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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5384_high_3 (Length: 384)

Name: NF5384_high_3
Description: NF5384
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5384_high_3
NF5384_high_3
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (18-216)||(22218-22416)
[»] chr5 (16 HSPs)
chr5 (18-216)||(39800133-39800331)
chr5 (88-216)||(40057165-40057293)
chr5 (88-216)||(35188312-35188440)
chr5 (88-216)||(39206821-39206949)
chr5 (19-209)||(3926439-3926629)
chr5 (23-209)||(42878646-42878832)
chr5 (43-216)||(23429510-23429677)
chr5 (88-216)||(33742404-33742531)
chr5 (65-212)||(39886957-39887104)
chr5 (43-216)||(42837778-42837950)
chr5 (19-210)||(26621609-26621800)
chr5 (37-82)||(40057130-40057175)
chr5 (91-139)||(2209869-2209917)
chr5 (19-76)||(33742527-33742584)
chr5 (155-211)||(2209916-2209972)
chr5 (94-162)||(3133302-3133370)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (18-216)||(25293738-25293936)
chr1 (43-209)||(31584933-31585099)
chr1 (78-216)||(29677298-29677436)
chr1 (19-216)||(11894504-11894701)
chr1 (19-216)||(47141031-47141228)
chr1 (26-203)||(2191491-2191668)
chr1 (19-210)||(15378980-15379177)
chr1 (19-216)||(48378772-48378969)
chr1 (88-210)||(25987661-25987783)
chr1 (35-156)||(38264075-38264196)
chr1 (133-216)||(17562520-17562603)
chr1 (150-208)||(42507314-42507372)
chr1 (150-216)||(36728552-36728618)
chr1 (96-216)||(52252893-52253013)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (18-216)||(8959-9157)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (18-216)||(12149228-12149426)
chr3 (19-216)||(27926322-27926519)
chr3 (21-216)||(25874390-25874587)
chr3 (19-214)||(13826296-13826491)
chr3 (19-216)||(3778666-3778862)
chr3 (43-210)||(21288359-21288527)
chr3 (43-210)||(5295482-5295649)
chr3 (19-216)||(48251176-48251373)
chr3 (62-154)||(36585012-36585104)
chr3 (111-216)||(53208798-53208902)
chr3 (118-210)||(26749152-26749244)
chr3 (63-181)||(27519860-27519978)
chr3 (116-182)||(25022411-25022477)
chr3 (167-212)||(36585102-36585147)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (18-216)||(40568625-40568807)
chr4 (26-221)||(36464484-36464679)
chr4 (26-216)||(8818979-8819169)
chr4 (35-210)||(19841991-19842166)
chr4 (50-215)||(22279279-22279443)
chr4 (20-216)||(38951868-38952064)
chr4 (19-199)||(42555582-42555762)
chr4 (57-216)||(41041721-41041880)
chr4 (23-208)||(40714518-40714702)
chr4 (26-211)||(51357450-51357629)
chr4 (19-209)||(43624591-43624768)
chr4 (43-161)||(29117275-29117393)
chr4 (19-208)||(17119979-17120168)
chr4 (23-192)||(23627113-23627282)
chr4 (19-216)||(33340844-33341041)
chr4 (46-207)||(47224071-47224232)
chr4 (141-186)||(48747921-48747966)
chr4 (119-160)||(50667871-50667912)
chr4 (88-159)||(47304063-47304132)
[»] chr7 (14 HSPs)
chr7 (18-221)||(27337257-27337441)
chr7 (19-210)||(1052754-1052948)
chr7 (19-216)||(33189563-33189760)
chr7 (19-210)||(36299048-36299238)
chr7 (35-209)||(7767255-7767429)
chr7 (19-209)||(11038881-11039071)
chr7 (22-216)||(47925083-47925276)
chr7 (19-210)||(2943746-2943936)
chr7 (19-203)||(5973233-5973417)
chr7 (19-195)||(30541196-30541371)
chr7 (19-174)||(23809405-23809560)
chr7 (43-182)||(38440133-38440272)
chr7 (22-190)||(22518891-22519058)
chr7 (138-206)||(43427061-43427129)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (18-216)||(42622357-42622539)
chr2 (238-366)||(5482041-5482169)
chr2 (62-216)||(5110496-5110650)
chr2 (44-216)||(5938947-5939119)
chr2 (19-216)||(5704842-5705039)
chr2 (20-203)||(45150940-45151123)
chr2 (43-208)||(31575637-31575802)
chr2 (62-210)||(13626007-13626155)
chr2 (19-149)||(13807790-13807920)
chr2 (94-182)||(14701489-14701577)
chr2 (285-337)||(5500962-5501014)
chr2 (45-217)||(9490314-9490486)
chr2 (90-146)||(45458242-45458298)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (43-216)||(7622571-7622744)
chr6 (19-210)||(641724-641914)
chr6 (50-210)||(35166981-35167140)
chr6 (21-209)||(10408637-10408825)
chr6 (19-197)||(28582409-28582587)
chr6 (19-216)||(10788721-10788917)
chr6 (19-161)||(8576983-8577125)
[»] chr8 (9 HSPs)
chr8 (19-216)||(8226929-8227126)
chr8 (23-210)||(7986897-7987084)
chr8 (19-221)||(28211598-28211800)
chr8 (19-210)||(9762621-9762812)
chr8 (19-212)||(31006277-31006470)
chr8 (57-216)||(36582620-36582779)
chr8 (35-203)||(7968163-7968331)
chr8 (19-216)||(11481662-11481860)
chr8 (90-211)||(6870294-6870415)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (43-210)||(6640-6807)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (94-216)||(66858-66980)


Alignment Details
Target: scaffold0115 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 22218 - 22416
Alignment:
Q  18 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22218 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcaggtgcggatatccgcgggtgcggataccattaaatccgcatccgt 22317  T
Q  118 atccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22318 atccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccgcggat 22416  T

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Target: chr5 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 16)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39800331 - 39800133
Alignment:
Q  18 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39800331 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgcgggtgcagataccattaaatccgcatccgt 39800232  T
Q  118 atccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39800231 atccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccgcggat 39800133  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 216
Target Start/End: Original strand, 40057165 - 40057293
Alignment:
Q  88 gggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctc 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  40057165 gggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatctatttattttatccgtagatatccattaaggtatccgctc 40057264  T
Q  188 cgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40057265 cgtgtccgtggcggattttatccgcggat 40057293  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 35188440 - 35188312
Alignment:
Q  88 gggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctc 187  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35188440 gggtgtggataccactaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctc 35188341  T
Q  188 cgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35188340 cgtgtccgtggcggattttatccgcggat 35188312  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 88 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39206949 - 39206821
Alignment:
Q  88 gggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctc 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  39206949 gggtgtggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttattttatccatcgatatccattaaggtatccgctc 39206850  T
Q  188 cgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
     ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  39206849 tgtgcccgtggcggattttatccgcggat 39206821  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 3926439 - 3926629
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| |  ||| ||| |||||| |||||| ||||  ||| |||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  3926439 taggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttactcgattttatagcgggtatggatatccgcgggtgtggataccattaaatccgcatccaca 3926538  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatc 209  Q
    ||||||||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3926539 tccattaataagcatgtagttaaaaaatccgtttattttatccatagatatccattaagatatccgctccgtgcctgtggcggattttatc 3926629  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42878832 - 42878646
Alignment:
Q  23 aagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatcca 122  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42878832 aagttgaatggtattaaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgtggataccattaaatccgcattcatatcca 42878733  T
Q  123 ttaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatc 209  Q
