View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5312_low_31 (Length: 334)

Name: NF5312_low_31
Description: NF5312
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5312_low_31
NF5312_low_31
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (1-324)||(183-507)
[»] chr7 (49 HSPs)
chr7 (1-324)||(19992133-19992458)
chr7 (1-324)||(21812178-21812503)
chr7 (1-324)||(24024266-24024591)
chr7 (1-324)||(12406153-12406477)
chr7 (1-324)||(12396733-12397057)
chr7 (1-324)||(31109523-31109846)
chr7 (1-270)||(4866551-4866820)
chr7 (1-324)||(24266141-24266468)
chr7 (1-324)||(24261262-24261589)
chr7 (1-324)||(16879892-16880218)
chr7 (1-324)||(16884748-16885074)
chr7 (22-314)||(20357508-20357801)
chr7 (3-314)||(2057786-2058101)
chr7 (181-275)||(1533445-1533540)
chr7 (181-275)||(18408764-18408859)
chr7 (181-275)||(21639809-21639904)
chr7 (181-275)||(18413641-18413735)
chr7 (181-275)||(21646007-21646102)
chr7 (180-293)||(29159802-29159918)
chr7 (182-265)||(21983285-21983370)
chr7 (180-275)||(46516310-46516408)
chr7 (180-275)||(49091660-49091758)
chr7 (181-275)||(44848685-44848781)
chr7 (180-275)||(2647696-2647794)
chr7 (180-275)||(33332450-33332548)
chr7 (180-263)||(9190021-9190106)
chr7 (180-263)||(20284088-20284173)
chr7 (180-293)||(2580389-2580504)
chr7 (180-275)||(55947-56044)
chr7 (180-264)||(35960815-35960901)
chr7 (180-263)||(9185178-9185263)
chr7 (181-293)||(2479337-2479450)
chr7 (180-275)||(4796667-4796765)
chr7 (181-260)||(47263678-47263757)
chr7 (184-244)||(28617258-28617319)
chr7 (182-265)||(21988909-21988992)
chr7 (185-244)||(31155911-31155971)
chr7 (181-264)||(5817282-5817366)
chr7 (185-244)||(1049296-1049356)
chr7 (22-122)||(1533595-1533694)
chr7 (185-244)||(2935497-2935557)
chr7 (185-244)||(3035953-3036013)
chr7 (185-244)||(7351652-7351712)
chr7 (181-228)||(8153466-8153514)
chr7 (185-244)||(9027194-9027254)
chr7 (185-244)||(22108295-22108355)
chr7 (185-244)||(22137306-22137366)
chr7 (185-244)||(40550055-40550115)
chr7 (185-244)||(40552333-40552393)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (1-324)||(18855547-18855871)
chr4 (1-324)||(3813844-3814168)
chr4 (1-324)||(5732484-5732809)
chr4 (1-324)||(9224346-9224670)
chr4 (3-324)||(51520280-51520603)
chr4 (1-324)||(9229133-9229457)
chr4 (2-311)||(56146664-56146974)
chr4 (1-324)||(45357236-45357560)
chr4 (1-324)||(45347756-45348081)
chr4 (22-324)||(24741784-24742087)
chr4 (3-275)||(29760470-29760737)
chr4 (181-263)||(28468542-28468625)
chr4 (180-275)||(10047378-10047476)
chr4 (180-275)||(39245993-39246091)
chr4 (180-275)||(36315230-36315327)
chr4 (180-275)||(36329439-36329536)
chr4 (181-275)||(31985635-31985730)
chr4 (180-266)||(38152449-38152537)
chr4 (181-293)||(5396654-5396768)
chr4 (180-275)||(16623293-16623391)
chr4 (181-292)||(3796502-3796616)
chr4 (182-265)||(5143260-5143345)
chr4 (180-263)||(5269204-5269289)
chr4 (182-293)||(5147678-5147792)
chr4 (180-266)||(24333808-24333896)
chr4 (182-275)||(3777550-3777645)
chr4 (186-266)||(6743425-6743507)
chr4 (180-275)||(16630680-16630778)
chr4 (180-263)||(25862035-25862120)
chr4 (185-244)||(16931789-16931849)
chr4 (185-244)||(16934143-16934203)
chr4 (185-244)||(22780373-22780433)
chr4 (185-244)||(44599838-44599898)
chr4 (202-275)||(39774305-39774380)
chr4 (180-265)||(54867183-54867269)
chr4 (185-244)||(6765117-6765177)
chr4 (185-244)||(7941596-7941656)
chr4 (185-244)||(18709164-18709224)
chr4 (185-244)||(22782738-22782798)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (1-324)||(44023814-44024137)
chr1 (1-324)||(25445029-25445354)
chr1 (1-324)||(39445320-39445644)
chr1 (1-324)||(1054952-1055276)
chr1 (1-324)||(41398058-41398381)
chr1 (1-324)||(43988401-43988731)
chr1 (78-324)||(41390483-41390726)
chr1 (22-324)||(24787314-24787621)
chr1 (72-275)||(24202770-24202970)
chr1 (1-82)||(41386569-41386650)
chr1 (181-275)||(19358844-19358939)
chr1 (181-275)||(19361433-19361528)
chr1 (181-275)||(19380073-19380168)
chr1 (181-293)||(26644880-26644994)
chr1 (180-266)||(47703946-47704034)
chr1 (181-275)||(19072928-19073025)
chr1 (181-275)||(19120818-19120915)
chr1 (181-293)||(3281708-3281822)
chr1 (180-275)||(16124516-16124614)
chr1 (180-275)||(27104372-27104470)
chr1 (180-266)||(9476260-9476348)
chr1 (180-266)||(13598397-13598485)
chr1 (180-266)||(29651810-29651898)
chr1 (181-273)||(37069770-37069864)
chr1 (180-266)||(775671-775759)
chr1 (181-293)||(21536552-21536666)
chr1 (180-263)||(47098837-47098922)
chr1 (181-275)||(13604624-13604720)
chr1 (180-263)||(32889438-32889523)
chr1 (184-244)||(47102874-47102935)
chr1 (185-244)||(9459419-9459479)
chr1 (185-244)||(9463246-9463306)
chr1 (185-244)||(16226386-16226446)
chr1 (285-324)||(25439836-25439875)
chr1 (185-244)||(23786058-23786118)
chr1 (185-244)||(51752582-51752642)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (1-324)||(28807514-28807839)
chr5 (1-324)||(37556562-37556889)
chr5 (1-324)||(37561384-37561711)
chr5 (3-324)||(43592102-43592425)
chr5 (3-324)||(1457101-1457423)
chr5 (3-324)||(43598547-43598870)
chr5 (3-324)||(43604039-43604362)
chr5 (3-324)||(43609531-43609854)
chr5 (3-324)||(27444793-27445116)
chr5 (3-324)||(27449637-27449960)
chr5 (1-324)||(15044510-15044831)
chr5 (1-324)||(2785195-2785521)
chr5 (1-324)||(33791136-33791462)
chr5 (1-323)||(33767999-33768324)
chr5 (1-324)||(31396930-31397258)
chr5 (3-324)||(30631231-30631553)
chr5 (1-324)||(31401787-31402115)
chr5 (103-324)||(31180138-31180360)
chr5 (181-275)||(38192174-38192269)
chr5 (181-275)||(38219399-38219494)
chr5 (181-275)||(35387663-35387758)
chr5 (181-275)||(24135849-24135944)
chr5 (181-275)||(9353333-9353429)
chr5 (181-275)||(36932351-36932447)
chr5 (181-293)||(10281751-10281866)
chr5 (181-275)||(15464532-15464628)
chr5 (182-275)||(11916972-11917068)
chr5 (181-293)||(14520230-14520344)
chr5 (180-266)||(17003970-17004058)
chr5 (180-275)||(3880298-3880396)
chr5 (184-275)||(12084176-12084269)
chr5 (181-275)||(19588746-19588843)
chr5 (180-263)||(28832258-28832343)
chr5 (180-263)||(42127423-42127508)
chr5 (185-244)||(4410241-4410301)
chr5 (180-260)||(31300612-31300694)
chr5 (185-244)||(15552464-15552524)
chr5 (185-244)||(31179371-31179431)
chr5 (185-244)||(31542953-31543013)
chr5 (185-244)||(31545299-31545359)
chr5 (185-238)||(27910675-27910729)
chr5 (180-263)||(24553520-24553604)
chr5 (185-244)||(3373137-3373197)
chr5 (185-244)||(10749919-10749979)
chr5 (185-244)||(15354575-15354635)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (1-324)||(6438322-6438645)
chr6 (1-324)||(14737516-14737840)
chr6 (1-324)||(14742376-14742699)
chr6 (1-324)||(28155510-28155834)
chr6 (1-324)||(28184323-28184650)
chr6 (1-324)||(22010636-22010960)
chr6 (1-324)||(11856793-11857120)
chr6 (1-324)||(6005237-6005563)
chr6 (1-324)||(16838564-16838890)
chr6 (1-324)||(33330384-33330712)
chr6 (1-324)||(33335881-33336209)
chr6 (1-226)||(5343300-5343527)
chr6 (182-275)||(5674771-5674865)
chr6 (181-293)||(5757461-5757575)
chr6 (181-275)||(21356036-21356132)
chr6 (180-265)||(10077176-10077263)
chr6 (180-275)||(5572241-5572339)
chr6 (180-264)||(31086485-31086571)
chr6 (181-265)||(4629954-4630040)
chr6 (22-129)||(30125940-30126048)
chr6 (180-275)||(31979512-31979610)
chr6 (180-275)||(22963699-22963796)
chr6 (180-275)||(23824597-23824694)
chr6 (193-275)||(21801344-21801429)
chr6 (203-263)||(22709041-22709102)
chr6 (180-263)||(31936586-31936671)
chr6 (202-275)||(18232867-18232942)
chr6 (180-263)||(5017482-5017567)
chr6 (185-244)||(12195515-12195575)
chr6 (185-244)||(4816231-4816291)
chr6 (185-244)||(5273216-5273276)
chr6 (185-244)||(19704567-19704627)
chr6 (185-244)||(20915356-20915416)
chr6 (185-244)||(26932562-26932622)
chr6 (185-244)||(29754709-29754769)
chr6 (185-244)||(33309110-33309170)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (1-324)||(9583-9904)
scaffold0355 (1-153)||(1-145)
scaffold0355 (267-324)||(3788-3845)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (1-324)||(39784763-39785088)
chr8 (1-324)||(25328218-25328542)
chr8 (3-324)||(6311121-6311443)
chr8 (3-324)||(7289865-7290188)
chr8 (1-324)||(35745211-35745537)
chr8 (1-324)||(10684203-10684530)
chr8 (3-324)||(36979205-36979524)
chr8 (22-314)||(33037768-33038060)
chr8 (22-314)||(4760036-4760329)
chr8 (22-324)||(30655484-30655793)
chr8 (22-314)||(18853128-18853422)
chr8 (22-324)||(18870511-18870813)
chr8 (3-314)||(10689104-10689412)
chr8 (181-275)||(1261955-1262050)
chr8 (181-263)||(26287902-26287985)
chr8 (181-263)||(26301159-26301242)
chr8 (181-263)||(26313153-26313236)
chr8 (180-266)||(26403240-26403328)
chr8 (181-275)||(31071230-31071326)
chr8 (181-275)||(4456028-4456124)
chr8 (184-275)||(7412344-7412437)
chr8 (181-275)||(19175755-19175851)
chr8 (180-293)||(23799559-23799675)
chr8 (180-263)||(4696609-4696694)
chr8 (180-275)||(5702483-5702581)
chr8 (184-275)||(6127224-6127318)
chr8 (183-244)||(9765852-9765914)
chr8 (180-263)||(19752407-19752492)
chr8 (185-244)||(43079877-43079937)
chr8 (185-244)||(43082248-43082308)
chr8 (181-247)||(6813683-6813750)
chr8 (211-244)||(18810982-18811015)
chr8 (185-244)||(44721118-44721178)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (1-324)||(39811928-39812252)
chr2 (1-324)||(44312563-44312887)
chr2 (1-324)||(19344241-19344567)
chr2 (1-324)||(19349099-19349425)
chr2 (1-314)||(32246605-32246922)
chr2 (3-324)||(11098877-11099196)
chr2 (22-314)||(14291331-14291624)
chr2 (22-275)||(9296402-9296655)
chr2 (181-275)||(3491751-3491846)
chr2 (181-275)||(25398496-25398591)
chr2 (181-275)||(25403634-25403729)
chr2 (180-266)||(8040059-8040147)
chr2 (181-263)||(40738844-40738926)
chr2 (184-275)||(13569331-13569425)
chr2 (180-275)||(21629943-21630040)
chr2 (181-293)||(28259160-28259274)
chr2 (180-275)||(10445444-10445542)
chr2 (180-275)||(17865202-17865300)
chr2 (180-275)||(20522219-20522317)
chr2 (180-275)||(34682334-34682432)
chr2 (182-275)||(34388859-34388955)
chr2 (182-293)||(10707234-10707348)
chr2 (180-275)||(14699008-14699105)
chr2 (211-275)||(25407653-25407718)
chr2 (184-292)||(8390133-8390244)
chr2 (181-266)||(31056044-31056131)
chr2 (181-293)||(23078453-23078567)
chr2 (180-275)||(33528621-33528719)
chr2 (180-275)||(39482930-39483028)
chr2 (180-266)||(16940219-16940307)
chr2 (180-266)||(17010884-17010972)
chr2 (181-311)||(36757728-36757859)
chr2 (181-275)||(42039670-42039766)
chr2 (180-265)||(33118135-33118222)
chr2 (184-244)||(1345574-1345635)
chr2 (184-244)||(2838063-2838124)
chr2 (185-244)||(35215586-35215646)
chr2 (185-244)||(35217963-35218023)
chr2 (202-264)||(27149306-27149369)
chr2 (184-264)||(2869705-2869787)
chr2 (185-241)||(45332181-45332238)
chr2 (185-244)||(23452237-23452297)
chr2 (185-244)||(36558864-36558924)
chr2 (185-244)||(36561141-36561201)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (1-324)||(22173134-22173458)
chr3 (1-324)||(18656254-18656579)
chr3 (1-324)||(2677026-2677353)
chr3 (1-324)||(2672870-2673197)
chr3 (1-324)||(8512035-8512363)
chr3 (1-324)||(8516915-8517243)
chr3 (3-324)||(7167072-7167391)
chr3 (30-329)||(24967957-24968258)
chr3 (26-324)||(28503814-28504104)
chr3 (1-324)||(32475304-32475629)
chr3 (22-275)||(2671587-2671840)
chr3 (1-324)||(32480161-32480487)
chr3 (1-229)||(10207753-10207983)
chr3 (22-314)||(8739024-8739318)
chr3 (22-314)||(9091262-9091556)
chr3 (163-275)||(40372796-40372908)
chr3 (161-275)||(8477343-8477458)
chr3 (181-275)||(26928592-26928687)
chr3 (181-275)||(1305949-1306044)
chr3 (224-324)||(28501647-28501750)
chr3 (181-275)||(8370477-8370573)
chr3 (181-275)||(27974943-27975039)
chr3 (181-275)||(32143321-32143417)
chr3 (180-275)||(18552873-18552971)
chr3 (181-292)||(16264350-16264463)
chr3 (180-275)||(21711222-21711319)
chr3 (181-275)||(27452958-27453054)
chr3 (181-263)||(27986449-27986533)
chr3 (182-275)||(36029094-36029190)
chr3 (184-275)||(1736295-1736389)
chr3 (181-275)||(30709780-30709877)
chr3 (180-306)||(40592742-40592870)
chr3 (181-263)||(33386669-33386753)
chr3 (180-275)||(3715992-3716090)
chr3 (180-275)||(48438213-48438311)
chr3 (180-275)||(6794704-6794801)
chr3 (180-275)||(26298987-26299085)
chr3 (181-275)||(25795781-25795878)
chr3 (180-275)||(47923896-47923994)
chr3 (180-244)||(1417513-1417578)
chr3 (180-263)||(37466290-37466375)
chr3 (181-263)||(39039995-39040079)
chr3 (180-275)||(40844651-40844748)
chr3 (180-263)||(3328359-3328444)
chr3 (181-247)||(4386947-4387014)
chr3 (180-275)||(24695154-24695252)
chr3 (22-91)||(40372981-40373049)
chr3 (185-244)||(38210569-38210629)
chr3 (185-244)||(50494198-50494258)
chr3 (185-248)||(53894055-53894119)
chr3 (202-263)||(3323693-3323755)
chr3 (185-244)||(458483-458543)
chr3 (185-244)||(6063444-6063504)
chr3 (185-244)||(10621528-10621588)
chr3 (181-228)||(39153357-39153405)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (1-324)||(35001-35325)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-324)||(148895-149221)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-324)||(2190-2516)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (1-324)||(19104-19430)
scaffold0197 (1-324)||(14248-14575)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (1-253)||(181976-182230)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (181-275)||(17953-18048)
scaffold0188 (181-275)||(24046-24141)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (22-213)||(300-491)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (1-82)||(34132-34213)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (1-65)||(13169-13233)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (181-275)||(8420-8516)
scaffold0140 (185-244)||(22343-22403)
scaffold0140 (185-244)||(24618-24678)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (182-275)||(85684-85779)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (181-293)||(43944-44058)
scaffold0087 (181-293)||(36815-36929)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (180-266)||(5682-5770)
scaffold0006 (180-266)||(2491-2579)
scaffold0006 (181-275)||(133281-133377)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (180-275)||(10728-10826)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (181-263)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (184-275)||(17266-17360)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (185-244)||(269-329)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (211-244)||(11500-11533)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (185-244)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: scaffold0464 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 183 - 507
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 282  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  283 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 382  T
Q  200 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagcttaacaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  383 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacaca 481  T
Q  299 tgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  482 tgaacaaaccctagaactaccctttg 507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 49)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 19992133 - 19992458
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19992133 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcttacaacaacaaacagccctaa 19992232  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19992233 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 19992332  T
Q  200 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagcttaacaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19992333 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacaca 19992432  T
Q  299 tgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19992433 tgaacaaaccctagaactaccctttg 19992458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21812503 - 21812178
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21812503 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaacagccctaa 21812404  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21812403 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaagcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 21812304  T
Q  200 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tc-aagcttaacac 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||    
T  21812303 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtg-aagtcttacaaaaggttccaagactctagcttgtcaaagctttacac 21812205  T
Q  298 atgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21812204 atgaacaaaccctagatctaccctttg 21812178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24024591 - 24024266
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  24024591 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcc-ta 24024494  T
Q  100 ag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaa-caccgagcaagattgttgacccagt 197  Q
     | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  24024493 tgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaaacaccgaacaagattgttgacccagt 24024394  T
Q  198 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaacac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24024393 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaatgttacaagactctagccttcaagctttacac 24024294  T
Q  298 atgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  24024293 atgaacaaaccctagattctaccctttg 24024266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 12406153 - 12406477
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12406153 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagcccta 12406251  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 198  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12406252 gactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 12406349  T
Q  199 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  12406350 cagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacac 12406449  T
Q  298 atgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12406450 atgaacaaaccctagattctaccctttg 12406477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 12396733 - 12397057
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12396733 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagcccta 12396831  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 198  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12396832 gactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 12396929  T
Q  199 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||    
T  12396930 cagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagcctttaatctttacac 12397029  T
Q  298 atgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12397030 atgaacaaaccctagattctaccctttg 12397057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31109846 - 31109523
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  31109846 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 31109748  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||| ||||||| |   ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31109747 a-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagtt 31109650  T
Q  199 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaacaca 298  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  31109649 cagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttgcaca 31109550  T
