View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5298-Insertion-6 (Length: 563)

Name: NF5298-Insertion-6
Description: NF5298
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5298-Insertion-6
NF5298-Insertion-6
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (105-560)||(31109418-31109872)
chr7 (105-554)||(24024167-24024618)
chr7 (103-554)||(12406128-12406576)
chr7 (105-554)||(12396710-12397156)
chr7 (132-540)||(19992134-19992544)
chr7 (126-540)||(21812092-21812508)
chr7 (104-401)||(4866527-4866820)
chr7 (156-489)||(20357463-20357797)
chr7 (296-540)||(24266054-24266302)
chr7 (103-540)||(24261175-24261619)
chr7 (133-489)||(2057786-2058147)
chr7 (296-540)||(16884914-16885162)
chr7 (296-540)||(16880058-16880306)
chr7 (156-489)||(1533359-1533690)
chr7 (251-489)||(21639752-21639988)
chr7 (271-406)||(18408726-18408859)
chr7 (271-489)||(21645968-21646186)
chr7 (274-406)||(18413606-18413735)
chr7 (491-554)||(4873310-4873373)
chr7 (489-560)||(20357340-20357410)
chr7 (489-560)||(1533237-1533307)
chr7 (489-560)||(2058202-2058272)
chr7 (311-406)||(29159802-29159900)
chr7 (313-396)||(21983285-21983370)
chr7 (311-406)||(55947-56044)
chr7 (311-406)||(46516310-46516408)
chr7 (311-406)||(49091660-49091758)
chr7 (312-406)||(44848685-44848781)
chr7 (311-406)||(2647696-2647794)
chr7 (489-551)||(21640039-21640101)
chr7 (489-551)||(21646237-21646299)
chr7 (311-406)||(33332450-33332548)
chr7 (311-375)||(9190041-9190106)
chr7 (311-375)||(20284088-20284153)
chr7 (489-551)||(18408993-18409055)
chr7 (311-375)||(2580389-2580454)
chr7 (132-227)||(16879893-16879990)
chr7 (132-227)||(16884749-16884846)
chr7 (132-227)||(24266370-24266467)
chr7 (489-551)||(18413869-18413931)
chr7 (333-375)||(28617258-28617300)
chr7 (334-395)||(35960839-35960901)
chr7 (311-375)||(9185198-9185263)
chr7 (312-381)||(47263678-47263746)
chr7 (311-406)||(4796667-4796765)
chr7 (312-395)||(2479337-2479421)
chr7 (319-375)||(31155914-31155971)
chr7 (316-375)||(20297591-20297651)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (105-560)||(39811823-39812278)
chr2 (105-553)||(32246577-32247031)
chr2 (104-455)||(44312563-44312911)
chr2 (103-540)||(19349068-19349513)
chr2 (105-540)||(19344212-19344655)
chr2 (133-489)||(11098843-11099196)
chr2 (158-489)||(14291337-14291669)
chr2 (156-489)||(9296317-9296651)
chr2 (199-406)||(25398386-25398591)
chr2 (199-406)||(25403524-25403729)
chr2 (274-489)||(3491716-3491930)
chr2 (311-397)||(8040059-8040147)
chr2 (489-560)||(11098720-11098790)
chr2 (289-394)||(40738822-40738926)
chr2 (319-406)||(13569335-13569425)
chr2 (311-406)||(21629943-21630040)
chr2 (312-406)||(28259178-28259274)
chr2 (489-560)||(9296195-9296265)
chr2 (489-560)||(14291722-14291792)
chr2 (311-406)||(10445444-10445542)
chr2 (311-406)||(17865202-17865300)
chr2 (311-406)||(20522219-20522317)
chr2 (311-406)||(34682334-34682432)
chr2 (342-406)||(25407653-25407718)
chr2 (313-406)||(34388859-34388955)
chr2 (311-381)||(14699034-14699105)
chr2 (489-551)||(25409860-25409922)
chr2 (313-406)||(10707252-10707348)
chr2 (319-406)||(8390150-8390240)
chr2 (334-397)||(31056067-31056131)
chr2 (489-551)||(3491981-3492043)
chr2 (311-406)||(33528621-33528719)
chr2 (311-406)||(39482930-39483028)
chr2 (333-406)||(42039670-42039744)
chr2 (319-406)||(23078471-23078560)
chr2 (311-397)||(16940219-16940307)
chr2 (311-397)||(17010884-17010972)
chr2 (333-381)||(33118158-33118206)
chr2 (333-375)||(27149327-27149369)
chr2 (312-381)||(36757789-36757859)
chr2 (319-375)||(1345574-1345631)
chr2 (319-375)||(2838063-2838120)
chr2 (319-375)||(35215589-35215646)
chr2 (319-375)||(35217966-35218023)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (104-554)||(15044483-15044931)
chr5 (105-554)||(1457002-1457445)
chr5 (105-554)||(43592080-43592524)
chr5 (103-554)||(43598523-43598969)
chr5 (103-554)||(43604015-43604461)
chr5 (103-554)||(43609507-43609953)
chr5 (103-554)||(27449613-27450059)
chr5 (100-554)||(27444766-27445215)
chr5 (105-540)||(28807429-28807868)
chr5 (127-540)||(37561300-37561715)
chr5 (132-540)||(37556478-37556888)
chr5 (133-488)||(30631231-30631586)
chr5 (132-540)||(2785196-2785608)
chr5 (132-540)||(33791137-33791549)
chr5 (132-540)||(31396843-31397257)
chr5 (234-489)||(31180139-31180394)
chr5 (132-540)||(31401700-31402114)
chr5 (132-540)||(33768000-33768417)
chr5 (199-489)||(38192064-38192353)
chr5 (199-489)||(38219289-38219578)
chr5 (198-489)||(24135739-24136028)
chr5 (251-406)||(35387606-35387758)
chr5 (489-554)||(30631640-30631705)
chr5 (489-560)||(31180447-31180517)
chr5 (312-406)||(9353333-9353429)
chr5 (312-406)||(36932351-36932447)
chr5 (489-560)||(24136080-24136150)
chr5 (312-406)||(10281751-10281848)
chr5 (312-406)||(15464532-15464628)
chr5 (489-551)||(35387893-35387955)
chr5 (313-406)||(11916972-11917068)
chr5 (311-381)||(17003987-17004058)
chr5 (312-406)||(14520230-14520326)
chr5 (333-406)||(3880321-3880396)
chr5 (489-551)||(38219629-38219691)
chr5 (319-406)||(12084176-12084265)
chr5 (312-406)||(19588746-19588843)
chr5 (311-375)||(28832258-28832323)
chr5 (319-375)||(4410241-4410298)
chr5 (311-375)||(42127443-42127508)
chr5 (319-375)||(15552464-15552521)
chr5 (319-375)||(31179374-31179431)
chr5 (311-375)||(31300629-31300694)
chr5 (319-375)||(31542953-31543010)
chr5 (319-375)||(31545299-31545356)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (103-560)||(41398030-41398486)
chr1 (105-553)||(25444931-25445382)
chr1 (102-553)||(44023716-44024166)
chr1 (104-553)||(39445291-39445742)
chr1 (105-553)||(1054854-1055304)
chr1 (210-560)||(41390485-41390831)
chr1 (132-540)||(43988314-43988730)
chr1 (156-489)||(24787280-24787617)
chr1 (417-553)||(25439738-25439874)
chr1 (199-489)||(24202686-24202973)
chr1 (105-208)||(41386543-41386646)
chr1 (274-406)||(19361433-19361564)
chr1 (274-406)||(19380073-19380204)
chr1 (274-489)||(19358760-19358975)
chr1 (489-551)||(24202573-24202635)
chr1 (490-560)||(24787157-24787226)
chr1 (312-406)||(3281708-3281804)
chr1 (312-406)||(26644898-26644994)
chr1 (311-397)||(47703946-47704034)
chr1 (312-406)||(19072928-19073025)
chr1 (312-406)||(19120818-19120915)
chr1 (311-397)||(29651810-29651898)
chr1 (311-406)||(16124516-16124614)
chr1 (311-406)||(27104372-27104470)
chr1 (311-397)||(9476260-9476348)
chr1 (311-397)||(13598397-13598485)
chr1 (312-404)||(37069770-37069864)
chr1 (311-397)||(775671-775759)
chr1 (334-406)||(13604624-13604697)
chr1 (342-406)||(21536570-21536635)
chr1 (311-375)||(47098857-47098922)
chr1 (489-551)||(19366112-19366174)
chr1 (489-551)||(21536378-21536438)
chr1 (489-551)||(19361237-19361298)
chr1 (333-375)||(32889461-32889503)
chr1 (319-375)||(9459422-9459479)
chr1 (319-375)||(9463249-9463306)
chr1 (319-375)||(16226386-16226443)
chr1 (319-375)||(47102874-47102931)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (105-556)||(28184297-28184754)
chr6 (103-554)||(14737417-14737868)
chr6 (105-554)||(14742277-14742725)
chr6 (104-554)||(22010537-22010984)
chr6 (102-554)||(11856762-11857219)
chr6 (105-553)||(28155412-28155861)
chr6 (104-553)||(6438293-6438743)
chr6 (132-540)||(6005238-6005650)
chr6 (132-540)||(33330297-33330711)
chr6 (132-540)||(16838565-16838977)
chr6 (132-540)||(33335794-33336208)
chr6 (313-489)||(5674685-5674865)
chr6 (489-560)||(5674563-5674633)
chr6 (132-227)||(5343301-5343397)
chr6 (312-406)||(5757479-5757575)
chr6 (312-406)||(21356036-21356132)
chr6 (311-396)||(10077176-10077263)
chr6 (311-406)||(5572241-5572339)
chr6 (311-395)||(31086485-31086571)
chr6 (312-396)||(4629954-4630040)
chr6 (469-540)||(5343637-5343710)
chr6 (311-406)||(31979512-31979610)
chr6 (324-406)||(21801344-21801429)
chr6 (334-394)||(22709041-22709102)
chr6 (156-255)||(30125944-30126044)
chr6 (310-357)||(5343480-5343527)
chr6 (333-406)||(18232867-18232942)
chr6 (311-406)||(22963699-22963796)
chr6 (311-406)||(23824597-23824694)
chr6 (311-375)||(31936586-31936651)
chr6 (311-394)||(5017482-5017567)
chr6 (319-375)||(12195518-12195575)
chr6 (488-551)||(31086282-31086343)
[»] chr8 (49 HSPs)
chr8 (105-553)||(39784665-39785114)
chr8 (103-553)||(25328120-25328570)
chr8 (105-554)||(7289766-7290210)
chr8 (133-489)||(6311121-6311477)
chr8 (132-540)||(35745212-35745624)
chr8 (133-489)||(36979205-36979558)
chr8 (156-488)||(33037724-33038056)
chr8 (156-489)||(30655488-30655827)
chr8 (296-540)||(10684116-10684364)
chr8 (156-489)||(4759991-4760325)
chr8 (156-489)||(18853083-18853418)
chr8 (156-489)||(18870477-18870809)
chr8 (133-489)||(10689058-10689412)
chr8 (274-394)||(26287866-26287985)
chr8 (274-394)||(26301123-26301242)
chr8 (274-394)||(26313117-26313236)
chr8 (312-489)||(1261871-1262050)
chr8 (477-553)||(25327994-25328070)
chr8 (489-560)||(6311532-6311602)
chr8 (489-560)||(18870354-18870424)
chr8 (489-560)||(30655880-30655950)
chr8 (274-489)||(31071146-31071362)
chr8 (489-560)||(10688933-10689003)
chr8 (489-560)||(18852960-18853030)
chr8 (311-397)||(26403240-26403328)
chr8 (489-560)||(33037601-33037671)
chr8 (489-560)||(36979611-36979680)
chr8 (489-551)||(1261758-1261820)
chr8 (333-406)||(4456050-4456124)
chr8 (319-406)||(7412348-7412437)
chr8 (312-406)||(19175755-19175851)
chr8 (311-381)||(4696623-4696694)
chr8 (489-551)||(4759875-4759938)
chr8 (314-375)||(9765852-9765914)
chr8 (311-406)||(23799577-23799675)
chr8 (26-90)||(12196950-12197013)
chr8 (26-90)||(12441378-12441441)
chr8 (333-406)||(6127243-6127318)
chr8 (311-406)||(5702483-5702581)
chr8 (132-227)||(10684432-10684529)
chr8 (489-549)||(31071035-31071095)
chr8 (489-551)||(26288121-26288183)
chr8 (489-551)||(26301378-26301440)
chr8 (489-551)||(26313372-26313434)
chr8 (311-375)||(19752427-19752492)
chr8 (489-551)||(7412569-7412629)
chr8 (342-375)||(18810982-18811015)
chr8 (319-375)||(43079877-43079934)
chr8 (319-375)||(43082248-43082305)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (105-553)||(3813816-3814266)
chr4 (105-553)||(45347658-45348109)
chr4 (103-554)||(9224247-9224700)
chr4 (105-553)||(45357138-45357588)
chr4 (105-554)||(9229034-9229484)
chr4 (105-554)||(51520258-51520702)
chr4 (104-553)||(5732457-5732907)
chr4 (105-540)||(18855519-18855956)
chr4 (105-442)||(56146664-56146995)
chr4 (156-489)||(24741788-24742121)
chr4 (133-487)||(29760470-29760821)
chr4 (483-554)||(18712606-18712677)
chr4 (274-394)||(28468542-28468660)
chr4 (489-560)||(24742174-24742244)
chr4 (275-406)||(31985635-31985764)
chr4 (311-406)||(10047378-10047476)
chr4 (311-406)||(39245993-39246091)
chr4 (319-406)||(36315230-36315319)
chr4 (319-406)||(36329439-36329528)
chr4 (489-560)||(29760874-29760945)
chr4 (311-406)||(16623293-16623391)
chr4 (312-406)||(5396672-5396768)
chr4 (311-397)||(38152449-38152537)
chr4 (312-406)||(3796519-3796616)
chr4 (313-396)||(5143260-5143345)
chr4 (311-394)||(5269204-5269289)
chr4 (313-396)||(5147678-5147763)
chr4 (333-397)||(24333831-24333896)
chr4 (319-397)||(6743425-6743505)
chr4 (313-406)||(3777550-3777645)
chr4 (333-406)||(16630680-16630755)
chr4 (489-551)||(28468342-28468404)
chr4 (333-375)||(39774338-39774380)
chr4 (319-375)||(16931792-16931849)
chr4 (319-375)||(16934146-16934203)
chr4 (319-375)||(22780376-22780433)
chr4 (319-375)||(44599841-44599898)
chr4 (489-548)||(5112466-5112523)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (100-524)||(9514-9935)
scaffold0355 (398-560)||(3683-3845)
scaffold0355 (106-253)||(28-170)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (105-554)||(22173035-22173484)
chr3 (104-553)||(18656227-18656677)
chr3 (126-540)||(2676939-2677358)
chr3 (126-540)||(2672783-2673202)
chr3 (133-489)||(7167072-7167425)
chr3 (152-489)||(28503780-28504108)
chr3 (132-540)||(8512036-8512450)
chr3 (132-540)||(8516916-8517330)
chr3 (160-540)||(24967957-24968340)
chr3 (156-406)||(2671587-2671836)
chr3 (254-486)||(8738982-8739213)
chr3 (254-486)||(9091220-9091451)
chr3 (296-540)||(32475470-32475717)
chr3 (296-540)||(32480328-32480575)
chr3 (271-489)||(40372712-40372929)
chr3 (355-489)||(28501613-28501750)
chr3 (271-489)||(8477324-8477545)
chr3 (102-360)||(10207722-10207983)
chr3 (312-489)||(26928507-26928687)
chr3 (274-406)||(1305914-1306044)
chr3 (489-560)||(28501489-28501560)
chr3 (489-560)||(28503656-28503727)
chr3 (275-489)||(32143287-32143501)
chr3 (489-560)||(2671379-2671449)
chr3 (489-560)||(8477598-8477668)
chr3 (489-560)||(40372589-40372659)
chr3 (489-554)||(8738861-8738926)
chr3 (489-560)||(7167478-7167549)
chr3 (312-406)||(8370477-8370573)
chr3 (312-406)||(27974943-27975039)
chr3 (489-560)||(9091094-9091164)
chr3 (311-406)||(18552873-18552971)
chr3 (311-406)||(48438213-48438311)
chr3 (311-406)||(21711222-21711319)
chr3 (312-406)||(16264350-16264446)
chr3 (312-406)||(27452958-27453054)
chr3 (312-394)||(27986449-27986533)
chr3 (313-406)||(36029094-36029190)
chr3 (319-406)||(1736295-1736385)
chr3 (312-406)||(30709780-30709877)
chr3 (312-394)||(33386669-33386753)
chr3 (311-406)||(3715992-3716090)
chr3 (333-406)||(6794704-6794778)
chr3 (311-406)||(40592772-40592870)
chr3 (312-373)||(25795781-25795843)
chr3 (311-406)||(26298987-26299085)
chr3 (311-375)||(1417513-1417578)
chr3 (489-549)||(1306179-1306239)
chr3 (311-406)||(47923896-47923994)
chr3 (337-378)||(4386947-4386988)
chr3 (132-227)||(32475305-32475402)
chr3 (311-375)||(37466290-37466355)
chr3 (312-394)||(39039995-39040079)
chr3 (333-406)||(40844674-40844748)
chr3 (132-227)||(32480162-32480260)
chr3 (311-375)||(3328379-3328444)
chr3 (319-375)||(38210569-38210626)
chr3 (319-375)||(50494198-50494255)
chr3 (342-379)||(53894082-53894119)
chr3 (492-551)||(4386774-4386831)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (105-554)||(34902-35352)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (103-553)||(153-605)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (102-540)||(19017-19461)
scaffold0197 (103-540)||(14161-14605)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (132-540)||(148808-149220)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (132-540)||(2103-2515)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (105-208)||(34136-34239)
[»] scaffold0188 (4 HSPs)
scaffold0188 (199-406)||(17953-18157)
scaffold0188 (271-406)||(24046-24180)
scaffold0188 (489-551)||(17756-17818)
scaffold0188 (489-551)||(23849-23911)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (296-380)||(181980-182064)
scaffold0009 (435-540)||(176829-176936)
scaffold0009 (132-227)||(182132-182229)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (104-195)||(13140-13233)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (312-406)||(8420-8516)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (156-344)||(300-487)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (311-406)||(10728-10826)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (313-406)||(85684-85779)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (312-406)||(43962-44058)
scaffold0087 (312-406)||(36833-36929)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (311-397)||(5682-5770)
scaffold0006 (311-397)||(2491-2579)
scaffold0006 (334-406)||(133281-133354)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (334-381)||(45276-45323)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (319-375)||(269-326)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (342-375)||(11500-11533)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 361; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 105 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 31109872 - 31109418
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31109872 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 31109774  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacagccctaacaagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaac 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  31109773 aagccaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaa-ggaagaacaaaac 31109675  T
Q  305 accatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaa 404  Q
    |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31109674 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 31109575  T
Q  405 gactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattac 503  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109574 gactctagccttcaagctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttgatattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattac 31109475  T
Q  504 aatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31109474 aatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatatggttc 31109418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 105 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 24024618 - 24024167
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaa-ctttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24024618 tgttgtgaatccggttccaaagaaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 24024520  T
Q  204 caagccaacaacaacaaaacagccc-taacaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaa 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | || ||| |||||||||| ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24024519 caagcaaacaacaacaaaacagcctatgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaa-ggaagaacaa 24024422  T
Q  302 aa-caccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtt 400  Q
    || ||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  24024421 aaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaatgtt 24024322  T
Q  401 acaagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 499  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24024321 acaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacgatgaaccctaaaacccacggtga 24024222  T
Q  500 ttacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024221 ttacaatgtttttccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 24024167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 103 - 554
Target Start/End: Original strand, 12406128 - 12406576
Alignment:
Q  103 attgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    |||||||||||||| |||| |||   || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12406128 attgttgtgaatcctgttcaaaa---accttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtct 12406223  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaaca 300  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||    
T  12406224 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcg-gtaaaagaaagaaca 12406321  T
Q  301 aaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtt 400  Q
    |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12406322 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 12406420  T
Q  401 acaaga-ctctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 498  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12406421 acaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagccaaggtg 12406520  T
Q  499 attacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406521 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 12406576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 105 - 554
Target Start/End: Original strand, 12396710 - 12397156
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcc 204  Q
    ||||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12396710 tgttgtgaatccggttcaaaa---accttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 12396805  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa 302  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  12396806 aagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcg-gtaaagggaagaacaaa 12396903  T
Q  303 acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttac 402  Q
    |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12396904 acaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 12397002  T
Q  403 aaga-ctctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 500  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12397003 aagaactctagcctttaatctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactatcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 12397102  T
Q  501 tacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397103 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 12397156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Original strand, 19992134 - 19992544
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa 231  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  19992134 ttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcttacaacaacaaa-cagccctaa 19992232  T
Q  232 -caagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagtt 329  Q
     | |||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| |   |||| | ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  19992233 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 19992331  T
Q  330 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-ccaagctttacac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  19992332 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacac 19992431  T
Q  429 atgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttt-cccaacctaagagac 527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  19992432 atgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatgtttttccccaacctaagaaac 19992531  T
Q  528 actctcaacaaag 540  Q
    |||| || |||||    
T  19992532 actcacatcaaag 19992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 126 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 21812508 - 21812092
Alignment:
Q  126 gaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacag 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||| |||    
T  21812508 gaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cag 21812410  T
Q  226 ccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaagagattcca-aagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgac 323  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |  | ||||||||||||||||| |   ||||   ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  21812409 ccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagttaacaagcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgac 21812311  T
Q  324 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaagactctagcct--ccaagc 421  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||| |  | ||||    
T  21812310 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtga-agtcttacaaaaggttccaagactctagcttgtcaaagc 21812212  T
Q  422 tttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttt-cccaacct 520  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21812211 tttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgtttttccccaacct 21812112  T
Q  521 aagagacactctcaacaaag 540  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  21812111 aagaaacactctcatcaaag 21812092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 104 - 401
Target Start/End: Original strand, 4866527 - 4866820
Alignment:
Q  104 ttgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctc 203  Q
    |||||||||||||||||| |||   || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  4866527 ttgttgtgaatccggttcaaaa---accttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctc 4866622  T
Q  204 caagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatc-acacaaga-gattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaaca 300  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  4866623 caagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcg-gtaaaaggaagaaca 4866720  T
Q  301 aaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtt 400  Q
    |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4866721 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 4866819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 156 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 20357797 - 20357463
Alignment:
Q  156 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacac 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  20357797 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 20357699  T
Q  254 aa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 352  Q
    || |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20357698 aaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaa-ggaagaacaaaataccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttggg 20357603  T
Q  353 ggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctac 449  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  20357602 ggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctttacacaagaacatgccctagattctac 20357503  T
Q  450 cctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    || |  || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20357502 ccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 20357463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 296 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 24266302 - 24266054
Alignment:
Q  296 gaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaa 395  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  24266302 gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 24266203  T
Q  396 ag-gttacaagactctagcct-ccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaaccca 493  Q
    || ||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || ||||    
T  24266202 agagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatccca 24266103  T
Q  494 aggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24266102 aggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 24266054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 103 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 24261619 - 24261175
Alignment:
Q  103 attgttgtgaatccggttcca--aagaaactttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||| |    
T  24261619 attgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatgg 24261520  T
Q  200 tctccaagccaa-caacaacaaaacagccctaa--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaa-agga 294  Q
     |||||||| || |||||||||||||| |||||  | | |||| ||||||  ||||| ||||| |  | ||||||  ||||||||| | | |||| |  |    
