View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5259_high_3 (Length: 345)

Name: NF5259_high_3
Description: NF5259
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5259_high_3
NF5259_high_3
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (11-329)||(33342051-33342370)
chr6 (11-329)||(34164761-34165079)
chr6 (11-308)||(6027151-6027448)
chr6 (11-314)||(34166983-34167287)
chr6 (11-308)||(25421208-25421507)
chr6 (3-326)||(16653007-16653330)
chr6 (11-326)||(16554772-16555087)
chr6 (11-326)||(16631328-16631643)
chr6 (81-314)||(13153888-13154122)
chr6 (11-326)||(16578468-16578783)
chr6 (11-326)||(16616597-16616912)
chr6 (22-313)||(27647777-27648065)
chr6 (22-313)||(412016-412308)
chr6 (22-313)||(3072722-3073014)
chr6 (22-314)||(6097412-6097695)
chr6 (22-287)||(2171520-2171792)
chr6 (25-279)||(31404671-31404932)
chr6 (106-272)||(30834539-30834705)
chr6 (106-279)||(5406196-5406367)
chr6 (106-279)||(5410521-5410692)
chr6 (29-279)||(16452325-16452583)
chr6 (106-268)||(5413401-5413561)
chr6 (106-272)||(21588931-21589095)
chr6 (106-272)||(21593664-21593828)
chr6 (106-279)||(33160348-33160521)
chr6 (106-282)||(3808701-3808877)
chr6 (197-268)||(5409076-5409146)
chr6 (106-272)||(17762990-17763155)
chr6 (109-272)||(17758026-17758188)
chr6 (106-272)||(2972943-2973107)
chr6 (106-264)||(28137420-28137576)
chr6 (106-279)||(9183028-9183199)
chr6 (25-279)||(16568953-16569193)
chr6 (197-272)||(26830127-26830200)
chr6 (106-272)||(22424829-22424995)
chr6 (197-279)||(33211182-33211262)
chr6 (126-272)||(5043648-5043792)
chr6 (197-268)||(26800679-26800748)
chr6 (109-279)||(26954283-26954450)
chr6 (106-225)||(4045423-4045542)
chr6 (207-282)||(603082-603156)
[»] chr5 (43 HSPs)
chr5 (11-329)||(16546534-16546853)
chr5 (11-329)||(16544312-16544631)
chr5 (11-314)||(25078023-25078328)
chr5 (11-314)||(25135992-25136297)
chr5 (11-308)||(40379995-40380292)
chr5 (11-308)||(40382206-40382503)
chr5 (11-326)||(10593161-10593475)
chr5 (18-313)||(22536253-22536545)
chr5 (22-313)||(29751122-29751414)
chr5 (22-313)||(29720278-29720569)
chr5 (22-313)||(29722438-29722729)
chr5 (22-313)||(16409389-16409681)
chr5 (22-313)||(26177797-26178088)
chr5 (22-326)||(9789176-9789478)
chr5 (22-326)||(18441600-18441902)
chr5 (22-313)||(26170688-26170968)
chr5 (25-279)||(25412672-25412932)
chr5 (106-279)||(13343060-13343232)
chr5 (106-279)||(30182588-30182760)
chr5 (125-279)||(37439161-37439313)
chr5 (25-279)||(36074039-36074302)
chr5 (125-277)||(13239771-13239921)
chr5 (106-272)||(213465-213630)
chr5 (106-272)||(40147261-40147425)
chr5 (106-277)||(28278316-28278485)
chr5 (106-279)||(32636824-32636995)
chr5 (106-252)||(13695713-13695859)
chr5 (106-279)||(42428427-42428598)
chr5 (197-272)||(5058136-5058209)
chr5 (106-270)||(13488203-13488365)
chr5 (25-268)||(30682930-30683178)
chr5 (207-279)||(19806463-19806534)
chr5 (197-272)||(27637616-27637689)
chr5 (207-254)||(16640961-16641008)
chr5 (106-270)||(28750661-28750823)
chr5 (109-270)||(31182976-31183133)
chr5 (197-270)||(16452171-16452242)
chr5 (106-279)||(533769-533940)
chr5 (210-270)||(4160702-4160762)
chr5 (197-272)||(27015614-27015687)
chr5 (109-178)||(39468644-39468714)
chr5 (112-288)||(316769-316943)
chr5 (197-279)||(8565943-8566023)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (11-329)||(5138193-5138511)
chr4 (11-329)||(5135967-5136286)
chr4 (11-311)||(8395508-8395807)
chr4 (11-311)||(8393299-8393598)
chr4 (11-308)||(7124804-7125103)
chr4 (11-308)||(7122585-7122884)
chr4 (38-313)||(31495279-31495556)
chr4 (25-279)||(13992289-13992544)
chr4 (106-272)||(29999809-29999974)
chr4 (106-279)||(56178633-56178805)
chr4 (106-279)||(48143042-48143215)
chr4 (106-277)||(52095361-52095530)
chr4 (110-288)||(2209717-2209895)
chr4 (120-279)||(5370079-5370237)
chr4 (106-272)||(41964415-41964580)
chr4 (106-279)||(47038408-47038577)
chr4 (106-267)||(9927467-9927626)
chr4 (126-288)||(12119559-12119720)
chr4 (106-279)||(12739547-12739718)
chr4 (106-272)||(46703500-46703666)
chr4 (106-288)||(26364236-26364416)
chr4 (20-279)||(34570411-34570677)
chr4 (106-272)||(41639426-41639590)
chr4 (125-279)||(12743922-12744073)
chr4 (125-279)||(12745311-12745462)
chr4 (113-270)||(5207848-5208003)
chr4 (106-270)||(40632445-40632607)
chr4 (197-272)||(50673851-50673924)
chr4 (124-272)||(6655975-6656120)
chr4 (106-266)||(37229731-37229890)
chr4 (106-272)||(12073392-12073557)
chr4 (106-288)||(54883020-54883200)
chr4 (106-255)||(8665408-8665556)
chr4 (106-279)||(26175633-26175804)
chr4 (132-270)||(26699447-26699585)
chr4 (106-279)||(36463386-36463557)
chr4 (106-279)||(45687179-45687351)
chr4 (197-272)||(8648230-8648303)
chr4 (106-270)||(36994524-36994686)
chr4 (197-288)||(50262688-50262778)
chr4 (124-268)||(379399-379541)
chr4 (108-279)||(46147388-46147557)
chr4 (197-279)||(48893635-48893715)
chr4 (106-279)||(5429679-5429850)
chr4 (106-267)||(27416974-27417133)
chr4 (106-267)||(37740625-37740784)
chr4 (106-279)||(5871820-5871991)
chr4 (207-270)||(6542185-6542247)
chr4 (106-178)||(12747851-12747924)
chr4 (197-267)||(35662532-35662600)
chr4 (106-178)||(54200001-54200074)
chr4 (206-279)||(52467351-52467423)
chr4 (160-270)||(4588014-4588121)
chr4 (110-207)||(48142444-48142542)
chr4 (232-279)||(52082660-52082707)
chr4 (125-178)||(12744142-12744195)
chr4 (106-178)||(52082752-52082825)
chr4 (197-270)||(31474242-31474313)
chr4 (207-279)||(29254594-29254665)
chr4 (193-249)||(33089966-33090021)
chr4 (160-251)||(33989899-33989989)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (11-329)||(10056122-10056440)
chr3 (11-329)||(10058344-10058662)
chr3 (11-329)||(10060566-10060884)
chr3 (11-329)||(10062788-10063106)
chr3 (11-329)||(10065010-10065328)
chr3 (11-326)||(4598473-4598788)
chr3 (11-335)||(4600685-4601009)
chr3 (11-326)||(10211298-10211613)
chr3 (11-314)||(3617352-3617657)
chr3 (11-326)||(10209078-10209393)
chr3 (11-326)||(25637331-25637645)
chr3 (22-313)||(54635039-54635330)
chr3 (22-326)||(45282897-45283203)
chr3 (22-313)||(6716414-6716705)
chr3 (11-209)||(10067232-10067431)
chr3 (22-313)||(801005-801297)
chr3 (86-313)||(7779967-7780191)
chr3 (22-140)||(6718598-6718718)
chr3 (22-313)||(23200102-23200398)
chr3 (236-329)||(10067435-10067527)
chr3 (22-313)||(23197903-23198199)
chr3 (25-279)||(45095075-45095335)
chr3 (25-287)||(9636114-9636385)
chr3 (25-279)||(5258140-5258402)
chr3 (25-279)||(5260319-5260581)
chr3 (109-279)||(19683885-19684054)
chr3 (106-279)||(7762265-7762437)
chr3 (106-279)||(37408458-37408630)
chr3 (113-279)||(9581290-9581454)
chr3 (117-279)||(7764476-7764636)
chr3 (106-279)||(34491212-34491383)
chr3 (106-270)||(4569952-4570115)
chr3 (106-288)||(49199456-49199638)
chr3 (106-288)||(43401788-43401970)
chr3 (106-279)||(29196383-29196555)
chr3 (109-279)||(39153358-39153526)
chr3 (197-282)||(43403737-43403821)
chr3 (110-288)||(30236129-30236305)
chr3 (106-279)||(40734498-40734669)
chr3 (106-272)||(41819526-41819691)
chr3 (106-279)||(44331545-44331716)
chr3 (197-272)||(6095603-6095676)
chr3 (109-268)||(22835010-22835167)
chr3 (106-279)||(40735383-40735554)
chr3 (209-288)||(40913395-40913473)
chr3 (197-272)||(54593795-54593868)
chr3 (197-279)||(16499120-16499200)
chr3 (108-267)||(31314447-31314604)
chr3 (109-255)||(760850-760995)
chr3 (124-279)||(51398833-51398985)
chr3 (106-268)||(53921511-53921671)
chr3 (208-267)||(27305719-27305777)
chr3 (125-279)||(29813083-29813234)
chr3 (106-178)||(5236551-5236624)
chr3 (109-279)||(29682362-29682530)
chr3 (106-264)||(46860474-46860631)
chr3 (197-270)||(47304342-47304413)
chr3 (207-272)||(55301975-55302040)
chr3 (106-178)||(5433971-5434046)
chr3 (126-255)||(29810889-29811016)
chr3 (207-266)||(46173457-46173515)
chr3 (111-182)||(4055856-4055926)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (11-314)||(3687-3990)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (11-314)||(18392157-18392460)
chr7 (11-308)||(6594525-6594822)
chr7 (11-310)||(18388725-18389024)
chr7 (11-308)||(6592307-6592604)
chr7 (11-308)||(32060289-32060590)
chr7 (22-313)||(20343811-20344102)
chr7 (22-313)||(24789755-24790047)
chr7 (11-176)||(1562103-1562268)
chr7 (22-313)||(39731283-39731573)
chr7 (22-313)||(43504117-43504409)
chr7 (183-326)||(1560617-1560757)
chr7 (106-287)||(35853914-35854094)
chr7 (22-287)||(25766948-25767215)
chr7 (25-279)||(29990965-29991225)
chr7 (106-279)||(34310712-34310884)
chr7 (22-287)||(48408709-48408984)
chr7 (106-279)||(23555039-23555212)
chr7 (38-279)||(25615785-25616025)
chr7 (106-272)||(22269973-22270137)
chr7 (106-279)||(14069830-14070001)
chr7 (106-279)||(14379858-14380029)
chr7 (106-279)||(41317431-41317602)
chr7 (25-279)||(4178685-4178945)
chr7 (160-279)||(19502233-19502350)
chr7 (106-272)||(8359319-8359485)
chr7 (197-272)||(32358058-32358131)
chr7 (106-272)||(29608737-29608901)
chr7 (106-268)||(30024740-30024900)
chr7 (106-255)||(48491579-48491727)
chr7 (106-279)||(27347817-27347988)
chr7 (125-279)||(41649008-41649158)
chr7 (210-288)||(2390385-2390462)
chr7 (106-266)||(4253538-4253697)
chr7 (106-272)||(48599338-48599502)
chr7 (207-272)||(3259095-3259159)
chr7 (207-271)||(6432071-6432134)
chr7 (106-270)||(43864244-43864406)
chr7 (106-270)||(4586161-4586323)
chr7 (106-279)||(8153342-8153513)
chr7 (106-279)||(18126644-18126815)
chr7 (106-270)||(2360978-2361140)
chr7 (106-272)||(4508710-4508874)
chr7 (106-178)||(23343975-23344048)
chr7 (106-177)||(24525992-24526065)
chr7 (124-279)||(31732966-31733118)
chr7 (210-279)||(48489534-48489602)
chr7 (106-267)||(47673953-47674111)
chr7 (207-270)||(18396418-18396481)
chr7 (207-270)||(30814536-30814598)
chr7 (197-270)||(24525508-24525579)
chr7 (109-270)||(31105399-31105558)
chr7 (197-268)||(31518993-31519063)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (11-314)||(12647347-12647650)
chr2 (22-326)||(6266605-6266907)
chr2 (85-326)||(13655981-13656221)
chr2 (22-313)||(32289479-32289770)
chr2 (22-313)||(4484294-4484592)
chr2 (104-313)||(30833342-30833550)
chr2 (25-279)||(45099665-45099926)
chr2 (125-279)||(4503129-4503280)
chr2 (25-279)||(36205661-36205921)
chr2 (106-279)||(5723252-5723423)
chr2 (106-279)||(2334414-2334586)
chr2 (124-279)||(36988072-36988225)
chr2 (125-279)||(6595002-6595154)
chr2 (111-270)||(33648176-33648335)
chr2 (106-272)||(45726929-45727093)
chr2 (124-279)||(34139767-34139920)
chr2 (106-270)||(29867869-29868031)
chr2 (124-279)||(723741-723893)
chr2 (106-277)||(24398055-24398228)
chr2 (197-272)||(35446888-35446961)
chr2 (124-267)||(14633834-14633975)
chr2 (106-279)||(38312240-38312411)
chr2 (197-272)||(1631736-1631809)
chr2 (197-279)||(17057366-17057446)
chr2 (197-279)||(17085349-17085429)
chr2 (109-255)||(42362355-42362500)
chr2 (106-279)||(11151588-11151759)
chr2 (106-279)||(36773562-36773733)
chr2 (207-279)||(39284936-39285007)
chr2 (106-179)||(13121769-13121843)
chr2 (106-270)||(26353184-26353346)
chr2 (197-279)||(36318006-36318086)
chr2 (197-270)||(17490154-17490225)
chr2 (207-279)||(17450678-17450748)
chr2 (212-264)||(28672036-28672088)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (11-314)||(44203536-44203839)
chr1 (11-326)||(9036320-9036633)
chr1 (22-313)||(21053872-21054163)
chr1 (22-313)||(40282291-40282582)
chr1 (22-313)||(9987116-9987407)
chr1 (22-313)||(20622200-20622492)
chr1 (22-313)||(51765302-51765601)
chr1 (105-279)||(13316348-13316521)
chr1 (109-279)||(8550783-8550952)
chr1 (106-279)||(20762671-20762844)
chr1 (106-279)||(3189330-3189502)
chr1 (106-279)||(3198147-3198319)
chr1 (106-279)||(3206986-3207158)
chr1 (106-272)||(37168297-37168462)
chr1 (106-272)||(29136247-29136412)
chr1 (106-272)||(13547093-13547257)
chr1 (106-288)||(42297962-42298143)
chr1 (106-270)||(44455160-44455322)
chr1 (106-272)||(13549004-13549168)
chr1 (106-272)||(47255343-47255508)
chr1 (106-279)||(28220223-28220394)
chr1 (106-272)||(7482234-7482399)
chr1 (106-272)||(11348698-11348862)
chr1 (109-279)||(834164-834332)
chr1 (106-279)||(3156865-3157036)
chr1 (106-279)||(4552634-4552805)
chr1 (125-279)||(28265551-28265702)
chr1 (106-288)||(37033059-37033241)
chr1 (106-272)||(47115171-47115337)
chr1 (124-272)||(31925711-31925856)
chr1 (197-272)||(28242396-28242469)
chr1 (106-255)||(37503577-37503722)
chr1 (106-279)||(49918350-49918521)
chr1 (197-279)||(13659333-13659413)
chr1 (207-272)||(193711-193775)
chr1 (124-271)||(34603595-34603740)
chr1 (106-279)||(28223418-28223589)
chr1 (106-279)||(45644351-45644523)
chr1 (111-251)||(22079322-22079461)
chr1 (197-279)||(46065009-46065089)
chr1 (106-270)||(19754494-19754657)
chr1 (106-268)||(50169218-50169378)
chr1 (106-255)||(23555286-23555433)
chr1 (207-279)||(31659338-31659409)
chr1 (106-279)||(50167172-50167343)
chr1 (160-247)||(5459961-5460046)
chr1 (124-182)||(32736952-32737009)
chr1 (207-272)||(37876770-37876834)
chr1 (127-178)||(928071-928123)
chr1 (111-178)||(12318618-12318685)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (11-314)||(2565-2868)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (11-330)||(42575272-42575589)
chr8 (11-314)||(15290427-15290731)
chr8 (11-314)||(15470796-15471100)
chr8 (18-313)||(25689865-25690161)
chr8 (22-313)||(3439418-3439709)
chr8 (22-313)||(2627649-2627941)
chr8 (25-279)||(17982563-17982825)
chr8 (25-279)||(34254327-34254586)
chr8 (25-279)||(31218167-31218429)
chr8 (106-279)||(42498193-42498366)
chr8 (25-279)||(34256503-34256762)
chr8 (25-279)||(44303764-44304027)
chr8 (125-278)||(1746216-1746366)
chr8 (106-279)||(19945355-19945529)
chr8 (106-272)||(42434995-42435159)
chr8 (106-279)||(15212786-15212957)
chr8 (108-279)||(40321082-40321251)
chr8 (106-272)||(4283524-4283688)
chr8 (106-279)||(33352150-33352321)
chr8 (106-279)||(43036423-43036594)
chr8 (106-272)||(18655400-18655564)
chr8 (106-279)||(27811278-27811449)
chr8 (197-279)||(4743211-4743291)
chr8 (207-288)||(10930187-10930267)
chr8 (124-279)||(12702631-12702783)
chr8 (106-279)||(3303667-3303838)
chr8 (196-255)||(1345391-1345449)
chr8 (207-270)||(40221845-40221907)
chr8 (197-279)||(5689362-5689442)
chr8 (109-279)||(6598975-6599143)
chr8 (109-279)||(6674428-6674596)
chr8 (109-249)||(40328782-40328922)
chr8 (207-270)||(4733806-4733868)
chr8 (106-145)||(8965820-8965859)
chr8 (106-269)||(18141821-18141981)
chr8 (106-178)||(9765745-9765818)
chr8 (160-269)||(41366622-41366727)
chr8 (109-177)||(44353796-44353865)
chr8 (207-272)||(11384085-11384149)
chr8 (106-177)||(30291606-30291679)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (11-326)||(6177-6491)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (22-313)||(11125-11423)
scaffold0491 (104-309)||(8703-8907)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (25-277)||(434443-434703)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (25-279)||(827-1087)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (106-287)||(11557-11737)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (243-314)||(1-72)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (106-279)||(114602-114774)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (125-272)||(18007-18151)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (207-270)||(10589-10651)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (197-279)||(149094-149174)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (106-272)||(7327-7491)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (106-270)||(20421-20583)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33342370 - 33342051
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342370 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 33342271  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342270 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtactccttttgtaaagaactcatttg 33342171  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342170 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 33342071  T
Q  310 ccttggtttatcttgtgttt 329  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  33342070 cctttgtttatcttgtgttt 33342051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 34164761 - 34165079
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164761 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 34164860  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164861 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 34164960  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164961 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 34165060  T
Q  310 ccttggtttatcttgtgttt 329  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  34165061 cctt-gtttatcttgtgttt 34165079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 6027151 - 6027448
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027151 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 6027250  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6027251 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 6027350  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027351 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 6027448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 34166983 - 34167287
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34166983 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 34167082  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34167083 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaacttatttg 34167182  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34167183 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 34167282  T
Q  310 ccttg 314  Q
    |||||    
T  34167283 ccttg 34167287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 25421208 - 25421507
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25421208 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 25421307  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25421308 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 25421407  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421408 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 25421507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 3 - 326
Target Start/End: Original strand, 16653007 - 16653330
Alignment:
Q  3 tggagaagcaaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattga 100  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  16653007 tggagaatcaaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattga 16653106  T
Q  101 gtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaaga 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  16653107 gtgtcttggtgagattgggaaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aaga 16653205  T
Q  201 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttct 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||    
T  16653206 actcatttgatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat-ttgttttct 16653304  T
Q  300 tcttccctctccttggtttatcttgtg 326  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16653305 tcttccctctcctt-gtttatcttgtg 16653330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 16554772 - 16555087
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16554772 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 16554871  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16554872 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcattt 16554970  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccct 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  16554971 gatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat-ttgttttcttcttccct 16555069  T
Q  308 ctccttggtttatcttgtg 326  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  16555070 ctcctt-gtttatcttgtg 16555087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 16631328 - 16631643
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16631328 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 16631427  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16631428 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcattt 16631526  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccct 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  16631527 gatagtggattggagagtgcaaactctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat-ttgttttcttcttccct 16631625  T
Q  308 ctccttggtttatcttgtg 326  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  16631626 ctcctt-gtttatcttgtg 16631643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 81 - 314
Target Start/End: Original strand, 13153888 - 13154122
Alignment:
Q  81 cttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacct 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13153888 cttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacct 13153987  T
Q  180 cttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13153988 cttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 13154087  T
Q  280 ctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154088 ctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg 13154122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16578783 - 16578468
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16578783 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 16578684  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16578683 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcattt 16578585  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccct 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  16578584 gatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat-ttgttttcttcttccct 16578486  T
Q  308 ctccttggtttatcttgtg 326  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  16578485 ctcctt-gtttatcttgtg 16578468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 16616597 - 16616912
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16616597 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacacgttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 16616696  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16616697 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgctcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcattt 16616795  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccct 307  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  16616796 gatagtggattggagagtgcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat-ttgttttcttcttccct 16616894  T
Q  308 ctccttggtttatcttgtg 326  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  16616895 ctcctt-gtttatcttgtg 16616912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 27647777 - 27648065
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647777 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccatgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 27647876  T
Q  122 aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 221  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27647877 aagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggattgg 27647974  T
Q  222 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  27647975 agagtacaaactctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcctt 27648065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 412016 - 412308
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  412016 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 412114  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 216  Q
    |||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  412115 aaaaaggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttatcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtgg 412211  T
Q  217 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  412212 attagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtat-ttgttttcttcttccctctcctt 412308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3073014 - 3072722
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3073014 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 3072916  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtg 215  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3072915 gaaaatggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtg 3072819  T
Q  216 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  3072818 aattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcctt 3072722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6097695 - 6097412
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| ||||  ||| |||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  6097695 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctctttggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgttttggtgagattgg 6097596  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgga 217  Q
     |||  ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||           ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6097595 aaaaatggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgtaa-gaactcatt-gatagtgga 6097509  T
Q  218 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttg 314  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  6097508 ttggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtct-ttgttttcctcttccctctccttg 6097412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 2171792 - 2171520
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       |||    
T  2171792 ctctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtg 2171694  T
Q  112 agattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||| |    
T  2171693 agattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccctttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-g 2171598  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 287  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2171597 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 2171520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31404932 - 31404671
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  31404932 tagggtttagggtcttttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatcagtgaga 31404834  T
Q  115 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgata 212  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| ||||    
