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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF5301_high_2 (Length: 835)
Name: NF5301_high_2
Description: NF5301
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF5301_high_2 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 563; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 563; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 37824063 - 37823270
Alignment:
| Q |
28 |
ctcgttctttcacacaatacttttctttctatcaacattgatagcagtgctgacaccatcttacccaaccttgtttacttagatttatcttattctaata |
127 |
Q |
| |
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| T |
37824063 |
ctcgttctttcacacaatacttttcttgctatcaacactgatagcagtgctgactccatcttacccaaccttttttcattagatttatcctctgctaata |
37823964 |
T |
|
| Q |
128 |
ttaatagttttcctaaattccaagc------acgaaatctggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaatggtttcataa |
221 |
Q |
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| T |
37823963 |
ttaatagttttcctaaattcctagcgcaactaccaaatctgcaatcattagatctctccaacaacaacattcatgggaaaattcccaaatggtttcataa |
37823864 |
T |
|
| Q |
222 |
gaaactcttaaactcgtggaagaacattcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaactat |
321 |
Q |
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|
| T |
37823863 |
gaagctcttaaactcatggaaggacatttggtccgttgacctcagtttcaacaagttacaaggagatcttccaattccaccttctggcattcaatacttt |
37823764 |
T |
|
| Q |
322 |
ttactctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggta |
421 |
Q |
| |
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| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
37823763 |
tcactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgacaggta |
37823664 |
T |
|
| Q |
422 |
tgattccacaatgcctaggaacatttcctaatctctatattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttttccaaaggaaa |
521 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37823663 |
tgattccacaatgcctgggaacattaaattctcttcatgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccaaaggaaa |
37823564 |
T |
|
| Q |
522 |
tgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgac |
621 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37823563 |
tgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgac |
37823464 |
T |
|
| Q |
622 |
aacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgtt |
721 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
37823463 |
aacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgtt |
37823364 |
T |
|
| Q |
722 |
ctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccagcatcatgcatcaagaactt |
815 |
Q |
| |
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|
|
| T |
37823363 |
ctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactt |
37823270 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 550; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 815
Target Start/End: Original strand, 37392874 - 37393671
Alignment:
| Q |
18 |
actatggtatctcgttctttcacacaatacttttctttctatcaacattgatagcagtgctgacaccatcttacccaaccttgtttacttagatttatct |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37392874 |
actatggtatctctatctttcacacaatggttttctttctatcaacattgatagcagtgttgacaccatcttacctaaccttttttcattagatttatca |
37392973 |
T |
|
| Q |
118 |
tattctaatattaatagttttcctaaattccaagcacgaaatctggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaatggtttc |
217 |
Q |
| |
|
||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37392974 |
tatgccaatattaatagttttcctaaattccaagcacgaaatctggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaatggtttc |
37393073 |
T |
|
| Q |
218 |
ataagaaactcttaaactcgtggaagaacattcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaa |
317 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
37393074 |
ataagaagctcttaaactcatggaaggacattatacacattgacctgagtttcaacaagttacaaggtgatcttccaattccacctgatggcattgaaga |
37393173 |
T |
|
| Q |
318 |
ctatttactctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgaaa |
417 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37393174 |
ctttttactctcaaacaacaacttcacaggagatatttcttcaacattctgcaatgctagttccctttatatcctcaatttggctcacaacaatttgaca |
37393273 |
T |
|
| Q |
418 |
ggtatgattccacaatgcctaggaacatttcctaatctctatattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttttccaaag |
517 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37393274 |
ggtatgattccacaatgtctaggaacattttcttatctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctgtggaagcattcctggaaccttttccaaag |
37393373 |
T |
|
| Q |
518 |
gaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttgg |
617 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37393374 |
gaaatatatttgagactataaaattgaatggaaaccaattggaaggaccattaccacaatgtttggcttactgttcatatcttgaagtattggaccttgg |
37393473 |
T |
|
| Q |
618 |
tgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacc |
717 |
Q |
| |
|
|||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
37393474 |
tgacaacaacatagaggatacttttcccaattggctagaaactctacaagagttacaggtgctaagtttacgatcaaatcatcttcatgggtcaatcaca |
37393573 |
T |
|
| Q |
718 |
tgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccagcatcatgcatcaagaactt |
815 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
37393574 |
tgttctagcaccaagcatccatttcctaagttgagaatttatgatgtctctagtaacaattttagtggccccttgccaacatcatgcttcaagaactt |
37393671 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 32 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 37702832 - 37702049
Alignment:
| Q |
32 |
