View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5386-Insertion-1 (Length: 356)

Name: NF5386-Insertion-1
Description: NF5386
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5386-Insertion-1
NF5386-Insertion-1
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (10-356)||(3409470-3409816)
chr6 (10-356)||(2377937-2378282)
chr6 (137-356)||(29518857-29519076)
chr6 (12-356)||(10073993-10074336)
chr6 (192-356)||(29518495-29518659)
chr6 (192-356)||(32741171-32741335)
chr6 (192-348)||(3409251-3409407)
chr6 (168-356)||(2578445-2578634)
chr6 (192-356)||(35210196-35210360)
chr6 (167-350)||(10074371-10074553)
chr6 (192-356)||(3058218-3058382)
chr6 (167-356)||(16454872-16455063)
chr6 (192-356)||(14748344-14748504)
chr6 (202-356)||(2377756-2377910)
chr6 (200-356)||(2579874-2580030)
chr6 (191-356)||(3415449-3415616)
chr6 (193-356)||(1846741-1846904)
chr6 (192-348)||(26544041-26544197)
chr6 (171-350)||(2579500-2579678)
chr6 (202-349)||(16107680-16107827)
chr6 (202-356)||(16454577-16454731)
chr6 (192-349)||(1127352-1127509)
chr6 (206-356)||(2843560-2843711)
chr6 (167-356)||(10073618-10073804)
chr6 (175-356)||(2578837-2579016)
chr6 (168-356)||(2579111-2579297)
chr6 (137-356)||(16107998-16108207)
chr6 (202-356)||(5832029-5832182)
chr6 (203-355)||(6999799-6999951)
chr6 (200-356)||(593709-593867)
chr6 (203-343)||(1950200-1950340)
chr6 (205-308)||(32460630-32460733)
chr6 (200-354)||(10911565-10911720)
chr6 (206-325)||(9062383-9062501)
chr6 (167-319)||(8481893-8482045)
chr6 (195-352)||(5958613-5958766)
chr6 (167-332)||(6071098-6071264)
chr6 (200-349)||(12092491-12092640)
chr6 (200-356)||(12071693-12071849)
chr6 (200-355)||(12085037-12085191)
chr6 (167-273)||(35210456-35210551)
chr6 (200-355)||(31714671-31714823)
chr6 (10-107)||(29518686-29518784)
chr6 (204-356)||(17135071-17135223)
chr6 (168-316)||(2975521-2975668)
chr6 (137-259)||(33605913-33606034)
chr6 (8-99)||(26544230-26544321)
chr6 (10-88)||(2579387-2579467)
chr6 (268-312)||(22605301-22605345)
chr6 (304-351)||(3409405-3409452)
chr6 (268-319)||(11637760-11637811)
chr6 (237-283)||(14789279-14789325)
chr6 (207-341)||(30618634-30618766)
chr6 (10-88)||(2578730-2578810)
chr6 (10-88)||(16107863-16107943)
chr6 (268-312)||(21130103-21130147)
chr6 (292-350)||(10902438-10902496)
chr6 (10-53)||(2579805-2579848)
chr6 (276-318)||(11638053-11638095)
chr6 (13-53)||(2579042-2579082)
[»] chr3 (88 HSPs)
chr3 (10-356)||(22304378-22304725)
chr3 (60-341)||(4823515-4823796)
chr3 (10-356)||(41359767-41360111)
chr3 (113-356)||(37990641-37990884)
chr3 (108-352)||(15773099-15773346)
chr3 (97-348)||(11661846-11662099)
chr3 (168-356)||(54017818-54018008)
chr3 (202-356)||(43346793-43346947)
chr3 (202-356)||(35946524-35946678)
chr3 (202-356)||(37990979-37991133)
chr3 (200-356)||(15772854-15773010)
chr3 (167-356)||(42342092-42342283)
chr3 (151-356)||(29644583-29644791)
chr3 (191-350)||(39934963-39935124)
chr3 (200-356)||(29644904-29645060)
chr3 (200-356)||(32589704-32589859)
chr3 (200-356)||(33803254-33803410)
chr3 (168-356)||(21832347-21832532)
chr3 (200-356)||(12114564-12114720)
chr3 (200-356)||(42342390-42342546)
chr3 (200-356)||(54018200-54018356)
chr3 (192-349)||(39389062-39389219)
chr3 (167-350)||(22303963-22304141)
chr3 (202-355)||(32462903-32463057)
chr3 (200-356)||(25739427-25739583)
chr3 (202-356)||(52634678-52634831)
chr3 (167-353)||(32462563-32462752)
chr3 (192-356)||(50612449-50612618)
chr3 (200-356)||(53577364-53577520)
chr3 (138-332)||(3135099-3135293)
chr3 (200-352)||(31190017-31190161)
chr3 (200-355)||(45395656-45395811)
chr3 (202-356)||(25755396-25755550)
chr3 (168-351)||(9240118-9240300)
chr3 (202-356)||(3135456-3135617)
chr3 (200-356)||(1634317-1634473)
chr3 (200-347)||(39914252-39914399)
chr3 (202-356)||(45901715-45901870)
chr3 (201-356)||(53117977-53118131)
chr3 (167-255)||(22304213-22304301)
chr3 (200-352)||(8327904-8328060)
chr3 (202-350)||(49336694-49336843)
chr3 (10-179)||(22303759-22303929)
chr3 (192-356)||(37726496-37726652)
chr3 (192-354)||(51886553-51886709)
chr3 (258-355)||(22303662-22303759)
chr3 (200-356)||(44160549-44160702)
chr3 (202-349)||(33175668-33175820)
chr3 (181-332)||(47964544-47964694)
chr3 (210-353)||(42584829-42584970)
chr3 (189-307)||(3384317-3384435)
chr3 (226-324)||(33362327-33362425)
chr3 (200-356)||(39336234-39336387)
chr3 (274-356)||(41359493-41359575)
chr3 (270-356)||(54017550-54017636)
chr3 (203-292)||(7767380-7767469)
chr3 (200-352)||(47964921-47965073)
chr3 (202-318)||(11661537-11661638)
chr3 (203-308)||(46546375-46546480)
chr3 (200-256)||(43346650-43346706)
chr3 (242-328)||(39336000-39336086)
chr3 (242-347)||(12749211-12749316)
chr3 (250-310)||(52634990-52635050)
chr3 (203-332)||(25317161-25317290)
chr3 (304-356)||(8328374-8328426)
chr3 (202-318)||(25991405-25991521)
chr3 (309-356)||(22304302-22304349)
chr3 (267-318)||(53596027-53596078)
chr3 (267-318)||(53596342-53596393)
chr3 (255-312)||(17731950-17732007)
chr3 (255-312)||(19033181-19033238)
chr3 (280-356)||(43978867-43978947)
chr3 (267-318)||(53596542-53596593)
chr3 (10-77)||(53577548-53577616)
chr3 (282-356)||(7766785-7766857)
chr3 (267-314)||(48127859-48127906)
chr3 (200-232)||(12747878-12747910)
chr3 (268-312)||(16871005-16871049)
chr3 (268-312)||(17735037-17735081)
chr3 (268-312)||(19036306-19036350)
chr3 (162-224)||(2299937-2300000)
chr3 (267-312)||(16143505-16143550)
chr3 (271-312)||(16869843-16869884)
chr3 (205-266)||(36986040-36986101)
chr3 (205-266)||(37011479-37011540)
chr3 (14-88)||(54018093-54018169)
chr3 (10-89)||(15773037-15773117)
chr3 (263-299)||(50329391-50329427)
[»] chr8 (83 HSPs)
chr8 (10-354)||(3669870-3670214)
chr8 (10-350)||(1013879-1014219)
chr8 (10-356)||(9309164-9309510)
chr8 (191-356)||(3669678-3669843)
chr8 (202-356)||(3038292-3038446)
chr8 (190-351)||(30441071-30441236)
chr8 (178-356)||(34835185-34835365)
chr8 (167-356)||(34835439-34835631)
chr8 (167-356)||(34835705-34835897)
chr8 (167-356)||(40518550-40518738)
chr8 (202-350)||(34834878-34835026)
chr8 (134-351)||(45121663-45121881)
chr8 (200-348)||(45122067-45122215)
chr8 (168-356)||(8918766-8918956)
chr8 (192-356)||(20870575-20870741)
chr8 (192-350)||(1014253-1014411)
chr8 (151-354)||(30359558-30359763)
chr8 (178-354)||(9482608-9482784)
chr8 (173-356)||(45122604-45122780)
chr8 (168-350)||(6731872-6732045)
chr8 (202-356)||(33113369-33113523)
chr8 (200-356)||(6876864-6877021)
chr8 (200-353)||(9608745-9608898)
chr8 (202-356)||(40518071-40518227)
chr8 (202-356)||(25561817-25561972)
chr8 (168-356)||(45122972-45123162)
chr8 (203-349)||(147454-147600)
chr8 (202-352)||(37544496-37544646)
chr8 (225-354)||(9483191-9483320)
chr8 (202-350)||(30359273-30359421)
chr8 (200-356)||(45121912-45122068)
chr8 (202-356)||(1513917-1514071)
chr8 (207-355)||(70277-70425)
chr8 (151-354)||(18371665-18371863)
chr8 (194-352)||(40579512-40579670)
chr8 (200-356)||(5420651-5420807)
chr8 (200-355)||(41972158-41972316)
chr8 (200-356)||(5915872-5916023)
chr8 (151-272)||(18372342-18372463)
chr8 (167-348)||(147794-147968)
chr8 (210-354)||(18371998-18372142)
chr8 (171-356)||(6651476-6651650)
chr8 (151-272)||(18372785-18372905)
chr8 (203-348)||(32640542-32640682)
chr8 (200-356)||(9308977-9309137)
chr8 (151-304)||(18372988-18373139)
chr8 (204-356)||(18380021-18380171)
chr8 (194-356)||(32305478-32305633)
chr8 (200-348)||(4154678-4154824)
chr8 (200-351)||(9507777-9507933)
chr8 (223-337)||(9609108-9609222)
chr8 (155-244)||(18372485-18372574)
chr8 (192-278)||(41416251-41416335)
chr8 (203-313)||(43274824-43274934)
chr8 (202-318)||(8794113-8794229)
chr8 (167-349)||(4154290-4154472)
chr8 (200-349)||(12283873-12284021)
chr8 (275-356)||(40579271-40579352)
chr8 (202-308)||(18372656-18372758)
chr8 (282-356)||(8919146-8919220)
chr8 (200-356)||(9620680-9620834)
chr8 (203-290)||(3037776-3037865)
chr8 (278-356)||(41129066-41129144)
chr8 (204-349)||(43398077-43398225)
chr8 (210-273)||(25561729-25561792)
chr8 (205-305)||(20130454-20130553)
chr8 (200-332)||(5274775-5274907)
chr8 (277-341)||(20995433-20995497)
chr8 (294-356)||(43274637-43274699)
chr8 (281-338)||(16524446-16524503)
chr8 (236-292)||(18373236-18373292)
chr8 (203-299)||(40991756-40991852)
chr8 (151-226)||(43274699-43274776)
chr8 (311-356)||(3037971-3038016)
chr8 (13-89)||(147637-147715)
chr8 (254-341)||(40417733-40417820)
chr8 (300-354)||(18372288-18372342)
chr8 (271-308)||(12156708-12156745)
chr8 (200-257)||(20995502-20995559)
chr8 (200-277)||(33831978-33832055)
chr8 (258-299)||(11442911-11442952)
chr8 (200-232)||(18645713-18645745)
chr8 (10-58)||(34835058-34835105)
[»] chr1 (83 HSPs)
chr1 (10-356)||(44290460-44290798)
chr1 (13-355)||(48588491-48588833)
chr1 (10-356)||(26661524-26661873)
chr1 (190-356)||(44290826-44290993)
chr1 (10-279)||(3537226-3537494)
chr1 (137-356)||(41157311-41157531)
chr1 (162-349)||(37556071-37556260)
chr1 (192-356)||(41759475-41759639)
chr1 (168-350)||(34364891-34365075)
chr1 (200-356)||(41142372-41142529)
chr1 (192-356)||(3537601-3537765)
chr1 (192-354)||(3550712-3550871)
chr1 (200-356)||(41156991-41157147)
chr1 (10-232)||(50051777-50051999)
chr1 (173-356)||(11977251-11977436)
chr1 (202-355)||(17294579-17294733)
chr1 (169-356)||(22077497-22077683)
chr1 (200-356)||(29798199-29798355)
chr1 (200-356)||(31767163-31767319)
chr1 (200-350)||(34364507-34364657)
chr1 (202-356)||(34649440-34649594)
chr1 (201-350)||(40082408-40082556)
chr1 (191-356)||(45493976-45494146)
chr1 (200-356)||(5319967-5320123)
chr1 (208-356)||(14318875-14319023)
chr1 (194-326)||(32594748-32594880)
chr1 (192-356)||(50052026-50052189)
chr1 (200-356)||(3875333-3875489)
chr1 (197-343)||(38804370-38804516)
chr1 (202-335)||(26661921-26662054)
chr1 (192-356)||(32168700-32168853)
chr1 (204-348)||(9955911-9956057)
chr1 (203-349)||(37555733-37555878)
chr1 (200-356)||(45084382-45084532)
chr1 (200-356)||(37850602-37850758)
chr1 (200-351)||(24600321-24600472)
chr1 (200-354)||(66476-66630)
chr1 (200-348)||(39066210-39066358)
chr1 (168-347)||(66100-66278)
chr1 (168-356)||(22077112-22077311)
chr1 (167-348)||(30630648-30630828)
chr1 (200-294)||(41184489-41184583)
chr1 (200-352)||(24131994-24132143)
chr1 (191-320)||(44043810-44043944)
chr1 (206-350)||(5575110-5575252)
chr1 (201-352)||(22793279-22793431)
chr1 (210-350)||(5528762-5528902)
chr1 (202-348)||(45839629-45839779)
chr1 (200-356)||(22077831-22077986)
chr1 (200-349)||(19283464-19283613)
chr1 (10-131)||(48588340-48588461)
chr1 (200-348)||(44685456-44685605)
chr1 (271-356)||(11977015-11977100)
chr1 (200-281)||(21378118-21378199)
chr1 (200-332)||(1188614-1188746)
chr1 (270-356)||(50051691-50051776)
chr1 (215-356)||(44091909-44092050)
chr1 (182-259)||(50469180-50469256)
chr1 (242-318)||(10351202-10351278)
chr1 (227-347)||(4956218-4956340)
chr1 (200-318)||(1187404-1187522)
chr1 (151-252)||(47379891-47379990)
chr1 (299-356)||(21378061-21378118)
chr1 (200-247)||(35154150-35154197)
chr1 (200-266)||(4878803-4878869)
chr1 (167-349)||(24448245-24448426)
chr1 (249-294)||(41184152-41184197)
chr1 (255-315)||(35154046-35154106)
chr1 (22-104)||(11977141-11977224)
chr1 (299-356)||(4266800-4266855)
chr1 (271-349)||(47380176-47380254)
chr1 (192-265)||(4266875-4266948)
chr1 (200-349)||(5996881-5997029)
chr1 (10-92)||(34364690-34364774)
chr1 (282-318)||(12466365-12466401)
chr1 (209-268)||(30630912-30630972)
chr1 (241-356)||(9499020-9499135)
chr1 (273-319)||(9956212-9956258)
chr1 (13-58)||(66399-66444)
chr1 (94-185)||(3537495-3537587)
chr1 (282-318)||(31973375-31973411)
chr1 (137-185)||(41184198-41184246)
chr1 (200-336)||(50556451-50556587)
[»] chr2 (80 HSPs)
chr2 (10-356)||(5542627-5542973)
chr2 (10-351)||(14745300-14745641)
chr2 (168-356)||(37106156-37106344)
chr2 (191-352)||(36178611-36178772)
chr2 (10-356)||(29676711-29677064)
chr2 (192-356)||(14745669-14745833)
chr2 (192-356)||(41283477-41283641)
chr2 (190-354)||(5543002-5543166)
chr2 (196-356)||(37105920-37106080)
chr2 (172-352)||(15880233-15880415)
chr2 (128-307)||(36178320-36178498)
chr2 (200-355)||(962598-962753)
chr2 (202-356)||(6421387-6421541)
chr2 (168-355)||(40679632-40679818)
chr2 (200-356)||(42514649-42514805)
chr2 (167-356)||(6422084-6422266)
chr2 (207-352)||(15511501-15511646)
chr2 (167-356)||(28531316-28531504)
chr2 (168-353)||(7598577-7598754)
chr2 (200-356)||(35580726-35580881)
chr2 (218-356)||(36178173-36178311)
chr2 (202-351)||(36005887-36006035)
chr2 (202-356)||(6712978-6713133)
chr2 (200-356)||(38796620-38796778)
chr2 (167-356)||(40733482-40733673)
chr2 (205-356)||(33731653-33731804)
chr2 (167-356)||(40733848-40734038)
chr2 (200-353)||(37632602-37632755)
chr2 (192-348)||(1769884-1770040)
chr2 (204-339)||(28254258-28254391)
chr2 (211-347)||(40163383-40163520)
chr2 (213-355)||(23346250-23346391)
chr2 (200-356)||(7598228-7598384)
chr2 (202-344)||(5367457-5367599)
chr2 (180-308)||(31468800-31468926)
chr2 (168-278)||(38796298-38796410)
chr2 (120-356)||(3673003-3673224)
chr2 (200-307)||(16542449-16542556)
chr2 (262-356)||(6421793-6421887)
chr2 (208-356)||(29676543-29676685)
chr2 (200-348)||(12529038-12529186)
chr2 (137-257)||(36785664-36785786)
chr2 (170-341)||(30313147-30313318)
chr2 (167-317)||(30323430-30323581)
chr2 (203-288)||(31899496-31899581)
chr2 (167-318)||(33561491-33561641)
chr2 (200-351)||(16590888-16591034)
chr2 (167-332)||(29873563-29873729)
chr2 (208-312)||(37895107-37895211)
chr2 (272-354)||(3672773-3672855)
chr2 (202-356)||(29874025-29874179)
chr2 (203-316)||(31259658-31259774)
chr2 (168-318)||(37894732-37894881)
chr2 (262-354)||(6421688-6421780)
chr2 (253-345)||(36784273-36784365)
chr2 (181-308)||(33953821-33953947)
chr2 (167-307)||(41678419-41678559)
chr2 (201-331)||(31385738-31385868)
chr2 (203-352)||(9231252-9231401)
chr2 (216-305)||(28254165-28254254)
chr2 (168-262)||(42514981-42515078)
chr2 (203-356)||(3594180-3594333)
chr2 (264-354)||(35580443-35580534)
chr2 (203-307)||(12910231-12910335)
chr2 (290-356)||(31899104-31899170)
chr2 (202-248)||(6421306-6421352)
chr2 (200-341)||(33954279-33954419)
chr2 (242-318)||(30312831-30312907)
chr2 (10-77)||(36178513-36178581)
chr2 (254-313)||(25390313-25390372)
chr2 (267-318)||(28226404-28226455)
chr2 (242-299)||(2336666-2336723)
chr2 (270-318)||(8904498-8904546)
chr2 (10-50)||(37106107-37106147)
chr2 (271-318)||(28226726-28226772)
chr2 (8-89)||(7598409-7598491)
chr2 (167-222)||(40734243-40734300)
chr2 (267-316)||(13792536-13792585)
chr2 (200-236)||(3672719-3672755)
chr2 (10-38)||(35580671-35580699)
[»] chr5 (84 HSPs)
chr5 (10-356)||(6500634-6500978)
chr5 (108-356)||(3295017-3295266)
chr5 (192-356)||(6500443-6500606)
chr5 (200-356)||(40296317-40296473)
chr5 (137-354)||(624134-624350)
chr5 (192-354)||(18603124-18603286)
chr5 (192-356)||(27502038-27502202)
chr5 (192-356)||(32487386-32487549)
chr5 (197-356)||(36492219-36492378)
chr5 (193-356)||(41170627-41170790)
chr5 (168-344)||(13415774-13415951)
chr5 (167-349)||(26074577-26074761)
chr5 (200-356)||(15370099-15370255)
chr5 (203-356)||(3295347-3295498)
chr5 (173-349)||(26074155-26074330)
chr5 (203-356)||(25327938-25328091)
chr5 (191-356)||(9498657-9498821)
chr5 (200-356)||(41632782-41632938)
chr5 (202-356)||(42405600-42405752)
chr5 (207-356)||(11416979-11417128)
chr5 (210-354)||(34753029-34753173)
chr5 (201-356)||(299490-299645)
chr5 (202-351)||(26075168-26075318)
chr5 (200-356)||(12662654-12662810)
chr5 (202-356)||(1028519-1028673)
chr5 (202-356)||(6224198-6224352)
chr5 (167-356)||(24489208-24489394)
chr5 (167-332)||(26074807-26074975)
chr5 (200-356)||(36568571-36568725)
chr5 (200-356)||(35150007-35150162)
chr5 (192-356)||(623810-623974)
chr5 (226-356)||(15370428-15370558)
chr5 (212-354)||(33747783-33747925)
chr5 (197-335)||(29549278-29549416)
chr5 (192-338)||(5723811-5723957)
chr5 (168-350)||(38427525-38427697)
chr5 (200-350)||(26590918-26591068)
chr5 (202-356)||(300961-301107)
chr5 (167-332)||(36521922-36522086)
chr5 (202-356)||(35167840-35167994)
chr5 (11-146)||(9498496-9498629)
chr5 (203-356)||(2411010-2411163)
chr5 (167-318)||(36522277-36522427)
chr5 (203-356)||(35914852-35915005)
chr5 (192-275)||(7768842-7768925)
chr5 (167-318)||(31509589-31509742)
chr5 (202-295)||(42508614-42508707)
chr5 (202-280)||(26074320-26074398)
chr5 (286-356)||(26900019-26900089)
chr5 (203-337)||(41635212-41635346)
chr5 (9-95)||(32487575-32487661)
chr5 (214-325)||(31509745-31509857)
chr5 (267-318)||(13042606-13042657)
chr5 (202-356)||(13786003-13786157)
chr5 (202-281)||(39309686-39309764)
chr5 (287-356)||(38427306-38427375)
chr5 (284-336)||(795254-795306)
chr5 (271-338)||(9498343-9498410)
chr5 (257-336)||(36527117-36527196)
chr5 (258-356)||(13785634-13785732)
chr5 (202-295)||(42524719-42524811)
chr5 (258-318)||(32445943-32446003)
chr5 (267-314)||(13112604-13112651)
chr5 (172-235)||(13785732-13785794)
chr5 (203-260)||(6225047-6225104)
chr5 (192-240)||(5660290-5660338)
chr5 (237-325)||(19275566-19275653)
chr5 (280-318)||(13042784-13042822)
chr5 (280-318)||(13112782-13112820)
chr5 (200-242)||(35150747-35150789)
chr5 (200-242)||(35151038-35151080)
chr5 (258-356)||(42435486-42435583)
chr5 (86-139)||(795196-795249)
chr5 (302-354)||(24489583-24489635)
chr5 (168-212)||(15370380-15370426)
chr5 (267-318)||(36389016-36389067)
chr5 (282-312)||(5963765-5963795)
chr5 (254-332)||(9510546-9510624)
chr5 (192-249)||(22298956-22299014)
chr5 (298-334)||(795152-795189)
chr5 (290-354)||(5660340-5660405)
chr5 (10-84)||(26075058-26075133)
chr5 (271-312)||(34103625-34103666)
chr5 (268-312)||(41341523-41341567)
[»] chr7 (75 HSPs)
chr7 (13-355)||(14681323-14681663)
chr7 (10-356)||(37533013-37533339)
chr7 (10-319)||(22566702-22567013)
chr7 (113-329)||(7553937-7554154)
chr7 (200-356)||(1085618-1085774)
chr7 (168-356)||(30244236-30244426)
chr7 (200-349)||(7517580-7517729)
chr7 (194-355)||(29157559-29157720)
chr7 (200-356)||(23379-23535)
chr7 (192-356)||(37533366-37533530)
chr7 (168-356)||(30245043-30245229)
chr7 (207-356)||(11845198-11845347)
chr7 (202-356)||(6054562-6054716)
chr7 (200-356)||(40094776-40094932)
chr7 (200-350)||(36939741-36939891)
chr7 (202-356)||(45433243-45433397)
chr7 (202-347)||(45754718-45754862)
chr7 (208-348)||(19122740-19122879)
chr7 (200-356)||(22567041-22567196)
chr7 (113-348)||(45434548-45434784)
chr7 (206-356)||(34218036-34218186)
chr7 (200-356)||(24177435-24177591)
chr7 (202-356)||(47129097-47129251)
chr7 (200-356)||(118301-118459)
chr7 (200-348)||(8128451-8128599)
chr7 (200-356)||(36622960-36623116)
chr7 (205-356)||(30032572-30032723)
chr7 (203-356)||(9901648-9901799)
chr7 (200-320)||(16569196-16569316)
chr7 (200-320)||(16596346-16596466)
chr7 (200-354)||(40230295-40230449)
chr7 (173-326)||(1085280-1085436)
chr7 (203-335)||(24838724-24838857)
chr7 (203-355)||(20599317-20599471)
chr7 (200-349)||(36534795-36534942)
chr7 (221-356)||(37167808-37167937)
chr7 (200-356)||(41854635-41854790)
chr7 (168-270)||(30244667-30244771)
chr7 (242-356)||(30253534-30253644)
chr7 (171-273)||(30255308-30255412)
chr7 (203-352)||(41910592-41910749)
chr7 (246-356)||(28300255-28300366)
chr7 (200-321)||(43241495-43241616)
chr7 (171-273)||(30245463-30245567)
chr7 (200-288)||(28301613-28301701)
chr7 (281-356)||(47129450-47129525)
chr7 (283-352)||(28300574-28300644)
chr7 (200-268)||(36109007-36109075)
chr7 (288-356)||(37532753-37532821)
chr7 (205-305)||(44361517-44361616)
chr7 (122-197)||(37532822-37532896)
chr7 (151-318)||(37345868-37346036)
chr7 (168-250)||(40094502-40094583)
chr7 (10-98)||(37532897-37532986)
chr7 (267-318)||(21416181-21416232)
chr7 (269-317)||(23569043-23569091)
chr7 (301-356)||(30244453-30244508)
chr7 (200-318)||(4124128-4124246)
chr7 (194-237)||(14681281-14681324)
chr7 (301-356)||(30245256-30245311)
chr7 (301-356)||(30253671-30253726)
chr7 (268-347)||(40094424-40094503)
chr7 (283-345)||(45755010-45755072)
chr7 (267-312)||(21619091-21619136)
chr7 (60-108)||(45697753-45697801)
chr7 (202-252)||(36967335-36967385)
chr7 (255-352)||(37393114-37393210)
chr7 (268-312)||(27391815-27391859)
chr7 (242-349)||(15902342-15902448)
chr7 (12-92)||(45433424-45433505)
chr7 (295-349)||(4719305-4719359)
chr7 (8-89)||(28300473-28300554)
chr7 (267-307)||(27598052-27598092)
chr7 (10-87)||(40094664-40094742)
chr7 (27-88)||(48243356-48243419)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (26-320)||(5181-5477)
scaffold0078 (200-351)||(4982-5133)
[»] chr4 (111 HSPs)
chr4 (13-356)||(18932749-18933102)
chr4 (167-356)||(36629205-36629393)
chr4 (200-355)||(25483336-25483491)
chr4 (190-356)||(50630755-50630921)
chr4 (192-356)||(41370349-41370513)
chr4 (192-356)||(55933124-55933288)
chr4 (200-355)||(54017596-54017751)
chr4 (137-356)||(39404334-39404554)
chr4 (137-356)||(44620595-44620815)
chr4 (172-348)||(54108888-54109060)
chr4 (200-356)||(1731647-1731803)
chr4 (200-355)||(3340807-3340962)
chr4 (197-356)||(50002423-50002582)
chr4 (202-356)||(39792860-39793014)
chr4 (200-348)||(52884695-52884844)
chr4 (170-348)||(52884856-52885038)
chr4 (200-352)||(10245920-10246071)
chr4 (169-356)||(22027961-22028150)
chr4 (200-356)||(36608661-36608817)
chr4 (202-356)||(34646649-34646803)
chr4 (202-356)||(39404020-39404174)
