View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5329_high_11 (Length: 420)

Name: NF5329_high_11
Description: NF5329
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5329_high_11
NF5329_high_11
[»] chr6 (80 HSPs)
chr6 (1-410)||(27718394-27718803)
chr6 (1-409)||(27724860-27725267)
chr6 (1-390)||(27611017-27611406)
chr6 (1-399)||(27698509-27698906)
chr6 (1-410)||(28780902-28781311)
chr6 (1-410)||(26802201-26802614)
chr6 (1-410)||(28786041-28786450)
chr6 (1-410)||(27604720-27605135)
chr6 (1-388)||(28792184-28792571)
chr6 (2-410)||(26655752-26656160)
chr6 (2-410)||(26761723-26762131)
chr6 (1-410)||(27678717-27679118)
chr6 (58-410)||(27228997-27229347)
chr6 (1-341)||(27593035-27593375)
chr6 (1-341)||(27677629-27677969)
chr6 (2-347)||(26646299-26646650)
chr6 (2-347)||(26752267-26752618)
chr6 (4-410)||(27706420-27706818)
chr6 (1-383)||(31284078-31284460)
chr6 (2-410)||(27338081-27338482)
chr6 (2-410)||(27398821-27399222)
chr6 (4-313)||(26884023-26884334)
chr6 (10-344)||(26622805-26623139)
chr6 (10-344)||(26728783-26729117)
chr6 (4-292)||(27531215-27531503)
chr6 (2-390)||(26823629-26824011)
chr6 (2-279)||(25579613-25579890)
chr6 (27-279)||(25481636-25481888)
chr6 (27-279)||(26142759-26143011)
chr6 (2-343)||(26861446-26861784)
chr6 (2-279)||(26055820-26056097)
chr6 (2-279)||(26075790-26076067)
chr6 (27-279)||(26048739-26048991)
chr6 (27-279)||(26069908-26070160)
chr6 (2-279)||(25538434-25538711)
chr6 (1-405)||(27427621-27428020)
chr6 (49-278)||(28234459-28234688)
chr6 (2-337)||(28139377-28139712)
chr6 (10-275)||(28242702-28242967)
chr6 (38-311)||(28325343-28325616)
chr6 (33-278)||(28226845-28227090)
chr6 (33-255)||(28181032-28181254)
chr6 (33-317)||(28185222-28185506)
chr6 (2-241)||(26848592-26848831)
chr6 (27-339)||(26341975-26342290)
chr6 (2-199)||(28149912-28150108)
chr6 (2-194)||(26937073-26937265)
chr6 (42-339)||(28098425-28098725)
chr6 (58-241)||(25506981-25507158)
chr6 (2-242)||(29825958-29826198)
chr6 (33-194)||(28297760-28297921)
chr6 (33-194)||(28514152-28514313)
chr6 (315-409)||(25538338-25538431)
chr6 (2-254)||(27214336-27214588)
chr6 (2-254)||(27234640-27234892)
chr6 (314-409)||(26055724-26055818)
chr6 (315-409)||(25481540-25481633)
chr6 (315-409)||(26048643-26048736)
chr6 (315-409)||(26069812-26069905)
chr6 (315-409)||(26075694-26075787)
chr6 (315-409)||(26142663-26142756)
chr6 (2-243)||(26949591-26949832)
chr6 (38-227)||(26635636-26635825)
chr6 (38-227)||(26741602-26741791)
chr6 (38-227)||(27665169-27665358)
chr6 (2-341)||(2184117-2184459)
chr6 (19-243)||(25071589-25071813)
chr6 (43-227)||(26974998-26975182)
chr6 (2-191)||(2184880-2185069)
chr6 (58-203)||(26893543-26893688)
chr6 (315-359)||(25579566-25579610)
chr6 (114-229)||(26811453-26811568)
chr6 (148-233)||(26617266-26617351)
chr6 (148-233)||(26723194-26723279)
chr6 (148-227)||(26959111-26959190)
chr6 (126-210)||(28491660-28491744)
chr6 (126-210)||(29804070-29804154)
chr6 (124-203)||(29467797-29467876)
chr6 (269-335)||(26018770-26018836)
chr6 (269-335)||(26139474-26139540)
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (1-399)||(14371-14767)
scaffold0349 (4-409)||(3439-3844)
scaffold0349 (246-410)||(8061-8225)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (1-410)||(4686-5100)
scaffold0277 (1-410)||(13647-14056)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (1-410)||(7295-7697)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (2-408)||(18699403-18699807)
chr4 (2-410)||(18679570-18679976)
chr4 (2-410)||(18731507-18731913)
chr4 (2-410)||(18655480-18655886)
chr4 (2-344)||(18724088-18724430)
chr4 (1-405)||(18073535-18073934)
chr4 (34-405)||(17989088-17989454)
chr4 (2-269)||(5090970-5091237)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (79-410)||(10-334)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (1-372)||(28164364-28164735)
chr1 (10-352)||(268368-268711)
chr1 (1-367)||(28127681-28128042)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (2-339)||(29273786-29274123)
chr8 (114-291)||(31903733-31903910)
chr8 (78-229)||(16373154-16373305)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-405)||(59343-59742)
[»] scaffold0038 (4 HSPs)
scaffold0038 (33-278)||(34620-34865)
scaffold0038 (10-275)||(42864-43129)
scaffold0038 (38-311)||(116658-116931)
scaffold0038 (33-278)||(27343-27588)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (38-311)||(58334-58607)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (2-240)||(16688944-16689182)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (38-269)||(3279592-3279823)
chr2 (38-230)||(17993736-17993928)
[»] scaffold0713 (1 HSPs)
scaffold0713 (269-335)||(5916-5982)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 80)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 27718394 - 27718803
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718394 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 27718493  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27718494 acacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 27718593  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||     
T  27718594 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaactgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggag 27718693  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagttttt 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||    
T  27718694 aatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaattttt 27718793  T
Q  401 gtggtctgtg 410  Q
    ||| ||||||    
T  27718794 gtgttctgtg 27718803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 409
Target Start/End: Original strand, 27724860 - 27725267
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27724860 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaataggcatagttgatagaaa 27724959  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27724960 acacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 27725059  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27725060 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaa 27725159  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagttttt 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  27725160 aatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaattttt 27725258  T
Q  401 gtggtctgt 409  Q
    |||||||||    
T  27725259 gtggtctgt 27725267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 390
Target Start/End: Original strand, 27611017 - 27611406
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611017 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 27611116  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611117 acacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 27611216  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  27611217 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaa 27611316  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatga 390  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27611317 aatgaagaagaagaggaagctaattgcatagccatgaaaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 27611406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 27698509 - 27698906
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  27698509 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttgagagaaa 27698608  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27698609 acacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 27698708  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  27698709 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaa 27698808  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttt 399  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  27698809 aatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttt 27698906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28781311 - 28780902
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||| |||||||||||||||||    
T  28781311 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcatagttgatagaaa 28781212  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28781211 acacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgat 28781112  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  28781111 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaa 28781012  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagttttt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  28781011 aatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgataattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgttttt 28780912  T
Q  401 gtggtctgtg 410  Q
    ||||||||||    
T  28780911 gtggtctgtg 28780902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26802614 - 26802201
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||    
T  26802614 aagaaaataggcaagacgaggcgaccctttgtcttatagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagaggcatagttgatagaaa 26802515  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26802514 acacaggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 26802415  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  26802414 tcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccgtaccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaa 26802315  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaa----aaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagt 396  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26802314 aatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattgtgagaaattggatgaaaaaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagt 26802215  T
Q  397 ttttgtggtctgtg 410  Q
    ||||||||||||||    
T  26802214 ttttgtggtctgtg 26802201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28786450 - 28786041
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    || | ||| |||||||||||||    
T  28786450 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaa 28786351  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28786350 acacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgat 28786251  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28786250 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaa 28786151  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagttttt 400  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  28786150 aatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgttttt 28786051  T
Q  401 gtggtctgtg 410  Q
    ||||||||||    
T  28786050 gtggtctgtg 28786041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 27604720 - 27605135
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  27604720 aagaaaacaggcaaaacgacgcgaccctttgtcgtgtagcaatgaatgatgtgaacaagttcatccaaacaaaaggaagaagaggcatatttgatagaaa 27604819  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  27604820 acacaggaataaaaatcctggattcatcaatggccttgagaagtgctggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaat 27604919  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27604920 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtatcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaa 27605019  T
Q  301 aatgaa------gaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataa 394  Q
    ||||||      ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||    
T  27605020 aatgaagaggatgaggatgaggaaggtaattgcatagccatgagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 27605119  T
Q  395 gtttttgtggtctgtg 410  Q