ttctttcacacaatacttttctttctatcaacattgatagcagtgctgacaccatcttacccaaccttgtttacttagatttatcttattctaatattaa |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || | | |||||||||| |
|
|
| T |
37702832 |
ttctttcacacaatagttttatttctatcaacattgatagcagtgctgactccatcttacccaaccttgttgacttagatttctcgtctgctaatattaa |
37702733 |
T |
|
| Q |
132 |
tagttttcctaaattccaagcacgaaatctggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaatggtttcataagaaactctta |
231 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37702732 |
tagttttcctaaattccaagcacaaaatctgcaaacattagatctctccaataactacattcatgggaaaattcccaaatggtttcataagaaactctta |
37702633 |
T |
|
| Q |
232 |
aactcgtggaagaacattcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaactatttactctcaa |
331 |
Q |
| |
|
||||| |||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37702632 |
aactcatggaaggacattatacacattaacctgagtttcaaaatgttgcaaggacatcttccaattccacctcatggcattgtacactttttactctcaa |
37702533 |
T |
|
| Q |
332 |
acaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccaca |
431 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
37702532 |
acaacaacttcacaggaaatatctcttcaacattctgcaatgcaagttccctttacattctcaatttggctcacaacaatttgacaggtatgattccaca |
37702433 |
T |
|
| Q |
432 |
atgcctaggaacatttcctaatctctatattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttttccaaaggaaatgcatttgag |
531 |
Q |
| |
|
||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37702432 |
atgtctgggaacatttcctcatctctctattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttctccaaaggaaatgcatttgag |
37702333 |
T |
|
| Q |
532 |
actataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttg |
631 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |
|
|
| T |
37702332 |
actataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccgcagtctttggctcaatgttcaaatcttgaagtattggaccttggtgacaacaacatag |
37702233 |
T |
|
| Q |
632 |
aggatacatttcctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaa |
731 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
37702232 |
aggatacatttcccaattggctagaaactttaccagagttacaggtgctgagtttacgatcaaatcatcttcatggtgcaatcacttgttctagcaccaa |
37702133 |
T |
|
| Q |
732 |
gcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccagcatcatgcatcaagaactt |
815 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37702132 |
gcattcatttcctaagttgagaatttttgatgcctctaacaacaattttagtggccccttgccaacatcatgcatcaagaactt |
37702049 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 270 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 37711415 - 37710870
Alignment:
| Q |
270 |
caacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaactatttactctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgc |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37711415 |
caacaactttcaaggagatcttccaattccaccttctggcattcaatacttttcactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgc |
37711316 |
T |
|
| Q |
370 |
aatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctaggaacatttcctaatctctatattttggata |
469 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
37711315 |
aatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctaggaacatttcctaatctctatgttttggata |
37711216 |
T |
|
| Q |
470 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttttccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccatt |
569 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
37711215 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggatcatt |
37711116 |
T |
|
| Q |
570 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
669 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37711115 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
37711016 |
T |
|
| Q |
670 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
769 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37711015 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
37710916 |
T |
|
| Q |
770 |
acaacaattttagtgggcccttgccagcatcatgcatcaagaactt |
815 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37710915 |
acaacaattttagtgggcccttgccagcatcatgcatcaagaactt |
37710870 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 466; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 270 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 37639657 - 37639112
Alignment:
| Q |
270 |
caacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaactatttactctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgc |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37639657 |
caacaactttcaaggagatcttccaattccaccttctggcattaaatacttttcactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgc |
37639558 |
T |
|
| Q |
370 |
aatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctaggaacatttcctaatctctatattttggata |
469 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| | | ||||||| |
|
|
| T |
37639557 |
aatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgacaggtatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttactgtattggata |
37639458 |
T |
|
| Q |
470 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttttccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccatt |
569 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37639457 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttctccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccatt |
37639358 |
T |
|
| Q |
570 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
669 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37639357 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
37639258 |
T |
|
| Q |