T  31404833 ttgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gata 31404738  T
Q  213 gtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31404737 gtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggccaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 31404671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30834705 - 30834539
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  |||||    
T  30834705 ttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaa 30834609  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30834608 ctcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 30834539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5406367 - 5406196
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| |||||    
T  5406367 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaact 5406271  T
Q  204 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5406270 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct 5406196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5410692 - 5410521
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| |||||    
T  5410692 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaact 5410596  T
Q  204 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5410595 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct 5410521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16452583 - 16452325
Alignment:
Q  29 gtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagattgg 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||||||    
T  16452583 gtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgagaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagattgg 16452486  T
Q  119 gaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtg 215  Q
    ||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||  || ||   ||||||||||| |||||||    
T  16452485 gaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc-ctttcatatctctttggaagaactcatt-gatagtg 16452389  T
Q  216 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16452388 gattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 16452325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5413561 - 5413401
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| |||||    
T  5413561 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaact 5413465  T
Q  204 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 268  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5413464 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5413401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 21588931 - 21589095
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  21588931 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 21589027  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21589028 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 21589095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 21593664 - 21593828
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  21593664 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 21593760  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21593761 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 21593828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33160521 - 33160348
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| |||||    
T  33160521 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgt-aagaa 33160425  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  33160424 ctca-ttgatggtggattggagagatcaatctctcctccagagtatttcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct 33160348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 3808877 - 3808701
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||    
T  3808877 ttggtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 3808781  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  3808780 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcatgattggaccgaactaggtgaacaatctctt 3808701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 197 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5409146 - 5409076
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5409146 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 5409076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 17762990 - 17763155
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||||   ||||||    
T  17762990 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtat--ctttttggaagaac 17763086  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17763087 tcatt-gatagtggattggagtgatcaatctctcctccagagtagatcaagtttggaccgaactaggtga 17763155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 109 - 272
Target Start/End: Original strand, 17758026 - 17758188
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| |||||||    
T  17758026 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactca 17758122  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    || |||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  17758123 tt-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtagttcaagtttggaccgaactaggtga 17758188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 2973107 - 2972943
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  2973107 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 2973011  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  2973010 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaag-ttcgaccgaactaggtga 2972943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 28137576 - 28137420
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||    
T  28137576 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatttcttt-gtaa-gaac 28137480  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 264  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  28137479 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaa 28137420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 9183199 - 9183028
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  9183199 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaatttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 9183103  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  9183102 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 9183028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Original strand, 16568953 - 16569193
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatggaaaacatcttgt---agagagaatcattgagtgtcttggtgagattggga 120  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||| ||||    || || |||||||||||||||||   |||||| ||    
T  16568953 tagggttaagggt-ctttgattagagt-tctcttgggtttggaaacattgtaaacaccttgggtaagtgaaaatcattgagtgtcttg---agattgaga 16569047  T
Q  121 aag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 218  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||||            |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16569048 aaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacct------------ttgtaa-gaactcatt-gatagtggat 16569133  T
Q  219 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  16569134 tggagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16569193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 26830200 - 26830127
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  26830200 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaagttt-gactgaactgggtga 26830127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 22424995 - 22424829
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc---tcttgtattccttttgtaaaga 200  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||   | ||||||  |||| |||| ||    
T  22424995 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttttgtatctcttt-gtaa-ga 22424899  T
Q  201 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||    
T  22424898 actcatt--atagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcattgttggaccgtactgggtga 22424829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33211262 - 33211182
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  33211262 aagaactcattt-ataatggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33211182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 272
Target Start/End: Original strand, 5043648 - 5043792
Alignment:
Q  126 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 223  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  5043648 gtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtagattggag 5043743  T
Q  224 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||  ||| |||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  5043744 agatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 5043792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 268
Target Start/End: Original strand, 26800679 - 26800748
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 268  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  26800679 aagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgg 26800748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26954450 - 26954283
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctct-tgtattccttttgtaaagaactcat 206  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||   | |||||  |||| |||| ||||||||    
T  26954450 gtgagattgggaaattggtataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatctgtatctcttt-gtaa-gaactcat 26954354  T
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    | |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  26954353 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 26954283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 225
Target Start/End: Original strand, 4045423 - 4045542
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaact 203  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||| |||| | ||||||||||||||||| | | || || ||  |||||||| ||||    
T  4045423 ttggagagattgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttatgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcattttata-tctctttgtaaataact 4045521  T
Q  204 catttgatagtggattggagag 225  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  4045522 ca-ttgatagtggattggagag 4045542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 603156 - 603082
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 282  Q
    ||||||||||||||||||   ||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  603156 ttgatagtggattggagaaatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctctt 603082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 43)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 16546534 - 16546853
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546534 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 16546633  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16546634 gagattaggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 16546733  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546734 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 16546833  T
Q  310 ccttggtttatcttgtgttt 329  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  16546834 cctttgtttatcttgtgttt 16546853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 16544312 - 16544631
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544312 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 16544411  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16544412 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttctcataacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttg 16544511  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544512 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 16544611  T
Q  310 ccttggtttatcttgtgttt 329  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  16544612 cctttgtttatcttgtgttt 16544631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 25078023 - 25078328
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25078023 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 25078122  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25078123 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 25078222  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078223 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 25078322  T
Q  309 tccttg 314  Q
    ||||||    
T  25078323 tccttg 25078328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 25135992 - 25136297
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25135992 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 25136091  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25136092 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 25136191  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136192 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 25136291  T
Q  309 tccttg 314  Q
    ||||||    
T  25136292 tccttg 25136297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 40379995 - 40380292
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40379995 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 40380094  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40380095 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 40380194  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380195 tagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 40380292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 40382206 - 40382503
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382206 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctctcgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 40382305  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40382306 gagattgggaaaggggtagaagttagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 40382405  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382406 tagtggattggagagttcaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 40382503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 10593161 - 10593475
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  10593161 caaagggggaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtagaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 10593260  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10593261 gtgagattgggagaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcattt 10593359  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||    
T  10593360 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtat-ttgttttctacttccctc 10593458  T
Q  309 tccttggtttatcttgtg 326  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  10593459 tcctt-gtttatcttgtg 10593475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 18 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22536545 - 22536253
Alignment:
Q  18 gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536545 gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgcagagagaatcattgagtgtcttggtgagattg 22536446  T
Q  118 ggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgga 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22536445 ggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtgga 22536348  T
Q  218 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  22536347 ttggggagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccctt 22536253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29751414 - 29751122
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29751414 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 29751315  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  29751314 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactc-tttgatagtggat 29751217  T
Q  219 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29751216 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctcctt 29751122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 29720278 - 29720569
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29720278 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 29720377  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  29720378 aaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactc-tttgatagtggat 29720475  T
Q  219 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29720476 tggagagtacaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcctt 29720569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 29722438 - 29722729
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29722438 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 29722537  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  29722538 aaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactc-tttgatagtggat 29722635  T
Q  219 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  29722636 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcctt 29722729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 16409389 - 16409681
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16409389 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 16409487  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 216  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16409488 aaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtgg 16409584  T
Q  217 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  16409585 attggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcctt 16409681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 26177797 - 26178088
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26177797 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 26177895  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 216  Q
     |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  26177896 aaaaggg-tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtgg 26177991  T
Q  217 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  26177992 attggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcctt 26178088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9789478 - 9789176
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9789478 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 9789380  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 216  Q
     ||| |||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9789379 aaaaagggtagaaattaaggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtgg 9789283  T
Q  217 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgg 315  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||   |    
T  9789282 attggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcc---g 9789187  T
Q  316 tttatcttgtg 326  Q
    |||||||||||    
T  9789186 tttatcttgtg 9789176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18441902 - 18441600
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18441902 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 18441804  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 216  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18441803 aaaaagggtagaaattagggtt-gttccttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtgg 18441707  T
Q  217 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctccttgg 315  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||   |    
T  18441706 attggagagttcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcc---g 18441611  T
Q  316 tttatcttgtg 326  Q
    |||||||||||    
T  18441610 tttatcttgtg 18441600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 26170688 - 26170968
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26170688 ctctagggtttagagt-ctttgattacagcttctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 26170786  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgga 217  Q
     |||||| ||||||||||| || |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||           ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26170787 aaaaggg-tagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaact----------cttttgtaa-gaactcatt-gatagtgga 26170872  T
Q  218 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  26170873 ttggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcctt 26170968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Original strand, 25412672 - 25412932
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  25412672 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 25412769  T
Q  115 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgata 212  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| ||||    
T  25412770 ttgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gata 25412865  T
Q  213 gtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25412866 gtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct 25412932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 13343060 - 13343232
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  ||||    |||||    
T  13343060 ttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctctttg---aagaa 13343155  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13343156 ctcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcatgtttggaccgaactgggtgaacaatct 13343232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 30182588 - 30182760
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | || |||  |||| |  ||||||    
T  30182588 ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttctatctctttgg--aagaac 30182684  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30182685 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtatgtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct 30182760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 37439161 - 37439313
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 222  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37439161 ggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattgga 37439256  T
Q  223 gagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37439257 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 37439313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36074302 - 36074039
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  36074302 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 36074205  T
Q  115 ttgggaaag----gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    ||||||||     ||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  ||||    |||||||||||     
T  36074204 ttgggaaaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgcgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg---aagaactcatt- 36074110  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36074109 gatagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatct 36074039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 125 - 277
Target Start/End: Original strand, 13239771 - 13239921
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 222  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13239771 ggtagaaattagggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattgga 13239866  T
Q  223 gagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 277  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  13239867 gagatcaatctctcctccagagtaggtcaaatttggaccgaactgggtgaacaat 13239921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 213465 - 213630
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || |||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  213465 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 213561  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  213562 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 213630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 40147261 - 40147425
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  40147261 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 40147357  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40147358 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 40147425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 277
Target Start/End: Original strand, 28278316 - 28278485
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| ||||| |||    
T  28278316 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaa-aac 28278412  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 277  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28278413 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaat 28278485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 32636824 - 32636995
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  32636824 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 32636920  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  32636921 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 32636995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13695859 - 13695713
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaact 203  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  13695859 ttggagagattgggaaaagggtacaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacccttttgta-tctctttgtaaagaact 13695761  T
Q  204 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaa 252  Q
    || || |||||||||| |||||   |  |||||||||| ||||||||||    
T  13695760 ca-ttaatagtggattagagagattattctctcctccatagtaggtcaa 13695713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 42428598 - 42428427
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  42428598 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggttt-ttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 42428502  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  42428501 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 42428427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Original strand, 5058136 - 5058209
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5058136 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 5058209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 13488203 - 13488365
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  13488203 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 13488299  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13488300 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 13488365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30683178 - 30682930