Q  299 tgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31109549 tgaacaaaccctagattctaccctttg 31109523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Original strand, 4866551 - 4866820
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4866551 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtccta 4866649  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 197  Q
      |||||||||||||||| ||||||||| || || ||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4866650 gactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 4866747  T
Q  198 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggtta 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4866748 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 4866820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24266468 - 24266141
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagccc 97  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||     
T  24266468 cttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc- 24266370  T
Q  98 taagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24266369 taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccc 24266273  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24266272 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctt 24266173  T
Q  293 aacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
     ||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  24266172 tacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 24266141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24261589 - 24261262
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagccc 97  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||     
T  24261589 cttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc- 24261491  T
Q  98 taagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24261490 taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccc 24261394  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24261393 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctt 24261294  T
Q  293 aacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
     ||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  24261293 tacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 24261262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 16879892 - 16880218
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagccc 97  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||     
T  16879892 cttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc- 16879990  T
Q  98 taagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16879991 taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccc 16880087  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagctta 293  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||     
T  16880088 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagcttt 16880187  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  16880188 acacaagacaaaaccctagacctaccctttg 16880218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 16884748 - 16885074
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagccc 97  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||     
T  16884748 cttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc- 16884846  T
Q  98 taagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16884847 taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccc 16884943  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagctta 293  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||     
T  16884944 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagcttt 16885043  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  16885044 acacaagacaaaaccctagacctaccctttg 16885074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20357801 - 20357508
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaacc 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  20357801 caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaacc 20357703  T
Q  120 acacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 218  Q
    |||||||||| |||||| |||  || |||||||||   ||| | |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20357702 acacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaataccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaattt 20357606  T
Q  219 gggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctagat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||| |||||  ||||||||    
T  20357605 gggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctttacacaagaacatgccctagat 20357508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 314
Target Start/End: Original strand, 2057786 - 2058101
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaaca--gccctaa 100  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||     
T  2057786 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctag 2057881  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaa----gataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
     || || || ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||    |||||||  |||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  2057882 acttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgaccca 2057980  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagctt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| |||||||||    
T  2057981 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagctt 2058080  T
Q  293 aacacatgaacaaaccctagat 314  Q
     ||||| |||||| ||||||||    
T  2058081 -acacaagaacaagccctagat 2058101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1533540 - 1533445
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1533540 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 1533445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 18408764 - 18408859
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18408764 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 18408859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 21639809 - 21639904
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21639809 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagggttacaaga 21639904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 18413641 - 18413735
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18413641 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 18413735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 21646007 - 21646102
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21646007 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaaga 21646102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 293
Target Start/End: Original strand, 29159802 - 29159918
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaagac 276  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  29159802 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 29159901  T
Q  277 tctagctttcaagctta 293  Q
      |||||| ||||||||    
T  29159902 attagcttacaagctta 29159918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 182 - 265
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983370
Alignment:
Q  182 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaa 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 21983370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 46516408 - 46516310
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  46516408 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 46516310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 49091660 - 49091758
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  49091660 caagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 49091758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848685
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 44848685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2647794 - 2647696
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2647794 caagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 2647696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33332548 - 33332450
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33332548 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 33332450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9190106 - 9190021
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  9190106 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9190021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Original strand, 20284088 - 20284173
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  20284088 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 20284173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 293
Target Start/End: Original strand, 2580389 - 2580504
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagact 277  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||   |||||||||      
T  2580389 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 2580488  T
Q  278 ctagctttcaagctta 293  Q
     |||||| ||||||||    
T  2580489 atagcttgcaagctta 2580504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 55947 - 56044
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  55947 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 56044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 264
Target Start/End: Original strand, 35960815 - 35960901
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaa 264  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  35960815 caagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 9185263 - 9185178
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  9185263 caagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 293
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479450
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 278  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  |||| ||||       
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttataagaaaa 2479435  T
Q  279 tagctttcaagctta 293  Q
    |||||| ||||||||    
T  2479436 tagcttgcaagctta 2479450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4796765 - 4796667
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4796765 caagattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaaga 4796667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 260
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263757
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgtta 260  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga--gcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta 47263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28617319 - 28617258
Alignment:
Q  184 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28617319 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatcca 28617258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 265
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21988992
Alignment:
Q  182 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaa 265  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggag--gagagcaactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaa 21988992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155971
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 5817366 - 5817282
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat-atgtgaaagtgttacaaa 264  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||    
T  5817366 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctactctgggg-agagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgatacaaa 5817282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 1049296 - 1049356
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1049296 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 1049356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1533694 - 1533595
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaacc 119  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||  | |||||||| ||||||||||||  |||||| |  |||||||| ||||| |||    
T  1533694 caaagatgtgtggagcaaaatatagtggtaatcaatgagaaaaaa--gtttccaagc-aacaacaacaaaaccagccccagtctagtgtagagcaacacc 1533598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2935557 - 2935497
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2935557 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 2935497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3036013 - 3035953
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3036013 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 3035953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 7351652 - 7351712
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7351652 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatcca 7351712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8153514 - 8153466
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  8153514 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 8153466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 9027194 - 9027254
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9027194 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatcca 9027254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22108355 - 22108295
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22108355 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22108295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22137366 - 22137306
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22137366 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22137306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40550115 - 40550055
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40550115 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40550055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 40552393 - 40552333
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40552393 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40552333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 18855547 - 18855871
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855547 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 18855646  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855647 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 18855746  T
Q  200 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagcttaacaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18855747 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacaca 18855845  T
Q  299 tgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18855846 tgaacaaaccctagaactaccctttg 18855871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 3813844 - 3814168
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  3813844 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagtccta 3813943  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 198  Q
      ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3813944 gactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccatgcaagattgttgacccagtt 3814042  T
Q  199 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaacaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3814043 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttacaca 3814142  T
Q  299 tgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3814143 tgaacaaaccctagatctaccctttg 3814168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 5732484 - 5732809
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  5732484 cttcacaccaatgaaaata--caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagcccta 5732581  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaa----caccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||    ||| || |||||||||||||||    
T  5732582 agctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgaccc 5732679  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5732680 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttta 5732779  T
Q  295 cacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732780 cacatgaacaaaccctagatctaccctttg 5732809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9224670 - 9224346
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9224670 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta 9224572  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 198  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9224571 gactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 9224474  T
Q  199 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  9224473 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagccttcaagctttacac 9224374  T
Q  298 atgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9224373 atgaacaaaccctagactctaccctttg 9224346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Original strand, 51520280 - 51520603
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||      
T  51520280 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 51520378  T
Q  102 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  51520379 ctagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttct 51520477  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  51520478 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacat 51520577  T
Q  300 gaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  51520578 gaacaaaccctagattctaccctttg 51520603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9229457 - 9229133
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9229457 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta 9229359  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 198  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  9229358 gactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttaacccagtt 9229261  T
Q  199 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  9229260 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagccttcaagctttacac 9229161  T
Q  298 atgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  9229160 atgaacaaaccctagactctaccctttg 9229133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 56146974 - 56146664
Alignment:
Q  2 ttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||     
T  56146974 ttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 56146876  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  56146875 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttggtccagttc 56146777  T
Q  200 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  56146776 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacaca 56146677  T
Q  299 tgaacaaacccta 311  Q
    |||||||||||||    
T  56146676 tgaacaaacccta 56146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45357560 - 45357236
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  45357560 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtccta 45357462  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 197  Q
      |||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45357461 gactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 45357364  T
Q  198 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaacac 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45357363 tcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttacac 45357264  T
Q  298 atgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  45357263 atgaacaaaccctagattctaccctttg 45357236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 45348081 - 45347756
