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Alignment Overview

Query: NF5247_low_11 (Length: 418)

Name: NF5247_low_11
Description: NF5247
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5247_low_11
NF5247_low_11
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (1-402)||(28998649-28999050)
chr1 (1-402)||(29004365-29004766)
chr1 (4-196)||(47905956-47906148)
chr1 (1-196)||(31735920-31736115)
chr1 (1-197)||(24325346-24325542)
chr1 (6-196)||(39931762-39931952)
chr1 (1-197)||(15295244-15295440)
chr1 (4-196)||(48664852-48665044)
chr1 (4-196)||(9463648-9463840)
chr1 (1-197)||(17325032-17325228)
chr1 (1-196)||(27337337-27337532)
chr1 (11-196)||(6115532-6115718)
chr1 (4-196)||(9459821-9460013)
chr1 (1-199)||(2949620-2949818)
chr1 (1-196)||(27339531-27339730)
chr1 (6-196)||(45693834-45694024)
chr1 (4-201)||(4131690-4131887)
chr1 (3-169)||(21948590-21948756)
chr1 (197-398)||(29011672-29011872)
chr1 (8-196)||(6997214-6997395)
chr1 (81-196)||(46432521-46432636)
chr1 (1-158)||(6996067-6996218)
chr1 (43-196)||(16561131-16561284)
chr1 (1-84)||(46432124-46432207)
chr1 (30-116)||(11693580-11693666)
chr1 (30-186)||(13785662-13785835)
chr1 (1-74)||(2510728-2510801)
chr1 (30-113)||(14352759-14352842)
chr1 (66-186)||(32260746-32260883)
chr1 (3-62)||(26520521-26520580)
chr1 (4-57)||(6115488-6115541)
chr1 (30-113)||(10115572-10115653)
chr1 (119-186)||(11693686-11693753)
chr1 (77-128)||(13112047-13112098)
chr1 (157-196)||(6997388-6997427)
chr1 (113-159)||(10115509-10115555)
chr1 (165-196)||(21964366-21964397)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (1-196)||(7094820-7095015)
chr7 (1-196)||(3035415-3035610)
chr7 (1-196)||(7092573-7092768)
chr7 (1-196)||(11756925-11757120)
chr7 (1-196)||(20299155-20299350)
chr7 (1-196)||(47865328-47865523)
chr7 (1-196)||(1849665-1849860)
chr7 (1-196)||(31156305-31156500)
chr7 (1-196)||(38395986-38396181)
chr7 (4-196)||(7470429-7470621)
chr7 (4-196)||(7472382-7472574)
chr7 (1-197)||(20625733-20625929)
chr7 (1-197)||(20629624-20629820)
chr7 (1-197)||(20642043-20642239)
chr7 (1-196)||(1606171-1606366)
chr7 (1-196)||(28487249-28487444)
chr7 (3-196)||(28485261-28485454)
chr7 (1-197)||(7352051-7352247)
chr7 (1-196)||(18345237-18345432)
chr7 (1-196)||(21470688-21470883)
chr7 (1-197)||(37412521-37412717)
chr7 (1-196)||(7349672-7349867)
chr7 (1-196)||(38393683-38393878)
chr7 (1-197)||(21989852-21990046)
chr7 (4-196)||(42331401-42331593)
chr7 (1-188)||(24258166-24258352)
chr7 (48-196)||(443326-443474)
chr7 (1-197)||(3676996-3677173)
chr7 (1-127)||(13099870-13099996)
chr7 (1-116)||(43253920-43254035)
chr7 (30-193)||(40281824-40281989)
chr7 (3-92)||(20297163-20297252)
chr7 (21-186)||(10690684-10690854)
chr7 (133-186)||(20297108-20297161)
chr7 (30-116)||(12310442-12310528)
chr7 (142-188)||(43254023-43254069)
chr7 (69-116)||(12484976-12485023)
chr7 (69-116)||(12506407-12506454)
chr7 (113-179)||(12310542-12310608)
chr7 (69-116)||(12657600-12657647)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (1-196)||(25803707-25803902)
chr5 (1-196)||(18468698-18468893)
chr5 (1-196)||(27912219-27912414)
chr5 (1-196)||(27910135-27910330)
chr5 (1-196)||(3373435-3373630)
chr5 (1-196)||(15551925-15552120)
chr5 (1-194)||(18511607-18511800)
chr5 (1-193)||(18509712-18509904)
chr5 (4-196)||(26098649-26098841)
chr5 (1-176)||(10586549-10586724)
chr5 (1-196)||(26097421-26097618)
chr5 (13-197)||(21288528-21288713)
chr5 (1-197)||(18596325-18596532)
chr5 (44-189)||(17415748-17415893)
chr5 (2-116)||(18466453-18466567)
chr5 (92-197)||(6661929-6662034)
chr5 (30-116)||(15143262-15143348)
chr5 (117-196)||(40221282-40221361)
chr5 (142-196)||(18466411-18466465)
chr5 (142-198)||(15143218-15143274)
chr5 (1-63)||(40221340-40221402)
chr5 (113-186)||(5779144-5779217)
chr5 (30-72)||(6661594-6661636)
chr5 (43-116)||(32520241-32520316)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (1-196)||(746422-746617)
chr3 (1-196)||(25533107-25533302)
chr3 (1-206)||(4104288-4104493)
chr3 (1-197)||(455572-455768)
chr3 (1-196)||(457950-458145)
chr3 (1-196)||(10621932-10622127)
chr3 (1-196)||(41848804-41848999)
chr3 (1-196)||(53915887-53916082)
chr3 (1-196)||(42991953-42992148)
chr3 (1-197)||(1313081-1313277)
chr3 (1-194)||(42989954-42990147)
chr3 (4-196)||(51943042-51943234)
chr3 (1-196)||(27636017-27636212)
chr3 (4-197)||(53918058-53918251)
chr3 (122-196)||(6561613-6561687)
chr3 (30-113)||(11066346-11066429)
chr3 (113-186)||(53974124-53974197)
chr3 (41-113)||(54287487-54287559)
chr3 (46-111)||(53974011-53974077)
chr3 (46-186)||(11072644-11072801)
chr3 (113-186)||(11066255-11066329)
chr3 (156-197)||(27000082-27000123)
chr3 (113-164)||(54287576-54287627)
chr3 (69-116)||(5535882-5535929)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (1-199)||(19704970-19705168)
chr6 (1-196)||(5275733-5275928)
chr6 (1-197)||(18317750-18317946)
chr6 (1-196)||(2629284-2629479)
chr6 (1-196)||(12195909-12196104)
chr6 (1-198)||(26932963-26933160)
chr6 (1-197)||(30035001-30035197)
chr6 (1-196)||(30966923-30967118)
chr6 (1-194)||(17011781-17011971)
chr6 (1-197)||(17852266-17852461)
chr6 (33-196)||(22858373-22858536)
chr6 (30-194)||(20526548-20526708)
chr6 (30-116)||(30445318-30445404)
chr6 (30-116)||(30443111-30443195)
chr6 (113-174)||(30445243-30445304)
chr6 (118-186)||(30443022-30443092)
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (1-196)||(43529871-43530066)
chr8 (1-197)||(15808961-15809157)
chr8 (1-196)||(28283618-28283813)
chr8 (1-198)||(3873748-3873946)
chr8 (1-196)||(608470-608665)
chr8 (4-196)||(41384493-41384684)
chr8 (1-195)||(41382420-41382614)
chr8 (38-196)||(32339094-32339252)
chr8 (79-196)||(3265635-3265752)
chr8 (30-116)||(11701364-11701447)
chr8 (115-186)||(13986304-13986374)
chr8 (2-45)||(181434-181477)
chr8 (42-113)||(13986214-13986285)
chr8 (115-186)||(30679186-30679256)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (1-196)||(22132792-22132987)
chr4 (1-196)||(22135024-22135219)
chr4 (1-197)||(56030188-56030384)
chr4 (1-196)||(5100743-5100938)
chr4 (1-198)||(24347957-24348153)
chr4 (1-197)||(44600233-44600429)
chr4 (1-200)||(17662631-17662830)
chr4 (1-196)||(14787826-14788021)
chr4 (4-180)||(30136331-30136507)
chr4 (46-197)||(47211158-47211309)
chr4 (2-200)||(38890524-38890705)
chr4 (30-196)||(10112626-10112787)
chr4 (30-198)||(9022058-9022225)
chr4 (42-196)||(9863499-9863650)
chr4 (95-194)||(19322410-19322510)
chr4 (1-89)||(19322547-19322635)
chr4 (30-186)||(38209098-38209259)
chr4 (30-116)||(54929094-54929180)
chr4 (37-116)||(10979676-10979755)
chr4 (125-196)||(14789500-14789571)
chr4 (2-65)||(53405001-53405064)
chr4 (118-180)||(5516771-5516833)
chr4 (54-113)||(29609838-29609897)
chr4 (113-182)||(29609914-29609983)
chr4 (65-111)||(5516701-5516747)
chr4 (115-186)||(54929198-54929267)
chr4 (77-116)||(14647175-14647214)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (1-196)||(23452634-23452829)
chr2 (1-197)||(42452448-42452644)
chr2 (1-198)||(35218370-35218567)
chr2 (1-196)||(35215989-35216184)
chr2 (1-196)||(42923899-42924094)
chr2 (30-186)||(28568584-28568740)
chr2 (30-196)||(27583741-27583907)
chr2 (66-197)||(27136367-27136506)
chr2 (101-189)||(34575608-34575696)
chr2 (30-186)||(15693583-15693755)
chr2 (30-115)||(7502638-7502723)
chr2 (45-116)||(39286971-39287042)
chr2 (38-186)||(41303457-41303623)
chr2 (121-186)||(28568346-28568411)
chr2 (37-116)||(41304806-41304884)
chr2 (30-91)||(34575556-34575617)
chr2 (132-183)||(7502582-7502633)
chr2 (118-182)||(39286892-39286952)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (1-197)||(1734-1930)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-197)||(11866-12062)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (1-196)||(51709-51904)
scaffold0005 (125-196)||(50159-50230)
scaffold0005 (77-116)||(170076-170115)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-196)||(78883-79078)
[»] scaffold0468 (2 HSPs)
scaffold0468 (81-195)||(2070-2184)
scaffold0468 (1-53)||(2028-2080)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (48-196)||(4546-4694)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (102-196)||(1-95)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (273-402)||(33151-33265)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (43-113)||(57836-57905)
scaffold0008 (115-186)||(57926-57995)
[»] scaffold0533 (1 HSPs)
scaffold0533 (45-92)||(1971-2018)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 370; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 28998649 - 28999050
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  28998649 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaaaatgtatttattgtccat 28998748  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998749 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaata 28998848  T
Q  201 ataacaaaattcaaaacatgatttctgctttagaaaaaatcgtgatataagtgtgctagccttgaaacttggcagtagtagtataatcaatcattctttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998849 ataacaaaattcaaaacatgatttctgctttagaaaaaatcgtgatataagtgtgctagccttgaaacttggcagtagtagtataatcaatcattctttg 28998948  T
Q  301 ttgttttaaggtaaggagtcatggctgatacctcatgttcaaacacatcatggccacttcaatgaaagatgtggccttttcttaagaaaattgttaactt 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998949 ttgttgtaaggtaaggagtcatggctgatacctcatgttcaaacacatcatggccacttcaatgaaagatgtggccttttcttaagaaaattgttaactt 28999048  T
Q  401 at 402  Q
    ||    
T  28999049 at 28999050  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 402
Target Start/End: Original strand, 29004365 - 29004766
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  29004365 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatatttcttcgtacggtacaaaaatgtatttattgtccat 29004464  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004465 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaata 29004564  T
Q  201 ataacaaaattcaaaacatgatttctgctttagaaaaaatcgtgatataagtgtgctagccttgaaacttggcagtagtagtataatcaatcattctttg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004565 ataacaaaattcaaaacatgatttctgctttagaaaaaatcgtgatataagtgtgctagccttgaaacttggcagtagtagtataatcaatcattctttg 29004664  T
Q  301 ttgttttaaggtaaggagtcatggctgatacctcatgttcaaacacatcatggccacttcaatgaaagatgtggccttttcttaagaaaattgttaactt 400  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004665 ttgttgtaaggtaaggagtcatggctgatacctcatgttcaaacacatcatggccacttcaatgaaagatgtggccttttcttaagaaaattgttaactt 29004764  T
Q  401 at 402  Q
    ||    
T  29004765 at 29004766  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 47906148 - 47905956
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906148 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 47906049  T
Q  104 tatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906048 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 47905956  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 31735920 - 31736115
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31735920 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 31736019  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31736020 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccttccatcaaattttgagtcatactacaaca 31736115  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24325542 - 24325346
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325542 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcactttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 24325443  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325442 aaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 24325346  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 6 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 39931952 - 39931762
Alignment:
Q  6 aaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaata 105  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39931952 aaagaatatttgcatcaaaagtataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaata 39931853  T
Q  106 tattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39931852 tattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 39931762  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 15295244 - 15295440
