View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5284_high_9 (Length: 448)

Name: NF5284_high_9
Description: NF5284
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5284_high_9
NF5284_high_9
[»] chr7 (212 HSPs)
chr7 (14-442)||(9004444-9004877)
chr7 (65-442)||(17946595-17946974)
chr7 (8-212)||(25181029-25181233)
chr7 (14-218)||(10204501-10204705)
chr7 (103-442)||(35964060-35964401)
chr7 (121-442)||(3376341-3376660)
chr7 (14-220)||(4313050-4313256)
chr7 (14-220)||(4307680-4307886)
chr7 (65-275)||(8787290-8787500)
chr7 (65-266)||(8780426-8780627)
chr7 (120-442)||(41722627-41722955)
chr7 (294-442)||(13434978-13435128)
chr7 (294-442)||(4030119-4030267)
chr7 (294-442)||(10204827-10204977)
chr7 (124-442)||(48340436-48340749)
chr7 (294-442)||(37100194-37100342)
chr7 (67-261)||(39271026-39271220)
chr7 (294-442)||(33612103-33612253)
chr7 (65-261)||(4090567-4090764)
chr7 (294-442)||(2325672-2325820)
chr7 (294-442)||(12199285-12199433)
chr7 (298-442)||(648620-648766)
chr7 (65-195)||(1611887-1612017)
chr7 (65-238)||(4029906-4030080)
chr7 (294-442)||(4313322-4313472)
chr7 (118-272)||(33609639-33609792)
chr7 (294-442)||(9258460-9258608)
chr7 (294-442)||(9311645-9311793)
chr7 (295-442)||(16330718-16330866)
chr7 (295-437)||(9009713-9009856)
chr7 (226-442)||(13731834-13732046)
chr7 (295-437)||(14229789-14229932)
chr7 (295-437)||(15061364-15061507)
chr7 (295-437)||(19014480-19014623)
chr7 (295-437)||(23203901-23204044)
chr7 (295-437)||(23510028-23510171)
chr7 (65-261)||(3210762-3210959)
chr7 (295-437)||(14532-14675)
chr7 (295-437)||(538098-538241)
chr7 (295-437)||(544972-545115)
chr7 (295-437)||(826364-826507)
chr7 (295-437)||(828375-828518)
chr7 (295-437)||(4158513-4158656)
chr7 (295-437)||(4466495-4466638)
chr7 (295-437)||(8713099-8713242)
chr7 (295-437)||(8718603-8718746)
chr7 (295-437)||(12548146-12548289)
chr7 (295-437)||(15066453-15066596)
chr7 (295-437)||(15916131-15916274)
chr7 (295-437)||(15924440-15924583)
chr7 (295-437)||(18389770-18389913)
chr7 (295-437)||(23515810-23515953)
chr7 (294-442)||(21507089-21507239)
chr7 (294-442)||(5397836-5397987)
chr7 (338-442)||(8521987-8522091)
chr7 (294-442)||(782599-782750)
chr7 (295-437)||(821351-821494)
chr7 (295-437)||(9577965-9578108)
chr7 (121-275)||(14941738-14941893)
chr7 (121-275)||(15369331-15369486)
chr7 (295-437)||(19364509-19364652)
chr7 (121-275)||(33612278-33612433)
chr7 (294-442)||(15707075-15707224)
chr7 (294-442)||(16487483-16487632)
chr7 (296-442)||(48801079-48801228)
chr7 (294-437)||(5840780-5840924)
chr7 (121-275)||(648795-648950)
chr7 (295-437)||(14545539-14545682)
chr7 (121-275)||(15707249-15707404)
chr7 (124-268)||(16076844-16076984)
chr7 (294-442)||(48355394-48355545)
chr7 (65-199)||(9311391-9311525)
chr7 (124-275)||(16097424-16097571)
chr7 (294-442)||(34390735-34390884)
chr7 (294-442)||(39271270-39271419)
chr7 (295-436)||(45407637-45407781)
chr7 (294-442)||(3210554-3210705)
chr7 (303-437)||(14551787-14551922)
chr7 (294-442)||(23293528-23293679)
chr7 (65-199)||(9258728-9258862)
chr7 (103-272)||(17206408-17206576)
chr7 (294-442)||(22578739-22578888)
chr7 (294-442)||(48713560-48713709)
chr7 (148-268)||(12561890-12562010)
chr7 (124-268)||(782792-782932)
chr7 (121-275)||(48355594-48355749)
chr7 (294-442)||(4307958-4308108)
chr7 (294-437)||(30257461-30257607)
chr7 (294-442)||(12562052-12562201)
chr7 (294-442)||(14941565-14941713)
chr7 (295-437)||(15173727-15173872)
chr7 (294-442)||(15369158-15369306)
chr7 (124-268)||(12567565-12567705)
chr7 (294-442)||(12567747-12567898)
chr7 (294-437)||(13652092-13652238)
chr7 (294-437)||(13658615-13658761)
chr7 (294-437)||(14582014-14582160)
chr7 (294-437)||(15205903-15206049)
chr7 (294-437)||(16119171-16119317)
chr7 (294-437)||(16154810-16154956)
chr7 (294-437)||(18274112-18274258)
chr7 (294-437)||(18288327-18288473)
chr7 (294-419)||(21005374-21005500)
chr7 (294-437)||(23077102-23077248)
chr7 (303-442)||(24057793-24057935)
chr7 (294-418)||(1614085-1614210)
chr7 (295-379)||(9585391-9585475)
chr7 (294-442)||(13674603-13674754)
chr7 (294-442)||(14752866-14753017)
chr7 (294-442)||(15176382-15176533)
chr7 (294-437)||(3201519-3201665)
chr7 (294-437)||(16464959-16465105)
chr7 (294-437)||(18072290-18072436)
chr7 (294-442)||(20109127-20109277)
chr7 (294-437)||(27292046-27292192)
chr7 (303-437)||(35953796-35953933)
chr7 (294-378)||(8780339-8780423)
chr7 (294-378)||(8787178-8787262)
chr7 (294-378)||(9562048-9562132)
chr7 (294-442)||(20624715-20624863)
chr7 (294-378)||(33609837-33609921)
chr7 (124-268)||(5840598-5840738)
chr7 (328-441)||(9192649-9192764)
chr7 (294-442)||(13667925-13668076)
chr7 (294-442)||(18589074-18589225)
chr7 (294-442)||(18592668-18592819)
chr7 (294-442)||(18599299-18599450)
chr7 (294-437)||(12575907-12576053)
chr7 (294-437)||(16471485-16471631)
chr7 (294-415)||(38877519-38877640)
chr7 (294-437)||(39387898-39388044)
chr7 (294-379)||(4460652-4460737)
chr7 (205-274)||(4460773-4460842)
chr7 (175-272)||(4983163-4983260)
chr7 (294-378)||(9193908-9193992)
chr7 (14-82)||(14941919-14941987)
chr7 (14-82)||(15369512-15369580)
chr7 (294-442)||(18618865-18619016)
chr7 (321-437)||(319766-319884)
chr7 (294-415)||(1462660-1462782)
chr7 (294-379)||(9264255-9264341)
chr7 (294-437)||(16076656-16076802)
chr7 (294-437)||(16532792-16532938)
chr7 (294-437)||(16632724-16632870)
chr7 (14-220)||(48713288-48713503)
chr7 (297-378)||(6257416-6257497)
chr7 (14-225)||(13434694-13434914)
chr7 (294-429)||(368221-368357)
chr7 (294-378)||(39388847-39388931)
chr7 (312-442)||(38387981-38388112)
chr7 (294-418)||(16897112-16897238)
chr7 (294-442)||(4294709-4294858)
chr7 (294-379)||(17206285-17206369)
chr7 (294-378)||(4090813-4090897)
chr7 (208-275)||(9264392-9264460)
chr7 (312-434)||(20627052-20627175)
chr7 (312-434)||(20630943-20631066)
chr7 (312-434)||(20635551-20635674)
chr7 (312-434)||(20637423-20637546)
chr7 (14-220)||(9194052-9194267)
chr7 (294-379)||(6712334-6712418)
chr7 (14-82)||(15707430-15707498)
chr7 (294-406)||(16497865-16497980)
chr7 (294-415)||(17911698-17911820)
chr7 (294-379)||(4256506-4256591)
chr7 (205-266)||(4465807-4465868)
chr7 (294-379)||(4983038-4983122)
chr7 (294-418)||(30063811-30063935)
chr7 (294-415)||(4465638-4465761)
chr7 (294-379)||(4790781-4790868)
chr7 (224-266)||(4541187-4541229)
chr7 (64-274)||(17911451-17911670)
chr7 (14-103)||(19515548-19515638)
chr7 (207-261)||(38877414-38877468)
chr7 (294-379)||(4316874-4316958)
chr7 (294-378)||(11997230-11997314)
chr7 (174-261)||(16897288-16897375)
chr7 (294-378)||(19515251-19515335)
chr7 (295-379)||(25034209-25034291)
chr7 (14-103)||(9264572-9264662)
chr7 (294-356)||(46274217-46274279)
chr7 (120-260)||(48801279-48801421)
chr7 (124-243)||(368031-368152)
chr7 (294-418)||(679344-679468)
chr7 (294-379)||(11483745-11483830)
chr7 (294-379)||(15523142-15523226)
chr7 (190-261)||(1613964-1614036)
chr7 (176-243)||(2325885-2325953)
chr7 (103-218)||(5825963-5826077)
chr7 (120-199)||(12199082-12199162)
chr7 (14-103)||(6257700-6257790)
chr7 (294-415)||(4541281-4541402)
chr7 (124-215)||(19364331-19364418)
chr7 (207-272)||(679512-679577)
chr7 (389-442)||(16097339-16097392)
chr7 (16-82)||(48355775-48355845)
chr7 (120-194)||(11997437-11997512)
chr7 (111-260)||(37100400-37100551)
chr7 (124-199)||(538348-538419)
chr7 (124-199)||(545223-545294)
chr7 (176-214)||(2325954-2325992)
chr7 (124-199)||(12548396-12548467)
chr7 (314-355)||(13411402-13411443)
chr7 (232-274)||(30063960-30064004)
chr7 (295-379)||(1751106-1751189)
chr7 (389-437)||(9725878-9725926)
chr7 (63-103)||(11484054-11484094)
chr7 (389-437)||(12661747-12661795)
chr7 (124-199)||(20108935-20109011)
chr7 (120-167)||(24057586-24057634)
chr7 (295-379)||(35103978-35104061)
chr7 (240-268)||(47877668-47877696)
[»] chr5 (146 HSPs)
chr5 (65-442)||(20169300-20169678)
chr5 (65-275)||(24165122-24165331)
chr5 (65-261)||(20724875-20725071)
chr5 (14-220)||(21273456-21273662)
chr5 (121-442)||(20967674-20968000)
chr5 (294-442)||(21273760-21273908)
chr5 (65-275)||(17408732-17408943)
chr5 (65-261)||(12322196-12322394)
chr5 (65-260)||(21389536-21389733)
chr5 (294-441)||(23756867-23757014)
chr5 (294-441)||(23822323-23822470)
chr5 (294-442)||(23435436-23435585)
chr5 (294-442)||(23446803-23446952)
chr5 (294-437)||(20832305-20832449)
chr5 (294-442)||(20915783-20915933)
chr5 (294-442)||(12322447-12322594)
chr5 (295-437)||(7760948-7761091)
chr5 (295-437)||(20601449-20601592)
chr5 (295-437)||(20607740-20607883)
chr5 (295-437)||(20614077-20614220)
chr5 (295-437)||(20790056-20790199)
chr5 (295-437)||(20795837-20795980)
chr5 (295-437)||(21734450-21734593)
chr5 (295-437)||(21812093-21812236)
chr5 (65-261)||(21382144-21382341)
chr5 (294-442)||(21382390-21382539)
chr5 (294-442)||(18483528-18483679)
chr5 (295-437)||(15732053-15732196)
chr5 (295-437)||(15736272-15736415)
chr5 (295-437)||(20595163-20595306)
chr5 (295-437)||(23618309-23618452)
chr5 (295-437)||(23684962-23685105)
chr5 (295-437)||(23849706-23849849)
chr5 (294-442)||(24220481-24220632)
chr5 (295-437)||(28834741-28834884)
chr5 (295-437)||(34780421-34780564)
chr5 (298-442)||(21389787-21389932)
chr5 (294-442)||(42789663-42789812)
chr5 (67-261)||(23435183-23435379)
chr5 (67-261)||(23446550-23446746)
chr5 (295-437)||(18067343-18067486)
chr5 (295-437)||(18073638-18073781)
chr5 (294-442)||(23343376-23343527)
chr5 (295-437)||(23973043-23973186)
chr5 (295-433)||(24935583-24935722)
chr5 (295-433)||(24941275-24941414)
chr5 (295-437)||(41765620-41765763)
chr5 (294-442)||(20245668-20245818)
chr5 (295-442)||(14482494-14482642)
chr5 (121-275)||(23343552-23343707)
chr5 (295-437)||(23771036-23771179)
chr5 (295-437)||(26848383-26848526)
chr5 (65-243)||(34223164-34223343)
chr5 (294-437)||(31057547-31057693)
chr5 (295-437)||(30729954-30730097)
chr5 (174-272)||(15059354-15059452)
chr5 (294-440)||(20571278-20571427)
chr5 (296-442)||(24214860-24215009)
chr5 (294-442)||(3388136-3388287)
chr5 (294-435)||(21400807-21400951)
chr5 (295-437)||(25577485-25577629)
chr5 (179-274)||(22942342-22942437)
chr5 (294-437)||(23599978-23600124)
chr5 (295-437)||(20449663-20449808)
chr5 (120-268)||(24214667-24214816)
chr5 (294-442)||(25741797-25741946)
chr5 (323-437)||(18613121-18613236)
chr5 (294-442)||(24952511-24952662)
chr5 (294-442)||(24969176-24969327)
chr5 (294-442)||(25202007-25202158)
chr5 (294-442)||(25266162-25266313)
chr5 (294-437)||(22856270-22856416)
chr5 (294-437)||(25006151-25006297)
chr5 (294-437)||(25891188-25891334)
chr5 (294-440)||(9728730-9728879)
chr5 (303-437)||(20444181-20444318)
chr5 (294-418)||(20724698-20724823)
chr5 (120-275)||(20915958-20916115)
chr5 (120-268)||(24220290-24220439)
chr5 (294-442)||(6406376-6406527)
chr5 (294-442)||(16104072-16104223)
chr5 (294-442)||(18611019-18611170)
chr5 (294-442)||(18772183-18772334)
chr5 (294-442)||(20616436-20616587)
chr5 (294-442)||(21729943-21730094)
chr5 (294-437)||(13910122-13910268)
chr5 (294-437)||(22143119-22143265)
chr5 (294-437)||(22316833-22316979)
chr5 (294-437)||(22323440-22323586)
chr5 (301-418)||(22948690-22948808)
chr5 (294-437)||(23267802-23267948)
chr5 (294-437)||(25115146-25115292)
chr5 (294-437)||(25174238-25174384)
chr5 (294-437)||(30759006-30759152)
chr5 (294-437)||(30769111-30769257)
chr5 (294-437)||(33701604-33701750)
chr5 (294-418)||(22942473-22942598)
chr5 (294-436)||(26780661-26780806)
chr5 (294-378)||(24165365-24165449)
chr5 (294-442)||(20802235-20802386)
chr5 (294-442)||(28621799-28621950)
chr5 (294-437)||(5078039-5078185)
chr5 (294-415)||(17408585-17408707)
chr5 (294-379)||(15059720-15059805)
chr5 (294-442)||(35307474-35307623)
chr5 (120-268)||(31057735-31057880)
chr5 (294-424)||(2953379-2953510)
chr5 (294-437)||(29052855-29053001)
chr5 (294-431)||(31757954-31758092)
chr5 (294-424)||(16677189-16677320)
chr5 (295-378)||(26842927-26843010)
chr5 (294-437)||(23626678-23626826)
chr5 (312-431)||(12410655-12410775)
chr5 (14-82)||(20967580-20967648)
chr5 (294-378)||(34223012-34223096)
chr5 (294-431)||(20738466-20738604)
chr5 (337-442)||(21833082-21833188)
chr5 (294-431)||(22170897-22171035)
chr5 (294-429)||(20103767-20103904)
chr5 (294-373)||(25122180-25122261)
chr5 (294-373)||(25181271-25181352)
chr5 (14-82)||(23343733-23343800)
chr5 (207-271)||(24166270-24166334)
chr5 (294-374)||(31414731-31414811)
chr5 (118-260)||(12410450-12410591)
chr5 (14-73)||(15059265-15059324)
chr5 (294-431)||(23114371-23114508)
chr5 (172-261)||(22170762-22170851)
chr5 (294-379)||(23582881-23582969)
chr5 (294-415)||(24166376-24166497)
chr5 (294-418)||(23029418-23029541)
chr5 (175-272)||(23029591-23029688)
chr5 (205-261)||(16677090-16677146)
chr5 (103-220)||(31758186-31758302)
chr5 (14-103)||(20104113-20104204)
chr5 (174-220)||(31414595-31414641)
chr5 (63-103)||(20738211-20738251)
chr5 (124-199)||(6406204-6406275)
chr5 (124-199)||(21734701-21734772)
chr5 (54-103)||(2953724-2953773)
chr5 (120-167)||(5078340-5078388)
chr5 (124-193)||(23267615-23267680)
chr5 (174-261)||(23756722-23756810)
chr5 (174-261)||(23822178-23822266)
chr5 (389-437)||(25122127-25122175)
chr5 (389-437)||(25181218-25181266)
[»] chr1 (113 HSPs)
chr1 (65-442)||(17986440-17986818)
chr1 (103-442)||(48256221-48256559)
chr1 (65-275)||(41802140-41802351)
chr1 (65-275)||(28207762-28207972)
chr1 (208-442)||(39286459-39286696)
chr1 (296-442)||(17716862-17717008)
chr1 (65-241)||(19880148-19880325)
chr1 (18-431)||(20412072-20412502)
chr1 (65-243)||(52755395-52755574)
chr1 (294-442)||(36850185-36850333)
chr1 (65-261)||(25726816-25727012)
chr1 (65-261)||(25735224-25735420)
chr1 (294-442)||(8648978-8649128)
chr1 (294-442)||(26134359-26134509)
chr1 (294-442)||(41802385-41802534)
chr1 (103-275)||(17716661-17716832)
chr1 (294-442)||(16365129-16365278)
chr1 (294-442)||(28207997-28208146)
chr1 (294-442)||(46143370-46143519)
chr1 (294-442)||(8653864-8654014)
chr1 (294-442)||(2386340-2386489)
chr1 (294-442)||(16431659-16431808)
chr1 (294-442)||(19874964-19875113)
chr1 (294-442)||(25727062-25727211)
chr1 (294-442)||(25735470-25735619)
chr1 (294-442)||(49379473-49379622)
chr1 (295-437)||(3985369-3985512)
chr1 (295-437)||(3990648-3990791)
chr1 (65-183)||(19875237-19875355)
chr1 (294-442)||(22659884-22660034)
chr1 (295-442)||(13250849-13250997)
chr1 (294-442)||(41461838-41461986)
chr1 (295-437)||(16485390-16485533)
chr1 (295-437)||(27047551-27047694)
chr1 (295-437)||(27911163-27911306)
chr1 (295-437)||(38045448-38045591)
chr1 (294-442)||(4028417-4028567)
chr1 (294-442)||(44538346-44538496)
chr1 (65-260)||(19364534-19364730)
chr1 (296-442)||(28206186-28206335)
chr1 (295-437)||(27041797-27041940)
chr1 (103-271)||(13799464-13799631)
chr1 (294-442)||(19879922-19880070)
chr1 (294-442)||(21792172-21792323)
chr1 (294-442)||(8953320-8953470)
chr1 (294-442)||(19772030-19772179)
chr1 (328-442)||(12060326-12060440)
chr1 (294-442)||(18816469-18816618)
chr1 (124-268)||(2386155-2386295)
chr1 (124-268)||(28206378-28206518)
chr1 (14-275)||(44538074-44538321)
chr1 (294-442)||(19788110-19788259)
chr1 (65-220)||(28763939-28764094)
chr1 (340-442)||(19364789-19364892)
chr1 (294-442)||(21784046-21784197)
chr1 (294-442)||(21797980-21798131)
chr1 (294-442)||(21804688-21804839)
chr1 (294-437)||(20231616-20231762)
chr1 (294-442)||(18885230-18885379)
chr1 (175-268)||(21792365-21792458)
chr1 (294-442)||(17093917-17094068)
chr1 (294-442)||(17101753-17101904)
chr1 (294-442)||(20399713-20399864)
chr1 (294-442)||(22841811-22841962)
chr1 (294-431)||(13799276-13799413)
chr1 (294-437)||(19599753-19599899)
chr1 (294-437)||(20393691-20393837)
chr1 (180-268)||(21784239-21784327)
chr1 (121-275)||(26134534-26134688)
chr1 (118-220)||(52235913-52236015)
chr1 (316-418)||(52755199-52755302)
chr1 (294-437)||(20238182-20238328)
chr1 (103-220)||(16431477-16431593)
chr1 (294-437)||(2395124-2395270)
chr1 (294-437)||(23501632-23501778)
chr1 (294-437)||(41309335-41309474)
chr1 (294-378)||(12059671-12059755)
chr1 (294-385)||(30818951-30819041)
chr1 (294-431)||(22411221-22411359)
chr1 (294-418)||(16384805-16384929)
chr1 (208-275)||(8648876-8648944)
chr1 (294-378)||(52169104-52169188)
chr1 (294-431)||(16148286-16148424)
chr1 (205-267)||(16384968-16385030)
chr1 (294-379)||(25404969-25405054)
chr1 (207-272)||(25405094-25405159)
chr1 (294-418)||(26194349-26194473)
chr1 (172-274)||(20860757-20860860)
chr1 (172-267)||(23298867-23298962)
chr1 (214-268)||(30819068-30819122)
chr1 (172-253)||(20899426-20899507)
chr1 (328-419)||(2130095-2130186)
chr1 (111-261)||(22411012-22411164)
chr1 (294-424)||(28763719-28763851)
chr1 (120-261)||(19788316-19788459)
chr1 (294-353)||(52235791-52235850)
chr1 (14-83)||(8648674-8648743)
chr1 (294-419)||(15346698-15346823)
chr1 (312-370)||(16354211-16354269)
chr1 (294-418)||(23299002-23299128)
chr1 (392-442)||(52235743-52235793)
chr1 (294-379)||(24680257-24680340)
chr1 (389-442)||(41224628-41224681)
chr1 (313-431)||(15421231-15421349)
chr1 (352-442)||(22635546-22635637)
chr1 (172-274)||(26194221-26194324)
chr1 (124-261)||(36850390-36850529)
chr1 (124-261)||(49379679-49379818)
chr1 (120-260)||(41461638-41461780)
chr1 (294-379)||(21924774-21924858)
chr1 (120-199)||(25646377-25646457)
chr1 (124-199)||(27911414-27911485)
chr1 (205-257)||(16148474-16148527)
[»] chr3 (200 HSPs)
chr3 (65-275)||(6236731-6236941)
chr3 (120-442)||(34053439-34053767)
chr3 (14-261)||(19567029-19567277)
chr3 (14-442)||(11398701-11399142)
chr3 (121-442)||(14494652-14494980)
chr3 (174-442)||(14976136-14976410)
chr3 (65-272)||(2721801-2722010)
chr3 (294-442)||(14071543-14071691)
chr3 (294-442)||(25765662-25765812)
chr3 (121-379)||(14660685-14660948)
chr3 (294-442)||(25055131-25055280)
chr3 (294-442)||(2722048-2722196)
chr3 (294-442)||(47974938-47975088)
chr3 (294-439)||(36076308-36076454)
chr3 (294-442)||(43841892-43842041)
chr3 (294-442)||(3279949-3280097)
chr3 (294-442)||(17480583-17480732)
chr3 (294-442)||(19566823-19566972)
chr3 (294-437)||(53354635-53354779)
chr3 (295-437)||(24696969-24697112)
chr3 (294-442)||(15429967-15430116)
chr3 (294-442)||(17388590-17388739)
chr3 (294-442)||(2006065-2006213)
chr3 (295-437)||(2781358-2781501)
chr3 (295-437)||(3338580-3338723)
chr3 (295-437)||(4768847-4768990)
chr3 (295-437)||(6710156-6710299)
chr3 (295-437)||(6809777-6809920)
chr3 (295-437)||(6815599-6815742)
chr3 (295-437)||(15854319-15854462)
chr3 (295-437)||(16385288-16385431)
chr3 (295-436)||(15425002-15425144)
chr3 (294-442)||(14347907-14348056)
chr3 (298-442)||(5687798-5687942)
chr3 (294-442)||(13605154-13605302)
chr3 (294-442)||(16034189-16034336)
chr3 (174-379)||(17041712-17041918)
chr3 (295-437)||(4365959-4366102)
chr3 (295-437)||(4383488-4383631)
chr3 (295-437)||(4830165-4830308)
chr3 (295-437)||(16334177-16334320)
chr3 (295-437)||(22164553-22164696)
chr3 (295-437)||(22169857-22170000)
chr3 (295-437)||(41473035-41473178)
chr3 (295-437)||(5226328-5226472)
chr3 (295-437)||(12246916-12247059)
chr3 (303-437)||(13093797-13093932)
chr3 (295-437)||(14866895-14867038)
chr3 (72-261)||(17388343-17388533)
chr3 (294-442)||(21264907-21265057)
chr3 (103-272)||(42244560-42244728)
chr3 (294-442)||(14137560-14137708)
chr3 (75-261)||(2005821-2006009)
chr3 (295-437)||(6829496-6829639)
chr3 (295-437)||(9360314-9360457)
chr3 (295-437)||(9365831-9365974)
chr3 (295-437)||(13087633-13087776)
chr3 (294-437)||(43496311-43496456)
chr3 (295-437)||(13098423-13098566)
chr3 (294-442)||(19655927-19656078)
chr3 (295-437)||(20556172-20556314)
chr3 (294-437)||(11948112-11948258)
chr3 (65-261)||(14071748-14071945)
chr3 (294-437)||(15944643-15944789)
chr3 (294-437)||(15947314-15947460)
chr3 (294-442)||(20150624-20150774)
chr3 (295-437)||(4651418-4651563)
chr3 (295-437)||(12775875-12776020)
chr3 (295-437)||(16377610-16377754)
chr3 (294-442)||(37978134-37978285)
chr3 (294-434)||(3244912-3245054)
chr3 (294-437)||(11940335-11940481)
chr3 (294-442)||(20155078-20155221)
chr3 (294-440)||(7785803-7785952)
chr3 (295-437)||(10249024-10249168)
chr3 (294-442)||(16705728-16705879)
chr3 (294-442)||(37935281-37935432)
chr3 (294-442)||(37943126-37943277)
chr3 (172-274)||(8685857-8685959)
chr3 (294-437)||(8991526-8991672)
chr3 (294-437)||(13000724-13000870)
chr3 (294-437)||(15951982-15952128)
chr3 (294-437)||(20154148-20154294)
chr3 (294-433)||(20155862-20156004)
chr3 (295-437)||(10601802-10601947)
chr3 (294-442)||(14445075-14445224)
chr3 (294-442)||(14457122-14457271)
chr3 (120-268)||(19656120-19656268)
chr3 (294-435)||(15639171-15639315)
chr3 (294-435)||(15645747-15645891)
chr3 (294-442)||(7601102-7601253)
chr3 (294-442)||(10159505-10159656)
chr3 (294-442)||(10166166-10166317)
chr3 (294-442)||(11880319-11880470)
chr3 (294-442)||(13186749-13186900)
chr3 (294-442)||(13193380-13193531)
chr3 (294-442)||(14815737-14815888)
chr3 (294-442)||(15556258-15556409)
chr3 (294-442)||(15564109-15564260)
chr3 (294-442)||(16372886-16373037)
chr3 (294-442)||(18214167-18214318)
chr3 (294-437)||(10559673-10559819)
chr3 (294-437)||(13135555-13135701)
chr3 (294-437)||(13142163-13142309)
chr3 (294-437)||(13665218-13665364)
chr3 (294-437)||(15573250-15573396)
chr3 (294-437)||(17733076-17733222)
chr3 (294-431)||(22038957-22039095)
chr3 (294-437)||(30026694-30026840)
chr3 (294-431)||(42244387-42244524)
chr3 (294-437)||(50908747-50908893)
chr3 (294-437)||(53160371-53160517)
chr3 (174-379)||(17050722-17050931)
chr3 (65-162)||(27880080-27880177)
chr3 (131-261)||(3212466-3212597)
chr3 (172-272)||(11869848-11869948)
chr3 (14-220)||(25054847-25055062)
chr3 (294-442)||(10147743-10147894)
chr3 (296-402)||(11827277-11827384)
chr3 (294-442)||(12186398-12186549)
chr3 (294-442)||(12192812-12192963)
chr3 (294-442)||(12199453-12199604)
chr3 (294-442)||(13194774-13194925)
chr3 (294-442)||(13325928-13326079)
chr3 (294-437)||(5212026-5212172)
chr3 (294-437)||(13204371-13204517)
chr3 (294-437)||(13504223-13504369)
chr3 (294-415)||(27407329-27407451)
chr3 (294-437)||(32403704-32403850)
chr3 (294-437)||(42281052-42281198)
chr3 (315-434)||(3249959-3250080)
chr3 (295-437)||(10608114-10608259)
chr3 (105-218)||(36076107-36076219)
chr3 (14-82)||(14660974-14661042)
chr3 (294-422)||(1905-2036)
chr3 (294-442)||(10141137-10141288)
chr3 (118-275)||(13604968-13605117)
chr3 (181-268)||(43842083-43842170)
chr3 (294-437)||(10546289-10546435)
chr3 (204-274)||(13069780-13069850)
chr3 (294-437)||(15634896-15635042)
chr3 (294-431)||(17023366-17023503)
chr3 (294-431)||(20225069-20225207)
chr3 (294-442)||(13068901-13069050)
chr3 (294-379)||(13418500-13418585)
chr3 (65-162)||(51034645-51034742)
chr3 (294-378)||(1993564-1993648)
chr3 (14-82)||(14495006-14495074)
chr3 (172-379)||(41545657-41545865)
chr3 (294-378)||(1998723-1998807)
chr3 (294-378)||(10850611-10850695)
chr3 (208-272)||(17023247-17023311)
chr3 (364-442)||(3212640-3212719)
chr3 (294-442)||(18128790-18128941)
chr3 (103-220)||(7908430-7908546)
chr3 (294-431)||(13069886-13070023)
chr3 (65-143)||(40846653-40846731)
chr3 (294-379)||(8532006-8532091)
chr3 (294-418)||(8685695-8685820)
chr3 (294-378)||(6236966-6237050)
chr3 (120-220)||(10850794-10850894)
chr3 (103-243)||(27407118-27407258)
chr3 (385-442)||(1991025-1991082)
chr3 (120-220)||(3279750-3279850)
chr3 (172-272)||(8531867-8531969)
chr3 (103-220)||(11827477-11827593)
chr3 (174-261)||(14348103-14348191)
chr3 (294-379)||(11869729-11869813)
chr3 (294-358)||(5666650-5666714)
chr3 (122-218)||(17209574-17209669)
chr3 (120-261)||(1993364-1993507)
chr3 (120-261)||(1998523-1998666)
chr3 (103-261)||(13418294-13418451)
chr3 (117-261)||(17480380-17480526)
chr3 (294-431)||(27992547-27992684)
chr3 (295-419)||(11577598-11577722)
chr3 (120-220)||(14137800-14137901)
chr3 (172-274)||(16703769-16703874)
chr3 (120-199)||(37978401-37978481)
chr3 (354-424)||(17766537-17766608)
chr3 (354-424)||(19067857-19067928)
chr3 (294-363)||(11868783-11868852)
chr3 (294-379)||(7908636-7908721)
chr3 (205-274)||(11577807-11577876)
chr3 (65-143)||(14659175-14659263)
chr3 (303-379)||(17577087-17577162)
chr3 (120-194)||(7786073-7786148)
chr3 (399-442)||(14660637-14660680)
chr3 (124-199)||(10546551-10546622)
chr3 (124-199)||(10559935-10560006)
chr3 (124-199)||(12776127-12776198)
chr3 (124-199)||(15429790-15429861)
chr3 (124-199)||(50908986-50909057)
chr3 (295-415)||(12697319-12697439)
chr3 (19-72)||(25765949-25766002)
chr3 (121-192)||(3245144-3245216)
chr3 (120-199)||(14139508-14139588)
chr3 (124-199)||(16034012-16034088)
chr3 (103-139)||(17041642-17041678)
chr3 (105-141)||(17050654-17050690)
[»] scaffold0031 (7 HSPs)
scaffold0031 (65-442)||(77709-78091)
scaffold0031 (174-442)||(23244-23514)
scaffold0031 (121-274)||(100295-100449)
scaffold0031 (345-439)||(18371-18466)
scaffold0031 (294-349)||(290-345)
scaffold0031 (174-275)||(166-268)
scaffold0031 (14-82)||(100201-100269)
[»] chr8 (142 HSPs)
chr8 (65-275)||(26012850-26013060)
chr8 (14-219)||(24967094-24967299)
chr8 (120-442)||(23503071-23503396)
chr8 (65-275)||(25396805-25397016)
chr8 (294-442)||(6570408-6570556)
chr8 (122-420)||(14351502-14351800)
chr8 (294-442)||(14878124-14878272)
chr8 (294-442)||(17126948-17127096)
chr8 (294-442)||(9317949-9318098)
chr8 (65-220)||(1990558-1990713)
chr8 (65-261)||(23455440-23455637)
chr8 (120-275)||(6279652-6279807)
chr8 (66-243)||(29003491-29003670)
chr8 (312-442)||(24034796-24034926)
chr8 (74-275)||(14878297-14878501)
chr8 (294-442)||(22818350-22818498)
chr8 (295-437)||(20038312-20038455)
chr8 (295-437)||(20043967-20044110)
chr8 (294-442)||(22831253-22831403)
chr8 (294-442)||(39730532-39730682)
chr8 (294-442)||(15759672-15759821)
chr8 (294-442)||(18264220-18264369)
chr8 (294-442)||(18273233-18273382)
chr8 (294-442)||(22285088-22285237)
chr8 (295-442)||(19997497-19997645)
chr8 (294-440)||(20263525-20263673)
chr8 (294-440)||(21050154-21050302)
chr8 (294-442)||(26826604-26826755)
chr8 (294-437)||(29325413-29325557)
chr8 (295-437)||(21103469-21103612)
chr8 (295-437)||(22370661-22370804)
chr8 (65-261)||(22284834-22285031)
chr8 (294-442)||(26013085-26013234)
chr8 (312-442)||(18230474-18230606)
chr8 (295-437)||(1685768-1685911)
chr8 (295-437)||(21105511-21105654)
chr8 (295-437)||(25751540-25751683)
chr8 (295-437)||(35996197-35996340)
chr8 (294-422)||(18162105-18162235)
chr8 (103-271)||(14162161-14162328)
chr8 (294-442)||(42418346-42418495)
chr8 (65-220)||(15759462-15759618)
chr8 (295-437)||(21939317-21939460)
chr8 (294-442)||(45466804-45466955)
chr8 (295-436)||(20002853-20002995)
chr8 (294-442)||(23879929-23880079)
chr8 (66-199)||(22818097-22818230)
chr8 (294-442)||(25397044-25397193)
chr8 (294-442)||(33632537-33632688)
chr8 (295-437)||(11346317-11346460)
chr8 (70-264)||(23221527-23221729)
chr8 (65-261)||(17126679-17126877)
chr8 (295-437)||(11351356-11351499)
chr8 (295-437)||(21945252-21945395)
chr8 (122-275)||(18161926-18162080)
chr8 (294-437)||(21821462-21821608)
chr8 (294-437)||(23912189-23912335)
chr8 (294-437)||(27537559-27537705)
chr8 (295-437)||(21842865-21843010)
chr8 (295-437)||(21858676-21858821)
chr8 (294-442)||(17515631-17515783)
chr8 (295-437)||(17621475-17621619)
chr8 (295-440)||(19768254-19768402)
chr8 (294-442)||(38349742-38349893)
chr8 (294-437)||(21098115-21098261)
chr8 (294-437)||(23904334-23904480)
chr8 (294-437)||(25228740-25228886)
chr8 (94-243)||(42418565-42418710)
chr8 (294-442)||(8308566-8308717)
chr8 (294-442)||(8315214-8315365)
chr8 (294-442)||(21382839-21382990)
chr8 (294-442)||(23779541-23779692)
chr8 (294-437)||(20836203-20836349)
chr8 (294-437)||(21831744-21831890)
chr8 (294-437)||(22098998-22099144)
chr8 (294-442)||(14821299-14821448)
chr8 (295-437)||(17613293-17613437)
chr8 (294-378)||(24967367-24967451)
chr8 (294-442)||(8328829-8328980)
chr8 (294-442)||(18399385-18399536)
chr8 (294-431)||(14161973-14162110)
chr8 (294-437)||(19360005-19360151)
chr8 (294-437)||(22032898-22033044)
chr8 (294-437)||(40952085-40952231)
chr8 (120-268)||(17515825-17515974)
chr8 (303-437)||(21956033-21956170)
chr8 (294-418)||(23455695-23455820)
chr8 (294-442)||(37652922-37653071)
chr8 (294-379)||(43836170-43836255)
chr8 (294-442)||(8322163-8322314)
chr8 (294-417)||(1693236-1693362)
chr8 (294-437)||(16418268-16418414)
chr8 (294-437)||(21950222-21950368)
chr8 (294-437)||(22103119-22103265)
chr8 (294-379)||(22854119-22854205)
chr8 (294-378)||(1990381-1990465)
chr8 (14-82)||(14351827-14351895)
chr8 (294-424)||(1302143-1302274)
chr8 (294-442)||(6279862-6280011)
chr8 (294-437)||(18821664-18821810)
chr8 (294-437)||(20713183-20713329)
chr8 (294-431)||(21319536-21319674)
chr8 (295-379)||(22029864-22029950)
chr8 (294-437)||(22039500-22039646)
chr8 (294-437)||(22093330-22093476)
chr8 (190-275)||(23193965-23194051)
chr8 (134-261)||(6570572-6570701)
chr8 (294-424)||(19792074-19792203)
chr8 (294-378)||(29003745-29003829)
chr8 (294-379)||(24039278-24039365)
chr8 (294-442)||(17504016-17504165)
chr8 (294-379)||(18008249-18008334)
chr8 (294-375)||(21139780-21139861)
chr8 (120-220)||(9317783-9317883)
chr8 (14-82)||(18161832-18161899)
chr8 (205-272)||(22904607-22904674)
chr8 (294-372)||(5579180-5579258)
chr8 (294-431)||(24342172-24342310)
chr8 (295-431)||(26854181-26854320)
chr8 (118-220)||(21139589-21139690)
chr8 (205-261)||(24342067-24342123)
chr8 (205-272)||(19792242-19792309)
chr8 (294-379)||(23221401-23221487)
chr8 (294-429)||(23193779-23193916)
chr8 (294-379)||(31469554-31469638)
chr8 (172-272)||(24221563-24221663)
chr8 (172-220)||(18008119-18008167)
chr8 (312-379)||(15636208-15636273)
chr8 (337-415)||(22904752-22904831)
chr8 (121-261)||(24034582-24034724)
chr8 (124-199)||(27086576-27086647)
chr8 (294-418)||(24221401-24221525)
chr8 (120-199)||(5578998-5579078)
chr8 (295-379)||(15634418-15634500)
chr8 (120-199)||(26826408-26826488)
chr8 (124-215)||(45466611-45466703)
chr8 (124-199)||(21843117-21843188)
chr8 (124-199)||(21858928-21858999)
chr8 (408-442)||(43836123-43836157)
chr8 (14-103)||(26853880-26853969)
chr8 (389-437)||(21037797-21037845)
chr8 (124-199)||(39730799-39730875)
[»] chr6 (192 HSPs)
chr6 (14-220)||(17284117-17284323)
chr6 (14-220)||(5949704-5949909)
chr6 (142-392)||(17743462-17743713)
chr6 (103-442)||(25963834-25964177)
chr6 (103-442)||(25968481-25968824)
chr6 (174-442)||(18184230-18184501)
chr6 (120-275)||(18233820-18233976)
chr6 (294-442)||(29360429-29360577)
chr6 (74-243)||(8603376-8603546)
chr6 (294-442)||(26474063-26474211)
chr6 (65-271)||(30245100-30245308)
chr6 (65-220)||(6794826-6794981)
chr6 (105-275)||(25949236-25949406)
chr6 (294-442)||(17283878-17284027)
chr6 (65-220)||(29360185-29360340)
chr6 (294-442)||(19560731-19560881)
chr6 (66-220)||(22601418-22601572)
chr6 (294-442)||(8603612-8603761)
chr6 (294-442)||(19615021-19615170)
chr6 (294-442)||(22737950-22738099)
chr6 (317-442)||(25786192-25786317)
chr6 (294-442)||(6795053-6795202)
chr6 (65-243)||(20105678-20105857)
chr6 (295-437)||(4188254-4188397)
chr6 (295-437)||(15700295-15700438)
chr6 (294-442)||(18854736-18854887)
chr6 (295-437)||(19075178-19075321)
chr6 (294-442)||(5671903-5672053)
chr6 (124-275)||(18195536-18195683)
chr6 (294-442)||(20993595-20993745)
chr6 (65-200)||(19615285-19615421)
chr6 (295-437)||(22005878-22006021)
chr6 (295-437)||(22060846-22060989)
chr6 (295-437)||(22071927-22072070)
chr6 (294-442)||(15153791-15153941)
chr6 (294-442)||(15158249-15158399)
chr6 (294-442)||(12657147-12657296)
chr6 (294-442)||(25949434-25949583)
chr6 (294-442)||(30671109-30671258)
chr6 (295-437)||(12474375-12474518)
chr6 (294-442)||(14077170-14077321)
chr6 (124-268)||(25402477-25402617)
chr6 (295-437)||(27565679-27565822)
chr6 (294-442)||(23603120-23603271)
chr6 (100-220)||(29093465-29093584)
chr6 (124-268)||(18844396-18844536)
chr6 (124-268)||(24218650-24218790)
chr6 (294-442)||(1626262-1626412)
chr6 (120-268)||(210156-210305)
chr6 (124-268)||(18448700-18448845)
chr6 (294-438)||(25775150-25775295)
chr6 (294-432)||(18732455-18732594)
chr6 (294-442)||(5152455-5152604)
chr6 (294-379)||(18233710-18233795)
chr6 (126-268)||(18854556-18854694)
chr6 (294-442)||(19966476-19966625)
chr6 (294-412)||(24218832-24218953)
chr6 (317-442)||(18844580-18844708)
chr6 (294-437)||(209968-210114)
chr6 (294-437)||(11607478-11607624)
chr6 (297-442)||(16470090-16470236)
chr6 (294-437)||(18006427-18006573)
chr6 (294-442)||(12442621-12442773)
chr6 (294-418)||(22601202-22601327)
chr6 (300-418)||(5399347-5399466)
chr6 (294-442)||(6479305-6479456)
chr6 (294-442)||(6490726-6490877)
chr6 (294-442)||(20022112-20022263)
chr6 (294-442)||(20164278-20164429)
chr6 (294-442)||(20170975-20171126)
chr6 (294-442)||(22164865-22165016)
chr6 (294-442)||(22244560-22244711)
chr6 (294-442)||(22766438-22766589)
chr6 (294-442)||(22773121-22773272)
chr6 (294-442)||(24854563-24854714)
chr6 (294-442)||(24861222-24861373)
chr6 (294-442)||(25402284-25402435)
chr6 (294-437)||(16738841-16738987)
chr6 (294-437)||(17934516-17934662)
chr6 (294-437)||(19828939-19829085)
chr6 (294-437)||(27322905-27323051)
chr6 (294-442)||(18448887-18449036)
chr6 (103-257)||(4740890-4741045)
chr6 (294-378)||(26138774-26138858)
chr6 (294-442)||(20015947-20016098)
chr6 (294-437)||(18107281-18107427)
chr6 (294-437)||(22787022-22787168)
chr6 (294-431)||(25923222-25923360)
chr6 (294-424)||(23616212-23616345)
chr6 (296-379)||(19563730-19563814)
chr6 (294-378)||(25507702-25507786)
chr6 (111-194)||(25786464-25786548)
chr6 (294-418)||(29093655-29093782)
chr6 (326-406)||(30245346-30245426)
chr6 (316-437)||(35271295-35271419)
chr6 (294-442)||(17119611-17119762)
chr6 (294-416)||(25339088-25339211)
chr6 (297-418)||(18396348-18396470)
chr6 (294-431)||(20218311-20218449)
chr6 (294-431)||(22112336-22112474)
chr6 (302-418)||(14992124-14992241)
chr6 (295-442)||(29596423-29596577)
chr6 (103-220)||(32543169-32543285)
chr6 (294-378)||(26018071-26018155)
chr6 (294-378)||(26157444-26157528)
chr6 (302-378)||(32543359-32543435)
chr6 (312-442)||(21559939-21560070)
chr6 (103-261)||(25923409-25923566)
chr6 (294-378)||(4741096-4741181)
chr6 (207-272)||(20222915-20222980)
chr6 (294-442)||(21573707-21573856)
chr6 (207-272)||(22116899-22116964)
chr6 (295-422)||(29563406-29563540)
chr6 (294-378)||(20105519-20105603)
chr6 (172-260)||(23348176-23348264)
chr6 (294-378)||(24545504-24545588)
chr6 (294-431)||(28733975-28734113)
chr6 (294-379)||(13168488-13168572)
chr6 (294-379)||(17793866-17793951)
chr6 (295-379)||(12660331-12660414)
chr6 (295-379)||(13217237-13217321)
chr6 (294-378)||(19993709-19993793)
chr6 (294-401)||(29682721-29682828)
chr6 (205-272)||(12660479-12660546)
chr6 (294-373)||(23297313-23297392)
chr6 (103-261)||(25339269-25339426)
chr6 (120-261)||(25774950-25775093)
chr6 (294-424)||(26821967-26822098)
chr6 (294-415)||(20464490-20464611)
chr6 (103-261)||(24545634-24545791)
chr6 (294-433)||(25615381-25615523)
chr6 (295-430)||(18627540-18627679)
chr6 (120-220)||(19570068-19570169)
chr6 (294-379)||(23517232-23517317)
chr6 (294-379)||(25031107-25031192)
chr6 (313-378)||(29254115-29254180)
chr6 (172-267)||(16207749-16207844)
chr6 (391-442)||(19570002-19570053)
chr6 (294-431)||(19612574-19612711)
chr6 (103-220)||(19993504-19993619)
chr6 (294-419)||(20221302-20221426)
chr6 (294-419)||(22115286-22115410)
chr6 (385-442)||(5949519-5949576)
chr6 (295-368)||(9414498-9414570)
chr6 (223-272)||(12658051-12658100)
chr6 (207-272)||(20221190-20221255)
chr6 (207-272)||(22115174-22115239)
chr6 (205-261)||(3923656-3923712)
chr6 (295-379)||(17522242-17522324)
chr6 (207-267)||(20464386-20464446)
chr6 (394-442)||(24511780-24511828)
chr6 (294-418)||(31965362-31965490)
chr6 (103-245)||(18993103-18993243)
chr6 (326-424)||(23523790-23523889)
chr6 (190-261)||(26821858-26821929)
chr6 (207-258)||(31965575-31965626)
chr6 (174-220)||(20218528-20218574)
chr6 (174-220)||(22112553-22112599)
chr6 (294-379)||(18973772-18973856)
chr6 (294-379)||(24392783-24392867)
chr6 (205-261)||(25031238-25031295)
chr6 (111-194)||(30671382-30671466)
chr6 (14-103)||(26017727-26017817)
chr6 (14-103)||(26157100-26157190)
chr6 (395-442)||(32544764-32544811)
chr6 (294-415)||(12657891-12658012)
chr6 (294-368)||(15162328-15162401)
chr6 (302-419)||(16207558-16207675)
chr6 (294-364)||(20223021-20223090)
chr6 (294-364)||(22117005-22117074)
chr6 (15-103)||(26138482-26138571)
chr6 (14-72)||(29253802-29253860)
chr6 (294-368)||(32796406-32796479)
chr6 (389-442)||(18195404-18195457)
chr6 (174-274)||(18973643-18973744)
chr6 (295-419)||(23639693-23639817)
chr6 (124-199)||(5152721-5152797)
chr6 (124-199)||(14077437-14077513)
chr6 (174-218)||(18627406-18627450)
chr6 (295-379)||(34108868-34108951)
chr6 (302-424)||(3923757-3923880)
chr6 (64-103)||(12660655-12660694)
chr6 (121-261)||(5672109-5672251)
chr6 (124-199)||(12657412-12657483)
chr6 (124-200)||(19560998-19561075)
chr6 (124-199)||(19966742-19966818)
chr6 (295-364)||(21237838-21237906)
chr6 (208-245)||(26017930-26017966)
chr6 (208-245)||(26138684-26138720)
chr6 (208-245)||(26157303-26157339)
chr6 (207-272)||(29682603-29682668)
chr6 (63-103)||(17739489-17739529)
[»] chr4 (129 HSPs)
chr4 (65-275)||(43701575-43701785)
chr4 (121-442)||(24125059-24125385)
chr4 (120-442)||(11888812-11889136)
chr4 (124-442)||(18286926-18287246)
chr4 (65-261)||(16953934-16954130)
chr4 (294-442)||(13622403-13622551)
chr4 (120-442)||(20058993-20059320)
chr4 (14-275)||(31593704-31593974)
chr4 (65-243)||(9857065-9857244)
chr4 (65-261)||(39769-39966)
chr4 (294-442)||(16952005-16952155)
chr4 (294-442)||(9945051-9945200)
chr4 (294-442)||(39043317-39043466)
chr4 (295-442)||(3392055-3392203)
chr4 (294-442)||(8091730-8091877)
chr4 (294-436)||(3419167-3419310)
chr4 (295-437)||(26811235-26811378)
chr4 (294-442)||(17484239-17484389)
chr4 (65-260)||(7197080-7197276)
chr4 (294-442)||(14653314-14653463)
chr4 (294-437)||(6518482-6518626)
chr4 (294-442)||(3355363-3355514)
chr4 (295-437)||(3371730-3371873)
chr4 (295-437)||(5717499-5717642)
chr4 (148-275)||(11902625-11902751)
chr4 (295-437)||(16683472-16683615)
chr4 (295-437)||(18078791-18078934)
chr4 (295-437)||(18080788-18080931)
chr4 (295-437)||(36654189-36654332)
chr4 (294-442)||(48641797-48641947)
chr4 (303-437)||(10631487-10631622)
chr4 (294-442)||(7197334-7197483)
chr4 (294-437)||(14690668-14690812)
chr4 (121-275)||(21275158-21275313)
chr4 (124-275)||(3355191-3355338)
chr4 (294-437)||(7897354-7897500)
chr4 (294-437)||(12845016-12845162)
chr4 (294-418)||(10731251-10731376)
chr4 (294-418)||(10945020-10945145)
chr4 (294-418)||(11902475-11902600)
chr4 (294-442)||(21275365-21275514)
chr4 (294-440)||(25146354-25146503)
chr4 (128-275)||(16951834-16951977)
chr4 (295-437)||(55798447-55798591)
chr4 (294-442)||(16217658-16217809)
chr4 (294-442)||(18242306-18242457)
chr4 (294-437)||(10559011-10559157)
chr4 (294-437)||(10637722-10637868)
chr4 (294-437)||(10651113-10651259)
chr4 (294-442)||(43701400-43701550)
chr4 (120-268)||(6518291-6518440)
chr4 (295-437)||(18984123-18984268)
chr4 (295-437)||(56579886-56580031)
chr4 (295-437)||(42709062-42709206)
chr4 (294-442)||(22105049-22105200)
chr4 (294-437)||(10732865-10733011)
chr4 (294-437)||(10946634-10946780)
chr4 (294-437)||(15248427-15248573)
chr4 (297-442)||(16227155-16227301)
chr4 (294-442)||(16392783-16392933)
chr4 (294-437)||(21420684-21420830)
chr4 (294-418)||(9857320-9857445)
chr4 (120-268)||(21102247-21102396)
chr4 (294-442)||(3124-3275)
chr4 (294-442)||(10684751-10684902)
chr4 (294-442)||(10898391-10898542)
chr4 (294-442)||(11495930-11496081)
chr4 (294-442)||(13823661-13823812)
chr4 (294-442)||(26293341-26293492)
chr4 (294-442)||(40844930-40845081)
chr4 (294-437)||(7515-7661)
chr4 (294-437)||(15124072-15124218)
chr4 (294-437)||(18563551-18563697)
chr4 (174-267)||(33331016-33331109)
chr4 (177-378)||(3772082-3772289)
chr4 (312-437)||(15305363-15305491)
chr4 (294-442)||(7870961-7871112)
chr4 (294-437)||(15255054-15255200)
chr4 (294-437)||(15259452-15259598)
chr4 (294-437)||(15266074-15266220)
chr4 (294-437)||(15302115-15302261)
chr4 (294-424)||(11504830-11504963)
chr4 (294-418)||(16953760-16953885)
chr4 (294-442)||(17996246-17996396)
chr4 (294-442)||(15866247-15866396)
chr4 (14-82)||(24125411-24125479)
chr4 (172-267)||(5675432-5675527)
chr4 (294-442)||(31593999-31594148)
chr4 (294-379)||(12347485-12347569)
chr4 (294-373)||(21102124-21102205)
chr4 (294-431)||(38652270-38652406)
chr4 (294-378)||(12808074-12808158)
chr4 (120-261)||(12808215-12808357)
chr4 (328-440)||(41400627-41400741)
chr4 (294-375)||(39631-39712)
chr4 (294-418)||(5675580-5675705)
chr4 (103-220)||(10731063-10731179)
chr4 (103-220)||(10944832-10944948)
chr4 (294-379)||(13883359-13883443)
chr4 (17-82)||(15409866-15409931)
chr4 (14-82)||(21275064-21275132)
chr4 (204-271)||(38652153-38652220)
chr4 (294-367)||(40563741-40563815)
chr4 (312-419)||(23793460-23793567)
chr4 (294-418)||(11922293-11922418)
chr4 (212-272)||(11922461-11922521)
chr4 (120-261)||(8091933-8092076)
chr4 (172-261)||(5513663-5513753)
chr4 (294-419)||(12345805-12345930)
chr4 (207-267)||(23793614-23793673)
chr4 (120-261)||(39043523-39043666)
chr4 (14-48)||(45233920-45233954)
chr4 (295-415)||(13510674-13510794)
chr4 (295-431)||(55267695-55267831)
chr4 (362-439)||(40560427-40560506)
chr4 (120-195)||(40567239-40567315)
chr4 (172-274)||(9487053-9487155)
chr4 (177-220)||(13622291-13622334)
chr4 (124-199)||(3418991-3419062)
chr4 (294-419)||(9717611-9717736)
chr4 (124-199)||(10631301-10631372)
chr4 (408-442)||(11048535-11048569)
chr4 (232-274)||(12345958-12346002)
chr4 (330-379)||(21276772-21276821)
chr4 (295-379)||(15048147-15048230)
chr4 (295-379)||(15106194-15106277)
chr4 (124-199)||(15409976-15410052)
chr4 (124-199)||(17484504-17484580)
chr4 (99-143)||(23793737-23793781)
[»] chr2 (148 HSPs)
chr2 (14-220)||(23140033-23140239)
chr2 (99-442)||(23340485-23340827)
chr2 (14-220)||(23551823-23552029)
chr2 (14-220)||(24507143-24507350)
chr2 (124-442)||(5499610-5499929)
chr2 (65-261)||(24177702-24177898)
chr2 (294-439)||(36684408-36684554)
chr2 (65-260)||(30949290-30949487)
chr2 (294-442)||(24507416-24507564)
chr2 (294-442)||(25370167-25370315)
chr2 (65-261)||(27744918-27745116)
chr2 (103-275)||(20281961-20282133)
chr2 (294-442)||(20282158-20282307)
chr2 (294-442)||(23798243-23798392)
chr2 (294-442)||(27745177-27745325)
chr2 (65-220)||(23704132-23704287)
chr2 (120-275)||(539118-539277)
chr2 (294-442)||(21468276-21468425)
chr2 (294-442)||(25803625-25803774)
chr2 (65-260)||(29577375-29577569)
chr2 (65-261)||(20708297-20708495)
chr2 (295-437)||(10980-11123)
chr2 (295-437)||(20172649-20172792)
chr2 (295-437)||(25358249-25358392)
chr2 (65-214)||(28496780-28496930)
chr2 (313-442)||(18994289-18994420)
chr2 (312-442)||(28496522-28496653)
chr2 (295-437)||(35080707-35080850)
chr2 (294-442)||(42767195-42767346)
chr2 (294-442)||(23014317-23014467)
chr2 (294-442)||(23018431-23018581)
chr2 (294-442)||(40916638-40916788)
chr2 (74-261)||(29563058-29563247)
chr2 (294-442)||(32140082-32140231)
chr2 (297-442)||(32441194-32441338)
chr2 (121-275)||(16134200-16134355)
chr2 (294-406)||(19929490-19929604)
chr2 (294-442)||(29563303-29563453)
chr2 (294-442)||(11391221-11391366)
chr2 (294-442)||(11407882-11408027)
chr2 (294-442)||(24820422-24820573)
chr2 (294-442)||(24824807-24824958)
chr2 (124-268)||(42767388-42767528)
chr2 (294-442)||(33181789-33181938)
chr2 (294-437)||(18446583-18446729)
chr2 (294-437)||(23644696-23644842)
chr2 (121-275)||(25481304-25481463)
chr2 (121-275)||(25488910-25489069)
chr2 (294-442)||(16134026-16134175)
chr2 (294-442)||(20708091-20708240)
chr2 (294-442)||(25481488-25481637)
chr2 (294-442)||(25489094-25489243)
chr2 (294-418)||(29577197-29577322)
chr2 (294-440)||(39870409-39870558)
chr2 (294-442)||(16769736-16769887)
chr2 (294-442)||(16776398-16776549)
chr2 (294-442)||(24794604-24794755)
chr2 (294-442)||(24801313-24801464)
chr2 (124-268)||(24825000-24825140)
chr2 (294-442)||(24877614-24877765)
chr2 (294-442)||(27628318-27628469)
chr2 (294-437)||(111597-111743)
chr2 (294-437)||(23163297-23163443)
chr2 (294-437)||(23574554-23574700)
chr2 (294-437)||(27615526-27615672)
chr2 (294-437)||(27632222-27632368)
chr2 (294-437)||(27768159-27768305)
chr2 (294-442)||(24172106-24172255)
chr2 (294-442)||(25144085-25144234)
chr2 (207-275)||(19929397-19929465)
chr2 (294-378)||(23139892-23139976)
chr2 (294-378)||(23551682-23551766)
chr2 (294-442)||(17583326-17583477)
chr2 (294-442)||(17591132-17591283)
chr2 (294-442)||(22043977-22044128)
chr2 (294-442)||(22288305-22288456)
chr2 (294-442)||(22665809-22665960)
chr2 (294-442)||(27621673-27621824)
chr2 (294-437)||(118269-118415)
chr2 (294-442)||(539308-539458)
chr2 (294-437)||(21201005-21201151)
chr2 (294-437)||(23158727-23158873)
chr2 (294-437)||(23569984-23570130)
chr2 (294-415)||(23704391-23704513)
chr2 (294-418)||(24609919-24610044)
chr2 (294-375)||(25043007-25043088)
chr2 (148-268)||(24820615-24820735)
chr2 (118-220)||(11391048-11391149)
chr2 (118-220)||(11407709-11407810)
chr2 (294-437)||(19278622-19278768)
chr2 (103-221)||(32441406-32441523)
chr2 (294-418)||(21261-21386)
chr2 (294-442)||(11318020-11318169)
chr2 (294-418)||(21344333-21344458)
chr2 (294-442)||(20635773-20635923)
chr2 (294-424)||(15583945-15584080)
chr2 (294-379)||(24177568-24177653)
chr2 (172-272)||(19124344-19124444)
chr2 (294-378)||(22328604-22328688)
chr2 (294-378)||(23698700-23698784)
chr2 (294-378)||(24366196-24366280)
chr2 (14-82)||(25481210-25481278)
chr2 (14-82)||(25488816-25488884)
chr2 (294-431)||(19012850-19012987)
chr2 (302-419)||(19124179-19124296)
chr2 (120-261)||(36684207-36684349)
chr2 (14-82)||(16134381-16134449)
chr2 (294-415)||(24371293-24371414)
chr2 (207-275)||(15583821-15583890)
chr2 (294-378)||(30949148-30949232)
chr2 (206-272)||(20852132-20852199)
chr2 (294-379)||(20852240-20852324)
chr2 (294-379)||(22578216-22578299)
chr2 (294-418)||(23256868-23256991)
chr2 (297-374)||(25858484-25858561)
chr2 (294-378)||(41653504-41653588)
chr2 (294-365)||(23613996-23614067)
chr2 (103-261)||(41653631-41653788)
chr2 (172-261)||(21436-21525)
chr2 (294-379)||(24321910-24321994)
chr2 (174-274)||(23257019-23257121)
chr2 (120-261)||(32139882-32140025)
chr2 (294-355)||(23648789-23648851)
chr2 (172-245)||(21344523-21344596)
chr2 (176-261)||(23698830-23698915)
chr2 (295-419)||(31590364-31590487)
chr2 (295-379)||(36129990-36130073)
chr2 (294-364)||(45706320-45706392)
chr2 (389-437)||(45706421-45706469)
chr2 (400-442)||(23139843-23139885)
chr2 (400-442)||(23551633-23551675)
chr2 (172-261)||(24321772-24321862)
chr2 (207-257)||(24371466-24371516)
chr2 (303-415)||(13004609-13004721)
chr2 (231-272)||(19013044-19013085)
chr2 (124-199)||(23014583-23014659)
chr2 (389-437)||(25198600-25198648)
chr2 (295-379)||(25593012-25593095)
chr2 (64-103)||(25337344-25337383)
chr2 (14-45)||(44998044-44998075)
chr2 (124-199)||(21468532-21468603)
chr2 (124-199)||(25144350-25144421)
chr2 (174-261)||(25370390-25370478)
chr2 (330-379)||(21511826-21511875)
chr2 (356-424)||(23633909-23633978)
chr2 (389-442)||(23634131-23634184)
chr2 (294-365)||(25198531-25198604)
chr2 (124-199)||(23018697-23018773)
[»] scaffold0916 (2 HSPs)
scaffold0916 (294-442)||(3628-3776)
scaffold0916 (118-275)||(3436-3594)
[»] scaffold0471 (2 HSPs)
scaffold0471 (121-442)||(9647-9973)
scaffold0471 (14-82)||(9999-10067)
[»] scaffold0773 (2 HSPs)
scaffold0773 (65-220)||(977-1132)
scaffold0773 (296-442)||(1232-1379)
[»] scaffold1092 (2 HSPs)
scaffold1092 (65-261)||(1714-1911)
scaffold1092 (297-442)||(1508-1654)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (294-442)||(34084-34234)
scaffold0006 (212-275)||(33972-34035)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (294-442)||(3043-3192)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (294-442)||(17477-17626)
scaffold0211 (124-275)||(17654-17801)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (294-442)||(8681-8830)
scaffold0168 (208-275)||(8864-8932)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (294-442)||(150686-150836)
scaffold0009 (294-442)||(245640-245792)
scaffold0009 (294-437)||(153704-153850)
scaffold0009 (121-215)||(150939-151034)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (294-442)||(8653-8802)
scaffold0197 (118-274)||(8875-9022)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (294-442)||(18763-18913)
scaffold0251 (14-275)||(18953-19201)
[»] scaffold0071 (3 HSPs)
scaffold0071 (294-442)||(32122-32271)
scaffold0071 (295-436)||(37094-37236)
scaffold0071 (124-199)||(32377-32448)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (295-437)||(8849-8992)
scaffold0230 (295-437)||(16375-16518)
[»] scaffold0035 (4 HSPs)
scaffold0035 (295-437)||(14412-14555)
scaffold0035 (295-437)||(49860-50003)
scaffold0035 (294-368)||(30985-31058)
scaffold0035 (294-368)||(31756-31829)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (295-437)||(33215-33358)
scaffold0022 (294-439)||(110667-110814)
[»] scaffold0097 (2 HSPs)
scaffold0097 (65-261)||(12371-12569)
scaffold0097 (294-442)||(12165-12314)
[»] scaffold0447 (4 HSPs)
scaffold0447 (294-442)||(6524-6673)
scaffold0447 (294-442)||(11138-11287)
scaffold0447 (121-275)||(6344-6499)
scaffold0447 (121-275)||(10958-11113)
[»] scaffold0383 (2 HSPs)
scaffold0383 (294-442)||(9133-9282)
scaffold0383 (121-275)||(8953-9108)
[»] scaffold0489 (1 HSPs)
scaffold0489 (295-437)||(783-926)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (295-437)||(34878-35021)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (295-437)||(369344-369487)
scaffold0004 (294-406)||(24174-24289)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (294-442)||(1889-2038)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (294-442)||(12369-12518)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (65-260)||(191182-191379)
scaffold0014 (294-418)||(168307-168431)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (294-442)||(163747-163899)
scaffold0011 (294-437)||(162590-162736)
scaffold0011 (174-275)||(163924-164025)
scaffold0011 (103-261)||(172645-172803)
scaffold0011 (294-377)||(172852-172935)
[»] scaffold0816 (1 HSPs)
scaffold0816 (296-442)||(1159-1306)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (295-437)||(9620-9763)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (295-437)||(38181-38324)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (295-437)||(117866-118009)
scaffold0029 (295-437)||(124110-124253)
[»] scaffold0001 (8 HSPs)
scaffold0001 (294-442)||(424850-425001)
scaffold0001 (124-268)||(425043-425183)
scaffold0001 (294-437)||(159181-159325)
scaffold0001 (294-418)||(82456-82580)
scaffold0001 (111-261)||(82631-82781)
scaffold0001 (118-218)||(520672-520771)
scaffold0001 (294-379)||(520862-520947)
scaffold0001 (124-199)||(49433-49504)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (294-442)||(13338-13488)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (294-442)||(60672-60822)
scaffold0072 (124-215)||(60922-61014)
[»] scaffold0064 (3 HSPs)
scaffold0064 (294-442)||(48896-49046)
scaffold0064 (121-275)||(48716-48871)
scaffold0064 (14-79)||(48622-48687)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (294-437)||(13830-13976)
scaffold0026 (148-268)||(13675-13795)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (294-442)||(117883-118032)
[»] scaffold0371 (3 HSPs)
scaffold0371 (121-275)||(9099-9254)
scaffold0371 (294-379)||(8979-9065)
scaffold0371 (8-82)||(9280-9354)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (294-436)||(19546-19689)
scaffold0075 (120-268)||(19355-19504)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (294-442)||(56513-56664)
scaffold0042 (294-437)||(71998-72144)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (294-442)||(48510-48661)
scaffold0037 (124-268)||(48328-48468)
scaffold0037 (294-442)||(84069-84218)
[»] scaffold1058 (1 HSPs)
scaffold1058 (297-442)||(2885-3031)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (296-442)||(14007-14155)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (295-406)||(4-116)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (124-268)||(1961-2101)
[»] scaffold0566 (1 HSPs)
scaffold0566 (295-437)||(3333-3476)
[»] scaffold0512 (1 HSPs)
scaffold0512 (294-442)||(5838-5989)
[»] scaffold0138 (4 HSPs)
scaffold0138 (128-268)||(27307-27443)
scaffold0138 (294-442)||(27485-27636)
scaffold0138 (128-268)||(39303-39439)
scaffold0138 (294-442)||(39481-39632)
[»] scaffold0115 (2 HSPs)
scaffold0115 (294-419)||(17730-17857)
scaffold0115 (124-199)||(17913-17989)
[»] scaffold0096 (3 HSPs)
scaffold0096 (294-442)||(37774-37925)
scaffold0096 (121-268)||(37967-38115)
scaffold0096 (14-82)||(38141-38209)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (294-442)||(18588-18739)
scaffold0018 (148-268)||(18781-18901)
[»] scaffold0894 (2 HSPs)
scaffold0894 (294-437)||(2249-2395)
scaffold0894 (124-199)||(2502-2573)
[»] scaffold0142 (4 HSPs)
scaffold0142 (294-437)||(21527-21673)
scaffold0142 (120-268)||(26862-27011)
scaffold0142 (294-379)||(26733-26820)
scaffold0142 (175-268)||(21715-21808)
[»] scaffold0741 (2 HSPs)
scaffold0741 (295-437)||(2877-3022)
scaffold0741 (124-199)||(3129-3200)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (295-437)||(2181-2325)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (295-442)||(14441-14589)
[»] scaffold0683 (1 HSPs)
scaffold0683 (294-442)||(5497-5648)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (294-442)||(6310-6461)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (294-440)||(13163-13310)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (65-261)||(31521-31718)
scaffold0084 (312-375)||(49825-49888)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (294-442)||(1504-1653)
[»] scaffold0760 (1 HSPs)
scaffold0760 (295-437)||(6055-6200)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (294-442)||(5550-5699)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (303-437)||(299995-300132)
scaffold0005 (124-193)||(300253-300318)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (124-268)||(2442-2582)
scaffold0123 (294-379)||(14205-14290)
[»] scaffold1323 (3 HSPs)
scaffold1323 (174-268)||(1922-2016)
scaffold1323 (328-439)||(530-643)
scaffold1323 (294-355)||(1818-1880)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (294-437)||(24589-24735)
scaffold0078 (294-437)||(30659-30805)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (294-437)||(186354-186500)
scaffold0012 (294-378)||(49994-50079)
scaffold0012 (208-275)||(49904-49972)
scaffold0012 (14-103)||(49701-49791)
[»] scaffold0058 (3 HSPs)
scaffold0058 (294-442)||(61960-62110)
scaffold0058 (121-268)||(61770-61918)
scaffold0058 (14-82)||(61676-61744)
[»] scaffold0404 (2 HSPs)
scaffold0404 (294-442)||(1764-1915)
scaffold0404 (294-442)||(4056-4207)
[»] scaffold0346 (3 HSPs)
scaffold0346 (294-440)||(10606-10756)
scaffold0346 (312-437)||(2252-2380)
scaffold0346 (120-199)||(2514-2594)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (297-437)||(13997-14140)
scaffold0315 (124-243)||(14212-14326)
[»] scaffold0258 (1 HSPs)
scaffold0258 (312-442)||(21494-21625)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (294-442)||(5387-5538)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (294-437)||(15217-15363)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (294-437)||(788-934)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (294-424)||(3436-3569)
[»] scaffold0098 (4 HSPs)
scaffold0098 (294-379)||(44184-44269)
scaffold0098 (118-220)||(44341-44442)
scaffold0098 (400-442)||(44136-44178)
scaffold0098 (14-101)||(44469-44556)
[»] scaffold0362 (3 HSPs)
scaffold0362 (294-378)||(9112-9196)
scaffold0362 (212-275)||(9221-9285)
scaffold0362 (103-160)||(9282-9339)
[»] scaffold0506 (2 HSPs)
scaffold0506 (297-437)||(7667-7810)
scaffold0506 (294-411)||(1656-1776)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (294-416)||(38651-38773)
scaffold0088 (207-261)||(38505-38559)
[»] scaffold0974 (1 HSPs)
scaffold0974 (294-437)||(1794-1940)
[»] scaffold0228 (2 HSPs)
scaffold0228 (294-406)||(19789-19903)
scaffold0228 (124-261)||(19593-19732)
[»] scaffold0150 (3 HSPs)
scaffold0150 (294-437)||(25362-25508)
scaffold0150 (294-442)||(19477-19626)
scaffold0150 (294-442)||(26306-26455)
[»] scaffold0624 (1 HSPs)
scaffold0624 (294-379)||(4791-4876)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (294-442)||(201-350)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (294-375)||(21290-21371)
scaffold0057 (14-220)||(20991-21205)
[»] scaffold0713 (2 HSPs)
scaffold0713 (294-378)||(6597-6681)
scaffold0713 (208-245)||(6738-6774)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (294-442)||(1616-1766)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (294-406)||(33804-33919)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (294-424)||(405-539)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (294-431)||(18966-19104)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (294-437)||(17162-17308)
[»] scaffold0264 (1 HSPs)
scaffold0264 (294-378)||(22315-22399)
[»] scaffold0275 (1 HSPs)
scaffold0275 (354-442)||(2054-2143)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (299-404)||(6870-6981)
scaffold0099 (294-437)||(47821-47973)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (294-442)||(169181-169330)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (346-437)||(42867-42959)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (294-437)||(121667-121813)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (294-442)||(23263-23412)
scaffold0076 (124-199)||(23076-23147)
[»] scaffold1559 (2 HSPs)
scaffold1559 (205-272)||(1411-1478)
scaffold1559 (294-379)||(1516-1600)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (329-442)||(4926-5041)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (103-220)||(21229-21346)
scaffold0231 (294-370)||(21435-21511)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (294-401)||(1764-1871)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (294-373)||(4640-4719)
[»] scaffold0855 (2 HSPs)
scaffold0855 (294-379)||(3583-3667)
scaffold0855 (207-274)||(3478-3544)
[»] scaffold0847 (2 HSPs)
scaffold0847 (294-379)||(3748-3832)
scaffold0847 (207-274)||(3643-3709)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (295-348)||(11753-11806)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (331-379)||(21748-21796)
scaffold0213 (204-274)||(21657-21728)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (312-373)||(3977-4040)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (294-355)||(5202-5264)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (294-355)||(6777-6839)
[»] scaffold0179 (1 HSPs)
scaffold0179 (303-355)||(33769-33822)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (37-82)||(54724-54769)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (394-442)||(74174-74222)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (395-442)||(70454-70501)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (124-261)||(232292-232431)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (294-379)||(22626-22710)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (295-327)||(18814-18846)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (389-437)||(105026-105074)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 212)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Original strand, 9004444 - 9004877
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  9004444 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgccccattatacccttttgctgcttttgcttcggagacaagctacctattttgacctaaaag 9004543  T
Q  114 cctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctt 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9004544 cctatggtttcttgtggaacattctagtgaatagttacttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaattcatctt 9004643  T
Q  214 ttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg---nnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgt 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||    
T  9004644 ttgttctctgaaataataagtgacaattggttctttgaataaaagttcacctttattttatgttcttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgt 9004743  T
Q  311 tagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccct-aatcttatgtaaccctagt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  9004744 tagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaaatcttatgtaaccctaat 9004843  T
Q  409 ttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9004844 ctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 9004877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 65 - 442
Target Start/End: Original strand, 17946595 - 17946974
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17946595 cttttgctgcttttgcttcgcaaacaagctacctattttgaccaaaaagctcgtggtttcttgtagaacattctattgaatagttgcttaggttttaagt 17946694  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatc-ataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-a 262  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  17946695 cgatattagactataaatagagtagctagctatcaataac-attcatcttttgttcttggaaataataagtgtcaattgtttctttgaataaaagttcaa 17946793  T
Q  263 cctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacata 362  Q
    |||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  17946794 cctttattttatgttcttcttcttcttttctatgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgaataagtctaatgacata 17946893  T
Q  363 atcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17946894 atcctaatcaaaccaagctttaaaccttaattttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 17946974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 8 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25181233 - 25181029
Alignment:
Q  8 tgaaatgaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacc 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25181233 tgaaaagaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgccctattatacccttttgttgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacc 25181134  T
Q  108 tacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  25181133 tacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcacaacaatt 25181034  T
Q  208 catct 212  Q
    |||||    
T  25181033 catct 25181029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Original strand, 10204501 - 10204705
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10204501 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgccccattatacccttatgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctaaaag 10204600  T
Q  114 cctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctt 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  10204601 cccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagtttcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctattacaacaattcatctt 10204700  T
Q  214 ttgtt 218  Q
    |||||    
T  10204701 ttgtt 10204705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 103 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 35964401 - 35964060
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  35964401 tgacctaaaagcccttggttttttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgatatat-actataaatagagtagctagccatcacaa 35964303  T
Q  203 caaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnn---atgtct 299  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                     ||||||    
T  35964302 atattcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcccctttattttatgttcatcttcttcttctcttctatgtct 35964203  T
Q  300 acaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatcttatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  35964202 acaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgagataatcctaatcaaaccaagctttaactctaatcttatgt 35964103  T
Q  400 aaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  35964102 aaccctaatctctaatctgaattcactgttttaacatgaatta 35964060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 121 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3376660 - 3376341
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3376660 tttcttgtggaacattctagtgatgtcttgcttaggttttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaacaaatcatcttttgttct 3376561  T
Q  221 ctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagtag 320  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||||     
T  3376560 tggaagtaataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgttcttcttctcttct---atgtctacaatgaacgttagtgagtaa 3376464  T
Q  321 acttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaa 419  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  3376463 actcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctattttctaatctaa 3376364  T
Q  420 attcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||| |||||||||||||||||    
T  3376363 attcaccgttttaacatgaatta 3376341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 4313050 - 4313256
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  4313050 gaatttgaagatcttgtacaaatatatacaagaggcgctccccattatacccttttgctgcttttgcttcagagacaagctacctattttgacctaaaag 4313149  T
Q  114 cctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctt 213  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4313150 cctatggtttcttgtggaacaatctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagccagctatcataacaattcatctt 4313249  T
Q  214 ttgttct 220  Q
    |||||||    
T  4313250 ttgttct 4313256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 4307680 - 4307886
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  4307680 gaatttgaagatcttgtacaaatatatataagaggcgcgccccattataccattttgctgtgtttgcttcggagacaagctacctattttgacctaaaag 4307779  T
Q  114 cctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctt 213  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4307780 cctatggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaattcatctt 4307879  T
Q  214 ttgttct 220  Q
    |||||||    
T  4307880 ttgttct 4307886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8787500 - 8787290
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8787500 cttttgctgcttttgcttcgaaaacaagctacctattttgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaataattgcttaggttttaagt 8787401  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc 264  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8787400 cgacataagactataaaaagagtatctatctatcaaaacaattcatcttttgttcttgaaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaatttcacc 8787301  T
Q  265 tttattttatg 275  Q
    |||||||||||    
T  8787300 tttattttatg 8787290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 65 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8780627 - 8780426
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| | | |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8780627 cttttgctgcttttgcttcggaaacaagctacattttttgacctaaaagcccatggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 8780528  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc 264  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8780527 tgacataagactataaatagagtatctagctatcacaataattcatcttttgttcttggaaataataagttataattgtttctttgaataaaagttcacc 8780428  T
Q  265 tt 266  Q
    ||    
T  8780427 tt 8780426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 120 - 442
Target Start/End: Original strand, 41722627 - 41722955
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||| ||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  41722627 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactgtaaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgtt 41722726  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttca-cctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnn---atgtctacaatgaacgttagt 314  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                     |||||||||||||||||| ||    
T  41722727 cttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaacctttattttatgttcttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttggt 41722826  T
Q  315 gagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaatcttatgtaaccctagtttcta 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||  | ||||    
T  41722827 gagtagacttctcttgtcttgggattgttgcataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagttattaaccataatcttatgtaaccctgatctcta 41722926  T
Q  414 atctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41722927 atctaaattcaccgttttaacatgaatta 41722955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 13434978 - 13435128
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagact--tctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaa 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  13434978 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttctcttgtcttgagattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaatctttaaccctaa 13435077  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13435078 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 13435128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 4030119 - 4030267
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  4030119 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctagtgacataatcctaatcaaaccaagcttgaaccctaatc 4030218  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4030219 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcatcgttttaacatgaatta 4030267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 10204827 - 10204977
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagact--tctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaa 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  10204827 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttctattgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatgaaaccaagctttaaccctaa 10204926  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10204927 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgatttaacatgaatta 10204977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 124 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 48340749 - 48340436
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||| | |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  48340749 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctatccatcacaaatattcatcttttgttctctg 48340654  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagtagac 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  48340653 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaacctttattttatg---ttcttcttctcttctatgtctacaat--acgttagtgagtagac 48340559  T
Q  323 ttc-tcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaa 419  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  48340558 ttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaataacataatcctaatcaaaccaagctttaaactttaatcttatgtaaccctcatctctaatctaa 48340459  T
Q  420 attcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  48340458 attcaccgctttaacatgaatta 48340436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 37100342 - 37100194
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37100342 atgtctacgatgaacatgagtgagtatacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatc 37100243  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37100242 ttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 37100194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Original strand, 39271026 - 39271220
Alignment:
Q  67 tttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcg 166  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39271026 tttgctgcttttgcttcgaaaacaagctacctattttgaccgaaaaccc-gtggtttcttgtggaacattctagtaattagttgcttaggttttaagtcg 39271124  T
Q  167 acataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  39271125 acataagactataaatagagtagctagctatcataacaattgatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 39271220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 33612253 - 33612103
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaa 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||    
T  33612253 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 33612154  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33612153 tcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcactgttttaacatgaatta 33612103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Original strand, 4090567 - 4090764
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4090567 cttttgatgtttttgcttcatggacaagctgcctattttgaccgaaaagtccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttatgttttaagt 4090666  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | |||||| |||||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  4090667 cgacataagactataaatagagtagttagctatcattaacattcatctattgttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 4090764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 2325820 - 2325672
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2325820 atgtctacgatgagcatgagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtctaacgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatc 2325721  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2325720 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 2325672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 12199285 - 12199433
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12199285 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtataatgacataatcataatcaaaccaagctttaaccctaatc 12199384  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12199385 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcactgttttaacatgaatta 12199433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 298 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 648766 - 648620
Alignment:
Q  298 ctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatctt 395  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||| ||    
T  648766 ctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccttaatttt 648667  T
Q  396 atgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  648666 atgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 648620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 195
Target Start/End: Original strand, 1611887 - 1612017
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1611887 cttttgttgcttttgcttcatggaaaagctacctattttgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattccagtgaatagttgcttaagttttaagt 1611986  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagct 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611987 cgacataagactataaatagagtagctagct 1612017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 238
Target Start/End: Original strand, 4029906 - 4030080
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||| | | |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4029906 cttttgctgcttttgcttcatgatctagctgcctgttttgatcgaaaagttcgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 4030005  T
Q  165 cgac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgaca 238  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4030006 cgacaataagactataaatagagtagctagctatcattaacattcatcttttgttcttggaaataataagtgaca 4030080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 4313322 - 4313472
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaa 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||    
T  4313322 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagcttttaaccctaa 4313421  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4313422 tcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcattgttttaacatgaatta 4313472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 272
Target Start/End: Original strand, 33609639 - 33609792
Alignment:
Q  118 tggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgt 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  33609639 tggtttcttttggaacattctagtgatgtattgcttagggcttaagtcgatata-gactataaataaagtagatagctatcataacaattcatcttttgt 33609737  T
Q  218 tctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33609738 tctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttatttt 33609792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 9258608 - 9258460
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9258608 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcccttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatc 9258509  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||| ||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9258508 ttaggtaaccctaatctataagctaaattcaccgttttaacatgaatta 9258460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 9311645 - 9311793
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9311645 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcccttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatc 9311744  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||| ||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9311745 ttaggtaaccctaatctataagctaaattcaccgttttaacatgaatta 9311793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16330866 - 16330718
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  16330866 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 16330767  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  16330766 ttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 16330718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 9009713 - 9009856
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  9009713 tgtctacgatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 9009812  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  9009813 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 9009856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 226 - 442
Target Start/End: Original strand, 13731834 - 13732046
Alignment:
Q  226 ataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttc 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13731834 ataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccgttattttatgttcttctcttct------atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttc 13731927  T
Q  326 tc-ttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattc 423  Q
    || || |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13731928 tccttttcttggatttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccataatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattc 13732027  T
Q  424 aacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||||||| ||||||||    
T  13732028 atcgttttaaaatgaatta 13732046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14229932 - 14229789
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  14229932 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 14229833  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  14229832 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 14229789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 15061364 - 15061507
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  15061364 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccttaatc 15061463  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  15061464 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 15061507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19014623 - 19014480
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  19014623 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 19014524  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  19014523 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 19014480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 23203901 - 23204044
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  23203901 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 23204000  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  23204001 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 23204044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 23510028 - 23510171
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  23510028 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 23510127  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  23510128 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 23510171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 3210959 - 3210762
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3210959 cttttgctgcttttgcttcgaaaacaagctacctgttttgaccaaaaagcccgtggtttcttgtagaacattctattgaatagttgcttaggttttaagt 3210860  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatc-ataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  3210859 cgatataagactataaatagagtagctagctatcaataac-attcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 3210762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14675 - 14532
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  14675 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 14576  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  14575 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 14532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 538241 - 538098
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  538241 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctctcgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 538142  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  538141 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 538098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 545115 - 544972
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  545115 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctctcgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 545016  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  545015 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 544972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 826364 - 826507
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  826364 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 826463  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  826464 ttgtgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 826507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 828375 - 828518
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  828375 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 828474  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  828475 ttgtgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 828518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4158656 - 4158513
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  4158656 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 4158557  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  4158556 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 4158513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4466638 - 4466495
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  4466638 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 4466539  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  4466538 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 4466495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 8713099 - 8713242
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  8713099 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 8713198  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  8713199 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 8713242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 8718603 - 8718746
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  8718603 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 8718702  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  8718703 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 8718746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12548289 - 12548146
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  12548289 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 12548190  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  12548189 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 12548146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 15066453 - 15066596
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||    
T  15066453 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatc 15066552  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  15066553 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 15066596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15916274 - 15916131
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  15916274 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 15916175  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  15916174 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 15916131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15924583 - 15924440
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  15924583 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 15924484  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  15924483 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 15924440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 18389770 - 18389913
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  18389770 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 18389869  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  18389870 ttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 18389913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 23515810 - 23515953
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  23515810 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatactaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 23515909  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  23515910 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 23515953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 21507089 - 21507239
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||    
T  21507089 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaggttattaaccctaa 21507188  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  21507189 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacataaatta 21507239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 5397836 - 5397987
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag--atttgacccta 390  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||  ||| ||    
T  5397836 atgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggatgagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaacctta 5397935  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5397936 atcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 5397987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 338 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8522091 - 8521987
Alignment:
Q  338 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8522091 attgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaattttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatg 8521992  T
Q  438 aatta 442  Q
    |||||    
T  8521991 aatta 8521987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 782750 - 782599
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   || | ||| |    
T  782750 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctta 782651  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  782650 atcttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 782599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 821351 - 821494
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  821351 tgtctacgatgaacattagtgaatagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 821450  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  821451 ttgtgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 821494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 9577965 - 9578108
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  9577965 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 9578064  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  9578065 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 9578108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14941893 - 14941738
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  14941893 tttcttgtggaatattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 14941794  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14941793 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 14941738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15369486 - 15369331
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  15369486 tttcttgtggaatattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 15369387  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15369386 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 15369331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 19364509 - 19364652
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  19364509 tgtctacgatgaacattagtaagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 19364608  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  19364609 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 19364652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33612433 - 33612278
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  33612433 tttcttgtgaaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 33612334  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33612333 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 33612278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15707224 - 15707075
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||  ||  ||||||||    
T  15707224 atgtctacaatgaaagttagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcttaatcaagccaagtcttaaaccctaat 15707125  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15707124 tttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 15707075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 16487483 - 16487632
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  16487483 atgtctacagtgaacatgagtgagtagaattctcttgtcttgggattgtgggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttcaaccctaat 16487582  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  16487583 cttacataaccctagtttctaatctaaatttaccgtttttacatgaatta 16487632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 296 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 48801228 - 48801079
Alignment:
Q  296 gtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa-t 392  Q
    |||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||| |    
T  48801228 gtctacgatgaacatgagtgagtggacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaaat 48801129  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48801128 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 48801079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 5840780 - 5840924
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||    
T  5840780 atgtctacaatgcacgttattgagtagatttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaat 5840879  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||||||| || |||||||||    
T  5840880 cttatgtaaccctaatctctaatccaaattcaccgctttaacatg 5840924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 648950 - 648795
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||  |||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  648950 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattcaaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 648851  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  648850 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttaacctttattttatg 648795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 14545539 - 14545682
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| |||||    
T  14545539 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgtgattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccttaatc 14545638  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    | ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  14545639 tcatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 14545682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15707404 - 15707249
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||| |||||||| |||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  15707404 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataattagagtaggtagccatcacaaatattcatcttttgttc 15707305  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15707304 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 15707249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16076984 - 16076844
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||| ||||||||||||    |||||||| |||||||| || | || ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  16076984 cttgtgggacattctagtga----ttgcttagattttaagttgaaacaaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctg 16076889  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16076888 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 16076844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 48355545 - 48355394
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcct-aatcaaaccaagattt-gacccta 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||  ||| ||    
T  48355545 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaactttaaacctta 48355446  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  48355445 atcttatgtaaccctattttctcttctaaattcactgttttaacatggatta 48355394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 199
Target Start/End: Original strand, 9311391 - 9311525
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9311391 cttttgctgcttttgcttcagaaacaagctacctgttttgaccaaaaagcccgtggtttcttgtagaacattctattgaatagtttcttaggttttaagt 9311490  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9311491 cgatataagactataaatatagtagcgagctatca 9311525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16097571 - 16097424
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | || ||||||||||||||    
T  16097571 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcaaaaatattcgtcttttgttctctg 16097476  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097475 aaataagaagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 16097424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 34390735 - 34390884
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||| ||||    
T  34390735 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagccaagccttaaaccttaat 34390834  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34390835 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 34390884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 39271270 - 39271419
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||    
T  39271270 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattggtggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaactctaat 39271369  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  39271370 cttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgtttcaacatgaatta 39271419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 45407781 - 45407637
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||    
T  45407781 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaa 45407682  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacat 436  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  45407681 tcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacat 45407637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3210705 - 3210554
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| |    
T  3210705 atgtctactatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaactaagctattaaccctca 3210606  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3210605 atcttatgtaacactaatctctaatctaaattaaccgttttaacatgaatta 3210554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 303 - 437
Target Start/End: Original strand, 14551787 - 14551922
Alignment:
Q  303 atgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaa 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||| |||||| ||||||    
T  14551787 atgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccttaatctcatgtaa 14551886  T
Q  402 ccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  14551887 ccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 14551922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23293679 - 23293528
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |    
T  23293679 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaatctttaaacctta 23293580  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23293579 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 23293528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 9258862 - 9258728
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9258862 cttttgctgcttttgctttagaaacaagctacctgttttgaccaaaaagcccgtggtttcttgtagaacattctattgaatagtttcttaggttttaagt 9258763  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9258762 cgatataagactataaatatagtagcgagctatca 9258728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 103 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 17206576 - 17206408
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||||||    ||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  17206576 tgacctaaatgcccgtggtttcttgtggaacattctagtgatatattt-cttagggcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagcaatcaca 17206479  T
Q  202 acaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17206478 acaattcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtctctttgaataaaagttcatctttatttt 17206408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 22578739 - 22578888
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||  ||| ||||    
T  22578739 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataattctaatcaagccaagtcttaaaccttaat 22578838  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22578839 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 22578888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 48713560 - 48713709
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||    
T  48713560 atgtctataatgagcgttaacgagtagactctttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcgtaatcaaaccaagccttaaaccctaat 48713659  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  48713660 tttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttcacatgaatta 48713709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 148 - 268
Target Start/End: Original strand, 12561890 - 12562010
Alignment:
Q  148 ttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttct 247  Q
    |||||||| |||||||||||    | |||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12561890 ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactagaaatagagtagctagccatcataaatattcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttct 12561989  T
Q  248 ttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12561990 ttgaataaaagttcaccttta 12562010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 782932 - 782792
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||| | |||||||||||    | |||||| |||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  782932 cttgtggaacattctagtga----ttgcttggattttaagtcgaatgtaaactatatatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctg 782837  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  782836 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 782792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 48355749 - 48355594
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || |||||||  || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  48355749 tttcttgtggaacattttagtgatgtaattgcttatattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 48355650  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48355649 tttgaaataataagtgacaattgtttatttgaataaaagttcacctttattttatg 48355594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 4307958 - 4308108
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaa 391  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||| | |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||    
T  4307958 atgtctacaatgaacgtcggtgagtagactcttcttttctggggattattggataagtataaatgacataatcctaatcaaaccaaacttttaaccctaa 4308057  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4308058 tcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaatatgaatta 4308108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 30257461 - 30257607
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| |    
T  30257461 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataattctaatcaaaccaagctttaagcctta 30257560  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  30257561 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 30257607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 12562052 - 12562201
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||  ||| ||||    
T  12562052 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagcaaagccttaaaccataat 12562151  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  12562152 attatgtaaccctagtttctcttctaaatttaccgttttaacatggatta 12562201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14941713 - 14941565
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| |||||  ||  |||||||     
T  14941713 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgatataatctaaatcaagccaagccttaaaccctaac 14941614  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  14941613 tttatgtaaccctagtttctcttct-aattcaccgttttaacatggatta 14941565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15173872 - 15173727
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | | | ||| ||    
T  15173872 tgtctacgatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatggcataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaa 15173773  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||||    
T  15173772 tcttatgtaaccctaaattcttatctaaattcaccgctttaacatg 15173727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15369306 - 15369158
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| |||||  ||  |||||||     
T  15369306 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgatataatcaaaatcaagccaagccttaaaccctaac 15369207  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  15369206 tttatgtaaccctagtttctcttct-aattcaccgttttaacatggatta 15369158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Original strand, 12567565 - 12567705
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||| |     
T  12567565 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctttt 12567660  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567661 aaataatatgtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 12567705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 12567747 - 12567898
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   || | ||| |    
T  12567747 atgtctacaatgaacgttagtgggtagacttatcttgtcttgggatttttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttcaacctta 12567846  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12567847 atattatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 12567898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 13652092 - 13652238
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  13652092 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 13652191  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  13652192 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 13652238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 13658615 - 13658761
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  13658615 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 13658714  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  13658715 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 13658761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 14582014 - 14582160
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  14582014 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 14582113  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  14582114 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 14582160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15206049 - 15205903
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  15206049 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctatttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 15205950  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  15205949 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcactgttttaacatg 15205903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16119317 - 16119171
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  16119317 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 16119218  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  16119217 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 16119171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16154956 - 16154810
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  16154956 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 16154857  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  16154856 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 16154810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 18274112 - 18274258
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  18274112 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 18274211  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  18274212 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 18274258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 18288327 - 18288473
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  18288327 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 18288426  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  18288427 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 18288473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 21005500 - 21005374
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||    
T  21005500 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccatgaaccctaat 21005401  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaa 419  Q
     |||| |||  ||| ||||||||||||    
T  21005400 tttatataaatctactttctaatctaa 21005374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23077248 - 23077102
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  23077248 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 23077149  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  23077148 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 23077102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 303 - 442
Target Start/End: Original strand, 24057793 - 24057935
Alignment:
Q  303 atgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgt 399  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||| ||||    
T  24057793 atgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctttaaaccttaatctaatgt 24057892  T
Q  400 aaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24057893 aaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 24057935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Original strand, 1614085 - 1614210
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  1614085 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaat 1614184  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     |||||||||| || |||||||||||    
T  1614185 tttatgtaaccttactttctaatcta 1614210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Original strand, 9585391 - 9585475
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9585391 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 9585475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 13674603 - 13674754
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  13674603 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 13674702  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  13674703 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 13674754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 14752866 - 14753017
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  14752866 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 14752965  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  14752966 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 14753017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 15176382 - 15176533
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  15176382 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 15176481  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  15176482 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 15176533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3201665 - 3201519
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  3201665 atgtctaccgtgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 3201566  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  3201565 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 3201519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16465105 - 16464959
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  16465105 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggactgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 16465006  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||    
T  16465005 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgctttaacatg 16464959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18072436 - 18072290
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  18072436 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 18072337  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||||||    
T  18072336 atcttatgtaaccctaatttattatctaaattcaccgctttaacatg 18072290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 20109127 - 20109277
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||| | |||||||||     
T  20109127 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtcttaataaaataatcctaatcaacccaagctattgaccctag 20109226  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||  || | ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  20109227 tcttatgtaactataatctctaatctaaattcgttgttttaacatgaatta 20109277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 27292046 - 27292192
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  27292046 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 27292145  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  27292146 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatg 27292192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 303 - 437
Target Start/End: Original strand, 35953796 - 35953933
Alignment:
Q  303 atgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgt 399  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||    
T  35953796 atgaacattagtgagtatacttcttcttctcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgt 35953895  T
Q  400 aaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35953896 aaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatg 35953933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8780423 - 8780339
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8780423 atgtctacaatgaacgttagtgagtatactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 8780339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 8787262 - 8787178
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8787262 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtattgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 8787178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 9562048 - 9562132
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9562048 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgtgattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 9562132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 20624715 - 20624863
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  | | ||||     
T  20624715 atgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcttatgtctttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaaccttaaatcttaata 20624814  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20624815 ttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 20624863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 33609837 - 33609921
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33609837 atgtttacaatgaacgttagtgagtatactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 33609921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Original strand, 5840598 - 5840738
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||| ||    | ||||||||||| ||||||||| |||| ||  | |||| |||||||||| |    
T  5840598 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagttgaatgtaaactataaatagcgtagctagccatcacaaatattcatattttgttctcgg 5840693  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5840694 aaataataagtgacaactgtttctttgaataaaagttcaccttta 5840738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 328 - 441
Target Start/End: Original strand, 9192649 - 9192764
Alignment:
Q  328 ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaa 425  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  9192649 ttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaatcttacgtaaccctaatttctaatctaaattcat 9192748  T
Q  426 cgttttaacatgaatt 441  Q
    ||||||||||||||||    
T  9192749 cgttttaacatgaatt 9192764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 13667925 - 13668076
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |  | ||    
T  13667925 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagtctta 13668024  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  13668025 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 13668076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18589225 - 18589074
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  18589225 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 18589126  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  18589125 accttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 18589074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18592819 - 18592668
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  18592819 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 18592720  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  18592719 accttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 18592668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18599450 - 18599299
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  18599450 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 18599351  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  18599350 accttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 18599299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 12575907 - 12576053
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | | |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  12575907 atgtctacgatgaacatgactgagtagacttctccttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 12576006  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  12576007 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcactgttttaacatg 12576053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16471631 - 16471485
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctct-tgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  16471631 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccatgtcttgggactgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 16471532  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||    
T  16471531 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgctttaacatg 16471485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 415
Target Start/End: Original strand, 38877519 - 38877640
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||| | | ||||||||    
T  38877519 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagactcgaaccctaat 38877617  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
    |||||||||  ||| ||||||||    
T  38877618 cttatgtaaatctattttctaat 38877640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 39387898 - 39388044
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  39387898 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 39387997  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| || ||| ||| ||||||||    
T  39387998 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaagtcaccgtcttaacatg 39388044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4460737 - 4460652
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4460737 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttgcatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaag 4460652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 205 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4460842 - 4460773
Alignment:
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttat 274  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4460842 aatcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttat 4460773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 4983260 - 4983163
Alignment:
Q  175 ctataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4983260 ctataaatagagcagctagcaaacatattcaatcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttatttt 4983163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9193992 - 9193908
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9193992 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 9193908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14941987 - 14941919
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14941987 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgccccattatacccttttgctgcttttgctt 14941919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 15369580 - 15369512
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15369580 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgccccattatacccttttgctgcttttgctt 15369512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 18618865 - 18619016
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  18618865 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggatttttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 18618964  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  18618965 accttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 18619016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 321 - 437
Target Start/End: Original strand, 319766 - 319884
Alignment:
Q  321 acttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaatcttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | | || |||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  319766 acttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctg 319865  T
Q  419 aattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||| ||| ||||||||    
T  319866 aattcaccgtcttaacatg 319884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 415
Target Start/End: Original strand, 1462660 - 1462782
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  1462660 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagaatcttcttgtctttagattgttgaataattttaatgacataatcctaatcaaaccaagccttgaaccctaat 1462759  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
     |||||| | |||| ||||||||    
T  1462760 tttatgtcaacctaatttctaat 1462782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9264341 - 9264255
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9264341 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctccttatcttaggattgttggataagtctaatgacataatccacatcaaaccaag 9264255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16076802 - 16076656
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  | | | || ||    
T  16076802 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaattaagccaaactctaagcctta 16076703  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||    
T  16076702 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgccttaacatg 16076656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 16532792 - 16532938
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||  |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  16532792 atgtctatgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 16532891  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||    
T  16532892 atcttatgtaaccctaatttcttatttaaattcaccgctttaacatg 16532938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16632870 - 16632724
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||  |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  16632870 atgtctatgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 16632771  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||    
T  16632770 atcttatgtaaccctaatttcttatttaaattcaccgctttaacatg 16632724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 48713288 - 48713503
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataa-aagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgccta----------ttt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  || |||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||          ||     
T  48713288 gaatttgaagatcttgtgcaaaaatataacaagtgccgc-accccttttacccttttgctgcttctgcttcaaagacaagctacctattaagtttacttc 48713386  T
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||    ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  48713387 tgacctaaaagcccatggtttcttgtggaacattatagtgatgtattgcttaggttttaagtcattgtaa-actataaatatagtagctagctatcacaa 48713485  T
Q  203 caaatcatcttttgttct 220  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  48713486 caattcatcttttgttct 48713503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 297 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6257497 - 6257416
Alignment:
Q  297 tctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6257497 tctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgaaatcctaatcaaaccaa 6257416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 13434694 - 13434914
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatac-ccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattt---------t 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||| |||| | ||  ||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||          |    
T  13434694 gaatttgaagatcttgtacaaatatatacaagaggcgcgccccactttagtccttttgctgcttttgcttcccggacaagctacctattagtttatttct 13434793  T
Q  104 gacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataac 203  Q
    |||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  13434794 gacctataagcccttggtttattgtggaacattctagtgatgtattgcttaggtttaaagtcgttata-gactataaatagagtagccagttatcataac 13434892  T
Q  204 aaatcatcttttgttctctgaa 225  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  13434893 aattcatcttttgttctttgaa 13434914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 429
Target Start/End: Original strand, 368221 - 368357
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||||||||    
T  368221 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttatgtcttggaattgttgaataagtataatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccctaat 368320  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtt 429  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  368321 tttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgtt 368357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 39388847 - 39388931
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39388847 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 39388931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 38388112 - 38387981
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgtaaccctagttt 410  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||| |||| |||||||||| ||||||    
T  38388112 agtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccatagttt 38388013  T
Q  411 ctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||  ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  38388012 ctcttctaaattcacagttttaacatggatta 38387981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 16897238 - 16897112
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatc-aaaccaag-atttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||  |||||||    
T  16897238 atgtctacgatgaacttgagtgagtagactcttcttgtctttggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaaccaagccttaaaccctaa 16897139  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||    
T  16897138 ttttatgtaaccctaatttttaatcta 16897112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 4294709 - 4294858
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| || |    
T  4294709 atgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgtcggataagtctaatgacataatcctaatcaagttaagccttaaaccttagt 4294808  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4294809 attatataaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 4294858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17206369 - 17206285
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17206369 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttct-ttatcttgggattgttggatgagtctaatgacataatccctatcaaaccaag 17206285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 4090813 - 4090897
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4090813 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtctttggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 4090897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9264460 - 9264392
Alignment:
Q  208 catcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatg 275  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9264460 catcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaacctttattttatg 9264392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 434
Target Start/End: Original strand, 20627052 - 20627175
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgtaaccctagttt 410  Q
    |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  20627052 agtgagtagacttcttatgtctttggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagttt 20627151  T
Q  411 ctaatctaaattcaacgttttaac 434  Q
     |  |||||||||| |||||||||    
T  20627152 attttctaaattcaccgttttaac 20627175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 434
Target Start/End: Original strand, 20630943 - 20631066
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgtaaccctagttt 410  Q
    |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  20630943 agtgagtagacttcttatgtctttggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagttt 20631042  T
Q  411 ctaatctaaattcaacgttttaac 434  Q
     |  |||||||||| |||||||||    
T  20631043 attttctaaattcaccgttttaac 20631066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 434
Target Start/End: Original strand, 20635551 - 20635674
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgtaaccctagttt 410  Q
    |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  20635551 agtgagtagacttcttatgtctttggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagttt 20635650  T
Q  411 ctaatctaaattcaacgttttaac 434  Q
     |  |||||||||| |||||||||    
T  20635651 attttctaaattcaccgttttaac 20635674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 434
Target Start/End: Original strand, 20637423 - 20637546
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgtaaccctagttt 410  Q
    |||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  20637423 agtgagtagacttcttatgtctttggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagttt 20637522  T
Q  411 ctaatctaaattcaacgttttaac 434  Q
     |  |||||||||| |||||||||    
T  20637523 attttctaaattcaccgttttaac 20637546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9194267 - 9194052
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataa-aagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgccta----------ttt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||| || ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||          ||     
T  9194267 gaatttgaagatcttgtgcaaaaatataacaagtggcgc-accccttttacccttttgcagcttctgcttcaaagacaagctacctattaagtttactta 9194169  T
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9194168 tgacctaaaagaccatggtttcttgtggaatattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagctatcacaa 9194070  T
Q  203 caaatcatcttttgttct 220  Q
    ||| | ||||||| ||||    
T  9194069 caattaatcttttattct 9194052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6712418 - 6712334
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  6712418 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaag 6712334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 15707498 - 15707430
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15707498 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcacgccctattatactcttttgctgcttttgctt 15707430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 294 - 406
Target Start/End: Original strand, 16497865 - 16497980
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | || ||    
T  16497865 atgtctacgatgaacatgagtgagtagatttctccttatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 16497964  T
Q  391 atcttatgtaacccta 406  Q
    ||||||||||||||||    
T  16497965 atcttatgtaacccta 16497980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 415
Target Start/End: Original strand, 17911698 - 17911820
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||||| |||| |  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| || | ||||||||    
T  17911698 atgtctacaacgaacatgtgtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcttcgaaccctaat 17911797  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
     ||||||||  ||| ||||||||    
T  17911798 tttatgtaaatctattttctaat 17911820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4256591 - 4256506
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4256591 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgttttgggattgttggatgagtctaataacctaatcctaatcaaaccaag 4256506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4465868 - 4465807
Alignment:
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctt 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4465868 aatcatcttttgttctctgaaattaatagtgacaattgtttctttgaataaaagttctcctt 4465807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4983122 - 4983038
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  4983122 atgtcttcaatgaacgtgagtgagtagacttat-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaag 4983038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 30063935 - 30063811
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||  ||||| |||||  | | ||||||||    
T  30063935 atgtctacaatgaacatgagtgagttgacttct-ttgtcttgggattgttgaatgagtctaatgacctaatccctatcaagccaagcctcgaaccctaat 30063837  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||    
T  30063836 cttatgtaaatctattttctaatcta 30063811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 4465761 - 4465638
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaa 391  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  | | |||||||    
T  4465761 atgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttctttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaa 4465662  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
    | ||||||||  ||| ||||||||    
T  4465661 ttttatgtaaatctattttctaat 4465638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4790868 - 4790781
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| || ||| | ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4790868 atgtctacgataaacatgagtgagtagacttctttttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaag 4790781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 266
Target Start/End: Original strand, 4541187 - 4541229
Alignment:
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctt 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4541187 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctt 4541229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 274
Target Start/End: Original strand, 17911451 - 17911670
Alignment:
Q  64 ccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattt----------tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgctt 153  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||          ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    || |||    
T  17911451 ccttttgctgcttttgcttctctgacaagctgcctatttagtttatttctgaccta-aagcttgtggtttcttgtggaacattctattgatgtatttctt 17911549  T
Q  154 aggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttc-tttgaa 252  Q
     ||  |||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| |  |||   |||||||| |||||||  ||||| |  ||| ||||||||||| ||||||    
T  17911550 ggggcttaagtagtcgtaa-actataaatagagtagctagcaaatatattgaatcatctcttgttcttggaaattaatagttacaattgtttcctttgaa 17911648  T
Q  253 taaaagttcacctttattttat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  17911649 taaaagttcatctttattttat 17911670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 19515638 - 19515548
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagac-aagctgcctatttt 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||| ||||||    
T  19515638 gaatttgaagatctcgtacaataatatgaaagtggcgcgctccattttacccttttgttgcttttgcttcttcgacaaagctgcatatttt 19515548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 261
Target Start/End: Original strand, 38877414 - 38877468
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38877414 tcatcttttgttcttggaaattataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 38877468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4316958 - 4316874
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  4316958 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactttgtttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaag 4316874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 11997314 - 11997230
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||    
T  11997314 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtgttgggattgttggataagtctaataatttattcctaatcaaaccaa 11997230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16897375 - 16897288
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgt-ttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| | |  |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16897375 actataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttcttggaattcaatagtgacaattgtcttcttt-aataaaagttc 16897288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19515335 - 19515251
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||| || |||||| | ||| ||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19515335 atgtcgacgatgaacatgagttagtagactcttcttctcttgggattcttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 19515251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25034291 - 25034209
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  25034291 tgtctacgatgaacatgagtgagtaggcttct-ttgtcttgtgattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaag 25034209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 9264662 - 9264572
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataa-aagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagac-aagctgcctatttt 103  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  9264662 gaatttgaatatcttgtgcaaaaatataacaagtggtgcaacccttt-tacccttttgctgcttttgcttcttcgacaaagctgcctatttt 9264572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 356
Target Start/End: Original strand, 46274217 - 46274279
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaat 356  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46274217 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaat 46274279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 48801421 - 48801279
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||    
T  48801421 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttatt 48801322  T
Q  219 ctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 260  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||| | | | ||||||||||    
T  48801321 cttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagtt 48801279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 243
Target Start/End: Original strand, 368031 - 368152
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctct 222  Q
    ||||||||||||||||||    || |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||      
T  368031 cttgtggaacattctagttttgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatcttttgttcttg 368130  T
Q  223 gaa-ataataagtgacaattgt 243  Q
    ||| | ||||||||||||||||    
T  368131 gaatacaataagtgacaattgt 368152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 679468 - 679344
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||  || ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||   | | ||||||||    
T  679468 atgtctgcaatgaacatgagtgagtagacaact-ttgtcttggaattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaaacctagaaccctaat 679370  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||    
T  679369 cttatgtaaatctattttctaatcta 679344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11483830 - 11483745
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| || ||| | ||||||||||||  |||| | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11483830 atgtctacgattaacatgagtgagtagactcttcttattttaggattgttggataagtataatgacataatcttaatcaaaccaag 11483745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 15523142 - 15523226
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  15523142 atgtttacaatgaacatgagtaagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgcgtctaatgacctaatccctatcaaaccaag 15523226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 261
Target Start/End: Original strand, 1613964 - 1614036
Alignment:
Q  190 ctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  1613964 ctagctatcataacaaatcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 1614036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 2325953 - 2325885
Alignment:
Q  176 tataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgt 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  2325953 tataaatagagtagctagccatcacaataaatcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgt 2325885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 218
Target Start/End: Original strand, 5825963 - 5826077
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||  |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  5825963 tgacctaaaagcccatggtttcttgtggaacattctagtgttatattt-cttagggcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagctatcaca 5826060  T
Q  202 acaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||| | ||||||||||    
T  5826061 acaatttatcttttgtt 5826077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Original strand, 12199082 - 12199162
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12199082 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 12199162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 6257790 - 6257700
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataa-aagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagac-aagctgcctatttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||| || | ||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  6257790 gaatttgaagatcttgtacaaaaatataacaagtggcgc-accccttttgcccttttcctgcttttgcttcttcgacaaagctgcctatttt 6257700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 415
Target Start/End: Original strand, 4541281 - 4541402
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||  ||||||||||| ||   ||||||||    
T  4541281 atgtctacaataaacatgtgtgagtagacttct-ttgttttgggattgttggatgagactaatgacctaatccctatcaaaccaagcatcgaaccctaat 4541379  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
     ||||||||  ||| ||||||||    
T  4541380 tttatgtaaatctattttctaat 4541402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 215
Target Start/End: Original strand, 19364331 - 19364418
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||    
T  19364331 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatctttt 19364418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 679577 - 679512
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||||||||   ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  679577 tcatcttttgttcttgaaaattctaagtgacaattatttctttgaataaaagttcttctttatttt 679512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16097392 - 16097339
Alignment:
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  16097392 taatcttatgtaaccctaatctctaatctaaatttaccgctttaacatgaatta 16097339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 48355845 - 48355775
Alignment:
Q  16 atttgaagatcttgtacaat----aatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48355845 atttgaagatcttgtacaattaataatataaaagtggcacgctccattatacccttttgcagcttttgctt 48355775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11997512 - 11997437
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    | |||||||||| ||||||||||    
T  11997512 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatacagtagctagc 11997437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 37100551 - 37100400
Alignment:
Q  111 aagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatca 209  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||| | |||| ||  | |||    
T  37100551 aagcctgcagttgcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctatccatcacaaacattca 37100452  T
Q  210 tcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 260  Q
    |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | ||||||||||    
T  37100451 tcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagtt 37100400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 538419 - 538348
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  538419 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 538348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 545294 - 545223
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  545294 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 545223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 214
Target Start/End: Original strand, 2325954 - 2325992
Alignment:
Q  176 tataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttt 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2325954 tataaatagagtagctagccatcacaacaaatcatcttt 2325992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12548467 - 12548396
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12548467 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 12548396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 314 - 355
Target Start/End: Original strand, 13411402 - 13411443
Alignment:
Q  314 tgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa 355  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13411402 tgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaa 13411443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30064004 - 30063960
Alignment:
Q  232 agtgacaattgttt--ctttgaataaaagttcacctttattttat 274  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30064004 agtgacaattgttttcctttgaataaaagttcatctttattttat 30063960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Original strand, 1751106 - 1751189
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||| | | | ||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| |||| |||||    
T  1751106 tgtctacaatgaacatgtgtgagtagaccttt-tagtcttgagattgttggatgggtctaatgactaaatcctattcaagccaag 1751189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 437
Target Start/End: Original strand, 9725878 - 9725926
Alignment:
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  9725878 taatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 9725926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 11484094 - 11484054
Alignment:
Q  63 cccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctatttt 103  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  11484094 cccttttgctgctttttcttcttcgacaagctgcctatttt 11484054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 437
Target Start/End: Original strand, 12661747 - 12661795
Alignment:
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||| |||||    
T  12661747 taatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttcacatg 12661795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Original strand, 20108935 - 20109011
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  20108935 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagcaatca 20109011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 167
Target Start/End: Original strand, 24057586 - 24057634
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcga 167  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||    
T  24057586 gtttcttgtggaacattctagtaatataattgcttagattttaagtcga 24057634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 35104061 - 35103978
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |  |  |||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  35104061 tgtctacaatgaacataagtgagtagaccttccaagtctttggattgttggatgagtctaatgactaaatcct-atcaaaccaag 35103978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 240 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 47877696 - 47877668
Alignment:
Q  240 ttgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47877696 ttgtttctttgaataaaagttcaccttta 47877668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 146)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 65 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20169678 - 20169300
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20169678 cttttgctgcttttgcttcggaaacaagctacctattttgaccgaaaagcccgtgatttcttgtagaacattctagtgaatagttgcttaggttttgagt 20169579  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc 264  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20169578 cgacataagactttaaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttattggaaagaataagtgacaattgtttctttgaataaaagtccacc 20169479  T
Q  265 tttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataat 364  Q
    |||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20169478 tttattttatgtttttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttagtgagtagactattcttgtcttcggattgttggataagtctaatgacataat 20169379  T
Q  365 cctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20169378 cctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 20169300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Original strand, 24165122 - 24165331
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  24165122 ctttttctgcttttgcttcatggacaagttgcgtattttgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctactgattagtttcttaggttttaagt 24165221  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc 264  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24165222 caccataagactataaatagagtagccatctatcatta-atatcatcttttgttctcttaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc 24165320  T
Q  265 tttattttatg 275  Q
    |||||||||||    
T  24165321 tttattttatg 24165331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20725071 - 20724875
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20725071 cttttgctgcttttgcttcatggacaagctgcctattttgacctaaaagcttgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 20724972  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| | |  |||||||||||| | | | |||||||||||    
T  20724971 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaattaatcttttgttcttggaattcaatagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 20724875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 21273456 - 21273662
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||| |||    
T  21273456 gaatttgaatatcttgcacaataatataaaagtggcgcgccccattatacctttttgctgcttttgcttcggagacaaactacgtattttgacctaaaag 21273555  T
Q  114 cctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctt 213  Q
    |   || |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21273556 ctcatgatttcttttggaacattctactaaatagttgcttaggttttaagccgacataagactataaataaagtagctagctatcataacaattcatctt 21273655  T
Q  214 ttgttct 220  Q
    |||||||    
T  21273656 ttgttct 21273662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 121 - 442
Target Start/End: Original strand, 20967674 - 20968000
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  20967674 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 20967773  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg---nnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtga 316  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||    
T  20967774 tctgaaataataagtgacaattttttctttgaataaaagttcaactttattttatgttcttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttagtga 20967873  T
Q  317 gtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||  ||| |||| |||||||||||||||||||  |    
T  20967874 gtagacttctcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgatataatccttatcaagccaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagtttctctt 20967973  T
Q  416 ctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||    
T  20967974 ataaattcaccgttttaacatggatta 20968000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 21273760 - 21273908
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21273760 atgtctacaatgaacgttagtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataagtctagcgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatc 21273859  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21273860 ttatataaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 21273908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17408943 - 17408732
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17408943 cttttgctgcttttgcttcggaaacatgctacctattttaaccgaaaagcttgtggtttcttgtagaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 17408844  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-ac 263  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||  || |||||||| || ||    
T  17408843 caacataagactataaatagagtaactagctatcataaacattcatcttttgttcttcaaaataataagtgccaattgttttctttaataaaagatcaac 17408744  T
Q  264 ctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||    
T  17408743 ctttattttatg 17408732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Original strand, 12322196 - 12322394
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12322196 cttttgctgcttttgcttcatgaactagcttcctgttttgaccgaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatatttgcttaggttttaagt 12322295  T
Q  165 cgac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  12322296 cgacaataagactataaatagagtagctagctatcataacagttcatcttttattcttagaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 12322394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 260
Target Start/End: Original strand, 21389536 - 21389733
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaa-gcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaag 163  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||  | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389536 cttttgctgcttttgcttcagaaacaagctacctgttttgacaaaaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaag 21389635  T
Q  164 tcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||| |||| | ||||| |||||||||| | | | ||||||||||    
T  21389636 tcgacataagactataaatagagtagctagctatcattaaaattcatcttttattctttgaattcaataactgacaattgtctttcttaataaaagtt 21389733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 294 - 441
Target Start/End: Original strand, 23756867 - 23757014
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||    
T  23756867 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagtcataaccctaatc 23756966  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatt 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23756967 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatt 23757014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 294 - 441
Target Start/End: Original strand, 23822323 - 23822470
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||    
T  23822323 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagtcataaccctaatc 23822422  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatt 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23822423 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatt 23822470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 23435436 - 23435585
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||    
T  23435436 atgtctacgatgaacatgagtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaacgctaat 23435535  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23435536 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 23435585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 23446803 - 23446952
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||    
T  23446803 atgtctacgatgaacatgagtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaacgctaat 23446902  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23446903 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 23446952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20832449 - 20832305
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  20832449 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcccttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 20832350  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  20832349 cttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 20832305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20915933 - 20915783
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaa 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  20915933 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaatgacaaaatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaa 20915834  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  20915833 ttttatgtaaccctaatttctaatgtaaattcaccattttaacatgaatta 20915783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 12322447 - 12322594
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  12322447 atgtctacgatgaacatgagtgaatagacttcttttgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaggctttaaccctaatc 12322546  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12322547 ttatgtaa-cctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 12322594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 7761091 - 7760948
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  7761091 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 7760992  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  7760991 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 7760948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20601592 - 20601449
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  20601592 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 20601493  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  20601492 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 20601449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20607883 - 20607740
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  20607883 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 20607784  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  20607783 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 20607740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20614220 - 20614077
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  20614220 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 20614121  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  20614120 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 20614077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20790199 - 20790056
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  20790199 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 20790100  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  20790099 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 20790056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20795980 - 20795837
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  20795980 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 20795881  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  20795880 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 20795837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21734593 - 21734450
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  21734593 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 21734494  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  21734493 ttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 21734450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21812236 - 21812093
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  21812236 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 21812137  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  21812136 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 21812093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Original strand, 21382144 - 21382341
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||| ||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382144 cttttgttgcttttgcttcagaagcaagctacctgttttgaccgaaaaccccgtggtttcttatggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 21382243  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  21382244 cgacataagactataaaaagagtagctagctatcattaacattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 21382341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 21382390 - 21382539
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||| ||||    
T  21382390 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttatcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagccttaaaccgtaat 21382489  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21382490 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 21382539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18483679 - 18483528
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag--atttgacccta 390  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||  ||| ||    
T  18483679 atgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaacctta 18483580  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18483579 atcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 18483528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 15732053 - 15732196
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  15732053 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 15732152  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  15732153 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 15732196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 15736272 - 15736415
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  15736272 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 15736371  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  15736372 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 15736415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20595306 - 20595163
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  20595306 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 20595207  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  20595206 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 20595163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23618452 - 23618309
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  23618452 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 23618353  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  23618352 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 23618309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 23684962 - 23685105
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  23684962 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 23685061  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  23685062 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 23685105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23849849 - 23849706
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  23849849 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 23849750  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  23849749 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 23849706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 24220481 - 24220632
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  24220481 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 24220580  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24220581 atcatatgtaaccctaatttccaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 24220632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 28834884 - 28834741
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  28834884 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcttaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 28834785  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  28834784 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcatcgctttaacatg 28834741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 34780421 - 34780564
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  34780421 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 34780520  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  34780521 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 34780564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 298 - 442
Target Start/End: Original strand, 21389787 - 21389932
Alignment:
Q  298 ctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatctta 396  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  | ||||||||||    
T  21389787 ctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaaccaagccttaaatcctaatctta 21389886  T
Q  397 tgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  21389887 tgtaaccctagtatctaatataaattcacccttttaacatgaatta 21389932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 42789812 - 42789663
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| | ||    
T  42789812 atgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgctggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttgat 42789713  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  42789712 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 42789663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Original strand, 23435183 - 23435379
Alignment:
Q  67 tttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcg 166  Q
    |||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23435183 tttgctgcttttgcttcatgatctagctgcctgttttgaccgaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggtttcaagtcg 23435282  T
Q  167 ac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||| || ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  23435283 acaataagactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctcttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 23435379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 261
Target Start/End: Original strand, 23446550 - 23446746
Alignment:
Q  67 tttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcg 166  Q
    |||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23446550 tttgctgcttttgcttcatgatctagctgcctgttttgaccgaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggtttcaagtcg 23446649  T
Q  167 ac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||| || ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  23446650 acaataagactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctcttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 23446746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 18067343 - 18067486
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  18067343 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 18067442  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  18067443 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 18067486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 18073638 - 18073781
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  18073638 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 18073737  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  18073738 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 18073781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23343527 - 23343376
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |    
T  23343527 atgtctacaatgaacgttagtgagtagaattcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaacctttaaacctta 23343428  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  23343427 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcatcgctttaacatgaatta 23343376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23973186 - 23973043
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  23973186 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 23973087  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||    
T  23973086 ttatgtaaccctaattccttatctatattcaccgctttaacatg 23973043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 433
Target Start/End: Original strand, 24935583 - 24935722
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  24935583 tgtctacaatgaacgtcagtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 24935682  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaa 433  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  24935683 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaa 24935722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 433
Target Start/End: Original strand, 24941275 - 24941414
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | | |||||    
T  24941275 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaatcttaatc 24941374  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaa 433  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  24941375 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaa 24941414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 41765763 - 41765620
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  41765763 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 41765664  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||| || |||||||||    
T  41765663 ttatgtaaccctaattccttatctagattcaccgctttaacatg 41765620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 20245668 - 20245818
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  20245668 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaa 20245767  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | ||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20245768 ttttatgtaaccctaattcgtaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 20245818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 442
Target Start/End: Original strand, 14482494 - 14482642
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  14482494 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggatttttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 14482593  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    || |||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  14482594 ttgtgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatggatta 14482642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23343707 - 23343552
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| |||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  23343707 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgtttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 23343608  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23343607 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacttttattttatg 23343552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 23771036 - 23771179
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  23771036 tgtctacaatgaacgtcaatgagaagacttttcttgtctggggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 23771135  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  23771136 ttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 23771179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 26848383 - 26848526
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  26848383 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 26848482  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||| |||| || || |||| |||||| || |||||||||    
T  26848483 ttatgtaatcctaattccttatcttaattcaccgctttaacatg 26848526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 34223343 - 34223164
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| |||| |    
T  34223343 cttttgctacttttgctttagaaacaagctacctattttgacctaaaagcccatggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggtcttaact 34223244  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgt 243  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  34223243 cgtcataaaactataaatagagtagctagctgtcacaacaattcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgt 34223164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 31057693 - 31057547
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | | || ||    
T  31057693 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagcctta 31057594  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  31057593 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 31057547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 30729954 - 30730097
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||||    
T  30729954 tgtctacgataaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagcctaatgacataatcctaatcaaacaaagctttaaaccttaatc 30730053  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  30730054 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 30730097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 272
Target Start/End: Original strand, 15059354 - 15059452
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15059354 actataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 15059452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 294 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 20571427 - 20571278
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| | ||| |    
T  20571427 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggatggttggataagtctaaatgacatgatcctaatcaaaccaacctttaaacctta 20571328  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaat 440  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20571327 atcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaat 20571278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 296 - 442
Target Start/End: Original strand, 24214860 - 24215009
Alignment:
Q  296 gtctacaatgaacgttagtgagtagacttc-tcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  24214860 gtctacgatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccttaat 24214959  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||||||||||| | || |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  24214960 catatgtaaccctaatctccaatctaaattcatcactttaacatgaatta 24215009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 3388136 - 3388287
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag--atttgacccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||   ||  ||| ||    
T  3388136 atgtctacgatgaacatcagtgagtagaattctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaactaagctcttaaacctta 3388235  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  3388236 atcttatgtaaccctaatttctaatataaattcaccgctttaacatgaatta 3388287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 21400951 - 21400807
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |    
T  21400951 atgtctacgatgaacattagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctttaagcctta 21400852  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaaca 435  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  21400851 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaaca 21400807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25577629 - 25577485
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | | || ||||    
T  25577629 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcctgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaat 25577530  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  25577529 cttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 25577485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 274
Target Start/End: Original strand, 22942342 - 22942437
Alignment:
Q  179 aaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttat 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22942342 aaatagagtagttagctatcataacaattcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaatttcacctttattttat 22942437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23600124 - 23599978
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | |||||    
T  23600124 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcccta 23600025  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  23600024 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 23599978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20449808 - 20449663
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | | ||| ||    
T  20449808 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaacgaagctctaagccttaa 20449709  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  20449708 tcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 20449663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Original strand, 24214667 - 24214816
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||| |    |  |||||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||    
T  24214667 gtttcttgtggaacattctagtaatgtaattgcttagattttaagtcaaatgtatgctataaatagagtagctagccatcataaatatttatcttttgtt 24214766  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24214767 ctcggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 24214816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 25741797 - 25741946
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  25741797 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaat 25741896  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25741897 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 25741946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 323 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18613236 - 18613121
Alignment:
Q  323 ttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaat 421  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  18613236 ttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatttcctatctaaat 18613137  T
Q  422 tcaacgttttaacatg 437  Q
    ||| || |||||||||    
T  18613136 tcaccgctttaacatg 18613121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24952662 - 24952511
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  24952662 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 24952563  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  24952562 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 24952511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24969327 - 24969176
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  24969327 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 24969228  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  24969227 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 24969176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 25202007 - 25202158
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  25202007 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 25202106  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  25202107 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 25202158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 25266162 - 25266313
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  25266162 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 25266261  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  25266262 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 25266313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 22856270 - 22856416
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  22856270 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 22856369  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  22856370 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 22856416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25006297 - 25006151
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  25006297 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 25006198  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  25006197 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 25006151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25891334 - 25891188
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  25891334 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 25891235  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  25891234 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 25891188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 9728879 - 9728730
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  | | | || ||    
T  9728879 atgtctacaatgaacatgagtgagtaaacttctctttgtattgagattgttggataagtctaaatgatataatcctaatcaaaccaaactctaagcctta 9728780  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaat 440  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  9728779 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatgaat 9728730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 303 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20444318 - 20444181
Alignment:
Q  303 atgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgt 399  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||    
T  20444318 atgaacattaatgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgt 20444219  T
Q  400 aaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  20444218 aaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 20444181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 20724823 - 20724698
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  20724823 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttatcttgtgattgttggataagtctaatgacattatcctaatcaaaccaagttttaaaccctaat 20724724  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  20724723 tttatgtaaccctactttctaatcta 20724698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20916115 - 20915958
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||| ||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  20916115 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaattcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgtt 20916016  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatg 275  Q
    ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20916015 cttggaaataataagtgacaattatttctttgaataaaagttcaacatttattttatg 20915958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Original strand, 24220290 - 24220439
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||    |  |||||||||||||||||||  |||| ||  | | ||||||||||    
T  24220290 gtttcttgtggaacattctagtaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagtcatcacaaatatttatcttttgtt 24220389  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24220390 ctcggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 24220439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 6406376 - 6406527
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgacccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  | | ||    
T  6406376 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaaatctta 6406475  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  6406476 atcttatgtaatcctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 6406527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16104223 - 16104072
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  16104223 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 16104124  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  16104123 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 16104072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18611170 - 18611019
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  18611170 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagtcctaagcctta 18611071  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  18611070 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 18611019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18772334 - 18772183
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  18772334 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 18772235  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  18772234 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 18772183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 20616436 - 20616587
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  20616436 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 20616535  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  20616536 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 20616587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 21729943 - 21730094
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  21729943 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 21730042  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  21730043 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 21730094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 13910122 - 13910268
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  13910122 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 13910221  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||||||    
T  13910222 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattgaccgctttaacatg 13910268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 22143119 - 22143265
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  22143119 atgtctacgatgagcatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 22143218  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  22143219 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 22143265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22316979 - 22316833
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  22316979 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacctaatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 22316880  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  22316879 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatg 22316833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22323586 - 22323440
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  22323586 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacctaatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 22323487  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  22323486 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatg 22323440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 301 - 418
Target Start/End: Original strand, 22948690 - 22948808
Alignment:
Q  301 caatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgt 399  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||| ||| ||||||    
T  22948690 caatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtcggataagtctaatgacataatcctattcaaaccaagctttaaacccaaattttatgt 22948789  T
Q  400 aaccctagtttctaatcta 418  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  22948790 aaccctaatttctaatcta 22948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 23267802 - 23267948
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  23267802 atgtctacgataaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 23267901  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  23267902 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 23267948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25115292 - 25115146
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  25115292 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 25115193  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  25115192 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatg 25115146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25174384 - 25174238
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  25174384 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 25174285  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  25174284 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatg 25174238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 30759152 - 30759006
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  30759152 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 30759053  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  30759052 atcttatgtaaccctaatttctcatctaaattcaccgctttaacatg 30759006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 30769257 - 30769111
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | | | || ||    
T  30769257 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaatctctaagcctta 30769158  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  30769157 atcttatgtaaccctaatttctcatctaaattcaccgctttaacatg 30769111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 33701604 - 33701750
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | | |  ||    
T  33701604 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcgtta 33701703  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  33701704 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 33701750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Original strand, 22942473 - 22942598
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||    
T  22942473 atgtctaaaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtcggataagtctaatgacataatcctagtcaaaccaaactttaaaccctaat 22942572  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||    
T  22942573 tttatgcaaccctaatttctaatcta 22942598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 436
Target Start/End: Original strand, 26780661 - 26780806
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  26780661 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttggtattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaatccaagttctaagcctta 26780760  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacat 436  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  26780761 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacat 26780806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 24165365 - 24165449
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24165365 atgtctacgatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 24165449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 20802235 - 20802386
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | | | ||| |    
T  20802235 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcattgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataattctaatcaaacgaagctctaagcctta 20802334  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  20802335 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 20802386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 28621950 - 28621799
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    | | || ||    
T  28621950 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaaccctaagcctta 28621851  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  28621850 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 28621799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 5078185 - 5078039
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttg-tcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  5078185 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 5078086  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  5078085 atcttatgtaaccctaatttcttatctaagttcaccgctttaacatg 5078039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 17408707 - 17408585
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||    
T  17408707 atgtctccgatgaacgttagtgagttgactcttcttgtcttgaatttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaacccagctttaaaccctaat 17408608  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
     |||||||||| || ||||||||    
T  17408607 tttatgtaaccttaatttctaat 17408585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 15059720 - 15059805
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  15059720 atgtctacaatgaaagttggtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgggtaagtctaatgatataatcctaatcaagccaag 15059805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 35307623 - 35307474
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  35307623 atgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcctgtgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaat 35307524  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  35307523 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 35307474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31057880 - 31057735
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||    |  |||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||      
T  31057880 gtttcttgtggaacattctagtaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttg-- 31057783  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31057782 --ctgaaataataagtgacaattttttctttgaataaaagttcaccttta 31057735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 2953510 - 2953379
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  2953510 atgtctacgatgaacatgagtcagtagactcttcttgtcttgtgattgttggatgagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttgaaccctaat 2953411  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
     |||| |||  ||| |||||||||||| ||||    
T  2953410 tttatataaatctactttctaatctaatttca 2953379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 29053001 - 29052855
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | | | || ||    
T  29053001 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgttttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagtcaagctctaagcctta 29052902  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  29052901 atcatatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 29052855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31758092 - 31757954
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||    
T  31758092 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccataaaccctaat 31757993  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     |||| |||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  31757992 tttatataaatctactttctaatctaatttcaccgtttt 31757954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Original strand, 16677189 - 16677320
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||| || | ||||||||    
T  16677189 atgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgatataatccctatcaaaccaagcatcttaccctaat 16677288  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
     ||||||||  ||| |||||||| ||| ||||    
T  16677289 tttatgtaaatctattttctaatataacttca 16677320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 26842927 - 26843010
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26842927 tgtctacgatgaacattagtaagtagacttctcttgtctttgaattgttggataagtataatgacataatcctaatcaaaccaa 26843010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23626826 - 23626678
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctct-tgtcttgagattgttggataagtctaa--tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccct 389  Q
    |||||||| ||||||   || |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  23626826 atgtctacgatgaacaagagagagtagacttctccctgtcttgggaatgttggataagtctaaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaagccct 23626727  T
Q  390 aatctt-atgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  23626726 aatcttaatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 23626678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 431
Target Start/End: Original strand, 12410655 - 12410775
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaatcttatgtaaccctagttt 410  Q
    ||||||||||||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||  ||| |||    
T  12410655 agtgagtagactcttcttgtcatgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatgtaaatctacttt 12410754  T
Q  411 ctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
    ||||||||| |||| ||||||    
T  12410755 ctaatctaatttcaccgtttt 12410775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 20967580 - 20967648
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20967580 gaatttgaagatcttgtacaaaaacataaaagtggcgcgccccattatacccttttgctgcttttgctt 20967648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34223096 - 34223012
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | ||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34223096 atgtctacgatgaacatgagtgagtggactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 34223012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Original strand, 20738466 - 20738604
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  20738466 atgtctacgatgaacataagtgagtagattcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaat 20738565  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     |||  |||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  20738566 tttacataaatctactttctaatctaatttcaccgtttt 20738604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 337 - 442
Target Start/End: Original strand, 21833082 - 21833188
Alignment:
Q  337 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaaca 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  || | ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| || |||    
T  21833082 gattgttggataagtctaatgacatattcctaataaaatcaagccttaaaccccaatcttatgtaaccctagtttctaatctgaatttaccgtctttaca 21833181  T
Q  436 tgaatta 442  Q
    |||||||    