    ||||||||||||||||    
T  27605120 gtttttgtggtctgtg 27605135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 28792571 - 28792184
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    || | ||| |||||||||||||    
T  28792571 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgatgtggcgtagttgatagaaa 28792472  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28792471 acacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgat 28792372  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28792371 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaa 28792272  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaat 388  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  28792271 aatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 28792184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 2 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26656160 - 26655752
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||    
T  26656160 agaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaa 26656061  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26656060 tatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggatt 26655961  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||   ||||||||    
T  26655960 cccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaa 26655861  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttg 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26655860 atgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaagtttttg 26655761  T
Q  402 tggtctgtg 410  Q
    |||||||||    
T  26655760 tggtctgtg 26655752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 2 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26762131 - 26761723
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||    | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||    
T  26762131 agaaaacaggcaaaaccgaacaaccctttgtcttatagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaa 26762032  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26762031 tatgggaataaaaatcctggattcttcaatggccttaacgagtgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggatt 26761932  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||   ||||||||    
T  26761931 cccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaa 26761832  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttg 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26761831 atgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaagtttttg 26761732  T
Q  402 tggtctgtg 410  Q
    |||||||||    
T  26761731 tggtctgtg 26761723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27679118 - 27678717
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27679118 aagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaa 27679019  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | |||    
T  27679018 acacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgat 27678919  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  || |   |||||||    
T  27678918 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattcccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaa 27678819  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagttttt 400  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||| ||       |||||||||||| | ||||||||    
T  27678818 attgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagattttagagaaattagatgaaaaaagagtttg-------agaatatgaatg-agaagttttt 27678727  T
Q  401 gtggtctgtg 410  Q
    ||||||||||    
T  27678726 gtggtctgtg 27678717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 58 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27229347 - 27228997
Alignment:
Q  58 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 157  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27229347 agttcgttcaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatccgagattcgtcaatggccttgacgagtgatggtgtgattt 27229248  T
Q  158 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaat 257  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  27229247 cgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtgccgagtgtcagt 27229148  T
Q  258 gcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatg 357  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  27229147 gcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccaaaggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgtatagccatgagacttgagagaaattggatg 27229048  T
Q  358 aaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 410  Q
      |||||||| |  ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  27229047 --aaaagagttttagaatgcagaatatgaatgagtatgtttttgtggtatgtg 27228997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 27593035 - 27593375
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593035 aagaaaacaggcaaaacagggcgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggtcaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 27593134  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  27593135 acacaggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgat 27593234  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  || |   |||||||    
T  27593235 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtaatcataggaa 27593334  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 341  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27593335 attgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27593375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 27677629 - 27677969
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27677629 aagaaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaa 27677728  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||    
T  27677729 acacagcaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggat 27677828  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | || || ||| ||||||| ||||||||  || |   |||||||    
T  27677829 tcccttgtcatcaagagccttgtagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcacttcctctgaaattgaggaatacttggtatttgtactcataggaa 27677928  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 341  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27677929 attgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27677969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26646650 - 26646299
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  26646650 agaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaa 26646551  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| || |||    
T  26646550 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaatt 26646451  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||   |||||||    
T  26646450 cccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaa 26646351  T
Q  302 atgaagaggaaga------ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaag 347  Q
     | ||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26646350 ttaaagaggaagaggaataggaaggagattgcatagccatgagaattgaaag 26646299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 26752618 - 26752267
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  26752618 agaaaacgggcaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatttagaagaggcatagttgatagaaaa 26752519  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| || |||    
T  26752518 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaatt 26752419  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| ||||||   |||||||    
T  26752418 cccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaa 26752319  T
Q  302 atgaagaggaaga------ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaag 347  Q
     | ||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26752318 ttaaagaggaagaggaataggaaggagattgcatagccatgagaattgaaag 26752267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 4 - 410
Target Start/End: Original strand, 27706420 - 27706818
Alignment:
Q  4 aaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaaca 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27706420 aaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggtgatagaaaaca 27706519  T
Q  104 caggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcc 203  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |  ||||||||||| ||||||||    
T  27706520 caggaataaaaatcctagactcttcaatggccttgagaagtgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcc 27706619  T
Q  204 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaat 303  Q
    |||||||  || |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||   || || ||||||||||| ||||||||  || |   |||||||| |    
T  27706620 cttgtcatcaaaagccttgtagagattgcctgtgaaaccgtaccgagtgtcacctcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaatt 27706719  T
Q  304 gaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtg 403  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||||||||||| ||       |||||||||||| | |||||||||||    
T  27706720 gaagtggaagagaaaggtgattgcatagccatgagattttagagaaattagatgaaaaaagagtttg-------agaatatgaatg-agaagtttttgtg 27706811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 31284460 - 31284078
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  31284460 aagaaaacgggcaaaacgaggcgaccattttgcttatacaagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgacgaagaggcatagttggcagaaa 31284361  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||    
T  31284360 acacggggataaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggat 31284261  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||  |||||||    
T  31284260 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccataccgagtgtcacttcccctgaaactaaggaatacttggtatttgaatacataggaa 31284161  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaata 383  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  31284160 attgaagaggaagaggaagatgattgcatagccatgagatttgagagaatatggatgaagaaagaatttgagaatgcagaata 31284078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 410
Target Start/End: Original strand, 27338081 - 27338482
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||    | |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   ||||||    
T  27338081 agaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaa 27338180  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  27338181 tatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgatt 27338280  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||   | ||||||    
T  27338281 cccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaa 27338380  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttg 401  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| ||       ||||||||||||| ||||||||||    
T  27338381 ttgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattgagagaaataagatgaaaaaaaagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttg 27338473  T
Q  402 tggtctgtg 410  Q
    |||||||||    
T  27338474 tggtctgtg 27338482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 410
Target Start/End: Original strand, 27398821 - 27399222
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||    | |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||   ||||||    