chr4 (192-338)||(49880152-49880297)
chr4 (203-356)||(50459724-50459877)
chr4 (210-356)||(54343008-54343147)
chr4 (209-356)||(44620362-44620509)
chr4 (202-356)||(36572021-36572175)
chr4 (200-341)||(4955332-4955473)
chr4 (168-353)||(20826186-20826370)
chr4 (200-356)||(22183264-22183420)
chr4 (209-356)||(44621011-44621158)
chr4 (219-356)||(54936215-54936351)
chr4 (200-356)||(49076831-49076986)
chr4 (113-309)||(2740984-2741180)
chr4 (200-356)||(22028369-22028527)
chr4 (200-351)||(32941128-32941279)
chr4 (168-349)||(3244458-3244638)
chr4 (163-356)||(49076451-49076643)
chr4 (203-352)||(49302907-49303058)
chr4 (199-349)||(54108537-54108686)
chr4 (201-356)||(16889536-16889691)
chr4 (157-356)||(3341083-3341284)
chr4 (206-356)||(20825842-20825992)
chr4 (215-329)||(45496820-45496934)
chr4 (200-356)||(2740700-2740854)
chr4 (200-355)||(4390102-4390257)
chr4 (201-356)||(16888816-16888971)
chr4 (176-354)||(43174480-43174661)
chr4 (168-356)||(45489332-45489522)
chr4 (254-356)||(23817681-23817783)
chr4 (202-318)||(41707503-41707618)
chr4 (192-323)||(6975489-6975620)
chr4 (200-355)||(34004586-34004739)
chr4 (202-346)||(19504707-19504842)
chr4 (13-132)||(41370543-41370662)
chr4 (200-355)||(51768061-51768216)
chr4 (200-342)||(54741194-54741334)
chr4 (200-355)||(3700365-3700512)
chr4 (246-356)||(18879852-18879962)
chr4 (251-352)||(31691203-31691306)
chr4 (240-356)||(43827480-43827595)
chr4 (137-266)||(44621361-44621492)
chr4 (213-308)||(54017750-54017845)
chr4 (202-337)||(40067045-40067181)
chr4 (80-289)||(10246240-10246436)
chr4 (200-356)||(28034229-28034385)
chr4 (221-356)||(48111698-48111833)
chr4 (222-356)||(3271806-3271945)
chr4 (205-332)||(760194-760320)
chr4 (242-341)||(15841383-15841482)
chr4 (192-252)||(50788087-50788147)
chr4 (208-266)||(44620304-44620362)
chr4 (200-332)||(23556890-23557022)
chr4 (206-349)||(45489721-45489864)
chr4 (10-143)||(10246103-10246237)
chr4 (292-356)||(43174233-43174297)
chr4 (267-318)||(11197293-11197344)
chr4 (203-318)||(34544107-34544225)
chr4 (225-356)||(39698944-39699077)
chr4 (184-266)||(44620926-44621011)
chr4 (171-237)||(41370673-41370738)
chr4 (280-354)||(41370738-41370812)
chr4 (10-102)||(3340990-3341083)
chr4 (10-78)||(45496734-45496803)
chr4 (200-288)||(11348396-11348484)
chr4 (206-318)||(15841023-15841134)
chr4 (137-196)||(16889315-16889375)
chr4 (267-318)||(10396198-10396249)
chr4 (267-318)||(10396483-10396534)
chr4 (263-349)||(11783560-11783646)
chr4 (10-88)||(2740874-2740953)
chr4 (313-354)||(23817457-23817498)
chr4 (267-319)||(922485-922537)
chr4 (268-307)||(1868119-1868158)
chr4 (310-349)||(19895406-19895445)
chr4 (258-316)||(11706584-11706641)
chr4 (14-89)||(20826024-20826101)
chr4 (266-312)||(51681604-51681650)
chr4 (254-314)||(2891864-2891924)
chr4 (200-248)||(45050601-45050649)
chr4 (278-354)||(50787996-50788072)
chr4 (267-318)||(11197003-11197054)
chr4 (192-223)||(18933103-18933134)
chr4 (255-298)||(45484774-45484817)
chr4 (314-348)||(11702307-11702341)
chr4 (244-318)||(31249896-31249970)
chr4 (276-318)||(41707279-41707321)
chr4 (200-241)||(11706636-11706677)
chr4 (311-348)||(19895533-19895570)
chr4 (263-296)||(29802604-29802637)
chr4 (10-92)||(44621182-44621266)
chr4 (282-318)||(34946151-34946187)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (10-356)||(149-489)
scaffold0702 (202-356)||(516-670)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (10-354)||(1110-1464)
scaffold0391 (247-318)||(1731-1802)
scaffold0391 (167-251)||(3092-3178)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (113-349)||(5689-5931)
scaffold0734 (200-349)||(5396-5546)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (168-316)||(17496-17648)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (200-356)||(47360-47516)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (202-277)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (202-332)||(39459-39588)
scaffold0113 (167-325)||(39805-39963)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (194-278)||(2869-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (238-278)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Original strand, 3409470 - 3409816
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||| |||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409470 tggtatcagagccccggttcgacgaagtatatgaccgaggcagccggtcgttgcgtaaaaagcagcaacggcggtacaagtagcaagtggctccttgtgc 3409569  T
Q  110 aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtg 209  Q
    ||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409570 agggatggcaatacaggcaaagtcaaaagcttcggctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtg 3409669  T
Q  210 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 309  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  3409670 agttatatgtaccacatcagataaaatagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgcctttattttttgggtaagagtgtgg 3409769  T
Q  310 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409770 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3409816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Original strand, 2377937 - 2378282
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2377937 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggtagtcggtcgttgcgaagaaagtcgcaacagcagtacaagcagcaagtggctccttgtgc 2378036  T
Q  110 aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 208  Q
    ||||||   |||||||| ||| | || ||||||||||  |||||| |||| | | ||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2378037 aggaacaatgatacaggtaaact-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgt 2378134  T
Q  209 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  2378135 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttaggtaagaatgtg 2378234  T
Q  309 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378235 gtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 2378282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 137 - 356
Target Start/End: Original strand, 29518857 - 29519076
Alignment:
Q  137 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 236  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518857 agcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 29518956  T
Q  237 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29518957 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 29519056  T
Q  337 agcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29519057 agcctcgatgtggacggtcc 29519076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10074336 - 10073993
Alignment:
Q  12 gtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgca 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10074336 gtatcagagccccggttcgaagaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagtagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcattgtgca 10074237  T
Q  111 ggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtg 209  Q
      |||||||||||| |||| || || ||||||||||  |||||| |||| | | || |||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  10074236 acaacggcgatacaagcaa-gt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgatagactcgcacttgagggggagtgttg-tgtgcaagggtg 10074140  T
Q  210 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 309  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10074139 agttatatatcccacatcggatagaaaagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaaagtgtgg 10074040  T
Q  310 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10074039 tgtctctctcgcttatttggttgttctagcctcgacgtggacggtcc 10073993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Original strand, 29518495 - 29518659
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29518495 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 29518594  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518595 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 29518659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Original strand, 32741171 - 32741335
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32741171 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattaccttaagg 32741270  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741271 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 32741335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 192 - 348
Target Start/End: Original strand, 3409251 - 3409407
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3409251 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 3409350  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3409351 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 3409407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 168 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2578634 - 2578445
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2578634 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccaca-cggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaaga 2578536  T
Q  266 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578535 ggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 2578445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Original strand, 35210196 - 35210360
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35210196 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaaccattgccttaagg 35210295  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35210296 ttttgggtaagagtgtggtgtttcttttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcc 35210360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 167 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10074553 - 10074371
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074553 tgatggactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttagaggtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 10074455  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10074454 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtgga 10074371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Original strand, 3058218 - 3058382
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3058218 tgttggtttgcaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtatgaggatccataaacccattgccttaagg 3058317  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  3058318 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtagggtggttctaacctcgatgtggaccgtcc 3058382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Original strand, 16454872 - 16455063
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  16454872 tgatggagtcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaaatgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaat 16454971  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454972 aggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 16455063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14748504 - 14748344
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14748504 tgttgatttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaactcattgcgttaagg 14748405  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14748404 ttttgggtaagagtgtgg----tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 14748344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 2377756 - 2377910
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377756 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 2377855  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  2377856 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcc 2377910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2580030 - 2579874
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2580030 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccacagccttaaggttttgggt 2579931  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2579930 aagaatgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggaaggtcc 2579874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 191 - 356
Target Start/End: Original strand, 3415449 - 3415616
Alignment:
Q  191 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3415449 gtgttggtttgcgagtgtgagttatatgtcccacatcacataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 3415548  T
Q  291 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgt--tctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  3415549 gtttttggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctctagcctcgatgtggaaggtcc 3415616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 193 - 356
Target Start/End: Original strand, 1846741 - 1846904
Alignment:
Q  193 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 292  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  1846741 gttgggttgcaagtgtgaattctatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagcacccataaatccattgccttaaggt 1846840  T
Q  293 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1846841 tttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 1846904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 192 - 348
Target Start/End: Original strand, 26544041 - 26544197
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26544041 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccaccgccttaagg 26544140  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  26544141 ttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgcgattgttctagcctcaatgtg 26544197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 171 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 2579678 - 2579500
Alignment:
Q  171 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 270  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||    
T  2579678 ggactcacacttgagggagagtgttg-ttagcaggtgtgagttatatgtcccacatcggacaaaaaagtaaaggtcggataccttataagtaagagggcc 2579580  T
Q  271 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2579579 cataaactcattgccttaaggttttgggtaaaagtatggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtgga 2579500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 202 - 349
Target Start/End: Original strand, 16107680 - 16107827
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16107680 caagtgtgagttatatgtgtcacatcggataaaaaagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaa 16107779  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16107780 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtgg 16107827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 16454577 - 16454731
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16454577 caagtgtgagttatgtgtcccacatcagataaaagaataaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataa 16454676  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454677 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 16454731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 349
Target Start/End: Original strand, 1127352 - 1127509
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1127352 tgttggtttgcaactgtgagttatatatcccacatcgggtaaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaagg 1127451  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  1127452 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttatgtggttgctctaacctcgatgtgg 1127509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 206 - 356
Target Start/End: Original strand, 2843560 - 2843711
Alignment:
Q  206 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 304  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843560 tgtgagttatatgtttcacatcggataaaataataaaagttgaacaccttataagtaagaggaccccataaactcattgccttaaggttttgggtaagag 2843659  T
Q  305 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2843660 tgtggtatctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 2843711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10073804 - 10073618
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10073804 tgatggactcacacttaagagggggtgttg-tgtgcaagtgttagttatatgtcccacatcggagaaaa--gtaaaggttgaacaccttataagtaagag 10073708  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    || |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10073707 gatccataaactcattggcttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 10073618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 175 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2579016 - 2578837
Alignment:
Q  175 tcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata 274  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  2579016 tcacacttgagggggagtgttg-tgagcaagtgtgatttatatgtccctcatcggataaaa-agtaaatgttgaataccttataaataagaggatccata 2578919  T
Q  275 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  2578918 aactcattaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctgacctcgatgtggacggtcc 2578837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2579297 - 2579111
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    |    
T  2579297 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgttagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataag----a 2579202  T
Q  266 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||| ||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2579201 ggaaccataaacccataactttaaggctttggctaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtcc 2579111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 137 - 356
Target Start/End: Original strand, 16107998 - 16108207
Alignment:
Q  137 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 234  Q
    ||||||||||  |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16107998 agcttccgcttgaaggggagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcagataaa 16108097  T
Q  235 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 334  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16108098 agagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg------------gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgtt 16108185  T
Q  335 ctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  16108186 ataacctcgatgtggacggtcc 16108207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5832182 - 5832029
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||||||||    
T  5832182 caagtgtaagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaagcca-ccccttaagattttgggtaa 5832084  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5832083 aagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtagacggtcc 5832029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 203 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6999951 - 6999799
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  6999951 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaaaagtaaaagttgaacaccttatatgtaagaggatccataaactcactgccttaaggttttggataag 6999852  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6999851 agtgtggcgtctctcttgctaatgtggttgttctagtctcgatgtggacggtc 6999799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 593867 - 593709
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  593867 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaaccgactgccttaaggttttgggt 593768  T
Q  300 aagagtgtgg--tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    || |||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  593767 aatagtgtggtatctctctcttacttgtacggttgttctaggctcgatgttgacggtcc 593709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 203 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1950340 - 1950200
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1950340 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggagccataaatctaatgccttaaggttttgagtaag 1950241  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 343  Q
    ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1950240 agtgtgacgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcg 1950200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 205 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32460733 - 32460630
Alignment:
Q  205 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32460733 gtgtgagttatatgtcccacatcgtataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 32460634  T
Q  305 tgtg 308  Q
    ||||    
T  32460633 tgtg 32460630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 354
Target Start/End: Original strand, 10911565 - 10911720
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||      
T  10911565 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttgaa 10911664  T
Q  299 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    |||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10911665 taagagtgtgatgtctctcttactaatgttgttgttcaagcctcgatgtggacggt 10911720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 206 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9062501 - 9062383
Alignment:
Q  206 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  9062501 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaactcattgtcttaa-gttttgggtaaaagt 9062403  T
Q  306 gtggtgtctctcttgcttgt 325  Q
    ||||| |||||||| |||||    
T  9062402 gtggtatctctcttacttgt 9062383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 319
Target Start/End: Original strand, 8481893 - 8482045
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| | ||    
