View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5357-Insertion-2 (Length: 891)

Name: NF5357-Insertion-2
Description: NF5357
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5357-Insertion-2
NF5357-Insertion-2
[»] chr1 (116 HSPs)
chr1 (8-887)||(15669457-15670348)
chr1 (572-887)||(8347336-8347652)
chr1 (698-885)||(42922259-42922446)
chr1 (585-887)||(14183655-14183955)
chr1 (572-887)||(8349115-8349432)
chr1 (696-884)||(16428677-16428868)
chr1 (615-883)||(38925545-38925819)
chr1 (706-887)||(18800636-18800817)
chr1 (696-883)||(10399895-10400085)
chr1 (696-887)||(50076735-50076929)
chr1 (572-887)||(49495274-49495582)
chr1 (696-887)||(6756551-6756744)
chr1 (696-887)||(9241149-9241343)
chr1 (696-891)||(17186187-17186385)
chr1 (696-887)||(25127896-25128090)
chr1 (696-885)||(3579681-3579873)
chr1 (559-887)||(31422936-31423269)
chr1 (706-887)||(40133978-40134162)
chr1 (696-887)||(18839611-18839805)
chr1 (696-883)||(50307613-50307804)
chr1 (696-883)||(12302572-12302762)
chr1 (696-859)||(13215105-13215271)
chr1 (696-883)||(17324703-17324893)
chr1 (696-863)||(20291481-20291651)
chr1 (696-883)||(47906294-47906484)
chr1 (696-887)||(50078884-50079078)
chr1 (748-887)||(6115166-6115305)
chr1 (696-883)||(15823570-15823760)
chr1 (696-863)||(46431794-46431964)
chr1 (696-883)||(48665201-48665392)
chr1 (696-883)||(51750063-51750253)
chr1 (696-883)||(11457542-11457732)
chr1 (703-887)||(13125521-13125707)
chr1 (696-887)||(18307133-18307327)
chr1 (659-883)||(24325650-24325877)
chr1 (696-863)||(16226191-16226362)
chr1 (696-887)||(17318917-17319105)
chr1 (696-863)||(28840704-28840874)
chr1 (696-863)||(39462543-39462713)
chr1 (696-883)||(15294901-15295091)
chr1 (696-887)||(25251338-25251532)
chr1 (615-883)||(41646860-41647134)
chr1 (698-858)||(26520205-26520372)
chr1 (695-883)||(2510392-2510582)
chr1 (696-883)||(21948255-21948444)
chr1 (696-863)||(28842519-28842689)
chr1 (696-883)||(2617540-2617730)
chr1 (712-887)||(17324103-17324281)
chr1 (696-863)||(20302483-20302653)
chr1 (696-863)||(39932097-39932267)
chr1 (696-863)||(9459503-9459674)
chr1 (696-863)||(9463330-9463501)
chr1 (703-863)||(13761868-13762031)
chr1 (696-883)||(14098036-14098227)
chr1 (696-887)||(31425078-31425276)
chr1 (696-863)||(47179737-47179908)
chr1 (696-863)||(6995787-6995957)
chr1 (696-883)||(2949298-2949488)
chr1 (712-883)||(50248639-50248813)
chr1 (696-863)||(51752389-51752558)
chr1 (696-887)||(4131439-4131636)
chr1 (749-863)||(16231643-16231758)
chr1 (696-863)||(31489939-31490107)
chr1 (696-863)||(31735608-31735778)
chr1 (723-887)||(16432446-16432612)
chr1 (749-887)||(25248615-25248753)
chr1 (696-863)||(28998340-28998510)
chr1 (696-863)||(29004056-29004226)
chr1 (754-887)||(16429042-16429175)
chr1 (698-863)||(27339217-27339385)
chr1 (696-863)||(47177386-47177557)
chr1 (696-863)||(6823039-6823208)
chr1 (696-863)||(27337026-27337195)
chr1 (696-887)||(28279293-28279484)
chr1 (765-863)||(51757627-51757725)
chr1 (763-863)||(23785933-23786034)
chr1 (736-887)||(155773-155924)
chr1 (736-887)||(26613303-26613455)
chr1 (749-885)||(16561546-16561683)
chr1 (696-863)||(6823909-6824086)
chr1 (736-883)||(30738697-30738845)
chr1 (736-887)||(30790464-30790615)
chr1 (698-828)||(27916525-27916653)
chr1 (696-883)||(28207133-28207323)
chr1 (673-813)||(26332699-26332837)
chr1 (615-883)||(47451588-47451856)
chr1 (751-828)||(14353047-14353126)
chr1 (751-826)||(26332613-26332688)
chr1 (755-887)||(43104245-43104379)
chr1 (810-883)||(23816027-23816100)
chr1 (751-828)||(4144804-4144882)
chr1 (698-796)||(13127787-13127885)
chr1 (751-828)||(2232580-2232658)
chr1 (751-861)||(49959129-49959241)
chr1 (766-828)||(14997040-14997101)
chr1 (415-481)||(18801043-18801109)
chr1 (751-828)||(2401342-2401420)
chr1 (751-828)||(9526449-9526527)
chr1 (751-828)||(21353467-21353545)
chr1 (751-828)||(25134054-25134132)
chr1 (763-828)||(37990770-37990836)
chr1 (751-828)||(9521698-9521776)
chr1 (751-827)||(2393404-2393481)
chr1 (754-807)||(10115868-10115922)
chr1 (415-452)||(16430823-16430860)
chr1 (415-455)||(17323785-17323825)
chr1 (415-447)||(17352797-17352829)
chr1 (415-447)||(31423403-31423435)
chr1 (415-455)||(50249093-50249133)
chr1 (775-814)||(3091240-3091279)
chr1 (766-828)||(13785392-13785455)
chr1 (416-455)||(25251775-25251814)
chr1 (751-861)||(46783126-46783240)
chr1 (405-447)||(50308045-50308087)
chr1 (593-634)||(43104078-43104118)
chr1 (415-452)||(50079346-50079383)
[»] chr7 (113 HSPs)
chr7 (593-883)||(20091610-20091901)
chr7 (572-887)||(24817415-24817729)
chr7 (593-887)||(7188472-7188767)
chr7 (696-887)||(25276175-25276369)
chr7 (698-887)||(24813560-24813748)
chr7 (648-886)||(24258448-24258690)
chr7 (696-883)||(9679093-9679283)
chr7 (696-887)||(20137170-20137364)
chr7 (706-887)||(27832694-27832878)
chr7 (696-887)||(39146048-39146242)
chr7 (696-877)||(42331068-42331254)
chr7 (696-861)||(11355292-11355460)
chr7 (696-883)||(4295999-4296190)
chr7 (646-883)||(21678049-21678290)
chr7 (696-883)||(11757263-11757454)
chr7 (696-883)||(20299493-20299684)
chr7 (696-883)||(9680853-9681044)
chr7 (696-887)||(13099536-13099731)
chr7 (703-890)||(24465582-24465767)
chr7 (696-863)||(443629-443799)
chr7 (696-883)||(44724613-44724803)
chr7 (698-887)||(24748630-24748822)
chr7 (696-883)||(7470087-7470277)
chr7 (696-883)||(38394020-38394210)
chr7 (696-863)||(40836827-40836997)
chr7 (696-883)||(21680061-21680251)
chr7 (696-887)||(31435108-31435302)
chr7 (696-863)||(7349357-7349528)
chr7 (696-887)||(37412187-37412383)
chr7 (696-863)||(1047009-1047179)
chr7 (696-883)||(3878611-3878801)
chr7 (696-863)||(18345575-18345745)
chr7 (708-883)||(21990196-21990374)
chr7 (696-883)||(48457687-48457877)
chr7 (696-883)||(43253582-43253771)
chr7 (698-863)||(20297398-20297566)
chr7 (593-887)||(22828694-22828993)
chr7 (696-883)||(42223191-42223382)
chr7 (696-883)||(35663-35853)
chr7 (615-883)||(27306295-27306568)
chr7 (696-863)||(7351736-7351907)
chr7 (696-863)||(1049380-1049550)
chr7 (730-883)||(7092277-7092432)
chr7 (696-883)||(7472045-7472235)
chr7 (696-883)||(28487587-28487777)
chr7 (696-883)||(40946362-40946552)
chr7 (696-883)||(20626072-20626262)
chr7 (696-883)||(20629963-20630153)
chr7 (696-883)||(20642382-20642572)
chr7 (696-883)||(21592208-21592398)
chr7 (696-850)||(26804603-26804763)
chr7 (698-883)||(1850017-1850205)
chr7 (712-887)||(6332272-6332448)
chr7 (696-863)||(31155995-31156166)
chr7 (749-883)||(7094525-7094659)
chr7 (696-863)||(25542564-25542733)
chr7 (696-883)||(28485600-28485790)
chr7 (696-883)||(44598-44788)
chr7 (696-887)||(22251607-22251797)
chr7 (696-863)||(3035755-3035928)
chr7 (703-806)||(22392506-22392608)
chr7 (763-863)||(2935372-2935473)
chr7 (667-891)||(11081515-11081741)
chr7 (749-863)||(38396725-38396839)
chr7 (697-887)||(6048909-6049098)
chr7 (763-863)||(9027278-9027378)
chr7 (763-863)||(1606484-1606584)
chr7 (763-863)||(22108171-22108271)
chr7 (763-863)||(40549931-40550031)
chr7 (789-885)||(6348912-6349008)
chr7 (751-827)||(16297146-16297222)
chr7 (723-828)||(11084439-11084544)
chr7 (763-863)||(22137182-22137282)
chr7 (763-863)||(40552209-40552309)
chr7 (714-887)||(13290536-13290710)
chr7 (798-887)||(26295586-26295675)
chr7 (813-887)||(22393876-22393950)
chr7 (729-807)||(12310157-12310236)
chr7 (736-850)||(40281475-40281590)
chr7 (635-756)||(6348791-6348913)
chr7 (697-828)||(26210580-26210710)
chr7 (751-828)||(3320171-3320249)
chr7 (751-828)||(3324919-3324997)
chr7 (751-828)||(7069763-7069841)
chr7 (751-828)||(7074770-7074848)
chr7 (414-478)||(20092017-20092081)
chr7 (751-828)||(25351336-25351414)
chr7 (751-828)||(25357030-25357108)
chr7 (751-828)||(25405376-25405454)
chr7 (751-828)||(25410113-25410191)
chr7 (751-828)||(42006646-42006724)
chr7 (766-828)||(2120899-2120960)
chr7 (723-828)||(21369592-21369703)
chr7 (751-828)||(8378625-8378703)
chr7 (751-804)||(15541139-15541194)
chr7 (751-828)||(30246953-30247031)
chr7 (751-828)||(44512646-44512724)
chr7 (775-816)||(6067332-6067373)
chr7 (751-817)||(44143997-44144065)
chr7 (696-777)||(18567647-18567731)
chr7 (415-455)||(22829131-22829171)
chr7 (753-807)||(8260570-8260625)
chr7 (769-804)||(34547007-34547042)
chr7 (405-447)||(11355000-11355042)
chr7 (415-449)||(39146490-39146524)
chr7 (791-887)||(6046625-6046721)
chr7 (410-455)||(24748341-24748386)
chr7 (414-449)||(21677795-21677830)
chr7 (750-807)||(2990772-2990830)
chr7 (414-452)||(24817872-24817910)
chr7 (414-447)||(4296423-4296456)
chr7 (593-634)||(6332155-6332195)
chr7 (415-452)||(20137631-20137668)
[»] chr6 (94 HSPs)
chr6 (667-887)||(3027915-3028135)
chr6 (703-887)||(15719712-15719895)
chr6 (703-887)||(17012109-17012293)
chr6 (696-887)||(13057253-13057447)
chr6 (696-887)||(3631999-3632193)
chr6 (703-887)||(32280062-32280249)
chr6 (696-883)||(15530188-15530377)
chr6 (670-887)||(16455487-16455705)
chr6 (696-877)||(3629935-3630119)
chr6 (696-877)||(25477333-25477517)
chr6 (696-887)||(13039813-13040007)
chr6 (696-885)||(3390438-3390630)
chr6 (696-883)||(9019985-9020175)
chr6 (696-863)||(26932646-26932817)
chr6 (696-883)||(11983094-11983284)
chr6 (696-875)||(15541213-15541395)
chr6 (754-887)||(1069780-1069913)
chr6 (703-875)||(15367101-15367272)
chr6 (696-863)||(4816316-4816486)
chr6 (696-883)||(15532746-15532936)
chr6 (696-865)||(19704651-19704824)
chr6 (696-883)||(14458832-14459020)
chr6 (696-863)||(14507260-14507430)
chr6 (696-883)||(28241386-28241576)
chr6 (696-883)||(30967260-30967450)
chr6 (696-883)||(1230314-1230504)
chr6 (696-877)||(3233801-3233986)
chr6 (703-887)||(19696508-19696693)
chr6 (696-863)||(2628970-2629140)
chr6 (750-887)||(12186133-12186271)
chr6 (714-887)||(20526885-20527058)
chr6 (696-887)||(22490699-22490893)
chr6 (696-863)||(20915440-20915611)
chr6 (736-887)||(26945245-26945397)
chr6 (749-863)||(5273300-5273415)
chr6 (696-883)||(30034668-30034858)
chr6 (696-863)||(12195599-12195770)
chr6 (749-856)||(26065098-26065205)
chr6 (749-856)||(26085067-26085174)
chr6 (696-842)||(19227514-19227663)
chr6 (696-866)||(30728910-30729083)
chr6 (714-887)||(14466399-14466576)
chr6 (696-883)||(12161622-12161810)
chr6 (698-887)||(22858015-22858203)
chr6 (696-887)||(24338508-24338703)
chr6 (763-882)||(26066190-26066309)
chr6 (763-863)||(33308986-33309086)
chr6 (763-863)||(33311255-33311355)
chr6 (714-877)||(25078629-25078792)
chr6 (763-863)||(26068479-26068580)
chr6 (763-863)||(29754793-29754894)
chr6 (752-883)||(28037795-28037927)
chr6 (745-826)||(11138417-11138499)
chr6 (751-877)||(7542454-7542581)
chr6 (703-779)||(15346449-15346524)
chr6 (723-887)||(30445603-30445777)
chr6 (726-822)||(30443388-30443484)
chr6 (751-828)||(13878710-13878788)
chr6 (751-828)||(13883458-13883536)
chr6 (751-828)||(16785902-16785980)
chr6 (751-828)||(26887345-26887423)
chr6 (415-463)||(26944926-26944974)
chr6 (751-828)||(31248835-31248913)
chr6 (751-828)||(35201447-35201525)
chr6 (723-826)||(19701985-19702094)
chr6 (769-828)||(22351973-22352031)
chr6 (774-828)||(5165936-5165989)
chr6 (724-827)||(6843217-6843325)
chr6 (766-887)||(12937255-12937376)
chr6 (751-828)||(3577636-3577713)
chr6 (751-828)||(17036038-17036116)
chr6 (751-828)||(17694972-17695050)
chr6 (774-828)||(11262596-11262649)
chr6 (766-887)||(12911508-12911629)
chr6 (751-828)||(13467585-13467662)
chr6 (810-875)||(15346523-15346588)
chr6 (773-828)||(12166267-12166321)
chr6 (833-887)||(28078257-28078310)
chr6 (696-741)||(32447525-32447571)
chr6 (772-828)||(25941650-25941704)
chr6 (769-849)||(26643179-26643259)
chr6 (769-849)||(26749145-26749225)
chr6 (412-452)||(3390129-3390169)
chr6 (415-455)||(3632454-3632494)
chr6 (415-455)||(13056949-13056989)
chr6 (751-804)||(33215810-33215865)
chr6 (415-454)||(3630383-3630422)
chr6 (769-804)||(22342945-22342980)
chr6 (572-634)||(15719580-15719641)
chr6 (829-887)||(25465653-25465710)
chr6 (415-452)||(3396095-3396132)
chr6 (414-447)||(13039508-13039541)
chr6 (768-828)||(17904470-17904531)
chr6 (414-447)||(24338996-24339029)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (635-887)||(9020185-9020436)
chr5 (545-837)||(42770645-42770934)
chr5 (696-887)||(16092261-16092455)
chr5 (696-883)||(18511277-18511467)
chr5 (698-887)||(6661247-6661436)
chr5 (696-887)||(31472674-31472868)
chr5 (696-887)||(34530727-34530921)
chr5 (672-887)||(17413228-17413443)
chr5 (696-883)||(25804049-25804239)
chr5 (696-883)||(6745093-6745282)
chr5 (696-883)||(658418-658608)
chr5 (749-887)||(695958-696095)
chr5 (696-883)||(18509383-18509573)
chr5 (696-883)||(31466044-31466233)
chr5 (696-887)||(40221546-40221740)
chr5 (696-887)||(1189670-1189864)
chr5 (696-883)||(10529164-10529354)
chr5 (696-887)||(18596669-18596863)
chr5 (749-883)||(20505906-20506040)
chr5 (696-863)||(39398078-39398248)
chr5 (696-883)||(2174943-2175132)
chr5 (696-883)||(4236653-4236843)
chr5 (696-887)||(6756518-6756710)
chr5 (696-883)||(16776182-16776371)
chr5 (696-883)||(17818555-17818745)
chr5 (696-883)||(21948050-21948240)
chr5 (696-883)||(25904127-25904317)
chr5 (696-863)||(39854507-39854677)
chr5 (696-863)||(31545104-31545275)
chr5 (647-883)||(37705845-37706085)
chr5 (696-883)||(24126880-24127070)
chr5 (696-883)||(25921538-25921728)
chr5 (696-863)||(38882130-38882300)
chr5 (696-887)||(17072907-17073101)
chr5 (696-863)||(27910474-27910644)
chr5 (696-863)||(31179455-31179626)
chr5 (726-883)||(2954472-2954630)
chr5 (696-849)||(6747330-6747485)
chr5 (749-863)||(4410103-4410217)
chr5 (696-863)||(18466708-18466878)
chr5 (696-863)||(18469035-18469205)
chr5 (696-863)||(27912560-27912730)
chr5 (749-863)||(39798127-39798241)
chr5 (696-863)||(15552269-15552440)
chr5 (674-887)||(20053847-20054053)
chr5 (696-843)||(31542759-31542910)
chr5 (696-827)||(20043074-20043208)
chr5 (696-831)||(20045034-20045172)
chr5 (696-883)||(26097757-26097946)
chr5 (703-863)||(10474408-10474571)
chr5 (696-863)||(21684536-21684706)
chr5 (714-828)||(4754198-4754312)
chr5 (750-887)||(36208656-36208794)
chr5 (696-863)||(34477137-34477309)
chr5 (696-863)||(34479502-34479674)
chr5 (696-883)||(2818400-2818591)
chr5 (703-883)||(36402393-36402576)
chr5 (749-863)||(10586912-10587026)
chr5 (763-863)||(10749794-10749895)
chr5 (736-887)||(15143532-15143684)
chr5 (696-863)||(12556009-12556178)
chr5 (749-883)||(41585809-41585943)
chr5 (793-883)||(42770934-42771024)
chr5 (763-863)||(3373221-3373322)
chr5 (698-887)||(2144624-2144815)
chr5 (763-863)||(38960216-38960316)
chr5 (769-887)||(4897828-4897947)
chr5 (763-857)||(10757271-10757365)
chr5 (763-863)||(15354659-15354759)
chr5 (763-863)||(15356935-15357035)
chr5 (763-863)||(23665138-23665238)
chr5 (763-863)||(23793349-23793449)
chr5 (698-849)||(21288790-21288949)
chr5 (703-808)||(26098391-26098499)
chr5 (723-826)||(34033691-34033796)
chr5 (752-863)||(2723985-2724087)
chr5 (723-828)||(15224889-15224996)
chr5 (751-828)||(2298122-2298200)
chr5 (751-828)||(10627347-10627425)
chr5 (772-863)||(23741943-23742034)
chr5 (698-823)||(29748377-29748502)
chr5 (723-828)||(26406594-26406705)
chr5 (723-828)||(31782578-31782689)
chr5 (751-828)||(1170794-1170872)
chr5 (751-828)||(35385573-35385651)
chr5 (751-887)||(35430259-35430398)
chr5 (696-826)||(13295765-13295896)
chr5 (766-887)||(15445328-15445453)
chr5 (723-801)||(16093438-16093522)
chr5 (751-828)||(22672817-22672895)
chr5 (751-828)||(25452478-25452556)
chr5 (769-828)||(11962554-11962612)
chr5 (751-828)||(32520518-32520597)
chr5 (771-828)||(25445501-25445557)
chr5 (751-828)||(1240411-1240489)
chr5 (415-455)||(20044757-20044797)
chr5 (751-804)||(28786387-28786442)
chr5 (421-484)||(34531136-34531199)
chr5 (751-804)||(17841393-17841448)
chr5 (415-454)||(24126579-24126618)
chr5 (415-452)||(1190117-1190154)
chr5 (418-455)||(2723698-2723735)
[»] chr4 (132 HSPs)
chr4 (648-887)||(18537536-18537775)
chr4 (698-887)||(19322776-19322965)
chr4 (703-863)||(18534918-18535078)
chr4 (615-887)||(8756313-8756589)
chr4 (698-887)||(38890287-38890476)
chr4 (696-883)||(13544037-13544227)
chr4 (696-887)||(37313127-37313321)
chr4 (696-883)||(33415553-33415742)
chr4 (696-887)||(36378370-36378564)
chr4 (696-883)||(12395910-12396100)
chr4 (696-863)||(24879067-24879237)
chr4 (696-863)||(24880529-24880699)
chr4 (696-883)||(40637152-40637342)
chr4 (696-883)||(12400872-12401062)
chr4 (615-883)||(22802799-22803073)
chr4 (696-887)||(36380427-36380621)
chr4 (615-883)||(48486313-48486587)
chr4 (696-883)||(19095960-19096151)
chr4 (593-887)||(28453660-28453954)
chr4 (706-887)||(30136640-30136821)
chr4 (696-863)||(16934227-16934398)
chr4 (696-883)||(8631484-8631674)
chr4 (696-883)||(36921558-36921749)
chr4 (696-883)||(38928242-38928433)
chr4 (696-883)||(14633397-14633586)
chr4 (696-887)||(16453387-16453581)
chr4 (696-883)||(22800927-22801117)
chr4 (696-883)||(24888874-24889064)
chr4 (696-855)||(26086069-26086231)
chr4 (696-883)||(41997570-41997760)
chr4 (696-863)||(16931873-16932044)
chr4 (698-883)||(9863791-9863974)
chr4 (696-883)||(3824635-3824825)
chr4 (696-883)||(5637530-5637720)
chr4 (749-887)||(16455375-16455513)
chr4 (696-863)||(18709248-18709418)
chr4 (696-883)||(40091480-40091670)
chr4 (696-863)||(31849683-31849854)
chr4 (696-863)||(44599922-44600093)
chr4 (696-863)||(18847231-18847402)
chr4 (696-863)||(22046770-22046940)
chr4 (696-883)||(24348296-24348486)
chr4 (696-863)||(38409283-38409453)
chr4 (593-863)||(47868373-47868649)
chr4 (696-863)||(51015324-51015494)
chr4 (757-887)||(2891433-2891563)
chr4 (696-863)||(9148331-9148501)
chr4 (696-883)||(14787496-14787686)
chr4 (696-863)||(37089456-37089626)
chr4 (696-883)||(47274805-47274994)
chr4 (703-887)||(27499130-27499314)
chr4 (664-887)||(47150955-47151177)
chr4 (696-863)||(9176558-9176729)
chr4 (696-863)||(11006321-11006492)
chr4 (696-863)||(22782822-22782993)
chr4 (696-863)||(2484957-2485127)
chr4 (696-863)||(9174230-9174401)
chr4 (696-863)||(22044475-22044645)
chr4 (696-863)||(22132476-22132645)
chr4 (696-863)||(36919669-36919840)
chr4 (696-883)||(619512-619702)
chr4 (696-857)||(11008656-11008821)
chr4 (749-883)||(17662310-17662444)
chr4 (696-863)||(18409432-18409602)
chr4 (698-887)||(40999011-40999201)
chr4 (696-863)||(22780457-22780628)
chr4 (696-849)||(56030522-56030678)
chr4 (696-863)||(11435033-11435203)
chr4 (698-885)||(15032612-15032790)
chr4 (696-863)||(5198498-5198668)
chr4 (765-883)||(13547304-13547422)
chr4 (696-833)||(6132950-6133090)
chr4 (637-887)||(10112890-10113141)
chr4 (749-863)||(7941457-7941571)
chr4 (697-887)||(9022386-9022577)
chr4 (696-863)||(22134701-22134870)
chr4 (749-883)||(6764978-6765112)
chr4 (750-887)||(12102221-12102359)
chr4 (698-843)||(3937314-3937462)
chr4 (696-863)||(52942544-52942701)
chr4 (750-887)||(31983589-31983727)
chr4 (765-863)||(47210837-47210935)
chr4 (723-887)||(3982238-3982410)
chr4 (749-844)||(53405263-53405358)
chr4 (736-887)||(25357757-25357913)
chr4 (698-810)||(10114412-10114522)
chr4 (751-887)||(16185897-16186035)
chr4 (795-883)||(4215486-4215574)
chr4 (723-822)||(38208809-38208910)
chr4 (810-883)||(5635541-5635614)
chr4 (751-828)||(55822248-55822326)
chr4 (766-828)||(5336903-5336964)
chr4 (810-863)||(11437558-11437611)
chr4 (723-828)||(16489300-16489410)
chr4 (763-828)||(29609591-29609656)
chr4 (751-877)||(54906722-54906850)
chr4 (751-828)||(4570077-4570155)
chr4 (751-828)||(7050378-7050456)
chr4 (751-828)||(11853532-11853610)
chr4 (751-828)||(25699732-25699810)
chr4 (766-824)||(16638827-16638884)
chr4 (414-463)||(18537981-18538030)
chr4 (723-828)||(36771346-36771457)
chr4 (772-827)||(3760105-3760161)
chr4 (751-828)||(8529250-8529328)
chr4 (751-828)||(18586949-18587027)
chr4 (751-828)||(31300407-31300485)
chr4 (724-828)||(47566444-47566554)
chr4 (769-828)||(4556180-4556238)
chr4 (769-828)||(4558314-4558372)
chr4 (769-828)||(15316961-15317019)
chr4 (751-814)||(4884857-4884922)
chr4 (800-838)||(38270120-38270158)
chr4 (751-826)||(5516367-5516444)
chr4 (723-828)||(36769429-36769540)
chr4 (407-455)||(6132639-6132687)
chr4 (751-804)||(15831124-15831179)
chr4 (751-828)||(16689061-16689139)
chr4 (415-499)||(18409801-18409885)
chr4 (415-463)||(18535289-18535337)
chr4 (752-828)||(22295294-22295370)
chr4 (703-776)||(24446756-24446832)
chr4 (751-807)||(4874620-4874678)
chr4 (816-883)||(5101130-5101197)
chr4 (696-776)||(38270158-38270241)
chr4 (712-828)||(26557677-26557801)
chr4 (751-828)||(13072102-13072180)
chr4 (751-828)||(15312299-15312377)
chr4 (415-455)||(27498965-27499005)
chr4 (766-809)||(25614059-25614102)
chr4 (415-449)||(2891134-2891168)
chr4 (415-452)||(37313563-37313600)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (635-887)||(16712-16963)
[»] chr8 (81 HSPs)
chr8 (576-883)||(27910973-27911284)
chr8 (576-883)||(27957392-27957703)
chr8 (706-887)||(15956051-15956231)
chr8 (593-887)||(31162188-31162483)
chr8 (703-888)||(21482401-21482585)
chr8 (637-887)||(36865558-36865809)
chr8 (703-887)||(21480593-21480776)
chr8 (707-863)||(30480588-30480747)
chr8 (696-859)||(14477356-14477522)
chr8 (696-863)||(27106982-27107152)
chr8 (696-883)||(14807831-14808021)
chr8 (707-887)||(3005693-3005872)
chr8 (696-863)||(32339389-32339559)
chr8 (696-887)||(13858546-13858739)
chr8 (698-887)||(14419252-14419444)
chr8 (696-863)||(43079682-43079853)
chr8 (696-883)||(608814-609004)
chr8 (704-883)||(15068069-15068251)
chr8 (696-883)||(22684718-22684911)
chr8 (696-863)||(27829377-27829547)
chr8 (696-863)||(1225246-1225416)
chr8 (696-887)||(5372239-5372433)
chr8 (726-887)||(31578339-31578501)
chr8 (707-883)||(3874101-3874280)
chr8 (696-863)||(24873265-24873436)
chr8 (714-877)||(31573797-31573961)
chr8 (696-883)||(15809299-15809488)
chr8 (696-863)||(18810788-18810958)
chr8 (696-863)||(27827066-27827236)
chr8 (696-883)||(28251632-28251822)
chr8 (709-887)||(25952613-25952794)
chr8 (696-883)||(15072790-15072981)
chr8 (696-863)||(43082053-43082224)
chr8 (696-883)||(41384824-41385014)
chr8 (696-863)||(28283304-28283474)
chr8 (696-857)||(4424098-4424262)
chr8 (749-863)||(18813018-18813132)
chr8 (708-863)||(44720935-44721094)
chr8 (748-863)||(43530250-43530365)
chr8 (735-887)||(31035239-31035391)
chr8 (647-829)||(33541507-33541693)
chr8 (748-883)||(181634-181771)
chr8 (696-887)||(15185776-15185965)
chr8 (751-863)||(17847661-17847775)
chr8 (771-883)||(41382820-41382932)
chr8 (698-785)||(31035151-31035238)
chr8 (714-885)||(3895920-3896094)
chr8 (712-793)||(2468261-2468341)
chr8 (751-850)||(13985177-13985278)
chr8 (751-887)||(6376124-6376262)
chr8 (751-828)||(33839043-33839120)
chr8 (696-808)||(5622878-5622993)
chr8 (723-828)||(30423162-30423274)
chr8 (819-887)||(2468191-2468259)
chr8 (751-828)||(9021228-9021306)
chr8 (751-828)||(16752643-16752721)
chr8 (751-828)||(16757388-16757466)
chr8 (751-828)||(28327891-28327969)
chr8 (751-828)||(28895485-28895563)
chr8 (751-827)||(13985933-13986011)
chr8 (751-814)||(17799558-17799623)
chr8 (704-831)||(37214317-37214438)
chr8 (751-828)||(590777-590855)
chr8 (751-828)||(4812608-4812686)
chr8 (751-828)||(28332614-28332692)
chr8 (751-828)||(33032637-33032715)
chr8 (751-826)||(29554908-29554984)
chr8 (723-828)||(2267144-2267255)
chr8 (751-803)||(11701102-11701155)
chr8 (417-481)||(21482125-21482189)
chr8 (751-828)||(25684626-25684704)
chr8 (703-776)||(35872555-35872631)
chr8 (769-828)||(3276347-3276405)
chr8 (751-802)||(21033853-21033906)
chr8 (703-790)||(26775288-26775378)
chr8 (766-807)||(15949534-15949575)
chr8 (751-817)||(23179692-23179760)
chr8 (414-455)||(26774977-26775018)
chr8 (414-445)||(15186217-15186248)
chr8 (414-452)||(30481059-30481097)
chr8 (766-807)||(28228514-28228555)
[»] chr3 (155 HSPs)
chr3 (703-891)||(13420241-13420428)
chr3 (703-886)||(25635395-25635578)
chr3 (613-877)||(31151265-31151531)
chr3 (593-887)||(23633359-23633651)
chr3 (703-887)||(561836-562020)
chr3 (710-890)||(17795280-17795459)
chr3 (710-890)||(19103720-19103899)
chr3 (696-883)||(28102065-28102255)
chr3 (696-883)||(53917727-53917917)
chr3 (698-863)||(23637032-23637197)
chr3 (696-887)||(28761488-28761681)
chr3 (697-883)||(39715474-39715663)
chr3 (696-883)||(1313413-1313603)
chr3 (698-887)||(53597245-53597434)
chr3 (593-883)||(4308344-4308640)
chr3 (696-883)||(38890044-38890234)
chr3 (696-884)||(53915558-53915749)
chr3 (696-883)||(43423526-43423716)
chr3 (696-883)||(10956090-10956280)
chr3 (696-887)||(3314688-3314882)
chr3 (696-863)||(6561814-6561984)
chr3 (696-883)||(18096963-18097153)
chr3 (696-883)||(45882943-45883133)
chr3 (698-878)||(1673981-1674161)
chr3 (696-883)||(1626746-1626936)
chr3 (696-863)||(18099253-18099423)
chr3 (696-859)||(18162667-18162833)
chr3 (696-883)||(25533446-25533636)
chr3 (696-883)||(43421478-43421668)
chr3 (696-877)||(10958392-10958576)
chr3 (696-883)||(51727070-51727259)
chr3 (696-863)||(28413114-28413285)
chr3 (696-883)||(880514-880705)
chr3 (696-883)||(1321483-1321673)
chr3 (696-863)||(3859532-3859702)
chr3 (696-883)||(9604670-9604860)
chr3 (696-863)||(27101264-27101434)
chr3 (696-863)||(455911-456082)
chr3 (696-863)||(458288-458459)
chr3 (696-863)||(746761-746932)
chr3 (696-863)||(6065878-6066049)
chr3 (696-863)||(10621612-10621783)
chr3 (696-849)||(24979711-24979867)
chr3 (696-863)||(38210374-38210545)
chr3 (706-887)||(53468515-53468699)
chr3 (696-863)||(4103978-4104148)
chr3 (696-863)||(5191657-5191827)
chr3 (698-849)||(12268061-12268216)
chr3 (696-883)||(22114368-22114558)
chr3 (696-883)||(43228295-43228485)
chr3 (696-883)||(5926827-5927017)
chr3 (696-883)||(11170408-11170598)
chr3 (696-883)||(30005845-30006035)
chr3 (696-849)||(35777425-35777582)
chr3 (696-883)||(42990308-42990498)
chr3 (696-863)||(6063528-6063699)
chr3 (696-863)||(25388910-25389080)
chr3 (707-887)||(32264097-32264281)
chr3 (707-883)||(43226100-43226279)
chr3 (696-863)||(50494003-50494174)
chr3 (696-883)||(10084452-10084642)
chr3 (696-863)||(47148978-47149148)
chr3 (703-883)||(889836-890019)
chr3 (749-885)||(6231861-6231996)
chr3 (706-883)||(36011841-36012021)
chr3 (696-844)||(28100143-28100294)
chr3 (749-883)||(6484420-6484554)
chr3 (707-887)||(15780886-15781073)
chr3 (749-863)||(25688244-25688358)
chr3 (696-883)||(29956690-29956880)
chr3 (749-887)||(4666574-4666714)
chr3 (749-863)||(5522709-5522823)
chr3 (698-796)||(24177285-24177383)
chr3 (698-887)||(36871361-36871550)
chr3 (696-863)||(48361754-48361924)
chr3 (749-883)||(51674829-51674963)
chr3 (696-883)||(51943375-51943564)
chr3 (749-849)||(7606684-7606784)
chr3 (750-857)||(5886261-5886367)
chr3 (721-883)||(14634505-14634667)
chr3 (714-861)||(32219106-32219256)
chr3 (696-876)||(54691644-54691827)
chr3 (753-883)||(11168165-11168295)
chr3 (750-863)||(5899734-5899846)
chr3 (696-883)||(10191373-10191562)
chr3 (749-887)||(54884215-54884352)
chr3 (415-499)||(562164-562248)
chr3 (698-825)||(13419890-13420015)
chr3 (696-849)||(28181026-28181182)
chr3 (749-877)||(35918012-35918140)
chr3 (696-863)||(26720552-26720721)
chr3 (767-887)||(3306839-3306959)
chr3 (703-797)||(25633934-25634028)
chr3 (714-837)||(28137415-28137541)
chr3 (749-883)||(53591244-53591378)
chr3 (696-821)||(42992290-42992417)
chr3 (792-887)||(24181483-24181578)
chr3 (736-828)||(1620580-1620672)
chr3 (414-499)||(13420643-13420728)
chr3 (723-828)||(7768602-7768709)
chr3 (415-499)||(23633160-23633244)
chr3 (415-482)||(23636727-23636794)
chr3 (698-807)||(31021284-31021392)
chr3 (414-499)||(25633230-25633315)
chr3 (696-807)||(27420658-27420768)
chr3 (751-828)||(11066652-11066731)
chr3 (816-883)||(47701734-47701801)
chr3 (778-828)||(11007633-11007683)
chr3 (749-829)||(4560401-4560481)
chr3 (751-828)||(10094195-10094273)
chr3 (751-828)||(10201075-10201153)
chr3 (751-828)||(16462186-16462264)
chr3 (751-828)||(22626105-22626183)
chr3 (696-781)||(41849156-41849244)
chr3 (751-828)||(47883003-47883081)
chr3 (769-828)||(27762107-27762165)
chr3 (415-456)||(25635122-25635163)
chr3 (751-804)||(6303293-6303348)
chr3 (751-804)||(10100235-10100290)
chr3 (751-828)||(10208121-10208199)
chr3 (751-804)||(27544256-27544311)
chr3 (751-828)||(29914074-29914152)
chr3 (751-828)||(47878292-47878370)
chr3 (751-828)||(54193209-54193287)
chr3 (769-828)||(10595155-10595213)
chr3 (774-828)||(13893470-13893523)
chr3 (766-828)||(16996875-16996936)
chr3 (751-828)||(10896988-10897066)
chr3 (751-828)||(11073007-11073084)
chr3 (751-804)||(20031462-20031517)
chr3 (751-828)||(54188492-54188570)
chr3 (832-887)||(25634030-25634085)
chr3 (812-883)||(27635721-27635792)
chr3 (696-741)||(6231453-6231499)
chr3 (770-804)||(10949404-10949438)
chr3 (751-826)||(38002852-38002928)
chr3 (751-828)||(5858529-5858605)
chr3 (766-814)||(7418064-7418112)
chr3 (415-455)||(7754063-7754103)
chr3 (751-828)||(10612899-10612977)
chr3 (415-455)||(28100558-28100598)
chr3 (415-455)||(28137791-28137831)
chr3 (415-455)||(43423960-43424000)
chr3 (413-452)||(3306516-3306555)
chr3 (766-801)||(11079517-11079552)
chr3 (576-634)||(1620711-1620768)
chr3 (417-455)||(1627200-1627238)
chr3 (774-828)||(4535622-4535675)
chr3 (410-452)||(6231164-6231206)
chr3 (414-456)||(8183208-8183250)
chr3 (696-741)||(27635834-27635880)
chr3 (415-449)||(36011527-36011561)
chr3 (415-449)||(43421937-43421971)
chr3 (415-452)||(3314404-3314441)
chr3 (415-452)||(47149420-47149457)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (698-885)||(15885-16072)
[»] chr2 (95 HSPs)
chr2 (593-887)||(17897307-17897603)
chr2 (703-887)||(18800375-18800558)
chr2 (698-887)||(20146670-20146859)
chr2 (703-887)||(22874141-22874324)
chr2 (696-859)||(15539564-15539730)
chr2 (698-887)||(11578170-11578358)
chr2 (648-863)||(28196588-28196807)
chr2 (696-887)||(17849117-17849311)
chr2 (696-877)||(42923580-42923764)
chr2 (696-886)||(3022163-3022355)
chr2 (615-866)||(40032140-40032397)
chr2 (696-863)||(13910129-13910299)
chr2 (696-883)||(19007640-19007830)
chr2 (696-863)||(19502096-19502266)
chr2 (696-863)||(42064515-42064685)
chr2 (698-887)||(35107301-35107488)
chr2 (696-883)||(45239042-45239231)
chr2 (696-883)||(45280049-45280239)
chr2 (696-863)||(23452322-23452492)
chr2 (749-883)||(42452837-42452971)
chr2 (714-887)||(43139395-43139568)
chr2 (698-887)||(6258878-6259068)
chr2 (696-883)||(17848443-17848630)
chr2 (618-863)||(27104718-27104968)
chr2 (706-877)||(27136196-27136368)
chr2 (698-887)||(34979640-34979832)
chr2 (704-887)||(6264210-6264396)
chr2 (696-883)||(21520758-21520948)
chr2 (749-883)||(43623645-43623779)
chr2 (696-887)||(44289129-44289323)
chr2 (572-886)||(31732839-31733146)
chr2 (696-863)||(19504431-19504600)
chr2 (696-887)||(11739621-11739815)
chr2 (696-883)||(22287401-22287591)
chr2 (696-863)||(35215670-35215841)
chr2 (696-863)||(35218047-35218218)
chr2 (696-887)||(14837273-14837461)
chr2 (706-887)||(28459251-28459435)
chr2 (749-887)||(40699429-40699568)
chr2 (749-863)||(5375431-5375544)
chr2 (766-887)||(20589763-20589885)
chr2 (764-863)||(36558948-36559048)
chr2 (764-863)||(36561225-36561325)
chr2 (763-863)||(45332265-45332366)
chr2 (714-810)||(27583477-27583573)
chr2 (714-826)||(35028595-35028707)
chr2 (576-857)||(37963030-37963304)
chr2 (745-835)||(38414194-38414283)
chr2 (696-863)||(24162307-24162467)
chr2 (750-884)||(15693958-15694095)
chr2 (750-826)||(26345661-26345738)
chr2 (751-828)||(28458949-28459028)
chr2 (751-828)||(17921754-17921833)
chr2 (696-851)||(38020202-38020350)
chr2 (751-826)||(7502975-7503052)
chr2 (766-828)||(2740941-2741002)
chr2 (755-826)||(10942634-10942707)
chr2 (755-826)||(10948503-10948576)
chr2 (810-883)||(22407519-22407592)
chr2 (751-828)||(17462419-17462497)
chr2 (751-828)||(20054886-20054964)
chr2 (751-828)||(22712637-22712715)
chr2 (751-828)||(22717346-22717424)
chr2 (751-887)||(33603977-33604115)
chr2 (751-828)||(39680028-39680106)
chr2 (751-828)||(39686966-39687044)
chr2 (751-828)||(45567392-45567470)
chr2 (751-828)||(30720732-30720811)
chr2 (751-828)||(34575230-34575308)
chr2 (766-828)||(2736205-2736266)
chr2 (751-828)||(17932617-17932695)
chr2 (751-828)||(17943520-17943598)
chr2 (751-828)||(27517760-27517838)
chr2 (751-828)||(30478977-30479055)
chr2 (769-828)||(12781342-12781400)
chr2 (789-887)||(13828404-13828503)
chr2 (775-828)||(27248021-27248075)
chr2 (751-804)||(20050166-20050221)
chr2 (751-804)||(38190980-38191035)
chr2 (763-826)||(41303155-41303219)
chr2 (412-455)||(3021836-3021879)
chr2 (413-456)||(11740037-11740080)
chr2 (769-828)||(37170873-37170931)
chr2 (703-790)||(22163106-22163195)
chr2 (829-883)||(22707818-22707872)
chr2 (751-802)||(33674551-33674604)
chr2 (819-876)||(7463020-7463077)
chr2 (766-826)||(45158308-45158369)
chr2 (415-455)||(15539995-15540035)
chr2 (415-455)||(22163445-22163485)
chr2 (696-763)||(22407594-22407664)
chr2 (414-455)||(14836970-14837011)
chr2 (415-452)||(31733247-31733284)
chr2 (415-452)||(38414530-38414567)
chr2 (415-452)||(45239463-45239500)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (730-887)||(1704-1861)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (696-883)||(14447-14637)
scaffold0131 (696-883)||(15052-15242)
scaffold0131 (751-795)||(31124-31170)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (696-883)||(79218-79408)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (696-887)||(85263-85457)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (696-863)||(69376-69546)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (696-883)||(183706-183895)
scaffold0005 (696-883)||(52044-52234)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (696-883)||(11538-11728)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (696-863)||(74-245)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (696-883)||(41548-41738)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (698-863)||(6234-6403)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (696-883)||(4030-4219)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (703-887)||(4853-5038)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (696-863)||(2913-3083)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (749-863)||(1537-1651)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (696-863)||(29204-29374)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (698-883)||(79894-80082)
scaffold0004 (751-828)||(188363-188441)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (696-840)||(35672-35819)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (749-863)||(2130-2244)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (763-863)||(22219-22319)
scaffold0140 (763-863)||(24494-24594)
[»] scaffold0964 (1 HSPs)
scaffold0964 (415-499)||(1228-1308)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (751-828)||(224802-224880)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (751-828)||(16308-16386)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (754-891)||(57486-57626)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (769-803)||(17131-17165)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 524; Significance: 0; HSPs: 116)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 524; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 15670348 - 15669457
Alignment:
Q  8 aactcccatatgaaatcataacattttgtgatttagtatttccgtattaataatgaacaccatttgttttcccaaatctagctaacactattgtttcttc 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15670348 aactcccatatgaaatcataacatcttgtgatttagtatttccgtattaataatgaacaccatttgttttcccaaatctagctaacactattgtttcttc 15670249  T
Q  108 ac------------ctcatcttgagctatagttcttgttaccttatgtaaattataaagttagtagcgtgctattgttattagataatatttttgaggcg 195  Q
    ||            ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15670248 acacacttttccacctcatcttgagctatagttcttgttacctcatgtaaattataaatttagtagcgtgcaattgttattagataatatttttgaggcg 15670149  T
Q  196 ttgttaatgtaaaatgttttagattgtcattcaaatcattatttatataacttttaaagttagacatgatcnnnnnnn-ttatannnnnnnnggtacaac 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||        |||||| |    
T  15670148 ttgttaatgtaaaatgttttagattgtcattcaaatcattatttatataacttttaaagttagacatgataaaaaaaaattatattttttttggtacagc 15670049  T
Q  295 taatatttaaattttataataatcaaacattgtgattgattgattgattgaccgtaaaaattatctatatgaagtaaatcnnnnnnnnacctatactaaa 394  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||    
T  15670048 tgatatttaaattttataatgatcaaacattgtgattgattgattgactg----taaaaattatctatatgaagtaaatcttttttttacctatactaaa 15669953  T
Q  395 tcacttttattatttataaatgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtctaattcggtggccgaattggatagctcagtg 494  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     ||    
T  15669952 tcacttttattatttataaatgttgtgaaagtaacttaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtctaattcgg---------------------tg 15669874  T
Q  495 gccgatttttgcctggttttggagcattttggtacgtgaattttcagcg---------------------accgatatgtcgtaacagcatatttttgaa 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||                     |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15669873 gccgatttttgcctggttttggagcattttggtacgtgaattttcggcgcccgaaggttcaaattcggcgaccgatgtgtcgtaacagcatattttttaa 15669774  T
Q  574 acgtatttttatgggccaaatttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggc 670  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15669773 acgtatttttatgggccagatttgttccagttttttgaggggatacttttactataaatacagaccttgtagcagatgtaaacattgggatagagggggc 15669674  T
Q  671 tgaaaacaagggttcgggaggcagcacaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaaca 770  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15669673 tgaaaactagggtttgggaggcagcacaaaagtagggtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaaca 15669574  T
Q  771 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaa 870  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15669573 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaa 15669474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 572 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 8347652 - 8347336
Alignment:
Q  572 aaacgtatttttatgggccaaatttgttccagttttttgaggggatacttttactataga-tat-ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagaggg 669  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | ||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  8347652 aaacgtatttttatgggtcagatttgttccaattttatgagggg-tacttttactataaaatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagaggggg 8347554  T
Q  670 ctgaaaacaagggttcgggaggcagcac-aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaa 768  Q
     ||||| ||||||||  | || || ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||    
T  8347553 ttgaaa-caagggtttagaagtcaacaagaaaactagggtttgtatagagattgctcttggcaacaaacaccaaggttagggttgattcaccttaggaaa 8347455  T
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgt 868  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  8347454 cactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 8347355  T
Q  869 aaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  8347354 aaagttactcattattata 8347336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 698 - 885
Target Start/End: Original strand, 42922259 - 42922446
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42922259 aaaactagggtttgtatagagtttgctcctagcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacg 42922358  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcatta 885  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  42922359 ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 42922446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 585 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 14183955 - 14183655
Alignment:
Q  585 tgggccaaatttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagg 681  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||  || ||||||||||| ||||   || |||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14183955 tgggccagatttgttctagtttttttagg--attcttttactataaatatagaccatgtatcaga-gtaaaccttgagatagagagggctgaaa-caagg 14183860  T
Q  682 gttcgggaggcagcacaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggatt 781  Q
    |||  | | ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  14183859 gtttagaatgcaacacaaac-tagggtttgtatagaggttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttggaaaacactattataatt 14183761  T
Q  782 gagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatc 881  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  14183760 gagtctcttggttacgggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc 14183661  T
Q  882 attata 887  Q
    ||||||    
T  14183660 attata 14183655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 572 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 8349432 - 8349115
Alignment:
Q  572 aaacgtatttttatgggccaaatttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatatc---cttgtagcagatgtaaacattgggatagagagg 668  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||| ||||    ||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||    
T  8349432 aaacgtaattttatgggtcagatttgttccaattttatgaggg-ataattttattataaatatagatcttgtattagatgcaaaccttgagatagagagg 8349334  T
Q  669 gctgaaaacaagggttcgggaggcagcac-aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaa 767  Q
    ||||||| ||||||||  | || || ||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||    
T  8349333 gctgaaa-caagggtttagaagtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggtttattcaccttgggaa 8349235  T
Q  768 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcg 867  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| | |    
T  8349234 acactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttg 8349135  T
Q  868 taaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||| |||||||||    
T  8349134 ttaagttactcatcattata 8349115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 696 - 884
Target Start/End: Original strand, 16428677 - 16428868
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16428677 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 16428776  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcatt 884  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  16428777 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatt 16428868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 615 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 38925819 - 38925545
Alignment:
Q  615 gatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga-ggcagca-caaaagtagggtt 709  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||| | | |||| || ||||| |||||||    
T  38925819 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtt 38925722  T
Q  710 tgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 806  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38925721 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 38925622  T
Q  807 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  38925621 tgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 38925545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 706 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 18800817 - 18800636
Alignment:
Q  706 ggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 805  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18800817 ggtttgtatagagtttgctcttggccacaaatactagggttggggttgattcaccctgagaaacactattaggattgagtctctaggtcacgggtagaga 18800718  T
Q  806 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  18800717 tttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 18800636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 10400085 - 10399895
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttg--aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400085 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 10399986  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  10399985 ttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 10399895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 50076929 - 50076735
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076929 acaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 50076830  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  50076829 ttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 50076735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 572 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 49495582 - 49495274
Alignment:
Q  572 aaacgtatttttatgggccaaatttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagg 668  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||||   | ||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||    
T  49495582 aaacgtatttttatgagccagatttgttcgaattttatgaggg-atacttttactataaatatagactttgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggg 49495485  T
Q  669 gctgaaaacaagggttcgggaggcagcacaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaa 768  Q
    ||||||| ||||||||    |  ||      || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  49495484 gctgaaa-caagggtttataaatca------aactagggtttgcatatagtttgctcttggcaacaaacactatggttgag-ttgattcaccttgggaaa 49495393  T
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgt 868  Q
    ||||| ||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  49495392 cactaataaaattgagtcttttggtcacggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgt 49495293  T
Q  869 aaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  49495292 aaagttactcatcattata 49495274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 6756551 - 6756744
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  6756551 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct--tg 6756648  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
     | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  6756649 attacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 6756744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 9241343 - 9241149
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9241343 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattattaggattgagtctcttgg 9241244  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  9241243 ttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 9241149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 696 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 17186385 - 17186187
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17186385 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttgg 17186286  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattataatgg 891  Q
    | |||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  17186285 ttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgg 17186187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 25127896 - 25128090
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgc-tcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25127896 acaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactatttggattgagtctcttgg 25127995  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  25127996 ttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 25128090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 696 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 3579873 - 3579681
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||     
T  3579873 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaattaggattgagtctcttga 3579774  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcatta 885  Q
    | |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  3579773 ttacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 3579681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 559 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 31423269 - 31422936
Alignment:
Q  559 cagcatatttttgaaacgtatttttatgggccaaatttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacat 655  Q
    ||||||||||   |||| ||||||| |||| || |||||||||| |||| || || ||||||||||||||| ||||   | ||||| ||| ||||||| |    
T  31423269 cagcatatttcaaaaacatattttt-tgggtcagatttgttccaattttatg-ggagatacttttactataaatataagcattgtatcag-tgtaaacct 31423173  T
Q  656 tgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga-ggcagca-caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggttg--ag 749  Q
    || ||||||| ||||||||| ||||||||  | | |||| || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||   |     
T  31423172 tgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaa 31423074  T
Q  750 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 849  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423073 gttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 31422974  T
Q  850 ctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||||| |||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  31422973 ccattgacatctcttttgtaaggttactcatcattata 31422936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 706 - 887
Target Start/End: Original strand, 40133978 - 40134162
Alignment:
Q  706 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40133978 ggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactactaggattgagtctcttggtcacgggaag 40134077  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  40134078 agattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 40134162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 18839611 - 18839805