T  27398821 agaaaacaggcaaaaccgaacaaccccttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagatgcatagtttgcagaaaa 27398920  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     |  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  27398921 tatgggaatcaaaatcctagactcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgatt 27399020  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||   | ||||||    
T  27399021 cccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtaaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaa 27399120  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttg 401  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||| ||       ||||||||||||| ||||||||||    
T  27399121 ttgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattgagagaaataagatgaaaaaaaagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttg 27399213  T
Q  402 tggtctgtg 410  Q
    |||||||||    
T  27399214 tggtctgtg 27399222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26884334 - 26884023
Alignment:
Q  4 aaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatta--tgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  26884334 aaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtctcgtagcagtgaatgacatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggtagaaaa 26884235  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  26884234 tattggaataaaaattctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggatt 26884135  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26884134 cccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaa 26884035  T
Q  302 atgaagaggaag 313  Q
    ||||||||||||    
T  26884034 atgaagaggaag 26884023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26623139 - 26622805
Alignment:
Q  10 ggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaa 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  26623139 ggcaaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaa 26623040  T
Q  110 taaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtc 209  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||   ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26623039 taaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtc 26622940  T
Q  210 agtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagag 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||    
T  26622939 agtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagag 26622840  T
Q  310 gaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattga 344  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26622839 gaagaggatggtgattgcatagccatgataattga 26622805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 26729117 - 26728783
Alignment:
Q  10 ggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaa 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||||||    
T  26729117 ggcaaaacgagacgaccctttgttttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaatgaagaatatgcatagttgggagaaaacacaggaa 26729018  T
Q  110 taaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtc 209  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||   ||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26729017 taaaaatcctagactcttcgatagcattgtcaagtgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtc 26728918  T
Q  210 agtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagag 309  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||||    
T  26728917 agtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccgtaccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagag 26728818  T
Q  310 gaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattga 344  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  26728817 gaagaggatggtgattgcatagccatgataattga 26728783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 27531215 - 27531503
Alignment:
Q  4 aaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaaca 103  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||| | |||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||| |    
T  27531215 aaaacaggcaaaacaagacaaccctttgtatcgtagcaatgagtgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttttcagaaaata 27531314  T
Q  104 caggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcc 203  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27531315 cgggaataaaaatcctagatttttcaatggcattttttagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcc 27531414  T
Q  204 cttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatg 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27531415 cttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtccgcgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatg 27531503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 26824011 - 26823629
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||  | |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||    
T  26824011 agaaaacaggcaaaacgaggcgccccttttccttgtagacgcgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggcagaaaa 26823912  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||| ||  ||||| ||| ||||||||||| |||   |||||||  ||||| ||||||    
T  26823911 cacaggaataaaaatcctagactcttcaatggcattattgagtgattgttcgattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggatt 26823812  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  | | ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||   ||| ||||    
T  26823811 cccttgtctgtaagagccttgtagagattgccggtaaattcataccgagtgtcagcgcctctaaaactgagaaacacttggtatttgaaatcatatgaaa 26823712  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatga 390  Q
     |||||||      |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26823711 ctgaagag------gaagttgactgcatagccatgagaattgagagaaattggacgaagaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 26823629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25579890 - 25579613
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||| ||||| || | || || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||    
T  25579890 agaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaa 25579791  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||    
T  25579790 tatgggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaatt 25579691  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 279  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||  ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  25579690 cccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaagtgttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacact 25579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25481888 - 25481636
Alignment:
Q  27 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattct 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||| ||||||||||||||    
T  25481888 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatacaaatcctagattct 25481789  T
Q  127 tcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 226  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  25481788 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttataga 25481689  T
Q  227 gattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 279  Q
    |||| || ||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  25481688 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 25481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 27 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26143011 - 26142759
Alignment:
Q  27 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattct 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  26143011 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26142912  T
Q  127 tcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 226  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26142911 tcaatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttataga 26142812  T
Q  227 gattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 279  Q
    |||| || |||||   ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26142811 gattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 2 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26861784 - 26861446
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||   |||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||    
T  26861784 agaaaacaggcaaaacgacgcgacccttttccttg---cagttaatgatttggacaagttcatccaaacaaaatgacgaagaggcatagttggcagaaaa 26861688  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||  | |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||    
T  26861687 cacaggaatgaaaattctagactcttcaatggcattgtcgagtgatcttttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaatt 26861588  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||| | || || ||||||||||| || |||||  |||||  ||||||||    
T  26861587 cccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaaaaccataccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacctggtatttgaatccataggaaa 26861488  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattg 343  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26861487 tggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 26861446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26056097 - 26055820
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||| ||||| || | || || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||    
T  26056097 agaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaa 26055998  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  26055997 tatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaatt 26055898  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 279  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26055897 cccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaaatgaggaacact 26055820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26076067 - 26075790
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||| ||||| || | || || |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||    
T  26076067 agaaaacgggcaatactaagcaactctttgtgttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaa 26075968  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  26075967 tatgggaataaaaatcccagattcttcgatggccttgacaagtgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaatt 26075868  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 279  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| || ||||||  ||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26075867 cccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 26075790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26048991 - 26048739
Alignment:
Q  27 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattct 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  26048991 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26048892  T
Q  127 tcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 226  Q
    || ||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  26048891 tccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttataga 26048792  T
Q  227 gattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 279  Q
    |||| || ||||||  ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26048791 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26048739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 27 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26070160 - 26069908
Alignment:
Q  27 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattct 126  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  26070160 ctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaataaaaatcctagattct 26070061  T