T  8481893 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcagatataaaagtggaggttgaacactttataaatgag 8481990  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 319  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8481991 atgactcataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctctt 8482045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5958766 - 5958613
Alignment:
Q  195 tggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 294  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5958766 tggtgtgcaattgtgagttatatgtgttacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagaactcataaactcattgtcttaaagttt 5958667  T
Q  295 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    ||||  |||||||| |||||||    |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5958666 tgggatagagtgtgatgtctct----cttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacg 5958613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 332
Target Start/End: Original strand, 6071098 - 6071264
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  6071098 tgatggactcacatttgaggggaagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgag 6071196  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 332  Q
    | || |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  6071197 atgatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggcgtctctctcgcttgtatggttg 6071264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 12092640 - 12092491
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  12092640 tgcaagggtgtgttagatgtcccacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggatccataaactcattgccttaaggttttgagt 12092541  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  12092540 aagactgtggtgtctctctcacttgtgaggttgctctggcctggatgtgg 12092491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12071849 - 12071693
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12071849 tgcaagtgtgagttatatgtctcgcatcagatagaaaaatggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaacctatgaccttaaggttttgggt 12071750  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12071749 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgaacggtcc 12071693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 200 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 12085191 - 12085037
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||  || |||||||| ||||||   | ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12085191 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcagatagaa-agtggagtttgaacactttataatagaaaggactcataaaaccatggccttaaggttttgggt 12085093  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12085092 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgcgaacggtc 12085037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 273
Target Start/End: Original strand, 35210456 - 35210551
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  35210456 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgc-----------cccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttgtaagtaagag 35210544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 355
Target Start/End: Original strand, 31714671 - 31714823
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||| || |||  |||||||||    ||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  31714671 tgcaagtgtgact-atatgtcctacatcggatagaaaagtggaggttgaacgttatataa-tgagaggacccattaactcattgccttaaggttttgagt 31714768  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    |||||||||| || | | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31714769 aagagtgtggcgt-tttttcgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggacggtc 31714823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 29518686 - 29518784
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||| | ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29518686 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgagaccgccggttagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgt 29518784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17135223 - 17135071
Alignment:
Q  204 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| ||| || |||||||||| |||||||  ||||||| |||||    || ||||||| |||||    
T  17135223 agtgtgagttatatgtctcacatcggatagagaagtaaatgtttaataccttataagcaagaggattcataaactcattgttagaaagttttggataaga 17135124  T
Q  304 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||  | |||| | ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  17135123 gtgtgacggctctttcgcttgtgcggttgttccggccttgatgtggacggtcc 17135071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 316
Target Start/End: Original strand, 2975521 - 2975668
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttg-gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| || ||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  2975521 gatgcactcacacttg-gggggagtgttgtgttt--aagtgtaagtaattatgtcccacatcaaatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagcaaga 2975617  T
Q  266 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 316  Q
     |||||||||| || ||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||||    
T  2975618 tgacccataaatcctttgtcttaaagttttgaataagagtgtgatgtctct 2975668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 259
Target Start/End: Original strand, 33605913 - 33606034
Alignment:
Q  137 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 236  Q
    ||||||||||| |||  | ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||     
T  33605913 agcttccgctcgaagaagggcacggtgaattgatggactcacacttgagggggagtgat-gtgtgcaaatgtaagttatatgtcccacatcgaatagaaa 33606011  T
Q  237 agtaaaggttgaacaccttataa 259  Q
    |||  ||||||||||| ||||||    
T  33606012 agtggaggttgaacactttataa 33606034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 99
Target Start/End: Original strand, 26544230 - 26544321
Alignment:
Q  8 actggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtgg 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||   |||||||  |||||||||    
T  26544230 actggtattagagccccggttcgatgaagggtgcgaccgaggcagccggtatttgcgtagaaagccgcaacgctggtacaaacagcaagtgg 26544321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 2579467 - 2579387
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2579467 tggtatcagagccccggttcgacgaacggtacgaccgaggcagccggtccacttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 2579387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 22605345 - 22605301
Alignment:
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22605345 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgt 22605301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 351
Target Start/End: Original strand, 3409405 - 3409452
Alignment:
Q  304 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 351  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3409405 gtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtggac 3409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 11637811 - 11637760
Alignment:
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 319  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11637811 acccataaacccattgtcttaagattttggataagagtgtggtgtctctctt 11637760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 237 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 14789325 - 14789279
Alignment:
Q  237 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattg 283  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14789325 agtaaaggttgaacaccttacaagtaagaggacccataaaccaattg 14789279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 30618766 - 30618634
Alignment:
Q  207 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 306  Q
    |||||||| | |||| ||||||| | ||| |||  ||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||| | ||    
T  30618766 gtgagttagaagtcctacatcggttgaaaaagtggaggatgaacactttataagtaagatgacc-ataaaccg-ttgtcttaaggttatgggtaaaaatg 30618669  T
Q  307 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 341  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  30618668 tggtgtctctcttacttatgtggttgctcttgcct 30618634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 2578810 - 2578730
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| ||| |||||    
T  2578810 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgcttgggcagaaagcagcaacggcgttacaa 2578730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 88
Target Start/End: Original strand, 16107863 - 16107943
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  16107863 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccatttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaa 16107943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 268 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21130147 - 21130103
Alignment:
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21130147 acccataaatccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgt 21130103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 10902496 - 10902438
Alignment:
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  10902496 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtatggttgttctgacctagatgtgga 10902438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 2579848 - 2579805
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 53  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  2579848 tggtatcagagccccggttccacgaagggtacgaccgaggcagc 2579805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11638095 - 11638053
Alignment:
Q  276 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  11638095 acccattgccttaggattttgggtaagagtatggtgtctctct 11638053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 2579082 - 2579042
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagc 53  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2579082 tatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagc 2579042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 88)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Original strand, 22304378 - 22304725
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagcc-gcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  22304378 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtcgttgcgcagaaagcaagcaacagctgtacaagtagtaagtggctccttgtt 22304477  T
Q  109 caggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtg 207  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304478 caggaacgacgatacaagcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtg 22304576  T
Q  208 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 307  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304577 tgagctatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgt 22304676  T
Q  308 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22304677 ggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacagtcc 22304725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 60 - 341
Target Start/End: Original strand, 4823515 - 4823796
Alignment:
Q  60 ttgcgcagaaagcc-gcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagca 158  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4823515 ttgcgcagaaagcaagcaacggtggtacaagcaacaagtggctccttgtgcaggaatggcgatacatgcaaagtaaaaagcttccgctcta-ggggagca 4823613  T
Q  159 cgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttata 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4823614 cgttaaagtgatggactcacacttgaaggggagtgttggtttgcaagtgtgagttataagtctcacatcggataaaatagtaaaagttaaacaccttata 4823713  T
Q  259 agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 341  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||    
T  4823714 agtaggaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtcttttttgcttatgcggatgttctagcct 4823796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41360111 - 41359767
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag--caagtggctccttgt 107  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||  ||||| |||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  41360111 tggtatcagagcgccggttcgacgaagagtacgaccg--gcagccggtcgttgtgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagagcaagtggctccttgt 41360014  T
Q  108 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaa 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  ||||| ||||| | | ||  |||| |||||||||| |||||||||||||  || |||||    
T  41360013 gcaagaacggcgatacaggcaaagtaaagagcttccacttgaagggagagcatgatgaatagatg-actcacacttaagggggagtgttgttgtgtgcaa 41359915  T
Q  205 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 304  Q
    |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41359914 gtgtgagttat----cccacatcggatacaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagaa 41359819  T
Q  305 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41359818 tgtggcgtctctctcgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcc 41359767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 113 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37990884 - 37990641
Alignment:
Q  113 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtga 210  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| | | || ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  |||||||||    
T  37990884 aacggcgatacatgcaaagt-aaaagcttccgct-tgaggggggcatgatgaattgatggactcacagttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtga 37990787  T
Q  211 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 310  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37990786 gttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 37990687  T
Q  311 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37990686 gtctctcttgcttgtgtgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37990641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 108 - 352
Target Start/End: Original strand, 15773099 - 15773346
Alignment:
Q  108 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaag 205  Q
    |||| ||| |||||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  15773099 gcagcaacagcgatacaagcaa-gtaaaaagcttccgctcttgggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaag 15773197  T
Q  206 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15773198 tgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggactcataagctcattgccttaaagttttgggtaagagt 15773297  T
Q  306 gtggtgtctct--cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15773298 gtgatgtctcttgcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 15773346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 97 - 348
Target Start/End: Original strand, 11661846 - 11662099
Alignment:
Q  97 tggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 196  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11661846 tggctccttgtgcagcaacggcgatacatgcaaagtaaaaagcttccgctctaggaggagcacgataaagtgatggactcacacttttgggggagtgttg 11661945  T
Q  197 --gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-tt 293  Q
      || || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||    
T  11661946 ttgtatgtaagtgtgagttaaatgccccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttaaaagtgagaggcctcataaaccaattgccttaaggttt 11662045  T
Q  294 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  11662046 ttgggtaagagtgaggtgtctctc-tcattgtgtggttgttctagcctcgatgtg 11662099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 168 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 54018008 - 54017818
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54018008 gatggactcacacttgagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 54017909  T
Q  266 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  54017908 ggactcataaacctaacgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttctagcttcgatgtgggcggtcc 54017818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43346947 - 43346793
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43346947 caagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 43346848  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43346847 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctctatgtggacggtcc 43346793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 35946524 - 35946678
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946524 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccgttgccttaaggttttgggtaa 35946623  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  35946624 aagtgtggtgtctctcttgcttgtgcaattgttctagcctcgatgtggacggtcc 35946678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37991133 - 37990979
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37991133 caagtgtgagttatatgtctcacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcatcgccttaaggttttgggtaa 37991034  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37991033 gagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37990979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 15772854 - 15773010
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  15772854 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttggat 15772953  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15772954 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgtggacggtcc 15773010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42342283 - 42342092
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  42342283 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgattcatatgttccacatcggataaaagagtaaatgttcaatgccttataagtaag 42342184  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342183 aggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42342092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 151 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29644791 - 29644583
Alignment:
Q  151 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgaggggga---gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 247  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    || || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29644791 ggggagcacgataaagtgatgaagtcacacttgaggggggaatgtttttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggattaaagagtaaaggttg 29644692  T
Q  248 aacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 347  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||    
T  29644691 aacaccttataagtaagagaacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcttcgatgt 29644592  T
Q  348 ggacggtcc 356  Q
    ||| |||||    
T  29644591 ggatggtcc 29644583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 191 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 39935124 - 39934963
Alignment:
Q  191 gtgttggtttgcaagtgtgag--ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 288  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39935124 gtgttggtttgcaagtgtgagagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgcctta 39935025  T
Q  289 aggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39935024 aagttttgagtaagagtgtgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 39934963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29645060 - 29644904
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29645060 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 29644961  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29644960 aagagtgtggcgtctctcttgcttatgcggttgttttagcctcgatgtggacggtcc 29644904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 32589704 - 32589859
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589704 tgcaagtgtgagt-atatgtcccacataagataaaataataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 32589802  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32589803 aagagtgcgatgtctctcttgcttgtgtggttgttctaggctcgatgtggacggtcc 32589859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33803410 - 33803254
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  33803410 tgcaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatataagtaagaggacccataaacccattgcattaaggtattgggt 33803311  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33803310 aagagtgtggcgtctccctctcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 33803254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 168 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21832532 - 21832347
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832532 gatggactcacacttgaggcggagtgtta-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 21832434  T
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    || ||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21832433 actcataaactcatagccttaaggttttgggtaaga--gtggcgtctctcttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacagtcc 21832347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12114720 - 12114564
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12114720 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 12114621  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12114620 aagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagccacgatgtggtcggtcc 12114564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42342546 - 42342390