    |||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  42878732 ttaattaatgggtatttaaaaaatccgtttattttatctatggatattcattaaagtatctgctctgtgtctgtgacggagtttatc 42878646  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 216
Target Start/End: Original strand, 23429510 - 23429677
Alignment:
Q  43 tatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaa 142  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||    | || ||  |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23429510 tatttatgtaatttactcagtttaatagcgggt----aaatgcg--ggtgtgaataccattaaatccgcatctgtatccattaattagcgagtagttaaa 23429603  T
Q  143 atatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    | |||| ||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  23429604 aaatccgtttatgttattcatggatatccattaagatatccgttccgtgtccgtagcggattttatctacggat 23429677  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33742531 - 33742404
Alignment:
Q  88 gggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctc 187  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  33742531 gggtgtggatacaattacatccgcatctgtatccattaattaacga-tagttaaaaaatccatttattttatccatggatatcaattaaggtatccactc 33742433  T
Q  188 cgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33742432 catgtccgtggaggattttatccacggat 33742404  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 65 - 212
Target Start/End: Original strand, 39886957 - 39887104
Alignment:
Q  65 taatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtg 164  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||| ||    
T  39886957 taatagcgggtacggatacccgcgggtgtagataccatgaaatctgcatctgtatccattaattagcaggtagttgaaatattcgtttattttatccatg 39887056  T
Q  165 gatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccac 212  Q
     |||||||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||||||    
T  39887057 tatatccattaagatatccattctgtgttcgtggcggattttatccac 39887104  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 43 - 216
Target Start/End: Original strand, 42837778 - 42837950
Alignment:
Q  43 tatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaa 142  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||||||   |||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||  || ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  42837778 tatttatgtaatttactcggtttaatagcgggtatagatatctgcgggtgtggatactattaaatctgcata-gtgtccattatttaacggatagttaaa 42837876  T
Q  143 atatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    | |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  42837877 aaatccgtttattttatccatagatatccattaagatatccgctctgtgtctgtggcgggttttatccgcggat 42837950  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 26621609 - 26621800
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||  ||||||||  |||  ||||||  | || ||  |||||||||||||  ||||| ||     
T  26621609 taggaagttgaaaggtattaaggttatttgtgtaatttactcgatttaatagtaggtatggatatatgcggatggagataccattaaatatgcatctgtg 26621708  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||| |||| ||||||||||    
T  26621709 tctgttaattagtgggtagttaaaatatttgtttattttatccatagacatccattaaggtatgcgctctgtatccttggcagattttatcc 26621800  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 82
Target Start/End: Original strand, 40057130 - 40057175
Alignment:
Q  37 taaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggata 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40057130 taaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggata 40057175  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 139
Target Start/End: Original strand, 2209869 - 2209917
Alignment:
Q  91 tgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagtt 139  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2209869 tgcgggtaccattaaatctgcatccgtatccattaattagtgggtagtt 2209917  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 33742584 - 33742527
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtg 76  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  33742584 taggaagttgaatgatattaaggttatttatgtaatttactctgtttaatagcgggtg 33742527  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 211
Target Start/End: Original strand, 2209916 - 2209972
Alignment:
Q  155 tttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcca 211  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| | |||||| |||||||||||||    
T  2209916 tttatccatggatatccgttaaagtatccactccatatccgtgacggattttatcca 2209972  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 162
Target Start/End: Original strand, 3133302 - 3133370
Alignment:
Q  94 ggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccg 162  Q
    ||||| |||||||||| ||   ||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  3133302 ggatatcattaaatccacagttgtatcaattaaatagcggatagttgaaatatccacttattttatccg 3133370  T

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Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25293936 - 25293738
Alignment:
Q  18 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25293936 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcaggtgcggatatccgcgggtgcggataccattaaatccgcatccgt 25293837  T
Q  118 atccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25293836 atccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatctgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccgcggat 25293738  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 43 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31585099 - 31584933
Alignment:
Q  43 tatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaa 142  Q
    |||||| |||||| | || ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31585099 tatttatgtaatttaatcggtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgtggatatcattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaa 31585000  T
Q  143 atatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatc 209  Q
    | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  31584999 aaacccatttattttatccatggatatccattaaggtatccgttccgtgtccatggcggattttatc 31584933  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 78 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29677436 - 29677298
Alignment:
Q  78 ggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaag 177  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29677436 ggatatccgcgggtgtggataccattaaatccgcatccgtatccattaatttgcgggtagttaaaaaatccatttattttatccatggatatccattaag 29677337  T
Q  178 gtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||| |||||    
T  29677336 gtatcagctccgtgtccgttgcagattttatccgcggat 29677298  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 11894504 - 11894701
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||  |||  ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  11894504 taggaagttgaatgatattaaggttatttatgtaatttactcggtttaatagtcggtatggatatccacgggtgtggataccgttaaatccgcatccata 11894603  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||    
T  11894604 tccattaattagcaggtagttaaaaaattcatttattttatccattgatatccattaaggtatccgctccgtgcccgtgacggattatatccgcggat 11894701  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 47141031 - 47141228
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| || ||||||  ||||||  ||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||||||  | || | ||    
T  47141031 taggaagttgaatggtattaagattatttatttaatttactcgatttaatagcgggtatggatatccgcgggtgctgataccattaaatatgtattccta 47141130  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47141131 tccattaattaacgggtagtaaaaaaatccgcttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccgcggat 47141228  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2191668 - 2191491
Alignment:
Q  26 ttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccatta 125  Q
    |||||| | ||||||| |||||| |||||| | || |||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  2191668 ttgaaaagtattaaggttatttatgtaatttattcggtttaatagcaggtatggatatctgcgggtgcggataccattaaatctgcatctgtatccatta 2191569  T
Q  126 attagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggat 203  Q