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  30683178 tagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgcgaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcatttgtgaga 30683081  T
Q  115 ttgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaaga-actcatttga 210  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||  ||    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||  | ||||||| ||    
T  30683080 ttgggaaaaagggtagaaattagggttcttt----gtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaagaatactcatt-ga 30682987  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 268  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  30682986 tagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 30682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 279
Target Start/End: Original strand, 19806463 - 19806534
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  19806463 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 19806534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 27637689 - 27637616
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27637689 aagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctgcagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 27637616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16641008 - 16640961
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagt 254  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16641008 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagt 16640961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28750823 - 28750661
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |  |||| ||||  ||| ||||||| |||||||  || |||| | |||||||| ||||    
T  28750823 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttatgaaattgttgaagttaatttcctgtaacccatttgtat-ctttttgtaa-gaac 28750727  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  28750726 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaattgggt 28750661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 270
Target Start/End: Original strand, 31182976 - 31183133
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatt 207  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||| | ||||  ||||  ||| |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||| |    
T  31182976 gtgagattggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgagtttgtttaagttaatttcttgtaaccatttgta-tccctttgt-aagaactca-t 31183071  T
Q  208 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||||| ||||||||||||  | | |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  31183072 tgatactggattggagagatctatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 31183133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 270
Target Start/End: Original strand, 16452171 - 16452242
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16452171 aagaactcattc-atagtggattggagagataaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 16452242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 533769 - 533940
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  533769 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggttggt-ctttgtgagcttgttgaagctaattttttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 533865  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  533866 tcatt-gatagtggattggaaagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 533940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 270
Target Start/End: Original strand, 4160702 - 4160762
Alignment:
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||    
T  4160702 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggt 4160762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Original strand, 27015614 - 27015687
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||  ||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27015614 aagaactcatt-gatagtggattgtacagatcaatctctcctccaaaataggtcaag-ttggaccgaactgggtga 27015687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 39468714 - 39468644
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 178  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39468714 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 39468644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 288
Target Start/End: Original strand, 316769 - 316943
Alignment:
Q  112 agattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||| | | || |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||    
T  316769 agattgagaaaaaggtagaaattagg-tttgttcttggagagcttgttgaagctaatttcttgtaatccttttgta-tctctttgtaaagaactca-ttg 316865  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    ||| ||||| |||| |  ||| |||||| | |||||||||||   |||||||||||| ||| | |||| ||||||||||    
T  316866 ataatggatcggagggatcaatctctcccctagagtaggtcattgttggaccgaacttggtaaacaat-tctttgtgtt 316943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8566023 - 8565943
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  8566023 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcacccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 8565943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 5138193 - 5138511
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138193 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaataccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 5138292  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138293 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 5138392  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138393 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 5138492  T
Q  310 ccttggtttatcttgtgttt 329  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  5138493 cctt-gtttatcttgtgttt 5138511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 5135967 - 5136286
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaa-catggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttgg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5135967 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaaacatgggaaataccttgtagagagaatcattgagtgtcttgg 5136066  T
Q  110 tgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136067 tgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 5136166  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136167 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 5136266  T
Q  309 tccttggtttatcttgtgttt 329  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  5136267 tcctt-gtttatcttgtgttt 5136286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 311
Target Start/End: Original strand, 8395508 - 8395807
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395508 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 8395607  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8395608 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttga 8395706  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395707 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 8395806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 11 - 311
Target Start/End: Original strand, 8393299 - 8393598
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393299 caaaggggaagctctagggtttatggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 8393398  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8393399 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttga 8393497  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393498 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 8393597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 7124804 - 7125103
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7124804 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 7124903  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124904 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 7125003  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125004 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 7125103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 7122585 - 7122884
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7122585 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 7122684  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122685 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaaactaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 7122784  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122785 gatagtggattggagagtacaatctctcctccatagtaggtcaagcaaagaccgaactgggtgaacaatttctttgtgtttattgttttcttcttccctc 7122884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31495556 - 31495279
Alignment:
Q  38 tctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaatt 134  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31495556 tctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaagggtagaaatt 31495457  T
Q  135 agggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaa 231  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||     
T  31495456 aggatt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagttgattggagagttcaat 31495360  T
Q  232 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  31495359 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcctt 31495279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13992544 - 13992289
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatggaaaacatcttg--tagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg-- 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| | ||||| ||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||      
T  13992544 tagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgggaa 13992446  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgga 217  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||  || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  13992445 aaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtat--ctcttgt-aagaactca-ttgatagtgga 13992351  T
Q  218 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13992350 ttggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaacaatct 13992289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 29999974 - 29999809
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaact 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||   |||||||| |||||    
T  29999974 ttggtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacatgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatcttttttgtaa-gaact 29999877  T
Q  204 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29999876 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 29999809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 56178805 - 56178633
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  56178805 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 56178709  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  56178708 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 56178633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 48143042 - 48143215
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||  || ||   |||||    
T  48143042 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtat--ctcttcataagaa 48143138  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  48143139 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaacaatct 48143215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 52095530 - 52095361
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| |||     
T  52095530 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaaa 52095434  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 277  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52095433 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtagg-caagtttggaccgaactgggtgaacaat 52095361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 288
Target Start/End: Original strand, 2209717 - 2209895
Alignment:
Q  110 tgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||||||    
T  2209717 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaactca 2209813  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    || |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2209814 tt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtt 2209895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 120 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5370237 - 5370079
Alignment:
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa--gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 216  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  5370237 aaagaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtgg 5370142  T
Q  217 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    | | |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5370141 actagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct 5370079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 41964415 - 41964580
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  | |||||| ||||| |||| |||    
T  41964415 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttattgtaacccattttgtatcccttt-gtaa-gaa 41964511  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41964512 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 41964580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 47038577 - 47038408
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactc 204  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| |  |||||| |  ||||||| || |||    
T  47038577 ttggtgagattggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatcatttgtat-ctgtttgtaagga-ctc 47038481  T
Q  205 atttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  47038480 att-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 47038408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 9927626 - 9927467
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  9927626 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 9927530  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9927529 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 9927467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 288
Target Start/End: Original strand, 12119559 - 12119720
Alignment:
Q  126 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 223  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12119559 gtagaaattatggtttgttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaaagaactcattt-atagtggattggag 12119656  T
Q  224 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    ||  ||| |||||| | |||||||||||   |||||||||||| ||||| |||| |||| |||||    
T  12119657 agatcaatctctcc-caagagtaggtcattgttggaccgaactaggtgaacaatttcttggtgtt 12119720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12739718 - 12739547
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||| |  ||||||  ||||    
T  12739718 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctatttgtat-gaac 12739622  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  12739621 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12739547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 46703500 - 46703666
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||    
T  46703500 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 46703596  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||    
T  46703597 ctcattt-atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaattgggtga 46703666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 288
Target Start/End: Original strand, 26364236 - 26364416
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  26364236 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta-tctctttgt-aagaac 26364332  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    ||| || ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||| |||||    
T  26364333 tca-ttaatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gactgaactgggtcaacaatttcttggtgtt 26364416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34570677 - 34570411
Alignment:
Q  20 agctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgt---agagagaatcattgagtgtcttg------- 108  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||    || || |||||||||||||||||           
T  34570677 agctttagggttgagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgaaaacatcttgggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattg 34570580  T
Q  109 gtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctc-ttgtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||  |||| |||| |||||||    
T  34570579 gtgagattgggaaaataggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccaattgtatctcttt-gtaa-gaactca 34570483  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    || |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||| | ||||||    
T  34570482 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggatcgaactgggtcaacaatct 34570411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 41639426 - 41639590
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||||||| |  |||||||||||||||||||  || |||| |  ||||||| ||||    
T  41639426 ttggtaagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaactttttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctatttgtaa-gaac 41639522  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  41639523 tcatc-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 41639590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12744073 - 12743922
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 222  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12744073 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgga 12743978  T
Q  223 gagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  12743977 gagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12743922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12745462 - 12745311
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 222  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12745462 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgga 12745367  T
Q  223 gagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  12745366 gagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12745311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 5208003 - 5207848
Alignment:
Q  113 gattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtat-tccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||| |||| ||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||    
T  5208003 gattggaaaaagggtagaaattagggtttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttattgcaacc-cttgtatatctatttgt-aagaactca-ttga 5207907  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||  |||||||||||||| ||||||| ||| |||||    
T  5207906 tagtggattggaaagatcaatctctctcccagagtaggtcaa-tttggactgaattgggt 5207848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 40632445 - 40632607
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||    
T  40632445 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaa-gaac 40632541  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40632542 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctaaagtaagtcaag-ttggaccgaactgggt 40632607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 50673924 - 50673851
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  50673924 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 50673851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 272
Target Start/End: Original strand, 6655975 - 6656120
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 221  Q
    |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6655975 gggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgg 6656070  T
Q  222 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  6656071 agagatcaatctctcatccagagtaggtcaag-ttggaccgaattgggtga 6656120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37229890 - 37229731
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtat-tccttttgtaaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||| |||| | |||| ||||| ||||||||  || ||| ||  ||||| |||||||    
T  37229890 ttggtgagattgggaaaatggtagaaattagggtgtgttctttgtgagcttgttaaagcaaatttgttgtaaccctttttatatctctttgt-aagaact 37229792  T
Q  204 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||    
T  37229791 cattt-atagtggattggagagatcaatctctccctcatagtaggtcaag-ttggaccgaact 37229731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 12073392 - 12073557
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  12073392 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 12073488  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||| |||||    
T  12073489 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcttccagagtaggtcattgttggaccgaactaggtga 12073557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 288
Target Start/End: Original strand, 54883020 - 54883200
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  54883020 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 54883116  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  54883117 tcatt-gatagtggattggagggatcaatctctcctccagattaagtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgtt 54883200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 255
Target Start/End: Original strand, 8665408 - 8665556
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  8665408 ttggtgagaatgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgagagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 8665504  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8665505 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtt 8665556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26175804 - 26175633
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  26175804 ttggtgagattgggaaaatggggagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 26175708  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  26175707 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 26175633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26699585 - 26699447
Alignment:
Q  132 attagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtaca 229  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  26699585 attagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgtatctcttt-gtaaagaactcattt-ataatggattggagagatca 26699488  T
Q  230 aactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    | ||||   |||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  26699487 atctctatcccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 26699447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36463557 - 36463386
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  36463557 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggct-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 36463461  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    || ||||| ||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  36463460 tc-tttgacagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36463386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45687351 - 45687179
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| |||| |  |||||| |  ||||||| ||||    
T  45687351 ttggtgagattgggaaaatgggaagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttataactcatttgtat-ctatttgtaa-gaac 45687254  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  | | |||||||||| | || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  45687253 tcatt-gatagtggattggagagatctatctctcctccatattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45687179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Original strand, 8648230 - 8648303
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  8648230 aagaactcatt-gatattggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccaaactgggtga 8648303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 36994524 - 36994686
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||||    
T  36994524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaac 36994620  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36994621 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattagatcaag-ttggaccgaactgggt 36994686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 50262778 - 50262688
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||   ||| || |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  50262778 aagaactcatt-gatagttgattggagatatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtt 50262688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Original strand, 379399 - 379541
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  379399 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcgcttt-gtaa-gaactaatt-gatagtggattgg 379494  T
Q  222 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 268  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  379495 agagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgg 379541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 46147557 - 46147388
Alignment:
Q  108 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactc 204  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||||    
T  46147557 ggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaactc 46147461  T
Q  205 atttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
     |||||||||||||||||||   ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  46147460 -tttgatagtggattggagacatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 46147388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 48893715 - 48893635
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  48893715 aagaactc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 48893635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 5429679 - 5429850
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||  ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||| |  ||||||| ||||    
T  5429679 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtta-ttcttcgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctatttgtaa-gaac 5429775  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  5429776 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5429850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27417133 - 27416974