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  42342546 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 42342447  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42342446 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 42342390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 54018356 - 54018200
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  54018356 tgcaagtgtgagttatatgtcctgcatcggataaaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaacgccttaaggttttgggt 54018257  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54018256 aagagtgtggtgtctctcatgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcc 54018200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 349
Target Start/End: Original strand, 39389062 - 39389219
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39389062 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttaaaactaagaggacccataaacccattgtcttaagg 39389161  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||||||| |||||||    
T  39389162 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcctgtgcaattgttctagccttgatgtgg 39389219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 167 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22304141 - 22303963
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||    
T  22304141 tgatggactcacacttgagggagaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggt-------cttataagtaag 22304049  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22304048 cggacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtgga 22303963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 32463057 - 32462903
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32463057 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaagagtaaaaggttgaataccttataagtaagaagactcataaacccattgccttaaggttttgagta 32462958  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32462957 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgtacggtc 32462903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25739583 - 25739427
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  25739583 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgcttttaggttttgggt 25739484  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25739483 aagagtgtgacgtctctctagcttgtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcc 25739427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 52634678 - 52634831
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634678 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacgccttataagtaagag-acccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 52634776  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  52634777 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagccttgatgtagactgtcc 52634831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 167 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 32462752 - 32462563
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32462752 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaatgaaagagtaaaaggttgaacaccttataagtaa 32462653  T
Q  264 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 353  Q
    || || ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||    
T  32462652 gatgatccataaacctattgctttaaggttttggataagagtgtggggtctctcttgtttgtgggattgttttagcctcgatgtagacgg 32462563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 50612618 - 50612449
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccata-----aacccattgcct 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||     |||  |||  ||    
T  50612618 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagattgaacaccttataagtaagaggactcataaatctaacatattatct 50612519  T
Q  287 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  50612518 taaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcttgagtggttgttccatcctcgacgtggacggtcc 50612449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 53577364 - 53577520
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  53577364 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttaaaaataagtggatccataaacatattgccttaaggtcttgggt 53577463  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  53577464 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcggtgtggatggtcc 53577520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 138 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3135293 - 3135099
Alignment:
Q  138 gcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtt-tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 236  Q
    |||||||||  | |||||||||| | || ||||| |||||||||||| || ||||||| ||| || |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135293 gcttccgctagagggggagcacgatgaattgatg-actcacacttgatggtgagtgtttgttgtgtacaagtgagttatatgtcccacatcggataaaat 3135195  T
Q  237 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 332  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3135194 agtaaatgttgaacaccttataagtaaaagaacccataaacccactgccataaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttg 3135099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 352
Target Start/End: Original strand, 31190017 - 31190161
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||    
T  31190017 tgcaagtgtgagtgatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagttagaggacccata--------gccttaaggttttgggt 31190108  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  31190109 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtcgggttgttctagcctcgatttggacg 31190161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 45395811 - 45395656
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45395811 tgcaagtgtaagttatatatcccacatcgaataaaagagtaaaggttaaacacgttataagtaagaggatccataaacccattgtcttaatgttttgggt 45395712  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  45395711 aagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgctctagcctcgatgtggagggtc 45395656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 25755396 - 25755550
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | ||| ||| |||||||    
T  25755396 caagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaatccattgtcctaaagttgtgggtaa 25755495  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25755496 aagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcc 25755550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 168 - 351
Target Start/End: Original strand, 9240118 - 9240300
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9240118 gatggactcacacttgaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagagaagtaaaagctgaacaccttataagtaagagg 9240216  T
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 351  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||   | ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  9240217 acccataaatccattaccttaagatttcggataagaatgtggtgtctctctcaatagtgcggttattctagcctcgatgtggac 9240300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3135617 - 3135456
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa-----gtaagaggaccc--ataaacccattgccttaaggttt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |     ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  3135617 caagtgtgagttatatgtcccacctcagataaaagagtaaaagttgaacaccttattatattagtaagaggacccccataaacccattgccttaaggttt 3135518  T
Q  295 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3135517 tagataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3135456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1634473 - 1634317
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1634473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaaggttaaacacattataagtaagaggacccataaacccattggcttaaggttttggg 1634374  T
Q  299 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||| ||| |||||||  | | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634373 taagagtgcggtatctctctcac-tatatggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 1634317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 200 - 347
Target Start/End: Original strand, 39914252 - 39914399
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| |    
T  39914252 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaacagtagaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctaatgccttaatattttggat 39914351  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 347  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  39914352 aagagtgtggtgtctctctcacttatgcggttgttctagcctcgatgt 39914399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 45901715 - 45901870
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa-ggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  45901715 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagaaaaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacgcataaactcatggccttaaagtttttggta 45901814  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45901815 agagtgtggtgtctctcttacttatagggttgttctaacttcgatgtggacggtcc 45901870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 201 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 53118131 - 53117977
Alignment:
Q  201 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  53118131 gcaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggattca-aaacccattgccttaagattttgggta 53118033  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  53118032 agagtgtagtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcatcgatgtgaacggtcc 53117977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 167 - 255
Target Start/End: Original strand, 22304213 - 22304301
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304213 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctt 22304301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 352
Target Start/End: Original strand, 8327904 - 8328060
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  8327904 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggatgaatatcttataagtaagagaacccataaacgtaatgccttaaggttttgggt 8328003  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg----gttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||| |    ||||||||||||||||||||||||    
T  8328004 aagagtgtggtgtctctctcacaagtgagtgcagttgttctagcctcgatgtggacg 8328060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 49336843 - 49336694
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  49336843 caagtgtgagttacatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaccaccttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaagttctgggtaa 49336744  T
Q  302 gagtgtggtgtctctc-ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  49336743 gagtgtggtgtctctctttttttgtgcggttgttctatcctcaatgtgga 49336694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22303929 - 22303759
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22303929 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgacagaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggcttcttgtg 22303830  T
Q  109 caggaacggcgatacaggc-aaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcaca 179  Q
    ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  22303829 cagcaacggcgattcaggcaaaagtaaaaagcttccgct-ttaggggaacacgttgaattgatggactcaca 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Original strand, 37726496 - 37726652
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||        | |||||||||| |||    
T  37726496 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaataccttataagtaagagg--------atccattgcctttagg 37726587  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||| ||||||||||  || | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726588 ttttggataagagtgtgacgtttatcttacttgtatagttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37726652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 354
Target Start/End: Original strand, 51886553 - 51886709
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||      |    
T  51886553 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcatataagtaagaggacccataaactcattgc------g 51886646  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  51886647 ttttggataagagtgtgatgtctcttttgcaagtgtgattgttctaatctcgatgtgaacggt 51886709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 258 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22303759 - 22303662
Alignment:
Q  258 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  22303759 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttacttgtgcgattgttctagcctcgatgtagacggtc 22303662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44160702 - 44160549
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||| ||||||||||  || || |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  44160702 tgcaagtgtcagttatatgtttcatattggataaaacaataaaggttgaacaccttataaataagaggatccataaacccattgtcttaaggtttt-ggt 44160604  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  44160603 aagaatgtggcgtctctcttact--tgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 44160549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 33175820 - 33175668
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc---ataaacccattgccttaaggttttggg 298  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33175820 caagtgtgagttatatgtctcacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataataaactcatagccttaaggttttggg 33175721  T
Q  299 taaga--gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    |||||  |||||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33175720 taagagtgtgtgacgtctctctcacttgtgtgattgttctagcctcggtgtgg 33175668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 181 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 47964694 - 47964544
Alignment:
Q  181 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 280  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||  ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||| |    
T  47964694 ttgagggcgagtgttg-tgtgcaagtgtgagttgtatgtcccgcatcggatagaaatgtggaggttgaacgctatataagtgagaggacccataaaccta 47964596  T
Q  281 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  47964595 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttg 47964544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 210 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 42584970 - 42584829
Alignment:
Q  210 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||    
T  42584970 agttatatgtcccacatcggatagaagagtaaagattgaacaccttataagtaagaggatccataaaccaattgtcttaagattttgagaaagagtgtgg 42584871  T
Q  310 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 353  Q
    |||  ||||| ||| || |||||||||||  || ||||||||||    
T  42584870 tgt--ctcttacttatgcggttgttctagtttcaatgtggacgg 42584829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 3384435 - 3384317
Alignment:
Q  189 gagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 288  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||    
T  3384435 gagtgttggtgtgcaagcgtgagttatatgtcccacatatgataaaacagtataggttaaacactttataaggaagaggacccataaacttaatgcctta 3384336  T
Q  289 aggttttgggtaagagtgt 307  Q
    | |||||||||||||||||    
T  3384335 aagttttgggtaagagtgt 3384317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33362425 - 33362327
Alignment:
Q  226 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 324  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  33362425 tcggataaaataataaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccatttccttaagattttgggtaagtgtggcgtctctctcttgcttg 33362327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39336387 - 39336234
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |  ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  39336387 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaagttggaggttgaacactttataagtgagaggatccataaactcattgctttaaggttttggat 39336288  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    || |||||  || |||||| ||| ||||||||| ||| |||| |||||||| |||||    
T  39336287 aatagtgt--tgcctctctcgctcgtgtggttgctct-gcctggatgtggatggtcc 39336234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41359575 - 41359493
Alignment:
Q  274 aaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41359575 aaacccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 41359493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 270 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 54017636 - 54017550
Alignment:
Q  270 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  54017636 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctattacttatgtgattgttttggcctcgatgtggtcggtcc 54017550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 203 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 7767469 - 7767380
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 292  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7767469 aagtctgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttggacactttataactaagaggactcataaacccattgtcttaaggt 7767380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 47965073 - 47964921
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||| || |||  ||||| ||||   ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  47965073 tgcaagtgtgagttatatgttttacatcggatagaaaagtggaggttaaacattatataagtgagagggctcataagcccattgccttaagattttgggt 47964974  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | || ||||||| |||| ||||||||||    
T  47964973 aagagtgtggcgtctctctcacttatatgattgttctggcctagatgtggacg 47964921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Original strand, 11661537 - 11661638
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||               |||||||||||||||||||    
T  11661537 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaacggttaaacatcttataagtaagagg---------------gccttaaggttttgggtaa 11661621  T
Q  302 gagtgtggtgtctctct 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661622 gagtgtggtgtctctct 11661638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 46546480 - 46546375
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||  ||  ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46546480 aagtgtgagttatatgtcctacattggattgaaatgtggaggttgaacactttataagttagagaatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaag 46546381  T
Q  303 agtgtg 308  Q
    ||||||    
T  46546380 agtgtg 46546375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 256
Target Start/End: Original strand, 43346650 - 43346706
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 256  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43346650 tgcaagtgtgagttgtatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta 43346706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 242 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 39336086 - 39336000
Alignment:
Q  242 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtg 328  Q
    ||||||||||| |||||| | | | ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39336086 aggttgaacactttataaatgataagactcataaaatcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtg 39336000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 347
Target Start/End: Original strand, 12749211 - 12749316
Alignment:
Q  242 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 341  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||  || ||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  12749211 aggttgaacactttataagtgtgaggacccataaaccaattgcattaaggtttttgataagagtgtggactcactcttacttatgtggttgttctagtct 12749310  T
Q  342 cgatgt 347  Q
     |||||    
T  12749311 ggatgt 12749316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 310
Target Start/End: Original strand, 52634990 - 52635050
Alignment:
Q  250 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 310  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52634990 caccttataaataagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggt 52635050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 332
Target Start/End: Original strand, 25317161 - 25317290
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||  || |||  ||||||| ||| || ||| | |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  25317161 aagtgtgagttatgtgtcccacaccagatggaaaagtggaggttgagcactttgtaactgagaggacccataaacttgttgccttaaggttttgggtaaa 25317260  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 332  Q
    ||||| |||| |||||  ||||||||||||    
T  25317261 agtgtagtgtgtctctcacttgtgtggttg 25317290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 356
Target Start/End: Original strand, 8328374 - 8328426
Alignment:
Q  304 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8328374 gtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttttagcctcgatgtggacggtcc 8328426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Original strand, 25991405 - 25991521
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||| || ||| ||||  |||||||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||| |    
T  25991405 caagtgtgagtaatatgtcccacatcaaataaacaagttaatgttaaacattttataagtgagagaacctataaacctaatgccttaaggttttgggtta 25991504  T
Q  302 gagtgtggtgtctctct 318  Q
     |||||||| |||||||    
T  25991505 aagtgtggtctctctct 25991521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 309 - 356