    |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  2191568 attaacaggtagataaaatatccgtttattttatccatggatatccattaaagtatccgctccatatccgtggcggat 2191491  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 15378980 - 15379177
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatcc--- 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||       
T  15378980 taggaagttgaaaggtattaaggttatttatgtaatttactcaatttaatagcgggtatggatatctgcgggtgtggatactattaaatctgcatccgta 15379079  T
Q  116 ---gtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  |||  |||| |||||| || ||||||||||||    
T  15379080 tccgtatccattaattagcgggcagttaaaatatccgtttatttgatccatggatatccattaaaatatatgctcggtgtccatgacggattttatcc 15379177  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48378969 - 48378772
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| |  ||| ||| |||| | |||| | |||||||||||||| ||||  |||| |||| ||| | | ||| ||||||||||||||  |||    
T  48378969 taggaagttgaatgatattgaggttattgatgtaacttactcagtttaatagagggtatggatgtccgcgggcgtgaatatcattaaatccgcatatgta 48378870  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||    
T  48378869 tccattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttattttatccatggatattcattaagctatccgctccgtgcccgtgatggattttatccgcggat 48378772  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 210
Target Start/End: Original strand, 25987661 - 25987783
Alignment:
Q  88 gggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctc 187  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||     
T  25987661 gggtgtggataccattaaatccacatttgtatccattaattagcgggtagttaaaaaattcatttattttatccatagatatccattaaggtatctgctt 25987760  T
Q  188 cgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
    |||| | ||| |||||| |||||    
T  25987761 cgtgcctgtgacggattatatcc 25987783  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38264196 - 38264075
Alignment:
Q  35 attaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcggg 134  Q
    ||||||| |||||| |||||| | |  ||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  38264196 attaaggttatttatgtaatttaattggtttaatagcgggtatagatatctgcgggtgcggataccattaaattcacatccatatccattaattagcggg 38264097  T
Q  135 tagttaaaatatccatttattt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  38264096 tagttaaaatatccatttattt 38264075  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17562603 - 17562520
Alignment:
Q  133 ggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  17562603 ggtagttaaaaaatttatttattttatctatggatatccattaaggtatccgctccgtgtccatggcagattttatccgcggat 17562520  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 150 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 42507372 - 42507314
Alignment:
Q  150 tttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttat 208  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42507372 tttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccgtgtcagtggcagattttat 42507314  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36728618 - 36728552
Alignment:
Q  150 tttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    |||||||||||| || || ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36728618 tttattttatccatgtatgtccatgaagatatccgctccgtgtctgtggcggattttatccgcggat 36728552  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 216
Target Start/End: Original strand, 52252893 - 52253013
Alignment:
Q  96 ataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccg 195  Q
    ||||||| | ||| |||| |||||  ||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  52252893 ataccatgatatctgcattcgtatttattaattagcatatagttgaaatatctatttattttatctatgaatatttattaaggtatccgttctgtgtccg 52252992  T
Q  196 tggcggattttatccacggat 216  Q
    || | ||||||||||| ||||    
T  52252993 tgacagattttatccatggat 52253013  T

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Target: scaffold0634 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 9157 - 8959
Alignment:
Q  18 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9157 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaataacgggtgcggatatccgcgggtgcggataccattaaatcagcatccgt 9058  T
Q  118 atccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9057 atccattaattaacgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccgcggat 8959  T

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Target: chr3 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Original strand, 12149228 - 12149426
Alignment:
Q  18 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12149228 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaataacgggtgcggatatccgcgggtgcggataccattaaatcagcatccgt 12149327  T
Q  118 atccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12149328 atccattaattaacgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccgcggat 12149426  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27926519 - 27926322
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||| | || |||||||||||  |   ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27926519 taggaagttgaatggtattgaggttatttacataatttattcggtttaatagcgcatatagatatccgcatgtgtggataccattaaatccgcatccgta 27926420  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27926419 tccattaattagcgggtagttaaaaaatctatttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccgcggat 27926322  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25874587 - 25874390
Alignment:
Q  21 ggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatc 120  Q
    |||||||||| |  ||| ||| |||||| |||||  | || |||||||| |||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25874587 ggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatatattcggtttaataacgggtatggatatccgcgggtgtggataccattaaatccgcatccgtatc 25874488  T
Q  121 cattaattagcgggtagttaaaatatccatttattt--tatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  25874487 cattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttattttatatccatggatatccattaaggtatccgctccgtgctcgtgacggattttatccgcggat 25874390  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 13826296 - 13826491
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| |  ||| ||| |||| | |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| ||    
T  13826296 taggaagttgaatgatattgaggttattaatgtaatttactcggtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgtggataccattaaatctgtatccata 13826395  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacgg 214  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  13826396 tccattaattagcgagtagttaaaaaatccgtttattttatccatggatatctattaatgtatctgctccgtgcccgtggcggattttatctacgg 13826491  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3778862 - 3778666
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||| || |  | ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| |||    
T  3778862 taggaagttgaatgatattaaggttatttatgtaatttactctgtttaatagtgg-tatgaatatccgcgggtatggataccgttaaatccgcatctgta 3778764  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  3778763 tccattaattagcggatagttaaaaaatctgtttattttattcatggatatccattaaggtatccgctccgtgcccgtggcggattttatccgcggat 3778666  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 21288359 - 21288527
Alignment:
Q  43 tatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagtt-aa 141  Q
    |||||| |||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  21288359 tatttatgtaatttacttggtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgtggataccattaaatccgcatccctatccattaattagcgggtagttaaa 21288458  T
Q  142 aatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
    || |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  21288459 aaaatccgtttattttatccatagatatccattaagatatccgctccgtgcccgtgacgtattttatcc 21288527  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Original strand, 5295482 - 5295649
Alignment:
Q  43 tatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaa 142  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  5295482 tatttatgtaatttactcagtttaatagcggatatggatatccgcaggtgtagataccattaaatctgcatctgtatccattaattagtgggtagttaaa 5295581  T
Q  143 atatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
    | || | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  5295582 aaatacgtttattttattcatggatatccattaaggtatccgctccgtgcccgtggtagattttatcc 5295649  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 48251373 - 48251176
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    ||||||||| || || ||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||||| |  |||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||| | |    
T  48251373 taggaagtttaatggtattaaggttatttatctaatttactcggtttaatagcggatatggatatacgcgggtagggataccattaaatccgtatctgca 48251274  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  48251273 tccattaattagcagttaattaaaatatccatttattttatccatagatatccattaaagtatctgctccgtatccgtgacagattttatccgcggat 48251176  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 154
Target Start/End: Original strand, 36585012 - 36585104
Alignment:
Q  62 gtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttat 154  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36585012 gtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgcggataccatttaatctgcatccgtatccattaattagcgggtagataaaatatctatttat 36585104  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 216
Target Start/End: Original strand, 53208798 - 53208902
Alignment:
Q  111 catccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
    |||| ||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||  ||||| |||  ||||||||||||    
T  53208798 catctgtatccattaagtaatgggtagttgtaatatccatttattttacccatggatatccattaaggtat-cgcctcgtgttcgtaccggattttatcc 53208896  T
Q  211 acggat 216  Q
    ||||||    
T  53208897 acggat 53208902  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 210
Target Start/End: Original strand, 26749152 - 26749244
Alignment:
Q  118 atccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
    ||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  | ||||||| | ||||||||||    
T  26749152 atccattaaatagcaagtagttgaaatatccatttattttatccattgatatccattaaggtatccactttgagtccgtgacagattttatcc 26749244  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 27519978 - 27519860
Alignment:
Q  63 tttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccg 162  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||| ||||||| || || | | |||||||||||| | ||||||||||||     
T  27519978 tttaataacgggcacggatatccgcggatgcggatcccatgaaatccacatccatatccataaaataacagctagttaaaatattcgtttattttatcca 27519879  T
Q  163 tggatatccattaaggtat 181  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  27519878 tggatgtccattaaagtat 27519860  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 25022477 - 25022411
Alignment:
Q  116 gtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatc 182  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||| |||||||||||    
T  25022477 gtatccattaaataacgggtagttaaaatatctatttatattatccatgaatatcaattaaggtatc 25022411  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 212
Target Start/End: Original strand, 36585102 - 36585147
Alignment:
Q  167 tatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccac 212  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36585102 tatccattaaagtatccgctccatgtccgtggcagattttatccac 36585147  T

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Target: chr4 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 40568807 - 40568625
Alignment:
Q  18 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||                |||||||||||||||||||    
T  40568807 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcgaata----------------ccattaaatccgcatccgt 40568724  T
Q  118 atccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40568723 atccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcgaattttatccgcggat 40568625  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36464679 - 36464484
Alignment:
Q  26 ttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccatta 125  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  36464679 ttgaaaggtattaaggttatttatgtaatttattcagtttaatagcgagtaaggatatttgcgggtgcggatatcattaaatccgcatccgtatctatta 36464580  T
Q  126 attagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggatgcgga 221  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  36464579 attagcggatagttaaaatatccgtttattttatccatggatatccgttaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccgcgggtgcgga 36464484  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8819169 - 8818979
Alignment:
Q  26 ttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccatta 125  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |||||| | | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8819169 ttgaaaggtattaatgttatttatgtaatttatttagtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgcggataccattaaatccgcatccatatccatta 8819070  T
Q  126 attagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    |||| | | |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  8819069 attaacagatagttaaaatatccgtttattttatccatgaatatccgttaaggtatccgcttcgtgtccgtgacggattttatccgcggat 8818979  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Original strand, 19841991 - 19842166
Alignment:
Q  35 attaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcggg 134  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||| |||||||||| |||   ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||      
T  19841991 attaaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcaggtattgatattcgcgggtgtggaaaccattaaatccgcatctttatccattaattagcgat 19842090  T
Q  135 tagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19842091 tagttaaaaaatccgtttattttatccatggatatccattaaggtatccactccgtgtccgtggcggattttatcc 19842166  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 215
Target Start/End: Original strand, 22279279 - 22279443
Alignment:
Q  50 gtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatcca 149  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  22279279 gtaatttactcggtttaatagcggatttggatatccgcgggtgtggatactattaaatctgcatctgtatccattaattaacgggtagttaaaa-atcca 22279377  T
Q  150 tttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacgga 215  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22279378 tttattttatccatggatatcctttaagggatccgtttcgtgtccatggcggattttatccgcgga 22279443  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Original strand, 38951868 - 38952064
Alignment:
Q  20 aggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtat 119  Q
    ||||||||||| |  ||| ||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||| |  |||||   | ||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  38951868 aggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttcctcggtttaatagcggatatggataaatgcgggtgtgaataccattaaatccgcatctgtat 38951967  T
Q  120 ccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||    
T  38951968 ccattaattagcgggtagttaaaaaatctgtttattttatccgtgaatatccattaatgtatccgctccgtacctgtggcggattttatccgcggat 38952064  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 199
Target Start/End: Original strand, 42555582 - 42555762
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| ||  |||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| | ||    
T  42555582 taggaagttgaaaggtattaaggatatttatgtaatttacttggtttaatagcgagtatggatattcgtgggtgcggatatcattaaatccacattcata 42555681  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggc 199  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  42555682 ttcattaattagttggtagttaaaatatctgtttattttattcattgatatccattaaggtatccgctctgtgtctgtggc 42555762  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 216
Target Start/End: Original strand, 41041721 - 41041880
Alignment:
Q  57 actcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattt 156  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41041721 actcggtttaatagcgggtatggatgtccgcgggtgtggatatcattaaattcgcatctgtatctattaattagcgggtagttaaaaaatccatttattt 41041820  T
Q  157 tatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| |||||    
T  41041821 tatccataaatatccattaaggtatccgctccgtgcccgtaatggattttatccgcggat 41041880  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 23 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 40714702 - 40714518