T  24261519 cctccaagctaatcaacaacaaaacag-cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaa 24261425  T
Q  295 agaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaa 394  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  24261424 cgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaa 24261325  T
Q  395 aag-gttacaagactctagcct-ccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 492  Q
    ||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||    
T  24261324 aagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatccc 24261225  T
Q  493 aaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  24261224 aagatgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 24261175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 133 - 489
Target Start/End: Original strand, 2057786 - 2058147
Alignment:
Q  133 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta- 230  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||| | ||||||     
T  2057786 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctag 2057881  T
Q  231 acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaa----caagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgaccc 325  Q
    ||  || || ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  2057882 acttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaa-ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgaccc 2057979  T
Q  326 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagct 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |||| | |||||     
T  2057980 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc- 2058078  T
Q  423 ttacacatgaacaaaccctaga-tctaccc-tttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||| | || | | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2058079 ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 2058147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 296 - 540
Target Start/End: Original strand, 16884914 - 16885162
Alignment:
Q  296 gaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaa 395  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||    
T  16884914 gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaa 16885013  T
Q  396 aggttacaagactctagcct-ccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggt-atgttcccactctcacactatgaaccctaaaaccca 493  Q
      ||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | |  ||||||  ||||||||||||||||  || ||||    
T  16885014 gagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatccca 16885113  T
Q  494 aggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  16885114 agatgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 16885162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 296 - 540
Target Start/End: Original strand, 16880058 - 16880306
Alignment:
Q  296 gaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaa 395  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||    
T  16880058 gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaa 16880157  T
Q  396 aggttacaagactctagcct-ccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggt-atgttcccactctcacactatgaaccctaaaaccca 493  Q
      ||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | |  ||||||  ||||||||||||||||  || ||||    
T  16880158 gagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatccca 16880257  T
Q  494 aggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    || ||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||| |||||    
T  16880258 agatgattacaatgttgtttttccaacctaagattcactctcatcaaag 16880306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 1533690 - 1533359
Alignment:
Q  156 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaac-agccctaa-caagtgtatagcaaaatcacac 253  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||||| | ||||     
T  1533690 gatgtgtggagcaaaatatagtggtaatcaatgagaaaaaa--gtttccaagc-aacaacaacaaaaccagccccagtctagtgtagagcaacaccaca- 1533595  T
Q  254 aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 352  Q
    |||||| | |||||||  ||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533594 aagagaatacaaagca--aacaatataagcaagaaaga--aagaacaaacacaccaat-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 1533500  T
Q  353 ggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacacatg-aacaaaccctaga-tct 447  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |||| | ||||| ||||||| | |||||  |||||| |||    
T  1533499 ggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattct 1533401  T
Q  448 accctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1533400 accctttggtgttttcccactctcacaatatgaaccctaaaa 1533359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 251 - 489
Target Start/End: Original strand, 21639752 - 21639988
Alignment:
Q  251 cacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatct 349  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21639752 cacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 21639846  T
Q  350 gggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tc 446  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||    
T  21639847 gggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattc 21639945  T
Q  447 taccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||||| || || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21639946 tacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 21639988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 271 - 406
Target Start/End: Original strand, 18408726 - 18408859
Alignment:
Q  271 aaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18408726 aaacaagataagcaagaaaga--aagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 18408821  T
Q  370 aatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  18408822 aatccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 18408859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 271 - 489
Target Start/End: Original strand, 21645968 - 21646186
Alignment:
Q  271 aaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 369  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21645968 aaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctcc 21646064  T
Q  370 aatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttccca 466  Q
    |||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | ||||    
T  21646065 aatccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttcccca 21646163  T
Q  467 ctctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  21646164 ctctcacaatatgaaccctaaaa 21646186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 406
Target Start/End: Original strand, 18413606 - 18413735
Alignment:
Q  274 caagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 372  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18413606 caagataagcaagaaaga--aagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctccaat 18413700  T
Q  373 ccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  18413701 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 18413735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 491 - 554
Target Start/End: Original strand, 4873310 - 4873373
Alignment:
Q  491 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4873310 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 4873373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 20357410 - 20357340
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20357410 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttc 20357340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 1533307 - 1533237
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1533307 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttc 1533237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Original strand, 2058202 - 2058272
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2058202 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttc 2058272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 29159802 - 29159900
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  29159802 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 29159900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 396
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983370
Alignment:
Q  313 agattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaa 396  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 21983370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 55947 - 56044
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  55947 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 56044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 46516408 - 46516310
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  46516408 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 46516310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 49091660 - 49091758
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  49091660 caagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 49091758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848685
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 44848685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2647794 - 2647696
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  2647794 caagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 2647696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Original strand, 21640039 - 21640101
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21640039 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 21640101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Original strand, 21646237 - 21646299
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21646237 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 21646299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 33332548 - 33332450
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||    
T  33332548 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 33332450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9190106 - 9190041
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9190106 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 9190041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 20284088 - 20284153
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20284088 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 20284153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Original strand, 18408993 - 18409055
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  18408993 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 18409055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 2580389 - 2580454
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2580389 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 2580454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Original strand, 16879893 - 16879990
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaa-caacaacaaaacagcc 227  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16879893 ttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc 16879990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Original strand, 16884749 - 16884846
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaa-caacaacaaaacagcc 227  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  16884749 ttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc 16884846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24266467 - 24266370
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaa-caacaacaaaacagcc 227  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  24266467 ttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc 24266370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Original strand, 18413869 - 18413931
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  18413869 acccaaggtgtttacattgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 18413931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28617300 - 28617258
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28617300 ccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatcca 28617258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 395
Target Start/End: Original strand, 35960839 - 35960901
Alignment:
Q  334 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaa 395  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||    
T  35960839 caatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9185263 - 9185198
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9185263 caagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatcca 9185198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 381
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263746
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga 381  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga--gcagctctccaatccactatga 47263746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4796765 - 4796667
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| || ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||    
T  4796765 caagattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaaga 4796667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 395
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479421
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaa 395  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||    
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 2479421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 31155914 - 31155971
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31155914 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 316 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20297651 - 20297591
Alignment:
Q  316 ttattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20297651 ttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 20297591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 105 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 39812278 - 39811823
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39812278 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 39812179  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  39812178 aagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcg-gtaaaagaaagaacaaaa 39812080  T
Q  304 caccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttaca 403  Q
    ||||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39812079 caccgag-aagattgttgaaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 39811981  T
Q  404 agactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatta 502  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39811980 agactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatta 39811881  T
Q  503 caatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39811880 caatgtttttctcaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 39811823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 105 - 553
Target Start/End: Original strand, 32246577 - 32247031
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttc--caaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  32246577 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtct 32246676  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaa--aggaagaac 299  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32246677 ccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaac 32246776  T
Q  300 aaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggt 399  Q
    ||||||||   ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32246777 aaaacaccgaacaagattgttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 32246876  T
Q  400 tacaagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 498  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32246877 tacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattataccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtg 32246976  T
Q  499 attacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  32246977 attacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 32247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 104 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 44312911 - 44312563
Alignment:
Q  104 ttgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctc 203  Q
    ||||||||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  44312911 ttgttgtgaatccggttc---aaaaatcttcacaccaatgaaataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 44312816  T
Q  204 caagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaa 301  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  44312815 caagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcga-taaaaggaagaacaa 44312718  T
Q  302 aacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtta 401  Q
    ||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44312717 aacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 44312619  T
Q  402 caag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttg 455  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44312618 caagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 44312563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 103 - 540
Target Start/End: Original strand, 19349068 - 19349513
Alignment:
Q  103 attgttgtgaatccggttcca---aagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| |    
T  19349068 attgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatgg 19349167  T
Q  200 tctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa- 295  Q
     |||||||| |||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||| | | |||| | ||     
T  19349168 cctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaa 19349263  T
Q  296 gaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaa 395  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  19349264 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 19349363  T
Q  396 ag-gttacaagactctagc-ctccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaaccca 493  Q
    || ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||    
T  19349364 agagttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatccca 19349463  T
Q  494 aggtgattacaa---tgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19349464 aggtgattacaatgttgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19349513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 105 - 540
Target Start/End: Original strand, 19344212 - 19344655
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttcca---aagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtc 201  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  19344212 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcc 19344311  T
Q  202 tccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-ga 297  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||| | | |||| | || ||    
T  19344312 tccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaaga 19344407  T
Q  298 acaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  19344408 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 19344507  T
Q  398 -gttacaagactctagc-ctccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaag 495  Q
     ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || ||||||    
T  19344508 agttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaag 19344607  T
Q  496 gtgattacaa---tgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19344608 gtgattacaatgttgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19344655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 133 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 11099196 - 11098843
Alignment:
Q  133 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta- 230  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  11099196 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctag 11099102  T
Q  231 acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagtt 329  Q
    || |||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  11099101 actagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataaggaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagtt 11099006  T
Q  330 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttac 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |||| | ||||| ||||    
T  11099005 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttac 11098907  T
Q  427 acatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11098906 acaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 11098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 158 - 489
Target Start/End: Original strand, 14291337 - 14291669
Alignment:
Q  158 tgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa 255  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| || | |||| ||||||| |||||||    
T  14291337 tgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaa 14291435  T
Q  256 -gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctggggg 354  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291436 agagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggg 14291531  T
Q  355 agagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctacc 450  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  14291532 agagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacc 14291630  T
Q  451 ctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    | |  || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14291631 catatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 14291669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 156 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 9296651 - 9296317
Alignment:
Q  156 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacac 253  Q
    ||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| | |||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||| ||||||| |||||    
T  9296651 gatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacac 9296553  T
Q  254 aa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 352  Q
    || |||||  ||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9296552 aaagagataacaaagca-aaacaagaaaagcaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttggg 9296457  T
Q  353 ggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaagactc--tagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagat-cta 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||  |  |||||| ||||||| | ||| |||||| |||||||| |||    
T  9296456 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-atacaagaacaagccctagattcta 9296358  T
Q  449 ccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||| |  || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9296357 cccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 9296317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 199 - 406
Target Start/End: Original strand, 25398386 - 25398591
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaag 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||  |||||    
T  25398386 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa--ggaag 25398480  T
Q  297 aacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    |||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  25398481 aacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 25398579  T
Q  395 aaggttacaaga 406  Q
    | ||||||||||    
T  25398580 agggttacaaga 25398591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 199 - 406
Target Start/End: Original strand, 25403524 - 25403729
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaag 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||  |||||    
T  25403524 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa--ggaag 25403618  T
Q  297 aacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    |||||| ||||||   |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  25403619 aacaaacacaccaaa-aagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 25403717  T
Q  395 aaggttacaaga 406  Q
    | ||||||||||    
T  25403718 agggttacaaga 25403729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 274 - 489
Target Start/End: Original strand, 3491716 - 3491930
Alignment:
Q  274 caagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 372  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3491716 caagataagcaagaaa--ggaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 3491811  T
Q  373 ccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactc 469  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||    
T  3491812 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactc 3491910  T
Q  470 tcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  3491911 tcacaatatgaaccctaaaa 3491930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 397
Target Start/End: Original strand, 8040059 - 8040147
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  8040059 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 8040147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 11098790 - 11098720
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11098790 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttc 11098720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 289 - 394
Target Start/End: Original strand, 40738822 - 40738926
Alignment:
Q  289 aaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagag 386  Q
    |||||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  40738822 aaaggaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccactatgatgaaag 40738918  T
Q  387 tgttacaa 394  Q
    ||||||||    
T  40738919 tgttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 319 - 406
Target Start/End: Original strand, 13569335 - 13569425
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  13569335 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 13569425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 21629943 - 21630040
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  21629943 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 21630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259178