670 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
769 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37639257 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
37639158 |
T |
|
| Q |
770 |
acaacaattttagtgggcccttgccagcatcatgcatcaagaactt |
815 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37639157 |
acaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactt |
37639112 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 462; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 270 - 815
Target Start/End: Original strand, 37401247 - 37401792
Alignment:
| Q |
270 |
caacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaactatttactctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgc |
369 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37401247 |
caacaactttcaaggagatcttccaattccaccttctggcattcaatacttttcactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgc |
37401346 |
T |
|
| Q |
370 |
aatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctaggaacatttcctaatctctatattttggata |
469 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || | ||||||| |
|
|
| T |
37401347 |
aatgccagttccctttatgtgctcgatttggctcacaacaatttgacaggtatgattccacaatgcctgggaacattaacttctcttaatgtattggata |
37401446 |
T |
|
| Q |
470 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttttccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccatt |
569 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37401447 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaacctttaccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccatt |
37401546 |
T |
|
| Q |
570 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
669 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37401547 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
37401646 |
T |
|
| Q |
670 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
769 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37401647 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
37401746 |
T |
|
| Q |
770 |
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acaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactt |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 37533263 - 37532466
Alignment:
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132 |
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T |
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226 |
Q |
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T |
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tctt---------aaactcgtggaagaacattcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaa |
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Q |
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417 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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617 |
Q |
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T |
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tgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacc |
717 |
Q |
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| T |
37532663 |
tgacaacaacatagaggacacatttccaaattggctagaaactctacaagagttacaagttctaagcttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcact |
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T |
|
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tgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccagcatcatgcatcaagaactt |
815 |
Q |
| |
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tgttctagcaccaagcattcatttcctaagttgagaatttttgatgtttctaacaacaattttagtgggcccttgccaatatcatgcatcaagaactt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 270 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 37594115 - 37593570
Alignment:
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Q |
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T |
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| Q |
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| T |
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T |
|
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tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttttccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccatt |
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Q |
| |
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|
| T |
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T |
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| |
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| T |
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T |
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Q |
| |
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T |
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770 |
acaacaattttagtgggcccttgccagcatcatgcatcaagaactt |
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Q |
| |
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| T |
37593615 |
tcaacaattttagtgggcccttgccaacatcatgcatcaagaactt |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 270 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 37696506 - 37695961
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|
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Q |
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T |
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tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttttccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccatt |
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Q |
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T |
|
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accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
669 |
Q |
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T |
|
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670 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
769 |
Q |
| |
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| T |
37696106 |
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37696007 |
T |
|
| Q |
770 |
acaacaattttagtgggcccttgccagcatcatgcatcaagaactt |
815 |
Q |
| |
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| T |
37696006 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 33 - 812
Target Start/End: Original strand, 37382332 - 37383117
Alignment:
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| |
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| Q |
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agttttcctaaattccaagcacgaaatc------tggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaatggtttcataagaaac |
226 |
Q |
| |
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T |
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tcttaaactcgtggaagaacattcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaactatttact |
326 |
Q |
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37382532 |
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T |
|
| Q |
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ctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgatt |
426 |
Q |
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37382632 |
ctcgaacaacaacttcacaggaaacattgatttttcattgtgcaacgcaagttccctgaatgtgctcaatttggctcacaacaatttaactggcatgatt |
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T |
|
| Q |
427 |
ccacaatgcctaggaacatttcctaatctctatattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttttccaaaggaaatgcat |
526 |
Q |
| |
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ccacaatgcttgggaacatttccttctctttcggtattggatatgcaaatgaacaacctctatggacacattcctagaaccttctccaaaggaaatgcat |
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T |
|
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527 |
ttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaa |
626 |
Q |
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| T |
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ttgagacaataaagttgaatggaaaccgattggaaggaccattaccacagtctttggctcactgtacaaaactcgaagttttggaccttggagacaacaa |
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|
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cgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagc |
726 |
Q |
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| T |
37382932 |
cgtagaggatacttttcccaattggcttgaaactctacaagaattacaggtgctcagtttaagatcaaataaacttcatggcgcaatcacatgctctagc |
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T |
|
| Q |
727 |
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812 |
Q |
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| T |
37383032 |
accaaacatccatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttattgggcccttgccaacatcgtgcatcaagaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 33 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 37435870 - 37435076
Alignment:
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|
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Q |
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37435770 |
agttttcctaaattccacgcacaaaaacttcaaacattagatctctccaataacaacattcatgggaaaattcccaaatggtttcataagaagctcttaa |
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T |
|
| Q |
233 |
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320 |
Q |
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| T |
37435670 |
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T |
|
| Q |
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tttactctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggt |
420 |
Q |
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| T |
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tttgctctcaaacaacaacttcgcaggagacatttcttcaaaattgtgccaagcaagctccatgaacgtgctcaatttggcccacaacaaattgacaggc |
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T |
|
| Q |
421 |
atgattccacaatgcctaggaacatttcctaatctctatattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttttccaaaggaa |
520 |
Q |
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| T |
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ataattccaaaatgcctgggaacatttccttttctttccgttttggatatgcaaatgaacaaccttaatggaagcatgcctaaaactttttccagaggaa |
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T |
|
| Q |
521 |
atgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtga |
620 |
Q |
| |
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| T |
37435370 |
atgccttcgagactataaagttgaatggcaaccaattagaaggaccattacctcaatctttggctcactgtacagaactcaaaattttggaccttggata |
37435271 |
T |
|
| Q |
621 |
caacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgt |
720 |
Q |
| |
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| T |
37435270 |
caacaacatagaggatacatttcccaattggctagaaactctacaagagttacaggtactcagtttaagatcaaataaacttaatggttcaatcacctgt |
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T |
|
| Q |
721 |
tctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccagcatcatgcatcaagaactt |
815 |
Q |
| |