Target Start/End: Original strand, 22304302 - 22304349
Alignment:
Q  309 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304302 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 22304349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Original strand, 53596027 - 53596078
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596027 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Original strand, 53596342 - 53596393
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53596342 gacccataaacccgttaccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 53596393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17732007 - 17731950
Alignment:
Q  255 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17732007 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 17731950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 255 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19033238 - 19033181
Alignment:
Q  255 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19033238 tataagaaagggaacccataaacccattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgt 19033181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43978947 - 43978867
Alignment:
Q  280 attgccttaaggttttgggtaag----agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43978947 attgccttaaggttttgggtaagctagagtgtggcgtctctctcacttgtgtgtttgttctaacctcgatgtggactgtcc 43978867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Original strand, 53596542 - 53596593
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53596542 gacccataaacccattgacttaagattttaggtaagagtgtggtgtctctct 53596593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Original strand, 53577548 - 53577616
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaa 77  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||    
T  53577548 tggtatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaa 53577616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 7766857 - 7766785
Alignment:
Q  282 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7766857 tgccttaaggttttaggtaagattgtggcgtctctca--cttgtatggttgttctagcctcgatgtagatggtcc 7766785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 48127906 - 48127859
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 314  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  48127906 gacccataaacccattgctttaatgttttggataagagtgtggtgtct 48127859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12747910 - 12747878
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747910 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 12747878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16871049 - 16871005
Alignment:
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16871049 acccataaactcattgccttaaggttttaggtaagagtgtcgtgt 16871005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17735081 - 17735037
Alignment:
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17735081 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 17735037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19036350 - 19036306
Alignment:
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19036350 acccataaactcattgacttaaggttttgggtaagagtgcggtgt 19036306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 162 - 224
Target Start/End: Original strand, 2299937 - 2300000
Alignment:
Q  162 taaagtgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccac 224  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  2299937 taaattgatggactcacacttgagggggatattgttg-tgtgcaagtgtgggttatatgtcccac 2300000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 312
Target Start/End: Original strand, 16143505 - 16143550
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16143505 gacccataagctcattgccttaaagttttgggtaagagtgtagtgt 16143550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16869884 - 16869843
Alignment:
Q  271 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16869884 cataaactcattgccttaaggttttgagcaagagtgtggtgt 16869843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36986101 - 36986040
Alignment:
Q  205 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  36986101 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 36986040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37011540 - 37011479
Alignment:
Q  205 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  || |||||||| ||||    
T  37011540 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaagtgaaggttgagaactttataagtgagag 37011479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 54018169 - 54018093
Alignment:
Q  14 atcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 88  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  54018169 atcagagctccggttcaacgaagggtgcgatcgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcaatggcggtacaa 54018093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 89
Target Start/End: Original strand, 15773037 - 15773117
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 89  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||  ||| |||||| || ||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15773037 tggtatcagagccctgattcgacgaagggtacgatcgaggccgccggtcagttatgcagaaagcagcaacagcgatacaag 15773117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 50329427 - 50329391
Alignment:
Q  263 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50329427 agaggacccataaatccaatgccttaaggttttgggt 50329391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 83)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Original strand, 3669870 - 3670214
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgc 109  Q
    |||||||||||||||  ||| | ||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3669870 tggtatcagagccccccttcaatgaagggtacgatcgaggcagccggtcgttgcgcagaaagccgcaacaacggtacaagcaacaagtggctccttgtgc 3669969  T
Q  110 aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||  ||||| ||||| | | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3669970 aggaacggcgatacatgcaaagt-aagagcttctgcttgaagggtgagcatgatgaattgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgt 3670068  T
Q  209 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3670069 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtatgaggacccataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtg 3670168  T
Q  309 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3670169 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 3670214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 10 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1014219 - 1013879
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1014219 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgactgaggcagccggtcgttgcgcagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgtgc 1014120  T
Q  110 aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 208  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  |||||| || | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014119 aggaacgacgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagtatgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 1014021  T
Q  209 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  1014020 gagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccctataagtaagaggaccaataaacccattgccttagagttttgagtaagagtgtg 1013921  T
Q  309 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
     ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1013920 ttgtctcttttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1013879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Original strand, 9309164 - 9309510
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtg 108  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9309164 tggtatcagaaccccagttcgacggagggtacgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcaacaacgacggcacaagcagcaagtggctccttgtg 9309263  T
Q  109 caggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagt 206  Q
    ||| ||| | ||||||    |||| |||| |||| | |    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||    
T  9309264 cagcaacagtgatacaaagcaagtaaaaaacttctgttgg--ggggagcacgataaagtgatggactcacaattgagggggagtgttgttgtgtgcaagt 9309361  T
Q  207 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  9309362 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccttaaactcattgccttaaggtgtcgggtaagagtg 9309461  T
Q  307 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309462 tggtgtctctc-tcagtatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 9309510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 191 - 356
Target Start/End: Original strand, 3669678 - 3669843
Alignment:
Q  191 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  3669678 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttaag 3669777  T
Q  291 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3669778 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggatggtcc 3669843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3038446 - 3038292
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038446 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 3038347  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038346 gagtgtggcatctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3038292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 190 - 351
Target Start/End: Original strand, 30441071 - 30441236
Alignment:
Q  190 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacctta----taagtaagaggacccataaacccattgcc 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30441071 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggctaaaatagtaaaggttgaacaccttaattataagtaagagggcccataaacccattgcc 30441170  T
Q  286 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30441171 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 30441236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 178 - 356
Target Start/End: Original strand, 34835185 - 34835365
Alignment:
Q  178 cacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 275  Q
    ||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835185 cacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 34835284  T
Q  276 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34835285 actcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtcc 34835365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Original strand, 34835439 - 34835631
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34835439 tgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaa 34835538  T
Q  264 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34835539 gaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtcc 34835631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Original strand, 34835705 - 34835897
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcg-gataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34835705 tgatggactcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagggtgagttatatgtcccacgtcccgataaaatagtaaaggtttaacaccttataagtaa 34835804  T
Q  264 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  34835805 gaggacccataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtcactcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtagacggtcc 34835897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Original strand, 40518550 - 40518738
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40518550 tgatggactcacacttgagggggagtattgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagag 40518648  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40518649 gacccataaacccaatgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 40518738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 202 - 350
Target Start/End: Original strand, 34834878 - 34835026
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34834878 caagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagatgactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34834977  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34834978 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 34835026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 134 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 45121881 - 45121663
Alignment:
Q  134 aaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggat 231  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  45121881 aaaagcttccgctctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttgt-tgtcccacatcggat 45121783  T
Q  232 aaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 331  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| || ||||    
T  45121782 aaaagagtaaaggttgatcaccttataagtaagaggatccataaacctacagccttaaggttttgagtaagagtgtgatatctctcttacttatggggtt 45121683  T
Q  332 gttctagcctcgatgtggac 351  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  45121682 gttctagcctcgatgtggac 45121663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 45122215 - 45122067
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  45122215 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaactcattttcttaaggttttgggt 45122116  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122115 aagagtgtggtgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtg 45122067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8918956 - 8918766
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8918956 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttacatgtcccacatcagatagcagagtaaaggttgaacactttataagtaaga 8918857  T
Q  266 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8918856 ggacccataaacctattgacttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctttcttgcgtgtgtggttgttttaacctcgatgtggacggtcc 8918766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20870741 - 20870575
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20870741 tgttggtttgcaagtgtgagttatatatgttccacatcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaa 20870642  T
Q  290 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20870641 gattttggataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatatggacggtcc 20870575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 192 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1014411 - 1014253
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| |    
T  1014411 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcatacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccgtaaactcgttaccttaaag 1014312  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1014311 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcctgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgga 1014253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 354
Target Start/End: Original strand, 30359558 - 30359763
Alignment:
Q  151 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 248  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  30359558 ggggagcatgataaattgatggactcacacttgagggggaatgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaagagtaaaagttga 30359657  T
Q  249 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||    
T  30359658 acaccttataagtaagaggactcataaacccataaccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttatgcggttgttctaacttcgatgtg 30359757  T
Q  349 gacggt 354  Q
    ||||||    
T  30359758 gacggt 30359763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 178 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9482784 - 9482608
Alignment:
Q  178 cacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 277  Q
    ||||||||||||||||||| | || |   ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482784 cacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgagttatatgttccacatgggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 9482685  T
Q  278 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9482684 ccattgcctaaagattttgtataagagtgtggtatctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9482608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 173 - 356
Target Start/End: Original strand, 45122604 - 45122780
Alignment:
Q  173 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||      ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45122604 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtg------atatggcccgcatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 45122696  T
Q  273 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45122697 taaactcattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaaggtcc 45122780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 168 - 350
Target Start/End: Original strand, 6731872 - 6732045
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 267  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||     
T  6731872 gatggactcacatttgagggggagtgttgttttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga---------aagtaagaga 6731962  T
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  6731963 acccataaattcattgccttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgcggttgttctaacctcgatgtgga 6732045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33113523 - 33113369
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  33113523 caagtttgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacgtcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagattttgggtaa 33113424  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  33113423 gagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctaggctcaatgcggacggtcc 33113369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6877021 - 6876864
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatat-gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||| |||||||||    
T  6877021 tgcaagtgtgagttatatagtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagatgacccatacactcattgtcttagggttttggg 6876922  T
Q  299 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6876921 taagagtgtggtgtttctcttgtttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 6876864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 200 - 353
Target Start/End: Original strand, 9608745 - 9608898
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  9608745 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccatcaccttaaggttttgggt 9608844  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 353  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9608845 atgagtgtggcgtctctcttgctagtgaggttgttctagcctcgatgtggacgg 9608898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 40518071 - 40518227
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata--gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40518071 caagtgtgagttatatgttccacattggataaaaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaaatggacccataaacccaatgccttaaggttttgggt 40518170  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40518171 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcc 40518227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 25561972 - 25561817
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-gggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  25561972 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaacgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggttttggggta 25561873  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  25561872 agagtgtgacatctctcttgcttgtgtggttgctctagcctcgatgtggaaggtcc 25561817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 168 - 356
Target Start/End: Original strand, 45122972 - 45123162
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  45122972 gatggacttacacttgagggggagtgttgctgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacacct--taagtaaga 45123069  T
Q  266 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     |||||||||||| |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45123070 tgacccataaacctattttcttaaggttttgggtaagagagtgtggtgtctctcttatttgtggggttgttctaatctcgatgtggacggtcc 45123162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 203 - 349
Target Start/End: Original strand, 147454 - 147600
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  147454 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacccataaacctattgccttaaagttttgggtaag 147553  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||    
T  147554 agtgtggcgtctctcttgcttgtgcggtagttctagcattgatgtgg 147600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 37544646 - 37544496
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  37544646 caagtgtgagttataagtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagaaagaggacccataaatccattactttaaggttttgggtaa 37544547  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37544546 gagtgtggtgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacg 37544496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 225 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9483320 - 9483191
Alignment:
Q  225 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttg 324  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  9483320 atcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgctcg 9483221  T
