View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5367_high_6 (Length: 391)

Name: NF5367_high_6
Description: NF5367
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5367_high_6
NF5367_high_6
[»] chr2 (84 HSPs)
chr2 (20-367)||(11677176-11677523)
chr2 (23-367)||(24640996-24641340)
chr2 (30-365)||(21147332-21147664)
chr2 (38-369)||(24502844-24503169)
chr2 (30-367)||(30971020-30971360)
chr2 (33-367)||(37318005-37318339)
chr2 (33-367)||(13970410-13970746)
chr2 (33-367)||(24714441-24714777)
chr2 (33-367)||(41610670-41611006)
chr2 (33-367)||(45057466-45057802)
chr2 (33-367)||(41604773-41605109)
chr2 (108-343)||(12828840-12829074)
chr2 (108-343)||(24914069-24914303)
chr2 (108-368)||(23170781-23171040)
chr2 (108-368)||(23582038-23582297)
chr2 (110-368)||(29233273-29233530)
chr2 (110-368)||(29346572-29346829)
chr2 (110-343)||(27599032-27599264)
chr2 (110-343)||(1842851-1843083)
chr2 (108-343)||(22321089-22321323)
chr2 (108-343)||(22327242-22327476)
chr2 (108-343)||(16928124-16928358)
chr2 (108-343)||(16996818-16997052)
chr2 (108-343)||(17003451-17003685)
chr2 (156-368)||(27369033-27369245)
chr2 (156-368)||(44381364-44381576)
chr2 (108-343)||(27617066-27617299)
chr2 (158-343)||(10873306-10873490)
chr2 (156-368)||(27375543-27375755)
chr2 (185-343)||(10865941-10866098)
chr2 (156-368)||(44388034-44388246)
chr2 (156-343)||(9340030-9340216)
chr2 (156-343)||(9488664-9488850)
chr2 (156-343)||(9607925-9608111)
chr2 (156-343)||(16922279-16922465)
chr2 (156-343)||(19490097-19490283)
chr2 (156-343)||(27215813-27215999)
chr2 (156-343)||(28432085-28432271)
chr2 (169-343)||(13306775-13306948)
chr2 (169-343)||(16985691-16985864)
chr2 (108-343)||(26877671-26877904)
chr2 (217-367)||(24880494-24880645)
chr2 (30-240)||(24872448-24872660)
chr2 (217-367)||(24872609-24872760)
chr2 (114-314)||(30345381-30345574)
chr2 (32-314)||(24628749-24629037)
chr2 (30-240)||(24880333-24880545)
chr2 (217-369)||(27195478-27195629)
chr2 (32-314)||(12901782-12902074)
chr2 (32-314)||(24648903-24649193)
chr2 (23-171)||(27196809-27196957)
chr2 (32-314)||(27379702-27379990)
chr2 (32-314)||(27383748-27384036)
chr2 (32-314)||(27601340-27601632)
chr2 (104-314)||(10101998-10102211)
chr2 (157-314)||(31344685-31344834)
chr2 (114-341)||(60598-60817)
chr2 (114-340)||(18855564-18855782)
chr2 (166-314)||(19928659-19928799)
chr2 (136-340)||(23186858-23187053)
chr2 (166-340)||(23598121-23598287)
chr2 (168-312)||(41666759-41666896)
chr2 (240-314)||(1282936-1283010)
chr2 (156-337)||(24735177-24735351)
chr2 (240-314)||(41531489-41531563)
chr2 (168-314)||(22461349-22461485)
chr2 (166-235)||(27195584-27195653)
chr2 (212-340)||(26124966-26125090)
chr2 (278-359)||(30657567-30657648)
chr2 (168-267)||(26125063-26125155)
chr2 (114-238)||(1282984-1283105)
chr2 (114-238)||(41531394-41531515)
chr2 (30-108)||(21139314-21139392)
chr2 (30-92)||(10101911-10101973)
chr2 (49-148)||(24174760-24174859)
chr2 (285-337)||(19691914-19691967)
chr2 (57-148)||(24655404-24655495)
chr2 (49-148)||(24869840-24869939)
chr2 (268-314)||(22134501-22134547)
chr2 (158-218)||(10866263-10866323)
chr2 (293-340)||(21327890-21327938)
chr2 (293-340)||(23020029-23020077)
chr2 (293-340)||(24673312-24673360)
chr2 (293-340)||(24679929-24679977)
[»] chr6 (106 HSPs)
chr6 (23-369)||(25928022-25928368)
chr6 (23-369)||(19808253-19808599)
chr6 (23-367)||(22758580-22758923)
chr6 (23-367)||(34370007-34370351)
chr6 (38-369)||(34298670-34298995)
chr6 (38-365)||(34832385-34832713)
chr6 (33-367)||(4167652-4167990)
chr6 (33-367)||(4208332-4208670)
chr6 (33-367)||(3708524-3708858)
chr6 (33-325)||(17037375-17037666)
chr6 (86-367)||(24291143-24291422)
chr6 (86-367)||(31317183-31317462)
chr6 (33-343)||(1545085-1545394)
chr6 (86-367)||(24315171-24315450)
chr6 (49-367)||(25117173-25117491)
chr6 (33-343)||(1538986-1539295)
chr6 (49-367)||(25110570-25110888)
chr6 (110-343)||(26130236-26130468)
chr6 (108-343)||(2870239-2870473)
chr6 (108-343)||(2876854-2877088)
chr6 (110-343)||(30694131-30694363)
chr6 (108-368)||(27328160-27328419)
chr6 (108-368)||(27388900-27389159)
chr6 (108-343)||(8796960-8797194)
chr6 (104-367)||(20176669-20176934)
chr6 (104-367)||(5834598-5834863)
chr6 (104-367)||(22159057-22159322)
chr6 (156-368)||(16552183-16552395)
chr6 (156-368)||(16576558-16576770)
chr6 (156-368)||(16618610-16618822)
chr6 (156-368)||(16628739-16628951)
chr6 (156-368)||(17017085-17017297)
chr6 (156-368)||(32565405-32565617)
chr6 (108-368)||(27430387-27430646)
chr6 (108-343)||(6980429-6980662)
chr6 (108-343)||(20060418-20060652)
chr6 (108-343)||(20649895-20650128)
chr6 (156-343)||(28314322-28314508)
chr6 (156-343)||(27185461-27185647)
chr6 (156-343)||(27207297-27207483)
chr6 (156-343)||(27241745-27241931)
chr6 (156-343)||(27263593-27263779)
chr6 (156-343)||(28287124-28287310)
chr6 (111-343)||(12762472-12762702)
chr6 (108-368)||(20801501-20801759)
chr6 (169-341)||(30596997-30597168)
chr6 (156-343)||(8228635-8228821)
chr6 (156-343)||(18930824-18931010)
chr6 (156-343)||(28258606-28258792)
chr6 (156-343)||(28265230-28265416)
chr6 (156-343)||(28337355-28337541)
chr6 (156-343)||(28343979-28344165)
chr6 (156-343)||(29587852-29588038)
chr6 (156-343)||(29593993-29594179)
chr6 (169-343)||(30638315-30638488)
chr6 (190-360)||(14098337-14098507)
chr6 (32-314)||(11566410-11566698)
chr6 (32-314)||(12619112-12619400)
chr6 (33-267)||(14098457-14098691)
chr6 (32-314)||(19870138-19870426)
chr6 (32-314)||(23394616-23394904)
chr6 (32-314)||(23989468-23989756)
chr6 (114-314)||(16759817-16760011)
chr6 (114-314)||(22948631-22948824)
chr6 (114-314)||(22952587-22952780)
chr6 (114-314)||(23414453-23414646)
chr6 (114-314)||(23871075-23871268)
chr6 (114-314)||(23875031-23875224)
chr6 (33-210)||(25595394-25595572)
chr6 (168-340)||(25135830-25135996)
chr6 (136-341)||(1587859-1588056)
chr6 (114-314)||(27416292-27416484)
chr6 (114-314)||(5616920-5617113)
chr6 (32-314)||(22862494-22862782)
chr6 (104-314)||(8243381-8243594)
chr6 (239-343)||(4233705-4233809)
chr6 (157-314)||(27556211-27556360)
chr6 (242-343)||(14053795-14053896)
chr6 (166-314)||(20803711-20803852)
chr6 (166-312)||(9482450-9482588)
chr6 (166-314)||(12496117-12496257)
chr6 (170-341)||(21702068-21702232)
chr6 (114-314)||(12706498-12706689)
chr6 (114-314)||(16741016-16741206)
chr6 (32-237)||(18917706-18917918)
chr6 (144-314)||(31478378-31478542)
chr6 (168-314)||(19662579-19662715)
chr6 (212-314)||(1644058-1644157)
chr6 (212-314)||(14471761-14471860)
chr6 (212-314)||(16623902-16624001)
chr6 (156-340)||(27325776-27325950)
chr6 (168-314)||(2685478-2685614)
chr6 (156-337)||(17803971-17804145)
chr6 (241-314)||(18917894-18917967)
chr6 (108-238)||(4233602-4233732)
chr6 (166-314)||(22430185-22430327)
chr6 (23-92)||(16371861-16371930)
chr6 (144-212)||(16624022-16624090)
chr6 (156-282)||(25767326-25767445)
chr6 (144-208)||(1644182-1644246)
chr6 (32-92)||(8243637-8243697)
chr6 (49-130)||(20908039-20908120)
chr6 (156-208)||(14471885-14471937)
chr6 (166-195)||(22592960-22592989)
chr6 (83-148)||(27553663-27553728)
chr6 (293-340)||(18906859-18906907)
[»] chr5 (105 HSPs)
chr5 (23-369)||(15441989-15442335)
chr5 (23-369)||(14359852-14360198)
chr5 (23-369)||(23337323-23337669)
chr5 (30-367)||(22325967-22326306)
chr5 (38-369)||(21295310-21295635)
chr5 (38-369)||(25534722-25535047)
chr5 (38-369)||(24554265-24554593)
chr5 (30-367)||(22343224-22343562)
chr5 (30-367)||(22352624-22352962)
chr5 (49-367)||(24020013-24020330)
chr5 (33-367)||(19768077-19768413)
chr5 (33-367)||(19774673-19775009)
chr5 (108-343)||(22139458-22139692)
chr5 (108-343)||(25406193-25406427)
chr5 (110-343)||(37286886-37287118)
chr5 (110-343)||(37293589-37293821)
chr5 (108-343)||(29471461-29471696)
chr5 (108-343)||(17283836-17284070)
chr5 (108-343)||(22132766-22133000)
chr5 (108-343)||(22587864-22588098)
chr5 (108-367)||(41294538-41294795)
chr5 (110-343)||(22328268-22328500)
chr5 (108-367)||(23249683-23249940)
chr5 (108-367)||(41768987-41769245)
chr5 (108-367)||(41775561-41775819)
chr5 (108-343)||(29478056-29478291)
chr5 (110-343)||(19991652-19991883)
chr5 (110-343)||(22341707-22341939)
chr5 (156-368)||(22410762-22410973)
chr5 (108-343)||(41098325-41098559)
chr5 (108-343)||(40706890-40707124)
chr5 (108-343)||(40713532-40713766)
chr5 (108-343)||(22264713-22264947)
chr5 (108-343)||(23583907-23584141)
chr5 (108-343)||(27663892-27664126)
chr5 (156-368)||(21667969-21668181)
chr5 (156-368)||(22258644-22258856)
chr5 (108-343)||(22062985-22063219)
chr5 (110-368)||(15001784-15002042)
chr5 (108-343)||(34294655-34294889)
chr5 (110-343)||(18038772-18039005)
chr5 (156-368)||(29316149-29316361)
chr5 (108-368)||(37543783-37544042)
chr5 (108-343)||(27516520-27516754)
chr5 (108-343)||(27523157-27523391)
chr5 (108-360)||(27670532-27670782)
chr5 (108-343)||(17707033-17707266)
chr5 (108-343)||(24472350-24472583)
chr5 (108-343)||(27608508-27608741)
chr5 (156-343)||(20775635-20775822)
chr5 (110-368)||(1692541-1692799)
chr5 (110-368)||(14995141-14995399)
chr5 (108-343)||(27615114-27615347)
chr5 (156-343)||(16354592-16354778)
chr5 (156-343)||(16361251-16361437)
chr5 (110-368)||(27687433-27687691)
chr5 (108-343)||(33725626-33725860)
chr5 (156-343)||(34564585-34564771)
chr5 (156-343)||(34571240-34571426)
chr5 (169-343)||(25106531-25106704)
chr5 (169-343)||(25165624-25165797)
chr5 (30-314)||(19472988-19473276)
chr5 (114-314)||(40723977-40724174)
chr5 (32-314)||(15237105-15237393)
chr5 (32-314)||(20295395-20295683)
chr5 (136-337)||(21885317-21885510)
chr5 (136-341)||(25229534-25229731)
chr5 (136-341)||(25293690-25293887)
chr5 (157-314)||(11220271-11220420)
chr5 (157-314)||(11230669-11230818)
chr5 (136-340)||(17730535-17730731)
chr5 (114-314)||(18355765-18355958)
chr5 (166-341)||(4035999-4036167)
chr5 (166-314)||(33409036-33409177)
chr5 (157-314)||(11224857-11225006)
chr5 (157-314)||(11228680-11228829)
chr5 (166-314)||(21340924-21341064)
chr5 (239-343)||(23609698-23609802)
chr5 (239-343)||(23841094-23841198)
chr5 (136-337)||(26172249-26172442)
chr5 (144-314)||(10752738-10752902)
chr5 (157-314)||(11226690-11226839)
chr5 (166-314)||(16673961-16674101)
chr5 (242-368)||(27680923-27681049)
chr5 (114-340)||(26742852-26743068)
chr5 (114-314)||(18774013-18774203)
chr5 (114-314)||(18783856-18784046)
chr5 (114-314)||(42805230-42805420)
chr5 (168-314)||(20232361-20232497)
chr5 (114-314)||(20911275-20911492)
chr5 (168-314)||(26666290-26666426)
chr5 (168-314)||(26937887-26938023)
chr5 (108-238)||(23609775-23609905)
chr5 (108-238)||(23841171-23841301)
chr5 (168-314)||(24533207-24533343)
chr5 (156-337)||(24767711-24767882)
chr5 (244-315)||(23535791-23535861)
chr5 (156-238)||(23535736-23535813)
chr5 (49-131)||(31342124-31342206)
chr5 (49-148)||(24221837-24221936)
chr5 (283-314)||(17410278-17410309)
chr5 (316-367)||(25808517-25808568)
chr5 (49-131)||(26680559-26680641)
chr5 (49-131)||(26952166-26952248)
chr5 (167-209)||(17410336-17410378)
[»] chr3 (154 HSPs)
chr3 (23-367)||(7985434-7985778)
chr3 (23-367)||(10325580-10325924)
chr3 (23-369)||(16332906-16333244)
chr3 (33-367)||(13320702-13321036)
chr3 (30-367)||(12891131-12891471)
chr3 (30-367)||(17253097-17253437)
chr3 (38-369)||(24187511-24187836)
chr3 (38-369)||(55148712-55149037)
chr3 (38-369)||(838980-839305)
chr3 (49-367)||(15825395-15825711)
chr3 (49-367)||(10236452-10236768)
chr3 (49-367)||(15992161-15992477)
chr3 (46-333)||(20722771-20723052)
chr3 (40-367)||(13316236-13316560)
chr3 (33-367)||(410791-411127)
chr3 (33-367)||(1145592-1145928)
chr3 (33-367)||(8721196-8721532)
chr3 (33-367)||(9073083-9073419)
chr3 (49-365)||(17710649-17710965)
chr3 (33-367)||(15343645-15343981)
chr3 (33-367)||(15350289-15350625)
chr3 (33-367)||(15366970-15367306)
chr3 (33-367)||(15404535-15404871)
chr3 (35-343)||(5150011-5150318)
chr3 (33-367)||(19808757-19809091)
chr3 (108-343)||(23704869-23705103)
chr3 (108-343)||(23723325-23723559)
chr3 (108-343)||(23741781-23742015)
chr3 (49-343)||(41092403-41092696)
chr3 (108-343)||(41201899-41202133)
chr3 (86-367)||(4710030-4710309)
chr3 (108-343)||(15727033-15727267)
chr3 (108-343)||(53380453-53380687)
chr3 (108-343)||(53387105-53387339)
chr3 (86-367)||(30777322-30777602)
chr3 (139-340)||(5221177-5221377)
chr3 (156-368)||(15584883-15585094)
chr3 (156-368)||(15591541-15591752)
chr3 (108-367)||(26794497-26794755)
chr3 (108-343)||(31422655-31422889)
chr3 (98-343)||(10153827-10154071)
chr3 (108-343)||(5106986-5107220)
chr3 (108-343)||(10846386-10846620)
chr3 (108-343)||(37615162-37615396)
chr3 (156-368)||(5426875-5427087)
chr3 (156-368)||(12482160-12482372)
chr3 (108-343)||(417769-418003)
chr3 (108-360)||(16758673-16758924)
chr3 (108-343)||(20057507-20057741)
chr3 (220-369)||(28368673-28368822)
chr3 (220-369)||(28376491-28376640)
chr3 (220-369)||(28384313-28384462)
chr3 (108-360)||(6598471-6598722)
chr3 (108-360)||(6605151-6605402)
chr3 (108-343)||(13250488-13250722)
chr3 (108-343)||(13257134-13257368)
chr3 (108-343)||(14673303-14673537)
chr3 (23-223)||(28351196-28351398)
chr3 (108-368)||(3690363-3690622)
chr3 (156-368)||(5200958-5201170)
chr3 (156-368)||(5420468-5420680)
chr3 (108-360)||(16747941-16748192)
chr3 (108-343)||(20064145-20064379)
chr3 (108-343)||(26889225-26889458)
chr3 (108-343)||(10010052-10010286)
chr3 (108-343)||(16624157-16624391)
chr3 (156-343)||(16633599-16633785)
chr3 (156-343)||(16640209-16640395)
chr3 (156-343)||(43160874-43161060)
chr3 (156-343)||(43167111-43167297)
chr3 (169-343)||(48423116-48423289)
chr3 (186-343)||(1333262-1333418)
chr3 (165-343)||(6608229-6608407)
chr3 (108-343)||(10003405-10003639)
chr3 (108-343)||(10903995-10904229)
chr3 (108-343)||(10910667-10910901)
chr3 (169-343)||(48429894-48430067)
chr3 (108-301)||(15692379-15692571)
chr3 (110-343)||(16489774-16490001)
chr3 (32-314)||(14498876-14499164)
chr3 (217-367)||(15337189-15337338)
chr3 (32-314)||(27409914-27410202)
chr3 (217-367)||(15360447-15360596)
chr3 (114-314)||(15964495-15964688)
chr3 (114-314)||(15968419-15968612)
chr3 (114-314)||(15972343-15972536)
chr3 (30-337)||(30065475-30065787)
chr3 (32-314)||(11069619-11069907)
chr3 (32-314)||(11165799-11166087)
chr3 (32-314)||(55022416-55022706)
chr3 (30-314)||(15616925-15617215)
chr3 (32-314)||(4107667-4107957)
chr3 (32-314)||(4111519-4111809)
chr3 (32-314)||(22321215-22321503)
chr3 (32-314)||(22336270-22336558)
chr3 (237-367)||(15398123-15398253)
chr3 (104-314)||(7109247-7109460)
chr3 (104-314)||(7113182-7113395)
chr3 (144-314)||(16750736-16750899)
chr3 (239-367)||(26789010-26789138)
chr3 (32-314)||(28949273-28949563)
chr3 (114-314)||(5222873-5223065)
chr3 (114-340)||(16808986-16809203)
chr3 (217-343)||(22643515-22643640)
chr3 (249-367)||(29695943-29696061)
chr3 (166-314)||(38814192-38814333)
chr3 (166-314)||(1598636-1598777)
chr3 (166-314)||(3833482-3833623)
chr3 (114-267)||(11300871-11301021)
chr3 (166-314)||(15942061-15942202)
chr3 (166-341)||(16696566-16696734)
chr3 (33-238)||(15397944-15398152)
chr3 (114-300)||(16798159-16798336)
chr3 (214-314)||(15464650-15464746)
chr3 (141-337)||(15482448-15482635)
chr3 (168-314)||(17241782-17241918)
chr3 (110-238)||(22643435-22643563)
chr3 (214-314)||(12339251-12339347)
chr3 (33-238)||(15360548-15360756)
chr3 (114-369)||(31097661-31097908)
chr3 (217-314)||(4589378-4589471)
chr3 (212-314)||(19775118-19775217)
chr3 (240-314)||(37440121-37440195)
chr3 (217-314)||(8489652-8489745)
chr3 (157-262)||(11854328-11854429)
chr3 (104-238)||(4589292-4589423)
chr3 (33-238)||(15337290-15337498)
chr3 (156-337)||(20461658-20461832)
chr3 (156-337)||(7793508-7793682)
chr3 (156-337)||(327323-327497)
chr3 (156-337)||(14665178-14665352)
chr3 (284-367)||(4290896-4290979)
chr3 (108-238)||(26788907-26789037)
chr3 (114-238)||(37440026-37440147)
chr3 (166-337)||(2897989-2898155)
chr3 (156-337)||(14668334-14668508)
chr3 (114-237)||(8489576-8489696)
chr3 (114-212)||(15464768-15464866)
chr3 (297-343)||(15711579-15711625)
chr3 (156-210)||(15850232-15850285)
chr3 (114-206)||(12339375-12339467)
chr3 (268-323)||(14572376-14572431)
chr3 (270-324)||(14577112-14577166)
chr3 (213-267)||(11854239-11854289)
chr3 (144-208)||(19775242-19775306)
chr3 (267-314)||(49668364-49668411)
chr3 (268-314)||(9512706-9512752)
chr3 (268-314)||(9520681-9520727)
chr3 (268-314)||(16103566-16103612)
chr3 (213-263)||(11854267-11854313)
chr3 (49-148)||(11557442-11557541)
chr3 (293-340)||(11849063-11849111)
chr3 (293-340)||(11862541-11862589)
chr3 (293-336)||(14878839-14878883)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (23-369)||(19111135-19111481)
chr1 (23-348)||(19104499-19104824)
chr1 (23-367)||(20525249-20525593)
chr1 (65-367)||(8304870-8305172)
chr1 (38-369)||(23762945-23763270)
chr1 (30-367)||(50887793-50888133)
chr1 (33-367)||(33386264-33386600)
chr1 (33-367)||(33392909-33393245)
chr1 (33-367)||(21807241-21807577)
chr1 (33-367)||(21835095-21835431)
chr1 (109-343)||(21828482-21828715)
chr1 (110-343)||(18600210-18600443)
chr1 (108-343)||(51328782-51329016)
chr1 (108-343)||(51335416-51335650)
chr1 (110-343)||(41478682-41478915)
chr1 (156-368)||(27898822-27899034)
chr1 (156-368)||(43063439-43063651)
chr1 (156-368)||(44755836-44756048)
chr1 (156-368)||(49334303-49334515)
chr1 (108-343)||(41348955-41349189)
chr1 (108-343)||(20216031-20216264)
chr1 (156-343)||(41356440-41356626)
chr1 (139-368)||(18626430-18626659)
chr1 (156-368)||(33384801-33385013)
chr1 (108-343)||(47658982-47659216)
chr1 (108-368)||(16345878-16346137)
chr1 (156-343)||(43078187-43078373)
chr1 (108-343)||(44844987-44845221)
chr1 (156-343)||(46157493-46157679)
chr1 (108-368)||(16352526-16352786)
chr1 (32-314)||(21406904-21407191)
chr1 (38-206)||(21437686-21437853)
chr1 (114-314)||(1925519-1925712)
chr1 (114-314)||(20924533-20924726)
chr1 (32-314)||(1010271-1010559)
chr1 (32-314)||(52639089-52639377)
chr1 (32-314)||(16375729-16376016)
chr1 (114-314)||(20137892-20138083)
chr1 (212-314)||(41388478-41388577)
chr1 (114-314)||(19211677-19211867)
chr1 (259-343)||(21844056-21844140)
chr1 (213-314)||(39244380-39244477)
chr1 (213-314)||(39247935-39248032)
chr1 (212-313)||(20229466-20229564)
chr1 (156-337)||(21172786-21172960)
chr1 (156-337)||(21312902-21313076)
chr1 (168-314)||(12646680-12646816)
chr1 (156-337)||(36819458-36819629)
chr1 (214-314)||(33797067-33797163)
chr1 (240-314)||(46975299-46975373)
chr1 (166-237)||(46975348-46975416)
chr1 (242-314)||(18882200-18882272)
chr1 (144-235)||(39244289-39244377)
chr1 (144-235)||(39247844-39247932)
chr1 (144-238)||(20229377-20229468)
chr1 (244-314)||(16080645-16080712)
chr1 (108-197)||(21844140-21844229)
chr1 (166-237)||(18882249-18882316)
chr1 (156-230)||(16080590-16080659)
chr1 (114-206)||(33797191-33797283)
chr1 (167-237)||(24783268-24783334)
chr1 (144-208)||(41388389-41388453)
chr1 (49-131)||(33050083-33050165)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (23-369)||(19905220-19905569)
chr8 (33-367)||(3215990-3216325)
chr8 (38-369)||(20527183-20527508)
chr8 (30-367)||(26935217-26935557)
chr8 (33-369)||(23845803-23846141)
chr8 (33-367)||(20023969-20024305)
chr8 (108-343)||(16883275-16883509)
chr8 (108-343)||(18865098-18865332)
chr8 (108-343)||(8354869-8355103)
chr8 (108-343)||(29122855-29123089)
chr8 (108-367)||(20013967-20014225)
chr8 (108-367)||(20020044-20020302)
chr8 (108-343)||(17669673-17669907)
chr8 (108-343)||(5534542-5534776)
chr8 (108-343)||(17676325-17676559)
chr8 (110-343)||(22123490-22123723)
chr8 (108-368)||(22115824-22116084)
chr8 (156-343)||(19496157-19496343)
chr8 (156-343)||(19498205-19498391)
chr8 (158-368)||(22047688-22047897)
chr8 (108-368)||(22124632-22124892)
chr8 (108-343)||(19110995-19111228)
chr8 (108-343)||(19117286-19117519)
chr8 (108-343)||(22083599-22083833)
chr8 (108-343)||(21915673-21915906)
chr8 (156-368)||(28454493-28454704)
chr8 (164-368)||(18065061-18065265)
chr8 (32-314)||(22111479-22111767)
chr8 (114-314)||(18863035-18863228)
chr8 (114-314)||(21828404-21828597)
chr8 (114-314)||(30940467-30940660)
chr8 (255-367)||(20705896-20706008)
chr8 (114-314)||(21410473-21410666)
chr8 (114-314)||(21804965-21805158)
chr8 (114-340)||(30308858-30309076)
chr8 (32-314)||(21972851-21973139)
chr8 (32-314)||(43251359-43251649)
chr8 (166-314)||(15531697-15531838)
chr8 (36-314)||(21976944-21977230)
chr8 (166-313)||(24445663-24445803)
chr8 (168-340)||(17055538-17055703)
chr8 (237-343)||(18854730-18854836)
chr8 (166-314)||(15538256-15538397)
chr8 (136-314)||(14398236-14398406)
chr8 (166-314)||(23847172-23847312)
chr8 (170-341)||(32598459-32598623)
chr8 (170-341)||(32604991-32605155)
chr8 (166-314)||(17828739-17828880)
chr8 (114-314)||(22044693-22044884)
chr8 (136-314)||(21386881-21387051)
chr8 (114-314)||(16231581-16231771)
chr8 (114-314)||(23833982-23834172)
chr8 (108-238)||(18854807-18854937)
chr8 (241-314)||(15440393-15440466)
chr8 (240-313)||(19278746-19278821)
chr8 (144-233)||(19278681-19278767)
chr8 (114-212)||(21383556-21383654)
chr8 (32-92)||(19278553-19278613)
chr8 (293-340)||(16184466-16184514)
chr8 (293-340)||(20466365-20466413)
chr8 (293-340)||(24755504-24755552)
chr8 (293-340)||(30643612-30643660)
[»] chr7 (121 HSPs)
chr7 (38-367)||(20144-20472)
chr7 (23-332)||(7535947-7536256)
chr7 (38-367)||(18530974-18531302)
chr7 (33-360)||(4318586-4318913)
chr7 (30-367)||(6017212-6017552)
chr7 (38-369)||(11262062-11262387)
chr7 (38-369)||(12692229-12692554)
chr7 (46-369)||(14958897-14959214)
chr7 (38-369)||(26419733-26420058)
chr7 (38-367)||(11548313-11548637)
chr7 (38-367)||(11554909-11555233)
chr7 (46-367)||(9409674-9409995)
chr7 (51-343)||(11232344-11232635)
chr7 (108-343)||(20703093-20703327)
chr7 (108-343)||(32767444-32767678)
chr7 (51-343)||(11239031-11239322)
chr7 (33-332)||(13569656-13569957)
chr7 (108-343)||(18175873-18176107)
chr7 (57-368)||(1347237-1347547)
chr7 (108-343)||(18182545-18182779)
chr7 (108-367)||(14330530-14330788)
chr7 (108-367)||(14337114-14337372)
chr7 (108-343)||(18164776-18165010)
chr7 (108-343)||(44786578-44786812)
chr7 (108-343)||(44793219-44793453)
chr7 (108-343)||(40523464-40523698)
chr7 (110-343)||(15162925-15163158)
chr7 (110-343)||(16407399-16407632)
chr7 (156-368)||(8705726-8705938)
chr7 (156-368)||(23520126-23520338)
chr7 (108-343)||(9511115-9511348)
chr7 (110-368)||(11365940-11366200)
chr7 (108-342)||(12703512-12703744)
chr7 (108-343)||(60780-61014)
chr7 (156-366)||(18553695-18553905)
chr7 (110-343)||(15156274-15156507)
chr7 (108-343)||(14655520-14655754)
chr7 (110-368)||(13690836-13691094)
chr7 (108-343)||(49051140-49051373)
chr7 (156-343)||(15021876-15022062)
chr7 (169-343)||(21429-21602)
chr7 (169-343)||(8202260-8202433)
chr7 (110-368)||(13684205-13684463)
chr7 (38-235)||(44408384-44408576)
chr7 (242-369)||(14952958-14953085)
chr7 (40-235)||(14953064-14953254)
chr7 (194-368)||(8712397-8712571)
chr7 (242-369)||(44408555-44408682)
chr7 (32-314)||(32657-32943)
chr7 (32-314)||(12704929-12705217)
chr7 (249-369)||(15380551-15380671)
chr7 (30-314)||(71033-71325)
chr7 (30-314)||(75142-75434)
chr7 (114-314)||(15083719-15083912)
chr7 (32-314)||(12718216-12718504)
chr7 (32-314)||(18282914-18283202)
chr7 (217-368)||(10869196-10869347)
chr7 (217-368)||(10875276-10875427)
chr7 (114-340)||(13461542-13461761)
chr7 (114-314)||(45170396-45170589)
chr7 (32-314)||(12723127-12723415)
chr7 (32-314)||(16113789-16114077)
chr7 (32-314)||(16116942-16117230)
chr7 (136-341)||(15728105-15728302)
chr7 (151-340)||(8917209-8917389)
chr7 (32-314)||(18278951-18279239)
chr7 (169-314)||(1859245-1859382)
chr7 (114-314)||(39721789-39721982)
chr7 (217-366)||(18585497-18585646)
chr7 (114-314)||(13148963-13149155)
chr7 (114-314)||(25927607-25927799)
chr7 (156-314)||(18556779-18556930)
chr7 (23-131)||(14148533-14148641)
chr7 (182-341)||(14216705-14216857)
chr7 (136-314)||(16724758-16724928)
chr7 (136-314)||(17701772-17701942)
chr7 (114-314)||(9593155-9593345)
chr7 (212-314)||(18425208-18425307)
chr7 (30-314)||(26291920-26292233)
chr7 (114-313)||(16457463-16457652)
chr7 (168-314)||(6801021-6801157)
chr7 (217-314)||(7519531-7519623)
chr7 (114-337)||(16583040-16583256)
chr7 (217-314)||(12714436-12714530)
chr7 (240-314)||(13918979-13919053)
chr7 (272-343)||(20871301-20871372)
chr7 (188-323)||(14932954-14933081)
chr7 (188-323)||(15356389-15356516)
chr7 (188-323)||(15360503-15360630)
chr7 (240-314)||(16275323-16275397)
chr7 (240-341)||(35151421-35151522)
chr7 (214-310)||(2530616-2530708)
chr7 (241-314)||(16907696-16907769)
chr7 (156-296)||(13635618-13635747)
chr7 (156-337)||(15605419-15605594)
chr7 (156-337)||(14152151-14152325)
chr7 (156-310)||(2832607-2832750)
chr7 (156-337)||(12317910-12318084)
chr7 (114-238)||(13918884-13919005)
chr7 (156-238)||(10869298-10869381)
chr7 (156-238)||(10875378-10875461)
chr7 (32-237)||(12714485-12714700)
chr7 (156-238)||(18585463-18585546)
chr7 (157-237)||(2530540-2530616)
chr7 (242-314)||(20579-20650)
chr7 (136-238)||(16275371-16275469)
chr7 (144-237)||(16907629-16907720)
chr7 (244-336)||(9751984-9752079)
chr7 (166-238)||(35151496-35151565)
chr7 (114-206)||(19164-19256)
chr7 (167-290)||(15580523-15580639)
chr7 (190-238)||(8712499-8712547)
chr7 (156-211)||(14932900-14932954)
chr7 (156-211)||(15356335-15356389)
chr7 (156-211)||(15360449-15360503)
chr7 (32-92)||(16907471-16907531)
chr7 (57-131)||(9446224-9446298)
chr7 (285-324)||(13569609-13569648)
chr7 (156-211)||(15605688-15605742)
chr7 (104-208)||(18425332-18425445)
chr7 (156-204)||(9751920-9751967)
[»] chr4 (106 HSPs)
chr4 (23-367)||(12521811-12522155)
chr4 (30-367)||(53433102-53433442)
chr4 (38-369)||(14678696-14679021)
chr4 (38-369)||(41385792-41386117)
chr4 (38-369)||(23838167-23838492)
chr4 (38-369)||(14684904-14685229)
chr4 (33-367)||(27709474-27709810)
chr4 (86-365)||(9272254-9272531)
chr4 (33-367)||(23081317-23081653)
chr4 (33-367)||(19942195-19942531)
chr4 (108-343)||(6873481-6873715)
chr4 (33-343)||(15322136-15322445)
chr4 (51-343)||(7901232-7901523)
chr4 (33-367)||(16956692-16957028)
chr4 (108-343)||(386434-386668)
chr4 (108-343)||(40477917-40478151)
chr4 (110-368)||(14268560-14268817)
chr4 (110-368)||(14298934-14299191)
chr4 (108-332)||(51493922-51494143)
chr4 (23-235)||(35170487-35170700)
chr4 (108-367)||(4771841-4772098)
chr4 (136-343)||(40453688-40453894)
chr4 (111-343)||(26285014-26285246)
chr4 (108-343)||(19780392-19780626)
chr4 (108-343)||(23953916-23954150)
chr4 (108-343)||(23960578-23960812)
chr4 (156-368)||(55795180-55795392)
chr4 (108-367)||(8048600-8048858)
chr4 (108-367)||(8055213-8055471)
chr4 (108-343)||(18295393-18295627)
chr4 (156-368)||(12300061-12300273)
chr4 (156-368)||(12349737-12349949)
chr4 (108-343)||(12474787-12475021)
chr4 (108-343)||(12481417-12481651)
chr4 (23-235)||(35613799-35614010)
chr4 (108-368)||(18070911-18071170)
chr4 (108-343)||(18024532-18024766)
chr4 (108-343)||(15148225-15148459)
chr4 (108-343)||(15361900-15362134)
chr4 (108-343)||(15383597-15383830)
chr4 (108-343)||(16231946-16232180)
chr4 (108-343)||(22194387-22194621)
chr4 (32-314)||(4561604-4561883)
chr4 (108-343)||(36884839-36885073)
chr4 (32-314)||(5757209-5757488)
chr4 (156-353)||(17962497-17962694)
chr4 (32-314)||(14757692-14757985)
chr4 (156-343)||(8384581-8384767)
chr4 (156-343)||(14073577-14073763)
chr4 (156-343)||(15256355-15256541)
chr4 (156-343)||(17090151-17090337)
chr4 (156-343)||(29041072-29041258)
chr4 (30-314)||(17809822-17810110)
chr4 (156-343)||(8391236-8391422)
chr4 (217-369)||(35170381-35170532)
chr4 (169-343)||(17808160-17808333)
chr4 (39-211)||(20682036-20682207)
chr4 (217-369)||(35613693-35613844)
chr4 (32-314)||(9556078-9556366)
chr4 (32-314)||(33741928-33742216)
chr4 (114-314)||(14954557-14954750)
chr4 (114-314)||(12487233-12487427)
chr4 (136-340)||(14708762-14708959)
chr4 (239-368)||(14305659-14305788)
chr4 (115-340)||(18236674-18236891)
chr4 (136-340)||(42997578-42997775)
chr4 (144-314)||(15224590-15224753)
chr4 (114-314)||(2014587-2014779)
chr4 (94-340)||(18602816-18603055)
chr4 (166-314)||(45937957-45938098)
chr4 (166-312)||(19757758-19757896)
chr4 (166-312)||(19781910-19782048)
chr4 (114-314)||(26243770-26243962)
chr4 (136-340)||(3412580-3412776)
chr4 (114-314)||(9530243-9530435)
chr4 (166-314)||(23139080-23139220)
chr4 (94-340)||(18609388-18609627)
chr4 (166-314)||(18222536-18222674)
chr4 (114-311)||(27533528-27533742)
chr4 (114-313)||(16243505-16243696)
chr4 (114-311)||(1951867-1952054)
chr4 (285-369)||(21339968-21340052)
chr4 (283-367)||(30235277-30235361)
chr4 (240-314)||(25689417-25689491)
chr4 (240-337)||(28569644-28569741)
chr4 (110-238)||(14305558-14305686)
chr4 (166-314)||(18229011-18229149)
chr4 (240-314)||(10712403-10712477)
chr4 (240-314)||(10926173-10926247)
chr4 (166-340)||(17152644-17152808)
chr4 (294-367)||(13020537-13020610)
chr4 (110-241)||(20115011-20115143)
chr4 (114-238)||(25689465-25689586)
chr4 (114-237)||(10712452-10712572)
chr4 (114-237)||(10926222-10926342)
chr4 (33-97)||(30235220-30235284)
chr4 (156-237)||(22634571-22634647)
chr4 (245-323)||(36134176-36134256)
chr4 (268-341)||(22634653-22634726)
chr4 (170-237)||(28569605-28569669)
chr4 (156-237)||(20157625-20157701)
chr4 (267-323)||(20157706-20157761)
chr4 (156-237)||(36134120-36134196)
chr4 (57-148)||(15353373-15353464)
chr4 (82-148)||(16351942-16352008)
chr4 (293-340)||(12569761-12569809)
[»] scaffold0013 (4 HSPs)
scaffold0013 (23-367)||(9068-9411)
scaffold0013 (156-337)||(2821-2992)
scaffold0013 (255-314)||(73818-73877)
scaffold0013 (260-314)||(81468-81521)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (38-367)||(8902-9230)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (23-367)||(9904-10248)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (38-369)||(14587-14913)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (38-369)||(241791-242116)
scaffold0010 (114-314)||(23026-23216)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (33-367)||(15035-15369)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (33-360)||(19619-19947)
[»] scaffold0242 (3 HSPs)
scaffold0242 (38-369)||(19309-19634)
scaffold0242 (190-369)||(25456-25634)
scaffold0242 (38-263)||(25589-25808)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (49-367)||(12175-12491)
[»] scaffold0028 (8 HSPs)
scaffold0028 (26-367)||(6735-7074)
scaffold0028 (49-367)||(13260-13576)
scaffold0028 (49-367)||(22788-23104)
scaffold0028 (33-343)||(56799-57108)
scaffold0028 (33-343)||(41292-41601)
scaffold0028 (108-343)||(67278-67511)
scaffold0028 (32-314)||(58989-59277)
scaffold0028 (268-323)||(132473-132528)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (33-367)||(77945-78277)
scaffold0004 (57-238)||(60833-61009)
[»] scaffold0572 (1 HSPs)
scaffold0572 (49-367)||(9583-9899)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (38-369)||(25024-25348)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (33-367)||(73725-74061)
scaffold0009 (114-369)||(228478-228724)
[»] scaffold0109 (8 HSPs)
scaffold0109 (62-343)||(26395-26676)
scaffold0109 (33-263)||(43148-43377)
scaffold0109 (190-367)||(42987-43166)
scaffold0109 (168-314)||(38977-39117)
scaffold0109 (114-314)||(36330-36547)
scaffold0109 (151-314)||(6769-6923)
scaffold0109 (168-340)||(11460-11626)
scaffold0109 (190-263)||(43120-43194)
[»] scaffold0744 (1 HSPs)
scaffold0744 (38-367)||(3717-4048)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (108-343)||(306866-307100)
[»] scaffold0052 (3 HSPs)
scaffold0052 (108-343)||(1157-1391)
scaffold0052 (169-343)||(10106-10279)
scaffold0052 (169-343)||(56528-56701)
[»] scaffold0044 (6 HSPs)
scaffold0044 (108-343)||(7829-8063)
scaffold0044 (108-367)||(73001-73259)
scaffold0044 (108-343)||(30295-30530)
scaffold0044 (166-341)||(62041-62210)
scaffold0044 (114-314)||(18998-19188)
scaffold0044 (114-337)||(12689-12904)
[»] scaffold0029 (5 HSPs)
scaffold0029 (108-343)||(105989-106223)
scaffold0029 (108-343)||(126224-126457)
scaffold0029 (30-314)||(65796-66082)
scaffold0029 (32-310)||(61882-62162)
scaffold0029 (144-314)||(80090-80253)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (108-343)||(9919-10153)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (156-368)||(21935-22147)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (156-368)||(4241-4453)
[»] scaffold0553 (1 HSPs)
scaffold0553 (156-368)||(8520-8732)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (108-368)||(56717-56976)
scaffold0003 (114-314)||(70877-71069)
scaffold0003 (114-314)||(139520-139712)
scaffold0003 (156-340)||(100854-101027)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (30-314)||(4143-4427)
[»] scaffold0140 (1 HSPs)
scaffold0140 (156-343)||(38451-38637)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (158-343)||(37809-37994)
scaffold0141 (166-314)||(14529-14670)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (158-343)||(76818-77003)
[»] scaffold0231 (2 HSPs)
scaffold0231 (193-367)||(1-174)
scaffold0231 (190-238)||(25-73)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (108-343)||(59564-59798)
scaffold0061 (32-314)||(67571-67859)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (108-343)||(138835-139069)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (169-343)||(25117-25290)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (65-219)||(5873-6026)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (156-332)||(32481-32656)
[»] scaffold0656 (1 HSPs)
scaffold0656 (238-369)||(1086-1217)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (30-314)||(5369-5657)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (32-314)||(11970-12258)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (136-341)||(16791-16989)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (114-314)||(36476-36669)
scaffold0031 (156-337)||(53339-53513)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (114-314)||(189767-189960)
scaffold0012 (114-337)||(25075-25290)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (248-369)||(14722-14843)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (114-314)||(33050-33244)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (32-311)||(1-286)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (33-211)||(1-178)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (136-341)||(15117-15315)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (168-340)||(9118-9283)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (114-341)||(9684-9904)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (136-340)||(77299-77495)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (94-340)||(1658-1897)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (136-314)||(20592-20762)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (166-314)||(6489-6629)
[»] scaffold0156 (2 HSPs)
scaffold0156 (38-215)||(2692-2868)
scaffold0156 (282-325)||(2651-2694)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (166-314)||(9229-9369)
[»] scaffold0111 (3 HSPs)
scaffold0111 (136-339)||(8283-8477)
scaffold0111 (212-339)||(15403-15525)
scaffold0111 (136-267)||(15498-15621)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (151-314)||(6384-6538)
scaffold0546 (168-340)||(1681-1847)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (114-340)||(36090-36307)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (136-314)||(6128-6298)
scaffold0130 (241-314)||(8224-8297)
[»] scaffold0229 (2 HSPs)
scaffold0229 (240-368)||(11986-12115)
scaffold0229 (114-235)||(11891-12009)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (156-337)||(29337-29509)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (38-185)||(6528-6674)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (166-313)||(18164-18303)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (166-314)||(63663-63803)
scaffold0042 (293-340)||(35241-35289)
[»] scaffold1552 (1 HSPs)
scaffold1552 (166-340)||(150-317)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (104-263)||(80874-81026)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (166-314)||(16487-16625)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (240-314)||(9400-9474)
[»] scaffold1852 (1 HSPs)
scaffold1852 (241-314)||(1-74)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (114-337)||(18738-18953)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (114-314)||(9771-9961)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (156-337)||(10208-10379)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (156-337)||(66573-66747)
scaffold0036 (88-148)||(68838-68898)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (241-314)||(208098-208171)
scaffold0016 (166-238)||(208006-208075)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (114-310)||(173106-173292)
scaffold0001 (49-130)||(422589-422670)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (114-310)||(20122-20307)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (240-310)||(11523-11593)
scaffold0200 (136-238)||(11567-11665)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (241-305)||(30725-30789)
scaffold0051 (157-237)||(30765-30841)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (62-310)||(28880-29140)
[»] scaffold1873 (1 HSPs)
scaffold1873 (156-282)||(1085-1204)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (166-212)||(10-56)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (280-314)||(4-38)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (49-148)||(2494-2593)
scaffold0439 (49-148)||(10354-10453)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (32-92)||(68083-68143)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (268-314)||(3397-3443)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (49-130)||(7449-7530)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 84)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 11677523 - 11677176
Alignment:
Q  20 gacatcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaa 119  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11677523 gacatcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaa 11677424  T
Q  120 attattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggag 219  Q
    ||||||||||||  | ||||||| || || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11677423 attattggatgcacattgatatgatggttacaatgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggag 11677324  T
Q  220 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11677323 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 11677224  T
Q  320 taagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11677223 taagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 11677176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 367
Target Start/End: Original strand, 24640996 - 24641340
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24640996 atcatcctgttgttgtgtgacctgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaatt 24641095  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641096 attggatgtttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtgcatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 24641195  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24641196 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgttctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 24641295  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24641296 gagcattatcgcattgtcatgtctagtatgctatgttgttgatga 24641340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 30 - 365
Target Start/End: Original strand, 21147332 - 21147664
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggat 129  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21147332 tgttgttgtgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggat 21147431  T
Q  130 gctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctc 229  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  21147432 gcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattatt---agctttgtcctc 21147528  T
Q  230 cgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcatt 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21147529 cgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcatt 21147628  T
Q  330 gtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgat 365  Q
    ||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  21147629 gtcacattgttatgtctataatgctatgttgttgat 21147664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24503169 - 24502844
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  24503169 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 24503070  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||  ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  24503069 atataatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgat----aggagctttgtcctccgcacgat 24502975  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24502974 t-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccatatgcatataaggagtctaagagcattgtcacatt 24502876  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24502875 gtcatgtctaagatgctatgttgttgatgatg 24502844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Original strand, 30971020 - 30971360
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  30971020 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 30971118  T
Q  128 atgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtc 226  Q
    ||||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30971119 atgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtc 30971218  T
Q  227 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30971219 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 30971318  T
Q  326 cattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30971319 cattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 30971360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 37318339 - 37318005
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatata--tgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatg 130  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37318339 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatatatacatgatgaa-acgatgacgtttagctccaaattattggatg 37318241  T
Q  131 ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctc 229  Q
    |    ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37318240 catgttgatatgttgattacggtgatttgtgcatatgagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctc 37318142  T
Q  230 cgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcatt 329  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37318141 cgcatgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttttgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcatt 37318043  T
Q  330 gtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||| |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  37318042 gtcacattgtcatgtccataatgttatgttgttgatga 37318005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 13970410 - 13970746
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  13970410 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 13970508  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13970509 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 13970607  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13970608 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 13970706  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  13970707 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 13970746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24714777 - 24714441
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  24714777 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 24714679  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24714678 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 24714580  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24714579 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 24714481  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||||||    
T  24714480 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgctgttgatga 24714441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 41610670 - 41611006
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata----atgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||     || | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  41610670 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 41610768  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41610769 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataa-catctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 41610867  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41610868 tccgcacgatt-attagaagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 41610966  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  41610967 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 41611006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 45057466 - 45057802
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  45057466 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 45057564  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45057565 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagattccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 45057663  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45057664 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 45057762  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  45057763 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 45057802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 41604773 - 41605109
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata----atgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| |||||||||||| |||||     || | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  41604773 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaactgcattgtatatatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 41604871  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41604872 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataa-catctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 41604970  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41604971 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 41605069  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    || || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  41605070 ttttcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 41605109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12829074 - 12828840
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12829074 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 12828976  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12828975 cgtttattaggagttttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatactaatacttatgatgacgattggtaccacatg 12828877  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12828876 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 12828840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 24914069 - 24914303
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24914069 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 24914167  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24914168 cgatgattaggagttttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 24914266  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24914267 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 24914303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23171040 - 23170781
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23171040 gtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgtccataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 23170942  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23170941 cgattattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 23170843  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  23170842 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 23170781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23582297 - 23582038
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23582297 gtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgtccataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 23582199  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23582198 cgattattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 23582100  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  23582099 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 23582038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29233530 - 29233273
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29233530 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccgcg 29233432  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29233431 attattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 29233333  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  29233332 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 29233273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29346829 - 29346572
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  29346829 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccgcg 29346731  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346730 attattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 29346632  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  29346631 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 29346572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27599264 - 27599032
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  27599264 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccatg 27599166  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27599165 aatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 27599067  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27599066 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 27599032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1843083 - 1842851
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1843083 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcgccacg 1842985  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1842984 aatattaggagctttgtcctccgcacattttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 1842886  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1842885 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 1842851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 22321089 - 22321323
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22321089 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 22321187  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321188 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 22321286  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22321287 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 22321323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 22327242 - 22327476
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22327242 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 22327340  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22327341 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 22327439  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22327440 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 22327476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16928358 - 16928124
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16928358 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 16928261  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16928260 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16928162  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16928161 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 16928124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16997052 - 16996818
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16997052 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 16996955  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16996954 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16996856  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16996855 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 16996818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17003685 - 17003451
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17003685 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 17003588  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17003587 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 17003489  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17003488 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 17003451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27369245 - 27369033
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27369245 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 27369148  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27369147 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 27369048  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  27369047 tttgttgatgatgat 27369033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 44381364 - 44381576
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44381364 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 44381461  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44381462 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 44381561  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  44381562 tttgttgatgatgat 44381576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27617299 - 27617066
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27617299 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 27617202  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27617201 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 27617103  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27617102 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 27617066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 158 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10873490 - 10873306
Alignment:
Q  158 tgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcct 256  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10873490 tgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcct 10873393  T
Q  257 ccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10873392 ccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 10873306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 27375755 - 27375543
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27375755 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctaaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 27375658  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27375657 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggattctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 27375558  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  27375557 tttgttgatgatgat 27375543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10866098 - 10865941
Alignment:
Q  185 tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatactta 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10866098 tcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatactta 10866000  T
Q  285 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10865999 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 10865941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 44388034 - 44388246
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  44388034 tttgttgttaagagtccatgcataa-catatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttat 44388131  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44388132 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacgaagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 44388231  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  44388232 tttgttgatgatgat 44388246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9340216 - 9340030
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9340216 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 9340119  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9340118 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 9340030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9488850 - 9488664
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9488850 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 9488753  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9488752 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 9488664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9608111 - 9607925
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9608111 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 9608014  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9608013 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 9607925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16922465 - 16922279
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16922465 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 16922368  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16922367 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 16922279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 19490097 - 19490283
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19490097 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 19490194  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19490195 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 19490283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27215999 - 27215813
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27215999 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 27215902  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27215901 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 27215813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 28432085 - 28432271
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28432085 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 28432182  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28432183 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 28432271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 13306775 - 13306948
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  13306775 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatta 13306872  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13306873 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 13306948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16985864 - 16985691
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16985864 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatta 16985767  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16985766 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 16985691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 26877671 - 26877904
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26877671 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagtttagtcctcacca 26877768  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26877769 cgaaaattaggagctttgtcctccgcatgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 26877867  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  26877868 catataaggagtctaggagaattgtcacattgtcatg 26877904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 217 - 367
Target Start/End: Original strand, 24880494 - 24880645
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagg 315  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24880494 gagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagg 24880593  T
Q  316 agtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  24880594 agtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 24880645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Original strand, 24872448 - 24872660
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  24872448 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 24872546  T
Q  128 atgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacga-ttattaggagctttgtc 226  Q
    ||||    ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24872547 atgcatgttgatatgttgattacaatgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtc 24872646  T
Q  227 ctccgcacgattta 240  Q
    ||||||||| ||||    
T  24872647 ctccgcacgtttta 24872660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 217 - 367
Target Start/End: Original strand, 24872609 - 24872760
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagg 315  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24872609 gagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagg 24872708  T
Q  316 agtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  24872709 agtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgatatgttgttgatga 24872760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 30345381 - 30345574
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30345381 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacgatta 30345479  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30345480 ---ggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 30345572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 24628749 - 24629037
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  24628749 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 24628847  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  24628848 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 24628942  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24628943 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 24629037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 240
Target Start/End: Original strand, 24880333 - 24880545
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||| | |||| || |  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  24880333 tgttgttgtgtgatttgactgtgttactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 24880431  T
Q  128 atgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacga-ttattaggagctttgtc 226  Q
    ||||    ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24880432 atgcatgttgatatgttgattacaatgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtc 24880531  T
Q  227 ctccgcacgattta 240  Q
    ||||||||| ||||    
T  24880532 ctccgcacgtttta 24880545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 217 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27195629 - 27195478
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 316  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27195629 gagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacctatgatgacgattggtaccacaagcatataagga 27195531  T
Q  317 gtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27195530 gtctaagagcaatgtcgcattgtcgtgtctatgatgctatgttgttgatgatg 27195478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 12901782 - 12902074
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg--------atgaataaggtgacgtttagctccaaatta 123  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  12901782 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaatta 12901880  T
Q  124 ttggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  12901881 ttggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta 12901978  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12901979 ---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12902072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 24649193 - 24648903
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg------atgaataaggtgacgtttagctccaaattatt 125  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||       ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  24649193 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttacttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattatt 24649095  T