T  21833182 tgaatta 21833188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Original strand, 22170897 - 22171035
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||  | | ||||||||    
T  22170897 atgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttggaatttttggatgagtctaatgaattaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaat 22170996  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22170997 tttatgtaaatctattttctaatctaaattcaccgtttt 22171035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 20103904 - 20103767
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaa 391  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||    
T  20103904 atgtctacaatgaatgtgaatgagtagactcttcttgtattgagattgttgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaagcattgaaccctaa 20103805  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtt 429  Q
    | |||| |||   || |||||||||||| |||| ||||    
T  20103804 ttttatataaatttactttctaatctaatttcaccgtt 20103767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25122261 - 25122180
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaa 373  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25122261 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaa 25122180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25181352 - 25181271
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaa 373  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25181352 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaa 25181271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23343800 - 23343733
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23343800 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcacg-cccattatacccttttgctgtttttgctt 23343733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 271
Target Start/End: Original strand, 24166270 - 24166334
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattt 271  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24166270 tcatcttttgttcttggaaatgataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttattt 24166334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 374
Target Start/End: Original strand, 31414731 - 31414811
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaa 374  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31414731 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaa 31414811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 260
Target Start/End: Original strand, 12410450 - 12410591
Alignment:
Q  118 tggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||  |||||||    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12410450 tggtttcttgtggaacattctagtgatttatttcttagggcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagcaatcataacaattcatcttttgt 12410548  T
Q  218 tctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 260  Q
    |||  ||| | ||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  12410549 tcttggaattcaataa-tgacaattgttttctttaataaaagtt 12410591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Original strand, 15059265 - 15059324
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctg 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  15059265 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcacgccccattatacccttttgctg 15059324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Original strand, 23114371 - 23114508
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  | | ||||||||    
T  23114371 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgttttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctagaaccctaat 23114469  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||   || |||||||||||| |||| ||||||    
T  23114470 tttatgtaaatatattttctaatctaatttcatcgtttt 23114508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 172 - 261
Target Start/End: Original strand, 22170762 - 22170851
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||   | |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22170762 agactataaataaagcagctagcaatcatattcattcatcttttgttatctgaaattaatagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 22170851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23582969 - 23582881
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgaca-taatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  23582969 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacattattcctaatcaaaccaag 23582881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 415
Target Start/End: Original strand, 24166376 - 24166497
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||  |||||||||||  | | ||||||||    
T  24166376 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttaggattgttggatgagtcgaatgacctaatccctatcaaaccaagcctggaaccctaat 24166474  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
    |||||||||  ||| ||||||||    
T  24166475 cttatgtaaatctattttctaat 24166497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 23029541 - 23029418
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||  || ||||||||  | | ||||||||    
T  23029541 atgtctacaatgaacatgagtgagt-gacttct-ttgtcttgggattgttggatgactctaatgacctaatccctattaaaccaagcctagaaccctaat 23029444  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||    
T  23029443 cttatgtaaatctattttctaatcta 23029418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 23029688 - 23029591
Alignment:
Q  175 ctataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    |||||||||||| |||||||   |||| | | ||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  23029688 ctataaatagagcagctagcagacatatctattcatcttttgttcttggaaattataagtgaagattgtttctttgaataaaagttcttctttatttt 23029591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 16677090 - 16677146
Alignment:
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677090 aatcatcttttcttctctgaaattaatagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 16677146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 31758302 - 31758186
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctag-tgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| || ||||||  |||||||    ||| |||||||||||||||| |||||| || |    
T  31758302 tgacctacaagcctgtggtttcttgtgaaacattctagttttata-tttcttagggcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagttagctagcaca 31758205  T
Q  202 acaaatcatcttttgttct 220  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  31758204 acaattcatcttttgttct 31758186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 20104204 - 20104113
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataa-aagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagac-aagctgcctatttt 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||    
T  20104204 gaatttgaagatcttatacaaaaatataacaagtggcgcgccccatattacccttctgctgcttttgcttatttgacaaagctgcctatttt 20104113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 220
Target Start/End: Original strand, 31414595 - 31414641
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  31414595 actataaatagagtagctagcaatcacaacaattcatcttttgttct 31414641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 103
Target Start/End: Original strand, 20738211 - 20738251
Alignment:
Q  63 cccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctatttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  20738211 cccttttgctgcttttgcttcttcgacaagctgcctatttt 20738251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Original strand, 6406204 - 6406275
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6406204 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 6406275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21734772 - 21734701
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21734772 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 21734701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 2953773 - 2953724
Alignment:
Q  54 cccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctatttt 103  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  2953773 cccattttgcccttttgctgcttttgcttctccgacaagctgcctatttt 2953724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5078388 - 5078340
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcga 167  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  5078388 gtttcttctggaacattctagtgatataattgcttagattttaagtcga 5078340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Original strand, 23267615 - 23267680
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctag 193  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||    
T  23267615 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctag 23267680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 261
Target Start/End: Original strand, 23756722 - 23756810
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  23756722 actataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 23756810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 261
Target Start/End: Original strand, 23822178 - 23822266
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  23822178 actataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 23822266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25122175 - 25122127
Alignment:
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  25122175 taatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatg 25122127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25181266 - 25181218
Alignment:
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  25181266 taatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatg 25181218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 113)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 65 - 442
Target Start/End: Original strand, 17986440 - 17986818
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||| ||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17986440 cttttgttgcttttgcttcggaaacaagctacctgttttgaccaaaaagcctgtggtttcttgtagaacaatctattgaatagttgcttaggttttaagt 17986539  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatc-ataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-a 262  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17986540 cgatataagactttaaatagagtagctagctatcaataac-atttatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaa 17986638  T
Q  263 cctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacata 362  Q
    |||||||||||||                  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17986639 cctttattttatgttcttcttcttcttctctatgtctacaatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacata 17986738  T
Q  363 atcctaatcaaaccaagatttgaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17986739 atcctaatcaaatcaagttttaaccctaatcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcactgttttaacatgaatta 17986818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 103 - 442
Target Start/End: Original strand, 48256221 - 48256559
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||    || ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48256221 tgacctaaaagcccttggtttcttatggaacattctagtgatgtattacttaggttttaagtcgttata-gactataaatagagtagctagctattataa 48256319  T
Q  203 caaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctac 301  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                  ||||||||    
T  48256320 caattcatcttttgttct-tggaataataagtaacaattgtttctttgaataaaagttcaacctttattttatgttcttcttcttctcttctatgtctac 48256418  T
Q  302 aatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatcttatgtaa 401  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||    
T  48256419 aatgaacgttagtgagtagattcttcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctaattttatgtaa 48256518  T
Q  402 ccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |  || |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  48256519 cattaatttctaatataaattcactgttttaacatgaatta 48256559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Original strand, 41802140 - 41802351
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||||   | | |||||| |||||||  | ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41802140 cttttgctgcttttgcttcatgatctaactgcctgttttgactgaaaagtccgtggtttcttgtgaaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 41802239  T
Q  165 cgaca-taagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcac 263  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41802240 cgacaataagactataaatagagtagctagcaatcattaacattcatcttttgttctatgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcac 41802339  T
Q  264 ctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||    
T  41802340 ctttattttatg 41802351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Original strand, 28207762 - 28207972
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  28207762 cttttgctgcatttgcttcggaaacaagctacctattttgaccgaaaagcccatggtttcttgtagaacattctagtgagtagttgcttaggctttaagt 28207861  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc 264  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  28207862 cgacataagactaaaaatagagtagctagctatcataacaattcatcttttgtttttgcaaataataagtgaccattgtttatttgaataaaagttcacc 28207961  T
Q  265 tttattttatg 275  Q
    |||||||||||    
T  28207962 tttattttatg 28207972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 208 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 39286696 - 39286459
Alignment:
Q  208 catcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttca-cctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatga 306  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                  |||||||||||||    
T  39286696 catcttttgttcttggaaaaaataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaacctttattttatgttcttcttcttctcttctatgtctacaatga 39286597  T
Q  307 acgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccct-aatcttatgtaaccc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||||    
T  39286596 acgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactattaaccctaaatcttatgtaaccc 39286497  T
Q  405 tagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39286496 taatttctaatctaaattcaccgttttaaaatgaatta 39286459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 296 - 442
Target Start/End: Original strand, 17716862 - 17717008
Alignment:
Q  296 gtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatctt 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17716862 gtctacaatgaacgttagtgagtatgcttctcttgtcttgggatggttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatctt 17716961  T
Q  396 atgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17716962 atgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 17717008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19880325 - 19880148
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19880325 cttttgctgcttttgctttatggacaagctgcctattttgacctaaaaccccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggtattaagt 19880226  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaatt 241  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  19880225 cgacataagattataaataaagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaatt 19880148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 431
Target Start/End: Original strand, 20412072 - 20412502
Alignment:
Q  18 ttgaagatcttgtacaataatataa-aagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattt----------tgac 106  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  || || |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||           ||||    
T  20412072 ttgaagatcttgtgcaaaaatataacaagtggtgcgctccttt-tacccttttgctgcttctacttcaaagacaagctacctattaagtttacttatgac 20412170  T
Q  107 ctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataag------actataaatagagtagctagctatcat 200  Q
    ||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||    |||       ||||||||||||||||||||||||||     
T  20412171 ctaaatgccaatggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcattctaaagtctaaactataaatagagtagctagctatcac 20412270  T
Q  201 aacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttca-cctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtct 299  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| |||||||||||||                  ||||||    
T  20412271 aacaattcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgttttctttaataaaagatcaacctttattttatgttcttcttcttctcatctatgtct 20412370  T
Q  300 acaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatcttatgt 399  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||    
T  20412371 ataatgaacgtgagtaagtagactcttcttgtcttgagattgcgggataagtttaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaccctaattttatgt 20412470  T
Q  400 aaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20412471 aaccctaatttctaatctaaattcaccgtttt 20412502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 52755574 - 52755395
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52755574 cttttgctgcttttgcttcggagacaatctacctattttgaccgaaaagctcgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 52755475  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  52755474 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataaacattcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgt 52755395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 36850333 - 36850185
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36850333 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccctaatc 36850234  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  36850233 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcactattttaacatgaatta 36850185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Original strand, 25726816 - 25727012
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25726816 cttttgctgcttttgcttcatggacaagctgcctattttgaccga-aagcccgtagtttcttgtggaacattatagtgaatagttgcttaggttctaagt 25726914  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  25726915 cgacataagactataaatagagtagctagctatcattaacaatcattttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 25727012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Original strand, 25735224 - 25735420
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25735224 cttttgctgcttttgcttcatggacaagctgcctattttgaccga-aagcccgtagtttcttgtggaacattatagtgaatagttgcttaggttctaagt 25735322  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  25735323 cgacataagactataaatagagtagctagctatcattaacaatcattttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 25735420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 8648978 - 8649128
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  8648978 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaa 8649077  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8649078 tcttatgtaaccctaatctctaatataaattcaccgttttaacatgaatta 8649128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 26134509 - 26134359
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaa 391  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||  ||| |||    
T  26134509 atgtctacaatgaatgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagttttaaaccttaa 26134410  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26134409 tcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 26134359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 41802385 - 41802534
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||    
T  41802385 atgtctacaatgaacgttactgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaacactaat 41802484  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41802485 cttatgtaaccttagtttctaatctaaattcattgttttaacatgaatta 41802534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 103 - 275
Target Start/End: Original strand, 17716661 - 17716832
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| |||||  ||| |||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17716661 tgacctaaaagcccttggcttcttgtggaccattctagtgatgtattgcttaggttttaagttgttata-gactataaatagagtagctagctatcataa 17716759  T
Q  203 caaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17716760 caatttatcttttgttctctaaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 17716832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16365278 - 16365129
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  16365278 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttagataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaat 16365179  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16365178 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 16365129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 28207997 - 28208146
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  28207997 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttcggattcttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaat 28208096  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28208097 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcactgttttaacatgaatta 28208146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 46143519 - 46143370
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  46143519 atgtctacgatgaacatgagtgagtatacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttacaccctaat 46143420  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46143419 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 46143370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 8653864 - 8654014
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  8653864 atgtctacgatgaacatgagcgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaa 8653963  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8653964 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 8654014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 2386340 - 2386489
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||    
T  2386340 atgtctacaatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaat 2386439  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  2386440 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 2386489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 16431659 - 16431808
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  16431659 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttggaatcgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccctaat 16431758  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16431759 tttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 16431808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19875113 - 19874964
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaga-tttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  19875113 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtctttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagacttaaaccctaat 19875014  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19875013 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcactgttttaacatgaatta 19874964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 25727062 - 25727211
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  25727062 atgtctactatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacccctaat 25727161  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25727162 tttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 25727211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 25735470 - 25735619
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  25735470 atgtctactatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaacccctaat 25735569  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25735570 tttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 25735619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 49379622 - 49379473
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  49379622 atgtctacgatgaacaagagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagcttttaaccctaat 49379523  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49379522 cttatgtaatcctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 49379473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 3985369 - 3985512
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  3985369 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 3985468  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  3985469 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 3985512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 3990648 - 3990791
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  3990648 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 3990747  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  3990748 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 3990791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19875355 - 19875237
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  19875355 cttttgctgcttttgcttcatggacaagctgcctattttgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagggaatagattcttaggttttaagt 19875256  T
Q  165 cgacataagactataaata 183  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19875255 cgacataagactataaata 19875237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22660034 - 22659884
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  22660034 atgtctacgatgaacataagtgagtagacttcccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcataatcaaaccaagctattgaccctaa 22659935  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22659934 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 22659884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 295 - 442
Target Start/End: Original strand, 13250849 - 13250997
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  13250849 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 13250948  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  13250949 ttatgtaaccgtaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 13250997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 41461838 - 41461986
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41461838 atgtctacgatgaacatgagtgagtatacttctcttgtcttgggtttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccctaatc 41461937  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||| |||||||    
T  41461938 ttatgtaacccgaatttctaatctaaattcactattttaacttgaatta 41461986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 16485390 - 16485533
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  16485390 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 16485489  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  16485490 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 16485533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 27047551 - 27047694
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  27047551 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 27047650  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  27047651 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 27047694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 27911306 - 27911163
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  27911306 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 27911207  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  27911206 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 27911163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 38045448 - 38045591
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  38045448 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 38045547  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  38045548 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 38045591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 4028417 - 4028567
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  4028417 atgtctacgatgaacatgagcgagtagacttctcttgtcttgggattgctggataagtcttaatgacataatcctaatcaaactaagctattgaccctaa 4028516  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4028517 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 4028567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 44538346 - 44538496
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaa 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||||  |||  ||| |||    
T  44538346 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggatacgagtaaatgacataattctaatcaaaccaaactttaaaccttaa 44538445  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44538446 tcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 44538496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 260
Target Start/End: Original strand, 19364534 - 19364730
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | ||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19364534 cttttgctgcttttgcttcagaaacaagctacctgttttgaccaaaaagctcgtggtttcttgtagaacattctattgaatagttgcttaggttttaagt 19364633  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatc-ataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 260  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | ||||||||||    
T  19364634 cgatataagactataaatagagtagttagctatcaataac-attcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagtt 19364730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 296 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 28206335 - 28206186
Alignment:
Q  296 gtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||    
T  28206335 gtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 28206236  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  28206235 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccactttaacatgaatta 28206186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 27041797 - 27041940
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| |||||    
T  27041797 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagctttaaaccttaatc 27041896  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  27041897 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 27041940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13799631 - 13799464
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    ||| |||||||||||||||||||||   || |    
T  13799631 tgacctaaaagcccatggtttcttgtggaacattctagtgatatattt-cttaggtcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagcagacaca 13799534  T
Q  202 acaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13799533 acaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttatttgaataaaagttcatctttattt 13799464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19880070 - 19879922
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  ||||||||    
T  19880070 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcc-aatcaaaccaagccttaaaccctaat 19879972  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19879971 cttacgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttgtaacatgaatta 19879922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21792323 - 21792172
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   || | ||| |    
T  21792323 atgtctacaatgaacgttagagagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctta 21792224  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21792223 atattatgtaaccctagtttctcttctaaattcaacgttttaacatggatta 21792172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8953470 - 8953320
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||     
T  8953470 atgtctacgatgaacatgagtgagtaaacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcataatcaaaccaagctattgaccctag 8953371  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8953370 tcttatgtaactctaatctctaatctaaattcactgttttaacatgaatta 8953320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19772179 - 19772030
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  19772179 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtcgtataagtctaatgacataatcctaatcaaacaaagctttaaaccctaat 19772080  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19772079 cttatataaccctaatttctaatctaaattcaccgtttcaacatgaatta 19772030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 328 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12060440 - 12060326
Alignment:
Q  328 ttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacg 427  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12060440 ttgttttgggattgttggataagtctaatgacataatcttaatccaaccaagctttaactctaatattatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccg 12060341  T
Q  428 ttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||    
T  12060340 ttttaacatgaatta 12060326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 18816469 - 18816618
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaga-tttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  ||| ||||    
T  18816469 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagacttaaaccttaat 18816568  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18816569 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 18816618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Original strand, 2386155 - 2386295
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||| |    
T  2386155 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctcgg 2386250  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2386251 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagtttaccttta 2386295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28206518 - 28206378
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||| |    
T  28206518 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctcag 28206423  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28206422 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaaattcaccttta 28206378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 44538074 - 44538321
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||           |||| | ||||       
T  44538074 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgccccattatactcttttgctgcttttgct---taga-----------ttttaagctactct 44538159  T
Q  114 cctgtggtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatct 212  Q
      | | |||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||  |||| || |  ||||||    
T  44538160 attttagtttattgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagtcatcacaatat-tcatct 44538258  T
Q  213 tttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44538259 tttgttctcaaaaatattaagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 44538321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19788259 - 19788110
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | | ||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  19788259 atgtctacgatgaacatgactgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatatgtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccctaat 19788160  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  19788159 tttatataaccctaatttgtaatctaaattcactgtttcaacatgaatta 19788110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28764094 - 28763939
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattt-tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaag 163  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||    
T  28764094 cttttgctgcttctgcttgaaagacaagctacctatttctgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattatagtgatgtattgcttaggttttaag 28763995  T
Q  164 tcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    |||  |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28763994 tcgttatat-actataaatagagtagttagctatcataacaatccatcttttgttct 28763939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 340 - 442
Target Start/End: Original strand, 19364789 - 19364892
Alignment:
Q  340 tgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatga 438  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19364789 tgttggataagtctattgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttgtgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatga 19364888  T
Q  439 atta 442  Q
    ||||    
T  19364889 atta 19364892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21784197 - 21784046
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcct-aatcaaacc-aagatttgacccta 390  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||  ||  ||  ||    
T  21784197 atgtctacaatgaacgttaatgagtagacttttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaacttta 21784098  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21784097 atattatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 21784046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21798131 - 21797980
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  21798131 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 21798032  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  21798031 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 21797980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21804839 - 21804688
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  21804839 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 21804740  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  21804739 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 21804688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 20231616 - 20231762
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  20231616 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcattgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 20231715  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  20231716 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 20231762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18885379 - 18885230
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga--cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  || ||    
T  18885379 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct--tgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagcttttaaacctta 18885282  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||| |||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18885281 atcctatgtaaccctaatctataatctaaattcaccgctttaacatgaatta 18885230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 175 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21792458 - 21792365
Alignment:
Q  175 ctataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21792458 ctataaatagagtagctagccatgacaaatattcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 21792365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17094068 - 17093917
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  17094068 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccgta 17093969  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  17093968 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 17093917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17101904 - 17101753
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  17101904 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagccgta 17101805  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  17101804 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 17101753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 20399713 - 20399864
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  20399713 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 20399812  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  20399813 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 20399864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 22841811 - 22841962
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  22841811 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 22841910  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  22841911 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 22841962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 13799413 - 13799276
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||    
T  13799413 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-ttgtctttggattgttggatgagtctaatgacctaatcctgatcaaaccaagcatcgaaccctaat 13799315  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  13799314 tttatgtaaatctaatttctaatctaatttcaccgtttt 13799276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19599899 - 19599753
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | | | || ||    
T  19599899 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagcaaagctctaagcctta 19599800  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  19599799 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 19599753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 20393691 - 20393837
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  20393691 atgtctacgatgaacatgagtgcgtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgagataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 20393790  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  20393791 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 20393837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21784327 - 21784239
Alignment:
Q  180 aatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    ||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21784327 aatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctaaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 21784239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26134688 - 26134534
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    ||||||||| |||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    |  ||||||||||||||| |||  |||  ||  | |||||||||||||    
T  26134688 tttcttgtgtaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaatctataaatagagtagttagtcatctcaaatattcatcttttgttc 26134589  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26134588 tctgaaataataagtgacaattgttt-tttgaataaaagttcacctttattttatg 26134534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 52236015 - 52235913
Alignment:
Q  118 tggtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52236015 tggtttcttgtggaacattctagtgatgtattagcttaggttttaagtcgttata-gactataaatagagtagctagctatcataacaattcatcttttg 52235917  T
Q  217 ttct 220  Q
    ||||    
T  52235916 ttct 52235913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 316 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 52755302 - 52755199
Alignment:
Q  316 agtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaatcttatgtaaccctagtttctaa 414  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  52755302 agtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaacccctaactttatgtaaccctaatttctaa 52755203  T
Q  415 tcta 418  Q
    ||||    
T  52755202 tcta 52755199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 20238182 - 20238328
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgacccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |   || ||    
T  20238182 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcattgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaaaccaagctctatgcctta 20238281  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  20238282 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 20238328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Original strand, 16431477 - 16431593
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16431477 tgacctaaaagccattggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgatata-gactataaatagagtagctagctatcacaa 16431575  T
Q  203 caaatcatcttttgttct 220  Q
    ||  |||| |||||||||    
T  16431576 catttcatattttgttct 16431593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 2395270 - 2395124
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  2395270 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggacaagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 2395171  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| ||||||||    
T  2395170 atcttatgtaaccctaatttcttatctggattcaccgtcttaacatg 2395124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23501778 - 23501632
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  23501778 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 23501679  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| ||||||  || ||||||||    
T  23501678 atcttatgtaactctaatttcttatctgaattcactgtcttaacatg 23501632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 41309474 - 41309335
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      | ||||    
T  41309474 atgtctacgatgaacatgagtgagtagatttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaag------ctctaa 41309381  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| |||||| || || ||||||    
T  41309380 tcttatgtaaccttaatttcttatctgaattcaccgcttaaacatg 41309335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12059755 - 12059671
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  12059755 atgtctacaatgaacattagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctgatcataatcaaaccaa 12059671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 30819041 - 30818951
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga 385  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  30819041 atgtctacaatggacgtgggtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagatttga 30818951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Original strand, 22411221 - 22411359
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaacc-aagatttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |  |||||| |    
T  22411221 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttggaattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaaaccataaaccctagt 22411320  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     |||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  22411321 tttatataaacctactttctaatctaatttcaacgtttt 22411359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 16384929 - 16384805
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  | | ||||||||    
T  16384929 atgtctacaatgaacatgagtgagcagacttct-ttctcttgggattgttggatgagtctaatgacataatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaat 16384831  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||    
T  16384830 tttatgtaaatctattttctaatcta 16384805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 275
Target Start/End: Original strand, 8648876 - 8648944
Alignment:
Q  208 catcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatg 275  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8648876 catcttttgttcttgaaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaacctttattttatg 8648944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 52169104 - 52169188
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | | |||||| |||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52169104 atgtctacgatgaacatgattgagtaaactcttcttgtcttgggattgttgcataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 52169188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 16148424 - 16148286
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||| |||||| ||| | |||||||| |||  |||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  16148424 atgtgtacaattaacatgagtgagtaaactcttcttgtctttgaattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaat 16148325  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  16148324 tttatgtaaatctactttctaatctaatttcaccgtttt 16148286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16385030 - 16384968
Alignment:
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttt 267  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16385030 aatcgtcttttgttctttgaaattataagtgacaattgtttctttgaataaaagttctccttt 16384968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25405054 - 25404969
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25405054 atgtctacaatgaacatgagtgagtaaactctttttgtcttgggattgatgtataagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaag 25404969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25405159 - 25405094
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  25405159 tcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttcttttaataaaagttcttctttatttt 25405094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Original strand, 26194349 - 26194473
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||   | | ||||||||    
T  26194349 atgtctacaattaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaaacctcgaaccctaat 26194447  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||    
T  26194448 tttatgtaaatctattttctaatcta 26194473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20860860 - 20860757
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgttt-ctttgaataaaagttcacctttatt 270  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||   |||||||| |||||||  ||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  20860860 agactataaatagagcagctagcaaacatatacaatcatctcttgttcttggaaattaatagtgacaattgtttcctttgaataaaagttcatctttatt 20860761  T
Q  271 ttat 274  Q
    ||||    
T  20860760 ttat 20860757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 267
Target Start/End: Original strand, 23298867 - 23298962
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttt 267  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||||| |||||| |  || || |||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23298867 agactataaatagagtagctagcaaacatattgaatcatcttttgttctttgaaattaatagcgagaattatttctttgaataaaagttctccttt 23298962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30819122 - 30819068
Alignment:
Q  214 ttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30819122 ttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatcttta 30819068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20899507 - 20899426
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaat 253  Q
    |||||||||||||| |||||||  | ||||   | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20899507 agactataaatagaatagctagaaaacatattcattcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaat 20899426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 328 - 419
Target Start/End: Original strand, 2130095 - 2130186
Alignment:
Q  328 ttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaa 419  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  | | ||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  2130095 ttgtcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctagaaccctaatcttatttaaatctattttctaatctaa 2130186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 261
Target Start/End: Original strand, 22411012 - 22411164
Alignment:
Q  111 aagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatca 209  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||    
T  22411012 aagcccgtagtttcttatggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattca 22411111  T
Q  210 tcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||  ||| | |||||| ||||||||| | | | |||||||||||    
T  22411112 tcttttgttcttggaattcaataagagacaattgtctttcttaataaaagttc 22411164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 28763851 - 28763719
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaa 391  Q
    |||| ||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  28763851 atgtttacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtagggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaagccttgaaccctaa 28763752  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
    | |||| |||   || |||||||||||| ||||    
T  28763751 ttttatataaatatactttctaatctaatttca 28763719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19788459 - 19788316
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||  |||| ||  ||||||||||| ||    
T  19788459 gtttcttgaggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagtcatcacaaataatcatcttttatt 19788360  T
Q  219 ctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  19788359 cttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 19788316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 52235850 - 52235791
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct 353  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  52235850 atgtctacgatgaacataagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtct 52235791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 8648674 - 8648743
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataa-aagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttc 83  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8648674 gaatttgaagatcttgtgcaaaaatataacaagtggcgcgacccttt-tacccttttgctgcttttgcttc 8648743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 15346823 - 15346698
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |   || |||||    
T  15346823 atgtctacaatgaacatgagtaagtagacttct-ttatcttgggattgttagatgagtctaatgacctaatcttattcaaagcaagcctaaaactctaat 15346725  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaa 419  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||    
T  15346724 tttatgtaaccctattttctaatctaa 15346698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 16354211 - 16354269
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaat 370  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16354211 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcttaat 16354269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Original strand, 23299002 - 23299128
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaa 391  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | |||||||||  | | |||||||    
T  23299002 atgtctacaatgaacatgagtgattcgactcttctttgtcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatccctaccaaaccaagcctggaaccctaa 23299101  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
    | ||||||||  ||| |||||||||||    
T  23299102 ttttatgtaaatctattttctaatcta 23299128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 52235793 - 52235743
Alignment:
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52235793 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 52235743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 24680257 - 24680340
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||| ||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24680257 atgtttacgatgaacatgagtgagtaaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacataat-cttatcaaaccaag 24680340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 442
Target Start/End: Original strand, 41224628 - 41224681
Alignment:
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  41224628 taatcttatataaccctaatttctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 41224681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 431
Target Start/End: Original strand, 15421231 - 15421349
Alignment:
Q  313 gtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaatcttatgtaaccctagtttc 411  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||| |||  | | ||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  15421231 gtgagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatgaaactaagcctagaaccctaatcttatttaaatctattttc 15421329  T
Q  412 taatctaaattcaacgtttt 431  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  15421330 taatctaatttcatcgtttt 15421349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 352 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22635637 - 22635546
Alignment:
Q  352 ctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgacc-ctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  || | | ||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22635637 ctaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaactctaattttatgtaaccctaatttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 22635546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 274
Target Start/End: Original strand, 26194221 - 26194324
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtt-tctttgaataaaagttcacctttatt 270  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | ||||   ||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||    
T  26194221 agactataaatagagcaactagcaaacatattgaatcatcttttgttcttggaaattaatagtgacaattgttatctttgaataaaagctctcatttatt 26194320  T
Q  271 ttat 274  Q
    ||||    
T  26194321 ttat 26194324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 36850529 - 36850390
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctct 222  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||      ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||||      
T  36850529 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtcaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttg 36850430  T
Q  223 gaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  36850429 gaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 36850390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 49379818 - 49379679
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctct 222  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| || ||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||||      
T  49379818 cttgtgaaacattctagtgatataattacttagattctaagtcgaatgtagactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttg 49379719  T
Q  223 gaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  49379718 gaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 49379679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 260
Target Start/End: Original strand, 41461638 - 41461780
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||  | ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||    
T  41461638 gtttcttgtggaacattctagtaatataattgcttagaatctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttatt 41461737  T
Q  219 ctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 260  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||| | | | ||||||||||    
T  41461738 cttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagtt 41461780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 21924774 - 21924858
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||  |||||| | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21924774 atgtctatgatgaacatgagtgagtagtctttt-ttgtcttgggattgttagatgagtctaatgacttaatcctattcaaaccaag 21924858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25646457 - 25646377
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  25646457 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatca 25646377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27911485 - 27911414
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27911485 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 27911414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16148527 - 16148474
Alignment:
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattg-tttctttgaataaaa 257  Q
    ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16148527 aatcatcttttgttctctgaatttaatagtgacaattgttttctttgaataaaa 16148474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 183; Significance: 8e-99; HSPs: 200)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Original strand, 6236731 - 6236941
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6236731 cttttgctgcttttgcttcatggacaagctgcctattttgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctactgaatagttgcttaggttttaagt 6236830  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc 264  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6236831 cgacataagactataaataaagtatctagctatcacaacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc 6236930  T
Q  265 tttattttatg 275  Q
    |||||||||||    
T  6236931 tttattttatg 6236941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 120 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 34053767 - 34053439
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  34053767 gtttcttgtggaacattctagtgattagttgcttagattttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttctgttc 34053668  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatg---nnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtg 315  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||    
T  34053667 ttggaaataataagtgacaattgtttctttgaatcaaagttcaacctttattttatgttcttcttcttcttcttctctatgtctacaatgaacgttagtg 34053568  T
Q  316 agtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccct-aatcttatgtaaccctagtttcta 413  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  34053567 agtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctattaaccctaaatcttatgtaaccctaatctcta 34053468  T
Q  414 atctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34053467 atctaaattcaccgttttaacatgaatta 34053439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 19567277 - 19567029
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19567277 gaattcgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgcctcattatacccttttgctgcttttgcttcggagacaagctacctattttgacctaaaag 19567178  T
Q  114 cctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctt 213  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19567177 cccatggtttcttgtggaacattctagtgaatacttgcttagattttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaattcatctt 19567078  T
Q  214 ttgttctctgaaat--aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    || |||| ||||||  |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  19567077 ttattct-tgaaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 19567029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 442
Target Start/End: Original strand, 11398701 - 11399142
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatac-ccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattt---------t 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||| |||| | ||  |||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||          |    
T  11398701 gaatttgaagatcttgtacaaatatatacaagaggcgcgccccactttagtccttttgctgcttttgctttctggacaagctacctattagtttatttct 11398800  T
Q  104 gacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataac 203  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  11398801 gacctaaaagcccttggtttcttgtggaacattctagtaatgtattgtttaggttttaagtcggtata-gactataaataaagtagctagctatcacaac 11398899  T
Q  204 aaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnn---atgtcta 300  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||    
T  11398900 aattcatcttttgttcttggaaataataagggacaaatgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgttcttcttcttcttctcttctatgtcta 11398999  T
Q  301 caatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgt 399  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  11399000 caatgaatgttagtgagtagactcttcttgtgttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttatgt 11399099  T
Q  400 aaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11399100 aaccctagtttctaatctaaatttaccgttttaacatgaatta 11399142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14494980 - 14494652
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  14494980 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 14494881  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnn---atgtctacaatgaacgttagtga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||    
T  14494880 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgttcttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttagtga 14494781  T
Q  317 gtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgtaaccctagtttcta 413  Q
     ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  14494780 ctagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctcta 14494681  T
Q  414 atctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14494680 atctaaattcaccgctttaacatgaatta 14494652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 174 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14976410 - 14976136
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttta 273  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14976410 actataaatatagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttta 14976311  T
Q  274 tgnnnnnnnnnnnnnnnnnn---atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatccta 368  Q
    ||                     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14976310 tgttcttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatccta 14976211  T
Q  369 atcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14976210 atcaaaccaagctttaaaccttaatattatgtaaccctaatctctaatctaaattcatcgctttaacatgaatta 14976136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 272
Target Start/End: Original strand, 2721801 - 2722010
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||||||||||||| |||||   | | |||||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2721801 cttttgctgcttttgtttcatgatccaactgcctgttttgatcgaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 2721900  T
Q  165 cgaca-taagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-a 262  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2721901 cgacaataagactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaa 2722000  T
Q  263 cctttatttt 272  Q
    ||||||||||    
T  2722001 cctttatttt 2722010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14071691 - 14071543
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14071691 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccctaatc 14071592  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14071591 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 14071543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25765812 - 25765662
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagact--tctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaa 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  25765812 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaa 25765713  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25765712 tcttatgtaaccgtagtttcgaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 25765662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 121 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14660948 - 14660685
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacata-agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||  ||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  14660948 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcggaatctaaactataaatagagtagctagccatcacaaagattcatcttttgtt 14660849  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnn---atgtctacaatgaacgttagtg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||    
T  14660848 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaattttacctttattttatgttcttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttagtg 14660749  T
Q  316 agtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14660748 agtagacttctcttgtcttgggatttttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 14660685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 25055131 - 25055280
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  25055131 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttttcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaat 25055230  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25055231 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcatcgttttaacatgaatta 25055280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 2722048 - 2722196
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  2722048 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctattgacataatcctaatcaaaccaagcttgaaccctaatc 2722147  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2722148 ttatgcaaccttaatttctaatctaaattcactgttttaacatgaatta 2722196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 47974938 - 47975088
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagact--tctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaa 391  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||    
T  47974938 atgtttacaacgaacgttagtgagtagactcttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaaccaagctttaaccataa 47975037  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47975038 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 47975088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 294 - 439
Target Start/End: Original strand, 36076308 - 36076454
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  36076308 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtttaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaat 36076407  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaa 439  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36076408 tttatgtagccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaa 36076454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 43842041 - 43841892
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  43842041 atgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 43841942  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43841941 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 43841892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 3279949 - 3280097
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||| ||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3279949 atgtttacgatgaacatgagtgcgtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatc 3280048  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  3280049 ttatgtaaccctagtttctaatctaaactcaccattttaacatgaatta 3280097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 17480583 - 17480732
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  17480583 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtccaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaat 17480682  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17480683 cttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 17480732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19566972 - 19566823
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  19566972 atgtctacgatgaacatgagtgggtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaattacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaat 19566873  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19566872 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 19566823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 53354779 - 53354635
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  53354779 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 53354680  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  53354679 cttatgtaaccctaatttcttatctaaaatcaccgctttaacatg 53354635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 24696969 - 24697112
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  24696969 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 24697068  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  24697069 ttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 24697112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 15429967 - 15430116
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  15429967 atgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 15430066  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  15430067 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 15430116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 17388590 - 17388739
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  17388590 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctattaaccctaat 17388689  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17388690 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 17388739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 2006065 - 2006213
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2006065 atgtttacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataatcaaaccaagctttaaccctaatc 2006164  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||    
T  2006165 tcatgtaaccctagtttctaatataaattcaccgtcttaacataaatta 2006213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 2781358 - 2781501
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  2781358 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 2781457  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  2781458 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 2781501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3338723 - 3338580
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  3338723 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 3338624  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  3338623 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 3338580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 4768990 - 4768847
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  4768990 tgtctacgatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 4768891  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  4768890 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 4768847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 6710156 - 6710299
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  6710156 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 6710255  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  6710256 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 6710299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 6809777 - 6809920
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  6809777 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 6809876  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  6809877 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 6809920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 6815599 - 6815742
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  6815599 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 6815698  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  6815699 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 6815742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 15854319 - 15854462
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  15854319 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 15854418  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  15854419 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 15854462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16385431 - 16385288
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  16385431 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 16385332  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  16385331 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 16385288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 295 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 15425144 - 15425002
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  15425144 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 15425045  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacat 436  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  15425044 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 15425002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14348056 - 14347907
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||    
T  14348056 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagtcttaaaccctaat 14347957  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  14347956 tttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaaaataaatta 14347907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 298 - 442
Target Start/End: Original strand, 5687798 - 5687942
Alignment:
Q  298 ctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatcttat 397  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||||||||    
T  5687798 ctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataattctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaagcccaatcttat 5687897  T
Q  398 gtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5687898 gtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 5687942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 13605154 - 13605302
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||     
T  13605154 atgtctacaatgaacgttagcgagtagactctccttgtcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaacctaatt 13605253  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13605254 ttatgtaaccctaatttctaatcgaaattcaccgttttaacatgaatta 13605302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 16034189 - 16034336
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  16034189 atgtctataatgaacgtttgtgagtggacttctcctgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaacaaaattttaaccctaatc 16034288  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||    
T  16034289 ttatgtaaccctaatttctaatc-aaattcaccgttttaacaagaatta 16034336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 174 - 379
Target Start/End: Original strand, 17041712 - 17041918
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttca-cctttatttt 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||||||    
T  17041712 actataaatagagtagctagctatcactacaattcatcttttgttcttcgaaataataagtgacaattgttttctttaataaaagatcaacctttatttt 17041811  T
Q  273 atgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatca 372  Q
    |||                  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17041812 atgttcttcttcttcttctctatgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatca 17041911  T
Q  373 aaccaag 379  Q
    |||||||    
T  17041912 aaccaag 17041918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 4365959 - 4366102
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||    
T  4365959 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccctaatc 4366058  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||    
T  4366059 ttatgtaaccctaattcgttatctaaattcaccgctttaacatg 4366102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 4383488 - 4383631
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||    
T  4383488 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccctaatc 4383587  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||    
T  4383588 ttatgtaaccctaattcgttatctaaattcaccgctttaacatg 4383631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 4830165 - 4830308
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  4830165 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 4830264  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  4830265 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 4830308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 16334177 - 16334320
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  16334177 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataaccctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 16334276  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  16334277 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 16334320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22164696 - 22164553
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  22164696 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 22164597  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  22164596 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 22164553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22170000 - 22169857
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  22170000 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 22169901  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  22169900 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 22169857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 41473035 - 41473178
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  41473035 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 41473134  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  41473135 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 41473178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 5226472 - 5226328
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  5226472 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 5226373  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||    
T  5226372 cttatgtaaccttaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 5226328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 12246916 - 12247059
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  12246916 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctctggtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 12247015  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  12247016 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 12247059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 303 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 13093932 - 13093797
Alignment:
Q  303 atgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaa 401  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  13093932 atgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaa 13093833  T
Q  402 ccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  13093832 ccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 13093797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14867038 - 14866895
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  14867038 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggatttttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 14866939  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  14866938 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 14866895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 261
Target Start/End: Original strand, 17388343 - 17388533
Alignment:
Q  72 tgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacata 171  Q
    ||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17388343 tgcttttgcttcggaaacaagctacctattttgaccaaaaagtttgtggtttcttgtagaacattctattgaatagttgcttaggttttaagtcgatata 17388442  T
Q  172 agactataaatagagtagctagctatc-ataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  17388443 agactataaatagagtagctagctatcaataac-attcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 17388533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21265057 - 21264907
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  21265057 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttggaattgttggataagcctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 21264958  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21264957 tcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 21264907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 103 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 42244728 - 42244560
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    ||| |||||||||||||||||||||   || |    
T  42244728 tgacctaaaagcccatggtttcttgtggaacattctagtgatatattt-cttaggtcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagcagccaca 42244631  T
Q  202 acaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  42244630 acaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttatttgaataaaagttcatctttatttt 42244560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14137708 - 14137560
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || |||||    
T  14137708 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgtataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaactctaat 14137609  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  14137608 -ttatgtaaccctagtttctaatttaaattcaccattttaacatgaatta 14137560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 261
Target Start/End: Original strand, 2005821 - 2006009
Alignment:
Q  75 ttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgaca-taag 173  Q
    |||||||||||   | |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2005821 ttttgcttcatgatctagctgcctgttttgaccgaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacagtaag 2005920  T
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||  ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  2005921 actataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttcattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 2006009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 6829639 - 6829496
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  6829639 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacacaatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 6829540  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    || |||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||    
T  6829539 ttgtgtaaccctaatttcttatctaaattcactgctttaacatg 6829496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 9360457 - 9360314
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||||    
T  9360457 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaactttaatc 9360358  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||  ||||||||    
T  9360357 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgccttaacatg 9360314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 9365974 - 9365831
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  9365974 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttgtataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 9365875  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| ||  ||||||||    
T  9365874 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgccttaacatg 9365831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 13087633 - 13087776
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  13087633 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 13087732  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||| ||||||| || |||||||||    
T  13087733 ttatgtaaccctaattccttatccaaattcaccgctttaacatg 13087776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 43496311 - 43496456
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaa 391  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  |||    
T  43496311 atgtctacaatgaacgttagtaagcagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaa 43496410  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  43496411 tcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccactttaacatg 43496456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 13098423 - 13098566
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||    
T  13098423 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatc 13098522  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||| |||| || || ||| ||||||| || |||||||||    
T  13098523 ttatgtaaacctaattccttatccaaattcaccgctttaacatg 13098566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19656078 - 19655927
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   || | ||| |    
T  19656078 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctta 19655979  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||    
T  19655978 atcttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccattttaacatggatta 19655927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 20556172 - 20556314
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  20556172 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagact-ctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 20556270  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
     |||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  20556271 ctatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 20556314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 11948112 - 11948258
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  11948112 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 11948211  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11948212 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatg 11948258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14071945 - 14071748
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||   ||| |||||||| | |||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14071945 cttttgctgcttttgcttcgaaaacaagtaacctgttttgaccaaaaagcatgtggtttcttgtagaatattctattgaatagtttcttaggttttaagt 14071846  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatc-ataacaaatcatcttttgttctctgaaa-taataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  14071845 cgatataagactataaatagagtagttagctatcaataac-attcatcttttattcttggaaattaataagtgacaattgtctttattaataaaagttc 14071748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 15944643 - 15944789
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  15944643 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 15944742  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15944743 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatg 15944789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 15947314 - 15947460
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  15947314 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 15947413  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15947414 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatg 15947460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 20150624 - 20150774
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || | ||| ||    
T  20150624 atgtctacgatgaacgttagtgagtagacttctcttatcttgggatcgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaaccttaaaccttaa 20150723  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20150724 tattatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 20150774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 4651418 - 4651563
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||    
T  4651418 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaa 4651517  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  4651518 tcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 4651563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12776020 - 12775875
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||    
T  12776020 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaa 12775921  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  12775920 tcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 12775875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16377754 - 16377610
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | | || ||||    
T  16377754 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaat 16377655  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  16377654 cttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 16377610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 37978285 - 37978134
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |    
T  37978285 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctttaaacctta 37978186  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37978185 atctcatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 37978134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3245054 - 3244912
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaa 391  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | || |||    
T  3245054 atgtctacaatgaacgttagtaagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtgtaattgacataatcctaatcaagccaagctttaagccttaa 3244955  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaac 434  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  3244954 tcttatgtaaccctaatttctaatataaattcaccgctttaac 3244912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 11940335 - 11940481
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  11940335 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 11940434  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11940435 atcttatgtaaacctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatg 11940481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 20155078 - 20155221
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaat 392  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||      ||| ||||    
T  20155078 atgtctacgatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggatcgttggataagtctaaatgacataatcctattcaaaccaa------accttaat 20155171  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  20155172 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaagatggatta 20155221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 7785952 - 7785803
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  7785952 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 7785853  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaat 440  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  7785852 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatgaat 7785803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 10249024 - 10249168
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | | || ||||    
T  10249024 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttatcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaat 10249123  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10249124 cttatgtaaccataatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 10249168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 16705728 - 16705879
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  16705728 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 16705827  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  16705828 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 16705879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 37935281 - 37935432
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  37935281 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 37935380  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  37935381 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 37935432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 37943126 - 37943277
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  37943126 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 37943225  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  37943226 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 37943277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 172 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8685959 - 8685857
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8685959 agactataaatagagtagctagaaaacatattgaatcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattt 8685860  T
Q  272 tat 274  Q
    |||    
T  8685859 tat 8685857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 8991526 - 8991672
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | | || ||    
T  8991526 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 8991625  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  8991626 atcttatgtaatcctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 8991672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 13000870 - 13000724
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  13000870 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 13000771  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  13000770 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 13000724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15952128 - 15951982
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  15952128 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 15952029  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  15952028 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 15951982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 20154148 - 20154294
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | |||||    
T  20154148 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgtcggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcccta 20154247  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  20154248 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 20154294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 20156004 - 20155862
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| | ||| |    
T  20156004 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgagatttttggataagtctaaatgacgtaatcctaatcaagccaagctttaagcctta 20155905  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaa 433  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  20155904 atcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgctttaa 20155862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 10601947 - 10601802
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | | || ||||    
T  10601947 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaat 10601848  T
Q  393 cttatgtaa-ccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  10601847 cttatgtaacccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 10601802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14445224 - 14445075
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  14445224 atgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaat 14445125  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14445124 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 14445075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14457271 - 14457122
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  14457271 atgtctacgatgaacatgagtgagtaaacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaat 14457172  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14457171 attatgtaaccttagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 14457122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19656268 - 19656120
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||    |  |||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  19656268 gtttcttgtggaacattctagtaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgtt 19656169  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19656168 ctcggaaataataagtgacaattg-ttctttgaataaaagttcaccttta 19656120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 435
Target Start/End: Original strand, 15639171 - 15639315
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  15639171 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 15639270  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaaca 435  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||    
T  15639271 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaaca 15639315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 435
Target Start/End: Original strand, 15645747 - 15645891
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  15645747 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 15645846  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaaca 435  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||    
T  15645847 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaaca 15645891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 7601102 - 7601253
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  7601102 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 7601201  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  7601202 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 7601253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 10159656 - 10159505
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  10159656 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 10159557  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  10159556 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 10159505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 10166317 - 10166166
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  10166317 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 10166218  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  10166217 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 10166166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11880470 - 11880319
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  11880470 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 11880371  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  11880370 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 11880319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13186900 - 13186749
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  13186900 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 13186801  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  13186800 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 13186749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13193531 - 13193380
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  13193531 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 13193432  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  13193431 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 13193380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 14815737 - 14815888
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  14815737 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 14815836  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  14815837 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 14815888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15556409 - 15556258
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  15556409 atgtctacgatgaacataagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 15556310  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  15556309 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 15556258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 15564260 - 15564109
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  15564260 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 15564161  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  15564160 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 15564109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16373037 - 16372886
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaag-atttgacccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |  ||| ||    
T  16373037 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaaacctta 16372938  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  16372937 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 16372886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18214318 - 18214167
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  18214318 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 18214219  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  18214218 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 18214167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 10559819 - 10559673
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  10559819 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 10559720  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  10559719 atcttatgtaaccctaattgcttatctaaattcaccgctttaacatg 10559673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 13135701 - 13135555
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | | || ||    
T  13135701 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagcctta 13135602  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  13135601 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 13135555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 13142309 - 13142163
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | | || ||    
T  13142309 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagcctta 13142210  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  13142209 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 13142163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 13665218 - 13665364
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | | | ||| |    
T  13665218 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatactaatcaagccaagctctaagcctta 13665317  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  13665318 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 13665364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15573396 - 15573250
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  15573396 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 15573297  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  15573296 atcttatgtaaccctaacttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 15573250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 17733222 - 17733076
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  17733222 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataattctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 17733123  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  17733122 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 17733076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Original strand, 22038957 - 22039095
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  22038957 atgtctacaatgaacgtgggtgagtggactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaat 22039056  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  22039057 tttatgtaaatctattttctaatctaatttcaccgtttt 22039095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 30026840 - 30026694
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  30026840 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 30026741  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| || |||||||||    
T  30026740 atcttatgtaaccctaatctcttatctgaattcaccgctttaacatg 30026694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 42244524 - 42244387
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  | | ||||||||    
T  42244524 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctgatcaaaccaagcctcgaaccctaat 42244426  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||   || |||||||||||| |||| ||||||    
T  42244425 tttatgtaaatttaatttctaatctaatttcaccgtttt 42244387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 50908893 - 50908747
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  50908893 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 50908794  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  50908793 atcttatgtaactctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 50908747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 53160517 - 53160371
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  53160517 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 53160418  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  53160417 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 53160371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 379
Target Start/End: Original strand, 17050722 - 17050931
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttca-cctttatttt 272  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||  || |||||||| ||| ||||||||||    
T  17050722 actataaatagagtagttagctatcacaacaattcatcttttgttcttggaaataataagtggcaattgttttctttaataaaagatcaacctttatttt 17050821  T
Q  273 atgnnnnnnnnnnnnnnnnnn---atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaa 369  Q
    |||                     ||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17050822 atgttcttcttcttcttcttctctatgtctacaatgaacgtgagtgagtagactctttttgttttgggattgttggataaatctaatgacataatcctaa 17050921  T
Q  370 tcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||    
T  17050922 tcaaaccaag 17050931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 162
Target Start/End: Original strand, 27880080 - 27880177
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaa 162  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  27880080 cttttgctgcttttccttcatgtacaggctgcctattttgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctattgaatagttgcttatgttttaa 27880177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 131 - 261
Target Start/End: Original strand, 3212466 - 3212597
Alignment:
Q  131 aacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca-taacaaatcatcttttgttctctgaaataa 229  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||  ||| | |    
T  3212466 aacattctattgaatagttgcttaggttttaagtcgatataagactataaatagagtagctagctatcaataacat-tcatcttttattcttggaattca 3212564  T
Q  230 -taagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
     |||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  3212565 ctaagtgacaattgtctttctgaataaaagttc 3212597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11869948 - 11869848
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11869948 agactataaatagagtagctagcaagcatattgaatcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttcttttaataaaagttcatctttattt 11869849  T
Q  272 t 272  Q
    |    
T  11869848 t 11869848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 25054847 - 25055062
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatac-ccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattt---------t 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||| |||| | ||  |||||||||||||||||||    |||||||| |||||||         |    
T  25054847 gaatttgaagatcttgtacaaatatatacaagaggcgcgccccactttagtccttttgctgcttttgctttccggacaagctacctatttgtttatttct 25054946  T
Q  104 gacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataac 203  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25054947 gacctagaagcccttggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgtttaggttttaagtcgttata-gactataaatagagtagttagctatcataac 25055045  T
Q  204 aaatcatcttttgttct 220  Q
    || ||||||||||||||    
T  25055046 aattcatcttttgttct 25055062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 10147743 - 10147894
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  10147743 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcctgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 10147842  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  10147843 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 10147894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 296 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 11827384 - 11827277
Alignment:
Q  296 gtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatct 394  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| |    
T  11827384 gtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattt 11827285  T
Q  395 tatgtaac 402  Q
    ||||||||    
T  11827284 tatgtaac 11827277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12186549 - 12186398
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  12186549 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 12186450  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  12186449 atcttatgaaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 12186398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12192963 - 12192812
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  12192963 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 12192864  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  12192863 atcttatgaaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 12192812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12199604 - 12199453
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  12199604 atgtctacgatgaacatgagtgagtagagttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 12199505  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  12199504 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 12199453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 13194925 - 13194774
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | | | || ||    
T  13194925 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttcggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagcgaagctctaagcctta 13194826  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  13194825 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatggatta 13194774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 13325928 - 13326079
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttg-acccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||| ||    
T  13325928 atgtctacgatgaacatgagtgagtagatttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaagcaagttttatacctta 13326027  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||| ||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  13326028 atcctatgtaaccataatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 13326079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 5212172 - 5212026
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  5212172 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 5212073  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| || | |||||| || |||||||||    
T  5212072 atcttatgtaaccctaatttcttatatgaattcaccgctttaacatg 5212026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 13204517 - 13204371
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  13204517 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttcggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 13204418  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  13204417 atcttatgtaaccttaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 13204371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 13504369 - 13504223
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | | | ||| |    
T  13504369 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcagaccaagctctaagcctta 13504270  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||  |||||| || |||||||||    
T  13504269 atcttatgtaaccctaatttcttatccgaattcaccgctttaacatg 13504223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 415
Target Start/End: Original strand, 27407329 - 27407451
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  27407329 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataattctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaat 27407428  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
     |||||||||||||  |||||||    
T  27407429 tttatgtaaccctaaattctaat 27407451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 32403850 - 32403704
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | | | ||| |    
T  32403850 atgtctacgatgaacatgagtgagtaaacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataattctaatcaagccaagctctaagcctta 32403751  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  32403750 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 32403704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 42281052 - 42281198
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  42281052 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagttctaagcctta 42281151  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||| || | |||||||    
T  42281152 atcttatgtaaccctaatttcttgtctaaattcaccgctctaacatg 42281198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 315 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 3250080 - 3249959
Alignment:
Q  315 gagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaat-gacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgtaaccctagtttct 412  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3250080 gagtagactcttcttgtcttgggattgtcggataagtctaattgacataatcctaatcaagccaagctttaagccttaatcttatgtaaccctaatttct 3249981  T
Q  413 aatctaaattcaacgttttaac 434  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  3249980 aatctaaattcaccgctttaac 3249959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 10608259 - 10608114
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| | | | || ||||    
T  10608259 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaataaaataatcctaatcaagccaagctctaagccttaat 10608160  T
Q  393 cttatgtaa-ccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  10608159 cttatgtaacccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 10608114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 218
Target Start/End: Original strand, 36076107 - 36076219
Alignment:
Q  105 acctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataaca 204  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36076107 acctaaaagcccttggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgttata-gactataaatagagtagttagctatcataaca 36076205  T
Q  205 aatcatcttttgtt 218  Q
    | ||||||||||||    
T  36076206 attcatcttttgtt 36076219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14661042 - 14660974
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14661042 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgccccattatacccttttgctgcttttgctt 14660974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 2036 - 1905
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  2036 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 1937  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaatt 422  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  1936 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaatt 1905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 10141137 - 10141288
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   | | || ||    
T  10141137 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcctgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagccctaagcctta 10141236  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  10141237 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 10141288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 275
Target Start/End: Original strand, 13604968 - 13605117
Alignment:
Q  118 tggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgt 217  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||    ||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  13604968 tggtttcttgtggaacattatagtgatgtattgcttaggttttaagtcattgtaa-actataaataaagtagctagctatcgcaacaattcatcttttgt 13605066  T
Q  218 tctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    |||  |||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13605067 tcttggaa-------gtgacaattgtttctttgaataaaatttcacctttattttatg 13605117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 43842170 - 43842083
Alignment:
Q  181 atagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||| |||| ||  | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43842170 atagagtagctagccatcacaaatattcattttttgttctcggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 43842083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 10546435 - 10546289
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||| | | | |  ||    
T  10546435 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcattgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatactaatcaagctaagctctaagcgtta 10546336  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10546335 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 10546289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 274
Target Start/End: Original strand, 13069780 - 13069850
Alignment:
Q  204 aaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttat 274  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13069780 aaatcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttattttat 13069850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15635042 - 15634896
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | |  ||    
T  15635042 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttcggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcatta 15634943  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  15634942 atcttatgtaaccctaacttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 15634896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Original strand, 17023366 - 17023503
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||| |||||| || |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  17023366 atgtctataatgaatgtgagtgtgtagatttct-ttgtcttgggattgttggataagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaat 17023464  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  17023465 tttatgtaaatctattttctaatctaatttcaccgtttt 17023503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20225207 - 20225069
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | | ||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  20225207 atgtctacgatgaacatgaatgagtagactcttcttgtcttgggattgttggacaagtctaatgacttaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaat 20225108  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
      |||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20225107 tctatgtaaatctattttctaatctaaattcaccgtttt 20225069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 13068901 - 13069050
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa-gatttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||   ||  ||| ||||    
T  13068901 atgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacatagtcctaatcaagtcaacccttaaaccttaat 13069000  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||| ||||    
T  13069001 attatgtaaccctagtttctcttctaaattccccgttttaacatggatta 13069050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 13418500 - 13418585
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13418500 atgtctgcgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaag 13418585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 162
Target Start/End: Original strand, 51034645 - 51034742
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaa 162  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  51034645 cttttgctgcttttgcttcatgatctagctgcctattttgatcgaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaataattgcttaagttttaa 51034742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 1993564 - 1993648
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1993564 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 1993648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14495074 - 14495006
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14495074 gaatttgaagatcttgtacaaaaatataaaagtggcgcgccccattatacccttttgctgcttttgctt 14495006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 41545865 - 41545657
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc--tttat 269  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||   ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  41545865 agactataaatagagtacctagcaaacatattgaatcatcttttgttcttggaaattataagtgacaaatgtttctttgaataaaagttctcctttttat 41545766  T
Q  270 tttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaa 369  Q
    ||||||                  ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||  |    
T  41545765 tttatgttcttcttcttcttctatatgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttcagattgttgaatgaatctaatgacctaatcccta 41545667  T
Q  370 tcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||    
T  41545666 tcaaaccaag 41545657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 1998723 - 1998807
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1998723 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 1998807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 10850695 - 10850611
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||| ||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10850695 atgtatacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataattctaatgacataatcctaatcaaaccaa 10850611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 208 - 272
Target Start/End: Original strand, 17023247 - 17023311
Alignment:
Q  208 catcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17023247 catcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttatttt 17023311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 364 - 442
Target Start/End: Original strand, 3212640 - 3212719
Alignment:
Q  364 tcctaatcaaaccaagatttga-ccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||  || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3212640 tcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatcttttgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 3212719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18128941 - 18128790
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||  |||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | | || ||    
T  18128941 atgtctatgatgaacatgagtgagtagatttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 18128842  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||| |||||||| ||| | ||||||||| | || ||||||||| ||||    
T  18128841 atcttatataaccctaatttattatctaaatttaccgctttaacatggatta 18128790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Original strand, 7908430 - 7908546
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||  |||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7908430 tgacctaaaagtccgtggtttcttgtggaacattctagtgttatattt-cttagggcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagctatcata 7908527  T
Q  202 acaaatcatcttttgttct 220  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7908528 acaaatcatcttttgttct 7908546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Original strand, 13069886 - 13070023
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||| | | | ||||||||    
T  13069886 atgtctacaatgaatgtgagtgagtagacttct-ttgtctttggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaacaacactcgaaccctaat 13069984  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  13069985 tttatgtaaatctattttctaatctaatttcaccgtttt 13070023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 143
Target Start/End: Original strand, 40846653 - 40846731
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga 143  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40846653 cttttgctgcttttgcttcagaaacaagctacctattttgacctaaaaactcgtggtttcttgtggaacattctagtga 40846731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 8532006 - 8532091
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8532006 atgtctacaatgaacatgagtgaaaagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacctaatccaaatcaaaccaag 8532091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 8685820 - 8685695
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  | | ||||||||    
T  8685820 atgtttacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaat 8685721  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||    
T  8685720 tttatgtaaatctattttctaatcta 8685695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 6236966 - 6237050
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  6236966 atgtctacaacgaacgttagtgagtaggctctccttgtcttgggattgttggataagtctaataacgtaaacctaatcaaaccaa 6237050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10850894 - 10850794
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||||    | ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10850894 gtttcttgtggaacattatagtgatgtattgcttaggttttaagtcgaatgtaaactataaatagcgtagctagccatcacaacaaatcatcttttgttc 10850795  T
Q  220 t 220  Q
    |    
T  10850794 t 10850794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 243
Target Start/End: Original strand, 27407118 - 27407258
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||  |||| ||    ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  27407118 tgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgttatattt-cttagggcttaaatcattgtaa-actataaatagagtagctagctatcaca 27407215  T
Q  202 acaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgt 243  Q
    |||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  27407216 acaattcatcttttgttcctagaaatcaataagtgacaattgt 27407258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Original strand, 1991025 - 1991082
Alignment:
Q  385 accctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1991025 accctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 1991082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 220
Target Start/End: Original strand, 3279750 - 3279850
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||| |||    
T  3279750 gtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgattgtaaactataaatagagtagctagccatcacaataaattatcttttattc 3279849  T
Q  220 t 220  Q
    |    
T  3279850 t 3279850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 272
Target Start/End: Original strand, 8531867 - 8531969
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaa--ataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttat 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||   | ||||||||| || |  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8531867 agactataaatagagtagctagcaaacatattcattcatcttttatttttagaaatataataagtgacatttgtttctttgaataaaagttcatctttat 8531966  T
Q  270 ttt 272  Q
    |||    
T  8531967 ttt 8531969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11827593 - 11827477
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||    ||| || ||||||||||||||||||||||| |    
T  11827593 tgacctaaaagcccgtggtttattgtgaaacattctagtgatatattt-cttagggtttaagtcattttaa-acaataaatagagtagctagctatcaca 11827496  T
Q  202 acaaatcatcttttgttct 220  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  11827495 acaattcatcttttgttct 11827477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14348191 - 14348103
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat--aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  14348191 actataaatagagtagctagccatcacaacaaatcatcttttattct-tgaaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 14348103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 11869813 - 11869729
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  11869813 atgtctacaatgaacatgcgtgagtatacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaag 11869729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 358
Target Start/End: Original strand, 5666650 - 5666714
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatga 358  Q
    |||||||| || ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5666650 atgtctacgataaacatgagtgactagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatga 5666714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 218
Target Start/End: Original strand, 17209574 - 17209669
Alignment:
Q  122 ttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||  |||||||    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  17209574 ttcttgtggaacattctagtgatgtgtttcttagggcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagctatcgtaacaattcatcttttgtt 17209669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Original strand, 1993364 - 1993507
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    | | |||||||||||||| |||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  1993364 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaattataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttgtt 1993463  T
Q  219 ctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  1993464 cttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 1993507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Original strand, 1998523 - 1998666
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    | | |||||||||||||| |||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  1998523 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaattataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttgtt 1998622  T
Q  219 ctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  1998623 cttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 1998666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 261
Target Start/End: Original strand, 13418294 - 13418451
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||  |||||||    ||| |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  13418294 tgacctaaaagctcgtggtttcttgtggaacattctagtgatatattt-cgtagggcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagttagctatcaca 13418391  T
Q  202 acaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| | |  |||||||||||| | | | |||||||||||    
T  13418392 acaattcatcttttgttcttggaattcaatagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 13418451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 261
Target Start/End: Original strand, 17480380 - 17480526
Alignment:
Q  117 gtggtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctttt 215  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||    
T  17480380 gtggttgcttgtgcaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaaaattcatctttt 17480479  T
Q  216 gttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
     ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  17480480 attcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 17480526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 27992684 - 27992547
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||  | | ||||||||    
T  27992684 atgtctacgatgagcatgagtgagtagatttct-ttgtattgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaagcctagaaccctaat 27992586  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  27992585 tttatgtaaatctattttctaatctaatttcatcgtttt 27992547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 11577722 - 11577598
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||  |||||||||||  |   ||||||||     
T  11577722 tgtctacaatgaacatgtgtgagtaaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaacgacctaatccctatcaaaccaagcctcaaaccctaatt 11577624  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaa 419  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  11577623 ttatgtaaatctattttctaatctaa 11577598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14137901 - 14137800
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  14137901 gtttgttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagcaatcacaaatattcatcttttgtt 14137802  T
Q  219 ct 220  Q
    ||    
T  14137801 ct 14137800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 274
Target Start/End: Original strand, 16703769 - 16703874
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgttt-ctttgaataaaagttca-ccttta 268  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || |   |||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16703769 agactataaatagagcagctagcaaacaaattgaatcatctcttgtttttggaaattaataagtgacaattgtttcctttgaataaaagttcatccttta 16703868  T
Q  269 ttttat 274  Q
    ||||||    
T  16703869 ttttat 16703874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 37978481 - 37978401
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  37978481 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttaggttttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatca 37978401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 424
Target Start/End: Original strand, 17766537 - 17766608
Alignment:
Q  354 aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  17766537 aatgacataatcctaatcaaaccaacctttaaaccttaatcttatgtaacgctaatctctaatctaaattca 17766608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 354 - 424
Target Start/End: Original strand, 19067857 - 19067928
Alignment:
Q  354 aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  19067857 aatgacataatcctaatcaaaccaacctttaaaccttaatcttatgtaacgctaatctctaatctaaattca 19067928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 363
Target Start/End: Original strand, 11868783 - 11868852
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataa 363  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11868783 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttc-cttgtcttgggattgtttgataagtctaaatgacataa 11868852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 7908636 - 7908721
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||  |||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||  |||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  7908636 atgtctatgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgcgataattggatgagtctaatggcctattcctaatcaaaccaag 7908721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11577876 - 11577807
Alignment:
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttat 274  Q
    ||||||||||||||||  | |||  || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11577876 aatcatcttttgttcttgggaattctaggtgacaattatttcattgaataaaagatcacctttattttat 11577807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 143
Target Start/End: Original strand, 14659175 - 14659263
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattt----------tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga 143  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||          ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14659175 cttttgctgcttctgcttcaaagacaagctacctatttagtttatttctgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtga 14659263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17577162 - 17577087
Alignment:
Q  303 atgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||| | |||||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  17577162 atgaacatgagtgagtaaatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaag 17577087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7786148 - 7786073
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagc 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    |  ||||||||||||||||||||    
T  7786148 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagc 7786073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 399 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14660680 - 14660637
Alignment:
Q  399 taaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14660680 taaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 14660637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10546622 - 10546551
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10546622 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 10546551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 10560006 - 10559935
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10560006 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 10559935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12776198 - 12776127
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12776198 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 12776127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Original strand, 15429790 - 15429861
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15429790 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaaggtaaactataaatagagtagctagccatca 15429861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 50909057 - 50908986
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  50909057 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 50908986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12697439 - 12697319
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||| | | |||||||| || | |||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| |  |||||| |||| || | ||||||||     
T  12697439 tgtctacaatgaacatgaatgagtagatttgt-ttgtcttgggattgttggttgagtctaatgacctaattcctatcaaatcaagcatataaccctaatt 12697341  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
    ||||||||  ||| ||||||||    
T  12697340 ttatgtaaatctattttctaat 12697319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 25766002 - 25765949
Alignment:
Q  19 tgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgct 72  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  25766002 tgaagatctcataccaaaatataaaagtggcgcgtcccattatacccttttgct 25765949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3245216 - 3245144
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagcta 192  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | |||||||||||||||||||    
T  3245216 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagcta 3245144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14139588 - 14139508
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  || |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14139588 gtttgttgtggaacattcttgtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 14139508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Original strand, 16034012 - 16034088
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16034012 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 16034088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 139
Target Start/End: Original strand, 17041642 - 17041678
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattcta 139  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17041642 tgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattcta 17041678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 141
Target Start/End: Original strand, 17050654 - 17050690
Alignment:
Q  105 acctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagt 141  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17050654 acctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagt 17050690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 7)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 65 - 442
Target Start/End: Original strand, 77709 - 78091
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| |  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  77709 cttttgctgcttttgcttcagaaacaagctacctgttttgaccaaagagcccgtgatttcttgtagaacattctattgaatagttgcttaggttttaagt 77808  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-ac 263  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |  | |||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  77809 cgatataagactataaatagagtagctagctatcaatagcattcatcttttgttattggaaataataagtgaccattgtttctttatataaaagttcaac 77908  T
Q  264 ctttattttatg---nnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgaca 360  Q
    ||||||||||||                     ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  77909 ctttattttatgttcttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgaca 78008  T
Q  361 taatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  78009 taatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatgtaaccctaatttctaatctgaattcaccgttttaacatgaatta 78091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 174 - 442
Target Start/End: Original strand, 23244 - 23514
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttca-cctttatttt 272  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23244 actataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaacctttatttt 23343  T
Q  273 atgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatca 372  Q
    |||                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  23344 atgttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtataatgaaataatcctaatca 23443  T
Q  373 aaccaagat-ttgaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23444 aaccaagctattagccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 23514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 121 - 274
Target Start/End: Original strand, 100295 - 100449
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | |||||||||||||||| ||||  ||| ||  |||||||||||||||    
T  100295 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagttagccctcacaaataatcatcttttgttc 100394  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttat 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100395 tctgaaataataagtgataattgtttctttgaataaaagttcacctttattttat 100449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 345 - 439
Target Start/End: Original strand, 18371 - 18466
Alignment:
Q  345 gataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaa 439  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18371 gataagtataatgaaataatcctaatcaaaccaagatattaaccctaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaa 18466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 349
Target Start/End: Original strand, 290 - 345
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataa 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  290 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataa 345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 275
Target Start/End: Original strand, 166 - 268
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttatttt 272  Q
    |||||||||||||| |||  | |||| ||  | ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  166 actataaatagagttgctgaccatcacaaatattcatcttttgttcttggaaatattaagtgacaattgtttctttgaataaaatttcaacctttatttt 265  T
Q  273 atg 275  Q
    |||    
T  266 atg 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 100201 - 100269
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  100201 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcacaccccataatacctttttgctgcatttgctt 100269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 142)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Original strand, 26012850 - 26013060
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26012850 cttttgctgcttttgcttcggaaacaagctacctattttgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgattagttgcttaggttttaagt 26012949  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012950 cgacataagactataaatagagtagttagctatcataacaattcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc 26013049  T
Q  265 tttattttatg 275  Q
    |||||||||||    
T  26013050 tttattttatg 26013060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 24967094 - 24967299
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||  ||| |||    
T  24967094 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgccccattatacccttttgctgcttttgcttcggagacaagctacctattttgtactaaaag 24967193  T
Q  114 cctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctt 213  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24967194 cccatggtttattgtggaacattctagtgaatatttgcttagtttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaattcatctt 24967293  T
Q  214 ttgttc 219  Q
    ||||||    
T  24967294 ttgttc 24967299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 120 - 442
Target Start/End: Original strand, 23503071 - 23503396
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  23503071 gtttcttgcggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaacaaatcatcttttgttc 23503170  T
Q  220 tctgaaataataa-gtgacaattgtttctttgaataaaagttca-cctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgag 317  Q
    |  ||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||    
T  23503171 ttggaaataacaaagggacaattgtttgtttgaataaaagtccaacctttattttatgttcttattcttttcttctatgtctacaatgaacgttagtgag 23503270  T
Q  318 tagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccc-taatcttatgtaaccctagtttctaatc 416  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||    
T  23503271 tagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaacccttaattttatttaaccctaatttctaatc 23503370  T
Q  417 taaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||    
T  23503371 taaattcattgttttaacatgaatta 23503396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Original strand, 25396805 - 25397016
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||||||||||||| |||||   | |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25396805 cttttgctgcttttgtttcatgatctagctgcctgttttgaccgaaaagcccgtggtttcttgtagaacattctattgaataattgcttaggttttaagt 25396904  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatc-ataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-a 262  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25396905 cgatataagactataaatagagtagctagctatcaataac-attcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaa 25397003  T
Q  263 cctttattttatg 275  Q
    |||||||||||||    
T  25397004 cctttattttatg 25397016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 6570556 - 6570408
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6570556 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatc 6570457  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6570456 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 6570408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 122 - 420
Target Start/End: Complemental strand, 14351800 - 14351502
Alignment:
Q  122 ttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| |||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| |   | ||||||||||||||    
T  14351800 ttcttgtggaacattctagtgatgtaattgtttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacagatattcatcttttgttct 14351701  T
Q  221 ctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttca-cctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagta 319  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||                   |||||||||||||||||||||||||    
T  14351700 atgaaataataagtgacaattgttcctttgaataaaagttcaacctttattttatgttcttcttctcttctt---tgtctacaatgaacgttagtgagta 14351604  T
Q  320 gacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14351603 gacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatcta 14351504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14878272 - 14878124
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14878272 atgtctacaatgaacgttggtgagtggacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatc 14878173  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14878172 ttatgtaaccataatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 14878124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 17126948 - 17127096
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  17126948 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccataatc 17127047  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17127048 ttatgtaaccctggtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 17127096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 9317949 - 9318098
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9317949 atgtctacaatgaatgttagtgagtagactcttcttatattgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttaacccctaat 9318048  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9318049 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 9318098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1990713 - 1990558
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1990713 cttttgctgcttttgcttcggaaacaagctacctattttgaccgaaaagcccgtggtttcttgtagaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 1990614  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  1990613 caacataagactatgaatagagtagctagctatcataacaattcatcttttcttct 1990558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Original strand, 23455440 - 23455637
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23455440 cttttgttgtttttgcttcatggacaagctacctattttgaccgaaaagctcgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 23455539  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||| ||| | | |||||||||||    
T  23455540 cgacataagactataaatagagtagctatctatcattaacattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattctttttcttaataaaagttc 23455637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 120 - 275
Target Start/End: Original strand, 6279652 - 6279807
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  6279652 gtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgctc 6279751  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6279752 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttctcctttattttatg 6279807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 66 - 243
Target Start/End: Original strand, 29003491 - 29003670
Alignment:
Q  66 ttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtc 165  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29003491 ttttgctgcttttgcttcatgatctagctgcctgttttgaccaaaaagtctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtc 29003590  T
Q  166 gac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgt 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  29003591 gacaataagactataaatagagtagctagctatcattaacattcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgt 29003670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 312 - 442
Target Start/End: Original strand, 24034796 - 24034926
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatcttatgtaaccctagtttc 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  24034796 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgccataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatcttatgtaaccctaatctc 24034895  T
Q  412 taatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24034896 taatctaaattcaccgttttaacatgaatta 24034926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 74 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14878501 - 14878297
Alignment:
Q  74 cttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgaca-taa 172  Q
    ||||||||||||   | |||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  14878501 cttttgcttcatgatccagctgcctgttttgaccgaaaagcctgtggttttttgtagaacattatagtgaatagttggttaggttttaagtcgacaataa 14878402  T
Q  173 gactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaat-aaaagttc-acctttatt 270  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  14878401 gactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttcttgaaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaaagttcaacctttatt 14878302  T
Q  271 ttatg 275  Q
    |||||    
T  14878301 ttatg 14878297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 22818350 - 22818498
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22818350 atgtctacgatgaacatgagtgtgtagacttctcttgtcttgggattgttggataaatctaatgacataatcataatcaaaccaagctttaaccctaatc 22818449  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22818450 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcattgttttaacatgaatta 22818498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20038455 - 20038312
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  20038455 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 20038356  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  20038355 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcatcgctttaacatg 20038312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20044110 - 20043967
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  20044110 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 20044011  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  20044010 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 20043967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 22831253 - 22831403
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22831253 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggatagttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaa 22831352  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22831353 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 22831403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 39730682 - 39730532
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39730682 atgtctacgatgatcatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaa 39730583  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39730582 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 39730532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 15759672 - 15759821
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  15759672 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggctaagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaat 15759771  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  15759772 tttatgtaaccctaatttctaatctaaattcactattttaacatgaatta 15759821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18264369 - 18264220
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  18264369 atgtctacgatgaacttgagtgagcagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctattaaccctaat 18264270  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18264269 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 18264220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18273382 - 18273233
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  18273382 atgtctacgatgaacttgagtgagcagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagctattaaccctaat 18273283  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18273282 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 18273233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 22285088 - 22285237
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22285088 atgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaat 22285187  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22285188 tttatgtaaccctaatttctaatctaaattcactgttttaacatgaatta 22285237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 442
Target Start/End: Original strand, 19997497 - 19997645
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  19997497 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 19997596  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  19997597 ttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 19997645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 294 - 440
Target Start/End: Original strand, 20263525 - 20263673
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20263525 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaa 20263624  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaat 440  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20263625 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaatttaccgttttaacatgaat 20263673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 294 - 440
Target Start/End: Original strand, 21050154 - 21050302
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21050154 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaa 21050253  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaat 440  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21050254 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaatttaccgttttaacatgaat 21050302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 26826604 - 26826755
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag--atttgacccta 390  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||  ||| ||    
T  26826604 atgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaacctta 26826703  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26826704 atcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 26826755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 29325413 - 29325557
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  29325413 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 29325512  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | |||| || |||||||||    
T  29325513 cttatgtaaccctaatttcttatctgacttcaccgctttaacatg 29325557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21103612 - 21103469
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  21103612 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 21103513  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  21103512 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 21103469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 22370661 - 22370804
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  22370661 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 22370760  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  22370761 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 22370804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Original strand, 22284834 - 22285031
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||| ||||||||||||||   | |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284834 cttttgttgcttttgcttcatgatctagctgcctgttttgaccgaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 22284933  T
Q  165 cgac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
     ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  22284934 tgacaataaga-tataaataaagtagctagctatcataacaattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 22285031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 26013085 - 26013234
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||  ||||||||    
T  26013085 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatgaagtcttaaaccctaat 26013184  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26013185 tttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttcacatgaatta 26013234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 312 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18230606 - 18230474
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaatcttatgtaaccctagtt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |     
T  18230606 agtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaataaaaccaagttattgaccctaatcttatgtaaccctaatc 18230507  T
Q  410 tctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18230506 tctaatctaaattcatcgttttaacatgaatta 18230474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 1685768 - 1685911
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  1685768 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 1685867  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  1685868 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 1685911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21105654 - 21105511
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||    
T  21105654 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatc 21105555  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  21105554 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 21105511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25751683 - 25751540
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  25751683 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 25751584  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  25751583 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 25751540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 35996197 - 35996340
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  35996197 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 35996296  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  35996297 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 35996340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 422
Target Start/End: Original strand, 18162105 - 18162235
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaa 391  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||    
T  18162105 atgtctacaatgaacgttagtaagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 18162204  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaatt 422  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18162205 tcttatgtaaccctaatttctaatctaaatt 18162235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 103 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14162328 - 14162161
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    ||| |||||||||||||||||||||  ||| |    
T  14162328 tgacctaaaagcccatggtttcttgtggaacattctagtgatatattt-cttaggtcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagcagtcaca 14162231  T
Q  202 acaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14162230 acaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttatttgaataaaagttcatctttattt 14162161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 42418495 - 42418346
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  42418495 atgtctacgatgaacataagtgagtagactcttcttgtcttggggttgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccctaat 42418396  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42418395 tttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 42418346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Original strand, 15759462 - 15759618
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||||| | |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15759462 cttttgctgcttttgcttcatgatctagctgcctgttttgaccaaaaagcccatggtttattgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 15759561  T
Q  165 cgac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||    
T  15759562 cgacaataagactataaatagagtagctagctaacattaacattcatcttttgttct 15759618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21939460 - 21939317
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||    
T  21939460 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaggctttaaaccttaatc 21939361  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  21939360 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 21939317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 45466804 - 45466955
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  45466804 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 45466903  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45466904 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 45466955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 295 - 436
Target Start/End: Original strand, 20002853 - 20002995
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  20002853 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtttaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 20002952  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacat 436  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  20002953 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcatcgctttaacat 20002995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 23879929 - 23880079
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  23879929 atgtctacgttgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacattatcctaattaaaccaagctattgaccctaa 23880028  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23880029 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcattgttttaacatgaatta 23880079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 66 - 199
Target Start/End: Original strand, 22818097 - 22818230
Alignment:
Q  66 ttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtc 165  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  22818097 tttttctgcttttgcttcagaaacaagctacctgttttgaccaaaaagcccgtggtttcttgtagaacattatattgaatagttgcttaggttttaagtc 22818196  T
Q  166 gacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22818197 gatataagactataaatagagtagctagctatca 22818230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 25397044 - 25397193
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  25397044 atgtctccaatgaacgttagtgagtatactcttcttgtcttgagatttttggatatgtctaatgacataatcctaatcaaacgaagttttaaaccctaat 25397143  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25397144 tttatctaaccctaatttctaatctaaattcaccattttaacatgaatta 25397193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 33632537 - 33632688
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag--atttgacccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||  ||| ||    
T  33632537 atgtctacgatgaacatcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaacctta 33632636  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  33632637 atcttatataaccctaatttctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 33632688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11346460 - 11346317
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||    
T  11346460 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatgaaaccaagctttaaaccttaatc 11346361  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||  | |||||||||    
T  11346360 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcactgctttaacatg 11346317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 70 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 23221729 - 23221527
Alignment:
Q  70 gctgcttttgcttcatagacaagctgcctattt---------tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggtttt 160  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||         ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||| |  ||    
T  23221729 gctgcttttgcttcaaagacaagctacctatttgtttatttctgacctaaaagcccatggtttcatgtggaacattctagtgatgtattgcttatggctt 23221630  T
Q  161 aagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 260  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23221629 aagtcgatataa-actataaatagagtagctaactatcataacaattcatcttttcttcttgaaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 23221531  T
Q  261 cacc 264  Q
    ||||    
T  23221530 cacc 23221527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Original strand, 17126679 - 17126877
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||||||| |||||||||||   | |||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17126679 cttttgctgattttgcttcatgatctagctgcctgttttgactgaaaagcccgtggtttcttgtgaaacattctactgaatagttgcttaggttttaagt 17126778  T
Q  165 cgac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  17126779 cgacaataagactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 17126877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11351499 - 11351356
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| |||||    
T  11351499 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatgaaaccaagctttaaaccttaatc 11351400  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||| |||||||  | |||||||||    
T  11351399 ttatgtaaccctaattccttatcaaaattcactgctttaacatg 11351356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21945395 - 21945252
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||| |||||    
T  21945395 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgtttgataagtctaatgacataatcctaatcaaactaggctttcaaccttaatc 21945296  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  21945295 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 21945252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 122 - 275
Target Start/End: Original strand, 18161926 - 18162080
Alignment:
Q  122 ttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | | ||||||||||||| ||| | |||| ||  | ||||||||||||||    
T  18161926 ttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaattataaatagagtatctacccatcacaaatattcatcttttgttct 18162025  T
Q  221 ctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162026 ctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 18162080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 21821462 - 21821608
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  21821462 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 21821561  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21821562 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatg 21821608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 23912189 - 23912335
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | |||||    
T  23912189 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcccta 23912288  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  23912289 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgttttaacatg 23912335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 27537559 - 27537705
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  27537559 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 27537658  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  27537659 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatg 27537705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21843010 - 21842865
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||    
T  21843010 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctacttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaa 21842911  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  21842910 tcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 21842865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21858821 - 21858676
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||    
T  21858821 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaa 21858722  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  21858721 tcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 21858676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17515783 - 17515631
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaacc-aagatttgaccct 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||  ||| |    
T  17515783 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaacctaaccttaaacctt 17515684  T
Q  390 aatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17515683 aatcttatgtagccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 17515631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 17621475 - 17621619
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | | |  ||||    
T  17621475 tgtctacgatgaacgttagtgagtagacttatcttgtcttgggattgctggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaaatctaagctttaat 17621574  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  17621575 cttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 17621619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 440
Target Start/End: Original strand, 19768254 - 19768402
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaat-gacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||    
T  19768254 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaaagacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaa 19768353  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaat 440  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  19768354 tcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatgaat 19768402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 38349893 - 38349742
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |    
T  38349893 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaattttaaacctta 38349794  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38349793 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 38349742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21098261 - 21098115
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | |||||    
T  21098261 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcccta 21098162  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  21098161 atcttgtgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgttttaacatg 21098115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 23904334 - 23904480
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | |||||    
T  23904334 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcccta 23904433  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  23904434 atcttgtgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgttttaacatg 23904480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 25228740 - 25228886
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  25228740 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 25228839  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  25228840 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgttttaacatg 25228886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 42418710 - 42418565
Alignment:
Q  94 tgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgac-ataagactataaatagagtagcta 192  Q
    ||||| |||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||||||||||||    
T  42418710 tgcctgttttgaccaaaaagcccgtggtttcttgcggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacaataag------aatagagtagcta 42418617  T
Q  193 gctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgt 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  42418616 gctatcataacaattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgt 42418565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 8308566 - 8308717
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  8308566 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 8308665  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  8308666 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 8308717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 8315214 - 8315365
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  8315214 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 8315313  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  8315314 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 8315365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 21382839 - 21382990
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  21382839 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 21382938  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  21382939 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 21382990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 23779541 - 23779692
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |    
T  23779541 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaacctta 23779640  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  23779641 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgccttaacatggatta 23779692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 20836203 - 20836349
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | | ||| |    
T  20836203 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagctctaagcctta 20836302  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  20836303 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 20836349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 21831744 - 21831890
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  21831744 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggatttttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 21831843  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21831844 atcttacgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatg 21831890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22099144 - 22098998
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  22099144 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacatgatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 22099045  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  22099044 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttatcatg 22098998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 14821299 - 14821448
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||  |||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  14821299 atgtctatgatgaacatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaat 14821398  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14821399 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 14821448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 17613293 - 17613437
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||  | | | || ||||    
T  17613293 tgtctacgatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgctggataagtttaaatgacataatcctaattgaaccaaactctaagccttaat 17613392  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  17613393 cttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 17613437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 24967367 - 24967451
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24967367 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacgcaatcctaatcaaaccaa 24967451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8328980 - 8328829
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  8328980 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 8328881  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  8328880 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 8328829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 18399385 - 18399536
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| |    
T  18399385 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaacaaagctttaaacctta 18399484  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  18399485 atcttatgtaactctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 18399536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14162110 - 14161973
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||   ||||||||    
T  14162110 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-ttgtctttggattgttggatgagtctaatgacctaatcctgatcaaaccaagcatcgaaccctaat 14162012  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  14162011 tttatgtaaatctaatttctaatctaatttcaccgtttt 14161973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 19360005 - 19360151
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  19360005 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagttctaagcctta 19360104  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  19360105 attttatgcaaccctagtttcttatctaaattcaccgctttaacatg 19360151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22033044 - 22032898
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  22033044 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctcagcctta 22032945  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  22032944 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatg 22032898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 40952231 - 40952085
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  40952231 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 40952132  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||||||||    
T  40952131 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcgtcgctttaacatg 40952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17515974 - 17515825
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||    |  |||||||||||||||||||| |||| ||  | |||| |||||||    
T  17515974 gtttcttgtggaacattctagtaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatattttgtt 17515875  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17515874 ataagaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 17515825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 303 - 437
Target Start/End: Original strand, 21956033 - 21956170
Alignment:
Q  303 atgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgt 399  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||    
T  21956033 atgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgt 21956132  T
Q  400 aaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||    
T  21956133 aaccctaatttcttatctgaattcaccgctttaacatg 21956170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Original strand, 23455695 - 23455820
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||    
T  23455695 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatcctagtcaaaccgagctttaaaccctaat 23455794  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  23455795 tttatgtaaccctaatttctaatcta 23455820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 37652922 - 37653071
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| ||||    
T  37652922 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttatgtcttggaattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagcattaaaccttaat 37653021  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| |||||  | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  37653022 attatgtaaccctaatttctcttttaaattcaccgttttaacatggatta 37653071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 43836255 - 43836170
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43836255 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 43836170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8322314 - 8322163
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   | | || ||    
T  8322314 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcataatcaaaccaagccctaagcctta 8322215  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  8322214 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 8322163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 417
Target Start/End: Original strand, 1693236 - 1693362
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  1693236 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 1693335  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatct 417  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  1693336 atcttatgtaaccctaatttcttatct 1693362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 16418414 - 16418268
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  | | | || ||    
T  16418414 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaagccaatctctaagcctta 16418315  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  16418314 attttatgtaaccctagtttcttatctaaattcaccgctttaacatg 16418268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 21950222 - 21950368
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||  |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  21950222 atgtctatgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 21950321  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||| | ||||| |||| |||||| || |||||||||    
T  21950322 atcttatgtaacccaaatttcttatctgaattcaccgctttaacatg 21950368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 22103119 - 22103265
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  22103119 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 22103218  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||| ||| ||||| |||| |||||  || |||||||||    
T  22103219 atcttatgtaactctaatttcttatctgaattcgccgctttaacatg 22103265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 22854119 - 22854205
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22854119 atgtctacgatgaacatcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaag 22854205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1990465 - 1990381
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1990465 atgtctacaatggacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 1990381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14351895 - 14351827
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14351895 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgccccattatacccttttgctgcttttgctt 14351827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1302274 - 1302143
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  1302274 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcttaatcaagtcaagccttaaaccttaat 1302175  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1302174 attatgtaaccctagtttctcttctaaattca 1302143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 6279862 - 6280011
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaa 391  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  6279862 atgtttacaatgaacgtgagtgagtagactcttct-gccttgggattgttgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaagccttgaaccctaa 6279960  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||| |||   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6279961 ttttatataaatttactttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 6280011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18821810 - 18821664
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | | || ||    
T  18821810 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgtttgataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagcctta 18821711  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||  || |||||||||    
T  18821710 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcgccgctttaacatg 18821664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 20713183 - 20713329
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| |||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  20713183 atgtctacgatgaacatgagtgagtatacttatctttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 20713282  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  20713283 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 20713329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Original strand, 21319536 - 21319674
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  21319536 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattcttggacaagtctaatgacttaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaat 21319635  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  21319636 tttatgtaaatctattttctactctaaattcaccgtttt 21319674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22029950 - 22029864
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22029950 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaag 22029864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22039646 - 22039500
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||| | | | ||| |    
T  22039646 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatgctaatcaagccaagctctaagcctta 22039547  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  22039546 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatg 22039500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 22093330 - 22093476
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | | | || ||    
T  22093330 atgtctacgatgaacatgagtgagtagaattctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacatagtcctaatcaaaccaagctctaagcctta 22093429  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||  || |||||||||    
T  22093430 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcgccgctttaacatg 22093476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23194051 - 23193965
Alignment:
Q  190 ctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttca-cctttattttatg 275  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23194051 ctagttatcataacaattcatcttttgttcttggaaataataactgacaattgtttctttgaataaaagttcaccctttattttatg 23193965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 6570701 - 6570572
Alignment:
Q  134 attctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aata 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  | ||||||||| ||||  ||| | ||||    
T  6570701 attctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacaataagactataaatagaggagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaata 6570602  T
Q  232 agtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||| | | | |||||||||||    
T  6570601 agtgacaattgtctttcttaataaaagttc 6570572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 19792203 - 19792074
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  19792203 atgtcgacaatgaacgtgagtgagtagacttct--tgtcttgggattgttggatgaatctaatgacctaatcctaatcaaactaagcattgaaccctaat 19792106  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  19792105 tttatgtaaaactactttctaatctaatttca 19792074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 29003745 - 29003829
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29003745 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 29003829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24039365 - 24039278
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24039365 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaag 24039278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17504165 - 17504016
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  17504165 atgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggacaagtctaattgcataatcttaatcaagtcaagccttaaaccttaat 17504066  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17504065 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 17504016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 18008249 - 18008334
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18008249 atgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgttttgggattgttgtataagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaag 18008334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 375
Target Start/End: Original strand, 21139780 - 21139861
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 375  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21139780 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgagatttttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaac 21139861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 220
Target Start/End: Original strand, 9317783 - 9317883
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||    | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9317783 gtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttatgtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaacaaatcatcttttgttc 9317882  T
Q  220 t 220  Q
    |    
T  9317883 t 9317883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 18161832 - 18161899
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18161832 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcg-cccattataccattttgctgcttttgctt 18161899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Original strand, 22904607 - 22904674
Alignment:
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22904607 aatcatcttttgttcttggaaattataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttatttt 22904674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 372
Target Start/End: Original strand, 5579180 - 5579258
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatca 372  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5579180 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcatgtcttaggattgttggataaatctaatgacataatcctaatca 5579258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Original strand, 24342172 - 24342310
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||| || ||| | ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  24342172 atgtctacgattaacataagtgagtagactcttcttgtcttggaattgttggataagtttaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaat 24342271  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||  ||| |||||||| ||| |||| ||||||    
T  24342272 tttatgtaaatctattttctaatttaatttcaccgtttt 24342310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 431
Target Start/End: Original strand, 26854181 - 26854320
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgt--cttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaa 391  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  26854181 tgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagactcgaaccctaa 26854280  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
    | |||  |||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  26854281 ttttagataaatctactttctaatctaatttcatcgtttt 26854320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 220
Target Start/End: Original strand, 21139589 - 21139690
Alignment:
Q  118 tggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    || || ||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21139589 tggtttcttgtggaacattctagtgatgtattactcaggttttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgt 21139687  T
Q  218 tct 220  Q
    |||    
T  21139688 tct 21139690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 24342067 - 24342123
Alignment:
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24342067 aatcatcttttgttcttagaaataataagtgacaattgtttcttttaataaaagttc 24342123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19792309 - 19792242