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||| | |||||||| || ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839611 acaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 18839710  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  18839711 ttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 18839805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 50307804 - 50307613
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50307804 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 50307705  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  50307704 gttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 50307613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 12302762 - 12302572
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12302762 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 12302663  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  12302662 ttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 12302572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 859
Target Start/End: Original strand, 13215105 - 13215271
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13215105 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttgg 13215204  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatat 859  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13215205 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 13215271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 17324893 - 17324703
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17324893 acaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 17324794  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  17324793 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 17324703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 20291481 - 20291651
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20291481 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 20291580  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20291581 tcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 20291651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 47906294 - 47906484
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906294 acaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 47906393  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  47906394 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 47906484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 50079078 - 50078884
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  50079078 acaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttgg 50078979  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||    
T  50078978 ttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattata 50078884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 748 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 6115305 - 6115166
Alignment:
Q  748 aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 847  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6115305 aggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgta 6115206  T
Q  848 acctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  6115205 accaattgatatctcttttgtaaaattactcatcattata 6115166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 15823570 - 15823760
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15823570 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaatattgagtctcttgg 15823669  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  15823670 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgttactcatcat 15823760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 46431964 - 46431794
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431964 acaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 46431865  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  46431864 ttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 46431794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 48665201 - 48665392
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665201 acaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 48665300  T
Q  793 tcac-gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | || ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  48665301 ttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 48665392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 51750063 - 51750253
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750063 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 51750162  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  51750163 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 51750253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 11457732 - 11457542
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11457732 acaaaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttgg 11457633  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  11457632 ttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 11457542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 703 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 13125707 - 13125521
Alignment:
Q  703 tagggtttg-tatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 801  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  13125707 tagggtttggtatagagtttgctcttggcgacaaacactagggttgaggttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaa 13125608  T
Q  802 gagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  13125607 gagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 13125521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 18307133 - 18307327
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18307133 acaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttgg 18307232  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  18307233 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 18307327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 659 - 883
Target Start/End: Original strand, 24325650 - 24325877
Alignment:
Q  659 gatagagagggctgaaaacaagggttcgggaggcagca-caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttga 754  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||    
T  24325650 gatagagggggctgaaa-caagggttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttga 24325748  T
Q  755 ttcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatt 854  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24325749 ttcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 24325848  T
Q  855 gatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  24325849 gatttctcttttgtaatgttactcatcat 24325877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 16226191 - 16226362
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16226191 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 16226290  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16226291 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 16226362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 17318917 - 17319105
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttg--aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||||    
T  17318917 acaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaaca------ggattgagtctcttgg 17319010  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||||||    
T  17319011 ttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagttactcatcattata 17319105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 28840704 - 28840874
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840704 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 28840803  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28840804 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 28840874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 39462543 - 39462713
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39462543 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 39462642  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  39462643 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctct 39462713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 15295091 - 15294901
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295091 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 15294992  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  15294991 ttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 15294901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 25251532 - 25251338
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25251532 acaaaactagggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctctcgg 25251433  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  25251432 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcattata 25251338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 615 - 883
Target Start/End: Original strand, 41646860 - 41647134
Alignment:
Q  615 gatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcgggaggcagca-caaaagtagggttt 710  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||| |||||| ||| ||||||| |||||||||  | || || |  ||||| || ||||| ||||||||    
T  41646860 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagagggggctgaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 41646958  T
Q  711 gtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 807  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||  | ||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  41646959 gtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttggttacgggaagagatt 41647058  T
Q  808 gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  41647059 gcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 41647134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 698 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 26520372 - 26520205
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg----- 792  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||         
T  26520372 aaaactagggtttctatagagtttgctcttggcaacaaacactaagattgaggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcaca 26520273  T
Q  793 -tcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgata 858  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26520272 gtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgata 26520205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 695 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 2510582 - 2510392
Alignment:
Q  695 cacaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2510582 cacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtcttttg 2510483  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  2510482 gttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagttactcatcat 2510392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 21948444 - 21948255
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948444 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttg-gaaacactattaggattgagtctcttgg 21948346  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  21948345 ttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 21948255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 28842519 - 28842689
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28842519 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctattgg 28842618  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28842619 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 28842689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 2617540 - 2617730
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617540 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 2617639  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  2617640 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 2617730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 712 - 887
Target Start/End: Original strand, 17324103 - 17324281
Alignment:
Q  712 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 808  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||    
T  17324103 tatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattg 17324202  T
Q  809 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||| | |||||||||    
T  17324203 gaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttattcatcattata 17324281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 20302483 - 20302653
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20302483 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 20302582  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20302583 ttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 20302653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 39932097 - 39932267
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39932097 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactattaggattgaatctcttgg 39932196  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  39932197 ttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctct 39932267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 9459674 - 9459503
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattga-gtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9459674 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttg 9459575  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  9459574 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctct 9459503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 9463501 - 9463330
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattga-gtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |  |||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9463501 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttg 9463402  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  9463401 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctct 9463330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 703 - 863
Target Start/End: Original strand, 13761868 - 13762031
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--gaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 799  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||  | |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13761868 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 13761967  T
Q  800 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13761968 aagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 13762031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 14098227 - 14098036
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta-aggttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| || |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  14098227 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 14098128  T
Q  793 tcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaa-gttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  14098127 ttacgggaagagattagag-ctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttactcatcat 14098036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 31425276 - 31425078
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgc-tctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagt---ctc 788  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||   |||    
T  31425276 acaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtgatctc 31425177  T
Q  789 ttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  31425176 ttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 31425078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 47179737 - 47179908
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  47179737 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 47179836  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  47179837 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 47179908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 6995957 - 6995787
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6995957 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgg 6995858  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  6995857 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctct 6995787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 2949488 - 2949298
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagg-ttga-ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  2949488 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgt 2949389  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||| ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  2949388 ttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 2949298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 712 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 50248813 - 50248639
Alignment:
Q  712 tatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 808  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  50248813 tatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcg 50248714  T
Q  809 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  50248713 agactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggttactcatcat 50248639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 51752389 - 51752558
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51752389 acaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactattag-attgagtctcttgg 51752487  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51752488 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 51752558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 4131636 - 4131439
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4131636 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 4131537  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctc----gtaaagttacttatcattata 887  Q
    | || |||||||  || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| ||||    ||||||||||| |||||||||    
T  4131536 ttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattata 4131439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Original strand, 16231643 - 16231758
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 847  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231643 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 16231742  T
Q  848 acctattgatatctct 863  Q
    ||| |||||| |||||    
T  16231743 acccattgatttctct 16231758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 31489939 - 31490107
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-ga-ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31489939 acaaaactagggtttgtatag--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatttcttgg 31490036  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31490037 ttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctct 31490107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 31735778 - 31735608
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  31735778 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaaggttgagtctcttgg 31735679  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  31735678 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctct 31735608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 723 - 887
Target Start/End: Original strand, 16432446 - 16432612
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggta 820  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  16432446 ctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggta 16432545  T
Q  821 gaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  16432546 gaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcattata 16432612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 749 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 25248753 - 25248615
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248753 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 25248654  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || |||||||||||| | |||| |||||| || ||||||    
T  25248653 cccattgatatctcttttgtaaggttactcataattata 25248615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 28998510 - 28998340
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||  || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28998510 acaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 28998411  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  28998410 ttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctct 28998340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 29004226 - 29004056
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||  || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29004226 acaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 29004127  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  29004126 ttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctct 29004056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 754 - 887
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429175
Alignment:
Q  754 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctat 853  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  854 tgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 16429175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 698 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 27339385 - 27339217
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtc 794  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||     
T  27339385 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacgattgagtctcttagtt 27339286  T
Q  795 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27339285 acgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctct 27339217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 47177386 - 47177557
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  47177386 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatgggagtctcttg 47177485  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  47177486 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 47177557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 6823039 - 6823208
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6823039 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttgg 6823137  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  6823138 ttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctct 6823208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 27337195 - 27337026
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 793  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||  ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27337195 acaaaactagggtttttatagatttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgggtctcttggt 27337096  T
Q  794 cacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
     ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27337095 tacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 27337026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 28279293 - 28279484
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtc 794  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28279293 acaaaattagggtttgta--gagtttgctcttgacaacaaacactagggttgggattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtc 28279390  T
Q  795 acgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||  ||||  |||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  28279391 acgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattata 28279484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 765 - 863
Target Start/End: Original strand, 51757627 - 51757725
Alignment:
Q  765 gaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  51757627 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttctct 51757725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Original strand, 23785933 - 23786034
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  23785933 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 23786032  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  23786033 ct 23786034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 736 - 887
Target Start/End: Original strand, 155773 - 155924
Alignment:
Q  736 acactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggag 834  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||   | ||    
T  155773 acactacggttgagattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaag 155872  T
Q  835 acttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | | ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  155873 agtaattcttgtaaccttttgttatctct-ttgtaaagttactcatcattata 155924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 736 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 26613455 - 26613303
Alignment:
Q  736 acactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggag 834  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||    
T  26613455 acactagggttgggattgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaag 26613356  T
Q  835 acttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| | | ||||||||| |||||||||    
T  26613355 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttggaaagttactaatcattata 26613303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 749 - 885
Target Start/End: Original strand, 16561546 - 16561683
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 847  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||    
T  16561546 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgta 16561645  T
Q  848 acctattgatatctctctcgtaaagttacttatcatta 885  Q
    |||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  16561646 accctttgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 16561683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 6823909 - 6824086
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  6823909 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattacgattgaatctcttgg 6824008  T
Q  793 tcacgg-------gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||       |||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6824009 ttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctct 6824086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 736 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 30738845 - 30738697
Alignment:
Q  736 acactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggag 834  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||   | ||    
T  30738845 acactagggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaag 30738746  T
Q  835 acttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  30738745 acttattcttgtaaccctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcat 30738697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 736 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 30790615 - 30790464
Alignment:
Q  736 acactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcg-ggag 834  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||    
T  30790615 acactagggttgtggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggag 30790517  T
Q  835 acttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  30790516 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 30790464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 698 - 828
Target Start/End: Original strand, 27916525 - 27916653
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  27916525 aaaactagggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactagggttggaattgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtcaca 27916622  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27916623 tgaagagattgtgactttgggtggaattagg 27916653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 28207323 - 28207133
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gag-gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||| || |||||| ||||| | ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28207323 acaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttgg 28207224  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | || ||||||||||| | |||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  28207223 ttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 28207133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 673 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 26332837 - 26332699
Alignment:
Q  673 aaaacaagggttcgggaggcagcacaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacact 772  Q
    ||||||||||||  | || || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||  ||||||||    
T  26332837 aaaacaagggtttagaagccaacacaaaaatagggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactaggtttgggtttgattcaccttcggaaacact 26332740  T
Q  773 attaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 813  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  26332739 attaggatttagtctcttggtcacgaaaatagattgagact 26332699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 615 - 883
Target Start/End: Original strand, 47451588 - 47451856
Alignment:
Q  615 gatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga-ggcagca-caaaagtagggtt 709  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||| |||||||| || | |||| || ||||| |||||||    
T  47451588 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagagggggcttaaa-caagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtt 47451685  T
Q  710 tgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 806  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||     |   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47451686 tgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacatt-----agtgt-ttaggattgagtctcttggttacgggaagagat 47451779  T
Q  807 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || | ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  47451780 tggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 47451856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 751 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaatta 826  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 755 - 887
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104379
Alignment:
Q  755 ttcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggaga-cttattcttgtaaccta 852  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   | |||  || |||||||||||      
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  853 ttgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 43104379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 810 - 883
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816100
Alignment:
Q  810 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 23816100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 4144882 - 4144804
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  4144882 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 698 - 796
Target Start/End: Complemental strand, 13127885 - 13127787
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcac 796  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||| | || | ||| ||||||||||||||    
T  13127885 aaaagtagggtttatatagagtttccttttggcaacaaacactagggttgggatagattcaccttgggaaacattgttggaattaagtctcttggtcac 13127787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 2232580 - 2232658
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  2232580 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 861
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959241
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| || |||||||   || ||| |||||| |||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattcttttaa 49959228  T
Q  849 cctattgatatct 861  Q
    ||  |||||||||    
T  49959229 ccctttgatatct 49959241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 766 - 828
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 18801109 - 18801043
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtctaattcggtggccgaatt 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||    
T  18801109 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaaggaattggagttctgatgctgccaacatcggtggccgaatt 18801043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 2401420 - 2401342
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  2401420 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2401342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 9526449 - 9526527
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  9526449 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 21353545 - 21353467
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaac--actattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  21353545 ttgattcaccttgaacaacgcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 21353467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 25134054 - 25134132
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  25134054 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 763 - 828
Target Start/End: Original strand, 37990770 - 37990836
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  37990770 gagaaacactattagaattgagtctcttgatcacgagaagagattcgaaattttgggtagaattagg 37990836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 9521698 - 9521776
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  9521698 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 751 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 2393481 - 2393404
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 827  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||    
T  2393481 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggac-ttgggtagaattag 2393404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 754 - 807
Target Start/End: Original strand, 10115868 - 10115922
Alignment:
Q  754 attcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 807  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10115868 attcaccttagagaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaaaagatt 10115922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Original strand, 16430823 - 16430860
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16430823 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaataaattggagtt 16430860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Original strand, 17323785 - 17323825
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17323785 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 17323825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 447
Target Start/End: Original strand, 17352797 - 17352829
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17352797 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattg 17352829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 31423435 - 31423403
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattg 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423435 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattg 31423403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 50249133 - 50249093
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50249133 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 50249093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 775 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 3091279 - 3091240
Alignment:
Q  775 taggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactt 814  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  3091279 taggattgagtctcttggtaacaggaagagattgagactt 3091240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 766 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 13785455 - 13785392
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  13785455 aaacacaattaggattgagtttcttggtcacaaaaagagattcgggactttgggtagaattagg 13785392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 416 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 25251814 - 25251775
Alignment:
Q  416 gttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  25251814 gttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 25251775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 861
Target Start/End: Original strand, 46783126 - 46783240
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag-actttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 846  Q
    ||||||||||||||  ||  |||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  46783126 ttgattcaccttgaacaaagcactgttaggatagagactcttggtcacatgaagagattcagaactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 46783225  T
Q  847 aacctattgatatct 861  Q
    ||||  |||||||||    
T  46783226 aaccctttgatatct 46783240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 405 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 50308087 - 50308045
Alignment:
Q  405 tatttataaatgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattg 447  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50308087 tatttatcattgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattg 50308045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 593 - 634
Target Start/End: Original strand, 43104078 - 43104118
Alignment:
Q  593 atttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat 634  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43104078 atttgttccagttttttga-gggatacttttactataaatat 43104118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 50079383 - 50079346
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  50079383 tgttgtgaaagtgactccaaattgaagaaattgaagtt 50079346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 164; Significance: 3e-87; HSPs: 113)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 593 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 20091901 - 20091610
Alignment:
Q  593 atttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga 689  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||   | || || |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  20091901 atttgttccaattttatgaggg-atacttttactataaatatagactttttatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaaacaagggtttcgga 20091804  T
Q  690 ggcagcacaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctct 789  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  20091803 ggcaacacaaaactagggtttgtatagagtttgctattggcaacaaagattagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctct 20091704  T
Q  790 tggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  20091703 tggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 20091610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 572 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 24817729 - 24817415
Alignment:
Q  572 aaacgtatttttatgggccaaatttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagg 668  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| || |||| |||||| ||||||| | |||| ||||   ||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  24817729 aaacgtatttttattggccagatttgttacaattttatgaggg-atactttaa-tataaatatagaccttgtatcagatgtaaaccttgagatagag-gg 24817633  T
Q  669 gctgaaaacaagggttcgggaggcagcacaa-aagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaa 767  Q
    ||||||| ||||||||  | || || ||  | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||    
T  24817632 gctgaaa-caagggtttagaagtcaacaagagaactagggtttgtatagagtttgctctttgcaacaaacactagggttg-ggttgattcaccttggaaa 24817535  T
Q  768 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcg 867  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |    
T  24817534 gcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttg 24817435  T
Q  868 taaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  24817434 taaagttactcatcattata 24817415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 593 - 887
Target Start/End: Original strand, 7188472 - 7188767
Alignment:
Q  593 atttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga 689  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||   | ||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||  | |    
T  7188472 atttgttccaattttatgaggg-atacttttactataaatatagactttgtatcaga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaa 7188568  T
Q  690 ggcagcac-aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctc 788  Q
    | || ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7188569 gtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctc 7188668  T
Q  789 ttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||||||||| | |||||||||    
T  7188669 ttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattata 7188767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 25276175 - 25276369
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25276175 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 25276274  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  25276275 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 25276369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 24813748 - 24813560
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24813748 aaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaagaaacactagggttg-ggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtctcttggtgacg 24813650  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||| |||||||||    
T  24813649 ggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 648 - 886
Target Start/End: Original strand, 24258448 - 24258690
Alignment:
Q  648 gtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga-ggcagca-caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagg 744  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  | | |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  24258448 gtaaacattgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatgg 24258546  T
Q  745 tt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 842  Q
    || |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  24258547 tttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattc 24258646  T
Q  843 ttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattat 886  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  24258647 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattat 24258690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 9679093 - 9679283
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9679093 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 9679192  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  9679193 ttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 9679283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 20137364 - 20137170
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||     
T  20137364 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttga 20137265  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  20137264 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 20137170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 706 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 27832878 - 27832694
Alignment:
Q  706 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27832878 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 27832779  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||    
T  27832778 agattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagttactcatcattata 27832694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 39146242 - 39146048
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttg--aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39146242 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattatgattgagtctcttgg 39146143  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  39146142 ttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 39146048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 42331254 - 42331068
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42331254 acaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 42331155  T
Q  793 t--cacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttact 877  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  42331154 ttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttact 42331068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 696 - 861
Target Start/End: Original strand, 11355292 - 11355460
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355292 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 11355391  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11355392 ttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatct 11355460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 4296190 - 4295999
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-ga-ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4296190 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 4296091  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  4296090 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 4295999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 646 - 883
Target Start/End: Original strand, 21678049 - 21678290
Alignment:
Q  646 atgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga-ggcagca-caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaa 742  Q
    |||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||  | | |||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21678049 atgtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactag 21678147  T
Q  743 ggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 840  Q
    |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  21678148 ggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtat 21678247  T
Q  841 tcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |||||||||| |||||||| ||| | |||| ||||||||||||    
T  21678248 tcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggttacttatcat 21678290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 11757263 - 11757454
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11757263 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 11757362  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  11757363 gttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 11757454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 20299493 - 20299684
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20299493 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 20299592  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  20299593 gttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 20299684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 9680853 - 9681044
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  9680853 acaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttg 9680952  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  9680953 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcat 9681044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 13099731 - 13099536
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta-aggttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13099731 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgg 13099632  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctc-tctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  13099631 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattata 13099536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 703 - 890
Target Start/End: Original strand, 24465582 - 24465767
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24465582 tagggtttgtatagcgtttgctcttggcaacaaacactagggttgaa-ttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaag 24465680  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattataatg 890  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||  |||||||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||    
T  24465681 agattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcattataatg 24465767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 443629 - 443799
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  443629 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttga 443728  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  443729 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctct 443799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 44724613 - 44724803
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724613 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 44724712  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  44724713 ttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 44724803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Original strand, 24748630 - 24748822
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtc 794  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  24748630 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactattacgattgagtctcttggtt 24748729  T
Q  795 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  24748730 ccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 24748822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 7470277 - 7470087
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470277 acaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttgg 7470178  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  7470177 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 7470087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 38394020 - 38394210