Q  126 ggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattatt 214  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||      
T  24649094 ggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta-- 24648999  T
Q  215 aggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24648998 -ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 24648903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 23 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 27196957 - 27196809
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27196957 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacatttagctccaaatt 27196858  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtc 171  Q
    |||||||||  | ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  27196857 attggatgcatattgatatgatgaatacggtgatttgttgataagagtc 27196809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 27379702 - 27379990
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| || |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  27379702 ttgttgtgtgatttgactgtgttactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 27379800  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  27379801 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 27379895  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27379896 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttttgatgacgattggtaccacatgcatataag 27379990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 27383748 - 27384036
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| || |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  27383748 ttgttgtgtgatttgactgtgttactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 27383846  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  27383847 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 27383941  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27383942 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttttgatgacgattggtaccacatgcatataag 27384036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27601632 - 27601340
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg--------atgaataaggtgacgtttagctccaaatta 123  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||         ||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  27601632 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaatta 27601534  T
Q  124 ttggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  27601533 ttggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta 27601436  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27601435 ---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27601342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Original strand, 10101998 - 10102211
Alignment:
Q  104 tgacgtttagctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgag 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  10101998 tgacgtttagctccaaattattggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgag 10102095  T
Q  193 cttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacg 292  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10102096 ctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacg 10102189  T
Q  293 attggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10102190 attggtaccacatgcatataag 10102211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 157 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31344834 - 31344685
Alignment:
Q  157 ttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcct 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   | |||||||||||||||||||||    || |||||||||||    
T  31344834 ttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta---gaagctttgtcctccgcacgatt----agaagctttgtcct 31344743  T
Q  257 ccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31344742 ccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 31344685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 60817 - 60598
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    ||||||||||||||| || | | ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||      
T  60817 ctccaaattattggaagcataagtgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat-- 60721  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
      ||||  |||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60720 --aggaa-tttgtcctccacacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 60627  T
Q  313 aggagtctaag-agcattgtcgcattgtca 341  Q
    | | |||||||  |||||||||||||||||    
T  60626 a-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 60598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Original strand, 18855564 - 18855782
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |     
T  18855564 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttg-ttagagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacca----tg 18855658  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18855659 ttaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcttccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 18855754  T
Q  313 aggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    | | |||||||  ||||||||||||||||    
T  18855755 a-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 18855782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 19928659 - 19928799
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  19928659 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 19928750  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19928751 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19928799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23187053 - 23186858
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||    
T  23187053 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccacacg 23186959  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
     |     |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  23186958 ttg----aggagctttgtcgtccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgc 23186864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 23598287 - 23598121
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| |||| |     |||||||||||| |||||||| |    
T  23598287 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccacacgttg----aggagctttgtcgtccgcacgat 23598196  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  23598195 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 23598121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 168 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41666896 - 41666759
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| | |    
T  41666896 agtccatgcattagcattcattgagttttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgatga 41666804  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41666803 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 41666759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1283010 - 1282936
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1283010 attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1282936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24735351 - 24735177
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  24735351 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 24735262  T
Q  256 tccgcacgtt---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  24735261 tccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 24735177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Original strand, 41531489 - 41531563
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41531489 attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 41531563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Original strand, 22461349 - 22461485
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    || ||||||||||||||| |||||| |     |||||||||||||| |||| |||    
T  22461349 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatg----ttcggagctttgtcctccacacgatat-----gagctttgtcctccacacgatta 22461439  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22461440 aagtatattaaaact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 22461485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27195653 - 27195584
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27195653 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 27195584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 26125090 - 26124966
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26125090 attaggagctttgtcctccgcacgttt----aggagctttgtcctccgcacgacgaaagtatattaatacttgtgatgacgattggtaccacatgcatat 26124995  T
Q  312 aaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    || | |||||||  ||||||||||||||||    
T  26124994 aa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 26124966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 278 - 359
Target Start/End: Original strand, 30657567 - 30657648
Alignment:
Q  278 atacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgtt 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  30657567 atacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgtt 30657648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 26125155 - 26125063
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26125155 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgttta 26125063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1283105 - 1282984
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  1283105 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcctgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 1283010  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  1283009 ttaggagctttgtcctccgcacgatt 1282984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 41531394 - 41531515
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  41531394 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 41531489  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  41531490 ttaggagctttgtcctccgcacgatt 41531515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 108
Target Start/End: Original strand, 21139314 - 21139392
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacg 108  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  21139314 tgttgttgtgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatatctatatatcatgaataagatgacg 21139392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 92
Target Start/End: Original strand, 10101911 - 10101973
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat 92  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10101911 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat 10101973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24174859 - 24174760
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgat 147  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  24174859 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgat 24174761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 337
Target Start/End: Original strand, 19691914 - 19691967
Alignment:
Q  285 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  19691914 tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 19691967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 148
Target Start/End: Original strand, 24655404 - 24655495
Alignment:
Q  57 tgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatt 148  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  24655404 tgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgatt 24655495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869840
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgat 147  Q
    ||||||| || | |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga-gtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgat 24869841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 22134501 - 22134547
Alignment:
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  22134501 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataag 22134547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10866323 - 10866263
Alignment:
Q  158 tgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattagga 218  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  10866323 tgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattagga 10866263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Original strand, 21327890 - 21327938
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  21327890 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 21327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Original strand, 23020029 - 23020077
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  23020029 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 23020077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24673360 - 24673312
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  24673360 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 24673312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24679977 - 24679929
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  24679977 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 24679929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 106)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25928368 - 25928022
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25928368 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaatt 25928269  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25928268 attggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 25928169  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25928168 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 25928069  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25928068 gagcattgtcgcattgtcgtgtctatgatgctatgttgttgatgatg 25928022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19808599 - 19808253
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| | ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19808599 atcatcctattgttgtgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaatt 19808500  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808499 attggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 19808400  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808399 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 19808300  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19808299 gagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 19808253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22758923 - 22758580
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22758923 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgaggaataagatgacgtttagctccaaatt 22758824  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22758823 attggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 22758724  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22758723 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg-ttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 22758625  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22758624 gagaattgtcgcattgtcatgtctagtatgttatgttgttgatga 22758580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 285; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 23 - 367
Target Start/End: Original strand, 34370007 - 34370351
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34370007 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgaagaataagatgacgtttagcttcaaatt 34370106  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34370107 attggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 34370206  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34370207 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaagtatattaatacttatgatgacgattgttaccacatgcatataaggagtctaa 34370306  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34370307 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgttatgttgttgatga 34370351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Original strand, 34298670 - 34298995
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  34298670 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 34298769  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  34298770 atatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 34298864  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34298865 t-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 34298963  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34298964 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 34298995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 38 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 34832713 - 34832385
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  34832713 tgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgga-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttg 34832615  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34832614 atatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcatttcattaagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacg 34832515  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgca 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34832514 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcaca 34832415  T
Q  336 ttgtcatgtctaatatgctatgttgttgat 365  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  34832414 ttgtcatgtccataatgctatgttgttgat 34832385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4167990 - 4167652
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat----gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| | | |||||||||||||||||||||||||    
T  4167990 tgttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgga 4167892  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167891 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 4167792  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4167791 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggattctaagagca 4167692  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4167691 ttgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 4167652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4208670 - 4208332
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat----gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| | | |||||||||||||||||||||| ||    
T  4208670 tgttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattaga 4208572  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4208571 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 4208472  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4208471 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 4208372  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4208371 ttgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 4208332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 3708524 - 3708858
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatat--atgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatg 130  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  3708524 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtatatgtgtatgatgaa-atgatgatgtttagctccaaattattggatg 3708622  T
Q  131 ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctc 229  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3708623 catattgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctc 3708721  T
Q  230 cgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcatt 329  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3708722 cgcacgatttatc-ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcatt 3708820  T
Q  330 gtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3708821 gtcgcattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 3708858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 33 - 325
Target Start/End: Original strand, 17037375 - 17037666
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  17037375 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatgtatgatgaaaaagatgacgtttagctccaaattattggatgca 17037474  T
Q  133 gactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccg 231  Q
     | ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17037475 cattgatatgatgattacggtgttttgttgataagagtccatgca-tagcatatcattgagcttagtcctcaccacaattattaggagctttgtcctccg 17037573  T
Q  232 cacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 325  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17037574 cacg-tttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 17037666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 86 - 367
Target Start/End: Original strand, 24291143 - 24291422
Alignment:
Q  86 tatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat- 184  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| |||||     
T  24291143 tatatatgatgaa-atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatc 24291240  T
Q  185 tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatactta 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24291241 tcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatactta 24291339  T
Q  285 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24291340 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 24291422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 86 - 367
Target Start/End: Original strand, 31317183 - 31317462
Alignment:
Q  86 tatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat- 184  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| |||||     
T  31317183 tatatatgatgaa-atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatc 31317280  T
Q  185 tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatactta 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31317281 tcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatactta 31317379  T
Q  285 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  31317380 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 31317462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 33 - 343
Target Start/End: Original strand, 1545085 - 1545394
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  1545085 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgtaatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgca 1545184  T
Q  133 gactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctcc 230  Q
       |||| | | ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1545185 tgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctcc 1545282  T
Q  231 gcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1545283 gcacg-tttattaggagctttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 1545381  T
Q  331 tcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||    
T  1545382 tcgcattgtcatg 1545394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 86 - 367
Target Start/End: Original strand, 24315171 - 24315450
Alignment:
Q  86 tatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat- 184  Q
    ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| | |||     
T  24315171 tatatatgatgaa-atgatgatgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcataa-catc 24315268  T
Q  185 tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatactta 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24315269 tcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatactta 24315367  T
Q  285 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  24315368 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 24315450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 49 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25117491 - 25117173
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctata--tatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttga 146  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| |||||    ||||||| |||    
T  25117491 tatgctgctgccgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaa-atgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatga 25117393  T
Q  147 tttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattagg 245  Q
    || || || |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  25117392 ttacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattaagtttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttat-agg 25117295  T
Q  246 agctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtc 345  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25117294 agctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtc 25117195  T
Q  346 taatatgctatgttgttgatga 367  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  25117194 caaaatgctatgttgttgatga 25117173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 33 - 343
Target Start/End: Original strand, 1538986 - 1539295
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   || | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  1538986 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgataatgtgtaatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgca 1539085  T
Q  133 gactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctcc 230  Q
       |||| | | ||||| || || ||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1539086 tgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccaggcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctcc 1539183  T
Q  231 gcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 330  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1539184 gcacg-tttattaggagttttgtcctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 1539282  T
Q  331 tcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||    
T  1539283 tcgcattgtcatg 1539295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 49 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 25110888 - 25110570
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctata--tatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttga 146  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |||   ||||||||| | | ||| |||||||||||||||||| |||||    ||||||| |||    
T  25110888 tatgctgctgccgttatttaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaa-atgatgaagtttagctccaaattattagatgcatgttgatatgatga 25110790  T
Q  147 tttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattagg 245  Q
    || || || |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  25110789 ttacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattaagtttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttttat-agg 25110692  T
Q  246 agctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtc 345  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25110691 agctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtc 25110592  T
Q  346 taatatgctatgttgttgatga 367  Q
     || |||||||||| |||||||    
T  25110591 caaaatgctatgtttttgatga 25110570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26130468 - 26130236
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26130468 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacg 26130370  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26130369 aatattaggagctttgtcccccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 26130271  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26130270 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 26130236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 2870239 - 2870473
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2870239 gtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 2870337  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2870338 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 2870436  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2870437 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 2870473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 2876854 - 2877088
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2876854 gtttagctccaaattattggatgcatattgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 2876952  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2876953 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 2877051  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2877052 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 2877088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30694363 - 30694131
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||| | || || |||||| ||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  30694363 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgactacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agaatctcattgagcttagtcctcaccacg 30694265  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30694264 aatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 30694166  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30694165 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 30694131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Original strand, 27328160 - 27328419
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27328160 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 27328258  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27328259 cgattattaggagttttgtcctccgcacattttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 27328357  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  27328358 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 27328419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Original strand, 27388900 - 27389159
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27388900 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgctgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 27388998  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27388999 cgattattaggagttttgtcctccgcacattttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 27389097  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  27389098 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 27389159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8797194 - 8796960
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8797194 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 8797096  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8797095 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 8796997  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8796996 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 8796960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 104 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20176934 - 20176669
Alignment:
Q  104 tgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcct 201  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||    |||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20176934 tgacggttatctccaaattattggatgcacgttgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcct 20176836  T
Q  202 caccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatactta-tgatgacgattggta 299  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20176835 caccaagatttttaggagctttgtcctccgcacgaattat-aggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgattggta 20176737  T
Q  300 ccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  20176736 ccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgttatgtccatgatgctatgttgttgatga 20176669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 104 - 367
Target Start/End: Original strand, 5834598 - 5834863
Alignment:
Q  104 tgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcct 201  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||    |||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  5834598 tgacggttatctccaaattattggatgcactttgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcat-agtatctcattgagcttagtcct 5834696  T
Q  202 caccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatactta-tgatgacgattggta 299  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5834697 caccatgatttttaggagctttgtcctccgcacgaattat-aggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgattggta 5834795  T
Q  300 ccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  5834796 ccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgttatgtccataatgctatgttgttgatga 5834863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 104 - 367
Target Start/End: Original strand, 22159057 - 22159322
Alignment:
Q  104 tgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcct 201  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||  | |||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  22159057 tgacggttaactccaaattattggatgcacattgatgtgttgattacggtgtttttgttgttaagagtccatgcat-agaatctcattgagcttagtcct 22159155  T
Q  202 caccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatactta-tgatgacgattggta 299  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22159156 caccaagatttttaggagctttgtcctccgcacgaattat-aggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttaatgatgacgattggta 22159254  T
Q  300 ccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |  ||||||||||||||||||    
T  22159255 ccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgttatatccataatgctatgttgttgatga 22159322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 16552183 - 16552395
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16552183 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 16552280  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16552281 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 16552380  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  16552381 tttgttgatgatgat 16552395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16576770 - 16576558
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16576770 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 16576673  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16576672 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 16576573  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  16576572 tttgttgatgatgat 16576558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 16618610 - 16618822
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16618610 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 16618707  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16618708 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 16618807  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  16618808 tttgttgatgatgat 16618822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 16628739 - 16628951
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16628739 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 16628836  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  16628837 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 16628936  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  16628937 tttgttgatgatgat 16628951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 17017085 - 17017297
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17017085 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 17017182  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17017183 cctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 17017282  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||| |||||||    
T  17017283 tatgttgatgatgat 17017297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 32565405 - 32565617
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32565405 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 32565502  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  32565503 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 32565602  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  32565603 tttgttgatgatgat 32565617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Original strand, 27430387 - 27430646
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | | ||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27430387 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 27430484  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27430485 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 27430583  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  27430584 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 27430646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6980662 - 6980429
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6980662 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 6980565  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6980564 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 6980466  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6980465 catatgaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 6980429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20060652 - 20060418
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20060652 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagctttgtcctcacca 20060554  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060553 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 20060455  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20060454 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 20060418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 20649895 - 20650128
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20649895 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 20649992  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649993 cgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 20650091  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20650092 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 20650128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28314508 - 28314322
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28314508 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 28314411  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28314410 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 28314322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27185647 - 27185461
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27185647 tttgttgttgagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 27185550  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27185549 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 27185461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27207483 - 27207297
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27207483 tttgttgttgagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 27207386  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27207385 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 27207297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 27241745 - 27241931
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27241745 tttgttgttgagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 27241842  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27241843 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 27241931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 27263593 - 27263779
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27263593 tttgttgttgagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 27263690  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27263691 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 27263779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 28287310 - 28287124
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28287310 tttgttcataagtgtccatgcatta-catatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 28287213  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28287212 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 28287124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 111 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12762702 - 12762472
Alignment:
Q  111 tagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacga 209  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12762702 tagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacga 12762604  T
Q  210 ttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 309  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12762603 aaattaggagctttgtcctccgcacg-tttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcat 12762506  T
Q  310 ataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12762505 aaaaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 12762472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 20801759 - 20801501
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| ||  | |||||  ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20801759 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgaagttttgtccatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 20801662  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20801661 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 20801563  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  20801562 catataatgagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 20801501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 169 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30597168 - 30596997
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  30597168 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatta 30597071  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30597070 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 30596997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8228821 - 8228635
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8228821 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 8228724  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8228723 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 8228635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18931010 - 18930824
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18931010 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 18930913  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18930912 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 18930824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 28258606 - 28258792
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28258606 tttgttcataagtgtccatgcatta-catatcattgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 28258703  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28258704 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 28258792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 28265230 - 28265416
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28265230 tttgttcataagtgtccatgcatta-catatcattgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 28265327  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28265328 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 28265416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 28337355 - 28337541
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28337355 tttgttcataagtgtccatgcatta-catatcattgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 28337452  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28337453 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 28337541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 28343979 - 28344165
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28343979 tttgttcataagtgtccatgcatta-catatcattgagcttagtcttcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 28344076  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28344077 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 28344165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 29587852 - 29588038
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29587852 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 29587949  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29587950 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 29588038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 29593993 - 29594179
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29593993 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 29594090  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29594091 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 29594179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 30638315 - 30638488
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  30638315 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatta 30638412  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30638413 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 30638488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 190 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14098507 - 14098337
Alignment:
Q  190 gagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgat 288  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  14098507 gagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg-tttattaggagctttgtcctcctcacgattaaagtatatttatacttctgat 14098409  T
Q  289 gacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14098408 gacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctaagatgctttgttg 14098337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11566698 - 11566410
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  11566698 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 11566600  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  11566599 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 11566505  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11566504 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 11566410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 12619112 - 12619400
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  12619112 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 12619210  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  12619211 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 12619305  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12619306 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12619400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14098691 - 14098457
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  14098691 tgttatgtgacttgactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtttatgtatgaggaacatgatgacgtttagctccaaattattggatgca 14098592  T
Q  133 gactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctcc 230  Q
       |||| | | ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||     
T  14098591 tgttgattacggtgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaagagctttgtcctct 14098494  T
Q  231 gcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14098493 gcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 14098457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19870426 - 19870138
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  19870426 ttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagagcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 19870328  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  19870327 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattatggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 19870233  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19870232 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19870138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23394904 - 23394616
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  23394904 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 23394806  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  23394805 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 23394711  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23394710 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23394616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23989756 - 23989468
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  23989756 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 23989658  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  23989657 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtggtttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 23989563  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989562 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23989468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16760011 - 16759817
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgatt 211  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  16760011 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatt 16759913  T
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 311  Q
    |   |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16759912 a---ggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 16759820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22948824 - 22948631
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  22948824 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 22948729  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22948728 ttaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 22948633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22952780 - 22952587
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  22952780 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 22952685  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22952684 ttaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 22952589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23414646 - 23414453
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23414646 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta 23414548  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23414547 ---ggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 23414455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23871268 - 23871075
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  23871268 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 23871173  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23871172 ttaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 23871077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23875224 - 23875031
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  23875224 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 23875129  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23875128 ttaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 23875033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 210
Target Start/End: Original strand, 25595394 - 25595572
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatg 130  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25595394 tgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgcctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatg 25595492  T
Q  131 ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgat 210  Q
    |    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25595493 catgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgat 25595572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 168 - 340
Target Start/End: Original strand, 25135830 - 25135996
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||    
T  25135830 agtccatgcattaacattcattgagctttgtcctcaccatgatta---ggagctttgtcctccgcacgattta---ggagctttgtcctccgcacgatta 25135923  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  25135924 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 25135996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 1587859 - 1588056
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||    
T  1587859 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccacacg 1587953  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
     ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  1587954 tttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgc 1588049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 27416292 - 27416484
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27416292 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta 27416390  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27416391 ---ggagctttgtcctccgcacgat-----aggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 27416482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 5616920 - 5617113
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||      
T  5616920 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat-- 5617016  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
      |||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5617017 --aggagctttgtcctccacacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 5617111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22862782 - 22862494
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg---atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    ||||||||||| | |||| || |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||  | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  22862782 ttgttgtgtgatttgactgtgatactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattgaaatgatgacgtttagctccaaattattgga 22862683  T
Q  129 tgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattagga 218  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |   ||||||||| || ||||||||||||||||   |||    
T  22862682 tgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatttcattgagttttgtcctcaccacgatta---gga 22862587  T
Q  219 gctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22862586 gctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 22862494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8243594 - 8243381
Alignment:
Q  104 tgacgtttagctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgag 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8243594 tgacgtttagctccaaattattggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgag 8243497  T
Q  193 cttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacg 292  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  8243496 ctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttca---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacg 8243403  T
Q  293 attggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8243402 attggtaccacatgcatataag 8243381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 239 - 343
Target Start/End: Original strand, 4233705 - 4233809
Alignment:
Q  239 tattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4233705 tattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattg 4233804  T
Q  339 tcatg 343  Q
    |||||    
T  4233805 tcatg 4233809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 157 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27556360 - 27556211
Alignment:
Q  157 ttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcct 256  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||| ||    | |||||||||||||||||    
T  27556360 ttgttgata-gagttcatgcattagcattcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccaca----tgattaggagctttgtcct 27556269  T
Q  257 ccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27556268 ccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 27556211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 242 - 343
Target Start/End: Original strand, 14053795 - 14053896
Alignment:
Q  242 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtca 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  14053795 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtca 14053894  T
Q  342 tg 343  Q
    ||    
T  14053895 tg 14053896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 20803711 - 20803852
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||  |||| ||||   |||||||||||||||||| | |    
T  20803711 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctctacacgtttta---ggagctttgtcctccgcatgat 20803803  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20803804 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 20803852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Original strand, 9482450 - 9482588
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    |||||||||| |||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  9482450 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttctcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 9482541  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482542 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9482588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12496257 - 12496117
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    | |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||| |||||| |    
T  12496257 agagtccatgcattagcattcactgagctttgtcctcacca----tgttaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtccttcgcacgat 12496166  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12496165 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12496117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 21702232 - 21702068
Alignment:
Q  170 tccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaa 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    || ||| |||||||||| ||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21702232 tccatgcattagcattcattgagctttgtccttaccatga----taagagatttgtcctccacacg---ttttaggagctttgtcctccgcacgattaaa 21702140  T
Q  270 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    
T  21702139 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 21702068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12706689 - 12706498
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |    
T  12706689 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctctgtcctcgccacgatca 12706591  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
        |||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12706590 ----gagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12706500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16741206 - 16741016
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||      
T  16741206 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatc- 16741109  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16741108 ---ggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 16741018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Original strand, 18917706 - 18917918
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataa--ggtgacgtttagctccaaattattggat 129  Q
    ||||||||||||| |||| |||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18917706 ttgttgtgtgacttgactgtgctatggctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat-atgaggaaatgatgacgtttagctccaaattattggat 18917804  T
Q  130 gc-tgactgatatgttgatttcg---------gtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggag 219  Q
    || ||| ||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||  |||||||    
T  18917805 gcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacc---atgtttaggag 18917900  T
Q  220 ctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18917901 ctttgtcctccgcacgat 18917918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Original strand, 31478378 - 31478542
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttatt 242  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||| ||||      
T  31478378 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgttta---ggagctttgtccttcgcacgtttta-- 31478471  T
Q  243 aggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31478472 -ggagctttgtcctctgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaaatgcatataag 31478542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19662715 - 19662579
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    || ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| |||    
T  19662715 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatg----ttcggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgatta 19662625  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19662624 aagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19662579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1644157 - 1644058
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644157 attaggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 1644061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14471860 - 14471761
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14471860 attaggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 14471764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16624001 - 16623902
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624001 attaggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 16623905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Original strand, 27325776 - 27325950
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||  ||||||      |||||||||| |    
T  27325776 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatc-----ggagctttgttc 27325865  T
Q  256 tccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  27325866 tccacacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 27325950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Original strand, 2685478 - 2685614
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |    || ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| |||    
T  2685478 agtccatgcattagcattcattgacctttgtcctcaccatg----ttcggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgatta 2685568  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2685569 aagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 2685614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 17804145 - 17803971
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  17804145 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 17804056  T
Q  256 tccgcacgtt--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  17804055 tccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 17803971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 241 - 314
Target Start/End: Original strand, 18917894 - 18917967
Alignment:
Q  241 ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18917894 ttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18917967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 108 - 238
Target Start/End: Original strand, 4233602 - 4233732
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4233602 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 4233700  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4233701 caaatattaggagctttgtcctccgcacgatt 4233732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 22430185 - 22430327
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcac--- 262  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||||| |||       
T  22430185 agagtccatgcattagcatacaatgagctttgtcctcaccacgatttt---gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcctccccacgat 22430276  T
Q  263 gtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22430277 gcttaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 22430327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 23 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16371930 - 16371861
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat 92  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16371930 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatat 16371861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16624090 - 16624022
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16624090 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta 16624022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 282
Target Start/End: Original strand, 25767326 - 25767445
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  25767326 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcatcaccaagatt----tgagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 25767415  T
