View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5311_low_17 (Length: 432)

Name: NF5311_low_17
Description: NF5311
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5311_low_17
NF5311_low_17
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (12-415)||(30019788-30020199)
chr4 (46-407)||(32429268-32429625)
chr4 (12-407)||(35095891-35096292)
chr4 (12-407)||(35090778-35091179)
chr4 (37-392)||(34279479-34279816)
chr4 (32-416)||(18670695-18671073)
chr4 (162-407)||(18716349-18716597)
chr4 (162-407)||(18737022-18737270)
chr4 (65-407)||(3424704-3425041)
chr4 (32-384)||(54859138-54859474)
chr4 (162-372)||(34128333-34128542)
chr4 (164-385)||(47071294-47071514)
chr4 (247-407)||(3415333-3415493)
chr4 (32-284)||(14643706-14643948)
chr4 (32-133)||(34128221-34128322)
chr4 (281-397)||(14646483-14646598)
chr4 (12-118)||(3409548-3409655)
chr4 (32-133)||(22118847-22118950)
chr4 (32-94)||(34601999-34602061)
chr4 (32-131)||(25618268-25618360)
chr4 (32-130)||(47071530-47071634)
chr4 (196-242)||(34602075-34602121)
chr4 (323-391)||(23920290-23920357)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (32-411)||(2022822-2023196)
chr5 (12-407)||(9877479-9877880)
chr5 (12-407)||(39908821-39909222)
chr5 (12-407)||(9872364-9872765)
chr5 (46-407)||(39903708-39904074)
chr5 (12-392)||(13556244-13556630)
chr5 (32-372)||(35368862-35369196)
chr5 (176-397)||(25183972-25184186)
chr5 (155-397)||(4555526-4555768)
chr5 (218-386)||(43378322-43378489)
chr5 (23-235)||(43540733-43540928)
chr5 (32-116)||(43402094-43402178)
chr5 (35-109)||(43379554-43379623)
chr5 (65-118)||(4555777-4555830)
chr5 (360-397)||(35369195-35369232)
[»] chr2 (10 HSPs)
chr2 (32-415)||(42780038-42780416)
chr2 (18-392)||(30283396-30283766)
chr2 (12-405)||(17720466-17720865)
chr2 (12-407)||(45120249-45120651)
chr2 (12-407)||(14917322-14917723)
chr2 (162-397)||(16284310-16284546)
chr2 (12-299)||(716238-716518)
chr2 (315-407)||(39196121-39196213)
chr2 (21-131)||(20892299-20892409)
chr2 (32-93)||(16286003-16286064)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (12-407)||(14318555-14318956)
chr8 (12-407)||(14314851-14315252)
chr8 (12-407)||(26981815-26982217)
chr8 (12-407)||(43956790-43957190)
chr8 (12-407)||(26986929-26987330)
chr8 (12-407)||(34108092-34108495)
chr8 (12-411)||(10340907-10341301)
chr8 (32-392)||(25953136-25953484)
chr8 (12-407)||(18608590-18608969)
chr8 (12-285)||(18494117-18494395)
chr8 (198-397)||(18884938-18885136)
chr8 (32-118)||(1781975-1782061)
chr8 (170-240)||(1781869-1781939)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (12-407)||(28574160-28574561)
chr1 (12-407)||(28598172-28598573)
chr1 (12-397)||(43358625-43359007)
chr1 (146-407)||(3465336-3465596)
chr1 (32-407)||(44523992-44524359)
chr1 (32-407)||(10186542-10186917)
chr1 (146-407)||(13654198-13654461)
chr1 (12-407)||(19310688-19311077)
chr1 (12-327)||(3468010-3468332)
chr1 (162-407)||(1187691-1187935)
chr1 (32-407)||(16051069-16051428)
chr1 (228-411)||(48366213-48366397)
chr1 (228-385)||(29681475-29681632)
chr1 (12-259)||(21431621-21431865)
chr1 (162-302)||(35626140-35626280)
chr1 (163-272)||(17414633-17414742)
chr1 (310-410)||(35624877-35624977)
chr1 (32-116)||(13654468-13654552)
chr1 (32-93)||(35653214-35653275)
chr1 (163-410)||(3696403-3696647)
chr1 (267-397)||(17415386-17415515)
chr1 (319-392)||(21431918-21431991)
chr1 (58-118)||(17414555-17414615)
chr1 (32-133)||(1187953-1188054)
chr1 (65-106)||(3701492-3701533)
chr1 (18-57)||(43359020-43359059)
chr1 (69-107)||(10185836-10185874)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (12-407)||(4049670-4050072)
chr3 (12-407)||(5481428-5481829)
chr3 (12-407)||(10672878-10673279)
chr3 (18-407)||(5457957-5458353)
chr3 (12-407)||(8464613-8465014)
chr3 (46-407)||(6852927-6853293)
chr3 (12-407)||(31076342-31076743)
chr3 (12-407)||(31081447-31081848)
chr3 (12-407)||(1302184-1302586)
chr3 (12-407)||(4054804-4055206)
chr3 (46-407)||(8458174-8458541)
chr3 (12-407)||(33702539-33702941)
chr3 (46-407)||(6858030-6858396)
chr3 (12-407)||(10677991-10678394)
chr3 (46-407)||(10591270-10591636)
chr3 (32-386)||(49784378-49784729)
chr3 (69-407)||(33703163-33703506)
chr3 (18-397)||(29827303-29827661)
chr3 (167-396)||(20890936-20891162)
chr3 (164-370)||(18024246-18024450)
chr3 (163-380)||(3187551-3187766)
chr3 (12-274)||(10584798-10585066)
chr3 (268-407)||(10586384-10586523)
chr3 (65-118)||(20891184-20891237)
chr3 (65-118)||(18024174-18024227)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (12-407)||(12856652-12857053)
chr7 (12-407)||(26050884-26051285)
chr7 (12-407)||(26055997-26056398)
chr7 (12-407)||(26060243-26060644)
chr7 (12-407)||(26065356-26065757)
chr7 (12-407)||(12851537-12851940)
chr7 (146-407)||(14610227-14610487)
chr7 (175-393)||(11056503-11056720)
chr7 (32-407)||(4181364-4181722)
chr7 (228-411)||(5436692-5436876)
chr7 (197-415)||(35352422-35352640)
chr7 (163-391)||(37459938-37460165)
chr7 (32-272)||(5440261-5440494)
chr7 (32-272)||(5449271-5449504)
chr7 (330-407)||(14615293-14615370)
chr7 (32-106)||(37459824-37459898)
chr7 (280-345)||(12239601-12239666)
chr7 (12-92)||(14610512-14610593)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (12-407)||(21275636-21276037)
chr6 (12-411)||(20752078-20752463)
chr6 (32-411)||(24509562-24509943)
chr6 (12-411)||(21936626-21937025)
chr6 (12-411)||(21937429-21937830)
chr6 (164-411)||(24508926-24509173)
chr6 (164-397)||(2889090-2889318)
chr6 (164-397)||(2887368-2887596)
chr6 (163-385)||(11183263-11183484)
chr6 (12-118)||(24508800-24508907)
chr6 (32-96)||(11183148-11183212)
[»] scaffold0223 (2 HSPs)
scaffold0223 (12-383)||(1959-2335)
scaffold0223 (337-407)||(7248-7318)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (146-407)||(143959-144222)
scaffold0006 (32-116)||(144229-144313)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (32-284)||(173344-173586)
scaffold0005 (281-397)||(170692-170807)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (307-407)||(16470-16570)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 12 - 415
Target Start/End: Original strand, 30019788 - 30020199
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30019788 aacctttggcaaaaaggtgcttaatgaaccataacat-gattcaagtcaaatgggtgctttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 30019886  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaacagaaca--------acacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctt 202  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30019887 ggcatttgggcattagtttgacagagaacagaacaacacaacaacacacaattttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctc 30019986  T
Q  203 ttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgca 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  30019987 ttactctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgttggaaccataaatatgtgaaatactgttaggagatacgtttggtgtggttatgca 30020086  T
Q  303 gtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaaccaaagg 402  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30020087 atacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcgaaccaaagg 30020186  T
Q  403 ttagtatggtaac 415  Q
    ||| |||||||||    
T  30020187 ttaatatggtaac 30020199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 46 - 407
Target Start/End: Original strand, 32429268 - 32429625
Alignment:
Q  46 attgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttgacagagaacagaaca 145  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||     || ||||    
T  32429268 attgattcaagtcaaaggggtgttttctctcatttgaagagtcatataatgcactataaatgcttggcatttgtgcattagttggaca-----cacaaca 32429362  T
Q  146 acacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaatt 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32429363 acacacaattttggacagaattttgttggattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcatccatcaattctttaatgcatgagtgaatt 32429462  T
Q  246 gctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccg 345  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32429463 gttggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgctttgtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccg 32429562  T
Q  346 gtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32429563 gtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 32429625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 35096292 - 35095891
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  35096292 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 35096193  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35096192 gacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 35096094  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35096093 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 35095994  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35095993 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 35095895  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  35095894 tagt 35095891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 35091179 - 35090778
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  35091179 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 35091080  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaacag------aacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | ||| || |       ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||    
T  35091079 gacatttgggcattagttgaagagacaaaaaccatacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcatcaaaattctatt 35090981  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35090980 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 35090881  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  35090880 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 35090782  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  35090781 tagt 35090778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 37 - 392
Target Start/End: Original strand, 34279479 - 34279816
Alignment:
Q  37 aaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttgacagag 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||| ||||||| |     
T  34279479 aaccataacattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgctcgacatttgagcattaatttgacacac 34279578  T
Q  137 aacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcat 236  Q
    | |||||||                 |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34279579 a-cagaacat----------------gaattttgttacattaacaacataattcttcctcgttctcttactctaaatcaaccatcaattctctaatgcat 34279661  T
Q  237 gagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaagga 336  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||     
T  34279662 gagtgaattcctgaaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaagaaactcatagtattttgaaggg 34279761  T
Q  337 gattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatc 392  Q
    || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34279762 gaatcgtcggtcattcc-tattgcattcaatatacagttattggtgggggcgaatc 34279816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 18671073 - 18670695
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||   |||| ||||     
T  18671073 taatgaaccatagcattgattcaagtcaaatgggtgctttctctcatgtgaagggtcatataatggactataaatgcttggcatttgggaattaatttg- 18670975  T
Q  132 cagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaa 231  Q
      || | || ||||| | |||||       |||||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18670974 --gaca-cacaacaa-agacaatagaaaccagaattatgttgcattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcatccatcaattctctaa 18670879  T
Q  232 tgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctg 331  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  18670878 tgcatgagtgacttgttggaaccataaatctgtaaaatattgttaggagatacacttggtgtggttgtgcaataca--tgaaggaactcatagtatcctg 18670781  T
Q  332 aaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggg-gcgaatcaaacc-aaaggttagtatggtaact 416  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  18670780 aagg-gattcgccggtcattccttattgcattcaatatatagttattggtggggtgtgaatcgaacctaaaggttagtgtggcaact 18670695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 162 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18716597 - 18716349
Alignment:
Q  162 agaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18716597 agaattttgttgcattaacaacataattctcccccattctcttactctaaatcatccatcaattctctaatacaagagtgaattgctggaaccataaatc 18716498  T
Q  262 tgtgaaatactgttaggagatacgcttgg--tgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattg 359  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18716497 tgtaaaatactattagaagatacgcttggtgtgtggttgtgcaatacacgtcaaagaactcttagtatcctgaaggggattcgccggtcattctttattg 18716398  T
Q  360 catccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18716397 catccaatatatagttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 18716349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 162 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18737270 - 18737022
Alignment:
Q  162 agaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 261  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18737270 agaattttgttgcattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcatccatcaattctctaattcatgagtgaattgctggaaccataaatc 18737171  T
Q  262 tgtgaaatactgttaggagatacgcttgg--tgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattg 359  Q
    ||| ||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18737170 tgtaaaatacttttagaagattcgcttggtgtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattctttattg 18737071  T
Q  360 catccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  18737070 catctaatatatagttattggtgggggcgaattgaacctaaaggttagt 18737022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 65 - 407
Target Start/End: Original strand, 3424704 - 3425041
Alignment:
Q  65 gtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagttt-gacagagaacagaacaacacacaattttggatag 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||| ||| ||||   |||||||||||| |||    || | |     
T  3424704 gtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatatttgatatttgggcattaatttagaca---aacagaacaaca-aca----tgaacaa 3424795  T
Q  164 aatttt-gttacattaacaacataat-tcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 261  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  ||| |  |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  3424796 aatttttgttactttaacaacataagatctccctcattctcttactctaaatcatccattaattctctaatgcatgagtgagttactggaaacataaatc 3424895  T
Q  262 tgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgca 361  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  3424896 tgtaaaatactgttaggagatacggttggtgtggttgtgcaatacacatcaatgaactcatagtatcctaaaggagattcgctgttcattcc-tattgca 3424994  T