Q  127 tcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 226  Q
    || ||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| ||||    
T  26070060 tccatggccttgacaagtttgggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttataga 26069961  T
Q  227 gattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 279  Q
    |||| || ||||||  ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26069960 gattaccggtaaaattgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26069908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25538711 - 25538434
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||| ||||| || | || || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  ||||||    
T  25538711 agaaaacgggcaatactaagcaactctttgtcttgtagcagtgaatgatctggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagatgcatagttggcagaaaa 25538612  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     |  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||   |||    
T  25538611 tatgggaataaaaattctagattcttcgatggccttgacaagtgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaatt 25538512  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacact 279  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| || |||||   ||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25538511 cccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttgttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 25538434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Original strand, 27427621 - 27428020
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||    
T  27427621 aagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaa 27427720  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatc------aatgaaggt 194  Q
    | |  ||||| |||||||| |||||||||||     ||||      |||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||      |  ||||||    
T  27427721 atatgggaatcaaaatcctggattcttcaataa---tgat------tggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggt 27427811  T
Q  195 atggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgta 294  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| || || |||||||||| | |||| |||||| |    
T  27427812 acgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgca 27427911  T
Q  295 taggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataa 394  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||  | |||||| || |||||||||||||||||||  |     
T  27427912 taggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgaggat 27428009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28234688 - 28234459
Alignment:
Q  49 atgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatg 148  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  28234688 atgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatg 28234589  T
Q  149 gtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccg 248  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||  | |||||||| |  ||    
T  28234588 gtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaaccatagcg 28234489  T
Q  249 agtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 278  Q
    ||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  28234488 agtgtcactacctctaaaactaaggaacac 28234459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 28139712 - 28139377
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||||||||||||| |  |  |||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28139712 agaaaacaggcaaaaccaaacatccctttgtgttgaagcagtcaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaacgaagaagaggcatagttgatggaaaa 28139613  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||||  ||||| || |||| |||||| ||  | |||||||| || || ||||||    
T  28139612 cacagggatgaaaatcctagattcttcaatggcttttacgagtgacggtgatatttcgtcacctccttgaagctccctatcatcaataaaagtgtggatt 28139513  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    ||   ||||  |||||| ||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||| |||| || || ||||| || || | ||| |||||   |||||| |    
T  28139512 ccacagtcacgaagagctttgtagagatttccagtgaaaccgaaacgagtgtcactgcctctgaagctgagaaagacatcgtatgtgaagccataggaga 28139413  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatga 337  Q
    | ||||  ||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  28139412 aagaagtagaagaagaaggtggttgcaaagccatga 28139377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 28242967 - 28242702
Alignment:
Q  10 ggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaa 109  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  28242967 ggcaaaactaggcgtccatttttcttgcagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaa 28242868  T
Q  110 taaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtc 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||  | |||||||| |     
T  28242867 tgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttctt 28242768  T
Q  210 agtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaa 275  Q
    |  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  28242767 acaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 28242702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 28325616 - 28325343
Alignment:
Q  38 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 137  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  28325616 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 28325517  T
Q  138 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 237  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | ||||||||||| ||||||    
T  28325516 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagta 28325417  T
Q  238 aaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagagga 311  Q
    ||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  28325416 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 28325343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28227090 - 28226845
Alignment:
Q  33 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 132  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28227090 cttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatg 28226991  T
Q  133 gccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgc 232  Q
     ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  |||||||||| |    
T  28226990 accttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttc 28226891  T
Q  233 cagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 278  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  28226890 cagtaaaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 28226845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 28181254 - 28181032
Alignment:
Q  33 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 132  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28181254 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatg 28181155  T
Q  133 gccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgc 232  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | |||||| |    
T  28181154 gccttgaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttc 28181055  T
Q  233 cagtaaaaccgtgccgagtgtca 255  Q
    |||||||||| |  |||||||||    
T  28181054 cagtaaaaccataacgagtgtca 28181032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 28185506 - 28185222
Alignment:
Q  33 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 132  Q
    |||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28185506 cttgaagcagttaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactcttcaatg 28185407  T
Q  133 gccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgc 232  Q
    |||||||  ||||||| ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | |||||| |    
T  28185406 gccttgaaaagtgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttc 28185307  T
Q  233 cagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagagga 317  Q
    |||||||||  |  ||||||||| | || ||||| || |||||||| |  || ||||||  |||||| || |||||||| |||||    
T  28185306 cagtaaaacgataacgagtgtcactacctctaaagctaaggaacacgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28185222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 26848831 - 26848592
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||||||| | ||| | || |||||||  |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||    
T  26848831 agaaaacaggaataaccatgctacccttttccttggagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagtggcatagttctcagagaa 26848732  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     ||| ||||  ||||||| || |||||||||  ||||| ||| || |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  26848731 tacaagaatggaaatcctcgagtcttcaatgttcttgaggagcgaaggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggatt 26848632  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaac 241  Q
    || ||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  26848631 ccattgtcagaaagagctttatagagattaccagtgaaac 26848592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 339
Target Start/End: Original strand, 26341975 - 26342290
Alignment:
Q  27 ctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattct 126  Q
    ||||| |||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |  ||||| |||||||| || |||    
T  26341975 ctttgccttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaagaagcatagttgattgagaaaattggaatgaaaatcctggactct 26342074  T
Q  127 tcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtaga 226  Q
    |||||||| ||||  |||||| |||||||||  || ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||  ||| |||   ||||   |||||  | ||||    
T  26342075 tcaatggctttgacaagtgattgtgtgattttgtcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcggactccaccgtcacatagagctctataga 26342174  T
Q  227 gattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgatt- 325  Q
     ||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||| |||||||||| |  || ||||||  ||| || ||||||||| ||||||| | |||||     
T  26342175 tattgccagtaaaaccatagcgagtgccaatgcccctaaaattgaggaacacatcatatgtgaatccatatgagaatgaagagaaagaggacgatgattg 26342274  T
Q  326 --gcatagccatgaga 339  Q
      ||||||||||||||    
T  26342275 gagcatagccatgaga 26342290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 28150108 - 28149912
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||| ||||| ||| | || |||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||    
T  28150108 agaaaataggcagaactaagcaaccctttgccttgaagcagtgaataatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagtatagttgatagagaa 28150009  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgga 199  Q
     |  ||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || ||| ||  | |||||||||||||| ||||    
T  28150008 gattggaatgaaaatcctggactcttcaatggccttga-gagtgatggtgtgatttcgtcccctcgttaaagctccgtatcatcaatgaaggtgtgga 28149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26937265 - 26937073
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||| ||||||||  ||  |||| ||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26937265 agaaaataggcaaaattagatgaccttttgtcttgaagcagtcaacgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtggcatagttgatagagaa 26937166  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 194  Q
     ||||| ||   |||||  || |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||  || || || |||||||||||||||||    