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394020 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 38394119  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  38394120 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 38394210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 40836997 - 40836827
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40836997 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 40836898  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  40836897 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 40836827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 21680061 - 21680251
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680061 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 21680160  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  21680161 ttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggttactcatcat 21680251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 31435302 - 31435108
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435302 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 31435203  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||||||||||  ||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  31435202 ttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 31435108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 7349528 - 7349357
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7349528 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 7349429  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7349428 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 7349357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 37412383 - 37412187
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttg-gcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37412383 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 37412284  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctc-tctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | | |||| |||||| |||||||||    
T  37412283 gttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggttactcatcattata 37412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 1047179 - 1047009
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1047179 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1047080  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1047079 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 1047009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 3878611 - 3878801
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagg-ttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| || ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3878611 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttgg 3878710  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  3878711 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 3878801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 18345575 - 18345745
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18345575 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 18345674  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18345675 ttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 18345745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 708 - 883
Target Start/End: Original strand, 21990196 - 21990374
Alignment:
Q  708 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21990196 tttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaagag 21990295  T
Q  805 attgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  21990296 attgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 21990374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 48457687 - 48457877
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457687 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactattaggattgagtctcttgg 48457786  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  48457787 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 48457877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 43253771 - 43253582
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 793  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43253771 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgat 43253672  T
Q  794 cacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
     |||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  43253671 tacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 43253582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 698 - 863
Target Start/End: Original strand, 20297398 - 20297566
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtc 794  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20297398 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 20297497  T
Q  795 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20297498 acgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 20297566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 593 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 22828993 - 22828694
Alignment:
Q  593 atttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga 689  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||   | ||||| | || |||||| ||| ||||||| ||||||||| |||| |||  | |    
T  22828993 atttgttccagttttatgaggg-atacttttactataaatataggctttgtatccga-gtaaaccttgagatagagggggctgaaa-caagagtttagaa 22828897  T
Q  690 -ggcagca-caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta-aggttga-ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgag 784  Q
     |||| || ||||| || ||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||| || |||| ||||||||||  ||   |||||||||||||||||||    
T  22828896 aggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactattaggattgag 22828797  T
Q  785 tctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcatt 884  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||    
T  22828796 tctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcattatt 22828697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 42223191 - 42223382
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42223191 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 42223290  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  42223291 gttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 42223382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 35663 - 35853
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  35663 acaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttgg 35762  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  35763 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 35853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 615 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 27306568 - 27306295
Alignment:
Q  615 gatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga-ggcagca-caaaagtagggtt 709  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||  | | |||| || ||||| |||||||    
T  27306568 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 27306471  T
Q  710 tgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 806  Q
    | ||||||||||| ||||| | |||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  27306470 t-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 27306372  T
Q  807 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  27306371 tgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 27306295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 7351907 - 7351736
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7351907 acaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 7351808  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  7351807 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 7351736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 1049550 - 1049380
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1049550 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttgg 1049451  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1049450 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 1049380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 730 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 7092432 - 7092277
Alignment:
Q  730 caacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 827  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7092432 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  828 gcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcat 7092277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 7472235 - 7472045
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472235 acaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 7472136  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  7472135 ttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 7472045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 28487587 - 28487777
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| ||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487587 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttgg 28487686  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  28487687 ttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 28487777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 40946362 - 40946552
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    |||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  40946362 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactattaggattgagtctcttag 40946461  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  40946462 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 40946552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 20626072 - 20626262
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626072 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 20626171  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  20626172 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 20626262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 20629963 - 20630153
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20629963 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 20630062  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  20630063 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 20630153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 20642382 - 20642572
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642382 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 20642481  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  20642482 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 20642572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 21592398 - 21592208
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||    
T  21592398 acaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactattaggatttagtctcttgg 21592299  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  21592298 ttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 21592208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 850
Target Start/End: Original strand, 26804603 - 26804763
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta--agg--ttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctct 789  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26804603 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctct 26804702  T
Q  790 tggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 850  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804703 tggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 26804763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 698 - 883
Target Start/End: Original strand, 1850017 - 1850205
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtc 794  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |     
T  1850017 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtttcttgctt 1850116  T
Q  795 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  1850117 acgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 1850205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 712 - 887
Target Start/End: Original strand, 6332272 - 6332448
Alignment:
Q  712 tatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaga 811  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||  |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6332272 tatagagtttactcttggcaacaaacactaggattgagattgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgaga 6332371  T
Q  812 ctttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  6332372 ctttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattata 6332448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 31156166 - 31155995
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| | ||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31156166 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 31156067  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31156066 ggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 31155995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 749 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 7094659 - 7094525
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7094659 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 7094560  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  7094559 cccattgatttctcttttgtaatgttactcatcat 7094525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 25542564 - 25542733
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| ||||    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25542564 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttg-gaaagactattaggattgagtctcttgg 25542662  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25542663 ttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 25542733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 28485600 - 28485790
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28485600 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactattaggattgagtctcttgg 28485699  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||| |||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  28485700 ttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 28485790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 44598 - 44788
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  44598 acaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtcttttgg 44697  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  44698 ttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 44788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 22251797 - 22251607
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||||    
T  22251797 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------taggattgagtctcttgg 22251706  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctc----gtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    ||||||||||| |||||||||    
T  22251705 ttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagttactcatcattata 22251607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 3035755 - 3035928
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035755 acaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 3035854  T
Q  793 tcacgggaaga---gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||   |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3035855 ttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3035928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 703 - 806
Target Start/End: Original strand, 22392506 - 22392608
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22392506 tagggtttgtatagaatttgctattggcaacaaacactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 22392604  T
Q  803 agat 806  Q
    ||||    
T  22392605 agat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Original strand, 2935372 - 2935473
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  2935372 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 2935471  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  2935472 ct 2935473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 667 - 891
Target Start/End: Original strand, 11081515 - 11081741
Alignment:
Q  667 gggctgaaaacaagggttcgggaggcagc-acaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgag 765  Q
    ||||||||||||||||||  | || || | |||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |    
T  11081515 gggctgaaaacaagggtttagaagccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt--ctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcactttggg 11081612  T
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc--tattgatatctc 862  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||| ||| |||||||   | ||||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  11081613 aaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctc 11081712  T
Q  863 tctcgtaaagttacttatcattataatgg 891  Q
    |   ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  11081713 ttgtgtaaagttactcatctttaaaatgg 11081741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Original strand, 38396725 - 38396839
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396725 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaa 38396824  T
Q  849 cctattgatatctct 863  Q
    || |||||| |||||    
T  38396825 cccattgatttctct 38396839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 697 - 887
Target Start/End: Original strand, 6048909 - 6049098
Alignment:
Q  697 caaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttga-gaaacactattaggattgagtctcttggtca 795  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6048909 caaaactagggtttgtaaagaatt--ctcttggcaacaaacactaggtttgggattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatctcttggtca 6049006  T
Q  796 cgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||||||||   | |||| ||||||| |||||  |||||||| || | ||||||||||| |||||||||    
T  6049007 cgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccct-ttgtaaagttactcatcattata 6049098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 9027378 - 9027278
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  9027378 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttct 9027280  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  9027279 ct 9027278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Original strand, 1606484 - 1606584
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  1606484 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttct 1606582  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  1606583 ct 1606584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Original strand, 22108171 - 22108271
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  22108171 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 22108269  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  22108270 ct 22108271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Original strand, 40549931 - 40550031
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  40549931 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 40550029  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  40550030 ct 40550031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 789 - 885
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349008
Alignment:
Q  789 ttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcatta 885  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcatta 6349008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 751 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297146
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 827  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 16297146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 723 - 828
Target Start/End: Original strand, 11084439 - 11084544
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtaga 822  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| |    
T  11084439 ctcttggcaacaaacaatagggttgagattgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaa 11084538  T
Q  823 attagg 828  Q
    ||||||    
T  11084539 attagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Original strand, 22137182 - 22137282
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  22137182 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 22137280  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  22137281 ct 22137282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Original strand, 40552209 - 40552309
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  40552209 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 40552307  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  40552308 ct 40552309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 714 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 13290710 - 13290536
Alignment:
Q  714 tagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac 812  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||   ||    
T  13290710 tagagttttctcttggcaacaaacactaggcttgggagtgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctcttggtcacaggaagatattagaac 13290611  T
Q  813 tttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||||||||||||||   | ||| | ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  13290610 tctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctct-ttgtaaagttactcatcattata 13290536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 798 - 887
Target Start/End: Original strand, 26295586 - 26295675
Alignment:
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  26295586 ggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 26295675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 813 - 887
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22393950
Alignment:
Q  813 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 22393950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 729 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 12310236 - 12310157
Alignment:
Q  729 gcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgag-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 807  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12310236 gcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 736 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 40281590 - 40281475
Alignment:
Q  736 acactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggag 834  Q
    |||||| ||||| | || |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||   | ||    
T  40281590 acactagggttgggattaattcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaag 40281491  T
Q  835 acttattcttgtaacc 850  Q
    ||||||||||||||||    
T  40281490 acttattcttgtaacc 40281475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 635 - 756
Target Start/End: Original strand, 6348791 - 6348913
Alignment:
Q  635 ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcgggaggcagcac-aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaac 733  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | ||  |  |  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6348791 ccttgtatcagatgtaaacattgagatagagaggactgaaaacaagggtttagaagtaaaaaagaaaactagggtttgtatcgagtttgctcttggcaac 6348890  T
Q  734 aaacactaaggttgaggttgatt 756  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  6348891 aaacattagggttgaggttgatt 6348913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 697 - 828
Target Start/End: Original strand, 26210580 - 26210710
Alignment:
Q  697 caaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtca 795  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26210580 caaaactagggtttgtagagaatt--ctcttggcaacaa-cactagggttgtgattgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaa 26210676  T
Q  796 cgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||| |||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  26210677 cggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 3320249 - 3320171
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  3320249 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3320171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 3324997 - 3324919
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  3324997 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3324919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 7069763 - 7069841
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  7069763 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7069841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 7074770 - 7074848
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  7074770 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7074848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 414 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 20092081 - 20092017
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtctaattcggtggccga 478  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  20092081 atgttgtgaaagtgacttaaaattaaagaaattggagttctgatgttatctaattcggtggccga 20092017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 25351336 - 25351414
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  25351336 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25351414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 25357030 - 25357108
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  25357030 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25357108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 25405376 - 25405454
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  25405376 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25405454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 25410113 - 25410191
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  25410113 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25410191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 42006646 - 42006724
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  42006646 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 766 - 828
Target Start/End: Original strand, 2120899 - 2120960
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  2120899 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2120960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 723 - 828
Target Start/End: Original strand, 21369592 - 21369703
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttg-----attcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt 815  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||     |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| ||    
T  21369592 ctcttggcaacaaacattagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-tt 21369690  T
Q  816 gggtagaattagg 828  Q
    ||||| |||||||    
T  21369691 gggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 8378703 - 8378625
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  8378703 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8378625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 15541194 - 15541139
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15541194 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15541139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 30246953 - 30247031
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  30246953 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 44512724 - 44512646
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  44512724 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 775 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 6067373 - 6067332
Alignment:
Q  775 taggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttg 816  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6067373 taggatttagtctcttggtcacgggaagagattgagactttg 6067332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 751 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 44144065 - 44143997
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgg 817  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  44144065 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 777
Target Start/End: Original strand, 18567647 - 18567731
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattag 777  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18567647 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22829171 - 22829131
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22829171 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggaattctg 22829131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 753 - 807
Target Start/End: Original strand, 8260570 - 8260625
Alignment:
Q  753 gattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 807  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8260570 gattcaccttgtataaaccctattaggattgagtgtcttggtcacgggaagagatt 8260625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 769 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34547007
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 34547007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 447
Target Start/End: Original strand, 11355000 - 11355042
Alignment:
Q  405 tatttataaatgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattg 447  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11355000 tattgataactgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattg 11355042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 39146524 - 39146490
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattgga 449  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39146524 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattgga 39146490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 791 - 887
Target Start/End: Original strand, 6046625 - 6046721
Alignment:
Q  791 ggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  6046625 ggtcacgagaaaagaatgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctct-ttgtaaagttactcatcattata 6046721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 455
Target Start/End: Original strand, 24748341 - 24748386
Alignment:
Q  410 ataaatgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  24748341 ataaatgttgtgaaagtgactcaaaattgaaaaaattagaattctg 24748386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 449
Target Start/End: Original strand, 21677795 - 21677830
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattgga 449  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21677795 atgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattgga 21677830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 750 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 2990830 - 2990772
Alignment:
Q  750 gttgattcaccttgag-aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 807  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  2990830 gttgattcaccttgaataaacactgttaggattgagtatcttggtcacatgaagagatt 2990772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 414 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 24817910 - 24817872
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  24817910 atgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattgaagtt 24817872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 4296456 - 4296423
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattg 447  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4296456 atgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattg 4296423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 593 - 634
Target Start/End: Original strand, 6332155 - 6332195
Alignment:
Q  593 atttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat 634  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  6332155 atttgttccagttttttga-gggatacttttactataaatat 6332195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 20137668 - 20137631
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20137668 tgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattgaagtt 20137631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 157; Significance: 5e-83; HSPs: 94)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 667 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 3028135 - 3027915
Alignment:
Q  667 gggctgaaaacaagggttcgggaggcagcacaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgaga 766  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||    
T  3028135 gggctgaaaacaagggtttggaaggcaacacaaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttggga 3028036  T
Q  767 aacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctc 866  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |     
T  3028035 aacactattaggattgagtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctctttt 3027936  T
Q  867 gtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  3027935 gtaaagttactcatcattata 3027915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 703 - 887
Target Start/End: Original strand, 15719712 - 15719895
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15719712 tagggtttgtatagagtttgcttttggcaacaaacactagggttgag-ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaag 15719810  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15719811 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 15719895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 703 - 887
Target Start/End: Original strand, 17012109 - 17012293
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17012109 tagggtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaag 17012208  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||    
T  17012209 agattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttata 17012293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 13057253 - 13057447
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13057253 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttgg 13057352  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  13057353 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 13057447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 3632193 - 3631999
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  3632193 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctctttg 3632094  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  3632093 ttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 3631999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 703 - 887
Target Start/End: Original strand, 32280062 - 32280249
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 799  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32280062 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggg 32280161  T
Q  800 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||    
T  32280162 aagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcgttata 32280249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 15530377 - 15530188
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530377 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 15530278  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  15530277 ttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaacc-attgatatctcttttgtaacgttactcatcat 15530188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 670 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 16455705 - 16455487
Alignment:
Q  670 ctgaaaacaagggttcgggaggcagcacaaaag-tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaa 768  Q
    |||||||||||||||  | || || |||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16455705 ctgaaaacaagggtttagaagtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttttctcttggcaacgaacactagggttgtggttgattcaccttgggaaa 16455606  T
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgt 868  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | ||    
T  16455605 cactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgt 16455506  T
Q  869 aaagttacttatcattata 887  Q
    ||| ||||| |||||||||    
T  16455505 aaaattactcatcattata 16455487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 696 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 3630119 - 3629935
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3630119 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttgg 3630020  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttact 877  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  3630019 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttact 3629935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 696 - 877
Target Start/End: Original strand, 25477333 - 25477517
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25477333 acaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 25477432  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttact 877  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||    
T  25477433 tcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttact 25477517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 13039813 - 13040007
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13039813 acaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttgg 13039912  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  13039913 ttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 13040007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 696 - 885
Target Start/End: Original strand, 3390438 - 3390630
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390438 acaaaactagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 3390537  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcatta 885  Q
    | || | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  3390538 ttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 3390630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 9019985 - 9020175
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9019985 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 9020084  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  9020085 ttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 9020175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 26932817 - 26932646
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26932817 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttg 26932718  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  26932717 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26932646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 11983284 - 11983094
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983284 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 11983185  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  11983184 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 11983094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 875
Target Start/End: Complemental strand, 15541395 - 15541213
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15541395 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttgg 15541296  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagtta 875  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  15541295 tcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 15541213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 754 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069780
Alignment:
Q  754 attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctat 853  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  854 tgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 1069780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 703 - 875
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367272
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttgctcttggcaacaaacactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaag 15367199  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagtta 875  Q
    ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||    
T  15367200 agattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagtta 15367272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 4816486 - 4816316
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4816486 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 4816387  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4816386 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 4816316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 15532936 - 15532746
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| | ||| | |||||||| || |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15532936 acaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 15532837  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  15532836 tcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15532746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 865
Target Start/End: Complemental strand, 19704824 - 19704651
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta-aggttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| || ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  19704824 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 19704725  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctct 865  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  19704724 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctct 19704651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 14459020 - 14458832
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gaggt-tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14459020 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 14458923  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  14458922 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 14458832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 14507430 - 14507260
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14507430 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 14507331  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14507330 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 14507260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 28241576 - 28241386
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241576 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 28241477  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  28241476 ttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 28241386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 30967260 - 30967450
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967260 acaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 30967359  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  30967360 ttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 30967450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 1230504 - 1230314
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1230504 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttgg 1230405  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  1230404 ttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 1230314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 3233986 - 3233801
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| || |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3233986 acaaaactaaggtttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 3233887  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttact 877  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | |||| ||||||    
T  3233886 gttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttact 3233801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 703 - 887
Target Start/End: Original strand, 19696508 - 19696693
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  19696508 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaatcactagggttcaaattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactgaaag 19696607  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||    
T  19696608 agattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattata 19696693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 2629140 - 2628970
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2629140 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 2629041  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||| |||||| |||||    
T  2629040 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctct 2628970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 750 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186133
Alignment:
Q  750 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 848  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 12186133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 714 - 887
Target Start/End: Original strand, 20526885 - 20527058
Alignment:
Q  714 tagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 813  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  20526885 tagagtttgctcttgacaacaaacactagggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagact 20526984  T
Q  814 ttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || ||||||||||||   | ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| | |||||||||    
T  20526985 tttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctct-ttgtaaagttattcatcattata 20527058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 22490699 - 22490893
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgc-tcttggcaacaaacactaaggtt-gaggttg-attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||| ||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22490699 acaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggattgagtctcttgg 22490798  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||  ||||| |||||||||    
T  22490799 ttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcattata 22490893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 20915611 - 20915440
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20915611 acaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 20915512  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  20915511 gttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 20915440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 736 - 887
Target Start/End: Original strand, 26945245 - 26945397
Alignment:
Q  736 acactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggag 834  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||    
T  26945245 acactaaggttgtggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtag 26945344  T
Q  835 acttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  26945345 acttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 26945397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 5273415 - 5273300
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 847  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273415 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 5273316  T
Q  848 acctattgatatctct 863  Q
    ||| |||||| |||||    
T  5273315 acccattgatttctct 5273300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 30034858 - 30034668
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  30034858 acaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcaattgg 30034759  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  30034758 ttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 30034668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 12195770 - 12195599
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  12195770 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 12195671  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12195670 gttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 12195599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 749 - 856
Target Start/End: Original strand, 26065098 - 26065205
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26065098 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26065197  T
Q  849 cctattga 856  Q
    || |||||    
T  26065198 cccattga 26065205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 749 - 856
Target Start/End: Original strand, 26085067 - 26085174
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26085067 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 26085166  T
Q  849 cctattga 856  Q
    || |||||    
T  26085167 cccattga 26085174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 696 - 842
Target Start/End: Complemental strand, 19227663 - 19227514
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227663 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 19227564  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 842  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227563 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 696 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 30729083 - 30728910
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30729083 acaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgactctcttgg 30728984  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctc 866  Q
    | ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||    
T  30728983 ttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctc 30728910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 714 - 887
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466576
Alignment:
Q  714 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 809  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  810 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||| | |||||||||    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcattata 14466576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 12161810 - 12161622
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 793  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  12161810 acaaaactagggtttgtatagagtttg-tctctggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactattaagatcgagtctattggt 12161712  T
Q  794 cacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  12161711 tacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 12161622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 22858203 - 22858015
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| |||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  22858203 aaaactagggtttgta--gaattttctcttggtaacaaacactagggttgagattgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcaca 22858106  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa-cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
     ||||||||||||||||| |||||| |||||   | ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  22858105 agaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacccttttgatatatct-ttgtaaagttactcatcattata 22858015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 24338703 - 24338508
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgc-tcttggcaacaaacactaagg--ttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||    
T  24338703 acaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactattaagattgagtcttttg 24338604  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || | || |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  24338603 gttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 24338508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 763 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 26066309 - 26066190
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26066309 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 26066210  T
Q  862 ctctcgtaaagttacttatca 882  Q
    || | |||| |||||||||||    
T  26066209 ct-ttgtaacgttacttatca 26066190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Original strand, 33308986 - 33309086
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  33308986 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttct 33309084  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  33309085 ct 33309086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Original strand, 33311255 - 33311355
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  33311255 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttct 33311353  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  33311354 ct 33311355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 714 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 25078792 - 25078629
Alignment:
Q  714 tagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 813  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  25078792 tagagtttactcttggcaacaaacattagggttgaaattgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-t 25078694  T
Q  814 ttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttact 877  Q
    ||  |||||||||||   | ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  25078693 ttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttact 25078629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 26068580 - 26068479
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  26068580 gagaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttct 26068481  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  26068480 ct 26068479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 29754894 - 29754793
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||    
T  29754894 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttct 29754795  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  29754794 ct 29754793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 752 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037795
Alignment:
Q  752 tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaacc 850  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  851 tattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
      ||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 28037795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 745 - 826
Target Start/End: Original strand, 11138417 - 11138499
Alignment:
Q  745 ttgaggttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaatta 826  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  11138417 ttgagattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 751 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542454
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga-ttgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||   | ||||| ||| ||||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaa 7542482  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttact 877  Q
    ||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  7542481 ccctttgatatctct-ttgtaaagttact 7542454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 703 - 779
Target Start/End: Original strand, 15346449 - 15346524
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattagga 779  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15346449 tagggtttgtataaaatttgctcttggcaacaaacactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 723 - 887
Target Start/End: Original strand, 30445603 - 30445777
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcacctt-gagaaacactattagga-------ttgagtctcttggtcacgggaagagat-tgagact 813  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||       |    ||||||||||| | ||||||||   |||||    
T  30445603 ctcttggcaacaaacactacggttgagattgattcaccttggagaaacactattaggatattctctattctctcttggtcatgtgaagagatccaagact 30445702  T
Q  814 ttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  30445703 ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 30445777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 726 - 822
Target Start/End: Original strand, 30443388 - 30443484
Alignment:
Q  726 ttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggtaga 822  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  30443388 ttggcaacaaacactagggttgatattgattcaccttgaagaaacactattaggat--agtcttctggtcacgggaagagattcaggactttgggtaga 30443484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 13878710 - 13878788
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  13878710 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13878788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 13883458 - 13883536
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  13883458 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13883536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 16785902 - 16785980
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  16785902 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16785980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 26887423 - 26887345
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  26887423 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 415 - 463
Target Start/End: Original strand, 26944926 - 26944974
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtc 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26944926 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgatgctgtc 26944974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 31248913 - 31248835
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  31248913 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 35201525 - 35201447
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  35201525 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 723 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 19702094 - 19701985
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttg-----attcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt 815  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||     |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  19702094 ctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-tt 19701996  T
Q  816 gggtagaatta 826  Q
    |||||||||||    
T  19701995 gggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 769 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 774 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165936
Alignment:
Q  774 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 724 - 827
Target Start/End: Original strand, 6843217 - 6843325
Alignment:
Q  724 tcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaa-acactattaggattgagtctcttggtca---cgggaagagatt-gagactttggg 818  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||    
T  6843217 tcttggcaacaaacactagggttaggattgaatcaccttgaacacacaccattaggattgagtctcttggtcacagcaggaagagattcgagactttggg 6843316  T
Q  819 tagaattag 827  Q
    |||||||||    
T  6843317 tagaattag 6843325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 766 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 12937376 - 12937255
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctc 864  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||   | || || ||||||||||||  || ||||||||     
T  12937376 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct- 12937278  T
Q  865 tcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||||||||||| |||||||||    
T  12937277 ttgtaaagttactcatcattata 12937255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 3577713 - 3577636
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||    
T  3577713 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 17036038 - 17036116
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  17036038 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 17695050 - 17694972
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  17695050 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17694972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 774 - 828
Target Start/End: Original strand, 11262596 - 11262649
Alignment:
Q  774 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11262596 ttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgaga-tttaggtagaattagg 11262649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 766 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 12911629 - 12911508
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctc 864  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||| |||||| |||||   | || || ||||||||||||  || ||||||||     
T  12911629 aaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct- 12911531  T
Q  865 tcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||||||||||| |||||||||    
T  12911530 ttgtaaagttactcatcattata 12911508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 13467662 - 13467585
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||    
T  13467662 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattagg 13467585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 810 - 875
Target Start/End: Original strand, 15346523 - 15346588
Alignment:
Q  810 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagtta 875  Q
    ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  15346523 gactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagtta 15346588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 773 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 12166321 - 12166267
Alignment:
Q  773 attaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  12166321 attaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 833 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078257
Alignment:
Q  833 agacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 28078257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 696 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 32447571 - 32447525
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta 741  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32447571 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacta 32447525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 772 - 828
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941704
Alignment:
Q  772 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 769 - 849
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643259
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 849  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26643259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 769 - 849
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749225
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac 849  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   || ||| |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattaggttggaagactaattcttgtaac 26749225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 452
Target Start/End: Original strand, 3390129 - 3390169
Alignment:
Q  412 aaatgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3390129 aaatgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattgaagtt 3390169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 3632494 - 3632454
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3632494 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 3632454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Original strand, 13056949 - 13056989
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13056949 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 13056989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 751 - 804
Target Start/End: Original strand, 33215810 - 33215865
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33215810 ttgattcaccttgaataaagcactattaggattgagtctcttggtcacggcaagag 33215865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 3630422 - 3630383
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttct 454  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3630422 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattct 3630383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 769 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342945
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagag 22342945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 572 - 634
Target Start/End: Original strand, 15719580 - 15719641
Alignment:
Q  572 aaacgtatttttatgggccaaatttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat 634  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  15719580 aaacgtatttttataggccatatttgttccaattttatga-gggttacttttactataaatat 15719641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 829 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 25465710 - 25465653
Alignment:
Q  829 cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  25465710 cgggagacttattcttgtacccctttgatatctct-ttgtaaagttactcatcattata 25465653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Original strand, 3396095 - 3396132
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3396095 tgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattgaagtt 3396132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 447
Target Start/End: Original strand, 13039508 - 13039541
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattg 447  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13039508 atgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattg 13039541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 768 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 17904531 - 17904470
Alignment:
Q  768 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||||    
T  17904531 acactattaggactgaatctcttggtcatgggaagagatttaggattttggctagaattagg 17904470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 24339029 - 24338996
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattg 447  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24339029 atgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattg 24338996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 635 - 887
Target Start/End: Original strand, 9020185 - 9020436
Alignment:
Q  635 ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcgggaggcagcacaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaaca 734  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| | ||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9020185 ccttgtatcagatgtaaaccttgtgctagagggagctgaaaacaagggtttgggaggcaacacaaaagtagggtttgtatagagtt-gctcttggcaaca 9020283  T
Q  735 aacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 834  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||    
T  9020284 aacactagggttgaagttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaag 9020383  T
Q  835 acttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  9020384 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattata 9020436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 545 - 837
Target Start/End: Original strand, 42770645 - 42770934
Alignment:
Q  545 ccgatatgtcgtaacagcatatttttgaaacgtatttttatgggccaaatttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgta 641  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||   | |||||    
T  42770645 ccgatgtgtcataacaacatatttttgaaacgtatttttatgggccagatttgttccaattttatgaggg-atacttttactataaatataaactttgta 42770743  T
Q  642 gcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcgggaggcagcacaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacacta 741  Q
     | || |||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42770744 tc-ga-gtaaaccttgagatagaggggactgaaaacaagggtttggaaggcaacacaaaattagg-tttatatagaatttgctcttggcaacaaacacta 42770840  T
Q  742 aggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact 837  Q
    |||||| |||| ||||||| || |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770841 aggttggggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 16092455 - 16092261
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092455 acaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 16092356  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  16092355 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgtaaggttactcatcattata 16092261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 18511467 - 18511277
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511467 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 18511368  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  18511367 ttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 18511277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 6661436 - 6661247
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6661436 aaaattagggtatgtatagagtttgttcttggcaacaaacactagagttggggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 6661337  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| || || ||||||    
T  6661336 ggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcataattata 6661247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 31472868 - 31472674
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31472868 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 31472769  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  | | ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  31472768 tcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 31472674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 34530921 - 34530727
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttg--aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34530921 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 34530822  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
      |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| | |||||||| || |||||||||    
T  34530821 ctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattata 34530727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 672 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 17413443 - 17413228
Alignment:
Q  672 gaaaacaagggttcgggaggcagcac-aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaaca 770  Q
    |||||||||||||  | ||||||||| |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  17413443 gaaaacaagggtttagaaggcagcactaaaactatggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaaca 17413346  T
Q  771 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgta 869  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   | | ||||||||||||||||  ||||||||||| | |||    
T  17413345 ctattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgta 17413246  T
Q  870 aagttacttatcattata 887  Q
    |||||||| |||||||||    
T  17413245 aagttactcatcattata 17413228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 25804049 - 25804239
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804049 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 25804148  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  25804149 ttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 25804239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 6745093 - 6745282
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 793  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745093 acaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 6745192  T
Q  794 cacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
     |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  6745193 tacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 6745282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 658608 - 658418
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  658608 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctcttgg 658509  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  658508 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 658418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 749 - 887
Target Start/End: Original strand, 695958 - 696095
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  695958 ggttgattcaccttg-gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 696056  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||    
T  696057 cccattgatatctcttttgtaaagttattcatcattata 696095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 18509573 - 18509383
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18509573 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 18509474  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||||||| |||||    
T  18509473 ttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagttactcatcat 18509383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 31466233 - 31466044
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-ga-ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31466233 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttgg 31466134  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||| |||||    
T  31466133 ttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcat 31466044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 40221546 - 40221740
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  40221546 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 40221645  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  40221646 ttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 40221740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 1189864 - 1189670
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1189864 acaaaactacggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactattatgattgagtctcttgg 1189765  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||| || ||||||    
T  1189764 ttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcataattata 1189670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 10529354 - 10529164
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529354 acaaaactaggatttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 10529255  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  10529254 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 10529164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 18596669 - 18596863
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||| |||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  18596669 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttgg 18596768  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  18596769 ttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 18596863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 749 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 20506040 - 20505906
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506040 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 20505941  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |  |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  20505940 cacattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 20505906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 39398248 - 39398078
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39398248 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 39398149  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||| |||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39398148 ttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctct 39398078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 2174943 - 2175132
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2174943 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttgg 2175042  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||    
T  2175043 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-ttgtaacgttacttatcat 2175132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 4236653 - 4236843
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  4236653 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 4236752  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  4236753 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 4236843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 6756518 - 6756710
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6756518 acaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactattaggattgagtatcttgg 6756617  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | | |||| |||||  |||||||||    
T  6756618 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac--attgatatcttttttgtaaggttacacatcattata 6756710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 16776182 - 16776371
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16776182 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 16776281  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||||    
T  16776282 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc-attgatttctcttttgtaacgttacttatcat 16776371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 17818745 - 17818555
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-ga-ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| |||| || |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  17818745 acaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactattaagactgagtctcttgg 17818646  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  17818645 ttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 17818555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 21948050 - 21948240
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948050 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 21948149  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | | ||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  21948150 ttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgttactcatcat 21948240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 25904127 - 25904317
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25904127 acaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 25904226  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  25904227 ttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgttacttatcat 25904317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 39854507 - 39854677
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  39854507 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcatgg 39854606  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39854607 ttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 39854677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 31545104 - 31545275
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggatt-gagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31545104 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattagagtctcttg 31545203  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31545204 gttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 31545275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 647 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 37706085 - 37705845
Alignment:
Q  647 tgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcgggaggcagc-acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagg 744  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||| || |  ||||| | |||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  37706085 tgtaaaccttgagatagagggggctgaaataaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactaggg 37705986  T
Q  745 tt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 842  Q
    || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |  ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37705985 tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattc 37705886  T
Q  843 ttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  37705885 ttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 37705845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 24126880 - 24127070
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttg--aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||   || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24126880 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactattaggattaagtctcttgg 24126979  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  24126980 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 24127070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 25921728 - 25921538
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921728 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttgg 25921629  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  25921628 ttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 25921538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 38882130 - 38882300
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38882130 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 38882229  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38882230 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctct 38882300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 17072907 - 17073101
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17072907 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttgg 17073006  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | | |||||||||||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  17073007 ttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 17073101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 27910474 - 27910644
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27910474 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttgg 27910573  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27910574 ttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 27910644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 31179626 - 31179455
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31179626 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 31179527  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  31179526 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctct 31179455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 726 - 883
Target Start/End: Original strand, 2954472 - 2954630
Alignment:
Q  726 ttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaa 823  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2954472 ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaa 2954571  T
Q  824 ttaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  2954572 ttaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctct-ttgtaaagttactcatcat 2954630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 849
Target Start/End: Original strand, 6747330 - 6747485
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 793  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747330 acaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 6747429  T
Q  794 cacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 849  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6747430 tacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 6747485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Original strand, 4410103 - 4410217
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410103 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 4410202  T
Q  849 cctattgatatctct 863  Q
    ||||||||| |||||    
T  4410203 cctattgatttctct 4410217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 18466708 - 18466878
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18466708 acaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 18466807  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18466808 ttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 18466878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 18469035 - 18469205
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18469035 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 18469134  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  18469135 ttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctct 18469205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 27912560 - 27912730
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||| | || | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912560 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 27912659  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27912660 ttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 27912730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Original strand, 39798127 - 39798241
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798127 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 39798226  T
Q  849 cctattgatatctct 863  Q
    || |||||| |||||    
T  39798227 cccattgatttctct 39798241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 15552269 - 15552440
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  15552269 acaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 15552368  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15552369 attacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 15552440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 674 - 887
Target Start/End: Original strand, 20053847 - 20054053
Alignment:
Q  674 aaacaagggttcgggaggcagcacaaaag-tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacact 772  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||||  ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20053847 aaacaagggtttagaaggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgggaaacact 20053946  T
Q  773 attaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaag 872  Q
    |||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||| | ||||||    
T  20053947 attaggattgagtctcttggt-----ttggagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaacc---cgatatctcttttgtaaag 20054038  T
Q  873 ttacttatcattata 887  Q
    ||||| |||||||||    
T  20054039 ttactcatcattata 20054053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 843
Target Start/End: Original strand, 31542759 - 31542910
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  31542759 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 31542858  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 843  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542859 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 31542910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 696 - 827
Target Start/End: Original strand, 20043074 - 20043208
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20043074 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 20043173  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 827  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20043174 ttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 696 - 831
Target Start/End: Original strand, 20045034 - 20045172
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20045034 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttgg 20045133  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgg 831  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20045134 ttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 26097757 - 26097946
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26097757 acaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttg-gaaacactattaggaatgagtctcttgg 26097855  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  26097856 ttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 26097946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 703 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 10474571 - 10474408
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 799  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| || ||    
T  10474571 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaagattgaatctcttggttacagg 10474472  T
Q  800 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10474471 aagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctct 10474408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 21684706 - 21684536
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21684706 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttgg 21684607  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  21684606 ttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctct 21684536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 714 - 828
Target Start/End: Original strand, 4754198 - 4754312
Alignment:
Q  714 tagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  4754198 tagagtttgctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtgact 4754297  T
Q  814 ttgggtagaattagg 828  Q
    |||| ||||||||||    
T  4754298 ttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 750 - 887
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208794
Alignment:
Q  750 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 848  Q
    |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 36208794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 34477309 - 34477137
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34477309 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttg 34477210  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34477209 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctct 34477137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 34479674 - 34479502
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34479674 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattatgattggagtctcttg 34479575  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34479574 gttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctct 34479502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 2818591 - 2818400
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg--ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2818591 acaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactattacgattgagtctcttg 2818492  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || ||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  2818491 gttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 2818400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 703 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 36402576 - 36402393
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 799  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  36402576 tagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggttacggg 36402477  T
Q  800 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  36402476 aggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 36402393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Original strand, 10586912 - 10587026
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  10586912 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaa 10587011  T
Q  849 cctattgatatctct 863  Q
    || |||||| |||||    
T  10587012 cccattgatttctct 10587026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Original strand, 10749794 - 10749895
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  10749794 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 10749893  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  10749894 ct 10749895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 736 - 887
Target Start/End: Original strand, 15143532 - 15143684
Alignment:
Q  736 acactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggag 834  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||   | ||    
T  15143532 acactagggttgagattgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaag 15143631  T
Q  835 acttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15143632 acttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 15143684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 12556178 - 12556009
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  12556178 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttgg 12556079  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
      |||||||||||||| || ||| ||||||||||| |  ||||||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  12556078 ctacgggaagagattg-gagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctct 12556009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 749 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 41585943 - 41585809
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41585943 ggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggagacttatttttgtaa 41585844  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
       |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  41585843 gtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcat 41585809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 793 - 883
Target Start/End: Original strand, 42770934 - 42771024
Alignment:
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  42770934 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 42771024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 3373322 - 3373221
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattga-gtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  3373322 gagaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 3373223  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  3373222 ct 3373221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 2144815 - 2144624
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaa-acactaaggttgaggttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtca 795  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  2144815 aaaactagggtttgta--gagtttgctcttggcaacaacacactagggttgggattgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtcg 2144718  T
Q  796 cgggaagagattga-gactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc-tattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||||| | || |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  2144717 cgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctct-ttgtaaagttactcatcattata 2144624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 38960316 - 38960216
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  38960316 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgatttct 38960218  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  38960217 ct 38960216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 769 - 887
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897947
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcg 867  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||||||||| | |    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  868 taaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattata 4897947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 763 - 857
Target Start/End: Original strand, 10757271 - 10757365
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgat 857  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10757271 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 10757365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 15354759 - 15354659
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  15354759 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 15354661  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  15354660 ct 15354659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 15357035 - 15356935
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  15357035 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 15356937  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  15356936 ct 15356935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Original strand, 23665138 - 23665238
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  23665138 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 23665236  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  23665237 ct 23665238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 23793449 - 23793349
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||    
T  23793449 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttct 23793351  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  23793350 ct 23793349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 698 - 849
Target Start/End: Original strand, 21288790 - 21288949
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-------gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctc 788  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||       |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  21288790 aaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-aaacactattaggattgagtatc 21288888  T
Q  789 ttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 849  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  21288889 ttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaac 21288949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 703 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 26098499 - 26098391
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 799  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||     
T  26098499 tagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactattatgattgagtctcttggttacgga 26098400  T
Q  800 aagagattg 808  Q
    |||||||||    
T  26098399 aagagattg 26098391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 723 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 34033796 - 34033691
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggta 820  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  34033796 ctcttggcaacaaacactagcgttgggattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattcaggattttgggta 34033697  T
Q  821 gaatta 826  Q
    ||||||    
T  34033696 gaatta 34033691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 752 - 863
Target Start/End: Original strand, 2723985 - 2724087
Alignment:
Q  752 tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacct 851  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||         |||||||||||||||| || ||||||||||||||     
T  2723985 tgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt---------ggtagaattaggcgggtgatttattcttgtaaccc 2724075  T
Q  852 attgatatctct 863  Q
    ||||||||||||    
T  2724076 attgatatctct 2724087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 723 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 15224996 - 15224889
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttga-gaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggta 820  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15224996 ctcttggcaacaaacactagggttatgattgattcaccttgaagaaacactattaggataaagtcttttggtcatgggaagagattcgagactttgggta 15224897  T
Q  821 gaattagg 828  Q
     |||||||    
T  15224896 aaattagg 15224889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 2298200 - 2298122
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2298200 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 10627347 - 10627425
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10627347 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-tagggtagaattagg 10627425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 772 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741943
Alignment:
Q  772 tattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 23741943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 698 - 823
Target Start/End: Original strand, 29748377 - 29748502
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcac 796  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| || ||||  | |||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29748377 aaaactagggtttgtagagaatt--ctcttggcaacaaacagtagggttaggattgattcgtcttggagaaacactaataggattgagtctcttggtcac 29748474  T
Q  797 gggaagagatt-gagactttgggtagaa 823  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  29748475 gggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 723 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 26406705 - 26406594
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttg-----attcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt 815  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||     |||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  26406705 ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacattgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-tt 26406607  T
Q  816 gggtagaattagg 828  Q
    | |||||||||||    
T  26406606 gagtagaattagg 26406594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 723 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 31782689 - 31782578
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttg-----attcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt 815  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||     |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  31782689 ctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-att 31782591  T
Q  816 gggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||||    
T  31782590 gggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 1170794 - 1170872
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  1170794 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 1170872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 35385651 - 35385573
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  35385651 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 35385573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 887
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430398
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 847  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 35430358  T
Q  848 a-cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |  || ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  35430359 attcttttgatatctct-ttgtaaagttactcatcattata 35430398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 696 - 826
Target Start/End: Original strand, 13295765 - 13295896
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggt 793  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||  |||| | || | ||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  13295765 acaaaactagggtttgtatagaatt--cttttggcaacaaacactagagttgggattcaatcaccatgaacaaaacacttttaggattgagtctcttgat 13295862  T
Q  794 cacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 826  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13295863 cacatgaagagattcgagactttgggtagaatta 13295896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 766 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 15445453 - 15445328
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggt---cacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    |||  |||||||||||||||||| |||||||||||   | ||| | ||||||||||||  |||||||||    
T  15445453 aaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatct 15445354  T
Q  862 ctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || | ||||||||||| |||||||||    
T  15445353 cttttgtaaagttactcatcattata 15445328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 723 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 16093522 - 16093438
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggt-----tgattcaccttgagaaa-cactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 801  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |     ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16093522 ctcttggcaacaaacactagggttgggatctttttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 16093438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 22672817 - 22672895
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22672817 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 22672895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 25452478 - 25452556
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  25452478 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 769 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962554
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 11962554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 32520518 - 32520597
Alignment:
Q  751 ttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  32520518 ttgattcacattcgagaaacactattaagattgagtctctcgattacgggaagagattcatgactttgggtagaattagg 32520597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 771 - 828
Target Start/End: Original strand, 25445501 - 25445557
Alignment:
Q  771 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  25445501 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25445557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 1240411 - 1240489
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  || || ||||||||||||||||    
T  1240411 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattagg 1240489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Original strand, 20044757 - 20044797
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20044757 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggaattctg 20044797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 804
Target Start/End: Original strand, 28786387 - 28786442
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786387 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 28786442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 421 - 484
Target Start/End: Complemental strand, 34531199 - 34531136
Alignment:
Q  421 gaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtctaattcggtggccgaattgga 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |  |||||||| ||||||||    
T  34531199 gaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctggtgttgtcaacatcggtggctgaattgga 34531136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 751 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 17841448 - 17841393
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17841448 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctctaggtcacgggaagag 17841393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 454
Target Start/End: Original strand, 24126579 - 24126618
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttct 454  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24126579 tgttgtgaaagtgtctcaaaattgaagaaattggaattct 24126618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 1190154 - 1190117
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1190154 tgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattgaagtt 1190117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 418 - 455
Target Start/End: Original strand, 2723698 - 2723735
Alignment:
Q  418 tgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2723698 tgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 2723735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 152; Significance: 5e-80; HSPs: 132)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 648 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 18537775 - 18537536
Alignment:
Q  648 gtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcgggaggcagcacaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttg 747  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  | |   | ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18537775 gtaaacattgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaacaaacaacaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaccactagggttg 18537676  T
Q  748 aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 847  Q
     ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537675 gggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgta 18537576  T
Q  848 acctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  18537575 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 18537536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Original strand, 19322776 - 19322965
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19322776 aaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggtttgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 19322875  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  19322876 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 19322965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 703 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 18535078 - 18534918
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18535078 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaag 18534979  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18534978 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 18534918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 615 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 8756589 - 8756313
Alignment:
Q  615 gatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcgggaggcagcac-aaaagtagggttt 710  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||  | || || ||  |||| |||| |||    
T  8756589 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaaccttgagatagaaggggctgaaaacaagggtttagaagtcaacaagaaaattaggattt 8756491  T
Q  711 gtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt-ggtcacgggaagagattga 809  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8756490 gtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattga 8756391  T
Q  810 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  8756390 gactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattata 8756313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890287
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacattagggttggggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacg 38890377  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  38890376 ggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 38890287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 13544037 - 13544227
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544037 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactaggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 13544136  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  13544137 ttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 13544227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 37313321 - 37313127
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gag-gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37313321 acaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 37313222  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  37313221 ttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattata 37313127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 33415742 - 33415553
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  33415742 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgg-aacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagatcgagtctcttgg 33415644  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  33415643 ttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 33415553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 36378370 - 36378564
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttg--aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |    
T  36378370 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctcttag 36378469  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  36378470 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagttactcatcattata 36378564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 12396100 - 12395910
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396100 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 12396001  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  12396000 ttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 12395910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 24879067 - 24879237
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24879067 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 24879166  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24879167 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 24879237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 24880529 - 24880699
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880529 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 24880628  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24880629 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 24880699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 40637152 - 40637342
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  40637152 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttgg 40637251  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  40637252 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 40637342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 12401062 - 12400872
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12401062 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgg 12400963  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  12400962 ttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 12400872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 615 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 22803073 - 22802799
Alignment:
Q  615 gatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga-ggcagca-caaaagtagggtt 709  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||  | | |||| || ||||| |||||||    
T  22803073 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 22802976  T
Q  710 tgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 806  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| || |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  22802975 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggc 22802876  T
Q  807 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  22802875 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcat 22802799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 36380427 - 36380621
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || || || |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36380427 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttgg 36380526  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  36380527 ttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattata 36380621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 615 - 883
Target Start/End: Original strand, 48486313 - 48486587
Alignment:
Q  615 gatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga-ggcagca-caaaagtagggtt 709  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||  | | |||| || ||||| |||||||    
T  48486313 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtt 48486410  T
Q  710 tgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 806  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48486411 tgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagat 48486510  T
Q  807 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  48486511 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgttactcatcat 48486587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 19095960 - 19096151
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19095960 acaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactattaggattgagtctcttg 19096059  T
Q  792 gtcacgggaagagattgaga-ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  19096060 gttacgggaagagatt-agagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcat 19096151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 593 - 887
Target Start/End: Original strand, 28453660 - 28453954
Alignment:
Q  593 atttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga 689  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||||   ||||||| ||||||| ||| ||| | |||||||  |||||||||||||||  | |    
T  28453660 atttgttccaattatttgaggg-atatttttactataaatatagaccttgtatcagatgtgaaccttgaggtagagagt-ctgaaaacaagggtttagaa 28453757  T
Q  690 ggcagcac-aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctc 788  Q
    | || ||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28453758 gccaacactaaaactagggtttgca--gagtttgctcttggcaagaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctc 28453855  T
Q  789 ttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||  | ||||| |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  28453856 ttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 28453954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 706 - 887
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136821
Alignment:
Q  706 ggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 805  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  30136640 ggtttgtatagagtttactcttggcaacaaacactagggttggggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaagaaa 30136739  T
Q  806 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || ||||||||| | ||||||||| | |||||||||    
T  30136740 ttgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattata 30136821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 16934398 - 16934227
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16934398 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttg 16934299  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16934298 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 16934227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 8631674 - 8631484
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631674 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 8631575  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  8631574 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 8631484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 36921749 - 36921558
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36921749 acaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 36921650  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  36921649 gttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 36921558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 38928433 - 38928242
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38928433 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 38928334  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  38928333 gttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 38928242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 14633397 - 14633586
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14633397 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 14633496  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  14633497 ttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcat 14633586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 16453387 - 16453581
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| ||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453387 acaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 16453486  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  16453487 ttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 16453581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 22801117 - 22800927
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  22801117 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttga 22801018  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  22801017 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 22800927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 24888874 - 24889064
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24888874 acaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 24888973  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  24888974 ttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgttacttatcat 24889064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 855
Target Start/End: Complemental strand, 26086231 - 26086069
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26086231 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 26086132  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattg 855  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26086131 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattg 26086069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 41997570 - 41997760
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    
T  41997570 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttag 41997669  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  41997670 ttacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcatcat 41997760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 16932044 - 16931873
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| | | ||||||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16932044 acaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattggagtctcttg 16931945  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16931944 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 16931873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 698 - 883
Target Start/End: Original strand, 9863791 - 9863974
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9863791 aaaactagggtttgta--gagtttgttcttggcaacaaacactaaggttgggtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtcacg 9863888  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  9863889 ggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctct-ttgtaaagttactcatcat 9863974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 3824825 - 3824635
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3824825 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctattgg 3824726  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  3824725 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 3824635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 5637720 - 5637530
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637720 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 5637621  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  5637620 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 5637530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 749 - 887
Target Start/End: Original strand, 16455375 - 16455513
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16455375 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 16455474  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |  |||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||    
T  16455475 ctcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattata 16455513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 18709418 - 18709248
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gag-gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  18709418 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaacactattagggttgagtctcttgg 18709319  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18709318 ttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 18709248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 40091670 - 40091480
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  40091670 acaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttgg 40091571  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  40091570 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcat 40091480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 31849854 - 31849683
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgag---gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31849854 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 31849755  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
     | ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31849754 cttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 31849683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 44600093 - 44599922
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  44600093 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 44599994  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  44599993 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctct 44599922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 18847231 - 18847402
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta-aggttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18847231 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagcattggagtctcttg 18847330  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18847331 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 18847402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 22046940 - 22046770
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22046940 acaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 22046841  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22046840 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 22046770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 24348296 - 24348486
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348296 acaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 24348395  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  24348396 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 24348486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 38409283 - 38409453
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38409283 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 38409382  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  38409383 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctct 38409453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 593 - 863
Target Start/End: Original strand, 47868373 - 47868649
Alignment:
Q  593 atttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga 689  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||   ||||||| |||| | |||| | | |||||||||||||||||  | || || |  |    
T  47868373 atttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcaga-gcaaacttggagatagagagggctgaaagaagggtttagaaa 47868471  T
Q  690 ggcagca-caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagt 785  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| | || |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  47868472 ggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 47868571  T
Q  786 ctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  47868572 ctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 47868649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 51015324 - 51015494
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015324 acaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 51015423  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  51015424 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 51015494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 757 - 887
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891563
Alignment:
Q  757 caccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattga 856  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  857 tatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcattata 2891563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 9148331 - 9148501
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148331 acaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 9148430  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9148431 ttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 9148501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 14787686 - 14787496
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14787686 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 14787587  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  14787586 ttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 14787496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 37089626 - 37089456
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  37089626 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttga 37089527  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37089526 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 37089456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 47274805 - 47274994
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47274805 acaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 47274903  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  47274904 ttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 47274994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 703 - 887
Target Start/End: Original strand, 27499130 - 27499314
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacggg 799  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||      
T  27499130 tagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacgat 27499229  T
Q  800 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  27499230 aagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaaccta---atatctcttttgtaaggttactcatcattata 27499314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 664 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 47151177 - 47150955
Alignment:
Q  664 agagggctgaaaacaagggttcgggaggcagcacaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttg 763  Q
    |||| ||||||||||||||||  | || || ||||||| || |||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  47151177 agagagctgaaaacaagggtttagaagccaacacaaaactaaggttt--atagagtttgctcttggtaaccaacactagggttgaaattgattcaccttg 47151080  T
Q  764 agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctc 862  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  47151079 ggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctc 47150980  T
Q  863 tctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |  ||||||| || |||||||||    
T  47150979 ttttctaaagttgctcatcattata 47150955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 9176729 - 9176558
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | | ||| ||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9176729 acaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 9176630  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  9176629 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 9176558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 11006492 - 11006321
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11006492 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 11006393  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11006392 gttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 11006321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 22782993 - 22782822
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22782993 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttg 22782894  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22782893 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 22782822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 2485127 - 2484957
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2485127 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 2485028  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2485027 ttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2484957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 9174401 - 9174230
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gag-gttgattcaccttgagaaacactattaggattga-gtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9174401 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttg 9174302  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  9174301 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctct 9174230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 22044645 - 22044475
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044645 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 22044546  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  22044545 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctct 22044475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 22132645 - 22132476
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132645 acaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 22132547  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22132546 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 22132476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 36919840 - 36919669
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36919840 acaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttg 36919741  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  36919740 gttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctct 36919669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 619702 - 619512
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  619702 acaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattaggattgactgtcttgg 619603  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  619602 ttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 619512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 11008821 - 11008656
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  11008821 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 11008722  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgat 857  Q
    || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11008721 gttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 11008656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 749 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 17662444 - 17662310
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662444 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 17662345  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  17662344 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 17662310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 18409602 - 18409432
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||| |    
T  18409602 acaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactattaggattgagtctcttag 18409503  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18409502 ttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctct 18409432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 40999201 - 40999011
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40999201 aaaactaggggttgtatagagtttgctcttgacaacaaacactaggattgagattgattcacctaggaaaacattattaggattgagtctcttggtcacg 40999102  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||   | ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||    
T  40999101 ggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcgttata 40999011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 22780628 - 22780457
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22780628 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggattggagtctcttg 22780529  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22780528 gttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 22780457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 849
Target Start/End: Original strand, 56030522 - 56030678
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  56030522 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttgg 56030621  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 849  Q
    | ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56030622 ttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaac 56030678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 11435033 - 11435203
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  11435033 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcctgg 11435132  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | || |||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11435133 ttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 11435203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 698 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 15032790 - 15032612
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||         |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15032790 aaaactagggtttgtatagagtttgctctttgcaacaaa---------tgaggttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacg 15032700  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcatta 885  Q
     ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  15032699 agaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 15032612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 5198498 - 5198668
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5198498 acaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtcttttgg 5198597  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  5198598 ttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 5198668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 765 - 883
Target Start/End: Original strand, 13547304 - 13547422
Alignment:
Q  765 gaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctc 864  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||     
T  13547304 gaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatctt 13547403  T
Q  865 tcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  13547404 ttgtaaagttactcatcat 13547422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 696 - 833
Target Start/End: Original strand, 6132950 - 6133090
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6132950 acaaaactagggcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactattaggattgagtctcttgg 6133049  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 833  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6133050 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 637 - 887
Target Start/End: Original strand, 10112890 - 10113141
Alignment:
Q  637 ttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcgggaggcagcacaaaag-tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaa 735  Q
    ||||| ||||||||||| | | || |||| | | ||||||||||||||  | || || |||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10112890 ttgtatcagatgtaaacctcgagagagagggagttgaaaacaagggtttagaagccaacacaaaaactagggtttgta--gagtttgctcttggcaacaa 10112987  T
Q  736 acactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcac-gggaagagattgagactttgggtagaattag-gcggga 833  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    | |    
T  10112988 acactagggttgagattgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaa 10113087  T
Q  834 gacttattcttgtaacc-tattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  10113088 gactaattcttgtaacctttttgatatctct-ttgtaatgttactaatcattata 10113141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Original strand, 7941457 - 7941571
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941457 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 7941556  T
Q  849 cctattgatatctct 863  Q
    || |||||| |||||    
T  7941557 cccattgatttctct 7941571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 697 - 887
Target Start/End: Original strand, 9022386 - 9022577
Alignment:
Q  697 caaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtca 795  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  9022386 caaaactagggtttgtagagaatt--ctcttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatttcttggtca 9022483  T
Q  796 cgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaac--ctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||   | ||||| |||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  9022484 cgggaagagattgagactttgggttgaattaggtttgaagactaattcttgtaacctctattgatatctct-ttgtaaagttactcatcattata 9022577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 22134870 - 22134701
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134870 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 22134772  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | | ||||| ||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22134771 ttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 22134701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 749 - 883
Target Start/End: Original strand, 6764978 - 6765112
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6764978 ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaa 6765077  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  6765078 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 6765112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 750 - 887
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102359
Alignment:
Q  750 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 848  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || | |||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 12102359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 698 - 843
Target Start/End: Complemental strand, 3937462 - 3937314
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgct-cttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtc 794  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||     
T  3937462 aaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattggaattgagtctcttggtt 3937363  T
Q  795 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 843  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937362 acaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 52942701 - 52942544
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942701 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 52942602  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52942601 ttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 52942544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 750 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983589
Alignment:
Q  750 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 848  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||  ||||||||| | | ||||| ||||| |||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattata 31983589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 765 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 47210935 - 47210837
Alignment:
Q  765 gaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  47210935 gaaacactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 47210837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 723 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 3982410 - 3982238
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttg-----attcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga-ttgagacttt 815  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||     |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  3982410 ctcttggcaacaaacactagggttgagattgtttttattcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggacttt 3982311  T
Q  816 gggtagaatt-aggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||| ||   | ||||| |||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  3982310 gggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaacactttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 3982238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 749 - 844
Target Start/End: Original strand, 53405263 - 53405358
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 844  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  53405263 ggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattctt 53405358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 736 - 887
Target Start/End: Original strand, 25357757 - 25357913
Alignment:
Q  736 acactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgg----gtagaatt-aggcg 830  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||     ||||||| ||       
T  25357757 acactagggttgtgattgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagttt 25357856  T
Q  831 ggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  25357857 gaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 25357913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 698 - 810
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114522
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10114412 aaaactagggtttgta--gagtctgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 10114509  T
Q  798 ggaagagattgag 810  Q
      |||||||||||    
T  10114510 ataagagattgag 10114522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 751 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 16186035 - 16185897
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 847  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| |    
T  16186035 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgca 16185936  T
Q  848 acctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||  ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  16185935 accctttgatatatct-ttgtaaagttactcatcattata 16185897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 795 - 883
Target Start/End: Original strand, 4215486 - 4215574
Alignment:
Q  795 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  4215486 acgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 4215574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 723 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 38208910 - 38208809
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggta 820  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||    
T  38208910 ctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggtcacaagaagagattcgagactttaggta 38208811  T
Q  821 ga 822  Q
    ||    
T  38208810 ga 38208809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 810 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635541
Alignment:
Q  810 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 5635541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 55822248 - 55822326
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  55822248 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 766 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336903
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5336903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 810 - 863
Target Start/End: Original strand, 11437558 - 11437611
Alignment:
Q  810 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  11437558 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 11437611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 723 - 828
Target Start/End: Original strand, 16489300 - 16489410
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttg-----attcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt 815  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||     |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  16489300 ctcttggcaacaa-cactaaggttgagattgttttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-tt 16489397  T
Q  816 gggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||||    
T  16489398 gggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 763 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 29609656 - 29609591
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  29609656 gagaaacactattagaattgagtctcttgatcacggcaagagattgagacttcgagtagaattagg 29609591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 751 - 877
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906850
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 847  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgta 54906821  T
Q  848 acctattgatatctctctcgtaaagttact 877  Q
    ||   ||||||||||| | |||||||||||    
T  54906822 actctttgatatctct-ttgtaaagttact 54906850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 4570077 - 4570155
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  4570077 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 4570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 7050456 - 7050378
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  7050456 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7050378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 11853532 - 11853610
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  11853532 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 11853610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 25699732 - 25699810
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  25699732 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 766 - 824
Target Start/End: Original strand, 16638827 - 16638884
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaat 824  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  16638827 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagagattgagac-ttgggtagaat 16638884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 18538030 - 18537981