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| ||||| |||    
T  27417133 ttggtgagattggtaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaa-aac 27417037  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27417036 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 27416974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 267
Target Start/End: Original strand, 37740625 - 37740784
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  37740625 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 37740721  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 267  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  37740722 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactg 37740784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 5871820 - 5871991
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 203  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||| ||||||||||||||  || |  ||  |||| || |||||    
T  5871820 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagcaaatttcttgtaacccatttttatcactttgcaa-gaact 5871917  T
Q  204 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    | |||||||||||||| |||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  5871918 c-tttgatagtggattagagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggtcaacaatct 5871991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6542247 - 6542185
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6542247 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagggtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 6542185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12747924 - 12747851
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 178  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12747924 ttggtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 12747851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 267
Target Start/End: Original strand, 35662532 - 35662600
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  35662532 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatatctcctcaagagtaggtcaag-ttggaccgaactg 35662600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 54200074 - 54200001
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 178  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54200074 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 54200001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 52467423 - 52467351
Alignment:
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  52467423 tttgatagtggattggagagatcaatctctccccgagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 52467351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 270
Target Start/End: Original strand, 4588014 - 4588121
Alignment:
Q  160 aagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttgg 258  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||| ||| ||||    
T  4588014 aagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagaacaatctctcccccataataggtgaag-ttgg 4588109  T
Q  259 accgaactgggt 270  Q
    ||| ||||||||    
T  4588110 accaaactgggt 4588121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48142542 - 48142444
Alignment:
Q  110 tgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtat-tccttttgtaaagaactcatt 207  Q
    ||||||||||||   | ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48142542 tgagattgggaacatgatagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctagtttcttgtaacc-cttgtatatctctttgtaaagaactcatt 48142444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 52082707 - 52082660
Alignment:
Q  232 ctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||    
T  52082707 ctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgatttgggtgaacaatct 52082660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12744195 - 12744142
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 178  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12744195 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacc 12744142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 52082825 - 52082752
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 178  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  52082825 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaactaggg-ttgttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacc 52082752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 270
Target Start/End: Original strand, 31474242 - 31474313
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||   || |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31474242 aagaactcatt-gatagttgattggagagataaatctctccaccagagtagatcaagtt-ggaccgaactgggt 31474313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 279
Target Start/End: Original strand, 29254594 - 29254665
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  29254594 ttgatagtggattggagagatcaatctctctcccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29254665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 249
Target Start/End: Original strand, 33089966 - 33090021
Alignment:
Q  193 tgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggt 249  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||| |||||||||    
T  33089966 tgtaaagaactcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcctctagagtaggt 33090021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 251
Target Start/End: Original strand, 33989899 - 33989989
Alignment:
Q  160 aagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtca 251  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||| ||||| ||  ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  33989899 aagctaatttcttgtaatccttttgtatctcttt-gtaaataactcgtta-atagtggattggagagatcaatctctccaccagagtaggtca 33989989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 10056122 - 10056440
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056122 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10056221  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056222 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10056321  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056322 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 10056421  T
Q  310 ccttggtttatcttgtgttt 329  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  10056422 cctt-gtttatcttgtgttt 10056440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 10058344 - 10058662
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058344 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10058443  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058444 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10058543  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058544 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 10058643  T
Q  310 ccttggtttatcttgtgttt 329  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  10058644 cctt-gtttatcttgtgttt 10058662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 10060566 - 10060884
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060566 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10060665  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060666 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10060765  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060766 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 10060865  T
Q  310 ccttggtttatcttgtgttt 329  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  10060866 cctt-gtttatcttgtgttt 10060884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 10062788 - 10063106
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062788 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10062887  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062888 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10062987  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062988 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 10063087  T
Q  310 ccttggtttatcttgtgttt 329  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  10063088 cctt-gtttatcttgtgttt 10063106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 329
Target Start/End: Original strand, 10065010 - 10065328
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065010 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10065109  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065110 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10065209  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 10065309  T
Q  310 ccttggtttatcttgtgttt 329  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  10065310 cctt-gtttatcttgtgttt 10065328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 4598788 - 4598473
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598788 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccctgtagagagaatcattgagtgtcttggt 4598689  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598688 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 4598589  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598588 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 4598489  T
Q  310 ccttggtttatcttgtg 326  Q
    |||| ||||||||||||    
T  4598488 cctt-gtttatcttgtg 4598473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4601009 - 4600685
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4601009 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 4600910  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600909 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtattccttttgtaaagaactcatttg 4600810  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600809 atagtggattggagagtacaaactctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 4600710  T
Q  310 ccttggtttatcttgtgtttgatgat 335  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||    
T  4600709 cctt-gtttatcttgtgattgttgat 4600685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 10211298 - 10211613
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211298 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10211397  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211398 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10211497  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10211498 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccctct 10211597  T
Q  310 ccttggtttatcttgtg 326  Q
    |||| ||||||||||||    
T  10211598 cctt-gtttatcttgtg 10211613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 3617352 - 3617657
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3617352 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 3617451  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3617452 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcattt 3617551  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617552 gatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 3617651  T
Q  309 tccttg 314  Q
    ||||||    
T  3617652 tccttg 3617657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 10209078 - 10209393
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209078 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10209177  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10209178 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtagtccttttgtaaagaactcatttg 10209277  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10209278 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcatcttccctct 10209377  T
Q  310 ccttggtttatcttgtg 326  Q
    |||| ||||||||||||    
T  10209378 cctt-gtttatcttgtg 10209393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 25637331 - 25637645
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637331 caaaggggtatctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 25637430  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25637431 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 25637530  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  25637531 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctct 25637629  T
Q  310 ccttggtttatcttgtg 326  Q
    |||| ||||||||||||    
T  25637630 cctt-gtttatcttgtg 25637645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 54635039 - 54635330
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635039 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 54635138  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  54635139 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggatt 54635236  T
Q  220 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  54635237 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcctt 54635330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 22 - 326
Target Start/End: Original strand, 45282897 - 45283203
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282897 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgcaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 45282996  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgt--aaagaactcatttgatagtgga 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |   |||||||||||||||||||||    
T  45282997 aaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatccctttttttgtaagaactcatttgatagtgga 45283096  T
Q  218 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttggtt 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45283097 ttggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatctcttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcctt-gtt 45283194  T
Q  318 tatcttgtg 326  Q
    |||||||||    
T  45283195 tatcttgtg 45283203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 6716414 - 6716705
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716414 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 6716513  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6716514 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggatt 6716611  T
Q  220 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  6716612 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctcccctt 6716705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 209
Target Start/End: Original strand, 10067232 - 10067431
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067232 caaaggggaagctctagagtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 10067331  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067332 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 10067431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 801005 - 801297
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  801005 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 801103  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtg 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  801104 gaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtg 801200  T
Q  216 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  801201 gattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcctt 801297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 86 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7780191 - 7779967
Alignment:
Q  86 agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacctcttgt 184  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  7780191 agagaaaatcattgagtgtcttcgtgagattgggaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgt 7780093  T
Q  185 attccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttg 284  Q
    ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  7780092 atctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccaaagtgggtgaacaatctcttgg 7779995  T
Q  285 tgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  7779994 tgtct-ttgttttcctcttccctctcctt 7779967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 140
Target Start/End: Original strand, 6718598 - 6718718
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgt--agagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718598 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 6718697  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtt 140  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  6718698 aaaagggtagaaattagggtt 6718718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23200398 - 23200102
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg------gtga 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||      ||||    
T  23200398 ctctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtga 23200300  T
Q  113 gattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||| |    
T  23200299 gattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat-ctttttgtaa-gaactcatt-g 23200204  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||||||||||||||    
T  23200203 atagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcttcttccctct 23200106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 329
Target Start/End: Original strand, 10067435 - 10067527
Alignment:
Q  236 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttggtttatcttgtgttt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10067435 cctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt-gtttatcttgtgttt 10067527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23198199 - 23197903
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg------gtga 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||      ||||    
T  23198199 ctctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtga 23198101  T
Q  113 gattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    ||||||||||   |||||||||||| ||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||| |    
T  23198100 gattgggaaaaatggtagaaattagagtt-gttttttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat-ctttttgtaa-gaactcatt-g 23198005  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||| ||||| ||||    
T  23198004 atagtgaattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcctcttctctct 23197907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Original strand, 45095075 - 45095335
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  45095075 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 45095172  T
Q  115 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgata 212  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| ||||    
T  45095173 ttgggaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gata 45095268  T
Q  213 gtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45095269 gtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 45095335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 9636385 - 9636114
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggt-------gaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||| || | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||||       ||||    
T  9636385 tagggtttagggt-ctttgattagagtctctcttgggttgggaaatattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgaga 9636287  T
Q  115 ttggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| | |||||||| ||||||||| ||    
T  9636286 ttgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaaactaatttcttgtaacccttttgtat-ctttttgtaa-gaactcatt-ga 9636191  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 287  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9636190 tagtggattggagagttcaatctctcctccaaagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 9636114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5258402 - 5258140
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  5258402 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 5258305  T
Q  115 ttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||||||||| ||    
T  5258304 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-ga 5258209  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5258208 tagtggattggagagttcaatctcttctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct 5258140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5260581 - 5260319
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggt-------gaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||||       ||||    
T  5260581 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtcattggtgaga 5260484  T
Q  115 ttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||||||||| ||    
T  5260483 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-ga 5260388  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5260387 tagtggattggagagttcaatctcttctccaaagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatct 5260319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19684054 - 19683885
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| |||||||    
T  19684054 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactca 19683958  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    || |||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19683957 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 19683885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 7762265 - 7762437
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||    
T  7762265 ttggtgagattgagaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgt-aagaac 7762361  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7762362 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 7762437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 37408458 - 37408630
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  37408458 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 37408554  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  37408555 tcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatct 37408630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 279
Target Start/End: Original strand, 9581290 - 9581454
Alignment:
Q  113 gattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||| |||||  || |||| ||||| |||| ||||||||| ||    
T  9581290 gattcggaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttttaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactcatt-ga 9581385  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9581386 tagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 9581454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 117 - 279
Target Start/End: Original strand, 7764476 - 7764636
Alignment:
Q  117 gggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagt 214  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  7764476 gggaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttaaagctaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagt 7764571  T
Q  215 ggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  7764572 ggattggagagatgaatctctcctccagagtaggtcaaatttagaccgaactgggtgaacaatct 7764636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 34491212 - 34491383
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  34491212 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 34491308  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  34491309 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatct 34491383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 4569952 - 4570115
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  4569952 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttattgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 4570048  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4570049 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctactccagagtaggtgaagtttggaccgaactgggt 4570115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 49199638 - 49199456
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||    
T  49199638 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 49199542  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  49199541 ctcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagactaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtt 49199456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 43401970 - 43401788
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattcct-tttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||   || | |  || ||||||| ||||    
T  43401970 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacgcattttttatctctttgtaa-gaac 43401873  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    ||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43401872 tcatt-gatagtggattggagaaattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtt 43401788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29196555 - 29196383
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| || ||  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  29196555 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttggaacccatttgta-tctctttgt-aagaac 29196458  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  29196457 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29196383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 109 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 39153526 - 39153358
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |  |||||| |||||    |||||||||    
T  39153526 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttcattgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgtatccctttat--aagaactca 39153430  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    || ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  39153429 tt-gatagtggattggagagaacaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 39153358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 197 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43403821 - 43403737
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43403821 aagaactcatt-gatagtggattggagagattaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctctt 43403737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 288
Target Start/End: Original strand, 30236129 - 30236305
Alignment:
Q  110 tgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcat 206  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||||||    
T  30236129 tgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaa-gaactcat 30236225  T
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    | |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | |||| |||| |||||    