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295244 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcgctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 15295343  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295344 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaacaa 15295440  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 48665044 - 48664852
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48665044 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatgtgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaa 48664945  T
Q  104 tatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48664944 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 48664852  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 9463648 - 9463840
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9463648 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcatacgatataaaaatatatttattgtccataaa 9463747  T
Q  104 tatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463748 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 9463840  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 17325032 - 17325228
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17325032 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattcccttgcaaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacggtacaaaaatatatttattgtccat 17325131  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17325132 aaatatattttcaactcaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 17325228  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27337337 - 27337532
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27337337 cagttaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 27337436  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27337437 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttatatatttttagcaacaatattccccatccatcaaatttggagtcatactacaaca 27337532  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Original strand, 6115532 - 6115718
Alignment:
Q  11 atatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115532 atatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtcattcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattt 6115631  T
Q  111 tcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaa-ttttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6115632 tcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttttgagtcatcctacaaca 6115718  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 9459821 - 9460013
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9459821 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaattgttcttcatacggtataaaaatatatttattgtccataaa 9459920  T
Q  104 tatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459921 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 9460013  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 2949620 - 2949818
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2949620 cagtgaaagaatatttgtatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccat 2949719  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  2949720 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatgaaattttgagtcatactataacaaat 2949818  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27339531 - 27339730
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27339531 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 27339630  T
Q  101 aa----atatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27339631 aaatatatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccgtcaaatttggagtcatactacaaca 27339730  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 196
Target Start/End: Original strand, 45693834 - 45694024
Alignment:
Q  6 aaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaata 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45693834 aaagaatatttgcataaaaaatatattattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaata 45693933  T
Q  106 tattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  45693934 tatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgaatcatagtacaaca 45694024  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 4131690 - 4131887
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttatt-gtccataa 102  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4131690 tgaaagaatatttgcatcaaaa-tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttatttgtccataa 4131788  T
Q  103 atatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaataa 201  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4131789 atatatgttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacacataa 4131887  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 169
Target Start/End: Original strand, 21948590 - 21948756
Alignment:
Q  3 gtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948590 gtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataa 21948689  T
Q  103 atatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatc 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21948690 atatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatc 21948756  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 197 - 398
Target Start/End: Original strand, 29011672 - 29011872
Alignment:
Q  197 aataataacaaaattcaaaacatgatttctgctttagaaaaaatcgtgatataagtgtgctagccttgaaacttggcagtagtagtataatcaatcattc 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||| ||| |||||    
T  29011672 aataataacaaaattcaaaa-atgatttctgctttagaaaaattcataatataagtgtgctagccttggaacttaacagtaatagtataagcaaccattc 29011770  T
Q  297 tttgttgttttaaggtaaggagtcatggctgatacctcatgttcaaacacatcatggccacttcaatgaaagatgtggccttttcttaagaaaattgtta 396  Q
    |||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29011771 tttgttattgtcaggtaaggagtcatggttgatacctcatgctcaaacacctcatggccacttcaatggaagatgtggcctttgcttaagaaaattgtta 29011870  T
Q  397 ac 398  Q
    ||    
T  29011871 ac 29011872  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6997395 - 6997214
Alignment:
Q  8 agaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatata 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6997395 agaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaa------tttgcatcaaatcgttcttcatacggtataaaaatatatttattgtccataa-tata 6997303  T
Q  108 ttttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6997302 tttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactataaca 6997214  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 81 - 196
Target Start/End: Original strand, 46432521 - 46432636
Alignment:
Q  81 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46432521 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 46432620  T
Q  181 gagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||    
T  46432621 gagtcatactacaaca 46432636  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6996218 - 6996067
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6996218 cagtgaaagaatatttgcaacaaaaatataatattccctttcaa------tttacatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatgtattgtccat 6996125  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaa 158  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  6996124 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaagtcttttatatttttagcaacaa 6996067  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 43 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16561284 - 16561131
Alignment:
Q  43 aaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatctttt 142  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16561284 aaaatatatttgtttcaaatattccttcatacggtacaaaaagatatttattgtcaataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatatttt 16561185  T
Q  143 atagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  16561184 atatttttagcaacaatattcttcatccaacaaattttgaatcatacaacaaca 16561131  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Original strand, 46432124 - 46432207
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaa 84  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46432124 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaa 46432207  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 116
Target Start/End: Original strand, 11693580 - 11693666
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11693580 aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 11693666  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 13785662 - 13785835
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcag--------------- 114  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||                   
T  13785662 aatattccttttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttactatctataaatatattttcagcaacaatattctaga 13785761  T
Q  115 --cacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
      |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13785762 aacacaaaatatatttgaaacaaatctttcatatttttagcgacaatattctccatccatcaatttttgagtca 13785835  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 2510728 - 2510801
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatac 74  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2510728 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatac 2510801  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14352842 - 14352759
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  14352842 aatattccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttactattcataaatatattttca 14352759  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 32260883 - 32260746
Alignment:
Q  66 ccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca-----------------caaaatatattttaaacaaatcttttatagtt 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||                 ||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  32260883 ccttcatacggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagcaacaatcttctgaaaacacaaaatatattttaaacaattcttttatattt 32260784  T
Q  149 ttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  32260783 ttagcaacaatcttcttcatccatcaaattttgagtca 32260746  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Original strand, 26520521 - 26520580
Alignment:
Q  3 gtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 62  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26520521 gtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaat 26520580  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 6115488 - 6115541
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 57  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6115488 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcat 6115541  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 10115653 - 10115572
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 113  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10115653 aatattccgtttaaaaatatatttgcatcaaatattccttcatacgggataaaa--atatttattgtccataaatatattttca 10115572  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 186
Target Start/End: Original strand, 11693686 - 11693753
Alignment:
Q  119 aaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11693686 aaatatatttaaaacaaaatttttataattttagcaataatcttcttcatccatcaaattttgagtca 11693753  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 128
Target Start/End: Original strand, 13112047 - 13112098
Alignment:
Q  77 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13112047 tacaaaaatatatttattgtccatgaatatattttcagcataaaatacattt 13112098  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 157 - 196
Target Start/End: Original strand, 6997388 - 6997427
Alignment:
Q  157 aatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6997388 aatattctccatccatcatattttgagtcatactacaaca 6997427  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10115555 - 10115509
Alignment:
Q  113 agcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaat 159  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10115555 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttaacaacaat 10115509  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 196
Target Start/End: Original strand, 21964366 - 21964397
Alignment:
Q  165 ccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21964366 ccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 21964397  T

