029  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  6181028 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 6180929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 13121100 - 13121497
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  13121100 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 13121196  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121197 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 13121296  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13121297 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 13121396  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  13121397 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 13121496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 14475659 - 14476056
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  14475659 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 14475755  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14475756 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 14475855  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14475856 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 14475955  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  14475956 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 14476055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 19788460 - 19788857
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  19788460 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 19788556  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19788557 cggaaaagaacagagcagaaaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 19788656  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19788657 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 19788756  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  19788757 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 19788856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 37865883 - 37866280
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  37865883 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatactttttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 37865979  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37865980 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 37866079  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37866080 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 37866179  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  37866180 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 37866279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 4175554 - 4175157
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  4175554 aattgtgttttctttttctcttgtaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 4175458  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175457 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 4175358  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4175357 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 4175258  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  4175257 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 4175158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 5537818 - 5537477
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  5537818 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 5537722  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5537721 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 5537622  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5537621 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 5537522  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5537521 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 5537477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 5548402 - 5548061
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  5548402 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 5548306  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5548305 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 5548206  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5548205 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 5548106  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5548105 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 5548061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 6221499 - 6221102
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  6221499 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 6221403  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    | ||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6221402 cagaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 6221303  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6221302 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 6221203  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  6221202 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 6221103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 13131342 - 13131739
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  13131342 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 13131438  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131439 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagctgttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 13131538  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13131539 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 13131638  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  13131639 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 13131738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 23756736 - 23757133
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  23756736 aattgtgttttatttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 23756832  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23756833 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttgtcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 23756932  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23756933 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 23757032  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  23757033 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 23757132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 37885016 - 37885413
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  37885016 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatactttttctgataaaacttcagaagcaatttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 37885112  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37885113 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 37885212  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  37885213 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 37885312  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  37885313 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 37885412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 27882787 - 27883217
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27882787 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaatacttcttctaataatacttcagaagcagtttaggaatg 27882884  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27882885 cttctgatgtgatgatcagaatcatatatgcagcagaaaagaacagagcagagaaaagaa-agaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaaat 27882983  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  27882984 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaa 27883082  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  27883083 atgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaa 27883182  T
Q  951 aatacaatgaaatatgttt-aacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  27883183 aatacagagaaa-atgtttgaccttgaacacttgat 27883217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 12238446 - 12238013
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| || |    
T  12238446 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagattgtgagt 12238347  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12238346 gcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 12238248  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  12238247 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaa 12238148  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    | |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||    
T  12238147 actgctcaagaacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaa 12238048  T
Q  951 aatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  12238047 aatacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 12238013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 19777823 - 19778220
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||  |||| |||| |||||| |||||    
T  19777823 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgatatgatcagagtcagat-tgcag 19777919  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19777920 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagttgttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 19778019  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19778020 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 19778119  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  19778120 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 19778219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 20684575 - 20684179
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  20684575 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 20684479  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20684478 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 20684379  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20684378 ggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 20684280  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  20684279 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 20684180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 9994692 - 9994293
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  9994692 aattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 9994593  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9994592 cggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 9994494  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9994493 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 9994394  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  9994393 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 9994294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 617 - 896
Target Start/End: Original strand, 28168574 - 28168853
Alignment:
Q  617 tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaag 716  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28168574 tacttcttctgataatacttcagaagctgttttggaatgcttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaa 28168673  T
Q  717 aataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac 816  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28168674 aacgagacacaagtagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac 28168773  T
Q  817 aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac 896  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||    
T  28168774 aaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcacgcaagagtcttctaatgctcaagcac 28168853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 10627742 - 10627341
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||    
T  10627742 aattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaataatcagaataagatttgcag 10627643  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10627642 cggaaaagaacatagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttttcctggttccttccacaacacggaagtagtacagtcccccttgcacttccaa 10627543  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10627542 ggagatttcactataatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 10627443  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa--caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||  ||| |  |||| |||||||||||||    
T  10627442 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttg 10627343  T
Q  984 at 985  Q
    ||    
T  10627342 at 10627341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 10656064 - 10655663
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||    
T  10656064 aattgtattttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaataatcagaataagatttgcag 10655965  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10655964 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 10655865  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  10655864 ggagatttcactataatcacaacgattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaaacacacacgcaagagtcttccaatg 10655765  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa--caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||||  ||| |  |||| |||||||||||||    
T  10655764 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttg 10655665  T
Q  984 at 985  Q
    ||    
T  10655664 at 10655663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 19121640 - 19121370
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19121640 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 19121541  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19121540 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 19121441  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgct 859  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19121440 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgct 19121370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 5866495 - 5866096
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  5866495 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 5866399  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866398 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 5866299  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5866298 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 5866199  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  5866198 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 5866099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 5877094 - 5876695
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  5877094 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 5876998  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876997 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 5876898  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5876897 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 5876798  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  5876797 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 5876698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 11273183 - 11272784
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  11273183 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 11273087  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11273086 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 11272987  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11272986 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 11272887  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  11272886 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcactcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 11272787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 548 - 985
Target Start/End: Original strand, 38194115 - 38194559
Alignment:
Q  548 gtagtatctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc---aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagca 644  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38194115 gtagaatctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagca 38194214  T
Q  645 gtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggtt 743  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38194215 gtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggtt 38194313  T
Q  744 ccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgag 843  Q
    || |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38194314 ccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgag 38194412  T
Q  844 acttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttc 939  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  38194413 acttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttc 38194512  T
Q  940 tgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    | ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  38194513 taatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 38194559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 23647187 - 23647584
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  23647187 aattgtgttttctttttctcttaaaaa-tacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 23647282  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23647283 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 23647382  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  23647383 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 23647482  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  23647483 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 23647582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 39382090 - 39382525
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  39382090 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 39382189  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39382190 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 39382288  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39382289 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 39382387  T
Q  853 aa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aac 947  Q
    ||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||    
T  39382388 aactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaac 39382487  T
Q  948 aaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  39382488 aaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 39382525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 12250239 - 12249839
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12250239 aattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcggattgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 12250140  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12250139 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 12250041  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  12250040 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaactgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 12249941  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||  ||| |  |||| |||||||||||||    
T  12249940 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttataatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttg 12249841  T
Q  984 at 985  Q
    ||    
T  12249840 at 12249839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 5580433 - 5580034
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  5580433 aattgtgttttctttttctcttaaataatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 5580337  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5580336 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 5580237  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5580236 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 5580137  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  5580136 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 5580037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 9982717 - 9982285
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||   | || ||    
T  9982717 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagaccgtgagtg 9982618  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  9982617 cttctgatgaaatgatcagaatcatatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 9982519  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  9982518 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcataaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 9982419  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  9982418 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 9982319  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  9982318 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 9982285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 10098505 - 10098903
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  10098505 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 10098601  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10098602 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 10098701  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10098702 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 10098800  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  10098801 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 10098900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 24384318 - 24383919
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  24384318 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 24384222  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24384221 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcttggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 24384122  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24384121 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 24384022  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  24384021 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 24383922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 556 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 28315069 - 28314689
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc---aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggga 652  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28315069 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaatccttcttctgataaaacttcagaagcagtttgaga 28314970  T
Q  653 atgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccac 751  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28314969 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 28314871  T
Q  752 aaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctca 851  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28314870 aacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcaca 28314772  T
Q  852 aaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28314771 aaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 28314689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 6501831 - 6501403
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||  |||||||||||   || || ||    
T  6501831 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttct----aaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 6501736  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataaga-cacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6501735 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaaaacacaagcagttatcctggttccttccacaac 6501637  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  6501636 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 6501537  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  6501536 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 6501437  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  6501436 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 6501403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 12297601 - 12297231
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12297601 aattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 12297505  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297504 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 12297405  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12297404 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 12297305  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  12297304 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaataca 12297231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 20673991 - 20673594
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  20673991 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 20673895  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20673894 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttccaa 20673795  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20673794 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 20673696  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  20673695 gctcaagcactaagtaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 20673596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 39371486 - 39371888
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  39371486 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 39371585  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39371586 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 39371684  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcc 883  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||    
T  39371685 aaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcatacacgcaagagtcttcc 39371783  T
Q  884 aatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacac 980  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||    
T  39371784 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 39371883  T
Q  981 ttgat 985  Q
    |||||    
T  39371884 ttgat 39371888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 8740922 - 8740526
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  8740922 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 8740825  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || || ||||||| |||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  8740824 cggaataaaacagagaagagaaaggaaaga-aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcgaaagtagtccagtctcccttgctcttccaag 8740726  T
Q  789 gagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8740725 gagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa-tgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatg 8740627  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||    
T  8740626 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaacacttga 8740527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 555 - 985
Target Start/End: Original strand, 8774055 - 8774492
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc---aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggg 651  Q
    ||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || |    
T  8774055 ctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgag 8774154  T
Q  652 aatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctcca 750  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8774155 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 8774253  T
Q  751 caaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc 850  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8774254 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcac 8774352  T
Q  851 aaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-a 945  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |    
T  8774353 aaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaa 8774452  T
Q  946 acaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  8774453 acaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 8774492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 38204658 - 38205095
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc---aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggga 652  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  38204658 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgaga 38204757  T
Q  653 atgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccac 751  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38204758 gtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccac 38204856  T
Q  752 aaattggaagtagtccagt-cccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc 850  Q
    ||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38204857 aacacggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcac 38204955  T
Q  851 aaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-a 945  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |    
T  38204956 aaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaa 38205055  T
Q  946 acaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  38205056 acaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 38205095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 5628816 - 5628418
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  5628816 aattgtgttttctttttctcttaaataatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 5628720  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5628719 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaa 5628621  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5628620 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 5628521  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  5628520 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 5628421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 18483478 - 18483879
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaa-aaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18483478 aattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 18483577  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18483578 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 18483676  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18483677 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 18483775  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  18483776 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 18483875  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  18483876 tgat 18483879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 6491177 - 6490749
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||    |||||| ||| |||||||||  |||||||||||   || || ||    
T  6491177 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttct----aaaaattctttttctgataaaccttcagaagcaaactgtgagtg 6491082  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataaga-cacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6491081 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaaaacaaaaacacaagcagttatcctggttccttccacaac 6490983  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  6490982 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 6490883  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  6490882 ctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaa 6490783  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  6490782 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 6490749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 12287779 - 12287409
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12287779 aattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 12287683  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12287682 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 12287583  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12287582 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 12287483  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  12287482 tgctcaagcactaaccaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaataca 12287409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 556 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 8996787 - 8996413
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  8996787 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataatacttcagaagcaggttaggagtg 8996690  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  8996689 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaa-agaaagacacaagcaattattttggttccttccacaaat 8996591  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  8996590 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaa 8996492  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  8996491 atgctcaagcacgcaggcaagagttttccaatgctcaagcactaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggca 8996413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 37759106 - 37759504
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  37759106 aattgtgttttctttttctctaaaaagagtacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 37759202  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37759203 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcatggttccttccacaacacggaagtagttcagtcccccttgcacttcca 37759302  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  37759303 aggagatttcactataatcacaaagattacaactcctcaatactttctaagtgtgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 37759402  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  37759403 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 37759502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 5510132 - 5510531
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  5510132 aattgtgttttctttttctctaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 5510228  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5510229 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 5510328  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5510329 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 5510427  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  5510428 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 5510527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 5520310 - 5520709
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  5520310 aattgtgttttctttttctctaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 5520406  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5520407 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 5520506  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  5520507 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 5520605  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  5520606 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 5520705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 13373468 - 13373066
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc---ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  13373468 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 13373372  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13373371 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 13373272  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc--aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13373271 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 13373172  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  13373171 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 13373072  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  13373071 cttgat 13373066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 20720546 - 20720948
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc---ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  20720546 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 20720642  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    || ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20720643 caacggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 20720742  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20720743 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 20720842  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  20720843 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 20720942  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  20720943 cttgat 20720948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 589 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 28325651 - 28325315
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc----aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    |||||||||||||||||||  |    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28325651 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaaatccttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatat 28325552  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  28325551 gcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 28325453  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28325452 ccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtctt 28325354  T
Q  882 ccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28325353 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctca 28325315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 13384062 - 13383660
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc---ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  13384062 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 13383966  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13383965 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 13383866  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc--aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  13383865 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagtaagagtcttc 13383766  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  13383765 caatgctcaagaactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 13383666  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  13383665 cttgat 13383660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 13394656 - 13394254
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc---ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  13394656 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaatatttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 13394560  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13394559 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctagttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 13394460  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc--aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13394459 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 13394360  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  13394359 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 13394260  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  13394259 cttgat 13394254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 29906980 - 29906638
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  29906980 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 29906883  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29906882 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagtaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 29906783  T
Q  789 gagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  29906782 gagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaat 29906685  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29906684 gctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggca 29906638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 556 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 9007339 - 9006965
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  9007339 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataatacttcagaagcaggttaggagtg 9007242  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |   || || |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  9007241 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataatacatagtagagaaaagaaaga-aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaat 9007143  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||    
T  9007142 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctgagtatgagacttctc-aaa 9007044  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  9007043 atgctcaagcatgcaggcaagagtcttccaatgctcaagctctaaagcaagagtctactaatgctcaagcacgcaggca 9006965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 504969 - 504568
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  504969 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 504873  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  504872 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 504773  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  504772 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 504674  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  504673 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 504574  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  504573 cttgat 504568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 527335 - 526934
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  527335 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 527239  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  527238 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 527139  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  527138 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 527040  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  527039 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 526940  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  526939 cttgat 526934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 4743172 - 4743573
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  4743172 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 4743268  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4743269 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 4743368  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4743369 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 4743467  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  4743468 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 4743567  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  4743568 cttgat 4743573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 4753759 - 4754160
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  4753759 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 4753855  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4753856 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 4753955  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4753956 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 4754054  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  4754055 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 4754154  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  4754155 cttgat 4754160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 41683112 - 41683513
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  41683112 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 41683208  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41683209 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 41683308  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41683309 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 41683407  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  41683408 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 41683507  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  41683508 cttgat 41683513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 41693681 - 41694082
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  41693681 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 41693777  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41693778 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 41693877  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41693878 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 41693976  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  41693977 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 41694076  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  41694077 cttgat 41694082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 656 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 15194772 - 15194516
Alignment:
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15194772 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagtagaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaat 15194673  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15194672 cggaagtagtccagtcccccttgcacttcctaggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 15194573  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttc 911  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15194572 atgctcaagcacacacacaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttc 15194516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 16385512 - 16385910
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  16385512 aattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaaatttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 16385608  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16385609 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 16385708  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16385709 ggagattttactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 16385807  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  16385808 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 16385907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 35186809 - 35187212
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-----cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagata 683  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |     ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||||||     
T  35186809 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat- 35186905  T
Q  684 tgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcact 782  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  35186906 tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcact 35187005  T
Q  783 tccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtct 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  35187006 tccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtct 35187104  T
Q  881 tccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaa 977  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||    
T  35187105 tccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaa 35187204  T
Q  978 cacttgat 985  Q
    ||||||||    
T  35187205 cacttgat 35187212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Original strand, 16076364 - 16076707
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  16076364 aattgtgttttcttgttctct--aaaaattcttcttctgataatactttagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgatcagaatcaaatatgcag 16076461  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    | ||| | | || |||||||| ||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16076462 cagaataaaacagagcagagagaagaaaagcgagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 16076561  T
Q  789 gagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  16076562 gagatttccactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaat 16076660  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16076661 gctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggca 16076707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Original strand, 24659333 - 24659679
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa----tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||    | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |    
T  24659333 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-t 24659429  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  24659430 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 24659529  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24659530 ccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtctt 24659628  T
Q  882 ccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24659629 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 24659679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Original strand, 24669913 - 24670259
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa----tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||    | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |    
T  24669913 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-t 24670009  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  24670010 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 24670109  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24670110 ccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtctt 24670208  T
Q  882 ccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24670209 ccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 24670259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 654 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 39673616 - 39673283
Alignment:
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  39673616 tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcgggaaaggacagagcagagaaaagaaagacaaagaca-aagcagttatcctggttccttccaca 39673519  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  39673518 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttcacaa 39673419  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaa 949  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  39673418 aaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 39673319  T
Q  950 aaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  39673318 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 39673283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 589 - 946
Target Start/End: Original strand, 1053145 - 1053503
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||  |||||||||||||||||    
T  1053145 aattgtgttttctttttctct-aaaaaat-cttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgcttcagatgtgatgttcagaatcagatatgcag 1053242  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1053243 cggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 1053341  T
Q  789 gaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  1053342 gagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaat 1053440  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa 946  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  1053441 gctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaa 1053503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 586 - 920
Target Start/End: Original strand, 1063571 - 1063904
Alignment:
Q  586 ttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  1063571 ttaaattgtgttttctttttctct-aaaaaata-ttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatg 1063668  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    |||| ||| | | || |||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1063669 cagcagaataaaacagagcagagaaaagaa-agagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccagaagttgtccagtcccccttgcacttcc 1063767  T
Q  786 aaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcc 883  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  1063768 aaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttcc 1063866  T
Q  884 aatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1063867 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctca 1063904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 177; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 589 - 896
Target Start/End: Original strand, 8784703 - 8785014
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc---aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    |||||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8784703 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 8784802  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8784803 cagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 8784901  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8784902 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 8785000  T
Q  883 caatgctcaagcac 896  Q
    ||||||||||||||    
T  8785001 caatgctcaagcac 8785014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17282232 - 17281835
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  17282232 aattgtgttttctttttctctgaaaaatt-cttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgctcagaatcagatatgcag 17282134  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    |||| || | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17282133 cggataaaa-cagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 17282036  T
Q  789 gaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  17282035 gagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaat 17281938  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacact 981  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||  |||| |||||| || |||||||||    
T  17281937 gctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacacagaaa-atgtttgactttgaacact 17281839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 589 - 854
Target Start/End: Original strand, 33650636 - 33650901
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa--tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  33650636 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--aatgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 33650732  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33650733 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 33650832  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33650833 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 33650901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 553 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 13200084 - 13199646
Alignment:
Q  553 atctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggga 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | || |||    
T  13200084 atctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttctctct-aaaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttagga 13199986  T
Q  653 atgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccac 751  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  13199985 atgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccac 13199887  T
Q  752 aaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagact 846  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||    
T  13199886 aaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaaataatcacacagattacaaatgcttaatactctct-agtatgagact 13199788  T
Q  847 tctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgat 943  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||| ||    
T  13199787 tctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatcgtcaagcacgcaggcgagagacttctaat 13199690  T
Q  944 c-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacacttgat 985  Q
    | ||||||| ||||  ||||  ||||| || |||||||||||||    
T  13199689 caaacaaaattacacagaaaattgtttgactttgaacacttgat 13199646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 589 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 7609072 - 7608861
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7609072 aattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 7608973  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7608972 acggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtactccagtcccccttgcacttccaa 7608873  T
Q  788 ggagatttcact 799  Q
    ||||||||||||    
T  7608872 ggagatttcact 7608861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 589 - 830
Target Start/End: Original strand, 11530235 - 11530474
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  11530235 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 11530331  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11530332 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 11530431  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 830  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11530432 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatact 11530474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 589 - 808
Target Start/End: Original strand, 13076327 - 13076547
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13076327 aattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaactttagaagcagtttgtgaatgcttctaatgaaatgatcagaatcagatatgca 13076426  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13076427 gcggaaaagatcaaggcagagaaaagaaaggcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 13076526  T
Q  788 ggagatttcactataatcaca 808  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13076527 ggagatttcactataatcaca 13076547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 29948146 - 29947803
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  29948146 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 29948049  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcag-ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||| || | || || ||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29948048 cggaataaaaacagagtagagagaagaaagaga-gacacaagcaaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 29947950  T
Q  787 aggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  29947949 aggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcca 29947852  T
Q  885 atgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29947851 atgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggca 29947803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 29997300 - 29996957
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  29997300 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 29997203  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcag-ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||| || | || || ||||| |||||  | | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29997202 cggaataaaaacagagtagagagaagaaagaga-gacacaagcaaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 29997104  T
Q  787 aggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  29997103 aggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcca 29997006  T
Q  885 atgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29997005 atgctcaagccctaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggca 29996957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 556 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 29934393 - 29934029
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||| ||    
T  29934393 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattg 29934296  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcag-ttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || |  | || ||||| |||||  | | ||||| ||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  29934295 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaatagagtagagagaagaaagaga-gacacgagcaaattatcctggatccttccacaa 29934197  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctca 851  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  29934196 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagact--tca 29934099  T
Q  852 aaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
     |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29934098 caaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctca 29934029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 556 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 29983547 - 29983183
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||| ||    
T  29983547 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggattg 29983450  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcag-ttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || |  | || ||||| |||||  | | ||||| ||||  ||||||||| ||| |||||||    
T  29983449 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaatagagtagagagaagaaagaga-gacacgagcaaattatcctggatccttccacaa 29983351  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctca 851  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  29983350 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagact--tca 29983253  T
Q  852 aaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
     |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29983252 caaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctca 29983183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 589 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 15663537 - 15663205
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||  ||||||||| | | || |||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  15663537 aattgtgttttctttctctct--aaaaattcttcttctggtatcacttcagaaacgggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagataagcag 15663440  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15663439 cggaataaaacagagcagagaaaagaaagata-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaactgaaagtagaccagtcccccttgcactttcaag 15663341  T
Q  789 gagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||    
T  15663340 gagattttcactaagagataatcacaaagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttc 15663244  T
Q  883 caatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15663243 caatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctca 15663205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 742 - 897
Target Start/End: Complemental strand, 18857580 - 18857426
Alignment:
Q  742 ttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatg 841  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18857580 ttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatg 18857481  T
Q  842 agacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact 897  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18857480 agacttctc-aaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcact 18857426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 556 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 15651935 - 15651570
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||| ||  |||| |||||| | || ||||||    
T  15651935 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttctctct--aaaaattcttattctggtatcactttagaagcgggttaggaatg 15651838  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||||| | | || | ||||||||||||  ||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  15651837 cttctgatgtgatgttcagaatcaaataagcagcggaataaaacagatcagagaaaagaaagata-gacgcaagcaattatcctggttccttccacaaac 15651739  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttct 849  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15651738 cggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagagataatcacaaagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagacttct 15651640  T
Q  850 caaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |  ||||||||||||||  |||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15651639 c--aaatgctcaagcacgtaggcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctca 15651570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 589 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 35579223 - 35579002
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  35579223 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 35579127  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35579126 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 35579027  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  35579026 caaggagatttcactataatcacaa 35579002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 633 - 946
Target Start/End: Original strand, 2245839 - 2246159
Alignment:
Q  633 acttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaa-agatcaaagcagagaaaagaagaata-agacacaagc 730  Q
    |||||| |||| | ||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  | | || ||||||||||| | ||| | ||||||||||    
T  2245839 acttcaaaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagagcagagaaaa-aggaagagagacacaagc 2245937  T
Q  731 agttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctc 824  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| |||||    
T  2245938 aattatcatggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctc 2246037  T
Q  825 aatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agc 922  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  2246038 aatactctc-aagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagc 2246134  T
Q  923 acgcaggc-agagtcttctgatcaa 946  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||    
T  2246135 acgcaggcgagagacttctaatcaa 2246159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 558 - 920
Target Start/End: Original strand, 14580541 - 14580906
Alignment:
Q  558 aaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgct 657  Q
    |||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||    
T  14580541 aaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttttaaaatccttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgct 14580640  T
Q  658 tctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaatt 756  Q
    |||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| || | || |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||       
T  14580641 tctgatgtgatgttcagaataagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaa-agagagacacaagcagttatcctggttccttccacaatcc 14580739  T
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact------ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttct 849  Q
    |||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||      |||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14580740 ggaagtagtcta----cccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctcacagattacaactgctcaatactttc-aagtatgagacttct 14580834  T
Q  850 caaaaatgctcaagcacacaggcaatagtct--tccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |  |||||||||||||| ||||||| || ||  || |||||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||    