Q  362 tccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  3424995 tccaatattcagttattggtgggggagaatcgaacctaaaggttagt 3425041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 384
Target Start/End: Original strand, 54859138 - 54859474
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgag-tgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttg 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  ||||| ||||    
T  54859138 taatgaaccataacattgattcaagtcaaagggggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttgatatttgggcattaatttg 54859237  T
Q  131 acagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctcta 230  Q
           ||| |||    || ||      || ||||||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  54859238 g------acacaac----caaaa------atggaattttgtcacattaacaacatgattctccctcattctcttgctctaaatcatccatcaattctcta 54859321  T
Q  231 atgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcct 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||| |    
T  54859322 atgcacgagtgaattgctggaaccataaatccgtaaaatactgttaggagatacgtttggtgtagttgtgtaatacacatcaaggaactcatattatcat 54859421  T
Q  331 gaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtggg 384  Q
    ||||| | ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54859422 gaaggggtttcgctggtaattcc-tattgcatccaatatacaattattggtggg 54859474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 162 - 372
Target Start/End: Original strand, 34128333 - 34128542
Alignment:
Q  162 agaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 261  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  34128333 agaattttgttgcattaacatcataattctccctcattctcttactctaaatcatccatcaattttctaatgcatgagtgaattgttgaaaccataaatc 34128432  T
Q  262 tgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgca 361  Q
    ||| |||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  34128433 tgtaaaatatggttaggagatatgtttggtgtggttgtgcaatacacctcatgaaactcatagtatcctgaaggagatttgctggtcattcctt-ttgca 34128531  T
Q  362 tccaatataca 372  Q
    |||||||||||    
T  34128532 tccaatataca 34128542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 164 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 47071514 - 47071294
Alignment:
Q  164 aattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  47071514 aattttgttacattaacaacataattctccctcattctcttactctaaattatctatcaattctctaatgaatgagtgaattgtttgaaccataaatttg 47071415  T
Q  264 tgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatc 363  Q
    | |||||||| || |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| | |||||||||    
T  47071414 taaaatactgatatgagatatgattggtgtggttgtgcaatacacatcaaggaactcatagtatcatgaaggggattcgctggtcatt-catattgcatc 47071316  T
Q  364 caatatacagttattggtgggg 385  Q
     |||||||| |||||| |||||    
T  47071315 aaatatacaattattgatgggg 47071294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 247 - 407
Target Start/End: Original strand, 3415333 - 3415493
Alignment:
Q  247 ctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccgg 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3415333 ctggaaccataaatctgtaaaatactattaggagatacggttggtgtggttgtgcaatacacatcaatgaactcatagtatcctgaaggagattcgttgg 3415432  T
Q  347 tcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  3415433 tcattcc-tattacatccaatatacagttattggtgggggcgaattgaacctaaaggttagt 3415493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 284
Target Start/End: Original strand, 14643706 - 14643948
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  ||||| |||      
T  14643706 taatgaaccttagcattgattcaagtcaaatgggtgttttctatcatgtgaagggtcatataatgcgctataaatgtttgatatttgtgcattaattt-- 14643803  T
Q  132 cagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaa 231  Q
         |||| ||||| | |||       | ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14643804 -----aacataacaaaatacagaaa---aaagaattttgttacatcaacaacataattcttcctaattctcttactctaaatcatccatcaattctctaa 14643895  T
Q  232 tgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatac 284  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  14643896 tgtataggtgaattgctggaaccataaatctctaaaatactgttaggggatac 14643948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 133
Target Start/End: Original strand, 34128221 - 34128322
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||    
T  34128221 taatgaactataacattgattcaagtcaaatgagtgttttctctaatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttgacatttggccattaatttga 34128320  T
Q  132 ca 133  Q
    ||    
T  34128321 ca 34128322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 397
Target Start/End: Original strand, 14646483 - 14646598
Alignment:
Q  281 atacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattgg 380  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14646483 atacgcttggtgtggttctgcaatacacattaaggaactcatagtatcctaaaggggattcgcgggtcattcc-tattgcatccaatatacagttattag 14646581  T
Q  381 tgggggcgaatcaaacc 397  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  14646582 tgggggcaaatcgaacc 14646598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Original strand, 3409548 - 3409655
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3409548 aacctttggcaaaggggtgcttaatgaatcatagcattgattcaagtcaaaggagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatattt 3409647  T
Q  111 ggcatttg 118  Q
    | ||||||    
T  3409648 gacatttg 3409655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22118950 - 22118847
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgt--tttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagttt 129  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| |||    
T  22118950 taatgaaccatattattcattcaagtcaaaggggtgtattttctctcatgtgaagggtcatataatatactataaatgcttgacatttgggcattaattt 22118851  T
Q  130 gaca 133  Q
    ||||    
T  22118850 gaca 22118847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Original strand, 34601999 - 34602061
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataa 94  Q
    |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  34601999 taatgaactatagcattgattcaagtcaaatgagtgttttttctcatgtgaatggtcatataa 34602061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 131
Target Start/End: Original strand, 25618268 - 25618360
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |   ||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  25618268 taatgaatcataacattgattcaagtcacagaggtgttttctctcatgt-------catataatgcactataaatgcttggcatttgggcattagtttga 25618360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 47071634 - 47071530
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctc------atgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccatta 125  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||    
T  47071634 taatgaaccattgcattgattcaagtcaaaaaagtgttttctctcatgttcatgtgaagggtcatataatgtactataaatgtttaacatttgggcatta 47071535  T
Q  126 gtttg 130  Q
     ||||    
T  47071534 atttg 47071530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 242
Target Start/End: Original strand, 34602075 - 34602121
Alignment:
Q  196 cattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtga 242  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  34602075 cattcttttactctaaatcatccatcaattttcttatgcatgagtga 34602121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 323 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23920357 - 23920290
Alignment:
Q  323 agtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaat 391  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23920357 agtattctgaaggagattcagtggtcattctgt-ttgcatccaatatacaaatattggtgggggcgaat 23920290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 32 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2023196 - 2022822
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||| ||    
T  2023196 taatgaatcataacattgattcaagtcaaagg-gtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatatgggcattagttgga 2023098  T
Q  132 cagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaa 231  Q
    ||     || ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  2023097 ca-----cacaacaacacataattttggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctcttattctaaatcatccatcaattctctaa 2023003  T
Q  232 tgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctg 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2023002 tgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtttggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtatcctg 2022903  T
Q  332 aaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagtatgg 411  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  2022902 aaggggattcgccggtcattccttattgcatcaaatatacagttattggtgggggcgaatggaacctaaaggttagtatgg 2022822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 9877479 - 9877880
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  9877479 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 9877578  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9877579 gacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 9877677  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9877678 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 9877777  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9877778 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 9877876  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  9877877 tagt 9877880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 39909222 - 39908821
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  39909222 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 39909123  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39909122 gacatttgggcattagttgaaaaaacaaaaatcacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 39909024  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39909023 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 39908924  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  39908923 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 39908825  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  39908824 tagt 39908821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 9872364 - 9872765
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  9872364 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 9872463  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9872464 gacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcacaattctatt 9872562  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9872563 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 9872662  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  9872663 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 9872761  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  9872762 tagt 9872765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 46 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 39904074 - 39903708
Alignment:
Q  46 attgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttgacagagaa------c 139  Q
    |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||   ||||||||  | | | ||      |    
T  39904074 attgattcaagttaaataggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacattttggcattagttgaaaaaacaaaaaccac 39903975  T
Q  140 agaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgag 239  Q
    | ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39903974 acaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgag 39903876  T
Q  240 tgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagat 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39903875 tgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggat 39903776  T
Q  340 tcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39903775 tcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 39903708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 392
Target Start/End: Original strand, 13556244 - 13556630
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  13556244 aacctttggcaaaaaggtgcttaatgaatcatagcattgattcaagtcaaatgggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 13556343  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagaga-------acagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttt 203  Q
    | ||||||  |||||||| |||| | |       ||| ||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13556344 gacatttgggcattagttggacatacagaaaaggacacaactacacacaattt-ggacagaagtttgttacattaacaacataattcttcatcattctct 13556442  T
Q  204 tactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcag 303  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13556443 tattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatatgtaaaatacggttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaa 13556542  T
Q  304 tacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatc 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13556543 tacacgtcaaggaactcatagtatcctaaaggggattcgtcgatcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatc 13556630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 32 - 372
Target Start/End: Original strand, 35368862 - 35369196
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| |||||    
T  35368862 taatgaatcataacattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaaaagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattaatttga 35368961  T
Q  132 cagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaa 231  Q
    ||     || ||||||||||||        ||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35368962 ca-----cacaacaacacacaacaaaaacaagaattttgttgcatcaaaaacataattcttcctcattctcttactctaaatcatccatcaattctctaa 35369056  T
Q  232 tgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctg 331  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35369057 tgcatgagtgaattgttgtaaccataaatctgtaaaatactattaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacatcaaggaactcatagtatcctg 35369156  T
Q  332 aaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatataca 372  Q
    | || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35369157 agggggattcgctggtcattcc-tattgcatccaatataca 35369196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 176 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 25184186 - 25183972
Alignment:
Q  176 ttaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgtt 275  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||      |||||| ||||| ||||    
T  25184186 ttaacaacatatttcttcaccattctcttactctaaatcatccatcaattctctaatgtattagtgaattgctagaa------atctgtaaaatattgtt 25184093  T
Q  276 aggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagtt 375  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  25184092 tggagatacgcttggtatggttgtgcaataaacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtaactcc-tattgcatccaatatacagtt 25183994  T
Q  376 attggtgggggcgaatcaaacc 397  Q
    ||||||||||| ||||| ||||    