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  45348081 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtccta 45347983  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 197  Q
      |||||||| ||||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45347982 gactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 45347885  T
Q  198 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaaga-ctctagctttcaagcttaaca 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  45347884 tcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagacctctagccttcaagctttaca 45347785  T
Q  297 catgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45347784 catgaacaaaccctagattctaccctttg 45347756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 324
Target Start/End: Original strand, 24741784 - 24742087
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaacc 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  24741784 caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaacc 24741881  T
Q  120 acacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 218  Q
    |||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24741882 acacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 24741978  T
Q  219 gggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctaga-t 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| |    
T  24741979 gggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaaaccctagatt 24742077  T
Q  315 ctaccctttg 324  Q
    ||||||||||    
T  24742078 ctaccctttg 24742087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 275
Target Start/End: Original strand, 29760470 - 29760737
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 101  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |  | |||||| |||||||||| |||||||||| || |||||      
T  29760470 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaataaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaacaaccctaga 29760564  T
Q  102 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29760565 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttca 29760661  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29760662 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 29760737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 28468625 - 28468542
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28468625 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 10047378 - 10047476
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10047378 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10047476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 39245993 - 39246091
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39245993 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 39246091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36315327 - 36315230
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  36315327 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36315230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36329536 - 36329439
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  36329536 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36329439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31985730 - 31985635
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31985730 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 31985635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38152537 - 38152449
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaaagtgttacaaaag 266  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38152537 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396654
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 278  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||||||||       
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaagaaaa 5396669  T
Q  279 tagctttcaagctta 293  Q
    |||||| ||||||||    
T  5396668 tagcttgcaagctta 5396654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16623391 - 16623293
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16623391 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16623293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796502
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaagact 277  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||      
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 3796517  T
Q  278 ctagctttcaagctt 292  Q
     |||||| |||||||    
T  3796516 ttagcttacaagctt 3796502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 182 - 265
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143345
Alignment:
Q  182 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaa 265  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaa 5143345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5269289 - 5269204
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5269289 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147792
Alignment:
Q  182 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaa-ggttacaagactc 278  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||       
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaaa 5147777  T
Q  279 tagctttcaagctta 293  Q
    |||||| ||||||||    
T  5147778 tagcttgcaagctta 5147792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Original strand, 24333808 - 24333896
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    |||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  24333808 caagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 182 - 275
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777645
Alignment:
Q  182 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 3777645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743425
Alignment:
Q  186 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16630778 - 16630680
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16630778 caaggttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16630680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25862120 - 25862035
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25862120 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagagagcggccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 25862035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931849
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16931849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934203
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16934203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780433
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22780433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599898
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 44599898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 39774380 - 39774305
Alignment:
Q  202 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat-atgtgaaagtgttacaaa-aggttacaaga 275  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |  |||||||| |||||| |||||||||||    
T  39774380 ccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaataggttacaaga 39774305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 180 - 265
Target Start/End: Original strand, 54867183 - 54867269
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaa 265  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||| | |||| ||||| ||||||||||    
T  54867183 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtct-ggggagagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaaa 54867269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6765177 - 6765117
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6765177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6765117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7941656 - 7941596
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7941656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 7941596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 18709164 - 18709224
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18709164 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatcca 18709224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 22782738 - 22782798
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782738 ttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22782798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44024137 - 44023814
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44024137 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 44024038  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44024037 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaatggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 44023938  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagcttaacacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44023937 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttgtcaagctttacacat 44023839  T
Q  300 gaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  44023838 gaacaaaccctagaactaccctttg 44023814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25445354 - 25445029
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445354 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 25445255  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445254 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 25445155  T
Q  200 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagcttaacaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25445154 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacaca 25445055  T
Q  299 tgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25445054 tgaacaaaccctagagctaccctttg 25445029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 39445320 - 39445644
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445320 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 39445419  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39445420 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 39445519  T
Q  200 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagcttaacaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  39445520 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacaca 39445618  T
Q  299 tgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  39445619 tgaacaaaccctagaactaccctttg 39445644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1055276 - 1054952
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  1055276 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtcttccaagcttacaacaacaaacagccctaa 1055177  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1055176 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 1055077  T
Q  200 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagcttaacaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1055076 agccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttacaca 1054978  T
Q  299 tgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1054977 tgaacaaaccctagaactaccctttg 1054952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 41398058 - 41398381
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaa----acagcc 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    ||||||    
T  41398058 cttcacaccaatgaaataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctccaagcaaacaacaacaacaaaacagcc 41398157  T
Q  97 ctaagctagtgtatagcaaaa--ccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacc 193  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||     |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41398158 ctaa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-----aaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacc 41398249  T
Q  194 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctta 293  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  41398250 caggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagcttt 41398349  T
Q  294 acacatgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41398350 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 41398381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43988731 - 43988401
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  43988731 cttcacgccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 43988633  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcg-gtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 196  Q
    |||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  | | || |  | |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  43988632 aagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgtttacccag 43988533  T
Q  197 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagcttaa 294  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  43988532 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagcttta 43988433  T
Q  295 cacatg--aacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  43988432 cacaagacaaaaaaccctagatctaccctttg 43988401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 78 - 324
Target Start/End: Original strand, 41390483 - 41390726
Alignment:
Q  78 caaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaa--ccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaac 173  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||     |||||| |||||||||    
T  41390483 caaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag-----aaggaa-gaacaaaac 41390575  T
Q  174 accgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaa 273  Q
    | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41390576 atcgag-aagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 41390674  T
Q  274 gactctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41390675 gactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 41390726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24787621 - 24787314
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaa-----acaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaa 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||||     ||||||| |||||||||||  ||  |||| ||||||    
T  24787621 caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagcaaa 24787523  T
Q  117 accacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaa 215  Q
    ||||||||||||| |||||| |||  || |||||||||   ||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787522 accacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaa 24787426  T
Q  216 tctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctaga 313  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||    
T  24787425 tctgggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcattacacaagaacaaatcctaga 24787326  T
Q  314 -tctaccctttg 324  Q
     |||||||||||    
T  24787325 ttctaccctttg 24787314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24202970 - 24202770
Alignment:
Q  72 tccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaa 170  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||  ||  ||||  ||| |||||||||   ||||| ||||||||    
T  24202970 tccaagcaaacaacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacaccaca-agaga-atacaaagc--aaacaagataagcaagaaagg-aagaacaa 24202876  T
Q  171 a-acaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggt 268  Q
    | ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||    
T  24202875 acacacc-aaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggt 24202777  T
Q  269 tacaaga 275  Q
    |||||||    
T  24202776 tacaaga 24202770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Original strand, 41386569 - 41386650
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41386569 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 41386650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19358939 - 19358844
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19358939 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 19358844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19361528 - 19361433
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19361528 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 19361433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19380168 - 19380073
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19380168 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 19380073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 181 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644880
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 278  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||       
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 26644895  T
Q  279 tagctttcaagctta 293  Q
    |||||| ||||||||    
T  26644894 tagcttgcaagctta 26644880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47704034 - 47703946
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  47704034 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 47703946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073025
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19073025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120915
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19120915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 293
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281822
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 278  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||||       
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 3281807  T
Q  279 tagctttcaagctta 293  Q
    |||||| ||||||||    
T  3281808 tagcttgcaagctta 3281822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 16124614 - 16124516
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  16124614 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16124516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27104470 - 27104372
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27104470 caagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 27104372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Original strand, 9476260 - 9476348
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  9476260 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaag 9476348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Original strand, 13598397 - 13598485
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  13598397 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Original strand, 29651810 - 29651898
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  29651810 caagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 273
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069864
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaa 273  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa 37069864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Original strand, 775671 - 775759
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  775671 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21536666 - 21536552
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaata-tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 278  Q
    ||||||||||||||||||| |  || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||       
T  21536666 aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 21536567  T