Alignment:
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  19792309 aatcatctttagttcttggaaataataagtgacaattgtttctttaaataaaaattcatctttatttt 19792242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23221487 - 23221401
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23221487 atgtcttcaatgaacgtgagtgaatagactcttcttgtcttgggattgctgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaag 23221401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 23193916 - 23193779
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaa 391  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| ||||  ||| ||| |||    
T  23193916 atgtctacaataaacgtgagtgagtagactcttcttgtctcgggattgttgggtaagtctaaatgacataaccttaatcaaatcaagccttgaaccttaa 23193817  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtt 429  Q
    | |||| |||  ||| |||||||||||| |||| ||||    
T  23193816 ttttatataaatctactttctaatctaatttcaccgtt 23193779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 31469638 - 31469554
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| |  |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31469638 atgtctacgatgaacatgggtgactagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaag 31469554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24221663 - 24221563
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattt 271  Q
    ||||||||||||||| | ||||| | ||||   |||||| |||||||||  |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  24221663 agactataaatagagcaactagcaaacatatacaatcattttttgttcttggaaattctaagtgacaattatttctttgaataaaagttcatatttattt 24221564  T
Q  272 t 272  Q
    |    
T  24221563 t 24221563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 220
Target Start/End: Original strand, 18008119 - 18008167
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  18008119 agactataaatagagtagctagcaatcgcaacaaatcatcttttgttct 18008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 379
Target Start/End: Original strand, 15636208 - 15636273
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15636208 agtgagtagacttct-ttgtcttgggattattggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaag 15636273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 337 - 415
Target Start/End: Original strand, 22904752 - 22904831
Alignment:
Q  337 gattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaatcttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  22904752 gattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagccttgaaccctaatcttatgtaaatctattttctaat 22904831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 261
Target Start/End: Original strand, 24034582 - 24034724
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    ||||||||||||||||||||| |  || |||||||| || ||||||||    |  |||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| |||    
T  24034582 tttcttgtggaacattctagtcatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaatctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattc 24034681  T
Q  220 tctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    | |||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  24034682 tttgaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 24034724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Original strand, 27086576 - 27086647
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27086576 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaataaaaactataaatagagtagctagccatca 27086647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 24221525 - 24221401
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||   ||||||||||  | | ||||||||    
T  24221525 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgctttgggattgttggatgattctaatgacctaatccctgtcaaaccaagcctagaaccctaat 24221427  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
    ||| |||||  ||| |||||||||||    
T  24221426 cttgtgtaaatctattttctaatcta 24221401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Original strand, 5578998 - 5579078
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5578998 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 5579078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Original strand, 15634418 - 15634500
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  15634418 tgtctacgataaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattatttgatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaag 15634500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Original strand, 26826408 - 26826488
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  26826408 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatca 26826488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 215
Target Start/End: Original strand, 45466611 - 45466703
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||    
T  45466611 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgagtgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatctttt 45466703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21843188 - 21843117
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21843188 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 21843117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21858999 - 21858928
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21858999 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 21858928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 408 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 43836157 - 43836123
Alignment:
Q  408 tttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43836157 tttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 43836123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 26853880 - 26853969
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctatttt 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |  |||||| |||||  |  |||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  26853880 gaatttgaagatcttgtaccaaaatatagcataggtgcgccccatattgtccttttgcagcttttgcttcttcgacaagctgcgtatttt 26853969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 437
Target Start/End: Original strand, 21037797 - 21037845
Alignment:
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  21037797 taatcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 21037845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39730875 - 39730799
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  39730875 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 39730799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 192)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17284323 - 17284117
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17284323 gaatttgaagatcttgtacattaatatcaaagtggcgcgccccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctaaaag 17284224  T
Q  114 cctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctt 213  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  17284223 ccggtggtttcttctggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcacaacaatttatctt 17284124  T
Q  214 ttgttct 220  Q
    |||||||    
T  17284123 ttgttct 17284117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5949909 - 5949704
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||    
T  5949909 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgccccattatacccttta-ctgcttttgcttcagagacaagctacctattttgacctaaaag 5949811  T
Q  114 cctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctt 213  Q
    ||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5949810 cccatgatttcttgtggaacattatagtgaatagttgcttaggttttaagtcgaaataagactataaataaagtagctagctatcataacaattcatctt 5949711  T
Q  214 ttgttct 220  Q
    |||||||    
T  5949710 ttgttct 5949704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Original strand, 17743462 - 17743713
Alignment:
Q  142 gaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatc-ataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaat 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17743462 gaatagttgcttaggttttaagtcgatataagactataaatagagtagctagctatcaataac-attcatcttttgttcttggaaataataagtgacaat 17743560  T
Q  241 tgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagat 339  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||                  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17743561 tgtttctttgaataaaagttcaacctttattttatgttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggat 17743660  T
Q  340 tgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17743661 tgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaat 17743713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 103 - 442
Target Start/End: Original strand, 25963834 - 25964177
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963834 tgacctaaaagcccttagtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgttatc-gactataaatagagtagctagctatcataa 25963932  T
Q  203 caaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatg---nnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtc 298  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||                     |||||    
T  25963933 caattcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaattaaagttcaacctttattttatgttcttcttcttcttatcttctatgtc 25964032  T
Q  299 tacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttat 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||| ||||    
T  25964033 tacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtattgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccataattttat 25964132  T
Q  398 gtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25964133 gtaaccataatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 25964177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 103 - 442
Target Start/End: Original strand, 25968481 - 25968824
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25968481 tgacctaaaagcccttagtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgttatc-gactataaatagagtagctagctatcataa 25968579  T
Q  203 caaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatg---nnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtc 298  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||                     |||||    
T  25968580 caattcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaattaaagttcaacctttattttatgttcttcttcttcttatcttctatgtc 25968679  T
Q  299 tacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttat 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||| ||||    
T  25968680 tacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtattgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccataattttat 25968779  T
Q  398 gtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25968780 gtaaccataatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 25968824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 174 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18184501 - 18184230
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttta 273  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18184501 actataaatagagtagctatccatcacaaatattcttcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttta 18184402  T
Q  274 tgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatc 371  Q
    ||                  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18184401 tgttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttgcgattgttggataagtctaaatgacataatcctaatc 18184302  T
Q  372 aaaccaagatttgaccc-taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18184301 aaaccaagctttaaaccataatcttatgtaaccttaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 18184230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 120 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18233976 - 18233820
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18233976 gtttcttgtggaacattgtagtgattagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttc 18233877  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatg 275  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18233876 ttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaacctttattttatg 18233820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 29360429 - 29360577
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  29360429 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttggggttgttggataagtctaatgtcataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatc 29360528  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29360529 ttatgtaaccctattttctaatctaaattcaccgttttaatatgaatta 29360577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 74 - 243
Target Start/End: Original strand, 8603376 - 8603546
Alignment:
Q  74 cttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataag 173  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8603376 cttttgcttcatgtacaagttgcctattttgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattatactgaatagttgcttaggttttaagtcgacataag 8603475  T
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgt 243  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  8603476 actataaatagagtagtcatctatcataacaattcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgt 8603546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 26474063 - 26474211
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||||||    
T  26474063 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaacaaagcttaaaccctaatc 26474162  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26474163 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 26474211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 271
Target Start/End: Original strand, 30245100 - 30245308
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||||   | |||||||| |||||| | | ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  30245100 cttttgctgcttttgcttcatgatctagctgcctgttttgatcgaaaagctcgtggtttcttgtggaacattctattgaatagttgtttaggttttaagt 30245199  T
Q  165 cgac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-a 262  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |  | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  30245200 cgacaataagactataaatagagtagttaactatcattaacattcatattttgttcttggaaataataagtgacaattgtttatttgaataaaagttcaa 30245299  T
Q  263 cctttattt 271  Q
    |||||||||    
T  30245300 cctttattt 30245308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Original strand, 6794826 - 6794981
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||  ||||||||||| | ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6794826 cttttgcttcttttgcttcggaaacaagctatctattttgaccgaaaagctcgtggtttcttgtagaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 6794925  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6794926 cgacataagactataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttct 6794981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 105 - 275
Target Start/End: Original strand, 25949236 - 25949406
Alignment:
Q  105 acctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataaca 204  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25949236 acctaaaagcccttggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcattata-gactataaatagagtagctagctatcataaca 25949334  T
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatg 275  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25949335 attcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaacctttattttatg 25949406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17284027 - 17283878
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | ||||||    
T  17284027 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgagattgttggataagtctaatgccataatcctaatcaaaccaagctttaaatcctaat 17283928  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  17283927 tttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccattttaacatgaatta 17283878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Original strand, 29360185 - 29360340
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||| ||||||| ||||||  ||||||| |  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29360185 cttttgttgcttttccttcatgtacaagctactaattttgacctaaaaacctgtggtttcttgtggaacattctactgaatagttgcttaggttttaagt 29360284  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29360285 cgacataagactataaattgagtagccatctatcataacaattcatcttttgttct 29360340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19560881 - 19560731
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  19560881 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagttattgaccgtaa 19560782  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19560781 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcatcgttttaacatgaatta 19560731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 66 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22601572 - 22601418
Alignment:
Q  66 ttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtc 165  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22601572 ttttgttgcttttgcttcatggacaagctgcttattttgacataaaagcccatggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtt 22601473  T
Q  166 gacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    ||||| |   |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22601472 gacattattttataaataaagtagctagctatcataacaattcatcttttgttct 22601418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 8603612 - 8603761
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  8603612 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttttcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaat 8603711  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8603712 tttatgtaaccctattttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 8603761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19615170 - 19615021
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||||    
T  19615170 atgtctacaatgaatatgagtgcgtagacttctcttgtcttcggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccttaat 19615071  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19615070 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 19615021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 22737950 - 22738099
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatt-tgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  22737950 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaataacataatcctaatcaaaccaagcttgaaaccctaat 22738049  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22738050 tttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacaggaatta 22738099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 317 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25786317 - 25786192
Alignment:
Q  317 gtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatc 416  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25786317 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccttattcttatgtaaccctagtttctaatc 25786218  T
Q  417 taaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||| | |||||||||||||||    
T  25786217 taaattcacctttttaacatgaatta 25786192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 6795053 - 6795202
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  6795053 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtcaaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaat 6795152  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  6795153 tttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaatatgaatta 6795202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 20105857 - 20105678
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||| |||||||||||||  | ||||||| | | |||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20105857 ctttttctgcttttgcttcggaaacaagctacatgttttgaccaaaaagcctgtggtttcttgtagaacaatctattgaatagttgcttaggttttaagt 20105758  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatc-ataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  20105757 cgacataagactataaatagagtagctagctatcaataac-attcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgt 20105678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 4188254 - 4188397
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  4188254 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 4188353  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  4188354 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 4188397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 15700295 - 15700438
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  15700295 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 15700394  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  15700395 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 15700438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 18854736 - 18854887
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  18854736 atgtctacaatgaacgttggtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 18854835  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18854836 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacataaatta 18854887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19075321 - 19075178
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  19075321 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 19075222  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  19075221 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 19075178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 5672053 - 5671903
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5672053 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtattaggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagatattgaccctaa 5671954  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5671953 tcttatgtaactctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 5671903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 124 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18195683 - 18195536
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  18195683 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctg 18195588  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18195587 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 18195536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20993745 - 20993595
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccct-aa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| ||    
T  20993745 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactattaaccctaaa 20993646  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20993645 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcacctttttaacatgaatta 20993595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 65 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19615421 - 19615285
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||| ||||||||| ||||||   | |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19615421 ctttggctgcttttacttcatgatctagcttcctgttttgaccgaaaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 19615322  T
Q  165 cgac-ataagactataaatagagtagctagctatcat 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19615321 cgacaataagactataaatagagtagctagctatcat 19615285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 22005878 - 22006021
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  22005878 tgtctacaatgaacatcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 22005977  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||| ||| || |||||||||    
T  22005978 ttatgtaaccctaattccttatctaaaatcaccgctttaacatg 22006021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22060989 - 22060846
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  22060989 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 22060890  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  22060889 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 22060846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22072070 - 22071927
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  22072070 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 22071971  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  22071970 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 22071927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 15153791 - 15153941
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||     
T  15153791 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggatagttggaaaagtcttaatgacataatcgtaatcaaaccaagctattgaccctag 15153890  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15153891 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 15153941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 15158249 - 15158399
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||     
T  15158249 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggatagttggaaaagtcttaatgacataatcgtaatcaaaccaagctattgaccctag 15158348  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15158349 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 15158399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12657296 - 12657147
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  12657296 atgtctatgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttaggtttgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaaccttaat 12657197  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  12657196 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 12657147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 25949434 - 25949583
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||    
T  25949434 atgtctacaatgaacgttagtgagtagattcttcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaagcaagccttaaaccctaat 25949533  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  25949534 tttatgtaaccctaatttctactctaaattcaccgttttaacatcaatta 25949583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 30671258 - 30671109
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||    
T  30671258 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaattacataatccaaatcaaaccaagatttaaaccttaat 30671159  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30671158 tttatgtaatcctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 30671109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12474518 - 12474375
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||     
T  12474518 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataattctaatcaaaccaagctttaaaccttaatt 12474419  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  12474418 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 12474375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14077321 - 14077170
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||  | ||| |    
T  14077321 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcataatcaaaccaagcttaaaacctta 14077222  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14077221 atcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 14077170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25402617 - 25402477
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||    
T  25402617 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtaactagccatcataaatattcatcttttgttctctg 25402522  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25402521 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 25402477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 27565822 - 27565679
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  27565822 tgtctacgatgaacgtcagtgactagacttctcttgtcttgggattgttggataattctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 27565723  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  27565722 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 27565679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23603271 - 23603120
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag--atttgacccta 390  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||  ||| ||    
T  23603271 atgtctacgatgatcattagtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctcttaaacctta 23603172  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  23603171 atcttatgtaaccctaatttctaatctaaatttaccgctttaacatgaatta 23603120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 220
Target Start/End: Original strand, 29093465 - 29093584
Alignment:
Q  100 ttttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29093465 ttttgacctaaaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgttata-gactataaatagagtagctagctatca 29093563  T
Q  200 taacaaatcatcttttgttct 220  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  29093564 taacaattcatcttttgttct 29093584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Original strand, 18844396 - 18844536
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    |||| |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  18844396 cttggggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctg 18844491  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18844492 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 18844536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Original strand, 24218650 - 24218790
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | |||||||||| |||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  24218650 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaataaagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctg 24218745  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24218746 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 24218790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 1626262 - 1626412
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgt-cttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||    
T  1626262 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctttttttcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaa 1626361  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1626362 ttttatgtaaccctagtttctattctaaattcaccgttttaacatggatta 1626412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 210305 - 210156
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||    |  |||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  210305 gtttcttgtggaacattctagtaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgtt 210206  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210205 ctctgaaataatgagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 210156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Original strand, 18448700 - 18448845
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctct 222  Q
    |||||||||||||| |||||  || |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||||    
T  18448700 cttgtggaacattccagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctct 18448799  T
Q  223 gaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18448800 gtaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 18448845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 294 - 438
Target Start/End: Original strand, 25775150 - 25775295
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa-gatttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||  | ||||||    
T  25775150 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttagataagtctaattacataatcctaatcaaagcaacccttaaatcctaat 25775249  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatga 438  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25775250 cttatttaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatga 25775295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 432
Target Start/End: Original strand, 18732455 - 18732594
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18732455 atgtctacgatgaacatgagtgagtag-cttctcttgtctttggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaatcaagatattgaccctaa 18732553  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttta 432  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  18732554 tcttatgtaactctaatctctaatctaaattcaccgtttta 18732594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 5152604 - 5152455
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa-gatttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| | ||  ||| ||||    
T  5152604 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacatgattctaatcaagccaaggcttaaaccttaat 5152505  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5152504 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 5152455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 18233795 - 18233710
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18233795 atgtctacaatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataatcaaaccaag 18233710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Original strand, 18854556 - 18854694
Alignment:
Q  126 tgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaa 225  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | |||||||||||||||||||||  ||| ||  | |||||||||||||||||||    
T  18854556 tgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccgtcacaaatattcatcttttgttctctgaa 18854651  T
Q  226 ataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18854652 atattaagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 18854694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19966625 - 19966476
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||  ||| ||||    
T  19966625 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagcaaagccttaaaccataat 19966526  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  19966525 attatgtaaccctagtttctcttctaaatttaccgttttaacatggatta 19966476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 412
Target Start/End: Original strand, 24218832 - 24218953
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttc-tcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  24218832 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 24218931  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttct 412  Q
    |||||||||||||||| |||||    
T  24218932 atcttatgtaaccctaatttct 24218953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 317 - 442
Target Start/End: Original strand, 18844580 - 18844708
Alignment:
Q  317 gtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgtaaccctagtttcta 413  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  18844580 gtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctcta 18844679  T
Q  414 atctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18844680 atctaaattcaccgttttaacatgaatta 18844708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 210114 - 209968
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| | | | || ||    
T  210114 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgatataatcctaatcaaatgaagctctaagcctta 210015  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| || |||||||||    
T  210014 atcttatgtaaccctaatttcttatctaagttcaccgctttaacatg 209968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 11607478 - 11607624
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  11607478 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 11607577  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  11607578 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 11607624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Original strand, 16470090 - 16470236
Alignment:
Q  297 tctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatctt 395  Q
    ||||| |||||| | |||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||| |||| ||    
T  16470090 tctacgatgaacatgagtgagtagaatcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcttaatcaaaccaagccttaaaccttaatttt 16470189  T
Q  396 atgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  16470190 gtgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttcacatgaatta 16470236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 18006427 - 18006573
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  18006427 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 18006526  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  18006527 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 18006573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 12442621 - 12442773
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaa--gatttgaccct 389  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    ||  ||| |    
T  12442621 atgtctacgatgaacatcagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaatcaaactcttaaacctt 12442720  T
Q  390 aatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  12442721 aatcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgctttgacatgaatta 12442773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 22601327 - 22601202
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||||||||    
T  22601327 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataatcaaaccaaactttaaaccctaat 22601228  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  22601227 tttatgtaaccctactttctaatcta 22601202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 300 - 418
Target Start/End: Original strand, 5399347 - 5399466
Alignment:
Q  300 acaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatg 398  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||||    
T  5399347 acaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaattttatg 5399446  T
Q  399 taaccctagtttctaatcta 418  Q
    ||| |||| |||||||||||    
T  5399447 taaacctattttctaatcta 5399466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 6479305 - 6479456
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  6479305 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 6479404  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  6479405 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 6479456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 6490726 - 6490877
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  6490726 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 6490825  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  6490826 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 6490877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20022263 - 20022112
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  20022263 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 20022164  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  20022163 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 20022112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 20164278 - 20164429
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  20164278 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 20164377  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  20164378 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 20164429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 20170975 - 20171126
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  20170975 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 20171074  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  20171075 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 20171126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22165016 - 22164865
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  22165016 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 22164917  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  22164916 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 22164865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 22244560 - 22244711
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  22244560 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 22244659  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  22244660 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 22244711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22766589 - 22766438
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  22766589 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 22766490  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  22766489 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 22766438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22773272 - 22773121
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  22773272 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 22773173  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  22773172 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 22773121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24854714 - 24854563
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   | | || ||    
T  24854714 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacgtaatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 24854615  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  24854614 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 24854563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24861373 - 24861222
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||   | | || ||    
T  24861373 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacgtaatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 24861274  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  24861273 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 24861222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25402435 - 25402284
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   || | ||| |    
T  25402435 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctta 25402336  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  25402335 atattatgtaaccctagtttctcttctaaatttaccgttttaacatggatta 25402284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 16738841 - 16738987
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  16738841 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacaaaatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 16738940  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  16738941 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 16738987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 17934516 - 17934662
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  17934516 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 17934615  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  17934616 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatg 17934662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19829085 - 19828939
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  19829085 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 19828986  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |||||| ||| ||||||||    
T  19828985 atcttatgtaaccctaatttcgtatctgaattcaccgtcttaacatg 19828939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 27323051 - 27322905
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctct-tgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  27323051 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccatgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 27322952  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  27322951 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 27322905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 18448887 - 18449036
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa-gatttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||   ||  ||| ||||    
T  18448887 atgtctacgatgaacattagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaatccttaaaccttaat 18448986  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  | |||||||  |||| ||||||| ||||    
T  18448987 attatgtaaccctagtttctcttataaattctccgttataacatggatta 18449036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 257
Target Start/End: Original strand, 4740890 - 4741045
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatag-ttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||  || ||||||  |||||||    ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4740890 tgacctaaaagcccgtagtttcttgtggaacattctagtgattatatttcttagggcttaagtcattgtaa-actataaatatagtagctagctatcata 4740988  T
Q  202 acaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtt-tctttgaataaaa 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4740989 acaattcatcttttgttctctgaaattaatagtgacaattgttctctttgaataaaa 4741045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 26138774 - 26138858
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26138774 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 26138858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20016098 - 20015947
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    | | || ||    
T  20016098 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaaccctaagcctta 20015999  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  20015998 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 20015947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 18107281 - 18107427
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | | | ||| |    
T  18107281 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaagccaagctataagcctta 18107380  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||    
T  18107381 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgcttaaacatg 18107427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22787168 - 22787022
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  22787168 atgtctacgataaacatgagtgagtagatttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 22787069  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  22787068 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 22787022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 25923360 - 25923222
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  25923360 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacatattcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaat 25923261  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     |||| |||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  25923260 tttatataaatctactttctaatctaatttcaccgtttt 25923222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23616345 - 23616212
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctct-tgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | | | || ||    
T  23616345 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctctatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaaactctaagcctta 23616246  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23616245 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattca 23616212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 296 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 19563814 - 19563730
Alignment:
Q  296 gtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19563814 gtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaag 19563730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 25507702 - 25507786
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  25507702 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtttaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 25507786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 25786548 - 25786464
Alignment:
Q  111 aagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgac-ataagactataaatagagtagctagc 194  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25786548 aagcccgtggtttcttgtgaaacattccagtgaatagttgcgtaggttttaagtcgactataagactataaatagagtagctagc 25786464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Original strand, 29093655 - 29093782
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatc-aaaccaag--atttgacccta 390  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||   ||  ||||||    
T  29093655 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattattggataagtctaattacgtaatcctaatcaaaaccaagcctttaaacccta 29093754  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||    
T  29093755 attttatgtaaccctaatttctaatcta 29093782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 326 - 406
Target Start/End: Original strand, 30245346 - 30245426
Alignment:
Q  326 tcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatcttatgtaacccta 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30245346 tcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcatagtcaaaccaagttttaaccctaatcttatgtaacccta 30245426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 316 - 437
Target Start/End: Original strand, 35271295 - 35271419
Alignment:
Q  316 agtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgtaaccctagtttct 412  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  35271295 agtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctcaatcttatgtaaccctaatttct 35271394  T
Q  413 aatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
     ||||||||||| || |||||||||    
T  35271395 tatctaaattcaccgctttaacatg 35271419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 17119611 - 17119762
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |  || |    
T  17119611 atgtctacgatgaacatgagtgagaagacttcttcgtgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaactaagctttaaatctta 17119710  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  17119711 atcttatgtaaccttaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgcatta 17119762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 25339211 - 25339088
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||  ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  25339211 atgtctacggtgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgagattgttggataagtttaatgacataatcctaatcaaaccaagtcttgaaccctaat 25339112  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatc 416  Q
     |||| |||  ||| |||||||||    
T  25339111 tttatataaatctactttctaatc 25339088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 297 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 18396470 - 18396348
Alignment:
Q  297 tctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaatctt 395  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||    
T  18396470 tctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggacaagtctaatgatttaatcctaatcaaaccaagccttgatccctaatttt 18396371  T
Q  396 atgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
    |||||| |||| |||| ||||||    
T  18396370 atgtaaacctattttccaatcta 18396348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20218449 - 20218311
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||    
T  20218449 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccataaaccctaat 20218350  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     |||| |||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  20218349 tttatataaatctactttctaatctaatttcaccgtttt 20218311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 22112474 - 22112336
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |  ||||||||    
T  22112474 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccataaaccctaat 22112375  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     |||| |||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  22112374 tttatataaatctactttctaatctaatttcaccgtttt 22112336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 302 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 14992241 - 14992124
Alignment:
Q  302 aatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgta 400  Q
    ||||||||| |||||||||||   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||| |||| ||    
T  14992241 aatgaacgtgagtgagtagacacttcttgtcttgggaatgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccctaattttatata 14992142  T
Q  401 accctagtttctaatcta 418  Q
    | |||| |||||||||||    
T  14992141 aacctaatttctaatcta 14992124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 295 - 442
Target Start/End: Original strand, 29596423 - 29596577
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag--atttgacccta 390  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||  ||| ||    
T  29596423 tgtctacgatgaacatgagtgagtagacttatctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcataatcaaaccaagctattaaacctta 29596522  T
Q  391 atc---ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||   ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  29596523 atctaattatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 29596577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Original strand, 32543169 - 32543285
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32543169 tgacctaaaagcccttggtttcttgtggaacatcctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgttata-gactataaatagagtagctagctatcataa 32543267  T
Q  203 caaatcatcttttgttct 220  Q
     || ||||||||| ||||    
T  32543268 taattcatcttttattct 32543285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 26018071 - 26018155
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  26018071 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctagtgatgtaatcctaatcaaaccaa 26018155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 26157444 - 26157528
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  26157444 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctagtgatgtaatcctaatcaaaccaa 26157528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 302 - 378
Target Start/End: Original strand, 32543359 - 32543435
Alignment:
Q  302 aatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32543359 aatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattggtggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 32543435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21560070 - 21559939
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgtaaccctagttt 410  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||  ||| || | |||| ||||||||||||    
T  21560070 agtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctgatcaagtcaagccttaaaccttagtattatataaccctagttt 21559971  T
Q  411 ctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21559970 ctcttctaaattcatcgttttaacatggatta 21559939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 103 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25923566 - 25923409
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    || ||||||  ||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25923566 tgacctaaaagcttgtggtttcttgtggaacattctagtgatgtatttcttagggcttaagtcaatgtaa-actataaatagagtagctagcaatcataa 25923468  T
Q  203 caaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||| ||||||||||||||  ||| | |  |||||||||||| | | | |||||||||||    
T  25923467 caattcatcttttgttcttggaattcaatagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 25923409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 4741096 - 4741181
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4741096 atgtctacgatgaacattagtgagtagactcttctttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 4741181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Original strand, 20222915 - 20222980
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20222915 tcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttatttt 20222980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21573856 - 21573707
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||||  ||  ||| || |    
T  21573856 atgtctacgatgaccattagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctgaccaagtcaagccttaaaccttagt 21573757  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     || | ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21573756 attgtataaccctagtttctcttctaaattcatcgttttaacatggatta 21573707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Original strand, 22116899 - 22116964
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22116899 tcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttatttt 22116964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 422
Target Start/End: Original strand, 29563406 - 29563540
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaag--atttgacccta 390  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||    
T  29563406 tgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgttttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaacctta 29563505  T
Q  391 atc---ttatgtaaccctagtttctaatctaaatt 422  Q
    |||   ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  29563506 atctaattatgtaaccctaatctctaatctaaatt 29563540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 20105603 - 20105519
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20105603 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtttaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 20105519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 23348264 - 23348176
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 260  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |   | ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23348264 agactataaatagagtagctagcaatcacatttattcatcttttgttctctgaaattaatagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 23348176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24545588 - 24545504
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24545588 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtattgagattgttggataagtctaataacgtaatcctaatcaaaccaa 24545504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 28734113 - 28733975
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||  | | ||| ||||    
T  28734113 atgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttatcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctgatcaaatcaagcctcgaaccttaat 28734014  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  28734013 tttatgtaaatctactttctaatctaatttcaccgtttt 28733975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 13168488 - 13168572
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13168488 atgtctacgatgaacattagtgagtagacttct-ttatcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaag 13168572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17793951 - 17793866
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||| || |||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17793951 atgtctataaagaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatccctatcaaaccaag 17793866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 12660414 - 12660331
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  12660414 tgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgatctaatccctatcaaaccaag 12660331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13217321 - 13217237
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13217321 tgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtttcgggattgttggataagtcgaatgacctaatcctaatcaaaccaag 13217237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 19993709 - 19993793
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19993709 atgtctactatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgaactaatcctaatcaaaccaa 19993793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 401
Target Start/End: Original strand, 29682721 - 29682828
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||   ||||||||    
T  29682721 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacctct-ttgtcatgagattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcatcgaaccctaat 29682819  T
Q  393 cttatgtaa 401  Q
    |||||||||    
T  29682820 cttatgtaa 29682828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12660546 - 12660479
Alignment:
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12660546 aatcatctttttttcttgaaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttatttt 12660479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23297392 - 23297313
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaa 373  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23297392 atgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcgtaatcaa 23297313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25339426 - 25339269
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||||||    ||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  25339426 tgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgatatattt-cttagggcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagcaatcaca 25339329  T
Q  202 acaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| | |  |||||||||||| | | | |||||||||||    
T  25339328 acaattcatcttttgttcttggaattcaatagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 25339269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Original strand, 25774950 - 25775093
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  25774950 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgtt 25775049  T
Q  219 ctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  25775050 cttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 25775093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Original strand, 26821967 - 26822098
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||  | | ||||||||    
T  26821967 atgtctacgatgaacataagtgagtagactcttcttatcttgggattgttgtatgagtctaatgacctaatcctaatcaaatcaagcctcgaaccctaat 26822066  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  26822067 tttatgtaaatctattttctaatctaatttca 26822098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 415
Target Start/End: Original strand, 20464490 - 20464611
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  ||  ||||||||    
T  20464490 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacatct-ttctcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcgttaaaccctaat 20464588  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
     ||||||||  ||| ||||||||    
T  20464589 tttatgtaaatctattttctaat 20464611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24545791 - 24545634
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    || |||||   |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24545791 tgacctaaaagcctgtgttttcttgtggaacattctagtgatgtatttcttagagcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagctatcacaa 24545693  T
Q  203 caaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||| ||||||||||||||  ||| | |  |||||||||||| | | | |||||||||||    
T  24545692 caattcatcttttgttcttggaattcaatagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 24545634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 433
Target Start/End: Original strand, 25615381 - 25615523
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | | | || ||    
T  25615381 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccatgctctaagcctta 25615480  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaa 433  Q
    |||||||||||| ||| ||||| || | |||||| || |||||    
T  25615481 atcttatgtaactctaatttcttatatgaattcaccgctttaa 25615523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 430
Target Start/End: Original strand, 18627540 - 18627679
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcc---taatcaaaccaagatttg-acccta 390  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||  | | ||||||    
T  18627540 tgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctaataatcaaaccaagcctcgaacccta 18627639  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttt 430  Q
    || |||| |||  ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  18627640 attttatataaatctactttctaatctaatttcaccgttt 18627679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 19570169 - 19570068
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  19570169 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatttaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgtt 19570070  T
Q  219 ct 220  Q
    ||    
T  19570069 ct 19570068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23517317 - 23517232
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| |  |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23517317 atgtctacgatgaacatgagtgagtagattcttcttgtcttgggattattggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaag 23517232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25031192 - 25031107
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25031192 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttatcttgggattgttggatgagtctaatgacataatcataatcaaatcaag 25031107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 378
Target Start/End: Original strand, 29254115 - 29254180
Alignment:
Q  313 gtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29254115 gtgagtagactcttcatgtcttgagattgttggataaatctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 29254180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16207844 - 16207749
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttt 267  Q
    |||||| |||||||| ||||||| | ||||   | |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  16207844 agactacaaatagagcagctagcaaacatattgagtcatcttttgttttcagaaattataagtgacaattgtttctttgaataaaatttctccttt 16207749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 391 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 19570053 - 19570002
Alignment:
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19570053 atcttatgtaatcctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 19570002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19612711 - 19612574
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||| || |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||||| || | ||||||||    
T  19612711 atgtcaacgatgaacataagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaacgacctaatcctagtcaagccaagcttcgaaccctaat 19612612  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     |||| |||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  19612611 tttatataa-tctactttctaatctaatttcaccgtttt 19612574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Original strand, 19993504 - 19993619
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||| |||||||    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19993504 tgacctaaaagctcgtggtttcttgtggaacattctagtgatatattt-cataggtcttaagtcattgtaa-actataa-tagagtagctagctatcata 19993600  T
Q  202 acaaatcatcttttgttct 220  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  19993601 acaattcatcttttgttct 19993619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 419
Target Start/End: Original strand, 20221302 - 20221426
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  | | ||||||||    
T  20221302 atgtctactatgaacatgagtgaataaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctcgaaccctaat 20221399  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaa 419  Q
    |||||||||   || ||||||||||||    
T  20221400 cttatgtaaatgtattttctaatctaa 20221426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 419
Target Start/End: Original strand, 22115286 - 22115410
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  | | ||||||||    
T  22115286 atgtctactatgaacatgagtgaataaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctcgaaccctaat 22115383  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaa 419  Q
    |||||||||   || ||||||||||||    
T  22115384 cttatgtaaatgtattttctaatctaa 22115410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 5949576 - 5949519
Alignment:
Q  385 accctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5949576 accctaatattatataaccctagtttctaatctaaattcaccgtttgaacatgaatta 5949519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 368
Target Start/End: Original strand, 9414498 - 9414570
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatccta 368  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9414498 tgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccta 9414570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 12658100 - 12658051
Alignment:
Q  223 gaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12658100 gaaataataagcgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttatttt 12658051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Original strand, 20221190 - 20221255
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  20221190 tcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttttttgaataagtgttcatctttatttt 20221255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Original strand, 22115174 - 22115239
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  22115174 tcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttttttgaataagtgttcatctttatttt 22115239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Original strand, 3923656 - 3923712
Alignment:
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3923656 aatcatcttttgttctctgaaattaatagtgacaattgttactttgaataaaagttc 3923712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 17522324 - 17522242
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||| |||||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17522324 tgtctacgatgaacatgagtaagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaag 17522242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 20464386 - 20464446
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttt 267  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20464386 tcatcttttgttcttgaaaattataagtgacaattgtttctttgaataaaagttctccttt 20464446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 394 - 442
Target Start/End: Original strand, 24511780 - 24511828
Alignment:
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24511780 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 24511828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 31965490 - 31965362
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaac----gttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accc 388  Q
    |||||||||||||||    || ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||||  | | ||||    
T  31965490 atgtctacaatgaacatgagtgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatctctatcaaaccaagtctcgaaccc 31965392  T
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
    | |||||||||||  ||| |||||||||||    
T  31965391 tgatcttatgtaaatctattttctaatcta 31965362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 245
Target Start/End: Original strand, 18993103 - 18993243
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||  |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18993103 tgacctaaaagcccatggtttcttgtggaacattctagtgatatattt-cttagggcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagctatcaca 18993200  T
Q  202 acaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgttt 245  Q
    || | ||||||||||||||  ||| | |  ||||||||||||||    
T  18993201 ac-attcatcttttgttcttggaattcaatagtgacaattgttt 18993243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 326 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23523889 - 23523790
Alignment:
Q  326 tcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||| |||| |||  ||| |||||||||||| ||||    
T  23523889 tcttgttttgggattgttggatgagtctaatgacttaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatataaatctactttctaatctaatttca 23523790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 261
Target Start/End: Original strand, 26821858 - 26821929
Alignment:
Q  190 ctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  26821858 ctagcaatcataataaatcatattttgttcttggaattaataagtgacaattatttcttttaataaaagttc 26821929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 31965626 - 31965575
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaag 258  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31965626 tcatcttttgttcttggaaattataagtgacaattgtttctttgaataaaag 31965575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20218574 - 20218528
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20218574 actataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttct 20218528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #158
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 174 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22112599 - 22112553
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22112599 actataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttct 22112553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #159
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 18973772 - 18973856
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||    
T  18973772 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttttcttaggattgttggatgagtttaatgacctaatccctatcaaaccaag 18973856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24392867 - 24392783
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || || |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  24392867 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacttctttt-tcataggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaag 24392783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #161
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25031295 - 25031238
Alignment:
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattg-tttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25031295 aatcatcttttgttctctgaaattaatagtgacaattgttttctttgaataaaagttc 25031238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 30671466 - 30671382
Alignment:
Q  111 aagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagc 194  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||||   | |||||||||||||||||||||    
T  30671466 aagcccgtcgtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagatttcaagtcgactgtaaactataaatagagtagctagc 30671382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 26017727 - 26017817
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataa-aagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagac-aagctgcctatttt 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||| || ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  26017727 gaatttgaagatcttgtgcaaaaatataacaagtggcgc-accccttttacccttttgctgcttttgtttcttcgacaaagctgcctatttt 26017817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 26157100 - 26157190
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataa-aagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagac-aagctgcctatttt 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| || |||| || ||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  26157100 gaatttgaagatcttgtgcaaaaatataacaagtggcgc-accccttttacccttttgctgcttttgtttcttcgacaaagctgcctatttt 26157190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 395 - 442
Target Start/End: Original strand, 32544764 - 32544811
Alignment:
Q  395 tatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  32544764 tatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgtttcaacatgaatta 32544811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #166
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 12658012 - 12657891
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||| || |||||   |||||||||||  | | ||||||||    
T  12658012 atgtcttcaatgaacgtgagtgagtagacttct-ttgtcctgggattgttggaagagtctaattacctaatcactatcaaaccaagtctcgaaccctaat 12657914  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
     ||||||||  ||| ||||||||    
T  12657913 tttatgtaaatctattttctaat 12657891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #167
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Original strand, 15162328 - 15162401
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatccta 368  Q
    ||||||| |||| || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  15162328 atgtctaaaatgcacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgatattgttggatgagtctaacgacctaatccta 15162401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #168
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 16207675 - 16207558
Alignment:
Q  302 aatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgta 400  Q
    ||||||| | || |||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||||||  |  ||||||||| |||| ||    
T  16207675 aatgaacatgagcgagtagacttat-ttgtcttgagattgttggttgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagtctcggaccctaattttatcta 16207577  T
Q  401 accctagtttctaatctaa 419  Q
    |  ||| ||||||||||||    
T  16207576 aatctattttctaatctaa 16207558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #169
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Original strand, 20223021 - 20223090
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataat 364  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  20223021 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggattagtcaaatgacgtaat 20223090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #170
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Original strand, 22117005 - 22117074
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataat 364  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  22117005 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggattagtcaaatgacgtaat 22117074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #171
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 103
Target Start/End: Original strand, 26138482 - 26138571
Alignment:
Q  15 aatttgaagatcttgtacaataatataa-aagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagac-aagctgcctatttt 103  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| | | ||| || ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  26138482 aatttgaagatcttgtgcaaaaatataacaagtggcgggccccttt-tacccttttgctgcttttgcttcttcgacaaagctgcctatttt 26138571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #172
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 72
Target Start/End: Original strand, 29253802 - 29253860
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgct 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||| |||| |||||||    
T  29253802 gaatttgaagatcttgtacaataatatgaaagtggcgcgccacattttacctttttgct 29253860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #173
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 32796479 - 32796406
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatccta 368  Q
    |||||||| |||||| | | | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  32796479 atgtctacgatgaacatgaattagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccta 32796406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18195457 - 18195404
Alignment:
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18195457 taatcttatgtaaccttaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 18195404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #175
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 274
Target Start/End: Original strand, 18973643 - 18973744
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttc-tttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||   ||| |||| |||||||  |||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||    
T  18973643 actataaatagagtagctagcaaacatattcaattatctcttgttcttggaaatttatagtgacaattgtttcttttgaataaaagttcatctttagttt 18973742  T
Q  273 at 274  Q
    ||    
T  18973743 at 18973744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #176
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23639817 - 23639693
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| | ||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||  | | ||||||||     
T  23639817 tgtctacgatgaacatgagtaagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaagcctagaaccctaatt 23639719  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaa 419  Q
    ||||||||   || ||||||||||||    
T  23639718 ttatgtaaatttattttctaatctaa 23639693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #177
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5152797 - 5152721
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  5152797 cttgtggaacattctagtgatgtagttgcttagattttaagtcgaatgtaacctataaatagagtagctagccatca 5152721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #178
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14077513 - 14077437
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14077513 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 14077437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 218
Target Start/End: Original strand, 18627406 - 18627450
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  18627406 actataaatagagtagctagcaatcacaacaattcatcttttgtt 18627450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 34108951 - 34108868
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||  ||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  34108951 tgtctacaatgaacatgagtgaatagatctct-ttgtcttgggattgttgaatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaag 34108868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #181
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 424
Target Start/End: Original strand, 3923757 - 3923880
Alignment:
Q  302 aatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaatcttatgta 400  Q
    ||||||| | ||||||||||||  |||||||||   |||||||||| ||||||||| | |||| |  |||||||||||  | | |||||||| |||| ||    
T  3923757 aatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttagaattgttggatgagtctaatggcctaattcctatcaaaccaagcctcgaaccctaattttatata 3923856  T
Q  401 accctagtttctaatctaaattca 424  Q
    |  ||| |||||||||||||||||    
T  3923857 aatctattttctaatctaaattca 3923880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #182
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12660694 - 12660655
Alignment:
Q  64 ccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctatttt 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12660694 ccttttgctgcttttgcttcttcgacaagctgcctatttt 12660655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5672251 - 5672109
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||| | |||| ||  | ||||||||| |||    
T  5672251 tttcttgtggaacattttagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctacccatcacaaatagtcatcttttattc 5672152  T
Q  220 tctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  5672151 ttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 5672109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12657483 - 12657412
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12657483 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 12657412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19561075 - 19560998
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  19561075 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcat 19560998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19966818 - 19966742
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgac-ataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  19966818 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatataaca-tataaatagagtagctagccatca 19966742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21237906 - 21237838
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataat 364  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  21237906 tgtctacgatgaacatgagtgagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtcttatgacctaat 21237838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 245
Target Start/End: Original strand, 26017930 - 26017966
Alignment:
Q  208 catcttttgttctctgaaataataagtgacaattgttt 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26017930 catcttttgttct-tgaaataataagtgacaattgttt 26017966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 245
Target Start/End: Original strand, 26138684 - 26138720
Alignment:
Q  208 catcttttgttctctgaaataataagtgacaattgttt 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26138684 catcttttgttct-tgaaataataagtgacaattgttt 26138720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 245
Target Start/End: Original strand, 26157303 - 26157339
Alignment:
Q  208 catcttttgttctctgaaataataagtgacaattgttt 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26157303 catcttttgttct-tgaaataataagtgacaattgttt 26157339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 272
Target Start/End: Original strand, 29682603 - 29682668
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||| ||||  |||||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  29682603 tcatcttttattcttggaaattctaagtgacaattatttctttggataaaagttcttctttatttt 29682668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #192
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 63 - 103
Target Start/End: Original strand, 17739489 - 17739529
Alignment:
Q  63 cccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctatttt 103  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  17739489 cccttttgctgcttttgcctcttcgacaagctgcctatttt 17739529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 129)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 65 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43701785 - 43701575
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43701785 cttttgctgcttttgcttcggaaacaagctacctattttgatctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 43701686  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc 264  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43701685 cgacataaggctataactagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttatctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc 43701586  T
Q  265 tttattttatg 275  Q
    |||||||||||    
T  43701585 tttattttatg 43701575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 121 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24125385 - 24125059
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||| ||    | |||||||||| |||||||||| |||| ||  |  ||||||||||||    
T  24125385 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagttgaatgtaaactataaataaagtagctagccatcacaaatatccatcttttgttc 24125286  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnn---atgtctacaatgaacgttagtga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||    
T  24125285 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttattttatgttcttcttcttcttcccttctatgtctacaatgaacgttagtga 24125186  T
Q  317 gtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  24125185 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaagccaagctttaaaccctaattttatgtaaccctagtttctctt 24125086  T
Q  416 ctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24125085 ctaaattcaccgttttaacatggatta 24125059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 120 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11889136 - 11888812
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  11889136 gtttcttgtggaacattctagcgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgtt 11889037  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacc-tttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgag 317  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||                  ||||||||||||||||||||||||    
T  11889036 cttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaatatttattttatgttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttagtgag 11888937  T
Q  318 tagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatc 416  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||  |||||||||| |||| |||||||||    
T  11888936 tagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagccaagcctttaaccctgttcttatgtaatcctaatttctaatc 11888837  T
Q  417 taaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||||| || ||||||||||||||    
T  11888836 t-aattcaccgctttaacatgaatta 11888812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 124 - 442
Target Start/End: Original strand, 18286926 - 18287246
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  18286926 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctg 18287021  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnn---atgtctacaatgaacgttagtgagtag 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||    
T  18287022 aaataataagtgacaattctttctttgaataaaagttcacttttattttatgttcttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttagtgagtag 18287121  T
Q  321 acttc-tcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatct 417  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| || | |||||| |    
T  18287122 acttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccataatctctaattt 18287221  T
Q  418 aaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||| || ||||||||||||||    
T  18287222 aaattcaccgctttaacatgaatta 18287246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16954130 - 16953934
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16954130 cttttgctgcttttgcttcgga-acaagctacctattttgacataaaagctcgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 16954032  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  16954031 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaattcatcttttgttattggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 16953934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 13622403 - 13622551
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||    
T  13622403 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacaaaatcctaatcaaaccaagccttaaccttaatc 13622502  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13622503 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 13622551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 120 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20059320 - 20058993
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  20059320 gtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgaatgtaaactataaatagagtaactagtcatcacaacaaatcatcttttgttc 20059221  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg---nnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     ||||||||||||||||| ||||     
T  20059220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgttcttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgtgagtgg 20059121  T
Q  317 gtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgtaaccctagtttctaa 414  Q
    |||||||  ||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| |||| |||  ||| |||||||    
T  20059120 gtagactcttctagtcttgggattgttgggtaaatctaaatgacataaccctaatcaaaccaagcattgaacccaaattttatataaatctactttctaa 20059021  T
Q  415 tctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20059020 tctaaattcatcgttttcacatgaatta 20058993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 31593704 - 31593974
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatac-ccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattt---------t 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| || ||| |||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||          |    
T  31593704 gaatttgaagatcttgtacaaatatatacaagaggcgcgccccactttagtccttttgctgcttttgctttctagacaagctaactattaatttatttct 31593803  T
Q  104 gacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataac 203  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31593804 gacctaaaagcccttggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgttata-gactataaatagagtaactagctatcataac 31593902  T
Q  204 aaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31593903 aattcatcttttgttctttgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacttttattttatg 31593974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 243
Target Start/End: Original strand, 9857065 - 9857244
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9857065 cttttgctgcttttgcttcatgaacaagctgcctattttgatcgaaaagcacgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgctaaggttttaagt 9857164  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgt 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  9857165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcattaacattcatcttttattctcggaattcaataagtgacaattgt 9857244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 39966 - 39769
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39966 cttttgatgcttttgcttcatggacaagctgcctattttcacctaaaagccagtgttttcgtgtggaacattctagtgaatagttgcttagattttaagt 39867  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  | ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  39866 cgacataagactataaatagagtagctaactatcattaacattcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 39769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 16952005 - 16952155
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaa 391  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||    
T  16952005 atgtctacaataaacgttagtgagtagacttctcttgttttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 16952104  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16952105 tcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatgaatta 16952155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 9945051 - 9945200
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||    
T  9945051 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctattgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccctaat 9945150  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  9945151 cttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgtttcaacatgaatta 9945200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 39043466 - 39043317
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  39043466 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtctttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaat 39043367  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39043366 cttacgtaaccctagtttataatctaaattcaccgttttaacatgaatta 39043317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 442
Target Start/End: Original strand, 3392055 - 3392203
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||    
T  3392055 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaggctttaaaccttaatc 3392154  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  3392155 ttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 3392203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8091877 - 8091730
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || | |||||||    
T  8091877 atgtctacgatgaacatgagtgagtatacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacaaaatcctaatcaaaccaag-cttaaacctaatc 8091779  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8091778 ttatataaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 8091730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 294 - 436
Target Start/End: Original strand, 3419167 - 3419310
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  3419167 atgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 3419266  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacat 436  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  3419267 cttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacat 3419310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 26811235 - 26811378
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  26811235 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 26811334  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  26811335 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 26811378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17484389 - 17484239
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17484389 atgtttacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaa 17484290  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17484289 tcttatgtaaccctaatctctattctaaattcaccgttttaacatgaatta 17484239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 260
Target Start/End: Original strand, 7197080 - 7197276
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7197080 cttttgctgcttttgcttcggaaacaagctacctgttttgaccaaaaagcccgtggtttcttgtagaacattctattgaatagttgcttaggttttaagt 7197179  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatc-ataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 260  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | ||||||||||    
T  7197180 cgatataagactataaatagagtagctagctatcaataac-attcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagtt 7197276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14653463 - 14653314
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  14653463 atgtctacgatgaacactagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 14653364  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  14653363 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 14653314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 6518482 - 6518626
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  6518482 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 6518581  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    || || |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  6518582 ctcatataaccctaatttcttatctaaattcacccctttaacatg 6518626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 3355363 - 3355514
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  3355363 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 3355462  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3355463 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 3355514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 3371730 - 3371873
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  3371730 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 3371829  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  3371830 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 3371873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 5717499 - 5717642
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| |||||    
T  5717499 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccttaatc 5717598  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  5717599 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 5717642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11902751 - 11902625
Alignment:
Q  148 ttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttct 247  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11902751 ttgcttaggttttaagtcgttata-gactataaatagagtagctagctatcataacaattcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttct 11902653  T
Q  248 ttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||    
T  11902652 ttaaataaaagttcacatttattttatg 11902625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 16683472 - 16683615
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  16683472 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 16683571  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  16683572 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 16683615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 18078791 - 18078934
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  18078791 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 18078890  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  18078891 ttatctaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 18078934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18080931 - 18080788
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||    
T  18080931 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccctaatc 18080832  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||    
T  18080831 ttatgtaaccctaattcgttatctaaattcaccgctttaacatg 18080788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 36654332 - 36654189
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||    
T  36654332 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccatgctttaaaccttaatc 36654233  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  36654232 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 36654189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 48641797 - 48641947
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||    
T  48641797 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaatatttaaaccttaa 48641896  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48641897 tcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacataaatta 48641947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 303 - 437
Target Start/End: Original strand, 10631487 - 10631622
Alignment:
Q  303 atgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaa 401  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||    
T  10631487 atgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaattttatgtaa 10631586  T
Q  402 ccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10631587 ccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 10631622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 7197334 - 7197483
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  7197334 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataattctaatgacttaatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaat 7197433  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  7197434 tttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgtttgaacatgaatta 7197483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14690812 - 14690668
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  14690812 atgtctacgatgaacactagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 14690713  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||| |||||||||  | ||||||||||||||| || |||||||||    
T  14690712 cttttgtaaccctgatctctaatctaaattcaccgctttaacatg 14690668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Original strand, 21275158 - 21275313
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    ||||||||||||||||| |||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  21275158 tttcttgtggaacattccagtgatgtaattgcttagattataagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 21275257  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21275258 tctgaaataataagggacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 21275313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 124 - 275
Target Start/End: Original strand, 3355191 - 3355338
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||| |     
T  3355191 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctata 3355286  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3355287 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 3355338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 7897500 - 7897354
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  7897500 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 7897401  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  7897400 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 7897354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 12845016 - 12845162
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  12845016 atgtctacaatgaatgttagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 12845115  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  12845116 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 12845162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Original strand, 10731251 - 10731376
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  10731251 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacccttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccctaat 10731350  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  10731351 tttatgtaaccctaatttctaatcta 10731376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Original strand, 10945020 - 10945145
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||    
T  10945020 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacccttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaaccctaat 10945119  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  10945120 tttatgtaaccctaatttctaatcta 10945145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11902600 - 11902475
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  11902600 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgccttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaat 11902501  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||||||| |||||||||||    
T  11902500 tttatgtaaccctaatttctaatcta 11902475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 21275365 - 21275514
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||  ||| ||||    
T  21275365 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgtttgttaagtctaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccttaat 21275464  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21275465 tttatgtaaccttagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 21275514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 440
Target Start/End: Original strand, 25146354 - 25146503
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  25146354 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 25146453  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaat 440  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25146454 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaat 25146503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Original strand, 16951834 - 16951977
Alignment:
Q  128 tggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat 227  Q
    ||||||||||||||||    |||| ||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  16951834 tggaacattctagtga----ttgcctagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctgaaat 16951929  T
Q  228 aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16951930 aataagtgacaattgtttctttgaataacagttcacctttattttatg 16951977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 55798447 - 55798591
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | | || ||||    
T  55798447 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaat 55798546  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  55798547 cttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 55798591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16217809 - 16217658
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | ||| |    
T  16217809 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaatctttaaacctta 16217710  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  16217709 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 16217658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 18242306 - 18242457
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  18242306 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgccttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 18242405  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  18242406 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 18242457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 10559011 - 10559157
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  10559011 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctataagcctta 10559110  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  10559111 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcactgttttaacatg 10559157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 10637722 - 10637868
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  10637722 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 10637821  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10637822 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 10637868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 10651113 - 10651259
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  10651113 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 10651212  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10651213 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 10651259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 43701550 - 43701400
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaa 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  43701550 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaaccaagcattgagccctaa 43701451  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43701450 ttttatataaatctactttctaatctaaattcaccgttttaacatgtatta 43701400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Original strand, 6518291 - 6518440
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||    |  ||||||||| |||||||||  |||| ||  | ||||||||||||    
T  6518291 gtttcttgtggaacattctagtaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaataaagtagctaggcatcacaaatattcatcttttgtt 6518390  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6518391 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 6518440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 18984123 - 18984268
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||    
T  18984123 tgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaa 18984222  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  18984223 tcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 18984268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 56580031 - 56579886
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||    
T  56580031 tgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaa 56579932  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  56579931 tcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 56579886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 42709206 - 42709062
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| | | | || ||||    
T  42709206 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaggcaagctctaagccttaat 42709107  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  42709106 cttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 42709062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 22105049 - 22105200
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  22105049 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 22105148  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  22105149 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 22105200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 10732865 - 10733011
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  10732865 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 10732964  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10732965 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 10733011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 10946634 - 10946780
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  10946634 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 10946733  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  10946734 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 10946780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 15248427 - 15248573
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  15248427 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 15248526  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  15248527 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 15248573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Original strand, 16227155 - 16227301
Alignment:
Q  297 tctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatctt 395  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||  ||| |||| ||    
T  16227155 tctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgagataatcctaatcaagccaagccttaaaccttaatttt 16227254  T
Q  396 atgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16227255 atgtaaccctagtttctcttctaaattcactgttttaacatggatta 16227301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 16392783 - 16392933
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||  |||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||     
T  16392783 atgtctatgatgaacatgagtgagtagacttcttttctcttgggattgttggataagttttaatgacataatcctaatcaaatcaagttattaaccctag 16392882  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16392883 tcttatgtaaccctaatctctaatctaatttcaccgttttaacatgaatta 16392933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 21420684 - 21420830
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  21420684 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 21420783  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  21420784 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 21420830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Original strand, 9857320 - 9857445
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||    
T  9857320 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaaaccctaat 9857419  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||    
T  9857420 tttacgtaaccctaatttctaatcta 9857445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21102396 - 21102247
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||||||    |   ||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  21102396 gtttcttgtggaacattctagtaatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgttataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgtt 21102297  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21102296 ctcttaaataataagtgacaattatttctttgaataaaagttcaccttta 21102247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3275 - 3124
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  3275 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 3176  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  3175 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 3124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 10684751 - 10684902
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  10684751 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 10684850  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  10684851 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 10684902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 10898391 - 10898542
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  10898391 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 10898490  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  10898491 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 10898542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11496081 - 11495930
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  11496081 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 11495982  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  11495981 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 11495930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 13823661 - 13823812
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  13823661 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 13823760  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  13823761 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 13823812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 26293341 - 26293492
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  26293341 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 26293440  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  26293441 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 26293492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 40845081 - 40844930
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  40845081 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 40844982  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  40844981 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 40844930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 7661 - 7515
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  7661 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaatccaagctctaagcctta 7562  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  7561 atcttatgcaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 7515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15124218 - 15124072
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  15124218 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttttccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 15124119  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  15124118 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 15124072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 18563551 - 18563697
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  18563551 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttagataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 18563650  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  18563651 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 18563697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 174 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 33331109 - 33331016
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttt 267  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33331109 actataaatagagtagctagcaaacatatcaaatcatctattgttctctgaaattataagtgacaattatttctttgaataaaagttctccttt 33331016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 3772289 - 3772082
Alignment:
Q  177 ataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctct--gaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttca-cctttatttta 273  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3772289 ataaatagagtagctagcaatcacaacaaataatcttttgtgttcttggaaataataagtgacaattgcttctttgaataaaagttcaccctttatttta 3772190  T
Q  274 tg---nnnnnnnnnnnnnnnnnnatgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaat 370  Q
    ||                     |||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3772189 tgttcttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttagtgagtagtttcttcttgtcttggaattgttggataagtcttatgacgtaatcctaat 3772090  T
Q  371 caaaccaa 378  Q
    ||||||||    
T  3772089 caaaccaa 3772082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 437
Target Start/End: Original strand, 15305363 - 15305491
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgtaaccctagt 408  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| ||||||||||||||||| |    
T  15305363 agtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaat 15305462  T
Q  409 ttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  15305463 ttcttatctgaattcaccgttttaacatg 15305491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 7870961 - 7871112
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  7870961 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcctgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 7871060  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  7871061 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 7871112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 15255054 - 15255200
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  15255054 atgtctacgatgaccatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 15255153  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | | ||||||||    
T  15255154 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccatcttaacatg 15255200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15259598 - 15259452
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  15259598 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattattggataagtctaaattacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 15259499  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  15259498 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 15259452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 15266220 - 15266074
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  15266220 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattattggataagtctaaattacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 15266121  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  15266120 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 15266074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 15302115 - 15302261
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | | || ||    
T  15302115 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 15302214  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  15302215 atcttatataaccctaatttcttatctgaattcaccgttctaacatg 15302261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 11504963 - 11504830
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  11504963 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacatctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 11504864  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11504863 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattca 11504830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 16953885 - 16953760
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||    
T  16953885 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggatagttggataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagctttaaaccctaat 16953786  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     |||||||| |||| |||||| ||||    
T  16953785 tttatgtaatcctactttctattcta 16953760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 17996246 - 17996396
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt--gaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||   ||| |||    
T  17996246 atgtctacgatgaacataagtgagtagacttcttatatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaggtcaagccttaaaaccttaa 17996345  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17996346 tattatgtaaccttagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 17996396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 15866247 - 15866396
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||  ||  | | ||||    
T  15866247 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttattatgtcttgggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaagttaagccttaaagcttaat 15866346  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15866347 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 15866396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 24125479 - 24125411
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24125479 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgccccgttatacccttttgctgcttttgctt 24125411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 267
Target Start/End: Original strand, 5675432 - 5675527
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttt 267  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  5675432 agactataaatagagaagctagcaaacatattgaatcatcttttgttctctgaaattataagtgacaactgtttctttgaataaatgttctccttt 5675527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 31593999 - 31594148
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaa 391  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||| |||| ||    
T  31593999 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagattcttcttgtcttgagattgttgggtaagtctaaatgacataaccctaatcaaatcaagccttgaaccccaa 31594098  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||| |||  | | |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  31594099 ttttatataaatc-attttctaatataaattcaccgttttcacatgaatta 31594148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 12347485 - 12347569
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12347485 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaag 12347569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21102205 - 21102124
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21102205 atgtctacaatgaatcttagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaa 21102124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Original strand, 38652270 - 38652406
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||  | || ||||||     
T  38652270 atgtctacaatgaacgtgagtgattagactcttcttgtcttgtgattgttggatgagtctgatgacctaatcataatcaaactaagcctcgaacctaatt 38652369  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
    ||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  38652370 ttatgtaa-actattttctaatctaatttcaccgtttt 38652406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 12808158 - 12808074
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12808158 atgtctacgatgaacatgagtgagtatactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 12808074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12808357 - 12808215
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||    | ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  12808357 gtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaagttttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctaaccatcacaacaaatcatcttttgttc 12808258  T
Q  220 tctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |  ||| | ||||||||| |||||| | | | |||||||||||    
T  12808257 ttggaattcaataagtgagaattgtctttctcaataaaagttc 12808215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 328 - 440
Target Start/End: Original strand, 41400627 - 41400741
Alignment:
Q  328 ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaa 425  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| | | | || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  41400627 ttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagctaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcac 41400726  T
Q  426 cgttttaacatgaat 440  Q
    || ||||||||||||    
T  41400727 cgctttaacatgaat 41400741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39712 - 39631
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 375  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  39712 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataggtctaatgacgtaatcctaatcaaac 39631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Original strand, 5675580 - 5675705
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  | | ||||||||    
T  5675580 atgtctacaatgaacatgtgtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaagcctcgaaccctaat 5675679  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||    
T  5675680 tttatgtaaatctattttctaatcta 5675705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Original strand, 10731063 - 10731179
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10731063 tgacctaaaagcccatgatttcttgtggaacattctaatgatgtattgcttaggttttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagctatcacaa 10731161  T
Q  203 caaatcatcttttgttct 220  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10731162 caattcatcttttgttct 10731179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Original strand, 10944832 - 10944948
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| |||||  || ||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10944832 tgacctaaaagcccatgatttcttgtggaacattctaatgatgtattgcttaggttttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagctatcacaa 10944930  T
Q  203 caaatcatcttttgttct 220  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  10944931 caattcatcttttgttct 10944948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13883443 - 13883359
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||  |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13883443 atgtctaagatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaag 13883359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Original strand, 15409866 - 15409931
Alignment:
Q  17 tttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15409866 tttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcacgccccattatacccttttgttgcttttgctt 15409931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 21275064 - 21275132
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21275064 gaatttgaagatcttgttcaataatataaaagtggcatgccccattatacccttttgctgcttttgctt 21275132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 271
Target Start/End: Original strand, 38652153 - 38652220
Alignment:
Q  204 aaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattt 271  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38652153 aaatcatcttttgttattggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatccttattt 38652220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 40563815 - 40563741
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcct 367  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40563815 atgtctacgatgaacatcagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcct 40563741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 23793567 - 23793460
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaatcttatgtaaccctagttt 410  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||  | | |||||||||||||||||  ||| |||    
T  23793567 agtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaatccaagcctcgaaccctaatcttatgtaaatctatttt 23793469  T
Q  411 ctaatctaa 419  Q
    |||||||||    
T  23793468 ctaatctaa 23793460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 11922418 - 11922293
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||  |||| | ||| ||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||||    
T  11922418 atgtctacaatgaacatgagtgggtagactcttcttattttgggatagatggatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagcctcgaaccctaat 11922319  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||    
T  11922318 tttatgtaaatctattttctaatcta 11922293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11922521 - 11922461
Alignment:
Q  212 ttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  11922521 ttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttcttttaataaaagttcttctttatttt 11922461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 8092076 - 8091933
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||    
T  8092076 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttatt 8091977  T
Q  219 ctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  8091976 cttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 8091933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 5513753 - 5513663
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||| || ||||||  | ||||   ||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5513753 agactataaataaagcagctagaaaacatattcaatcatcttttgttcttgtaaattaataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 5513663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 12345930 - 12345805
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||   || ||||||||  | | ||||||||    
T  12345930 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttttcttgggattgttagatgagtctaatgacctaatcgctattaaaccaagcctcgaaccctaat 12345832  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaa 419  Q
     ||||||||  ||| ||||||||||||    
T  12345831 tttatgtaaatctattttctaatctaa 12345805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23793673 - 23793614
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttt 267  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23793673 tcatcttttgttcttggaaattataagtg-caattgtttctttgaataaaagttcatcttt 23793614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 39043666 - 39043523
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| |   | ||||||||| ||    
T  39043666 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttaaattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacatatattcatcttttatt 39043567  T
Q  219 ctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  39043566 cttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 39043523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 45233954 - 45233920
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtgg 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45233954 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtgg 45233920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 13510794 - 13510674
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||  |||||||||||  | | ||||||||     
T  13510794 tgtctacgatgaacatgagtgagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgaatctgatgacctaatccctatcaaaccaagcctagaaccctaatt 13510696  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
    ||||||||  ||| ||||||||    
T  13510695 ttatgtaaatctattttctaat 13510674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 431
Target Start/End: Original strand, 55267695 - 55267831
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||  | |||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||| ||||  | || ||||||||    
T  55267695 tgtctacgatgaatatgagtgagtagatttc-cttgttttgggattgttggatgagtctaatgacttaattcctatcaaatcaagcctagaaccctaatc 55267793  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
    |||| |||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  55267794 ttatttaaatctattttctaatctaatttcatcgtttt 55267831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 362 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 40560506 - 40560427
Alignment:
Q  362 aatcctaatcaaaccaagatttga--ccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaa 439  Q
    |||||||||||||||||| | | |  || ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  40560506 aatcctaatcaaaccaagctcttaaaccttaatcttatataaccctaatttttaatctaaattcaccgctttaacatgaa 40560427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40567315 - 40567239
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagct 195  Q
    |||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||    |  |||||||||||||||||||||    
T  40567315 gtttcttgtggaacattctagtaaagtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagct 40567239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9487155 - 9487053
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctga-aataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatt 270  Q
    ||||||||||||||| || |||| | ||||   | |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9487155 agactataaatagagcaggtagcaaacatattcattcatcttttgttct-tgagaattctaagtgacaattatttctttgaaaaaaatatcacctttatt 9487057  T
Q  271 ttat 274  Q
    ||||    
T  9487056 ttat 9487053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 220
Target Start/End: Original strand, 13622291 - 13622334
Alignment:
Q  177 ataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13622291 ataaatatagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttct 13622334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Original strand, 3418991 - 3419062
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3418991 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 3419062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 9717736 - 9717611
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||| ||| |||||| | |||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||  |  ||| |||||    
T  9717736 atgtatacgatgaacatgagtgagtaaacttct-ttgtcttggtattgttggatgagtctaatgatctaatccctatcaaaccaagcctcggactctaat 9717638  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaa 419  Q
    |||||||||  | | ||||||||||||    
T  9717637 cttatgtaaatcaattttctaatctaa 9717611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Original strand, 10631301 - 10631372
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  10631301 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 10631372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 408 - 442
Target Start/End: Original strand, 11048535 - 11048569
Alignment:
Q  408 tttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11048535 tttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 11048569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 232 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12346002 - 12345958
Alignment:
Q  232 agtgacaattgttt--ctttgaataaaagttcacctttattttat 274  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12346002 agtgacaattgttttcctttgaataaaagttcatctttattttat 12345958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 379
Target Start/End: Original strand, 21276772 - 21276821
Alignment:
Q  330 gtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21276772 gtcttgggattgttggaatagtctaatgacttaatcctattcaaaccaag 21276821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15048230 - 15048147
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||||| | | | |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15048230 tgtctacaatcatcatgagtgagtatactt-tctagtcttgggattgttggaatagtctaatgactaaatcctattcaaaccaag 15048147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Original strand, 15106194 - 15106277
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||||| | | | |||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  15106194 tgtctacaatcatcatgagtgagtatactt-tctagtcttgggattgttggaatagtctaatgactaaatcctattcaaaccaag 15106277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Original strand, 15409976 - 15410052
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15409976 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagcgatca 15410052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17484580 - 17484504
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17484580 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 17484504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 23793781 - 23793737
Alignment:
Q  99 attttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga 143  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  23793781 attttgacctaaaagcccatggtttcttgtggaacattctattga 23793737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 148)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23140239 - 23140033
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  23140239 gaattcgaagatcttgtacaataataaaaaagtggcgcgccccattatacccttttgctgcttctgcttctgagacaaggtacctattttgacctaaaag 23140140  T
Q  114 cctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctt 213  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23140139 cccatggtttcttctggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaattcatctt 23140040  T
Q  214 ttgttct 220  Q
    |||||||    
T  23140039 ttgttct 23140033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 99 - 442
Target Start/End: Original strand, 23340485 - 23340827
Alignment:
Q  99 attttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatc 198  Q
    ||||||||| | ||||| |  |||| ||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||| | |    
T  23340485 attttgaccgaaaagcccgcagttttttgtggagcattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccaac 23340584  T
Q  199 ataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttca-cctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnatgt 297  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||                  ||||    
T  23340585 acaacaaatcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaacctttattttatgttcttcttctcctct---atgt 23340681  T
Q  298 ctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatctta 396  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| |||    
T  23340682 ctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatttta 23340781  T
Q  397 tgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23340782 tgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 23340827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23552029 - 23551823
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||| |||    
T  23552029 gaattcgaagatcttgtacaataataaaaaagtggcgcgccccattatacccttttgctgcttctgcttctgagacaaggtacctattttgacctaaaag 23551930  T
Q  114 cctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctt 213  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23551929 cccatggtttcttctggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaattcatctt 23551830  T
Q  214 ttgttct 220  Q
    |||||||    
T  23551829 ttgttct 23551823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 24507143 - 24507350
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24507143 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgccccattatacctttttcctgctttttcttcatagacaagctgcctattttgacctaaaag 24507242  T
Q  114 cctg-tggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatct 212  Q
    || | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||    
T  24507243 cccgttgttttgttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagttgacataagactataaataaagtagttagctatcacaacaattcatct 24507342  T
Q  213 tttgttct 220  Q
    ||||||||    
T  24507343 tttgttct 24507350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 124 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 5499929 - 5499610
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||||     
T  5499929 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctcta 5499834  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnn---atgtctacaatgaacgttagtgagtag 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||||||    
T  5499833 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgttcttcttcttcttctcttctatgtctacaatgaacgttagtgagtag 5499734  T
Q  321 acttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| || | |||||||||    
T  5499733 acttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccttaatctctaatcta 5499634  T
Q  419 aattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||| || ||||||||| ||||    
T  5499633 aattcaccgctttaacatggatta 5499610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 24177898 - 24177702
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177898 cttttgctgcttttgcttgatggacaagctgcctattttgacctaaaagcccgtggtttcttgtgga-cagtctagtgaatagttgcttaggttttaagt 24177800  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  24177799 cgatataagactataaatagagtagctagctatcataacatttcatcttttgttcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 24177702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 294 - 439
Target Start/End: Original strand, 36684408 - 36684554
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36684408 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccctaatc 36684507  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaa-cgttttaacatgaa 439  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36684508 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaaccgttttaacatgaa 36684554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 65 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 30949487 - 30949290
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30949487 cttttgctacttttgcttcatgatcaagctgcctgttttgaccgaaaagtctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 30949388  T
Q  165 cgac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| | | | ||||||||||    
T  30949387 cgacaataagactataaatagagtagctagctatcataacaattcatcttttgttcttcgaattcaataagtgacaattgtctttctaaataaaagtt 30949290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 24507416 - 24507564
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24507416 atgtctacaatgaacgttaatgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatc 24507515  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  24507516 ttatgtaaccctagtttctaatccaaattcaccgttttaacatgaatta 24507564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25370315 - 25370167
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  25370315 atgtctacgatgaacatgagtgaatatacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatc 25370216  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25370215 ttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 25370167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Original strand, 27744918 - 27745116
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||| |||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27744918 cttttgctacttttgcttcataaactagctacctgtttagaccaaaaagtccgtggtttcttgtggaacgttctagtgaatagttgcttaggttttaagt 27745017  T
Q  165 cgac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  27745018 cgacaataagactataaatagagtagctagctatcataacaattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 27745116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 275
Target Start/End: Original strand, 20281961 - 20282133
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20281961 tgacctaaaagcccttggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttagggtttaagtcgatata-gactataaatagagtagctggctatcacaa 20282059  T
Q  203 caaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatg 275  Q
    ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20282060 caattcatcttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaacctttattttatg 20282133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 20282158 - 20282307
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaat 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  20282158 atgtctaaaatgaacgttagtgagtagacttctattgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaat 20282257  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  20282258 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcactattttaacatgaatta 20282307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23798392 - 23798243
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaat 392  Q
    |||||||  |||||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23798392 atgtctatgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtctggagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaat 23798293  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23798292 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcacagttttaacatgaatta 23798243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 27745177 - 27745325
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27745177 atgtctacgatgaacatgagtgagtaaacttctcttgtttttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccctaatc 27745276  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27745277 ttatgtaaccctattttctaatctaaattcaccgttttaacaagaatta 27745325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Original strand, 23704132 - 23704287
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704132 cttttgctacttttgcttcggaaacaagctgcctattttgaccgaaaagcccgtggtttcttttggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 23704231  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||    
T  23704232 cgacataagactgtaaataaagtagctagctatcgcaacaatgcatcttttgttct 23704287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 275
Target Start/End: Original strand, 539118 - 539277
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagcta----tcataacaaatcatctttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||    
T  539118 gtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagctagccatcacaacaaatcatctttt 539217  T
Q  216 gttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  539218 gttttctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 539277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21468425 - 21468276
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  21468425 atgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 21468326  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  21468325 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 21468276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25803774 - 25803625
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||    
T  25803774 atgtctacgataaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaaaccaagcttttaaccccaat 25803675  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25803674 cttatgtaatcctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 25803625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 65 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29577569 - 29577375
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29577569 cttttgctgcttttgcttcggaaacaagctacctattttgacctaaaagtctgtggtttcttgttgaacattctagtgaatagttccttaggttttaagt 29577470  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 260  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||  ||| | ||| |||||||||||| | | | ||||||||||    
T  29577469 cgacataagac--taaatagagtagcgagctatcacaacaattcattttttgttcttggaattcaatcagtgacaattgtctttcttaataaaagtt 29577375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 20708495 - 20708297
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||||||||||||| |||||   | |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20708495 cttttgctgcttttgattcatgatctagctgcctgttttgaccgaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttgggttttaagt 20708396  T
Q  165 cgac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  20708395 cgacaataagactataaatagagtagctagctatcattaacattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 20708297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11123 - 10980
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  11123 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgcgattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 11024  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  11023 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 10980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 20172792 - 20172649
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  20172792 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 20172693  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  20172692 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 20172649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 25358249 - 25358392
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  25358249 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 25358348  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  25358349 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 25358392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 28496930 - 28496780
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||||   | || || || |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  28496930 cttttgctgcttttgcttcatgatctaggtgtctgttttgaccgaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttatgttttaagc 28496831  T
Q  165 cgac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttt 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28496830 cgacaataagactataaatagagtagctagctatcataacaattcatcttt 28496780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 313 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18994420 - 18994289
Alignment:
Q  313 gtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaatcttatgtaaccctagttt 410  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  18994420 gtgagtagagttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaatcttatgtaacactaatct 18994321  T
Q  411 ctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18994320 ctaatctaaattcatcgttttaacatgaatta 18994289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 312 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 28496653 - 28496522
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaaccctagttt 410  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||| |||||||| |||    
T  28496653 agtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccctaattttatataaccctaattt 28496554  T
Q  411 ctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28496553 ctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 28496522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 35080707 - 35080850
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  35080707 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattattggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 35080806  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  35080807 ttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 35080850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 42767346 - 42767195
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | | |    
T  42767346 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttaggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacatta 42767247  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  42767246 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 42767195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23014467 - 23014317
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  23014467 atgtctacgatgaacatgtgtgagtagacttctcttgtcttgggattgttcgataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctag 23014368  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23014367 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccattttaacatgaatta 23014317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23018581 - 23018431
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  23018581 atgtctacgatgaacatgtgtgagtagacttctcttgtcttgggattgttcgataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctag 23018482  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23018481 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccattttaacatgaatta 23018431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 40916788 - 40916638
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  40916788 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactttttttgtctcgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 40916689  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40916688 tcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcatcgttttaacatgaatta 40916638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 74 - 261
Target Start/End: Original strand, 29563058 - 29563247
Alignment:
Q  74 cttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgac-ataa 172  Q
    ||||||||||||   | |||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29563058 cttttgcttcatgatctagctgcctgttttgaccgaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacaataa 29563157  T
Q  173 gactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||  ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  29563158 gactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctttcattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 29563247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 32140082 - 32140231
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  | || |||    
T  32140082 atgtctacgatgaacatgagtgaatagacttcttttgtcatgggattgttggagaagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttcaatccgaat 32140181  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32140182 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 32140231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 32441338 - 32441194
Alignment:
Q  297 tctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatctta 396  Q
    |||||||||||||||| |||||| | |  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  32441338 tctacaatgaacgttactgagtaaattcttcttgtcttaggattgtcggataagtctaatgacataatcataatcaaaccaagctttaacc-taatctta 32441240  T
Q  397 tgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32441239 tgtaaccctagtttctaatctaaattcattgttttaacatgaatta 32441194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16134355 - 16134200
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | | ||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  16134355 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaattataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 16134256  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16134255 tttgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 16134200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 406
Target Start/End: Original strand, 19929490 - 19929604
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaa 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||    
T  19929490 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 19929589  T
Q  392 tcttatgtaacccta 406  Q
    |||||||||||||||    
T  19929590 tcttatgtaacccta 19929604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 29563303 - 29563453
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||  |||||||    
T  29563303 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacacaatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaa 29563402  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | | || ||||||||||||    
T  29563403 tcttatgtaaccctagtttttaatctaaatttaccattgtaacatgaatta 29563453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 11391221 - 11391366
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  11391221 atgtctacaatgaacgttagcgagcagactcttcttgtcttgggattgttggataagtccaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaacccctaat 11391320  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11391321 tttatgtaaccc----ttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 11391366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 11407882 - 11408027
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  11407882 atgtctacaatgaacgttagcgagcagactcttcttgtcttgggattgttggataagtccaatgacataatcctaatcaaaccaaactttaacccctaat 11407981  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11407982 tttatgtaaccc----ttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 11408027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24820573 - 24820422
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcct-aatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || | ||| |    
T  24820573 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctca 24820474  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  24820473 atattatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttcacatggatta 24820422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24824958 - 24824807
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   || | ||| |    
T  24824958 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctta 24824859  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    || |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  24824858 atattatgtaaccctagtttctcttctaaattcactgttttaacatggatta 24824807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42767528 - 42767388
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||| ||||    
T  42767528 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttatctg 42767433  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42767432 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 42767388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 33181789 - 33181938
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  33181789 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagacaagccttaaaccttaat 33181888  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33181889 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 33181938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 18446729 - 18446583
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  18446729 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttagataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 18446630  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18446629 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatg 18446583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 23644696 - 23644842
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  23644696 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 23644795  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  23644796 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 23644842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Original strand, 25481304 - 25481463
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||| ||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  25481304 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaaatcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 25481403  T
Q  220 tctgaaat----aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25481404 tctgaaataaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 25481463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Original strand, 25488910 - 25489069
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||| ||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  25488910 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaaatcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 25489009  T
Q  220 tctgaaat----aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25489010 tctgaaataaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 25489069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 16134175 - 16134026
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||  |||||||     
T  16134175 atgtctacaatgaacgttagtgagtatacttcttttgtcttgtgattgttgggtaagtctaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaac 16134076  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||    
T  16134075 tttatgtaactctagtttctcttctaaattcaccattttaacatggatta 16134026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 20708240 - 20708091
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  20708240 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacacttcttgtcttgggattattggataagtctaatggcaaaatccaaatcaaaccaagctttaaaccctaat 20708141  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  20708140 cttatgtaatcctagtttctaatctaaattcacttttttaacatgaatta 20708091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 25481488 - 25481637
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa-gatttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||   ||  ||| ||||    
T  25481488 atgtctacaatgaacaatagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggttaagtctaatgatataatcctaatcaagccaatccttaaaccttaat 25481587  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25481588 attatgtaaccctagtttttcttctaaattcaccgttttaacatggatta 25481637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 25489094 - 25489243
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa-gatttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||   ||  ||| ||||    
T  25489094 atgtctacaatgaacaatagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggttaagtctaatgatataatcctaatcaagccaatccttaaaccttaat 25489193  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25489194 attatgtaaccctagtttttcttctaaattcaccgttttaacatggatta 25489243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 29577322 - 29577197
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  29577322 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaatccctaat 29577223  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     |||||||||| |  |||||||||||    
T  29577222 tttatgtaaccttgatttctaatcta 29577197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 39870558 - 39870409
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  39870558 atgtctacgatgaacatgagtgagtaaacttctccttgtcttgggattgttggataagcctaaatgacataatcctaatcaaaccaagttctaagcctta 39870459  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaat 440  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39870458 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatgaat 39870409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 16769736 - 16769887
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  16769736 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 16769835  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  16769836 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 16769887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 16776398 - 16776549
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  16776398 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 16776497  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  16776498 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 16776549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24794755 - 24794604
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  24794755 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 24794656  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  24794655 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 24794604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 24801464 - 24801313
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  24801464 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 24801365  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  24801364 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 24801313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24825140 - 24825000
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||  ||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  24825140 cttgtggaacattctagtga----ttggctagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctctg 24825045  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24825044 aaataataagggacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 24825000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 24877614 - 24877765
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  24877614 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 24877713  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  24877714 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 24877765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 27628318 - 27628469
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  27628318 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 27628417  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  27628418 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 27628469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 111597 - 111743
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  111597 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttatcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 111696  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  111697 atcttacgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatg 111743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23163443 - 23163297
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  23163443 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 23163344  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  23163343 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 23163297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23574700 - 23574554
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  23574700 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 23574601  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  23574600 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 23574554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 27615526 - 27615672
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  27615526 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 27615625  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  27615626 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 27615672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 27632222 - 27632368
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  27632222 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 27632321  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  27632322 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 27632368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 27768305 - 27768159
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | | ||| |    
T  27768305 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaccaaaccaagctctaagcctta 27768206  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  27768205 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 27768159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 24172106 - 24172255
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  24172106 atgtctactatgaacatgagtgagtagacttcttatgtgttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaat 24172205  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24172206 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 24172255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 25144234 - 25144085
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  25144234 atgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaat 25144135  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25144134 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 25144085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 275
Target Start/End: Original strand, 19929397 - 19929465
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19929397 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 19929465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23139976 - 23139892
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23139976 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactctttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 23139892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23551766 - 23551682
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23551766 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactctttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 23551682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 17583326 - 17583477
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  17583326 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 17583425  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  17583426 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 17583477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 17591132 - 17591283
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  17591132 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 17591231  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  17591232 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 17591283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 22044128 - 22043977
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  22044128 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 22044029  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  22044028 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 22043977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 22288305 - 22288456
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  22288305 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 22288404  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  22288405 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 22288456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 22665809 - 22665960
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  22665809 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 22665908  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  22665909 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 22665960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 27621673 - 27621824
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | |  ||    
T  27621673 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcttta 27621772  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  27621773 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 27621824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 118269 - 118415
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||  |||||| | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  118269 atgtctatgatgaacatgagtgagtaaacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 118368  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  118369 atcttacgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatg 118415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 539308 - 539458
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaa 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||    
T  539308 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgggtaagtttaaatgacataaccctaatcaaaccaagtcttgaaccctaa 539407  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||| |||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  539408 ttttatataaatctactttctaatctaaattcactgttttcacatgaatta 539458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 21201005 - 21201151
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  21201005 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 21201104  T
Q  392 -tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
     ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  21201105 gtcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 21201151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23158873 - 23158727
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | || ||    
T  23158873 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccacgctctaagcctta 23158774  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  23158773 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 23158727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 23570130 - 23569984
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | || ||    
T  23570130 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccacgctctaagcctta 23570031  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  23570030 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 23569984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 415
Target Start/End: Original strand, 23704391 - 23704513
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||||||||    
T  23704391 atgtctacaatgaacgctagtgagtagcctcttcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatactaatcaaaccaagctctaaaccctaat 23704490  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
     ||||||||||||| ||||||||    
T  23704491 tttatgtaaccctaatttctaat 23704513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 24610044 - 24609919
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  24610044 atgtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtccaatgacctaatcctaatcaaaccaagccttgaaccctaat 24609945  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||    
T  24609944 tttatgtaaatctattttctaatcta 24609919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25043088 - 25043007
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 375  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25043088 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 25043007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24820735 - 24820615
Alignment:
Q  148 ttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttct 247  Q
    |||||||| |||||||||||    | |||||||||||||||| |||| |||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24820735 ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttgttctttgaaataataagggacaattgtttct 24820636  T
Q  248 ttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24820635 ttgaataaaagttcaccttta 24820615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 220
Target Start/End: Original strand, 11391048 - 11391149
Alignment:
Q  118 tggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11391048 tggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgttata-gactataaatagagtagctaactatcataacaattcatcttttgt 11391146  T
Q  218 tct 220  Q
    |||    
T  11391147 tct 11391149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 220
Target Start/End: Original strand, 11407709 - 11407810
Alignment:
Q  118 tggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  11407709 tggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgttata-gactataaatagagtagctaactatcataacaattcatcttttgt 11407807  T
Q  218 tct 220  Q
    |||    
T  11407808 tct 11407810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 19278768 - 19278622
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  19278768 atgtctacgatgaacatgagtgagtagatttctccttctcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 19278669  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  19278668 attttatgtaaccctagtttcttatctaaattcaccgctttaacatg 19278622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 103 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32441523 - 32441406
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32441523 tgacctaaaagcccttggttttttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgttata-gactataaatagagtagctagctatcacaa 32441425  T
Q  203 caaatcatcttttgttctc 221  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  32441424 caattcatcttttgttctc 32441406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 21386 - 21261
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  21386 atgtctacaatgaacatgagtgaatagactcttcttgtcttgagattgttggataagtctaataacgtaatgctaatcaaaccaagccttaaaccctaat 21287  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     |||||||||| || |||||||||||    
T  21286 tttatgtaaccttaatttctaatcta 21261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 11318169 - 11318020
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  11318169 atgtctacgatgaacatgagtgagtagatttcttatgtcttgggattgttggataggtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaat 11318070  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11318069 attatgtaaccctattttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 11318020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 21344458 - 21344333
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | || |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  21344458 atgtctacgatgaacataagcgagtagactcttcctgtcttgagattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaat 21344359  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||| ||||||||| |||||||||||    
T  21344358 tttaggtaaccctaatttctaatcta 21344333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 20635773 - 20635923
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt--gaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||   ||| |||    
T  20635773 atgtctacgatgaacataagtgagtagacttcttatatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaggtcaagccttaaaaccttaa 20635872  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20635873 tattatgtaaccttagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 20635923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Original strand, 15583945 - 15584080
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagact---tc-tcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accc 388  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  15583945 atgtctacaatgaactcaagtgagtagactcactcttcttgtcttgagattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttgaaccc 15584044  T
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
    |||| |||| |||  ||| |||||||||||| ||||    
T  15584045 taattttatataaatctactttctaatctaatttca 15584080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24177653 - 24177568
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177653 atgtctacgatgaacataagtgagtagactcttcttgtcttgggattgatggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 24177568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 172 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19124444 - 19124344
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||   | |||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19124444 agactataaatagagtagctagcaaacatattcattcatcttttgttcatgaaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttattt 19124345  T
Q  272 t 272  Q
    |    
T  19124344 t 19124344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 22328604 - 22328688
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22328604 atgtctacaatgaatgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgttatcctaatcaaaccaa 22328688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 23698784 - 23698700
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23698784 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 23698700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 24366280 - 24366196
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24366280 atgtctacaatgaacgtgagtggatagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 24366196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 25481210 - 25481278
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25481210 gaatttgaagatcttgtacaaaaatataaaagtggtgcgcctcattatacccttttgctgcttttgctt 25481278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 25488816 - 25488884
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25488816 gaatttgaagatcttgtacaaaaatataaaagtggtgcgcctcattatacccttttgctgcttttgctt 25488884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 19012987 - 19012850
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||  | | ||||||||    
T  19012987 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttct-ttgtctcgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaagcctcgaaccctaat 19012889  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  19012888 tttatgtaaatctattttctaatctaatttcatcgtttt 19012850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 302 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 19124296 - 19124179
Alignment:
Q  302 aatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaatcttatgta 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  | | |||||||| |||||||    
T  19124296 aatgaacgttagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttgaatgagtctaatgacctaatcctaatcaaaccaagtctcgaaccctaattttatgta 19124198  T
Q  401 accctagtttctaatctaa 419  Q
    |   || ||||||||||||    
T  19124197 aatttattttctaatctaa 19124179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Original strand, 36684207 - 36684349
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  36684207 gtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaaatcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaacaaatcatcttttcttc 36684306  T
Q  220 tctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  36684307 ttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 36684349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16134449 - 16134381
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16134449 gaatttgaagatattgtacaataatataaaagtggcacgccccattatacccttttgctgcttttgctt 16134381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 24371414 - 24371293
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||  | | ||| ||||    
T  24371414 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacgtaatccctatcaaaccaagcctagaaccttaat 24371316  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
    |||||||||  ||| ||||||||    
T  24371315 cttatgtaaatctattttctaat 24371293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 275
Target Start/End: Original strand, 15583821 - 15583890
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttca-cctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15583821 tcatcttttgttcttggaaataataagtgacaactgtttctttgaataaaagttcaccctttattttatg 15583890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 30949232 - 30949148
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30949232 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttggaattattggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 30949148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 206 - 272
Target Start/End: Original strand, 20852132 - 20852199
Alignment:
Q  206 atcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaat-aaaagttcacctttatttt 272  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20852132 atcatcttttgttcttcgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaaagttcatctttatttt 20852199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 20852240 - 20852324
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  20852240 atgtctacaatgaacatgagtgagtagaattct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaag 20852324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22578299 - 22578216
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22578299 atgtctacaatgaacatgagtgagtagaattct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaag 22578216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 23256991 - 23256868
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||  | | ||||||||    
T  23256991 atgtctacaatgaatatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaacccaagcctcgaaccctaat 23256894  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||    
T  23256893 tttatgtaaatctattttctaatcta 23256868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25858561 - 25858484
Alignment:
Q  297 tctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaa 374  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25858561 tctacaatgaacgtgagtgagaaggctcttcttgtcttgggattgttcgataagtctaatgacgtaatcctaatcaaa 25858484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 41653588 - 41653504
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  41653588 atgtctacgatgaacatgagtgagtagattcttcttatcttgggattgttggataagtctaatgatgtaatcctaatcaaaccaa 41653504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 23614067 - 23613996
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatc 365  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23614067 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatcacataatc 23613996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 41653788 - 41653631
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||  |||||||    ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  41653788 tgacctaaaagtccgtggtttcttgtggaacattctagtgttatattt-cttagggcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagctatcaca 41653691  T
Q  202 acaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| | |  |||||||||||| | | | |||||||||||    
T  41653690 acaattcatcttttgttcttggaattcaatagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 41653631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21525 - 21436
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgt-ttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  ||| |||  |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21525 agactataaatagagtagctagctatcacaacgattcatcttttgttcttggaattaaatagtgacaattgtcttcttt-aataaaagttc 21436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 24321910 - 24321994
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  24321910 atgtctacaatgaacatgagtgtgtagacttctttt-tcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccatatcaaaccaag 24321994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23257121 - 23257019
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgttt--ctttgaataaaagttcacctttattt 271  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||||| |||||||  ||| | |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23257121 actataaatagagtagctagcaaacatattgaatcatctcttgttcttggaatttaatagtgacaattgttttgctttgaataaaagttcatctttattt 23257022  T
Q  272 tat 274  Q
    |||    
T  23257021 tat 23257019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 261
Target Start/End: Original strand, 32139882 - 32140025
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||    
T  32139882 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttatt 32139981  T
Q  219 ctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  32139982 cttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 32140025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 355
Target Start/End: Original strand, 23648789 - 23648851
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa 355  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23648789 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaa 23648851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21344596 - 21344523
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgttt 245  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||| |||  ||||||||||||||    
T  21344596 agactataaatagagttgctagctatcacaacaattcatcttttgttattggaattaaatagtgacaattgttt 21344523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23698915 - 23698830
Alignment:
Q  176 tataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| | |  |||||||||||| | | | |||||||||||    
T  23698915 tataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttcttggaattcaatagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 23698830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 31590487 - 31590364
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| | |||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  | | ||||||||     
T  31590487 tgtctacgatgaacatgagtgagcagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcct-atcaaaccaagcctagaaccctaatt 31590390  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaa 419  Q
    |||||||   ||| ||||||||||||    
T  31590389 ttatgtagatctattttctaatctaa 31590364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 36130073 - 36129990
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  36130073 tgtctacgatgaacatgagtgagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaag 36129990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 364
Target Start/End: Original strand, 45706320 - 45706392
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataat 364  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  45706320 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagactaaatgacataat 45706392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 437
Target Start/End: Original strand, 45706421 - 45706469
Alignment:
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45706421 taatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgttttaacatg 45706469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23139885 - 23139843
Alignment:
Q  400 aaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23139885 aaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 23139843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 23551675 - 23551633
Alignment:
Q  400 aaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23551675 aaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 23551633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 261
Target Start/End: Original strand, 24321772 - 24321862
Alignment:
Q  172 agactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||| | || || | ||||   ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24321772 agactataaatagagcacctggcaaacatattcaatcatcttttgttcttggaaattaataagtgacaattgtttatttgagtaaaagttc 24321862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24371516 - 24371466
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaa 257  Q
    ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24371516 tcatcttttgttcttggaatttataagtgacaattgtttctttgaataaaa 24371466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 415
Target Start/End: Original strand, 13004609 - 13004721
Alignment:
Q  303 atgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaatcttatgtaa 401  Q
    |||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||  | | |||||||| ||||||||    
T  13004609 atgaacatgagtgagtagatttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaattcctatcaaaccaagcctagaaccctaattttatgtaa 13004707  T
Q  402 ccctagtttctaat 415  Q
      ||| ||||||||    
T  13004708 atctattttctaat 13004721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 19013085 - 19013044
Alignment:
Q  231 aagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  19013085 aagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatcattatttt 19013044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23014659 - 23014583
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23014659 cttgtggaacattctagtgatgtagttgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 23014583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 437
Target Start/End: Original strand, 25198600 - 25198648
Alignment:
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  25198600 taatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 25198648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 25593095 - 25593012
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||||    
T  25593095 tgtctacgatgaacatgagtgagtagatctct-ttgtcttgatattgttggatgagtctaatgacttaattcctatcaaaccaag 25593012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 25337383 - 25337344
Alignment:
Q  64 ccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctatttt 103  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25337383 ccttttgctgcttttgcttcttcgacaagctgcctatttt 25337344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 45
Target Start/End: Original strand, 44998044 - 44998075
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaag 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44998044 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaag 44998075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21468603 - 21468532
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  21468603 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 21468532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25144421 - 25144350
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25144421 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 25144350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 25370478 - 25370390
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat--aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  25370478 actataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattct-tgaaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 25370390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 330 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 21511875 - 21511826
Alignment:
Q  330 gtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21511875 gtcttgggattgttggaatagtctaatgacttaatcctattcaaaccaag 21511826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 356 - 424
Target Start/End: Original strand, 23633909 - 23633978
Alignment:
Q  356 tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaa-tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | | | ||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  23633909 tgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctaaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattca 23633978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 442
Target Start/End: Original strand, 23634131 - 23634184
Alignment:
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  23634131 taatcttatgtaacactaatctctaatctaaattcactgctttaacatgaatta 23634184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 365
Target Start/End: Original strand, 25198531 - 25198604
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttg-tcttgagattgttggataagtct-aatgacataatc 365  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25198531 atgtctacgatgaacatgagtgggtagatttctctttctcttgggattgttggataagtctaaatgacataatc 25198604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23018773 - 23018697
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23018773 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 23018697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0916 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0916
Description:

Target: scaffold0916; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 3628 - 3776
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3628 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaccctaatc 3727  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3728 ttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 3776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0916; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 275
Target Start/End: Original strand, 3436 - 3594
Alignment:
Q  118 tggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca-taacaaatcatcttttg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||     
T  3436 tggtttcttttggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgatattagactataaatagagtagctagctatcagtaac-attcatcttttc 3534  T
Q  217 ttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatg 275  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3535 ttcttggaaataataagtgacaattgtctctttgaataatagttcaacctttattttatg 3594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 121 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 9973 - 9647
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||| ||    | |||||||||| |||||||||| |||| ||  |  ||||||||||||    
T  9973 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagttgaatgtaaactataaataaagtagctagccatcacaaatatccatcttttgttc 9874  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatgnnnnnnnnnnnnnnnnnn---atgtctacaatgaacgttagtga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||                     |||||||||||||||||||||||    
T  9873 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttattttatgttcttcttcttcttcccttctatgtctacaatgaacgttagtga 9774  T
Q  317 gtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaaccctagtttctaat 415  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||  |    
T  9773 gtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgatataatcctaatcaagccaagctttaaaccctaattttatgtaaccctagtttctctt 9674  T
Q  416 ctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9673 ctaaattcaccgttttaacatggatta 9647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 9999
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10067 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgccccgttatacccttttgctgcttttgctt 9999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0773
Description:

Target: scaffold0773; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 220
Target Start/End: Original strand, 977 - 1132
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||||||| |||||||||  | ||||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  977 cttttgctgtttttgcttcgaaaacaagctacctgttttgacctaaaagcttgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 1076  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttct 220  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1077 agacataagactataaatagagtagctagctatcacaacaattcatcttttgttct 1132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0773; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 296 - 442
Target Start/End: Original strand, 1232 - 1379
Alignment:
Q  296 gtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatct 394  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| |||| |    
T  1232 gtctacaatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccttaatat 1331  T
Q  395 tatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  1332 tatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccattttcacatgaatta 1379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1092 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold1092
Description:

Target: scaffold1092; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 1911 - 1714
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1911 cttttgctgcttttgcttcatggacaagctacctaatttgaccgaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagtttcttaggttttaagt 1812  T
Q  165 cgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | || |||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  1811 cgacataagactataaatagagtagctagctatcattaacattcgtcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 1714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1092; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1654 - 1508
Alignment:
Q  297 tctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatctt 395  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||    
T  1654 tctacgatgaacatgagtgactagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatttt 1555  T
Q  396 atgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  1554 atgtaaccctaatttctaatctaaattcattgttataacatgaatta 1508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 34084 - 34234
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaa 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||    
T  34084 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 34183  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34184 tcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcaccgttttaatatgaatta 34234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Original strand, 33972 - 34035
Alignment:
Q  212 ttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33972 ttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 34035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3192 - 3043
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  3192 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 3093  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3092 cttatgtatccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatggatta 3043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 17626 - 17477
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||    
T  17626 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaat 17527  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  17526 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 17477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17801 - 17654
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | |||||||||||||||| |||| |||| ||  | |||||||| |||||| |    
T  17801 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagatagccatcacaaatattcatctttggttctcgg 17706  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17705 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 17654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8830 - 8681
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8830 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctccttgtcttgggattgtttgataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagttttaaccctaat 8731  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  8730 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccaatttaacatgaatta 8681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 208 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8932 - 8864
Alignment:
Q  208 catcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8932 catcttttgttcgtggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaacctttattttatg 8864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 150836 - 150686
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  150836 atgtctacgaagaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaa 150737  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  150736 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 150686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 245792 - 245640
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga--ccct 389  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||| |  || |    
T  245792 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatggcataatcctaatcaaaacaagcttttaaacctt 245693  T
Q  390 aatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  245692 aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 245640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 153850 - 153704
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  153850 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 153751  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  153750 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 153704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 151034 - 150939
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctttt 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||    
T  151034 tttcttatggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaaaattcatctttt 150939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 8802 - 8653
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||    
T  8802 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagtcttaaaccctaat 8703  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  8702 tttatgtaaccatagtttctaatctaaattcaccattttaacatgaatta 8653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 118 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 9022 - 8875
Alignment:
Q  118 tggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||    
T  9022 tggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgttata-gactataaatagagtagctagctatcataacaa--------ttgt 8932  T
Q  218 tctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttat 274  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8931 tctatgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcatctttattttat 8875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18913 - 18763
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaa 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||    
T  18913 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcgaaatgacataattctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 18814  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18813 tcttatgtaaccctaatttctaatctaaattcactgttttaacatgaatta 18763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19201 - 18953
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaag 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||   ||||           |||| | ||||       
T  19201 gaatttgaagatcttgaacaataatataaaagtggcgcgccccattatacctttttgctgcttttgct---taga-----------ttttaagctactct 19116  T
Q  114 cctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatct 212  Q
      | | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||    | | ||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||    
T  19115 attttagtttcttgtggaacattctagtgatataattgcttagattctaagtcgaatgtaaaatataaatagagtagctagccatcaaaaatattcatct 19016  T
Q  213 tttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19015 ttagttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 18953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 32271 - 32122
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  32271 atgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 32172  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  32171 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 32122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 436
Target Start/End: Original strand, 37094 - 37236
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  37094 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctctcgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 37193  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacat 436  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  37194 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacat 37236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 32448 - 32377
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  32448 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaaggtaaactataaatagagtagctagccatca 32377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 8849 - 8992
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  8849 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 8948  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  8949 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 8992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 16375 - 16518
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  16375 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 16474  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  16475 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 16518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14555 - 14412
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  14555 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 14456  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  14455 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 14412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 50003 - 49860
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  50003 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 49904  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  49903 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 49860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31058 - 30985
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatccta 368  Q
    |||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31058 atgtctacgattaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggataagtcaaatgacctaatccta 30985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 31829 - 31756
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatccta 368  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  31829 atgtctacaattaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtcaaatgacctaatccta 31756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 33358 - 33215
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  33358 tgtctacgatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 33259  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  33258 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 33215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 439
Target Start/End: Original strand, 110667 - 110814
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  110667 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctag 110766  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaa 439  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  110767 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgtattaacatgaa 110814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 95; Significance: 3e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 12569 - 12371
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    ||||||||||||||| |||||   | |||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12569 cttttgctgcttttgattcatgatctagctgcctgttttgaccgaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttgggttttaagt 12470  T
Q  165 cgac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  12469 cgacaataagactataaatagagtagctagctatcattaacattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 12371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12314 - 12165
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||| | |||||||    
T  12314 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacacttcttgtcttgggattattggataagtctaatggcaaaatccaaatcaaaccaagctttaaaccctaat 12215  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  12214 cttatgtaatcctagtttctaatctaaattcacttttttaacatgaatta 12165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 6524 - 6673
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||  ||||||||    
T  6524 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtccaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaat 6623  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6624 tttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 6673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 11138 - 11287
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||  ||||||||    
T  11138 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtccaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaat 11237  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11238 tttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 11287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Original strand, 6344 - 6499
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  6344 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 6443  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6444 tcggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 6499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Original strand, 10958 - 11113
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  10958 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 11057  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11058 tcggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 11113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 9133 - 9282
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||  ||||||||    
T  9133 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtccaatgatataatcctaatcaagccaagccttaaaccctaat 9232  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9233 tttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 9282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Original strand, 8953 - 9108
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  8953 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 9052  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9053 tcggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 9108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0489 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0489
Description:

Target: scaffold0489; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 783 - 926
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  783 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 882  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  883 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 35021 - 34878
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  35021 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 34922  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  34921 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 34878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 369487 - 369344
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  369487 tgtctacgatgaacgtcagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 369388  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  369387 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 369344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24289 - 24174
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | | || ||    
T  24289 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 24190  T
Q  391 atcttatgtaacccta 406  Q
    ||||||||||||||||    
T  24189 atcttatgtaacccta 24174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 1889 - 2038
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||||    
T  1889 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactttttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaactaagctttcaaccttaat 1988  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| || | ||||||| ||||    
T  1989 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctataacatggatta 2038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 12518 - 12369
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||| |||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||    
T  12518 atgtctacgatgaacatgagtgcgtagatttctcttgtcatggcattgttagataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaat 12419  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12418 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 12369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 191379 - 191182
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattttgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagt 164  Q
    |||||||||||||||||||||   | |||||||  |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  191379 cttttgctgcttttgcttcatgatctagctgccagttttgaccgaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctattgaatagttgcttaggttttaagt 191280  T
Q  165 cgaca-taagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagtt 260  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||| | | | ||||||||||    
T  191279 cgacattaagactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttattcttggaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagtt 191182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Original strand, 168307 - 168431
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||||||   | | ||||||||    
T  168307 atgtctacaatgaacatgagtgagtagaattct-ttgtcttgtgattgttggatgagtctaatgacctaatctctatcaaaccaaacctagaaccctaat 168405  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
    |||||||||  |||  ||||||||||    
T  168406 cttatgtaaatctatattctaatcta 168431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 163899 - 163747
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga--ccct 389  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  || |    
T  163899 atgtctacaatgaacgttagtgagttgacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagcttttaaacctt 163800  T
Q  390 aatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  163799 aatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatgaatta 163747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 162590 - 162736
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  162590 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 162689  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  162690 atcttatgtaaccctgatttctaatctaaattcaccgttttaacatg 162736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 174 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 164025 - 163924
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttta 273  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164025 actataaatagagtagctaaccatcacatatattcatcttttgttctgtgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttta 163926  T
Q  274 tg 275  Q
    ||    
T  163925 tg 163924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 261
Target Start/End: Original strand, 172645 - 172803
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcata 201  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||| ||  |||||||    ||| ||||||||||||||||||||| |||| |    
T  172645 tgacctaaaagcccgtggtttcttctggaacattctagtgatatattt-cttggggcttaagtcattgtaa-actataaatagagtagctagcaatcaca 172742  T
Q  202 acaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattg-tttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| | |  ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  172743 acaattcatcttttgttcttggaattcaatagtgacaattgttttctcttaataaaagttc 172803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 377
Target Start/End: Original strand, 172852 - 172935
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaacca 377  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||| ||| || |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  172852 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactgttcttgtattgggaatgttggatgagtctaatgacctaattctaatcaaacca 172935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0816 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0816
Description:

Target: scaffold0816; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 296 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1306 - 1159
Alignment:
Q  296 gtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatct 394  Q
    |||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||    
T  1306 gtctacgatgaacattagtgagtatacatctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatct 1207  T
Q  395 tatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  1206 tatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 9620 - 9763
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  9620 tgtctacgatgaacgtcggtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 9719  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  9720 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 9763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 38181 - 38324
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  38181 tgtctacgatgaacattactgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 38280  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  38281 ttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 38324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 117866 - 118009
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  117866 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 117965  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| | | ||||||||    
T  117966 ttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccatcttaacatg 118009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 124110 - 124253
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  124110 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 124209  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||| | | ||||||||    
T  124210 ttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccatcttaacatg 124253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 8)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 425001 - 424850
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||| |    
T  425001 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactccttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaatcaagctttaaacctta 424902  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  424901 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaatttaccgttttaacatgaatta 424850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 425183 - 425043
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||| |||    
T  425183 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttccctg 425088  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  425087 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 425043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 159181 - 159325
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||  ||| ||||    
T  159181 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttatgtcctgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtaaagccttaaaccttaat 159280  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
     ||||||||| ||||||||   ||||||||||  |||||||||||    
T  159281 attatgtaactctagtttcacttctaaattcactgttttaacatg 159325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 418
Target Start/End: Complemental strand, 82580 - 82456
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||  ||  ||||||| |||| ||||||||    
T  82580 atgtctacaatgaacatgtgtgagtagacttct-ttgtcttgggattgatggatgagtttaatgacctaatccctatacaaccaagctttgaaccctaat 82482  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatcta 418  Q
     ||||||||  ||| |||||||||||    
T  82481 tttatgtaaatctattttctaatcta 82456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 82781 - 82631
Alignment:
Q  111 aagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcat 210  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||    || ||| ||  |||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||| | ||||   ||||||    
T  82781 aagcctgttgtttcttgtggaacattctattgatgtatttcttggggcttaagtagttata-gactataaatagagtatctagcaaacatattcaatcat 82683  T
Q  211 cttttgttctctgaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    |||||||| |  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  82682 cttttgtttttggaaattaataagtgaccattgtttctttgaataaaggttc 82631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 218
Target Start/End: Original strand, 520672 - 520771
Alignment:
Q  118 tggtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||  |||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  520672 tggtttcttgtggaacattctagtgatatattt-cttggggcttaagttgttataa-actataaatagagtagctagcaatcacaacaattcatcttttg 520769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 520862 - 520947
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||  |||||||||  || |||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||||    
T  520862 atgtctacgatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttaggaatgttggatgagtctaatgactaaatcttaatcataccaag 520947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 49504 - 49433
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    |||||||||||||||||| |    |||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49504 cttgtggaacattctagtaa----ttgcttagattttaagtcgaatgtagactataaatagagtagctagccatca 49433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 13338 - 13488
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||     
T  13338 atgtctacgatgaatatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataactcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctag 13437  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13438 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgtcttaacatgaatta 13488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 60822 - 60672
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||     
T  60822 atgtctacgttgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctatttaccttat 60723  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  60722 tcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 60672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 61014 - 60922
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatctttt 215  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||    
T  61014 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatctttt 60922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 48896 - 49046
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaa 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||    
T  48896 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagacttctcttgccttgggattgttagataagtctaaatgacataatcctattcaaaccaagctttaaaccttaa 48995  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  48996 tcttatgtaatcctaatttctaatctaaattcaccggtttaacatgaatta 49046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Original strand, 48716 - 48871
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaat-agttgcttaggttttaagtcgac-ataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||  |||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  48716 tttcttgtggaacattctagtgatttaattgcttagattctaagtcgaatataa-actataaatagagtacttagccatcacaaatattcatcttttgtt 48814  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48815 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 48871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 48622 - 48687
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttg 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  48622 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgcctcattatacccttttgctgcttttg 48687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 13830 - 13976
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  13830 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 13929  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  13930 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 13976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 268
Target Start/End: Original strand, 13675 - 13795
Alignment:
Q  148 ttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttct 247  Q
    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |    
T  13675 ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctcggaaataaaaagtgacaattgtttat 13774  T
Q  248 ttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  13775 ttgaataaaagttcaacttta 13795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 117883 - 118032
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||    
T  117883 atgtctatgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttaggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaat 117982  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  117983 cttatataaccctaatctctaatctaaattcaccgctttaacatggatta 118032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9254 - 9099
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||| |||| || ||| ||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  9254 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgtttagattctaattcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 9155  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9154 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttatg 9099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 9065 - 8979
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9065 atgtctacaatgaacgttagtaagtagaattctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaag 8979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 9354 - 9280
Alignment:
Q  8 tgaaatgaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9354 tgaaaagaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggcgcgccccattataatcttttgctgcttttgctt 9280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 294 - 436
Target Start/End: Original strand, 19546 - 19689
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||    
T  19546 atgtctacgatgaacattagtgagtagatttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacattaat 19645  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacat 436  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| | || ||||||||    
T  19646 cttatgtaaccctaatatctaatctaaattaaccgctttaacat 19689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Original strand, 19355 - 19504
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || || ||||| |||||||||||    |  |||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  19355 gtttcttgtggaacattctagtaatgtaatttcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgtt 19454  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19455 ctcggaaataataagtgacaattggttctttgaacaaaagttcaccttta 19504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 56664 - 56513
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  56664 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 56565  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56564 atcttatataaacctaatttctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 56513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 72144 - 71998
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  72144 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 72045  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  72044 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 71998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 48510 - 48661
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   || | ||| |    
T  48510 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctta 48609  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  48610 agcttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 48661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Original strand, 48328 - 48468
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||| ||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||| |||    
T  48328 cttgtggaacattctagtga----ttgcatagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttccctg 48423  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48424 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 48468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 84218 - 84069
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||  ||||    
T  84218 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagccaagccttaaacgttaat 84119  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     ||||||||||||| |||||  | |||||| | |||||||||||| ||||    
T  84118 attatgtaaccctactttctcttataaattaaccgttttaacatggatta 84069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1058 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1058
Description:

Target: scaffold1058; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 297 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3031 - 2885
Alignment:
Q  297 tctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatctt 395  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||    
T  3031 tctacgatgaacatgagtgactagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagccttaaaccctaatttt 2932  T
Q  396 atgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  2931 atgtaaccctaatttctaatctaaattcattgttataacatgaatta 2885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 296 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14155 - 14007
Alignment:
Q  296 gtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaatc 393  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  14155 gtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgttttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctattaaccctaatc 14056  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  14055 ttatgtaaccataatctctaatctaaattcactattttaacatgaatta 14007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 295 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 116 - 4
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||    
T  116 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatc 17  T
Q  394 ttatgtaacccta 406  Q
    |||||||||||||    
T  16 ttatgtaacccta 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2101 - 1961
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||| |    
T  2101 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctcgg 2006  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2005 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 1961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0566 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0566
Description:

Target: scaffold0566; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Original strand, 3333 - 3476
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  | | |||||    
T  3333 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaatcaaactttaaaacttaatc 3432  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||  | |||||||||    
T  3433 ttatgtaaccctaatttcttatctaaattcactgctttaacatg 3476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0512 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0512
Description:

Target: scaffold0512; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 5838 - 5989
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | ||| |    
T  5838 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaattaaaccaagctttaaacctta 5937  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  5938 atcttatgtaactctaatttctaacctaaattcaccgttttaacatgaatta 5989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 128 - 268
Target Start/End: Original strand, 27307 - 27443
Alignment:
Q  128 tggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat 227  Q
    ||||||||||||||||    |||||||  |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  27307 tggaacattctagtga----ttgcttacattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatcttttgttctctgaaat 27402  T
Q  228 aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27403 aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 27443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 27485 - 27636
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || | ||| |    
T  27485 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacaaaatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctta 27584  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  27585 atcttatgtaaccctagtttcccttctaaattcaccgttttaacatggatta 27636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 128 - 268
Target Start/End: Original strand, 39303 - 39439
Alignment:
Q  128 tggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaat 227  Q
    ||||||||||||||||    |||||||  |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  39303 tggaacattctagtga----ttgcttacattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaataatcatcttttgttctctgaaat 39398  T
Q  228 aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39399 aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 39439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 39481 - 39632
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaa-tcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   || | ||| |    
T  39481 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacaaaatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctta 39580  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39581 atcttatgtaaccctagtttcccttctaaattcaccgttttaacatggatta 39632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 419
Target Start/End: Complemental strand, 17857 - 17730
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtc-taatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17857 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtcttaatgacataatcctaatcaaaccaagctattgaccctaa 17758  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaa 419  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  17757 tcttatgtaacactaatctctaatctaa 17730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17989 - 17913
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17989 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 17913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 37925 - 37774
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcct-aatcaaacc-aagatttgacccta 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||  ||| ||    
T  37925 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgttttgggattgtttgataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaacattaaacctta 37826  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  37825 atcttatgtaaccctagtttctcttctaaattcacagttttaacatggatta 37774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38115 - 37967
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||||||||    
T  38115 tttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgattgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttc 38016  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  38015 tctgtaataataagtgacaattgtttctttaaacaaaagttcaccttta 37967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 38209 - 38141
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38209 gaatttgaagatcttgtacaaaaatataaaagtggcacgccccattatacccttttgttgcttttgctt 38141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 18739 - 18588
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcct-aatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   || | ||| |    
T  18739 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaatcaaaccaaaccttaaacctca 18640  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  18639 atattatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttcacatggatta 18588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18901 - 18781
Alignment:
Q  148 ttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttct 247  Q
    |||||||| |||||||||||    | |||||||||||||||| |||| |||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18901 ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagttagccatcacaaatattcatcttttgttctttgaaataataagggacaattgtttct 18802  T
Q  248 ttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18801 ttgaataaaagttcaccttta 18781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 2395 - 2249
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  2395 atgtctacgatgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 2296  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  2295 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 2249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2573 - 2502
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2573 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 2502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 21673 - 21527
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  21673 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataattctgaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 21574  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  21573 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaagtcaccggtttaacatg 21527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27011 - 26862
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgtt 218  Q
    |||||||||||||||||||||| |  || |||||||| |||||| ||||    |  |||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||    
T  27011 gtttcttgtggaacattctagtaatgtaattgcttagattttaattcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgtt 26912  T
Q  219 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26911 ctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 26862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 26820 - 26733
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26820 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaag 26733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 175 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21808 - 21715
Alignment:
Q  175 ctataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808 ctataaatagagtatctacccatcacaaatattcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 21715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3022 - 2877
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  3022 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaa 2923  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  2922 tcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccactttaacatg 2877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3200 - 3129
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3200 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagtttttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 3129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 2325 - 2181
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | | || ||||    
T  2325 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaat 2226  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  2225 cttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 2181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 295 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 14589 - 14441
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatc 393  Q
    ||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||  |||| ||||    
T  14589 tgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttgggattgttggataagtctaatgacatattcctaataaaaccaagccttaaaccccaatc 14490  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||    
T  14489 ttatgtaaccttagtttctaatctgaattcaccgtctttacatgaatta 14441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0683 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0683
Description:

Target: scaffold0683; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 5497 - 5648
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| ||| | ||| |    
T  5497 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtttaaattacataatcctaatcaaaccaagctttaaacctta 5596  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  5597 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccattttaacatgaatta 5648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 6461 - 6310
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgacccta- 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||| | |||      
T  6461 atgtctactatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatcctaattaaaccaagctttaaaccttt 6362  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6361 atcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 6310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 76; Significance: 6e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 294 - 440
Target Start/End: Original strand, 13163 - 13310
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | | | || ||||    
T  13163 atgtctacgatgaacatgagcgagtagacttctcttgtcttgggattatttgataagtctaatgaaataatcctaaccaaaccaagctctaagccttaat 13262  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaat 440  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13263 cttatgtaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaat 13310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 261
Target Start/End: Original strand, 31521 - 31718
Alignment:
Q  65 cttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattt-tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaa 162  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |     
T  31521 cttttgctgcttctgcttcaaaggaaagctacttatttctgacctaaaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgatgtagt-gcttaggtttaag 31619  T
Q  163 gtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||  ||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  31620 gtcgttttgagactataaatagagtagctagctatcataacaattaatcttttgttcttggaattaagtagtaacaattgtcttttttaataaaagttc 31718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 375
Target Start/End: Original strand, 49825 - 49888
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 375  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49825 agtgagtagacctttcttgtcttgggatttttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaac 49888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 1504 - 1653
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  1504 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaat 1603  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1604 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 1653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0760 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0760
Description:

Target: scaffold0760; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 295 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 6200 - 6055
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtcta-atgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aa 391  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||    
T  6200 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctagatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaactttaa 6101  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  6100 tcttatgcaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 6055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 5550 - 5699
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  5550 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaat 5649  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5650 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 5699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 74; Significance: 9e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 303 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 300132 - 299995
Alignment:
Q  303 atgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgt 399  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||    
T  300132 atgaacattagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagccttaatcttatgt 300033  T
Q  400 aaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  300032 aaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 299995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 300318 - 300253
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctag 193  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||    
T  300318 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctag 300253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 268
Target Start/End: Original strand, 2442 - 2582
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    |||||||| |||||||||||    |||||||| |||||||| ||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||| |    
T  2442 cttgtggagcattctagtga----ttgcttagattttaagtggaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctcgg 2537  T
Q  224 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2538 aaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 2582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 14205 - 14290
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||    
T  14205 atgtctataatgaacatgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgtttgataagtctaatgacctaatccctatcgaaccaag 14290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1323 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold1323
Description:

Target: scaffold1323; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 174 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2016 - 1922
Alignment:
Q  174 actataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2016 actataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttgttctcggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 1922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1323; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 328 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 643 - 530
Alignment:
Q  328 ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaa 425  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||     
T  643 ttgtcttgggattgttggataagtttaaatgacataatgctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaatctctaatctaaattcac 544  T
Q  426 cgttttaacatgaa 439  Q
    ||||||||||||||    
T  543 cgttttaacatgaa 530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1323; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1880 - 1818
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttc-tcttgtcttgagattgttggataagtctaa 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1880 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaa 1818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 24589 - 24735
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  24589 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 24688  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  24689 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 24735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 30659 - 30805
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  30659 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 30758  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| || |||||||||    
T  30759 atcttatgtaaccctaatttcttatctcaattcaccgctttaacatg 30805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 186354 - 186500
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  186354 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcatgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 186453  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  186454 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 186500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Original strand, 49994 - 50079
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggat-aagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49994 atgtttacaatgaacgttagtgagtagactcttcttatcttgggattgttggataaagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 50079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 275
Target Start/End: Original strand, 49904 - 49972
Alignment:
Q  208 catcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc-acctttattttatg 275  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  49904 catcttttgttcttggaaataataagtgacaattgttcctttgagtaaaaattcaacctttattttatg 49972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 49701 - 49791
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataa-aagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagaca-agctgcctatttt 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| || | ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  49701 gaatttgaagatcttgtacaaaaatataacaagtggcgcg-ccctttttgcccttttgctgcttttgcttcttcgacatagctgcctatttt 49791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 61960 - 62110
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaa--tcaaaccaagatttgacccta 390  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | || | ||  ||  ||| ||    
T  61960 atgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctctt-tcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaaattgaaccaaaccttaaacctta 62058  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  62059 atcttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 62110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 121 - 268
Target Start/End: Original strand, 61770 - 61918
Alignment:
Q  121 tttcttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttc 219  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| |||    
T  61770 tttcttatggaatattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatcttttcttc 61869  T
Q  220 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccttta 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  61870 tctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaaattgaccttta 61918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 61676 - 61744
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  61676 gaatttgaagatcttgtacaaaaatataaaagtggcacgccccattatacccttttgctgcttttgctt 61744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 1764 - 1915
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   | | || ||    
T  1764 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagccctaagcctta 1863  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  1864 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 1915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 4056 - 4207
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   | | || ||    
T  4056 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcttaatcaaaccaagccctaagcctta 4155  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  4156 atcttatgtaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 4207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 10756 - 10606
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa--tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct- 389  Q
    |||||||| |||||| | | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| | | | |||     
T  10756 atgtctacgatgaacatgactgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaaatgacgtaatcctaatcaagccaagctctaagcctt 10657  T
Q  390 aatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaat 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  10656 aatcttatgtaaccctagtttcttatctaaattcaccgctttaacatgaat 10606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 2380 - 2252
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatcttatgtaaccctagt 408  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| | | | ||| ||||||||||||||||| |    
T  2380 agtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaataacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatcttatgtaaccctaat 2281  T
Q  409 ttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  2280 ttcttatctaaattcaccactttaacatg 2252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 2594 - 2514
Alignment:
Q  120 gtttcttgtggaacattctagtga-atagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||    |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  2594 gtttcttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattttaagtcgaatgtatgctataaatagagtagctagccatca 2514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 297 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 14140 - 13997
Alignment:
Q  297 tctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatc 393  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| ||||    
T  14140 tctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatc 14041  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  14040 ttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 13997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14326 - 14212
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctctg 223  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||||   |||| ||    
T  14326 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaatattcatctt---ttctttg 14234  T
Q  224 aaat--aataagtgacaattgt 243  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  14233 aaattcaataagtgacaattgt 14212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 312 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 21625 - 21494
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgtaaccctagttt 410  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| |||| |||||||||||||||||    
T  21625 agtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaatattatgtaaccctagttt 21526  T
Q  411 ctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21525 ctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 21494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 5387 - 5538
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct-cttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | | || ||    
T  5387 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttcttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagccctaagcctta 5486  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  5487 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatggatta 5538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 15217 - 15363
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  15217 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggatttttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 15316  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  15317 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 15363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 934 - 788
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  934 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttttctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 835  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  834 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Original strand, 3436 - 3569
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  3436 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 3535  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3536 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattca 3569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 44269 - 44184
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44269 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcgtaatcaaatcaag 44184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 44442 - 44341
Alignment:
Q  118 tggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||| |||||| |     ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  44442 tggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttagattttaaattattgtaa-actataaatagagtagctagctatcaccacaattcatcttttgt 44344  T
Q  218 tct 220  Q
    |||    
T  44343 tct 44341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 400 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 44178 - 44136
Alignment:
Q  400 aaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44178 aaccctaatttttaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 44136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 44556 - 44469
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataa-aagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctatt 101  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||| || |||||||| | || || ||||||| ||||||||| ||||||    
T  44556 gaatttgaagatcttgtgcaaaaatataacaagtggcgcg-ccccttttaccctttcgttgtttctgcttcaaagacaagctacctatt 44469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 9196 - 9112
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9196 atgtctacaatgaacgttagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataaatctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 9112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9285 - 9221
Alignment:
Q  212 ttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttca-cctttattttatg 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9285 ttttgttcttggaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcaccctttattttatg 9221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9339 - 9282
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggtttt 160  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  9339 tgacctaaaagcccgtggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggtttt 9282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 297 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 7810 - 7667
Alignment:
Q  297 tctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-aatc 393  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| ||||    
T  7810 tctacgatgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagccttaatc 7711  T
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  7710 ttatgtaaccctgatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 7667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1776 - 1656
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    ||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   | | || ||    
T  1776 atgtctacgttgaacatgagtgagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagcgctaagcctta 1677  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttc 411  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  1676 atcttatgtaaccctaatttc 1656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 294 - 416
Target Start/End: Original strand, 38651 - 38773
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagatttg-accctaat 392  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||  | | ||||||||    
T  38651 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgagattgttggatgagtctaatgacctaatcatattcaaaccaagcctagaaccctaat 38749  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatc 416  Q
     ||||||||||||| |||||||||    
T  38750 tttatgtaaccctattttctaatc 38773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 261
Target Start/End: Original strand, 38505 - 38559
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38505 tcatcttttgttcttggaaattataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 38559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0974 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0974
Description:

Target: scaffold0974; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 1794 - 1940
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  1794 atgtctacgatgaacatgagtgagcagacttctccttgtcttgggattgttgggtaagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 1893  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  1894 atcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgctttaacatg 1940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 406
Target Start/End: Original strand, 19789 - 19903
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagat-ttgaccctaa 391  Q
    |||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  19789 atgtatacgatgaacatgagtgagtagacttcttttgtcttggaattgttggataagtctaaatgacataatactaatcaaaccaagctattgaccctaa 19888  T
Q  392 tcttatgtaacccta 406  Q
    |||||||||||||||    
T  19889 tcttatgtaacccta 19903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 261
Target Start/End: Original strand, 19593 - 19732
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctct 222  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||| ||||      
T  19593 cttgtggaacattctagtgatgtaattgcttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcataaatattcatcttttattcttg 19692  T
Q  223 gaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||| |  ||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  19693 gaattcgataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 19732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 25508 - 25362
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | | | ||| |    
T  25508 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttttccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgaaataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 25409  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  25408 atcttatgtaaccctaatttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 25362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 19477 - 19626
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  19477 atgtctacgatgaccatgagtgagtagactttttatgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaat 19576  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||| ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  19577 attatataaccctagttactcttttaaattcaccgttttaacatggatta 19626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 26306 - 26455
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  26306 atgtctacgatgaccatgagtgagtagactttttatgtcttgggattgttgaataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaat 26405  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||| ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||| ||||    
T  26406 attatataaccctagttactcttttaaattcaccgttttaacatggatta 26455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0624 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0624
Description:

Target: scaffold0624; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 4791 - 4876
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4791 atgtctacgatgaacatgagcgagtagacttctcttgtcttgggattgttggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaag 4876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 350 - 201
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||  ||  | | ||||    
T  350 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttcttatgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcataataaagtcaagccttcaatcttaat 251  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  250 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 375
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21371
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21290 atgtctacaataaacgttagtgagtagactcttcttgttttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaac 21371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 20991 - 21205
Alignment:
Q  14 gaatttgaagatcttgtacaataatataaaagtggtgcgacccattata-cccttttgctgcttttgcttcatagacaagctgcctattt---------t 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||| | |||| | || ||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||          |    
T  20991 gaatttgaagatcttgtacaaatatatacaagaggtgtgccccactttagcccttttgctgattttgctttctggacaagctacctattagtttatttct 21090  T
Q  104 gacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataac 203  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21091 aacctaaaagcct-tggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtcgttatac-actataaattgagtagctagctatcataac 21188  T
Q  204 aaatcatcttttgttct 220  Q
    || ||||||||||||||    
T  21189 aattcatcttttgttct 21205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 6681 - 6597
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6681 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagactcttcttgtcttgggattgttggataagcctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 6597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6774 - 6738
Alignment:
Q  208 catcttttgttctctgaaataataagtgacaattgttt 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6774 catcttttgttct-tgaaataataagtgacaattgttt 6738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 1766 - 1616
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt--gaccctaa 391  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||   ||| |||    
T  1766 atgtctacgatgaacataagtgagtagacttcttatatcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaggtcaagccttaaaaccttaa 1667  T
Q  392 tcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    | |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1666 tattatgtaaccttagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 1616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 33919 - 33804
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | || ||    
T  33919 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagctctaagcctta 33820  T
Q  391 atcttatgtaacccta 406  Q
    ||||||||||||||||    
T  33819 atcttatgtaacccta 33804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 424
Target Start/End: Original strand, 405 - 539
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatca-aaccaagatttga-ccct 389  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | | | || |    
T  405 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcatgaccaagctctaagcctt 504  T
Q  390 aatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattca 424  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  505 aatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattca 539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 431
Target Start/End: Original strand, 18966 - 19104
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||  ||| ||||    
T  18966 atgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcttatgtctttggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagccttaaaccttaat 19065  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgtttt 431  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  19066 attatgtaaccctagtttctcttctaaattcatcgtttt 19104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 59; Significance: 8e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 17162 - 17308
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctct-tgtcttgagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttgaccct-a 390  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | | | ||| |    
T  17162 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctctatgtcttaggattgttgaataagtctaaatgacataatcctaatcaagccaagctctaagcctta 17261  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||    
T  17262 atcttatgtaaccctaatttcttatcaaaattcaccgctttaacatg 17308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0264 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0264
Description:

Target: scaffold0264; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 294 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 22399 - 22315
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaa 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22399 atgtctacaatgaacgtgagtgagtagacacttcttgtcttgggattgatggataagtctaatgacgtaatcctaatcaaaccaa 22315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0275 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0275
Description:

Target: scaffold0275; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 354 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 2143 - 2054
Alignment:
Q  354 aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-ccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2143 aatgacataatcctaatcgaaccaagttttaaaccctaattttatgtaactctaatttctaatctaaattcatcgttttaacatgaatta 2054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 6981 - 6870
Alignment:
Q  299 tacaatgaacgttagtgagtagactt-ctcttgtctt-gagattgttggataagtctaa-tgacataatcctaatcaaaccaagatttga---ccctaat 392  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |   || ||||    
T  6981 tacaatgaacgtcagtgagtagactttctcttgtctttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaaaccaagactttaaacccttaat 6882  T
Q  393 cttatgtaaccc 404  Q
    ||||||||||||    
T  6881 cttatgtaaccc 6870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 47821 - 47973
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttct--cttgt-cttgag-attgttggataagtctaa--tgacataatcctaatcaaacc-aagatttga- 385  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||   | |     
T  47821 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctttcttgttcttgggtattgttggataagtctaaattgacataatcctaatcaaaccaaagccctaag 47920  T
Q  386 ccctaatcttatg-taaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||    
T  47921 ccttaatcttatgttaaccctagtttcttatctgaattcaccgtcttaacatg 47973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 169330 - 169181
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  ||  ||| || |    
T  169330 atgtctacgatgaccgtgagtgagtagacttcttatgtcttgggatttttggataagtctaatgacataatcctgatcaagtcaagccttaaaccttagt 169231  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  169230 ataatataaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 169181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 346 - 437
Target Start/End: Original strand, 42867 - 42959
Alignment:
Q  346 ataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagattt-gaccctaatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||    
T  42867 ataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaagctttaaaccttaatcttatgtaaccctaattccttatctaaattcaccgctttaacatg 42959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 51; Significance: 5e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 294 - 437
Target Start/End: Original strand, 121667 - 121813
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaaaccaagatttga-cccta 390  Q
    |||||||| |||||  | ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||| | | | || ||    
T  121667 atgtctacgatgaatatgagtcagtagacttctctttgtcttgggattgttggataagtctaaataacataatcctaatcaagtcaagctctaagcctta 121766  T
Q  391 atcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  121767 attttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccgatttaacatg 121813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 294 - 442
Target Start/End: Original strand, 23263 - 23412
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||| |||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||  ||| || |    
T  23263 atgtctacgatgaccatgagtgagtaggcttcttatgtcttggggttgttggataagtctaatgacataatcctaattaagtcaagccttaaaccttagt 23362  T
Q  393 cttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
     |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23363 attatataaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 23412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 199
Target Start/End: Original strand, 23076 - 23147
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatca 199  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23076 cttgtggaacattctagtga----ttgcttagattttaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatca 23147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1559 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold1559
Description:

Target: scaffold1559; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 272
Target Start/End: Original strand, 1411 - 1478
Alignment:
Q  205 aatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttatttt 272  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  1411 aatcatcttttgttcttggaaataataagtgacaactgtttctttgaataaaagttcatctctatttt 1478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1559; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 1516 - 1600
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  1516 atgtctacaatgaacatgagtgagtagaattct-ttgtctttggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaag 1600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 329 - 442
Target Start/End: Original strand, 4926 - 5041
Alignment:
Q  329 tgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaatcttatgtaa-ccctagtttctaatctaaattcaac 426  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |   ||| |||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| |    
T  4926 tgtcttgggattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaagtcaagcctcaaaccttaatattatgtaacccctagtttctcttctaaattcacc 5025  T
Q  427 gttttaacatgaatta 442  Q
    ||||||||||| ||||    
T  5026 gttttaacatggatta 5041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 103 - 220
Target Start/End: Original strand, 21229 - 21346
Alignment:
Q  103 tgacctacaagcctgtggtttcttgtggaacattctagtgaatagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataa 202  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |    | |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21229 tgacctaaaatcctgtggtttcttgtggaacattctagtgatgtattgcttaggttttaagtc-attgtacactataaatagagtagctagatatcacaa 21327  T
Q  203 ca-aatcatcttttgttct 220  Q
     | ||||||||||||||||    
T  21328 tagaatcatcttttgttct 21346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 370
Target Start/End: Original strand, 21435 - 21511
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaat 370  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  21435 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttttcttgtcttgggattgttggataggtctaatgatgtaatcctaat 21511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 401
Target Start/End: Original strand, 1764 - 1871
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag-atttgaccctaat 392  Q
    |||||||  |||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||||||||||    
T  1764 atgtctatgatgaacatgagtgagtaaacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatcctattcaaaccaagcctatgaccctaat 1862  T
Q  393 cttatgtaa 401  Q
     ||||||||    
T  1863 tttatgtaa 1871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 294 - 373
Target Start/End: Original strand, 4640 - 4719
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaa 373  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4640 atgtctacgatgaccatgagtgagtagacttcttttgacttgggattgttggataagtctaatgatgtaatcctaatcaa 4719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0855 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0855
Description:

Target: scaffold0855; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 3583 - 3667
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  3583 atgtttacaataaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaag 3667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0855; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Original strand, 3478 - 3544
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttat 274  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  3478 tcatcttttgttcttggaaattataagtgacaattgtttcttagaataaaagttc-tctttattttat 3544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0847 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0847
Description:

Target: scaffold0847; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Original strand, 3748 - 3832
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    |||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  3748 atgtttacaataaacatgagtgagtagacttct-ttgtcttgggattgttggatgagtctaatgacctaatccctatcaaaccaag 3832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0847; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 274
Target Start/End: Original strand, 3643 - 3709
Alignment:
Q  207 tcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgtttctttgaataaaagttcacctttattttat 274  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  3643 tcatcttttgttcttggaaattataagtgacaattgtttcttagaataaaagttc-tctttattttat 3709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11806 - 11753
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggata 348  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11806 tgtctacgatgaacattagtgagtagacttctcttgtcttgggattgttggata 11753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 331 - 379
Target Start/End: Original strand, 21748 - 21796
Alignment:
Q  331 tcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21748 tcttgggattgttggataaatctaatgacataatcctaatcaaaccaag 21796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 274
Target Start/End: Original strand, 21657 - 21728
Alignment:
Q  204 aaatcatcttttgttctctgaaataataagtgacaattgttt-ctttgaataaaagttcacctttattttat 274  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21657 aaatcatcttttgttctttgaatttaatagtgacaattgttttcttttaataaaagttcatctttattttat 21728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 373
Target Start/End: Original strand, 3977 - 4040
Alignment:
Q  312 agtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtct-aatgacataatcctaatcaa 373  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3977 agtgagtagacttctttttgtcttgggattgttggataagtctaaatgacataatcctaatcaa 4040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 294 - 355
Target Start/End: Original strand, 5202 - 5264
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa 355  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  5202 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaa 5264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 355
Target Start/End: Original strand, 6777 - 6839
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctctt-gtcttgagattgttggataagtctaa 355  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  6777 atgtctacgatgaacatgagtgagtagacttctttttgtcttgggattgttggataagtctaa 6839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 303 - 355
Target Start/End: Original strand, 33769 - 33822
Alignment:
Q  303 atgaacgttagtgagtagacttctc-ttgtcttgagattgttggataagtctaa 355  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  33769 atgaacatgagtgagtagacttctccttgtcttgggattgttggataagtctaa 33822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 37 - 82
Target Start/End: Original strand, 54724 - 54769
Alignment:
Q  37 atataaaagtggtgcgacccattatacccttttgctgcttttgctt 82  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54724 atataaaagtggcacgccccattatacccttttgctgcttttgctt 54769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 394 - 442
Target Start/End: Original strand, 74174 - 74222
Alignment:
Q  394 ttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  74174 ttatgtaaccctagtttctcttctaaattcaccgttttaacatggatta 74222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 395 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 70501 - 70454
Alignment:
Q  395 tatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatgaatta 442  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  70501 tatntaaccctaatctctaatctaaattcaccgttttaacatgaatta 70454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 232431 - 232292
Alignment:
Q  124 cttgtggaacattctagtgaa-tagttgcttaggttttaagtcgacataagactataaatagagtagctagctatcataacaaatcatcttttgttctct 222  Q
    ||||||||||||||||||||  || || ||||| || ||||||||    | ||||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||| ||||      
T  232431 cttgtggaacattctagtgatgtaattacttagattctaagtcgaatgtaaactataaatagagtagctagccatcacaaacattcatcttttattcttg 232332  T
Q  223 gaaat-aataagtgacaattgtttctttgaataaaagttc 261  Q
    ||| | |||||||||||||||| | | | |||||||||||    
T  232331 gaattcaataagtgacaattgtctttcttaataaaagttc 232292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22710 - 22626
Alignment:
Q  294 atgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctcttgtcttgagattgttggataagtctaatgacataatcctaatcaaaccaag 379  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||| | || ||| ||  |||||||||||    
T  22710 atgtctacaatgaacatgagtgagtagacttct-ttttcttaggattgttggatgagtctattaacctaacccctatcaaaccaag 22626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 327
Target Start/End: Original strand, 18814 - 18846
Alignment:
Q  295 tgtctacaatgaacgttagtgagtagacttctc 327  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18814 tgtctacaatgaacgtcagtgagtagacttctc 18846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 389 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 105074 - 105026
Alignment:
Q  389 taatcttatgtaaccctagtttctaatctaaattcaacgttttaacatg 437  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  105074 taatcttatgtaaccctaatttcttatctaaattcaccactttaacatg 105026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University