T  14580835 c--aaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctcaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctca 14580906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 785 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 16671766 - 16671630
Alignment:
Q  785 caaggagatttcacta-taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcc 883  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | || |||||    
T  16671766 caaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-taaatgctcaagcacacaggcgagagacttcc 16671668  T
Q  884 aatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16671667 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctca 16671630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 727 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 24393483 - 24393356
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24393483 aagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcaatacaaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaa 24393384  T
Q  827 tactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24393383 tactttcaaagtatgagacttcacaaaa 24393356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 88; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 721 - 899
Target Start/End: Original strand, 27172428 - 27172610
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact------ataatcacaaagat 813  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||||| ||||    
T  27172428 agacacaagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaatcaataatcacacagat 27172527  T
Q  814 tacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa 899  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  27172528 tacaactgctcaatactctct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaa 27172610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 589 - 874
Target Start/End: Original strand, 21735608 - 21735888
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | ||| ||        ||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  21735608 aattgtgttttctttttctcgtaaaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgaga--------gatgtgatgttcagaattagatatgcag 21735699  T
Q  689 cggaaa-agatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||  | | || |||| |||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21735700 cggaatgaaaacagagcaaagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 21735798  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaa 874  Q
    |||||||| ||||     ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||    
T  21735799 ggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatactatct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggcaa 21735888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 589 - 742
Target Start/End: Original strand, 30390732 - 30390883
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  30390732 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 30390828  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggt 742  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30390829 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggt 30390883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 31114662 - 31114459
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  31114662 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 31114563  T
Q  815 acaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||      
T  31114562 acaactgctcaatactacct-agtatgagact--tcaataatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 31114466  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  31114465 atgctca 31114459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 721 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 51989821 - 51989627
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||| | |||||    
T  51989821 agacacaagcaattatactgattccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcatacagatt 51989722  T
Q  815 acaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 911  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  51989721 acaactgctcaatactacct-agtatgagact--tcacaaatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 51989627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 589 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 27245149 - 27244987
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| |||||| | ||| |||| |||||| |||||    
T  27245149 aattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgctactgatgaagtgatcagagtcagat-tgcag 27245053  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27245052 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 27244987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 721 - 913
Target Start/End: Original strand, 10528733 - 10528931
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  10528733 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgaacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 10528832  T
Q  815 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttct 912  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10528833 acaactgctcaatactacacctagtatgagact--tcataaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttct 10528930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Original strand, 14465102 - 14465225
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  14465102 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 14465198  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  14465199 cggaaaagaacagagcagagaaaagaa 14465225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 40457096 - 40456973
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  40457096 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 40457000  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  40456999 cggaaaagaacagagcagagaaaagaa 40456973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Original strand, 17006553 - 17006757
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 815  Q
    ||||||||||  |||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  17006553 agacacaagcgattatactggtttcttccacaaactggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 17006652  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||     
T  17006653 caactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctt 17006750  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  17006751 atgctca 17006757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 554 - 795
Target Start/End: Original strand, 17960803 - 17961043
Alignment:
Q  554 tctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   || ||  ||||||||||||| |||||||||||  | || ||     
T  17960803 tctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctttaagaaatcttcttctgataagacttcagaagctatatgagag 17960901  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagtt-atcctggttccctccaca 752  Q
     |||||||||| | ||  |||| ||||||||||| ||||| | | || |||||||||||||||| | ||||||||||| || || |||||||| ||||||    
T  17960902 agcttctgatgaactgttcagagtcagatatgcatcggaataaaacagagcagagaaaagaaga-tgagacacaagcaatttatactggttccttccaca 17961000  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 795  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17961001 atccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagattt 17961043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 721 - 913
Target Start/End: Original strand, 17017389 - 17017586
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 815  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  17017389 agacacaagcgattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 17017488  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17017489 caactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 17017586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Original strand, 22150605 - 22150809
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 815  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  22150605 agacacatgcaattatactggttcctttcacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagatta 22150704  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| || || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||      
T  22150705 caactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggaaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 22150802  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  22150803 atgctca 22150809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Original strand, 15832766 - 15832971
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agat 813  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||    
T  15832766 aagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgat 15832865  T
Q  814 tacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 911  Q
    ||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15832866 tacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 15832962  T
Q  912 taatgctca 920  Q
      |||||||    
T  15832963 ctatgctca 15832971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 589 - 697
Target Start/End: Original strand, 40287580 - 40287685
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  40287580 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 40287676  T
Q  689 cggaaaaga 697  Q
    |||||||||    
T  40287677 cggaaaaga 40287685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 654 - 920
Target Start/End: Original strand, 41045034 - 41045306
Alignment:
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  || | || || |||||||||||  | | ||||||| || |||| || ||||| || |||    
T  41045034 tgcttctgatgtattgttcagaatcagatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga-gacacaaacaattatactagttccttctaca 41045132  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagac 845  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||    
T  41045133 aactggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagac 41045232  T
Q  846 ttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |  ||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  41045233 t--tcacaaatgttcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctca 41045306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Original strand, 13953621 - 13953826
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agat 813  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||    
T  13953621 aagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgat 13953720  T
Q  814 tacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttc 911  Q
    ||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||  ||||||||| ||||    
T  13953721 tacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagacttc 13953817  T
Q  912 taatgctca 920  Q
      |||||||    
T  13953818 ctatgctca 13953826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Original strand, 14353862 - 14353982
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  14353862 aattgtgttttctttttctc---aatattacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 14353955  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  14353956 cggaaaagaacagagcagagaaaagaa 14353982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Original strand, 49989619 - 49989824
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agat 813  Q
    ||||||||  || |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||    
T  49989619 aagacacagacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgat 49989718  T
Q  814 tacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 911  Q
    ||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  49989719 tacaattgctcaatactgcacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 49989815  T
Q  912 taatgctca 920  Q
      |||||||    
T  49989816 ctatgctca 49989824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 854 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 15663242 - 15663107
Alignment:
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaa 949  Q
    |||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||     
T  15663242 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacag 15663143  T
Q  950 aaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    || ||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  15663142 aattacacagaaaaatgtttgacttgaacacttgat 15663107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 720 - 899
Target Start/End: Original strand, 15848500 - 15848683
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agat 813  Q
    ||||||||  || |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||    
T  15848500 aagacacagacaattatactggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagagtttcactaagtttaatcacaactgat 15848599  T
Q  814 tacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa 899  Q
    ||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || ||||   ||||||||||||||    
T  15848600 tacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaa 15848683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 720 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 45862361 - 45862162
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 812  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  45862361 aagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 45862262  T
Q  813 ttacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtctt 910  Q
    |||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  45862261 ttacaactgctcaatactgcacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagactt 45862165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 720 - 913
Target Start/End: Original strand, 13147651 - 13147851
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agat 813  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||    
T  13147651 aagacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgat 13147750  T
Q  814 tacaa-atgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtctt 910  Q
    |||||  |||||||||||   |  |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| || ||| |  || ||||||||| ||||||||| |||    
T  13147751 tacaacttgctcaatactacacctagtatgagact--tcaaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttactttgatcaagcactaaagcaagagactt 13147848  T
Q  911 cta 913  Q
    |||    
T  13147849 cta 13147851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 727 - 805
Target Start/End: Original strand, 27849590 - 27849668
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27849590 aagcaattatcctcgttccttccacaatccggaagtagtacagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 27849668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 720 - 914
Target Start/End: Original strand, 37411993 - 37412193
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 812  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  37411993 aagacacaagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 37412092  T
Q  813 ttacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtctt 910  Q
    |||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| |||    
T  37412093 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaagcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagactt 37412189  T
Q  911 ctaa 914  Q
    ||||    
T  37412190 ctaa 37412193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 730 - 805
Target Start/End: Original strand, 13931364 - 13931439
Alignment:
Q  730 cagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    |||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13931364 cagttatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccctttgcacatctaaggagatttcactataatc 13931439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 12753404 - 12753243
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact-t 831  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||      
T  12753404 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatactac 12753305  T
Q  832 tctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac 896  Q
     |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||    
T  12753304 acctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcac 12753243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 741 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 13410817 - 13410752
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13410817 gttccttccacaattcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 13410752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 446 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 29081679 - 29081598
Alignment:
Q  446 ttatgaaagagaacgaagaaaacgatttgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||| |||| ||||||| | | |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  29081679 ttatgaaaaagaaagaagaaagctacttgtgacattgtggttggtcaatgtcaccgatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 29081598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 14063770 - 14063710
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14063770 ggttccttccacaaactggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14063710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 705 - 800
Target Start/End: Original strand, 3238036 - 3238130
Alignment:
Q  705 agagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||||||||||  | ||| ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3238036 agagaaaagaagaaggacaca-aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 3238130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 858 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 15651603 - 15651472
Alignment:
Q  858 ctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaat 953  Q
    |||||||||  | |||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||| ||| |||| || |    
T  15651603 ctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaaggactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcgagagacttctaatcaaacagaatt 15651504  T
Q  954 acaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  15651503 acacagaaaaatgtttgacttgaacacttgat 15651472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 712 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 17769763 - 17769645
Alignment:
Q  712 agaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtccccctt-gcacttccaaggaga--tttcactataatcaca 808  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||| ||||| |||||||   |||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17769763 agaagaaagagacacaaacaattatcctagttccttccacaatccggaaatagtccagttcccatttgcacttccaaggagatttttcactataatcaca 17769664  T
Q  809 -aagattacaaatgctcaa 826  Q
     |||||||||| |||||||    
T  17769663 caagattacaattgctcaa 17769645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 712 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 19071064 - 19070946
Alignment:
Q  712 agaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtccccctt-gcacttccaaggaga--tttcactataatcaca 808  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||| ||||| |||||||   |||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19071064 agaagaaagagacacaaacaattatcctagttccttccacaatccggaaatagtccagttcccatttgcacttccaaggagatttttcactataatcaca 19070965  T
Q  809 -aagattacaaatgctcaa 826  Q
     |||||||||| |||||||    
T  19070964 caagattacaattgctcaa 19070946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 841 - 913
Target Start/End: Original strand, 14580858 - 14580929
Alignment:
Q  841 gagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14580858 gagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 14580929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 426
Target Start/End: Original strand, 22893891 - 22893960
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  22893891 ggataatacttgggtgacattgtggttggtgacattggtgacatt-accaaccacaatgttacaagtgtac 22893960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 527
Target Start/End: Original strand, 49159495 - 49159537
Alignment:
Q  485 gttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49159495 gttggccaatgtcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 49159537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 2560551 - 2560624
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2560551 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 2560624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 728 - 805
Target Start/End: Original strand, 8693512 - 8693589
Alignment:
Q  728 agcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    |||| ||||||||||||| || | ||  |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  8693512 agcaattatcctggttccttcaaaaatctggaagtagtgcagtcccccttgcttgtccaaggagatttcactataatc 8693589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 728 - 805
Target Start/End: Original strand, 9045399 - 9045476
Alignment:
Q  728 agcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    |||| ||||||||||||| || | ||  |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  9045399 agcaattatcctggttccttcaaaaatctggaagtagtgcagtcccccttgcttgtccaaggagatttcactataatc 9045476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 23538957 - 23538884
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23538957 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtccccattgcacttccaaggagagttcacta 23538884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 555 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 51990024 - 51989914
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    ||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||    ||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  51990024 ctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttttaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagt 51989925  T
Q  655 gcttctgatgt 665  Q
    |||||||||||    
T  51989924 gcttctgatgt 51989914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 792
Target Start/End: Original strand, 20724466 - 20724518
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 792  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20724466 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 20724518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 803
Target Start/End: Original strand, 50299613 - 50299677
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 803  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50299613 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactataa 50299677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Original strand, 6252799 - 6252866
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtc-cagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6252799 ggttccttccacaaaccggaagtagtttctgtcccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatca 6252866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 739 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 14078096 - 14078029
Alignment:
Q  739 tggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  14078096 tggttccttccataatctggaagtagtccactcccccttgcacttcaaaggagagttcactaaaatca 14078029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 855 - 913
Target Start/End: Original strand, 18006022 - 18006081
Alignment:
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18006022 atgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 18006081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 742 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 22804801 - 22804746
Alignment:
Q  742 ttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 797  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22804801 ttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaatgagatttca 22804746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 589 - 668
Target Start/End: Original strand, 41044932 - 41045011
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaat 668  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  41044932 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaatctttttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgcttatgatgtaat 41045011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Original strand, 11078134 - 11078200
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  11078134 ggttccttccacaatccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 11078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 556 - 671
Target Start/End: Original strand, 15832565 - 15832680
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||  || |    
T  15832565 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaagataaattcttcttctgagatcacttcagaagctgtttgaaaacg 15832664  T
Q  656 cttctgatgtaatgac 671  Q
    |||||||||| |||||    
T  15832665 cttctgatgtgatgac 15832680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 473 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 20286957 - 20286903
Alignment:
Q  473 tgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20286957 tgtgacattgtggttggccaatgtcatcaatgtcaccaaccataatgtcacccaa 20286903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 760 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 20736673 - 20736609
Alignment:
Q  760 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  20736673 agtagtccagtcccc-ttgcactttcaagg-gatttcactataacctcaaacattacaaatgctcaa 20736609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 22770637 - 22770571
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  22770637 ggttccttccacaattcggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcactaaaatca 22770571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 631
Target Start/End: Original strand, 23413894 - 23413936
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataa 631  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23413894 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataa 23413936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 47207083 - 47207145
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47207083 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 47207145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 757 - 806
Target Start/End: Original strand, 6174731 - 6174780
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  6174731 ggaagtagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 6174780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 12963879 - 12963806
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  12963879 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtaatcatgtcccccttacacttccaaggagagttcacta 12963806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 17239716 - 17239643
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17239716 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcacta 17239643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 26418470 - 26418397
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26418470 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtgccccttgcacttccaagtagagttcacta 26418397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 422
Target Start/End: Original strand, 29081602 - 29081655
Alignment:
Q  369 gtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagt 422  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  29081602 gtgacattgtggttggtgacatcggtgacattgaccaaccacaatgtcacaagt 29081655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 29081730 - 29081697
Alignment:
Q  393 gtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29081730 gtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 29081697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 747 - 792
Target Start/End: Original strand, 52919850 - 52919895
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 792  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  52919850 tccacaaatcggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 52919895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 792
Target Start/End: Original strand, 6090105 - 6090157
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 792  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6090105 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggaga 6090157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 356 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 11512554 - 11512487
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgt 424  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  11512554 ggataatacttgggtgacattatggttggtgacattggtgacatt-accaaccacaatgttacaagtgt 11512487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Original strand, 13147483 - 13147558
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |  |||||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  13147483 aattgtgttttctttttctcaaaaaaaat-cttcttctgagatcacttcaaaagctgtttaagaatgcttctgatgt 13147558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 363 - 419
Target Start/End: Original strand, 20286901 - 20286957
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcaca 419  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20286901 acttgggtgacattatggttggtgacattgatgacattggccaaccacaatgtcaca 20286957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Original strand, 22150436 - 22150512
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22150436 aattgtgttttctttttctcaagataaaatcttcttctgagatcacttcagaagctgtttgagaatgcttctgatgt 22150512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 742 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 49669267 - 49669207
Alignment:
Q  742 ttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49669267 ttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 49669207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 741 - 800
Target Start/End: Original strand, 13939275 - 13939334
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| ||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13939275 gttccttccacaaaccggaagttgtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13939334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 739 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 19198655 - 19198588
Alignment:
Q  739 tggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||| |||||||   || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19198655 tggttccttccacaatccgggagtagtccactcccccttgaacttccaaggagagttcactaaaatca 19198588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 747 - 798
Target Start/End: Original strand, 20645539 - 20645590
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 798  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20645539 tccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcac 20645590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 22893935 - 22893900
Alignment:
Q  492 aatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22893935 aatgtcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 22893900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 484 - 527
Target Start/End: Original strand, 25790889 - 25790932
Alignment:
Q  484 tgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  25790889 tgttggtcaatgtcaccaatgtcaccaaccataatgtcacccaa 25790932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 801
Target Start/End: Original strand, 28581471 - 28581546
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28581471 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 28581546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 722 - 896
Target Start/End: Original strand, 51340340 - 51340519
Alignment:
Q  722 gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatt 814  Q
    |||||||||| |||| | |||||| | ||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||    
T  51340340 gacacaagcaattatacaggttcctttcacaaaacggaagtcagtcctctcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 51340439  T
Q  815 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac 896  Q
    |||| |||||||||||   |  ||||||||| |||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||    
T  51340440 acaactgctcaatactacacctagtatgagatttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcac 51340519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 712 - 826
Target Start/End: Original strand, 1463736 - 1463853
Alignment:
Q  712 agaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatca-ca 808  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||       
T  1463736 agaagaaaaagtcacaagcaattatcatggtttcttccacaatcaagaattagtctagtcccccttgcacttccaaagatatttttcactataatcatgc 1463835  T
Q  809 aagattacaaatgctcaa 826  Q
    |||||||||| |||||||    
T  1463836 aagattacaattgctcaa 1463853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 856 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 12753253 - 12753195
Alignment:
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  12753253 tgctcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 12753195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 856 - 913
Target Start/End: Original strand, 13953791 - 13953849
Alignment:
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13953791 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 13953849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 894 - 985
Target Start/End: Original strand, 14465332 - 14465426
Alignment:
Q  894 cactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  14465332 cactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 14465426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Original strand, 17017221 - 17017296
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||| ||||  || ||||||||||||    
T  17017221 aattgtgttttctttttc--ccaaaaaatatcttcttctaatatcacttcagaagctgtttaagagtgcttctgatgt 17017296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Original strand, 21316932 - 21316998
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21316932 ggttccttccacaatccggaagtagtcttgtctcccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21316998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 797
Target Start/End: Original strand, 21640245 - 21640303
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 797  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  21640245 ggttccttccacaaattggaagtcagtcctgtcccgcttgcacgtccaaggagagttca 21640303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 30054960 - 30054898
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30054960 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 30054898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 363 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 49159539 - 49159493
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaacca 409  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  49159539 acttgggtgacattgtggttggtgacattggtgacattggccaacca 49159493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 49554290 - 49554216
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49554290 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 49554216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 53299860 - 53299826
Alignment:
Q  392 cgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53299860 cgtgacattggccaaccacaatgtcacaagtgtac 53299826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 774 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 4768281 - 4768229
Alignment:
Q  774 ccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa-agattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  4768281 ccttgcacttccaag-agatttcactataatctcactagattacaaatgctcaa 4768229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 856 - 893
Target Start/End: Original strand, 8710418 - 8710455
Alignment:
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaag 893  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8710418 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 8710455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 856 - 893
Target Start/End: Original strand, 9062305 - 9062342
Alignment:
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaag 893  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9062305 tgctcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaag 9062342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 741 - 801
Target Start/End: Original strand, 13823446 - 13823507
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13823446 gttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 13823507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 733 - 805
Target Start/End: Original strand, 15647145 - 15647218
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 805  Q
    |||||| |||||| |||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  15647145 ttatcccggttccttccacaatgcggaagtactccagtaccccttgcacttccaagaacattttcactataatc 15647218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 757 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 15961388 - 15961340
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15961388 ggaagtagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 15961340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 29952230 - 29952157
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  29952230 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccctttgcactttcaaggggagttcacta 29952157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 30001384 - 30001311
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||    
T  30001384 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccctttgcactttcaaggggagttcacta 30001311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 741 - 801
Target Start/End: Original strand, 31302728 - 31302789
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31302728 gttccttccacaaaccggaagtcagttctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 31302789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 426
Target Start/End: Original strand, 32385385 - 32385418
Alignment:
Q  393 gtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32385385 gtgacattggtcaaccacaatgtgacaagtgtac 32385418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 363 - 424
Target Start/End: Original strand, 48342214 - 48342274
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgt 424  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||| |||| ||||    
T  48342214 acttgggtgacattgtggttggtgacatt-gtgacattagccaaccacaatgccacatgtgt 48342274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 856 - 920
Target Start/End: Original strand, 51340509 - 51340574
Alignment:
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||||    
T  51340509 tgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcattaaagcaagagacttcctatgctca 51340574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 52283168 - 52283229
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| |||||||| || |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52283168 ggttccttccacaaactgaaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 52283229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 304; Significance: 1e-170; HSPs: 158)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 18926606 - 18926175
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  18926606 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcggaagcagtttggaaatg 18926507  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||      
T  18926506 cttctaatgtaataatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggtttcttccacaaca 18926407  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18926406 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaa 18926308  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaa 952  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18926307 ttctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 18926208  T
Q  953 tacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18926207 tacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 18926175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 25787088 - 25787486
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25787088 aattgtgttttctttttctttctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatgtgcag 25787187  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787188 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 25787287  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25787288 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgacacttctc-aaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 25787386  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  25787387 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 25787486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 20030716 - 20030315
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccca--aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20030716 aattgtgttttctttttctctcttgaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 20030617  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20030616 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 20030517  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20030516 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 20030417  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  20030416 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatactatgaaataagtttgacttgaacacttg 20030317  T
Q  984 at 985  Q
    ||    
T  20030316 at 20030315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 20063467 - 20063066
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20063467 aattgtgttttctttttctctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 20063368  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20063367 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 20063268  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  20063267 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 20063168  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  20063167 gctcaagtactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatactatgaaataagtttgacttgaacacttg 20063068  T
Q  984 at 985  Q
    ||    
T  20063067 at 20063066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 7376572 - 7376169
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc---aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    |||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7376572 aattgtgttttctttttctctctaaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 7376473  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7376472 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 7376373  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  7376372 aaggagatttcactataatcacgaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttcca 7376273  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7376272 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacact 7376173  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  7376172 tgat 7376169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 12827048 - 12827477
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12827048 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttct---gataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 12827144  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  12827145 cttctgatgaaatgatcagactcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaa 12827244  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12827245 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaa 12827344  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaa 952  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12827345 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaatagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 12827444  T
Q  953 tacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12827445 tacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 12827477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 553 - 985
Target Start/End: Original strand, 32756753 - 32757183
Alignment:
Q  553 atctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggga 652  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32756753 atctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctct--aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggga 32756849  T
Q  653 atgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32756850 atgcttttgatgtaattaccagaatcagatttgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcagttatcctggttccttccaca 32756949  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32756950 aatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatac--tctaagtatgagacttctcaa 32757047  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaa 949  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||| |||||| || |||||    
T  32757048 aaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagtacgcagacaagagacttctgttcaaacaa 32757147  T
Q  950 aaatacaatgaaatatgttt-aacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||  |||| |||||| | ||||||||||||||    
T  32757148 aaatacagagaaa-atgtttgaccttgaacacttgat 32757183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 16124344 - 16123946
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16124344 aattgtgttttctttttctct--aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttttgatgtaataaccagaatgagatatgcag 16124247  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16124246 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcagttatcatggttccttccacaaatcggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaag 16124147  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16124146 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 16124047  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgttt-aacttgaacacttga 984  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||||    
T  16124046 taaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgaccttgaacacttga 16123947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 9123940 - 9123543
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  9123940 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcag 9123844  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9123843 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 9123744  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9123743 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 9123644  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  9123643 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 9123544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 9113303 - 9112906
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  9113303 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcag 9113207  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9113206 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 9113107  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9113106 agagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 9113007  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  9113006 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 9112907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 552 - 985
Target Start/End: Original strand, 31571765 - 31572199
Alignment:
Q  552 tatctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggg 651  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  31571765 tatctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataatacttcagaagcaggttagg 31571862  T
Q  652 aatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccac 751  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31571863 aatgcttctgatgtgatgatcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcaattatcctggttccttccac 31571962  T
Q  752 aaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc 850  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31571963 aaatcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctc 31572062  T
Q  851 aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aa 946  Q
     ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||    
T  31572063 -aaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaa 31572161  T
Q  947 caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  31572162 caaaaatacagagaaa-atgtttgacttgaacacttgat 31572199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 589 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 10404350 - 10404043
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaa-aaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10404350 aattgtgttttctttttctctcttagaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 10404251  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10404250 gcggaaaggatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 10404151  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10404150 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 10404051  T
Q  888 ctcaagca 895  Q
    ||||||||    
T  10404050 ctcaagca 10404043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 5844467 - 5844871
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5844467 aattgtgttttctttttctct-aaaaaattcttcttctgataatactttagaagcagtttaggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 5844565  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaga-ataag----acacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5844566 cggaaaataacaaagcagagaaaagaaaagaaaagcgaaacacaagcaattatcctgcttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcactt 5844665  T
Q  784 ccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5844666 ccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttc 5844764  T
Q  883 caatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgttt-aacttgaa 977  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||  |||| |||||| | ||||||    
T  5844765 caatgctcaagcactaaagcaagactctactaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctgttcaaacaaaaatacagagaaa-atgtttgaccttgaa 5844863  T
Q  978 cacttgat 985  Q
    ||||||||    
T  5844864 cacttgat 5844871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 3671435 - 3671832
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  3671435 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 3671531  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3671532 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 3671631  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3671632 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 3671731  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  3671732 ctcaagcacaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 3671831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 12854409 - 12854806
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12854409 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 12854505  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12854506 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacataagcagttatcctggttccttccacaacatggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 12854605  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12854606 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 12854705  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  12854706 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 12854805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 12864935 - 12865332
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12864935 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 12865031  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12865032 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 12865131  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12865132 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcagaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 12865231  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  12865232 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 12865331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 12717646 - 12717247
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12717646 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 12717550  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717549 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 12717450  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12717449 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 12717350  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  12717349 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 12717250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 12728295 - 12727896
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12728295 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 12728199  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12728198 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 12728099  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12728098 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 12727999  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  12727998 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 12727899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17983311 - 17982912
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  17983311 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 17983215  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17983214 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 17983115  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17983114 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 17983015  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  17983014 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 17982915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 25985468 - 25985867
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  25985468 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 25985564  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25985565 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 25985664  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc--aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25985665 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 25985764  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  25985765 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 25985864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 3660771 - 3661168
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  3660771 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 3660867  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3660868 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacgaaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 3660967  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3660968 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 3661067  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  3661068 ctcaagcacaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 3661167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17985520 - 17985121
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||    
T  17985520 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaattatcagagtcagat-tgcag 17985424  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17985423 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 17985324  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17985323 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 17985224  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  17985223 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 17985124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 27505293 - 27505727
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||     
T  27505293 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaat-cttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgag 27505391  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27505392 tgcttctgatgaactgatcagaattggatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 27505491  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  27505492 acacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaa 27505591  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaa 949  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27505592 agatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 27505691  T
Q  950 aaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27505692 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 27505727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 27372183 - 27372617
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||     
T  27372183 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaat-cttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgag 27372281  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27372282 tgcttctgatgaactgatcagaattggatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagtagttatcctggttccttccaca 27372381  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  27372382 acacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaa 27372481  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaa 949  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27372482 agatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 27372581  T
Q  950 aaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27372582 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 27372617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 27462533 - 27462967
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||     
T  27462533 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaat-cttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgag 27462631  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  27462632 tgcttctgatgaactgatcagaattggatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagtagttatcctggttccttccaca 27462731  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  27462732 acacggaagtagtccagtcccccttgtacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactatctaagtgtgagacttcacaa 27462831  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaa 949  Q
    | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27462832 agatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaa 27462931  T
Q  950 aaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  27462932 aaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 27462967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 619 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17746565 - 17746195
Alignment:
Q  619 cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaa 718  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |     
T  17746565 cttcttctgaaaatacttcaaaagcagtttaggaatgcttctgatgtgatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaag 17746466  T
Q  719 taagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattaca 817  Q
      ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17746465 cgagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattaca 17746366  T
Q  818 aatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatg 916  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17746365 aatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatg 17746267  T
Q  917 ctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacacttgat 985  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||  |||| |||||| || |||||||||||||    
T  17746266 ctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaa-atgtttgactttgaacacttgat 17746195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 26043598 - 26043997
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26043598 aattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 26043697  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||| || |  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26043698 cggaaa-gaactgagcagagaaaagaaaaacaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 26043796  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26043797 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaagctgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 26043896  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  26043897 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 26043996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 34818602 - 34818203
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  34818602 aattgtgttttctatttctcttaaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaaacagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 34818506  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34818505 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 34818406  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc--aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34818405 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 34818306  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  34818305 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 34818206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 29384139 - 29384537
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  29384139 aattgtgttttctttttctcttaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 29384235  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29384236 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 29384335  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29384336 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 29384434  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  29384435 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 29384534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 32962746 - 32962345
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc----ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    ||||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||| | |    
T  32962746 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcag-ttt 32962650  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    |||||||||| || || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  32962649 gcagcggaaaggaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 32962550  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcc 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32962549 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 32962450  T
Q  884 aatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacac 980  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||    
T  32962449 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 32962350  T
Q  981 ttgat 985  Q
    |||||    
T  32962349 ttgat 32962345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 32973363 - 32972964
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||| | ||||    
T  32973363 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagtt-tgca 32973267  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtccccc-ttgcacttcc 785  Q
    ||||||| || || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32973266 gcggaaaggaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccccttgcacttcc 32973167  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32973166 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 32973067  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  32973066 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 32972967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 34807972 - 34807571
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  34807972 aattgtgttttctatttctcttaaaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 34807876  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34807875 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 34807776  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc---aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcc 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  34807775 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 34807676  T
Q  884 aatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacac 980  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||    
T  34807675 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 34807576  T
Q  981 ttgat 985  Q
    |||||    
T  34807575 ttgat 34807571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 26864172 - 26864571
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaat-acttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  26864172 aattgtgttttctttttctcttaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 26864268  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26864269 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 26864368  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26864369 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 26864467  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  26864468 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 26864567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 26874796 - 26875195
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaat-acttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||    
T  26874796 aattgtgttttctttttctcttaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgattagagtcagat-tgca 26874892  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26874893 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 26874992  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26874993 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 26875091  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  26875092 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 26875191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 33198715 - 33199113