Q  279 tagctttcaagctta 293  Q
    |||||| ||||||||    
T  21536566 tagcttgcaagctta 21536552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 47098922 - 47098837
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  47098922 caagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 47098837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604624
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaaga 13604624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Original strand, 32889438 - 32889523
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  32889438 caagattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 32889523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 47102935 - 47102874
Alignment:
Q  184 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  47102935 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatcca 47102874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459479
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9459479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463306
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9463306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226386
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16226386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 285 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25439875 - 25439836
Alignment:
Q  285 tcaagcttaacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25439875 tcaagctttacacatgaacaaaccctagagctaccctttg 25439836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 23786118 - 23786058
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23786118 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 23786058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 51752642 - 51752582
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51752642 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 51752582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28807839 - 28807514
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807839 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 28807740  T
Q  101 gctagtgtatagc--aaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 197  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28807739 gctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 28807640  T
Q  198 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaacac 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  28807639 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagaatctagctttcaagctttacac 28807541  T
Q  298 atgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28807540 atgaacaaaccctagatctaccctttg 28807514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37556889 - 37556562
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  37556889 cttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 37556791  T
Q  99 aag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 196  Q
    | | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556790 atgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 37556691  T
Q  197 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagcttaac 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  37556690 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagctttac 37556591  T
Q  296 acatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37556590 acatgaacaaaccctagaactaccctttg 37556562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37561711 - 37561384
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  37561711 cttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 37561613  T
Q  99 aag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 196  Q
    | | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37561612 atgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 37561513  T
Q  197 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagcttaac 295  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||    
T  37561512 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagctttac 37561413  T
Q  296 acatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37561412 acatgaacaaaccctagaactaccctttg 37561384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Original strand, 43592102 - 43592425
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 101  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||      
T  43592102 tcacatcaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 43592200  T
Q  102 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43592201 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 43592299  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  43592300 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacat 43592399  T
Q  300 gaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  43592400 gaacaaaccctagattctaccctttg 43592425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1457423 - 1457101
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||      
T  1457423 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 1457325  T
Q  102 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1457324 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 1457227  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacacat 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  1457226 gccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacat 1457127  T
Q  300 gaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  1457126 gaacaaaccctagattctaccctttg 1457101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Original strand, 43598547 - 43598870
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||      
T  43598547 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 43598645  T
Q  102 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  43598646 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttggtccagttca 43598744  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  43598745 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacat 43598844  T
Q  300 gaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  43598845 gaacaaaccctagattctaccctttg 43598870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Original strand, 43604039 - 43604362
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||      
T  43604039 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 43604137  T
Q  102 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  43604138 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttggtccagttca 43604236  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  43604237 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacat 43604336  T
Q  300 gaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  43604337 gaacaaaccctagattctaccctttg 43604362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Original strand, 43609531 - 43609854
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||||      
T  43609531 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 43609629  T
Q  102 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  43609630 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttggtccagttca 43609728  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  43609729 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacat 43609828  T
Q  300 gaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  43609829 gaacaaaccctagattctaccctttg 43609854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Original strand, 27444793 - 27445116
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||      
T  27444793 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctaga 27444891  T
Q  102 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27444892 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 27444990  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacacat 299  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  27444991 ggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacat 27445090  T
Q  300 gaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  27445091 gaacaaaccctagattctaccctttg 27445116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Original strand, 27449637 - 27449960
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||      
T  27449637 tcacaccaatgaaataaac-aatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctaga 27449735  T
Q  102 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27449736 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 27449834  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacacat 299  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  27449835 gccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacat 27449934  T
Q  300 gaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  27449935 gaacaaaccctagattctaccctttg 27449960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 15044510 - 15044831
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||   ||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  15044510 cttcacaccaatgaaata---caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagcccta 15044606  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 198  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||| |||||||||   ||| | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  15044607 gactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagtt 15044704  T
Q  199 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaacaca 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15044705 cagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttacaca 15044804  T
Q  299 tgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  15044805 tgaacaaaccctagattctaccctttg 15044831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 2785195 - 2785521
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  2785195 cttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 2785293  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaagg--aaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2785294 aagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 2785390  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-tttcaagctta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||     
T  2785391 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagcttt 2785490  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2785491 actcatgaacaaaccctagacctaccctttg 2785521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 33791136 - 33791462
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  33791136 cttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 33791234  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaagg--aaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    |||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||||| || |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33791235 aagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcataca--agataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 33791331  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-tttcaagctta 293  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||     
T  33791332 gttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagcttt 33791431  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33791432 acacatgaacaaaccctagacctaccctttg 33791462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 323
Target Start/End: Original strand, 33767999 - 33768324
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccct 98  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| | ||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  33767999 cttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaacag-cct 33768097  T
Q  99 aag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaa--ggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||  ||||| || ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33768098 aagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcatacag--gataaacgataaaaggaaaagaac-aaacaccgagcaagattgttgaccca 33768194  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-tttcaagctta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||     
T  33768195 gttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagcttt 33768294  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctacccttt 323  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33768295 acacatgaacaaaccctagacctacccttt 33768324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31397258 - 31396930
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagcccta 99  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||    ||||    
T  31397258 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacatccta 31397159  T
Q  100 agc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaagaaca-aaacaccgagcaagattgttgacccagt 197  Q
    ||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397158 agcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaagaaaacaaacaaacaccgagcaagattgttgacccagt 31397061  T
Q  198 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagcttaac 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  31397060 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctttac 31396961  T
Q  296 acatg--aacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  31396960 acaagacaaaaaaccctagatctaccctttg 31396930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Original strand, 30631231 - 30631553
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 101  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||      
T  30631231 tcacacaaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagcaa-caacaacaaaacagccctaga 30631328  T
Q  102 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    |||||||||||||||| |||| | | || |||||| ||||||| ||||||||    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  30631329 ctagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgactcagttca 30631426  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacaca 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  30631427 gccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacaca 30631526  T
Q  299 tgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||    
T  30631527 tgaacaaaccatagattctaccctttg 30631553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 31402115 - 31401787
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  31402115 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 31402017  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    |||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31402016 aagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 31401920  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctta 293  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||     
T  31401919 gttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagcttt 31401820  T
Q  294 acacatg--aacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||| |  || |||| ||||||||||||||||    
T  31401819 acacaagacaaaaaactctagatctaccctttg 31401787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 103 - 324
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180360
Alignment:
Q  103 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaac-aagcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||    ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-gaaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcag 31180235  T
Q  202 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||     
T  31180236 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaa 31180335  T
Q  300 gaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  31180336 g-acaaaccctagattctaccctttg 31180360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 38192174 - 38192269
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38192174 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 38192269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 38219399 - 38219494
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  38219399 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 38219494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 35387663 - 35387758
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  35387663 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 35387758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 24135849 - 24135944
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24135849 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgttacaaagggttacaaga 24135944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353333
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 9353333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932351
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36932351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 293
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281866
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaagact 277  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||      
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 10281850  T
Q  278 ctagctttcaagctta 293  Q
     |||||| ||||||||    
T  10281851 ttagcttacaagctta 10281866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464628
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 15464628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916972
Alignment:
Q  182 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 11916972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 181 - 293
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520344
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 278  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||       
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 14520329  T
Q  279 tagctttcaagctta 293  Q
    |||||| ||||||||    
T  14520330 tagcttgcaagctta 14520344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17004058 - 17003970
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  17004058 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaag 17003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 3880298 - 3880396
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3880298 caagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3880396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 184 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12084176
Alignment:
Q  184 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 12084176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588843
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19588843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Original strand, 28832258 - 28832343
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  28832258 caagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 28832343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 42127508 - 42127423
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || | ||||||||||||||    
T  42127508 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaa 42127423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410241
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 4410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 31300694 - 31300612
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgtta 260  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||    