Q  325 tgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9483220 tgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 9483191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 202 - 350
Target Start/End: Original strand, 30359273 - 30359421
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359273 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagcaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaa 30359372  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  30359373 gagtgtggtgtctctctttcttgtgatgttgttttagcctcaatgtgga 30359421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45122068 - 45121912
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45122068 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcattgccttaagattttgggt 45121969  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    || ||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  45121968 aacagtgtggcgtctcttttgctcgtgtggttattcaagcctcgatgtggaaggtcc 45121912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1514071 - 1513917
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1514071 caagtatgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccttaaacccataaccttaaggttttgggtaa 1513972  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     |||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1513971 aagtgtggtatctctcttacatgtggggttattctagcctcgatgtggacggtcc 1513917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 207 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 70425 - 70277
Alignment:
Q  207 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  70425 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttaggtaagagtg 70326  T
Q  307 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  70325 tgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctaacctcaatgcggacggtc 70277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 151 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18371863 - 18371665
Alignment:
Q  151 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 250  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || |   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18371863 ggggggcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgctgttgtgtagaagtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18371764  T
Q  251 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    |     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  18371763 a----ttaagtaagaagacccataaaccca-tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtgtctctcatttgtgcggttgctctagcttcgatgtgga 18371669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 194 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 40579670 - 40579512
Alignment:
Q  194 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 293  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40579670 ttggtttccaagtgtgaattatatgtttcatattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttattgctttaaggtt 40579571  T
Q  294 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  40579570 ttaggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtacggttgttctatcctcgatgtggacg 40579512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 5420651 - 5420807
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  5420651 tgcaagtgtgtattatatgtcccacatcggatagaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttttgt 5420750  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5420751 aagagtgtgacgtctccctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggaccgtcc 5420807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 355
Target Start/End: Original strand, 41972158 - 41972316
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt---ttg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||   |||    
T  41972158 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgataggacccataaacccattgccataaagttttgttg 41972257  T
Q  297 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||    
T  41972258 ggtaagagtgtggcgtcactcttgcttgtgtggttgttccagcctcaatatggacggtc 41972316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 5915872 - 5916023
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||| ||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5915872 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaaatgtaaa-gtttaacacttta----taagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggt 5915966  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5915967 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 5916023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 151 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18372463 - 18372342
Alignment:
Q  151 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372463 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18372364  T
Q  251 accttataagtaagaggaccca 272  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  18372363 accttataagtaagaagaccca 18372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Original strand, 147794 - 147968
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| | |||||         
T  147794 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaaaagtaaatgttgaacaacatataa----- 147888  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  147889 ----cccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcagttgttctagcctcaatgtg 147968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 210 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18372142 - 18371998
Alignment:
Q  210 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 309  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18372142 agttatatgtaccacatccaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtgg 18372043  T
Q  310 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  18372042 tgtttctctcgcttgtgcggttgctctagcctcaatgtgaacggt 18371998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 171 - 356
Target Start/End: Original strand, 6651476 - 6651650
Alignment:
Q  171 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 270  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |         |||||| |||    
T  6651476 ggactcacacttgaggggaggtgttgttttgcaagtg--agttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaaaa---------taagagaacc 6651564  T
Q  271 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||    
T  6651565 cataaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcgattgttctaacctcgatgtggatggtcc 6651650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 18372905 - 18372785
Alignment:
Q  151 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372905 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgaggag-agtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaggttgaac 18372807  T
Q  251 accttataagtaagaggaccca 272  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18372806 accttataagtaagaggaccca 18372785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 203 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 32640682 - 32640542
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32640682 aagtgtgagttatctgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaaca-----taggtaagaggaccgataaacccattgccttaaggttttgggtaag 32640588  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32640587 agtgttgcgtctctcttgcttttgtgattgttctagcctcgatgtg 32640542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 9308977 - 9309137
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9308977 tgcaagtgtgagttatatgtcctacacatcagataaaagagtaaaagttgaacatgttataagtaagaggacccataaacccattgcctaaaggttttgg 9309076  T
Q  298 gtaag---agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    | |||   ||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309077 gcaagagtagtgtggtgtctctctcac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 9309137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 18373139 - 18372988
Alignment:
Q  151 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgca-agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaa 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | || | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18373139 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagatggagtgttgttgtgtacagtgtgatttatatgtcccacttcggataaaatagtaaaggttgaa 18373040  T
Q  250 caccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 304  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  18373039 caccttataaataagaggactcataaactcattgcc---aggttttgggtaagag 18372988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 204 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18380171 - 18380021
Alignment:
Q  204 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 303  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  18380171 agtgtgagttatatatcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggggcctataaacccactaccttaaggttttgagtaaga 18380072  T
Q  304 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||   |||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| ||||    
T  18380071 gtgtggtg--cctcttgcttgtgcgattcttctagcttcgatgtggacagtcc 18380021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 194 - 356
Target Start/End: Original strand, 32305478 - 32305633
Alignment:
Q  194 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  32305478 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtc-------ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacctataaacccattaccttaagatt 32305570  T
Q  294 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| ||||||||||| |||| | || ||| ||  ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  32305571 ttggataagagtgtggcgtctttattacttatgcagttgttctaaccttgatgtggacggtcc 32305633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 200 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4154824 - 4154678
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  4154824 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgaaaggacccataaactcattgccccaaggttttgggt 4154725  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  4154724 aagagtgtggcgtctctc--gcttgtgtggttgctctggcctagatgtg 4154678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 351
Target Start/End: Original strand, 9507777 - 9507933
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcc--cacatcggataaaat---agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 294  Q
    |||||||||||||||||| |||  || || ||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9507777 tgcaagtgtgagttatatctcctccatattggataaaagtacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggactcataaacccattaccttaaggttt 9507876  T
Q  295 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 351  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  ||| | ||||||||| |||||||||||||||    
T  9507877 tgggtaagagtgtggcgtctctatctcttatatggttgttcaagcctcgatgtggac 9507933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 223 - 337
Target Start/End: Original strand, 9609108 - 9609222
Alignment:
Q  223 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 322  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9609108 acatcagatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagatgacccataaacccatcgccttaatgttttcggtaagagtgtggcgtctctcttgct 9609207  T
Q  323 tgtgtggttgttcta 337  Q
     ||||||||||||||    
T  9609208 agtgtggttgttcta 9609222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 155 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18372574 - 18372485
Alignment:
Q  155 agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 244  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372574 agcacgataaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgaaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg 18372485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 192 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41416335 - 41416251
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 278  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41416335 tgttggtttgcaagtg--agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacc 41416251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 203 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43274934 - 43274824
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  43274934 aagtgtgagttatatgtttcacatcagataaaagagtaaaggttgaatatattataagtaagaggacccataaacctattgtcttaaggttttgagtaag 43274835  T
Q  303 agtgtggtgtc 313  Q
    |||||||||||    
T  43274834 agtgtggtgtc 43274824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Original strand, 8794113 - 8794229
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||||||| |    
T  8794113 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagaataaatgttgaacatcttataagtaagaggactcataaacctaatatcttaaggttttgggtga 8794212  T
Q  302 gagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||| |||||||||||    
T  8794213 gagtgcggtgtctctct 8794229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4154472 - 4154290
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||||| ||    
T  4154472 tgatggactcacacttgagggggaaattgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgag 4154374  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    || |||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||   |||| |||||| ||| |||| |||||||    
T  4154373 ag-acccataaactcattgccttaatattttgggtaagtgtgtgatgtctctctcaattgtttggttgctctggcctagatgtgg 4154290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 200 - 349
Target Start/End: Original strand, 12283873 - 12284021
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||| | ||| ||||||| ||  | ||||||||||||| |    
T  12283873 tgcaagtgtaagttatatgtcccacgtcagataaaaaagtaaatgttgaatatcttaaaagtaaaatgacacataaactcaa-gtcttaaggttttggat 12283971  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12283972 aagagtgtagtgtctctctcacttgtgtggttgttctagcctctatgtgg 12284021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40579352 - 40579271
Alignment:
Q  275 aacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40579352 aacccattgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcc 40579271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18372758 - 18372656
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||    
T  18372758 caagtgtgatttatatgttccatttcggataaaatagtaaaggttgaaca-cttataagtaagaggactcataaacccattgcc---aggttttgggtaa 18372663  T
Q  302 gagtgtg 308  Q
    |||||||    
T  18372662 gagtgtg 18372656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 282 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8919220 - 8919146
Alignment:
Q  282 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8919220 tgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctcttttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtggacggtcc 8919146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9620834 - 9620680
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |    
T  9620834 tgcaagtgtgagttatatgtctcacaacagatagaaaagtagaagttgatcactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt--at 9620737  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||    
T  9620736 aagagtttgatgtctctctcacttgtgtggttgctcaggcctggatgtggacggtcc 9620680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 203 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 3037865 - 3037776
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 290  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3037865 aagtgtgagttatatatgttccacatcggatgaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgtcttaag 3037776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 356
Target Start/End: Original strand, 41129066 - 41129144
Alignment:
Q  278 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  41129066 ccattgtcttaaggttttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgttcaaacctcgatgtggacggtcc 41129144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 204 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 43398225 - 43398077
Alignment:
Q  204 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaa---gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 300  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||    
T  43398225 agtgtgagttatatatctcatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataagaggaggacccataaattcattgccttaaagttttggata 43398126  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    ||| ||||| || ||| || || ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  43398125 agaatgtggcgtttcttttactagtgcggttgctctaacctcgatgtgg 43398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 25561792 - 25561729
Alignment:
Q  210 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25561792 agttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagtacccat 25561729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 305
Target Start/End: Original strand, 20130454 - 20130553
Alignment:
Q  205 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 304  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  20130454 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 20130552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 332
Target Start/End: Original strand, 5274775 - 5274907
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||| | |||||| || | ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| ||||| ||    
T  5274775 tgcaagtatgagttatatgttctacattgaataaaaaaggagaggttgaacactttataaatgggaagacccataaaatcattgccttaagattttgagt 5274874  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 332  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| ||||    
T  5274875 aagagtgtgatgtctctatcgcttgtgttgttg 5274907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 20995497 - 20995433
Alignment:
Q  277 cccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  20995497 cccattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcacttgtgtggttgctctggcct 20995433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 294 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 43274699 - 43274637
Alignment:
Q  294 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43274699 ttgggtatgagtgtggtgtctctcttacttatggggttgttccagcctcgatgtggacggtcc 43274637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 281 - 338
Target Start/End: Original strand, 16524446 - 16524503
Alignment:
Q  281 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 338  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16524446 ttgctttaaggttttgagtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgtggttgctctag 16524503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 236 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 18373292 - 18373236
Alignment:
Q  236 tagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 292  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  18373292 tagtaaaggttgaacaccttataaataagaggatccattaacccattgtcttaaggt 18373236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 299
Target Start/End: Original strand, 40991756 - 40991852
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |  || || |||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  40991756 aagtgtgagttagaagtcccacattgcttagaaaagtggaggttgaacacttcataagtgagaggacccataaacccaatgcctcaaggttttgggt 40991852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 151 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 43274776 - 43274699
Alignment:
Q  151 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacat 226  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||||||| || |||||    
T  43274776 ggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggacagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatatctcacat 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3038016 - 3037971
Alignment:
Q  311 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038016 gtctctctatcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3037971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 89
Target Start/End: Original strand, 147637 - 147715
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 89  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||  |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  147637 tatcagagccccggttcgacaaagggtacgatcgaggcagccagtccgtttgcgcagaaagcagcaacagcggtacaag 147715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 40417820 - 40417733
Alignment:
Q  254 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 341  Q
    |||||||||||| ||| | |||| ||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||    
T  40417820 ttataagtaagatgactcgtaaatccattgcgttaagattttggataaaagtgtggtgtctctctcacttgtgtgattgctcttgcct 40417733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18372342 - 18372288
Alignment:
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  18372342 aagagtgtggtgtctctctcgcttgtgcggttgctttagtctcgatgtggacggt 18372288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12156745 - 12156708
Alignment:
Q  271 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12156745 cataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 12156708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20995559 - 20995502