Q  256 tccgcac---gtttaaagtatattaatact 282  Q
    ||| |||   | ||||||||||||||||||    
T  25767416 tccccacgatgcttaaagtatattaatact 25767445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1644246 - 1644182
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  1644246 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacg 1644182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 8243697 - 8243637
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat 92  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8243697 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat 8243637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 130
Target Start/End: Original strand, 20908039 - 20908120
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatg 130  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  20908039 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacatgatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatg 20908120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 14471937 - 14471885
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14471937 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagctttgtcctcaccacg 14471885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 195
Target Start/End: Original strand, 22592960 - 22592989
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagctt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22592960 agagtccatgcattagcattcattgagctt 22592989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Original strand, 27553663 - 27553728
Alignment:
Q  83 gtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatt 148  Q
    ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  27553663 gtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgatt 27553728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18906907 - 18906859
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  18906907 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 18906859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 105)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 15441989 - 15442335
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15441989 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaatt 15442088  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15442089 attggatgcatattgatatgatgattacagtgaattgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 15442188  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15442189 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 15442288  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15442289 gagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 15442335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 14359852 - 14360198
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14359852 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaact 14359951  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14359952 attggatgcatattgatatgatgattacggtggtttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 14360051  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14360052 tgtcctccgcacgatttattatgagttttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 14360151  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14360152 gagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 14360198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Original strand, 23337323 - 23337669
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| | ||||||||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  23337323 atcatcctattgttgtgttacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttggctccaaatt 23337422  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23337423 attggatgcatattgatatgatgattacagtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagctcagtcctcaccgcgattattaggagctt 23337522  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23337523 tgtactccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcatataaggagtctaa 23337622  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23337623 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 23337669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Original strand, 22325967 - 22326306
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  22325967 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgccgttatttaactaagtgcataatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 22326065  T
Q  128 atgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtc 226  Q
    ||||  | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22326066 atgcatattgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtc 22326165  T
Q  227 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagc 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22326166 ctccgcacgatttattaagagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagc 22326265  T
Q  327 attgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22326266 attgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 22326306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Original strand, 21295310 - 21295635
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  21295310 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 21295409  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  21295410 atatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 21295504  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21295505 t-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 21295603  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21295604 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 21295635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25535047 - 25534722
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||    
T  25535047 tgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttaactccaaattattggatgcatattg 25534948  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  25534947 atatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 25534853  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25534852 t-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 25534754  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25534753 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 25534722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24554593 - 24554265
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  24554593 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 24554494  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  24554493 atatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgat----aggagctttgtcctccgcacgat 24554399  T
Q  238 t--tattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgca 335  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24554398 tatttttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggaatctaagagcattgtcgca 24554299  T
Q  336 ttgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24554298 ttgtcgtgtctaagatgttatgttgttgatgatg 24554265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22343562 - 22343224
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggat 129  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||| | | |||||||||||||||||||||| |||    
T  22343562 tgttgttgtgtgacttgactgtgctattgctgttatttaactaagtgcatattgtattcatacgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattagat 22343464  T
Q  130 gctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcc 227  Q
    ||    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22343463 gcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtcc 22343365  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22343364 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagc 22343265  T
Q  327 attgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22343264 attgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 22343224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22352962 - 22352624
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggat 129  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  22352962 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatattgtattcatacgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggat 22352864  T
Q  130 gctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcc 227  Q
    ||    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22352863 gcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcttcaccacgatttattaggagctttgtcc 22352765  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22352764 tccgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagc 22352665  T
Q  327 attgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22352664 attgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 22352624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 49 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 24020330 - 24020013
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgt-ctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgat 147  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||    
T  24020330 tatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtactttatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgat 24020232  T
Q  148 ttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggag 247  Q
    | || ||||||||| |||||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  24020231 tacgatgatttgttcataagaatccatgcataacatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtactccgtacgatttat-aggag 24020133  T
Q  248 ctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta 347  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  24020132 ctttgtcctccgcacgattaaaatatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatgtcca 24020033  T
Q  348 atatgctatgttgttgatga 367  Q
      ||||||||||||||||||    
T  24020032 taatgctatgttgttgatga 24020013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19768413 - 19768077
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  19768413 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 19768315  T
Q  129 tgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtc 226  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19768314 tgcatga-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctccgcacgattattaggagctttgtc 19768217  T
Q  227 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagc 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19768216 ctccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagc 19768118  T
Q  327 attgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  19768117 attgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 19768077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19775009 - 19774673
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  19775009 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 19774911  T
Q  129 tgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtc 226  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19774910 tgcatga-tgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcttcaccacgtttattaggagctttgtc 19774813  T
Q  227 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagc 326  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19774812 ctccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagc 19774714  T
Q  327 attgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  19774713 attgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 19774673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22139692 - 22139458
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22139692 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtctatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 22139594  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22139593 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 22139495  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22139494 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 22139458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25406427 - 25406193
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25406427 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 25406329  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25406328 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 25406230  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25406229 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 25406193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 37286886 - 37287118
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37286886 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacg 37286984  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37286985 aatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 37287083  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37287084 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 37287118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 37293589 - 37293821
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37293589 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacg 37293687  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37293688 aatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 37293786  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37293787 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 37293821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 29471461 - 29471696
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgattt-cggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29471461 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 29471559  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29471560 acgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 29471658  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29471659 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 29471696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17284070 - 17283836
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17284070 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgtat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 17283972  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17283971 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatatttatgatgacgattggtaccacatg 17283873  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17283872 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 17283836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22133000 - 22132766
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22133000 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatattgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 22132902  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132901 cgtttattaggagctttgtccttcgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 22132803  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22132802 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 22132766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22588098 - 22587864
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22588098 gtttatctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 22588000  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22587999 tgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 22587901  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22587900 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 22587864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Original strand, 41294538 - 41294795
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||| || || ||| |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41294538 gtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttt-tccataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 41294635  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41294636 cgattattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 41294734  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||    
T  41294735 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgttgatga 41294795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 22328268 - 22328500
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22328268 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacg 22328366  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22328367 aatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 22328465  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22328466 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 22328500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23249940 - 23249683
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23249940 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 23249843  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23249842 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 23249744  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  23249743 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 23249683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41769245 - 41768987
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41769245 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 41769147  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41769146 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 41769048  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  41769047 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgttcataatgctatgttgttgatga 41768987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41775819 - 41775561
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41775819 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 41775721  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41775720 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 41775622  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  41775621 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgttcataatgctatgttgttgatga 41775561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 29478056 - 29478291
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgattt-cggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  29478056 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataa-catatcattgagcttagtcctcacc 29478154  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29478155 acgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 29478253  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29478254 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattggcatg 29478291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19991883 - 19991652
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19991883 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcgccacg 19991785  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19991784 aatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 19991686  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19991685 tataa-gagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 19991652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 22341707 - 22341939
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    |||||||||||||||| |||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| | |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  22341707 ttagctccaaattatttgatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgcccatgcat-agcatctcattgagcatagtcctcaccacg 22341805  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341806 aatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 22341904  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22341905 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 22341939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 22410762 - 22410973
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22410762 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 22410859  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgct 354  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22410860 ctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgct 22410959  T
Q  355 atgttgttgatgat 368  Q
    |||||| |||||||    
T  22410960 atgttgatgatgat 22410973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 41098325 - 41098559
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41098325 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 41098423  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41098424 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 41098522  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  41098523 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 41098559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40707124 - 40706890
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40707124 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 40707027  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40707026 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 40706928  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40706927 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 40706890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40713766 - 40713532
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  40713766 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 40713669  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40713668 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 40713570  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40713569 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 40713532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22264947 - 22264713
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||| | || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22264947 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgactacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 22264849  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22264848 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 22264750  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22264749 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 22264713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23584141 - 23583907
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23584141 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 23584043  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23584042 cgaatattaggagctttgtcctccacacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 23583944  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23583943 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 23583907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 27663892 - 27664126
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27663892 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 27663990  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27663991 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtccttcgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 27664089  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27664090 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 27664126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 21667969 - 21668181
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21667969 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 21668066  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21668067 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 21668166  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  21668167 tttgttgatgatgat 21668181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 22258644 - 22258856
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22258644 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 22258741  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22258742 cctccgcacgaataaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 22258841  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||| |||||||    
T  22258842 tatgttgatgatgat 22258856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 22062985 - 22063219
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22062985 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 22063082  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22063083 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 22063181  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22063182 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 22063219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Original strand, 15001784 - 15002042
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15001784 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccac 15001882  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15001883 gaataataggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagcttcgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 15001981  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  15001982 atatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 15002042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 34294655 - 34294889
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||||||||||||| |    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34294655 gtttagctccaaattattggatacatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 34294753  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294754 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 34294852  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34294853 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 34294889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 18038772 - 18039005
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18038772 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccac 18038870  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18038871 gaataataggagctttgtcctccgcacgttttat-atgagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 18038969  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18038970 atatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 18039005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29316361 - 29316149
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  29316361 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacaatt-attaggagctttgt 29316264  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29316263 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 29316164  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  29316163 tttgttgatgatgat 29316149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 37544042 - 37543783
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | | ||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37544042 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 37543945  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37543944 acgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 37543846  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  37543845 gcatataaggagtctaagagcattgtcacagtgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 37543783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27516754 - 27516520
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27516754 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 27516657  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27516656 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgactggtaccacat 27516558  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27516557 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 27516520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27523391 - 27523157
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27523391 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 27523294  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27523293 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgactggtaccacat 27523195  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27523194 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 27523157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 360
Target Start/End: Original strand, 27670532 - 27670782
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27670532 gtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 27670629  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27670630 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 27670728  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttg 360  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  27670729 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttg 27670782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 17707033 - 17707266
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17707033 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 17707130  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17707131 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacttg 17707229  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17707230 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 17707266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 24472350 - 24472583
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24472350 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 24472448  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24472449 cgaatattaggagctt-gtcctccgcacgttttataag-agctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 24472546  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24472547 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 24472583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27608741 - 27608508
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27608741 gtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 27608644  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27608643 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 27608545  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27608544 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 27608508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20775822 - 20775635
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20775822 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgaat-attaggagctttgt 20775725  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20775724 cctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgccacattgtcatg 20775635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Original strand, 1692541 - 1692799
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    |||||||||| ||| |||||||    ||||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1692541 ttagctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat-agcatcttattgagcttagtcctcaccac 1692639  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1692640 gaataataggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 1692738  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  1692739 atatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 1692799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Original strand, 14995141 - 14995399
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14995141 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccac 14995239  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14995240 gaataataggagctttgtcctccgcacgttttat-aggaccttcgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 14995338  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  14995339 atgtagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 14995399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27615347 - 27615114
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27615347 gtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 27615250  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27615249 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 27615151  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27615150 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 27615114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16354778 - 16354592
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16354778 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 16354681  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16354680 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 16354592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16361437 - 16361251
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16361437 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 16361340  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16361339 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 16361251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Original strand, 27687433 - 27687691
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    |||||||||| ||| |||||||    ||||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27687433 ttagctccaatttaatggatgcgtgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccac 27687531  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27687532 gaataataggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcatccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 27687630  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  27687631 atatagggagtctaagagcattgtcacgttgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 27687691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33725860 - 33725626
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  33725860 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcataacattgagctttgtcctcacca 33725762  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33725761 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 33725663  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  33725662 catatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 33725626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34564771 - 34564585
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34564771 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 34564674  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34564673 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 34564585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 34571426 - 34571240
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34571426 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 34571329  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34571328 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 34571240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25106704 - 25106531
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  25106704 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatta 25106607  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25106606 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 25106531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25165797 - 25165624
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  25165797 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatta 25165700  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25165699 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 25165624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 314
Target Start/End: Original strand, 19472988 - 19473276
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  19472988 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 19473086  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  19473087 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 19473181  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19473182 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 19473276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 40723977 - 40724174
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40723977 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcttcaccacgatta 40724075  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40724076 ttaggagctttgtcctccgcacg---ttttagaagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 40724172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 15237105 - 15237393
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  15237105 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 15237203  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  15237204 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 15237298  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15237299 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15237393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20295683 - 20295395
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  20295683 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 20295585  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  20295584 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 20295490  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20295489 gagctttgtcctcctcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 20295395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 337
Target Start/End: Original strand, 21885317 - 21885510
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  21885317 tgataagttgattaaggtggtttgttgttaa-agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacg 21885412  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
         ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  21885413 ----tttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatataa-gagtctaagttgcattgtcgc 21885507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 25229534 - 25229731
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    ||||||||||||||||| ||||    
T  25229534 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcactatga----taggagctttgtcctccacacg 25229628  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
       | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  25229629 ---ttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgc 25229724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 25293690 - 25293887
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    ||||||||||||||||| ||||    
T  25293690 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcactatga----taggagctttgtcctccacacg 25293784  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
       | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  25293785 ---ttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgc 25293880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 157 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11220420 - 11220271
Alignment:
Q  157 ttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcct 256  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  11220420 ttgttgata-gagtccatgcattaacattcattgagctttgtcctgaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcct 11220329  T
Q  257 ccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11220328 ccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 11220271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 157 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11230818 - 11230669
Alignment:
Q  157 ttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcct 256  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  11230818 ttgttgata-gagtccatgcattaacattcattgagctttgtcctgaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcct 11230727  T
Q  257 ccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11230726 ccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 11230669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 340
Target Start/End: Original strand, 17730535 - 17730731
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||    
T  17730535 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccacacg 17730629  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
     ||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  17730630 tttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgc 17730725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18355958 - 18355765
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18355958 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gaggccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta 18355860  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18355859 ---ggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgaagattggtaccacatgcatata 18355767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4036167 - 4035999
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| |    
T  4036167 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccacacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgat 4036075  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtca 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    
T  4036074 taaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 4035999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33409177 - 33409036
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||     ||||||| ||||||||||||||| |    
T  33409177 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagttttgtcctccgcacgat 33409085  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33409084 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 33409036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 157 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11225006 - 11224857
Alignment:
Q  157 ttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcct 256  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  11225006 ttgttgata-gagtccatgcattaacattcattgagctttgtcctgaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcct 11224915  T
Q  257 ccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11224914 ccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataag 11224857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 157 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11228829 - 11228680
Alignment:
Q  157 ttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcct 256  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  11228829 ttgttgata-gagtccatgcattaacattcattgagctttgtcctgaccac---aattaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcct 11228738  T
Q  257 ccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11228737 ccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 11228680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 21340924 - 21341064
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    ||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||| |    
T  21340924 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcac----ttttaggagctttgtcctccgcacgat 21341015  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21341016 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21341064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 239 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23609802 - 23609698
Alignment:
Q  239 tattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23609802 tattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattg 23609703  T
Q  339 tcatg 343  Q
    |||||    
T  23609702 tcatg 23609698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 239 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23841198 - 23841094
Alignment:
Q  239 tattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23841198 tattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattg 23841099  T
Q  339 tcatg 343  Q
    |||||    
T  23841098 tcatg 23841094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26172442 - 26172249
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  26172442 tgataagttgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgtattagcattcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacg 26172347  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
         ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  26172346 ----tttaggagctctgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatataa-gagtctaagttgcattgtcgc 26172252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10752902 - 10752738
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttatta 243  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |   ||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||       
T  10752902 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcataacatttcattgggctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta--- 10752809  T
Q  244 ggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10752808 ggagctttgtcctccgcacgatgaaaatatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 10752738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 157 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11226839 - 11226690
Alignment:
Q  157 ttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcct 256  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  11226839 ttgttgata-gagttcatgcattaacattcattgagctttgtcctgaccacg---attaagagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcct 11226748  T
Q  257 ccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11226747 ccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 11226690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16674101 - 16673961
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    |||||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  16674101 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctctgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 16674010  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16674009 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatacatataag 16673961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 242 - 368
Target Start/End: Original strand, 27680923 - 27681049
Alignment:
Q  242 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtca 341  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27680923 taggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaagagcattgtcacgttgtca 27681022  T
Q  342 tgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  27681023 tgattaagatgccttgttgatgatgat 27681049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Original strand, 26742852 - 26743068
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||      
T  26742852 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatc- 26742949  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26742950 ---ggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattgataccacatgcatata 26743040  T
Q  313 aggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    | | |||||||  ||||||||||||||||    
T  26743041 a-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 26743068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18774203 - 18774013
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||      
T  18774203 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtttcgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatc- 18774106  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||| | ||||||     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18774105 ---ggagctttgtccttcacacgat-----aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 18774015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18784046 - 18783856
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||      
T  18784046 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtttcgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccatgatc- 18783949  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18783948 ---ggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 18783858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 42805420 - 42805230
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||      
T  42805420 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatc- 42805323  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42805322 ---ggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-aatgatgacgattggtaccacatgcatata 42805232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20232497 - 20232361
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    || ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| |||    
T  20232497 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatg----ttcggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgatta 20232407  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20232406 aagtatattaatac-tatgatgacgattggtatcacatgcatataag 20232361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 20911275 - 20911492
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt- 211  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     
T  20911275 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta 20911373  T
Q  212 --------------------attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgac 291  Q
                        |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20911374 ggagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttt----aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgac 20911469  T
Q  292 gattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  20911470 gattggtaccacatgcatataag 20911492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Original strand, 26666290 - 26666426
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    || |||||||| |||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| |||    
T  26666290 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatg----ttcggagctttatcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgatta 26666380  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26666381 aagtatattaatac-tatgatgacgattggtactacatgcatataag 26666426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Original strand, 26937887 - 26938023
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    || |||||||| |||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| |||    
T  26937887 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatg----ttcggagctttatcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgatta 26937977  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26937978 aagtatattaatac-tatgatgacgattggtactacatgcatataag 26938023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23609905 - 23609775
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23609905 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 23609807  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23609806 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgatt 23609775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 108 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23841301 - 23841171
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23841301 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 23841203  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23841202 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgatt 23841171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Original strand, 24533207 - 24533343
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||    |||||||||||||||  |||||     |||||||||||||||| |||| |||    
T  24533207 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgttt----ggagctttgtcctccatacgat-----aggagctttgtcctccacacgatta 24533297  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24533298 aaatatattaatac-tatgatgacgattgataccacatgcatataag 24533343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Original strand, 24767711 - 24767882
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||     ||||| ||||||||| ||||||     |||||||||||||    
T  24767711 tttgttgata-gaatccatgcattagcatacattgatctttgtcctcaccacgatc----ggagccttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcc 24767800  T
Q  256 tccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  24767801 tccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 24767882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 244 - 315
Target Start/End: Original strand, 23535791 - 23535861
Alignment:
Q  244 ggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagg 315  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23535791 ggagcttcgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatcacgattgataccacatgcatataagg 23535861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 23535736 - 23535813
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    ||||||| ||||||| |||||||    
T  23535736 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatt----ggagcttcgtcctccccacgatt 23535813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31342206 - 31342124
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgc 131  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  31342206 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgc 31342124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 24221936 - 24221837
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgat 147  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| || |||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  24221936 tatgctgctgctgttatttaactaggttgcatga-gtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgat 24221838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 283 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17410309 - 17410278
Alignment:
Q  283 tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410309 tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 17410278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 367
Target Start/End: Original strand, 25808517 - 25808568
Alignment:
Q  316 agtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  25808517 agtctaagagtattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 25808568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680559
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgc 131  Q
    ||||||| || | |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga-gtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgc 26680559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952166
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgc 131  Q
    ||||||| || | |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatga-gtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgc 26952166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17410378 - 17410336
Alignment:
Q  167 gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacga 209  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  17410378 gagtccatgcattagcatatattgagctttgtcctcaccacga 17410336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 154)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 23 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7985778 - 7985434
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7985778 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaatt 7985679  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    ||||| |||    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7985678 attgggtgcatgttgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 7985579  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7985578 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttttgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 7985479  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7985478 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 7985434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 23 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10325924 - 10325580
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagg-tgacgtttagctccaaat 121  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10325924 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaagatgacgtttagctccaaat 10325825  T
Q  122 tattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagct 221  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||| || |  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325824 tattggatgcttattgatatgatgattacgattttttgttgata-gagttcatgcattagcattcattgagtttagtcctcaccacgattattaggagct 10325726  T
Q  222 ttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtcta 321  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325725 ttgtcctccacacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtcta 10325626  T
Q  322 agagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10325625 agagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 10325580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16333244 - 16332906
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16333244 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgataaataagatgacgtttagctccaaatt 16333145  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16333144 attggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattatcaggagttt 16333045  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16333044 tgtcctccgcatgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 16332945  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    |||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16332944 gagcattgtcg--------tgtctaagatgctatgttgttgatgatg 16332906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13321036 - 13320702
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  13321036 tgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgca 13320938  T
Q  133 gactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgc 232  Q
       ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13320937 tgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgc 13320838  T
Q  233 acgatttattaggagctttgtcctccgcacg-tttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgt 331  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13320837 acaacttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgt 13320738  T
Q  332 cgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13320737 cacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 13320702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12891471 - 12891131
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  12891471 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 12891373  T
Q  128 atgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtc 226  Q
    ||||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12891372 atgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtc 12891273  T
Q  227 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12891272 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 12891173  T
Q  326 cattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12891172 cattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 12891131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Original strand, 17253097 - 17253437
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  17253097 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 17253195  T
Q  128 atgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtc 226  Q
    ||||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17253196 atgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtc 17253295  T
Q  227 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17253296 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 17253395  T
Q  326 cattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  17253396 cattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 17253437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 24187836 - 24187511
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  24187836 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 24187737  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  24187736 atatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 24187642  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24187641 t-attaggagctttgtcctccgcaagtttaaagtatattaacacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 24187543  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24187542 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 24187511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 55149037 - 55148712
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  55149037 tgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 55148938  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  55148937 atatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 55148843  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55148842 t-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccatatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 55148744  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55148743 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 55148712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 839305 - 838980
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  839305 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaa-tgcataatgtctatatataatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcacattg 839207  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||||| |||||    
T  839206 atatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcactcattgagcttagtcctcaccacgat----aggagttttgtcctccgtacgat 839111  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  839110 t-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataagaattctaagagcattgtcgcatt 839012  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  839011 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 838980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 49 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15825711 - 15825395
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatt 148  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  15825711 tatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatt 15825613  T
Q  149 tcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggag 247  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15825612 acggtgatttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggag 15825515  T
Q  248 ctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta 347  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  15825514 ctttgtcctccacatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtcca 15825415  T
Q  348 atatgctatgttgttgatga 367  Q
      ||||||||||||||||||    
T  15825414 tgatgctatgttgttgatga 15825395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 49 - 367
Target Start/End: Original strand, 10236452 - 10236768
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatt 148  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  10236452 tatgctgctgctgttatttaactaagtgcatggtgtatttatatgatgaact-gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatt 10236550  T
Q  149 tcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggag 247  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10236551 acggtgatttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctgcgcacgatttat-aggag 10236648  T
Q  248 ctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  10236649 ctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtcca 10236748  T
Q  348 atatgctatgttgttgatga 367  Q
      ||||||||||||||||||    
T  10236749 tgatgctatgttgttgatga 10236768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 49 - 367
Target Start/End: Original strand, 15992161 - 15992477
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatt 148  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  15992161 tatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaact-gatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatt 15992259  T
Q  149 tcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggag 247  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15992260 acggtgatttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattgagtttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggag 15992357  T