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  33198715 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatatttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgattctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 33198811  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33198812 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttattctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttctaa 33198911  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33198912 ggagatttgactataatcaccaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 33199011  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  33199012 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttg 33199111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 556 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 11148033 - 11147708
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11148033 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataagacttcagaagcagtttgtgaatg 11147934  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | || | ||||||||||||||||||||| |||||||      
T  11147933 cttctgatgaaatgatcagaatcagatgtgcagcggaaaggatcagagcagagaaaagaaagacaa-agacaagcagttatcctggttccttccacaaca 11147835  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11147834 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgcttaatactctctaagtatgagacttcacaaaaa 11147735  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||    
T  11147734 tgctcaagcacacacgcaagagtcttc 11147708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 16929835 - 16930236
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaa---atacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  16929835 aattgtgttttctttttctcttaaaaagggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 16929931  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16929932 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 16930031  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16930032 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 16930130  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  16930131 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 16930230  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  16930231 cttgat 16930236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 26024843 - 26025244
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaa---atacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  26024843 aattgtgttttctttttctcttaaaaagggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 26024939  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26024940 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 26025039  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26025040 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 26025138  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  26025139 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 26025238  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  26025239 cttgat 26025244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 26035417 - 26035818
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaa---atacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  26035417 aattgtgttttctttttctcttaaaaagggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 26035513  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26035514 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 26035613  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26035614 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 26035712  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  26035713 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 26035812  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  26035813 cttgat 26035818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 27341078 - 27341479
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  27341078 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27341174  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341175 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27341274  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27341275 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 27341373  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  27341374 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 27341473  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  27341474 cttgat 27341479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 27401818 - 27402219
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  27401818 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27401914  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27401915 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27402014  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27402015 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 27402113  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  27402114 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 27402213  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  27402214 cttgat 27402219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 27412477 - 27412878
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  27412477 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 27412573  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27412574 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 27412673  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27412674 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 27412772  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  27412773 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 27412872  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  27412873 cttgat 27412878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 31983438 - 31983037
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | |||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  31983438 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgagaaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 31983342  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31983341 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 31983242  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  31983241 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 31983143  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  31983142 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 31983043  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  31983042 cttgat 31983037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 32301855 - 32301454
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  32301855 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 32301759  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301758 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 32301659  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  32301658 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 32301560  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  32301559 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 32301460  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  32301459 cttgat 32301454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 32312544 - 32312143
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  32312544 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 32312448  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32312447 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 32312348  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  32312347 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 32312249  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  32312248 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 32312149  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  32312148 cttgat 32312143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 589 - 896
Target Start/End: Original strand, 12352964 - 12353277
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc---aaaaaatacttcttctgataata-cttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    |||||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  12352964 aattgtgttttctttttctctcttaaaaaaaaacttcttctgataaaaacttcagaagcagtttgtaagtgcttctgatgaaatgatcagaatcaggtat 12353063  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  12353064 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagtagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 12353163  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa-tgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  12353164 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttc 12353263  T
Q  883 caatgctcaagcac 896  Q
    ||||||||||||||    
T  12353264 caatgctcaagcac 12353277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 612 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 27167229 - 27166854
Alignment:
Q  612 aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 711  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| | |  | || |||||||    
T  27167229 aaaaattcttcttctgaaaacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgatcaaaatcagatatgcagcggaataaaatagagtagagaaa 27167130  T
Q  712 agaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaa 810  Q
    ||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  27167129 aga-gagaaagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactaataatcacaaa 27167031  T
Q  811 gattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtct 909  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27167030 gattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtct 27166932  T
Q  910 tctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||  |||| |||||| | |||||||||||||    
T  27166931 tctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaa-atgtttgaattgaacacttgat 27166854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 589 - 920
Target Start/End: Original strand, 27503703 - 27504033
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| |||||| | ||| |||| |||||| |||||    
T  27503703 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcag 27503799  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27503800 cggaagagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 27503899  T
Q  788 ggagattt-cactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  27503900 ggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaat 27503999  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27504000 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctca 27504033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 589 - 920
Target Start/End: Original strand, 27383821 - 27384151
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||| |||||| | ||| |||| |||||| |||||    
T  27383821 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcactttg--attgctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcag 27383917  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383918 cggaagagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 27384017  T
Q  788 ggagattt-cactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  27384018 ggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaat 27384117  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27384118 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctca 27384151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 589 - 920
Target Start/End: Original strand, 27474205 - 27474535
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||| |||||| | ||| |||| |||||| |||||    
T  27474205 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcactttg--attgctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcag 27474301  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27474302 cggaagagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 27474401  T
Q  788 ggagattt-cactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  27474402 ggagattttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaat 27474501  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27474502 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctca 27474535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 4630253 - 4630656
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-----cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagata 683  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |     ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||||||     
T  4630253 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat- 4630349  T
Q  684 tgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcact 782  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  4630350 tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagtcaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcact 4630449  T
Q  783 tccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtct 880  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||    
T  4630450 tccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtct 4630548  T
Q  881 tccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaa 977  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||    
T  4630549 tccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaa 4630648  T
Q  978 cacttgat 985  Q
    ||||||||    
T  4630649 cacttgat 4630656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 16959006 - 16959407
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaa---atacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| | || |||||| ||    
T  16959006 aattgtgttttctttttctcttaaaaagggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatctgagtcagat-tg 16959102  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16959103 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 16959202  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16959203 caaagagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 16959301  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  16959302 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 16959401  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  16959402 cttgat 16959407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 554 - 891
Target Start/End: Original strand, 25583262 - 25583600
Alignment:
Q  554 tctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |     |  |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||     
T  25583262 tctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctttttaatcttcttctaataaaacttcagaagcagtttgtgag 25583361  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25583362 tgcttctgatgaattgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaatgacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 25583461  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25583462 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaa 25583561  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctca 891  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  25583562 aaatgctcaagcacacacgcatgagtcttccaatgctca 25583600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 556 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 28357554 - 28357188
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||||  ||     
T  28357554 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaataat-cttcttcagataaatcttcagaagcagtttatgag 28357456  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||| | ||| |||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28357455 tgcttctgatgaattgatcagaattagatgtgcagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 28357356  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  28357355 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaa 28357256  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    | ||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28357255 agatgctcaagcacacacgcaagagacttccactgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctca 28357188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 556 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 18835474 - 18835112
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||| |||||||||||| |   |||||| |||||||| |||| |||| |||||| | || | ||||    
T  18835474 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgagttttctttttcact--aaaaattcttcttctaataacactttagaagctggttagaaatg 18835377  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  18835376 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaatagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaat 18835278  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18835277 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaa 18835179  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18835178 atgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctca 18835112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 176; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 589 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 28252374 - 28252041
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||||  || ||||||||||| | ||| |||||| |||| |||    
T  28252374 aattgtgttttctttttctctcttaaataat-cttcttcagataaatcttcagaagcagtttatgagtgcttctgatgaattgatcagaattagatgtgc 28252276  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28252275 agcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 28252176  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || ||||||     
T  28252175 aaggagatttcactataatcaacaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccac 28252076  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28252075 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctca 28252041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 622 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 7752015 - 7751714
Alignment:
Q  622 cttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaata 720  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||  |    
T  7752015 cttctgataaaccttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaatagatcagaattagatgtgcagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaa 7751916  T
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtccccc-ttgcacttccaaggagattt-cactataatcacaaagattacaa 818  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  7751915 agaaacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccccttgcacttccaaagagattttcactataatcaacaagattacaa 7751816  T
Q  819 atgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgct 918  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7751815 ctgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaagatgctcaagcacacacgcaagagacttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgct 7751716  T
Q  919 ca 920  Q
    ||    
T  7751715 ca 7751714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 556 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 30120736 - 30120483
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  30120736 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcttcttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtg 30120637  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  30120636 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagtagttatcttggttccttccacaaat 30120537  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 809  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120536 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 30120483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 721 - 985
Target Start/End: Original strand, 29765053 - 29765320
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaa 819  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29765053 agacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcctccttgcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaa 29765152  T
Q  820 tgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgct 918  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29765153 tgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgct 29765251  T
Q  919 c-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    | ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||| |||| |||||| | |||||||||||||    
T  29765252 caagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacaaagaaa-atgtttgaattgaacacttgat 29765320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 619 - 985
Target Start/End: Original strand, 22308203 - 22308573
Alignment:
Q  619 cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaa 718  Q
    ||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |     
T  22308203 cttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaa-ag 22308301  T
Q  719 taagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattac 816  Q
      ||||||||||| ||||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||    
T  22308302 agagacacaagcaattatcctggttccttccacaatccgtaagtagtccagtcccccttgcacttcgaaggagattttcaataataatctcaaagattac 22308401  T
Q  817 aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22308402 aaatgctcaatactctcttagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaat 22308500  T
Q  916 gctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacacttgat 985  Q
    |||| |||| |||||| |||| ||||| ||| |||| |||||||  |||| |||||| || |||||||||||||    
T  22308501 gctcaagcaagcaggcaagaggcttctaatcaaacagaaatacacagaaa-atgtttgactttgaacacttgat 22308573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 678 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 18826959 - 18826717
Alignment:
Q  678 cagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtccccctt 777  Q
    |||||||||||||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18826959 cagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccataaatcggaagtagtccagtccccctt 18826861  T
Q  778 gcacttccaaggagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaata 876  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  18826860 gcacttccaaggagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagatttctc-aaaatgctcaagcacacaggcgaga 18826762  T
Q  877 gtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18826761 gacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatactca 18826717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 556 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 25687594 - 25687229
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  25687594 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatg 25687497  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||| |||  || ||||| ||||||||||||| | |  | || ||||| |||||  | | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||     
T  25687496 cttctgatgtgatgttcataatcaaatatgcagcggaataaaaaagagtagagagaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttctttccacaaac 25687398  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttct 849  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  25687397 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatc-cacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagact--t 25687301  T
Q  850 caaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    || |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25687300 cacaaatgctcaagcactcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctca 25687229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 550 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 17742553 - 17742173
Alignment:
Q  550 agtatctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttg 649  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||     
T  17742553 agtatatgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggtta 17742456  T
Q  650 ggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaa-agatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctc 748  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  | | || | ||||||||||||  | | |||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  17742455 ggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctagttccttc 17742357  T
Q  749 cacaaattggaagtagtccagtcccccttgcac-ttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagac 845  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  17742356 cacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcactttttaaggagatttccactaataatcgcacagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagac 17742258  T
Q  846 ttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    |||||  |||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17742257 ttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgggagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 17742173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 589 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 12417168 - 12416902
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa----tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||    | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |    
T  12417168 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-t 12417072  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  12417071 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 12416972  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12416971 ccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 12416902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 556 - 915
Target Start/End: Original strand, 18554650 - 18555010
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||  ||||||||||| | |||||||||    
T  18554650 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctc---aaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttgggaatg 18554746  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || | || || ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18554747 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagtagagaaaagaa-agagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 18554845  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttc 848  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18554846 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtatgagacttc 18554944  T
Q  849 tcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
     |  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18554945 cc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 18555010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Original strand, 31930834 - 31931163
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||||| |||| | ||| || |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  31930834 aattgtgttttctttttctcgtaaaaaat-cttcttctgatatcacttcaaaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaattagatatgcag 31930932  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | ||||| |||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31930933 cggaataaaaacaaagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 31931031  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| || |||    
T  31931032 ggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggcaagagactt 31931128  T
Q  882 ccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  31931129 ccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 31931163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 589 - 809
Target Start/End: Original strand, 1902118 - 1902340
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1902118 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaatcttcagaagcagactgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 1902217  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1902218 agcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 1902316  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1902317 aaggagatttcactataatcacaa 1902340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 555 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 17573268 - 17573068
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccca-aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    ||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17573268 ctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaa 17573169  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17573168 tgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 17573069  T
Q  754 a 754  Q
    |    
T  17573068 a 17573068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 589 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 9934422 - 9934131
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| | ||||||||||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  9934422 aattgtgttttctttttctct--aaaagttcttcttctgataacacttcagaagctggttagaaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 9934325  T
Q  689 cggaaa-agatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||  | | || | ||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9934324 cggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtccccctcgcacttccaa 9934226  T
Q  788 ggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  9934225 ggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtacgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttc 9934131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 556 - 851
Target Start/End: Original strand, 22292246 - 22292541
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||| ||||||| |||| |  |||||| ||||||||| || ||||||||||||   ||| || ||    
T  22292246 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtattttcttcttct-cttaaaaattcttcttctggtattacttcagaagctagttgagagtg 22292344  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| |||||||      
T  22292345 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaa-agagagacacaagcaattatcctggttccttccacaatc 22292443  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctca 851  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22292444 cggaagtagtccagtcccccttgcatttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctca 22292541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 556 - 913
Target Start/End: Original strand, 11205325 - 11205683
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||| |||||||   | ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  11205325 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgttttttttttctt--agaaaattctccttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtg 11205422  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | | || || |||||||||||  | | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||     
T  11205423 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatactggttccttccacaaac 11205521  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttct 849  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  |    
T  11205522 cagaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactatct-agtatgagact--t 11205618  T
Q  850 caaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    || |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11205619 cacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 11205683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 589 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 27819279 - 27819055
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata------cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagat 682  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |      ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  27819279 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat 27819182  T
Q  683 atgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcac 781  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  27819181 -tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcac 27819083  T
Q  782 ttccaaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819082 ttccaaggagatttcactataatcacaa 27819055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 555 - 920
Target Start/End: Original strand, 11234846 - 11235213
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    ||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||| ||||| ||  | ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  11234846 ctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgtttttttttt-tcttagaaaattctccttctgatatcacttcagaagctgtttgagagt 11234944  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | | || || |||||||||||  | | |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||    
T  11234945 gcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatactgattccttccacaaa 11235043  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttc 848  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||      
T  11235044 ccggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatactatct-agtatgagact-- 11235140  T
Q  849 tcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  11235141 tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctca 11235213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 109; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 589 - 787
Target Start/End: Original strand, 18720101 - 18720297
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  18720101 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatactccttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 18720197  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18720198 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 18720297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 672 - 913
Target Start/End: Original strand, 17047052 - 17047297
Alignment:
Q  672 cagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagt 770  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||    
T  17047052 cagaattagatatgcagcggaataagaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagt 17047150  T
Q  771 cccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagc 864  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17047151 cccccttgcacttccaaggagattttcactaaaaaataatcacacagattacaactgctcaatactatc-aagtatgagacttctcaaa--tgctcaagc 17047247  T
Q  865 acacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |  ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  17047248 atgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 17047297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 589 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 12575968 - 12575773
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12575968 aattgtgttttctttttctcttaaaaaa-acttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 12575873  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12575872 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 12575773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 619 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 12953885 - 12953586
Alignment:
Q  619 cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaa 718  Q
    ||||||||||||   |||||||||| | ||| ||  ||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||| | | || || |||||||||||  |    
T  12953885 cttcttctgatatctcttcagaagctggttgagatagcttctgatgtgatgttcagaattggatatgcagcggaataaaacagagtagagaaaagaaaga 12953786  T
Q  719 taagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaaga 812  Q
     | ||||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||    
T  12953785 ga-gacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaga 12953687  T
Q  813 ttacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 911  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12953686 ttacaattgctcaatactatct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggctagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagaggcttc 12953590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 553 - 752
Target Start/End: Original strand, 11021309 - 11021509
Alignment:
Q  553 atctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggg 651  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11021309 atctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag 11021408  T
Q  652 aatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctcca 750  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11021409 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 11021507  T
Q  751 ca 752  Q
    ||    
T  11021508 ca 11021509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 589 - 753
Target Start/End: Original strand, 18576117 - 18576279
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  18576117 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 18576213  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18576214 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 18576279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 721 - 946
Target Start/End: Original strand, 25518201 - 25518431
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagatta 815  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    |||||||| ||||||    
T  25518201 agacacaaatagttatactggttccttccacaacccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttccactaaaaataatcacacagatta 25518300  T
Q  816 caaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcacta-agcaagagtcttctaa 914  Q
    ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25518301 caactgctcaatactaccta-gtatgagacttctcaaa--tgctcaagtacgcaggcaaaagactttcaatgctcaagcactacagcaagagtcttctaa 25518397  T
Q  915 tgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa 946  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  25518398 tgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaa 25518431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 556 - 899
Target Start/End: Original strand, 17063582 - 17063923
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||    |||||  ||||||||||||  ||||| |||| | || ||||||    
T  17063582 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttgtaaaatctttcttctgataactcttcataagctggttaggaatg 17063681  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||  |||  |||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  17063682 cttctgatg--atgttcagaattagatatgcagcggaataagaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcagttatcctggttccttccacaat 17063778  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact------ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagactt 847  Q
      |||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||      |||||| || ||||||||| || |||||||| || | |||||||||||    
T  17063779 ccggaagtagtcta----cccttgcacttccaaggagattttcactaaatcaataatctcacagattacaattgttcaatactatc-atgtatgagactt 17063873  T
Q  848 ctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa 899  Q
    |||  |||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17063874 ctc--aaatgctcaaacacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaa 17063923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 589 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 5521906 - 5521748
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  5521906 aattgtgttttctttttctcttaaaaa-tacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 5521811  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctcca 750  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5521810 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 5521748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 7586945 - 7586742
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||||  ||||    
T  7586945 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacactgatt 7586846  T
Q  815 acaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||      
T  7586845 acaactgctcaatactacct-agtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcct 7586749  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  7586748 atgctca 7586742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Original strand, 21127591 - 21127794
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  21127591 agacataagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 21127690  T
Q  815 acaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||      
T  21127691 acaactgctcaatactacct-agtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctacgctcaagcactaaagcaagagacttcct 21127787  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  21127788 atgctca 21127794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 733 - 826
Target Start/End: Original strand, 14757752 - 14757848
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14757752 ttatcatggttccttccacaattcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttttcactataatcacacaagattacaaatgctcaa 14757848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 589 - 796
Target Start/End: Original strand, 25678797 - 25679001
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||  ||||| |||||||| || | |  || ||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||    
T  25678797 aattgtgttttctttttctc--aaaaaaaagttctttcgataacacttcagaggcgggtaagggatgcttctgatgtgatgtttagaatcaaatatgcag 25678894  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    | ||| | | || || ||||| |||||  | | |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25678895 cagaataaaacagagtagagagaagaaagaga-gacacacgcaattatcctggttccttccacaaaccagaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 25678993  T
Q  789 gagatttc 796  Q
    ||||||||    
T  25678994 gagatttc 25679001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 589 - 773
Target Start/End: Original strand, 27720755 - 27720937
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||     ||||||||||| |||  || ||| ||||||||||    
T  27720755 aattgtgttttctttttctctttaaaaat-cttcttctgagattacttcagaagctgtttgaatgagcttctgatgtgatgttcaaaattagatatgcag 27720853  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtccc 773  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  || ||||| || ||||||| |||||||| |||||||   |||||||| ||||||||    
T  27720854 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagat-agacagaaacagttatactggttccttccacaatccggaagtagcccagtccc 27720937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 17609095 - 17608892
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagatta 815  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||    
T  17609095 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagattttcactaagtttaatcacacagatta 17608996  T
Q  816 caaatgctcaata-ctttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| | ||||||| |   |  ||||| |||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||      
T  17608995 caactactcaataccacacctagtataagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 17608899  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  17608898 atgctca 17608892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Original strand, 20635080 - 20635285
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agat 813  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||    
T  20635080 aagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgat 20635179  T
Q  814 tacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 911  Q
    ||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || ||||   |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  20635180 tacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaactgctcaagcacgcaggcaagagacttcatttgctcaagtactaaagcaagagacttc 20635276  T
Q  912 taatgctca 920  Q
      |||||||    
T  20635277 ctatgctca 20635285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 727 - 806
Target Start/End: Original strand, 15551392 - 15551471
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15551392 aagcaattatcctggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactaaaatca 15551471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 589 - 664
Target Start/End: Original strand, 33866530 - 33866607
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatg 664  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33866530 aattgtgttttctttttctctcttaaataatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatg 33866607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 710 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 18027483 - 18027387
Alignment:
Q  710 aaagaagaataagacaca-agcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    ||||||||  |||||||| |||| |||||||| || | |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18027483 aaagaagagaaagacacatagcaattatcctgatttcttccacaatctggaagtagtccagtctcccttgcacttctaaggagatttcactataatc 18027387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 19453312 - 19453107
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||     | ||||||| |||||    
T  19453312 agacacaagcaattataccggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtatttccaaggagatttccactaagaaaaaatcacacagatt 19453213  T
Q  815 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttct 912  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||   |||||||||||| ||||||||| ||||     
T  19453212 acaactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagatacttcttttgctcaagcactaaagcaagagacttcc 19453115  T
Q  913 aatgctca 920  Q
     |||||||    
T  19453114 tatgctca 19453107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 721 - 830
Target Start/End: Original strand, 21119169 - 21119284
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  21119169 agacacaagcaattatactggttccttccacatactggaagtagttcagtcccccttacacttctaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 21119268  T
Q  815 acaaatgctcaatact 830  Q
    |||| |||||||||||    
T  21119269 acaactgctcaatact 21119284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Original strand, 17927171 - 17927237
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17927171 ggttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 17927237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 619 - 715
Target Start/End: Original strand, 3390782 - 3390875
Alignment:
Q  619 cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3390782 cttcttctgataaaacttcagaagtagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 3390875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 720 - 800
Target Start/End: Original strand, 22386163 - 22386244
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 800  Q
    |||||||| ||| |||| |||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22386163 aagacacaggcaattatactggtttcttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacta 22386244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 854 - 956
Target Start/End: Original strand, 27503997 - 27504101
Alignment:
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    |||||||||||||  || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  27503997 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaa 27504095  T
Q  951 aataca 956  Q
    ||||||    
T  27504096 aataca 27504101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 589 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 9818055 - 9817970
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccaga 675  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||    
T  9818055 aattgtgttttctttttctctaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcaga 9817970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 3680479 - 3680552
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3680479 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 3680552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 800 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 19289950 - 19289837
Alignment:
Q  800 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-a 898  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| | || ||||| ||||||||||||| |    
T  19289950 ataatcacacatattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgctcaagcactaa 19289854  T
Q  899 agcaagagtcttctaat 915  Q
    || ||||| ||||||||    
T  19289853 aggaagagacttctaat 19289837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 665
Target Start/End: Original strand, 21127391 - 21127499
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||| || ||    
T  21127391 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctgaaaaaat-cttcttctgatatcactttagaagctgtttgagagtg 21127489  T
Q  656 cttctgatgt 665  Q
    ||||||||||    
T  21127490 cttctgatgt 21127499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 749 - 800
Target Start/End: Original strand, 19625198 - 19625249
Alignment:
Q  749 cacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19625198 cacaaactggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19625249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 806
Target Start/End: Original strand, 25929844 - 25929923
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||| |||| | |||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25929844 aagcaattatacaggttccttcaacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 25929923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 801
Target Start/End: Original strand, 13435251 - 13435325
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13435251 aagcaattatgcaggttccttccacaaaccggaagtagtcctttcccccttgcacttccaaggagagttcactat 13435325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 742 - 800
Target Start/End: Original strand, 18434919 - 18434977
Alignment:
Q  742 ttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18434919 ttccttccacaaatcggaagtactcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 18434977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 751
Target Start/End: Complemental strand, 19290118 - 19289957
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||    
T  19290118 aattgtgttttctttttctc--agaaaattcttcttctcatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcag 19290021  T
Q  689 cgga--aaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccac 751  Q
    ||||  ||| | || || ||||||||||| |   ||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  19290020 cggaataaaaaacagagtagagaaaagaa-acagagacacaagcaattatcatggttccttccac 19289957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 733 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 15478522 - 15478450
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 805  Q
    ||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15478522 ttatcttggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccc-ttgcacttccaaggagattttcactataatc 15478450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 747 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 20113400 - 20113347
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20113400 tccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 20113347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 556 - 665
Target Start/End: Original strand, 21118967 - 21119077
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaata-cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||  ||||||||||  ||||| || |    
T  21118967 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctgaaaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagttgtttgagagt 21119066  T
Q  655 gcttctgatgt 665  Q
    |||||||||||    
T  21119067 gcttctgatgt 21119077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 424
Target Start/End: Original strand, 2543735 - 2543802
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgt 424  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  2543735 ggataatacttgggtgacattgtggttggtgacattggtgacatt-accaaccacaatgttacaagtgt 2543802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 7587113 - 7587038
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||| || ||||||||||||    
T  7587113 aattgtgttttctttttctcaaaaaaaata-ttcttctgatatcacttcagaagttgtttgagagtgcttctgatgt 7587038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 900 - 985
Target Start/End: Original strand, 12353252 - 12353340
Alignment:
Q  900 gcaagagtcttctaatgctca-gcacgcaggca-gagtcttctgatcaa-caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| | |||||||||||||    
T  12353252 gcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaaagaattaagtttgaattgaacacttgat 12353340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 14101208 - 14101148
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14101208 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14101148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 806
Target Start/End: Original strand, 21034428 - 21034476
Alignment:
Q  758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21034428 gaagtagtccactcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 21034476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 24116206 - 24116266
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24116206 ggttccttccacaaaccagaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24116266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 24719485 - 24719437
Alignment:
Q  758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24719485 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24719437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 741 - 801
Target Start/End: Original strand, 29917407 - 29917467
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29917407 gttccttccacaaaccggaagtagtctagtccccgttgcacttccaaggagagttcactat 29917467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 555 - 671
Target Start/End: Original strand, 20634878 - 20634994
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    ||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||| |  ||||||||||| |||||  ||     
T  20634878 ctgaaggtgagaaaaacacaagaatggggggttgaattgtgttttctttttctcaagataaattcttcttctgagatcacttcagaagctgtttgaaaac 20634977  T
Q  655 gcttctgatgtaatgac 671  Q
    ||||||||||| |||||    
T  20634978 gcttctgatgtgatgac 20634994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 898 - 985
Target Start/End: Original strand, 4292420 - 4292510
Alignment:
Q  898 aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  4292420 aagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagcgaaatttttttgacttgaacacttgat 4292510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Original strand, 12347471 - 12347537
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  12347471 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtccccattgcacttccaaggaaagttcactaaaatca 12347537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 16193888 - 16193827
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193888 ggataatacttgggtgacattgtggttggt---------gacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 16193827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 18377821 - 18377883
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18377821 ggttccttccacaaaccggaagtcagtccggtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 18377883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 19482131 - 19482193
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19482131 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19482193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 21234538 - 21234600
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21234538 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 21234600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 854 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 25687266 - 25687204
Alignment:
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    |||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25687266 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaat 25687204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 854 - 920
Target Start/End: Original strand, 27474499 - 27474564
Alignment:
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |||||||||||||  || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27474499 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctca 27474564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 369580 - 369543
Alignment:
Q  354 atggataatacttgagtgacattgtggttggtaacatt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  369580 atggataatacttgagtgacattgtggttggtgacatt 369543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 16528689 - 16528750
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16528689 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16528750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 758 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 14883699 - 14883651
Alignment:
Q  758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14883699 gaagtagtctggtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 14883651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 15301594 - 15301654
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15301594 ggttccttccacaaaccagaagtagacctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15301654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 727 - 791
Target Start/End: Original strand, 19623345 - 19623409
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag 791  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19623345 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggag 19623409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 741 - 800
Target Start/End: Original strand, 21624471 - 21624531
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21624471 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21624531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 742 - 801
Target Start/End: Original strand, 22801521 - 22801581
Alignment:
Q  742 ttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22801521 ttccttccacaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcatttccaaggagatttcactat 22801581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 2543779 - 2543744
Alignment:
Q  492 aatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2543779 aatgtcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 2543744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 739 - 806
Target Start/End: Original strand, 7811387 - 7811454
Alignment:
Q  739 tggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  7811387 tggttccttccacaaaccggaagtagtccactcctcattgcacttataaggagatttcactaaaatca 7811454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Original strand, 12422622 - 12422705
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12422622 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcactcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 12422705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 747 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 17304035 - 17303976
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17304035 tccacaaaccggaagtagtcatgtctcccttgcacttccaaggagagttcactacaatca 17303976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 741 - 804
Target Start/End: Original strand, 19470047 - 19470110
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 804  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19470047 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtccccctagcacttctaaggagagttcactataat 19470110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 757 - 826
Target Start/End: Original strand, 30372752 - 30372823
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 826  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  30372752 ggaagtagtccaatcccacttgcatttccaaggagattttcactataattacacaaaattacaattgctcaa 30372823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 10631513 - 10631575
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10631513 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 10631575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 757 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 15395375 - 15395333
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcact 799  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15395375 ggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggagagttcact 15395333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 15954077 - 15954139
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15954077 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagatcactat 15954139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 17380956 - 17381018
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17380956 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaatgagagttcactat 17381018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 19952340 - 19952282
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 797  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19952340 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttca 19952282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 26588977 - 26589039
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26588977 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 26589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 712 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 31720354 - 31720245
Alignment:
Q  712 agaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca- 808  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||||||| ||||| || |  |||||  || ||||  ||||||||||||||||     
T  31720354 agaagaaagagacacaagcaattatcctggttcattccacaacctggaagtagttcagtctccttatcacttagaatgagatttttcactataatcacac 31720255  T
Q  809 aagattacaa 818  Q
    ||||||||||    
T  31720254 aagattacaa 31720245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 9717222 - 9717283
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||| | |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9717222 ggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagttcacta 9717283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 12716193 - 12716132
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12716193 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12716132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 14052152 - 14052099
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 792  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14052152 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 14052099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 757 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 18172974 - 18172925
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18172974 ggaagtagtcatgtcccgcttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18172925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 757 - 806
Target Start/End: Original strand, 18226827 - 18226876
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18226827 ggaagtagtcatgtcccgcttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18226876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 757 - 806
Target Start/End: Original strand, 19875235 - 19875284
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19875235 ggaagtagtcatgtccccctttcacttccaaggagagttcactaaaatca 19875284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 733 - 801
Target Start/End: Original strand, 21617618 - 21617687
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||| |||||||  ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21617618 ttatactggttcattccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttcaaaggagagttcactat 21617687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 760 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 21689580 - 21689533
Alignment:
Q  760 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21689580 agtagtccagtcccc-ttccacttccaagg-gatttcactataatcacaa 21689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 759 - 800
Target Start/End: Original strand, 25592020 - 25592061
Alignment:
Q  759 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25592020 aagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 25592061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 854 - 915
Target Start/End: Original strand, 27384115 - 27384175
Alignment:
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 915  Q
    |||||||||||||  || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27384115 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 27384175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 854 - 915
Target Start/End: Original strand, 27474528 - 27474588
Alignment:
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 915  Q
    |||||||||||||  || ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27474528 aatgctcaagcactaag-caagagacttctaatgctcaagcactaagcaagagacttctaat 27474588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 304; Significance: 1e-170; HSPs: 155)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 20442192 - 20441760
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20442192 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgagaatg 20442093  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20442092 cttctgatgtaatgataagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaagcaagacaaaagcagttatcctggttccttccacaaat 20441993  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20441992 cggaagtagtccactcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaa 20441893  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaa 952  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20441892 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttataatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 20441793  T
Q  953 tacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20441792 tacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 20441760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 18382779 - 18382347
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18382779 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaatatttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 18382680  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18382679 cttctgatgtaacgaccagaatcagatatgcagcggaaatgatcaaagcagagaaaataagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaat 18382580  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18382579 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaagagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaa 18382481  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa--caaaa 951  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||    