T  25183993 attggtgggggagaatcgaacc 25183972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 155 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 4555768 - 4555526
Alignment:
Q  155 tttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaacc 254  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  4555768 tttggacacaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctattactctaaatcatccattaattctctaatgcatgagtgaattattggtacc 4555669  T
Q  255 ataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattcct 354  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||| || |||| ||||| |||| |||||| || |||| |||| |  ||| |  |||||||||     
T  4555668 ataaatctgtaaaataatgttaagaaatatgtttggtgtgattttgcaatacacatcaatgaactcgtaatatcttgaaaggaatttgttggtcattcc- 4555570  T
Q  355 tattgcatccaatatacagttattggt-gggggcgaatcaaacc 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  4555569 tattgcatccaatatacagttattggtaagggacgaatcaaacc 4555526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 43378489 - 43378322
Alignment:
Q  218 catcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaa 317  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  43378489 catcaattctttaatgcattagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttaatgtgattgtgcaatacacgtcaaggaa 43378390  T
Q  318 ctcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtggggg 386  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  43378389 ctaataatatcctgaaggggattcacttgtcattcc-aattgcatcaaatatacaattattggtggggg 43378322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Original strand, 43540733 - 43540928
Alignment:
Q  23 aaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgacc 121  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  |    
T  43540733 aaaaggtgcttaatgaaccataacattgactcaagtcaaatgagtgtt--ctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatacttggcatctgggc 43540830  T
Q  122 attagtttgacagagaacagaacaacacacaattttggatagaa-ttttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcat 220  Q
    |||| ||||       ||| ||||           || |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||  ||    
T  43540831 attaatttgg------acataaca-----------tgaatagaaattttgttacattaacaacatagttctccatcattctcttactctaaatcatctat 43540913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Original strand, 43402094 - 43402178
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatt 116  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||   |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43402094 taatgaaccataacattgattcgaatcaaattgatgttttctttcatatgaaggatcatataatgcactataaatgtttgtcatt 43402178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 43379623 - 43379554
Alignment:
Q  35 tgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtt 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43379623 tgaatcataacattgattcaagtaaaatgagtgtttt-----atgtgaagggtcatataatgcactataaatgtt 43379554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4555830 - 4555777
Alignment:
Q  65 gtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttg 118  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  4555830 gtgttttctctcatgttaatagtcatataatgcactataaatgcttgacatttg 4555777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 397
Target Start/End: Original strand, 35369195 - 35369232
Alignment:
Q  360 catccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  35369195 catccaatatacagttattggtgggtgcgaatcgaacc 35369232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 10)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 32 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 42780416 - 42780038
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||    
T  42780416 taatgaaccataacattgattcaagtcaaaggggtgttttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgattgacagttgggcattagttgga 42780317  T
Q  132 cagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaa 231  Q
    ||     || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42780316 ca-----cacaacaacacacaattttggacagaattttgttacatta-ctacataattcttcaccattctcttactctaaatcatccatcaattctctaa 42780223  T
Q  232 tgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctg 331  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42780222 tgcatgagtgaattgttggaaccataaatttgtaaaatactgttaggagatacatttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtatcctg 42780123  T
Q  332 aaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagtatggtaac 415  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  42780122 aaggggattcgccggtcattcgttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagtgtggtaac 42780038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 392
Target Start/End: Original strand, 30283396 - 30283766
Alignment:
Q  18 tggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatt 116  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30283396 tggcaaaagggtgcttaatgaaccataatattgattcaagttaaaggggtgttttctttcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgtttggcatt 30283495  T
Q  117 tgaccattagtttgacagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcat 216  Q
    ||  ||||||||  | | |   || ||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||    
T  30283496 tgggcattagttgaaaaca---cacaactaaacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattctccatccttctcttactctaaatcat 30283591  T
Q  217 tcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaagga 316  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30283592 caatcaattctctaatgcatgagtgaattgctagaaccataaatctgtaaaatactattaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaagga 30283691  T
Q  317 actcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatc 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30283692 actcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatc 30283766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 405
Target Start/End: Original strand, 17720466 - 17720865
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  17720466 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 17720565  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17720566 gacatttgggcattagttgaagatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 17720664  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17720665 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 17720764  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  17720765 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 17720863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 45120651 - 45120249
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  45120651 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 45120552  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa-------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttt 203  Q
    | ||||||  |||||||| || | | ||       || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  45120551 gacatttgggcattagttggatatacaaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctat 45120453  T
Q  204 tactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcag 303  Q
    || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45120452 tattctaaatcatccatcaattctccaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaa 45120353  T
Q  304 tacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaagg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||    
T  45120352 tacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgagtcgaacctaaagg 45120254  T
Q  403 ttagt 407  Q
    |||||    
T  45120253 ttagt 45120249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 14917322 - 14917723
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  14917322 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaatagctgttttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 14917421  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  14917422 gacatttgggcattagttgaagatacaaaaaccacacaactacacacaactt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctatt 14917520  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14917521 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 14917620  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14917621 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcatttc-tattgcatccaatatacatttattggtggaggcgaatcgaacctaaaggt 14917719  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  14917720 tagt 14917723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 162 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 16284546 - 16284310
Alignment:
Q  162 agaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaa-tcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaat 260  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |  |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16284546 agaattttgttgcattaacaatataattctccctcattctcttactctaaaatcattcatcaactctctaatgcatgagtgaattgctgaaaccataaat 16284447  T
Q  261 ctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctg-aaggagattcgccggtcattccttattg 359  Q
    | || ||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  16284446 cagtaaaataccattaggagatacgcttggtgtggttgtacaatacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaaggggattcgctggtcattcc-tattg 16284348  T
Q  360 catccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16284347 catccaatatacagttattggtgggggcgaatcgaacc 16284310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 716518 - 716238
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  716518 aacctttggcaaaaaggtgtttaatggaccgtaacattgattcaagtcaaagggatgttttctctcatatgaaaggtcatataatgcactataaatgttt 716419  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactcta 210  Q
    ||||||||  ||||||| |||| || ||||||| |||| | |         ||||||||| | | |||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  716418 ggcatttgggcattagtgtgactgacaacagaa-aacataaaca-------agaattttgcttctttaacaacataattctccttcattctcttactcta 716327  T
Q  211 aatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgt 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  716326 aatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccctaaatctgtaaaatacagttaggagatacgtttggtgtggttgt 716238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 315 - 407
Target Start/End: Original strand, 39196121 - 39196213
Alignment:
Q  315 gaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  39196121 gaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 39196213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 131
Target Start/End: Original strand, 20892299 - 20892409
Alignment:
Q  21 caaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttga 119  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||     
T  20892299 caaaaaggtgcttaatgaacca-aacattgattcaaatcaaatgagtgttttctctcgtgtgaagagtcatataatgcactataaatacttgacatttgg 20892397  T
Q  120 ccattagtttga 131  Q
     |||||||||||    
T  20892398 gcattagtttga 20892409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 16286064 - 16286003
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatata 93  Q
    |||||||| ||||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16286064 taatgaactataacgttgattgaagttaaatgggtgttttctctcatgtgaagggtcatata 16286003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 14318555 - 14318956
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  14318555 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgttttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 14318654  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | ||| ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14318655 gacatttgggcattagttgaagagacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 14318753  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14318754 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 14318853  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14318854 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 14318952  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  14318953 tagt 14318956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 14314851 - 14315252
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  14314851 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgttttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 14314950  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | ||| ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14314951 gacatttgggcattagttgaagagacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 14315049  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14315050 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 14315149  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  14315150 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcatttc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 14315248  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  14315249 tagt 14315252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 26981815 - 26982217
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26981815 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgttt 26981914  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa-------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttt 203  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||       || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26981915 gacatttgggcattagttgaatatacaaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctat 26982013  T
Q  204 tactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcag 303  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26982014 tattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaa 26982113  T
Q  304 tacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaagg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  26982114 tacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaagg 26982212  T
Q  403 ttagt 407  Q
    |||||    
T  26982213 ttagt 26982217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 43956790 - 43957190
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  43956790 aacctttggcaaaaaggtgcttaatgaatcatagcattgattcaagtcaaatgagtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 43956889  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa-----cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttta 205  Q
    | ||||||  |||||||| |||| | ||     || ||| ||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  43956890 gacatttgggcattagttggacatacaaaaacacacaactacacacaattt-ggacataattttgttgcattaacaacataattcttcatcattctctta 43956988  T
Q  206 ctctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagta 305  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43956989 ttctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctgaaaccataaatttgtaaaacactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaata 43957088  T