T  26937165 tacaggtatggcaatcccggaatcttcaattgccttgacaagtgatggtgtgatttcttctcctccatggagctccttgtcatcaatgaaggt 26937073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 339
Target Start/End: Original strand, 28098425 - 28098725
Alignment:
Q  42 gtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatg 141  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||||      
T  28098425 gtgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatagttcttagagaagaccggaattaaaatcctggactcttcgatggccttgaca 28098524  T
Q  142 agtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaac 241  Q
    || ||| ||||||||  ||| |||   |||||||| || |  |||||||||||  ||| |||   ||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28098525 agggattgtgtgattctatcaccttcatgaagatctttatggtcaatgaaggtgcggactcctccgtcacaaagagctttgtagagatttccagtaaaac 28098624  T
Q  242 cgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgatt---gcatagccatgag 338  Q
    | | |||||||||  ||||||||||| | || ||||| |  || ||||||  ||| || ||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||||    
T  28098625 cataccgagtgtcggtgcccctaaaattaagaaacacgtcataggtgaatccataagagaatgaagagaaagaggaagatgattggagcatagccatgag 28098724  T
Q  339 a 339  Q
    |    
T  28098725 a 28098725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 58 - 241
Target Start/End: Original strand, 25506981 - 25507158
Alignment:
Q  58 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 157  Q
    ||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||    
T  25506981 agttcctccaaacaaaattttgaagaggcatagttgatagaaagaaccggaataaaaatcctagattcttcaatggcgatgacgactgatggtgtgattt 25507080  T
Q  158 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaac 241  Q
    ||||||||||||  ||||||   |||||||||      || ||||||||||||   |||||| ||||||||| || ||||||||    
T  25507081 catctcctcttttcagatcacaatcatcaatg------tgaattcccttgtcatatagagccgtgtagagatggctagtaaaac 25507158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 29826198 - 29825958
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||   || | || ||| || || ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  29826198 agaaaataggcaaaacgagacgacccttcctcttgacacactcaactatatgcacaagttcatctaagcaaaacgaagaagaagcataattggtagagaa 29826099  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     | ||||||    ||||||||||||| ||| ||||| |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||    
T  29826098 aataggaatggctatcctagattcttgaattgccttcacaagtgagggtgtgatttcgtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaatt 29825999  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaacc 242  Q
      ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29825998 ttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaacc 29825958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 194
Target Start/End: Original strand, 28297760 - 28297921
Alignment:
Q  33 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 132  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  28297760 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28297859  T
Q  133 gccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 194  Q
      |||||  ||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  28297860 tgcttgaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggt 28297921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 28514313 - 28514152
Alignment:
Q  33 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 132  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  28514313 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattggtagataagacaggaatgaaaatcctagtctcttcaatg 28514214  T
Q  133 gccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggt 194  Q
      |||||  ||||||||||| ||||| || |||| || ||| ||  ||||||||||||||||    
T  28514213 tgcttgaaaagtgatggtgttatttcgtcacctcctttaagctctctgtcatcaatgaaggt 28514152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 315 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 25538431 - 25538338
Alignment:
Q  315 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  25538431 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgattaa-tttgtgtggtctgt 25538338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27214588 - 27214336
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| |||  |||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    || ||    
T  27214588 agaaaacaggtagaacaaggcgacctttttccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagttctctgagaa 27214489  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     |||  || | ||||||| || ||||||||   ||||  ||| || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||    
T  27214488 tacaataacagaaatcctcgagtcttcaattttcttgtggagcgaagatgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggatt 27214389  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtc 254  Q
    || ||||||  |||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  27214388 cctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcgagtgtc 27214336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 254
Target Start/End: Original strand, 27234640 - 27234892
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||||||| | ||| |||||||| |||  |||| |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    || ||    
T  27234640 agaaaacaggtagaacaaggcgacctttttccttggagcaatgagtgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagtagcatagttctctgagaa 27234739  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     |||  || | ||||||| || ||||||||   ||||  ||| || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  |||||    
T  27234740 tacaataacagaaatcctcgagtcttcaattttcttgtggagcgaagatgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggatt 27234839  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtc 254  Q
    || ||||||  |||||| || |||||||| || || |||||||| ||||||||    
T  27234840 cctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcgagtgtc 27234892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 314 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26055818 - 26055724
Alignment:
Q  314 aggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26055818 aggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26055724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 25481633 - 25481540
Alignment:
Q  315 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  25481633 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaaaactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 25481540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26048736 - 26048643
Alignment:
Q  315 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26048736 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26048643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26069905 - 26069812
Alignment:
Q  315 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26069905 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26069812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26075787 - 26075694
Alignment:
Q  315 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26075787 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26075694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 26142756 - 26142663
Alignment:
Q  315 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgt 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  26142756 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa-tttgtgtggtctgt 26142663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26949832 - 26949591
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| |||  |||| || ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |   |||||||    
T  26949832 agaaaactggcagaacaaggcgacctttttccttgaagtagtgaatgatatggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatattccttagaaaa 26949733  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     ||   |||   ||| || |||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||| || ||| | ||||| || || ||||||||||||||  |||||    
T  26949732 gacgataatggcaattctcgattcttcaattctcttgaggagtgaaggtgtgatttcgtcacctttctgaagctccttatcatcaatgaaggttcggatt 26949633  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccg 243  Q
    ||||||||||  ||||| || |||||||| || || ||||||    
T  26949632 cccttgtcagagagagctttatagagattaccggtgaaaccg 26949591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26635825 - 26635636
Alignment:
Q  38 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 137  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |   |||| || ||   |||   |||||| || |||||||||  |||    
T  26635825 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctctt 26635726  T
Q  138 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 227  Q
    || ||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  26635725 gaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagag 26635636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26741791 - 26741602
Alignment:
Q  38 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 137  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||| |   |||| || ||   |||   |||||| || |||||||||  |||    
T  26741791 agcaatgaatgatgtggacaagttcatccaaacaaaacaaagaagaagcatattccttagagaaaacgataatggcaatcctcgactcttcaatgctctt 26741692  T
Q  138 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 227  Q
    || ||| || |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  26741691 gaggagcgaaggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagag 26741602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 227
Target Start/End: Original strand, 27665169 - 27665358
Alignment:
Q  38 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 137  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||| |||||||  ||||||||  |||| || | |  |||   |||||| ||||||||||||  |||    
T  27665169 agcaatgaatgatgtggacaagttcatctaaacaaaatgaagaagtagcatagttcttagagaatataataatggcaatcctcgattcttcaatgctctt 27665268  T
Q  138 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 227  Q
       |||||| ||||||||||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  27665269 ccggagtgaaggtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagag 27665358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 2184459 - 2184117
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||| || | ||| ||||| ||||||| |||| || |  |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || ||    
T  2184459 agaaaactggtagaaccaggcgtccctttgacttggagtaacgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagttctttgagaa 2184360  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     ||||| || ||||| || || ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||| | |||| |||||| || | ||||||  |||| || |||| |    
T  2184359 aacagggatgaaaattctggactcttcaatggctttcataagtgatgctgttatttcaccccctcgttgaagctcctcgtcatccttgaaagtgtggact 2184260  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    ||  | | |   ||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||||   || || ||||| |||||||| |  || |||||| |  ||||      
T  2184259 ccacttttacatagagcatcgtaaagattgccggtaaaaccatggcgagtgtcagctcctctgaaacttaggaacacgttataggtgaatttggaggagg 2184160  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgatt---gcatagccatgagaat 341  Q
    ||||||| || ||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  2184159 atgaagaagaggaggaagatgattgtggcatagccatgagaat 2184117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25071813 - 25071589