Q  248 ctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta 347  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  15992358 ctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagtgcattgtcacattgtcatgtcca 15992457  T
Q  348 atatgctatgttgttgatga 367  Q
      ||||||||||||||||||    
T  15992458 tgatgctatgttgttgatga 15992477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 46 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20723052 - 20722771
Alignment:
Q  46 gactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttg 145  Q
    |||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  20723052 gactatgctgctgttgttatttaaataagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatg 20722953  T
Q  146 atttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattagg 245  Q
    ||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20722952 attacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgatt-attagg 20722859  T
Q  246 agctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcg 333  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20722858 agctttgtcctccacacatttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcg 20722771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 40 - 367
Target Start/End: Original strand, 13316236 - 13316560
Alignment:
Q  40 tgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgat 139  Q
    ||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||||  | | | |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  13316236 tgacttgattatgctgctgctgttatttgactaagtgcatggtatatttatacgatgaatga--tgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgat 13316333  T
Q  140 atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13316334 atgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgttt 13316432  T
Q  239 tattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattg 338  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13316433 tat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattg 13316531  T
Q  339 tcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  13316532 tcatgtccataatgctatgttgttgatga 13316560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 410791 - 411127
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||    
T  410791 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaagttgttgga 410889  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  410890 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 410988  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  410989 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 411087  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  411088 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 411127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 1145592 - 1145928
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  1145592 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 1145690  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1145691 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 1145789  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1145790 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtttaagagca 1145888  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  1145889 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 1145928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 8721196 - 8721532
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  8721196 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 8721294  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8721295 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 8721393  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8721394 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 8721492  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  8721493 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 8721532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 9073083 - 9073419
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  9073083 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 9073181  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9073182 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 9073280  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9073281 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 9073379  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  9073380 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 9073419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 49 - 365
Target Start/End: Original strand, 17710649 - 17710965
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatata--tgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttga 146  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||    
T  17710649 tatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatatatacatgatgaa-atgatgacatttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttga 17710747  T
Q  147 tttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattc-attgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattagg 245  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17710748 ttacggtgatttgttcatatgagtccatgcat-agcattccattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttat-agg 17710845  T
Q  246 agctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtc 345  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17710846 agctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatgtc 17710945  T
Q  346 taatatgctatgttgttgat 365  Q
     |  |||| |||||||||||    
T  17710946 cataatgccatgttgttgat 17710965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 15343645 - 15343981
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  15343645 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 15343743  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15343744 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 15343842  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15343843 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctctgcatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 15343941  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  15343942 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 15343981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 15350289 - 15350625
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  15350289 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 15350387  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15350388 tgcatgttgatatgttgattacgatgtttttttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 15350486  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15350487 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaatagca 15350585  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  15350586 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 15350625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 15366970 - 15367306
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata----atgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || |||| ||||||| ||||||||||||||||||     || | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| | |||    
T  15366970 tgttatgtgacttgattatgatgttgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgtagga 15367068  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15367069 tgcatgttgatatgttgattacgattttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 15367167  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367168 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattagtaccacatgcatataaggagtctaagagca 15367266  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  15367267 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 15367306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 15404535 - 15404871
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata----atgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||     || | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  15404535 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaatttttgga 15404633  T
Q  129 tgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtc 226  Q
    ||| || | |||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15404634 tgcatgtc-gatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtc 15404731  T
Q  227 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagc 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15404732 ctccgcacgattt-ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgaatataaggagtctaagagc 15404830  T
Q  327 attgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||  ||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  15404831 attgtcatattgtcatgtccataatgttatgttgttgatga 15404871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 343
Target Start/End: Original strand, 5150011 - 5150318
Alignment:
Q  35 ttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctga 134  Q
    ||||||||||  | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       
T  5150011 ttgtgtgacttaattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgtaatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatg 5150110  T
Q  135 ctgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgc 232  Q
     |||| | |  |||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5150111 ttgattacgacgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgc 5150208  T
Q  233 acgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtc 332  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5150209 acg-tttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtc 5150307  T
Q  333 gcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||    
T  5150308 gcattgtcatg 5150318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19809091 - 19808757
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctata--tatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatg 130  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||| |||   ||||||||| | | | | ||||||||||||||||||| |||    
T  19809091 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttattgaactaagtgcatattgtatatgagtatgatgaa-atgataaagtttagctccaaattattgaatg 19808993  T
Q  131 ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctc 229  Q
    |    |||||||| |||| || || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19808992 catgttgatatgtcgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctc 19808894  T
Q  230 cgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcatt 329  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19808893 cgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatgcttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcatc 19808795  T
Q  330 gtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  19808794 gtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 19808757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 23704869 - 23705103
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23704869 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 23704967  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23704968 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 23705066  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23705067 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 23705103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 23723325 - 23723559
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23723325 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 23723423  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23723424 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 23723522  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23723523 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 23723559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 23741781 - 23742015
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23741781 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 23741879  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23741880 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 23741978  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23741979 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 23742015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 49 - 343
Target Start/End: Original strand, 41092403 - 41092696
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgat 147  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||  | | | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||| | | ||||    
T  41092403 tatgctgctgctgttatttaactaagtgcatgatgattgtgtgtaatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgat 41092502  T
Q  148 ttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattagga 246  Q
    | || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  41092503 tacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagccttgtcctccgcacg-tttattagga 41092599  T
Q  247 gctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41092600 gctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 41092696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 41201899 - 41202133
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41201899 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 41201997  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41201998 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 41202096  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41202097 catataaggagtttaagagcattgtcacattgtcatg 41202133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 86 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4710309 - 4710030
Alignment:
Q  86 tatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt 185  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4710309 tatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatt 4710212  T
Q  186 -cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatactta 284  Q
     |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4710211 tcattgagcttagtcttcaccacgtttattaggagctttgtcctctgcacgatt-attaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatactta 4710113  T
Q  285 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  4710112 tgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgcaacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 4710030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 15727033 - 15727267
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15727033 gtttagctccaaattattgtatgcatgttgacatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 15727131  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15727132 cgtttattaggagctttgtcctccgcacattttat-aggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 15727230  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15727231 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 15727267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 53380453 - 53380687
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53380453 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 53380551  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53380552 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 53380650  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53380651 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 53380687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 53387105 - 53387339
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53387105 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 53387203  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387204 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 53387302  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53387303 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 53387339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 86 - 367
Target Start/End: Original strand, 30777322 - 30777602
Alignment:
Q  86 tatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgattt-cggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat 184  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||| || ||||||||    ||||||||||| || || || |||||| || ||||||||||||| |||||    
T  30777322 tatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaagttgttggatgcatgttgatatgttgaattacgatgttttgttcatgagagtccatgcat-agcat 30777419  T
Q  185 t-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatactt 283  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30777420 ttcattgagcttagtcctcaccacgtttattagaagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatactt 30777518  T
Q  284 atgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  30777519 atgatgacgattggtaccacatgcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgccatgttgttgatga 30777602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 139 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5221377 - 5221177
Alignment:
Q  139 tatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    |||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5221377 tatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgtt 5221279  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5221278 ttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 5221180  T
Q  338 gtc 340  Q
    |||    
T  5221179 gtc 5221177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 15584883 - 15585094
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15584883 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 15584980  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgct 354  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15584981 ctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgct 15585080  T
Q  355 atgttgttgatgat 368  Q
    |||||| |||||||    
T  15585081 atgttgatgatgat 15585094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 15591541 - 15591752
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15591541 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 15591638  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgct 354  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15591639 ctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgct 15591738  T
Q  355 atgttgttgatgat 368  Q
    |||||| |||||||    
T  15591739 atgttgatgatgat 15591752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Original strand, 26794497 - 26794755
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26794497 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatttgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 26794595  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26794596 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 26794694  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  26794695 catataaggagtctaggagcattgccacattgtcatgttcataatgctatgttgttgatga 26794755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 31422655 - 31422889
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31422655 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 31422753  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31422754 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 31422852  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31422853 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 31422889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 98 - 343
Target Start/End: Original strand, 10153827 - 10154071
Alignment:
Q  98 ataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagctta 196  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  10153827 ataagatgaagtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagctta 10153925  T
Q  197 gtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 296  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10153926 gtcctcaccatgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattg 10154024  T
Q  297 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10154025 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 10154071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 5106986 - 5107220
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  5106986 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacaa 5107084  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5107085 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 5107183  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5107184 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 5107220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 10846386 - 10846620
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||| |  || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10846386 gtttagctccaaattattggatgcatattgataagtttattacaatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 10846484  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10846485 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 10846583  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10846584 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 10846620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37615396 - 37615162
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37615396 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 37615298  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37615297 cgaatattaggagctttgtcctccgcatgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 37615199  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37615198 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 37615162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 5426875 - 5427087
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5426875 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 5426972  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  5426973 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacactgtcatgtctactatgc 5427072  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||| |||||||    
T  5427073 tatgttgatgatgat 5427087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12482372 - 12482160
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12482372 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 12482275  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12482274 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 12482175  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  12482174 tttgttgatgatgat 12482160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 418003 - 417769
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  418003 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 417906  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  417905 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 417807  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  417806 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 417769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 360
Target Start/End: Original strand, 16758673 - 16758924
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || ||||  | || |||||| ||| | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16758673 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggttgttttgttcatacgtgttcatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 16758771  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16758772 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 16758870  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  16758871 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttg 16758924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 20057507 - 20057741
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | | ||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20057507 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 20057604  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20057605 acgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 20057703  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20057704 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 20057741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Original strand, 28368673 - 28368822
Alignment:
Q  220 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28368673 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 28368772  T
Q  320 taagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28368773 taagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 28368822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Original strand, 28376491 - 28376640
Alignment:
Q  220 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28376491 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 28376590  T
Q  320 taagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28376591 taagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 28376640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 220 - 369
Target Start/End: Original strand, 28384313 - 28384462
Alignment:
Q  220 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28384313 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtc 28384412  T
Q  320 taagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28384413 taagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 28384462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6598722 - 6598471
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || || ||| ||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6598722 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgtttcgttcatgtgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 6598624  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6598623 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 6598525  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  6598524 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttg 6598471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6605402 - 6605151
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || || ||| ||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6605402 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgtttcgttcatgtgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 6605304  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6605303 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 6605205  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  6605204 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttg 6605151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13250722 - 13250488
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13250722 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 13250625  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13250624 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 13250526  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13250525 gcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 13250488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13257368 - 13257134
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13257368 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 13257271  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13257270 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 13257172  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13257171 gcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 13257134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 14673303 - 14673537
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14673303 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatacat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 14673400  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14673401 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 14673499  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14673500 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 14673537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 23 - 223
Target Start/End: Original strand, 28351196 - 28351398
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctata--tatgatgaataaggtgacgtttagctccaaa 120  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| || |||  ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28351196 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgccgttatttagctaagtgcataatgtctatatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaa 28351295  T
Q  121 ttattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagc 220  Q
    |||||||||||  | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28351296 ttattggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagc 28351395  T
Q  221 ttt 223  Q
    |||    
T  28351396 ttt 28351398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 3690622 - 3690363
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | | ||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3690622 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 3690525  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3690524 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 3690426  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  3690425 gcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 3690363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5201170 - 5200958
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5201170 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 5201073  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  5201072 cctccgcacgattaaagtatgtttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacagagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 5200973  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  5200972 tttgttgatgatgat 5200958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 5420468 - 5420680
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5420468 tttgttgttaagagtccatgcat-atcatatcattgagcttagtcctcaccacattttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 5420565  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  5420566 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacactgtcatgtctactatgc 5420665  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||| |||||||    
T  5420666 tatgttgatgatgat 5420680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 360
Target Start/End: Original strand, 16747941 - 16748192
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||||| || ||||  | || |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16747941 gtttagctctaaattattggatgcatgttgataagtcgattaggctgttttgttcatacgtgtccatgcat-agcatatcattgagtttagtcctcacca 16748039  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748040 cgaatattaggagctttgtcctccgcacattttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 16748138  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  16748139 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgctttgttg 16748192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 20064145 - 20064379
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | | ||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20064145 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 20064242  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20064243 acgaatatgaggagctttgtcctctgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 20064341  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20064342 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 20064379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26889458 - 26889225
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26889458 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 26889361  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26889360 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 26889262  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  26889261 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 26889225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10010286 - 10010052
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  10010286 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcataacattgagctttgtcctcacca 10010188  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10010187 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 10010089  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10010088 catatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 10010052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 16624157 - 16624391
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16624157 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatgtgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 16624255  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16624256 cgaaaattaggagctttgtcctccgcatgttttat-aggagccttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 16624354  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16624355 catgtaaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 16624391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16633785 - 16633599
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16633785 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 16633688  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16633687 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 16633599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16640395 - 16640209
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16640395 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 16640298  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16640297 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 16640209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43161060 - 43160874
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43161060 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 43160963  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43160962 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 43160874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43167297 - 43167111
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43167297 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 43167200  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43167199 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 43167111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48423289 - 48423116
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  48423289 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatta 48423192  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48423191 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 48423116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 186 - 343
Target Start/End: Original strand, 1333262 - 1333418
Alignment:
Q  186 cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1333262 cattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttat 1333360  T
Q  286 gatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  1333361 gatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 1333418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 165 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6608407 - 6608229
Alignment:
Q  165 aagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgat-tattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcac 262  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  6608407 aagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccacac 6608310  T
Q  263 gtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6608309 gattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcgcattgtcatg 6608229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10003639 - 10003405
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  10003639 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcataacattgagctttgtcctcacca 10003541  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10003540 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 10003442  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||    
T  10003441 catatatggagtctaggagcattgtcacattatcatg 10003405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10904229 - 10903995
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  10904229 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcataacattgagctttgtcctcacca 10904131  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10904130 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacggttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 10904032  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  10904031 catatacggagtctaggaacattgtcacattgtcatg 10903995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10910901 - 10910667
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  10910901 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcataacattgagctttgtcctcacca 10910803  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10910802 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacggttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 10910704  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  10910703 catatacggagtctaggaacattgtcacattgtcatg 10910667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 48430067 - 48429894
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  48430067 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacggaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatta 48429970  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  48429969 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 48429894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 108 - 301
Target Start/End: Original strand, 15692379 - 15692571
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||    ||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15692379 gtttagctccaaattattgtatgcatgttgacatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 15692477  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 301  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15692478 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtacc 15692571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 16489774 - 16490001
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||  | ||||| |||||||||| ||||| |||||     ||||||||||||||    
T  16489774 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtcataagtgtccatgcat-agcatctcatt-----tagtcctcaccacg 16489867  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    | || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16489868 aataataggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 16489966  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16489967 tatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 16490001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 14499164 - 14498876
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  14499164 ttgttgtgtgattggactgtgctactgctattatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 14499066  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgattt---------cggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| |||||||||||||          ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  14499065 atgcatga-tgatatgttgattatgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 14498971  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14498970 gagctttgtcctccgcac-attt--taggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14498876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 217 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15337338 - 15337189
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15337338 gagctttgtcctccgcacgattt-ttaggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 15337240  T
Q  317 gtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  15337239 gtctaagagcattgtcatattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 15337189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 27409914 - 27410202
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  27409914 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 27410012  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  27410013 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 27410107  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27410108 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 27410202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 217 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 15360596 - 15360447
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15360596 gagctttgtcctccgcacgattt-ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 15360498  T
Q  317 gtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||  ||| | ||||| |  ||||||||||||||||||    
T  15360497 gtctaagagcattgtcatatttttatgtccataatgctatgttgttgatga 15360447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15964688 - 15964495
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  15964688 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 15964593  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15964592 ttaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15964497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15968612 - 15968419
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  15968612 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 15968517  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15968516 ttaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15968421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15972536 - 15972343
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  15972536 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 15972441  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15972440 ttaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15972345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30065787 - 30065475
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||  || | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  30065787 tgttattgtgtgacttgactgtgctactgttgttatttaaataagtacatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 30065689  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  30065688 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 30065594  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 316  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  30065593 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagttttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagt 30065497  T
Q  317 gtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    |||||||  |||||||||||||    
T  30065496 gtctaagttgcattgtcgcatt 30065475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 11069907 - 11069619
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  11069907 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 11069809  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  11069808 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 11069714  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11069713 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacctatgatgacgattggtaccacatgcatataag 11069619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 11165799 - 11166087
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  11165799 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 11165897  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  11165898 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 11165992  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11165993 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcatccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 11166087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 55022706 - 55022416
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg------atgaataaggtgacgtttagctccaaattatt 125  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  55022706 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattatt 55022608  T
Q  126 ggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattatt 214  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||      
T  55022607 ggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta-- 55022512  T
Q  215 aggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55022511 -ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 55022416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15617215 - 15616925
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattatt 125  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||     ||||| | | |||| |||||||||||||||||    
T  15617215 tgttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtttatatatatattatgaa-atgatgacatttagctccaaattatt 15617117  T
Q  126 ggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattatt 214  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||      
T  15617116 ggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta-- 15617021  T
Q  215 aggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15617020 -ggagctttgtcctccgcacggttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15616925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 4107667 - 4107957
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg------atgaataaggtgacgtttagctccaaattatt 125  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  4107667 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattatt 4107765  T
Q  126 ggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattatt 214  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||      
T  4107766 ggatgcatga-tgatatattgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta-- 4107861  T
Q  215 aggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4107862 -ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4107957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 4111519 - 4111809
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg------atgaataaggtgacgtttagctccaaattatt 125  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  4111519 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattatt 4111617  T
Q  126 ggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattatt 214  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||      
T  4111618 ggatgcatga-tgatatattgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta-- 4111713  T
Q  215 aggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4111714 -ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4111809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22321503 - 22321215
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  22321503 ttgttgtgtgaattgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 22321405  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  22321404 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 22321310  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321309 gagctttgtcctccgcacgttttg---ggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 22321215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22336558 - 22336270
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  22336558 ttgttgtgtgaattgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 22336460  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  22336459 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 22336365  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22336364 gagctttgtcctccgcacgttttg---ggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 22336270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 367
Target Start/End: Original strand, 15398123 - 15398253
Alignment:
Q  237 tttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  15398123 tttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcatat 15398222  T
Q  337 tgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  15398223 tgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 15398253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7109460 - 7109247
Alignment:
Q  104 tgacgtttagctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgag 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7109460 tgacgtttagctccaaattattggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgag 7109363  T
Q  193 cttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacg 292  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7109362 ctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacg 7109269  T
Q  293 attggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7109268 attggtaccacatgcatataag 7109247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7113395 - 7113182
Alignment:
Q  104 tgacgtttagctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgag 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7113395 tgacgtttagctccaaattattggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgag 7113298  T
Q  193 cttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacg 292  Q
    ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  7113297 ctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacg 7113204  T
Q  293 attggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7113203 attggtaccacatgcatataag 7113182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Original strand, 16750736 - 16750899
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttatt 242  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||        
T  16750736 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgttta---ggagctttgtcctccgcacgatt---- 16750827  T
Q  243 aggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16750828 aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16750899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 239 - 367
Target Start/End: Original strand, 26789010 - 26789138
Alignment:
Q  239 tattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26789010 tattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattg 26789109  T
Q  339 tcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  26789110 tcatgttcataatgctatgttgttgatga 26789138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28949563 - 28949273
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg------atgaataaggtgacgtttagctccaaattatt 125  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  28949563 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattatt 28949465  T
Q  126 ggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattatt 214  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||      
T  28949464 ggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccatgatta-- 28949369  T
Q  215 aggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28949368 -ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgaaaaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 28949273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5223065 - 5222873
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5223065 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta 5222967  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5222966 ---ggagctttgtcctccgcacgat-----aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatata 5222875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Original strand, 16808986 - 16809203
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       
T  16808986 ctccaaattattggatgtctaagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga--- 16809081  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
     ||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16809082 -taggagctttgtcctccacacg----tttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 16809175  T
Q  313 aggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    | | |||||||  ||||||||||||||||    
T  16809176 a-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 16809203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 217 - 343
Target Start/End: Original strand, 22643515 - 22643640
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 316  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22643515 gagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcgtataagga 22643613  T
Q  317 gtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  22643614 gtctaagagcattgtcgcattgtcatg 22643640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 249 - 367
Target Start/End: Original strand, 29695943 - 29696061
Alignment:
Q  249 tttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaa 348  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |     
T  29695943 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccat 29696042  T
Q  349 tatgctatgttgttgatga 367  Q
     ||||||||||||||||||    
T  29696043 gatgctatgttgttgatga 29696061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38814333 - 38814192
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| | |    
T  38814333 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcatgat 38814241  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38814240 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 38814192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 1598636 - 1598777
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  1598636 agagtccatgcattagcgttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctcctcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 1598728  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1598729 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1598777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 3833623 - 3833482
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  3833623 agagtccatgcattaacattcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 3833531  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3833530 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 3833482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 267
Target Start/End: Original strand, 11300871 - 11301021
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11300871 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgataagagtccatgcattagcattcactgagcttagtcctcaccacgatta 11300970  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    ||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11300971 ttaggagttttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgttta 11301021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 15942061 - 15942202
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  15942061 agagttcatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 15942153  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15942154 gaaagtatattaatacttatgataaagattggtaccacatgcatataag 15942202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 16696734 - 16696566
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||   ||  |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||| |||| |    
T  16696734 agagtccatgcattagcattcattgacctttgtcctcacc---atgtttaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccacacgat 16696642  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtca 341  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    
T  16696641 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 16696566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 238
Target Start/End: Original strand, 15397944 - 15398152
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata----atgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||     || | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  15397944 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 15398042  T
Q  129 tgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtc 226  Q
    ||| || | |||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15398043 tgcatgtc-gatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtc 15398140  T
Q  227 ctccgcacgatt 238  Q
    ||||||||||||    
T  15398141 ctccgcacgatt 15398152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 300
Target Start/End: Original strand, 16798159 - 16798336
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       
T  16798159 ctccaaattattggatgtctaagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga--- 16798254  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtac 300  Q
     ||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16798255 -taggagctttgtcctccacacg----tttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtac 16798336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 214 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15464746 - 15464650
Alignment:
Q  214 taggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15464746 taggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 15464651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 141 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 15482635 - 15482448
Alignment:
Q  141 tgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgattta 240  Q
    ||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||  |||||||      
T  15482635 tgttgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt----gagttttgtcctcaccacgatt-- 15482543  T
Q  241 ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag-gagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
       ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||    
T  15482542 ---ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagagtgtctaagttgcattgtcgcatt 15482448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17241918 - 17241782
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    || ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| |||    
T  17241918 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatg----ttcggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgatta 17241828  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17241827 aagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 17241782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 110 - 238
Target Start/End: Original strand, 22643435 - 22643563
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22643435 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcatacgagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacg 22643533  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22643534 attattaggagctttgtcctccgcacgatt 22643563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 214 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12339347 - 12339251
Alignment:
Q  214 taggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12339347 taggagctttgtcctccgcacgatt----agcagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 12339252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15360756 - 15360548
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata----atgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||     || | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  15360756 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 15360658  T
Q  129 tgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtc 226  Q
    ||| || | |||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  15360657 tgcatgtc-gatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagctttgtcctccgcacgatttttaggagctttgtc 15360560  T
Q  227 ctccgcacgatt 238  Q
    ||||||||||||    
T  15360559 ctccgcacgatt 15360548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 369
Target Start/End: Original strand, 31097661 - 31097908
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | |||| ||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||      
T  31097661 ctccaaattattggatgtataagtgatctgttgattaaggtgttttgttgatat-agtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatc- 31097758  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||  ||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31097759 ---ggagtcttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcataaa 31097849  T
Q  313 aggagtctaag-agcattgtcgca-ttgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
      | |||||||  ||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||| |||||||||    
T  31097850 gagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtctaagatgttatgttattgatgatg 31097908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 217 - 314
Target Start/End: Original strand, 4589378 - 4589471
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4589378 gagctttgtcctccccacgatt----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4589471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19775217 - 19775118
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19775217 attaggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 19775121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Original strand, 37440121 - 37440195
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37440121 attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 37440195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 217 - 314
Target Start/End: Original strand, 8489652 - 8489745
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8489652 gagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataag 8489745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 157 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 11854429 - 11854328
Alignment:
Q  157 ttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcct 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||     ||||||||||||||||    
T  11854429 ttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgacgattagcagctttatcctccgcacg----tttaggagctttgtcct 11854334  T
Q  257 ccgcac 262  Q
    ||||||    
T  11854333 ccgcac 11854328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 104 - 238
Target Start/End: Original strand, 4589292 - 4589423
Alignment:
Q  104 tgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggt-gatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| | || | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4589292 tgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgattgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctc 4589390  T
Q  203 accacgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
     |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  4589391 cccacg---attaggagctttgtcctccgcacgatt 4589423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15337498 - 15337290
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata----atgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||||||     || | ||||||||||||| | | |||| |||||||||||||| |||||    
T  15337498 tgttatgtgacttgattatgctactgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaa-atgatgacatttagctccaaattgttgga 15337400  T
Q  129 tgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtc 226  Q
    ||| || | |||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  15337399 tgcatgtc-gatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagctttgtcctccgcacgatttttaggagttttgtc 15337302  T
Q  227 ctccgcacgatt 238  Q
    ||||||||||||    
T  15337301 ctccgcacgatt 15337290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Original strand, 20461658 - 20461832
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  20461658 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcgccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 20461747  T
Q  256 tccgcacgtt---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  20461748 tccccacgatgcgtaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 20461832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Original strand, 7793508 - 7793682
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  7793508 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgaactttgtcctcagcacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 7793597  T
Q  256 tccgcacgtt---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| |   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  7793598 tccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgataacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 7793682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Original strand, 327323 - 327497