Alignment:
Q  23 aagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatcca 122  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  40714702 aagttgaaaggtattaaagttatttatgtaatttactcggtttaatagcgagtatggatatccgcgggtgcggatgccattaaatctgcatctgtatcca 40714603  T
Q  123 ttaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttat 208  Q
     |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||||||||||    
T  40714602 ctaattag-tggtagttaaaatatccatttattttatcgataaatatccattaatgtatccgcttcgtgcctgtgacggattttat 40714518  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 26 - 211
Target Start/End: Original strand, 51357450 - 51357629
Alignment:
Q  26 ttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccatta 125  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||      ||| ||||    
T  51357450 ttgaaaggtattaaggttatttatgtaatttattcagtttaatagcgggtatggatatccgtgggtgtggataccattaaatccgc------atcaatta 51357543  T
Q  126 attagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcca 211  Q
    |||||| | || ||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  51357544 attagcagataattaaaatatccgtttattttatccataaatatccattaaggtatctgcttcatgtcagtggcggattttatcca 51357629  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Original strand, 43624591 - 43624768
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| | ||| |||||||||   |||||||||||||    
T  43624591 taggaagttgaatgatattaaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcgggtatggatatccgcgagtgtggataccat---atccgcatccgta 43624687  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||          |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43624688 tccattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttgttt----------tatccattaaggtacccgctccgtgtccgtggcggattttatc 43624768  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 161
Target Start/End: Original strand, 29117275 - 29117393
Alignment:
Q  43 tatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaa 142  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||||||    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29117275 tatttatgtaatttattcagtttaatagcggaaatggatatccgcggatgcggataccgttaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaa 29117374  T
Q  143 atatccatttattttatcc 161  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  29117375 atatccgtttattttatcc 29117393  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17120168 - 17119979
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    ||||||||| ||||  ||||||  || ||| |||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  17120168 taggaagttcaaagatattaagattacttatgtaatttactcggtttaatatcgggtatggatatccgcgcgtgcggatgccattaagtccgcattcgta 17120069  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttat 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||||  | ||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  17120068 tccattaattagcggatagttaaaatattcgtttatttcatccacgaatatctattaaggcatccgctctgtgcccgtggtggattttat 17119979  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 23 - 192
Target Start/End: Original strand, 23627113 - 23627282
Alignment:
Q  23 aagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatcca 122  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||| ||||| ||||  ||  | |||| ||||| ||| |||||||||| ||  ||||  |||||||    
T  23627113 aagttgaaaagtattaaggttatttatgtaatttactcggtttagtagcaagtatgcatattcgaggatgcagataccattatatatgcatatgtatcca 23627212  T
Q  123 ttaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgt 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||    
T  23627213 ttaattagcaggtagttaaaatattcgtttattttatccatgtatttccattaaggtatccactccgtgt 23627282  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 33340844 - 33341041
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||  || || ||||  |||||||| || |  ||||||| | |||| |  ||||||||||||| |||||||||    
T  33340844 taggaagttgaaaggtattaatgttatttatatattttactctatttaatagtggatatggatatctgcgggtacatataccattaaatctgcatccgta 33340943  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||   | ||||||| |  |||||||||||| |||||    
T  33340944 tccattaattagtaggtagttaaaatatccgtttattttatccatagatgtctattaaggtatctatttcgtgtccataacggattttatccgcggat 33341041  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 207
Target Start/End: Original strand, 47224071 - 47224232
Alignment:
Q  46 ttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaata 145  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| || ||  |||||||||  ||||   ||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||| || || || |||||    
T  47224071 ttacgtaatttacttaatttaataacgagtatggatatccgcaggtggaaataccatcaaatctgcatctgcatccattaaatagtggataattgaaata 47224170  T
Q  146 tccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggatttta 207  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||  ||| |||||  || ||||||||||    
T  47224171 tccacttattttatctttggatattcattaaggtatttgcttcgtgtttgttgcggatttta 47224232  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 186
Target Start/End: Original strand, 48747921 - 48747966
Alignment:
Q  141 aaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgct 186  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  48747921 aaatatccgtttattttatccttggatatccattaaggtattcgct 48747966  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 50667912 - 50667871
Alignment:
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatc 160  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  50667912 tccattaactagcaagtagttaaaatatccatttattttatc 50667871  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 159
Target Start/End: Original strand, 47304063 - 47304132
Alignment:
Q  88 gggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttat 159  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47304063 gggtgcggat--catcaaatctgcatctgcatccattaaataacggatagtaaaaatatccatttattttat 47304132  T

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Target: chr7 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 27337257 - 27337441
Alignment:
Q  18 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||||||||||    
T  27337257 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggt----------------gcggataccattaaatccgcatccgt 27337340  T
Q  118 atccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggatg 217  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  27337341 atctattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttattcgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcgga---tatccacggatg 27337437  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1052948 - 1052754
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccg-agg--gtgcggataccattaaatccgcatcc 115  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||| | || || |||||||||||  ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  1052948 taggaatttgaaaggtattaaggttatttatgtaatttattcggtataatagcgggtatggatatccgcaggaggtgcggataccattaaatccacatcc 1052849  T
Q  116 gtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1052848 ttatccattaattagcgggtagttaaaatatccgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcgaattttatcc 1052754  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 33189563 - 33189760
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| |||||| |||| || ||||| ||| |  |  |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||| |||    
T  33189563 taggatgttgaatggtattaaggatatttatgtaatttactctgtgtaataacggatatgtttatccgcgggtgtggataccattgaattcgcatctgta 33189662  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33189663 tccattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccgcggat 33189760  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Original strand, 36299048 - 36299238
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||| |||||| | ||||||| |||||| |||||| | |  ||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||  |||  |||    