T  30236226 t-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatttcttggtgtt 30236305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 40734498 - 40734669
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | || ||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||| ||||||    
T  40734498 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaacctaatttcttgtaacacatttgta-tccctttgt-aagaac 40734594  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40734595 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40734669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 41819691 - 41819526
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||| |||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||    
T  41819691 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgtctaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 41819595  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||||  |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||    
T  41819594 ctcatt--atagtggattggagacatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccaaactgggtga 41819526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 44331545 - 44331716
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||  |||| |||| ||||    
T  44331545 ttggtgagattaggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaagccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 44331641  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  44331642 ttatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 44331716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 6095676 - 6095603
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  6095676 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgtgtga 6095603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22835167 - 22835010
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| |||||||    
T  22835167 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactca 22835071  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 268  Q
    || |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22835070 tt-gatagtggattggagagatcaatctctccgccatattaggtcaag-ttggaccgaactgg 22835010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 40735383 - 40735554
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||| ||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  40735383 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttattgtaaccagtttgtatctcttt-gtaa-gaac 40735479  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40735480 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcagcaatct 40735554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 209 - 288
Target Start/End: Original strand, 40913395 - 40913473
Alignment:
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  40913395 gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatctcttggtgtt 40913473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Original strand, 54593795 - 54593868
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  54593795 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtatgtcaag-ttggaccaaactgggtga 54593868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Original strand, 16499120 - 16499200
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  16499120 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 16499200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 108 - 267
Target Start/End: Original strand, 31314447 - 31314604
Alignment:
Q  108 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactc 204  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||| | |||||||| ||||||    
T  31314447 ggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgatcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctttttgtaa-gaactc 31314543  T
Q  205 atttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 267  Q
     ||||||||||||||||||||  |||  ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  31314544 -tttgatagtggattggagagatcaatatctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactg 31314604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 255
Target Start/End: Original strand, 760850 - 760995
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| |||||||    
T  760850 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tctgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactca 760946  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 255  Q
    || |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  760947 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 760995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 279
Target Start/End: Original strand, 51398833 - 51398985
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51398833 gggtagaaattagggtt-gttcttagtgaacttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattgg 51398928  T
Q  222 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||    | |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  51398929 agagatttatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaacttggtcaacaatct 51398985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 53921671 - 53921511
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||  | |||| ||||| || |||||||||||||||| |  ||||| || |||||| ||||||    
T  53921671 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagg-tttgttgtttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaactcatttgta-tcattttgt-aagaac 53921575  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 268  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  53921574 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccggagtagatcaagttt-gaccgaactgg 53921511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 27305777 - 27305719
Alignment:
Q  208 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 267  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  27305777 tgatagtggattggagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaa-tttggaccgaactg 27305719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Original strand, 29813083 - 29813234
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 223  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||    ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  29813083 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgcatctctttgtaa-gaactcattt-atagtggattggag 29813179  T
Q  224 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||  ||| |||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||| | ||||||    
T  29813180 agatcaatctctcccccagatttggtcatg-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29813234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5236624 - 5236551
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 178  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5236624 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc 5236551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 279
Target Start/End: Original strand, 29682362 - 29682530
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||| |||  || |||| ||||| |||| |||||||    
T  29682362 gtgagattgggaaaatgggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtcacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactca 29682458  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    || |||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  29682459 tt-gatagtggattggagagatcaatctctcccctagattagatcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 29682530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 264
Target Start/End: Original strand, 46860474 - 46860631
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| ||||  |||    
T  46860474 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaat-aac 46860570  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 264  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  46860571 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctttcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 46860631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 270
Target Start/End: Original strand, 47304342 - 47304413
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  47304342 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaagttt-gaccgaactgggt 47304413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 55302040 - 55301975
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||   |||||||||||| |||||    
T  55302040 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccatagtaggtcattgttggaccgaacttggtga 55301975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5434046 - 5433971
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 178  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  5434046 ttggtgagattgggagaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaacc 5433971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 255
Target Start/End: Original strand, 29810889 - 29811016
Alignment:
Q  126 gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 223  Q
    ||||||||||| ||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  29810889 gtagaaattagagtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggag 29810984  T
Q  224 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 255  Q
    ||  ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  29810985 agatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 29811016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 266
Target Start/End: Original strand, 46173457 - 46173515
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 266  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  46173457 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaact 46173515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 4055926 - 4055856
Alignment:
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgt-caagctaatttcttgtaacctctt 182  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  |||||| | | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  4055926 gagattgggaaatgggtagaaattagg--ttgttcttggagaacttgtaaaagttaatttcttgtaacctctt 4055856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3990 - 3687
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3990 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 3891  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3890 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacatgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 3791  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 310  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3790 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 3691  T
Q  311 cttg 314  Q
    ||||    
T  3690 cttg 3687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18392460 - 18392157
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392460 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 18392361  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18392360 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 18392261  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392260 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 18392161  T
Q  311 cttg 314  Q
    ||||    
T  18392160 cttg 18392157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6594822 - 6594525
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594822 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 6594723  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6594722 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 6594623  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594622 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 6594525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18389024 - 18388725
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18389024 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 18388925  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18388924 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 18388825  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388824 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 18388725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6592604 - 6592307
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592604 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 6592505  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6592504 gagattgggaaatgggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 6592405  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592404 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 6592307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32060590 - 32060289
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32060590 caaagggtaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 32060491  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattcc--ttttgtaaagaactcat 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  32060490 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccctttttgtaaagaactcat 32060391  T
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060390 ttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaacttggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccc 32060291  T
Q  307 tc 308  Q
    ||    
T  32060290 tc 32060289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 20343811 - 20344102
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343811 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagattggg 20343910  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20343911 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactcatttgatagtggatt 20344009  T
Q  220 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20344010 ggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcctt 20344102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 24789755 - 24790047
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24789755 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtaagattggg 24789854  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 218  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  24789855 aaaagggtaaaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacattttgtatcccttttgtaaa-aactc-tttgatagtggat 24789952  T
Q  219 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||||    
T  24789953 tggagagtactatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtctttgtttttcttcttccctctcctt 24790047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1562268 - 1562103
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562268 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 1562169  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 176  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562168 gagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaa 1562103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 39731283 - 39731573
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatggaaaacatcttg--tagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| | |||||| | ||||| ||||   || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  39731283 ctctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 39731381  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtca-agctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 216  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39731382 aaaaagggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgtcagatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgt-aagaactca-ttgatagtgg 39731478  T
Q  217 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  39731479 attggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcctt 39731573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43504409 - 43504117
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| |||  |||||||| ||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  43504409 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttggcttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcatcgagtgtcttggtgagattgg 43504311  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtg 215  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  43504310 gaaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactctttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtg 43504214  T
Q  216 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
     |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  43504213 aattggagagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggatcgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcctt 43504117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 183 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1560757 - 1560617
Alignment:
Q  183 gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctt 282  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1560757 gtatcccttttgtaa-gaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtaaccaatctctt 1560659  T
Q  283 tgtgtttattgttttcttcttccctctccttggtttatcttgtg 326  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1560658 ggtgtat-ttgttttcttcttccctctcctt-gtttatcttgtg 1560617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Original strand, 35853914 - 35854094
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||    
T  35853914 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaac 35854010  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  35854011 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 35854094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25767215 - 25766948
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggt----gagat 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    |||||| | ||||| ||||  ||| |||  ||||||||||||||| |    |||||    
T  25767215 ctctagggtttagggt-ctttgattagagtttctctttggg---aaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattgagat 25767120  T
Q  116 tgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatag 213  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  || || | ||||||||||| |||||    
T  25767119 tggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgaagaactcatt-gatag 25767022  T
Q  214 tggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 287  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25767021 tggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 25766948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Original strand, 29990965 - 29991225
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  29990965 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 29991062  T
Q  115 ttgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgata 212  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||    || |||||||| ||||    
T  29991063 ttgggaaaaggatagaaattagggtt-gttatttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttct--aataactcatt-gata 29991158  T
Q  213 gtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29991159 gtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 29991225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34310884 - 34310712
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||| |  ||||| || |||||| ||||||    
T  34310884 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaaattgttgaagctaatttcttgtaacacatttgta-tctttttgt-aagaac 34310788  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34310787 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34310712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 287
Target Start/End: Original strand, 48408709 - 48408984
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtg 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       |||    
T  48408709 ctctagggtttagggt-ctttgattagagtttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtg 48408807  T
Q  112 agattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt--gtattccttttgtaaagaactcatt 207  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||  |||||| ||| ||||||||    
T  48408808 agattgggaaaaagggtagaaattaatgtt-gttctttgtaaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttg-aaataactcatt 48408905  T
Q  208 tgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 287  Q
     ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  48408906 -gatagtggattggagagtttaatctctcctccagagtatgtcaagtttagaccgaactgggtgaacaatttcttggtgt 48408984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 23555039 - 23555212
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattcct-tttgtaaaga 200  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||  ||| ||||||| ||    
T  23555039 ttggtgagattgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgta--cctctttgtaa-ga 23555134  T
Q  201 actcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23555135 actcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 23555212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 279
Target Start/End: Original strand, 25615785 - 25616025
Alignment:
Q  38 tctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatggaaaacatcttgt---agagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaag-gggtagaaa 132  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||| ||||    ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||    
T  25615785 tctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacattgtaaacaccttgggtgagagaaaatcattgagtgtcttg---agattgggaaaatgggtagaaa 25615880  T
Q  133 ttagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaa 230  Q
    ||||| |||||||   |||  |||||  |||||||||||||||||||  || |||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||  |||    
T  25615881 ttagg-tttgttctatgtgcgcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtat-cattttgtaa-gaactcatt-gatagtggattagagagatcaa 25615976  T
Q  231 actctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25615977 tctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggcgaacaatct 25616025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 22269973 - 22270137
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  22269973 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 22270069  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22270070 tgatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 22270137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14070001 - 14069830
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  14070001 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgta-tctctttgt-aagaac 14069905  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  14069904 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 14069830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14380029 - 14379858
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  14380029 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgta-tctctttgt-aagaac 14379933  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  14379932 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 14379858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41317602 - 41317431
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||| |||| ||||    
T  41317602 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaatccatttgtatcccttt-gtaa-gaac 41317506  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  41317505 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41317431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Original strand, 4178685 - 4178945
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  4178685 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 4178782  T
Q  115 ttgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgat 211  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||  ||||    ||||||||||| |||    
T  4178783 ttgggaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgggaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg---aagaactcatt-gat 4178877  T
Q  212 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  4178878 agtggattgaacagttcaatctctcctccagagcaggtcaagtttgaaccaaactaggtgaacaatct 4178945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 279
Target Start/End: Original strand, 19502233 - 19502350
Alignment:
Q  160 aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttgg 258  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19502233 aagctaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaagtcaagtttgg 19502329  T
Q  259 accgaactgggtgaccaatct 279  Q
    | |||| ||||||| ||||||    
T  19502330 aacgaagtgggtgaacaatct 19502350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 8359485 - 8359319
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| | |||| |||||  || ||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||    
T  8359485 ttggggagattgggaaaatgggtagaaattagggttt-ttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 8359389  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  8359388 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 8359319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 32358131 - 32358058
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32358131 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 32358058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 29608737 - 29608901
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  29608737 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 29608833  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  29608834 tcatt-gatagtggattggagatatcaatcactcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 29608901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30024900 - 30024740
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  30024900 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 30024804  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 268  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30024803 tc-tttgatagtggattggagagatcaatcactcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 30024740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 255
Target Start/End: Original strand, 48491579 - 48491727
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||  || ||  |||||||    