Q  306 cacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggtt 404  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43957089 cacgtcaaagaactcatagaatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggtt 43957187  T
Q  405 agt 407  Q
    |||    
T  43957188 agt 43957190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 26986929 - 26987330
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26986929 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 26987028  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26987029 gacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 26987127  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26987128 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 26987227  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26987228 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 26987326  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  26987327 tagt 26987330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 34108495 - 34108092
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  34108495 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 34108396  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagaga--------acagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctt 202  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | |        ||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  34108395 gacatttgggcattagttgaatatatacaaaaaccacacaactacacacaactt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattcta 34108297  T
Q  203 ttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgca 302  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34108296 ttattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgca 34108197  T
Q  303 gtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaag 401  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34108196 atacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaag 34108098  T
Q  402 gttagt 407  Q
    ||||||    
T  34108097 gttagt 34108092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 411
Target Start/End: Original strand, 10340907 - 10341301
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  10340907 aacctttgacaaaagggtgcttaatgaatcatagcattgattcaagtcaaagaggtgctttttctcatgtgaagagtcatataatgcaccataaatgctt 10341006  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactcta 210  Q
    ||||||||  |||||||| |||| | || |     ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  10341007 ggcatttgggcattagttggacatataaaa-----acatacaattttggacagaattttgttgcattaacaacataattctccctcattctcttactcta 10341101  T
Q  211 aatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgt 310  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  10341102 aatcatccataaattctctaatgcatgagtgaattgctggaatcataaatctgtaaaatattgttaggagatacgcttggtgtagttgtgcaatacacgt 10341201  T
Q  311 caaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaaccaaaggttagtatg 410  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10341202 caaggaactcatagtatcatgaaggggattcgccgatcactcc-tattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcgaacctaaggttagtatg 10341300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 32 - 392
Target Start/End: Original strand, 25953136 - 25953484
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        | || ||    
T  25953136 taatgaaccataaaattgatttaagtcaaatgggtgttttctctcatgtgaatggtcatataatgcactataaatgtttggcatta-------atttgga 25953228  T
Q  132 cagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaa 231  Q
    || | || |  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25953229 caaacaata--acaacac--aattttggacagaattttgttacattaacaacataattctccatcattctcatactctaaatcatccatcaattgtctaa 25953324  T
Q  232 tgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctg 331  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25953325 tgcatgagtgaattgcttgaaccataaatatgtacaatactgttaggagatacgctaggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtaccctg 25953424  T
Q  332 aaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatc 392  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25953425 aaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccattatacagttattggtgggggcgaatc 25953484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 18608590 - 18608969
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18608590 aacctttggcaaaggggtgcttaatgaaccataacattgattcaagttaaaggggtgttttctctcatgtgaa-ggtcatataatgcactacaaatgttt 18608688  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactcta 210  Q
    |||||||   ||||| |||    | | ||   |||| | ||||         ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  18608689 ggcatttaggcattaattt----gggcac---acaagaaacaa---------gaattttgttacattaacaacataattctccctcattctcttactcta 18608772  T
Q  211 aatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgt 310  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18608773 aatcatccatcaattctctaatgcatgagttaattgacggaacgataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacat 18608872  T
Q  311 caaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  18608873 caaggaactcatattatcctgaaggggatttactggtcattcc-tatttcatccaatatacaattattggtgggggcgaattgaacctaaaggttagt 18608969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 285
Target Start/End: Original strand, 18494117 - 18494395
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  18494117 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaaag-gtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 18494215  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18494216 gacatttgggcattagttgaagatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 18494314  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacg 285  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18494315 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacg 18494395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 198 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 18885136 - 18884938
Alignment:
Q  198 ttcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggtt 297  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| ||    
T  18885136 ttctcttactctaaatcatcaatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatcctgttaagagatatgcttggtgtgatt 18885037  T
Q  298 gtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc 397  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||| | |||||||||  |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18885036 gtgcaatacacatcaaggaacttaaagtatcctgaagggggttcactggtcattcc-cattgaatccaatctacagtaattggtgggggcgaatcgaacc 18884938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1782061 - 1781975
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttg 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1782061 taatgaaccataacattgattcaagtcaaaatagtattttctctcatgtgaaaggtcgtatactgcactataaatgtttgacatttg 1781975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 170 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1781939 - 1781869
Alignment:
Q  170 gttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagt 240  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  1781939 gttacattaacaacataattatccctcattctcttactcaaaatcatccaccaattctctaattcatgagt 1781869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28574561 - 28574160
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  28574561 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgttttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 28574462  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28574461 gacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 28574363  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28574362 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 28574263  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28574262 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 28574164  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  28574163 tagt 28574160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28598573 - 28598172
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  28598573 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaataggtgttttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 28598474  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28598473 gacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 28598375  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28598374 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 28598275  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  28598274 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 28598176  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  28598175 tagt 28598172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 43359007 - 43358625
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  43359007 aacctttggcaaaggggtgcttaatgaatcatagcattgattcaagtcaaatgagtgctttctctcatgtgaagagtcctataatgcactataaatgctt 43358908  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactcta 210  Q
    ||||||||  |||||||| ||||     ||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  43358907 ggcatttgggcattagttggaca-----cactacaacacacaattttggactgaattttgttacattaacaacataattctccctcattctcttactcta 43358813  T
Q  211 aatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgt 310  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  43358812 aattatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaaaattgttaggagatatgtttggtgtggttgtgcaatacacgt 43358713  T
Q  311 caaggaactc--atagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc 397  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  43358712 caaggaactcatatagtattctgaaggggattcgccggtcactcc-tattgcatccaatatacagttattggtgggggcaaatcgaacc 43358625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 146 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 3465596 - 3465336
Alignment:
Q  146 acacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaatt 245  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3465596 acacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaatt 3465498  T
Q  246 gctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccg 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3465497 gctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccg 3465398  T
Q  346 gtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  3465397 gtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtggggacgaatcgaacctaaaggttagt 3465336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 32 - 407
Target Start/End: Original strand, 44523992 - 44524359
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcat--gtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagttt 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  44523992 taatgaaccataacattgattcaagtcaaatgggtgttttccctcatatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttgacatttgggcattaattt 44524091  T
Q  130 gacagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctct 229  Q
    ||   | ||||  |||||||||||||| | | ||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  44524092 ga---acaaca--acaacacacaattt-gaacagaatattgttgcattaacaacataattctccatcattctcttactttaaatcatccatcaattctct 44524185  T
Q  230 aatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |    
T  44524186 aatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgct---tgtggttgtgcaatacacatcaaggaactcatagtattc 44524282  T
Q  330 tgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaaccaaaggttagt 407  Q
     ||||| |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  44524283 cgaaggggattcgtcgatcattcc-tattgcatccaatatacagttattgatgggggcgaatcgaactaaatgttagt 44524359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 407
Target Start/End: Original strand, 10186542 - 10186917
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||    
T  10186542 taatgaaccatagcattggttcaagtcaaatgggtgctttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttgacatttgggcattaatttga 10186641  T
Q  132 -cagagaacag-aacaaca-cacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctc 228  Q
     || |||| |  || |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  10186642 acacagaagaacaataacaacataattttggacagaattttgttacattaacaacataattctccatcattctcttactctaaatcatccatcaattctc 10186741  T
Q  229 taatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgt----gaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatag 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10186742 taatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaataaatattgttaggagatacgtttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatag 10186841  T
Q  325 tatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    ||||        ||||| | ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10186842 tatc-------ggattcactggtcatttc-tattgcatccaatatacaattattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 10186917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 146 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13654461 - 13654198
Alignment:
Q  146 acacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactct--aaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  13654461 acacacaattttggatagaattttgttgcattaacaacataattctccctcattctcttgctctctaaatcatccattaattctctaatgcatgagtgaa 13654362  T
Q  244 ttgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgc 343  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13654361 ttgctgaaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgc 13654262  T
Q  344 cggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  13654261 cggtaactcc-tattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 13654198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 19311077 - 19310688
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| ||| |||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19311077 aacctttggtaaaagggtgcttaatgaactataacattgattcaagtcaaaggggtgctttctctcatgtgaagggtcatgtaatgcactataaatgttt 19310978  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactcta 210  Q
    | ||||||  ||||| ||||||| | ||     ||||| |  |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| ||    
T  19310977 gacatttgggcattaatttgacacaaaag----caacata--attttggacagagttttgttacattaacaatataattctccctcattctcttactata 19310884  T
Q  211 aatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgt 310  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  19310883 aatcatccatcaattctctaatgcatgaatgaattgctggaaccataaatctgtaaaacactattaggagatatgcttggtgcggttgtgcaatacacgt 19310784  T
Q  311 caaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  19310783 caaggaactcataatatact-aaggggattcgctggtcattcc-tattgcatccaatatagagttattggtgggggtgaatcgaacctaaaggttagt 19310688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3468332 - 3468010