Alignment:
Q  19 aggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcc 118  Q
    ||||||| ||||  |||| || ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||   |||| || ||   |||   ||| |    
T  25071813 aggcgactcttttccttgaagtagtgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagtctttagagaagacgataatggcaattc 25071714  T
Q  119 tagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagc 218  Q
    | || |||||||||  ||||  ||| || ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  25071713 tcgaatcttcaatgctcttgcggagcgaaggtgtgatttcgtcacctctcttaagctctttgtcatcaataaaggtgtggattcctttgtcagaaagagc 25071614  T
Q  219 cttgtagagattgccagtaaaaccg 243  Q
     || || ||||| || |||||||||    
T  25071613 tttataaagattaccggtaaaaccg 25071589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26975182 - 26974998
Alignment:
Q  43 tgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatga 142  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||   |||| || ||   |||   |||||| || |||||||||  ||||| ||    
T  26975182 tgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtctttagagaagacgataatggtaatcctcgagtcttcaatgctcttgagga 26975083  T
Q  143 gtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 227  Q
    | || ||||||||||| || ||| ||| ||| || ||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  26975082 gcgaaggtgtgatttcgtccccttttttaagctccttgtcatcaatgaagatgttgattcctttgtcagaaagagctttatagag 26974998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2185069 - 2184880
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||| |||| |||  |||| ||||||| |||| ||||  |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||   | || ||    
T  2185069 agaaaactggcagaaccgggcgtccctttgacttggagcaacgaatgatatggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaagcatagtcctttgagaa 2184970  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaa 191  Q
     ||||| || ||||| || |||||||||||||| || |  || |||||||| |||||| | |||| |||||| || | |||||| |||||    
T  2184969 aacagggatgaaaattctggattcttcaatggctttcacaagcgatggtgttatttcaccccctcgttgaagctcttcgtcatccatgaa 2184880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 203
Target Start/End: Original strand, 26893543 - 26893688
Alignment:
Q  58 agttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgattt 157  Q
    ||||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||| |  || |||||  | ||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  26893543 agttcttccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaggactggaatgtatatcatagactcttcaattgccttgataagtgatggtgagattt 26893642  T
Q  158 catctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcc 203  Q
    | || ||||| ||||| ||  | |||||||||||||| || |||||    
T  26893643 cgtcacctctatgaagctctgtatcatcaatgaaggtgtgaattcc 26893688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25579610 - 25579566
Alignment:
Q  315 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaa 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25579610 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaa 25579566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26811568 - 26811453
Alignment:
Q  114 aatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagta 213  Q
    ||||||||| | |||||||  ||||| ||| || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  26811568 aatcctagagtgttcaatgctcttgaggagcgaaggtgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaa 26811469  T
Q  214 agagccttgtagagat 229  Q
    ||||| || |||||||    
T  26811468 agagctttatagagat 26811453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26617351 - 26617266
Alignment:
Q  148 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcc 233  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || |||||||||||    
T  26617351 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgcc 26617266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26723279 - 26723194
Alignment:
Q  148 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgcc 233  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || |||||||||||    
T  26723279 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagattgcc 26723194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26959190 - 26959111
Alignment:
Q  148 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 227  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || |||||    
T  26959190 ggtgtgatttcatccccttttttaagctctttgtcatcaatgaaggtgtcgattcctttgtcagaaagagctttatagag 26959111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Original strand, 28491660 - 28491744
Alignment:
Q  126 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || | ||| || ||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  28491660 ttcaatggctttgatgagtgatggtgtgatttcttcacctttttgaagctcctcgtcgtccatgaaagtacggactcctttgtca 28491744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Original strand, 29804070 - 29804154
Alignment:
Q  126 ttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || | ||| || ||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  29804070 ttcaatggctttgatgagtgatggtgtgatttcttcacctttttgaagctcctcgtcgtccatgaaagtacggactcctttgtca 29804154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29467876 - 29467797
Alignment:
Q  124 tcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcc 203  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| || |  ||||| |||||||| || |||||    
T  29467876 tcttcaatagctttgatgagtgatggtgtgatttcttcgcctttttgaagttcttcatcatccatgaaggtgtgaattcc 29467797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 335
Target Start/End: Original strand, 26018770 - 26018836
Alignment:
Q  269 tgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 335  Q
    |||||||||||||||| |||| |  ||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  26018770 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagacgaaggtgattgaatagccat 26018836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 335
Target Start/End: Original strand, 26139474 - 26139540
Alignment:
Q  269 tgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 335  Q
    |||||||||||||||| |||| |  ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  26139474 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagaggaaggtgattgaataaccat 26139540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 399
Target Start/End: Original strand, 14371 - 14767
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14371 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaa-aggcatagttgatagaaa 14469  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14470 acacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 14569  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  14570 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaa 14669  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttt 399  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14670 aatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgagagaaataggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttt 14767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 4 - 409
Target Start/End: Original strand, 3439 - 3844
Alignment:
Q  4 aaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatag-ttgatagaaaac 102  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3439 aaaacaggcagaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcataggttgatagaaaac 3538  T
Q  103 acaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3539 acaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattc 3638  T
Q  203 ccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaa 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  3639 ccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaa 3738  T
Q  303 tgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgt 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  3739 tgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattgagagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaatttttgt 3837  T
Q  403 ggtctgt 409  Q
    |||||||    
T  3838 ggtctgt 3844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 246 - 410
Target Start/End: Original strand, 8061 - 8225
Alignment:
Q  246 ccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaa 345  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  8061 ccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgag 8160  T
Q  346 agaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 410  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||    
T  8161 agaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaatttttgtgttctgtg 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 4686 - 5100
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  4686 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggacaagttcgtccaaacaaaacgaagaaaaggcatagaagatagaaa 4785  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4786 acacaggaataaaaatcctagattcatcaatggccttgcggagggatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgat 4885  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  4886 tcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgtggcgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaa 4985  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatg-----aatgaataag 395  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||     ||||||||||    
T  4986 aatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatttaatgaataag 5085  T
Q  396 tttttgtggtctgtg 410  Q
    |||||||||||||||    
T  5086 tttttgtggtctgtg 5100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Original strand, 13647 - 14056
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||| ||| |||||||||||||    
T  13647 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttttgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaa 13746  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  13747 acacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgat 13846  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  13847 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaa 13946  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagttttt 400  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  13947 aatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgataattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgttttt 14046  T
Q  401 gtggtctgtg 410  Q
    ||||||||||    
T  14047 gtggtctgtg 14056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7697 - 7295
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||    |||| ||| |||||||||||||    
T  7697 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccttctgtcttgtagcaatgaataatgtgaacaagttcgtccaagcaaaattttgaagtggcgtagttgatagaaa 7598  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7597 acacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgat 7498  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  7497 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaa 7398  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagttttt 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||       ||||||||||||| |||||||||    
T  7397 aatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatgaaaaaagagtttg-------agaatatgaatgagtaagttttt 7305  T
Q  401 gtggtctgtg 410  Q
    ||||||||||    
T  7304 gtggtctgtg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 2 - 408