T  31300694 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatccactaagatgaaagtgtta 31300612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552464
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 15552464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179431
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31179431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542953
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31542953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545299
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31545299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910675
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 238  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27910675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 24553604 - 24553520
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| || | ||||||||||||||    
T  24553604 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagcagc-ctccactccactaagatgaaagtgttacaa 24553520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 3373137 - 3373197
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3373137 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 3373197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 10749979 - 10749919
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10749979 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 10749919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 15354575 - 15354635
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15354575 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 15354635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 6438322 - 6438645
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6438322 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaa 6438420  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggt-aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6438421 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgtcccagttc 6438520  T
Q  200 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagcttaacaca 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6438521 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttgtcaagctttacaca 6438619  T
Q  299 tgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  6438620 tgaacaaaccctagaactaccctttg 6438645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14737840 - 14737516
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14737840 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta 14737742  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaa-gagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 197  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14737741 gactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgatccagt 14737644  T
Q  198 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaacac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  14737643 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacat 14737544  T
Q  298 atgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14737543 atgaacaaaccctagattctaccctttg 14737516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14742699 - 14742376
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14742699 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagcccta 14742601  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 198  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14742600 gactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 14742503  T
Q  199 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaacaca 298  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  14742502 cagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacata 14742403  T
Q  299 tgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14742402 tgaacaaaccctagattctaccctttg 14742376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28155834 - 28155510
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  28155834 cttcacaccaatgcaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 28155737  T
Q  100 ag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 197  Q
     | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28155736 tgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagt 28155637  T
Q  198 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaacac 297  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  28155636 tcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaatttagctttcaagctttacac 28155537  T
Q  298 atgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  28155536 atgaacaaaccctagatctaccctttg 28155510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 28184323 - 28184650
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaa--tggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccc 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  28184323 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccc 28184422  T
Q  98 taagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaag-gaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28184423 tagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgaccca 28184520  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaac 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  28184521 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaacactctagccttcaagctttac 28184620  T
Q  296 acatgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28184621 acatgaacaaaccctagattctaccctttg 28184650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22010960 - 22010636
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22010960 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgcccta 22010862  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 198  Q
      | |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22010861 gacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 22010764  T
Q  199 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  22010763 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacac 22010664  T
Q  298 atgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22010663 atgaacaaaccctagattctaccctttg 22010636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 11856793 - 11857120
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11856793 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta 11856891  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaa---caccgagcaagattgttgaccca 195  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||| ||||| |||| | ||||||||||   |||| || |||||||||||||||    
T  11856892 gactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaaaaaaacaccaag-aagattgttgaccca 11856989  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |    
T  11856990 gttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagcttta 11857089  T
Q  295 cacatgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11857090 cacatgaacaaaccctagattctaccctttg 11857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 6005237 - 6005563
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  6005237 cttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 6005335  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaagg--aaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6005336 aagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 6005432  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-tttcaagctta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||     
T  6005433 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagcttt 6005532  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6005533 acacatgaacaaaccctagacctaccctttg 6005563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 16838564 - 16838890
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |    
T  16838564 cttcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagcc-t 16838662  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16838663 aagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 16838759  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagct-ttcaagctta 293  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||     
T  16838760 gttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagcttt 16838859  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838860 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 16838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33330712 - 33330384
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  33330712 cttcacaccaattagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 33330614  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggt--aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    |||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |  |  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  33330613 aagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcataac-aagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgaccc 33330516  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  33330515 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctt 33330416  T
Q  293 aacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33330415 tacacatgacaaaaccctagatctaccctttg 33330384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33336209 - 33335881
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  33336209 cttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaaactaacaacaacaaaacagcc-t 33336111  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggt--aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |  |  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  33336110 aagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaagcataac-aagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgaccc 33336013  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctt 292  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  33336012 agttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctt 33335913  T
Q  293 aacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33335912 tacacatgacaaaaccctagatctaccctttg 33335881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 5343300 - 5343527
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  5343300 cttcacaccaatgagaataagtcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 5343398  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5343399 aagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgaccc 5343495  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggaga 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5343496 agttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5674865 - 5674771
Alignment:
Q  182 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  5674865 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 5674771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 181 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757461
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 278  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||       
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 5757476  T
Q  279 tagctttcaagctta 293  Q
    |||||| ||||||||    
T  5757475 tagcttgcaagctta 5757461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356132
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttactaagagttacaaga 21356132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10077263 - 10077176
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaa 265  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10077263 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 10077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5572339 - 5572241
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5572339 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 5572241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 31086571 - 31086485
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaa 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  31086571 caagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 31086485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 265
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630040
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaa 265  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaa 4630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 22 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 30126048 - 30125940
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaacc 119  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||||  ||||||| ||| ||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  30126048 caaagatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgagc-caaatggtctccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaacc 30125950  T
Q  120 acacaaagag 129  Q
    ||||||||||    
T  30125949 acacaaagag 30125940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 31979512 - 31979610
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||||    
T  31979512 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaaga 31979610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 22963699 - 22963796
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22963699 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 22963796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 23824694 - 23824597
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23824694 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 23824597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801344
Alignment:
Q  193 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaaga 21801344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 263
Target Start/End: Original strand, 22709041 - 22709102
Alignment:
Q  203 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22709041 caatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Original strand, 31936586 - 31936671
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat-atgtgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  31936586 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgttacaa 31936671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 275
Target Start/End: Original strand, 18232867 - 18232942
Alignment:
Q  202 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18232867 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 18232942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 5017567 - 5017482
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  5017567 caagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195575
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 12195575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 4816231 - 4816291
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4816231 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 4816291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 5273216 - 5273276
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5273216 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 5273276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 19704567 - 19704627
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19704567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 19704627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 20915356 - 20915416
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20915356 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 20915416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 26932562 - 26932622
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26932562 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 26932622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 29754709 - 29754769
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29754709 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 29754769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33309170 - 33309110
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33309170 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 33309110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9583
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  9904 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagcccta 9805  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9804 agctagtatatagcaaaaccacacaa-gagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttc 9708  T
Q  200 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaacacat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9707 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacacat 9608  T
Q  300 gaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9607 gaacaaaccctagatctaccctttg 9583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 145 - 1
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  145 cttcacaccaattaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagcccta 52  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagc 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  51 agctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaacaagcataaacaagataagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 267 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 3845 - 3788
Alignment:
Q  267 gttacaagactctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3845 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 3788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39785088 - 39784763
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  39785088 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagcccta 39784989  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaa-ggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39784988 agctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 39784890  T
Q  198 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagcttaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  39784889 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaagactctagcttatcaagctttaca 39784791  T
Q  297 catgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39784790 catgaacaaaccctagaactaccctttg 39784763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 25328542 - 25328218
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  25328542 cttcacaacaatgaaataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaacccta 25328443  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaag-cataaagaagataagcggtaaaggaaa-gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagt 197  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| || |||  ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25328442 a-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagt 25328346  T
Q  198 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaacac 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25328345 tcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacac 25328246  T
Q  298 atgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25328245 atgaacaaaccctagattctaccctttg 25328218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Original strand, 6311121 - 6311443
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  6311121 tcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctaga 6311219  T