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||  || ||||     ||||||||||||    
T  327323 tttgttgata-gagtccatgcatgagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccatgatt-----ggagctttgtcc 327412  T
Q  256 tccgcacgtt--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  327413 tccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 327497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14665352 - 14665178
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  14665352 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt----gagttttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 14665263  T
Q  256 tccgcacgtt--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| || | |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  14665262 tccccatgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 14665178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 284 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4290979 - 4290896
Alignment:
Q  284 atgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  4290979 atgatgacgattggcaccacatgcatataaagtgtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 4290896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 238
Target Start/End: Original strand, 26788907 - 26789037
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  26788907 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatattattgagcttagttctcacca 26789005  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789006 cgtatattaggagctttgtcctccgcacgatt 26789037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 37440026 - 37440147
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  37440026 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 37440121  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  37440122 ttaggagctttgtcctccgcacgatt 37440147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 337
Target Start/End: Original strand, 2897989 - 2898155
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||||| |||| |    
T  2897989 agagtccatgcattagcatacattgatctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcctccccacgat 2898079  T
Q  266 ---taaagtatattaatacttatgatgacg-attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
       ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  2898080 gcttaaagtatattaatact-atgatgaagtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 2898155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14668508 - 14668334
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||     ||| |||||||||  ||| |||     ||||||||||||    
T  14668508 tttgttgata-gagtccatgcattaacatacattgagctttgtcctcaccacgattt----gagttttgtcctcaccacaatt-----ggagctttgtcc 14668419  T
Q  256 tccgcacgtt--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  14668418 tccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 14668334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Original strand, 8489576 - 8489696
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||   |    
T  8489576 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttggt-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctccgcacg---a 8489671  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8489672 ttaggagctttgtcctccgcacgat 8489696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 15464866 - 15464768
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15464866 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta 15464768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 297 - 343
Target Start/End: Original strand, 15711579 - 15711625
Alignment:
Q  297 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15711579 gtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 15711625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 210
Target Start/End: Original strand, 15850232 - 15850285
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgat 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15850232 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgat 15850285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 12339467 - 12339375
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12339467 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gaggccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacca 12339375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 14572431 - 14572376
Alignment:
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 323  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14572431 aagtatattaatacttattacgatgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 14572376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 324
Target Start/End: Original strand, 14577112 - 14577166
Alignment:
Q  270 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaaga 324  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14577112 gtatattaatacttattacgatgattggtaccacatgcatataagacgtctaaga 14577166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11854289 - 11854239
Alignment:
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||    
T  11854289 ttaggagctttgtcctccgcacgact----aggagctttgtcctccgcacgttta 11854239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19775306 - 19775242
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19775306 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacg 19775242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 314
Target Start/End: Original strand, 49668364 - 49668411
Alignment:
Q  267 aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  49668364 aaagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataag 49668411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9512752 - 9512706
Alignment:
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  9512752 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataag 9512706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9520727 - 9520681
Alignment:
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  9520727 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataag 9520681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16103612 - 16103566
Alignment:
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  16103612 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataag 16103566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11854313 - 11854267
Alignment:
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||    
T  11854313 ttaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacg 11854267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 148
Target Start/End: Original strand, 11557442 - 11557541
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgat 147  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  11557442 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga-gtttatacatgatgaataagatgttgctgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgat 11557540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11849111 - 11849063
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  11849111 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 11849063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 11862589 - 11862541
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  11862589 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 11862541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 336
Target Start/End: Original strand, 14878839 - 14878883
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcat 336  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  14878839 attggtaccacatgcatataagaagtctaagttgcattgtcgcat 14878883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19111481 - 19111135
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19111481 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatacataatgaataagatgacgtttagctccaaatt 19111382  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19111381 attggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 19111282  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19111281 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 19111182  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19111181 gagcattgtcgtattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 19111135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 23 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 19104824 - 19104499
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19104824 atcatcatgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatacataatgaataagatgacgtttagctccaaatt 19104725  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19104724 attggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacggttattaggagctt 19104625  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19104624 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 19104525  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaa 348  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  19104524 gagcattgtcgcattgtcgtgtctaa 19104499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 23 - 367
Target Start/End: Original strand, 20525249 - 20525593
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20525249 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgttgctgttgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgaagtttagctccaaatt 20525348  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| |||||   ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20525349 attggatgcatattgatatgatgattattgtgttttgttgttaatagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 20525448  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20525449 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 20525548  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20525549 gagcattgtcgcattgtcatgtctattatgttatgttgttgatga 20525593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 65 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 8305172 - 8304870
Alignment:
Q  65 tttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8305172 tttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaa-atgatgacgtttaggtccaaattattggatgcatattgatatgttgattacggtgatttgttgat 8305074  T
Q  165 aagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8305073 aagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagttttgtcctccgcacg 8304974  T
Q  264 tttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttg 363  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8304973 attaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgttatgttgttg 8304874  T
Q  364 atga 367  Q
    ||||    
T  8304873 atga 8304870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23763270 - 23762945
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  23763270 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 23763171  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  23763170 atatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 23763076  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23763075 t-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 23762977  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23762976 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 23762945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Original strand, 50887793 - 50888133
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  50887793 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 50887891  T
Q  128 atgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtc 226  Q
    ||||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50887892 atgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtc 50887991  T
Q  227 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50887992 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 50888091  T
Q  326 cattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50888092 cattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 50888133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 33386264 - 33386600
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  33386264 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 33386362  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33386363 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 33386461  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33386462 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 33386560  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  33386561 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 33386600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 33392909 - 33393245
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  33392909 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 33393007  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33393008 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 33393106  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33393107 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 33393205  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  33393206 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 33393245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 21807241 - 21807577
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  21807241 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgatgtttagctccaaattgttgga 21807339  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21807340 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 21807438  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21807439 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 21807537  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  21807538 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 21807577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 21835431 - 21835095
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||    
T  21835431 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgatgtttagctccaaattgttgga 21835333  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21835332 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 21835234  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21835233 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 21835135  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  21835134 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 21835095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 109 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21828715 - 21828482
Alignment:
Q  109 tttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21828715 tttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggcgttttgttgttaagagtccatgcataa-catatcattgagcttagtcctcaccac 21828617  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828616 gtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 21828518  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21828517 atataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 21828482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 18600210 - 18600443
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18600210 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccac 18600308  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18600309 gaataataggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 18600407  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18600408 atataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 18600443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 51328782 - 51329016
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  51328782 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 51328879  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51328880 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 51328978  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  51328979 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 51329016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 51335416 - 51335650
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  51335416 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 51335513  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51335514 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 51335612  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  51335613 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 51335650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 41478682 - 41478915
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41478682 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccac 41478780  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41478781 gaataataggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 41478879  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41478880 atatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 41478915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 27898822 - 27899034
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27898822 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 27898919  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  27898920 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 27899019  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  27899020 tttgttgatgatgat 27899034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 43063439 - 43063651
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43063439 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 43063536  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43063537 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 43063636  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  43063637 tttgttgatgatgat 43063651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 44756048 - 44755836
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44756048 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 44755951  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  44755950 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 44755851  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  44755850 tttgttgatgatgat 44755836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 49334515 - 49334303
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49334515 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 49334418  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  49334417 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 49334318  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  49334317 tttgttgatgatgat 49334303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 41348955 - 41349189
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | | ||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  41348955 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 41349052  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41349053 acgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 41349151  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41349152 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 41349189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 20216031 - 20216264
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20216031 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 20216128  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20216129 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 20216227  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20216228 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 20216264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 41356440 - 41356626
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41356440 tttgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 41356537  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41356538 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 41356626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 139 - 368
Target Start/End: Original strand, 18626430 - 18626659
Alignment:
Q  139 tatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacga 236  Q
    |||| ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18626430 tatgatgattacgatgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacga 18626528  T
Q  237 tttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcat 336  Q
    || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  18626529 tt-attaggagctttgtcctccgcatgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacat 18626627  T
Q  337 tgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  18626628 tgtcatgtctattatgctttgttgatgatgat 18626659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 33385013 - 33384801
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  33385013 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttat 33384916  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33384915 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 33384816  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  33384815 tttgttgatgatgat 33384801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47659216 - 47658982
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  47659216 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcataacattgagctttgtcctcacca 47659118  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47659117 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 47659019  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47659018 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 47658982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Original strand, 16345878 - 16346137
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | | ||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16345878 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 16345975  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16345976 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 16346074  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  16346075 gcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 16346137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 43078373 - 43078187
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43078373 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 43078276  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43078275 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 43078187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 44844987 - 44845221
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44844987 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccgtgcat-agcatatcattgagctttgtcctcacca 44845085  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44845086 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttac-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 44845184  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44845185 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 44845221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 46157493 - 46157679
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  46157493 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 46157590  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  46157591 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 46157679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Original strand, 16352526 - 16352786
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | | ||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  16352526 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 16352623  T
Q  206 acgattatta-ggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 304  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16352624 acgaaaattaaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccaca 16352722  T
Q  305 tgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  16352723 tgcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 16352786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21407191 - 21406904
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  21407191 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 21407093  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  21407092 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 21406998  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21406997 gagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21406904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21437853 - 21437686
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  21437853 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaaatgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 21437754  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21437753 atatgatgattacgatgatttgttgat-agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcacca 21437686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 1925519 - 1925712
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1925519 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacgatta 1925617  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1925618 ---ggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 1925710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 20924533 - 20924726
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20924533 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacgatta 20924631  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20924632 ---ggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 20924724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1010559 - 1010271
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  1010559 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 1010461  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  1010460 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 1010366  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1010365 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1010271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 52639377 - 52639089
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  52639377 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 52639279  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  52639278 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 52639184  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52639183 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 52639089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 16375729 - 16376016
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg--atgaataaggtgacgtttagctccaaattattggat 129  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16375729 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggat 16375827  T
Q  130 gc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagca--ttcattgagcttagtcctcaccacgattattagg 217  Q
    || ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  16375828 gcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agctatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---gg 16375922  T
Q  218 agctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16375923 agctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16376016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 20138083 - 20137892
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||       
T  20138083 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttg-ttagagtccatgcattagcattcattgagctttg-cctcaccatga--- 20137989  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
     ||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20137988 -taggagctttgtcctccacacg----tttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 20137894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 212 - 314
Target Start/End: Original strand, 41388478 - 41388577
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41388478 attaggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 41388574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19211867 - 19211677
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||      
T  19211867 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgtttcgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctatgtcctcaccatgatc- 19211770  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19211769 ---ggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 19211679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21844140 - 21844056
Alignment:
Q  259 gcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21844140 gcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 21844056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 314
Target Start/End: Original strand, 39244380 - 39244477
Alignment:
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39244380 ttaggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 39244475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 314
Target Start/End: Original strand, 39247935 - 39248032
Alignment:
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39247935 ttaggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 39248030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 313
Target Start/End: Original strand, 20229466 - 20229564
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20229466 attaggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatatcaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 20229562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21172960 - 21172786
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  21172960 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 21172871  T
Q  256 tccgcacgtt---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  21172870 tccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 21172786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 21313076 - 21312902
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  21313076 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 21312987  T
Q  256 tccgcacgtt---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  21312986 tccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 21312902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12646816 - 12646680
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    || ||||||||||||||| ||||||     ||||||||| |||||| |||| |||    
T  12646816 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatg----ttcggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttttcctccacacgatta 12646726  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12646725 aagtatattaatac-tatgatgacgattggaaccacatgcatataag 12646680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Original strand, 36819458 - 36819629
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  36819458 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgaactttgtcctcaccacaattt----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 36819547  T
Q  256 tccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  36819548 tccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 36819629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 214 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33797163 - 33797067
Alignment:
Q  214 taggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33797163 taggagctttgtcctccgcacgttt----aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgaagattggtaccacatgcatataa 33797068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 46975373 - 46975299
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46975373 attaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattcatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 46975299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 166 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 46975416 - 46975348
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  46975416 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacgat 46975348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18882272 - 18882200
Alignment:
Q  242 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18882272 taggagctttgtcctccgcacgatgaaagtgtattaatacttttgatgacgattggtactacatgcatataag 18882200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 235
Target Start/End: Original strand, 39244289 - 39244377
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  39244289 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg 39244377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 235
Target Start/End: Original strand, 39247844 - 39247932
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  39247844 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg 39247932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 20229377 - 20229468
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  20229377 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgc-ttagcatttcattgagctttgtcctcaccacgttta---ggagctttgtcctccgcacgatt 20229468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 314
Target Start/End: Original strand, 16080645 - 16080712
Alignment:
Q  244 ggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080645 ggagctttgtcctcc-cacgat-aaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 16080712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21844229 - 21844140
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttag 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  21844229 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggcgttttgttgttaagagtccatgca-tagcatatcattgagcttag 21844140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 18882316 - 18882249
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||    
T  18882316 agagtccatgcattagcattcattgagtcttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgat 18882249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 230
Target Start/End: Original strand, 16080590 - 16080659
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctcc 230  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  16080590 tttgttgatagg-gtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatt----ggagctttgtcctcc 16080659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 33797283 - 33797191
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33797283 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagttttgtcctcacca 33797191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 237
Target Start/End: Original strand, 24783268 - 24783334
Alignment:
Q  167 gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||    
T  24783268 gagttcatgcattagcatacattgagctttgttctcaccacgatt----ggagctttgtcctccccacgat 24783334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 208
Target Start/End: Original strand, 41388389 - 41388453
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  41388389 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctcaccacg 41388453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 131
Target Start/End: Original strand, 33050083 - 33050165
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgc 131  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||| | || |||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  33050083 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga-gtttatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgc 33050165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 23 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19905569 - 19905220
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19905569 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaatt 19905470  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19905469 attggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 19905370  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19905369 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 19905270  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaat---atgctatgttgttgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |   ||||||||||||||||||||    
T  19905269 gagcattgtcgcattgtcgtgtcttttttgatgctatgttgttgatgatg 19905220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 3216325 - 3215990
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  3216325 tgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgca 3216227  T
Q  133 gactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccg 231  Q
       ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3216226 tgttgatatgttgattacagtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccg 3216127  T
Q  232 cacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3216126 cacgacttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 3216027  T
Q  331 tcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3216026 tcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 3215990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20527508 - 20527183
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  20527508 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 20527409  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  20527408 atatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 20527314  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20527313 t-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcgcatt 20527215  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20527214 gtcatgtctaagatgctatgttgttgatgatg 20527183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Original strand, 26935217 - 26935557
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  26935217 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 26935315  T
Q  128 atgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtc 226  Q
    ||||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26935316 atgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtc 26935415  T
Q  227 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26935416 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 26935515  T
Q  326 cattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26935516 cattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 26935557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 33 - 369
Target Start/End: Original strand, 23845803 - 23846141
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata----atgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||     || | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  23845803 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 23845901  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23845902 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 23846000  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23846001 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctatgagca 23846099  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  23846100 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatgatg 23846141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 20023969 - 20024305
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | |||||||||||||||| || |||||    
T  20023969 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaagttgttgga 20024067  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20024068 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagttttgtcc 20024166  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20024167 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacattcatataaggagtctaagagca 20024265  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  20024266 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 20024305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 16883275 - 16883509
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16883275 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 16883373  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16883374 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 16883472  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16883473 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 16883509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18865332 - 18865098
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18865332 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 18865234  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18865233 cgtttattaggagctttgtccttcgcacg-tttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 18865135  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18865134 cacataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 18865098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 8354869 - 8355103
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || | |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8354869 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttctgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 8354967  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8354968 cgattattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggcaccacatg 8355066  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8355067 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 8355103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 29123089 - 29122855
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29123089 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacagtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 29122991  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29122990 catttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-agtagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 29122892  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29122891 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 29122855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Original strand, 20013967 - 20014225
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20013967 gtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 20014064  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20014065 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 20014163  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta-atatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  20014164 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataaatgctatgttgttgatga 20014225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Original strand, 20020044 - 20020302
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20020044 gtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 20020141  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20020142 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 20020240  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta-atatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  20020241 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataaatgctatgttgttgatga 20020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 17669673 - 17669907
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17669673 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 17669771  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17669772 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 17669870  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17669871 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 17669907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 5534542 - 5534776
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || |  |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  5534542 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatattttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgaacttagtcctcacca 5534640  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5534641 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 5534739  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5534740 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 5534776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 17676325 - 17676559
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17676325 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 17676423  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17676424 cgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 17676522  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17676523 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 17676559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 22123490 - 22123723
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22123490 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagctcagtcctcaccac 22123588  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123589 gaataataggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcaggattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 22123687  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123688 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 22123723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Original strand, 22115824 - 22116084
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||| || || ||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22115824 gtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtccataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttggtcctcacc 22115922  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22115923 acgattattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 22116021  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  22116022 gcatataaggagtctaggagcattgtcacactgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 22116084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19496343 - 19496157
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19496343 tttgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 19496246  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19496245 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 19496157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19498391 - 19498205
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19498391 tttgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 19498294  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19498293 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 19498205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 158 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22047897 - 22047688
Alignment:
Q  158 tgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcct 256  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22047897 tgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcct 22047800  T
Q  257 ccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctat 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  |    
T  22047799 ccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgcctt 22047700  T
Q  357 gttgttgatgat 368  Q
    |||| |||||||    
T  22047699 gttgatgatgat 22047688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Original strand, 22124632 - 22124892
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||| || || ||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22124632 gtttagctccaaattactggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtccataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacc 22124730  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22124731 acgattattaggagatttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcatgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacgt 22124829  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  22124830 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 22124892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19111228 - 19110995
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19111228 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 19111131  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19111130 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 19111032  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19111031 gcatataa-gagtctaggagcattgtcacattgtcatg 19110995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19117519 - 19117286
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19117519 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 19117422  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19117421 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 19117323  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19117322 gcatataa-gagtctaggagcattgtcacattgtcatg 19117286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22083833 - 22083599
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22083833 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagctttgtcctcacca 22083735  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22083734 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 22083636  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22083635 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 22083599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 21915673 - 21915906
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattc-attgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21915673 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcataccattgagcttagtcctcacca 21915770  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21915771 tgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 21915869  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21915870 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 21915906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 28454704 - 28454493
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28454704 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 28454607  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgct 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||     
T  28454606 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgcc 28454507  T
Q  355 atgttgttgatgat 368  Q
     ||||| |||||||    
T  28454506 ttgttgatgatgat 28454493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 164 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18065265 - 18065061
Alignment:
Q  164 taagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgca 261  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18065265 taagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagatttgtcctccgca 18065168  T
Q  262 cgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgt 361  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||     
T  18065167 cgattaaagtatatttatatttatgatgacgattggtaccacatgcatgtacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctttgttga 18065068  T
Q  362 tgatgat 368  Q
    |||||||    
T  18065067 tgatgat 18065061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22111767 - 22111479
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  22111767 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 22111669  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  22111668 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 22111574  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111573 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 22111479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 18863035 - 18863228
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  18863035 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 18863130  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18863131 ttaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 18863226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 21828404 - 21828597
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  21828404 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 21828499  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21828500 ttaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21828595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 30940467 - 30940660
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  30940467 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 30940562  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30940563 ttaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 30940658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 255 - 367
Target Start/End: Original strand, 20705896 - 20706008
Alignment:
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgct 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20705896 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctagtatgct 20705995  T
Q  355 atgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||    
T  20705996 atgttgttgatga 20706008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21410666 - 21410473
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  21410666 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgctgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 21410571  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21410570 ttaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21410475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21805158 - 21804965
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  21805158 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgctgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 21805063  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21805062 ttaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 21804967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Original strand, 30308858 - 30309076
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| | |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       
T  30308858 ctccaaattattggatgtataagtgataagctgattaaggtgatttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga--- 30308953  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
     ||||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30308954 -taggagctttgtcctccacacg----tttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 30309048  T
Q  313 aggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    | | |||||||  ||||||||||||||||    
T  30309049 a-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 30309076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 21972851 - 21973139
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||    
T  21972851 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgatgtttagctccaaattattgg 21972949  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  21972950 atgcatga-tgatatgttgattgcgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 21973044  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21973045 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtttattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21973139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 43251649 - 43251359
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg------atgaataaggtgacgtttagctccaaattatt 125  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||       ||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  43251649 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttacttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattatt 43251551  T
Q  126 ggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattatt 214  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||      
T  43251550 ggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta-- 43251455  T
Q  215 aggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43251454 -ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 43251359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15531838 - 15531697
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  15531838 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 15531746  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15531745 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15531697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 314
Target Start/End: Original strand, 21976944 - 21977230
Alignment:
Q  36 tgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg------atgaataaggtgacgtttagctccaaattattggat 129  Q
    ||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21976944 tgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggat 21977042  T
Q  130 gc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattagga 218  Q
    || ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||   |||    
T  21977043 gcatga-tgatatgttgattgcgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagttttgtcctcaccacgatta---gga 21977137  T
Q  219 gctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21977138 gctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21977230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 166 - 313
Target Start/End: Original strand, 24445663 - 24445803
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  24445663 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 24445755  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24445756 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 24445803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 168 - 340
Target Start/End: Original strand, 17055538 - 17055703
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| | |    
T  17055538 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgatga 17055630  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  17055631 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata-caggagtctaagttgcattgtcgcattgtc 17055703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 237 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18854836 - 18854730
Alignment:
Q  237 tttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcat 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18854836 tttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacat 18854737  T
Q  337 tgtcatg 343  Q
    |||||||    
T  18854736 tgtcatg 18854730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15538397 - 15538256
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  15538397 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccac---aattaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 15538305  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15538304 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15538256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Original strand, 14398236 - 14398406
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||   ||||||||||||||| ||||    
T  14398236 tgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaacaagatta---ggagctttgtcctccacacg 14398331  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14398332 att----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacatatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14398406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 23847172 - 23847312
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  23847172 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 23847263  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23847264 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23847312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32598623 - 32598459
Alignment:
Q  170 tccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaa 269  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  32598623 tccatgcgttagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccacacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaa 32598531  T
Q  270 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    
T  32598530 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 32598459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 170 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 32605155 - 32604991
Alignment:
Q  170 tccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaa 269  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||    
T  32605155 tccatgcgttagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccacacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaa 32605063  T
Q  270 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    
T  32605062 gtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 32604991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 17828739 - 17828880
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||  |    
T  17828739 agagtccatgcattaacattcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacaat 17828831  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17828832 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 17828880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22044884 - 22044693
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||      
T  22044884 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcgtcaccacgatc- 22044787  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22044786 ---ggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 22044695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 21387051 - 21386881
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||    
T  21387051 tgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgccatccgcacg 21386956  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
         |||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21386955 ----tttaggaactttgtcctccgcacaatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 21386881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 16231581 - 16231771
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||      
T  16231581 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatc- 16231678  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231679 ---ggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 16231769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23834172 - 23833982
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||      
T  23834172 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttttcctcaccatgatc- 23834075  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23834074 ---ggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 23833984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 108 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18854937 - 18854807
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18854937 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 18854839  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18854838 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgatt 18854807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 241 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15440466 - 15440393
Alignment:
Q  241 ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15440466 ttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15440393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 240 - 313
Target Start/End: Original strand, 19278746 - 19278821
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgca-cgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccac-atgcatataa 313  Q
    |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19278746 attaggagctttgtcctccgcaacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacaatgcatataa 19278821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 233
Target Start/End: Original strand, 19278681 - 19278767
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgca 233  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  19278681 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgca 19278767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 114 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21383654 - 21383556
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21383654 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagttcatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacgatta 21383556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Original strand, 19278553 - 19278613