Target Start/End: Original strand, 18699403 - 18699807
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18699403 agaaaacaggcaaaacgagacgaccttttgtcttgtagcagtgaatgatgtgaacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18699502  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  18699503 cacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18699602  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18699603 cccttgtcagtaagagctttgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcagtgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaa 18699702  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttg 401  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  18699703 atgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaactagatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga--ggttaagtttttg 18699800  T
Q  402 tggtctg 408  Q
    |||||||    
T  18699801 tggtctg 18699807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 410
Target Start/End: Original strand, 18679570 - 18679976
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18679570 agaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18679669  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  18679670 cacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18679769  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18679770 cctttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaa 18679869  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttg 401  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  18679870 atgaagagaatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatagagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga--gtttaagtttttg 18679967  T
Q  402 tggtctgtg 410  Q
    |||| ||||    
T  18679968 tggtatgtg 18679976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 410
Target Start/End: Original strand, 18731507 - 18731913
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18731507 agaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18731606  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  18731607 cacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18731706  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18731707 cccttgtcagtaagagctctgtagagatggccagtaaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaa 18731806  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttg 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  18731807 atgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatcgagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga--gtttaagtttttg 18731904  T
Q  402 tggtctgtg 410  Q
    |||| ||||    
T  18731905 tggtatgtg 18731913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 2 - 410
Target Start/End: Original strand, 18655480 - 18655886
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18655480 agaaaacaggaaaaacgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgcggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18655579  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  18655580 cacaggaataaagatcctagactcttgaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18655679  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18655680 cccttgtcagtaagagctttgtagagatgcccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaa 18655779  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttg 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  18655780 atgaagaggatgaggaaggtgattgcctagccatgaaaattgagagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga--gtttaagtttttg 18655877  T
Q  402 tggtctgtg 410  Q
    |||| ||||    
T  18655878 tggtatgtg 18655886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 2 - 344
Target Start/End: Original strand, 18724088 - 18724430
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18724088 agaaaacaggcaaaacaagacgaccctttgtcttgtagcagtgcatgatgtggacaagttcgttcaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 18724187  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||    
T  18724188 cacaggaatgaagatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggatt 18724287  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  18724288 cccttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccgttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaa 18724387  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattga 344  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18724388 atgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattga 18724430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 18073934 - 18073535
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||    
T  18073934 aagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaa 18073835  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatc------aatgaaggt 194  Q
    | |  ||||| |||||||| |||||||||||     ||||      |||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||      |  ||||||    
T  18073834 atatgggaatcaaaatcctggattcttcaataa---tgat------tggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggt 18073744  T
Q  195 atggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgta 294  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| || || |||||||||| | |||| |||||| |    
T  18073743 acgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgca 18073644  T
Q  295 taggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataa 394  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||  | |||||| || |||||||||||||||||||  |     
T  18073643 taggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgaggat 18073546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 34 - 405
Target Start/End: Original strand, 17989088 - 17989454
Alignment:
Q  34 ttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatgg 133  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||| |  ||||| |||||||| |||||||||||      
T  17989088 ttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaaatatgggaatcaaaatcctggattcttcaataa 17989187  T
Q  134 ccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatc------aatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 227  Q
       ||||      |||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||      |  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  17989188 ---tgat------tggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagag 17989278  T
Q  228 attgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgc 327  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||  ||||| || || |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  17989279 attgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgc 17989378  T
Q  328 atagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataagtttttgtggt 405  Q
    || |||||||||||||| ||||||  ||||  | |||||| || |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  17989379 atggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgaggatgtttttgtggt 17989454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 269
Target Start/End: Original strand, 5090970 - 5091237
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||| |||  |||| |||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||    
T  5090970 agaaaataggcaaaaccaggcaaccattttccttggagcagtgaataatatggacaagttcatctaaacaaaacgaagaagaagcatagtggttagagaa 5091069  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
     ||   ||| | |||| ||||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||||  |||||||  ||||| ||  |||||||||||||||| || |||    
T  5091070 aacgataatgacaatcttagattcttgaatggccttgagaagtgacggtgttatttggtctcctcgctgaagctctctgtcatcaatgaaggtgtgaatt 5091169  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaact 269  Q
    |||||| ||   ||||| |  |||||||| |||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||    
T  5091170 cccttgacacgtagagcttcatagagatttccagtaaaaccgtaacgagtgtcggtgcctctaaaact 5091237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 79 - 410
Target Start/End: Original strand, 10 - 334
Alignment:
Q  79 gaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 178  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10 gaagtggcgtagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcgatggccttgaggagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcat 109  T
Q  179 tgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 278  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  110 tgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacac 209  T
Q  279 ttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgca 378  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||       |    
T  210 ttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattgagagaaattagatgaaaaaagagtttg-------a 302  T
Q  379 gaatatgaatgaataagtttttgtggtctgtg 410  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  303 gaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 28164364 - 28164735
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  28164364 aagaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagata 28164463  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggat 200  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||| || || ||    
T  28164464 acacaggaataaaaattcaagatttttcaatggccttgatgaatgacggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaat 28164563  T
Q  201 tcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaa 300  Q
    |||||||||   ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  28164564 tcccttgtcgtcaagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctaaaactgaggaacacttggtatgtgaatccataggaa 28164663  T
Q  301 aatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctggg 372  Q
    | |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  28164664 attgaagaggaagaggaatgcgatcgtatagccatgagaattgacagaaattggatgagaaaagagtttggg 28164735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 352
Target Start/End: Original strand, 268368 - 268711
Alignment:
Q  10 ggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaa 109  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268368 ggcaaaatgagacgaccctttttcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaa 268467  T
Q  110 taaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtc 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  268468 taaaaatcctagactcttcaatggcattgtcgagtgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtc 268567  T
Q  210 agtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagag 309  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |  |||||||||  ||| || ||  ||||||| || ||||| |  |||  ||| || | |||||||    
T  268568 agtaagagccttgtagagatggccaataaaaccctcacgagtgtcaccgcctctgaagttgaggaagacctggtaggcaaatccatatgagattgaagag 268667  T
Q  310 gaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattga-aagaaatt 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  268668 gaagaggaaggtgattgcatagccatgagaactgagaagaaatt 268711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 28127681 - 28128042
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  28127681 aagaaaacaggcaaaactaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtgcacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttggtagaaa 28127780  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcat-ctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatgga 199  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||  | ||||||| | ||||| |   ||||||||||| || ||||    