T  48491579 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat--ctctttgaaagaac 48491675  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 255  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  48491676 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagtt 48491727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 27347817 - 27347988
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  27347817 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggatt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 27347913  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  27347914 tcatt-gatagtggattgcagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 27347988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41649158 - 41649008
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 223  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  41649158 ggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattggag 41649063  T
Q  224 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  41649062 agatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 41649008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 288
Target Start/End: Original strand, 2390385 - 2390462
Alignment:
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| |||||    
T  2390385 atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaataatctcttggtgtt 2390462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4253697 - 4253538
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtat-tccttttgtaaagaact 203  Q
    ||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||| ||| ||  |||| ||||||||    
T  4253697 ttggtgaaattggtaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcatgtaacc-cttttatatctctttggaaagaact 4253599  T
Q  204 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaact 266  Q
    || |||||| |||||| |||||  ||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4253598 ca-ttgataatggattagagagatcaatctctcccacagagtaggtcaa-tttggaccgaact 4253538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 48599502 - 48599338
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |  |||| |    
T  48599502 ttggtgatattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctctttgg--aagagc 48599406  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  48599405 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagcagatcaag-ttggaccgaactgggtga 48599338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Original strand, 3259095 - 3259159
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3259095 ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttgaaccgaactgggtga 3259159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 271
Target Start/End: Original strand, 6432071 - 6432134
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 271  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6432071 ttgatagtggattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtg 6432134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 43864244 - 43864406
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||||  || ||||  |||| ||||| |||    
T  43864244 ttggtgagattggaaaagtgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaacccatttgtatctcttt-gtaaa-aac 43864340  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    | ||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43864341 taatt-gatagtggattggagagatcaatctctctcccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 43864406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 4586161 - 4586323
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 203  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||||  || |  ||  ||||| |||||||    
T  4586161 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaattttttgtaacccatttttatctctttgt-aagaact 4586258  T
Q  204 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    || |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | || |||||  ||||||||||||||||    
T  4586259 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattatgtcaa-cttggaccgaactgggt 4586323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 8153342 - 8153513
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | ||||  ||||||| |||||||||||||||| |  ||||||  |||| ||||  |||    
T  8153342 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagattgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaat-aac 8153438  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||    
T  8153439 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggactgaactgggtcaacaatct 8153513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 18126644 - 18126815
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgt-caagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||||| |||  | ||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  18126644 ttggtgagattggaaaaatgtgtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttcaagctaatttcttgtaacccatttgta-tctctttgt-aagaac 18126740  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||| |||||||||||||||||    ||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| | ||||||    
T  18126741 tca-ttgatagtggattggaggaatcaatctctcccccagactaggtcaagttt-gaccgacctgggtcaacaatct 18126815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 2361140 - 2360978
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  2361140 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgta-tctctttgt-aagaac 2361044  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||| ||||||||||||| ||||   ||| |||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2361043 tca-ttgatagtggatttgagatatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttgaaccgaactgggt 2360978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4508874 - 4508710
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||| | |||| ||| |  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  4508874 ttggtgagattgggaaaatgagtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttattgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 4508778  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| || ||||||||||||||  ||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4508777 tcatt-gagagtggattggagagatcaatctcttcttcagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 4508710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 178
Target Start/End: Original strand, 23343975 - 23344048
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 178  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  23343975 ttggtgagatttggaaaagggtagaaattaaggtttattctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 23344048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24526065 - 24525992
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 177  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24526065 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaac 24525992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 31733118 - 31732966
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  31733118 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggtgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatactggattgg 31733023  T
Q  222 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  31733022 agagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31732966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 210 - 279
Target Start/End: Original strand, 48489534 - 48489602
Alignment:
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  48489534 atagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct 48489602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 47674111 - 47673953
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  47674111 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta-tctctttgt-aagaac 47674015  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 267  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | || |||||| |||||||||||||    
T  47674014 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcc-ccatattaagtcaag-ttggaccgaactg 47673953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Original strand, 18396418 - 18396481
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||    
T  18396418 ttgatagaggattggagagatcaatctctcctcaagagtaggtcaatggtggaccgaactgggt 18396481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Original strand, 30814536 - 30814598
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  30814536 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 30814598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 24525579 - 24525508
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  24525579 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccccaagattaggtcaag-ttggacggaactgggt 24525508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31105558 - 31105399
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||| | |||||||| |||||||    
T  31105558 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagatttt-ttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtat-ctttttgtaa-gaactca 31105462  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    || ||| |||||||||||||   || |||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  31105461 tt-gatggtggattggagagataaatctctccccaagagtagatcaag-ttggaccgaactgggt 31105399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 268
Target Start/End: Original strand, 31518993 - 31519063
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctc-ctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 268  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31518993 aagaactcatt-gacagtggattggagagatcaatctctctccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgg 31519063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12647650 - 12647347
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647650 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 12647551  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12647550 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 12647451  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647450 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 12647351  T
Q  311 cttg 314  Q
    ||||    
T  12647350 cttg 12647347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 22 - 326
Target Start/End: Original strand, 6266605 - 6266907
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6266605 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 6266704  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 218  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6266705 aaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactc-tttgatagtggat 6266802  T
Q  219 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttggttt 318  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||   ||||    
T  6266803 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctcc---gttt 6266899  T
Q  319 atcttgtg 326  Q
    ||||||||    
T  6266900 atcttgtg 6266907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 85 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 13656221 - 13655981
Alignment:
Q  85 tagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgt 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656221 tagagagaatcattgagtgtcttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgt 13656122  T
Q  185 attccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt- 283  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13656121 atcccttttgt-aagaactcatttgatagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttg 13656023  T
Q  284 gtgtttattgttttcttcttccctctccttggtttatcttgtg 326  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13656022 gtgtttgttgttttcttcttccctctcctt-gtttatcttgtg 13655981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 32289479 - 32289770
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggtt-gaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32289479 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggtttggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 32289577  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtgg 216  Q
     |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||      
T  32289578 aaaaggg-tagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaactcttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt-gatagtaa 32289673  T
Q  217 attggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    ||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |  |||||||| ||||||||||||||    
T  32289674 attagagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtccttgttttcctcttccctctcctt 32289770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4484592 - 4484294
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagag--aatcattgagtgtcttg------gtga 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||||      ||||    
T  4484592 ctctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtga 4484494  T
Q  113 gattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
     |||||||  || ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||||||     
T  4484493 aattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt- 4484397  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| | ||||||||||||||||||    
T  4484396 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggacagaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcttcttccctc 4484299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 104 - 313
Target Start/End: Original strand, 30833342 - 30833550
Alignment:
Q  104 tcttggtgagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaag 199  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| |    
T  30833342 tcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaa-g 30833439  T
Q  200 aactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttct 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||| | ||||||||     
T  30833440 aactcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggactgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcc 30833536  T
Q  300 tcttccctctcctt 313  Q
    ||||||||||||||    
T  30833537 tcttccctctcctt 30833550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Original strand, 45099665 - 45099926
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  45099665 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 45099762  T
Q  115 ttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  ||||    ||||||||||| ||    
T  45099763 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg---aagaactcatt-ga 45099857  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45099858 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 45099926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4503280 - 4503129
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 222  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  ||||    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4503280 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg---aagaactcatt-gatagtggattgga 4503186  T
Q  223 gagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4503185 gagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 4503129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36205921 - 36205661
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  36205921 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacatggtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 36205824  T
Q  115 ttgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgat 211  Q
    ||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  ||||    ||||||||||| ||     
T  36205823 ttgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcttttgtatctctttg---aagaactcatt-gac 36205729  T
Q  212 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    || |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36205728 agcggattggagagttcaatctatcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 36205661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5723423 - 5723252
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaact 203  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  |||| |||| |||||    
T  5723423 ttggtgagattgagaaaagggtagaaattaggctt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacctttttgtatctcttt-gtaa-gaact 5723327  T
Q  204 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5723326 catt-gatagtggattggagagatcaatctctcctctagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 5723252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2334586 - 2334414
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| ||  ||||| ||||||    
T  2334586 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaataaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaagctaatttctagtaactcttttgta-tctctttgt-aagaac 2334490  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  2334489 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggggaacaatct 2334414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 124 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36988225 - 36988072
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||   |||| |||||| || ||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  36988225 gggtagaaattaggg-ttgttctatgtgagcttgtcaaaactaatttcttgtaactcttttgta-tctctttgt-aagaactca-ttgatagtggattgg 36988130  T
Q  222 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36988129 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 36988072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 6595154 - 6595002
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggag 223  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  ||  | ||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  6595154 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgaatctctttgtaa-gaactcgtt-gatagtggattggag 6595058  T
Q  224 agtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6595057 agatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgagtgaacaatct 6595002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 270
Target Start/End: Original strand, 33648176 - 33648335
Alignment:
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||     
T  33648176 gagattgagaaaatggtaaaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcctgtaacccttttgtatttcttt-gtaaagaactcatt- 33648273  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  33648274 gatagcggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggt 33648335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 45726929 - 45727093
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||| ||||    
T  45726929 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagagtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacctatttgtatctcttt-gtaa-gaac 45727025  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45727026 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 45727093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34139920 - 34139767
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctct-tgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  34139920 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatatgtatcccttttgtaa-gaactcatt-gatagtggattgg 34139824  T
Q  222 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  34139823 agagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 34139767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 29867869 - 29868031
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  29867869 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgta-tctctttgt-aagaac 29867965  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29867966 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 29868031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 124 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 723893 - 723741
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 221  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  723893 gggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgg 723798  T
Q  222 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  723797 agagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 723741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 277
Target Start/End: Original strand, 24398055 - 24398228
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaa--aggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||| |||  | |||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||  ||||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||    
T  24398055 ttggtgagattgtgaagaaagggtagaagttaaggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaaagaa 24398153  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 277  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||   |||||||||||||| ||| ||||    
T  24398154 ctcatt-gataatggattggagagatcaatctctcccccatagtaggtcattgttggaccgaactggctgaacaat 24398228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 35446961 - 35446888
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35446961 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcactctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 35446888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14633975 - 14633834
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 221  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  14633975 gggtagaaattaggatt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttttgtaa-gaactcata-gatagtggattgg 14633879  T
Q  222 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactg 267  Q
    ||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14633878 agagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactg 14633834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 38312240 - 38312411
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| || |    
T  38312240 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gatc 38312336  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  38312337 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 38312411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 1631809 - 1631736
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  1631809 aagaactcatt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 1631736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17057446 - 17057366
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17057446 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 17057366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17085429 - 17085349
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  17085429 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagactaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 17085349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 255
Target Start/End: Original strand, 42362355 - 42362500
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| |||||||    
T  42362355 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactca 42362451  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 255  Q
    || |||||||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||||||    
T  42362452 tt-gatagtggattggagagatctatctctcccccagattaggtcaagtt 42362500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11151759 - 11151588
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  11151759 ttggtgaaattgggaaaatgggtagaaattaga-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaa-gaac 11151663  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    || || |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  11151662 tc-ttagatagtggattggagagatcaacctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 11151588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 36773562 - 36773733
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  36773562 ttggtgagattgggaaaatgggaataaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 36773658  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  36773659 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36773733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 279
Target Start/End: Original strand, 39284936 - 39285007
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  39284936 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 39285007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 179
Target Start/End: Original strand, 13121769 - 13121843
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacct 179  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  13121769 ttggtgagactgggaaaatggtagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagataatttcttgtaacct 13121843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 26353184 - 26353346
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaact 203  Q
    ||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||| | ||||  ||| | |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| |||    
T  26353184 ttggtgagattgaaaaaagtgtagaaattaaggtttgttctttgtgagtttgttgaagctaatttcttgtaacacttttgta-tctttttgt-aagtact 26353281  T
Q  204 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    || |||||||||||||||||||  ||  ||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  26353282 ca-ttgatagtggattggagagatcactctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaaccgggt 26353346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 36318086 - 36318006
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  36318086 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccttagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 36318006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17490225 - 17490154
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17490225 aagaactcatt-gatagtggattgtagagatcaatctctcccctagagtaggtcaa-tttggaccgaactgggt 17490154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 279
Target Start/End: Original strand, 17450678 - 17450748
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  17450678 ttgatagtggattggagagatcaatctctcc-acagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtgaacaatct 17450748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 264
Target Start/End: Original strand, 28672036 - 28672088
Alignment:
Q  212 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaa 264  Q
    ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  28672036 agtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaa 28672088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 44203536 - 44203839
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203536 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 44203635  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44203636 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 44203735  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203736 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 44203835  T
Q  311 cttg 314  Q
    ||||    
T  44203836 cttg 44203839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 9036320 - 9036633
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttg 108  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9036320 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttg 9036419  T
Q  109 gtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||    
T  9036420 gtgagattgggaaaagggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-ttt 9036517  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  9036518 gatagtggattgaagagtacaatctctcctcgagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctc 9036616  T
Q  309 tccttggtttatcttgtg 326  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  9036617 tcctt-gtttatcttgtg 9036633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 21053872 - 21054163
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21053872 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagaaaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 21053971  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 218  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21053972 aaaagtgtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactc-tttgatagtggat 21054069  T
Q  219 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21054070 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttggtgtat-ttgttttcttcttccctctcctt 21054163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 40282291 - 40282582
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  40282291 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 40282390  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  40282391 aaaagggtagaaattagggttagttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgtaa-gaactc-tttgatagtggat 40282488  T
Q  219 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  40282489 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcctt 40282582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 9987116 - 9987407
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9987116 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 9987215  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggat 218  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  9987216 aaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtctaatctaatttcttgcaaccttttgtatcccttttgcaa-gaactcatt-gatagtggat 9987312  T
Q  219 tggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9987313 tggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtcttttgttttcttcttccctctcctt 9987407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20622492 - 20622200
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20622492 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagggaaaatcattgactgtcttggtgagattggg 20622393  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgta-aagaactcatttgatagtgga 217  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| |  |||||||| ||||||||||||    
T  20622392 aaaagggtagaaattagggtt-gttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttttgtaagaactc-tttgatagtgga 20622295  T
Q  218 ttggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  20622294 ttggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtct-ttgttttcttcttccctctcctt 20622200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 51765302 - 51765601
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagag--aatcattgagtgtcttg------gtgag 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||||      ||  |    
T  51765302 ctctagggtttagggt-ctttgattagagcttctcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtttg 51765400  T
Q  114 attggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt--gtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||    | | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||  ||||||||| |||||||||     
T  51765401 attgggagaaaagggtagaaattagggttgtacctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccccttttgtatctcttttgtaa-gaactcatt- 51765498  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||| |||||||||    
T  51765499 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggacaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcctcttccctc 51765596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13316521 - 13316348
Alignment:
Q  105 cttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  |||||    
T  13316521 cttggtgagattgggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaa 13316425  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13316424 ctcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 13316348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8550952 - 8550783
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||| ||| ||||| |||||||||    
T  8550952 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaactcatttgta-tccctttgt-aagaactca 8550856  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
     |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8550855 -ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 8550783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 20762671 - 20762844
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  || ||   |||||    
T  20762671 ttggtgagattgagaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtat--ctcttcgtaagaa 20762767  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20762768 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctacagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtgaccaatct 20762844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 3189330 - 3189502
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| || |||||| | |||||||| ||||    
T  3189330 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtat-ctttttgtaa-gaac 3189426  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3189427 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3189502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 3198147 - 3198319
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| || |||||| | |||||||| ||||    
T  3198147 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtat-ctttttgtaa-gaac 3198243  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3198244 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3198319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 3206986 - 3207158
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| || |||||| | |||||||| ||||    
T  3206986 ttggtgagatttggaaaaagggtataaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcctgtaactcttttgtat-ctttttgtaa-gaac 3207082  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3207083 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcatccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 3207158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 37168297 - 37168462
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||    
T  37168297 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 37168393  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37168394 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 37168462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 29136247 - 29136412
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | |||| |||| | |||||||||||||| || ||  ||||||| | ||||| ||||||    
T  29136247 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttggaacccatttgtatttc-tttgt-aagaac 29136343  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29136344 tca-ttgatcgtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactaggtga 29136412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13547257 - 13547093
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||| ||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  13547257 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctattttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 13547161  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13547160 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 13547093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 42298143 - 42297962
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  42298143 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 42298047  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  42298046 tcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgtt 42297962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 44455160 - 44455322
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||||||||||| |  ||||| || |||||| ||||||    
T  44455160 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaggg-ttgttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaactcatttgta-tctttttgt-aagaac 44455256  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  44455257 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaagttt-gaccgaactgggt 44455322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 13549168 - 13549004
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagc-taatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||| || | ||||||| |||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  13549168 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttaaacctaatttcatgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 13549072  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13549071 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 13549004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 47255508 - 47255343
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  47255508 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 47255412  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  47255411 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 47255343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28220394 - 28220223
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  28220394 ttggtgagattcggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 28220298  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  28220297 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28220223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 7482399 - 7482234
Alignment:
Q  106 ttggtgagattggg-aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||  |||| |||| |||    
T  7482399 ttggtgagattgggtaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaa-gaa 7482303  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7482302 ctcatt-gatagtgaattggagagatcaatctctccttcagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 7482234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 11348698 - 11348862
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  ||||    ||||||    
T  11348698 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctctttct--aagaac 11348794  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11348795 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgagtga 11348862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 834332 - 834164
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || |||| ||||| |||| |||||||    
T  834332 gtgagattgggaaaatggatagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatcccttt-gtaa-gaactca 834236  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    || |||||||||||||||||  | | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  834235 tt-gatagtggattggagagatctatctctcccccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 834164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 3156865 - 3157036
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  3156865 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 3156961  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  3156962 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 3157036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4552805 - 4552634
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| | | |||| |||||  ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||||    
T  4552805 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagg-tttgtcctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccctttgtatcccttt-gtaa-gaac 4552709  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  4552708 tcatt-gataatggattggagagatcaatctctccctcagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4552634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28265702 - 28265551
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  28265702 ggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactc-tttgatagtggattgga 28265607  T
Q  223 gagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  28265606 gagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28265551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 37033241 - 37033059
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  ||||||||||||||||| |  | ||| ||  |||| |||| |||    
T  37033241 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaatccattttgcatctcttt-gtaa-gaa 37033145  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    |||||| |||||||||||||||||   || |||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  37033144 ctcatt-gatagtggattggagagattaatctcttctccatagtaggtcatggttggaccgaactgggtgaacaatctattcgtgtt 37033059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 47115171 - 47115337
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  | ||||||  |||| ||||| ||    
T  47115171 ttggtgagattgggaaaattggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttgtatctcttt-gtaaa-aa 47115267  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    | |||| |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  47115268 cccatt-gatagtggattggagagatcaatctctgctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 47115337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 31925856 - 31925711
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 221  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31925856 gggtagaaattagggat-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatagtggattgg 31925761  T
Q  222 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||  ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31925760 agagatcaatctctcctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtga 31925711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 272
Target Start/End: Original strand, 28242396 - 28242469
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  28242396 aagaactcatt--atagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcattgttggaccgaactgggtga 28242469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 37503722 - 37503577
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaact 203  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| |||||||    
T  37503722 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac--cttgta-tctctttgt-aagaact 37503628  T
Q  204 catttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 255  Q
    || |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| || ||||||||    
T  37503627 ca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattatgtcaagtt 37503577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 49918350 - 49918521
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  49918350 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta-tctctttgt-aagaac 49918446  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  49918447 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccaaattaggtcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 49918521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13659413 - 13659333
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  13659413 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 13659333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Original strand, 193711 - 193775
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  193711 ttgatagtggattggagagatcaatctcttctccagagtatgtcaag-ttggaccgaactgggtga 193775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 271
Target Start/End: Original strand, 34603595 - 34603740
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattcct-tttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || | |  || ||||||| ||||||||| ||| ||||||||     
T  34603595 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccattttttatctctttgtaa-gaactcatt-gatggtggattga 34603691  T
Q  222 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtg 271  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34603692 agagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactaggtg 34603740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 28223589 - 28223418
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | || |  |||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  28223589 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattatggtt-gatctttctgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 28223493  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  28223492 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 28223418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45644523 - 45644351
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagggg-tagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||| | ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  45644523 ttggtgagattgagaaaatggatagaaattaagttttgttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgcaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 45644426  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  45644425 tcatt-gatagtggattggagagatcaatatctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 45644351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 251
Target Start/End: Original strand, 22079322 - 22079461
Alignment:
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    |||||||| |||  ||||||||||| | ||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||     
T  22079322 gagattggaaaaatggtagaaattatg-tttgttctttgtgagcttgttaaagctaatttcttgtaaccattttgtatctcttt-gtaaagaactcatt- 22079418  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtca 251  Q
    |||| ||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||||    
T  22079419 gatattggattggagagatcaatttctcctccaaagtaggtca 22079461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Original strand, 46065009 - 46065089
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||    
T  46065009 aagaactcattc-atagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggtcaag-ttggatcgaactgggtaaacaatct 46065089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Original strand, 19754494 - 19754657
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| |||    
T  19754494 ttggtgagattgagaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaaccgatttgtatctcttt-gtaa-gaa 19754590  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  19754591 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaagtgggt 19754657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 50169378 - 50169218
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| |  ||||| ||  ||||| ||| ||    
T  50169378 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgta-tctctttgt-aagtac 50169282  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgg 268  Q
    ||| |||||||||||||| ||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  50169281 tca-ttgatagtggattgaagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgg 50169218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 23555433 - 23555286
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || |||||||||| |||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  23555433 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttataactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 23555337  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  23555336 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcc-ccatagtaggtcaagtt 23555286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 279
Target Start/End: Original strand, 31659338 - 31659409
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  31659338 ttgatagtggattggagagatcaatctctccctcagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 31659409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 50167343 - 50167172
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||  | |||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||||  |||| ||||| |||    
T  50167343 ttggtgagattgggaaaattagtagaaattagggtt-gttatttgtgagcttgtcaaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaaa-aac 50167247  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||| ||| | ||||||    
T  50167246 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattagctcaag-ttggaccgaactaggtcaacaatct 50167172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 160 - 247
Target Start/End: Original strand, 5459961 - 5460046
Alignment:
Q  160 aagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtag 247  Q
    |||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||| ||||| || |||||||    
T  5459961 aagctaatttcttgtaacattttatatttc-tttgtaaagaactca-ttgatagtagattggagagatcaatctctcatctagagtag 5460046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 182
Target Start/End: Original strand, 32736952 - 32737009
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctctt 182  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  32736952 gggtagaaattagggtttgttctttatgaactt-ttaagctaattttttgtaacctctt 32737009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 37876834 - 37876770
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  37876834 ttgatagtggattgcagagatcaatctctcctccagagtacatcaag-ttgaaccgaactgggtga 37876770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 928123 - 928071
Alignment:
Q  127 tagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaacc 178  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  928123 tagaaattagggtttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 928071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12318685 - 12318618
Alignment:
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc 178  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||    
T  12318685 gagatttggaaatgggtagaaattagg-tttgttcatggagagcttgttgaagctaatttcttgtaacc 12318618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2868 - 2565
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2868 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 2769  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2768 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 2669  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 310  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2668 tagtggattggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctttttgtgtttattgttttcttcttccctctc 2569  T
Q  311 cttg 314  Q
    ||||    
T  2568 cttg 2565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 42575589 - 42575272
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575589 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 42575490  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575489 gagattgggaaaggggtagaaattagggattgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 42575390  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575389 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 42575290  T
Q  310 ccttggtttatcttgtgtttg 330  Q
    |||||   |||||||||||||    
T  42575289 ccttg---tatcttgtgtttg 42575272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 15290427 - 15290731
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290427 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 15290526  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290527 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 15290626  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290627 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 15290726  T
Q  310 ccttg 314  Q
    |||||    
T  15290727 ccttg 15290731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Original strand, 15470796 - 15471100
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470796 caaagggaaagctctagggtttagggttctttgattagagtacctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 15470895  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaac-ttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470896 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacattgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 15470995  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470996 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgtccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctct 15471095  T
Q  310 ccttg 314  Q
    |||||    
T  15471096 ccttg 15471100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 18 - 313
Target Start/End: Original strand, 25689865 - 25690161
Alignment:
Q  18 gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgta--gagagaatcattgagtgtcttggtgagat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689865 gaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagagaatcattgagtgtcttggtgagat 25689964  T
Q  116 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtg 215  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||    
T  25689965 tgggaaaaaggtagaaattagggtttgttcattgtgaacttgtcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtg 25690062  T
Q  216 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25690063 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctctttggtgtttgttgttttcttcttccctcccctt 25690161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 3439418 - 3439709