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|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 33 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37594487 - 37594110
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agttttcctaaattccaagcacgaaatctggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaatggtttcataagaaactcttaa |
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agttttcctaaattccaaacacgaaatcttcaaagattagatctctccaataacaacattcatgggaaaattcccaaatggtttcataagaagctcttaa |
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actcgtggaagaacattcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaactatttactctcaaa |
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caacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 403 - 764
Target Start/End: Original strand, 37413547 - 37413908
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| Q |
403 |
cacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctaggaacatttcctaatctctatattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattccta |
502 |
Q |
| |
|
||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37413547 |
cacaacaatttaacaggcatgattccacaatgcctaggaacatttccttctctttctatattggatatgcaaatgaacaacttgtatggaagctttccta |
37413646 |
T |
|
| Q |
503 |
gaaccttttccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccacaatctttggctaactgttcatatcttga |
602 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || | ||||||| |
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| T |
37413647 |
gaaccttttccaaaggaaatacatttgagatgataaagttgaacggaaatcaattggaaggaccattaccacagtctttggcttagtgcataaatcttga |
37413746 |
T |
|
| Q |
603 |
agttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatctt |
702 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37413747 |
agttctggaccttggtgacaacaatatagaggatacatttcccaattggctagaaactctacaagagttacaggtgctaagtttacgatcaaataatctt |
37413846 |
T |
|
| Q |
703 |
catggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgt |
764 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
37413847 |
catggtgcaatcacctgttctagcacaaagcatacatttcccaagttgagaatattttatgt |
37413908 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 18 - 413
Target Start/End: Complemental strand, 37696899 - 37696498
Alignment:
| Q |
18 |
actatggtatctcgttctttcacacaatacttttctttctatcaacattgatagcagtgctgacaccatcttacccaaccttgtttacttagatttatct |
117 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
| T |
37696899 |
actatggcatctcgttctttcacacaatacttttcttgctatcaacactgatagcagtgctgactccatcttacccaaccttgttgacttagaattatct |
37696800 |
T |
|
| Q |
118 |
tattctaatattaatagttttcctaaattccaagc------acgaaatctggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaat |
211 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
37696799 |
aatgctaatattaatagttttcctaaattcctagcgcaactaccaaatctgcaatcgttagatctctccaacaacaacattcatgggaaaattcccaaat |
37696700 |
T |
|
| Q |
212 |
ggtttcataagaaactcttaaactcgtggaagaacattcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcat |
311 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||| |
|
|
| T |
37696699 |
ggtttcataagaagctcttaaactcatggaaggacattcaggacttagacctcagtttcaacaagttacaaggagatcttccaattccaccttctagcat |
37696600 |
T |
|
| Q |
312 |
taaaaactatttactctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaat |
411 |
Q |
| |
|
| | ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37696599 |
tggatacttttcactctcaaacaacaacttcacaggaaatatttcttcaacattctgcaatgcaagttccctttataccctcaatttggctcacaacaat |
37696500 |
T |
|
| Q |
412 |
tt |
413 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
37696499 |
tt |
37696498 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 410
Target Start/End: Original strand, 37400860 - 37401252
Alignment:
| Q |
18 |
actatggtatctcgttctttcacacaatacttttctttctatcaacattgatagcagtgctgacaccatcttacccaaccttgtttacttagatttatct |
117 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37400860 |
actatggtttctccatctttcccataatagttttctttctatcaacattgatagcagtgctgactccatcttacccaacctttttttattagatttatcc |
37400959 |
T |
|
| Q |
118 |
tattctaatattaatagttttcctaaattccaagcacgaaatctggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaatggtttc |
217 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |
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|
| T |
37400960 |
tctgctaatattaatagttttcctaaattcccagcacgaaatctgaaaagattatatctctccaataacaacattcgtgggaaaattcccaaatggtttc |
37401059 |
T |
|
| Q |
218 |
ataagaaactcttaaactcgtggaagaacattcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaa |
317 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |
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|
| T |
37401060 |
ataagaagctcttaaactcatggaaggacattcagtacttagacctcagtttcaacaagttacaaggagatcttccaattccaccttctggcattgaata |
37401159 |
T |
|
| Q |
318 |
ctatttactctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaa |
410 |
Q |
| |
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|| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37401160 |
cttttcactctcaaataacaacttcacaggatacatttcttcaacattctgcaatgcaagttcccttcgtaccctcaatttggctcacaacaa |
37401252 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 18 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37711802 - 37711410
Alignment:
| Q |
18 |
actatggtatctcgttctttcacacaatacttttctttctatcaacattgatagcagtgctgacaccatcttacccaaccttgtttacttagatttatct |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
37711802 |
actatggtatctcgttctttcacacaatacttttctttctatcaacattgatagcagtattgactccatcatacccaaccttttttcattagatttatcc |