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat 257  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  20995559 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcagataaaaaagtggaggttgaacactttat 20995502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 277
Target Start/End: Original strand, 33831978 - 33832055
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 277  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | | | | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  33831978 tgcaagtgtgagttatatgtctcacgttgaagagaaaagtagaagttgaacactttataagtaagaggacctataaac 33832055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 299
Target Start/End: Original strand, 11442911 - 11442952
Alignment:
Q  258 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11442911 aagtgagaggacccataaactcaatgccttaaggttttgggt 11442952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18645745 - 18645713
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18645745 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggata 18645713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 58
Target Start/End: Original strand, 34835058 - 34835105
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 58  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  34835058 tggtatcagagccc-ggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtc 34835105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 83)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44290798 - 44290460
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||||||        |||||||||||||    
T  44290798 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggcagccggttgttgcgcagaaagccgcaacggtggtacaa--------tggctccttgtgc 44290707  T
Q  110 aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 208  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||  |||||| |||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290706 aggaacgacgatacaggcaaagt-aagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 44290608  T
Q  209 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44290607 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtatg 44290508  T
Q  309 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290507 gtgtctttcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 44290460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 48588833 - 48588491
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48588833 tatcagagccccggttcgacgaagggtgcgactgaggcagccggtcattgtgcagaaagctgcaacgacggtacaagcagcaagtggctccttgtgcagg 48588734  T
Q  113 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 211  Q
    |||| ||||||| ||||| | || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48588733 aacgacgatacatgcaaaat-aagagcttccgcttgaaggggtagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 48588635  T
Q  212 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 311  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48588634 ttctatgtccgacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccgtaaattcattgccttaaggttttgggtaagagtgcggtg 48588535  T
Q  312 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48588534 tctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtc 48588491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26661873 - 26661524
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtg 108  Q
    |||||| ||| || || ||||||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26661873 tggtattagaacctcgattcgacgaagggtacgaccgaggccgccagtcaattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcaacaagtggctccttgtg 26661774  T
Q  109 caggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggg-gagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caag 205  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||| ||| | | | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  ||||    
T  26661773 cagcaacgacgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaagggagagtatgatgaatagatggactcacacttaagggggagtgttgttgtgtacaag 26661675  T
Q  206 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26661674 tgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagt 26661575  T
Q  306 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  26661574 gtggtgtctctctcgcttgtgtggttgttcaagcctcgatatggacggtcc 26661524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 190 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 44290993 - 44290826
Alignment:
Q  190 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290993 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 44290894  T
Q  290 ggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290893 ggttttgggtaaagagtgtggtgtatctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 44290826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 3537494 - 3537226
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagcc-gcaacagcggtacaagtagcaagtg--gctccttg 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||     |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  3537494 tggtatcagagccacggttcgacgaagggtacgaccgaggcagttagtc-----gcagaaagcaagcaacggcggtacaagcagcaagtgtggctccttg 3537400  T
Q  107 tgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaag 205  Q
    |||||||||| ||||||| |||| || || ||||||||||  |||||| |||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537399 tgcaggaacgacgatacatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaag 3537300  T
Q  206 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537299 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccc 3537226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 137 - 356
Target Start/End: Original strand, 41157311 - 41157531
Alignment:
Q  137 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 234  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41157311 agcttccgctctg-ggggagcacgataaattgatggactcacacttaagggggagtattgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaa 41157409  T
Q  235 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 334  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41157410 agagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctttaggttttgagtaagagtgtggtgtctgtcttgcttgtgtggttgtt 41157509  T
Q  335 ctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  41157510 ctagcctcgatgtgggcggtcc 41157531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 162 - 349
Target Start/End: Original strand, 37556071 - 37556260
Alignment:
Q  162 taaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa-tagtaaaggttgaacaccttata 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37556071 taaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaaatagtaaaggttgaacatcttata 37556170  T
Q  259 agtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37556171 agtaagaggacc-ataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37556260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Original strand, 41759475 - 41759639
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  41759475 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagatgatccataaatccattgccttaagg 41759574  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41759575 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttatgtggttgttctagccttgatgtggacggtcc 41759639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 168 - 350
Target Start/End: Original strand, 34364891 - 34365075
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34364891 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaga 34364990  T
Q  266 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||| ||||||||||||    
T  34364991 ggacccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttatgcagttgctctaacctcgatgtgga 34365075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 41142372 - 41142529
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41142372 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 41142471  T
Q  300 -aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142472 aaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 41142529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3537765 - 3537601
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3537765 tgttggtttgtacgtgttagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttatgagtaagaggacctataaacccattggcttaagg 3537666  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537665 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3537601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 192 - 354
Target Start/End: Original strand, 3550712 - 3550871
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3550712 tgttggttggcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaag 3550811  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  3550812 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgc---tacggttgttctagcctcgatgtggacggt 3550871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 41156991 - 41157147
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  41156991 tgcaagtgtgaattatatgtcccataacggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgctttaaggttttgggt 41157090  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41157091 aagagtgtggtgtctctattgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgggcggtcc 41157147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50051999 - 50051777
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  50051999 tggtatcagagccccggttcgacaaagggcgcgaccgaggcagccggtggttgggcagaaagccgcaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgtgc 50051900  T
Q  110 aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 208  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||  || |||||||| | | || | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50051899 aggaacggcgatactggcaaagt-aagagcttctgcttgaagggggagcatgatgaattaatggactcacacttgagggggaatgttggtttgcaagtgt 50051801  T
Q  209 gagttatatgtcccacatcggata 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  50051800 gagttatatgtcccacatcggata 50051777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 173 - 356
Target Start/End: Original strand, 11977251 - 11977436
Alignment:
Q  173 actcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc 270  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  11977251 actcacacttgagggggagtgttgctgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgggtaaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagagcact 11977350  T
Q  271 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977351 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctcttgcaagtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 11977436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 355
Target Start/End: Original strand, 17294579 - 17294733
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294579 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 17294678  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtg-tggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17294679 gagtgtggtgtctctctcgcttatgcaggttgctctagcctcgatgtggacggtc 17294733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 169 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22077683 - 22077497
Alignment:
Q  169 atggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077683 atggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 22077585  T
Q  269 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  22077584 cccataaactcgtagccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgttcaagcatcgatatggacggtcc 22077497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 29798199 - 29798355
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |    
T  29798199 tgcaagtgtgagttatatgtcctacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtcttggat 29798298  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  29798299 aagagtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctaacctcgatatagacggtcc 29798355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31767319 - 31767163
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  31767319 tgcaagtgtgggttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccattaacctaatgccttaaggttttgggt 31767220  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31767219 aagagtgtgacgtctatcttgcttgtgtggttgttctagactcgatgtggacggtcc 31767163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 200 - 350
Target Start/End: Original strand, 34364507 - 34364657
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  34364507 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccgtaaacccatagccttaaggttttgggt 34364606  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  34364607 aagagtgtgatgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtgga 34364657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 34649440 - 34649594
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34649440 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgcaagaacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 34649539  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649540 gagtgaggcgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 34649594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 201 - 350
Target Start/End: Original strand, 40082408 - 40082556
Alignment:
Q  201 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40082408 gcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-tcataaattcattgccttaaggttttgggta 40082506  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  40082507 agagtgtggtatctctcttgcttgtgcgtttgttctagcctcgatgtgga 40082556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 191 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45494146 - 45493976
Alignment:
Q  191 gtgttggtttgcaagtgtgagtt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacc----ttataagtaagaggacccataaacccattgcc 285  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45494146 gtgttggtttgcaagtgtgagtttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccatatatataagtaagatgatccataaacccattgcc 45494047  T
Q  286 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45494046 ttaaagttttggataagagtgtggtgtctctcttccttatgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 45493976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5320123 - 5319967
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5320123 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 5320024  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5320023 aagagtgtagtgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcc 5319967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 208 - 356
Target Start/End: Original strand, 14318875 - 14319023
Alignment:
Q  208 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 307  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14318875 tgagttatatgttccacgtcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaatctattgccttaaggttttgggtaagagtgt 14318974  T
Q  308 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14318975 ggtgtctctcttatttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 14319023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 194 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32594880 - 32594748
Alignment:
Q  194 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32594880 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgtcttaaggtt 32594781  T
Q  294 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32594780 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtg 32594748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 50052189 - 50052026
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |    
T  50052189 tgttggtttttaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacctattttcttaaag 50052090  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  50052089 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctaacctcgatgtggacagtcc 50052026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3875489 - 3875333
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3875489 tgcaagagtcagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgtacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttaggt 3875390  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| ||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3875389 aagaatgtggagtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3875333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 197 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 38804516 - 38804370
Alignment:
Q  197 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 296  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  38804516 gtttacaagtgtgagttatacgtcccacatcgaataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaagaggatccataaacccataaccttaaggttttg 38804417  T
Q  297 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcg 343  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38804416 ggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcg 38804370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 202 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26662054 - 26661921
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26662054 caagtgtgagttatatatcccatatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtgagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaa 26661955  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661954 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 26661921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 32168853 - 32168700
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32168853 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccc-----ggataaaatagtaaaggttgaacacctta------agaggacccataaacccattgccttgagg 32168765  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32168764 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacagtcc 32168700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 204 - 348
Target Start/End: Original strand, 9955911 - 9956057
Alignment:
Q  204 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccat-aaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9955911 agtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaaagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccattaaaccaattgccttaaggttttgggtaa 9956010  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  9956011 gagtgtgatgtctctcttgcttgtgcggttgctctagcctcgatgtg 9956057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 203 - 349
Target Start/End: Original strand, 37555733 - 37555878
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  37555733 aagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtgaaggttgaatacattataagtaagaggacct-taaatccttagccttaaggttttgggtaag 37555831  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37555832 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtgg 37555878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 45084382 - 45084532
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||||||||    
T  45084382 tgcaagtgtgagttatatctcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa------cgtcttaaggttttgggt 45084475  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45084476 aagagagtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgcggacggtcc 45084532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37850758 - 37850602
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||| || |    
T  37850758 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgcataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagagaacccataaacctaatgttttaaggtttcggat 37850659  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37850658 aagagtgtggtgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctcgatgtggacggtcc 37850602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24600472 - 24600321
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  24600472 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacatattataagtaagagaactcataaactcattgtcttaaggttttgtgt 24600373  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 351  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  24600372 aagagtgtggtgtctctctcgctagtatggttgttctagcctcgatgtggac 24600321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 200 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 66630 - 66476
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  66630 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacatatggccttaaggttttgggt 66531  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    |||||| | | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  66530 aagagtatagcgtctctctcgcttgtgcggttgttctagcctcaatgtggacggt 66476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 39066358 - 39066210
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |    
T  39066358 tgcaagtgtgagttatatattccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataactaagatgacccataaaatcattgtcttaaggttttggat 39066259  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39066258 aagagtgtggtgtctctcttacttatgtggttgttctagccttgatgtg 39066210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 168 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 66278 - 66100