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat 92  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19278553 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat 19278613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 16184514 - 16184466
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  16184514 attggtaccacatgcatataagatgtctaagttgcattgtcgcattgtc 16184466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Original strand, 20466365 - 20466413
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  20466365 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 20466413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24755552 - 24755504
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  24755552 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 24755504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Original strand, 30643612 - 30643660
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  30643612 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 30643660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 121)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 38 - 367
Target Start/End: Original strand, 20144 - 20472
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  20144 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttg 20242  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20243 atatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 20342  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 20442  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20443 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 20472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 23 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7536256 - 7535947
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7536256 atcatcatgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaatt 7536157  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7536156 attggatgcttattgatatgttgattacggtgatttgttgataagagttcatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 7536057  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7536056 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataaggagtctaa 7535957  T
Q  323 gagcattgtc 332  Q
    ||||||||||    
T  7535956 gagcattgtc 7535947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 38 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18531302 - 18530974
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18531302 tgtgacttgactgtgctgctgctgttgtttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgctcattg 18531204  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531203 atatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagttctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 18531104  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18531103 ttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgttgcatt 18531004  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18531003 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 18530974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 33 - 360
Target Start/End: Original strand, 4318586 - 4318913
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| ||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  4318586 tgttatgtgacttgactatgatgctactgttatttaactaagtgcataatgtctatatgtgaagaataagatgacgtttagctccaaattattggatgca 4318685  T
Q  133 gactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgc 232  Q
     | ||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4318686 tattgatatgatgattatggtgatttgttgttaagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgc 4318785  T
Q  233 acgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4318786 acgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtc 4318885  T
Q  333 gcattgtcatgtctaatatgctatgttg 360  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4318886 gcattgtcatgtctaagatgctttgttg 4318913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Original strand, 6017212 - 6017552
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  6017212 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 6017310  T
Q  128 atgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtc 226  Q
    ||||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6017311 atgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtc 6017410  T
Q  227 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6017411 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 6017510  T
Q  326 cattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6017511 cattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 6017552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 11262387 - 11262062
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  11262387 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 11262288  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  11262287 atatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 11262193  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11262192 t-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattgataccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 11262094  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11262093 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 11262062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 12692554 - 12692229
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  | ||    
T  12692554 tgtgacttgactatgctgctgctgttttttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtctagctccaaattattggatgcatattg 12692455  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||    
T  12692454 atatgatgattacgatgatttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgat----aggagctttgtcctctgcacgat 12692360  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692359 t-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 12692261  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12692260 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 12692229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 46 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14959214 - 14958897
Alignment:
Q  46 gactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttg 145  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||    
T  14959214 gactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatg 14959115  T
Q  146 atttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattagg 245  Q
    ||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14959114 attacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgatt-attagg 14959021  T
Q  246 agctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtc 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14959020 agctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtc 14958921  T
Q  346 taatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  14958920 taagatgctatgttgttgatgatg 14958897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 26420058 - 26419733
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  26420058 tgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 26419959  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||||    
T  26419958 atatgatgattacgatgttttgttgata-gcgtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccacacgat 26419864  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26419863 t-attaggagttttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 26419765  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26419764 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 26419733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 38 - 367
Target Start/End: Original strand, 11548313 - 11548637
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||    
T  11548313 tgtgacttgactatgctgctgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattgttggatgcatattg 11548412  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    |||||  |||| || || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  11548413 atatgaagattacgatgttttgttgata-gagtccatgcagtagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 11548507  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcat 336  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11548508 t-attaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcat 11548606  T
Q  337 tgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11548607 tgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatga 11548637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 38 - 367
Target Start/End: Original strand, 11554909 - 11555233
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||    
T  11554909 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattgttggatgcatattg 11555008  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    |||||  |||| || || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  11555009 atatgaagattacgatgttttgttgata-gagtccatgcagtagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 11555103  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcat 336  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555104 t-attaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcat 11555202  T
Q  337 tgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11555203 tgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatga 11555233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 46 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9409995 - 9409674
Alignment:
Q  46 gactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttg 145  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||    
T  9409995 gactgtgctgctgctgttatttaactaagtgcgtaatgtctatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttg 9409897  T
Q  146 atttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattag 244  Q
    ||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9409896 attacgatgttttgttcataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagtcttcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttatttg 9409797  T
Q  245 gagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgt 344  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9409796 gagctttgtcctccgtacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgt 9409697  T
Q  345 ctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||  ||| ||||||||||||||    
T  9409696 ctataatgttatgttgttgatga 9409674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 51 - 343
Target Start/End: Original strand, 11232344 - 11232635
Alignment:
Q  51 tgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgattt 149  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    |||| | | |||||     
T  11232344 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatgatgactgtatgtaatgaataagatgacatttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgatta 11232443  T
Q  150 cggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagc 248  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  11232444 cg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagc 11232540  T
Q  249 tttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11232541 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 11232635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 20703093 - 20703327
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20703093 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 20703191  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20703192 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 20703290  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20703291 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 20703327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 32767678 - 32767444
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32767678 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 32767580  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32767579 cgtttattaggagttttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 32767481  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32767480 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 32767444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 51 - 343
Target Start/End: Original strand, 11239031 - 11239322
Alignment:
Q  51 tgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgattt 149  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| || ||| | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||||    |||| | | |||||     
T  11239031 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatgatgactgtatgtaatgaataagataacatttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgatta 11239130  T
Q  150 cggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagc 248  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  11239131 cg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccacacgttttat-aggagc 11239227  T
Q  249 tttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11239228 tttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 11239322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 33 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 13569957 - 13569656
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata----atgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||     || | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  13569957 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaatttttgga 13569859  T
Q  129 tgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtc 226  Q
    ||| || | |||||||||||| || || |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13569858 tgcatgtc-gatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgtat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtc 13569761  T
Q  227 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagc 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13569760 ctccgcacgattt-ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcataaaaggagtctaagagc 13569662  T
Q  327 attgtc 332  Q
    ||||||    
T  13569661 attgtc 13569656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18176107 - 18175873
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18176107 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 18176009  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18176008 caattattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 18175910  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18175909 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 18175873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 57 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1347547 - 1347237
Alignment:
Q  57 tgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtga 155  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||  | ||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    |||| | | ||||| || ||     
T  1347547 tgctgttatttaactaagtgcatgatgattgtatgtaatgaataagatgacatttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgt 1347449  T
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1347448 tttgttgttaagagttcatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 1347351  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgct 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||     
T  1347350 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgcc 1347251  T
Q  355 atgttgttgatgat 368  Q
     ||||| |||||||    
T  1347250 ttgttgatgatgat 1347237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18182779 - 18182545
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || ||| || ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18182779 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttattcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 18182681  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18182680 caattattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 18182582  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18182581 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 18182545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14330788 - 14330530
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||  | ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14330788 gtttagctccaagttattggatgcatattgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 14330691  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330690 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 14330592  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta-atatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  14330591 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataaatgctatgttgttgatga 14330530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 14337372 - 14337114
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||  | ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14337372 gtttagctccaagttattggatgcatattgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 14337275  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14337274 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 14337176  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta-atatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  14337175 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataaatgctatgttgttgatga 14337114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 18164776 - 18165010
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18164776 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 18164874  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18164875 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 18164973  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18164974 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 18165010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 44786578 - 44786812
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44786578 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 44786675  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44786676 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 44786774  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44786775 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 44786812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 44793219 - 44793453
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44793219 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 44793316  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44793317 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 44793415  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44793416 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 44793453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 40523464 - 40523698
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40523464 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcag-agcatatcattgagcttagtcctcacca 40523562  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40523563 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 40523661  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40523662 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 40523698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 15162925 - 15163158
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15162925 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccac 15163023  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15163024 gaataataggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 15163122  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15163123 atatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 15163158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 16407399 - 16407632
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttg-ttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||  || ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16407399 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttattcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccac 16407497  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16407498 gaataataggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 16407596  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16407597 atataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 16407632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8705938 - 8705726
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8705938 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 8705841  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8705840 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 8705741  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  8705740 tttgttgatgatgat 8705726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 23520126 - 23520338
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23520126 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggatctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 23520223  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23520224 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 23520323  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||| |||||||    
T  23520324 tatgttgatgatgat 23520338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 9511115 - 9511348
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9511115 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 9511212  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9511213 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 9511311  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9511312 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 9511348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11366200 - 11365940
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt---gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||   ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11366200 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgtgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacc 11366102  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366101 acgaataataggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 11366003  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  11366002 gcatatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccgtgttgatgatgat 11365940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 108 - 342
Target Start/End: Original strand, 12703512 - 12703744
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12703512 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 12703609  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12703610 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 12703708  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcat 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12703709 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcat 12703744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 60780 - 61014
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  60780 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagctttgtcctcacca 60878  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60879 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 60977  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  60978 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 61014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 156 - 366
Target Start/End: Original strand, 18553695 - 18553905
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18553695 tttgttgttaagagtacatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 18553792  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  18553793 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtttattatgc 18553892  T
Q  354 tatgttgttgatg 366  Q
    ||||||| |||||    
T  18553893 tatgttgatgatg 18553905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 343
Target Start/End: Original strand, 15156274 - 15156507
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  15156274 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccat 15156372  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    || || ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15156373 gaataatagaagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 15156471  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15156472 atatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 15156507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 14655520 - 14655754
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | | ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14655520 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 14655617  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14655618 acgattactaggagctttgtcctccgcacgttatat-aggagctttgtcctccgaacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 14655716  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14655717 gcatttaaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 14655754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13691094 - 13690836
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    |||||||||| ||| |||||||    ||||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13691094 ttagctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccac 13690996  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    || || |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13690995 gaataataggagctttgtcctccgcacattttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 13690897  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  13690896 atatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 13690836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 49051373 - 49051140
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49051373 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 49051276  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49051275 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 49051177  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  49051176 catataaggagtctaggagcattgtcacattgccatg 49051140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15022062 - 15021876
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15022062 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 15021965  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15021964 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 15021876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21602 - 21429
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  21602 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatta 21505  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21504 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 21429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Original strand, 8202260 - 8202433
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  8202260 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatta 8202357  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8202358 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 8202433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13684463 - 13684205
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    |||||||||| ||| |||||||    ||||||||||||| || || ||| ||| | ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13684463 ttagctccaatttaatggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcacaagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccac 13684365  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 307  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13684364 gaataataggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaaacatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgc 13684266  T
Q  308 atataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  13684265 atatagggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 13684205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 235
Target Start/End: Original strand, 44408384 - 44408576
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  44408384 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 44408483  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||    
T  44408484 atatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatga----taggagctttgtcctccgcacg 44408576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 242 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14953085 - 14952958
Alignment:
Q  242 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14953085 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcg 14952986  T
Q  342 tgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14952985 tgtctaagatgctatgttgttgatgatg 14952958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 40 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14953254 - 14953064
Alignment:
Q  40 tgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgat 139  Q
    ||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  14953254 tgacttgactatgctgcttctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgat 14953155  T
Q  140 atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||    
T  14953154 atgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatga----taggagctttgtcctccgcacg 14953064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 194 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8712571 - 8712397
Alignment:
Q  194 ttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacg 292  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8712571 ttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacg 8712473  T
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||    
T  8712472 attggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcaaattgtcatttctattatgctttgttgatgatgat 8712397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 242 - 369
Target Start/End: Original strand, 44408555 - 44408682
Alignment:
Q  242 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44408555 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcg 44408654  T
Q  342 tgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||    
T  44408655 tgtccaagatgctatgttgttgatgatg 44408682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 32943 - 32657
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg-atgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatg 130  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||  | | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  32943 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattgaaatgatgacgtttagctccaaattattggatg 32844  T
Q  131 c-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggag 219  Q
    | ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||||    
T  32843 catga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggag 32749  T
Q  220 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32748 ctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 32657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 12704929 - 12705217
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  12704929 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 12705027  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  12705028 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 12705122  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12705123 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12705217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 249 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15380671 - 15380551
Alignment:
Q  249 tttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaa 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15380671 tttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaa 15380572  T
Q  349 tatgctatgttgttgatgatg 369  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  15380571 gatgctatgttgttgatgatg 15380551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 314
Target Start/End: Original strand, 71033 - 71325
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg------atgaataaggtgacgtttagctccaaatta 123  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  71033 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaatta 71131  T
Q  124 ttggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  71132 ttggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta 71229  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       |||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71230 ---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagccttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 71323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 314
Target Start/End: Original strand, 75142 - 75434
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg------atgaataaggtgacgtttagctccaaatta 123  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||       ||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  75142 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaatta 75240  T
Q  124 ttggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  75241 ttggatgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta 75338  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       |||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75339 ---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagccttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 75432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15083912 - 15083719
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  15083912 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 15083817  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15083816 ttaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 15083721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12718504 - 12718216
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  12718504 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 12718406  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||||   |    
T  12718405 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagttttgtcctcaccacgatta---g 12718311  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12718310 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12718216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18283202 - 18282914
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||| |||||||||||||     
T  18283202 ttgttgtgtgatttgactatgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttaactccaaattattga 18283104  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  18283103 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 18283009  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18283008 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18282914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 217 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10869347 - 10869196
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 316  Q
    |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10869347 gagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacgga 10869248  T
Q  317 gtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10869247 gtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgat 10869196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 217 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10875427 - 10875276
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 316  Q
    |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10875427 gagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacgga 10875328  T
Q  317 gtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10875327 gtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgctatgttgatgatgat 10875276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 13461761 - 13461542
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||      
T  13461761 ctccaaattattggatgtctaaatgataagttgattaaggtgatttgttgattagagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccttgat-- 13461664  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
      |||||||||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13461663 --aggagctttgtcctccacacg----tttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgttttgtaccacatgcatata 13461570  T
Q  313 aggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    | | |||||||  ||||||||||||||||    
T  13461569 a-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 13461542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 45170396 - 45170589
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  45170396 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 45170491  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45170492 ttaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacaagcatata 45170587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12723415 - 12723127
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  12723415 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 12723317  T
Q  128 atgc----tga----ctgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattagg 217  Q
    ||||    |||    ||||| | | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||   ||    
T  12723316 atgcatgatgatatgctgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccatgatta---gg 12723221  T
Q  218 agctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12723220 agctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12723127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16114077 - 16113789
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||     ||||| | | |||||||||||||||| |||||||    
T  16114077 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgtatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaagttattgg 16113979  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  16113978 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 16113884  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16113883 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16113789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16117230 - 16116942
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||     ||||| | | |||||||||||||||| |||||||    
T  16117230 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgtatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaagttattgg 16117132  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  16117131 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 16117037  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16117036 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16116942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15728302 - 15728105
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| ||||    
T  15728302 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccacacg 15728208  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
     ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  15728207 tttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgc 15728112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 151 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 8917389 - 8917209
Alignment:
Q  151 ggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctt 250  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||| ||||||| ||||     ||||||||||    
T  8917389 ggtgatttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga----taggagcttagtcctccacacg----tttaggagctt 8917299  T
Q  251 tgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  8917298 tgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 8917209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18279239 - 18278951
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||| |||||||||||||     
T  18279239 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttaactccaaattattga 18279141  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  18279140 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 18279046  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18279045 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagttttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18278951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 169 - 314
Target Start/End: Original strand, 1859245 - 1859382
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaa 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1859245 gtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta---ggagctttgtcctccgcacgat-----aggagctttgtcctccgcacgattaa 1859336  T
Q  269 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1859337 agtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 1859382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 39721982 - 39721789
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   |    
T  39721982 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtcaatgcattagcattcattgagctttgtcctcactacg---a 39721887  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39721886 ttaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgttctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 39721791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 217 - 366
Target Start/End: Original strand, 18585497 - 18585646
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 316  Q
    |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  18585497 gagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgatgattggtaccacatgcatatacgga 18585596  T
Q  317 gtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatg 366  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  18585597 gtctaggagcattgtcacattgtcatgtttattatgctatgttgatgatg 18585646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 13149155 - 13148963
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       
T  13149155 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttg-ttagagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga--- 13149060  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
     ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13149059 -taggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 13148965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 25927607 - 25927799
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25927607 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagttcatgcattagcattcattgagctt-gtcctcaccatgatta 25927704  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||| |||||||    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25927705 ---ggagctttgtcctccacacgatt----agaagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 25927797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 156 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18556930 - 18556779
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||    
T  18556930 tttgttgtttagcgtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcc 18556838  T
Q  256 tccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18556837 tccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataaagattggtaccacatgcatataag 18556779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 23 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 14148641 - 14148533
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14148641 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaatt 14148542  T
Q  123 attggatgc 131  Q
    |||||||||    
T  14148541 attggatgc 14148533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14216857 - 14216705
Alignment:
Q  182 cattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatac 281  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14216857 cattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccacacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac 14216765  T
Q  282 ttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    
T  14216764 ttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 14216705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Original strand, 16724758 - 16724928
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||| ||||||||| || |    
T  16724758 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatacattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagccttgtcctccacagg 16724852  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     |||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16724853 ttttc---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16724928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Original strand, 17701772 - 17701942
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||| ||||||||| || |    
T  17701772 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatacattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagccttgtcctccacagg 17701866  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     |||    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17701867 ttttc---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 17701942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9593345 - 9593155
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||      
T  9593345 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatc- 9593248  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9593247 ---ggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctcccaacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccacatgcatata 9593157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 212 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18425307 - 18425208
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18425307 attaggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 18425211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26292233 - 26291920
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||  || | |||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  26292233 tgttgttgtatgacttgactgtgctactggtgttatttaactaagtgcctgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 26292135  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||  |||    
T  26292134 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacgatgtcttgttgttaagagtcaatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgttt--tag 26292039  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatt---------------------tattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||                     | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26292038 gagctttgtcctccgcacgattaggagctttgtcctccgcacgttttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgatt 26291939  T
Q  296 ggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26291938 ggtaccacatgcatataag 26291920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 313
Target Start/End: Original strand, 16457463 - 16457652
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |        
T  16457463 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagcccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatg---- 16457557  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    || ||||||||||||||| ||||||     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16457558 ttcggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgacctccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 16457651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6801157 - 6801021
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    || ||||||||||||||| || |||     ||||||||||||||||||||| |||    
T  6801157 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatg----ttcggagctttgtcctccacatgat-----aggagctttgtcctccgcacgatta 6801067  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6801066 aagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatttaag 6801021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 217 - 314
Target Start/End: Original strand, 7519531 - 7519623
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7519531 gagctttgtcctccgcacgat-----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 7519623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16583256 - 16583040
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | |||| ||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  16583256 ctccaaattattggatgtattagtgatttgttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt 16583158  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |   |||||||||||||  ||||||      ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  16583157 t---gagctttgtcctcaccacgatc-----ggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacaattggtaccacatgcatgta 16583067  T
Q  313 ag-gagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    || | |||||||  |||||||||||||    
T  16583066 agagtgtctaagttgcattgtcgcatt 16583040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 217 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12714530 - 12714436
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12714530 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 12714436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Original strand, 13918979 - 13919053
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13918979 attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 13919053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 272 - 343
Target Start/End: Original strand, 20871301 - 20871372
Alignment:
Q  272 atattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20871301 atattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 20871372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Original strand, 14932954 - 14933081
Alignment:
Q  188 ttgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatga 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14932954 ttgagctttgtcctcaccacgat----aggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatga 14933044  T
Q  288 tga-cgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 323  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14933045 tgagagattggtaccacatgcatataagaggtctaag 14933081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Original strand, 15356389 - 15356516
Alignment:
Q  188 ttgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatga 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15356389 ttgagctttgtcctcaccacgat----aggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatga 15356479  T
Q  288 tga-cgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 323  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15356480 tgagagattggtaccacatgcatataagaggtctaag 15356516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 188 - 323
Target Start/End: Original strand, 15360503 - 15360630
Alignment:
Q  188 ttgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatga 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15360503 ttgagctttgtcctcaccacgat----aggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatac-tatga 15360593  T
Q  288 tga-cgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 323  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15360594 tgagagattggtaccacatgcatataagaggtctaag 15360630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16275397 - 16275323
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275397 attaggagctttgtcctctgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16275323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 240 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 35151522 - 35151421
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattg 338  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  35151522 attacgagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattg 35151424  T
Q  339 tca 341  Q
    |||    
T  35151423 tca 35151421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 310
Target Start/End: Original strand, 2530616 - 2530708
Alignment:
Q  214 taggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 310  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2530616 taggagctttgtcctccacacgttt----aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 2530708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 241 - 314
Target Start/End: Original strand, 16907696 - 16907769
Alignment:
Q  241 ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16907696 ttaggagctttgtcctccgcacgataaaagtatataaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 16907769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 296
Target Start/End: Original strand, 13635618 - 13635747
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  13635618 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatt----tgagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 13635707  T
Q  256 tccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattg 296  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13635708 tccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattg 13635747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Original strand, 15605419 - 15605594
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  15605419 tttgttgata-gagtccatgcattagcataaattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 15605508  T
Q  256 tccgcacgtt---taaagtatattaatacttatgatgacg-attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| |   ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  15605509 tccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgtattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 15605594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Original strand, 14152151 - 14152325
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||  ||| |||     ||||||||||||    
T  14152151 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatt----tgagctttgtcctcaccactatt-----ggagctttgtcc 14152240  T
Q  256 tccgcac---gtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||   | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||    
T  14152241 tccccacgatgcttaaagtatattaatac-tatgatgacaattggtaccacatgcatataaaaggtctaagttgcattgtcgcatt 14152325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Original strand, 2832607 - 2832750
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     ||||| ||||||||| ||||||     |||||| ||||||    
T  2832607 tttgttgata-gagtctatacattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatc----ggagccttgtcctccacacgat-----aggagccttgtcc 2832696  T
Q  256 tccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 310  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2832697 tccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcata 2832750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12318084 - 12317910
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  |||  ||| |||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  12318084 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttatcctcacaacga--att--gagttttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 12317995  T
Q  256 tccgcacgtt---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  12317994 tccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 12317910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Original strand, 13918884 - 13919005
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || |    
T  13918884 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacc---atga 13918979  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13918980 ttaggagctttgtcctccgcacgatt 13919005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10869381 - 10869298
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10869381 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt 10869298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10875461 - 10875378
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10875461 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt 10875378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12714700 - 12714485
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  12714700 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 12714602  T
Q  128 atgc-tgactgatatgt---------tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||         ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||  | ||||    
T  12714601 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgca-tagcatttcattgagctttgtcctccgcacg--ttttag 12714506  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12714505 gagctttgtcctccgcacgat 12714485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 238
Target Start/End: Original strand, 18585463 - 18585546
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18585463 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt 18585546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 237
Target Start/End: Original strand, 2530540 - 2530616
Alignment:
Q  157 ttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  2530540 ttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---tttaggagctttgtcctccgcacgat 2530616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 314
Target Start/End: Original strand, 20579 - 20650
Alignment:
Q  242 taggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20579 taggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccaaatgcatataag 20650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16275469 - 16275371
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || |||||||||||||||||| |||||    
T  16275469 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctctgcacg 16275374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 237
Target Start/End: Original strand, 16907629 - 16907720
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16907629 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgttt--taggagctttgtcctccgcacgat 16907720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 244 - 336
Target Start/End: Original strand, 9751984 - 9752079
Alignment:
Q  244 ggagctttgtcctccgcacgtt---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcat 336  Q
    ||||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||    
T  9751984 ggagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcat 9752079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35151565 - 35151496
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  35151565 agagtccatgcattagcattcattgagttttgtcctcacc---atgattacgagctttgtcctccgcacgatt 35151496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 206
Target Start/End: Original strand, 19164 - 19256
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| |||||||  | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19164 ctccaaattattggatgtataactgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacca 19256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 167 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15580639 - 15580523
Alignment:
Q  167 gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcac---g 263  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||||| |||   |    
T  15580639 gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacga--att--gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcctccccacgatg 15580549  T
Q  264 tttaaagtatattaatacttatgatga 290  Q
     |||||||||||||||| |||||||||    
T  15580548 cttaaagtatattaata-ttatgatga 15580523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 8712547 - 8712499
Alignment:
Q  190 gagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8712547 gagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 8712499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Original strand, 14932900 - 14932954
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  14932900 tttgttgata-gagttcatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatt 14932954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Original strand, 15356335 - 15356389
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15356335 tttgttgata-gagttcatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatt 15356389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Original strand, 15360449 - 15360503
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  15360449 tttgttgata-gagttcatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatt 15360503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Original strand, 16907471 - 16907531
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat 92  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16907471 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat 16907531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 57 - 131
Target Start/End: Original strand, 9446224 - 9446298
Alignment:
Q  57 tgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgc 131  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  9446224 tgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgc 9446298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 285 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 13569648 - 13569609
Alignment:
Q  285 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaaga 324  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13569648 tgatgacgattggtaccacaggcataaaaggagtctaaga 13569609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 156 - 211
Target Start/End: Original strand, 15605688 - 15605742
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt 211  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  15605688 tttgttgata-gagttcatgcattagcatacattgagctttgttctcaccacgatt 15605742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18425445 - 18425332
Alignment:
Q  104 tgacgtttagctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgag 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  18425445 tgacgtttagctccaaattattggatgcatga-taatatgttgattacgatgattatggtgtcttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgag 18425348  T
Q  193 cttagtcctcaccacg 208  Q
    ||| ||||||||||||    
T  18425347 ctttgtcctcaccacg 18425332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 204
Target Start/End: Original strand, 9751920 - 9751967
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcac 204  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9751920 tttgttgata-gagttcatgcattagcatacattgagctttgtcctcac 9751967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 106)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 23 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12522155 - 12521811
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12522155 atcatcctgttgttatgttacttgactatgatgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttggctccaaatt 12522056  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12522055 attggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagctcagtcctcaccacgattattaggagctt 12521956  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12521955 tgtcctccgcatgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 12521856  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12521855 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatactatgttgttgatga 12521811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 30 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 53433442 - 53433102
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  53433442 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataaggtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 53433344  T
Q  128 atgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtc 226  Q
    ||||    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53433343 atgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtc 53433244  T
Q  227 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53433243 ctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 53433144  T