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 28259178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 9296265 - 9296195
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9296265 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaatagacactttctacaaagacactcaaccc-tttggttc 9296195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Original strand, 14291722 - 14291792
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||    
T  14291722 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactatctacaaagacgctcaaccc-tttggttc 14291792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10445542 - 10445444
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  10445542 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10445444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 17865202 - 17865300
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  17865202 caagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 17865300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 20522219 - 20522317
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaa-ggttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  20522219 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaaga 20522317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 34682432 - 34682334
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  34682432 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 34682334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407718
Alignment:
Q  342 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 25407718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388955
Alignment:
Q  313 agattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 34388955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 14699105 - 14699034
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga 381  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  14699105 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatga 14699034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Original strand, 25409860 - 25409922
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  25409860 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 25409922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707252
Alignment:
Q  313 agattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10707252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 319 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8390240 - 8390150
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||||||    
T  8390240 ttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaaga 8390150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 397
Target Start/End: Original strand, 31056067 - 31056131
Alignment:
Q  334 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  31056067 caatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 31056131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Original strand, 3491981 - 3492043
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  3491981 acccaaggtgtttacaatgttttttccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 3492043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 33528719 - 33528621
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  33528719 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 33528621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 39482930 - 39483028
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||    
T  39482930 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaaga 39483028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 42039744 - 42039670
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||| ||  |||||||||    
T  42039744 ccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttacgaagagttacaaga 42039670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 319 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23078560 - 23078471
Alignment:
Q  319 ttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| || ||||||| |||  |||||||||    
T  23078560 ttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttagaaagagttacaaga 23078471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16940307 - 16940219
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  16940307 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16940219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 17010972 - 17010884
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  17010972 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17010884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 381
Target Start/End: Original strand, 33118158 - 33118206
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga 381  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33118158 ccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatga 33118206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27149369 - 27149327
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  27149369 ccaatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatcca 27149327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 36757859 - 36757789
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga 381  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  36757859 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatga 36757789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1345631 - 1345574
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1345631 ttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatcca 1345574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2838120 - 2838063
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2838120 ttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatcca 2838063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 35215589 - 35215646
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35215589 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35215646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 35217966 - 35218023
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35217966 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35218023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 104 - 554
Target Start/End: Original strand, 15044483 - 15044931
Alignment:
Q  104 ttgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  15044483 ttgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaata---caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 15044579  T
Q  204 caagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa 302  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15044580 caaaccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaa-ggaagaacaaa 15044678  T
Q  303 acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttac 402  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15044679 acaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 15044777  T
Q  403 aagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatt 501  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044778 aagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatt 15044877  T
Q  502 acaatgtttttccc-aacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044878 acaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 15044931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 105 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 1457445 - 1457002
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1457445 tgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 1457353  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa 302  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  1457352 aagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa--ggaagaacaaa 1457255  T
Q  303 acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttac 402  Q
    |||||  | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1457254 acaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 1457156  T
Q  403 aaga-ctctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 500  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1457155 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 1457056  T
Q  501 tacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457055 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 1457002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 105 - 554
Target Start/End: Original strand, 43592080 - 43592524
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  43592080 tgttgtgaatccggttccaaag------tcacatcaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 43592172  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa 302  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  43592173 aagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaa-ggaagaacaaa 43592271  T
Q  303 acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttac 402  Q
    |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43592272 acaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 43592370  T
Q  403 aag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 500  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  43592371 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 43592470  T
Q  501 tacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592471 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 43592524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 103 - 554
Target Start/End: Original strand, 43598523 - 43598969
Alignment:
Q  103 attgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  43598523 attgttgtgaatccggttccaaag------tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtct 43598615  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaaca 300  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  43598616 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaa-ggaagaaca 43598714  T
Q  301 aaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtt 400  Q
    |||||||  | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43598715 aaacaccgag-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 43598813  T
Q  401 acaaga-ctctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 498  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  43598814 acaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtg 43598913  T
Q  499 attacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598914 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 43598969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 103 - 554
Target Start/End: Original strand, 43604015 - 43604461
Alignment:
Q  103 attgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  43604015 attgttgtgaatccggttccaaag------tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtct 43604107  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaaca 300  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  43604108 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaa-ggaagaaca 43604206  T
Q  301 aaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtt 400  Q
    |||||||  | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43604207 aaacaccgag-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 43604305  T
Q  401 acaaga-ctctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 498  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  43604306 acaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtg 43604405  T
Q  499 attacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604406 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 43604461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 103 - 554
Target Start/End: Original strand, 43609507 - 43609953
Alignment:
Q  103 attgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||    
T  43609507 attgttgtgaatccggttccaaag------tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtct 43609599  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaaca 300  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  43609600 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaa-ggaagaaca 43609698  T
Q  301 aaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtt 400  Q
    |||||||  | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43609699 aaacaccgag-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 43609797  T
Q  401 acaaga-ctctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 498  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  43609798 acaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtg 43609897  T
Q  499 attacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609898 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 43609953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 103 - 554
Target Start/End: Original strand, 27449613 - 27450059
Alignment:
Q  103 attgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  27449613 attgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaac-aatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtct 27449705  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaaca 300  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||    
T  27449706 ccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaa-ggaagaaca 27449804  T
Q  301 aaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtt 400  Q
    |||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27449805 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 27449903  T
Q  401 acaag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 498  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  27449904 acaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtg 27450003  T
Q  499 attacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450004 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 27450059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 100 - 554
Target Start/End: Original strand, 27444766 - 27445215
Alignment:
Q  100 actattgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatag 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |    
T  27444766 actagtgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatgg 27444858  T
Q  200 tctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaaga 297  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  | |||| ||||||    
T  27444859 tctccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaa-ggaaga 27444957  T
Q  298 acaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||||||  | |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27444958 acaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 27445056  T
Q  398 gttacaaga-ctctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaag 495  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  27445057 gttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaag 27445156  T
Q  496 gtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445157 gtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 27445215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 105 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 28807868 - 28807429
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttcca---aagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtc 201  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  28807868 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 28807769  T
Q  202 tccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacac---aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaaga 297  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||   |||   ||||| |  ||| ||||||||||||||| |   |||| | ||||    
T  28807768 tccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaaga 28807671  T
Q  298 acaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28807670 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtga-agtgttacaaaag 28807572  T
Q  398 gttacaagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 497  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28807571 gttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggt 28807472  T
Q  498 gattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28807471 gattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 28807429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 127 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 37561715 - 37561300
Alignment:
Q  127 aaactttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacag 225  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  37561715 aaaccttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag 37561616  T
Q  226 ccc-taacaagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgac 323  Q
    ||  | ||  ||||||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||| |   |||  | ||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  37561615 cctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgac 37561517  T
Q  324 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-ccaagct 422  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||    
T  37561516 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagct 37561417  T
Q  423 ttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaa 522  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37561416 ttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatg-ttttcccaacctaa 37561318  T
Q  523 gagacactctcaacaaag 540  Q
    || |||||| || |||||    
T  37561317 gaaacactcacatcaaag 37561300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 37556888 - 37556478
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagccc-t 229  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||  |    
T  37556888 ttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctat 37556789  T
Q  230 aacaagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagt 328  Q
     ||  ||||||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||| |   |||  | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  37556788 gacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 37556690  T
Q  329 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-ccaagctttaca 427  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||| |  |||||||||||    
T  37556689 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagctttaca 37556590  T
Q  428 catgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagac 527  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  37556589 catgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatg-ttttcccaacctaagaaac 37556491  T
Q  528 actctcaacaaag 540  Q
    |||| || |||||    
T  37556490 actcacatcaaag 37556478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 133 - 488
Target Start/End: Original strand, 30631231 - 30631586
Alignment:
Q  133 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-a 231  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  30631231 tcacacaaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagc-aacaacaacaaaacagccctaga 30631328  T
Q  232 caagtgtatagcaaaatcacaca-agagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttc 330  Q
    | ||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||    
T  30631329 ctagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgactcagttc 30631425  T
Q  331 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacac 428  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  30631426 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacac 30631525  T
Q  429 atgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaa 488  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  30631526 atgaacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 30631586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Original strand, 2785196 - 2785608
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2785196 ttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 2785294  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattattgaccca 326  Q
    |  | | |||||||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||| | | |||| | || ||||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  2785295 agcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 2785390  T
Q  327 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-ctccaagcttt 424  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||    
T  2785391 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagcttt 2785490  T
Q  425 acacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaa 522  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2785491 actcatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaa 2785590  T
Q  523 gagacactctcaacaaag 540  Q
    || ||||||||| |||||    
T  2785591 gaaacactctcatcaaag 2785608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Original strand, 33791137 - 33791549
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  33791137 ttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 33791235  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatcacaca-agagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattattgaccca 326  Q
    |  | | |||||||||||| |||| | |||| |  ||| |||||  |||||||| | | |||| | || ||||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  33791236 agcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 33791331  T
Q  327 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcctc-caagcttt 424  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||    
T  33791332 gttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagcttt 33791431  T
Q  425 acacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaa 522  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  33791432 acacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaa 33791531  T
Q  523 gagacactctcaacaaag 540  Q
    || ||||||||| |||||    
T  33791532 gaaacactctcatcaaag 33791549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 31397257 - 31396843
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  31397257 ttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacatcc-ta 31397159  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccag 327  Q
    |  | | |||| ||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||| | | ||||   || ||  |||||||  |||||||| |||||||||    
T  31397158 agcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacaaacaaacaccgagcaagattgttgacccag 31397062  T
Q  328 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-ccaagcttta 425  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  31397061 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagcttta 31396962  T
Q  426 cacatg--aacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaaccta 521  Q
    |||| |  || |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31396961 cacaagacaaaaaaccctagatctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaaccta 31396862  T
Q  522 agagacactctcaacaaag 540  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  31396861 agatacactctcatcaaag 31396843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 234 - 489
Target Start/End: Original strand, 31180139 - 31180394
Alignment:
Q  234 agtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcag 332  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  31180139 agtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaaga--aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcag 31180235  T
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacacat 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||     
T  31180236 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaa 31180335  T
Q  431 gaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  31180336 g-acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccataaaa 31180394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 31402114 - 31401700
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  31402114 ttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 31402016  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattattgaccca 326  Q
    |  | | |||| ||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||| | | ||||   || ||||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  31402015 agcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 31401920  T
Q  327 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-ccaagcttt 424  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||    
T  31401919 gttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagcttt 31401820  T
Q  425 acacatg--aacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacct 520  Q
    ||||| |  || |||| ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31401819 acacaagacaaaaaactctagatctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacct 31401720  T
Q  521 aagagacactctcaacaaag 540  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  31401719 aagatacactctcatcaaag 31401700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Original strand, 33768000 - 33768417
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  33768000 ttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 33768098  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatcacaca-agagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattattgaccca 326  Q
    |  | | |||||||||||| |||| | |||| |  ||| |||||  || ||||| | | |||| | || ||||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  33768099 agcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaa-gcata--caggataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 33768194  T
Q  327 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-ctccaagcttt 424  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||    
T  33768195 gttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagcttt 33768294  T
Q  425 acacatgaacaaaccctagatctacccttt--ggtatgttccc-actc--tcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaa 517  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  | ||| ||||| || |   |||||||||||||   || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33768295 acacatgaacaaaccctagacctaccctttcggttattttccctacccctccacactatgaaccaataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaa 33768394  T