T  18382480 tgctcaagcacacatgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaa 18382381  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||  |||| |||||| |||||||||||||||    
T  18382380 atacagggaaacatgtttgacttgaacacttgat 18382347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 39586301 - 39586733
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaa-aatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  39586301 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttgaaaat 39586400  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||    
T  39586401 gcttttgatgtaatgaccataatcaaatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaaccagttatcctggttcattccataaa 39586500  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  39586501 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaa 39586599  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  39586600 atgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttttaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttatgatcaaacaaaa 39586699  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||| |||||||| |||| | |||||||||||||    
T  39586700 ataccatgaaataagtttgatttgaacacttgat 39586733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 555 - 985
Target Start/End: Original strand, 7677172 - 7677607
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||       || |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7677172 ctgaaggtgagaaaaacacaaaaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgagaa 7677271  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcct-ggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  7677272 tgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcattggttccttccaca 7677371  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7677372 aaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacgaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaa 7677471  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaa 949  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  7677472 aaatgctcaaacacacacgcaagagttttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttccaatgctcaagcacacaggcaagagtcttctgatcaaacaa 7677571  T
Q  950 aaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  7677572 aaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgat 7677607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 5973119 - 5973521
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5973119 aattgtgttttctttttctctctaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 5973218  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973219 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 5973318  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  5973319 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaa 5973418  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||    
T  5973419 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatgcaatgaattaagtttgacttgaacactt 5973518  T
Q  983 gat 985  Q
    |||    
T  5973519 gat 5973521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 4251413 - 4251008
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataata-cttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4251413 aattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 4251314  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4251313 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcatggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 4251214  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttct----caaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4251213 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctaaaaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 4251114  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  4251113 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaaca 4251014  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  4251013 cttgat 4251008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 555 - 956
Target Start/End: Original strand, 17956570 - 17956973
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    ||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17956570 ctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 17956667  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  17956668 gcttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcgagacacaaacagttatcctagttccttccacaaa 17956767  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17956768 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaa 17956867  T
Q  855 atgctc-aagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||| || ||||||    
T  17956868 atgctcaaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaaacactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgtaggcaagagacttctgttcaaacaaa 17956967  T
Q  951 aataca 956  Q
    ||||||    
T  17956968 aataca 17956973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 155135 - 154732
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc---ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  155135 aattgtgttttctttttctctaaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 155037  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  155036 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 154937  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcc 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  154936 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaaacacacacgcaagagtcttcc 154837  T
Q  884 aatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacac 980  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  154836 aatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacac 154737  T
Q  981 ttgat 985  Q
    |||||    
T  154736 ttgat 154732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 589 - 916
Target Start/End: Original strand, 47194567 - 47194894
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  47194567 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatatttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatgcttctgatgtaataatcagaatcagatatgcag 47194666  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47194667 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 47194766  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  47194767 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgc 47194865  T
Q  889 tcaagcac-taagcaagagtcttctaatg 916  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||    
T  47194866 tcaagcacataggcaagagtcttccaatg 47194894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 35012292 - 35012691
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  35012292 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatactttttctgataaaacttcataagcaatttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcag 35012390  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35012391 cggaaaggaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 35012490  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35012491 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 35012590  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  35012591 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 35012690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 39194942 - 39194537
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata---cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  39194942 aattgtgttttctttttctctttaaaaaaaaatcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 39194843  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccc-tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194842 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaaacagttatcctggttcccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 39194743  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  39194742 cagctagatttcactacaatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 39194643  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  39194642 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaaca 39194543  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  39194542 cttgat 39194537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 19178325 - 19178722
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  19178325 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 19178421  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19178422 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 19178521  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19178522 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 19178621  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  19178622 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 19178721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 7690305 - 7689903
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7690305 aattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 7690206  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    || ||||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7690205 cgaaaaagatcaaagcagagaaaatagaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 7690106  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa---aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7690105 gagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 7690006  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  7690005 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 7689906  T
Q  983 gat 985  Q
    |||    
T  7689905 gat 7689903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 4177281 - 4177678
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  4177281 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 4177377  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
     |||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177378 tggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 4177477  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4177478 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 4177577  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  4177578 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 4177677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 19187204 - 19187601
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  19187204 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatactttttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 19187300  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19187301 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 19187400  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19187401 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 19187500  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  19187501 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 19187600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 10998625 - 10998228
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  10998625 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 10998529  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10998528 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccggtcccccttgcacttccaa 10998429  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10998428 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 10998329  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  10998328 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 10998229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 12615157 - 12614760
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12615157 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 12615061  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12615060 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttccaa 12614961  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12614960 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 12614861  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  12614860 ctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 12614761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 35649534 - 35649135
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  35649534 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 35649438  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35649437 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 35649338  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35649337 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 35649238  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  35649237 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 35649138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 36247819 - 36247420
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  36247819 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 36247723  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36247722 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 36247623  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36247622 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 36247523  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  36247522 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 36247423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 38094440 - 38094839
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  38094440 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 38094536  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38094537 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 38094636  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  38094637 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 38094736  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  38094737 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 38094836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 38105065 - 38105464
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  38105065 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 38105161  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38105162 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 38105261  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  38105262 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 38105361  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  38105362 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 38105461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 33083927 - 33084325
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  33083927 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttatgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 33084023  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084024 cggaaaagaacagaacagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 33084123  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33084124 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 33084223  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| |||||||||||||    
T  33084224 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttg 33084323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 5651108 - 5650711
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  5651108 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaacttcttctgaaaaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 5651012  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5651011 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 5650912  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5650911 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 5650812  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  5650811 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 5650712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 12624622 - 12624225
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12624622 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaatcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 12624526  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12624525 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttccaa 12624426  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12624425 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 12624326  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  12624325 ctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 12624226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 23581137 - 23580816
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  23581137 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagattcagat-tgcag 23581041  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23581040 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 23580941  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23580940 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaatg 23580841  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttct 912  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  23580840 ctcaagcactaagcaagagacttct 23580816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 51657294 - 51656892
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  51657294 aattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaatcttcagaagcagactgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 51657195  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51657194 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 51657095  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51657094 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 51656995  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  51656994 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 51656895  T
Q  983 gat 985  Q
    |||    
T  51656894 gat 51656892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 21863024 - 21863424
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc---ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  21863024 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcacttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 21863120  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21863121 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21863220  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21863221 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 21863320  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  21863321 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 21863420  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  21863421 tgat 21863424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 12729913 - 12730310
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12729913 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgtttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 12730009  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12730010 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacgacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaa 12730109  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12730110 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 12730209  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  12730210 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 12730309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 12740506 - 12740903
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12740506 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgtttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 12740602  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12740603 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacgacacggaagtagttcagtcccccttgcacttccaa 12740702  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12740703 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 12740802  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  12740803 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 12740902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 35405235 - 35404836
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  35405235 aattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcag 35405138  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35405137 cggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 35405039  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35405038 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 35404939  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  35404938 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 35404839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 36237272 - 36236873
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  36237272 aattgtgttttctttttcaattaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 36237176  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36237175 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 36237076  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36237075 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 36236976  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  36236975 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 36236876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 51630065 - 51629631
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||  || || ||    
T  51630065 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaatcttcagaagcagactgagagtg 51629966  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  51629965 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 51629867  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa- 853  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||     
T  51629866 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatcaaagtatgagacttcacaaaa 51629767  T
Q  854 -aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaa 949  Q
     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||||    
T  51629766 caatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaa 51629667  T
Q  950 aaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  51629666 aaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 51629631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 5640552 - 5640154
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| || ||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  5640552 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaacttcttctgaaaaaacttcagaaacagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 5640456  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5640455 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 5640356  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5640355 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 5640256  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  5640255 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 5640156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 12898825 - 12898425
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc---ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  12898825 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcaccttgtg--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 12898729  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12898728 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 12898629  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12898628 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 12898529  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  12898528 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 12898429  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  12898428 tgat 12898425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 2537901 - 2538299
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  2537901 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 2537997  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2537998 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 2538097  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2538098 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 2538196  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  2538197 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 2538296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 21877129 - 21877530
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc---ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  21877129 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcacttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 21877225  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21877226 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagataaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttc 21877325  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21877326 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 21877425  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc--aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacac 980  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||    
T  21877426 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 21877525  T
Q  981 ttgat 985  Q
    |||||    
T  21877526 ttgat 21877530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 12944574 - 12944972
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  12944574 aattgtgttttctttttctct-aaaaaattcttcttctaataatacgtcagaagcaggttaggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcag 12944672  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    | ||| | | || ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12944673 cagaataaaacagagcagagaaaagaaaga-aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 12944771  T
Q  789 gagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||| |||||    
T  12944772 gagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatactcaagcacgcaggcaagagacttacaatg 12944870  T
Q  888 ctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||    
T  12944871 ctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgacttgaacacttg 12944970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 3170984 - 3171385
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3170984 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 3171083  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3171084 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 3171182  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3171183 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 3171281  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  3171282 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 3171381  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  3171382 tgat 3171385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 3181586 - 3181987
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3181586 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 3181685  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3181686 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 3181784  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3181785 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 3181883  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  3181884 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 3181983  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  3181984 tgat 3181987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 7506666 - 7507065
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  7506666 aattgtgttttctttttctcttaattaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 7506762  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7506763 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 7506862  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7506863 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 7506962  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  7506963 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 7507062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 7517263 - 7517662
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  7517263 aattgtgttttctttttctcttaattaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 7517359  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517360 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 7517459  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7517460 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 7517559  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  7517560 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 7517659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 47608775 - 47608375
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47608775 aattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagattgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 47608676  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47608675 cggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 47608577  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47608576 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 47608478  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  47608477 tgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 47608378  T
Q  983 gat 985  Q
    |||    
T  47608377 gat 47608375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 47619383 - 47618983
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47619383 aattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagattgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 47619284  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47619283 cggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 47619185  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  47619184 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 47619086  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  47619085 tgctcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 47618986  T
Q  983 gat 985  Q
    |||    
T  47618985 gat 47618983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 589 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 20196534 - 20196193
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  20196534 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctgattaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 20196437  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | |  | |||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20196436 cggaataaaatagagcagagaaaagaaaagtgagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 20196337  T
Q  789 gagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  20196336 gagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcgagagtcttccaatg 20196238  T
Q  888 ctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20196237 ctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 20196193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 35638878 - 35638538
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||  | ||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||    
T  35638878 aattgtgttttctttt-ctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcataatcagtttg--attgcttctgataaaatgatcagagtcagat-tgcag 35638783  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35638782 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttccacttccaa 35638683  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35638682 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 35638583  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  35638582 ctcaagcactaagcaagagacttctactgctcaagcacgcaggca 35638538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 5832583 - 5832981
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| |||||| | ||| |||| |||||| |||||    
T  5832583 aattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcag 5832679  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5832680 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 5832779  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5832780 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 5832878  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  5832879 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 5832978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 5843185 - 5843583
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| |||||| | ||| |||| |||||| |||||    
T  5843185 aattgtgttttctttttctgtctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgctcctgatgaagtgatcagagtcagat-tgcag 5843281  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5843282 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 5843381  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5843382 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 5843480  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  5843481 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 5843580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 163; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 590 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 11195908 - 11195512
Alignment:
Q  590 attgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagc 689  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| ||||  ||  |||||||||||| |||||    
T  11195908 attgtgttttctttttctct-aaaaaat-cttcttctgataacacttcagaagcagattaggaaagcttctaatgtggtgttcagaatcagatacgcagc 11195811  T
Q  690 ggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagg 789  Q
    ||| || | || |||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11195810 ggataaaa-cagagcagagaaaagaa-agcgagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagg 11195713  T
Q  790 aga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11195712 agattttcattaaaaatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatg 11195614  T
Q  888 ctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacactt 982  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||  || ||||||||||||  |||| |||||| || ||||||||||    
T  11195613 atcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcaagcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaa-atgtttgactttgaacactt 11195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 589 - 848
Target Start/End: Original strand, 16710199 - 16710456
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  16710199 aattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcag 16710296  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16710297 cggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 16710395  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttc 848  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16710396 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttc 16710456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 556 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 18311850 - 18311474
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   || ||  ||||||||| || ||||||||||||   ||| || ||    
T  18311850 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctttaagaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgagagtg 18311751  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| |||||||  |||| ||||||||     
T  18311750 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctaattccttccacaaac 18311652  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18311651 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacatattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aa 18311553  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18311552 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 18311474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 589 - 946
Target Start/End: Original strand, 674811 - 675168
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  674811 aattgtgttttctttttctcttaaaaaat-cttcttctggtattactttagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcag 674909  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  674910 cggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 675008  T
Q  789 gagattt-cac-tataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  675009 gagatttccacaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaat 675105  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa 946  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  675106 gctcaagcactaaagcaagagtcttctaacgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaa 675168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 767 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 148879 - 148657
Alignment:
Q  767 cagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctca-aaaatgctcaagca 865  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  148879 cagtcctccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaaatgctcaagca 148780  T
Q  866 cacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaa 962  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  148779 cacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaat 148680  T
Q  963 tatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    || |||| |||||||||||||||    
T  148679 taagtttgacttgaacacttgat 148657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 589 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 14388972 - 14388629
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||  ||||||||| || || ||||||||    ||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14388972 aattgtgttttctttttctctttaataaatcttcttctggtattaattcagaagttagttgagagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcag 14388873  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388872 cggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttcattccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 14388774  T
Q  789 gaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  14388773 gagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaat 14388675  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14388674 gctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 14388629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 152; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 589 - 946
Target Start/End: Complemental strand, 41133461 - 41133103
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| || ||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41133461 aattgtgttttctttttctcttaaataaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtacttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcag 41133362  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41133361 cggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgtacttccaag 41133263  T
Q  789 gagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |  | ||||||||    
T  41133262 gagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagggacttccaat 41133166  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa 946  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  41133165 gctcaagcactaaaacaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaa 41133103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 589 - 833
Target Start/End: Original strand, 4717497 - 4717739
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  4717497 aattgtgttttctttttctcttaaaagatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 4717593  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4717594 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 4717693  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttc 833  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4717694 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttc 4717739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 591 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 22610818 - 22610419
Alignment:
Q  591 ttgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcg 690  Q
    ||||||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  22610818 ttgtgttttctttttctc--aataaattcttcttctggtatcacttcagaaactggttgggaatgcttctgatgtgatgttcataatcagatatgcagcg 22610721  T
Q  691 gaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagg 789  Q
    ||| || | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22610720 gaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctcgttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagg 22610622  T
Q  790 agattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcc 883  Q
    |||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || |||||    
T  22610621 agatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactttct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcc 22610525  T
Q  884 aatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||| || ||||  ||||  ||||| |||||||||    
T  22610524 aatgctcaagcactaaagcaggagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaaca 22610425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 747 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 9051143 - 9050994
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagact 846  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9051143 tccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagact 9051044  T
Q  847 tctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac 896  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9051043 tctcaaaaatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcac 9050994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 132; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 589 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 36551378 - 36551159
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  36551378 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 36551282  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36551281 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 36551182  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaa 810  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36551181 ggagatttcactataatcacaaa 36551159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 554 - 809
Target Start/End: Original strand, 13223380 - 13223637
Alignment:
Q  554 tctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggg 651  Q
    |||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||  || |    
T  13223380 tctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaattcttcttctgataaatcttcagaagcagactgag 13223479  T
Q  652 aatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctcca 750  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13223480 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 13223578  T
Q  751 caaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13223579 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 13223637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 589 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 9750062 - 9749843
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9750062 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 9749963  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9749962 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 9749864  T
Q  787 aggagatttcactataatcac 807  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9749863 aggagatttcactataatcac 9749843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 589 - 809
Target Start/End: Original strand, 36099900 - 36100124
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc----aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    |||||||||||||||||||  |    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  36099900 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttatgatgaaatgatcagaatcagatat 36099999  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  36100000 gcagcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 36100098  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  36100099 ccaaggagatttcactataatcacaa 36100124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 46181698 - 46181367
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||  |||||| | ||||||||    
T  46181698 aattgtgttttctttttctcgtaaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaattatatatgcag 46181599  T
Q  689 cggaaaag-atcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagt-cccccttgcacttcca 786  Q
    ||||| || | || |||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46181598 cggaatagaaacagagcagagaaaagaa-agagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtccccccttgcacttcca 46181500  T
Q  787 aggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtct 880  Q
    ||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||| || ||    
T  46181499 aggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcatgcaagagact 46181403  T
Q  881 tccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  46181402 tccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 46181367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 589 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 24049342 - 24049120
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc----aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |    
T  24049342 aattgtgttttctttttctcttgtaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-t 24049246  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  24049245 gcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 24049146  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24049145 ccaaggagatttcactataatcacaa 24049120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 589 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 25218261 - 25218042
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||||| || ||| |||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  25218261 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcatatgataaaacttcaaaaacagattg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 25218165  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218164 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 25218065  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaa 810  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25218064 ggagatttcactataatcacaaa 25218042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 589 - 920
Target Start/End: Original strand, 5928938 - 5929271
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||  || |||| |||| ||||    
T  5928938 aattgtgttttctttttctcctaaaaaat-cttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgcttctgatgtgatgttcaaaatctgatacgcag 5929036  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || || ||||||||||| |   |||||||| || ||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5929037 cggaataaaaacagagtagagaaaagaa-agagagacacaaacaattatcctggtttcttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaa 5929135  T
Q  788 ggaga-tttcact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    ||||| |||||||     ||||||||| |||||| || |||||||||||  || ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| || |||    
T  5929136 ggagattttcactaagaaataatcacacagatta-aactgctcaatactacct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggcaagagactt 5929231  T
Q  882 ccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  5929232 ccaatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctca 5929271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 45071445 - 45071117
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |  || || |||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||    
T  45071445 aattgtgttttctttttctc--agaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggatgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcag 45071348  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || || ||||||||||| |   |||||||| || ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45071347 cggaataaaaacagagtagagaaaagaa-agagagacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 45071249  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||| ||||     ||||||||| | ||||||| |||||||||| | |  ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| | || |||    
T  45071248 ggagatttccactaagaaataatcacacaaattacaactgctcaatac-tacgtagtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggctagagactt 45071152  T
Q  882 ccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  45071151 cctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 45071117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 854 - 985
Target Start/End: Original strand, 47194891 - 47195025
Alignment:
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47194891 aatgatcaagcacataggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaa 47194990  T
Q  951 aatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  47194991 aatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 47195025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 563 - 752
Target Start/End: Original strand, 5234525 - 5234715
Alignment:
Q  563 gagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctg 661  Q
    ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5234525 gagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgatgaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctg 5234624  T
Q  662 atgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5234625 atgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 5234715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 589 - 753
Target Start/End: Original strand, 10256310 - 10256477
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc---aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    |||||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10256310 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaatccttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 10256409  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10256410 cagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 10256477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 589 - 742
Target Start/End: Original strand, 11958363 - 11958514
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  11958363 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 11958459  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggt 742  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  11958460 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggt 11958514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 834 - 985
Target Start/End: Original strand, 4166868 - 4167022
Alignment:
Q  834 taagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-a 931  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  4166868 taagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaa 4166967  T
Q  932 gagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  4166968 gagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 4167022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 589 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 19088034 - 19087872
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||    
T  19088034 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaccttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcag 19087938  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19087937 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 19087872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 721 - 913
Target Start/End: Original strand, 20251163 - 20251361
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  20251163 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagatttccactaacaaataatcacacagatt 20251262  T
Q  815 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttct 912  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20251263 acaactgctcaatactacacctagtatgagact--tcaaaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttct 20251360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 589 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 46687725 - 46687603
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  46687725 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 46687629  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaaga 714  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  46687628 cggaaaagaacagagcagagaaaaga 46687603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 589 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 23160906 - 23160800
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc---aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    |||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23160906 aattgtgttttctttttctctctaaaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatg 23160807  T
Q  686 cagcgga 692  Q
    |||||||    
T  23160806 cagcgga 23160800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Original strand, 23926421 - 23926626
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  23926421 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 23926520  T
Q  815 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttct 912  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||||||  || |||||||| || ||||||| || |||||  |||||||||||  | ||||||| ||||     
T  23926521 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttctc--aattgctcaaggacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacgcaggcaagagacttcc 23926618  T
Q  913 aatgctca 920  Q
    ||||||||    
T  23926619 aatgctca 23926626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Original strand, 34190108 - 34190231
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  34190108 aattgtgttttctttttctcttaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 34190204  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  34190205 cggaaaagaacagagcagagaaaagaa 34190231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 761 - 915
Target Start/End: Original strand, 28473660 - 28473818
Alignment:
Q  761 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||| ||||     
T  28473660 gtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa- 28473757  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
     ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28473758 -tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 28473818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 721 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 19171048 - 19170869
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  19171048 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagatt 19170949  T
Q  815 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac 896  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||    
T  19170948 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcac 19170869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 721 - 899
Target Start/End: Original strand, 22018690 - 22018872
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagatta 815  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||||| ||||||    
T  22018690 agacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggatattttcactaagtttaatcacacagatta 22018789  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa 899  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |  |||||  ||||||||||||||    
T  22018790 caactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagacacttcctttgctcaagcactaa 22018872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Original strand, 22642221 - 22642427
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agat 813  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||  |||    
T  22642221 aagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagagtttcactaagtttaatcacaactgat 22642320  T
Q  814 tacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 911  Q
    ||||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22642321 tacaactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactcaagcaagagacttc 22642418  T
Q  912 taatgctca 920  Q
      |||||||    
T  22642419 ctatgctca 22642427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Original strand, 28379352 - 28379557
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||     ||||||||| |||||    
T  28379352 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccattcccccttgcacttccaaggagattttcactaagtaataatcacacagatt 28379451  T
Q  815 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttct 912  Q
    |||| || ||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||     
T  28379452 acaactgttcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacacaaacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcc 28379549  T
Q  913 aatgctca 920  Q
     |||||||    
T  28379550 tatgctca 28379557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 654 - 796
Target Start/End: Original strand, 19037299 - 19037441
Alignment:
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||  || | || || |||||||||||  | | |||||||||| |||| |||||||| ||||||    
T  19037299 tgcttctgatgtattgttcagaatcagatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatactggttccttccaca 19037397  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 796  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19037398 aatcggaagtagtccagtccaccttgcacttccaaggagatttc 19037441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 26548979 - 26548775
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagatta 815  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||    ||||    
T  26548979 agacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcactcttatta 26548880  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||      
T  26548879 caactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcagtcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 26548782  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  26548781 atgctca 26548775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Original strand, 17370400 - 17370604
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatt 814  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||||    
T  17370400 agacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtcgagtccccattgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 17370499  T
Q  815 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttct 912  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||     
T  17370500 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcc 17370596  T
Q  913 aatgctca 920  Q
     |||||||    
T  17370597 tatgctca 17370604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 800 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 20884483 - 20884370
Alignment:
Q  800 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-a 898  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| | ||  |||||||||||||||||| |    
T  20884483 ataatcacacagattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttcccaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagaattccaatgctcaagcactaa 20884387  T
Q  899 agcaagagtcttctaat 915  Q
    |||||||| ||||||||    
T  20884386 agcaagagacttctaat 20884370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 589 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 24211286 - 24211201
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccaga 675  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||    
T  24211286 aattgtgttttctttttctctcaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gagtgcttctgatgaaatgatcaga 24211201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 853 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 19965828 - 19965761
Alignment:
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19965828 aaatgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaggagacttctaatgctca 19965761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 722 - 800
Target Start/End: Original strand, 21541164 - 21541243
Alignment:
Q  722 gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 800  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21541164 gacacatgcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacta 21541243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 721 - 796
Target Start/End: Original strand, 23058953 - 23059028
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 796  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23058953 agacacaagcaactatactggttccttccacaaaccggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagatttc 23059028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 733 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 23975558 - 23975486
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    ||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23975558 ttatcatggttccttccacaatccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagaagatttaactataatc 23975486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 805
Target Start/End: Original strand, 31358730 - 31358809
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 805  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31358730 aagcaattatcctggttccttccacaatctagaagtagtccaatcccccctgcacttccaaggagattttcactataatc 31358809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 742 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 22202434 - 22202376
Alignment:
Q  742 ttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22202434 ttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 22202376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 372 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 44291200 - 44291146
Alignment:
Q  372 acattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44291200 acattgtggttggttatattggtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 44291146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 2328137 - 2328076
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2328137 ggttccttccacaaattggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 2328076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 50754892 - 50754824
Alignment:
Q  355 tggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgt 424  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  50754892 tggataatacttgggtgacattgtggttggtgacattggtgacatt-atcaaccacaatgttacaagtgt 50754824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 423
Target Start/End: Original strand, 718988 - 719048
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtg 423  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  718988 acttgagtgacattgtggttggtgacattggcggcattggacaaccacaatgtcacaagtg 719048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 720 - 800
Target Start/End: Original strand, 7309176 - 7309256
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  7309176 aagacacaagcaattatataggttccttccacaaatcggaagtagtactgtcccccttgcacttctaaggagagttcacta 7309256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 722 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 34256238 - 34256035
Alignment:
Q  722 gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatt 814  Q
    |||||| ||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    |||||||||  ||||    
T  34256238 gacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaagtagagtttcactaagtttaatcacaactgatt 34256139  T
Q  815 acaaatgctcaatacttt-ctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttcta 913  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||  |||||||| |||||     
T  34256138 acaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcacacagcaagagacttctt 34256042  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  34256041 atgctca 34256035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 854 - 920
Target Start/End: Original strand, 47194861 - 47194928
Alignment:
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  47194861 aatgctcaagcacataggcaagagtcttccaatgatcaagcacataggcaagagtcttccaatgctca 47194928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 527
Target Start/End: Original strand, 6539664 - 6539718
Alignment:
Q  473 tgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6539664 tgtgacattgtggttgaccaatgtcaccaatatcatcaaccacaatgtcacccaa 6539718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 7745752 - 7745657
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 830  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  7745752 ggttccttccacaaaccggaagtagccatgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaaaaataatcacacagattacaattgctcaatact 7745657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 369 - 419
Target Start/End: Original strand, 9884844 - 9884894
Alignment:
Q  369 gtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcaca 419  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9884844 gtgacatagtggttggtgacattggtgacattggtcaaccacaatgtcaca 9884894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 370 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 10449601 - 10449552
Alignment:
Q  370 tgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaa 420  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10449601 tgacattgtggttggtgacatt-gtgacattggtcaaccacaatgtcacaa 10449552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 28045486 - 28045417
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||    
T  28045486 ggataatacttgggtgacattgtggttggtgacattggtgacatt-accaaccacaatgttacaagtgtac 28045417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 865
Target Start/End: Original strand, 44200443 - 44200549
Alignment:
Q  762 tagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     |||||||| ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||  ||| |||    
T  44200443 tagttcagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacct-agtatgagact--tcacaaa 44200539  T