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  3468332 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaagatgtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 3468233  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa-------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttt 203  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||       || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3468232 gacatttgggcattagttgaagatacaaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctat 3468134  T
Q  204 tactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcag 303  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3468133 tattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaa 3468034  T
Q  304 tacacgtcaaggaactcatagtat 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3468033 tacacgtcaaggaactcatagtat 3468010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 162 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 1187935 - 1187691
Alignment:
Q  162 agaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1187935 agaattttgttacattaacaacataaatctcctc-attctcttactctaaatcatccatcaattctttaatgcatgagtgaattggtagaaccataaatc 1187837  T
Q  262 tgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgca 361  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  1187836 tgtaaaatattgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacatcaaggaactcatagtatcatgaaggagattcgctggtctttcc-tattgca 1187738  T
Q  362 tccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1187737 tccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacctaaaggttagt 1187691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16051428 - 16051069
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||     
T  16051428 taatgaaccatatcattgattcaagtcaaaagggtgttttcactcatgtgaatggtcatataatgcactataaatgtttgacatttgggcattaatttgg 16051329  T
Q  132 cagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaa-cataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctcta 230  Q
          ||| ||||| | ||||         ||||||||||||||||||   |||  |||||   |||| | ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16051328 ------acacaacaaga-acaa---------gaattttgttacattaaccctcatt-ttcttactcattttcttactttaaatcatccatcaattctcta 16051246  T
Q  231 atgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcct 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16051245 atgcatgagtgaattgctgaaaccataaatctgtaaaatactgttaggaaatacgcttggtgtggctgtgcaatacacatcaaggaactcatagtatctt 16051146  T
Q  331 gaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||||  ||||||  ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16051145 gaagggtattcgctagtcattcatt-ttgcatcaaatatacagttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 16051069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 228 - 411
Target Start/End: Original strand, 48366213 - 48366397
Alignment:
Q  228 ctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtat 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  48366213 ctaatgcattagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatattgtttggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggacctcatagtat 48366312  T
Q  328 cctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagtatgg 411  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  48366313 cctcaaggggattcgccggtcattccttattgcatccaatatacaattattggtgggggcaaatcgaacctaaaggttggtatgg 48366397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 228 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 29681632 - 29681475
Alignment:
Q  228 ctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtat 327  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  29681632 ctaatgcattagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatattgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggacctcatagtat 29681533  T
Q  328 cctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggg 385  Q
    ||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29681532 cctcaaagggatttgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggg 29681475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 259
Target Start/End: Original strand, 21431621 - 21431865
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgag-tgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtt 109  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21431621 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaaccataacattgatttaagtcaaagggggtgctttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgct 21431720  T
Q  110 tggcatttgaccattagtttgacagagaacagaacaacacacaattttgga-tagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactc 208  Q
    || ||||||  |||||||| ||||||||||  ||||  | ||||    | |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||    
T  21431721 tgacatttgggcattagttggacagagaac--aacagaaaacaa----gaacaagaattttgttgcattaacaacataattctccctcattctcttaatc 21431814  T
Q  209 taaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaa 259  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  21431815 taaatcatccatcaattctctaatgcatcagtgaattgatggaaccataaa 21431865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 162 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35626280 - 35626140
Alignment:
Q  162 agaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35626280 agaattttgttacattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgttggaaccataaatc 35626181  T
Q  262 tgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgca 302  Q
    | | ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||    
T  35626180 tataaaatactattaggagatacgttcgatgtggttgtgca 35626140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 163 - 272
Target Start/End: Original strand, 17414633 - 17414742
Alignment:
Q  163 gaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatct 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17414633 gaattttgttacattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatct 17414732  T
Q  263 gtgaaatact 272  Q
    |  |||||||    
T  17414733 ggaaaatact 17414742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 310 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 35624977 - 35624877
Alignment:
Q  310 tcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagta 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35624977 tcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcactcc-tattgcatccaatatacagttgttggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagta 35624879  T
Q  409 tg 410  Q
    ||    
T  35624878 tg 35624877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 13654552 - 13654468
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatt 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13654552 taatgaaccataacattgattcaagtcaaaggggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatacttggcatt 13654468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 93
Target Start/End: Original strand, 35653214 - 35653275
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatata 93  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35653214 taatgaaccatatcattgattcaattcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatata 35653275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 410
Target Start/End: Original strand, 3696403 - 3696647
Alignment:
Q  163 gaattttgttacattaacaacataattcttcaccatt-cttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||  | || |||||||| ||||||||||||   | |||| ||||||| ||||||||||| |     
T  3696403 gaattttgttacattaacaacacaattctcttccatttctcattctataaatcatccatcaattctctgcagaatgaatgaattgatggaaccataatt- 3696501  T
Q  262 tgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgca 361  Q
    ||| |||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||| |  |||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    | ||||||  |||||||    
T  3696502 tgtaaaatacggttaagagatacttttgctgtgattgtgaa--acacatcaaggaattcatagtatcttgaaggagatttattgatcattc--tattgca 3696597  T
Q  362 tccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagtatg 410  Q
    |||||||| || |||| ||||| |  | |||||||| |||||||||||||    
T  3696598 tccaatattcaattatcggtggagaagcatcaaacctaaaggttagtatg 3696647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 397
Target Start/End: Original strand, 17415386 - 17415515
Alignment:
Q  267 aatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaa 366  Q
    |||| ||||| |||||| | |||||||| || |||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||| |  ||||||||| |||| |||||||    
T  17415386 aatattgttaagagatatgattggtgtgattatgcaatacacatcaagaaactaatagtatcctgaagaggatttgatggtcattcc-tatttcatccaa 17415484  T
Q  367 tatacagttattggtgggggcgaatcaaacc 397  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  17415485 tatacaattattggtgggggcaaatcgaacc 17415515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 392
Target Start/End: Original strand, 21431918 - 21431991
Alignment:
Q  319 tcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatc 392  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21431918 tcatagtatccagaaggggattcaccggtcattccttattgcaaacaatatatagttattggtgggggtgaatc 21431991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 118
Target Start/End: Original strand, 17414555 - 17414615
Alignment:
Q  58 caaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttg 118  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17414555 caaatgggtggtttctctcatgtgaatggtcatataatgcactataaatgcttggcatttg 17414615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1188054 - 1187953
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||||||| || |||||||||| ||  |||| || ||| ||||||  ||||| |||||    
T  1188054 taatgaaccataacattaattcaagtcaaaggggtgtttactctcatgtgtagagtcatataatccataataagtgcttgccatttgggcattaatttga 1187955  T
Q  132 ca 133  Q
    ||    
T  1187954 ca 1187953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 106
Target Start/End: Original strand, 3701492 - 3701533
Alignment:
Q  65 gtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaat 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3701492 gtgttttctctcatgtgaagagtcacataatgcactataaat 3701533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 43359059 - 43359020
Alignment:
Q  18 tggcaaaaaggtgctaatgaaccataatattgattcaagt 57  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43359059 tggcaaaagggtgctaatgaaccataacattgattcaagt 43359020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 10185874 - 10185836
Alignment:
Q  69 tttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatg 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10185874 tttctctcatatgaatggtcatataatgcactataaatg 10185836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4050072 - 4049670
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  4050072 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgttttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 4049973  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa-------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttt 203  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||       || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4049972 gacatttgggcattagttgaagatacaaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctat 4049874  T
Q  204 tactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcag 303  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4049873 tattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaa 4049774  T
Q  304 tacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaagg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4049773 tacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaagg 4049675  T
Q  403 ttagt 407  Q
    |||||    
T  4049674 ttagt 4049670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 5481428 - 5481829
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  5481428 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaataggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 5481527  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5481528 gacatttgggcattagttgaagataaaaaaaccacacaactacacacaactt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctatt 5481626  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5481627 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 5481726  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  5481727 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 5481825  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  5481826 tagt 5481829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 10672878 - 10673279
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  10672878 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 10672977  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10672978 gacatttgggcattagttgaaaatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 10673076  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10673077 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 10673176  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10673177 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 10673275  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  10673276 tagt 10673279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 18 - 407
Target Start/End: Original strand, 5457957 - 5458353
Alignment:
Q  18 tggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatt 116  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  5457957 tggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaataggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatt 5458056  T
Q  117 tgaccattagtttgacagagaa-------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactct 209  Q
    ||  ||||||||  | | | ||       || ||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||    
T  5458057 tgggcattagttgaagataaaaaaaaccacacaactacacacaactt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattct 5458155  T
Q  210 aaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacg 309  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5458156 aaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacg 5458255  T
Q  310 tcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  5458256 tcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 5458353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8465014 - 8464613
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  8465014 aacctttggcaaaatggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 8464915  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8464914 gacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctatt 8464816  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8464815 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 8464716  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||    