Q  518 cctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  33768395 cctaagaaacactctcatcaaag 33768417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 489
Target Start/End: Original strand, 38192064 - 38192353
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaag 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||  |||||    
T  38192064 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa--ggaag 38192158  T
Q  297 aacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    |||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  38192159 aacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 38192257  T
Q  395 aaggttacaag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctag-atctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    | ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||| || || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38192258 agggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 38192353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 199 - 489
Target Start/End: Original strand, 38219289 - 38219578
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaag 296  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||  |||||    
T  38219289 gtctccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa--ggaag 38219383  T
Q  297 aacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    |||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  38219384 aacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 38219482  T
Q  395 aaggttacaag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctag-atctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    | ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||| || || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38219483 agggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 38219578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 198 - 489
Target Start/End: Original strand, 24135739 - 24136028
Alignment:
Q  198 agtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaag 296  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| | ||||  ||| | | |||||||  |||||||||||| |||||| |||||    
T  24135739 agtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccaca--agataatacaaagca--aacaagataagctagaaaa-ggaag 24135833  T
Q  297 aacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    |||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || || ||||||||||    
T  24135834 aacaaacacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgttacaa 24135932  T
Q  395 aaggttacaag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    | ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| | ||||||||||||    
T  24135933 agggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatgtgaaccctaaaa 24136028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 251 - 406
Target Start/End: Original strand, 35387606 - 35387758
Alignment:
Q  251 cacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatct 349  Q
    ||||||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35387606 cacaagagaatacaaagca--aacgagataagcaagaaa--ggaagaacaaacacaccaaa-aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatct 35387700  T
Q  350 gggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  35387701 gggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 35387758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 489 - 554
Target Start/End: Original strand, 30631640 - 30631705
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631640 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 30631705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Original strand, 31180447 - 31180517
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31180447 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttc 31180517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353333
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 9353333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932351
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36932351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Original strand, 24136080 - 24136150
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24136080 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactttctacaaagacactcaaccc-tttggttc 24136150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281848
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10281848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464628
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 15464628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Original strand, 35387893 - 35387955
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35387893 acccaaggtgattacaatgttttttccaacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccc 35387955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916972
Alignment:
Q  313 agattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 11916972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 17004058 - 17003987
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga 381  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17004058 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatga 17003987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520326
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 14520326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Original strand, 3880321 - 3880396
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  3880321 ccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3880396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Original strand, 38219629 - 38219691
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  38219629 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 38219691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12084265 - 12084176
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  12084265 ttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 12084176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588843
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19588843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 28832258 - 28832323
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28832258 caagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 28832323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4410298 - 4410241
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410298 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 4410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42127508 - 42127443
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||| |||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  42127508 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatcca 42127443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15552521 - 15552464
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15552521 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 15552464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 31179374 - 31179431
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31179374 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31179431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31300694 - 31300629
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  31300694 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatcca 31300629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31543010 - 31542953
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31543010 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31542953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31545356 - 31545299
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31545356 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31545299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 103 - 560
Target Start/End: Original strand, 41398030 - 41398486
Alignment:
Q  103 attgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  41398030 attgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtct 41398129  T
Q  203 ccaagc---caacaacaacaaaacagccctaacaagtgtatagcaaaat--cacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaag 296  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||       |||||||    
T  41398130 ccaagcaaacaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-------aaggaag 41398222  T
Q  297 aacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaa 396  Q
    |||||||||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41398223 aacaaaacaccgag-aagattgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaa 41398321  T
Q  397 ggttacaagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaag 495  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398322 ggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaag 41398421  T
Q  496 gtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398422 gtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 41398486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 105 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25445382 - 25444931
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttc--caaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  25445382 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 25445283  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaaca 300  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| || |||||||||||| |   |||| | |||||||    
T  25445282 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 25445185  T
Q  301 aaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtt 400  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25445184 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 25445085  T
Q  401 acaagactctagcct-ccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 499  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25445084 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagagctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtga 25444985  T
Q  500 ttacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  25444984 ttacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 25444931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 102 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 44024166 - 44023716
Alignment:
Q  102 tattgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |      
T  44024166 tattgttgtgaatccgattccaaataaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 44024067  T
Q  202 tccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-gaa 298  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||  | |  ||||||| |||    
T  44024066 tccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataa--atggtaaaggaaagaa 44023971  T
Q  299 caaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaagg 398  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  44023970 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtga-agtgttacaaaagg 44023872  T
Q  399 ttacaagactctagcctc-caagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 497  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  44023871 ttacaagactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggt 44023772  T
Q  498 gattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  44023771 gattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 44023716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 104 - 553
Target Start/End: Original strand, 39445291 - 39445742
Alignment:
Q  104 ttgttgtgaatccggttc--caaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtc 201  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |      
T  39445291 ttgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggct 39445390  T
Q  202 tccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaac 299  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| |   |||| | ||||||    
T  39445391 tccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaac 39445488  T
Q  300 aaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggt 399  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39445489 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtga-agtgttacaaaaggt 39445587  T
Q  400 tacaagactctagcctc-caagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 498  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39445588 tacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 39445687  T
Q  499 attacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  39445688 attacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 39445742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 105 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 1055304 - 1054854
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttc--caaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    |||||||||||||||||  |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1055304 tgttgtgaatccggttctacaatcgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaat-gtct 1055206  T
Q  203 -ccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaac 299  Q
     ||||||  ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| |   |||| | ||||||    
T  1055205 tccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaac 1055108  T
Q  300 aaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggt 399  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1055107 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtga-agtgttacaaaaggt 1055009  T
Q  400 tacaagactctagcctc-caagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 498  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1055008 tacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 1054909  T
Q  499 attacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  1054908 attacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 1054854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 210 - 560
Target Start/End: Original strand, 41390485 - 41390831
Alignment:
Q  210 aacaacaacaaaacagccctaacaagtgtatagcaaaat--cacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacac 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||     
T  41390485 aacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag-------aaggaagaacaaaacat 41390577  T
Q  307 catgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |  | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41390578 cgag-aagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga 41390676  T
Q  407 ctctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 505  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390677 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 41390776  T
Q  506 tgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41390777 tgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaatccatttggttc 41390831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 43988730 - 43988314
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  43988730 ttcacgccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 43988632  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccag 327  Q
    |  | | ||||||||| || ||||| ||||| |  ||| ||||| |  | | || || |||||   ||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  43988631 agcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgtttacccag 43988533  T
Q  328 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-ccaagcttta 425  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||    
T  43988532 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagcttta 43988433  T
Q  426 cacatg--aacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaaccta 521  Q
    |||| |  || |||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43988432 cacaagacaaaaaaccctagatctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaaccta 43988333  T
Q  522 agagacactctcaacaaag 540  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  43988332 agaaacactctcatcaaag 43988314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 156 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 24787617 - 24787280
Alignment:
Q  156 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagc--caacaacaacaaaa--cagcccta-acaagtgtatagcaaaatca 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||| || |||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||   |||| ||||||| ||    
T  24787617 gatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagcaaaacca 24787519  T
Q  251 cacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatct 349  Q
    ||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787518 cacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaa-ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 24787423  T
Q  350 gggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tc 446  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  24787422 gggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcattacacaagaacaaatcctagattc 24787323  T
Q  447 taccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||    
T  24787322 taccctttggtgtttcccaactctcacaatatgaaccctaaaa 24787280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 417 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25439874 - 25439738
Alignment:
Q  417 caagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttccca 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25439874 caagctttacacatgaacaaaccctagagctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttccca 25439775  T
Q  517 acctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    |||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  25439774 acctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 25439738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 199 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 24202973 - 24202686
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaaga 297  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||    
T  24202973 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa--ggaaga 24202880  T
Q  298 acaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaa 395  Q
    ||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  24202879 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 24202781  T
Q  396 aggttacaag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24202780 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 24202686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 41386543 - 41386646
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41386543 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 41386642  T
Q  205 aagc 208  Q
    ||||    
T  41386643 aagc 41386646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19361564 - 19361433
Alignment:
Q  274 caagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 372  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19361564 caagataagcaagaaaa-ggaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaat 19361468  T
Q  373 ccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  19361467 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 19361433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19380204 - 19380073
Alignment:
Q  274 caagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 372  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19380204 caagataagcaagaaaa-ggaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaat 19380108  T
Q  373 ccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  19380107 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 19380073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 19358975 - 19358760
Alignment:
Q  274 caagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 372  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||   |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19358975 caagataagcaagaaaa-ggaagaacaaacacatcaa--aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaat 19358879  T
Q  373 ccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactc 469  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||    
T  19358878 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactc 19358780  T
Q  470 tcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    || || ||||||||||||||    
T  19358779 tctcaatatgaaccctaaaa 19358760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24202635 - 24202573
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24202635 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc 24202573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 490 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 24787226 - 24787157
Alignment:
Q  490 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24787226 cccaaggtgattataatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttc 24787157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281804
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||  |||||||||    
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 3281804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644898
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 26644898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 47704034 - 47703946
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  47704034 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 47703946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073025
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19073025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120915
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19120915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 397
Target Start/End: Original strand, 29651810 - 29651898
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  29651810 caagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16124614 - 16124516
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  16124614 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16124516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27104470 - 27104372
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| ||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  27104470 caagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 27104372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 397
Target Start/End: Original strand, 9476260 - 9476348
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||    
T  9476260 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaag 9476348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 397
Target Start/End: Original strand, 13598397 - 13598485
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  13598397 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 404
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069864
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaa 404  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa 37069864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 397
Target Start/End: Original strand, 775671 - 775759
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || || |||||||||||||    
T  775671 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 13604697 - 13604624
Alignment:
Q  334 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||  |||||||||    
T  13604697 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaaga 13604624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21536635 - 21536570
Alignment:
Q  342 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||  |||||||||    
T  21536635 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagagttacaaga 21536570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47098922 - 47098857
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47098922 caagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatcca 47098857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19366174 - 19366112
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  19366174 acccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 19366112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21536438 - 21536378
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  21536438 acccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacctaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 21536378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 19361298 - 19361237
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  19361298 acccaaggtgtttacaatgtttt-cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 19361237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Original strand, 32889461 - 32889503
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32889461 ccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatcca 32889503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 9459422 - 9459479
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459422 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9459479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 9463249 - 9463306
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463249 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9463306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16226443 - 16226386
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16226443 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16226386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47102931 - 47102874
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  47102931 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatcca 47102874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 105 - 556
Target Start/End: Original strand, 28184297 - 28184754
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaata--gtct 202  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||    
T  28184297 tgttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtct 28184396  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaa 301  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  28184397 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaacaa 28184496  T
Q  302 aacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtta 401  Q
    ||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  28184497 aacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 28184595  T