Q  856 tgctcaagca 865  Q
    ||||||||||    
T  44200540 tgctcaagca 44200549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 721 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 52351335 - 52351269
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52351335 agacacaagcaattatactggttccttctacaaaccggaagtagtccagtcccccctgcacttccaa 52351269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 884 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 9051036 - 9050931
Alignment:
Q  884 aatgctcaagcactaag-caagagtcttctaatgctca-gcacgcaggca-gagtcttctgatcaa-caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||    
T  9051036 aatgctcaagcacacaggcaagagtcttccaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacagagaaatatttttgacttgaaca 9050937  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  9050936 cttgat 9050931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 727 - 805
Target Start/End: Original strand, 22639682 - 22639762
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatc 805  Q
    ||||| |||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  22639682 aagcaattatcctatttccttccacaacctggaagtagtccagttccccttgcacttcaaaggagatttttcactataatc 22639762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 363 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 6539720 - 6539664
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcaca 419  Q
    ||||| ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6539720 acttgggtgacattgtggttgatgatattggtgacattggtcaaccacaatgtcaca 6539664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 9885008 - 9884941
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgt 424  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  9885008 ggatgatacttgggtgatattgtggttggtgacattcgtgacatt-atcaaccacaatgttacaagtgt 9884941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 12283800 - 12283860
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12283800 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12283860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 12625255 - 12625195
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12625255 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 12625195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 22428040 - 22427980
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22428040 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22427980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 856 - 915
Target Start/End: Original strand, 23926591 - 23926651
Alignment:
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23926591 tgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 23926651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 52351502 - 52351426
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  52351502 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgacagtgcttctgatgt 52351426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 22601297 - 22601219
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22601297 aagcaattatacaggttccttccacaa-tcggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 22601219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 527
Target Start/End: Original strand, 10449529 - 10449606
Alignment:
Q  449 tgaaagagaacgaagaaaacgatttgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||||| |||||||   |||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10449529 tgaaagagaaagaagaaagatatttgtgacattgtggttgaccaatgtca-caatgtcaccaaccacaatgtcatccaa 10449606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 26702845 - 26702771
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26702845 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 26702771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 426
Target Start/End: Original strand, 44381908 - 44381978
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  44381908 ggataatatttgggtgacattgtggttggtgatattggtgacattgaccaaccacaatgttacacgtgtac 44381978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 44824461 - 44824399
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44824461 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 44824399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 47557429 - 47557359
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||||||||||  |||| |||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  47557429 ggataatacttaggtgaaattgcggttggtgacattggtgacattgatcaaccacaatatcgcaagtgtac 47557359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 757 - 806
Target Start/End: Original strand, 18614312 - 18614361
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18614312 ggaagtagtccactcccccttgaacttccaaggagaattcactaaaatca 18614361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 851 - 911
Target Start/End: Original strand, 19037499 - 19037560
Alignment:
Q  851 aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 911  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19037499 aaaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttc 19037560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 747 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 22465505 - 22465452
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22465505 tccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 22465452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 741 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 23037206 - 23037145
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23037206 gttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 23037145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 49200122 - 49200057
Alignment:
Q  360 aatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgta 425  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| | |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  49200122 aatacttaggtgacattgtggttggtgatattgatgacattgaccaaccacaatgtcacaagtgta 49200057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 836 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 52351252 - 52351174
Alignment:
Q  836 agtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  52351252 agtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggtaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 52351174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Original strand, 22018545 - 22018621
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22018545 aattgtgttttctttttctcaagataaaatcttcttctgagatcacttcagaagctgtttgagaatgcttctgatgt 22018621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 25449260 - 25449196
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 803  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25449260 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagcgttcactataa 25449196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Original strand, 1577224 - 1577307
Alignment:
Q  720 aagacaca-agcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||| |||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1577224 aagacacagagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcatttccaaggagagttcactat 1577307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 473 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 9884894 - 9884843
Alignment:
Q  473 tgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacc 524  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  9884894 tgtgacattgtggttgaccaatgtcaccaatgtcaccaaccactatgtcacc 9884843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 741 - 800
Target Start/End: Original strand, 10756803 - 10756862
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10756803 gttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 10756862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 21215399 - 21215316
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21215399 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggaattcactat 21215316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 22600901 - 22600826
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22600901 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22600826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 527
Target Start/End: Original strand, 28045442 - 28045477
Alignment:
Q  492 aatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28045442 aatgtcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 28045477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 28810091 - 28810060
Alignment:
Q  393 gtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgt 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28810091 gtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgt 28810060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 32786653 - 32786578
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32786653 aagcaattatacaggttccttccacaaactggaagtcaatcctgtctcccttgcacttccaaggagagttcactat 32786578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 527
Target Start/End: Original strand, 50754847 - 50754882
Alignment:
Q  492 aatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50754847 aatgtcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 50754882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 733 - 795
Target Start/End: Original strand, 8698265 - 8698327
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt 795  Q
    ||||||| ||||| |||||||    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8698265 ttatcctcgttccttccacaatccagaagtagtctagtccccattgcacttccaaggagattt 8698327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 473 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 9379871 - 9379817
Alignment:
Q  473 tgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||    
T  9379871 tgtgacattgtggttggccaatatcaccaatgtcaccaaccacgatatcacccaa 9379817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 10250367 - 10250429
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10250367 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 10250429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Original strand, 17017969 - 17018035
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| |||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  17017969 ggttccttccataaatcagaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcgctaaaatca 17018035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 750 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 17025656 - 17025614
Alignment:
Q  750 acaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 792  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17025656 acaaattagaagtagttctgtcccccttgcacttccaaggaga 17025614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 21121766 - 21121704
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21121766 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 21121704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 21192580 - 21192506
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| |||||||| || |||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21192580 aagcaattatactggttccttcaacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21192506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 21983974 - 21984036
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21983974 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 21984036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 22153220 - 22153294
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtag-tccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  22153220 aagcaattatacaggttccttccacaaactggaagtcggtcctgtccctcttgcacttccaaggagagttcacta 22153294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 720 - 798
Target Start/End: Original strand, 26702971 - 26703049
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcac 798  Q
    |||||||||||| |||| |  ||||| |||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  26702971 aagacacaagcaattatacaagttccttccacaatctggaagtagttctgtccctcttgcacttccaaagagagttcac 26703049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 38281763 - 38281825
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  38281763 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtccctcttgcacttccaaggagagttcactat 38281825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 42284019 - 42284081
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42284019 ggttccttccacaaactggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 42284081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 485 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 44381959 - 44381917
Alignment:
Q  485 gttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  44381959 gttggtcaatgtcaccaatatcaccaaccacaatgtcacccaa 44381917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 757 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 16233808 - 16233759
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  16233808 ggaagtagtcttgtcccccttgcgcttccaaggagagttcactaaaatca 16233759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 769 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 18130650 - 18130613
Alignment:
Q  769 gtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18130650 gtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18130613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 28492996 - 28492924
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  28492996 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctatcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 28492924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 302; Significance: 1e-169; HSPs: 120)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 18153150 - 18153583
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaa-aatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18153150 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgctttctttttctctcaaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagttttggaaa 18153249  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18153250 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaa 18153349  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18153350 tcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaa 18153448  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18153449 atgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 18153548  T
Q  952 a-tacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    | ||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  18153549 attacaggaaaatatgtttgacttgaacacttgat 18153583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 297; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 23470295 - 23469895
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaat-acttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23470295 aattgtgttttctttttctctctaaaaattacttcttctgataatacttcagaagcagtttgagaaagcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgca 23470196  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23470195 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 23470096  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  23470095 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 23469996  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  23469995 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttga 23469896  T
Q  985 t 985  Q
    |    
T  23469895 t 23469895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 19417797 - 19418198
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19417797 aattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaacttcaaaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 19417896  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19417897 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccctttgcacttccaa 19417996  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19417997 ggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 19418096  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19418097 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttg 19418196  T
Q  984 at 985  Q
    ||    
T  19418197 at 19418198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 40214000 - 40213602
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40214000 aattgtgttttctttttctct--aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaataaccagaatcagatatgcag 40213903  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
     ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213902 tggaaaagatcaaaacagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 40213803  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  40213802 gagatttcactataatcagaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacgcaggcaaaagtcttccaatgc 40213703  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca-atgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |  || |||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||    
T  40213702 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttatattcaaacaaaaatacagagaaaatatgtttgacttgaacacttga 40213603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 19428372 - 19428773
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19428372 aattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttcggataaaacttctgaagcaatttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 19428471  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19428472 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccctttgcacttccaa 19428571  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19428572 ggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 19428671  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19428672 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttg 19428771  T
Q  984 at 985  Q
    ||    
T  19428772 at 19428773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 19224378 - 19224780
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  19224378 aattgtgttttctttttctctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 19224477  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19224478 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaagggcaaagacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 19224577  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  19224578 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctttaagtatgagacttctcaaaaatgcttaagcacacacgcaagagtcttccaa 19224677  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  19224678 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacactt 19224777  T
Q  983 gat 985  Q
    |||    
T  19224778 gat 19224780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 16746412 - 16746846
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  16746412 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaa 16746511  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  16746512 tgcttccgatgaaattatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacaccagcagttattctggttccttccacaa 16746611  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16746612 aatggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagattttactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaa 16746711  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaa 950  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||| ||||||    
T  16746712 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcatgcaagactcttctgatcaaacaaa 16746811  T
Q  951 aatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  16746812 aatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgat 16746846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 30315535 - 30315130
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  30315535 aattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaactttagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 30315436  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30315435 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtactccagtcccccttgcacttccaa 30315336  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  30315335 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaagatgctcaagcacacacgcaagagtcttccgatg 30315236  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc------agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  30315235 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagataagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaaca 30315136  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  30315135 cttgat 30315130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 18157669 - 18158102
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  18157669 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttaggaaag 18157768  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  18157769 cttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaac 18157868  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  18157869 acggaagtagtccagtcccccttccacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaa 18157967  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  18157968 atgctcaagcacacaagcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatactcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaa 18158067  T
Q  952 a-tacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    | ||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  18158068 attacaggaaaatatgtttgacttgaacacttgat 18158102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 20162067 - 20161665
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  20162067 aattgtgttttctttttctctaaaaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 20161969  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20161968 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttc 20161869  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20161868 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 20161769  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  20161768 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacact 20161669  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  20161668 tgat 20161665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 623 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 18769937 - 18769571
Alignment:
Q  623 ttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataag 722  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  18769937 ttctgataatacttcagaagcagcttgggaatgcttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaag 18769838  T
Q  723 acacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgc 822  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||     
T  18769837 acacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcaatttcaaggagatttcaccataatcacaaagattaaaaatgt 18769738  T
Q  823 tcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-ag 921  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18769737 tcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacagacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaag 18769638  T
Q  922 cacgcaggc-agagtcttctgatcaa--caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18769637 cacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttgat 18769571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 31214425 - 31214858
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||    
T  31214425 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 31214524  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||||     
T  31214525 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacataagcagttatcctggttcattccacaac 31214624  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  31214625 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaa 31214724  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  31214725 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaa 31214824  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||| ||| || |||| |||| ||||||||||    
T  31214825 atacaaagaattaagtttgacttaaacacttgat 31214858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 6319387 - 6318950
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||    
T  6319387 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaat-cttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 6319289  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagag-----aaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctcc 749  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||     ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6319288 cttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcc 6319189  T
Q  750 acaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttct 849  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6319188 acaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttca 6319089  T
Q  850 caaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aa 946  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  6319088 caaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaa 6318989  T
Q  947 caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  6318988 caaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 6318950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 3220081 - 3220478
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  3220081 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 3220177  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3220178 cggaaaagaatagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 3220277  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3220278 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 3220377  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  3220378 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaaacacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 3220477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 26110680 - 26111077
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| | ||| |||| |||||| |||||    
T  26110680 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaactgatcagagtcagat-tgcag 26110776  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110777 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 26110876  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26110877 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 26110976  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  26110977 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 26111076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 43247774 - 43248171
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||| |||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  43247774 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttctgaagcagtttg--attgctcctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 43247870  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43247871 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 43247970  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43247971 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 43248070  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  43248071 ctcaagcactaagcaagagacttttaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 43248170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 19128195 - 19128594
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa--tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||    
T  19128195 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgc 19128291  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128292 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacagaagtagtccagtcccccttgcacttcc 19128391  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19128392 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 19128491  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  19128492 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacactt 19128591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 210986 - 210616
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  210986 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 210890  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210889 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 210790  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  210789 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 210690  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  210689 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 210616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Original strand, 241271 - 241641
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  241271 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 241367  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241368 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 241467  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  241468 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 241567  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  241568 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 241641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Original strand, 251856 - 252226
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  251856 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 251952  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  251953 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 252052  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  252053 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 252152  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  252153 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 252226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 724609 - 724239
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  724609 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 724513  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  724512 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 724413  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  724412 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 724313  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  724312 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 724239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Original strand, 794626 - 794996
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  794626 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 794722  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  794723 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 794822  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  794823 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 794922  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  794923 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 794996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 956
Target Start/End: Complemental strand, 849800 - 849430
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  849800 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 849704  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  849703 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 849604  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  849603 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 849504  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  849503 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 849430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 32089101 - 32088759
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  32089101 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 32089005  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32089004 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 32088905  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32088904 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 32088805  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  32088804 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 32088759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 13689401 - 13689002
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  13689401 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 13689305  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13689304 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaa 13689205  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13689204 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 13689105  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  13689104 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 13689005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 26120354 - 26120755
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  26120354 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 26120450  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120451 gcggaaaagaacaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 26120550  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa---tgctcaagcacacaggcaatagtcttcc 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  26120551 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaattgctcaagcacacacgcaagagtcttcc 26120650  T
Q  884 aatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacac 980  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||    
T  26120651 aatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacac 26120750  T
Q  981 ttgat 985  Q
    |||||    
T  26120751 ttgat 26120755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 32078528 - 32078186
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  32078528 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 32078432  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32078431 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcatggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 32078332  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  32078331 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 32078232  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  32078231 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 32078186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 556 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 23270805 - 23270531
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23270805 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcattttggaaatg 23270706  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23270705 cttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagtagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaat 23270606  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 830  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23270605 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 23270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 612 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 9857285 - 9856911
Alignment:
Q  612 aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaa 711  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  9857285 aaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaa 9857189  T
Q  712 agaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 810  Q
    ||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9857188 agaaggacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaa 9857089  T
Q  811 gattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtctt 910  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9857088 gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagactt 9856989  T
Q  911 ctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  9856988 ctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 9856911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 19138726 - 19139126
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctc---ccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  19138726 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 19138822  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19138823 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccaatcccccttgcacttc 19138922  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  19138923 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattctcaagcacacacgcaagagtcttcca 19139022  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  19139023 atgctcaagcgctaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacact 19139122  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  19139123 tgat 19139126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 29076179 - 29076577
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  29076179 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 29076275  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29076276 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 29076375  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29076376 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 29076474  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  29076475 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 29076574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 29086430 - 29086828
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  29086430 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 29086526  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29086527 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 29086626  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  29086627 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 29086725  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  29086726 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 29086825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 18448819 - 18449216
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||||    
T  18448819 aattgtgttttctttttcacttaaaaaatacttcttctgaaaaaactccagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcag 18448915  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448916 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccagaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 18449015  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  18449016 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgcgcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 18449115  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  18449116 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 18449215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 916
Target Start/End: Complemental strand, 13697512 - 13697185
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  13697512 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 13697416  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13697415 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaa 13697316  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13697315 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 13697216  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatg 916  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13697215 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatg 13697185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 36077382 - 36077783
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36077382 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 36077481  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077482 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 36077580  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36077581 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 36077679  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  36077680 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 36077779  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  36077780 tgat 36077783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 36087968 - 36088369
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36087968 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 36088067  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36088068 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 36088166  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36088167 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 36088265  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  36088266 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 36088365  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  36088366 tgat 36088369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 589 - 896
Target Start/End: Original strand, 20195429 - 20195739
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  20195429 aattgtgttttctttttctctcaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagaagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 20195527  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20195528 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttc 20195627  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  20195628 caaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcta 20195727  T
Q  885 atgctcaagcac 896  Q
    ||||||||||||    
T  20195728 atgctcaagcac 20195739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 611 - 956
Target Start/End: Original strand, 36292390 - 36292738
Alignment:
Q  611 aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaa 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  36292390 aaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaa 36292486  T
Q  711 aagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36292487 aagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 36292586  T
Q  810 agattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagt 907  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36292587 agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 36292686  T
Q  908 cttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  36292687 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 36292738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 611 - 956
Target Start/End: Original strand, 36302993 - 36303341
Alignment:
Q  611 aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaa 710  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  36302993 aaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaa 36303089  T
Q  711 aagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36303090 aagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 36303189  T
Q  810 agattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagt 907  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  36303190 agattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaga 36303289  T
Q  908 cttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaataca 956  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  36303290 cttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaataca 36303341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 556 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 26735844 - 26735573
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26735844 tgaaggtgagaaaaacacaagaagagggggttgaattgtgttttctttttctctcaataaatacttcttcttatattacttcagaagcagtttggaaatg 26735745  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  26735744 cttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaca 26735645  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat 827  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26735644 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaat 26735573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 3349460 - 3349061
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  3349460 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 3349364  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3349363 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 3349264  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3349263 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 3349165  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  3349164 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 3349065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 3360057 - 3359658
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  3360057 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 3359961  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359960 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 3359861  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3359860 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 3359762  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  3359761 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 3359662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 6150520 - 6150914
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataata-cttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  6150520 aattgtgttttctttttctc---aatattacttcttctgataaaaacttcagaagcagtttggt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 6150613  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaata-agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150614 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 6150713  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6150714 aggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 6150812  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  6150813 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 6150912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 6160475 - 6160869
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataata-cttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||    
T  6160475 aattgtgttttctttttctc---aatattacttcttctgataaaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgca 6160568  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaata-agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6160569 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 6160668  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6160669 aggagatttcactataatcacaa-gattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 6160767  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  6160768 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 6160867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 44480536 - 44480937
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  44480536 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 44480632  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44480633 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 44480732  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44480733 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 44480831  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  44480832 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 44480931  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  44480932 cttgat 44480937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 44491152 - 44491553
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  44491152 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 44491248  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44491249 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 44491348  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44491349 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 44491447  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  44491448 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 44491547  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  44491548 cttgat 44491553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 9340589 - 9340990
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  9340589 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9340685  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9340686 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacagtcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9340785  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9340786 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 9340884  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  9340885 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 9340984  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  9340985 cttgat 9340990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 9367733 - 9368134
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  9367733 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9367829  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9367830 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacagtcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9367929  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9367930 caaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttc 9368028  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  9368029 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 9368128  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  9368129 cttgat 9368134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 15792133 - 15791733
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||| |||    |||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  15792133 aattgtgttttcttttcctctttaaaaaaaaacttctactgataaaacaccagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgc 15792037  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15792036 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 15791937  T
Q  786 aaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  15791936 aaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttcca 15791837  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  15791836 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 15791737  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  15791736 tgat 15791733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 15781546 - 15781144
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc----aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatat 684  Q
    ||||||||||||||||||||      |||||| |||||| ||||||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |    
T  15781546 aattgtgttttctttttctctttaaaaaaaaaaacttctactgataaaacaccagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagacagat-t 15781450  T
Q  685 gcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcactt 783  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  15781449 gcagcggaaaagaacaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactt 15781350  T
Q  784 ccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15781349 ccaatgagatttcactataatcacaaagattgcaactgctcagtactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacaagcaagagtcttc 15781250  T
Q  883 caatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||    
T  15781249 caatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaaca 15781150  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  15781149 cttgat 15781144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 589 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 15999050 - 15998801
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  15999050 aattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctaatgaaatgatcagaatcagatatgta 15998951  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15998950 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttattctggttccttctacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 15998851  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaag 837  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15998850 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaag 15998801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 168; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 556 - 930
Target Start/End: Original strand, 3842937 - 3843310
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||    
T  3842937 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaat-cttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtg 3843035  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  3843036 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 3843134  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc--actataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  3843135 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccagaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagacttctc--a 3843231  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3843232 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 3843310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 589 - 839
Target Start/End: Original strand, 23290346 - 23290596
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaa-aaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23290346 aattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 23290445  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23290446 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 23290544  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagta 839  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23290545 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttcaaagta 23290596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 589 - 930
Target Start/End: Original strand, 23363576 - 23363920
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  23363576 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 23363673  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||  | | ||||||| || ||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23363674 cggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaatcaattatcctagttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 23363772  T
Q  788 ggagattt-cact----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    |||||||| ||||    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| | || ||||    
T  23363773 ggagatttccactaaaaataatcacacagattacaaatgttcaatactctcttagtatgagacttctc--aaatgctcaagcgcgcaggcgagagacttc 23363870  T
Q  883 caatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23363871 caatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 23363920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 22167893 - 22167458
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||  |||| |||||| | |||||| ||    
T  22167893 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggtttgaattgtgttttctttttctca-aaaaaattcttcttctggtatcactttagaagctggttgggagtg 22167795  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||| |||   ||||| ||||| ||||||||| || | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22167794 cttctgatgtgatgtttagaatgagataagcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 22167696  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttc 848  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22167695 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtatgagacttc 22167597  T
Q  849 tcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc- 944  Q
    ||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||     
T  22167596 tc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatca 22167499  T
Q  945 aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||| || ||||  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  22167498 aacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgat 22167458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 589 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 7019252 - 7018919
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  7019252 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagcatcagatatgcag 7019155  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||  | | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7019154 cggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccaatcccccttgcacttccaa 7019056  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||| ||||     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || |||    
T  7019055 ggagatttccactaagaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagactt 7018959  T
Q  882 ccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7018958 ccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctca 7018919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 20260445 - 20260053
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||       ||||||||||||    
T  20260445 aattgtgttttctttttctcttaaagaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctaatgtaatgt------tcagatatgcag 20260352  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || || |||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20260351 cggaataaaacagagtagagaaaagaaaga-aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 20260253  T
Q  789 gagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  20260252 gagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcagtactcact-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaat 20260156  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacact 981  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||||| || |||||||||    
T  20260155 gctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaaa-atgtttgactttgaacact 20260057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 21047075 - 21046683
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||       ||||||||||||    
T  21047075 aattgtgttttctttttctcttaaagaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctaatgtaatgt------tcagatatgcag 21046982  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || || |||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21046981 cggaataaaacagagtagagaaaagaaaga-aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 21046883  T
Q  789 gagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  21046882 gagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcagtactcact-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaat 21046786  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacact 981  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||  |||| |||||| || |||||||||    
T  21046785 gctcaagcactaaagcaagagtcttttaatgctcaagcatgcaggcgagaggcttctaatcaaacaaaattacacagaaa-atgtttgactttgaacact 21046687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 672 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 22136613 - 22136293
Alignment:
Q  672 cagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagt 770  Q
    |||||||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  22136613 cagaatcagataagcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagt 22136515  T
Q  771 cccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagc 864  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  22136514 cccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttctcaaa--tgctcaagc 22136418  T
Q  865 acacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatga 960  Q
    || ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||| |||| || ||||  ||    
T  22136417 acgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaatgctcaagcaggcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacaga 22136318  T
Q  961 aatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||  ||||| |||||||||||||||    
T  22136317 aaattgtttgacttgaacacttgat 22136293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 555 - 913
Target Start/End: Original strand, 19460406 - 19460767
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    ||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||| || |    
T  19460406 ctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaaaat-cttcttctgatatcactttagaagctgtttgagagt 19460504  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||||| |||  || |||| |||| ||||||||  || | || || |||||||||||  | | |||||||||| ||||| ||||||| | |||||    
T  19460505 gcttctgatgtgatgttcaaaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcttggttcctttcacaa 19460603  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagactt 847  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||     
T  19460604 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacct-agtatgagact- 19460701  T
Q  848 ctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  19460702 -tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttcta 19460767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 555 - 913
Target Start/End: Original strand, 19558084 - 19558445
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    ||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||| || |    
T  19558084 ctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaaaaaaaat-cttcttctgatatcactttagaagctgtttgagagt 19558182  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||||| |||  || |||| |||| ||||||||  || | || || |||||||||||  | | |||||||||| ||||| ||||||| | |||||    
T  19558183 gcttctgatgtgatgttcaaaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcttggttcctttcacaa 19558281  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagactt 847  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||  || |||||||||||     
T  19558282 accggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacct-agtatgagact- 19558379  T
Q  848 ctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
     ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  19558380 -tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactcgagcaagagacttcta 19558445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 22212197 - 22211869
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  | |||||||||    || || |||||||||| | |||  ||||||||||||||||     
T  22212197 aattgtgttttctttttctc--agaaaattcttcttctgatatcaattcagaagctaggtgagagtgcttctgatatgatgttcagaatcagatatgcaa 22212100  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || || ||||||||||| |   |||||||| || ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22212099 cggaataaaaacagagtagagaaaagaa-agagagacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccctttgcactttcaa 22212001  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||| |||| ||||| | || |||    
T  22212000 ggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctct-agtatgagacttccc--aaatgctcaggcacgcaggcgagagactt 22211904  T
Q  882 ccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  22211903 ccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 22211869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 589 - 777
Target Start/End: Original strand, 21547515 - 21547702
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata-cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  21547515 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 21547611  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtccccctt 777  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  21547612 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 21547702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 556 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 23272048 - 23271689
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||  ||||| ||||| ||||| || ||    
T  23272048 tgaaggtgagaaaaacacaagaacggggggttgaattgtgttttctttttctcagaaaaat--cttcttctgatatcacttccgaagctgtttgagagtg 23271951  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||| | |||  ||||||| |||| ||||||||  || | || || |||||||||||  | | ||||||| || |||  || ||||| ||||||||    
T  23271950 cttctgatatgatgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagaaaagaaagaga-gacacaaacaattaaactagttccttccacaaa 23271852  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttc 848  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| | |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  23271851 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactactcaatactaccta-gtatgagacttc 23271753  T
Q  849 tcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
     ||||  ||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23271752 acaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 23271689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 34275486 - 34275363
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  34275486 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 34275390  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  34275389 cggaaaagaacagagcagagaaaagaa 34275363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 723 - 913
Target Start/End: Original strand, 29378961 - 29379157
Alignment:
Q  723 acacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcaca-aagattac 816  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||  |||||||    
T  29378961 acacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacaccagattac 29379060  T
Q  817 aaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    || |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  29379061 aactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcta 29379157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 611 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 27392208 - 27392105
Alignment:
Q  611 aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaa 710  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  27392208 aaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaa 27392110  T
Q  711 aagaa 715  Q
    |||||    
T  27392109 aagaa 27392105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 556 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 17520022 - 17519675
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||  |||||    
T  17520022 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcaataaaaaatcttcttctgagatcacttcagaagctgtttaagaatg 17519923  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||| ||||||   |  ||||||  |||| ||||||||  || | || || ||||| |||||  | | |||||||||| |||| |||||||| |||| |||    