T  8464715 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggttggggcgaatcgaacctaaaggt 8464617  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  8464616 tagt 8464613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 46 - 407
Target Start/End: Original strand, 6852927 - 6853293
Alignment:
Q  46 attgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttgacagagaa------c 139  Q
    |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| || | | ||      |    
T  6852927 attgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttggatatacaaaaaccac 6853026  T
Q  140 agaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgag 239  Q
    | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6853027 acaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcacgag 6853125  T
Q  240 tgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagat 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6853126 tgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggat 6853225  T
Q  340 tcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6853226 tcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 6853293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 31076342 - 31076743
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  31076342 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgctt 31076441  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  ||| | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31076442 gacatttgggcattagttgaacatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 31076540  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  31076541 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgtttggtgtggttgtgcaat 31076640  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31076641 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgtcggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 31076739  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  31076740 tagt 31076743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 31081447 - 31081848
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  31081447 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcattataaatgctt 31081546  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  ||| | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31081547 gacatttgggcattagttgaacatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 31081645  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  31081646 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgttggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgtttggtgtggttgtgcaat 31081745  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31081746 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 31081844  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  31081845 tagt 31081848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 1302184 - 1302586
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  1302184 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 1302283  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa-------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttt 203  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||       || ||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1302284 gacatttgggcattagttgaatatacaaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacaaaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctat 1302382  T
Q  204 tactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcag 303  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1302383 tattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaa 1302482  T
Q  304 tacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaagg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||    
T  1302483 tacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgtatcgaacctaaagg 1302581  T
Q  403 ttagt 407  Q
    |||||    
T  1302582 ttagt 1302586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4055206 - 4054804
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  4055206 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 4055107  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa-------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttt 203  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||       || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4055106 gacatttgggcattagttgaagatacaaaaaaccacacaactacacacaattt-ggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctat 4055008  T
Q  204 tactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcag 303  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4055007 tattctaaatcatccatcaattctttaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaa 4054908  T
Q  304 tacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaagg 402  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  4054907 tacacgttaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgtcggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaagg 4054809  T
Q  403 ttagt 407  Q
    |||||    
T  4054808 ttagt 4054804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 46 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 8458541 - 8458174
Alignment:
Q  46 attgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcattt-gaccattagtttgacagagaa------ 138  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||  | | | ||          
T  8458541 attgattcaagttaaagaggtgttttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacattttgggcattagttgaatatacaaaaacca 8458442  T
Q  139 cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatga 238  Q
    || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8458441 cacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatga 8458343  T
Q  239 gtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggaga 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8458342 gtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtatcctgaagggga 8458243  T
Q  339 ttcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8458242 ttcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 8458174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 33702539 - 33702941
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  33702539 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 33702638  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa-------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttt 203  Q
    | ||||||  ||||||||  | ||| ||       || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33702639 gacatttgggcattagttgaatagacaaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctat 33702737  T
Q  204 tactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcag 303  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  33702738 tattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatatgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaa 33702837  T
Q  304 tacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaagg 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  33702838 tacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccagtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggagcgaatcgaacctaaagg 33702936  T
Q  403 ttagt 407  Q
    |||||    
T  33702937 ttagt 33702941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 46 - 407
Target Start/End: Original strand, 6858030 - 6858396
Alignment:
Q  46 attgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttgacagagaa------c 139  Q
    |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| || | | ||      |    
T  6858030 attgattcaagttaaagaggtgatttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttggatatacaaaaaccac 6858129  T
Q  140 agaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgag 239  Q
    | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6858130 acaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgag 6858228  T
Q  240 tgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagat 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  6858229 tgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtatcttgaaggggat 6858328  T
Q  340 tcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6858329 ttgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 6858396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Original strand, 10677991 - 10678394
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtca--tataatgcactataaatgt 108  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||     
T  10677991 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaaaaggtgctttctttcatgtgaagagtcacatataatgcactataaatgc 10678090  T
Q  109 ttggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctt 202  Q
    ||| ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  10678091 ttgacatttgggcattagttgaaaatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcta 10678189  T
Q  203 ttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgca 302  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10678190 ttattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgca 10678289  T
Q  303 gtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaag 401  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10678290 atacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaag 10678388  T
Q  402 gttagt 407  Q
    ||||||    
T  10678389 gttagt 10678394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 46 - 407
Target Start/End: Original strand, 10591270 - 10591636
Alignment:
Q  46 attgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttgacagagaa------c 139  Q
    |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||  | | | ||      |    
T  10591270 attgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaaaatacaaaaaccac 10591369  T
Q  140 agaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgag 239  Q
    | ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10591370 acaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcctcatcattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgag 10591468  T
Q  240 tgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagat 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  10591469 tgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaatgaactcatagtatcctgaaggggat 10591568  T
Q  340 tcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10591569 tcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 10591636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 32 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 49784729 - 49784378
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||| ||    
T  49784729 taatgaatcataacattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgga 49784630  T
Q  132 cagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaa 231  Q
    || | ||||     ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  49784629 catacaaca-----acacacaattttggacagaattttgttgcattaacaacataattccccctcattcttttactttaaatcatctatcaattctctaa 49784535  T
Q  232 tgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcata--gtatcc 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||     
T  49784534 ttcatgagtgaattgctggaaccataaatctggaaaatattgttaggagatatgtttggtatggttgtgcaatacacgtcaaagaactcatagtgtatct 49784435  T
Q  330 tgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtggggg 386  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49784434 tgaaggggattcgccagtcattccttattgcatccaatatacagttattggtggggg 49784378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 69 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 33703506 - 33703163
Alignment:
Q  69 tttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttgacagagaa-------cagaacaacacacaattttggat 161  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||  | | | ||       || ||| ||||||||||| |||     
T  33703506 tttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagttgaatatacaaaaaaccacacaactacacacaattt-ggac 33703408  T
Q  162 agaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 261  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33703407 ataattttgttacattaacaacataattcttcaccattctattattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatc 33703308  T
Q  262 tgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgca 361  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||    
T  33703307 tgtaaaatactattaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtatcctgaacg-gattcgccggtcattcc-tattgca 33703210  T
Q  362 tccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33703209 tccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 33703163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 29827661 - 29827303
Alignment:
Q  18 tggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatt 116  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29827661 tggcaaaatggtgcttaatgaatcataacattgattcaagtcaaaggggtgttttctatcatgtgaaag-tcatataatgcattataaatgcttggcatt 29827563  T
Q  117 tgaccattagtttgacagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcat 216  Q
    ||  ||||||||||||| | |||| ||      ||||         |||||||||| |||||| ||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  29827562 tgggcattagtttgacaaaaaacataa------acaa---------gaattttgttgcattaataacctaattctccctcattctcttactctaaatcat 29827478  T
Q  217 tcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaagga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29827477 tcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctg-----ataaatctgtaaaatactgttaggagatacccttggtgtggttgtgcaatacacgtcaagga 29827383  T
Q  317 actcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc 397  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29827382 actcatagtatcttgaaggggattcgccggtcgctcc-tattgcatccaatatacaattattggtggaggcgaatcgaacc 29827303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 167 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 20891162 - 20890936
Alignment:
Q  167 tttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtga 266  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  20891162 tttgttacataaacaacataattctccctcattcgcttactctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctataa 20891063  T
Q  267 aatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaa 366  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||| | ||||||||||||    
T  20891062 aatactgttaagagatacgctttgtgtgattgtgtaatacacatcaaggaactcatagtat-ctgaaggggattcactagtcatt-catattgcatccaa 20890965  T
Q  367 tatacagttattggtgggggcgaatcaaac 396  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  20890964 tatacagttattggt-ggcgcgaatcaaac 20890936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 164 - 370
Target Start/End: Original strand, 18024246 - 18024450
Alignment:
Q  164 aattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||    
T  18024246 aattttgttacattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgaatgaattgttagaacaataaatctg 18024345  T