Q  402 caagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 500  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184596 caacactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 28184695  T
Q  501 tacaatgttttt---cccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttg 556  Q
    ||| ||||||||   || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28184696 tactatgtttttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagaccctcaacccatttg 28184754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 103 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 14737868 - 14737417
Alignment:
Q  103 attgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14737868 attgttgtgaatccggtttcaaataaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtct 14737770  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa--gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaac 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||    
T  14737769 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcg-gtaaaagaaagaac 14737672  T
Q  300 aaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggt 399  Q
    ||||||||  | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14737671 aaaacaccgag-aagattgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 14737573  T
Q  400 tacaagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 498  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737572 tacaagactctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 14737473  T
Q  499 attacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737472 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 14737417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 105 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 14742725 - 14742277
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcc 204  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14742725 tgttgtgaatccggtttcaaataaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 14742627  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa 302  Q
    ||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||  | ||||| |||||||||    
T  14742626 aagcatacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcg-gtaaaagaaagaacaaa 14742529  T
Q  303 acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttac 402  Q
    |||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14742528 acaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 14742430  T
Q  403 aagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatt 501  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14742429 aagactctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaagtgatt 14742330  T
Q  502 acaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14742329 acaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacacttaacccatt 14742277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 104 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 22010984 - 22010537
Alignment:
Q  104 ttgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctc 203  Q
    ||||||||||||||||||   | |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22010984 ttgttgtgaatccggttc---aaaaatcttcacaccaatgaaataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 22010889  T
Q  204 caagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaa 301  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  22010888 caagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcga-taaaaggaagaacaa 22010791  T
Q  302 aacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtta 401  Q
    ||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22010790 aacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 22010692  T
Q  402 caag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 499  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22010691 caagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttgatatttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtga 22010592  T
Q  500 ttacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010591 ttacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 22010537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 102 - 554
Target Start/End: Original strand, 11856762 - 11857219
Alignment:
Q  102 tattgttgtgaatccggttccaaagaaa--ctttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatag 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  11856762 tattgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatgg 11856860  T
Q  200 tctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaaga 297  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||    
T  11856861 tctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaa-ggaaga 11856958  T
Q  298 acaaaa---caccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaa 394  Q
    ||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11856959 acaaaaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaa 11857057  T
Q  395 aaggttacaaga-ctctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 492  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11857058 aaggttacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaaccc 11857157  T
Q  493 aaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857158 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 11857219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 105 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 28155861 - 28155412
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaa-ctttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctc 203  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||     
T  28155861 tgttgtgaatccggttctaaacaaaaccttcacaccaatgcaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctt 28155763  T
Q  204 caagccaacaacaacaaaacagccc-taacaagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaa 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||| ||||| ||||| |  ||| ||||||||||||||| |   |||  | ||||||||    
T  28155762 caagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaa 28155664  T
Q  302 aacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtta 401  Q
    ||||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28155663 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 28155564  T
Q  402 caagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatt 501  Q
    ||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28155563 caagaatttagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgatt 28155464  T
Q  502 acaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  28155463 acaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 28155412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 104 - 553
Target Start/End: Original strand, 6438293 - 6438743
Alignment:
Q  104 ttgttgtgaatccggttc--caaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtc 201  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |      
T  6438293 ttgttgtgattccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggct 6438391  T
Q  202 tccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaac 299  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| |   |||| | ||||||    
T  6438392 tccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaac 6438489  T
Q  300 aaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggt 399  Q
    ||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  6438490 aaaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtga-agtgttacaaaaggt 6438588  T
Q  400 tacaagactctagcctc-caagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 498  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6438589 tacaagactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 6438688  T
Q  499 attacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  6438689 attacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 6438743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Original strand, 6005238 - 6005650
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  6005238 ttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 6005336  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattattgaccca 326  Q
    |  | | |||||||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||| | | |||| | || ||||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  6005337 agcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 6005432  T
Q  327 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-ctccaagcttt 424  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||    
T  6005433 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagcttt 6005532  T
Q  425 acacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaa 522  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6005533 acacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaa 6005632  T
Q  523 gagacactctcaacaaag 540  Q
    || ||||||||| |||||    
T  6005633 gaaacactctcatcaaag 6005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 33330711 - 33330297
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  33330711 ttcacaccaattagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 33330613  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatc-acac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattattgaccc 325  Q
    |  | | |||||||||||| | |||| ||||| |  ||| |||||| |||||||| | |  ||||| || ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  33330612 agcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgaccc 33330516  T
Q  326 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-ccaagctt 423  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||    
T  33330515 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctt 33330416  T
Q  424 tacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaaccta 521  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33330415 tacacatgacaaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaaccta 33330316  T
Q  522 agagacactctcaacaaag 540  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  33330315 agaaacactctcatcaaag 33330297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Original strand, 16838565 - 16838977
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||    
T  16838565 ttcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 16838663  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattattgaccca 326  Q
    |  | | |||||||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||| | | ||||   || ||||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  16838664 agcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 16838759  T
Q  327 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcc-tccaagcttt 424  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||    
T  16838760 gttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagcttt 16838859  T
Q  425 acacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaa 522  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16838860 acacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaa 16838959  T
Q  523 gagacactctcaacaaag 540  Q
    || ||||||||| |||||    
T  16838960 gatacactctcatcaaag 16838977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 33336208 - 33335794
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | |||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  33336208 ttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaaactaacaacaacaaaacagcc-ta 33336110  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatc-acac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattattgaccc 325  Q
    |  | | ||||||| |||| | |||| ||||| |  ||| |||||| |||||||| | |  ||||| || ||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  33336109 agcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgaccc 33336013  T
Q  326 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcctc-caagctt 423  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||    
T  33336012 agttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctt 33335913  T
Q  424 tacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaaccta 521  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33335912 tacacatgacaaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaaccta 33335813  T
Q  522 agagacactctcaacaaag 540  Q
    ||| ||||||||| |||||    
T  33335812 agaaacactctcatcaaag 33335794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 313 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 5674865 - 5674685
Alignment:
Q  313 agattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actc 409  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||      
T  5674865 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaa 5674766  T
Q  410 tagcctccaagctttacacatg-aacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    |||| | ||||| ||||||| | |||||  |||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5674765 tagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 5674685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 5674633 - 5674563
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5674633 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttc 5674563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Original strand, 5343301 - 5343397
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcc 227  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5343301 ttcacaccaatgagaataagtcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc 5343397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757479
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 5757479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356132
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||  |||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttactaagagttacaaga 21356132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 10077263 - 10077176
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaa 396  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  10077263 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 10077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 5572339 - 5572241
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  5572339 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 5572241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31086571 - 31086485
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaa 395  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  31086571 caagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 31086485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 396
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630040
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaa 396  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaa 4630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 469 - 540
Target Start/End: Original strand, 5343637 - 5343710
Alignment:
Q  469 ctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  5343637 ctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 5343710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 31979512 - 31979610
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || |||||| |||||| |||||||||    
T  31979512 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaaga 31979610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 324 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801344
Alignment:
Q  324 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||| |||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaaga 21801344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 394
Target Start/End: Original strand, 22709041 - 22709102
Alignment:
Q  334 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  22709041 caatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 156 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 30126044 - 30125944
Alignment:
Q  156 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaac-aaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacac 253  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  30126044 gatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgag-ccaaatggtctccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 30125946  T
Q  254 aa 255  Q
    ||    
T  30125945 aa 30125944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 357
Target Start/End: Original strand, 5343480 - 5343527
Alignment:
Q  310 gcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggaga 357  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5343480 gcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Original strand, 18232867 - 18232942
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  18232867 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 18232942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 22963699 - 22963796
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  22963699 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 22963796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23824694 - 23824597
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  23824694 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 23824597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 31936586 - 31936651
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31936586 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5017567 - 5017482
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||| || ||||||||||    
T  5017567 caagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 12195518 - 12195575
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195518 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 12195575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 488 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 31086343 - 31086282
Alignment:
Q  488 aacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  31086343 aacccaaggtgtttacaatgtttctc--aacctaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 31086282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 49)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 105 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 39785114 - 39784665
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcc 204  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39785114 tgttgtgaatctggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 39785015  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaa 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| | ||||||||||    
T  39785014 aagccaataacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaa 39784915  T
Q  304 caccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttaca 403  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  39784914 caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtga-agtgttacaaaaggttaca 39784816  T
Q  404 agactctagcct-ccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatta 502  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  39784815 agactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatta 39784716  T
Q  503 caatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| || |||||    
T  39784715 caatgtttttcccaacctaagagactctctcatcaaaggcacacaccccat 39784665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 103 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25328570 - 25328120
Alignment:
Q  103 attgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25328570 attgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaacaatgaaataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtct 25328471  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagccctaacaagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa 302  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |   |||    |||||||||    
T  25328470 ccaagccaacaacaacaaaacaaccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaa 25328371  T
Q  303 acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttac 402  Q
    |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25328370 acaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 25328272  T
Q  403 aagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatt 501  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25328271 aagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatt 25328172  T
Q  502 acaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25328171 acaatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccat 25328120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 105 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 7290210 - 7289766
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7290210 tgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaac-attgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 7290118  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa 302  Q
    || | |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  7290117 aaacaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaa-ggaagaacaaa 7290019  T
Q  303 acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttac 402  Q
    |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7290018 acaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 7289920  T
Q  403 aaga-ctctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 500  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7289919 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctatattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 7289820  T
Q  501 tacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289819 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 7289766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 133 - 489
Target Start/End: Original strand, 6311121 - 6311477
Alignment:
Q  133 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-a 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| |    
T  6311121 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 6311219  T
Q  232 caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttc 330  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  6311220 ctagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 6311316  T
Q  331 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacac 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  6311317 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacac 6311416  T
Q  429 atgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||  |||||||||||||    
T  6311417 aag-acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 6311477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Original strand, 35745212 - 35745624
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  35745212 ttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 35745310  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattattgaccca 326  Q
    |  | | |||||||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||| | | |||| | || ||||||| ||||  |||||||| ||||||||    
T  35745311 agcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 35745406  T
Q  327 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-ctccaagcttt 424  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||    
T  35745407 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagcttt 35745506  T
Q  425 acacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaa 522  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  35745507 acacatgaacaaaccctagacctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaa 35745606  T
Q  523 gagacactctcaacaaag 540  Q
    || ||||||||| |||||    
T  35745607 gaaacactctcatcaaag 35745624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 133 - 489
Target Start/End: Original strand, 36979205 - 36979558
Alignment:
Q  133 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta- 230  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| || ||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  36979205 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctag 36979299  T
Q  231 acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagtt 329  Q
    || |||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  36979300 actagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagtt 36979395  T
Q  330 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttac 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||    
T  36979396 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttac 36979494  T
Q  427 acatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36979495 acaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 36979558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 33038056 - 33037724
Alignment:
Q  156 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaa--aacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcaca 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| || ||||||| |||||||||||  |||||||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  33038056 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaaccaca 33037959  T
Q  253 caa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 351  Q
    ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037958 caaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaa--gaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 33037863  T
Q  352 gggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tcta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  33037862 gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattcta 33037764  T
Q  449 ccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaa 488  Q
    ||| |  || | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  33037763 cccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 33037724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 156 - 489
Target Start/End: Original strand, 30655488 - 30655827
Alignment:
Q  156 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaa--cagcccta-acaagtgtatagcaaaatcaca 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||||| ||||    
T  30655488 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccaca 30655585  T