Q  102 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6311220 ctagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 6311317  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  6311318 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacaca 6311417  T
Q  299 tgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
     | |||||||||||| |||||||||||    
T  6311418 ag-acaaaccctagattctaccctttg 6311443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7290188 - 7289865
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 101  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||      
T  7290188 tcacaccaatgaaataaac-attgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaaacaacaacaaagcagccctaga 7290090  T
Q  102 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagc-ataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| | |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7290089 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttca 7289991  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacacat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  7289990 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacacat 7289891  T
Q  300 gaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||| | |||||||||||    
T  7289890 gaacaaaccctatattctaccctttg 7289865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 35745211 - 35745537
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  35745211 cttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 35745309  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaagg--aaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35745310 aagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 35745406  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-tttcaagctta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||     
T  35745407 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagcttt 35745506  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35745507 acacatgaacaaaccctagacctaccctttg 35745537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10684530 - 10684203
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagccc 97  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||     
T  10684530 cttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc- 10684432  T
Q  98 taagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10684431 taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccc 10684335  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  10684334 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctt 10684235  T
Q  293 aacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
     ||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  10684234 tacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 10684203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Original strand, 36979205 - 36979524
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa--cagccctaa 100  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||     
T  36979205 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctag 36979299  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 199  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  36979300 actagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttc 36979396  T
Q  200 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| |||    
T  36979397 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-aca 36979495  T
Q  297 catgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||    
T  36979496 caagaacaaaccctagattctaccctttg 36979524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33038060 - 33037768
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaa--acaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaacc 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  33038060 caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaacc 33037962  T
Q  120 acacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 218  Q
    |||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||   ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037961 acacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaagaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 33037865  T
Q  219 gggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctagat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33037864 gggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaaaccctagat 33037768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 4760329 - 4760036
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaacc 119  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  4760329 caaagatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaacc 4760232  T
Q  120 acacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 218  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4760231 acacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacatcaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatat 4760134  T
Q  219 gggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctagat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  4760133 gggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaagccctagat 4760036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 324
Target Start/End: Original strand, 30655484 - 30655793
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaa--acaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaacc 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  30655484 caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaacaacaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaacc 30655582  T
Q  120 acacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaa----caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggccta 214  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||||| ||||||||    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655583 acacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaaaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggccta 30655680  T
Q  215 atctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacacatgaacaaacccta 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  30655681 atctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaaacccta 30655779  T
Q  312 ga-tctaccctttg 324  Q
    || |||||||||||    
T  30655780 gattctaccctttg 30655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18853422 - 18853128
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaaca--gccctaagctagtgtatagcaaaacc 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||  || || || |||||||||    
T  18853422 caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaacc 18853324  T
Q  120 acacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 218  Q
    |||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853323 acacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 18853227  T
Q  219 gggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaaagtgttacaaaa-ggttacaag--actctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctagat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18853226 gggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagctt-acacaagaacaaaccctagat 18853128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 18870813 - 18870511
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccac 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  || || || |||||||||||    
T  18870813 caaagatgtgtggagcaagagataatggtaatctatgagtt-aaatggtttccaagcaaacaacaaaaaac-gccctagacttgtttagagcaaaaccac 18870716  T
Q  122 acaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 220  Q
    |||||||| || ||| ||| ||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18870715 acaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgg 18870619  T
Q  221 gggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaaagtgttacaaaa-ggttacaag--actctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctaga-tc 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  18870618 gggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagctt-acacaagaacaaaccctagattc 18870520  T
Q  316 taccctttg 324  Q
    |||||||||    
T  18870519 taccctttg 18870511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 3 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10689412 - 10689104
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa--cagccctaa 100  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||||||| ||||||||||  || |||||     
T  10689412 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-ctaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacaaccctag 10689318  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 199  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10689317 tgtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttc 10689221  T
Q  200 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||  |||| ||||||||| |||    
T  10689220 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-aca 10689122  T
Q  297 catgaacaaaccctagat 314  Q
    || |||||| ||||||||    
T  10689121 caagaacaagccctagat 10689104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1262050 - 1261955
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1262050 aagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 1261955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Original strand, 26287902 - 26287985
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26287902 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Original strand, 26301159 - 26301242
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26301159 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Original strand, 26313153 - 26313236
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26313153 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26403328 - 26403240
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26403328 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31071326 - 31071230
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  31071326 aagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 31071230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456124
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 4456124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 275
Target Start/End: Original strand, 7412344 - 7412437
Alignment:
Q  184 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  7412344 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 7412437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175755
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 19175755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23799675 - 23799559
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaagac 276  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  23799675 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 23799576  T
Q  277 tctagctttcaagctta 293  Q
      |||||| ||||||||    
T  23799575 attagcttacaagctta 23799559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 4696694 - 4696609
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  4696694 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5702581 - 5702483
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  5702581 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 5702483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 275
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127318
Alignment:
Q  184 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 6127318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  183 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19752492 - 19752407
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  19752492 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 19752407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079877
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082248
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43082248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Original strand, 6813683 - 6813750
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 247  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6813683 aagattgttaacccagttcggtccaatataacctacactaggggagagagcagctctccaatccaata 6813750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18811015 - 18810982
Alignment:
Q  211 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18811015 cctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 18810982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 44721178 - 44721118
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44721178 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatcca 44721118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 39812252 - 39811928
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  39812252 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagcccta 39812153  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39812152 agctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgaaccagtt 39812055  T
Q  199 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaacaca 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39812054 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagccttcaagctttacaca 39811955  T
Q  299 tgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  39811954 tgaacaaaccctagattctaccctttg 39811928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 44312887 - 44312563
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44312887 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgcccta 44312789  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 198  Q
      | |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44312788 gacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 44312691  T
Q  199 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  44312690 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacac 44312591  T
Q  298 atgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  44312590 atgaacaaaccctagattctaccctttg 44312563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 19344241 - 19344567
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  19344241 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 19344339  T
Q  100 agc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaagg--aaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 196  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19344340 agcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 19344437  T
Q  197 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-tttcaagcttaa 294  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  19344438 ttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagcttta 19344537  T
Q  295 cacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19344538 cacatgaacaaaccctagacctaccctttg 19344567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 19349099 - 19349425
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  19349099 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-ta 19349197  T
Q  100 agc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaagg--aaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 196  Q
    ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19349198 agcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaaggaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 19349295  T
Q  197 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-tttcaagcttaa 294  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  19349296 ttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaagcttta 19349395  T
Q  295 cacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19349396 cacatgaacaaaccctagacctaccctttg 19349425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 314
Target Start/End: Original strand, 32246605 - 32246922
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  32246605 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagtccta 32246704  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaa---agaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||| |||||||||   |||  ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  32246705 gactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacctt 32246803  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaac 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32246804 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagctttac 32246903  T
Q  296 acatgaacaaaccctagat 314  Q
    |||||||||||||||||||    
T  32246904 acatgaacaaaccctagat 32246922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 11099196 - 11098877
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa--cagccctaa 100  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||     
T  11099196 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaaca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctag 11099102  T
Q  101 gctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttc 199  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||    ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11099101 actagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataaggaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttc 11099005  T
Q  200 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaaca 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||||| |||    
T  11099004 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagctt-aca 11098906  T
Q  297 catgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||    
T  11098905 caagaacaaaccctagattctaccctttg 11098877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Original strand, 14291331 - 14291624
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaacc 119  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  14291331 caaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaacc 14291429  T
Q  120 acacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 218  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291430 acacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 14291526  T
Q  219 gggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctagat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  14291527 gggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaagccctagat 14291624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 9296655 - 9296402
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaacc 119  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||||||||    
T  9296655 caaagatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaacc 9296557  T
Q  120 acacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 218  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| |||| ||||   ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9296556 acacaaagagataacaaagca-aaacaagaaaagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaattt 9296460  T
Q  219 gggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9296459 gggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 9296402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 3491751 - 3491846
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  3491751 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 3491846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 25398496 - 25398591
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25398496 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 25398591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 25403634 - 25403729