T  36299048 taggaatttgaaatgtattaaggttatttatgtaatttattg-gtttaatagcgggtatgaatatccgtgggtgcggataccattaaatcaacatttgta 36299146  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36299147 tccattaattagcgggtagttaaaatattcatttattttatccatggatatccattaagatatccgctccgtgtccgtggcagattttatcc 36299238  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 209
Target Start/End: Original strand, 7767255 - 7767429
Alignment:
Q  35 attaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcggg 134  Q
    ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||  |||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||    
T  7767255 attaaggttatttatgtaatttactcagtttaatagtgggtatggatatccgcaggtgtggataccattaaatctgaatccgtgtccattaattaggggg 7767354  T
Q  135 tagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatc 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7767355 tagttaaaaaatccgtttattttattcatggatatccattaaagtatccgctccatgtccgtggcggattttatc 7767429  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11039071 - 11038881
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||||| | |||| |||| |||||||||| |||  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  11039071 taggaagtggaatggtattaagcttatttatgaaatttactcggtttaatagccggtatggatatctgcgggtgtggataccattaaatccgtatccata 11038972  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatc 209  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11038971 ttcattaattagcgggtagttaaaaaatccgtttattttatccatgaatatccattaaggtatctgctccatgtccgtggcggattttatc 11038881  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 216
Target Start/End: Original strand, 47925083 - 47925276
Alignment:
Q  22 gaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatcc 121  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| ||| || | | ||||||||||||||   ||||||  | |||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  47925083 gaagttgaaagatattaaggttatttatgtattt-agtaagtttaatagcgggcatggatatttgtgggtgcggataccattaaatccactttcgtatcc 47925181  T
Q  122 attaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47925182 attaattaatgggtagttaaaatatctatttattttatctaaggatatccattaaggtatccgttccgtgtccgtggcggattttatccgcggat 47925276  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2943936 - 2943746
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    ||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||| |  ||||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||    
T  2943936 taggaagttgaaatgtattaatgttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatccgcggatgtggataccattaaatctgcattcgta 2943837  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  2943836 tc-attaattagcgggtagttaaaatatccgtttattttacccataaatatccattaaggtattcgctccgtatccgtaacggattttatcc 2943746  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 5973233 - 5973417
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| |  ||| ||| |||||| |||||| ||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||    
T  5973233 taggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttactcgatttaatagcgggtatggatatccgcgggtgtgaataccattaaatccgcatctgta 5973332  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggat 203  Q
    |||||||||||| || ||||||||| || | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||    
T  5973333 tccattaattagtggatagttaaaaaattcgtttattttatcaatggatttccattaaggtatccgttccgtgcccatggcggat 5973417  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30541371 - 30541196
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    ||||||||||||||  |||| || |||||| |||  | |||| |||||||| ||| |  ||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||| ||    
T  30541371 taggaagttgaaagttatta-ggttatttatgtatcttactcggtttaataacggatatggatatctgcgggtgcaaataccattaaatcggcatccata 30541273  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccg 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30541272 tccattaattagcgggtagttaaaatattcgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccatgtccg 30541196  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23809560 - 23809405
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| |  ||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||  ||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23809560 taggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcaagtatggatatccgcgggtgtggataccattaaatccgcatccgta 23809461  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccatt 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| || |||||||||    
T  23809460 tccattaattagcgggtagttaaaaaacctgtttattttatccatgaatatccatt 23809405  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 43 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 38440272 - 38440133
Alignment:
Q  43 tatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaa 142  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||| |  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38440272 tatttatgtaatttactcggtttaatagtgggtatggatatctgcaggtgtggataccatcaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaa 38440173  T
Q  143 atatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatc 182  Q
    | || | |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38440172 aaattcgtttattttatctatggatatccattaaggtatc 38440133  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22519058 - 22518891
Alignment:
Q  22 gaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatcc 121  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||| |||||| | ||| ||||||| || ||  ||||||| |  | |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22519058 gaagttgaaagatattaagtttatttatgtaatttattcaatttaataacgtgtatggatatctgctgatgcggataccattaaacccacatccgtatcc 22518959  T
Q  122 attaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgt 190  Q
    ||| ||| || ||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||    
T  22518958 att-atttgcaggtagttaaaatatttgtttattttatctatggatatccattaaggtatttgctccgt 22518891  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 43427129 - 43427061
Alignment:
Q  138 ttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggatttt 206  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| || | || |||||||||    
T  43427129 ttaaaatatccatttattttattcatggatgtccattaaggtatccgctccatgcctgttgcggatttt 43427061  T

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Target: chr2 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 42622539 - 42622357
Alignment:
Q  18 ataggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgt 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                |||||||||||||||||||    
T  42622539 ataggaagttaaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggata----------------ccattaaatccgcatccgt 42622456  T
Q  118 atccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  42622455 attcattaattaacgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgttccgtgtccgtgacggattttatccgcggat 42622357  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 238 - 366
Target Start/End: Original strand, 5482041 - 5482169
Alignment:
Q  238 ctatgcttagtagatggaatctctacaagctccagcatctagacctgtcatataattatctaacaggtgatacaactgaaatgattgaggccttgtcttg 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5482041 ctatgcttagtagatggaatctctacaagctccagcaactagacctgtcatataattatctaacaggtgatacaactgaaacgattgaggccttgtcttg 5482140  T
Q  338 tggaaaccaaagcctgaagtttttaaatt 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5482141 tggaaaccaaagcctgaagtttttaaatt 5482169  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 62 - 216
Target Start/End: Original strand, 5110496 - 5110650
Alignment:
Q  62 gtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatcc 161  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  5110496 gtttaatagcgggtatggatatctgcgggtgtggataccattaaatccgcattcgtatccattaattagcgggtagttaaaaaattcatttattttatcc 5110595  T
Q  162 gtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  5110596 atggatatccattaaggtatccgctctgtgtccgtggcagattttatccgcggat 5110650  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 216
Target Start/End: Original strand, 5938947 - 5939119