Q  326 cattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53433143 cattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 53433102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14679021 - 14678696
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  14679021 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 14678922  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  14678921 atatgatgattacgatgttttgt-gata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 14678828  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14678827 t-attaggagctttgtcctccgcacatttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 14678729  T
Q  338 gtcatgtctaat-atgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14678728 gtcgtgtctaatgatgctatgttgttgatgatg 14678696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Original strand, 41385792 - 41386117
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| ||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  41385792 tgtgacttgactatgttgctgcggttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 41385891  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||| ||||||||||    
T  41385892 atatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcttccgcacgat 41385986  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41385987 t-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 41386085  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41386086 gtcgtgtctaagatgttatgttgttgatgatg 41386117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23838492 - 23838167
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  23838492 tgtgactcgactatgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 23838393  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| ||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  23838392 atatgatgattacgacgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgaacttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 23838298  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
     | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23838297 at-ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 23838199  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23838198 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 23838167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14685229 - 14684904
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |     
T  14685229 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatatta 14685130  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||    
T  14685129 atatgatgattacgatgttttgt-gata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgtacgat 14685036  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14685035 t-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgatttgtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 14684937  T
Q  338 gtcatgtctaat-atgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14684936 gtcgtgtctaatgatgctatgttgttgatgatg 14684904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 27709810 - 27709474
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  27709810 tgttatgtgacttgattatgctgttgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 27709712  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27709711 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 27709613  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27709612 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 27709514  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  27709513 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 27709474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 86 - 365
Target Start/End: Original strand, 9272254 - 9272531
Alignment:
Q  86 tatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt 185  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  9272254 tatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaatacggtgatttgttcataagagtccatgcat-agcatt 9272351  T
Q  186 -cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatactta 284  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9272352 tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatactta 9272450  T
Q  285 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgat 365  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  9272451 tgatgacaattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgat 9272531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23081653 - 23081317
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  23081653 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 23081555  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23081554 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 23081456  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23081455 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 23081357  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  23081356 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttattgatga 23081317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 19942195 - 19942531
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  19942195 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 19942293  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19942294 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattatgagctttgtcc 19942392  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19942393 tctgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 19942491  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  19942492 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 19942531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 6873481 - 6873715
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6873481 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 6873579  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6873580 cgtttattaggagctttgtcctccgcacg-tttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 6873678  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6873679 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 6873715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 33 - 343
Target Start/End: Original strand, 15322136 - 15322445
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  15322136 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgtaatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgca 15322235  T
Q  133 gactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctcc 230  Q
       |||| | | ||||| || || ||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15322236 tgttgattacgatgattacg-tgttttattgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattacgagctttgtcctcc 15322333  T
Q  231 gcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 330  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15322334 gcacg-tttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 15322432  T
Q  331 tcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||    
T  15322433 tcgcattgtcatg 15322445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 51 - 343
Target Start/End: Original strand, 7901232 - 7901523
Alignment:
Q  51 tgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgattt 149  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||  ||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||| |||||     
T  7901232 tgctgctgctgttatttaactaagtgcatgatgattatgtgtaatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgattatgatgatta 7901331  T
Q  150 cggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagc 248  Q
    || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  7901332 cg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgttctctgcacg-tttattaggagc 7901428  T
Q  249 tttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7901429 tttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 7901523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 16956692 - 16957028
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata----atgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||     || | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  16956692 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 16956790  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || | |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16956791 tgcatgttgatatgttgattacgatgttatgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 16956889  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16956890 tccgcacgatt-attaggagttttttcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagtgtctaagagca 16956988  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  16956989 ttgtcacattgtcatgtccataatgttatgttgttgatga 16957028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 386434 - 386668
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  386434 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 386532  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  386533 cgtttattaggagctttgtcctccgcatgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 386631  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  386632 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 386668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40478151 - 40477917
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40478151 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 40478053  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40478052 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 40477954  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40477953 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 40477917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Original strand, 14268560 - 14268817
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14268560 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacg 14268658  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14268659 attattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 14268757  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  14268758 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 14268817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 110 - 368
Target Start/End: Original strand, 14298934 - 14299191
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14298934 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcgccacg 14299032  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14299033 aatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 14299131  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  14299132 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 14299191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 108 - 332
Target Start/End: Original strand, 51493922 - 51494143
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51493922 gtttagctccaaattattggatgc--attgatatgtttattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 51494018  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51494019 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 51494117  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtc 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  51494118 catataaggagtctaagagcattgtc 51494143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35170700 - 35170487
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35170700 atcatcctgttgttgtgtcacttgcctatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaatt 35170601  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagca-ttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagct 221  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35170600 attggatgcatattgatatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagct 35170501  T
Q  222 ttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||||||||||||    
T  35170500 ttgtcctccgcacg 35170487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 4772098 - 4771841
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4772098 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 4772001  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4772000 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 4771902  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  4771901 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 4771841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 136 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 40453894 - 40453688
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcac 234  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40453894 tgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcac 40453796  T
Q  235 gatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgc 334  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40453795 gttttat-aggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcac 40453697  T
Q  335 attgtcatg 343  Q
    |||||||||    
T  40453696 attgtcatg 40453688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 111 - 343
Target Start/End: Original strand, 26285014 - 26285246
Alignment:
Q  111 tagctccaaattattggatgctgactgatatgttgattt-cggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26285014 tagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgaattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacg 26285112  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgca 308  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26285113 tttattaggagccttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgaggattggtaccacatgca 26285211  T
Q  309 tataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26285212 tataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 26285246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 19780392 - 19780626
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19780392 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 19780490  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19780491 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 19780589  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19780590 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 19780626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23954150 - 23953916
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23954150 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 23954052  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23954051 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 23953953  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23953952 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 23953916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23960812 - 23960578
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23960812 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 23960714  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23960713 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 23960615  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23960614 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 23960578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 55795392 - 55795180
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55795392 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 55795295  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55795294 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcgcattgtcatgtctattatgc 55795195  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  55795194 tttgttgatgatgat 55795180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Original strand, 8048600 - 8048858
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8048600 gtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 8048697  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8048698 cgaatattaggagccttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 8048796  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta-atatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  8048797 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataaatgctatgttgttgatga 8048858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Original strand, 8055213 - 8055471
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    |||||||||||| |||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8055213 gtttagctccaagttattggatgcatgttgataagt-gattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 8055310  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055311 cgaatattaggagccttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 8055409  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta-atatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  8055410 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataaatgctatgttgttgatga 8055471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18295627 - 18295393
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18295627 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 18295530  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18295529 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 18295431  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18295430 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 18295393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 12300061 - 12300273
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12300061 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 12300158  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12300159 cctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 12300258  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||| |||||||    
T  12300259 tatgttgatgatgat 12300273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 12349737 - 12349949
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12349737 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 12349834  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12349835 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 12349934  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  12349935 tttgttgatgatgat 12349949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12475021 - 12474787
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12475021 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 12474924  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474923 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 12474825  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12474824 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 12474787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12481651 - 12481417
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12481651 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 12481554  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12481553 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 12481455  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12481454 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 12481417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 23 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 35614010 - 35613799
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||    
T  35614010 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgatgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagataacgttg-gctccaaatt 35613912  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35613911 attggatgcatattgatatgatgattacgatgttttgttgataagagtccatgtattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 35613812  T
Q  223 tgtcctccgcacg 235  Q
    |||||||||||||    
T  35613811 tgtcctccgcacg 35613799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 18071170 - 18070911
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | | ||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18071170 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 18071073  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18071072 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 18070974  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  18070973 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 18070911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 18024532 - 18024766
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | ||||||| || || ||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  18024532 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgttgattacg-tgttttgttgttaagagtccatacat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 18024629  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18024630 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 18024728  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18024729 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 18024766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15148459 - 15148225
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15148459 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagctttgtcctcacca 15148361  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15148360 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 15148262  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15148261 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 15148225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15362134 - 15361900
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15362134 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagctttgtcctcacca 15362036  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15362035 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 15361937  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15361936 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 15361900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 15383597 - 15383830
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || ||||||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15383597 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatacgttgattacg-tgttttgttgttatgtgtccatgcat-agcatatcattgagctttgtcctcacca 15383694  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15383695 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 15383793  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15383794 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 15383830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 16231946 - 16232180
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16231946 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagctttgtcctcacca 16232044  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232045 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 16232143  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16232144 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 16232180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 22194621 - 22194387
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22194621 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagctttgtcctcacca 22194523  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22194522 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 22194424  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22194423 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 22194387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 4561604 - 4561883
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  4561604 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 4561702  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgt 225  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  4561703 atgcatga-tgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgt 4561797  T
Q  226 cctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4561798 cctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4561883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 36884839 - 36885073
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  36884839 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagctttgtcctcacca 36884937  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36884938 cgaaaattaggagcgttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 36885036  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  36885037 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 36885073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 5757209 - 5757488
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  5757209 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtatatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 5757307  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgt 225  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||    
T  5757308 atgcatga-tgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgt 5757402  T
Q  226 cctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5757403 cctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 5757488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 156 - 353
Target Start/End: Original strand, 17962497 - 17962694
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17962497 tttgttgttaagaatccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 17962594  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  17962595 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 17962694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 14757692 - 14757985
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg---atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||  | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  14757692 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattgaaatgatgacgtttagctccaaattattgga 14757791  T
Q  129 tgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattagg 217  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14757792 tgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattagg 14757889  T
Q  218 agctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14757890 agctttgtcctccgcacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14757985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8384767 - 8384581
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8384767 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 8384670  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8384669 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 8384581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14073763 - 14073577
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  14073763 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 14073666  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14073665 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 14073577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 15256541 - 15256355
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15256541 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 15256444  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15256443 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 15256355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 17090151 - 17090337
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  17090151 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 17090248  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17090249 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 17090337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Original strand, 29041072 - 29041258
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29041072 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 29041169  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29041170 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 29041258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 17810110 - 17809822
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  17810110 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 17810012  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  17810011 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 17809917  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17809916 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 17809822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8391422 - 8391236
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  8391422 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 8391325  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8391324 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatagggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 8391236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 217 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35170532 - 35170381
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 316  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35170532 gagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 35170434  T
Q  317 gtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35170433 gtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 35170381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17808333 - 17808160
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  17808333 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattg 17808236  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17808235 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 17808160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 20682207 - 20682036
Alignment:
Q  39 gtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactga 138  Q
    |||||| |||| ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  20682207 gtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatattga 20682109  T
Q  139 tatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt 211  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20682108 tatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt 20682036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 217 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 35613844 - 35613693
Alignment:
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 316  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35613844 gagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaattatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagga 35613746  T
Q  317 gtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  35613745 gtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatactatgttgttgatgatg 35613693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9556366 - 9556078
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  9556366 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 9556268  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  9556267 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 9556173  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9556172 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9556078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33742216 - 33741928
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  33742216 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 33742118  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  33742117 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 33742023  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33742022 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 33741928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 14954557 - 14954750
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  14954557 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 14954652  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14954653 ttaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 14954748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12487427 - 12487233
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12487427 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacgatta 12487329  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12487328 ---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 12487235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 136 - 340
Target Start/End: Original strand, 14708762 - 14708959
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||    
T  14708762 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta---ggagctttgtcctccgcacg 14708857  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
     ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  14708858 tttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgc 14708953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 239 - 368
Target Start/End: Original strand, 14305659 - 14305788
Alignment:
Q  239 tattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14305659 tattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattg 14305758  T
Q  339 tcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    |||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  14305759 tcatgattaagatgccttgttgatgatgat 14305788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 115 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 18236891 - 18236674
Alignment:
Q  115 tccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattat 213  Q
    ||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||        
T  18236891 tccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgatttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga---- 18236797  T
Q  214 taggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||     |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18236796 taggagctttgtcctccacacg----tttaggatctttgtcctccgcacgattaaagtatattaataattatgacgacgattggtaccacatgcatataa 18236701  T
Q  314 ggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
     | |||||||  ||||||||||||||||    
T  18236700 -gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 18236674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 136 - 340
Target Start/End: Original strand, 42997578 - 42997775
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||    
T  42997578 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta---ggagctttgtcctccgcacg 42997673  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
     ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  42997674 tttta---ggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtatcacgtgcatataa-gtgtctaagtcgcattgtcgc 42997769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15224753 - 15224590
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttatt 242  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||        
T  15224753 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgttta---ggagctttgtcctccgcacgatt---- 15224662  T
Q  243 aggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15224661 aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 15224590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2014779 - 2014587
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       
T  2014779 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttg-ttagagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga--- 2014684  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
     ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2014683 -taggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 2014589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 340
Target Start/End: Original strand, 18602816 - 18603055
Alignment:
Q  94 atgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgag 192  Q
    ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| |  | | ||||| || ||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18602816 atgaataagttgacgatgaactccaaattattggaagtataagtgataagtcgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgag 18602914  T
Q  193 cttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacg 292  Q
    ||| |||||||||| |||    ||||| |||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18602915 ctttgtcctcaccatgat----aggagatttgtcctccacacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 18603007  T
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  18603008 tttggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 18603055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 45938098 - 45937957
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  45938098 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 45938006  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45938005 gaaagtatattaatacttatgataacgattggtaccacatgcatataag 45937957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Original strand, 19757758 - 19757896
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  19757758 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatt----ggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 19757849  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19757850 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19757896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 166 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19782048 - 19781910
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  19782048 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatt----ggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 19781957  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19781956 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 19781910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 26243770 - 26243962
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |        
T  26243770 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatg---- 26243864  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26243865 ttaggagctttgtcctccgcacgtttaa----gagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 26243960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 3412776 - 3412580
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||| |       
T  3412776 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccac--- 3412685  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  3412684 atgttttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgtttggtagcacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgc 3412586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9530435 - 9530243
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       
T  9530435 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgttaa-agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga--- 9530340  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
     ||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9530339 -taggagctttgtcctccgcacg----tttaggatctttgtcctccacacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9530245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23139220 - 23139080
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    | |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  23139220 agagtgcatgcattagcattcattgagctttgtcatcacca----tgttaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 23139129  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23139128 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 23139080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 340
Target Start/End: Original strand, 18609388 - 18609627
Alignment:
Q  94 atgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgag 192  Q
    ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| |  | | ||||| || ||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18609388 atgaataagttgacgatgaactccaaattattggaagtataagtgataagtcgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgag 18609486  T
Q  193 cttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacg 292  Q
    ||| ||||| |||| ||| |    |||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18609487 ctttgtccttaccatgataa----gagctttgtcctccacacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 18609579  T
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
     || ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  18609580 tttagtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 18609627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 18222536 - 18222674
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     ||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||| |    
T  18222536 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatc----ggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccgcacgat 18222626  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18222627 taaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatataag 18222674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 27533742 - 27533528
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        
T  27533742 ctccaaattattggatgtataagtgatacgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---t 27533646  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgat-------------------ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacga 293  Q
    |||||||||||||||||||||| ||                   |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  27533645 ttaggagctttgtcctccgcacaataggagctttgtcctccgcatgtttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgataacga 27533546  T
Q  294 ttggtaccacatgcatat 311  Q
    ||||||||||||||||||    
T  27533545 ttggtaccacatgcatat 27533528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 313
Target Start/End: Original strand, 16243505 - 16243696
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||       
T  16243505 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttg-ttagagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga--- 16243600  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
     ||||||||| ||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16243601 -taggagcttagtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctctgcacgatgaaattatattaatacttacgatgacgattggtaccacatgcatata 16243695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 311
Target Start/End: Original strand, 1951867 - 1952054
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||      
T  1951867 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagttcatgcattagcatacattgagctttgtcctgaccacgatc- 1951964  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 311  Q
       ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1951965 ---ggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatat 1952054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Original strand, 21339968 - 21340052
Alignment:
Q  285 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  21339968 tgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcgtgtctaagatactatgttgttgatgatg 21340052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 283 - 367
Target Start/End: Original strand, 30235277 - 30235361
Alignment:
Q  283 tatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30235277 tatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtctataatgctatgttgttgatga 30235361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 25689491 - 25689417
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689491 attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 25689417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 337
Target Start/End: Original strand, 28569644 - 28569741
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  28569644 attaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gagtctaagttgcattgtcgcatt 28569741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 238
Target Start/End: Original strand, 14305558 - 14305686
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  14305558 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcgccacg 14305656  T
Q  209 attattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14305657 aatattaggagctttgtcctccgcacgatt 14305686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 18229011 - 18229149
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     ||||||||||||||| ||| ||     |||||||||||| |||||||| |    
T  18229011 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatc----ggagctttgtcctccacacaat-----aggagctttgtcttccgcacgat 18229101  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  18229102 taaagtatattaatac-tatgatgacaattggtaccatatgcatataag 18229149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10712477 - 10712403
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10712477 attaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 10712403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 10926247 - 10926173
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10926247 attaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 10926173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 166 - 340
Target Start/End: Original strand, 17152644 - 17152808
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||     |||||||||| |||| ||||||     ||||||||||| |||| |||| |    
T  17152644 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatc----ggagctttgtgctccacacgat-----aggagctttgttctccacacgat 17152734  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  17152735 taaagtatattaatac-tacgatgacgattggtactacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 17152808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 367
Target Start/End: Original strand, 13020537 - 13020610
Alignment:
Q  294 ttggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  13020537 ttggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 13020610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20115143 - 20115011
Alignment:
Q  110 ttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgattt-gttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccac 207  Q
    ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || ||| ||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20115143 ttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgtttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccac 20115045  T
Q  208 gattattaggagctttgtcctccgcacgatttat 241  Q
    || || |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  20115044 gaataataggagttttgtcctccgcacgttttat 20115011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25689586 - 25689465
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  25689586 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 25689491  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25689490 ttaggagctttgtcctccgcacgatt 25689465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10712572 - 10712452
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  10712572 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcctgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 10712477  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10712476 ttaggagctttgtcctccgcacgat 10712452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10926342 - 10926222
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  10926342 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcctgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 10926247  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10926246 ttaggagctttgtcctccgcacgat 10926222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 33 - 97
Target Start/End: Original strand, 30235220 - 30235284
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatga 97  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30235220 tgttatgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatga 30235284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 237
Target Start/End: Original strand, 22634571 - 22634647
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||    
T  22634571 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatt----ggagctttgtcctccccacgat 22634647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 323
Target Start/End: Original strand, 36134176 - 36134256
Alignment:
Q  245 gagctttgtcctccgcacgtt---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 323  Q
    |||||||||||||| |||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36134176 gagctttgtcctccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 36134256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 341
Target Start/End: Original strand, 22634653 - 22634726
Alignment:
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtca 341  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||||    
T  22634653 aagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatagtca 22634726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 170 - 237
Target Start/End: Original strand, 28569605 - 28569669
Alignment:
Q  170 tccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28569605 tccatgcattagcattcattgagttttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacgat 28569669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 237
Target Start/End: Original strand, 20157625 - 20157701
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||| ||||||    
T  20157625 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctgaccacgatt----ggagctttgtcctccccacgat 20157701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 323
Target Start/End: Original strand, 20157706 - 20157761
Alignment:
Q  267 aaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20157706 aaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 20157761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 237
Target Start/End: Original strand, 36134120 - 36134196
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||| ||||||    
T  36134120 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatt----tgagctttgtcctccccacgat 36134196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 148
Target Start/End: Original strand, 15353373 - 15353464
Alignment:
Q  57 tgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatt 148  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  15353373 tgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgatt 15353464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 148
Target Start/End: Original strand, 16351942 - 16352008
Alignment:
Q  82 tgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatt 148  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  16351942 tgtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgatt 16352008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12569809 - 12569761
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  12569809 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 12569761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 4)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 23 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9411 - 9068
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  9411 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgcataagatgacgtttagatccaaatt 9312  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    ||| |||||| | ||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9311 attagatgcttattgatatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattaataggagctt 9213  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9212 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaa 9113  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9112 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 9068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Original strand, 2821 - 2992
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  2821 tttgttgata-gagtacatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 2910  T
Q  256 tccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  2911 tccccacgattaaagtatattaata-ttatgatgacgattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 2992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 314
Target Start/End: Original strand, 73818 - 73877
Alignment:
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73818 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 73877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 260 - 314
Target Start/End: Original strand, 81468 - 81521
Alignment:
Q  260 cacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  81468 cacgattaaagtatattaatact-atgatgaagattggtaccacatgcatataag 81521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 38 - 367
Target Start/End: Original strand, 8902 - 9230
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||  ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  8902 tgtgacttgaccgtgctgctgctgttgtttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgctcattg 9000  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9001 atatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 9100  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9101 ttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgttgcatt 9200  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9201 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 9230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 23 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 10248 - 9904
Alignment:
Q  23 atcatcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaatt 122  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10248 atcatcctgttgttgtgtgacttgactatgctgctgctcttatttaactaagtgcataaggtctatatatgatgaataagatgacgtttatctccaaatt 10149  T
Q  123 attggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctt 222  Q
    |||||||||  | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  10148 attggatgcatattgatatgatgattacggtgaattgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcttcacgacgattattacgagctt 10049  T
Q  223 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10048 tgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa 9949  T
Q  323 gagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9948 gagcattttcgcattgtcgtgtctaagatgctatgttgttgatga 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Original strand, 14587 - 14913
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  14587 tgtgacttgactatggtgctgttgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcacattg 14686  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||||||||||||| |||||||||     
T  14687 atatgatgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtccttaccacga----taggagctttgtcatccgcacga- 14781  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14782 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataagaagtctaagagcattgtcgcatt 14881  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14882 gtcatgtctaagatgctatgttgatgatgatg 14913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 242116 - 241791
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  242116 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 242017  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  242016 atatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 241922  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241921 t-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 241823  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  241822 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 241791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23216 - 23026
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||      
T  23216 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatc- 23119  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||| |||| |     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23118 ---ggagctttgtcctccacacggt-----aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaattc-tatgatgacgattggcaccacatgcatata 23028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Original strand, 15035 - 15369
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  15035 tgttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactatgtgcataatgtctatatatgatgaa-atgatgatgtttagctccaaattattggatgca 15133  T
Q  133 gactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccg 231  Q
     | |||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15134 tattgatatgttgattatggtgatttgttcataagagttcatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctccg 15233  T
Q  232 cacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15234 cacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgt 15333  T
Q  332 cgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    | ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  15334 cacattgtcatgtctataatgttatgttgttgatga 15369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 33 - 360
Target Start/End: Original strand, 19619 - 19947
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  19619 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgca 19718  T
Q  133 gactga-tatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctcc 230  Q
       ||| || | ||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19719 tgttgaatacgatgattacggtgttgtgttgatatgagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttatcctcc 19817  T
Q  231 gcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19818 gcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaaaagcattg 19917  T
Q  331 tcgcattgtcatgtctaatatgctatgttg 360  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19918 tcgcattgtcatgtctaagatgctttgttg 19947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 3)
Name: scaffold0242
Description:

Target: scaffold0242; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19634 - 19309
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  19634 tgtgacttgactatgatgctgttgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgatgtttagctccaaattattggatgcatattg 19535  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||||||||||||    
T  19534 atatgatgattacgatgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccgcacgat 19440  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19439 t-attaggagcattgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtctcatt 19341  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  19340 gtcgtgtctaagatgctaagttgttgatgatg 19309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 190 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 25634 - 25456
Alignment:
Q  190 gagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatg 289  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25634 gagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatg 25536  T
Q  290 acgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  25535 atgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtctcattgtcgtgtctaagatgctaagttgttgatgatg 25456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0242; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25808 - 25589
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    ||    
T  25808 tgtgacttgactatgatgctgttgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgatgtttagctccaaattattggatgcattttg 25709  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||     
T  25708 atatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatga----taggagctttgtcctccgcacga- 25615  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25614 ttattaggagctttgtcctccgcacg 25589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 49 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12491 - 12175
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatt 148  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  12491 tatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatt 12393  T
Q  149 tcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggag 247  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12392 acggtgatttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggag 12295  T
Q  248 ctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta 347  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  12294 ctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgtcca 12195  T
Q  348 atatgctatgttgttgatga 367  Q
      ||| ||||||||||||||    
T  12194 tgatgttatgttgttgatga 12175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 8)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7074 - 6735
Alignment:
Q  26 atcatgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattatt 125  Q
    ||||| ||||| ||||||| |  ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  7074 atcatcttgttatgtgacttgtttatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattatt 6976  T
Q  126 ggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgt 225  Q
    ||||||    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6975 ggatgcatgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcataacatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgt 6876  T
Q  226 cctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 325  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6875 cctccgcacgatttat-aggagccttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 6777  T
Q  326 cattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  6776 cattgtcacattatcatgtccatgatgctatgttgttgatga 6735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 49 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13576 - 13260
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatt 148  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  13576 tatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatt 13478  T
Q  149 tcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggag 247  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13477 acggtgatttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggag 13380  T
Q  248 ctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta 347  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  13379 ccttgtcctctgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattatcatgtcca 13280  T
Q  348 atatgctatgttgttgatga 367  Q
      ||||||||||||||||||    
T  13279 tgatgctatgttgttgatga 13260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 49 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 23104 - 22788
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatt 148  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  23104 tatgctgctgctgttatttaactaagtgcatagtgtatttatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatt 23006  T
Q  149 tcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggag 247  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23005 acggtgatttgtccataagagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggag 22908  T
Q  248 ctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta 347  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  22907 ccttgtcctctgcacgattaaagtatattaatatttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattatcatgtcca 22808  T
Q  348 atatgctatgttgttgatga 367  Q
      ||||||||||||||||||    
T  22807 tgatgctatgttgttgatga 22788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 33 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 57108 - 56799
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| | | | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  57108 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgtaacgaataagatgacgtttaactccaaattattggatgca 57009  T
Q  133 gactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctcc 230  Q
       |||| | | ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  57008 tgttgattacgatgattacg-tgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctcc 56911  T
Q  231 gcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 330  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56910 gcatg-tttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 56812  T
Q  331 tcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||    
T  56811 tcgcattgtcatg 56799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 33 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 41601 - 41292