Q  253 ca-agagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaa----caccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaat 347  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655586 catagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaaaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 30655682  T
Q  348 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30655683 ctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctaga 30655781  T
Q  445 -tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
     ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30655782 ttctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 30655827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 296 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 10684364 - 10684116
Alignment:
Q  296 gaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaa 395  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  10684364 gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaa 10684265  T
Q  396 ag-gttacaagactctagcct-ccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaaccca 493  Q
    || ||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || ||||    
T  10684264 agagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatccca 10684165  T
Q  494 aggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10684164 aggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 10684116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 156 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 4760325 - 4759991
Alignment:
Q  156 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacac 253  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| | |||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  4760325 gatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 4760228  T
Q  254 aa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 352  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4760227 aaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaacatcaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatggg 4760131  T
Q  353 ggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tcta 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  4760130 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattcta 4760032  T
Q  449 ccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||| |  || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4760031 cccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 4759991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 18853418 - 18853083
Alignment:
Q  156 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaaca-gcccta-acaagtgtatagcaaaatcacac 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| || ||||||| |||||||| |||| | |||||| ||  || || ||||||| |||||    
T  18853418 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacac 18853320  T
Q  254 aa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 352  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853319 aaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 18853224  T
Q  353 ggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaa-ggttacaag--actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tct 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||  ||  |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| | |    
T  18853223 ggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagatttt 18853125  T
Q  448 accctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18853124 accctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18853083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 156 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 18870809 - 18870477
Alignment:
Q  156 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacaca 254  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||   |||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||| ||  || || ||||||| ||||||    
T  18870809 gatgtgtggagcaagagataatggtaatctatgagtt-aaatggtttccaagcaaacaacaa-aaaac-gccctagacttgtttagagcaaaaccacaca 18870713  T
Q  255 a-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 353  Q
    | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18870712 aagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggg 18870617  T
Q  354 gagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaa-ggttacaag--actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tcta 448  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||  ||  |||| | ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18870616 gagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattcta 18870518  T
Q  449 ccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18870517 ccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18870477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 133 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 10689412 - 10689058
Alignment:
Q  133 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaa 231  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  | ||| || ||||||| ||||||||||||| || |||||     
T  10689412 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-ctaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacaaccctag 10689318  T
Q  232 ca-agtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagtt 329  Q
       |||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  10689317 tgtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagtt 10689222  T
Q  330 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttac 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||    
T  10689221 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttac 10689123  T
Q  427 acatgaacaaaccctaga-tctaccc-tttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||| |||||| ||||||| ||||||| | || | | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10689122 acaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 10689058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 394
Target Start/End: Original strand, 26287866 - 26287985
Alignment:
Q  274 caagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 372  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26287866 caagataagcaagaaa--ggaagaacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 26287962  T
Q  373 ccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    ||| ||||| || ||||||||||    
T  26287963 ccactatgatgaaagtgttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 394
Target Start/End: Original strand, 26301123 - 26301242
Alignment:
Q  274 caagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 372  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26301123 caagataagcaagaaa--ggaagaacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 26301219  T
Q  373 ccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    ||| ||||| || ||||||||||    
T  26301220 ccactatgatgaaagtgttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 274 - 394
Target Start/End: Original strand, 26313117 - 26313236
Alignment:
Q  274 caagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 372  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313117 caagataagcaagaaa--ggaagaacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 26313213  T
Q  373 ccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    ||| ||||| || ||||||||||    
T  26313214 ccactatgatgaaagtgttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 1262050 - 1261871
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag-actc 409  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |       
T  1262050 aagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 1261951  T
Q  410 tagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    |||| | ||||| ||||||| | ||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1261950 tagcttgcaagc-ttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 1261871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 477 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 25328070 - 25327994
Alignment:
Q  477 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  25328070 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccat 25327994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Original strand, 6311532 - 6311602
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6311532 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttc 6311602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 18870424 - 18870354
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18870424 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttc 18870354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Original strand, 30655880 - 30655950
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30655880 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttc 30655950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 31071362 - 31071146
Alignment:
Q  274 caagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaa 371  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31071362 caagataagcaagaaa--ggaagaacaaacacaccaaa-aagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaa 31071266  T
Q  372 tccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctag-atctaccctttggtatgttcccact 468  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||  ||||||| || || | | ||||||    
T  31071265 tccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccact 31071167  T
Q  469 ctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  31071166 ctcacaatatgaaccctaaaa 31071146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 10689003 - 10688933
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10689003 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttc 10688933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 18853030 - 18852960
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18853030 acccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttc 18852960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 26403328 - 26403240
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  26403328 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 33037671 - 33037601
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  33037671 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacgaagacactcaaccc-tttggttc 33037601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Original strand, 36979611 - 36979680
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  36979611 acccaaggtgattacaatgtttt-cccaacctaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttc 36979680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1261820 - 1261758
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1261820 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccc 1261758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Original strand, 4456050 - 4456124
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  4456050 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 4456124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 406
Target Start/End: Original strand, 7412348 - 7412437
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  7412348 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 7412437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175755
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 19175755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 4696694 - 4696623
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga 381  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4696694 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatga 4696623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4759938 - 4759875
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgttttt-cccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4759938 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagactctctctacaaagacactcaaccc 4759875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  314 gattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23799675 - 23799577
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  23799675 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 23799577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 90
Target Start/End: Original strand, 12196950 - 12197013
Alignment:
Q  26 ctatatgtgttttagtacaaagcgttgtaaaatagcagctatagcacaatagcgtacttgacttt 90  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12196950 ctatatgtgttt-agtacaatgtgttgtaaaatagcagctatagcacaataacgtaattgacttt 12197013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 90
Target Start/End: Original strand, 12441378 - 12441441
Alignment:
Q  26 ctatatgtgttttagtacaaagcgttgtaaaatagcagctatagcacaatagcgtacttgacttt 90  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12441378 ctatatgtgttt-agtacaatgtgttgtaaaatagcagctatagcacaataacgtaattgacttt 12441441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Original strand, 6127243 - 6127318
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  6127243 ccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 6127318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 5702581 - 5702483
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  5702581 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 5702483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10684529 - 10684432
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaa-caacaacaaaacagcc 227  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  10684529 ttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc 10684432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 31071095 - 31071035
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaac 549  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  31071095 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 31071035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Original strand, 26288121 - 26288183
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26288121 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26288183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Original strand, 26301378 - 26301440
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26301378 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26301440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Original strand, 26313372 - 26313434
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26313372 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26313434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19752492 - 19752427
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19752492 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatcca 19752427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Original strand, 7412569 - 7412629
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  7412569 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 7412629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18811015 - 18810982
Alignment:
Q  342 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18811015 cctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 18810982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43079934 - 43079877
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43079934 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43082305 - 43082248
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082305 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43082248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 105 - 553
Target Start/End: Original strand, 3813816 - 3814266
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttc--caaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  3813816 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 3813915  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatc-acacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaac 299  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||| | |||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3813916 ccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa--ggaagaac 3814012  T
Q  300 aaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggt 399  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  3814013 aaaacaccatgcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggt 3814112  T
Q  400 tacaagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 499  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814113 tacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 3814212  T
Q  500 ttacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||    
T  3814213 ttacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaagacacacaccccat 3814266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 105 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 45348109 - 45347658
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttc--caaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  45348109 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtct 45348011  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaa 301  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| | ||||||||    
T  45348010 tcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaa 45347911  T
Q  302 aacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtta 401  Q
    ||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45347910 aacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 45347812  T
Q  402 caagac-tctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 499  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45347811 caagacctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaccccaaggtga 45347712  T
Q  500 ttacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  45347711 ttacaatgtttttcccaacctaagagacactctcatcaaaggcacacaccccat 45347658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 103 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9224700 - 9224247
Alignment:
Q  103 attgttgtgaatccggttccaaagaaa--ctttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagt 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  9224700 attgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggt 9224602  T
Q  201 ctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaa 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  | |||||||||||    
T  9224601 ctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcg-gtaaaaggaagaa 9224504  T
Q  299 caaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaagg 398  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9224503 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 9224405  T
Q  399 ttacaaga-ctctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 496  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224404 ttagaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 9224305  T
Q  497 tgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224304 tgattacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 9224247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 105 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 45357588 - 45357138
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttc--caaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  45357588 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtct 45357490  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaa 301  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||| | ||||||||    
T  45357489 tcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaa 45357390  T
Q  302 aacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtta 401  Q
    ||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45357389 aacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 45357291  T
Q  402 caagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 500  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45357290 caagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaccccaaggtgat 45357191  T
Q  501 tacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  45357190 tacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 45357138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 105 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 9229484 - 9229034
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaa-ctttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctc 203  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  9229484 tgttgtgaatccggttaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 9229386  T
Q  204 caagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaa 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  9229385 caagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcg-gtaaaaggaagaacaa 9229288  T
Q  302 aacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtta 401  Q
    ||||||  | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9229287 aacaccgag-aagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 9229189  T
Q  402 caaga-ctctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 499  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229188 gaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 9229089  T
Q  500 ttacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229088 ttacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 9229034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 105 - 554
Target Start/End: Original strand, 51520258 - 51520702
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  51520258 tgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 51520350  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa 302  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  51520351 aagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaa-ggaagaacaaa 51520449  T
Q  303 acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttac 402  Q
    |||||  | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51520450 acaccgag-aagattgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 51520548  T
Q  403 aag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 500  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  51520549 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 51520648  T
Q  501 tacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520649 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 51520702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 104 - 553
Target Start/End: Original strand, 5732457 - 5732907
Alignment:
Q  104 ttgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5732457 ttgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaaata--caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 5732554  T
Q  204 caagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaa 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||| |  |||||||  |||||||||| |  | ||| | ||||||||    
T  5732555 caagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacg-gtaaaggaaagaacaa 5732651  T
Q  302 aa----caccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag 397  Q
    ||    |||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5732652 aaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 5732751  T
Q  398 gttacaagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 497  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  5732752 gttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactataaacccttaatcccaaggt 5732851  T
Q  498 gattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  5732852 gattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 5732907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 105 - 540
Target Start/End: Original strand, 18855519 - 18855956
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttc--caaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtct 202  Q
    |||||||||||||||||  |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  18855519 tgttgtgaatccggttctacaagcgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 18855618  T
Q  203 ccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaaca 300  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| |   |||| | |||||||    
T  18855619 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 18855716  T
Q  301 aaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtt 400  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  18855717 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtga-agtgttacaaaaggtt 18855815  T
Q  401 acaagactctagcctc-caagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 499  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  18855816 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccacaatcccaaggtga 18855915  T
Q  500 ttacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  18855916 ttacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 18855956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 105 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 56146995 - 56146664
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  56146995 tgttgtgaatccggttccaaa------ttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctcc 56146903  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa 302  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  56146902 aagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaa-ggaagaacaaa 56146804  T
Q  303 acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttac 402  Q
    |||||  | |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  56146803 acaccgag-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 56146705  T
Q  403 aag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaacccta 442  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56146704 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaacccta 56146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 156 - 489
Target Start/End: Original strand, 24741788 - 24742121
Alignment:
Q  156 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaa-cagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacac 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |||||    