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Target: chr7 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 7094820 - 7095015
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094820 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 7094919  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094920 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 7095015  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3035610 - 3035415
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035610 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 3035511  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035510 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 3035415  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 7092573 - 7092768
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092573 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 7092672  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092673 aaatatatcttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 7092768  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11757120 - 11756925
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757120 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatagttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 11757021  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757020 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 11756925  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20299350 - 20299155
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299350 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 20299251  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299250 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 20299155  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 47865523 - 47865328
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47865523 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 47865424  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47865423 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcatactacaaca 47865328  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1849860 - 1849665
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849860 cagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 1849761  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849760 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaca 1849665  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 31156305 - 31156500
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31156305 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 31156404  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31156405 aaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaaca 31156500  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38396181 - 38395986
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38396181 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtacat 38396082  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38396081 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcatactacaaca 38395986  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 7470429 - 7470621
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470429 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 7470528  T
Q  104 tatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470529 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatgttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 7470621  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 7472382 - 7472574
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7472382 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatatgatacaataatatatttattgtccataaa 7472481  T
Q  104 tatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472482 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 7472574  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20625929 - 20625733
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20625929 cagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 20625830  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20625829 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactagaacaa 20625733  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20629820 - 20629624
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629820 cagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 20629721  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20629720 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactagaacaa 20629624  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20642239 - 20642043
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642239 cagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 20642140  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20642139 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactagaacaa 20642043  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1606366 - 1606171
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606366 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 1606267  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1606266 aaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaca 1606171  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28487444 - 28487249
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28487444 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgatacaaaattatatttattgtccat 28487345  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487344 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaagcaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 28487249  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 28485454 - 28485261
Alignment:
Q  3 gtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataa 102  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485454 gtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataa 28485355  T
Q  103 atatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28485354 atatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgaatcatactacaaca 28485261  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 7352051 - 7352247
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7352051 cagtgaaagaatatttgcctcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccat 7352150  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7352151 aaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaacaa 7352247  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18345432 - 18345237
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  18345432 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccatttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtcaat 18345333  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345332 aaatatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 18345237  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 21470688 - 21470883
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21470688 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatattcgcatcaaatcgttcttcatacgatataaaaatatatttattgtccat 21470787  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21470788 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcaaactacaaca 21470883  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 37412521 - 37412717
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  37412521 cagtggaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacgttacataattatatttattgtccat 37412620  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37412621 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 37412717  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 7349672 - 7349867
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7349672 cagtgaaagaatatttgcctcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatgcgatacaaaaatatatttattgtccat 7349771  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7349772 aaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaaca 7349867  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38393878 - 38393683
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38393878 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataacattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 38393779  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  38393778 aaataaattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttatatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttagaatcatactacaaca 38393683  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21990046 - 21989852
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21990046 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccat 21989947  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21989946 aaatatattttca--acacaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgggtcatactacaacaa 21989852  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 42331401 - 42331593
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  42331401 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatacttattgtccataaa 42331500  T
Q  104 tatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  42331501 tatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcattcatcaaattttaagtcatactacaaca 42331593  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 24258352 - 24258166
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24258352 cagtgaaagaatatttacatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaa-tcgtccttcatactgtacaaaaatatatttattgtccat 24258254  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcata 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24258253 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcata 24258166  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 48 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 443474 - 443326
Alignment:
Q  48 atatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagt 147  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  443474 atatttgcatcaaattgttcttcagacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatt 443375  T
Q  148 tttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  443374 tttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 443326  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3677173 - 3676996
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||                
T  3677173 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatata------------ 3677086  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
           ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3677085 -------ttttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatctatcaaattttgagtcatactacaacaa 3676996  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 13099870 - 13099996
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13099870 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgtatcaaatcgttcttcatacggtacgaaaatatatttattgtccat 13099969  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatatt 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  13099970 aaatatattttcagcacaaaatatatt 13099996  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 43253920 - 43254035
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43253920 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 43254019  T
Q  101 aaatatattttcagca 116  Q
    ||||||||||| ||||    
T  43254020 aaatatatttttagca 43254035  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 40281824 - 40281989
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttt 129  Q
    |||||||| ||| |||||||||  | |||||||  || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  40281824 aatattccttttaaaaatatatccgtatcaaatattctttcatacggtacaaaaatatatttattttccataaatatattttcaacacaaaatatatttg 40281923  T
Q  130 aaacaaatcttttatagttttagcaacaa--tattctccatccatcaaattttgagtcatactaca 193  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40281924 aaacaaatattttatatttttagcaacaaattcttcttcatccatcaaattttgagtcatactaca 40281989  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 3 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 20297252 - 20297163
Alignment:
Q  3 gtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatattta 92  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20297252 gtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatattta 20297163  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10690854 - 10690684
Alignment:
Q  21 aaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataa------atatattttcag 114  Q
    |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||  ||| | | |||||||||||||||||||| |||||      || | ||   ||    
T  10690854 aaaatataaaatattccttttaaaaatatatttgcatcaaatattctgtcacatggtacaaaaatatatttattgtacataagcaacaattttttgaaag 10690755  T
Q  115 cacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  10690754 cacaaaatatatttgaaacata-cttttatatttttagcaacaatcttctccctccatcaaattttgagtca 10690684  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20297161 - 20297108
Alignment:
Q  133 caaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297161 caaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 20297108  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 30 - 116
Target Start/End: Original strand, 12310442 - 12310528
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||    
T  12310442 aatattccttttaaaaatatatttacatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattaactgtccttaagtataatttcagca 12310528  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 188
Target Start/End: Original strand, 43254023 - 43254069
Alignment:
Q  142 tatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcata 188  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43254023 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagacata 43254069  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 116
Target Start/End: Original strand, 12484976 - 12485023
Alignment:
Q  69 tcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  12484976 tcatacgatacaaaaatatatttgctatccataaatatattttcagca 12485023  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 116
Target Start/End: Original strand, 12506407 - 12506454
Alignment:
Q  69 tcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  12506407 tcatacgatacaaaaatatatttgctatccataaatatattttcagca 12506454  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 179
Target Start/End: Original strand, 12310542 - 12310608
Alignment:
Q  113 agcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattt 179  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  12310542 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatcagtagcaacaatcttcttcatccattaaattt 12310608  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 116
Target Start/End: Original strand, 12657600 - 12657647
Alignment:
Q  69 tcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  12657600 tcatacgatacaaaaatatatttgctatccatgaatatattttcagca 12657647  T