Alignment:
Q  44 atttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaa 143  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5938947 atttatgtaatatactcggtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgtagataccattaaatccgcatttgtatccattaattagcgggtagttaaaa 5939046  T
Q  144 tatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
     ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5939047 aatccatttattatatccatgaatatccattaaggtattcgctccatgtccgtgacggattttatctacggat 5939119  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 5704842 - 5705039
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| |  ||| ||| |||||| |||||| |||| |||||||||| | |  | ||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  5704842 taggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcagatatgaatatttgcgggtgtggataccattaaatccacatccgta 5704941  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5704942 tccattaattagcggatagttaaaaaatccatttattttatccacggatatacattaaggtatccgttccgtgcccgtggcggattttatccgcggat 5705039  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45151123 - 45150940
Alignment:
Q  20 aggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtat 119  Q
    ||||||||||| |  ||| ||| |||||| |||||| |||| |||||||||||| |  ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  45151123 aggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcggatatggatatctgtgggtgtggataccattaaatccgcatctgtat 45151024  T
Q  120 ccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggat 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  || |||||||||||    
T  45151023 ccattaattagcggatagttaaaaaatccgtttattttatccatggatatctattaaggtatccgttctatgcccgtggcggat 45150940  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 43 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31575802 - 31575637
Alignment:
Q  43 tatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaa 142  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||||| |  |||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31575802 tatttatgtaatttacttggtttaatagcggatatggatatccgctggtgtggatacaattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaca 31575703  T
Q  143 atatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttat 208  Q
    | || | |||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  31575702 aaattcgtttattttatccatgcatatccattaagatatccactctgtgtcagtggcggattttat 31575637  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 62 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 13626155 - 13626007
Alignment:
Q  62 gtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatcc 161  Q
    ||||||||| ||||  |||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  13626155 gtttaatagagggtatggatattcgcgggtgtagataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaaaatctgtttattttatcc 13626056  T
Q  162 gtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
     | |||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||    
T  13626055 atagatatccattaaggtatccgcttcgcgcccgtggtgaattttatcc 13626007  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Original strand, 13807790 - 13807920
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| |  ||| ||| ||||||  ||||| |||  ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13807790 taggaagttgaatgatattgaggttatttatataatttacttggtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgtggataccattaaatccacatccgta 13807889  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatcca 149  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13807890 tccattaataagcgggtagttaaaaaatcca 13807920  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 182
Target Start/End: Original strand, 14701489 - 14701577
Alignment:
Q  94 ggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatc 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||| ||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||| |||||| ||||    
T  14701489 ggataccatcaaatccgcatccgtatccatcaaatcacggatagttgaaatgtccgtttattttatccatgaatatctattaagatatc 14701577  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 337
Target Start/End: Original strand, 5500962 - 5501014
Alignment:
Q  285 tcatataattatctaacaggtgatacaactgaaatgattgaggccttgtcttg 337  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  5500962 tcatctaattatctaactggtgatataacagaaatgattgaggccatgtcttg 5501014  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 45 - 217
Target Start/End: Original strand, 9490314 - 9490486
Alignment:
Q  45 tttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaat 144  Q
    |||| |||||| |||  ||||||||| |||||||||||||   ||||||  ||||||| ||||  || | | |||||||||| || || |||  | ||||    
T  9490314 tttatgtaatttacttcgtttaatagtgggtgcggatatctacgggtgcaaataccatcaaatatgcgtgcatatccattaaataacgagtaactgaaat 9490413  T
Q  145 atccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggatg 217  Q
     |||||| |||| |||  ||| || |||||||||||| | |  |||||||| | | |||||||||||||||||    
T  9490414 gtccattcatttgatctatgggtaaccattaaggtattcacctcgtgtccgcgacagattttatccacggatg 9490486  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 45458298 - 45458242
Alignment:
Q  90 gtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatat 146  Q
    ||||||||| |||||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  45458298 gtgcggatatcattaaattcgcatatggatccattaattagctggtagttgaaatat 45458242  T

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Target: chr6 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 216
Target Start/End: Original strand, 7622571 - 7622744
Alignment:
Q  43 tatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaa 142  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7622571 tatttacttaatttactcggtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgtggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtaaataaa 7622670  T
Q  143 atatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  7622671 aaatccgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccgcgtccgtggcggattttatccgcggat 7622744  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 641914 - 641724
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    ||||||||||||||  |||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||  |||    
T  641914 taggaagttgaaagttatta-ggttatttatgtaatttactcagtttaatagcggatatggatatccgcggatgcggttaccattaaatcctcatatgta 641816  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  641815 tccattaattagcggatagttaaaatatccgtttattttatccatggatatccattaaaatatccgctccgtgtccgtggtgaattttatcc 641724  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35167140 - 35166981
Alignment:
Q  50 gtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatcca 149  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  35167140 gtaatttactcagtttagtagcgggtatggatatccgcgg-tgcagataccattaaatccacatccgtatcaattaattagcgggtagttaaaatatccg 35167042  T
Q  150 tttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  35167041 tttattttatccatggatatctattaaggtatccgctttgtgtctgtggtggattttatcc 35166981  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10408825 - 10408637
Alignment:
Q  21 ggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatc 120  Q
    |||||||||| || ||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||| ||||  ||||||| | || ||||||| ||| |||||| ||||| |||||    
T  10408825 ggaagttgaatggtattaacgttatttatgtaatttactcggtttaatagtgggtatggatatctgcggatgcggatgccaataaatctgcatctgtatc 10408726  T
Q  121 cattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatc 209  Q
     | || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10408725 tactatttagcgggtagttgaaatatccgtttattttatccatgaatatccattaaggtatccgctccgtttccgtggcggattttatc 10408637  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 197
Target Start/End: Original strand, 28582409 - 28582587
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    ||||||||||||||| || ||   |||||| |||||| | |  ||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||  |||    