T  17519922 cttatgatgtgtagttcagaattggatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga-gacacaagcaattatactggttccttccaaaaa 17519824  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttc 848  Q
      ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||||| || ||||||||   |  |||||||||||      
T  17519823 ccggaagtagttcagttccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattacaactgatcaatactacacctagtatgagact-- 17519726  T
Q  849 tcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa 899  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  |||| |||||||||    
T  17519725 tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctaaagcactaa 17519675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 23580715 - 23580589
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  23580715 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gactgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 23580619  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23580618 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaa 23580589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 556 - 715
Target Start/End: Original strand, 23800829 - 23800987
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||| ||  |||||    
T  23800829 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggagttgaattgtgttttctttttctct-aaaaaattcttcttttgataacacttcagaaacaggttacgaatg 23800927  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||| || | |  | ||||||||||||||    
T  23800928 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcgaaataaaatagagcagagaaaagaa 23800987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Original strand, 40002577 - 40002783
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaa-agat 813  Q
    ||||||||| || |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||     | | |||||||||  |||    
T  40002577 aagacacaaacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttctaaggagagttccattaagtttaatcacaactgat 40002676  T
Q  814 tacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 911  Q
    ||||| |||||||||||   |  |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40002677 tacaactgctcaatactacacctagtatgagact--tcaaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 40002774  T
Q  912 taatgctca 920  Q
      |||||||    
T  40002775 ctatgctca 40002783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 721 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 15969595 - 15969520
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc 796  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15969595 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccggtcccccttgcacttccaaggagatttc 15969520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 724 - 915
Target Start/End: Original strand, 8031410 - 8031608
Alignment:
Q  724 cacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattaca 817  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||    
T  8031410 cacaagcaattatattggttccttccacgaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattaca 8031509  T
Q  818 aatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagca-ct-aagcaagagtcttctaa 914  Q
    | |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||  || || |||||  |||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  8031510 actgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcagaaaagagacttcctttgctcaagcagctaaagcaagagacttctaa 8031607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 728 - 805
Target Start/End: Original strand, 12541041 - 12541118
Alignment:
Q  728 agcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12541041 agcaattatcttggttccttccacaatccggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 12541118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 712 - 826
Target Start/End: Original strand, 17687363 - 17687479
Alignment:
Q  712 agaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca- 808  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||     
T  17687363 agaagaaagagacacaagcaattatcctggttccttacacaattcgga-gtagtcaagtctcccttgcacttccaaagagatttttcactataatcacat 17687461  T
Q  809 aagattacaaatgctcaa 826  Q
    |||||||||| |||||||    
T  17687462 aagattacaattgctcaa 17687479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 884 - 985
Target Start/End: Original strand, 20195697 - 20195802
Alignment:
Q  884 aatgctcaagcactaa-gcaagagtcttctaatgctca-gcacgcaggca-gagtcttctgatcaa-caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  20195697 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaaca 20195796  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  20195797 cttgat 20195802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 733 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 24498857 - 24498761
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt--cactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24498857 ttatcctggttccttccacaatccagaagtagtccagtcccccttgcatttcgaaggagattttccactataatcacacaagattacaattgctcaa 24498761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 854 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 7018956 - 7018878
Alignment:
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    |||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7018956 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 7018878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 830
Target Start/End: Original strand, 28902839 - 28902934
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagattacaaatgctcaatact 830  Q
    |||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28902839 ggttccttccacagatcggaagtagttcagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcacacagattacaactgctcaatact 28902934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 15934454 - 15934381
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15934454 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 15934381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 19706874 - 19706947
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19706874 aagcaattatacaggttccttccacaaatcgaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19706947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 24679180 - 24679101
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  24679180 aagcaattatacaggttccttccacaatctggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 24679101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 556 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 15969794 - 15969686
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||  |||||||||||  | || || ||    
T  15969794 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctc--aaaaaaaacttcttctgatatcacttcagaagc--tgtgagagtg 15969699  T
Q  656 cttctgatgtaat 668  Q
    |||||||||||||    
T  15969698 cttctgatgtaat 15969686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 19942594 - 19942667
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19942594 aagcaattatacaggttccttccacaaaccgaaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19942667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 26832434 - 26832507
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26832434 aagcaattatacaggttccttccacaaacaggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 26832507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 354 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31470915 - 31470842
Alignment:
Q  354 atggataatacttgag-tgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31470915 atggataatacttggggtgatattgtggttggtggtattggtgacattggccaaccacaatgtcacaagtgtac 31470842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 757 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 1210470 - 1210399
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  1210470 ggaagtagtcctgtccctcttgcacttccaaggagagttcactaaaatcagaatctgattacaaatgctcaa 1210399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 556 - 664
Target Start/End: Original strand, 8031204 - 8031313
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaata-cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  8031204 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctttaaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagt 8031303  T
Q  655 gcttctgatg 664  Q
    ||||||||||    
T  8031304 gcttctgatg 8031313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 826
Target Start/End: Original strand, 24634774 - 24634847
Alignment:
Q  758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca---aagattacaaatgctcaa 826  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  24634774 gaagtagtccagtctcccttgcccttccaaggagatttttcactataatcacacacaagattacaaattctcaa 24634847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 747 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 16376107 - 16376048
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16376107 tccacaaaccggaagtagtcatgacccccttgcacttccaaggagatttcactaaaatca 16376048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Original strand, 22673150 - 22673233
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22673150 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22673233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 30422180 - 30422117
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 802  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30422180 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactata 30422117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 472 - 527
Target Start/End: Original strand, 32857076 - 32857131
Alignment:
Q  472 ttgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32857076 ttgtgacattgtggttggcctatgtcatcaatgtcatcaaccacaatatcacccaa 32857131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 356 - 426
Target Start/End: Original strand, 16687512 - 16687582
Alignment:
Q  356 ggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  16687512 ggataatacttggatgacattgtggttggtgatattggtgacattagctaaccacaatgtcccaagtgtac 16687582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 758 - 800
Target Start/End: Original strand, 19153422 - 19153464
Alignment:
Q  758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19153422 gaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19153464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 20383130 - 20383060
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 797  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20383130 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagacttca 20383060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 364 - 422
Target Start/End: Original strand, 31470743 - 31470800
Alignment:
Q  364 cttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagt 422  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31470743 cttgggtgacattatggttggtaacatt-gtgacattgaccaaccacaatgtcacaagt 31470800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 43773491 - 43773553
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43773491 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 43773553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 757 - 806
Target Start/End: Original strand, 17928476 - 17928525
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17928476 ggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 17928525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 19957130 - 19957057
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19957130 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagccctatcccccttgcacttccaaggagagttcacta 19957057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 763 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 14990235 - 14990196
Alignment:
Q  763 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactata 802  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14990235 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactata 14990196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Original strand, 22662437 - 22662520
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||  | |||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22662437 aagacacaagcagtttatacaggttccttccacaaaccgtaagtcaatcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 22662520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 747 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 23192543 - 23192484
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||    
T  23192543 tccacaattcggaagtagtcctgtcccccttgcctttccaaggagaattcactaaaatca 23192484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 760 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 23433672 - 23433607
Alignment:
Q  760 agtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca-aagattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  23433672 agtagtccagttccc-ttgcacttccaagg-gatttcactataataacacatgattacaaatgctcaa 23433607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 762 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 33560971 - 33560932
Alignment:
Q  762 tagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33560971 tagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 33560932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 747 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 40846161 - 40846106
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40846161 tccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 40846106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 758 - 800
Target Start/End: Original strand, 18772081 - 18772123
Alignment:
Q  758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18772081 gaagtagtcctgtccccctcgcacttccaaggagagttcacta 18772123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 856 - 913
Target Start/End: Original strand, 21287924 - 21287982
Alignment:
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  21287924 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 21287982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 360 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 32857136 - 32857070
Alignment:
Q  360 aatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgtac 426  Q
    |||| ||| |||| |||||||||| | |||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  32857136 aatatttgggtgatattgtggttgatgacattgatgacataggccaaccacaatgtcacaagtgtac 32857070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 763 - 801
Target Start/End: Original strand, 43639177 - 43639215
Alignment:
Q  763 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43639177 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 43639215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 856 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 45568547 - 45568489
Alignment:
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45568547 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 45568489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 486 - 527
Target Start/End: Original strand, 5667195 - 5667236
Alignment:
Q  486 ttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  5667195 ttggccaatgtcaccaatgtcatcaaactctatgtcacccaa 5667236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 414
Target Start/End: Original strand, 5729228 - 5729285
Alignment:
Q  357 gataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatg 414  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  5729228 gataatacttacgtgacattgtggtttgtaatattggtgacattgatcaactacaatg 5729285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 757 - 806
Target Start/End: Original strand, 18557439 - 18557487
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  18557439 ggaagtagtccactcccc-ttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 18557487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 662
Target Start/End: Complemental strand, 22148405 - 22148333
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctga 662  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||  ||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  22148405 aattttgttttctttttctca-aaaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttgggagtgcttctga 22148333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 25163429 - 25163502
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| |||| |||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25163429 aagcaattatacaggttccttccataaaccggaagtagacttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 25163502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 642
Target Start/End: Original strand, 29378791 - 29378843
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaag 642  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  29378791 aattgtgttttcttttt-tcaaaaaaaatacttcttctgatatcacttcagaag 29378843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 29692683 - 29692744
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29692683 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 29692744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 472 - 525
Target Start/End: Original strand, 31470848 - 31470901
Alignment:
Q  472 ttgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcaccc 525  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  31470848 ttgtgacattgtggttggccaatgtcaccaataccaccaaccacaatatcaccc 31470901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 45539215 - 45539155
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45539215 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagatttcacta 45539155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 553 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 37610 - 37174
Alignment:
Q  553 atctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccca-aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggg 651  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  37610 atctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaatcagtttgtg 37511  T
Q  652 aatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccac 751  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37510 aatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccac 37411  T
Q  752 aaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctca 851  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37410 aaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctca 37311  T
Q  852 aaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aaca 948  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  37310 aaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctgatcaaaca 37211  T
Q  949 aaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  37210 aaaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgat 37174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 164)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 588633 - 589032
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  588633 aattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 588732  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  588733 cggaaatgatcaaagcatagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 588832  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||     
T  588833 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactatctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgt 588932  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  588933 tcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacaatgaattatgtttgacttgaacacttgat 589032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 15889208 - 15888809
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  15889208 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcaaaatcagatatgcag 15889109  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889108 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 15889009  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15889008 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 15888909  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  15888908 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaattagtttgacttgaacacttgat 15888809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 21770822 - 21770423
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||    
T  21770822 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgaaataatcagaatcaggtatgcag 21770723  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770722 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagatacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 21770623  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21770622 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 21770523  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21770522 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 21770423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 1367048 - 1367449
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataata-cttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  1367048 aattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 1367147  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367148 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaatggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 1367247  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  1367248 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 1367347  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  1367348 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacacttg 1367447  T
Q  984 at 985  Q
    ||    
T  1367448 at 1367449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 9169573 - 9170005
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  9169573 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtg 9169672  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  9169673 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaanatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaancagttatcctggttccttccacaaat 9169772  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9169773 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaa 9169872  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaa 952  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||    
T  9169873 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaa 9169972  T
Q  953 tacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  9169973 tacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 9170005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 31117390 - 31116991
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31117390 aattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 31117291  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31117290 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 31117191  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  31117190 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 31117091  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31117090 tcaagcaataagcaagagacttctaatgctcaagcgcgcaggcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 31116991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 591 - 985
Target Start/End: Original strand, 30048941 - 30049339
Alignment:
Q  591 ttgtgttttctttttctccca-aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagc 689  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  30048941 ttgtgttttctttttctctcttaaaaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagc 30049040  T
Q  690 ggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaagg 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30049041 ggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacgaaagtagtccagtcccccttgcacttccaagg 30049140  T
Q  790 agatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgct 889  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  30049141 agatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgct 30049240  T
Q  890 caagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  30049241 caagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcatgcaagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgat 30049339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 9159150 - 9159550
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9159150 aattgtgttttctttttctctctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 9159249  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9159250 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 9159349  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9159350 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgatcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 9159449  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  9159450 ctcaagcactaagcaagaggcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttga 9159549  T
Q  985 t 985  Q
    |    
T  9159550 t 9159550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 40055664 - 40055234
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40055664 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaataattcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 40055567  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40055566 cttctgatgtaataaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaat 40055467  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40055466 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaa 40055367  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaa 952  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||    
T  40055366 tgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaatagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgttcaaacaaaaa 40055267  T
Q  953 tacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||  |||| |  || | ||||||||||||||    
T  40055266 tacacagaaaaagtttgaccttgaacacttgat 40055234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 3165152 - 3165554
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  3165152 aattgtgttttctttttctctcaaaaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 3165250  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3165251 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 3165350  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3165351 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 3165450  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  3165451 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacact 3165550  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  3165551 tgat 3165554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 20490427 - 20490826
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  20490427 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcag 20490525  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20490526 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 20490625  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20490626 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 20490725  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||    
T  20490726 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgactcgaacacttga 20490825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 21003886 - 21003489
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  21003886 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcag 21003790  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21003789 cggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 21003690  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21003689 ggagatttcactataataacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 21003590  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  21003589 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 21003490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 237; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 589 - 896
Target Start/End: Complemental strand, 38594560 - 38594256
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38594560 aattgtgttttctttttctct--aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaataaccagaatcagatgtgcag 38594463  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38594462 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcgagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 38594363  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  38594362 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttctaatgc 38594264  T
Q  889 tcaagcac 896  Q
    ||||||||    
T  38594263 tcaagcac 38594256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 166317 - 166714
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  166317 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 166413  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166414 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 166513  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  166514 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 166613  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  166614 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 166713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 176909 - 177306
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  176909 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 177005  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177006 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 177105  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  177106 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 177205  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  177206 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 177305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 5684941 - 5685338
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  5684941 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 5685037  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5685038 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 5685137  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  5685138 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagatttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 5685237  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  5685238 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgcacaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 5685337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 6868103 - 6867706
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  6868103 aattgtgttttctttttctcctaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 6868007  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6868006 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaggacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 6867907  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6867906 ggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 6867807  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  6867806 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 6867707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 6878735 - 6878338
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  6878735 aattgtgttttctttttctcctaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 6878639  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataa-gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878638 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaggacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 6878539  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  6878538 ggagatttcactataatcacaaggattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 6878439  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  6878438 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttga 6878339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 9432686 - 9433083
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  9432686 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttaag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 9432782  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9432783 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 9432882  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9432883 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 9432982  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  9432983 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 9433082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 14746550 - 14746150
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| || |||||||    
T  14746550 aattgtgttttctttttctctctaaaaat-cttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaattagttatgcag 14746452  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746451 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 14746352  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctc-aagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  14746351 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaaagcacacacgcaagagtcttccaat 14746252  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| |||||||||||||    
T  14746251 gctcaaacactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagttttacttgaacacttg 14746152  T
Q  984 at 985  Q
    ||    
T  14746151 at 14746150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 20989076 - 20989472
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20989076 aattgtgttttctttttctctcaaaaa-tacttcttctgacaaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcag 20989171  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20989172 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 20989271  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20989272 ggagatttcactataatcacaaagattacagatgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 20989371  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  20989372 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcagacaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 20989471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 48711369 - 48710972
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  48711369 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 48711273  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48711272 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 48711173  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  48711172 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 48711073  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  48711072 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 48710973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 22099160 - 22099557
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  22099160 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 22099256  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099257 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 22099356  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  22099357 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacgcatgcaagagtcttccaatg 22099456  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  22099457 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 22099556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 26654203 - 26653806
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  26654203 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 26654107  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataag-acacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26654106 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaggacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 26654007  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26654006 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 26653907  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  26653906 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 26653807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 26700532 - 26700135
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  26700532 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 26700436  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataag-acacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26700435 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaggacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 26700336  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  26700335 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 26700236  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  26700235 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 26700136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 26294908 - 26294510
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  26294908 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 26294812  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294811 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 26294712  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  26294711 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 26294612  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  26294611 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 26294512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 468459 - 468062
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  468459 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 468363  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  468362 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttccaa 468263  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  468262 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatacttcctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 468163  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  468162 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 468063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 9443282 - 9443679
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  9443282 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcataagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 9443378  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9443379 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtacagtcccccttgcacttccaa 9443478  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  9443479 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacacaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 9443578  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcagg-cagagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||||||||||||||    
T  9443579 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggaaagagacttctgatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgacttgaacacttga 9443678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 22088545 - 22088942
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  22088545 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 22088641  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22088642 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 22088741  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||    
T  22088742 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcatgcatgcaagagtcttccaatg 22088841  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  22088842 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 22088941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 40042988 - 40042589
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  40042988 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 40042892  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40042891 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 40042792  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40042791 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 40042692  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  40042691 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 40042592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 40053537 - 40053138
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  40053537 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 40053441  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40053440 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 40053341  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40053340 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 40053241  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  40053240 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 40053141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 24931482 - 24931084
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  24931482 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 24931386  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24931385 cggaaaagaacagaacagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 24931286  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa-tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  24931285 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaattgctcaagcacacaagcaagagtcttccaat 24931186  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  24931185 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttg 24931086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 37343621 - 37344019
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  37343621 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 37343717  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37343718 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcatttcca 37343817  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  37343818 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 37343917  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  37343918 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgagttgaacacttg 37344017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17961604 - 17961205
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  17961604 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatactccttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 17961508  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961507 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 17961408  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc--aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17961407 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 17961308  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  17961307 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 17961208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 9084703 - 9085103
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaa---atacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  9084703 aattgtgttttctttttctcttaaaaagggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9084799  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9084800 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9084899  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9084900 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9084999  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  9085000 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 9085099  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  9085100 tgat 9085103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 9094417 - 9094817
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaa---atacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   || ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  9094417 aattgtgttttctttttctcttaaaaagggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 9094513  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9094514 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 9094613  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9094614 caaggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 9094713  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  9094714 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 9094813  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  9094814 tgat 9094817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17950998 - 17950599
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  17950998 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcaaaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 17950902  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17950901 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 17950802  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc--aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17950801 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 17950702  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  17950701 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcatgcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 17950602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 8627369 - 8627768
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  8627369 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 8627465  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8627466 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 8627565  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattaca-aatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8627566 ggagatttcactataatcacaaagattacatactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 8627665  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  8627666 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 8627765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 8616807 - 8617205
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  8616807 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 8616903  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8616904 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccagaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 8617003  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc-aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8617004 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaattctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 8617103  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||    
T  8617104 gctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaatcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttg 8617203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 2706493 - 2706093
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  2706493 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaatacttcttctgataaaacttcataagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 2706397  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2706396 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 2706297  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2706296 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 2706197  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  2706196 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 2706097  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  2706096 tgat 2706093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 24734173 - 24734572
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  24734173 aattgtgttttctttttctctaaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 24734269  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24734270 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 24734369  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24734370 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 24734469  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  24734470 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 24734569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 24744120 - 24744519
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  24744120 aattgtgttttctttttctctaaattaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 24744216  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744217 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 24744316  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  24744317 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttccaa 24744416  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  24744417 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 24744516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 11004567 - 11005004
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc----aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggg 651  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||  |    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  11004567 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctaaaaaaaaatccttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag 11004666  T
Q  652 aatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctcca 750  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11004667 agtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcaacggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttcca 11004765  T
Q  751 caaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc 850  Q
    |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11004766 caacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcac 11004864  T
Q  851 aaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-a 945  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |    
T  11004865 aaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaa 11004964  T
Q  946 acaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  11004965 acaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttgat 11005004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 26390977 - 26390577
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  26390977 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 26390881  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26390880 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 26390781  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26390780 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttcca 26390681  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  26390680 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 26390581  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  26390580 tgat 26390577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 26401619 - 26401219
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  26401619 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtt--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 26401523  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401522 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 26401423  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26401422 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacaagcaagagtcttcca 26401323  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  26401322 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 26401223  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  26401222 tgat 26401219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 1986958 - 1987359
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1986958 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 1987057  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987058 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 1987156  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1987157 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 1987255  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  1987256 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 1987355  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  1987356 tgat 1987359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 1997579 - 1997980
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1997579 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 1997678  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1997679 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 1997777  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  1997778 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 1997876  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  1997877 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 1997976  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  1997977 tgat 1997980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 42865245 - 42865646
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42865245 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 42865344  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42865345 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 42865443  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42865444 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 42865542  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  42865543 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 42865642  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  42865643 tgat 42865646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 42875871 - 42876272
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  42875871 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 42875970  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42875971 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 42876069  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  42876070 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 42876168  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  42876169 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 42876268  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  42876269 tgat 42876272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 2717097 - 2716697
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa-tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  2717097 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaatatttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgca 2717001  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2717000 gcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 2716901  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2716900 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 2716801  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  2716800 atggtcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcatgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 2716701  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  2716700 tgat 2716697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 589 - 896
Target Start/End: Original strand, 44279941 - 44280251
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  44279941 aattgtgttttctttttctctcaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagaagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tg 44280039  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  44280040 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcagaagtagtccagtcccccttgcacttc 44280139  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  44280140 caaggagatttaactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcta 44280239  T
Q  885 atgctcaagcac 896  Q
    ||||||||||||    
T  44280240 atgctcaagcac 44280251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 8002947 - 8002546
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaa-aaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8002947 aattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttcagataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 8002848  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8002847 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 8002749  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8002748 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 8002650  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  8002649 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 8002550  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  8002549 tgat 8002546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 8013592 - 8013191
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaa-aaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8013592 aattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttcagataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 8013493  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8013492 gcggaaa-gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 8013394  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8013393 aggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaacactatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 8013295  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | |||||||||    
T  8013294 atgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacact 8013195  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  8013194 tgat 8013191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 589 - 848
Target Start/End: Complemental strand, 25212732 - 25212471
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa--tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25212732 aattgtgttttttttttctctaaaaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 25212633  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25212632 agcagaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagtgagacacaaacagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 25212533  T
Q  787 aggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttc 848  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25212532 aggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactctctaagtatgagacttc 25212471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 589 - 896
Target Start/End: Original strand, 540535 - 540840
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  540535 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgag--tgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 540631  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  540632 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 540731  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  540732 ggagatttcgctataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 540831  T
Q  888 ctcaagcac 896  Q
    |||||||||    
T  540832 ctcaagcac 540840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 589 - 974
Target Start/End: Complemental strand, 17064408 - 17064021
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| || ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  17064408 aattgtgttttctttttctct-agaaaattcttcttctgaaaatactttagaagcaggttaggagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 17064310  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17064309 cggaataaaacagagcagagaaaagaaaga-aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccattcccccttgcacttccaag 17064211  T
Q  789 gagatttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  17064210 gagatttcactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaagcaagagtcttccaatg 17064112  T
Q  888 ctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaactt 974  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  17064111 ctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaaaatgtttgactt 17064021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 556 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 38404124 - 38403749
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||    
T  38404124 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct-aaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaagttaggaatg 38404026  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  38404025 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacatagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 38403927  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  38403926 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aa 38403828  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38403827 aatactcaagcacgcaggcaagagtcttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 38403749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 4222032 - 4222427
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| || ||| |||||    
T  4222032 aattgtgttttctttttctc---aatattacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtccgat-tgcag 4222125  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaata-agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  | | |||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4222126 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcccggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 4222225  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc--aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4222226 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 4222324  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  4222325 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 4222424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 589 - 946
Target Start/End: Original strand, 18440616 - 18440974
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  18440616 aattgtgttttctttttctct-aaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaattagatatgcag 18440714  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18440715 cggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 18440813  T
Q  789 gaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  18440814 gagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaat 18440911  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa 946  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  18440912 gctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaa 18440974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Original strand, 4211463 - 4211785
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | || |||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  4211463 aattgtgttttctttttctc---aatattacttcttctgataaaacttcagaatcagtttg--attgtttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 4211556  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaata-agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4211557 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacacagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 4211656  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc--aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4211657 ggagatttcactataatcac-aagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 4211755  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaat 915  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4211756 tgctcaagcactaagcaagagacttctaat 4211785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 589 - 930
Target Start/End: Original strand, 8932985 - 8933325
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  8932985 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 8933082  T
Q  689 cggaaa-agatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||  | | || | ||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8933083 cggaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 8933181  T
Q  788 ggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || |||||||    
T  8933182 ggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaa 8933278  T
Q  886 tgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8933279 tgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 8933325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 556 - 929
Target Start/End: Complemental strand, 26210460 - 26210088
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  26210460 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatg 26210363  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaa-agatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | | || | ||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  26210362 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaaagaaaacagaacagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 26210264  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatt-tcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||      
T  26210263 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattcccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctct-agtatgagacttctc-- 26210167  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcagg 929  Q
    |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26210166 aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcagg 26210088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Original strand, 48381606 - 48381950
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   || ||  ||||||||| || ||||||||||||   ||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48381606 aattgtgttttctttttctctttaagaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgagagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcag 48381705  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||| ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48381706 cggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctagttcctttcacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 48381804  T
Q  789 gaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||    
T  48381805 gagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcgagggacttccaat 48381903  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48381904 gctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggca 48381950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 157; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 589 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 457870 - 457618