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Target: chr5 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25803902 - 25803707
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803902 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 25803803  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25803802 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 25803707  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18468893 - 18468698
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468893 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 18468794  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18468793 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaaaaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 18468698  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27912414 - 27912219
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912414 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtttttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 27912315  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912314 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 27912219  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27910330 - 27910135
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27910330 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccat 27910231  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910230 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 27910135  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 3373435 - 3373630
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373435 cagtgaaaaaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 3373534  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3373535 aaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattctgagtcatactacaaca 3373630  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15552120 - 15551925
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552120 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatgtcatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 15552021  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552020 aaatatatcttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 15551925  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 18511607 - 18511800
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18511607 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccat 18511706  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511707 aaatatattttcagcacaaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaa 18511800  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 18509712 - 18509904
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18509712 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccat 18509811  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaca 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509812 aaatatattttcagcacaaaatatattcgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaca 18509904  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 26098649 - 26098841
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 103  Q
    ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26098649 tgaaagaatttttgtatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttattgtccataaa 26098748  T
Q  104 tatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26098749 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 26098841  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10586724 - 10586549
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586724 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 10586625  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaa 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10586624 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattccccatccatcaaa 10586549  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 26097618 - 26097421
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctt--tcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtcc 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26097618 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataacatttccttcttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtcc 26097519  T
Q  99 ataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26097518 ataaatatattttcagtacaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 26097421  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21288713 - 21288528
Alignment:
Q  13 atttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgataca-aaaatatatttattgtccataaatatatttt 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21288713 atttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcataaaatcgttcttcatacggtaccgaaaatatatttattgtccataaatatatttt 21288614  T
Q  112 cagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21288613 cagcacaaaatatattttaaacaaatcttttttatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagttatactacaacaa 21288528  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18596532 - 18596325
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttat------- 93  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||           
T  18596532 cagtgatagaatatttgtatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttatggtatat 18596433  T
Q  94 ----tgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatac 189  Q
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18596432 ttattgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatag 18596333  T
Q  190 tacaacaa 197  Q
    ||||||||    
T  18596332 tacaacaa 18596325  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 189
Target Start/End: Original strand, 17415748 - 17415893
Alignment:
Q  44 aaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatctttta 143  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17415748 aaatatatttgcatcaaattttccttcatacagtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatctttta 17415847  T
Q  144 tagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatac 189  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17415848 tatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatac 17415893  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 18466567 - 18466453
Alignment:
Q  2 agtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccata 101  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466567 agtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccata 18466468  T
Q  102 aatatattttcagca 116  Q
    |||||||||| ||||    
T  18466467 aatatatttttagca 18466453  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 92 - 197
Target Start/End: Original strand, 6661929 - 6662034
Alignment:
Q  92 attgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatacta 191  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  6661929 attgtccataaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaagttttaagtcatacta 6662028  T
Q  192 caacaa 197  Q
    ||||||    
T  6662029 caacaa 6662034  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 15143348 - 15143262
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15143348 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatgtatttattgtccataaatatatttttagca 15143262  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40221361 - 40221282
Alignment:
Q  117 caaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  40221361 caaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatcaattaaattttgagtcatactacaaca 40221282  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18466465 - 18466411
Alignment:
Q  142 tatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466465 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 18466411  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15143274 - 15143218
Alignment:
Q  142 tatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaa 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15143274 tatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactataacaaa 15143218  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 40221402 - 40221340
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatc 63  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40221402 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttgaaacaaatc 40221340  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Original strand, 5779144 - 5779217
Alignment:
Q  113 agcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||||    
T  5779144 agcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaataatcttcttcatctatcaaattttaagtca 5779217  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 72
Target Start/End: Original strand, 6661594 - 6661636
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcat 72  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  6661594 aatattccctttcaaaatatatttacttcaaatcttccttcat 6661636  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 43 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 32520316 - 32520241
Alignment:
Q  43 aaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatata--tttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    ||||||| ||||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||    
T  32520316 aaaatatgtttgcatcaaatttttcttcgtacggtacaaaaatatatttttactctacataaatatattttcagca 32520241  T