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtc 463  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18538030 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattgaagttctgaagctgtc 18537981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 723 - 828
Target Start/End: Original strand, 36771346 - 36771457
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttg-----attcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt 815  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||     |||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  || ||| ||    
T  36771346 ctcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcaccttgaacaaaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgac-tt 36771444  T
Q  816 gggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||||    
T  36771445 gggtagaattagg 36771457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 772 - 827
Target Start/End: Original strand, 3760105 - 3760161
Alignment:
Q  772 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag-actttgggtagaattag 827  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  3760105 tattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatttagcactttgggtagaattag 3760161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 8529250 - 8529328
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  8529250 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8529328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 18586949 - 18587027
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  18586949 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 31300407 - 31300485
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  31300407 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 724 - 828
Target Start/End: Original strand, 47566444 - 47566554
Alignment:
Q  724 tcttggcaacaaacactaaggttgaggttg-----attcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttg 816  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||     |||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||    
T  47566444 tcttggcaacaaacactagggttgagattgttttgattcacattgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagactg-gaatttg 47566542  T
Q  817 ggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||    
T  47566543 ggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 769 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 769 - 828
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 769 - 828
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 751 - 814
Target Start/End: Original strand, 4884857 - 4884922
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactt 814  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  4884857 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 4884922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 800 - 838
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270120
Alignment:
Q  800 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 838  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 751 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 5516444 - 5516367
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 826  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  5516444 ttgattcatcttggagaaacaccattaggtttgggtctcttgctcacgggaagagattcgagactttgcgtagaatta 5516367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 723 - 828
Target Start/End: Original strand, 36769429 - 36769540
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttg-----attcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt 815  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||     |||||||||||   ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  36769429 ctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtttcttggtcacgggaagaggctgagac-tt 36769527  T
Q  816 gggtagaattagg 828  Q
    ||||| |||||||    
T  36769528 gggtaaaattagg 36769540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 455
Target Start/End: Original strand, 6132639 - 6132687
Alignment:
Q  407 tttataaatgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6132639 tttataattgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 6132687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 804
Target Start/End: Original strand, 15831124 - 15831179
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15831124 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15831179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 16689139 - 16689061
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  16689139 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16689061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 18409885 - 18409801
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtctaattcggtggccgaattggatagctcagtggccga 499  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||| |  ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  18409885 tgttgagaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttatggttttgtcaacatcggtggccgaattggagagcacggtggccga 18409801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 18535337 - 18535289
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtc 463  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18535337 tgttgtgaaagtgactcaatattgaagaaattggagttctaaagctgtc 18535289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 752 - 828
Target Start/End: Original strand, 22295294 - 22295370
Alignment:
Q  752 tgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||   ||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||    
T  22295294 tgattcaccttagtaaacattgttaggatttagtctcttggtcacggaaagagattgaaactttgagtataattagg 22295370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 703 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 24446832 - 24446756
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactatta 776  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24446832 tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 751 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 4874678 - 4874620
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 807  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4874678 ttgattcaccttgatcaaaacactattaagatagagtctcttggtcacgggaagagatt 4874620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 816 - 883
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101197
Alignment:
Q  816 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| |||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcat 5101197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 696 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 38270241 - 38270158
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactatta 776  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  38270241 acaaaactagggtttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 712 - 828
Target Start/End: Original strand, 26557677 - 26557801
Alignment:
Q  712 tatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttg-----attcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | |||     ||||||||| |   |||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||    
T  26557677 tatagagatttctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttaaacaaaacactattaggatatagtctcatggtcacgggaaaag 26557776  T
Q  805 att-gagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||    
T  26557777 attcaagactttgggtggaattagg 26557801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 13072180 - 13072102
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  || || ||||||||||||||||    
T  13072180 ttgattcaccttgaacaaatcactattatgattgagtctcttggtcactggaagaggctgtga-tttgggtagaattagg 13072102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 15312299 - 15312377
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||||    
T  15312299 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtcgcttggtcacgggaagatgctgtgac-ttgggtagaattagg 15312377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Original strand, 27498965 - 27499005
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  27498965 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 27499005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 766 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 25614102 - 25614059
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 809  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25614102 aaacactgttagaattgagtctcttggtcacgagaagagattga 25614059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 415 - 449
Target Start/End: Original strand, 2891134 - 2891168
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattgga 449  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2891134 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattgga 2891168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 37313600 - 37313563
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37313600 tgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattgaagtt 37313563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 635 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 16963 - 16712
Alignment:
Q  635 ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcgggaggcagcacaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaaca 734  Q
    ||||||| |||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| |  || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16963 ccttgtatcaga-gtaaaccttgagatagaggaggctgaaaacaagggtttgaaagacaacacaaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaaca 16865  T
Q  735 aacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggag 834  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16864 aacactagggttgggattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccagag 16765  T
Q  835 acttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  16764 acttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 16712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 81)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 576 - 883
Target Start/End: Original strand, 27910973 - 27911284
Alignment:
Q  576 gtatttttatgggccaaatttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctg 672  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| || || ||||||||||| ||| ||||   | ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  27910973 gtatttttatgggccagatttgttccaattttatg-ggagatacttttacaataaatattgacattgtatca-atgtaaaccttgagatagagggggctg 27911070  T
Q  673 aaaacaagggttcgggaggcagca-caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaa 768  Q
    ||| ||||||||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  27911071 aaa-caagggtttagaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 27911169  T
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgt 868  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| | ||    
T  27911170 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgt 27911269  T
Q  869 aaagttacttatcat 883  Q
    ||||||||| |||||    
T  27911270 aaagttactcatcat 27911284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 576 - 883
Target Start/End: Original strand, 27957392 - 27957703
Alignment:
Q  576 gtatttttatgggccaaatttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctg 672  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| || || ||||||||||| ||| ||||   | ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  27957392 gtatttttatgggccagatttgttccaattttatg-ggagatacttttacaataaatattgacattgtatca-atgtaaaccttgagatagagggggctg 27957489  T
Q  673 aaaacaagggttcgggaggcagca-caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaa 768  Q
    ||| ||||||||  | ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  27957490 aaa-caagggtttagaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 27957588  T
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgt 868  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| | ||    
T  27957589 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgt 27957688  T
Q  869 aaagttacttatcat 883  Q
    ||||||||| |||||    
T  27957689 aaagttactcatcat 27957703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 706 - 887
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956231
Alignment:
Q  706 ggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 805  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaagaga 15956149  T
Q  806 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15956150 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 15956231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 593 - 887
Target Start/End: Original strand, 31162188 - 31162483
Alignment:
Q  593 atttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga 689  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||   ||||||| || | |||||| ||| || |||| ||||| ||||||| ||||  | |    
T  31162188 atttgttccaattttatgaggg-atacttttactataaatatagaccttgtatcata-gtaaaccttgagaaagagggggctaaaaacaaaggtttagaa 31162285  T
Q  690 ggcagcacaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctct 789  Q
       ||||  ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31162286 acaagcaacaaattagtgtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactaacgttagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctct 31162385  T
Q  790 tggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  31162386 tggtcaccggaagagattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattata 31162483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 703 - 888
Target Start/End: Original strand, 21482401 - 21482585
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  21482401 tagggtttgtataaagtttgctcttggcaacaaacactagggttg-ggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaag 21482499  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattataa 888  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  21482500 agattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataa 21482585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 637 - 887
Target Start/End: Original strand, 36865558 - 36865809
Alignment:
Q  637 ttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga-ggcagca-caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaac 733  Q
    ||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||||||||| ||||||||  | | |||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36865558 ttgtatcagatgtaaaccttaagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaac 36865656  T
Q  734 aaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgg 831  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  36865657 aaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctt---cacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgg 36865753  T
Q  832 gagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  36865754 gagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagttactcatcattata 36865809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 703 - 887
Target Start/End: Original strand, 21480593 - 21480776
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21480593 tagggtttgtatggagtttgctcttggcaacaaacactaggtttg-ggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaag 21480691  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  21480692 atattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 21480776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 707 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 30480747 - 30480588
Alignment:
Q  707 gtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 803  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30480747 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 30480648  T
Q  804 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30480647 gattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 30480588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 696 - 859
Target Start/End: Original strand, 14477356 - 14477522
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14477356 acaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttgg 14477455  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatat 859  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14477456 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatat 14477522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 27107152 - 27106982
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta-aggttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27107152 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 27107053  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  27107052 ttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctct 27106982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 14807831 - 14808021
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807831 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 14807930  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  14807931 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 14808021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 707 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 3005872 - 3005693
Alignment:
Q  707 gtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 806  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| | ||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3005872 gtttgtatagagtttgctcttaacaacaaacaatagggttg-gattgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagat 3005774  T
Q  807 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||| || |||||||||    
T  3005773 tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattata 3005693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 32339389 - 32339559
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  32339389 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactattaggattgagtctcttgg 32339488  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32339489 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 32339559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 13858739 - 13858546
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13858739 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtttcttgg 13858640  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  13858639 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagttactcatcattata 13858546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 14419444 - 14419252
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagg-ttga-ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtc 794  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| |  || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  14419444 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtt 14419345  T
Q  795 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | |||| |||||| |||||||||    
T  14419344 acgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggttactcatcattata 14419252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 43079682 - 43079853
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43079682 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 43079781  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43079782 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 43079853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 608814 - 609004
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  608814 acaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttgg 608913  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  608914 ttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 609004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 704 - 883
Target Start/End: Original strand, 15068069 - 15068251
Alignment:
Q  704 agggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 800  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  15068069 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactattaggattgagtcttttggttacggaa 15068168  T
Q  801 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  15068169 agaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 15068251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 22684911 - 22684718
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttg--aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684911 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 22684812  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc---tattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  22684811 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacgttactcatcat 22684718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 27829377 - 27829547
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27829377 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 27829476  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27829477 ttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 27829547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 1225246 - 1225416
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1225246 acaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1225345  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  1225346 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctct 1225416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 5372433 - 5372239
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5372433 acaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 5372334  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| | | |||| |||||| |||||||||    
T  5372333 ttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggttactcatcattata 5372239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 726 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 31578501 - 31578339
Alignment:
Q  726 ttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaatt 825  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31578501 ttggtaacaaacactaaggttgagattgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaatt 31578402  T
Q  826 agg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||   | ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  31578401 aggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 31578339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 707 - 883
Target Start/End: Original strand, 3874101 - 3874280
Alignment:
Q  707 gtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 803  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3874101 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaaga 3874200  T
Q  804 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  3874201 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 3874280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 24873436 - 24873265
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24873436 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactattaggattggagtctcttg 24873337  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24873336 gttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctct 24873265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 714 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 31573961 - 31573797
Alignment:
Q  714 tagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 813  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573961 tagagttttctcttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 31573862  T
Q  814 ttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttact 877  Q
    |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||    
T  31573861 ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaaagttact 31573797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 15809299 - 15809488
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15809299 acaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 15809397  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  15809398 ttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 15809488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 18810788 - 18810958
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810788 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 18810887  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||| ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18810888 ttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 18810958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 27827066 - 27827236
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27827066 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 27827165  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | || |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27827166 ttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 27827236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 28251822 - 28251632
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251822 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 28251723  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  28251722 ttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcat 28251632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 709 - 887
Target Start/End: Original strand, 25952613 - 25952794
Alignment:
Q  709 ttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 805  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |    
T  25952613 ttgtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaa 25952712  T
Q  806 ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  25952713 ttgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattata 25952794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 15072790 - 15072981
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  15072790 acaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 15072889  T
Q  793 tcacgggaagaga-ttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  15072890 ttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 15072981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 43082053 - 43082224
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  43082053 acaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatcaggattggagtctcttg 43082152  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  43082153 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 43082224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 41384824 - 41385014
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttg--aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41384824 acaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttgg 41384923  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  41384924 ttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 41385014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 28283474 - 28283304
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28283474 acaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgaatctcttgg 28283375  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  28283374 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctct 28283304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 696 - 857
Target Start/End: Original strand, 4424098 - 4424262
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||||    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4424098 acaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattaggattgagtctcttgg 4424197  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgat 857  Q
    | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4424198 ttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 4424262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Original strand, 18813018 - 18813132
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813018 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 18813117  T
Q  849 cctattgatatctct 863  Q
    || |||||| |||||    
T  18813118 cccattgatttctct 18813132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 708 - 863
Target Start/End: Original strand, 44720935 - 44721094
Alignment:
Q  708 tttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaa-cactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 803  Q
    |||||||||||| || ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44720935 tttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 44721034  T
Q  804 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  44721035 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 44721094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 748 - 863
Target Start/End: Original strand, 43530250 - 43530365
Alignment:
Q  748 aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 847  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43530250 aggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgta 43530349  T
Q  848 acctattgatatctct 863  Q
    ||| |||||| |||||    
T  43530350 acccattgatttctct 43530365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 735 - 887
Target Start/End: Original strand, 31035239 - 31035391
Alignment:
Q  735 aacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cggga 833  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   | |    
T  31035239 aacactatggttggggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaa 31035338  T
Q  834 gacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  31035339 gacttattcttgtaaccctttgatatctct-ttgtaaagttactcatcattata 31035391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 647 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 33541693 - 33541507
Alignment:
Q  647 tgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga-ggcagca-caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaag 743  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  | | |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |    
T  33541693 tgtaaacattgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg 33541595  T
Q  744 gtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggc 829  Q
    ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33541594 gtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggc 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 748 - 883
Target Start/End: Original strand, 181634 - 181771
Alignment:
Q  748 aggttgattcaccttgagaaacactatt-aggattgagtctcttggtcacg--ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 844  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || |||  |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  181634 aggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcggaagacttattctt 181733  T
Q  845 gtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  181734 gtaacccattgatatctct-ttgtaaagttactcatcat 181771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 15185965 - 15185776
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagt--ctctt 790  Q
    |||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||| |||||||  |||||    
T  15185965 acaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactattagaattgagtctctctt 15185866  T
Q  791 ggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||| |||||||||||       |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  ||| |||||| |||||||||    
T  15185865 ggttacgggaagaga-------tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggttactcatcattata 15185776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 751 - 863
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847775
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttga--gaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 847  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| |||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgta 17847760  T
Q  848 acctattgatatctct 863  Q
    |||| |||||||||||    
T  17847761 acct-ttgatatctct 17847775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 771 - 883
Target Start/End: Original strand, 41382820 - 41382932
Alignment:
Q  771 ctattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaa 870  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | ||||    
T  41382820 ctattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa 41382919  T
Q  871 agttacttatcat 883  Q
     |||||| |||||    
T  41382920 cgttactcatcat 41382932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 698 - 785
Target Start/End: Original strand, 31035151 - 31035238
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagt 785  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31035151 aaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 714 - 885
Target Start/End: Original strand, 3895920 - 3896094
Alignment:
Q  714 tagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac 812  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||    
T  3895920 tagagtttgcttttggcaacaaacaatagggttgggattgattcactttggagaaacactattgcgattgagtctcttcgtcacgggaagaaattgggac 3896019  T
Q  813 tttgggtagaattaggcgggagactt-attcttgtaac-ctattgatatctctctcgtaaagttacttatcatta 885  Q
    |||| ||| |||||||   || | || ||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  3896020 tttgagtataattaggtttgaaaattaattcttgtaactcttatgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 3896094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 712 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 2468341 - 2468261
Alignment:
Q  712 tatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 793  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468341 tatagagtttgctcttggcaacaaatactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 751 - 850
Target Start/End: Complemental strand, 13985278 - 13985177
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa-cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||   || ||| ||||||||||    
T  13985278 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaa 13985179  T
Q  849 cc 850  Q
    ||    
T  13985178 cc 13985177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 751 - 887
Target Start/End: Original strand, 6376124 - 6376262
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 847  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||   | ||||| ||||||||     
T  6376124 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgtt 6376223  T
Q  848 acctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  6376224 accttttgatatctct-ttgtaaagttactcatcattata 6376262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 33839120 - 33839043
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttga-gaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  33839120 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggtca--ggaagagattcaagactttgggtagaattagg 33839043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 696 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 5622993 - 5622878
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||     
T  5622993 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatttggattgagtctcttga 5622894  T
Q  793 tcacgggaagagattg 808  Q
    | ||||||||||||||    
T  5622893 ttacgggaagagattg 5622878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 723 - 828
Target Start/End: Original strand, 30423162 - 30423274
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttg-----attcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt 815  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| |||     |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  30423162 ctcttggcaacaaacactagggctgagattgttttgattcaccttgaacaaaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaacttt 30423261  T
Q  816 gggtagaattagg 828  Q
    || ||||||||||    
T  30423262 ggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 819 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468191
Alignment:
Q  819 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 2468191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 9021306 - 9021228
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  9021306 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 16752721 - 16752643
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  16752721 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 16757466 - 16757388
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  16757466 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 28327891 - 28327969
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  28327891 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28327969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 28895485 - 28895563
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  28895485 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 751 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 13986011 - 13985933
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattag 827  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  13986011 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattag 13985933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 751 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 17799623 - 17799558
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactt 814  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  17799623 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 17799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 704 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 37214438 - 37214317
Alignment:
Q  704 agggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 800  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||         |||||||||||||| ||||||    
T  37214438 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca---------ttgagtctcttggttacggga 37214348  T
Q  801 agagattgagactttgggtagaattaggcgg 831  Q
    || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  37214347 agcgattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 590777 - 590855
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  590777 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 4812686 - 4812608
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  4812686 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4812608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 28332614 - 28332692
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  28332614 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 33032637 - 33032715
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  33032637 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 751 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 29554984 - 29554908
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaatta 826  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  29554984 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 29554908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 723 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 2267255 - 2267144
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttg-----attcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttt 815  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||     |||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||| ||    
T  2267255 ctcttggcaacaaacactacggttgagattgttttgattcacgttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattaggac-tt 2267157  T
Q  816 gggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||||    
T  2267156 gggtagaattagg 2267144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 751 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 11701155 - 11701102
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttga-gaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 803  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11701155 ttgattcaccttgaagaaacattattagaattgagtctcttggtcacgggaaga 11701102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 417 - 481
Target Start/End: Original strand, 21482125 - 21482189
Alignment:
Q  417 ttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtctaattcggtggccgaatt 481  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||| |  ||||||||||||||    
T  21482125 ttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattgaagttctgatattgtcaacatcggtggccgaatt 21482189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 25684626 - 25684704
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  25684626 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagacagggac-ttgggtagaattagg 25684704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 703 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 35872631 - 35872555
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactatta 776  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35872631 tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 769 - 828
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 751 - 802
Target Start/End: Original strand, 21033853 - 21033906
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21033853 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag 21033906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 703 - 790
Target Start/End: Original strand, 26775288 - 26775378
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt 790  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| || ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  26775288 tagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 766 - 807
Target Start/End: Original strand, 15949534 - 15949575
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 807  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15949534 aaacactattaggatatagtctcttggtcacgggaagagatt 15949575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 751 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 23179760 - 23179692
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgg 817  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  23179760 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg 23179692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 414 - 455
Target Start/End: Original strand, 26774977 - 26775018
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26774977 atgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 26775018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 15186248 - 15186217
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaat 445  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15186248 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaat 15186217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 414 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 30481097 - 30481059
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  30481097 atgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattgaagtt 30481059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 766 - 807
Target Start/End: Original strand, 28228514 - 28228555
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 807  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||    
T  28228514 aaacactattaggatagagactcttggtcacgagaagagatt 28228555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 155)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 703 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 13420428 - 13420241
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13420428 tagggtttgtatagagttttctctaggcaacaaacactagggttgag-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 13420330  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattataatgg 891  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||    
T  13420329 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatgg 13420241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 703 - 886
Target Start/End: Original strand, 25635395 - 25635578
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25635395 tagggtttgtatatagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgggaag 25635494  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattat 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||||||    
T  25635495 agattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcattat 25635578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 613 - 877
Target Start/End: Original strand, 31151265 - 31151531
Alignment:
Q  613 gggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcgggaggcagcac-aaaagtagggt 708  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   | ||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||  | |  || ||  |||| ||||||    
T  31151265 gggatgcttttactataaatatagactttgtatcagatgtaaacctcgagatagagggggctgaaaacaagggtttagaaatcaacaagaaaactagggt 31151364  T
Q  709 ttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31151365 ttgtatagagtttgctcttggcaacaaacaccagggttggggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattg 31151464  T
Q  809 agactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttact 877  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||    
T  31151465 ggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacc--ctgatatctcttttgtaaagttact 31151531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 593 - 887
Target Start/End: Original strand, 23633359 - 23633651
Alignment:
Q  593 atttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga 689  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||   | ||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||  | |    
T  23633359 atttgttccaattttatgaggg-atacttttactataaatatagactttgtatcaga-gtaaaccttgagatagagagggct-aaaacaaggatttagaa 23633455  T
Q  690 ggcagcac-aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctc 788  Q
    | || ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  23633456 gccaacaagaaaactagggtttgtatagtgtttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtctc 23633553  T
Q  789 ttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  23633554 ttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctct-ttgtaaagttactcatcattata 23633651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 703 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 562020 - 561836
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  562020 tagggtttgtatagagttttctcttggcaacaaacactagggttcaggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaag 561921  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  561920 agattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattata 561836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 710 - 890
Target Start/End: Original strand, 17795280 - 17795459
Alignment:
Q  710 tgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 809  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17795280 tgtatagagtttgcttttggcaacaaacactagggttg-ggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattga 17795378  T
Q  810 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattataatg 890  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  17795379 ggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatg 17795459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 710 - 890
Target Start/End: Original strand, 19103720 - 19103899
Alignment:
Q  710 tgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 809  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19103720 tgtatagagtttgcttttggcaacaaacactagggttg-ggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattga 19103818  T
Q  810 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattataatg 890  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  19103819 ggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatg 19103899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 28102255 - 28102065
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28102255 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctattaggattgagtctcttgg 28102156  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28102155 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttacttatcat 28102065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 53917917 - 53917727
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53917917 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 53917818  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  53917817 ttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 53917727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 698 - 863
Target Start/End: Original strand, 23637032 - 23637197
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23637032 aaaactagggtttgtatagagtctgctcttggcaacaaacactagggtttgggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgttcatg 23637131  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23637132 ggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 23637197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 28761681 - 28761488
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggtt-gag-gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 793  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28761681 acaaaactagggtttgtatatagtttgctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 28761582  T
Q  794 cacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
     || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  28761581 tacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 28761488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 697 - 883
Target Start/End: Original strand, 39715474 - 39715663
Alignment:
Q  697 caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 793  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715474 caaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 39715573  T
Q  794 cacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  39715574 tacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 39715663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 1313413 - 1313603
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1313413 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttag 1313512  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  1313513 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 1313603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Original strand, 53597245 - 53597434
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  53597245 aaaactaggggttgtatagagttttctcttggcaacaaacactagggttgaagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatg 53597344  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
     ||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  53597345 agaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattata 53597434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 593 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 4308640 - 4308344
Alignment:
Q  593 atttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga 689  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||| ||||   ||||||| |||| | |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||  | |    
T  4308640 atttgtttcagttttttaagggattactttcactataaatatagaccttgtatcaga-gcaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaa 4308543  T
Q  690 -ggcagca-caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgag 784  Q
     |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4308542 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgag 4308443  T
Q  785 tctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  4308442 tctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 4308344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 38890044 - 38890234
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890044 acaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 38890143  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  38890144 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 38890234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 696 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 53915749 - 53915558
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-ga-ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  53915749 acaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtctcttgg 53915650  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcatt 884  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| ||||||    
T  53915649 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatt 53915558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 43423716 - 43423526
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43423716 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 43423617  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  43423616 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 43423526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 10956280 - 10956090
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttg--aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10956280 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattattaggattgagtctcttgg 10956181  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  10956180 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 10956090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 3314688 - 3314882
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3314688 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 3314787  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | || ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||    
T  3314788 ttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattattcatcattata 3314882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 6561814 - 6561984
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6561814 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 6561913  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  6561914 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctct 6561984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 18097153 - 18096963
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18097153 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 18097054  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||| |||||| |||||    
T  18097053 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgttactcatcat 18096963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 45882943 - 45883133
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45882943 acaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 45883042  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  45883043 ttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 45883133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 698 - 878
Target Start/End: Original strand, 1673981 - 1674161
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1673981 aaaactagtgtttgtatatagtttgctcttggcaacaaacactagggttaggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacg 1674080  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttactt 878  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||    
T  1674081 ggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttactt 1674161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 1626936 - 1626746
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttg--aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1626936 acaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 1626837  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  1626836 ttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 1626746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 18099423 - 18099253
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099423 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 18099324  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18099323 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 18099253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 859
Target Start/End: Original strand, 18162667 - 18162833
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162667 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 18162766  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatat 859  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18162767 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatat 18162833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 25533446 - 25533636
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25533446 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcttttgg 25533545  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  25533546 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 25533636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 43421668 - 43421478
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43421668 acaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttgg 43421569  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  43421568 ttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 43421478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 696 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 10958576 - 10958392
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttg--aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10958576 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 10958477  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttact 877  Q
    | | ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||| ||||||    
T  10958476 ttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttact 10958392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 51727259 - 51727070
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 793  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||  | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727259 acaaaactagggtatgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggt 51727160  T
Q  794 cacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
     |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  51727159 tacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 51727070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 28413285 - 28413114
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattga-gtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28413285 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttg 28413186  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  28413185 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 28413114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 880705 - 880514
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  880705 acaaaactagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagcattgagtctcttg 880606  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || |||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  880605 gttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 880514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321673
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | || |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 1321673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 3859532 - 3859702
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3859532 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 3859631  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  3859632 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctct 3859702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 9604860 - 9604670
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| | || |||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604860 acaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 9604761  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  9604760 ttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 9604670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 27101434 - 27101264
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101434 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 27101335  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | || |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27101334 ttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 27101264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 455911 - 456082
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  455911 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 456010  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  456011 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 456082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 458288 - 458459
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  458288 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 458387  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  458388 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 458459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 746761 - 746932
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  746761 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 746860  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  746861 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 746932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 6066049 - 6065878
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6066049 acaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 6065950  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6065949 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 6065878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 10621783 - 10621612
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10621783 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 10621684  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10621683 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10621612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 696 - 849
Target Start/End: Original strand, 24979711 - 24979867
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24979711 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttgg 24979810  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 849  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24979811 ttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 24979867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 38210374 - 38210545
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38210374 acaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 38210473  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  38210474 gttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctct 38210545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 706 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 53468699 - 53468515
Alignment:
Q  706 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  53468699 ggtttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggttacggggag 53468600  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  53468599 agattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 53468515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 4104148 - 4103978
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4104148 acaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 4104049  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4104048 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 4103978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 5191657 - 5191827
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5191657 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 5191756  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  5191757 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctct 5191827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 698 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 12268216 - 12268061
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 793  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268216 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactattaggattgagtctcttggt 12268117  T
Q  794 cacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 849  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268116 tacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 12268061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 22114558 - 22114368
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114558 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 22114459  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  22114458 ttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 22114368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 43228295 - 43228485
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228295 acaaaactagcgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 43228394  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  43228395 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 43228485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 5927017 - 5926827
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5927017 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 5926918  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| | |||| |||||| |||||    
T  5926917 ttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggttactcatcat 5926827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 11170408 - 11170598
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11170408 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttgg 11170507  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  11170508 ttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 11170598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 30005845 - 30006035
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30005845 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttgg 30005944  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  30005945 ttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 30006035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 849
Target Start/End: Original strand, 35777425 - 35777582
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35777425 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 35777524  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 849  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35777525 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 35777582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 42990308 - 42990498
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaag-gttga-ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42990308 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 42990407  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  42990408 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 42990498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 6063699 - 6063528
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6063699 acaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 6063600  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6063599 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 6063528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 25388910 - 25389080
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  25388910 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttg-gaaacactattaggattggagtctcttg 25389008  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  25389009 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctct 25389080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 707 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 32264281 - 32264097
Alignment:
Q  707 gtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 803  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  32264281 gtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaaga 32264182  T
Q  804 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctc-tctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  32264181 ggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagttactcatcattata 32264097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 707 - 883
Target Start/End: Original strand, 43226100 - 43226279
Alignment:
Q  707 gtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 803  Q
    |||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43226100 gtttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaga 43226199  T
Q  804 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  43226200 ggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 43226279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 50494003 - 50494174
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  50494003 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 50494102  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  50494103 gttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 50494174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 10084642 - 10084452
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10084642 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttgg 10084543  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  10084542 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgttactcatcat 10084452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 47149148 - 47148978
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-ga-ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  | || || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47149148 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttg-gaaacactattatgattgagtctcttg 47149050  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47149049 gttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 47148978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 703 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 890019 - 889836
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-ga-ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgg 798  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  890019 tagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgg 889920  T
Q  799 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  889919 gaagag-ttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagttactcatcat 889836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 749 - 885
Target Start/End: Original strand, 6231861 - 6231996
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6231861 ggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 6231959  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcatta 885  Q
    || |||||||||||| | |||||| |||| |||||||    
T  6231960 cccattgatatctcttttgtaaagctactcatcatta 6231996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 706 - 883
Target Start/End: Original strand, 36011841 - 36012021
Alignment:
Q  706 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  36011841 ggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattaggattgaatatcttggttacgggaag 36011940  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  36011941 agattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 36012021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 844
Target Start/End: Complemental strand, 28100294 - 28100143
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28100294 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctattaggattgagtcttttgg 28100195  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 844  Q
    | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100194 ttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 749 - 883
Target Start/End: Original strand, 6484420 - 6484554
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6484420 ggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaa 6484519  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || |||||||||| | | ||||||||||| |||||    
T  6484520 cccattgatatcttttttgtaaagttactcatcat 6484554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 707 - 887
Target Start/End: Original strand, 15780886 - 15781073
Alignment:
Q  707 gtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 803  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  15780886 gtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaaga 15780985  T
Q  804 gattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgata----tctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    ||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  15780986 ggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttctcttttgtaaagttatttatcattata 15781073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 25688358 - 25688244
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688358 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 25688259  T
Q  849 cctattgatatctct 863  Q
    || ||||||||||||    
T  25688258 cccattgatatctct 25688244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 29956690 - 29956880
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaag-gttga-ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| || |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29956690 acaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttgg 29956789  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  29956790 ttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 29956880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 749 - 887
Target Start/End: Original strand, 4666574 - 4666714
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgt 846  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4666574 ggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgt 4666673  T
Q  847 aacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || | |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  4666674 aatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 4666714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 5522823 - 5522709
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5522823 ggttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5522724  T
Q  849 cctattgatatctct 863  Q
    || |||||| |||||    
T  5522723 cccattgatttctct 5522709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 698 - 796
Target Start/End: Original strand, 24177285 - 24177383
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcac 796  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24177285 aaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttggggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcac 24177383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 36871550 - 36871361
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  | |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  36871550 aaaactagggcttgtatagagtttgctcttggcaacaaacaccagggttaggattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacg 36871451  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||  ||| ||||||| | ||||||||| | |||||||||    
T  36871450 gaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctct-ttgtaaagttaatcatcattata 36871361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 48361924 - 48361754
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  48361924 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggattgagtctcttag 48361825  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||    
T  48361824 ttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctct 48361754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 749 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 51674963 - 51674829
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51674963 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaa 51674864  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
     | |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  51674863 tccattgatatctcttttgtaatgttactcatcat 51674829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 51943375 - 51943564
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51943375 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 51943474  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||| | |||| |||||| |||||    
T  51943475 ttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgttactcatcat 51943564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 749 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 7606784 - 7606684
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7606784 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 7606685  T
Q  849 c 849  Q
    |    
T  7606684 c 7606684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 750 - 857
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886367
Alignment:
Q  750 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 849  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttg-gaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  850 ctattgat 857  Q
    | ||||||    
T  5886360 ccattgat 5886367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 721 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 14634667 - 14634505
Alignment:
Q  721 tgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggta 820  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14634667 tgctcttggcaacaaacactg-ggttgagattgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggta 14634569  T
Q  821 gaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||   | ||||| |||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  14634568 gcattaggtttgaagactgattcttgtaaacctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 14634505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 714 - 861
Target Start/End: Original strand, 32219106 - 32219256
Alignment:
Q  714 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttg--aggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 810  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  32219106 tagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattggg 32219205  T
Q  811 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  32219206 actttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatct 32219256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 696 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 54691827 - 54691644
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||    
T  54691827 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaattttttgg 54691728  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttac 876  Q
    | | |||||||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| | |||| |||||    
T  54691727 ttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttac 54691644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 753 - 883
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168295
Alignment:
Q  753 gattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccta 852  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  853 ttgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||||| ||||| | |||| ||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcat 11168295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 750 - 863
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899846
Alignment:
Q  750 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 849  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttg-gaaacactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  850 ctattgatatctct 863  Q
    | |||||| |||||    
T  5899833 ccattgatttctct 5899846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 10191562 - 10191373
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10191562 acaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatcgagtctcttgg 10191463  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | || |||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || || ||||| | |||| |||||| |||||    
T  10191462 ttacaggaagaggctg-gactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgttactcatcat 10191373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 749 - 887
Target Start/End: Original strand, 54884215 - 54884352
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  54884215 ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaa 54884313  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
     |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  54884314 tctattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 54884352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 415 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 562248 - 562164
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtctaattcggtggccgaattggatagctcagtggccga 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  562248 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgatgctgtctaattcggtggcccaattggatagctcggtggccga 562164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 698 - 825
Target Start/End: Original strand, 13419890 - 13420015
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13419890 aaaactagggtttgta--gagtttgctcttggcaacaaacactagggttgggattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtctcttggtcacg 13419987  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaatt 825  Q
    | |||||||| | | |||||||||||||    
T  13419988 gaaagagattcaaattttgggtagaatt 13420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 696 - 849
Target Start/End: Original strand, 28181026 - 28181182
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||  | || |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28181026 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccattaggattgagtctattgg 28181125  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 849  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181126 ttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 749 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 35918140 - 35918012
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  35918140 ggttgattcaccttgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaa 35918041  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttact 877  Q
    || |||||| ||||| | |||| ||||||    
T  35918040 cccattgatttctcttttgtaacgttact 35918012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 26720552 - 26720721
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||| ||||||    
T  26720552 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actattaggattgagtttcttgg 26720650  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||    
T  26720651 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctct 26720721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 767 - 887
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3306959
Alignment:
Q  767 aacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctc 866  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |     
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  867 gtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcattata 3306959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 703 - 797
Target Start/End: Original strand, 25633934 - 25634028
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25633934 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactagggctgggattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggtcacg 25634028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 714 - 837
Target Start/End: Complemental strand, 28137541 - 28137415
Alignment:
Q  714 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 810  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  28137541 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggg 28137442  T
Q  811 actttgggtagaattaggcgggagact 837  Q
     |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137441 gctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 749 - 883
Target Start/End: Original strand, 53591244 - 53591378
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53591244 ggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaa 53591343  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
     | |||||||||||  | |||| |||||| |||||    
T  53591344 tccattgatatctcatttgtaacgttactcatcat 53591378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 696 - 821
Target Start/End: Original strand, 42992290 - 42992417
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42992290 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 42992389  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtag 821  Q
    | | ||||||||| || ||||||||||||    
T  42992390 ttatgggaagagagtg-gactttgggtag 42992417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 792 - 887
Target Start/End: Original strand, 24181483 - 24181578
Alignment:
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  24181483 gtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattata 24181578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 736 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 1620672 - 1620580
Alignment:
Q  736 acactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1620672 acactagggttgggattgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 1620580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 414 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 13420728 - 13420643
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtctaattcggtggccgaattggatagctcagtggccga 499  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||  | |||||||||||||    
T  13420728 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgatgctgtcaacgtcggtggccgacttgactggctcagtggccga 13420643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 723 - 828
Target Start/End: Original strand, 7768602 - 7768709
Alignment:
Q  723 ctcttggcaacaaaca--ctaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggta 820  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||  |||||| |||    
T  7768602 ctcttggcaacaaacaaactaaggttgagattgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagta 7768701  T
Q  821 gaattagg 828  Q
    ||||||||    
T  7768702 gaattagg 7768709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 415 - 499
Target Start/End: Original strand, 23633160 - 23633244
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtctaattcggtggccgaattggatagctcagtggccga 499  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  23633160 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattagagttatgatattgtctaattcggtggccgaattgactagctcggtggccga 23633244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 415 - 482
Target Start/End: Original strand, 23636727 - 23636794
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtctaattcggtggccgaattg 482  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  23636727 tgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattggagttccgatgttgtctaattcggtggccgaattg 23636794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 698 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 31021392 - 31021284
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcac 796  Q
    |||| |||||||||||  |||||||| || | |||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31021392 aaaactagggtttgta--gagtttgccctagtcaacaaacactagggttgggattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttgatcac 31021295  T
Q  797 gggaagagatt 807  Q
      |||||||||    
T  31021294 atgaagagatt 31021284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 414 - 499
Target Start/End: Original strand, 25633230 - 25633315
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtctaattcggtggccgaattggatagctcagtggccga 499  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||  | |||| ||||||||    
T  25633230 atgttgtgaaagtgattcaaaattgaagaaattggagttctgatgctgtcaacatcggtggccgaattgactggctcggtggccga 25633315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 696 - 807
Target Start/End: Original strand, 27420658 - 27420768
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcac-cttgagaaacactattaggattgagtctcttggtc 794  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||| |||||||| | | ||||||||||||    
T  27420658 acaaaattagggtttgtagagaattt--tcttggcaacaaacactatggttgggattgattcacgctggagaaatactattagaactcagtctcttggtc 27420755  T
Q  795 acgggaagagatt 807  Q
    |||||||||||||    
T  27420756 acgggaagagatt 27420768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 816 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701734
Alignment:
Q  816 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 47701734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 778 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007633
Alignment:
Q  778 gattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 11007633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 749 - 829
Target Start/End: Complemental strand, 4560481 - 4560401
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggc 829  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  4560481 ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 10094273 - 10094195
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  10094273 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 10201153 - 10201075
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  10201153 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10201075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 16462186 - 16462264
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  16462186 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 22626183 - 22626105
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  22626183 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 696 - 781
Target Start/End: Original strand, 41849156 - 41849244
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggatt 781  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  41849156 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 47883081 - 47883003
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  47883081 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 769 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 456
Target Start/End: Original strand, 25635122 - 25635163
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25635122 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctga 25635163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 804
Target Start/End: Original strand, 6303293 - 6303348
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6303293 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 6303348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 10100290 - 10100235
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100290 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10100235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 10208199 - 10208121
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  10208199 ttgattcaccttgaacaaaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10208121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 804
Target Start/End: Original strand, 27544256 - 27544311
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27544256 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27544311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 29914152 - 29914074
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  29914152 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 29914074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 47878370 - 47878292
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  47878370 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47878292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 54193209 - 54193287
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  54193209 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54193287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 769 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595155
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 10595155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 774 - 828
Target Start/End: Original strand, 13893470 - 13893523
Alignment:
Q  774 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13893470 ttagaattgagtctcttggtcacgggaagagattgagac-ttgggtaaaattagg 13893523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 766 - 828
Target Start/End: Original strand, 16996875 - 16996936
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  16996875 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattagg 16996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 10896988 - 10897066
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  10896988 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10897066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 11073007 - 11073084
Alignment:
Q  751 ttgattcacctt-gagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga-ttgagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  11073007 ttgattcaccttcgagaaacact--tatgattgagtctcttggtcacgagaagagatttgggactttaggtagaattagg 11073084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 20031517 - 20031462
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20031517 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 20031462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 54188492 - 54188570
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  54188492 ttgattcaccttgaacaaagcactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54188570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 832 - 887
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634085
Alignment:
Q  832 gagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 25634085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 812 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 27635792 - 27635721
Alignment:
Q  812 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  27635792 ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 27635721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 696 - 741
Target Start/End: Original strand, 6231453 - 6231499
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta 741  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6231453 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacta 6231499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 770 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 10949438 - 10949404
Alignment:
Q  770 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10949438 actattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10949404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 751 - 826
Target Start/End: Original strand, 38002852 - 38002928
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaatta 826  Q
    ||||||||||||||   |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  38002852 ttgattcaccttgaacaaaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 5858529 - 5858605
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  5858529 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgag--tcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 5858605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 766 - 814
Target Start/End: Original strand, 7418064 - 7418112
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactt 814  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  7418064 aaacaccattatgattgagtctattggtcacgggaagagattgggactt 7418112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Original strand, 7754063 - 7754103
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  7754063 tgttgtgaaagtggctcaaaattgaagaaattggaattctg 7754103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 10612977 - 10612899
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  10612977 ttgattcaccttgaacaaagcactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10612899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 28100598 - 28100558
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28100598 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 28100558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 28137831 - 28137791
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28137831 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 28137791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 43424000 - 43423960
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  43424000 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 43423960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 413 - 452
Target Start/End: Original strand, 3306516 - 3306555
Alignment:
Q  413 aatgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3306516 aatgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattgaagtt 3306555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 766 - 801
Target Start/End: Original strand, 11079517 - 11079552
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaa 801  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11079517 aaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaa 11079552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 576 - 634
Target Start/End: Complemental strand, 1620768 - 1620711
Alignment:
Q  576 gtatttttatgggccaaatttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat 634  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1620768 gtatttttatgggctagatttgttccaattttatga-gggatacttttactataaatat 1620711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 417 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 1627238 - 1627200
Alignment:
Q  417 ttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1627238 ttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 1627200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 774 - 828
Target Start/End: Original strand, 4535622 - 4535675
Alignment:
Q  774 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||  |||||||||||||||    
T  4535622 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattagg 4535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 452
Target Start/End: Original strand, 6231164 - 6231206
Alignment:
Q  410 ataaatgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6231164 ataactgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattgaagtt 6231206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 414 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 8183250 - 8183208
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctga 456  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  8183250 atgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattgaaattctga 8183208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 696 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 27635880 - 27635834
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta 741  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27635880 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacacta 27635834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 415 - 449