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  457870 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 457774  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    || |||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  457773 cgaaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtaatccagtcccccttgcacttccaa 457674  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgag 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  457673 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgag 457618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 3477220 - 3476822
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||| || || ||||||||||||   ||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||    
T  3477220 aattgtgttttctttttctcttaaagaattcttcttttggtattacttcagaagctagttgggagggcttcttatgtaatgcacagaatcagatatgtag 3477121  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || || |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3477120 cggaataaaacagagtagagaaaagaaaga-aagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 3477022  T
Q  789 gaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  3477021 gagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaat 3476925  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| |||| || ||||  ||||  ||||| ||||||||||||    
T  3476924 gcttaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacactt 3476825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 589 - 930
Target Start/End: Original strand, 15215738 - 15216078
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15215738 aattttgttttctttttctc--aaaaaattcttcttctggtatcacttcagaagctagttgggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 15215835  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || || |||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15215836 cggaataaaacagagtagagaaaagaaaga-aggacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 15215934  T
Q  789 gaga-tttcact--ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    |||| ||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || |||||||    
T  15215935 gagattttaactaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaa 15216031  T
Q  886 tgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15216032 tgctaaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 15216078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 589 - 946
Target Start/End: Original strand, 13681742 - 13682098
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13681742 aattgtgttttctttttctcttaaaaatt-cttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcag 13681840  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    | ||| | | || |||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  13681841 cagaataaaacagagcagagaaaagaa-agagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccag-accccttgcacttcgaag 13681938  T
Q  789 gagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||    
T  13681939 gagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaat 13682035  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa 946  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  13682036 gctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctaatcaa 13682098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 556 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 19986435 - 19986159
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccca-aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||| ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |    
T  19986435 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggaggattgaattatgttttctttttctctcttaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtatgtaagt 19986336  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19986335 gcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 19986236  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 830  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19986235 cacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatact 19986159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 589 - 946
Target Start/End: Original strand, 29589414 - 29589770
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||  ||  ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  29589414 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctagtatcacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 29589511  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| |    ||| ||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29589512 cggaata----aaaacagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 29589606  T
Q  789 gagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttc 882  Q
    |||||||| ||||     |||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | || ||||    
T  29589607 gagatttccactaagaaataatcacacagatcacaaatgctcaatactatcta-gtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttc 29589703  T
Q  883 caatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa 946  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  29589704 caatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaa 29589770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 24883274 - 24882945
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||  || ||| ||||||||||    
T  24883274 aattgtgttttctttttctcgtaaaaatt-cttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcataattagatatgcag 24883176  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||  | | |||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24883175 cggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcccggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 24883077  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| || |||    
T  24883076 ggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggcaagagactt 24882980  T
Q  882 ccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  24882979 ccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 24882945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 127; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 650 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 12734984 - 12734703
Alignment:
Q  650 ggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaa-agatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctc 748  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||  | | || | ||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12734984 ggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagccgaatgaaaacagaacagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttc 12734886  T
Q  749 cacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagact 846  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12734885 cacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacaaagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagact 12734787  T
Q  847 tctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  12734786 tctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagattcttctaaggctcaagcacgcaggc 12734703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 733 - 946
Target Start/End: Original strand, 18418677 - 18418893
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 830  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18418677 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatact 18418776  T
Q  831 ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcag 928  Q
     ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18418777 ctcttagtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 18418874  T
Q  929 gc-agagtcttctgatcaa 946  Q
    || |||| ||||| |||||    
T  18418875 gcgagaggcttctaatcaa 18418893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 589 - 826
Target Start/End: Original strand, 11015217 - 11015463
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccca-aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  11015217 aattgtgttttctttttctctcttaaaaatacttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaattagatatgca 11015316  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagag-----aaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcac 781  Q
    |||||||||| || |||||||     ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||||||    
T  11015317 gcggaaaagaacagagcagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaatccggaagtagttcagttccccttgcac 11015416  T
Q  782 ttccaaggaga-tttcactataatcacaaa-gattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11015417 ttccaaggagattttcactataatcacaaatgattacaaatgctcaa 11015463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 589 - 828
Target Start/End: Original strand, 20967086 - 20967328
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata---cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |   ||| |||||||||  |||||||||||||||| || ||      ||| | ||| |||||| |||||||    
T  20967086 aattgtgttttctttttctctctaaaaaaaaatcttattctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg------atgaactgatcagaattagatatg 20967179  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagag-----aaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgc 779  Q
    |||||||||||| || |||||||     ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  20967180 cagcggaaaagaacagagcagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgc 20967279  T
Q  780 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaata 828  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20967280 acttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaata 20967328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 589 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 1251784 - 1251598
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  1251784 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 1251688  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtccccctt 777  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||    
T  1251687 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccctt 1251598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 555 - 788
Target Start/End: Original strand, 23643052 - 23643286
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaa-aaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||       || |||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  23643052 ctgaaggagagaaaaacgcaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctgtctagaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagag 23643151  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23643152 tgcttttgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaagacaatgacacaagcagttatcctggttccttccaca 23643250  T
Q  753 aattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23643251 acacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 23643286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 556 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 6170028 - 6169838
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| || ||    
T  6170028 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttctctctctaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgagtg 6169929  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttcc 745  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6169928 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttcc 6169838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 589 - 753
Target Start/End: Original strand, 1775553 - 1775718
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1775553 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 1775652  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1775653 gcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 1775718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 589 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 22499521 - 22499359
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  22499521 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 22499425  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22499424 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 22499359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 589 - 768
Target Start/End: Original strand, 12220245 - 12220422
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  12220245 aattgtattttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 12220341  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtcca 768  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||    
T  12220342 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtcca 12220422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 589 - 795
Target Start/End: Complemental strand, 6045161 - 6044957
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| | ||| ||||| || ||||||||||||   |||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||||||||    
T  6045161 aattgtgttttctttttctcttaaaaatt-cttattctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttcagatataatgttcagaatcagatatgcag 6045063  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6045062 cggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcatggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 6044964  T
Q  789 gagattt 795  Q
    |||||||    
T  6044963 gagattt 6044957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 589 - 743
Target Start/End: Original strand, 24072031 - 24072183
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  24072031 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 24072127  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggtt 743  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24072128 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggtt 24072183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 596 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 23304041 - 23303859
Alignment:
Q  596 ttttctttttctcccaaaaaata--cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa 693  Q
    ||||||||||||| | ||||| |  |||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23304041 ttttctttttctctctaaaaaaaatcttcttctgataaacctttagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaattagatatgcagcggaa 23303942  T
Q  694 aagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtccccc 775  Q
    ||||  | |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  23303941 aagaatagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtccccc 23303859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 589 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 45931049 - 45930884
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45931049 aattgtgttttctttttctgtctaaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagagtgagagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 45930950  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45930949 gcgg-aaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 45930884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 20327973 - 20327850
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  20327973 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 20327877  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  20327876 cggaaaagaacagagcagagaaaagaa 20327850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Original strand, 22392648 - 22392771
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  22392648 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 22392744  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  22392745 cggaaaagaacagagcagagaaaagaa 22392771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 22467921 - 22467798
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  22467921 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 22467825  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  22467824 cggaaaagaacagagcagagaaaagaa 22467798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 589 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 37556127 - 37556005
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  37556127 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 37556031  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaaga 714  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  37556030 cggaaaagaacagagcagagaaaaga 37556005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 839 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 455429 - 455336
Alignment:
Q  839 atgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  455429 atgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggca 455336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 8999694 - 8999489
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  8999694 agacacaagcaattatactgattccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 8999595  T
Q  815 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttct 912  Q
    |||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  8999594 acaactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagaaacttcaaatgctcaagcactaaagcaagagacttcc 8999497  T
Q  913 aatgctca 920  Q
     |||||||    
T  8999496 tatgctca 8999489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 723 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 13175362 - 13175160
Alignment:
Q  723 acacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cacta----taatcacaaagattaca 817  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||| ||||||||    
T  13175362 acacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacagattaca 13175263  T
Q  818 aatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    | |||||| ||||   |  ||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  ||    
T  13175262 actgctcagtactacacctagtctgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggctatagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctat 13175165  T
Q  916 gctca 920  Q
    |||||    
T  13175164 gctca 13175160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 721 - 911
Target Start/End: Complemental strand, 11087803 - 11087608
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-----actataatcacaaagatta 815  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     | | |||||||| ||||||    
T  11087803 agacacaagcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggcgatttccgctaagtttaatcacacagatta 11087704  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 911  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11087703 caactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 11087608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 725 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 1879018 - 1878923
Alignment:
Q  725 acaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatcaca-aagattacaa 818  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  1879018 acaagcaattatcctggttccttccacaattcggaagtagtccagccccccttgcacttccaaggagattttcactataatcacataagattacaa 1878923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 733 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 2501735 - 2501662
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 805  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2501735 ttatcctggttccttccataatttggaagtagtcaagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 2501662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 859 - 985
Target Start/End: Original strand, 11095744 - 11095873
Alignment:
Q  859 tcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatac 955  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||    
T  11095744 tcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttataatgctcaagcacgcaggcgagagacttgtaatcaaacaaaaatac 11095843  T
Q  956 aatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |  ||| |  |||| | |||||||||||||    
T  11095844 agagaattgagtttgaattgaacacttgat 11095873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 723 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 12223196 - 12223090
Alignment:
Q  723 acacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcaca-aagattacaaa 819  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||     
T  12223196 acacaagcaattatcctggtttcatccacaatccagaagtggtccagtcccccttgcacttctaaggagatttttcactataatcacacaagattacaat 12223097  T
Q  820 tgctcaa 826  Q
    |||||||    
T  12223096 tgctcaa 12223090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 733 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 11572949 - 11572876
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 805  Q
    ||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11572949 ttatcctggttccttccacattccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactataatc 11572876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 13259198 - 13259125
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13259198 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13259125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 13266538 - 13266465
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13266538 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13266465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 884 - 985
Target Start/End: Original strand, 44280209 - 44280314
Alignment:
Q  884 aatgctcaagcactaa-gcaagagtcttctaatgctca-gcacgcaggca-gagtcttctgatcaa-caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaaca 979  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  44280209 aatgctcaagcacacacgcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctaatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaaca 44280308  T
Q  980 cttgat 985  Q
    ||||||    
T  44280309 cttgat 44280314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 720 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 4433342 - 4433158
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 812  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||||||  ||    
T  4433342 aagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggaaagtttcactaagtttaatcacaactga 4433243  T
Q  813 ttacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa 899  Q
    ||||||||||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  4433242 ttacaaatgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 4433158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 739 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 7488687 - 7488620
Alignment:
Q  739 tggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  7488687 tggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttacacttccaaggagagttcactaaaatca 7488620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 741 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 13261397 - 13261338
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13261397 gttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13261338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 720 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 4412770 - 4412585
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt--agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-ag 811  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |    
T  4412770 aagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagttcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactg 4412671  T
Q  812 attacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa 899  Q
    ||||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  4412670 attacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 4412585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 728 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 15871832 - 15871754
Alignment:
Q  728 agcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataatc 805  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  15871832 agcaattatcctggttccttccacaatctggaagtagtccagtcccctttgtacttccaaggatattttcactataatc 15871754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 727 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 19711807 - 19711733
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19711807 aagcaattatactggttccttccataaaccagaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 19711733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 4820848 - 4820921
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4820848 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 4820921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 14187063 - 14187123
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14187063 ggttccttccacaaatcggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 14187123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 797
Target Start/End: Original strand, 11318766 - 11318837
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttca 797  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11318766 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttca 11318837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 30946141 - 30946079
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30946141 ggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 30946079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 831
Target Start/End: Original strand, 602139 - 602237
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcac----tataatcaca-aagattacaaatgctcaatactt 831  Q
    |||||| ||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  602139 ggttccttccacaaatcgaaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtataatcacacaagattacaactgctcaatactt 602237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 5001622 - 5001549
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5001622 aagcaattatacaggttccttccacaaatcgaaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 5001549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 720 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 16105732 - 16105624
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattaca 817  Q
    |||||||||||| |||| | |||||| |||||||   ||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |  ||||||||    
T  16105732 aagacacaagcaattatacaggttccttccacaatccggaagtagtcctgccctccttgcacttctaaggagagttcactaaaatcaatatcagattaca 16105633  T
Q  818 aatgctcaa 826  Q
    |||||||||    
T  16105632 aatgctcaa 16105624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 24787735 - 24787796
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24787735 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 24787796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 8999862 - 8999787
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||  | ||||||||||||    
T  8999862 aattgtgttttctttttctcttaaaaaat-cttcttctgatatcacttcagaagctgtttgacagtgcttctgatgt 8999787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 11792284 - 11792344
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11792284 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 11792344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16317337 - 16317278
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16317337 ggttccttccacaaacaggaagtagtcc-gtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16317278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 733 - 805
Target Start/End: Original strand, 25806797 - 25806869
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    ||||| ||||||| |||||||   |||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25806797 ttatcttggttccttccacaatccggaagtagtttagtccctcttgcacttccaacgagatttcactataatc 25806869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 29681941 - 29681893
Alignment:
Q  355 tggataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggt 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  29681941 tggataatacttgggtgacattgtggttggtgacattggtgacattggt 29681893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Original strand, 1292444 - 1292527
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1292444 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 1292527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 805
Target Start/End: Original strand, 16464385 - 16464461
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    ||||| |||| || ||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  16464385 aagcaattatactagttccttccataatctggaagtagtccagtcccccttgcaattccaaggaga--tcactataatc 16464461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 15087925 - 15087987
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15087925 ggttccttccacaaatcggaagtcagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcactat 15087987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 16308492 - 16308426
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  16308492 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatca 16308426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Original strand, 16411383 - 16411449
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16411383 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 16411449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 358 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 17272864 - 17272799
Alignment:
Q  358 ataatacttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgt 424  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  17272864 ataatacttgggtgacattgtggttggtgacattggtgacatt-accaaccacaatgttacaagtgt 17272799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 28623142 - 28623080
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28623142 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 28623080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 10883967 - 10883894
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| | ||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10883967 aagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 10883894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 12367533 - 12367460
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  12367533 aagcaattatacaggttccttccacaaactggaagtagttatgtcccccttgcacttccaaggaaagttcacta 12367460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 13302222 - 13302295
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13302222 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggatagttcacta 13302295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 13645812 - 13645885
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13645812 aagcaattatacaggttccttccacaaaccgtaagtagtcctgtcccccttgcacttccaagcagagttcacta 13645885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 363 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 24532854 - 24532794
Alignment:
Q  363 acttgagtgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcacaagtgt 424  Q
    ||||| || |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24532854 acttgggtaacattgtggttggtgacact-gtgacattgatcaaccacaatgtcacaagtgt 24532794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 490 - 527
Target Start/End: Original strand, 29681894 - 29681931
Alignment:
Q  490 ccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29681894 ccaatgtcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 29681931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 370 - 419
Target Start/End: Original strand, 35418177 - 35418226
Alignment:
Q  370 tgacattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcaca 419  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  35418177 tgacattgtggttgataacattgatgacattggtcaaccacaatatcaca 35418226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 758 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 10257828 - 10257765
Alignment:
Q  758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga--tttcactataatcac-aaagattacaa 818  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  10257828 gaagtagtccaaacccccttgcacttccaaggacatttttcactataatcacaaaagattacaa 10257765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 556 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 13175565 - 13175456
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||| ||||||||||| |  ||||||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||  || ||    
T  13175565 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtcttttctttttcccaaaaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttaagagtg 13175466  T
Q  656 cttctgatgt 665  Q
    ||||||||||    
T  13175465 cttctgatgt 13175456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 19237818 - 19237758
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19237818 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaatgagagttcacta 19237758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 29936128 - 29936069
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  29936128 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccc-ttgcacttccaaggagagttcacta 29936069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Original strand, 8182313 - 8182396
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8182313 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 8182396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 13138692 - 13138617
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13138692 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaacgagagttcactat 13138617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 747 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 13173124 - 13173065
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  13173124 tccacaatctggaagaagtccactcccccttgcacttccaaggatagttcactaaaatca 13173065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 801
Target Start/End: Original strand, 13879531 - 13879606
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13879531 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttctaaggagagttcactat 13879606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 527
Target Start/End: Original strand, 17272822 - 17272857
Alignment:
Q  492 aatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtcacccaa 527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17272822 aatgtcaccaatgtcaccaaccacaatgtcacccaa 17272857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 741 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 21211326 - 21211267
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21211326 gttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttgcaaggagagttcacta 21211267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 757 - 800
Target Start/End: Original strand, 21691752 - 21691795
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21691752 ggaagtagtcctgtcccccttgaacttccaaggagagttcacta 21691795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 757 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 41843190 - 41843147
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41843190 ggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 41843147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 419
Target Start/End: Original strand, 43499990 - 43500037
Alignment:
Q  372 acattgtggttggtaacattcgtgacattggtcaaccacaatgtcaca 419  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  43499990 acattgtggttggtgacattagtgatattggtcaatcacaatgtcaca 43500037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 2499424 - 2499498
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2499424 aagcatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgacccccttgcacttccaaggagagttcacta 2499498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 554 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 11088007 - 11087896
Alignment:
Q  554 tctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||||| ||||||||||||||||       || |||| |||||||||||||||   | |||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||  ||     
T  11088007 tctgaaggtgagaaaaacacaagaagagggggttgaattttgttttctttttctcaatataaaatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttaagag 11087908  T
Q  654 tgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||    
T  11087907 tgcttctgatgt 11087896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 14424891 - 14424953
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14424891 ggttccttccacaaactggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaagagagttcactat 14424953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 763 - 801
Target Start/End: Original strand, 15467316 - 15467354
Alignment:
Q  763 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15467316 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagaattcactat 15467354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 19340031 - 19339969
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19340031 ggttccttccacaaaccggaagttagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 19339969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 763 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 35954663 - 35954625
Alignment:
Q  763 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35954663 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 35954625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 44466455 - 44466529
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44466455 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 44466529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 48237623 - 48237561
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48237623 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagaattcactat 48237561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 720 - 803
Target Start/End: Original strand, 331004 - 331089
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataa 803  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  331004 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtccccctggcacttccaaggagagttcactataa 331089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 2914394 - 2914329
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataat 804  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2914394 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcactataat 2914329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 4493936 - 4494009
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| | ||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4493936 aagcaattatacaggttcctttcacaaaccggaagtattcctgtcccccttgcacttcaaaggagagttcacta 4494009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 13034621 - 13034560
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13034621 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctttcccccttgcacttccaaggagagttcacta 13034560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 747 - 800
Target Start/End: Original strand, 14425929 - 14425982
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  14425929 tccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaagaagagttcacta 14425982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16310703 - 16310630
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  16310703 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcaattccatggagagttcacta 16310630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16546118 - 16546057
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16546118 ggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16546057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 16619544 - 16619605
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16619544 ggttccttccacaaaccggaagttagccctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16619605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 763 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 21284133 - 21284096
Alignment:
Q  763 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21284133 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 21284096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 792
Target Start/End: Original strand, 33604268 - 33604333
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 792  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  33604268 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttccacttccaaggaga 33604333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 282; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 3059 - 2658
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3059 aattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgatagtacttcagaagcagtttgagaatgcttatgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 2960  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2959 cggaaaagattaaagcagagaaaagaaaggcaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 2860  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2859 ggagatttcactataatcacaaagattacaaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaat 2760  T
Q  887 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttg 983  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2759 gctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaagcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaaatatgtttgacttgaacacttg 2660  T
Q  984 at 985  Q
    ||    
T  2659 at 2658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 33741 - 33342
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33741 aattgtgttttctttttctctataaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 33642  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33641 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcatttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtccctcttgcacttccaag 33542  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgc 888  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  33541 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatacttaagcacacacgcaagagtcttccaatgc 33442  T
Q  889 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  33441 tcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggctagagtcttctgatcaaacaaaaatacaaagaaataagtttgacttgaacacttgat 33342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 41290 - 40893
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  41290 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 41194  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41193 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 41094  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41093 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgcttaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 40994  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  40993 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 40894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 13997 - 14399
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  13997 aattgtgttttctttttctctcaaaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaagtgatcagaatcagat-tg 14095  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14096 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 14195  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcca 884  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14196 caaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttcca 14295  T
Q  885 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacact 981  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  14296 atgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaagtttgacttgaacact 14395  T
Q  982 tgat 985  Q
    ||||    
T  14396 tgat 14399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 54962 - 54563
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  54962 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcag 54864  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54863 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 54764  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  54763 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 54664  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||    
T  54663 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctgatcaaacaaaaatacaatgaattaactttgacttgaacacttga 54564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 7756 - 7324
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  7756 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtattttctttttctctctaaaaattcttcttctaataaaacttcagaagcagtttgtgaatg 7657  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7656 cttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcaattatcctggttccttccacaaat 7557  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaa 855  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7556 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttgactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtaagagacttcacaaaaa 7457  T
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaa 952  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  7456 tgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaaa 7357  T
Q  953 tacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    ||||  ||| || |||| |||||||||||||||    
T  7356 tacagagaattaagtttgacttgaacacttgat 7324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 43396 - 42960
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  43396 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctaaaaattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtgagtg 43297  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  43296 cttctgatgaaattatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagag-aaagaaaagcaagacacaagcagttatcttggttccttccacaaaa 43198  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattac-aaatgctcaatactttctaagtatgagacttc----tc 850  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||          
T  43197 cggaagtagtccagtcccccttgcactttcaaggagatttcactataatcacaaagattacaaaacgcttaatactctctaagtatgagacttcaaaaaa 43098  T
Q  851 aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcagg-cagagtcttctgatc-aac 947  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||    
T  43097 aaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggccagaggcttctgatcaaac 42998  T
Q  948 aaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  42997 aaaaataccaagaaataagtttgacttgaacacttgat 42960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 30549 - 30948
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  30549 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 30645  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30646 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 30745  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa--aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30746 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaacaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 30845  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  30846 tgctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 30945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 26845 - 26720
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||  || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26845 aattgtgttttctttttctctcttaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagactgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcag 26746  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  26745 cgg-aaagaacagagcagagaaaagaa 26720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 2073 - 2506
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||  |||||||||||| ||| || ||    
T  2073 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcaaaaaattcttccactgataaaccttcagaagcagattgtgagtg 2172  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| | |||||     
T  2173 cttctgatgaaatgatcagagtcagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttattctggttccttgcacaac 2272  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  2273 acggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaccaagattacaaatgctcaatactttcaaagtatgagacttcacaaaa 2372  T
Q  855 atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaa 951  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  2373 atgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatgctcaagcactatgcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctgatcaaacaaaa 2472  T
Q  952 atacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||  ||| |  |||| |||||||||||||||    
T  2473 atacagagaattgagtttgacttgaacacttgat 2506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 589 - 874
Target Start/End: Complemental strand, 287 - 3
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  287 aattgtgttttctttttctctcaaaaaatacttcttctgatagtacttcagaagcagtttggaaatgcctctgatgtaatgatcagaatcagatatgcag 188  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  187 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaataataagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcaattccaag 88  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaa 874  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  87 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacataggcaa 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 28172 - 28098
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28172 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 28098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 7378 - 7777
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  7378 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 7474  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7475 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 7574  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7575 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 7674  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  7675 tgctcaagcactaagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 7774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 37797 - 37398
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  37797 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 37701  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37700 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 37601  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa--atgctcaagcacacaggcaatagtcttccaa 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37600 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaactatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaa 37501  T
Q  886 tgctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacactt 982  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||    
T  37500 tgctcaagcactaagcaagagacttctattgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacactt 37401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 11777 - 12173
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||    
T  11777 aattatgttttctttttctcttaaaaa-tacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagttagat-tgcag 11872  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11873 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 11972  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11973 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 12072  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttga 984  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| | ||||||||||||    
T  12073 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgctcaagcacgcaggcaagagacttctaatcaaacaaaaatacagagaattgagtttgaattgaacacttga 12172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 589 - 931
Target Start/End: Complemental strand, 7679 - 7338
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  7679 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcctttgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 7583  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7582 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcactttcaa 7483  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatg 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7482 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactgtctaagtatgagacttcacaaaaatgctcaagcacacacgcaagagtcttccaatg 7383  T
Q  888 ctcaagcactaagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  7382 ctcaagcactaagcaagagacttctaatgatcaagcacgcaggca 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 589 - 826
Target Start/End: Original strand, 100037 - 100272
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  100037 aattgtgttttgtttttctct--aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgatcagaatcagatatgcag 100134  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100135 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 100234  T
Q  789 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100235 gagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaa 100272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 723 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 476001 - 475799
Alignment:
Q  723 acacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattaca 817  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| | ||||||    
T  476001 acacaagcaattatactggttccttccacaaactggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacatattaca 475902  T
Q  818 aatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    | |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  ||    
T  475901 actgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctat 475804  T
Q  916 gctca 920  Q
    |||||    
T  475803 gctca 475799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 723 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 482521 - 482319
Alignment:
Q  723 acacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattaca 817  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| | ||||||    
T  482521 acacaagcaattatactggttccttccacaaactggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtttaatcacacatattaca 482422  T
Q  818 aatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    | |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| ||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||  ||    
T  482421 actgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcagacaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcctat 482324  T
Q  916 gctca 920  Q
    |||||    
T  482323 gctca 482319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 759 - 826
Target Start/End: Original strand, 111805 - 111874
Alignment:
Q  759 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  111805 aagtagtcctgtctcccttgtacttccaaggagagttcactaaaatcagaatctgattacaaatgctcaa 111874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 589 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 8908 - 8650
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8908 aattgtgttttctttttctctctaaaaatacttcttctgaaaaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttc-gatgaaatgatcagaatcagatatgcag 8810  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8809 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 8710  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagactt 847  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8709 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagactt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 181; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 12955 - 12557
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||| | ||||||||    
T  12955 aattctgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaattatatatgcag 12858  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12857 cggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 12759  T
Q  789 gaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaat 886  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12758 gagattttcactaagaatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcacgcaggcaagagtcttccaat 12660  T
Q  887 gctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacact 981  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||  |||| |||||| || |||||||||    
T  12659 gctcaaggactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcaagaggcttctattcaaacaaaaatacagagaaa-atgtttgactttgaacact 12561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 175; Significance: 1e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 555 - 985
Target Start/End: Original strand, 39886 - 40317
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    ||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || | |||    
T  39886 ctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttagaaat 39983  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39984 gcttctaatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 40082  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  40083 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-- 40180  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aaca 948  Q
    |||||||||||||| ||||| | || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||  || ||||    
T  40181 aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatactcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacacaggcaagaggcttctattcaaaca 40280  T
Q  949 aaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacacttgat 985  Q
    ||||||||  |||| |||||| || |||||||||||||    
T  40281 aaaatacagagaaa-atgtttgactttgaacacttgat 40317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 175; Significance: 1e-93; HSPs: 4)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 556 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 57656 - 57280
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  57656 tgaaggtgagaaaaacacaagaagagggggttgaattgtgttttctttttctct-aaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatg 57558  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
     ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  57557 tttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 57459  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  57458 ccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgatacttctc-a 57360  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa-gcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  57359 aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaatgcaagagtcttctaatgcacaagcacgcaggc 57280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 1141 - 935
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-aga 812  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  ||    
T  1141 aagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactga 1042  T
Q  813 ttacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtctt 910  Q
    |||||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| | ||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||  ||||||||| |||    
T  1041 ttacaactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattactcaagcacacagacaagagacttcctttgctcaagcacacaagcaagagactt 945  T
Q  911 ctaatgctca 920  Q
    |  |||||||    
T  944 cctatgctca 935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 31952 - 32026
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31952 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 32026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 48698 - 48772
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48698 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 48772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 173; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 4681 - 5111
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||    
T  4681 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcttaaaaaat-cttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtg 4779  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  4780 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaac 4878  T
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cac-tataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaa 853  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |    
T  4879 cggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccacaaataatcacacagattacaaatgctcaatactctct-agtatgagacttctc--a 4975  T
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaa 949  Q
    ||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || |||||    
T  4976 aatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagaggcttctattcaaacaa 5075  T
Q  950 aaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacacttgat 985  Q
    |||||||  |||| |||||| || |||||||||||||    
T  5076 aaatacacagaaa-atgtttgactttgaacacttgat 5111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 170; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 589 - 778
Target Start/End: Original strand, 7085 - 7274
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7085 aattgtgttttctttttctctaaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttttgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 7184  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttg 778  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7185 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttg 7274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 165; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 563 - 808
Target Start/End: Original strand, 1279 - 1524
Alignment:
Q  563 gagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctga 662  Q
    ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  1279 gagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctctataaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatgcttatga 1378  T
Q  663 tgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt 762  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  1379 tgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaaacggaagt 1478  T
Q  763 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1479 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaca 1524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1200 (Bit Score: 162; Significance: 6e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold1200
Description:

Target: scaffold1200; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 555 - 844
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 1
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    ||||||| | ||||||||||||||       || |||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| || |    
T  290 ctgaaggtgtgaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttcattatctctctaaaaatacttcttctgaagaaacttcagaagcagtttgtgagt 191  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  190 gcttctgatgaaataatcagaatcagat-tgcagcggaaaagaacagagcagagaaaataaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 92  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgaga 844  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  91 atcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactctctaagtatgaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 159; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 589 - 818
Target Start/End: Complemental strand, 4667 - 4437
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccca-aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  4667 aattgtgttttctttttctctcttaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgagaatgcttctgatgaaattatcagaatcagatatgca 4568  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4567 gcggaaaagatcaaagtagagaaaagaaaagcaagacacaaacagttatcatggttccttccacaaatcggaaatagtccagtcccccttgcacttccaa 4468  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaa 818  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4467 ggagatttcactataatcacaaagattacaa 4437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 156; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 589 - 854
Target Start/End: Original strand, 23190 - 23453
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  23190 aattgtgttttctttttctcttaattaaaacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 23286  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23287 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaacacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 23386  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaa 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23387 ggagatttcactataatcacaaagattacaactgctcaatactttctaagtatgagacttcacaaaa 23453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 556 - 985
Target Start/End: Original strand, 15112 - 15543
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||| ||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  15112 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattttgttttcttcttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatg 15209  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaa-agatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||  | | || | ||||||||||||  | |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  15210 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcaacggaatgaaaacagaacagagaaaagaaaga-aagacacaagcaattattctggttccttccacaaa 15308  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||      
T  15309 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacagatgctcaatactctcttagtatgagacttctc-- 15406  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatc-aaca 948  Q
    ||||||| |||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  15407 aaatgctgaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatggtcaagcacgcaggcgagaggcttctgatcaaaca 15506  T
Q  949 aaaatacaatgaaatatgtttaac-ttgaacacttgat 985  Q
    ||| ||||  |||| |||||| || |||||||||||||    
T  15507 aaattacacagaaa-atgtttgactttgaacacttgat 15543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 150; Significance: 9e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 556 - 930
Target Start/End: Original strand, 15984 - 16363
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||    ||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  15984 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggggcttgaattgtgttttctttttctctttgaaaaatcttcttctgatattacttcagaagctgattgggagtg 16083  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | || |  | ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16084 cttctgatgtaatgttcagaatcagatatgcagcggcataaaaatagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaa 16182  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttct 849  Q