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Target: chr3 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 746617 - 746422
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746617 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 746518  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  746517 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 746422  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25533302 - 25533107
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533302 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 25533203  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533202 aaatatattttcagcaaaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 25533107  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 4104288 - 4104493
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104288 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 4104387  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaata 200  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  4104388 aaatatattttcagcataaagtatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaacaattc 4104487  T
Q  201 ataaca 206  Q
    ||||||    
T  4104488 ataaca 4104493  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 455768 - 455572
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  455768 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccac 455669  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455668 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattccccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 455572  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 458145 - 457950
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  458145 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccac 458046  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458045 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattccccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 457950  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 10621932 - 10622127
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621932 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 10622031  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10622032 aaatatatcttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 10622127  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41848999 - 41848804
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41848999 cagttaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccttttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 41848900  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41848899 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 41848804  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 53915887 - 53916082
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53915887 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccat 53915986  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53915987 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccctcaaattttgagtcatactacaaca 53916082  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 42992148 - 42991953
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42992148 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccat 42992049  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992048 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaaccttttatatttttaacaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 42991953  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1313277 - 1313081
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  1313277 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacagaaatatatttattgtccat 1313178  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1313177 aaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcatttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 1313081  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 42990147 - 42989954
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990147 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 42990048  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 194  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990047 aaatatactttcagcaaaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 42989954  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 51943234 - 51943042
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 103  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51943234 tgaaagaatatttacatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcattcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaa 51943135  T
Q  104 tatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943134 tatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaaca 51943042  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27636017 - 27636212
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27636017 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccat 27636116  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  27636117 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaactaatattttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaaatcatactacaaca 27636212  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Original strand, 53918058 - 53918251
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  53918058 tgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtaaaaaaatatatttattgtccataaa 53918157  T
Q  104 tatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53918158 tatatgttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactataacaa 53918251  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 122 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6561687 - 6561613
Alignment:
Q  122 tatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6561687 tatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaatttcgagtcatactacaaca 6561613  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 11066429 - 11066346
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 113  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11066429 aatattctctttaaaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtaaaaaaatatatttattgtccataaatgtattttca 11066346  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Original strand, 53974124 - 53974197
Alignment:
Q  113 agcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  53974124 agcacaaaatataattgaaacaaatcttttatatttttaacaacaacattcttcatccatcaaattttgagtca 53974197  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 113
Target Start/End: Original strand, 54287487 - 54287559
Alignment:
Q  41 tcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  54287487 tcaaaatatatttgcatcaaatattccttcatacagtacaaaaatgtatttattatccataaatatattttca 54287559  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 111
Target Start/End: Original strand, 53974011 - 53974077
Alignment:
Q  46 atatatttgcatcaaatcgtcctt-catacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatttt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  53974011 atatatttgcatcaaatcttcctttcatacggtacaaaaatatatttattgtctataaatatatttt 53974077  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11072801 - 11072644
Alignment:
Q  46 atatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttc-----------------agcacaaaatatattt 128  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||                 ||||||| ||||||||    
T  11072801 atatatttgcatcaaatcttccgtaatacggtacaaaaatctatttgttgtccataaatgtattttcagcaacaatcttctggaagcacaagatatattt 11072702  T
Q  129 taaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
     ||||||||| |||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11072701 gaaacaaatcatttatattttttgcaacaatcttcttcatccatcaaattttgagtca 11072644  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 11066329 - 11066255
Alignment:
Q  113 agcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagtttt-agcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11066329 agcacaagatatatttgaaacaaatcatttatcttttttagcaacaatattcttcatccatcaaattatgagtca 11066255  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 27000123 - 27000082
Alignment:
Q  156 caatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27000123 caatattctccatccatcaaattttcagtcatactacaacaa 27000082  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 164
Target Start/End: Original strand, 54287576 - 54287627
Alignment:
Q  113 agcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattct 164  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  54287576 agcacgaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatcttct 54287627  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 69 - 116
Target Start/End: Original strand, 5535882 - 5535929
Alignment:
Q  69 tcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  5535882 tcatacgatacaaatatatcttttctgtccataaatatattttcagca 5535929  T