Target Start/End: Original strand, 36011527 - 36011561
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattgga 449  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36011527 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattgga 36011561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 415 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 43421971 - 43421937
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattgga 449  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43421971 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattgga 43421937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Original strand, 3314404 - 3314441
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3314404 tgttgtgaaagtgattcaaaattgaagaaattgaagtt 3314441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 47149457 - 47149420
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  47149457 tgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattgaagtt 47149420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 140; Significance: 7e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 698 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 16072 - 15885
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16072 aaaactagggtttgtatagagtttgctcctagcaacaaacactagggttgaggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtctcttggtcacg 15973  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcatta 885  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  15972 ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 15885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 1e-68; HSPs: 95)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 593 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 17897603 - 17897307
Alignment:
Q  593 atttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga 689  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||   ||||||| ||||||||||  ||| | |||||||  |||| ||||||||||  | |    
T  17897603 atttgttccagtttttttgagggatacttttactataaatatagaccttgtatcagatgtaaaacttgaggtagagagt-ctgagaacaagggtttagaa 17897505  T
Q  690 ggcagcac-aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctc 788  Q
    | || ||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17897504 gtcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgctcttcgcaacaaacacta-ggttgagattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctc 17897406  T
Q  789 ttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  17897405 ttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcattata 17897307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 703 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 18800558 - 18800375
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18800558 tagggtttgtatagaggttgctcttggcaacaaacactagggttg-ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag 18800460  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  18800459 agattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattata 18800375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 20146859 - 20146670
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  20146859 aaaactagggtttgtatagagtttgcccttggcaacaaacactatggttgggattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtctcttggtcacg 20146760  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  20146759 ggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 20146670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 703 - 887
Target Start/End: Original strand, 22874141 - 22874324
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22874141 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactatggttg-ggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaag 22874239  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  22874240 agattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 22874324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 696 - 859
Target Start/End: Complemental strand, 15539730 - 15539564
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15539730 acaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttgg 15539631  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatat 859  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15539630 ttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatat 15539564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 11578358 - 11578170
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcac 796  Q
    |||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11578358 aaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaac--tagggttggggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac 11578261  T
Q  797 gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  11578260 gggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 11578170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 648 - 863
Target Start/End: Original strand, 28196588 - 28196807
Alignment:
Q  648 gtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcgggaggcagca-caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggt 745  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||  |||| || |  ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  28196588 gtaaacattgagatagagggggctgaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggt 28196687  T
Q  746 tga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattct 843  Q
    | |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28196688 ttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattct 28196787  T
Q  844 tgtaacctattgatatctct 863  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  28196788 tgtaacccattgatatctct 28196807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 17849117 - 17849311
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgc-tcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||| |||| | || |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17849117 acaaaactagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaagattgagtctcttgg 17849216  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  17849217 ttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 17849311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 696 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 42923764 - 42923580
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  42923764 acaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 42923665  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttact 877  Q
    | | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||    
T  42923664 ttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttact 42923580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 696 - 886
Target Start/End: Original strand, 3022163 - 3022355
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3022163 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttgg 3022262  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattat 886  Q
    | || |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  3022263 ttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctct-ttataaagttactcatcattat 3022355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 615 - 866
Target Start/End: Complemental strand, 40032397 - 40032140
Alignment:
Q  615 gatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga-ggcagca-caaaagtagggtt 709  Q
    ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||  | | |||| || ||||| |||||||    
T  40032397 gatacttttactataaatatagaccttgtatcaga-gtaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtt 40032300  T
Q  710 tgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagat 806  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  40032299 tgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggt 40032200  T
Q  807 tgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctc 866  Q
    |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40032199 taggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctc 40032140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 13910299 - 13910129
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13910299 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttgg 13910200  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13910199 ttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 13910129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 19007640 - 19007830
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  19007640 acaaaattatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtttcttgg 19007739  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  19007740 ttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 19007830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 19502266 - 19502096
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19502266 acaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 19502167  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19502166 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 19502096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 42064515 - 42064685
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42064515 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 42064614  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  42064615 ttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 42064685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Original strand, 35107301 - 35107488
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacg 797  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35107301 aaaactagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacag---ggttgggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtctcttggtcacg 35107397  T
Q  798 ggaagagattgagactttgggtagaattag--gcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||     | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  35107398 ggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaacct-ttgttatctcttttgtaatgttactcatcattata 35107488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 45239231 - 45239042
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttgctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45239231 acaaaactagggtttgtatagacttt-ctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 45239133  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  45239132 ttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 45239042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 45280239 - 45280049
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| | || |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  45280239 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtctcttgg 45280140  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  45280139 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 45280049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 23452492 - 23452322
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452492 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 23452393  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | ||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23452392 ttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23452322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 749 - 883
Target Start/End: Original strand, 42452837 - 42452971
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452837 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 42452936  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  42452937 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 42452971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 714 - 887
Target Start/End: Original strand, 43139395 - 43139568
Alignment:
Q  714 tagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 813  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43139395 tagagtttgctcttggcaacaaacactagggttgagattgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagact 43139494  T
Q  814 ttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || |||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  43139495 ttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctct-ttgtaaagttactcatcattata 43139568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 6259068 - 6258878
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtc 794  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || | || |||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  6259068 aaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtt 6258969  T
Q  795 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||  ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    
T  6258968 acgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcattattata 6258878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 17848443 - 17848630
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17848443 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactattaggattgagtctcttg 17848542  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  17848543 gttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaacc-attgatatctcttttgtaacgttactcatcat 17848630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 618 - 863
Target Start/End: Original strand, 27104718 - 27104968
Alignment:
Q  618 acttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctgaaaacaagggttcggga-ggcagca-caaaagtagggtttgt 712  Q
    |||||||||||| ||||   ||||||| |||| | |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | | |||| || ||||| ||||||||||    
T  27104718 acttttactataaatatagaccttgtatcaga-gaaaactttgagatagagggggctgaaa-caagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 27104815  T
Q  713 atagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga 809  Q
    |||||||||| ||||| | |||||| |||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||     
T  27104816 atagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgg 27104914  T
Q  810 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  27104915 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 27104968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 706 - 877
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136196
Alignment:
Q  706 ggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga 805  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  27136368 ggtttatatagagcttgctcttggcaacaaacactagggttggggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaagaaa 27136269  T
Q  806 ttgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttact 877  Q
    ||| ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  27136268 ttgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttact 27136196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 698 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 34979832 - 34979640
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtc 794  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||     
T  34979832 aaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtt 34979733  T
Q  795 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| | |||| ||| || |||||||||    
T  34979732 acgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcctcatcattata 34979640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 704 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 6264396 - 6264210
Alignment:
Q  704 agggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacggga 800  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |    
T  6264396 agggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggttacgata 6264297  T
Q  801 agagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  6264296 aaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 6264210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 21520948 - 21520758
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21520948 acaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttgg 21520849  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | || |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  21520848 ttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 21520758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 749 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 43623779 - 43623645
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623779 ggttgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 43623680  T
Q  849 cctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    || |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  43623679 cccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 43623645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 44289323 - 44289129
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  44289323 acaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtcacttgg 44289224  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||  ||||| |||||||||    
T  44289223 ttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaagattactcatcattata 44289129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 572 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 31733146 - 31732839
Alignment:
Q  572 aaacgtatttttatgggccaaatttg-ttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagag 667  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| | ||||| || ||||||||||| ||||   | ||||| |||| |||||||||| ||||||| |    
T  31733146 aaacgtatttttatgggcctgatttggttccaatttat-gaggg-atgcttttactataaatatagactttgtaacaga-gtaaacattgagatagaggg 31733050  T
Q  668 ggctgaaaacaagggttcggga-ggcagca-caaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcacctt 762  Q
    |||||||| ||||||||  | | |||| || ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  31733049 ggctgaaa-caagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgtt 31732951  T
Q  763 gagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctc 862  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||            ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31732950 gggaaacactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctc 31732863  T
Q  863 tctcgtaaagttacttatcattat 886  Q
    | | ||||||||||| ||||||||    
T  31732862 ttttgtaaagttactcatcattat 31732839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 19504600 - 19504431
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| | ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504600 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 19504501  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  19504500 ttacgg-aagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 19504431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 11739815 - 11739621
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11739815 acaaaattagggtttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgattctcttgg 11739716  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||| | | || |||||| |||||||||    
T  11739715 ttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggttactcatcattata 11739621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 22287591 - 22287401
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| | |||||||| || |||| |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |    
T  22287591 acaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtattaggattgagtctcttag 22287492  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  22287491 ttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgttactcatcat 22287401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 35215841 - 35215670
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35215841 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 35215742  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  35215741 gttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctct 35215670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 35218218 - 35218047
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35218218 acaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 35218119  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  35218118 gttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctct 35218047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 14837273 - 14837461
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14837273 acaaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 14837372  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
          |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | |||| |||||| |||||||||    
T  14837373 ------gaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcattata 14837461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 706 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459251
Alignment:
Q  706 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gaggttg-attcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| | || |||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    || ||| | |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattata 28459251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 749 - 887
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699568
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 847  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  848 acctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | |  ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 40699568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 5375544 - 5375431
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5375544 ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttattcttgtaa 5375446  T
Q  849 cctattgatatctct 863  Q
    || ||||||||||||    
T  5375445 cccattgatatctct 5375431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 766 - 887
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589885
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctc 864  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  20589763 aaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctctt 20589862  T
Q  865 tcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | || |||||||| |||||||||    
T  20589863 ttgtgaagttactcatcattata 20589885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 764 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 36559048 - 36558948
Alignment:
Q  764 agaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctc 862  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36559048 agaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 36558949  T
Q  863 t 863  Q
    |    
T  36558948 t 36558948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 764 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 36561325 - 36561225
Alignment:
Q  764 agaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctc 862  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  36561325 agaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 36561226  T
Q  863 t 863  Q
    |    
T  36561225 t 36561225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 45332366 - 45332265
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||    
T  45332366 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttct 45332267  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  45332266 ct 45332265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 714 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 27583573 - 27583477
Alignment:
Q  714 tagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 810  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27583573 tagagttttctcttggcaacgaacactaaggttgggagtgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgag 27583477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 714 - 826
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028707
Alignment:
Q  714 tagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagact 813  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  35028595 tagagtttgctcttggtaacaaacactagggttgagattgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgacact 35028694  T
Q  814 ttgggtagaatta 826  Q
    |||||||||||||    
T  35028695 ttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 37963304 - 37963030
Alignment:
Q  576 gtatttttatgggccaaatttgttccagttttttgaggggatacttttactatagatat---ccttgtagcagatgtaaacattgggatagagagggctg 672  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || |||||||||||||| ||||   | |||||  ||| |||||| ||| ||||||| ||||||    
T  37963304 gtatttttatgggccagatttgttccaattttatgatgg-atacttttactataaatatagactttgtataaga-gtaaaccttgagatagagggggctg 37963207  T
Q  673 aaaacaagggttcgggaggcagcacaaaagtagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacact 772  Q
    ||| ||||||||  | |  ||      || |||||||||| || |||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||||| ||||   ||||| |    
T  37963206 aaa-caagggtttagaaatca------aactagggtttgtgtatagtttgctcttgacaacaaacaccatggttgtg-ttgattccccttagaaaacatt 37963115  T
Q  773 attaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgat 857  Q
    |||  |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||    
T  37963114 attgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgat 37963030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 745 - 835
Target Start/End: Complemental strand, 38414283 - 38414194
Alignment:
Q  745 ttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaga 835  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38414283 ttgaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 24162467 - 24162307
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  24162467 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttgg 24162368  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    |  |          || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  24162367 ttgc----------tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 24162307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 750 - 884
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694095
Alignment:
Q  750 gttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga-ttgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 846  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  847 aacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcatt 884  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcatt 15694095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 750 - 826
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  750 gttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 826  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 28459028 - 28458949
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  28459028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttga-gaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 696 - 851
Target Start/End: Original strand, 38020202 - 38020350
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  38020202 acaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccatggtaaacactattaggattgagtctcttgg 38020301  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacct 851  Q
    |   |||          | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38020302 tattggg----------ggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacct 38020350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 751 - 826
Target Start/End: Original strand, 7502975 - 7503052
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaga-ttgagactttgggtagaatta 826  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7502975 ttgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 766 - 828
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741002
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  2740941 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 755 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 10942707 - 10942634
Alignment:
Q  755 ttcaccttga-gaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 826  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10942707 ttcaccttgaagaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 755 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 10948576 - 10948503
Alignment:
Q  755 ttcaccttga-gaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 826  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10948576 ttcaccttgaagaaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 810 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 22407592 - 22407519
Alignment:
Q  810 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  22407592 gacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 22407519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 17462419 - 17462497
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  17462419 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 20054964 - 20054886
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  20054964 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 22712715 - 22712637
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  22712715 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 22717424 - 22717346
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  22717424 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 887
Target Start/End: Original strand, 33603977 - 33604115
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 847  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||   | ||||| |||||| ||    
T  33603977 ttgattcaccttgaacaaaacactattataattgagtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttcta 33604076  T
Q  848 acctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  33604077 accttttgatatatct-ttgtaaagttactcatcattata 33604115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 39680028 - 39680106
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  39680028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 39680106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 39686966 - 39687044
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  39686966 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 39687044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 45567392 - 45567470
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  45567392 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 30720811 - 30720732
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  30720811 ttgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattagg 30720732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttg-agaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 766 - 828
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736266
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||    
T  2736205 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 2736266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 17932617 - 17932695
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  17932617 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 17943520 - 17943598
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  17943520 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17943598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 27517838 - 27517760
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  27517838 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 27517760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 30478977 - 30479055
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  30478977 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 30479055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 769 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 789 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 13828503 - 13828404
Alignment:
Q  789 ttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaatta-ggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |   | ||||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| ||||| || ||||||    
T  13828503 ttggtcacgggaagagattcagactttgggtagaattatgtttgaagacttattcttgtagccctttgatatctcttttgtaaaattactcataattata 13828404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 775 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 27248075 - 27248021
Alignment:
Q  775 taggattgagtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  27248075 taggattgagtctcttggtcacgggaagagatccaggactttgggtagaattagg 27248021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 20050221 - 20050166
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20050221 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagag 20050166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 804
Target Start/End: Original strand, 38190980 - 38191035
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 804  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38190980 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagag 38191035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 763 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 41303219 - 41303155
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaatta 826  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  41303219 gagaaaaattattaggattaagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaatta 41303155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 412 - 455
Target Start/End: Original strand, 3021836 - 3021879
Alignment:
Q  412 aaatgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3021836 aaatgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 3021879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 413 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 11740080 - 11740037
Alignment:
Q  413 aatgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctga 456  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11740080 aatgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctga 11740037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 769 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 703 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 22163195 - 22163106
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctctt 790  Q
    |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  22163195 tagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 829 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707818
Alignment:
Q  829 cgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 22707818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 751 - 802
Target Start/End: Complemental strand, 33674604 - 33674551
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33674604 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 33674551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 819 - 876
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7463020
Alignment:
Q  819 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttac 876  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||| |||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttac 7463020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 766 - 826
Target Start/End: Original strand, 45158308 - 45158369
Alignment:
Q  766 aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattga-gactttgggtagaatta 826  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  45158308 aaacactgttaggatatagtctcttggtcacgggaagagattcaggactttgagtagaatta 45158369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 15540035 - 15539995
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15540035 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 15539995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 22163485 - 22163445
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  22163485 tgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattggaattctg 22163445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 696 - 763
Target Start/End: Complemental strand, 22407664 - 22407594
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagg-ttga-ggttgattcaccttg 763  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  22407664 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttg 22407594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 414 - 455
Target Start/End: Original strand, 14836970 - 14837011
Alignment:
Q  414 atgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctg 455  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  14836970 atgttgtgaaagtgcctcaaaattgaagaaattagaattctg 14837011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 31733284 - 31733247
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31733284 tgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattgaagtt 31733247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 38414567 - 38414530
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38414567 tgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattgaagtt 38414530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 45239500 - 45239463
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagtt 452  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  45239500 tgttgtgaaagtgactcaaaattggagaaattgaagtt 45239463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 730 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 1861 - 1704
Alignment:
Q  730 caacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggc 829  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1861 caacaaacactagggttgtggttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 1762  T
Q  830 gggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  1761 gggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 1704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 111; Significance: 1e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 14637 - 14447
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14637 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttgg 14538  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||| |||||    
T  14537 ttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcat 14447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 15052 - 15242
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacacta-aggttgagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15052 acaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 15151  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  15152 ttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 795
Target Start/End: Original strand, 31124 - 31170
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtca 795  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31124 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtca 31170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 108; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 79218 - 79408
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  79218 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 79317  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  79318 ttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 79408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 887
Target Start/End: Original strand, 85263 - 85457
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  85263 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggattgagtcttttgg 85362  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    | ||| |||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  85363 ttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttcgtaaagttactcatcattata 85457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 107; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 69546 - 69376
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  69546 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 69447  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  69446 ttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 69376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 103; Significance: 9e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 183895 - 183706
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  183895 acaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 183796  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  183795 ttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcat 183706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 52044 - 52234
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52044 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 52143  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  52144 ttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 52234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 11728 - 11538
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| |||| |||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11728 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 11629  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  11628 ttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 11538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 74 - 245
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttg 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  74 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttg 173  T
Q  792 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  174 gttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctct 245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 96; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 41738 - 41548
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41738 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 41639  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | ||||||||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| |||||| |||||    
T  41638 ttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 41548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 95; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 698 - 863
Target Start/End: Original strand, 6234 - 6403
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattga-gtctcttggt 793  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6234 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtctcttggt 6333  T
Q  794 cacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  6334 tacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctct 6403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 95; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 696 - 883
Target Start/End: Original strand, 4030 - 4219
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | ||| ||||||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4030 acaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 4128  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
    | |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  4129 ttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 4219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 703 - 887
Target Start/End: Original strand, 4853 - 5038
Alignment:
Q  703 tagggtttgtatagagtttgctcttggcaacaaacactaaggttgaggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 802  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  4853 tagggtttatatagcgttttctctcagcaacaaacactagagttgagtttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaag 4952  T
Q  803 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctc-tctcgtaaagttacttatcattata 887  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||||| |||| |||||||||    
T  4953 agattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctttttgtaaagatactcatcattata 5038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 88; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 2913 - 3083
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2913 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 3012  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | | ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3013 ttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Complemental strand, 1651 - 1537
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1651 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 1552  T
Q  849 cctattgatatctct 863  Q
    || |||||| |||||    
T  1551 cccattgatttctct 1537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 696 - 863
Target Start/End: Original strand, 29204 - 29374
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttga--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29204 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactattaggattgagtctcttgg 29303  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctct 863  Q
    | |||||||||| ||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  29304 ttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctct 29374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 78; Significance: 7e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 698 - 883
Target Start/End: Original strand, 79894 - 80082
Alignment:
Q  698 aaaagtagggtttgtatagagtttg-ctctt-ggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggt 793  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  79894 aaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggt 79993  T
Q  794 cacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctctcgtaaagttacttatcat 883  Q
     |||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||| | |||| |||||| |||||    
T  79994 tacgggaagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcat 80082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Complemental strand, 188441 - 188363
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  188441 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 696 - 840
Target Start/End: Original strand, 35672 - 35819
Alignment:
Q  696 acaaaagtagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt-gagg-ttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttgg 792  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35672 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactattaggattaagtctcttgg 35771  T
Q  793 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttat 840  Q
    | ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35772 ttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 749 - 863
Target Start/End: Original strand, 2130 - 2244
Alignment:
Q  749 ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 848  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2130 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaa 2229  T
Q  849 cctattgatatctct 863  Q
    || ||| || |||||    
T  2230 cccattaatttctct 2244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Original strand, 22219 - 22319
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  22219 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttct 22317  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  22318 ct 22319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 763 - 863
Target Start/End: Original strand, 24494 - 24594
Alignment:
Q  763 gagaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatct 861  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||    
T  24494 gagaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttct 24592  T
Q  862 ct 863  Q
    ||    
T  24593 ct 24594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0964 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0964
Description:

Target: scaffold0964; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 415 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 1308 - 1228
Alignment:
Q  415 tgttgtgaaagtgactcaaaattgaagaaattggagttctgacgctgtctaattcggtggccgaattggatagctcagtggccga 499  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    || |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1308 tgttgtgaaagtgactcaaaattgtagaaattggag----gatgctgtcaatttcggtggccgaattggatagctcggtggccga 1228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 224802 - 224880
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgag--aaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  224802 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 751 - 828
Target Start/End: Original strand, 16308 - 16386
Alignment:
Q  751 ttgattcaccttgagaaa--cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 828  Q
    ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  16308 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 754 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 57626 - 57486
Alignment:
Q  754 attcaccttgagaaa-cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gagactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacc 850  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||||||   | |||  |||||||||||||    
T  57626 attcaccttgaaaaaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaacc 57527  T
Q  851 tattgatatctctctcgtaaagttacttatcattataatgg 891  Q
      ||||||||| | | ||||||||||| || | ||||||||    
T  57526 ctttgatatctattttgtaaagttactcattaatataatgg 57486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 769 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 17131
Alignment:
Q  769 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 803  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaaga 17131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University