      |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16183 ccggaactagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaagataatcacacagattacaaatgctcaatactctcttagtatgagacttct 16282  T
Q  850 caaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc 930  Q
    |  |||||||||||| | ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16283 c--aaatgctcaagcgcgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggc 16363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 612 - 931
Target Start/End: Original strand, 127080 - 127406
Alignment:
Q  612 aaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa--aagatcaaagcagaga 709  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  || | || |  |||||    
T  127080 aaaaattcttcttctgataacacttcagaagctggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcggaataaaaaacagattagaga 127179  T
Q  710 aaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taa 803  Q
     |||||  | | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||    
T  127180 gaagaaagaga-gacacgagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataa 127278  T
Q  804 tcacaaagattacaaatgctcaatacttt-ctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagc 901  Q
    || || ||||||||| |||||||||||   |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||||    
T  127279 tc-cacagattacaactgctcaatactacacctagtatgagacttctcaaa--tgctcaagcacacaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagc 127375  T
Q  902 aagagtcttctaatgctc-agcacgcaggca 931  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  127376 aagagtcttctaatgctcaagcacgcaggca 127406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 589 - 946
Target Start/End: Original strand, 34952 - 35313
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||   ||| ||  ||||||||| || ||||||||||||   |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34952 aattgtgttttctttttcttttaaagaaatcttcttctggtattacttcagaagctagttgggagtgcttttgatgtaatgttcagaatcagatatgcag 35051  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35052 cggaataaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccagaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 35150  T
Q  789 gagatttc-act----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttcc 883  Q
    |||||||| |||    ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || |||||    
T  35151 gagatttctactaaaaataatcacacagattacaaatgttcaatactctct-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcc 35247  T
Q  884 aatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgatcaa 946  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  35248 aatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcaggcgagagacttctaatcaa 35313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1409 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold1409
Description:

Target: scaffold1409; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 589 - 817
Target Start/End: Original strand, 1630 - 1856
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  1630 aattgtgttttcttttactctcaaaaattacttcttctgataaaacttcagaagcagcttgag--tgcttctgatgaaatgatcagaatcagat-tgcag 1726  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1727 cggaaaagaacagagaagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 1826  T
Q  788 ggagatttcactataatcacaaagattaca 817  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1827 ggagatttcactataatcacaaagattaca 1856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 589 - 784
Target Start/End: Original strand, 21233 - 21430
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataata-cttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21233 aattgtgttttctttttctctctaaaaaatacttcttctgataaaaacttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgc 21332  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21333 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagcagttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcacttc 21430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 5)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 589 - 866
Target Start/End: Original strand, 174799 - 175074
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  174799 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttccgataacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 174896  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 788  Q
    ||||| | | || ||||||| ||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174897 cggaataaaacagagcagaggaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaag 174995  T
Q  789 gaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcac 866  Q
    |||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  174996 gagattttcactaaaaatcacacagattacaaatgctcaatactctctaagtatgagacttctc-aaaatgctcaagcac 175074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 59608 - 59405
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagatt 814  Q
    |||||||| || |||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| |||||    
T  59608 agacacaaacaattatactggttccttccacaaaccagaagtagtccagtctcccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 59509  T
Q  815 acaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||      
T  59508 acaaatgctcaatactaccta-gtatgagacttcacaaa--tgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 59412  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  59411 atgctca 59405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 721 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 41064 - 40859
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  41064 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 40965  T
Q  815 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttct 912  Q
    |||| ||||||||| |   |  |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||| || |||||  |||||||||| | ||||||||| ||||     
T  40964 acaactgctcaatattacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgtaggcaagagacttcctttgctcaagcaataaagcaagagacttcc 40867  T
Q  913 aatgctca 920  Q
     |||||||    
T  40866 tatgctca 40859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 556 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 41263 - 41156
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||  |||| ||| || ||||| || ||    
T  41263 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctc--aaaaaaatcttcttctgatatcactttagaggctgtttgagagtg 41166  T
Q  656 cttctgatgt 665  Q
    ||||||||||    
T  41165 cttctgatgt 41156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 59774 - 59700
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  59774 aattgtgttttctttttctcagaaaaat--cttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtgcttctgatgt 59700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 556 - 918
Target Start/End: Complemental strand, 363 - 1
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | | || ||| ||    
T  363 tgaaggtgagaaaaacacaagaaggggaggttgaattgtgttttctttttcttt-aaaaaattcttcttctgataacacttcagaaactggttaggattg 265  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| || | || || ||||| |||||  | | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  264 cttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagtggaataaaaacagagtagagagaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttctttccacaaa 166  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaa 852  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||     
T  165 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatctcacagattacaaatgttcaatactctctaagtatgagact--tcac 68  T
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgct 918  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  67 aaatgctcaagcacgcaggcaagagacttccaatgctcaagcactaaaacaagagtcttctaatgct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 589 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 2556 - 2227
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||  |||||||||| |  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||   |  ||||||  ||||  |||    
T  2556 aattgtgttttctttttctcaataaaaaatcttcttctgagatcacttcagaagctgtttaagaatgcttctgatgtgtagttcagaattggatacacag 2457  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||  || | || || ||||| |||||  | | ||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2456 cggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga-gacacaaacaattatactggttccttccacaaatcggaagtagtccagtctcccttgcacttccaa 2358  T
Q  788 ggagatttc-acta----taatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    ||||||||| ||||    ||||||||  |||||||| |||||||||||   |  |||||||||||  ||| |||||||||||||  || |||| || |||    
T  2357 ggagatttccactaagtttaatcacactgattacaactgctcaatactacacctagtatgagact--tcacaaatgctcaagcatgcatgcaagagactt 2260  T
Q  882 ccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2259 cctttgctcaagcactaaagcaagaggcttcta 2227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 637 - 985
Target Start/End: Original strand, 18668 - 19039
Alignment:
Q  637 cagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaaga-tcaaagcagagaaaagaagaat--aagacacaagc-ag 732  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||   ||||||||||| ||    
T  18668 cagaagcagtttgtgagtgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgcagcggaaaagaatcaaagtagagaaaaagaaaagcaaagacacaagcgag 18767  T
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtcc-agtcccc-cttgcacttccaaggagatttcactataatc-acaaagatta--caaatgctc-aa 826  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||    
T  18768 ttatcctggttccttccacaaatcggaagtagtcccagtccccccttgcacttccaaggagatttcactataatcaacaaagattaacaaaatgctctaa 18867  T
Q  827 tactttctaagtatgagacttctcaaaa---atgctcaagcacacaggcaatagtcttcc--aatgctcaagc-actaag-caagagtcttctaat-gct 918  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  18868 tactctctaagtatgagatttctcaaaaattatgctcaagcacacacgcaagagtcttcccaaatgctcaagcaactaagacaagagtcttctaatagct 18967  T
Q  919 c-agcacgcaggc--agagtcttctgatcaa--caaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    | ||||| |||||  |||| |||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  18968 caagcacacaggcaaagaggcttctgatcaaacaaaaaatacaatgaaataagtttgacttgaacacttgat 19039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 730 - 985
Target Start/End: Complemental strand, 17673 - 17396
Alignment:
Q  730 cagttatcctggttccctccacaaatt-ggaagtagtccagtccccc-ttgcactt-ccaaggag-atttcactat--aatcacaaa-gattac--aaat 820  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||   ||||    
T  17673 cagttatcctggttccttccacaaatacggaagtagtccagtccccccttgcactttccaaggagtatttcactattaaatcacaaaagattaacaaaat 17574  T
Q  821 gct-caatactttctaagtatgagacttctc--aaaaat-gctcaag-cacacaggcaat-agtcttccaatgct-caagcactaagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||   |||||| ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17573 gctacaatactctctaagcatgagacttctacaaaaaatagctcaagtcacacacgcaaagagtcttccaatgctacaagcactaagcaagagtcttcta 17474  T
Q  914 atgctc-agcacgcaggc-agagtcttctgat---caacaaaaatacaatgaaatatg-tttaacttgaacacttgat 985  Q
    |||||| ||||| ||||| |||| ||||||||    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  17473 atgctcaagcacacaggcaagaggcttctgatacaaaacaaaaatacaatgaaataagttttgacttgaacacttgat 17396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 596 - 809
Target Start/End: Original strand, 4153 - 4364
Alignment:
Q  596 ttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaa 695  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  4153 ttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcagcggaaaa 4249  T
Q  696 gatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatt 794  Q
    || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4250 gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatt 4349  T
Q  795 tcactataatcacaa 809  Q
    |||||||||||||||    
T  4350 tcactataatcacaa 4364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 596 - 825
Target Start/End: Complemental strand, 155909 - 155682
Alignment:
Q  596 ttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaa 695  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  155909 ttttctttttctcttaaaaaatacttcttttgataaaactccagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgcagcggaaaa 155813  T
Q  696 gatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatt 794  Q
    || || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  155812 gaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatt 155713  T
Q  795 tcactataatcacaaagattacaaatgctca 825  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  155712 tcactataatcacaaagattacaactgctca 155682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0738 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0738
Description:

Target: scaffold0738; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 589 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 5641 - 5331
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||    
T  5641 aattgtgttttctttttctcg---aaaattcttcttctggtatcacttcagaagctggttgggaatgcttctgatgtgatgttcagaatcatatatgcag 5545  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || ||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5544 cggaataaaaacagagcagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 5446  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||| | || |||    
T  5445 ggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactctct-agtatgagacttccc--aaattctcaagcacgcaggcgagagactt 5349  T
Q  882 ccaatgctcaagcactaa 899  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5348 ccaatgctcaagcactaa 5331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 120; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 589 - 985
Target Start/End: Original strand, 28887 - 29288
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||  | |||||||||    || || |||||||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  28887 aattgtgttttctttttctc--aaaaaattcttcttctgatatcaattcagaagcttggtgagagtgcttctgatatgatgttcagaatcagatatgcag 28984  T
Q  689 cggaa--aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 786  Q
    |||||  || | ||||| |||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28985 cggaataaaaaacaaagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcca 29083  T
Q  787 aggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtct 880  Q
    ||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||  | || ||    
T  29084 aggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatac-atct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggagagagact 29179  T
Q  881 tccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca-gcacgcaggc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttga 976  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||| ||| |||| || ||||  ||||  ||||| ||||||    
T  29180 tccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgcttaggcacgcaggcgagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttga 29279  T
Q  977 acacttgat 985  Q
    |||||||||    
T  29280 acacttgat 29288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 733 - 985
Target Start/End: Original strand, 1554 - 1809
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 830  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1554 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaataatcacacagattacaaatgctcaatact 1653  T
Q  831 ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcag 928  Q
      || |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1654 cact-agtatgagacttctc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 1750  T
Q  929 gc-agagtcttctgatc-aacaaaaatacaatgaaatatgtttaacttgaacacttgat 985  Q
    || |||| ||||| ||| |||| || ||||  ||||  ||||| |||||||||||||||    
T  1751 gcaagagacttctaatcaaacagaattacacagaaaattgtttgacttgaacacttgat 1809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 116; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 589 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 61357 - 61136
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||    
T  61357 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg--attgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tg 61261  T
Q  686 cagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttc 784  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  61260 cagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaggcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttc 61161  T
Q  785 caaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  61160 caaggagatttcactataatcacaa 61136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 111; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 733 - 930
Target Start/End: Complemental strand, 10984 - 10785
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 830  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10984 ttatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattttcactaataatctcaaagattacaaatgctcaatact 10885  T
Q  831 ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctc-agcacgcag 928  Q
     ||| |||||||||||||||  | |||||||||||| ||||  | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10884 ctcttagtatgagacttctc--agatgctcaagcacgcaggtgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagtcttctaatgctcaagcacgcag 10787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 105; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Original strand, 57779 - 58107
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||  | |||| ||||   ||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  57779 aattgtgttttctttttctcctaaaa--ttcttcttctgatatcaattcaaaagctagttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcag 57876  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | ||||| |||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57877 cggaataaaaacaaagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccataaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 57975  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||| ||||     ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||   |||| | || |||    
T  57976 ggagatttccactaagaaataatcacacagattataactgctcaatactatct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcatgtaggcgagagactt 58072  T
Q  882 ccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  58073 ccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 58107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Original strand, 155 - 489
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagat------ 682  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||  |||||||||||          
T  155 aattgtgttttctttttctcctaaaa--ttcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagattcatat 252  T
Q  683 atgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcac 781  Q
    | ||||||||| || | || || |||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  253 acgcagcggaataaaaacatagtagagaaaagaaacaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttgcac 351  T
Q  782 ttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaat 875  Q
    |||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |     
T  352 ttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggcgag 448  T
Q  876 agtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  449 agacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 10609 - 10275
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagat------ 682  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||  |||||||||||          
T  10609 aattgtgttttctttttctcctaaaa--ttctttttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcagattcagat 10512  T
Q  683 atgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcac 781  Q
    | ||||||||| || | ||||| |||||||||||  | | ||||||| || ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10511 acgcagcggaataaaaacaaagtagagaaaagaaagaga-gacacaaacaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcac 10413  T
Q  782 ttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaat 875  Q
    |||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |     
T  10412 ttccaaggagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggcgag 10316  T
Q  876 agtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  10315 agacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 10275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 554 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 7230 - 7052
Alignment:
Q  554 tctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggg 651  Q
    |||||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  7230 tctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggg-ttgaattgtgttttctttttctctctaaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtttgtg 7132  T
Q  652 aatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagca 731  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  7131 aatgcttctgatgaaatgatcagaatcacatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaaaagcaagacacaagca 7052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 93; Significance: 9e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 29610 - 29282
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||  | |||||||||   ||| ||  ||||||||| | |||  |||||||| ||||||||    
T  29610 aattgtgttttctttttct--cataaaattcttcttctgatatcaattcagaagctagttgagagcgcttctgatatgatgttcagaatcatatatgcag 29513  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || || ||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29512 cggaataaaaacagagtagagaaaagaa-agagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtctagtcccccttgcacttccaa 29414  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
     ||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  || || | || |||    
T  29413 tgagatttccactatgaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtatgagacttccc--aaatgctcaagcatgcatgctagagactt 29317  T
Q  882 ccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  29316 ccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 29282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 589 - 753
Target Start/End: Complemental strand, 412158 - 411994
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa--tacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||| ||||  ||||| |||    
T  412158 aattgttttttctttttctcttaaaaaaaatacttcttctgataaaactccagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagacagat-tgc 412062  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  412061 agcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 411994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 507793 - 507720
Alignment:
Q  449 tgaaagagaacgaagaaaacgatttgtgacattgatgttggccaatgtcaccaatgtcatcaaccacaatgtca 522  Q
    |||||||||| ||||||| | | |||| | ||||   |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  507793 tgaaagagaaagaagaaatccacttgtaatattgtgattggtcaatgtcaccaatgtcatcaatcacaatgtca 507720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 92; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 589 - 766
Target Start/End: Complemental strand, 10376 - 10201
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  10376 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 10280  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtc 766  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  10279 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtc 10201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 556 - 913
Target Start/End: Original strand, 53 - 415
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaata-cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || |    
T  53 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctttaaaaaaatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagt 152  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||| ||| || | || || ||||||||||| |   ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  153 gcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcagaataaaaacagagtagagaaaagaa-agagagacacaagcaattatcttggttccttccacaa 251  T
Q  754 attggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagactt 847  Q
    |   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||     ||||||||| | ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||    
T  252 accagaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactacct-agtatgagactt 350  T
Q  848 ctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    | |  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  351 ccc--aaatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttcta 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 556 - 913
Target Start/End: Original strand, 4436 - 4795
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||    
T  4436 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctcggaaaa--ttcttcttctgatatcacttcagaagctgtttgagagtg 4533  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    |||||||||| |||  ||||||| |||| ||||| ||| || | || || ||||||||||| |   ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  4534 cttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcagcagaataaaaacagagtagagaaaagaa-agagagacacaagcaattatcttggttccttccacaaa 4632  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttc 848  Q
       |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||     ||||||||| | ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||    
T  4633 ccagaagtagttcagtaccccttgcacttccaaggagattttgactaagaaataatcacacatattacaactgctcaatactacct-agtatgagacttc 4731  T
Q  849 tcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
     |  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  4732 cc--aaatgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagaactaaagcaagagacttcta 4795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 589 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 52574 - 52370
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc--aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgc 686  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||||  || ||||||||||| | ||| |||||| |||| |||    
T  52574 aattgtgttttctttttctctcttaaataat-cttcttcagataaatcttcagaagcagtttatgagtgcttctgatgaattgatcagaattagatgtgc 52476  T
Q  687 agcggaaaagatcaaagcagagaaaagaa-gaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52475 agcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaacacggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 52376  T
Q  786 aaggag 791  Q
    ||||||    
T  52375 aaggag 52370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 90; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 556 - 703
Target Start/End: Original strand, 12218 - 12371
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaa------aatacttcttctgataatacttcagaagcagtttg 649  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||      |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12218 tgaaggtgagaaaaacacaagaagtgggggttgaattgtgttttctttttctctaaaaaaaaaaaaatacttcttctgataatacttcagacgcagtttg 12317  T
Q  650 ggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaag 703  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318 ggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaag 12371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 721 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 1723 - 1525
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  1723 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagatt 1624  T
Q  815 acaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||| |||||||||||  || |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1623 acaactgctcaatactacct-agtatgagact--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0360 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0360
Description:

Target: scaffold0360; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 589 - 753
Target Start/End: Original strand, 17749 - 17911
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  17749 aattgtgttttttttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gagtgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 17845  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaa 753  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17846 cggaaaagaacagagcagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccacaa 17911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 589 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 38810 - 38499
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | ||| || || |||||||||||||   |||||  |||||| ||    
T  38810 aattgtgttttccttttctca-aaaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagattgattctgatgtaatgtttagaattggatatgtag 38712  T
Q  689 cggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaa 787  Q
    ||||| || | || | |||||||||||| |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38711 cggaataaaaacagatcagagaaaagaa-agagagacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccgtaagtagtccagttccccttgcacttccaa 38613  T
Q  788 ggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtctt 881  Q
    |||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |  |||||||||||||| ||||| | || |||    
T  38612 ggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatct-agtataagacttccc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagactt 38516  T
Q  882 ccaatgctcaagcactaa 899  Q
     |||||||||||||||||    
T  38515 -caatgctcaagcactaa 38499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 589 - 915
Target Start/End: Original strand, 646 - 976
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    |||||||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||  ||||||| |||| ||||    
T  646 aattgtgttttcttttcctt--agaaaattcttcttctgatatcacttcagaagctggttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatcggatacgcag 743  T
Q  689 cggaaaag---atcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 785  Q
    ||||| |    | || || |||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  744 cggaataacaaaacagagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatcctggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttcc 842  T
Q  786 aaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtc 879  Q
    |||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||| | | |  |||||||||||||| ||||| | || |    
T  843 aaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacct-agtatgagaatgccc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagac 939  T
Q  880 ttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    |||| ||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  940 ttcctatgttcaaggactaaagcaagagacttctaat 976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 800 - 915
Target Start/End: Original strand, 1478 - 1591
Alignment:
Q  800 ataatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-a 898  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||  || ||||||||| | | |  |||||||||||||| ||||| | || ||||| ||| ||||| ||| |    
T  1478 ataatcacacagattacaactgctcaatactacct-agtatgagaatgccc--aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttcctatgatcaagaactaa 1574  T
Q  899 agcaagagtcttctaat 915  Q
    |||||||| ||||||||    
T  1575 agcaagagacttctaat 1591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2071 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold2071
Description:

Target: scaffold2071; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 757 - 915
Target Start/End: Complemental strand, 1117 - 955
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-----taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctc 850  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  1117 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactatcta-gtatgagacttccc 1019  T
Q  851 aaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    |||  ||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  1018 aaa--tgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 74; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 654 - 915
Target Start/End: Original strand, 60545 - 60813
Alignment:
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcgga--aaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccac 751  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||  ||| | || || |||||||||||  | | |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  60545 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatactggttccttccac 60643  T
Q  752 aaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgaga 844  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||   |  |||||||||    
T  60644 aaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacagattacaactgctcaatactacacctagtatgaga 60743  T
Q  845 cttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaat 915  Q
    ||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  60744 ct--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttctaat 60813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 589 - 668
Target Start/End: Original strand, 60441 - 60522
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata--cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaat 668  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  60441 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaaaatcttcttctgatattacttcagaagctgtttgagagtgcttctgatgtaat 60522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Original strand, 8614 - 8737
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  8614 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 8710  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  8711 cggaaaagaacagagcagagaaaagaa 8737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Original strand, 17691 - 17814
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  17691 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 17787  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  17788 cggaaaagaacagagcagagaaaagaa 17814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 589 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 82854 - 82731
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  82854 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagttt--gattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 82758  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaaagaa 715  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||    
T  82757 cggaaaagaacagagcagagaaaagaa 82731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0398 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0398
Description:

Target: scaffold0398; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 589 - 706
Target Start/End: Complemental strand, 13326 - 13208
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctccc-aaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgca 687  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13326 aattgtgttttctttttctttctaaaaaattcttcttctgataaaccttcagaagcagtttgtgaatgcttctgatgaaatgatcagaatcagatatgca 13227  T
Q  688 gcggaaaagatcaaagcag 706  Q
    |||||||||| || |||||    
T  13226 gcggaaaagaacagagcag 13208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 67; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 555 - 690
Target Start/End: Original strand, 5270 - 5404
Alignment:
Q  555 ctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaat 654  Q
    ||||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  5270 ctgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctct-aaaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaat 5368  T
Q  655 gcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcg 690  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  5369 gcttctgatgtgatgttcagaatcagatatgcagcg 5404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0382 (Bit Score: 65; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0382
Description:

Target: scaffold0382; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 556 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 2163 - 1883
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||||  ||||||||||| | ||   ||||    
T  2163 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctttgaaaaaactttttctgatatcacttcagaagctggttaataatg 2064  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaa-aagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaa 754  Q
    ||||||||||  ||  |||||||||||| ||||||||  || | || || ||||| |||||  | | |||||||||| |||| ||| || | ||||||||    
T  2063 cttctgatgtgttgttcagaatcagatacgcagcggagtaaaaacagagtagagagaagaaagaga-gacacaagcaattatactgttttcttccacaaa 1965  T
Q  755 ttggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact 830  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1964 ccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagattacaactgctcaatact 1883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 589 - 711
Target Start/End: Complemental strand, 120 - 1
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcag 688  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  120 aattgtgttttctttttctcttaaaaaatacttcttctgataaaacttcagaagcagtt--agattgcttctgatgaaatgatcagagtcagat-tgcag 24  T
Q  689 cggaaaagatcaaagcagagaaa 711  Q
    ||||||||| || ||||||||||    
T  23 cggaaaagaacagagcagagaaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 556 - 768
Target Start/End: Original strand, 17715 - 17929
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaa--aatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaa 653  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || |||||||||||||||||||| |  ||  ||| |||||| |||| |  |||||||||||||||| ||     
T  17715 tgaaggtgagaaaaacacaagaagggggggttgaattgtgttttctttttctctcttaattaat-cttcttttgatcaatcttcagaagcagtttgtgat 17813  T
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaag-aagaataagacacaagcagttatcctggttccctccaca 752  Q
    ||||||||||| | ||  |||||| |||| |||||||||||||| || || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17814 tgcttctgatgaattgttcagaattagatgtgcagcggaaaagaacagagtagagaaaagaaagacaaagacacaagcagttatcctggttccttccaca 17913  T
Q  753 aattggaagtagtcca 768  Q
    |   ||||||||||||    
T  17914 acacggaagtagtcca 17929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 721 - 896
Target Start/End: Original strand, 61090 - 61270
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagatt 814  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |||||    
T  61090 agacacaagcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaagtaataatcacacagatt 61189  T
Q  815 acaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac 896  Q
    | || |||||||||||   |  ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||    
T  61190 ataactgctcaatactacacctagtatgagacttcgc--aaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcac 61270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 63; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 721 - 899
Target Start/End: Original strand, 11091 - 11272
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatt-----tcactataatcacaaagatta 815  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     ||| | |||||||| ||||||    
T  11091 agacacaagcaattatactggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccctttgcacttccaaggagattttcactcagtttaatcacacagatta 11190  T
Q  816 caaatgctcaata-ctttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa 899  Q
    ||| ||||||||| |   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  ||||||||||||||    
T  11191 caactgctcaataccacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaa 11272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 61; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 556 - 773
Target Start/End: Original strand, 10140 - 10355
Alignment:
Q  556 tgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatg 655  Q
    |||||| ||||||||||||||||       || ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||     |    
T  10140 tgaaggtgagaaaaacacaagaagagggggttgaattgtgttttctttttctctttaaaaat-cttcttctgagattacttcagaagctgtttgaatgag 10238  T
Q  656 cttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcggaaaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccacaaat 755  Q
    |||||||||| |||  || ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  || ||||| || ||||||| |||||||| |||||||      
T  10239 cttctgatgtgatgttcaaaattagatatgcagcggaaaagaacagagcagagaaaagaaagat-agacagaaacagttatactggttccttccacaatc 10337  T
Q  756 tggaagtagtccagtccc 773  Q
     |||||||| ||||||||    
T  10338 cggaagtagcccagtccc 10355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 767 - 896
Target Start/End: Original strand, 13934 - 14068
Alignment:
Q  767 cagtcccccttgcacttccaaggagatttc-acta-------taatcacaaagattacaaatgctcaatactttctaagtatgagacttctcaaaaatgc 858  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||  |||    
T  13934 cagtcccccttgcacttccaaggagatttccactaaaatcaataatcacacagattacagatgctcaatactctcta-gtatgagacttatcaaa--tgc 14030  T
Q  859 tcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac 896  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14031 tcaagcacacaggcaagagacttccaatgctcaagcac 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 654 - 920
Target Start/End: Original strand, 32282 - 32555
Alignment:
Q  654 tgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatgcagcgga--aaagatcaaagcagagaaaagaagaataagacacaagcagttatcctggttccctccac 751  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||||  ||| | || || |||||||||||  | | |||||||||| ||||  ||||||| |||||    
T  32282 tgcttctgatgtattgttcagaatcggatacgcagcggagtaaaaaacagagtagagaaaagaaagaga-gacacaagcaattatattggttccttccac 32380  T
Q  752 aaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagattt-cact-----ataatcacaaagattacaaatgctcaatact-ttctaagtatgaga 844  Q
    |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||     ||||||||| |  |||||| |||||||||||   |  |||||||||    
T  32381 aaaccggaagtagttcagtccccctggcacttccaaggagatttccactaagaaataatcacacaatttacaactgctcaatactacacctagtatgaga 32480  T
Q  845 cttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttctaatgctca 920  Q
    ||  ||| |||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||    
T  32481 ct--tcacaaatgctcaagcacgcaggcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcctatgctca 32555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 53; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Original strand, 4475 - 4681
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agat 813  Q
    |||||| | ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    |||||||||  |||    
T  4475 aagacagaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagttccactaagtttaatcacaactgat 4574  T
Q  814 tacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 911  Q
    ||||| |||||||||||   |  |||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  4575 tacaactgctcaatactacacctagtatgagact--tcaaaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcattaaagcaagagacttc 4672  T
Q  912 taatgctca 920  Q
      |||||||    
T  4673 ctatgctca 4681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Original strand, 4304 - 4382
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata--cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  4304 aattgtgttttctttttctcaaaaaatataatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttaagaatgcttctgatgt 4382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 52; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 720 - 830
Target Start/End: Original strand, 5761 - 5877
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agat 813  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||    
T  5761 aagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgat 5860  T
Q  814 tacaaatgctcaatact 830  Q
    ||||| |||||||||||    
T  5861 tacaactgctcaatact 5877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold1507
Description:

Target: scaffold1507; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 720 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 101 - 20
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta 800  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  101 aagacacaggcaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcacta 20  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1507; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 272 - 194
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaata--cttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  272 aattgtgttttctttttctcaaaaaatataatcttcttctgatatcacttcagaagctgtttaagaatgcttctgatgt 194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 722 - 830
Target Start/End: Original strand, 19923 - 20037
Alignment:
Q  722 gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 815  Q
    |||||| ||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  19923 gacacatgcaattatactggttccttccacaaactggaagtagtccagttccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 20022  T
Q  816 caaatgctcaatact 830  Q
    ||| |||||||||||    
T  20023 caactgctcaatact 20037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 720 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 21126 - 20921
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggag-atttcacta----taatcacaa-agat 813  Q
    ||||||||  || |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    |||||||||  |||    
T  21126 aagacacatacaattatactggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagtgtttcactaagtttaatcacaactgat 21027  T
Q  814 tacaaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttc 911  Q
    ||||| | |||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21026 tacaactactcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttc 20930  T
Q  912 taatgctca 920  Q
      |||||||    
T  20929 ctatgctca 20921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 552 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 21331 - 21212
Alignment:
Q  552 tatctgaaggcgagaaaaacacaagaannnnnnnttaaattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttggg 651  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||       || ||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||| |  |||||||||||  ||||      
T  21331 tatctgaaggtgagaaaaacacgagaaggggcggttgaattgtgttttctttttctcaagataaattcttcttctgagatcacttcagaagctatttgaa 21232  T
Q  652 aatgcttctgatgtaatgac 671  Q
    || ||||||||||| |||||    
T  21231 aacgcttctgatgtgatgac 21212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 50; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 721 - 899
Target Start/End: Original strand, 34977 - 35158
Alignment:
Q  721 agacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaagatta 815  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  | ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||| ||||||    
T  34977 agacacaggcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtagtccagtttcccttgcacttccaaggagattttcactaagtttaatcacacagatta 35076  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa 899  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || ||||   ||||||||||||||    
T  35077 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagacttcttttgctcaagcactaa 35158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 722 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 1686 - 1483
Alignment:
Q  722 gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 815  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  1686 gacacatgcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 1587  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| |||||||||||   |  |||| ||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||      
T  1586 caactgctcaatactacacctagtacgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 1490  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  1489 atgctca 1483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 589 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 1833 - 1751
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgac 671  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||  |||||||||| |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||    
T  1833 aattgtgttttctttttctcaagataaaatcttcttctgagatcacttcagaagctgtttgaaaatgcttctgatgtgatgac 1751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 722 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 1879 - 1676
Alignment:
Q  722 gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 815  Q
    |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  1879 gacacatgcaattatattggttccttccacaaaccggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 1780  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| |||||||||||   |  |||| ||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| || ||| |  |||||||||||| ||||||||| ||||      
T  1779 caactgctcaatactacacctagtacgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagagactttctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 1683  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  1682 atgctca 1676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 589 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 2026 - 1944
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgac 671  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||  |||||||||| |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||    
T  2026 aattgtgttttctttttctcaagataaaatcttcttctgagatcacttcagaagctgtttgaaaatgcttctgatgtgatgac 1944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 722 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 7234 - 7031
Alignment:
Q  722 gacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agatta 815  Q
    ||||||| || |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  7234 gacacaaacaattataccggttccttccacaaatcggaagtagtccagtcccccttacactttcaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 7135  T
Q  816 caaatgctcaatact-ttctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||  | |||||  |||||||||||| ||||||||| ||||      
T  7134 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacgcaggcaagtgacttcctttgctcaagcactaaagcaagagacttcct 7038  T
Q  914 atgctca 920  Q
    |||||||    
T  7037 atgctca 7031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 46; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 589 - 665
Target Start/End: Original strand, 1590 - 1664
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgt 665  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1590 aattgtgttttctttttctct--aaaaattcttcttctgataacacttcagaagcaggttaggaatgcttctgatgt 1664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 733 - 830
Target Start/End: Original strand, 16338 - 16441
Alignment:
Q  733 ttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaa 826  Q
    |||| |||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||    
T  16338 ttatactggttccttccacaaaccggaagtagtccaatcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaa 16437  T
Q  827 tact 830  Q
    ||||    
T  16438 tact 16441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0827 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0827
Description:

Target: scaffold0827; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 685
Target Start/End: Original strand, 5428 - 5524
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaatacttcttctgataatacttcagaagcagtttgggaatgcttctgatgtaatgaccagaatcagatatg 685  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||  ||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||  ||||||| ||||||    
T  5428 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaatcttcttctggtatcacttcagaagctgtttgagagtgcttctgatgtgatgttcagaatctgatatg 5524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 41; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 723 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 2534 - 2338
Alignment:
Q  723 acacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaaa-gatta 815  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| ||||||||  | |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    |||||||||  |||||    
T  2534 acacaggcaattatactggttccttccacaaaccgaaagtcagtcctgtctcccttgcacttccaatgagagtttcactaagtttaatcacaactgatta 2435  T
Q  816 caaatgctcaatacttt-ctaagtatgagacttctcaaaaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcac-taagcaagagtcttcta 913  Q
    ||| |||||||||||   |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  2434 caactgctcaatactacacctagtatgagacttc---aaattgctcaagcacacaggcaagagacttcctatgctcaagcacacaagcaagagacttcta 2338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 3420 - 3337
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3420 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 3337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 2525 - 2443
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa 809  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  2525 aagcaattatacaggttccttccacaattcggaagtagtcctgtcctccttgcacttccaaggagagttcactaaaattacaa 2443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 727 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 37490 - 37412
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||    
T  37490 aagcaattatacaggttccttccacaaatcggaagtagtcctgtcccccttgctcttccaaggagagtttactaaaatc 37412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Original strand, 76625 - 76691
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  76625 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcactaaaatca 76691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1281 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1281
Description:

Target: scaffold1281; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 747 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 2109 - 2056
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2109 tccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 2056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 9272 - 9345
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9272 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 9345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 16860 - 16800
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16860 ggttccttccacaaaccggaagtagtcacgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 16800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 20201 - 20141
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  20201 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaagagagttcacta 20141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 727 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 6434 - 6359
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||| | |||||| |||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6434 aagcaattatacaggttccttccacaaaatggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 6359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 16468 - 16385
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16468 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 16385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 720 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 35498 - 35415
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagtt-atcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||||||||| || || | |||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  35498 aagacacaagcaatttatacaggttccttccacaaactggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcactat 35415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000009; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 739 - 806
Target Start/End: Original strand, 87788 - 87855
Alignment:
Q  739 tggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  87788 tggttccttccacaatccggaagtagttcactcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 87855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 741 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 378277 - 378218
Alignment:
Q  741 gttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  378277 gttccttccacaaactggaagtagtcatgccccccttgcacttccaaggagagttcacta 378218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 747 - 800
Target Start/End: Original strand, 219626 - 219679
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  219626 tccacaaatcggaagtagtcatgtcccccttgcactttcaaggagagttcacta 219679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 245025 - 244952
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  245025 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcgtgtcccccttgcactttcaaggagggttcacta 244952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 759 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 9699 - 9630
Alignment:
Q  759 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatcacaa--agattacaaatgctcaa 826  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
T  9699 aagtagtcctgtcccccttgtacttccaaggagagttcactaaaatcagaatctgattacaaatgctcaa 9630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Original strand, 268162 - 268228
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  268162 ggttccttccacaaaccggaagtagtcctattccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 268228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 763 - 801
Target Start/End: Original strand, 83796 - 83834
Alignment:
Q  763 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  83796 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 83834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 806
Target Start/End: Original strand, 95 - 161
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  95 ggttccttccacaatccggaagtagtcctgtcccacttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 763 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 90763 - 90725
Alignment:
Q  763 agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  90763 agtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 90725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1002 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1002
Description:

Target: scaffold1002; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 649
Target Start/End: Original strand, 3426 - 3489
Alignment:
Q  589 aattgtgttttctttttctcccaaaaaa---tacttcttctgataatacttcagaagcagtttg 649  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||   | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3426 aattgtgttttctttttctcttaaaaaaggattcttcttctgataaaacttcagaagcagtttg 3489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 757 - 806
Target Start/End: Original strand, 19474 - 19523
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19474 ggaagtagtcctgccccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 19523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 727 - 800
Target Start/End: Original strand, 14484 - 14557
Alignment:
Q  727 aagcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||| |||| | |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  14484 aagcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaaggaaagttcacta 14557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 73961 - 74022
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  73961 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 74022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 804
Target Start/End: Original strand, 251037 - 251114
Alignment:
Q  728 agcagttatcctggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcactataat 804  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  251037 agcaattattctggttccttccacaatctggaagtagtcaaatctcccttgcactttcaaggagattttcactataat 251114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 856 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 165214 - 165156
Alignment:
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  165214 tgctcaagcacacaggaaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 165156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 792
Target Start/End: Original strand, 2040 - 2092
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 792  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  2040 ggttccttccacaaactggaagtagtcctgtcccatttgcacttccaaggaga 2092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 758 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 4075 - 4027
Alignment:
Q  758 gaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4075 gaagtagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactaaaatca 4027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 210 - 113
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga-tttcacta----taatcacaa-agattacaaatgctcaatact 830  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  210 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggagagtttcactaagtttaatcacaactgattacaactgctcaatact 113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 856 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 59 - 1
Alignment:
Q  856 tgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcact-aagcaagagtcttcta 913  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  59 tgctcaagcacacaagcaagagacttcctatgctcaagcactaaagcaagagacttcta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 32517 - 32457
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  32517 ggttccttccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcatttccaaggagagttcacta 32457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 59459 - 59519
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  59459 ggttccttccacaaaccggaagtagtcatgtaccccttgcacttccaaggagagttcacta 59519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 757 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 6850 - 6815
Alignment:
Q  757 ggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggaga 792  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6850 ggaagtagtcctgtcccccttgcacttccaaggaga 6815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 854 - 895
Target Start/End: Complemental strand, 8320 - 8279
Alignment:
Q  854 aatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagca 895  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  8320 aatgctcaagcacacaagcaagaggcttccaatgctcaagca 8279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 2361 - 2423
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2361 ggttccttccacaaaccggaagttagtactgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 2423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 756 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 1588 - 1538
Alignment:
Q  756 tggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatca 806  Q
    |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1588 tggaagtagtcttgtcacccatgcacttccaaggagagttcactataatca 1538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 740 - 801
Target Start/End: Original strand, 24010 - 24072
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactat 801  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24010 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcatgtcccccttgcacttccaaggagagttcactat 24072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 759 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 17046 - 17000
Alignment:
Q  759 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcactataatc 805  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17046 aagtagtccaatctcctttgcacttccaaggagatttcattataatc 17000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 853 - 899
Target Start/End: Complemental strand, 59838 - 59792
Alignment:
Q  853 aaatgctcaagcacacaggcaatagtcttccaatgctcaagcactaa 899  Q
    |||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  59838 aaatgctcaagcacgcaggcgagagacttccaatgctcaagcactaa 59792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 759 - 800
Target Start/End: Original strand, 720 - 761
Alignment:
Q  759 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  720 aagtagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcacta 761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 759 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 691 - 650
Alignment:
Q  759 aagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  691 aagtagtcctatcccccttgcacttccaaggagagttcacta 650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 747 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 1380 - 1327
Alignment:
Q  747 tccacaaattggaagtagtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    ||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  1380 tccacaaaccggaagtagtcttgtcccccttgcacttccaagtagagttcacta 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Original strand, 9343 - 9404
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  9343 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttacaaggagagttcacta 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 7473 - 7412
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7473 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggagagttcacta 7412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 720 - 792
Target Start/End: Original strand, 9326 - 9399
Alignment:
Q  720 aagacacaagcagttatcctggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggaga 792  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||| ||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9326 aagacacaggcaattatacaggttccttccacaaaccggaagtcagtcttgtcccccttgcacttccaaggaga 9399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 6000 - 5939
Alignment:
Q  740 ggttccctccacaaattggaagt-agtccagtcccccttgcacttccaaggagatttcacta 800  Q
    |||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6000 ggttccttccacaaaccggaagtcagtcctgtcccccttgcacttccaaggggagttcacta 5939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University