T  28127781 atacaggaataaaaattctagattcttcaatggcctttaaaagtgacggtgtgatttttttctcctctctcaagattacaatcatcaatgaatgtgtgga 28127880  T
Q  200 ttcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtatagga 299  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  28127881 ttcccttgtcataaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtatgtgaatccatagga 28127980  T
Q  300 aaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagt 367  Q
    || |      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  28127981 aatt------gaagaggaatgtgattgcatagccatgagaattgacaaaaattggatgagaaaagagt 28128042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 29273786 - 29274123
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29273786 agaagacaggcaaaatgagacgaccctttgtcttgtagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatgaagaagaggcatagttgatagaaaa 29273885  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||    
T  29273886 cacaggaataaaaattctagactcttcaatgacattgtcgagtgatgatttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggatt 29273985  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaa 301  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||  ||| |||||  ||||||| || ||||||||||||  ||| || |    
T  29273986 cccttgtcagtaagagtcttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagtgtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgaga 29274085  T
Q  302 atgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgaga 339  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29274086 ttgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgaga 29274123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 31903910 - 31903733
Alignment:
Q  114 aatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagta 213  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| ||||| ||||||||||| |||  |    
T  31903910 aatcctagactcttcaattgcctctaaaagtgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataa 31903811  T
Q  214 agagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 291  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| | ||| ||||||    
T  31903810 agagctttgtagagatttccagtaaaaccatagcgagtgtctaagcctctaaagctgaggaacacatcgtaggtgaat 31903733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 229
Target Start/End: Original strand, 16373154 - 16373305
Alignment:
Q  78 agaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatca 177  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | |   ||| |||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||     
T  16373154 agaagaggcatagttcgtagaaaatataattatacaaatcctagactcttcgattgccttaaaaagcgatggagtgatctcatctcctatttgaagctcc 16373253  T
Q  178 ttgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 229  Q
       |||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  16373254 gaatcatgaatgaaggtacggatccctttgtcagtcagagctttgtacagat 16373305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 59742 - 59343
Alignment:
Q  1 aagaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||| | |||||||| |||||||||  |||||    
T  59742 aagaaaacaggcaaaacgaggcaacccttggttttgtagcagtgaatgatgtggacaagtgtgtccaaacaagatgaagaagatgcatagttggcagaaa 59643  T
Q  101 acacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatc------aatgaaggt 194  Q
    | |  ||||| |||||||| |||||||||||     ||||      |||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||||      |  ||||||    
T  59642 atatgggaatcaaaatcctggattcttcaataa---tgat------tggtgtgactttgtctcttctttgaagatcactgtcatcgtcatcatggaaggt 59552  T
Q  195 atggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgta 294  Q
    | | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||| |||||||||  ||||| || || |||||||||| | |||| |||||| |    
T  59551 acgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgaggaacacatcgtaactgaatgca 59452  T
Q  295 taggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaaattggatgaaaaaagagtctgggaatgcagaatatgaatgaataa 394  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||  | |||||| || |||||||||||||||||||  |     
T  59451 taggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaatgcagaatatgaatgaggat 59354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 34865 - 34620
Alignment:
Q  33 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 132  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34865 cttgaagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagactcttcaatg 34766  T
Q  133 gccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgc 232  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | ||||||||      
T  34765 gccttgaaaagtgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagatttt 34666  T
Q  233 cagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 278  Q
    | |||||||| |  ||||||||| | || |||||||| ||||||||    
T  34665 cggtaaaaccatagcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacac 34620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43129 - 42864
Alignment:
Q  10 ggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaa 109  Q
    |||||||| ||||| || ||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||    
T  43129 ggcaaaactaggcgtccatttttcttgcagcagtgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaa 43030  T
Q  110 taaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtc 209  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  || |||| | |||| ||  ||||||||||||||||  | |||||||| |     
T  43029 tgaaaatcctagactcttcaatggccttgaaaagtgatggtgttattttgtcacctcctggaagttctctgtcatcaatgaaggtgcgaattcccttctt 42930  T
Q  210 agtaagagccttgtagagattgccagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaa 275  Q
    |  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||    
T  42929 acaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaa 42864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 116931 - 116658
Alignment:
Q  38 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 137  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  116931 agcagtgaataatgtggacaagttcatccaagcaaaaggaagaagaagcataattgatagacaaaataggaatgaaaatcctagactcttcaatggcctt 116832  T
Q  138 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 237  Q
    ||  ||||| ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | ||||||||||| ||||||    
T  116831 gaaaagtgacggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagta 116732  T
Q  238 aaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagagga 311  Q
    ||||| |  ||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||  ||||||||| ||||||||    
T  116731 aaaccataacgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaagagga 116658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27588 - 27343
Alignment:
Q  33 cttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatg 132  Q
    |||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27588 cttgaagcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaagcaaaatgaagaagaagcataattgatagacaagacaggaatgaaaatcctagattcttcaatg 27489  T
Q  133 gccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgc 232  Q
     ||||||  ||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||  | ||||||| ||| || || |||||||| | |  |||| |  |||||||||| |    
T  27488 accttgaaaagtgatgatgttatttcatcacctccttgaagctctctatcatcaaagaatgtgtgaattcccttcttacaaagatcactgtagagatttc 27389  T
Q  233 cagtaaaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacac 278  Q
    |||||||||| |  ||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  27388 cagtaaaaccataacgagtgtcaatacctctaaaactaaggaacac 27343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Original strand, 58334 - 58607
Alignment:
Q  38 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 137  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  58334 agcagtgaatgatgtggacaagttcgttcaagcaaaatgaagaagaagcatagttgatagacaagacgggaatgaaaatcctagactctttaatggcctt 58433  T
Q  138 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 237  Q
    ||  ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||    
T  58434 gaaaagtgatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagta 58533  T
Q  238 aaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagagga 311  Q
    ||||| |  |||||||||   || ||||| || |||||||| || || ||||||  |||||| || ||||||||    
T  58534 aaaccatagcgagtgtcacaacctctaaagctaaggaacacgtgataggtgaatccataggagaaggaagagga 58607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16689182 - 16688944
Alignment:
Q  2 agaaaacaggcaaaacgaggcgaccctttgtcttgtagcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaa 101  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||   || |||  | ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||  |||||||    
T  16689182 agaaaacaggcaaaactagccgaccttttgcactgaagccatcaatgatgttgacaagttcatccaaacaaaacgaggaaaatgcatagttcttagaaaa 16689083  T
Q  102 cacaggaataaaaatcctagattcttcaatggccttgatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggatt 201  Q
    ||| || ||   |||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||  | |||||    
T  16689082 cacggggattgcaatccttgagtcttcaattgccttgataagtgatggtgtgattttgtcacctctctgaagttccttgtcatcaatgaagacacggatt 16688983  T
Q  202 cccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagtaaaa 240  Q
    |||||||||   ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  16688982 cccttgtcacatagagctttgtacagattaccagtaaaa 16688944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3279823 - 3279592
Alignment:
Q  38 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 137  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  3279823 agcaatgaatgatgtggacaagttcgtccaaacaaaatatagaagaagcatagttgatagagaagaccggaataaaaatcatggactcttcgatggcctt 3279724  T
Q  138 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccagta 237  Q
    ||  |||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||  | ||||||||||||||   || |||   |||| | | |||  | |||||||| ||||||    
T  3279723 gacaagtgattgtgtgatttcatcacctccatgaagctccctatcatcaatgaaggtgcagaatccaccgtcacttaaagctctatagagatttccagta 3279624  T
Q  238 aaaccgtgccgagtgtcaatgcccctaaaact 269  Q
    ||||| |  ||||||||| |||||||||||||    
T  3279623 aaaccatagcgagtgtcagtgcccctaaaact 3279592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 230
Target Start/End: Original strand, 17993736 - 17993928
Alignment:
Q  38 agcagtgaattatgtggactagttcgtccaaacaaaacgaagaagaggcatagttgatagaaaacacaggaataaaaatcctagattcttcaatggcctt 137  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||   | || || ||   |||   ||| || || |||||||||  |||    
T  17993736 agcattgaatgatgtggacaagttcgtctaaacaaaatgaagaagaagcatagtcctttgagaagacgataatcgcaattcttgagtcttcaatgctctt 17993835  T
Q  138 gatgagtgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 230  Q
    || ||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  17993836 gaggagcgacggtgtgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaaagagctttatagagatt 17993928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 269 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 5982 - 5916
Alignment:
Q  269 tgaggaacacttggtaagtgaatgtataggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 335  Q
    |||||||||||||||| |||| |  ||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  5982 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagaggaaggtgattgaataaccat 5916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University