Q  264 tgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatc 363  Q
    | ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  18024346 taaaatattgttaacagatacgcttggtgtgattgtgcaatacacat-aaaaaactcatagtatcctgaaggatattcgctggtcattcc-tattgcatc 18024443  T
Q  364 caatata 370  Q
     ||||||    
T  18024444 aaatata 18024450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 163 - 380
Target Start/End: Original strand, 3187551 - 3187766
Alignment:
Q  163 gaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatct 262  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3187551 gaattttgtgacattaacaacataattctccctcattctcttactctaaatcatctatcaattctttaatgcatgagtgaattgctcgaaccataaatct 3187650  T
Q  263 gtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcat 362  Q
    || ||||| ||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  3187651 gtaaaatattgttaagagatacactttgtgtaattgtgcaatacacatcaagaaactcat-gtatccttaaggggattcgccagtcattcc-tattgcat 3187748  T
Q  363 ccaatatacagttattgg 380  Q
    |||||||| |||||||||    
T  3187749 ccaatatatagttattgg 3187766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 10584798 - 10585066
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  10584798 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgttttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 10584897  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  10584898 gacatttgggcattagttgaaaatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcctcatcattctatt 10584996  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgt 274  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  10584997 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaatagctagaaccataaatctgtaaaatactgt 10585066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 268 - 407
Target Start/End: Original strand, 10586384 - 10586523
Alignment:
Q  268 atactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaat 367  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10586384 atactgttaggagatacgcttggcgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaat 10586482  T
Q  368 atacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10586483 atacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 10586523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 20891237 - 20891184
Alignment:
Q  65 gtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20891237 gtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttggcatttg 20891184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 118
Target Start/End: Original strand, 18024174 - 18024227
Alignment:
Q  65 gtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18024174 gtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttgacatttg 18024227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12857053 - 12856652
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  12857053 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 12856954  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12856953 gacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 12856855  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12856854 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 12856755  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12856754 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 12856656  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  12856655 tagt 12856652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26051285 - 26050884
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26051285 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 26051186  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | |||||   ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26051185 gacatttaggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 26051087  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26051086 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 26050987  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26050986 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 26050888  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  26050887 tagt 26050884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26056398 - 26055997
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26056398 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 26056299  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | |||||   ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26056298 gacatttaggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 26056200  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26056199 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 26056100  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26056099 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 26056001  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  26056000 tagt 26055997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26060644 - 26060243
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26060644 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 26060545  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | |||||   ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26060544 gacatttaggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 26060446  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26060445 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 26060346  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26060345 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 26060247  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  26060246 tagt 26060243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26065757 - 26065356
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26065757 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 26065658  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | |||||   ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26065657 gacatttaggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 26065559  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26065558 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 26065459  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  26065458 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 26065360  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  26065359 tagt 26065356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12851940 - 12851537
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  12851940 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatgacattgattcaagttaaataggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatactt 12851841  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagaga--------acagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctt 202  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | |        | | ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  12851840 gacatttgggcattagttgaagatatacaaaaaccatacaactacacacaattt-ggacaaaattttgttacattaacaacataattcttcatcattcta 12851742  T
Q  203 ttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgca 302  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12851741 ttattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgca 12851642  T
Q  303 gtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaag 401  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||| ||||    
T  12851641 atacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgtcggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgtgttcgaatcgaacctaaag 12851543  T
Q  402 gttagt 407  Q
    ||||||    
T  12851542 gttagt 12851537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 146 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14610487 - 14610227
Alignment:
Q  146 acacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaatt 245  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610487 acacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcatcattctcttattctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaatt 14610389  T
Q  246 gctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccg 345  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  14610388 gctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaagaaactcatagtatcctgaaggggattcgctg 14610289  T
Q  346 gtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14610288 gtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 14610227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 175 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11056720 - 11056503
Alignment:
Q  175 attaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgt 274  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11056720 attaacaacataattctttatcattctcttactttaaatcatccatcaattctttaatgcatgagtgaattgttggaaccataaatctgtaaaatactat 11056621  T
Q  275 taggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagt 374  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  11056620 taggagatacgtttggtgtgattgtgcaacacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgtcggtcatt-catattgcatccaatatacagt 11056522  T
Q  375 tattggtgggggcgaatca 393  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11056521 tattggtgggggcgaatca 11056503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 407
Target Start/End: Original strand, 4181364 - 4181722
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||    
T  4181364 taatgaaccttaacattgattcaagtcaaaatggtgttttctctcatatgaagagtcatataatgcactataaatgtttgacatttgggcattaatttga 4181463  T
Q  132 cagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaa 231  Q
    || |           |||| ||        ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4181464 caca-----------cacataaacg-----agaattttgttgcattaacaacataattctccctcattctcttaatctaaatcatccatcaattctctaa 4181547  T
Q  232 tgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctg 331  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||    
T  4181548 tgcatgagtga-ttgctcgaaccataaacccgtaaaatactgttagtagatacgcttgatgtggttgtgcaatacatgtcaaggaactcatagtatcatg 4181646  T
Q  332 aaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||    
T  4181647 aaggggattctctggtcattcc-aattgcatccaatatagagttattggtggggaagaatcgaacctaaaggttagt 4181722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 228 - 411
Target Start/End: Original strand, 5436692 - 5436876
Alignment:
Q  228 ctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtat 327  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  5436692 ctaatgcattagtgaattgcttgaaccataaatctgtaaaatattgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggacctcatagtat 5436791  T
Q  328 cctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagtatgg 411  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||    
T  5436792 cctcaagggaattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcaaatcgaacctaaaggttggtatgg 5436876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 197 - 415
Target Start/End: Original strand, 35352422 - 35352640
Alignment:
Q  197 attcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggt 296  Q
    ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  35352422 attctcttactataaaccatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctataaaatactgttaggagttactcttgatgtggt 35352521  T
Q  297 tgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaac 396  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  35352522 tgtgcaatacacatcatggaactcatagtatcctgaagaggattcgctggtcattcc-tattgcatccaatatacaattattggtgggggcgaattgaac 35352620  T
Q  397 c-aaaggttagtatggtaac 415  Q
    | |||||||||| |||||||    
T  35352621 ctaaaggttagtgtggtaac 35352640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 163 - 391
Target Start/End: Original strand, 37459938 - 37460165
Alignment:
Q  163 gaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatct 262  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| ||||||| ||||    
T  37459938 gaattatgttacatgaacaacataattctcccacattctcttactctaaatcatccatcaattctctgatgcattagcgaattgctgaaaccatatatct 37460037  T
Q  263 gtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcat 362  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||| ||||||||||    
T  37460038 gtaaaatattgttaagagatacgcttgatgtggttgtgcaatacacatcaaggaactcatagtatcatgaagtggattcatcggtcatt-cttattgcat 37460136  T
Q  363 ccaatatacagttattggtgggggcgaat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37460137 ccaatatacagttattggtgggggtgaat 37460165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 272
Target Start/End: Original strand, 5440261 - 5440494
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagttt-g 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||| |    
T  5440261 taatgaaccataacattgattcaagtcaaatgggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttggcatttgggctttaatttgg 5440360  T
Q  131 acaga-gaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctct 229  Q
    ||| |  || | ||||| | ||||     ||   | |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  5440361 acacacaaaaacaacaaga-acaa-----ga---atttttattacattaacaacataattctccctcattcccttactctaaatcatcgatcaattctct 5440451  T
Q  230 aatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatact 272  Q
    || || ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5440452 aaagcttgagtaaattgctggaaccatacatctgtaaaatact 5440494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 272
Target Start/End: Original strand, 5449271 - 5449504
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagttt-g 130  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||| |    
T  5449271 taatgaaccataacattgattcaagtcaaatgggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgcttggcatttgggctttaatttgg 5449370  T
Q  131 acaga-gaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctct 229  Q
    ||| |  || | ||||| | ||||     ||   | |||| ||||||||||||||||||||| |  |||||  ||||||||||||||  |||||||||||    
T  5449371 acacacaaaaacaacaaga-acaa-----ga---atttttattacattaacaacataattctccctcattcccttactctaaatcatcgatcaattctct 5449461  T
Q  230 aatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatact 272  Q
    || || ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  5449462 aaagcttgagtaaattgctggaaccatacatctgtaaaatact 5449504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 330 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 14615370 - 14615293
Alignment:
Q  330 tgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14615370 tgaaggggattcgccggtcattcct-attgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 14615293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Original strand, 37459824 - 37459898
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaat 106  Q
    ||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37459824 taatgaaccataacatcaattcaaatcaaatgcgtgttttctctcatgtgaatggacatataatgcactataaat 37459898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12239666 - 12239601