37711703 |
T |
|
| Q |
118 |
tattctaatattaatagttttcctaaattccaagcacgaaatctggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaatggtttc |
217 |
Q |
| |
|
| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
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| T |
37711702 |
tctgctaatattaatagttttcctaaattccaagcacgaaatctgcaaacattagatctctccaacaacaacattcatgggaaaattcccaaatggtttc |
37711603 |
T |
|
| Q |
218 |
ataagaaactcttaaactcgtggaagaacattcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaa |
317 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| | ||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |
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|
| T |
37711602 |
atacgaagctcttaaactcatggaaggacattcggtacattgatcttagtttcaacatgttgcaaggagatcttccaattccaccatctggcattcaata |
37711503 |
T |
|
| Q |
318 |
ctatttactctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaa |
410 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
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|
| T |
37711502 |
cttttcactctcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattccgcaacgcaagttccctttataccctcaatttggctcacaacaa |
37711410 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 33 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37640035 - 37639652
Alignment:
| Q |
33 |
tctttcacacaatacttttctttctatcaacattgatagcagtgctgacaccatcttacccaaccttgtttacttagatttatcttattctaatattaat |
132 |
Q |
| |
|
|||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| | |||||||||| |
|
|
| T |
37640035 |
tctttcccataatagttttctttctatcaacattgatagcagtgctgactccatcttacccaaccttgaatcattatatttatcttctgctaatattaaa |
37639936 |
T |
|
| Q |
133 |
agttttcctaaattccaagcacga------aatctggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaatggtttcataagaaac |
226 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||||||| ||| || || | |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
37639935 |
agttttcccaaattcctagcacgagtacataatttgcaatggttagatctctccaataacaacattcatgggaaaattcccaaatggtttcataagaagc |
37639836 |
T |
|
| Q |
227 |
tcttaaactcgtggaagaacattcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaactatttact |
326 |
Q |
| |
|
|||||||| | |||||| |||||| | ||||| || |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |
|
|
| T |
37639835 |
tcttaaacacatggaaggacattcggtacattgatcttagtttcaacatgttgcaaggacatcttccaattccacctgatggcattgtatactttttact |
37639736 |
T |
|
| Q |
327 |
ctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaa |
410 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
37639735 |
ctcaaataacaacttcacaggaaatatttcttcaacattccgcaacgcaagttccctttataccctcaatttggctcacaacaa |
37639652 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37428753 - 37428578
Alignment:
| Q |
169 |
ttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaa-ttcccaaatggtttcataagaaactcttaaactcgtggaagaacattcaacaaattgacctcagt |
267 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | ||||||||||| || || || ||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||| | ||| || |||| |||||| |
|
|
| T |
37428753 |
ttagatctctccaaaaacaacattcatgggaaaaatttccatatggtttcataaaatgctcttaaactcatggaagtatatttggcacgttgatctcagt |
37428654 |
T |
|
| Q |
268 |
ttcaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaactatttactctcaaacaacaacttca |
343 |
Q |
| |
|
|||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
37428653 |
ttcaacaagttgcaaggagatcttccaattccaccttatggcattgaatactttttactctctaacaacaacttca |
37428578 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 48 - 301
Target Start/End: Original strand, 37413268 - 37413527
Alignment:
| Q |
48 |
ttttctttctatcaacattgatagcagtgctgacaccatcttacccaaccttgtttacttagatttatcttattctaatattaatagttttcctaaattc |
147 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
37413268 |
ttttctttctgtcaacattggtagcagtgttgactccatctcacccaaccttgaatcattatatttatcttctagtaatattaatagttttcctaatttc |
37413367 |
T |
|
| Q |
148 |
------caagcacgaaatctggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaatggtttcataagaaactcttaaactcgtgga |
241 |
Q |
| |
|
||| | ||||||| || |||||||| || |||| || ||||| | | | |||| |||||||||||| |||| |||||| || | |||| |
|
|
| T |
37413368 |
ttcgcacaacttcaaaatctgcaagagttagatctatctaataacataattcaaggaaaagttcctaaatggtttcatgagaagctcttacacacatgga |
37413467 |
T |
|
| Q |
242 |
agaacattcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattccac |
301 |
Q |
| |
|
| | |||| ||| || || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37413468 |
gggaaattcgacatatcgatctcagtttcaacaagttgcaaggagatcttccaattccac |
37413527 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 684 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 37428548 - 37428425
Alignment:
| Q |
684 |
tttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagt |
783 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||| || | ||||||| |
|
|
| T |
37428548 |
tttaagatcaaataaactgcatggtacaatcacttgttctatgaccaaacatccatt-cccaagttgagaattttcgacatctataataaaatttttagt |
37428450 |
T |
|
| Q |
784 |
gggcccttgccagcatcatgcatca |
808 |
Q |
| |
|
|| |||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
37428449 |
ggtcccttgccgacaacatgcatca |
37428425 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 727 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 26437777 - 26437719
Alignment:
| Q |
727 |
accaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgg |
785 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26437777 |
accaaccaaacatttcctaagttgagggtttttgatgtctccaacaataattttagtgg |