T  24741788 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 24741885  T
Q  254 aa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 352  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24741886 aaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 24741981  T
Q  353 ggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tcta 448  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24741982 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattcta 24742080  T
Q  449 ccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24742081 ccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 24742121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 133 - 487
Target Start/End: Original strand, 29760470 - 29760821
Alignment:
Q  133 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-a 231  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  | |||| || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  29760470 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaataaaca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacaaccctaga 29760564  T
Q  232 caagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttc 330  Q
    | |||||| ||||||| ||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  29760565 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttc 29760660  T
Q  331 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttaca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| |||||    
T  29760661 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctgcaagc-ttaca 29760759  T
Q  428 catg-aacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaa 487  Q
    || | |||||  |||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  29760760 caagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaa 29760821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 483 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 18712677 - 18712606
Alignment:
Q  483 cctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712677 cctaaaacccaaggtgataacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 18712606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 28468660 - 28468542
Alignment:
Q  274 caagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 372  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28468660 caagataagcaagaaa--ggaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaat 28468565  T
Q  373 ccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    ||| ||||| || ||||||||||    
T  28468564 ccactatgatgaaagtgttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Original strand, 24742174 - 24742244
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24742174 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttc 24742244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31985764 - 31985635
Alignment:
Q  275 aagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 372  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31985764 aagataagcaagaaa--ggaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaat 31985670  T
Q  373 ccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  31985669 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 31985635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 10047378 - 10047476
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  10047378 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10047476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 39245993 - 39246091
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  39245993 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 39246091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 36315319 - 36315230
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  36315319 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36315230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 319 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 36329528 - 36329439
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  36329528 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36329439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Original strand, 29760874 - 29760945
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttt-tcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29760874 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttc 29760945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16623391 - 16623293
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  16623391 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16623293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396672
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||  |||||||||    
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaaga 5396672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 38152537 - 38152449
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gagagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||    
T  38152537 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796519
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3796519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 396
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143345
Alignment:
Q  313 agattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaa 396  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaa 5143345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5269289 - 5269204
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  5269289 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 313 - 396
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147763
Alignment:
Q  313 agattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaa 396  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||    
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaa 5147763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 397
Target Start/End: Original strand, 24333831 - 24333896
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||    
T  24333831 ccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 6743505 - 6743425
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  6743505 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777645
Alignment:
Q  313 agattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 3777645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16630755 - 16630680
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  16630755 ccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16630680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 28468404 - 28468342
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  ||| | ||||||||||| |||||    
T  28468404 acccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacacttaaccc 28468342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39774380 - 39774338
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39774380 ccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatcca 39774338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 16931792 - 16931849
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16931792 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16931849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 16934146 - 16934203
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934146 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16934203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 22780376 - 22780433
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22780376 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22780433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Original strand, 44599841 - 44599898
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44599841 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 44599898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 489 - 548
Target Start/End: Original strand, 5112466 - 5112523
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaa 548  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  5112466 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcacaacaaagacactcaa 5112523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 100 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 9935 - 9514
Alignment:
Q  100 actattgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatag 199  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9935 actaatgttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatgg 9836  T
Q  200 tctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaa 298  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9835 tctccaaccaaacaacaacaaaacagccctaagctagtatatagcaaaaccacacaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa--ggaagaa 9739  T
Q  299 caaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaagg 398  Q
    |||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9738 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 9640  T
Q  399 ttacaagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 498  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9639 ttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 9540  T
Q  499 attacaatgtttttcccaacctaaga 524  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  9539 attacaatgtttttcccaacctaaga 9514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 398 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 3845 - 3683
Alignment:
Q  398 gttacaagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 497  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3845 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 3746  T
Q  498 gattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3745 gattacaatgtttttcctaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 3683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 170 - 28
Alignment:
Q  106 gttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcca 205  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  170 gttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaattaaataaaccaatgatgtgtggagcaagt------gataatcaatgagagcaaatggtctcca 77  T
Q  206 agccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacac 253  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  76 agtaaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 105 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 22173484 - 22173035
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcc 204  Q
    |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22173484 tgttgtgaatccggtttcaaacaaatcttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 22173386  T
Q  205 aagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa 302  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||    
T  22173385 aagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcg-gtaaaaggaagaacaaa 22173288  T
Q  303 acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttac 402  Q
    |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22173287 acaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 22173189  T
Q  403 aag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 500  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  22173188 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcctaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 22173089  T
Q  501 tacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173088 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 22173035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 104 - 553
Target Start/End: Original strand, 18656227 - 18656677
Alignment:
Q  104 ttgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18656227 ttgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaaata--caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 18656324  T
Q  204 caagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaa 301  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||| |  |||||||  |||||||||| |  | ||| | ||||||||    
T  18656325 caagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacg-gtaaaggaaagaacaa 18656421  T
Q  302 aa----caccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag 397  Q
    ||    |||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18656422 aaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 18656521  T
Q  398 gttacaagactctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 497  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  18656522 gttacaagactctagcattcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtattttcccactctcacactataaacccttaatcccaaggt 18656621  T
Q  498 gattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  18656622 gattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 18656677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 126 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 2677358 - 2676939
Alignment:
Q  126 gaaactttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaaca 224  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  2677358 gaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaaca 2677259  T
Q  225 gccctaa--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattatt 320  Q
    ||| |||  | | |||||||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||| |||||||| | |  ||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||    
T  2677258 gcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgtt 2677163  T
Q  321 gacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-cca 418  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||    
T  2677162 gacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatca 2677063  T
Q  419 agctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccca 516  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2677062 agctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttccca 2676963  T
Q  517 acctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  2676962 acctaagaaacactctcatcaaag 2676939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 126 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 2673202 - 2672783
Alignment:
Q  126 gaaactttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaaca 224  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  2673202 gaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaaca 2673103  T
Q  225 gccctaa--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattatt 320  Q
    ||| |||  | | |||||||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||| |||||||| | |  ||||| || ||||||| ||||| |||||||| ||    
T  2673102 gcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgtt 2673007  T
Q  321 gacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-cca 418  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||    
T  2673006 gacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatca 2672907  T
Q  419 agctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccca 516  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2672906 agctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccttaaatcccaaggtgattacaatgttgttttccca 2672807  T
Q  517 acctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    |||||||| ||||||||| |||||    
T  2672806 acctaagaaacactctcatcaaag 2672783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 133 - 489
Target Start/End: Original strand, 7167072 - 7167425
Alignment:
Q  133 tcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-a 231  Q
    |||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7167072 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagccctaga 7167166  T
Q  232 caagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttc 330  Q
    | |||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  7167167 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttc 7167263  T
Q  331 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttaca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| |||||    
T  7167264 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttaca 7167362  T
Q  428 catgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7167363 caagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 7167425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 152 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 28504108 - 28503780
Alignment:
Q  152 caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatca 250  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||    
T  28504108 caatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaacca 28504011  T
Q  251 cacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatct 349  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||           ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28504010 cacaaagagataacaaagcataaacaaga-----------aaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 28503923  T
Q  350 gggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tc 446  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  28503922 ggggaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattc 28503823  T
Q  447 taccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28503822 taccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 28503780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Original strand, 8512036 - 8512450
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  8512036 ttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 8512134  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa---gaacaaaacaccatgcaagattattgacc 324  Q
    |  | | ||| ||||| || ||||| ||||| |  ||| |||||  ||||||||  | || ||| |||   ||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  8512135 agcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaa-gcata--caagataaa-acgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacc 8512230  T
Q  325 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-ccaagct 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||    
T  8512231 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagct 8512330  T
Q  423 ttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacct 520  Q
    ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8512331 ttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacct 8512430  T
Q  521 aagagacactctcaacaaag 540  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  8512431 aagatacactctcatcaaag 8512450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Original strand, 8516916 - 8517330
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  8516916 ttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 8517014  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa---gaacaaaacaccatgcaagattattgacc 324  Q
    |  | | ||| ||||| || ||||| ||||| |  ||| |||||  ||||||||  | || ||| |||   ||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  8517015 agcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaa-gcata--caagataaa-acgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgacc 8517110  T
Q  325 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-ccaagct 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||    
T  8517111 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagct 8517210  T
Q  423 ttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacct 520  Q
    ||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8517211 ttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacct 8517310  T
Q  521 aagagacactctcaacaaag 540  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  8517311 aagatacactctcatcaaag 8517330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 160 - 540
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968340
Alignment:
Q  160 tgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--caagtgtatagcaaaatcacac-aag 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||| ||||| |||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaag 24968055  T
Q  257 agattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctggggga 355  Q
    || |  ||| |||||  |||||||| | | ||||   || ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||    
T  24968056 agctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttgggga 24968151  T
Q  356 gagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcc-tccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctt 453  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24968152 gagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaacccgagatctaccctt 24968251  T
Q  454 tggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    |||||  ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24968252 tggtactttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 24968340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 156 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 2671836 - 2671587
Alignment:
Q  156 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaa-cagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacac 253  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||| || |||| |||||    
T  2671836 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacac 2671738  T
Q  254 aa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 352  Q
    || |||||  ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671737 aaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 2671642  T
Q  353 ggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  2671641 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 2671587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 254 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 8739213 - 8738982
Alignment:
Q  254 aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 353  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739213 aagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 8739118  T
Q  354 gagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctac 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  8739117 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccctagattctac 8739019  T
Q  450 cctttggtatgttcccactctcacactatgaacccta 486  Q
    || |  |||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  8739018 ccatatgtatttccccactctcacaatatgaacccta 8738982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 254 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 9091451 - 9091220
Alignment:
Q  254 aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 353  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091451 aagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 9091356  T
Q  354 gagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctac 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  9091355 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccctagattctac 9091257  T
Q  450 cctttggtatgttcccactctcacactatgaacccta 486  Q
    || |  |||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  9091256 ccatatgtatttccccactctcacaatatgaacccta 9091220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 296 - 540
Target Start/End: Original strand, 32475470 - 32475717
Alignment:
Q  296 gaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaa 395  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||    
T  32475470 gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaa 32475568  T
Q  396 aggttacaagactctagcct-ccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggt-atgttcccactctcacactatgaaccctaaaaccca 493  Q
      ||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | |  ||||||  ||||||||||||||||  || ||||    
T  32475569 gagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatccca 32475668  T
Q  494 aggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  32475669 agatgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 32475717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 296 - 540
Target Start/End: Original strand, 32480328 - 32480575
Alignment:
Q  296 gaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaa 395  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||    
T  32480328 gaacaaaacaccaaccaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaa 32480426  T
Q  396 aggttacaagactctagcct-ccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggt-atgttcccactctcacactatgaaccctaaaaccca 493  Q
      ||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| | |  ||||||  ||||||||||||||||  || ||||    
T  32480427 gagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatccca 32480526  T
Q  494 aggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  32480527 agatgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 32480575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 271 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 40372929 - 40372712
Alignment:
Q  271 aaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 370  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372929 aaacaagataagcaagata--ggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcca 40372833  T
Q  371 atccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccac 467  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| |  || | | |||||    
T  40372832 atccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccac 40372734  T
Q  468 tctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||||| | ||||||||||||||    
T  40372733 tctcataatatgaaccctaaaa 40372712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 355 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501613
Alignment:
Q  355 agagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccc 451  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28501651  T
Q  452 tttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    |||||| | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28501650 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 28501613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 271 - 489
Target Start/End: Original strand, 8477324 - 8477545
Alignment:
Q  271 aaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 369  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477324 aaacaagataagcaagaaaga--aagaacaaacacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 8477420  T