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Target: chr6 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 19704970 - 19705168
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704970 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 19705069  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19705070 aaatatattttcagcacaaaatatctttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaacaaat 19705168  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 5275733 - 5275928
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5275733 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 5275832  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5275833 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 5275928  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18317946 - 18317750
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18317946 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 18317847  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18317846 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccttcaaattttgagtcatactacaacaa 18317750  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 2629284 - 2629479
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629284 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 2629383  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629384 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtcatactacaaca 2629479  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 12195909 - 12196104
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195909 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 12196008  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12196009 aaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaaca 12196104  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 26932963 - 26933160
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932963 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 26933062  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaa 198  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26933063 aataatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaacaaa 26933160  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 30035001 - 30035197
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30035001 cagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcattaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtctat 30035100  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30035101 aaatatatttttagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 30035197  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 30967118 - 30966923
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30967118 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcgctttcaaaatatatttgcattaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccat 30967019  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30967018 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaataaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttggagtcatactacaaca 30966923  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17011971 - 17011781
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17011971 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccatcatacggtacaaaaatatatttattgtccat 17011872  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 194  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17011871 aaatatattttctacacaaa--atatttaaaacaaa-cttttatatttttagcaataatattcttcatccatcaaattttaagtcatactacaa 17011781  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17852461 - 17852266
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17852461 cagtgaaataatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatagttcttcataaggtacaaaaatatatttattgtccat 17852362  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagca--acaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17852361 aaatatattttcagcataaa--atatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacacaatattctccat-catcaaattttgagtcatatttcaacaa 17852266  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Original strand, 22858373 - 22858536
Alignment:
Q  33 attccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaa 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  22858373 attccctttcaaaatatatttgcatctaatcttctttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaagtatatttaaaa 22858472  T
Q  133 caaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22858473 caaatcttttatatttttattaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaaca 22858536  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20526708 - 20526548
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaa-tatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattt 128  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20526708 aatattctctttcaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatgta-----cataaatatattttcagcataaaatatattt 20526614  T
Q  129 taaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaa 194  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20526613 gaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcacccatcaaattttgagtcatactacaa 20526548  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 30445404 - 30445318
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30445404 aatattcctttttaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatggtacaaaaatatatttattgttcataaatatattttcagca 30445318  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 30443195 - 30443111
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    |||||| | ||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30443195 aatatttcttttaaaaatacatttgcatcaaatcttcctttatacggtacaaacatatatt--ttgtccataaatatattttcagca 30443111  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 30445304 - 30445243
Alignment:
Q  113 agcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatca 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  30445304 agcacaaaatatatttgaaacaaatattttatatttctagcaacaatattcttcatccatca 30445243  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30443092 - 30443022
Alignment:
Q  118 aaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatc--aaattttgagtca 186  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  30443092 aaaatatatttgaaacaaatctcttatatttttaacaacaatattcttcatccatcataaattttgagtca 30443022  T

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Target: chr8 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43530066 - 43529871
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43530066 cagtgaaagaatattagcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccat 43529967  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43529966 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 43529871  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15809157 - 15808961
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809157 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 15809058  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15809057 aaatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaaaacaa 15808961  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 28283618 - 28283813
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283618 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcactttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 28283717  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28283718 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaaaaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 28283813  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 3873946 - 3873748
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtc-cttcatacgatacaaaaatatatttattgtcca 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873946 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtcca 3873847  T
Q  100 taaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaa 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3873846 taaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaa 3873748  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 608665 - 608470
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608665 cagtgaaagaatatttgcataaaatatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 608566  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  608565 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccatcaaattttgagtgatactacaaca 608470  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41384684 - 41384493
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41384684 tgaaagaatatttgcataaaaa-tataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccataaa 41384586  T
Q  104 tatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384585 tatattttcagtataaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 41384493  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41382614 - 41382420
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41382614 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttgttcatacggtacaaaaatatatttattgtccat 41382515  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaac 195  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41382514 aaatatattttcagtataaaatatattcgaaacaaatcttttatatttttaacaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaac 41382420  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32339252 - 32339094
Alignment:
Q  38 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32339252 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaat 32339153  T
Q  138 cttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339152 cttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 32339094  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 196
Target Start/End: Original strand, 3265635 - 3265752
Alignment:
Q  79 caaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaatt 178  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3265635 caaacatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatt 3265734  T
Q  179 ttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3265735 ttgagtcatactacaaca 3265752  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 116
Target Start/End: Original strand, 11701364 - 11701447
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||   ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11701364 aatattccctttaaaaatatatttacatcaattcttcc---atacggtacaaaaatatatttactgaccataaatatattttcagca 11701447  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 115 - 186
Target Start/End: Original strand, 13986304 - 13986374
Alignment:
Q  115 cacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  13986304 cacaaaatatatttaaaacaaatcttt-atatttttagcaacaatcttcttcatccataaaattttgagtca 13986374  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 181477 - 181434
Alignment:
Q  2 agtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaa 45  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  181477 agtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaa 181434  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 113
Target Start/End: Original strand, 13986214 - 13986285
Alignment:
Q  42 caaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 113  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  13986214 caaaatatatttgcatcaaatcttctttcatgcggtacaaaaatttattaactatccataaatatattttca 13986285  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 186
Target Start/End: Original strand, 30679186 - 30679256
Alignment:
Q  115 cacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30679186 cacaaaatatatctaaaacaaatcttttttatttttaccaaca-tattcttcatccatcaaattttgagtca 30679256  T