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25403634 aagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 25403729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Original strand, 8040059 - 8040147
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  8040059 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 8040147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Original strand, 40738844 - 40738926
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40738844 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 275
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569425
Alignment:
Q  184 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 13569425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 21629943 - 21630040
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21629943 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 21630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259160
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 278  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||       
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 28259175  T
Q  279 tagctttcaagctta 293  Q
    |||||| ||||||||    
T  28259174 tagcttgcaagctta 28259160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 10445542 - 10445444
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata-tgtgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10445542 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10445444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 17865202 - 17865300
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17865202 caagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 17865300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 20522219 - 20522317
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaa-ggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20522219 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaaga 20522317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 34682432 - 34682334
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34682432 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 34682334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 182 - 275
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388955
Alignment:
Q  182 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 34388955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 182 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707234
Alignment:
Q  182 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaagactc 278  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||       
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat 10707249  T
Q  279 tagctttcaagctta 293  Q
    |||||| ||||||||    
T  10707248 tagcttacaagctta 10707234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14699105 - 14699008
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  14699105 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaaga 14699008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407718
Alignment:
Q  211 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 25407718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390133
Alignment:
Q  184 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaagactcta 280  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||   ||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaagaaatta 8390145  T
Q  281 gctttcaagctt 292  Q
    |||| |||||||    
T  8390144 gcttacaagctt 8390133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 266
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056131
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 31056131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23078567 - 23078453
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 278  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||| |||  |||||||||       
T  23078567 aagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttagaaagagttacaagaaaa 23078468  T
Q  279 tagctttcaagctta 293  Q
    |||||| ||||||||    
T  23078467 tagcttgcaagctta 23078453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 33528719 - 33528621
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  33528719 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 33528621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 39482930 - 39483028
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  39482930 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaaga 39483028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16940307 - 16940219
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16940307 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16940219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17010972 - 17010884
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17010972 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17010884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36757859 - 36757728
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 278  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||  |||| ||||       
T  36757859 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaaagtgtttcaaagagttataagaaaa 36757760  T
Q  279 tagctttcaagcttaacacatgaacaaacccta 311  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  36757759 aagctttcaagctt-acacaagaacaaaaccta 36757728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039670
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttacgaagagttacaaga 42039670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 265
Target Start/End: Original strand, 33118135 - 33118222
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaa 265  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  33118135 caagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaa 33118222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1345635 - 1345574
Alignment:
Q  184 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1345635 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatcca 1345574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 184 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 2838124 - 2838063
Alignment:
Q  184 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2838124 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatcca 2838063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215646
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35215646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218023
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35218023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 202 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27149369 - 27149306
Alignment:
Q  202 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaaagtgttacaaa 264  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||||    
T  27149369 ccaatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgatacaaa 27149306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 2869787 - 2869705
Alignment:
Q  184 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaa 264  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  2869787 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 2869705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Original strand, 45332181 - 45332238
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 241  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45332181 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaat 45332238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 23452237 - 23452297
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23452237 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 23452297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 36558864 - 36558924
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36558864 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36558924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 36561141 - 36561201
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36561141 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36561201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 22173458 - 22173134
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22173458 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta 22173360  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 198  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22173359 gactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 22173262  T
Q  199 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  22173261 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagctttacac 22173162  T
Q  298 atgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22173161 atgaacaaaccctagattctaccctttg 22173134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 18656254 - 18656579
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18656254 cttcacaccaatgaaaata--caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagcccta 18656351  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaa----caccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||    ||| || |||||||||||||||    
T  18656352 agctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgttgaccc 18656449  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctttcaagcttaa 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18656450 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcattcaagcttta 18656549  T
Q  295 cacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656550 cacatgaacaaaccctagatctaccctttg 18656579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2677353 - 2677026
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  2677353 cttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 2677255  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggt--aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |  |  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2677254 aagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataac-aagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgaccca 2677157  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||     
T  2677156 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagcttt 2677057  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2677056 acacatgacaaaaccctagatctaccctttg 2677026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2673197 - 2672870
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  2673197 cttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 2673099  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggt--aaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |  |  |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2673098 aagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataac-aagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttgaccca 2673001  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||     
T  2673000 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagcttt 2672901  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  2672900 acacatgacaaaaccctagatctaccctttg 2672870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 8512035 - 8512363
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  8512035 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 8512133  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataag-cggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    |||| || ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512134 aagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcataca--agataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 8512231  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8512232 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctt 8512331  T
Q  293 aacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
     ||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  8512332 tacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 8512363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 8516915 - 8517243
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  8516915 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 8517013  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataag-cggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    |||| || ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||  || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8517014 aagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcataca--agataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 8517111  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8517112 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctt 8517211  T
Q  293 aacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
     ||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  8517212 tacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 8517243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 324
Target Start/End: Original strand, 7167072 - 7167391
Alignment:
Q  3 tcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaag 101  Q
    |||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||      
T  7167072 tcacaccaatgaaaaa---caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaacagccctaga 7167166  T
Q  102 ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttca 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7167167 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttca 7167264  T
Q  201 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||    
T  7167265 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acac 7167363  T
Q  298 atgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||    
T  7167364 aagaacaaaccctagattctaccctttg 7167391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 329
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968258
Alignment:
Q  30 tgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaag 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaag 24968055  T
Q  128 agctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggag 225  Q
    |||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||    
T  24968056 agctaacaagcataca--agataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggag 24968152  T
Q  226 agagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagct-ttcaagcttaacacatgaacaaaccctagatctacccttt 323  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24968153 agagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaacccgagatctacccttt 24968252  T
Q  324 gctact 329  Q
    | ||||    
T  24968253 ggtact 24968258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28504104 - 28503814
Alignment:
Q  26 gatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacaca 124  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  28504104 gatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaaccacaca 28504007  T
Q  125 aagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggg 223  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||         |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28504006 aagagataacaaagcataaacaaga---------aaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggga 28503918  T
Q  224 agagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctaga-tctaccc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  28503917 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28503818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 32475304 - 32475629
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagccc 97  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||| | || |||||||||| |||||     
T  32475304 cttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacagcc- 32475402  T
Q  98 taagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32475403 taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccc 32475499  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagctta 293  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||     
T  32475500 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagcttt 32475598  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  32475599 acacaagacaaaaccctagacctaccctttg 32475629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 2671840 - 2671587
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa--cagccctaagctagtgtatagcaaaacc 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| || ||||||    
T  2671840 caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaacc 2671742  T
Q  120 acacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 218  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671741 acacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 2671645  T
Q  219 gggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  2671644 gggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 2671587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Original strand, 32480161 - 32480487
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaa-ccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagcc 96  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||| | || |||||||||| |||||    
T  32480161 cttcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacagcc 32480260  T
Q  97 ctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgacc 193  Q
     ||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  32480261 -taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgttgacc 32480356  T
Q  194 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagactctagctt-tcaagctt 292  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32480357 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaatctagcttatcaagctt 32480455  T
Q  293 aacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
     ||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  32480456 tacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 32480487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10207753 - 10207983
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaac-aaacagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||    
T  10207753 cttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag-cct 10207851  T
Q  99 aag-ctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagc--ggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |   | |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10207852 aagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcat-aacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaagattgttgaccca 10207949  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagag 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10207950 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8739318 - 8739024
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaaca--gccctaagctagtgtatagcaaaa-c 118  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||||  || || || | ||||| |    
T  8739318 caaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaac 8739220  T
Q  119 cacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 217  Q
    ||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739219 cacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 8739123  T