Q  370 aatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--actctagcctccaagctttacac-atgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgt-tc 463  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||  |||| | ||||| |||||| || |||||  |||||| ||||||||||||| | |  |    
T  8477421 aatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaataaacaagacctagattctaccctttggtgtttccc 8477519  T
Q  464 ccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  8477520 ccactctcacaatatgaaccctaaaa 8477545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 360
Target Start/End: Original strand, 10207722 - 10207983
Alignment:
Q  102 tattgttgtgaatccggttcca--aagaaactttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaata 198  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||     
T  10207722 tattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 10207821  T
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagat-aagcaagaaaaagga 294  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||| ||||| ||||| |  | |||||| |||||||| || || |||||   |    
T  10207822 gcctccaagctaacaacaacaaaacag-cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcat-aacaagataaaccatgaaaagaaa 10207918  T
Q  295 agaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagag 360  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10207919 agaac-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 312 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 26928687 - 26928507
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag--act 408  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||  |      
T  26928687 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 26928588  T
Q  409 ctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaa 489  Q
     |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26928587 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 26928507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 406
Target Start/End: Original strand, 1305914 - 1306044
Alignment:
Q  274 caagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 372  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1305914 caagataagcaagaaa--ggaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaat 1306009  T
Q  373 ccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    ||| || || || ||||||||||| ||||||||||    
T  1306010 ccactacgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 1306044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 28501560 - 28501489
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28501560 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcatcccttttggttc 28501489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 28503727 - 28503656
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28503727 acccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccttttggttc 28503656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 275 - 489
Target Start/End: Original strand, 32143287 - 32143501
Alignment:
Q  275 aagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 372  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||   |||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32143287 aagataagcaagaaa--ggaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaat 32143382  T
Q  373 ccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaag-actctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactc 469  Q
    ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||| || || | | |||||||    
T  32143383 ccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactc 32143481  T
Q  470 tcacactatgaaccctaaaa 489  Q
    || || ||||||||||||||    
T  32143482 tctcaatatgaaccctaaaa 32143501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 2671449 - 2671379
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2671449 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttc 2671379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Original strand, 8477598 - 8477668
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8477598 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttc 8477668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 40372659 - 40372589
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40372659 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc-tttggttc 40372589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 489 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 8738926 - 8738861
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8738926 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactcaacccatt 8738861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Original strand, 7167478 - 7167549
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttt-tcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7167478 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-tttggttc 7167549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370477
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8370477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974943
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 27974943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 489 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 9091164 - 9091094
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttc 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9091164 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactcaaccc-tttggttc 9091094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18552971 - 18552873
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  18552971 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 18552873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 48438213 - 48438311
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  48438213 caagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 48438311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 21711222 - 21711319
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  21711222 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 21711319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264446
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 16264446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453054
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 27453054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986449
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029190
Alignment:
Q  313 agattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 36029190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 1736385 - 1736295
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  1736385 ttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 1736295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709780
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaaga 30709780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    |||||| |||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3716090 - 3715992
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  3716090 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3715992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 6794778 - 6794704
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  6794778 ccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 6794704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 40592870 - 40592772
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  40592870 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 40592772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 312 - 373
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795843
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 373  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 25795843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 26298987 - 26299085
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  26298987 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 26299085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1417578 - 1417513
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1417578 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatcca 1417513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 549
Target Start/End: Original strand, 1306179 - 1306239
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaac 549  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  1306179 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 1306239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 47923994 - 47923896
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| || |||| |||||||| |||||||||    
T  47923994 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaagagttacaaga 47923896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 337 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 4386988 - 4386947
Alignment:
Q  337 tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 378  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4386988 tatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccaata 4386947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Original strand, 32475305 - 32475402
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaa-caacaacaaaacagcc 227  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||| | |||||| | || ||||||||||||||||    
T  32475305 ttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacagcc 32475402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 37466290 - 37466355
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||| ||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  37466290 caagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatcca 37466355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 39040079 - 39039995
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaa 394  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  39040079 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 406
Target Start/End: Original strand, 40844674 - 40844748
Alignment:
Q  333 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  40844674 ccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 40844748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Original strand, 32480162 - 32480260
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaa-ccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaa-caacaacaaaacagcc 227  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||| | |||||| | || ||||||||||||||||    
T  32480162 ttcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacagcc 32480260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3328444 - 3328379
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||    
T  3328444 caagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatcca 3328379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38210626 - 38210569
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38210626 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatcca 38210569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50494255 - 50494198
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50494255 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 50494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 379
Target Start/End: Original strand, 53894082 - 53894119
Alignment:
Q  342 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 379  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53894082 cctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatat 53894119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 492 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 4386831 - 4386774
Alignment:
Q  492 caaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  4386831 caaggtgattacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 4386774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 105 - 554
Target Start/End: Complemental strand, 35352 - 34902
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaa-ctttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctc 203  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  35352 tgttgtgaatccggttaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 35254  T
Q  204 caagccaacaacaacaaaacagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaa 301  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  35253 caagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcg-gtaaaaggaagaacaa 35156  T
Q  302 aacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaaggtta 401  Q
    ||||||  | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35155 aacaccgag-aagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 35057  T
Q  402 caaga-ctctagcctccaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 499  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35056 gaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 34957  T
Q  500 ttacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 554  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34956 ttacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatt 34902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 103 - 553
Target Start/End: Original strand, 153 - 605
Alignment:
Q  103 attgttgtgaatccggttc--caaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagt 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  153 attgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggc 252  T
Q  201 ctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa-caagtgtatagcaaaatcacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaa 298  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||| |   |||| | |||||    
T  253 ttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaa 350  T
Q  299 caaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaagg 398  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  351 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtga-agtgttacaaaagg 449  T
Q  399 ttacaagactctagcctc-caagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 497  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  450 ttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggt 549  T
Q  498 gattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  550 gattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 102 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 19461 - 19017
Alignment:
Q  102 tattgttgtgaatccggttcca--aagaaactttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaata 198  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||     
T  19461 tattgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatg 19362  T
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaacagccctaa--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa 295  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||| |||  | | |||||||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||| | | ||||   ||    
T  19361 gcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaa 19266  T
Q  296 -gaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaa 394  Q
     ||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  19265 cgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgttacaa 19167  T
Q  395 aag-gttacaagactctagcct-ccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 492  Q
    ||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  ||  ||    
T  19166 aagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagatctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataattcc 19067  T
Q  493 aaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19066 aaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 103 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 14605 - 14161
Alignment:
Q  103 attgttgtgaatccggttcca--aagaaactttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatag 199  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||  ||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||| |    
T  14605 attgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatgg 14506  T
Q  200 tctccaagccaa-caacaacaaaacagccctaa--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaa-agga 294  Q
     |||||||| || |||||||||||||| |||||  | | |||| ||||||  ||||| ||||| |  | ||||||  ||||||||| | | |||| |  |    
T  14505 cctccaagctaatcaacaacaaaacag-cctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaac-aagcat--acaagataaacgataaaagaaaa 14411  T
Q  295 agaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaa 394  Q
     ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  14410 cgaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaa 14311  T
Q  395 aag-gttacaagactctagcct-ccaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaaccc 492  Q
    ||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||    
T  14310 aagagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatccc 14211  T
Q  493 aaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactctcaacaaag 540  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14210 aaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 14161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 149220 - 148808
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  149220 ttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 149122  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa---gaacaaaacaccatgcaagattattgacc 324  Q
    |  | | |||||||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||| |  || |||||||   ||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  149121 agcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaac--gataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacc 149028  T
Q  325 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-ccaagct 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||    
T  149027 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagct 148928  T
Q  423 ttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacct 520  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  148927 ttacacaagacaaaaccatagatctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacct 148828  T
Q  521 aagagacactctcaacaaag 540  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  148827 aagatacactctcatcaaag 148808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 132 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 2515 - 2103
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 230  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2515 ttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 2417  T
Q  231 a--caagtgtatagcaaaatcacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa---gaacaaaacaccatgcaagattattgacc 324  Q
    |  | | |||||||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||  |||||||| |  || |||||||   ||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  2416 agcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaac--gataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacc 2323  T
Q  325 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagagagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-ccaagct 422  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||    
T  2322 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagct 2223  T
Q  423 ttacacatgaacaaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacct 520  Q
    ||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  2222 ttacacaagacaaaaccatagatctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacct 2123  T
Q  521 aagagacactctcaacaaag 540  Q
    |||| ||||||||| |||||    
T  2122 aagatacactctcatcaaag 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34239 - 34136
Alignment:
Q  105 tgttgtgaatccggttccaaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctcc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34239 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 34140  T
Q  205 aagc 208  Q
    ||||    
T  34139 aagc 34136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 4)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 199 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18157 - 17953
Alignment:
Q  199 gtctccaagccaacaacaacaaaa--cagcccta-acaagtgtatagcaaaatcacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaa 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||| | ||||  ||||| | |||||||  ||||||||||||||||||  ||||    
T  18157 gtctccaagc-aacaacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa--ggaa 18065  T
Q  296 gaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttaca 393  Q
    ||||||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  18064 gaacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaca 17966  T
Q  394 aaaggttacaaga 406  Q
    || ||||||||||    
T  17965 aagggttacaaga 17953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 271 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 24180 - 24046
Alignment:
Q  271 aaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaa-acaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 369  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24180 aaacaagataagaaagaaa--ggaagaacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 24084  T
Q  370 aatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  24083 aatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 24046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 17818 - 17756
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  17818 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 17756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 23911 - 23849
Alignment:
Q  489 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23911 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 23849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 296 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 182064 - 181980
Alignment:
Q  296 gaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 380  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182064 gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 435 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 176936 - 176829
Alignment:
Q  435 aaaccctagatctaccctttggtatgttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacctaagagacactct 532  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  176936 aaaccctagacctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactct 176837  T
Q  533 caacaaag 540  Q
    || |||||    
T  176836 catcaaag 176829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 182229 - 182132
Alignment:
Q  132 ttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaa-caacaacaaaacagcc 227  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  ||||| | |||||||| || ||||||||||||||||    
T  182229 ttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc 182132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 104 - 195
Target Start/End: Original strand, 13140 - 13233
Alignment:
Q  104 ttgttgtgaatccggttc--caaagaaactttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 195  Q
    ||||||||||||||||||  ||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13140 ttgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8420
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 156 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 487 - 300
Alignment:
Q  156 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatagtctccaagccaacaacaacaaaa--cagccctaa-caagtgtatagcaaaatcaca 252  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||| || ||||||| |||||||||||||  ||||||||| | ||||   ||||||| ||||    
T  487 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccaca 389  T
Q  253 caa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaggaagaacaaaacaccatgcaagattattgacccagttcagccaatatggcct 344  Q
    ||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  388 caaagagataataaagca-aaacaagataagctagaaaga--aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 406
Target Start/End: Original strand, 10728 - 10826
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag-gttacaaga 406  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||| |||||||||    
T  10728 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 313 - 406
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85779
Alignment:
Q  313 agattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||  |||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 85779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43962
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 43962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 36929 - 36833
Alignment:
Q  312 aagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||| || |||||||||||  |||||||||    
T  36929 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 397
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5770
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  5682 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 397
Target Start/End: Original strand, 2491 - 2579
Alignment:
Q  311 caagattattgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaag 397  Q
    ||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  2491 caagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 133354 - 133281
Alignment:
Q  334 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gagagtgttacaaaaggttacaaga 406  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||  |||||||||    
T  133354 caatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaaga 133281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 381
Target Start/End: Original strand, 45276 - 45323
Alignment:
Q  334 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga 381  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45276 caatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatga 45323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 269
Alignment:
Q  319 ttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  326 ttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 342 - 375
Target Start/End: Original strand, 11500 - 11533
Alignment:
Q  342 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500 cctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University