T  28582409 taggaagttgaaaggtatcaaaattatttatgtaatttattttgtttaatagcgagtatggatatctgagggtgtggatactattaaatccgtatttgta 28582508  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtg 197  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28582509 tccactaattaacgggtagttaaaatatccgtttattttatccatggatatccatcaaggtatccgctccgtgtccgtg 28582587  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 10788721 - 10788917
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| |  ||| ||| |||||| |||||| | |  |||||||||||  |  |||| |||  ||||| |||||| ||||||||| |||  |||    
T  10788721 taggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttagttggtttaatagcgaatatggatctcctcgggtgtggatactattaaatccacatttgta 10788820  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  10788821 tccattaattagcaggtagttaaaa-attcgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccgtgcccgtggcgaattttatccgcggat 10788917  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 161
Target Start/End: Original strand, 8576983 - 8577125
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| |  ||| ||| ||||||  ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||    
T  8576983 taggaagttgaatgatattgaggttatttatataatttactcggtttaatagcgggtatggatatccacgggtgtggataccattaaatctgcatctgta 8577082  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatcc 161  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| | || ||||||||||||    
T  8577083 tccattaattaacggttggttaaaaaaaccgtttattttatcc 8577125  T

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Target: chr8 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 9)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8227126 - 8226929
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    |||||||||||| |  ||| ||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8227126 taggaagttgaatgatattgaggttatttatgtaatttactcggtttaatagcgggtatgaatatccgcgggtgtggataccattaaatccgcatccgta 8227027  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  8227026 tctattaattagcgggtagttaaaagatccgtttattttatccatgtatatccattaaggtatccactccgtgcccgtgacggattttatccgcggat 8226929  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7987084 - 7986897
Alignment:
Q  23 aagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatcca 122  Q
    |||||||| || ||||||| |||||| |||||| | || ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  7987084 aagttgaatggtattaaggttatttatgtaatttattcggtttaatagcgggtatggatatccgcgggtgtgaataccattaaatccgcatccgtatcca 7986985  T
Q  123 ttaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
    ||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7986984 ttaattagcaggtagttgacaaatccgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccatgtccgtagcggattttatcc 7986897  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28211800 - 28211598
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||  |||||||||||  |  ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  28211800 taggaagttgaaaggtattaaggttatttatgtaatttacttggtttaatagcgaatatggatatctgcgggtgtggatactattaaatccgcattcgta 28211701  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggatgc 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  28211700 tccattaattagtgggtagttaaaatatccgtttattttatccatagatatccattaaagtatctgctctgtgtccgtggcggattttatccgcgggtgc 28211601  T
Q  219 gga 221  Q
    |||    
T  28211600 gga 28211598  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9762812 - 9762621
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
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T  9762812 taggaagttgaatgatattaaggttatttatgtaatttattcgatttaatagcgagtatggatatccgaggatgtggataccatcaaatccgcatccata 9762713  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
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T  9762712 tccattaattagcaggtagttaaaaaatctgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccgtgcccgtggcggattttatcc 9762621  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 31006277 - 31006470
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
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T  31006277 taggaatttgaatggtattaaagttatttatataattcactcggtttaatagctgatatggatatttgtgggtgcagataccgttaaatccgtgttcgtg 31006376  T
Q  119 tccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccac 212  Q
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T  31006377 tccattaattagcggatagttaaaatatccgtttattttatccatggatatccattaagatatccgctccatgtccgtggcggattttatccac 31006470  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 57 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36582779 - 36582620
Alignment:
Q  57 actcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattt 156  Q
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T  36582779 actcggtttaataacgggtatggatattcgcgggtgtgtatactattaaatccgcatccgtatccattaattagtggatagttaaaaaatccgtttattt 36582680  T
Q  157 tatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  36582679 tattcatggatatccattaagatatccgctccgtgttcgtggcggattttatccgcggat 36582620  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7968331 - 7968163
Alignment:
Q  35 attaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcggg 134  Q
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T  7968331 attaaggttatttatgtaatttattcggtttaatagcgaatatggatatacgcgggtgtgaataccattaaatccgcatgcgtatccattaattagcggg 7968232  T
Q  135 tagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggat 203  Q
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T  7968231 tagttgaaaaatccgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctacgtatccgtagcggat 7968163  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 216
Target Start/End: Original strand, 11481662 - 11481860
Alignment:
Q  19 taggaagttgaaaggcattaaggatatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgta 118  Q
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T  11481662 taggaagttgaatgatattgaggttatttacataatttactcggtttaatagcgggtatggatattcgcggatgtggataccgttaaatccacatccata 11481761  T
Q  119 tccattaattagcgggtagtt-aaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatccacggat 216  Q
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T  11481762 tccattaattagcaagtagttaaaaaaatccgtttattttatcgatggatattcatcaaagtatccgctccgtacccgtggcagattttatccacggat 11481860  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 90 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6870415 - 6870294
Alignment:
Q  90 gtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccg 189  Q
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T  6870415 gtgcggataccattaaatctgcatatgtatcaattaattaacgggtagttaaattatatgtttattttatccatggatatccattaagatatccgttctg 6870316  T
Q  190 tgtccgtggcggattttatcca 211  Q
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T  6870315 tatccttgaaggattttatcca 6870294  T

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Target: scaffold0155 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 43 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 6807 - 6640
Alignment:
Q  43 tatttacgtaattcactcagtttaatagcgggtgcggatatccgagggtgcggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaa 142  Q
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T  6807 tatttatgtaatttactcggtttaatagcgggtatgaatatccacgggtgtggataccattaaatccgcatctgtatccattaattaatggttagttaga 6708  T
Q  143 atatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtccgtggcggattttatcc 210  Q
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T  6707 aaatccatttattttatccatggatattcattaagatattcgttccgtgcccgtgacggattttatcc 6640  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 216
Target Start/End: Original strand, 66858 - 66980
Alignment:
Q  94 ggataccattaaatccgcatccgtatccattaattagcgggtagttaaaatatccatttattttatccgtggatatccattaaggtatccgctccgtgtc 193  Q
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T  66858 ggataccattaaatatgtatccatattcatcaattagagggtagataaaatatccgtttattttatccatggatatccattaaggtatccgctccgtgtc 66957  T
Q  194 cgtggcggattttatccacggat 216  Q
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T  66958 tgtgacagattttatccacggat 66980  T

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