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Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 22132792 - 22132987
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132792 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 22132891  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22132892 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgaatcatactacaaca 22132987  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 22135024 - 22135219
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135024 cagtgaaagaatatttgaatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 22135123  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22135124 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 22135219  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 56030384 - 56030188
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56030384 cagtgaaagaatatttgcaccaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccat 56030285  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56030284 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 56030188  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5100938 - 5100743
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  5100938 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttgttgtccat 5100839  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5100838 aaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 5100743  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24348153 - 24347957
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24348153 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacaatacaaaaatatatttattgtccat 24348054  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaa 198  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348053 aaatatattttc-gcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaa 24347957  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 44600233 - 44600429
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44600233 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattcccttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 44600332  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44600333 aaatatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaatttttgagtcatactacaacaa 44600429  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 17662631 - 17662830
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17662631 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcgtacggtacaaaaatatatttattgtccat 17662730  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17662731 aaatatattttcagcacaaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttgtagtcatactacaacaaata 17662830  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 14787826 - 14788021
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14787826 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttattgtccat 14787925  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787926 aaatatattttcaccacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 14788021  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30136507 - 30136331
Alignment:
Q  4 tgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaa 103  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30136507 tgaaagaatatttgaatcaaaaatataatattctcttttaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaaaatatatttattgtccataaa 30136408  T
Q  104 tatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 180  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30136407 tatattttcagcacaatatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccattcatcaaatttt 30136331  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 46 - 197
Target Start/End: Original strand, 47211158 - 47211309
Alignment:
Q  46 atatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttata 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47211158 atatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttgagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttata 47211257  T
Q  146 gttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47211258 tttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaagtcatactacaacaa 47211309  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 2 - 200
Target Start/End: Original strand, 38890524 - 38890705
Alignment:
Q  2 agtgaaagaatatttgcataaaaaatataatatt-ccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38890524 agtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacaatacaaaaatatatttattgtccat 38890623  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaata 200  Q
    |                  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38890624 a------------------aatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatgctacaacaaata 38890705  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10112787 - 10112626
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttt 129  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  10112787 aatattctctttcaaa-tatatttacatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatagtttcagcacaaaatatatttg 10112689  T
Q  130 aaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||    |||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  10112688 aaac----cttttatatttttagcaacaatattcttcattcaacaaattttaagtcatactacaaca 10112626  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 9022225 - 9022058
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttt 129  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  9022225 aatattcccttttaaaatatatttgcatcaaatctttcttcatacggtagaaaaatatatttattgtc-ataaatatattttcagcaaaaaatatatttg 9022127  T
Q  130 aaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaa 198  Q
    ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9022126 aaacaaatcatttatattttcaacaacaatatttctcatccataaaattttgaatcatactacaacaaa 9022058  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 9863650 - 9863499
Alignment:
Q  42 caaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttt 141  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||    
T  9863650 caaaatatatttgcatcaaatcttccttcatgc---acaaaaatatatttattgttcataaatatatttttagcacaaaatatgtttgaaacaaatcatt 9863554  T
Q  142 tatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||| |||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9863553 tatatttttagtaacaatatatttcatccaacaaattttgagtcatattacaaca 9863499  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19322510 - 19322410
Alignment:
Q  95 gtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagc-aacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaca 193  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19322510 gtccataaatatattttcagtataaaatatatttaaaacaaatcttttatatttttagcaaaaaatattctccatccatcaaattttgagtcatactaca 19322411  T
Q  194 a 194  Q
    |    
T  19322410 a 19322410  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 19322635 - 19322547
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatat 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  19322635 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtcctttatacagtacaaaaatatat 19322547  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 38209098 - 38209259
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaa-atatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttat--tgtccataaatatattttc--agcacaaaatat 124  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  | || | ||  || || |   ||||||||||||    
T  38209098 aatattccttttcaaatatatatttgcatcaaatcttccttcatacagtacaaaaatatatttatattttcaacaacaatcttcttgaagcacaaaatat 38209197  T
Q  125 attttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  38209198 atttaaaacaaatcttttatatttttaacaacaatatttttcatccatcaaattttgagtca 38209259  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 116
Target Start/End: Original strand, 54929094 - 54929180
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54929094 aatattcctattaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatattttttgtccataaatatattttcagca 54929180  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 10979755 - 10979676
Alignment:
Q  37 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10979755 cctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacagcacaaaaatatatttgttgtccataaatatattttcagca 10979676  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 196
Target Start/End: Original strand, 14789500 - 14789571
Alignment:
Q  125 attttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14789500 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaaca 14789571  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 53405064 - 53405001
Alignment:
Q  2 agtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgt 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53405064 agtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatttttcctttcaaaatatatttgcatcaaatcgt 53405001  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 180
Target Start/End: Original strand, 5516771 - 5516833
Alignment:
Q  118 aaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 180  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5516771 aaaatatatttgaaacaattcatttatatttttagcaacaatattctccattcatcaaatttt 5516833  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 113
Target Start/End: Original strand, 29609838 - 29609897
Alignment:
Q  54 gcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  29609838 gcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttactcttcataaatatattttca 29609897  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 182
Target Start/End: Original strand, 29609914 - 29609983
Alignment:
Q  113 agcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 182  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29609914 agcacaaaatatatttgaaaaaaatcaagaatacttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttga 29609983  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 111
Target Start/End: Original strand, 5516701 - 5516747
Alignment:
Q  65 tccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatatttt 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  5516701 tccttcatacgataaaaaaatatatttattatctataaatatatttt 5516747  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 186
Target Start/End: Original strand, 54929198 - 54929267
Alignment:
Q  115 cacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||    
T  54929198 cacaaaatacatttaaatcaaatcttttatatttttagcaacaatattat--ttccatcaaattttaagtca 54929267  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 116
Target Start/End: Original strand, 14647175 - 14647214
Alignment:
Q  77 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14647175 tacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 14647214  T