Alignment:
Q  280 gatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccg 345  Q
    |||||||||||||||  ||||||   |||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  12239666 gatacgcttggtgtgaatgtgcaagtcacgtcaaggatttcatcgtatcctgaaggggattcgccg 12239601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14610593 - 14610512
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatat 92  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   ||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14610593 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagtcaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatat 14610512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21276037 - 21275636
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  21276037 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgctttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 21275938  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21275937 gacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaattt-ggacagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctatt 21275839  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21275838 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 21275739  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggt 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21275738 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggt 21275640  T
Q  404 tagt 407  Q
    ||||    
T  21275639 tagt 21275636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 411
Target Start/End: Original strand, 20752078 - 20752463
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||    
T  20752078 aacctttgacaaaatggtgcttaatgaaccataacattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaaaggtcatctaatgcactataaatactt 20752177  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactcta 210  Q
    |||||||   |||||  ||||||               |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  20752178 ggcatttaggcattaacttgaca---------------cacagttttggaaagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctcttactata 20752262  T
Q  211 aatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgt 310  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20752263 agtcatccatcaattctctgatgcatgagtgaattgttggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgt 20752362  T
Q  311 caaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagtat 409  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20752363 caaggaactcgtagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacagttatttgtgggggcgaatcgaacctaaaggttagtat 20752461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24509943 - 24509562
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| |    
T  24509943 taatgaaccataacattgattcaagtcaaatgggtgttttctctcatgtgaaggttcatataatgcactataaatgcttgacatttgggcattagtttaa 24509844  T
Q  132 ca-gagaacag-aacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctct 229  Q
    || || ||||  ||  | ||| ||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24509843 cacgacaacaacaattatacataattttgtacaaaattatgttacattaacaacataattctccatcattcttttactttaaatcatccatcaattctct 24509744  T
Q  230 aatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcc 329  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
T  24509743 aatgcattagtgaattgttggaaccataaatttgtaaaatactgttaggagatacgcatggtgtggttgtgcaatacacatcaaggaactcatagtatta 24509644  T
Q  330 tgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagtatgg 411  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24509643 tgaaggggattcgccgatcattcc-tattgcatccaatatatagttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagtatgg 24509562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 411
Target Start/End: Original strand, 21936626 - 21937025
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21936626 aacctttggcaaaaaggtgcttaataaaccataacattgattcaagtcaaaggggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgctt 21936725  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactcta 210  Q
      ||||||  ||||||||| ||| |  | | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||    
T  21936726 aacatttgggcattagtttaacacaaca-acaacaacacacaattttggactgaactttgttacattaacaacataattctccatcattctcatactcta 21936824  T
Q  211 aatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgt 310  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || | |||||||||||| ||||| |    
T  21936825 aatcatctatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatattattaggagatacactcgatgtggttgtgcaatacacat 21936924  T
Q  311 caaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagtat 409  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| | || ||||||||||||    
T  21936925 caaggaactcatagtattctgaaggggattctccgaccattcc-tattgcatctaatatacaattattggtggggacgaatcgagcctaaaggttagtat 21937023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21937830 - 21937429
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21937830 aacctttggcaaaagggtgtttaatgaaccatcacattgattcaagtcaaaggggtattttctctcatgtgaagggtcatataacgcactataaatgttt 21937731  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagag-aacag-aacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactc 208  Q
    ||||||||  ||||||||| ||| |  ||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||| | || || ||| ||| ||    
T  21937730 ggcatttgggcattagtttaacacaacaacaacaacaacacacaattttggacataattttgt-acattaacaacataattttccatcactctcttattc 21937632  T
Q  209 taaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacac 308  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21937631 taaaacatccatcaattctcaaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatttgtataatattgttacgagatacgcttggtgtggttgtgcaatacac 21937532  T
Q  309 gtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
      |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  21937531 aacaaggaactcatagtatcctaaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatatggttattggtgggggcgaatcgagcctaaaggttagt 21937433  T
Q  408 atgg 411  Q
    ||||    
T  21937432 atgg 21937429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 164 - 411
Target Start/End: Original strand, 24508926 - 24509173
Alignment:
Q  164 aattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctg 263  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  24508926 aattatgttacattaacaacataattctccatcattcttttactctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgttggaatcataaatttg 24509025  T
Q  264 tgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatc 363  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||    
T  24509026 taaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtattatgaaggggattcgccgatcattcc-tattgcatc 24509124  T
Q  364 caatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagtatgg 411  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  24509125 caatatatagttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagtatgg 24509173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 164 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 2889318 - 2889090
Alignment:
Q  164 aattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctg 263  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2889318 aattttgttccattaccaacataattctccctcattctcttactctaaatcattcatcaactctctaatgcatgagtgaattgctggaatcataaatctg 2889219  T
Q  264 tgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatc 363  Q
    | ||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2889218 taaaatagtgttaagagatatatttggtgtggttgtgcaatacacgtgaaggaattcatagtatcgtgaagaggattcgccggtcattccttattgcatc 2889119  T
Q  364 caatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc 397  Q
    ||||| |     ||||||||||||||||| ||||    
T  2889118 caataaa-----attggtgggggcgaatcgaacc 2889090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 164 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 2887596 - 2887368
Alignment:
Q  164 aattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctg 263  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2887596 aattttgttccattaccaacataattctccctcattctcttactctaaatcatccatcaactctctaatgcatgagtgaattgctggaatcataaatctg 2887497  T
Q  264 tgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatc 363  Q
    | ||||| ||||| ||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2887496 taaaatagtgttaagagatatatttggtgtggttgtgcaatacacgtgaaggaattcatagtatcgtgaagaggattcgtcggtcattccttattgcatc 2887397  T
Q  364 caatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc 397  Q
    ||||| |     ||||||||||||||||| ||||    
T  2887396 caataaa-----attggtgggggcgaatcgaacc 2887368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 163 - 385
Target Start/End: Original strand, 11183263 - 11183484
Alignment:
Q  163 gaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatct 262  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  11183263 gaattttgttacaataataacataattctctctcattctcttactctaaatcatcaatcaattctctaatgcatgagtaaattgctgaaaccataaacct 11183362  T
Q  263 gtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcat 362  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| |||| | ||||| | | |||||||  ||  |||    
T  11183363 gtaaaatactgttaggagatacatttggtgtggttgtgtaatacacatcaaggaactcataatatcttgaatgggattcactgatcattcc-catcacat 11183461  T
Q  363 ccaatatacagttattggtgggg 385  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11183462 ccaatatacagttattggtgggg 11183484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 118
Target Start/End: Original strand, 24508800 - 24508907
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  24508800 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaaccataacattgattcaagtcaaaggggtgttttctctcatgagaagggtcatattatgtactgtaaatgttt 24508899  T
Q  111 ggcatttg 118  Q
    ||||||||    
T  24508900 ggcatttg 24508907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 96
Target Start/End: Original strand, 11183148 - 11183212
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatg 96  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11183148 taatgaaccataacactgattcaagtcaaatgggtgtgttctcccatgtgaaggctcatataatg 11183212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 383
Target Start/End: Original strand, 1959 - 2335
Alignment:
Q  12 aacctgtggcaaaaaggtgct-aatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgttt 110  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| |||   |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  1959 aacctttggcaaaagggtgcttaatgaatcatggcattgattcaagttaaagaggtgttttctctcatgtgaagagtcatataatgcactataaatgctt 2058  T
Q  111 ggcatttgaccattagtttgacagagaa------cagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattctttt 204  Q
    | ||||||  ||||||||  | | | ||      || ||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  2059 gacatttgggcattagttgaatatacaaaaaccacacaactacacacaactt-ggacagaattttattacattaacaacataattcttcatcattctatt 2157  T
Q  205 actctaaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagt 304  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2158 attctaaatcatccatcaattctctaatgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaat 2257  T
Q  305 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2258 acacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgg 2335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 337 - 407
Target Start/End: Original strand, 7248 - 7318
Alignment:
Q  337 gattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  7248 gattcgccggtcattcct-attgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 7318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 146 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 144222 - 143959
Alignment:
Q  146 acacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactct--aaatcattcatcaattctctaatgcatgagtgaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||| || ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  144222 acacacaattttggatagaattttgttgcattaacaacataattctccctcattctcttgctctctaaatcatccattaattctctaatgcatgagtgaa 144123  T
Q  244 ttgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgc 343  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  144122 ttgctgaaaccataaatctgtaaaatactgttaggagatacgcttggtgtggttgtgcaatacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgc 144023  T
Q  344 cggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggttagt 407  Q
    |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  144022 cggtaactcc-tattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggttagt 143959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 144313 - 144229
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatt 116  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  144313 taatgaaccataacattgattcaagtcaaaggggtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatacttggcatt 144229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 173586 - 173344
Alignment:
Q  32 taatgaaccataatattgattcaagtcaaatgagtgttttctctcatgtgaagggtcatataatgcactataaatgtttggcatttgaccattagtttga 131  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  ||||| |||      
T  173586 taatgaaccttagcattgattcaagtcaaatgggtgttttctatcatgtgaagggtcatataatgcgctataaatgtttgatatttgtgcattaattt-- 173489  T
Q  132 cagagaacagaacaacacacaattttggatagaattttgttacattaacaacataattcttcaccattcttttactctaaatcattcatcaattctctaa 231  Q
         |||| ||||| | |||       | ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  173488 -----aacataacaaaatacagaaa---aaagaattttgttacatcaacaacataattcttcctaattctcttactctaaatcatccatcaattctctaa 173397  T
Q  232 tgcatgagtgaattgctggaaccataaatctgtgaaatactgttaggagatac 284  Q
    || ||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  173396 tgtataggtgaattgctggaaccataaatctctaaaatactgttaggggatac 173344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 170807 - 170692
Alignment:
Q  281 atacgcttggtgtggttgtgcagtacacgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattgg 380  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  170807 atacgcttggtgtggttctgcaatacacattaaggaactcatagtatcctaaaggggattcgcgggtcattcc-tattgcatccaatatacagttattag 170709  T
Q  381 tgggggcgaatcaaacc 397  Q
    ||||||| |||| ||||    
T  170708 tgggggcaaatcgaacc 170692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 307 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 16570 - 16470
Alignment:
Q  307 acgtcaaggaactcatagtatcctgaaggagattcgccggtcattccttattgcatccaatatacagttattggtgggggcgaatcaaacc-aaaggtta 405  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16570 acgtcaaggaactcatagtatcctgaaggggattcgccggtcattcc-tattgcatccaatatacatttattggtgggggcgaatcgaacctaaaggtta 16472  T
Q  406 gt 407  Q
    ||    
T  16471 gt 16470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University