Q  218 tgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctagat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  8739122 tgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaatccctagat 8739024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9091556 - 9091262
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaaca--gccctaagctagtgtatagcaaaa-c 118  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||| |  ||||||  || || || | ||||| |    
T  9091556 caaagatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaac 9091458  T
Q  119 cacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 217  Q
    ||||||||||| || ||| ||| ||| |||||||||   ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091457 cacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatc 9091361  T
Q  218 tgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctagat 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  9091360 tgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctt-acacaagaacaatccctagat 9091262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 163 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 40372908 - 40372796
Alignment:
Q  163 aagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttac 261  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40372908 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 40372810  T
Q  262 aaaaggttacaaga 275  Q
    ||| ||||||||||    
T  40372809 aaagggttacaaga 40372796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 275
Target Start/End: Original strand, 8477343 - 8477458
Alignment:
Q  161 gaaagaacaaa-acaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgt 258  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8477343 gaaagaacaaacacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgt 8477441  T
Q  259 tacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||| ||||||||||    
T  8477442 tacaaagggttacaaga 8477458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 26928687 - 26928592
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  26928687 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 26928592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 1305949 - 1306044
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  1305949 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 1306044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 224 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501647
Alignment:
Q  224 agagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagctttcaagcttaacacatgaacaaaccctaga-tctaccc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28501651  T
Q  321 tttg 324  Q
    ||||    
T  28501650 tttg 28501647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370477
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8370477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974943
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 27974943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 32143321 - 32143417
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  32143321 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 32143417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18552971 - 18552873
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18552971 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 18552873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 292
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264463
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 278  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||       
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 16264449  T
Q  279 tagctttcaagctt 292  Q
    |||||| |||||||    
T  16264450 tagcttgcaagctt 16264463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 21711222 - 21711319
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  21711222 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 21711319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453054
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 27453054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986449
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 182 - 275
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029190
Alignment:
Q  182 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 36029190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 184 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736295
Alignment:
Q  184 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 1736295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709780
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaaga 30709780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 180 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40592870 - 40592742
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaagac 276  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||     
T  40592870 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 40592771  T
Q  277 tctagctttcaagcttaacacatgaacaaa 306  Q
      |||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  40592770 attagcttacaagctt-acacaagaacaaa 40592742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 3716090 - 3715992
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3716090 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3715992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 48438213 - 48438311
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  48438213 caagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 48438311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 6794801 - 6794704
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  6794801 caagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 6794704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 26298987 - 26299085
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  26298987 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 26299085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795878
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||| |||| |||||||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaaga 25795878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 47923994 - 47923896
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  47923994 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaagagttacaaga 47923896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 1417578 - 1417513
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1417578 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatcca 1417513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Original strand, 37466290 - 37466375
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  37466290 caagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 37466375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 39040079 - 39039995
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39040079 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 40844651 - 40844748
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  40844651 caagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 40844748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 180 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3328444 - 3328359
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||    
T  3328444 caagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaa 3328359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4387014 - 4386947
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 247  Q
    ||||||||| |||||||| ||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4387014 aagattgtttacccagtttagttcagtatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccaata 4386947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24695252 - 24695154
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24695252 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 24695154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 40373049 - 40372981
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa 91  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  40373049 caaaggtgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaacaacatcaaa 40372981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210569
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatcca 38210569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494198
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 50494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 248
Target Start/End: Original strand, 53894055 - 53894119
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 248  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53894055 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatat 53894119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 3323755 - 3323693
Alignment:
Q  202 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  3323755 ccaatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 3323693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 458543 - 458483
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  458543 ttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 458483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 6063444 - 6063504
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    |||| |||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6063444 ttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6063504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 10621528 - 10621588
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621528 ttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 10621588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 228
Target Start/End: Original strand, 39153357 - 39153405
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  39153357 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 39153405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35325 - 35001
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagcccta 99  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35325 cttcacaccaatgaaataaac-aatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta 35227  T
Q  100 agctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagtt 198  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  35226 gactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttaacccagtt 35129  T
Q  199 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagctttcaagcttaacac 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  35128 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttagaagaactctagccttcaagctttacac 35029  T
Q  298 atgaacaaaccctaga-tctaccctttg 324  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  35028 atgaacaaaccctagactctaccctttg 35001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 149221 - 148895
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  149221 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 149123  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  149122 aagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 149026  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||     
T  149025 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagcttt 148926  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  148925 acacaagacaaaaccatagatctaccctttg 148895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 161; Significance: 8e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2516 - 2190
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  2516 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 2418  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2417 aagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 2321  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctta 293  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||     
T  2320 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagcttt 2221  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||| ||  ||||| |||||||||||||||    
T  2220 acacaagacaaaaccatagatctaccctttg 2190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19430 - 19104
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccct 98  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  19430 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-t 19332  T
Q  99 aagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccca 195  Q
    |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19331 aagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgaccca 19235  T
Q  196 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctta 293  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||     
T  19234 gttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagcttt 19135  T
Q  294 acacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
    ||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  19134 acacaagacaaaaccctagatctaccctttg 19104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 14575 - 14248
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagccc 97  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||     
T  14575 cttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc- 14477  T
Q  98 taagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14476 taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccc 14380  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagctt-tcaagctt 292  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14379 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagctt 14280  T
Q  293 aacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 324  Q
     ||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  14279 tacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 14248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 182230 - 181976
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaa-caacaacaaa-cagccc 97  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||| ||||||| || |||||||||| |||||     
T  182230 cttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacagcc- 182132  T
Q  98 taagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaagaagataagcggtaaaggaaa--gaacaaaacaccgagcaagattgttgaccc 194  Q
    ||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||| || |||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  182131 taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcataca--agataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttgaccc 182035  T
Q  195 agttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa 253  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182034 agttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa 181976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18048 - 17953
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18048 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 17953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24141 - 24046
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24141 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 24046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 491 - 300
Alignment:
Q  22 caaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagca--aacaacaacaaacagccctaagctagtgtatagcaaaacc 119  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||||    
T  491 caaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagcaacaacaacaaaaaacagccctaaactagtgaggagcaaaacc 392  T
Q  120 acacaaagagctaa-caagcataaagaagataagcggtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 213  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||   ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  391 acacaaagagataataaagca-aaacaagataagctagaaa-gaaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 34213 - 34132
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaac 82  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34213 cttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaac 34132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 13169 - 13233
Alignment:
Q  1 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13169 cttcacaccaatgaaataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaa 13233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8420
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22403 - 22343
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22403 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24678 - 24618
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24678 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 24618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 182 - 275
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85779
Alignment:
Q  182 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 85779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43944
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 278  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||       
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 43959  T
Q  279 tagctttcaagctta 293  Q
    |||||| ||||||||    
T  43958 tagcttgcaagctta 43944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 36929 - 36815
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaagactc 278  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||  |||||||||       
T  36929 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaaaa 36830  T
Q  279 tagctttcaagctta 293  Q
    |||||| ||||||||    
T  36829 tagcttgcaagctta 36815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5770
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5682 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Original strand, 2491 - 2579
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag 266  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  2491 caagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133281
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaaggttacaaga 275  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaaga 133281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 275
Target Start/End: Original strand, 10728 - 10826
Alignment:
Q  180 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10728 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 263
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45337
Alignment:
Q  181 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaa 263  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 275
Target Start/End: Original strand, 17266 - 17360
Alignment:
Q  184 attgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaaagtgttacaaaag-gttacaaga 275  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17266 attgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 17360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 269
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 244
Target Start/End: Original strand, 11500 - 11533
Alignment:
Q  211 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500 cctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 185 - 244
Target Start/End: Original strand, 69292 - 69352
Alignment:
Q  185 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 244  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  69292 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatcca 69352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University