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Target: chr2 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 23452634 - 23452829
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452634 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 23452733  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452734 aaatttattttcagcataaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 23452829  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42452644 - 42452448
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452644 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 42452545  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42452544 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttaagtcatactacaacaa 42452448  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 35218370 - 35218567
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218370 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgatacaaaaatatatttattgtccat 35218469  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218470 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaacaaa 35218567  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 35215989 - 35216184
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215989 cagtgaaagaatatctgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacgatacaaaaatatatttattgtccat 35216088  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35216089 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaaca 35216184  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 42923899 - 42924094
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42923899 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatatttcttttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccat 42923998  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42923999 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 42924094  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Original strand, 28568584 - 28568740
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||     
T  28568584 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcacacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcaaaacaaaatatatttg 28568683  T
Q  130 aaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28568684 aaacaaatcttttatagttttagcaacaatattcttcatctatcaaattttgagtca 28568740  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Original strand, 27583741 - 27583907
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttt 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  27583741 aatattccttttcaaaatatatttgcatcaaatattccttcatatggtataaaaatatatttattgttcataaatatatcttcagcacaaaatatatttg 27583840  T
Q  130 aaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27583841 aaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaaatttgagtcatactacaaca 27583907  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 66 - 197
Target Start/End: Original strand, 27136367 - 27136506
Alignment:
Q  66 ccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatat--------attttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaaca 157  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27136367 ccttcatacggtacaaaaatatatttattttccataaatatatttatatattttcaacacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcacca 27136466  T
Q  158 atattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27136467 atattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 27136506  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 101 - 189
Target Start/End: Original strand, 34575608 - 34575696
Alignment:
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatac 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34575608 aaatatattttcagcacaaaatatatttagaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagtcatac 34575696  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15693755 - 15693583
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttc----------------- 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||                     
T  15693755 aatatcccctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacggtacaaaaatatatttattgcccataaatatattttcagcaacaagtttttgga 15693656  T
Q  113 agcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  15693655 agcacaaaatatatttgaaacaaatc-tttatatttttagcaacaatattattcatccatcaaattttaagtca 15693583  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 7502723 - 7502638
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagc 115  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7502723 aatatttcctttaaaaatatatttgcatcaaatcttctgtcatacaatacaaaaatatttttattgttcataaatatattttcagc 7502638  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 39287042 - 39286971
Alignment:
Q  45 aatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39287042 aatatatttgcatcaaatcttcattcatatggtacaaaaatatatttattgtccataaatatattttaagca 39286971  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 186
Target Start/End: Original strand, 41303457 - 41303623
Alignment:
Q  38 ctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttc-----------------agcacaaa 120  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||                 ||||||||    
T  41303457 ctttaaaaatatatttgaatcaattcttccttcacacggtacaaaattatatttactgtccataaatatattttcagcaacaatcttatggaagcacaaa 41303556  T
Q  121 atatattttaaacaaatcttttata-gttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  41303557 atatatttgaaacaaatcttttatattttttagcaacaatcttcttcatccatcaaattctgagtca 41303623  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28568411 - 28568346
Alignment:
Q  121 atatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28568411 atatatttgaaacaaatcttttatatttttaacaacaatattcttcatccatcaaattttgagtca 28568346  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 116
Target Start/End: Original strand, 41304806 - 41304884
Alignment:
Q  37 cctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  41304806 cctttaaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatatg-tacaaaaatatatttactatccataaatatattgtcagca 41304884  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 91
Target Start/End: Original strand, 34575556 - 34575617
Alignment:
Q  30 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatattt 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||||||||||||||    
T  34575556 aatattccctttcaaaatatatttgcatcaaattttcctttatatggtacaaaaatatattt 34575617  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 7502633 - 7502582
Alignment:
Q  132 acaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgag 183  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  7502633 acaaatcttttatactttgagcaacaatcttcttcatccatcaaattttgag 7502582  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 118 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 39286952 - 39286892
Alignment:
Q  118 aaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttga 182  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |    |||||||||||||||||    
T  39286952 aaaatatatttgaaacaaatcatttatatttttagcaacaatct----catccatcaaattttga 39286892  T

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Target: scaffold0511 (Bit Score: 173; Significance: 7e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1930 - 1734
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1930 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcttccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 1831  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1830 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattcttcttccttcaaattttgagtcatactacaacaa 1734  T

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Target: scaffold0154 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 11866 - 12062
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11866 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacggtacaaaaatatatttattgtccat 11965  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaacaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11966 aaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaattttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgaatcatactacaacaa 12062  T

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Target: scaffold0005 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 51904 - 51709
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51904 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttctttatacggtacaaaaatatatttattgtccat 51805  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51804 aaatatattttcaccacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 51709  T

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Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 125 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 50230 - 50159
Alignment:
Q  125 attttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50230 atttgaaacaaatcttttatatttttagcaacattattcttcatccatcaaattttgagtcatactacaaca 50159  T

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Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 77 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 170115 - 170076
Alignment:
Q  77 tacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagca 116  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  170115 tacaaaaatatatttgttgtccatgaatatattttcagca 170076  T

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Target: scaffold0031 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 79078 - 78883
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  79078 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattccctttcaaaatatatttgcatcaaatcgttcttcatacagtacaaaaatatatttattatccat 78979  T
Q  101 aaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  78978 aaatatatttttagcagaaaatatatttgagacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttaagtcatactacaaca 78883  T

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Target: scaffold0468 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 81 - 195
Target Start/End: Original strand, 2070 - 2184
Alignment:
Q  81 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2070 aaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaatttt 2169  T
Q  181 gagtcatactacaac 195  Q
    |||||||||||||||    
T  2170 gagtcatactacaac 2184  T

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Target: scaffold0468; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 2028 - 2080
Alignment:
Q  1 cagtgaaagaatatttgcataaaaaatataatattccctttcaaaatatattt 53  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2028 cagtgaaagaatatttgcatcaaaaatataatattctctttcaaaatatattt 2080  T

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Target: scaffold0133 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 48 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4694 - 4546
Alignment:
Q  48 atatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagt 147  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |    
T  4694 atatttgcatcaaattgtccttcatacagtacaaaaatatatatattgtccataaatatattttcagcacgaaatatattcgaaacaaatcttttatatt 4595  T
Q  148 tttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4594 tttagcaacaatattcttcatccatcaaattttgagttatactgcaaca 4546  T

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Target: scaffold1674 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 196
Target Start/End: Original strand, 1 - 95
Alignment:
Q  102 aatatattttcagcacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 aatatattttcagcacaaaatatatttgaaacaaatcttttatatttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtcatactacaaca 95  T

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Target: scaffold0016 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 273 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 33265 - 33151
Alignment:
Q  273 cagtagtagtataatcaatcattctttgttgttttaaggtaaggagtcatggctgatacctcatgttcaaacacatcatggccacttcaatgaaagatgt 372  Q
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T  33265 cagtagtagtataatcaatcattctttgttgttgtaagataaggagtcatggctgatacct---------------catggccacttcaatgaaagatgt 33181  T
Q  373 ggccttttcttaagaaaattgttaacttat 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33180 ggccttttcttaagaaaattgttaacttat 33151  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 113
Target Start/End: Original strand, 57836 - 57905
Alignment:
Q  43 aaaatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatatttattgtccataaatatattttca 113  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  57836 aaaatatatttgcatcaaattttc-ttcatacggtacaaaaatatatttattgttcatacatatattttca 57905  T

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Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 186
Target Start/End: Original strand, 57926 - 57995
Alignment:
Q  115 cacaaaatatattttaaacaaatcttttatagttttagcaacaatattctccatccatcaaattttgagtca 186  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||    
T  57926 cacaaaaaatatataaaacaaatcttttatacttttagaaaca--attcatcatccatcaaattttgagtca 57995  T

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Target: scaffold0533 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0533
Description:

Target: scaffold0533; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 92
Target Start/End: Original strand, 1971 - 2018
Alignment:
Q  45 aatatatttgcatcaaatcgtccttcatacgatacaaaaatatattta 92  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1971 aatatatttgtatcaaatattccttcatatgatacaaaaatatattta 2018  T

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