26437719 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 727 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 26451146 - 26451088
Alignment:
| Q |
727 |
accaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgg |
785 |
Q |
| |
|
||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
26451146 |
accaaccaaacatttcctaagttgagggtttttgatgtctccaacaataattttagtgg |
26451088 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 270 - 815
Target Start/End: Original strand, 16843245 - 16843790
Alignment:
| Q |
270 |
caacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaactatttactctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgc |
369 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16843245 |
caacaattttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattgtatacttttcactctcaaataacaacttcacaggagatatttcttcaacattctgc |
16843344 |
T |
|
| Q |
370 |
aatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctaggaacatttcctaatctctatattttggata |
469 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| || | ||||||| |
|
|
| T |
16843345 |
aatgcaagtacccttaatttgcttaatttggctcacaacaatttgacaggtatgattccacaatgcctaggaacattaacttctcttaatgtattggata |
16843444 |
T |
|
| Q |
470 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttttccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccatt |
569 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16843445 |
tgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctaaaaccttttccaaaggaaatgcatttcagactataaagttgaatggaaaccaattggaaggaccatt |
16843544 |
T |
|
| Q |
570 |
accacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagag |
669 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
16843545 |
accacagtctttgtctcactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacatagaggatacatttcccagttggcttgaaactctacaagag |
16843644 |
T |
|
| Q |
670 |
ttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctcta |
769 |
Q |
| |
|
|||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16843645 |
ttacaggtactcgttttacgatctaataatcttcatggagtaatcacttgttctagcaccaagcatccatttcctaagttgagaatttttgatgtctcta |
16843744 |
T |
|
| Q |
770 |
acaacaattttagtgggcccttgccagcatcatgcatcaagaactt |
815 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
16843745 |
acaacaattttagtggcaccttgccaacatcatgcatccagaactt |
16843790 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 201 - 812
Target Start/End: Original strand, 16845840 - 16846454
Alignment:
| Q |
201 |
aattcccaaatggtttcataagaaactcttaaactcgtggaagaacattcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattcca |
300 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
16845840 |
aattccaaaatggtttcataagaagctcttaaactcgtggaaggacattcgacacattgacctcagtttcaacaaattgcaaggagacattccaattcca |
16845939 |
T |
|
| Q |
301 |
cctgatggcattaaaaactatttactctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttgg |
400 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||| | | ||| |||||| |
|
|
| T |
16845940 |
tattatggcattaaatactttttgctctcaaacaacaacttcacagaagatatgtcttccacattctgcagtgcaagtttcctgattgttctcaatttgg |
16846039 |
T |
|
| Q |
401 |
ctcacaacaatttgaaaggtatgat----tccacaatgcctaggaacatttcctaatctctatattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagca |
496 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| | |||||||| || ||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16846040 |
ctcacaacaatttaatatgtatgatatattccacaatgcttgggaacattaacttctcttaatgtattggatatgcaaatgaacaacctctttggaagca |
16846139 |
T |
|
| Q |
497 |
ttcctagaaccttttccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccacaatctttggctaactgttcata |
596 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
16846140 |
ttcctagaaccttttccaaaggaaatgtgtttgtcactataaagttgaatggcaaccaattggaaggaccattaccacggtctttagctaactgttcata |
16846239 |
T |
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| Q |
597 |
tcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaat |
696 |
Q |
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| T |
16846240 |
tcttgaagttttggaccttggtgacaacaacatagaggatacatttcccagttggcttgaaactctacaagagttacatgtactcagtttaaggtcaaat |
16846339 |
T |
|
| Q |
697 |
aatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatgtctctaacaacaattttagtgggcccttgccag |
796 |
Q |
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| T |
16846340 |
aaactttatggttcaatcacatgttctagcaccaagcatccattt-ccaaattgagaattttggacatcttcgataacaaattcagtggaccgttgccaa |
16846438 |
T |
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| Q |
797 |
catcatgcatcaagaa |
812 |
Q |
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| T |
16846439 |
catcatgtatcaagaa |
16846454 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 53 - 768
Target Start/End: Original strand, 24217757 - 24218478
Alignment:
| Q |
53 |
tttctatcaacattgatagcagtgctgacaccatcttacccaaccttgtttacttagatttatcttattctaatattaatagttttcctaaattccaagc |
152 |
Q |
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| T |
24217757 |
tttctattaacgttggtagcggcgctgactacatcttacccaaccttgatgatttatctttatcttcttgtaatgttaatggttttcctaaattcttagc |
24217856 |
T |
|
| Q |
153 |
acg------aaatctggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaatggtttcataagaaactcttaaactcgtggaagaac |
246 |
Q |
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| T |
24217857 |
aagtcttgaaaatctgcaaggattagatctctctaataacaaaattcaaggaaaagttcctaaatggtttcatgagaagctcttacacacatggaaggaa |
24217956 |
T |
|
| Q |
247 |
attcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaactatttactctcaaacaacaacttcacag |
346 |
Q |
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| T |
24217957 |
attcgaattattaatctcagtttcaacaagttgcaaggagaccttccgattccaccctatggaattcaatacttttcactctcaaacaacaacttcacag |
24218056 |
T |
|
| Q |
347 |
gatatatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctaggaacatt |
446 |
Q |
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| T |
24218057 |
gagacattgctttgtcactgtgcaatgcaagttccctgaatttgctcaatttggctaacaacaatttaacaggaacgattccacaatgcctgggaacatt |
24218156 |
T |
|
| Q |
447 |
tcctaatctctatattttggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttttccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaat |
546 |
Q |
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| T |
24218157 |
tccttatctttctgtattggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcatgcctaaaacattttcggaaggaaatgcattcgagactataaagttgaat |
24218256 |
T |
|
| Q |
547 |
ggcaaccaattggaaggaccattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctg |
646 |
Q |
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| T |
24218257 |
ggcaaccaattggagggaccattaccacagtctttggctcactgcacacaacttgaagttttggaccttggagacaacatcataaacgatacatttccca |
24218356 |
T |
|
| Q |
647 |
attggctagaaactctaccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaa |
746 |
Q |
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| T |
24218357 |
attggttagaagttctgcaagagttacaggtactcagtttacgatcaaatcatcttcatggtggaatcacttgttctagcaccaaacaatcatttccgaa |
24218456 |
T |
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| Q |
747 |
gttgagaatttttgatgtctct |
768 |
Q |
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| T |
24218457 |
gatgagaatttacgatgtctct |
24218478 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 18 - 413
Target Start/End: Original strand, 16842858 - 16843253
Alignment:
| Q |
18 |
actatggtatctcgttctttcacacaatacttttctttctatcaacattgatagcagtgctgacaccatcttacccaaccttgtttacttagatttatct |
117 |
Q |
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| T |
16842858 |
actagggtatctcgatctttcacacaatacttttctttctatcaacactgatagcattgctgactccatcttacccaaccttttttcattagatttatct |
16842957 |
T |
|
| Q |
118 |
tattctaatattaatagttttcctaaattccaagcacgaaatctggaaagcttagatctctccaatagcaacattcatgcgagaattcccaaatggtttc |
217 |
Q |
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| T |
16842958 |
tatgctaatattaatagttttcctaaattccaaacacgaaatcttcaaagattagatctctccaataacaacattcatggtaaaattcccaaatggtttc |
16843057 |
T |
|
| Q |
218 |
ataagaaactcttaaactcgtggaagaacattcaacaaattgacctcagtttcaacaactttcaaggagatcttccaattccacctgatggcattaaaaa |
317 |
Q |
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| T |
16843058 |
ataagaagctcttaaacacatggaatgacatttggtacattgatcttagtttcaacaaattgcaaggagacattccaattccatcttatggccttcaata |
16843157 |
T |
|
| Q |
318 |
ctatttactctcaaacaacaacttcacaggatatatttcttcaacattctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaattt |
413 |
Q |
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| T |
16843158 |
cttttcgctctcaaacaacaacttcacaggagacatttcttcaacattctgcaatgcaagtttcttgaatgttctcaatttggctcacaacaattt |
16843253 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 308; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 364 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 14553189 - 14552738
Alignment:
| Q |
364 |
ttctgcaatgccagttccctttatatgctcgatttggctcacaacaatttgaaaggtatgattccacaatgcctaggaacatttcctaatctctatattt |
463 |
Q |
| |
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| T |
14553189 |
ttctgcaatgcaagttccctttatatgctcaatttggctcacaacaatttgacaggtatgattccacaatgcctggggacatttcctcttctctctattt |
14553090 |
T |
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| Q |
464 |
tggatatgcaaatgaacaacctctatggaagcattcctagaaccttttccaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggcaaccaattggaagg |
563 |
Q |
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| T |
14553089 |
tggatatgcaaatgaacaacctctatggaatcattcctagaaccttttcaaaaggaaatgcatttgagactataaagttgaatggaaaccaattgaaagg |
14552990 |
T |
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| Q |
564 |
accattaccacaatctttggctaactgttcatatcttgaagttttggaccttggtgacaacaacgttgaggatacatttcctgattggctagaaactcta |
663 |
Q |
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| T |
14552989 |
accactaccacagtcattggctcactgttcaaatcttgaagtattagaccttggtgacaacagcatagaggatacatttcccaattggctagaaactcta |
14552890 |
T |
|
| Q |
664 |
ccagagttacaggtgataagtttacgatcaaataatcttcatggtgcaatcacctgttctagcaccaagcatacatttcccaagttgagaatttttgatg |
763 |
Q |
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| T |
14552889 |
caagagttacaagtgctaagtttacgatcaaatcatcttcacggagcaatcacctgttctagcatcaagcattcatttcctaagttgagaatttttgatg |
14552790 |
T |
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| Q |
764 |
tctctaacaacaattttagtgggcccttgccagcatcatgcatcaagaactt |
815 |
Q |
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| T |
14552789 |
tctctaacaacaattttagtggcaccttgccaacatcatgcatcaagaactt |
14552738 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 14553278 - 14553188
Alignment:
| Q |
28 |
ctcgttctttcacacaatacttttctttctatcaacattgatagcagtgctgacaccatcttacccaaccttgtttacttagatttatctt |
118 |
Q |
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| T |
14553278 |
ctcgatctttcacacaatagttttatttctatcaacattgatagcagtgctaactccatcttacccaaccttgttaacttagatttatctt |
14553188 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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