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| || |||| || |||| ||||||||||||||||||||||  ||| | | | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||     
T  41601 tgttatgtgacttgattatgttgctgctgttatttaactaagtgcataatgattatgtgtaacgaataagatgacgtttaactccaaattattggatgca 41502  T
Q  133 gactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctcc 230  Q
       |||| | | ||||| || || ||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41501 tgttgattaggatgattacg-tgttttgttgtttagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctcc 41404  T
Q  231 gcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 330  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41403 gcatg-tttattaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattg 41305  T
Q  331 tcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||    
T  41304 tcgcattgtcatg 41292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 67511 - 67278
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||  ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  67511 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgtc-atatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 67414  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67413 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 67315  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  67314 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 67278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 58989 - 59277
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  58989 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 59087  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  59088 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcttttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 59182  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  59183 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaaatatattaatacttatgatgacgattggtatcacatgcatataag 59277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 132528 - 132473
Alignment:
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag 323  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  132528 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataagaggtctaag 132473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 78277 - 77945
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| || ||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  78277 tgttatgtgacttgattatgctgctgttgttatttaactaagtgcatattgtattcatacgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgca 78179  T
Q  133 gactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccg 231  Q
       ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78178 tgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccg 78080  T
Q  232 cacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgt 331  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78079 cacgatttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgt 77981  T
Q  332 cgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    | |||||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  77980 cacattgtcatgtccataatgccatgttgttgatga 77945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 238
Target Start/End: Original strand, 60833 - 61009
Alignment:
Q  57 tgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgat 156  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||| || || |    
T  60833 tgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgattacgatgtt 60932  T
Q  157 ttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||||||||    
T  60933 ttgttgat-agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccatga----taggagctttgtcctccgcacgatt 61009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0572 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0572
Description:

Target: scaffold0572; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 49 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 9899 - 9583
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatt 148  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  9899 tatgctgctgctgttatttaacttagtgcatagtgtatttatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgatt 9801  T
Q  149 tcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagc 248  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9800 acggtgatttgttcataagagtccatgcataacatttcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttat-aggagc 9702  T
Q  249 tttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaa 348  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |     
T  9701 tttgtcctccgcacaattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatgtccat 9602  T
Q  349 tatgctatgttgttgatga 367  Q
     ||||||||||||||||||    
T  9601 aatgctatgttgttgatga 9583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 38 - 369
Target Start/End: Original strand, 25024 - 25348
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  25024 tgtgacttgactatgctgctgctgttatttaacta-gtgtataatgtctatgtatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcacattg 25122  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||| ||||| |  || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    || ||||||||||||| ||||||    
T  25123 atatgatgattacaatgttttgttgata-gagtccatgcattagcgttcattgagcttagtcctcaccatgat----agaagctttgtcctccacacgat 25217  T
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25218 t-attaggagatttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgaagacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 25316  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25317 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 25348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 33 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 74061 - 73725
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata--atgtct--atatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    |||| ||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||    
T  74061 tgttatgtgacttgattatgctgctgctgttatttaactaagtgcattgtatgtatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttgga 73963  T
Q  129 tgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc 227  Q
    |||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  73962 tgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcc 73864  T
Q  228 tccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73863 tccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagca 73765  T
Q  328 ttgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  73764 ttgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 73725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 369
Target Start/End: Original strand, 228478 - 228724
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | |||| || |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||     
T  228478 ctccaaattattggatgtataagtgatttgatgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctatgtcctcaccacgattt 228576  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
        |||||||| ||||  ||||||      ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  228577 ----gagctttg-cctcaccacgatc-----ggagctttgtcctctacacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcataaa 228665  T
Q  313 aggagtctaag-agcattgtcgca-ttgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
      | |||||||  ||||||||||| |||||  |||||| ||| |||||| |||||||||    
T  228666 gagtgtctaagttgcattgtcgcatttgtcgagtctaagatgttatgttattgatgatg 228724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 8)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 62 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26676 - 26395
Alignment:
Q  62 ttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactga-tatgttgatttcggtgatttgt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    ||| |||| ||| | || || |||||    
T  26676 ttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatgttgaatatgatgactacgatgttttgt 26577  T
Q  161 tgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccg 259  Q
    | |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26576 tcataagattccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcaccacgatttttaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccg 26479  T
Q  260 cacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26478 cacgattaaagtatattaatatttatgataacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 26395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43377 - 43148
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||     
T  43377 tgttatgtgacttgactatgctgctactgttatttaactaagtgcaatatgtctatacatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggaagca 43279  T
Q  133 gactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacga-ttattaggagctttgtcctccg 231  Q
       ||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  43278 tgttgatatgttgatcacggtgatt-gttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatttattaggagctttgtcctctg 43180  T
Q  232 cacgatttattaggagctttgtcctccgcacg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43179 cacgatttattaggagctttgtcctctgcacg 43148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 43166 - 42987
Alignment:
Q  190 gagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttt-aaagtatattaatacttatga 287  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43166 gagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctccgaacgttttaaagtatattaatacttatga 43067  T
Q  288 tgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  43066 tgacgattggtaccacatgcatataacgagtctaagagcattgtcacattgtgatgtctataatgctatgttgttgatga 42987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 168 - 314
Target Start/End: Original strand, 38977 - 39117
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||| |||    
T  38977 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccacacgatta 39070  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39071 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 39117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 36330 - 36547
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        
T  36330 ctccaaattattggatgtataagtgatatgttgattacggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---t 36426  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgat------tt-------------attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacga 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||      ||              ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36427 ttaggagctttgtcctccgcacgataggagctttgtcctctgcacgtttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacga 36526  T
Q  294 ttggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  36527 ttggtaccacatgcatataag 36547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6923 - 6769
Alignment:
Q  151 ggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| |||| || |    ||||||    
T  6923 ggtgatttgttgata-gagtccatccattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccacacgtttca----gagctt 6833  T
Q  251 tgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6832 tgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 6769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 168 - 340
Target Start/End: Original strand, 11460 - 11626
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||| ||||   |||| ||| ||||||||| | |||    
T  11460 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta---ggagctttgtcctccacacgtttta---ggagttttatcctccgcaggatta 11553  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  11554 aagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 11626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 43194 - 43120
Alignment:
Q  190 gagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg 263  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43194 gagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacgatttattaggagctttgtcctctgcacg 43120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0744 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0744
Description:

Target: scaffold0744; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 38 - 367
Target Start/End: Original strand, 3717 - 4048
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcata----atgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctg 133  Q
    ||||||| || ||||||| |||| || |||||||||||||||     || | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||      
T  3717 tgtgacttgattatgctgctgctgttgtttaactaagtgcattgtatatatttatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattgttggatgcat 3815  T
Q  134 actgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgc 232  Q
      ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3816 gttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatttcattgagcttagtcctcaccacatttattaggagctttgtcctccgc 3914  T
Q  233 acgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtc 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  3915 acgatt-attaggagctttgtcctccgtacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaagtgtctaagagcattgtc 4013  T
Q  333 gcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
     |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  4014 acattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 4048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 307100 - 306866
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  307100 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 307002  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  307001 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306903  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  306902 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 306866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0052
Description:

Target: scaffold0052; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 1157 - 1391
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1157 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 1255  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1256 cgattattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 1354  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1355 catataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 1391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10279 - 10106
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  10279 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatta 10182  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10181 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 10106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0052; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 56701 - 56528
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  56701 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagttttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatta 56604  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  56603 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 56528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 6)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8063 - 7829
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8063 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 7965  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7964 cgtttattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 7866  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7865 catataagaagtctaagagcattgtcacattgtcatg 7829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 367
Target Start/End: Original strand, 73001 - 73259
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  73001 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 73099  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  73100 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 73198  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  73199 catataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatgttcataatgctatgttgttgatga 73259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30530 - 30295
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaa-ttattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    ||||| ||||||  || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30530 gtttagctccaaaattattggatgcatgttgataagttgatcacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 30432  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30431 acgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 30333  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30332 gcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 30295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 166 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 62210 - 62041
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| |    
T  62210 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta---ggagctttgtcctccacacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgat 62117  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtca 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    
T  62116 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 62041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 19188 - 18998
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | |||| ||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  19188 ctccaaattattggatgtataagtgatttgttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt 19090  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
        |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19089 ----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatac-tatgatgatgattggtaccacatgcatata 19000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 12904 - 12689
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | |||| ||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  12904 ctccaaattattggatgtataagtgatttgttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt 12806  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
        |||||||||||||  |||||||     |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12805 ----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagttttgtcctccccacgattaaagtatattaatact-atgatgatgattggtaccacatgcatata 12716  T
Q  313 ag-gagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    || | |||||||  |||||||||||||    
T  12715 agagtgtctaagttgcattgtcgcatt 12689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 5)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 105989 - 106223
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  105989 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagtccatgcat-agcatctcattgagcttagtcctcacca 106087  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  106088 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggaactacatg 106186  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106187 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 106223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 126224 - 126457
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || || |||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  126224 gtttagctccaaattattggatgcatgttgatatgttgattacgatgttttgttcataagagaccatgcat-agcatctcattgagcttagtccttacca 126322  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  126323 c-attattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccgcatg 126420  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126421 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 126457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 314
Target Start/End: Original strand, 65796 - 66082
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  65796 tgttgctgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtttatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 65894  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattagg 217  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||    
T  65895 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacaatta---gg 65989  T
Q  218 agctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  65990 agctttgtcctccgcacgatt----aggagcattgtctcccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 66082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 32 - 310
Target Start/End: Original strand, 61882 - 62162
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggat 129  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  61882 ttgttgtgttacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtttatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggat 61980  T
Q  130 gc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggag 219  Q
    || ||| ||||||||||||| || |||||         |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||    
T  61981 gcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggag 62075  T
Q  220 ctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 310  Q
    |||||||||||||| ||||    |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  62076 ctttgtcctccgcatgatt----aggagcattgtcctccgcacgattaaattatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 62162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 144 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 80253 - 80090
Alignment:
Q  144 tgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttatt 242  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||        
T  80253 tgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgttta---ggagctttgtcctccgcacgatt---- 80162  T
Q  243 aggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80161 aggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 80090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 9919 - 10153
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||| || || |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9919 gtttagctccaaattattggatgcatgttgataagttgattacgatgttttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacca 10017  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10018 cgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 10116  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  10117 catataaggagtctaggagcattgccacattgtcatg 10153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 22147 - 21935
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22147 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 22050  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22049 cctccgcacgactaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatatggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 21950  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||| |||||||    
T  21949 tatgttgatgatgat 21935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Original strand, 4241 - 4453
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4241 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 4338  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4339 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 4438  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  4439 tttgttgatgatgat 4453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0553 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0553
Description:

Target: scaffold0553; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 156 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8520
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgt 253  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8732 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgttttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgt 8635  T
Q  254 cctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgc 353  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8634 cctccgcacgattaaagtatatttatacttatgatgacgattggtacctcatgcatatacggagtctaggagcattgtcacattgtcatgtctattatgc 8535  T
Q  354 tatgttgttgatgat 368  Q
    | ||||| |||||||    
T  8534 tttgttgatgatgat 8520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 108 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 56976 - 56717
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgat-atgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacc 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||| | | ||||| || || |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  56976 gtttagctccaaattattggatgcatgttgattacgatgattacg-tgttttgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcacc 56879  T
Q  206 acgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56878 acgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 56780  T
Q  306 gcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  56779 gcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatgattaagatgccttgttgatgatgat 56717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 71069 - 70877
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  71069 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta 70971  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  70970 ---ggagctttgtcctccgcacgat-----aggagttttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 70879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 139712 - 139520
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||     
T  139712 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgttt- 139615  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       ||||||||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139614 ---ggagctttgtcctccgcacg----tttaggtgctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 139522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 156 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 101027 - 100854
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||     ||||||||||||||| ||||||     |||||||||||||    
T  101027 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatc----ggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcc 100938  T
Q  256 tccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  100937 tccacacgattaaagtatattaatac-tattatgatgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 100854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 314
Target Start/End: Original strand, 4143 - 4427
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctata--tatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  4143 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtacatgaagtctataaatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 4241  T
Q  128 atgctgactga-tatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattatt-aggagctttg 224  Q
    ||||    ||| || | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4242 atgcatgttgaatacgatgattacggtgttttgttgataagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgattttttaggagctttg 4340  T
Q  225 tcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4341 tcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 156 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38637 - 38451
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    |||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38637 tttgttcatatgtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 38540  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  38539 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 38451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 158 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 37994 - 37809
Alignment:
Q  158 tgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc-tccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  37994 tgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtccctccgcacgttttat-aggagctttgtcc 37897  T
Q  256 tccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37896 tccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 37809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Original strand, 14529 - 14670
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |    
T  14529 agagtccatacattagcattcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgat 14621  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14622 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 14670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 158 - 343
Target Start/End: Original strand, 76818 - 77003
Alignment:
Q  158 tgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcc-tccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  76818 tgttcataagtgtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagctttgtccctccgcacgttttat-aggagctttgtcc 76915  T
Q  256 tccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  76916 tccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcacattgtcatg 77003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 193 - 367
Target Start/End: Original strand, 1 - 174
Alignment:
Q  193 cttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacg 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 cttagtcctcaccacgtttattaggagctttgtcctccgcacgatt-attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacg 99  T
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtctaatatgctatgttgttgatga 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  100 attggtaccacatgcatataaggagataaagagcattgtcacattgtcatgtccataatgctatgttgttgatga 174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Original strand, 25 - 73
Alignment:
Q  190 gagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25 gagctttgtcctccgcacgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 73  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Original strand, 59564 - 59798
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || ||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  59564 gtttaactccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcctatgtgtccatgcat-agcatatcattgagctttgtcctcacca 59662  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59663 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 59761  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  59762 catataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatg 59798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Original strand, 67571 - 67859
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  67571 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttacttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 67669  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  67670 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 67764  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67765 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 67859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 108 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 139069 - 138835
Alignment:
Q  108 gtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcacca 206  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    ||||| || |||| || || ||||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  139069 gtttaactccaaattattggatgcatgttgataagtcgattacgttgttttgttcctatgtgtccatgcat-agcatatcattgagctttgtcctcacca 138971  T
Q  207 cgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 306  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  138970 cgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatg 138872  T
Q  307 catataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  138871 catataaagagtctaagagcattgtcacattgtcatg 138835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 169 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25290 - 25117
Alignment:
Q  169 gtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  25290 gtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaaaattaggagctttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtcctccgcacgatta 25193  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatg 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25192 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaggagcattgtcacattgtcatg 25117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 65 - 219
Target Start/End: Original strand, 5873 - 6026
Alignment:
Q  65 tttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgat 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5873 tttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgctcattgatatgttgattacggtgatttgttgat 5971  T
Q  165 aagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggag 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5972 aagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggag 6026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 156 - 332
Target Start/End: Original strand, 32481 - 32656
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcat-tcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtc 254  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  32481 tttgttgttaagagtccatgcat-agcatatcattgagcttagtcctcaccacgaatattaggagttttgtcctccgcacgttttat-aggagctttgtc 32578  T
Q  255 ctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtc 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  32579 ctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatatacggagtctaggagcattgtc 32656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0656 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0656
Description:

Target: scaffold0656; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 238 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1217 - 1086
Alignment:
Q  238 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1217 ttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcatt 1118  T
Q  338 gtcatgtctaatatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1117 gtcgtgtctaagatgctatgttgttgatgatg 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 314
Target Start/End: Original strand, 5369 - 5657
Alignment:
Q  30 tgttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat--gatgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  5369 tgttgttgtgtgacttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtttatatatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 5467  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  5468 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 5562  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5563 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 5657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 12258 - 11970
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg----atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgg 127  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||     ||||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  12258 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatattatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattgg 12160  T
Q  128 atgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattag 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |    
T  12159 atgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---g 12065  T
Q  217 gagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12064 gagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 11970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Original strand, 16791 - 16989
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  16791 tgataagttgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacgatta---ggagttttgtcctccgcacg 16886  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
     ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  16887 tttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgc 16982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 36476 - 36669
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  36476 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgtcgat-agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 36571  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36572 ttaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 36667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 53513 - 53339
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  53513 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 53424  T
Q  256 tccgcacgtt---taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| |   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  53423 tccccacgatgcttaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 53339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 189767 - 189960
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  189767 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacgatta 189865  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  189866 ---ggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 189958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 337
Target Start/End: Original strand, 25075 - 25290
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||      
T  25075 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgttctcaccacgat-- 25171  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
      ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25172 --aggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctcagcacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcatata 25264  T
Q  313 aggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||  |||||||  |||||||||||||    
T  25265 agatgtctaagttgcattgtcgcatt 25290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 248 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14843 - 14722
Alignment:
Q  248 ctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgtcatgtcta 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  14843 ctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagagcattgtcgcattgttgtgtcta 14744  T
Q  348 atatgctatgttgttgatgatg 369  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  14743 agatgctatgttgttgatgatg 14722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 33050 - 33244
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33050 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacgatta 33148  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33149 ---ggagctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 33242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 32 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 286 - 1
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatg---atgaataaggtgacgtttagctccaaattattgga 128  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    ||  | | | |||||||||||||||||||||||||    
T  286 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatatatatattgaaatgatgacgtttagctccaaattattgga 187  T
Q  129 tgc-tgactgatatgttgatttcggtgatt---------tgttgataagagtccatgcattagcatt-cattgagcttagtcctcaccacgattattagg 217  Q
    ||| ||| ||||||||||||| || |||||         ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  186 tgcatga-tgatatgttgattacgatgattacggtgttttgttgttaagagtccatgcat-agcatttcattgagctttgtcctcaccacgatta---gg 92  T
Q  218 agctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  91 agctttgtcctccgcacgtttta---ggagctttgtcctccgcacgataaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 33 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 178 - 1
Alignment:
Q  33 tgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgct 132  Q
    |||| ||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||     
T  178 tgttatgtgacttgactatgttgctgctgttatttaactaagtgcatattgtttttatatgatgaa-atgatgacgtttagctccaaattattggatgca 80  T
Q  133 gactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt 211  Q
       ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79 tgttgatatgttgattacggtgatttgttcataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 136 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15315 - 15117
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||    
T  15315 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta---ggagctttgtcctccgcacg 15220  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
     ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  15219 tttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatgttaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgc 15124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 168 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 9283 - 9118
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| | |    
T  9283 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---attaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgatga 9191  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  9190 aagtattttaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gagtctaagttgcattgtcgcattgtc 9118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 114 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 9904 - 9684
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatg-ctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || |    
T  9904 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttg-ttagagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacc---atga 9809  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
    |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9808 ttaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 9713  T
Q  313 aggagtctaag-agcattgtcgcattgtca 341  Q
    | | |||||||  |||||||||||||||||    
T  9712 a-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtca 9684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 136 - 340
Target Start/End: Original strand, 77299 - 77495
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  77299 tgataagttgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacg 77394  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
         ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||    
T  77395 ----tttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa-gagtctaagttgcattgttgc 77489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1897 - 1658
Alignment:
Q  94 atgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgag 192  Q
    ||||||||| ||| | | ||||||||||||||||| |  | | ||||| |||||||  |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1897 atgaataagttgatgatgagctccaaattattggaagtataagtgataagttgattaaggtattttgttgttaa-agtccatgcattagcattcattgag 1799  T
Q  193 cttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacg 292  Q
    ||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||     |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1798 ctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacg----tttaggagccttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacg 1706  T
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  1705 attggtaccacatgcatataa-gagtctaagttgcattgtcgcattgtc 1658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Original strand, 20592 - 20762
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||   ||||||||||||||| ||||    
T  20592 tgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcatcaccatgatta---ggagctttgtcctccacacg 20687  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20688 att----aggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 20762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6629 - 6489
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |    
T  6629 agagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgat----aggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcctccgcacgat 6538  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6537 taaagtatattaatacttatgatgacaattggtaccacatgcatataag 6489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2868 - 2692
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||| ||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |  |    
T  2868 tgtgacttgactgtgcttctgctgttgtttaactaagtgcataatgtctatatatgatgattaagatgacgtttggctccaaattattggatgcatatcg 2769  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattatta 215  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2768 atatgatgattacgatgttttgttgat-agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgtttatta 2692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 282 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 2694 - 2651
Alignment:
Q  282 ttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2694 ttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaagag 2651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9369 - 9229
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| |    
T  9369 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgat 9278  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9277 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 136 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8477 - 8283
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  8477 tgataagttgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacg 8382  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgc 334  Q
         ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||    
T  8381 ----tttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgatagcacatgcatataa--agtctaagttgcattgtcgc 8288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15525 - 15403
Alignment:
Q  212 attaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatat 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15525 attaggagctttgtcctccgcacgttt----aggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattgatagcacatgcatat 15430  T
Q  312 aaggagtctaag-agcattgtcgcattgt 339  Q
    ||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  15429 aa--agtctaagttgcattgtcgcattgt 15403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 136 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15621 - 15498
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  15621 tgataagttgattaaggtgttttgttgttaa-agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccgcacg 15526  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15525 ----attaggagctttgtcctccgcacgttta 15498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 151 - 314
Target Start/End: Original strand, 6384 - 6538
Alignment:
Q  151 ggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctt 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||| |||| || |    ||||||    
T  6384 ggtgatttgttgata-gagtccatccattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctccacacgtttca----gagctt 6474  T
Q  251 tgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6475 tgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 6538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 168 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 1847 - 1681
Alignment:
Q  168 agtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgttta 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||| ||||   |||| ||| ||||||||| | |||    
T  1847 agtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgatta---ggagctttgtcctccacacgtttta---ggagttttatcctccgcaggatta 1754  T
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  1753 aagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 1681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 114 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 36307 - 36090
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattat 213  Q
    |||||||||||||||||   | ||||| |||||||  | || ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||    | |    
T  36307 ctccaaattattggatgtaaagtgataagttgattaagatgttttgttgtta-gagtccatacattagcattcattgagctttgtcctcgcca----tgt 36213  T
Q  214 taggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36212 taggagctttgtcctccgcacg----tttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 36117  T
Q  314 ggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
     | |||||||  ||||||||||||||||    
T  36116 -gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 36090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 314
Target Start/End: Original strand, 6128 - 6298
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    |||||||||||||||  || |    
T  6128 tgataagttgattaaggtgttttgttgtta-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----aggagctttgtcctctacaag 6222  T
Q  236 atttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6223 tttta---ggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 6298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 241 - 314
Target Start/End: Original strand, 8224 - 8297
Alignment:
Q  241 ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8224 ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 8297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 240 - 368
Target Start/End: Original strand, 11986 - 12115
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaa-gagcattgtcgcattg 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  11986 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaaggagcattgtcacagtg 12085  T
Q  339 tcatgtctaatatgctatgttgttgatgat 368  Q
    |||||  ||| ||||  ||||| |||||||    
T  12086 tcatgattaagatgccttgttgatgatgat 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 235
Target Start/End: Original strand, 11891 - 12009
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |    
T  11891 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacg---a 11986  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11987 ttaggagctttgtcctccgcacg 12009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 29509 - 29337
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  29509 tttgttgata-gagtctatgcattagcatacactgagctttgtcctcaccacgat----aggagctttgtcctccgcacgatt----aggagctttgtcc 29419  T
Q  256 tccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  29418 tccgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 29337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6674 - 6528
Alignment:
Q  38 tgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactg 137  Q
    ||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  6674 tgtgactcgactatgctactgctgttatttaactaagtgcataatgtctatatatgatgaataagatgacgtttagctccaaattattggatgcatattg 6575  T
Q  138 atatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcatt 185  Q
    ||||| ||||| ||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6574 atatgatgattacgacgttttgttgat-agagtccatgcattagcatt 6528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18303 - 18164
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||     |||| |||||| ||||||||||| |    
T  18303 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccgcacg----tttagtagctttttcctccgcacgat 18212  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 313  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18211 gaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataa 18164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 63803 - 63663
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    ||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||||| |    
T  63803 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatga----taggagctttgtcctccgcac-at---ttaggagctttttcctccgcacgat 63712  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  63711 gaaagtatattaatacttatgatgatgattggtaccacatgcatataag 63663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 340
Target Start/End: Original strand, 35241 - 35289
Alignment:
Q  293 attggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  35241 attggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcattgtc 35289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 166 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 317 - 150
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    || ||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||||||| | || |    
T  317 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatgat----agtagctttgtcctccacacgtttta---ggagctttgtcctccactcgat 225  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcattgtc 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||    
T  224 taaagtatattaatatttatgatgacgtttggtaccacatgcatataa-gtgtctaagttgcattgtcgcattgtc 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 263
Target Start/End: Original strand, 80874 - 81026
Alignment:
Q  104 tgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatttcggt-gatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| | || | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  80874 tgacgtttagctccaaattattggatgcatattgatatgatgaatacgattgttttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctc 80972  T
Q  203 accacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacg 263  Q
    |||   || ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  80973 acc---atgattaggagctttgtcctccgcacg----attaggagctttgtcctccgcacg 81026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 166 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 16625 - 16487
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtt 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    || ||||||||||||||| ||||||     ||||||||| |||||| |||| |    
T  16625 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccatg----ttcggagctttgtcctccacacgat-----aggagctttttcctccacacgat 16535  T
Q  266 taaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16534 tacagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatataag 16487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 240 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9474 - 9400
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9474 attaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 9400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1852 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1852
Description:

Target: scaffold1852; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 241 - 314
Target Start/End: Original strand, 1 - 74
Alignment:
Q  241 ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 ttaggagctttgtcctccgcacgattaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 74  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 337
Target Start/End: Original strand, 18738 - 18953
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | |||| || |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  18738 ctccaaattattggatgtataagtgatttgatgattaaggtgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccatgattt 18836  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
        |||||| ||| ||  |||||||     ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18837 ----gagcttagtcatcaccacgatt-----ggagctttgtcctccccacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcatata 18926  T
Q  313 ag-gagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    || | |||||||  |||||||||||||    
T  18927 agagtgtctaagttgcattgtcgcatt 18953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 314
Target Start/End: Original strand, 9771 - 9961
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||| |||      
T  9771 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgataa-agtccatgaattagcatacattgaactttgtcctcaccaagatc- 9868  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatata 312  Q
       |||| |||||||||| ||||||     |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9869 ---ggagatttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgacgattggtaccacatgcatata 9959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Original strand, 10208 - 10379
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||     ||||| ||||||||| ||||||     |||||||||||||    
T  10208 tttgttgata-gaatccatgcattagcatacattgatctttgtcctcaccacgatc----ggagccttgtcctccacacgat-----aggagctttgtcc 10297  T
Q  256 tccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  10298 tccacacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattgataccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 10379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 156 - 337
Target Start/End: Original strand, 66573 - 66747
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  66573 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt----gagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 66662  T
Q  256 tccgcacgtt--ta-aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataaggagtctaag-agcattgtcgcatt 337  Q
    ||| |||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||    
T  66663 tccccacgatgctataagtatattaatactt-tgatgacgattggtaccacatgcatataagaggtctaagttgcattgtcgcatt 66747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 68898 - 68838
Alignment:
Q  88 tatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgatt 148  Q
    |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||    
T  68898 tataagatgaataagatgtcgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgatt 68838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 241 - 314
Target Start/End: Original strand, 208098 - 208171
Alignment:
Q  241 ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  208098 ttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 208171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 238
Target Start/End: Original strand, 208006 - 208075
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   || ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  208006 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcacc---atgatttggagctttatcctccgcacgatt 208075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 114 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 173292 - 173106
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     
T  173292 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgattt 173194  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 310  Q
        ||||| |||||||  ||||||      ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  173193 ----gagctatgtcctcaccacgatc-----ggagctttgtcctgcacacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcata 173106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 130
Target Start/End: Original strand, 422589 - 422670
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatg 130  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  422589 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacatgatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatg 422670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 114 - 310
Target Start/End: Original strand, 20122 - 20307
Alignment:
Q  114 ctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||     
T  20122 ctccaaattattggatgtataagtgataagttgattaagatgttttgttgata-gagtccatgcattagcatacattaagctttgtcctcaccacgattt 20220  T
Q  213 ttaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 310  Q
        |||||||||||||  ||||||      ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20221 ----gagctttgtcctcaccacgatc-----ggagctttgtcctca-cacgattaaagtatattaatact-atgatgacgattggtaccacatgcata 20307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 240 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11593 - 11523
Alignment:
Q  240 attaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 310  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11593 attaggagctttgtcctccacacgattaaagtatattaatacttatgatgaagattggtaccacatgcata 11523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 11665 - 11567
Alignment:
Q  136 tgatatgttgatttcggtgatttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacg 235  Q
    ||||| |||||||  ||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||    
T  11665 tgataagttgattaaggtgtcttgttgata-gagtccatgtattagcattcattgagctttgtcctcacc---atgattaggagctttgtcctccacacg 11570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 241 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 30789 - 30725
Alignment:
Q  241 ttaggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30789 ttaggagctttgtcctccgcacgatgaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacat 30725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 30841 - 30765
Alignment:
Q  157 ttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgat 237  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30841 ttgttgata-gagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccac-at--ttaggagctttgtcctccgcacgat 30765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29140 - 28880
Alignment:
Q  62 ttatttaactaag-tgcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgc-tgactgatatgttgatttcggtgatttg 159  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||| |||| ||| | | |  ||||||||||||||||  | | ||||||| |||||  | || ||||    
T  29140 ttatttaactaagatgcatga-gtctatacatgatgattaagttgatgatgaattccaaattattggatgtataagtgatatgatgattaagatgttttg 29042  T
Q  160 ttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatt-----------------tatt 242  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    || ||||||| ||||||||| ||||                  |||    
T  29041 ttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacga----tatgagctttctcctccgcatgattaggagctttgtcctcacgatt 28947  T
Q  243 aggagctttgtcctccgcacgtttaaagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcata 310  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  28946 aggagctttgtcctctgcacgattaaagtatattaatac-tatgatgaagattggtaccacatgcata 28880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 1204 - 1085
Alignment:
Q  156 tttgttgataagagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgattattaggagctttgtcctccgcacgatttattaggagctttgtcc 255  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||     |||||||||||||  |||||||     ||||||||||||    
T  1204 tttgttgata-gagtccatgcattagcatacattgagctttgtcctcaccacgatt----tgagctttgtcctcaccacgatt-----ggagctttgtcc 1115  T
Q  256 tccgcac---gtttaaagtatattaatact 282  Q
    ||| |||   | ||||||||||||||||||    
T  1114 tccccacgatgcttaaagtatattaatact 1085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 56 - 10
Alignment:
Q  166 agagtccatgcattagcattcattgagcttagtcctcaccacgatta 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56 agagtccatgcattagcattcattgagctttgtcctcaccacgatta 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 38 - 4
Alignment:
Q  280 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38 acttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 4  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 148
Target Start/End: Original strand, 2494 - 2593
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgat 147  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  2494 tatgctgctgctgttatttaactaaattgcatga-gtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgat 2592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 148
Target Start/End: Original strand, 10354 - 10453
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatgctgactgatatgttgat 147  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||    
T  10354 tatgctgctgctgttatttaactaaattgcatga-gtctatacatgatgaataagatgttgttgagctccaaattattggatgcatattgagatgttgat 10452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 68143 - 68083
Alignment:
Q  32 ttgttgtgtgactggactatgctgttgctattatttaactaagtgcataatgtctatatat 92  Q
    ||||||||||| | |||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  68143 ttgttgtgtgatttgactgtgctactgctgttatttaactaagtgcatgatgtctatatat 68083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 314
Target Start/End: Original strand, 3397 - 3443
Alignment:
Q  268 aagtatattaatacttatgatgacgattggtaccacatgcatataag 314  Q
    |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  3397 aagtatattaatacttattacgttgattggtaccacatgcatataag 3443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 7530 - 7449
Alignment:
Q  49 tatgctgttgctattatttaactaagt-gcataatgtctatatatgatgaataaggtgacgtttagctccaaattattggatg 130  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||    
T  7530 tatgctgctgctgttatttaactaagttgcatga-gtctatacatgatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatg 7449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University