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattggg 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3439418 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtaaagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattggg 3439517  T
Q  120 aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggatt 219  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3439518 aaaagggtagaaattagggtttgttcattatgaacttggcaagctaatttcttgtaaccttttgtatcccttttgt-aagaactc-tttgatagtggatt 3439615  T
Q  220 ggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctcttt-gtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3439616 ggagagtacaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggatgaacaatctctttggtgctt-ttgttttcttcttccctctcctt 3439709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Original strand, 2627649 - 2627941
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttggtgagattgg 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2627649 ctctagggtttagagt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacatgggaaacaccttgaagagagaaaatcattgagtgtcttggtgagattgg 2627747  T
Q  119 gaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa--cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtg 215  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||  | | ||||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  2627748 gaaaagggtagaaattaggg-ttgttcattgtgaacttgtcaaatctaatttcttgcaactctttttgtatctcttgtgt-aagaactca-ttgatagtg 2627844  T
Q  216 gattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctcctt 313  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  2627845 gattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaataatctcttggtgtct-ttgttttcctcttccctctcctt 2627941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Original strand, 17982563 - 17982825
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  17982563 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 17982660  T
Q  115 ttgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||||||||| ||    
T  17982661 ttgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-ga 17982756  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17982757 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 17982825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34254586 - 34254327
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagat 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       |||||||    
T  34254586 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggagacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagat 34254489  T
Q  116 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatag 213  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||| ||| |||||    
T  34254488 tgggaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaacttatt-gatag 34254393  T
Q  214 tggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34254392 tggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34254327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Original strand, 31218167 - 31218429
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  31218167 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 31218264  T
Q  115 ttgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    ||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |  ||||||||||| ||    
T  31218265 ttgggaaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttgg--aagaactcatt-ga 31218360  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31218361 tagtggattagagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 31218429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 42498193 - 42498366
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg--ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaa 201  Q
    |||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |||    
T  42498193 ttggtgagattgggaaaaaaaggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccttttgtatttcttt-gtaa-gaa 42498289  T
Q  202 ctcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42498290 ctcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 42498366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 34256762 - 34256503
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgagat 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| | ||||| ||||  | | |||  |||||||||||||||       |||||||    
T  34256762 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tatcttgggttggaaacattgtaaacaccttggtgtgtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgagat 34256665  T
Q  116 tgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatag 213  Q
    ||| |||  |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| |||||    
T  34256664 tggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagttaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-gatag 34256569  T
Q  214 tggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34256568 tggattggagagatcaatctctcctctagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 34256503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Original strand, 44303764 - 44304027
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  44303764 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 44303861  T
Q  115 ttgggaaag---gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaactcatttg 209  Q
    ||||||||    |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||   ||||||||||| |    
T  44303862 ttgggaaaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaatccttttgtatctcttttt--aagaactcatt-g 44303957  T
Q  210 atagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  44303958 atagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggatcgaactaggtgaacaatct 44304027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 125 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 1746366 - 1746216
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 222  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  1746366 ggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg---aagaactcatt-gatagtggattgga 1746272  T
Q  223 gagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatc 278  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1746271 gagttcaatctctcctccatagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatc 1746216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19945529 - 19945355
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |  || ||   ||||||    
T  19945529 ttggtgagattgggaaaaaagggtagaaattatggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaaccacttttgtatctctttggaagaac 19945431  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19945430 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctcgagagtaggtcaagtttgaaccgaactgggtgaacaatct 19945355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42435159 - 42434995
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  42435159 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 42435063  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42435062 tcatt-gatagtggattggagaaatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 42434995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 15212786 - 15212957
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaa-cctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||| ||||||    
T  15212786 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgta-tctctttgt-aagaac 15212882  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  15212883 tca-ttgataatggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 15212957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 279
Target Start/End: Original strand, 40321082 - 40321251
Alignment:
Q  108 ggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactc 204  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||| |||||||||||||||  || ||||  |||| ||||| |||||    
T  40321082 ggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagttaatttcttgtaacccattagtatctcttt-gtaaa-aactc 40321178  T
Q  205 atttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
     ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  40321179 -tttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 40321251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 4283524 - 4283688
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  4283524 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttttttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 4283620  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4283621 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctcccctctagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 4283688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 33352150 - 33352321
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  33352150 ttggtgagattgggaaaatgggtaaaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaacctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 33352246  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  33352247 tcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 33352321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 43036423 - 43036594
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  || ||||||||||||||  |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  43036423 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaaactaatttcttgtaattcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 43036519  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  43036520 tcatt-gatagtggatttgagagatcaatctctcctccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 43036594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 18655400 - 18655564
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  18655400 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 18655496  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18655497 tcatt-gatagtggattagagagatcaatctctcctccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtga 18655564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 27811278 - 27811449
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  27811278 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 27811374  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
     |||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  27811375 ccatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 27811449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 4743291 - 4743211
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  4743291 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccaaagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 4743211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10930267 - 10930187
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtt 288  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||    
T  10930267 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatttcttggtgtt 10930187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 12702783 - 12702631
Alignment:
Q  124 gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctcttgtattcct-tttgtaaagaactcatttgatagtggattgg 221  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | |  || ||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  12702783 gggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacc-cttttgtgtctctttgtaa-gaactcatt-gatattggattgg 12702688  T
Q  222 agagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  12702687 agagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 12702631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3303838 - 3303667
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | |||| |||||  || ||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  3303838 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgtgagcttgtttaacctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 3303742  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  3303741 tcatt-gatagtggattgaagagatcaatctctcccccacagtaggtcaag-ttggaccgaactgggtaaacaatct 3303667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1345449 - 1345391
Alignment:
Q  196 aaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtt 255  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1345449 aaagaactcatt-gatagtggattgaagagttcaatctctcccccagagtaggtcaagtt 1345391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Original strand, 40221845 - 40221907
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40221845 ttgatagtggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 40221907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Original strand, 5689362 - 5689442
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  5689362 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagatttggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 5689442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 279
Target Start/End: Original strand, 6598975 - 6599143
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  || |||| | |||||||| |||||||    
T  6598975 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaa-gaactca 6599071  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    || ||||||||||| |||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  6599072 tt-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6599143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 279
Target Start/End: Original strand, 6674428 - 6674596
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactca 205  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||| | | || |||||  |||||||||||||||||||  || |||| | |||||||| |||||||    
T  6674428 gtgagattgggaaaatgggtagaaattaag-tttgttctttgcgagcttgtttaagctaatttcttgtaacccatttgtatac-ttttgtaa-gaactca 6674524  T
Q  206 tttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    || ||||||||||| |||||  ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  6674525 tt-gatagtggattagagagatcaatctctcccccatattaggtcaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 6674596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 249
Target Start/End: Original strand, 40328782 - 40328922
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacc--tcttgtattccttttgtaaagaactc 204  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||||  || |||||||||||||||   | ||||||  |||| |||| ||||||    
T  40328782 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagg-tttgttctttgtgagcttgtttaaactaatttcttgtaactcattttgtatctcttt-gtaa-gaactc 40328878  T
Q  205 atttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggt 249  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  40328879 att-gatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggt 40328922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Original strand, 4733806 - 4733868
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  4733806 ttgatagtggattggagagatcgatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 4733868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8965859 - 8965820
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttc 145  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8965859 ttggtgagattgggaaaaaggtagaaattagggtttgttc 8965820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 269
Target Start/End: Original strand, 18141821 - 18141981
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  18141821 ttggtgagattgtgaaaatgggtagaaattagg--ttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatcacttt-gtaa-gaac 18141916  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactggg 269  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  18141917 tc-tttgatagtggattggagagatcaatctctcccctagattaggtcaag-ttggaccaaactggg 18141981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 178
Target Start/End: Original strand, 9765745 - 9765818
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc 178  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  9765745 ttggtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgagcttggcaaagctaatttcttgtaacc 9765818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41366727 - 41366622
Alignment:
Q  160 aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttgg 258  Q
    ||||||||||||| |||||| || |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| ||||||||| ||||    
T  41366727 aagctaatttcttttaacctatttgtatcccttt-gtaa-gaactcattt-atagtggattggagagatcaatctctcc-ctagattaggtcaag-ttgg 41366633  T
Q  259 accgaactggg 269  Q
    |||||||||||    
T  41366632 accgaactggg 41366622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 177
Target Start/End: Original strand, 44353796 - 44353865
Alignment:
Q  109 gtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac 177  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44353796 gtgagattgggaaaatgggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaac 44353865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Original strand, 11384085 - 11384149
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||||| |||||||||||   | | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11384085 ttgatactggattggagacatcgatctctcctccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 11384149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 177
Target Start/End: Original strand, 30291606 - 30291679
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttg-tcaagctaatttcttgtaac 177  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| | |||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  30291606 ttggtgagattgagaaaatgggtagaaattaggttttgttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaac 30291679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Original strand, 6177 - 6491
Alignment:
Q  11 caaaggggaagctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatggaaaacatcttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 110  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177 caaaggggcaactctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttgaaaacatgggaaacaccttgtagagagaatcattgagtgtcttggt 6276  T
Q  111 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaacctcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6277 gagattgggaaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaagctaatttcttgtaagcccttgtatcccttttgtaaagaactcatttga 6376  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6377 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggttaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtg-ttattgttttcttcttccctctc 6475  T
Q  311 cttggtttatcttgtg 326  Q
    |||| |||||||||||    
T  6476 cttgttttatcttgtg 6491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11423 - 11125
Alignment:
Q  22 ctctagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagag--aatcattgagtgtcttg------gtga 112  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||||      ||||    
T  11423 ctctagggtttatggt-ctttgattagagcttctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgtaaatcattgagtgtcttgttcttggtga 11325  T
Q  113 gattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcattt 208  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| |||||| ||     
T  11324 gattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtaaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaa-gaactcgtt- 11228  T
Q  209 gatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctc 308  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | |||||||| |||||||||    
T  11227 gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcctcttccctc 11130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 104 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 8907 - 8703
Alignment:
Q  104 tcttggtgagattggga--aaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaag-ctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaag 199  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| | |||||||| | ||  |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| |    
T  8907 tcttggtgagattgggagaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttataaaatctaatttcttgtaacccttttgtatctcttttgtaa-g 8810  T
Q  200 aactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttct 299  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| | ||||||||     
T  8809 aactcgtt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct-ttggtgtct-ttgttttcc 8713  T
Q  300 tcttccctct 309  Q
    ||||||||||    
T  8712 tcttccctct 8703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Original strand, 434443 - 434703
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttg-aaaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg-------gtgaga 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||  ||| |||  |||||||||||||||       ||||||    
T  434443 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttggaaaacatggtaaataccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcattggtgaga 434540  T
Q  115 ttggg--aaaggggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttga 210  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||| ||    
T  434541 ttggggaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctcttt-gtaa-gaactcatt-ga 434636  T
Q  211 tagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaat 277  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  434637 tagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaat 434703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 279
Target Start/End: Original strand, 827 - 1087
Alignment:
Q  25 tagggtttagggttctttgattagagtatctcttgggttga-aaacatggaaaacatcttgtagagagaa--tcattgagtgtcttg------gtgagat 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||| ||||  ||| |||  |||||||||||||||      |||||||    
T  827 tagggtttagggt-ctttgattagagt-tctcttgggttgggaaacattgtaaacaccttggtgagtgaaaatcattgagtgtcttgttcttggtgagat 924  T
Q  116 tgggaaag--gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaacc-tcttgtattccttttgtaaagaactcatttgat 211  Q
    |||||||   ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||  ||||    || |||||||| |||    
T  925 tgggaaaaaagggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacccttttgtatctctttg---aacaactcatt-gat 1019  T
Q  212 agtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1020 agtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatct 1087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 287
Target Start/End: Original strand, 11557 - 11737
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaagg-ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||| ||||    
T  11557 ttggtgagattgggaaaaatggtagaaattagggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaa-gaac 11653  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgt 287  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11654 tcatt-gatagtggattggagagttcaatctctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaacaatctcttggtgt 11737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 314
Target Start/End: Original strand, 1 - 72
Alignment:
Q  243 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 agtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatctctttgtgtttattgttttcttcttccctctccttg 72  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 106 - 279
Target Start/End: Original strand, 114602 - 114774
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtcaa-gctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||  ||||| ||||||    
T  114602 ttggtgagattgggaaaaagggtagaaattaaggtt-gttctttgtgaacttgtcaaagctaatttcttgtaacgcttttgta-tctctttgt-aagaac 114698  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  114699 tca-ttgatagtggattggagagatcaatctctcctccagagtaggttaagtttagaccgaactggatgaacaatct 114774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 125 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18151 - 18007
Alignment:
Q  125 ggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaac-ctcttgtattccttttgtaaagaactcatttgatagtggattgga 222  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  18151 ggtagaaattagggtt-gttcattgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaactcatttgtatctcttt-gtaaa--actcatt-gatagtggattgga 18057  T
Q  223 gagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    |||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18056 gagatcaatctctcctccagggtaggtcaagtttggatcgaactgggtga 18007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 270
Target Start/End: Original strand, 10589 - 10651
Alignment:
Q  207 ttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10589 ttgatagtggattgaagagatcaatctctcctccagagtaggtcaag-ttggaccgaactgggt 10651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 149174 - 149094
Alignment:
Q  197 aagaactcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtgaccaatct 279  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  149174 aagaactcatt-gatagtggattggagagatcaatctctcccccagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtcaacaatct 149094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 272
Target Start/End: Original strand, 7327 - 7491
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaag-gggtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||| | |||| |||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  7327 ttggtgagattggaaaaatgggtagaaattaaggtt-gttctttgtgagcttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 7423  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggtga 272  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7424 tcatt-gatagtggattggaaagatcaatctctcctctagagtaggttaag-ttggaccgaactgggtga 7491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 20583 - 20421
Alignment:
Q  106 ttggtgagattgggaaaggg-gtagaaattagggtttgttcatagtgaacttgtc-aagctaatttcttgtaacctctt-gtattccttttgtaaagaac 202  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||  |||| |||| ||||    
T  20583 ttggtgagattgggaaaatgagcagaaattagg-tttgttttttgtgaacttgttgaagctaatttcttgtaacccatttgtatctcttt-gtaa-gaac 20487  T
Q  203 tcatttgatagtggattggagagtacaaactctcctccagagtaggtcaagtttggaccgaactgggt 270  Q
    || ||||||| ||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20486 tc-tttgatattggattggagagatcaatctctcccccagattaggtcaag-ttggaccgaactgggt 20421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University