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-gaacaccttataagtaaga 265  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  66278 gatggactcacacttgaggggaagtgttg-tgtgcaagtgtgagtaatcatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggtttgaacaccttataagtaaga 66180  T
Q  266 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 347  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  66179 ggacccataaacctatggccttaaggttttgggtaagagtgtggcgcctctc--acttgtatggttgttctggcctcgatgt 66100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 168 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22077311 - 22077112
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggata--aaat----------agtaaaggttgaacacctt 255  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||          ||||||||||||| |||||    
T  22077311 gatggacacacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaatcggatagaaaagtaaaggttgaatacctt 22077213  T
Q  256 ataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||| ||  ||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22077212 ataagtaagaggacccataaactcattgccctaaggttttggataagagtgtgacgtctccctcacttatgcggttgttcaagcctcgatgtggacggtc 22077113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30630828 - 30630648
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  30630828 tgatggactcacacttgagagggagtgtta-tgtgcaagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaaaattaaaggtttgacactttataagtaagag 30630730  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| || |  ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30630729 aacccataaacacattgccttaaagttttgggtaagagtggggcgtccctatcacttatgtggttgttctggcctcgatgtg 30630648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41184583 - 41184489
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41184583 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 41184489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 200 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24132143 - 24131994
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  24132143 tgcaactgtgagttatatgtccctcatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataaataaggggatccataaactcattgccttaagg-tttgggt 24132045  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    |  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24132044 a--agtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtagacg 24131994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 191 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 44043944 - 44043810
Alignment:
Q  191 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa------aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgc 284  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  44043944 gtgttggtttgcaagtgt-agttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgacccataaacccattgt 44043846  T
Q  285 cttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 320  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44043845 cttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 44043810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 206 - 350
Target Start/End: Original strand, 5575110 - 5575252
Alignment:
Q  206 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 305  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||| |||||||    
T  5575110 tgtgaattatatgtcccacgtcggatagaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaatccatagctttaaggttttggataagagt 5575209  T
Q  306 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  5575210 gtggcgtctctct--cttatgaggtagttctagcctcgatgtgga 5575252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 201 - 352
Target Start/End: Original strand, 22793279 - 22793431
Alignment:
Q  201 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca-ttgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  22793279 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcgtatagaaaagtagaggttgaaaactttataagtgagaggatccataaacccatttgccttacggttttgagt 22793378  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22793379 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttgttctggcctcaatatggacg 22793431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 210 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5528902 - 5528762
Alignment:
Q  210 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 309  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||    
T  5528902 agttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataaataagaggactcataaactcattttcttaaggttttgggtaaatgtgtgg 5528803  T
Q  310 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
     |||||||||  || || |||||||||| ||||||||||||    
T  5528802 cgtctctcttctttatgcggttgttctatcctcgatgtgga 5528762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 202 - 348
Target Start/End: Original strand, 45839629 - 45839779
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggtt-----gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 296  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||     ||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||    
T  45839629 caagtatgagttatatgtcccacatcggatagaa-aataaaggttgaatcgaacaccttataagtaagaagacccataaatgtaatgccttaaggttttg 45839727  T
Q  297 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  45839728 ggtaagattgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctggcctcgatgtg 45839779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22077986 - 22077831
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||   | |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  22077986 tgcaagtgtgagttatatgttttaaatcggatagaaaaataaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcatagcc-taaggtttggggt 22077888  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| |||||| |  ||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22077887 aagagtgtggcgtctctttcacttatgcggttgttcaagcatcgatgtggacggtcc 22077831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 19283613 - 19283464
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  ||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  19283613 tgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggatagaaaagtggaggttgagcactttgtaaatgagaggacacataaactcatcgccttaaggttttggat 19283514  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  19283513 aagagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgctctagcctggatgtgg 19283464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 48588461 - 48588340
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgc 109  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  || |||||  | |||||||||||||||||    
T  48588461 tggtatcagagtcccggttcaacgaagggtgcaaccgaggcagccggttgttgcgcagaaagccgcaacgacgatacaaacaacaagtggctccttgtgc 48588362  T
Q  110 aggaacggcgatacaggcaaag 131  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  48588361 aggaacggcgatacaggcaaag 48588340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 200 - 348
Target Start/End: Original strand, 44685456 - 44685605
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaagg-ttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||    
T  44685456 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaaaggtttgaaaaccttataagtaagaggaccaataaactcattgccttaatg-tttggg 44685554  T
Q  299 taagagtgtggtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    ||| ||||||  |||| |||  ||||| | ||| |||||| ||||||||||    
T  44685555 taacagtgtgacgtctttctctcttgtgggggtagttctaacctcgatgtg 44685605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 271 - 356
Target Start/End: Original strand, 11977015 - 11977100
Alignment:
Q  271 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11977015 cataaacctaatgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcaagtgcggtagttctagcctcgatgtggacggtcc 11977100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 21378199 - 21378118
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 281  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21378199 tgcaagtgtcagttatatgtcccagatcggatagaacagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggacccataaacccat 21378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1188746 - 1188614
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  |||||||| |  |||||||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  1188746 tgcaagtgtgagttatatgttccatatcggatagaaaagtggaggttgaatattttataagtgagaagactcataaactcattgctttaaggttttgggt 1188647  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 332  Q
    || ||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  1188646 aaaagtgtggcgtctctctcacttatgtggttg 1188614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 270 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 50051776 - 50051691
Alignment:
Q  270 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50051776 ccataaacccattatcttaaggttttgcgtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctagcatcgatgtggacggtcc 50051691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 356
Target Start/End: Original strand, 44091909 - 44092050
Alignment:
Q  215 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 314  Q
    |||||| |||||| |||  || |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | | |   ||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  44091909 tatgtcacacatcagatgtaaaagtaaaggttgaacactttataagtgagagaacccataaatctaatattttaagattgtgggtaagagtgtggcgtct 44092008  T
Q  315 ctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     |||  ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  44092009 ttctcacttgttttgttgttctggcctcgatgtagacggtcc 44092050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 182 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 50469256 - 50469180
Alignment:
Q  182 tgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa 259  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  50469256 tgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagataataaagtaaaggttgaacactttataa 50469180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 242 - 318
Target Start/End: Original strand, 10351202 - 10351278
Alignment:
Q  242 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10351202 aggttgaacactttataagtgagagaacccataaacacattactttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctct 10351278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 227 - 347
Target Start/End: Original strand, 4956218 - 4956340
Alignment:
Q  227 cggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg--gtgtctctcttgcttg 324  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||||  || | |||||||||||    
T  4956218 cggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaactcattgctctaaagttttaggtaaaagtgtgacgtctatctcttgcttg 4956317  T
Q  325 tgtggttgttctagcctcgatgt 347  Q
    || | ||| | || |||||||||    
T  4956318 tgcgattgctttaacctcgatgt 4956340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1187522 - 1187404
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||  ||||| ||||  |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  1187522 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcgaatataaaagtggaggttaaacattttataagtgagaagacccataaactcattaccttaagattttgagt 1187423  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctct 318  Q
    || ||||||  ||||||||    
T  1187422 aaaagtgtgacgtctctct 1187404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 47379990 - 47379891
Alignment:
Q  151 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 250  Q
    |||||||||| | || || |||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  |||||||||    
T  47379990 ggggagcacgatgaattgttggacttacatttgagggggagtgttgat--gcaagtgtgagttatatatcccacatcggatagaaaagtggaggttgaac 47379893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 21378118 - 21378061
Alignment:
Q  299 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21378118 taagagtgtggcgtctatattgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 21378061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 35154197 - 35154150
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  35154197 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttg 35154150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 266
Target Start/End: Original strand, 4878803 - 4878869
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||| ||||    
T  4878803 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtgaagcttgaacattttataagtgagag 4878869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 167 - 349
Target Start/End: Original strand, 24448245 - 24448426
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   |||||  | | || |||  | ||||||||  |||||||| ||||    
T  24448245 tgatgggctcacaattgagggggagtgtt-gtgtgcaagtgtaagttatatgttagacatctcaaagaaaagtggaagttgaacattttataagtgagag 24448343  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    | | ||||||| ||||| |||||| |||||| ||| ||||||| || |||||  ||| || ||||||||  |||| |||||||    
T  24448344 ggctcataaactcattgtcttaagattttggataaaagtgtggcgtgtctctcacttatgaggttgttcaggcctagatgtgg 24448426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41184197 - 41184152
Alignment:
Q  249 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttt 294  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41184197 acactttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttt 41184152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 35154106 - 35154046
Alignment:
Q  255 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctc 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  35154106 tataagtaagagggcccataaactgattgtcttaaggtttttggcaagagtgtggtgtctc 35154046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 104
Target Start/End: Original strand, 11977141 - 11977224
Alignment:
Q  22 cccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctcct 104  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  11977141 cccggtttgacgaagggtacgaccgaggccgtcggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaagtggctcct 11977224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4266855 - 4266800
Alignment:
Q  299 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4266855 taagagtgtgatgtctctcttacttgtg--gttgttctagcctcgatgtgggcggtcc 4266800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 47380254 - 47380176
Alignment:
Q  271 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||  ||||| |||||| || ||||| |||||||    
T  47380254 cataaactcattgccttaaagttttgggtaagagtgtgacatctctctcacttgtctggttgctcaagcctagatgtgg 47380176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4266948 - 4266875
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4266948 tgttgttttacaaatgtgagttatatgtcctacattagataaaagagtaaatgttgaacacattagaagtaaga 4266875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5997029 - 5996881
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  | || || |||   | |||||||  |||||| | |||||| ||||| | ||||||  ||||||||||| ||    
T  5997029 tgcaagcgtgggttatatgtcccacataagttagaaaagtggtgcttgaacattttataaatgagaggatccatatatccattgt-ttaaggttttgagt 5996931  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
     ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||  |||||||    
T  5996930 gagagtgtggtgtctctctcatttgtgtggttgctctagccgagatgtgg 5996881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Original strand, 34364690 - 34364774
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||| ||||   ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  34364690 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtacgacccagacagccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacggcgatacaagtag 34364774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 318
Target Start/End: Original strand, 12466365 - 12466401
Alignment:
Q  282 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12466365 tgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 12466401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30630972 - 30630912
Alignment:
Q  209 gagttatatgtcccacatcggataaaatagt-aaaggttgaacaccttataagtaagagga 268  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30630972 gagttatatgtcttacatcggataaaaaaattaaaggctgaacaccttataagtaagagga 30630912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 241 - 356
Target Start/End: Original strand, 9499020 - 9499135
Alignment:
Q  241 aaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcc 340  Q
    |||||||||||  ||||| || ||| |||| |||||  |||| |||| |  |||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||| || ||    
T  9499020 aaggttgaacattttatatgttagatgacctataaattcattaccttcaaattttggataaaagtgtggtgtcacttttacttgtgtggttgttttatcc 9499119  T
Q  341 tcgatgtggacggtcc 356  Q
    |  |||||||||||||    
T  9499120 tatatgtggacggtcc 9499135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 9956258 - 9956212
Alignment:
Q  273 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 319  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9956258 taaacacattgtcttaatgttttgggtaagagtgtgatgtctctctt 9956212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 66444 - 66399
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc 58  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  66444 tatcagagtcccggttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtc 66399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3537587 - 3537495
Alignment:
Q  94 aagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgag 185  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| || || ||||||||||  || |||||||| | | |  |||||||||||||||||||    
T  3537587 aagtggctccttgtgcaagaacgacgacacatgcaaggtaaagagcttccgcttgaagggggagcatgatgatttgatggactcacacttgag 3537495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31973411 - 31973375
Alignment:
Q  282 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973411 tgccttaagattttgggtaagagtgtgatgtctctct 31973375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 137 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41184246 - 41184198
Alignment:
Q  137 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgag 185  Q
    ||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41184246 agcttccgcttgagggggagcacgatgaagtgatggactcacacttgag 41184198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 336
Target Start/End: Original strand, 50556451 - 50556587
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||  ||| || ||   ||||||||||  |||||||| |||| | || |||||| |||  ||||||||||||  |    
T  50556451 tgcaagtgtgggttatatatcacacatcatatagaaaagcggaggttgaacaatttataagtgagagaatccgtaaacctattttcttaaggttttgaat 50556550  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 336  Q
    || ||| |||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  50556551 aaaagtttggtatctctctcacttgtgtgattgttct 50556587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 80)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5542973 - 5542627
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgc 109  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |   || ||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5542973 tggtatcagagcttcggttcgacgacgaatgcaaccgaggcagtcggtcgttgtgcagaaagccgcaacggcggtacaagcaacaagtggctccttgtgc 5542874  T
Q  110 aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggga-gcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 208  Q
    |||||| |||||||||||||||| | | |||||||||  ||||||| ||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542873 aggaacagcgatacaggcaaagttaga-gcttccgcttgaaggggaagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 5542775  T
Q  209 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5542774 gagttatatgtcccatatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggtttttggtaagagtgtg 5542675  T
Q  309 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  5542674 gtgtctctcttgcttgtgcggttgttcaagtctcgatgtggacggtcc 5542627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14745641 - 14745300
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgc 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||  | ||||||| | |||||||||||||||||    
T  14745641 tggtatcagagccccggttcgatgaagggtgcgaccaaggcagccgatcgttacgcagaaagccgcaacgacagtacaagcaacaagtggctccttgtgc 14745542  T
Q  110 aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 208  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  |||||| |||| | | ||  |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  14745541 aggaacggcgatacagacaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatgtactcaaacttgagggg-agtgttggtttgcaactgt 14745444  T
Q  209 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745443 gagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaatggttgaacatcttgtaagtatgaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 14745344  T
Q  309 gtgtctctcttgcttgt-gtggttgttctagcctcgatgtggac 351  Q
    | ||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||    
T  14745343 gcgtctctcttgtaagtggtggttgttctagcctcgatgtggac 14745300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 168 - 356
Target Start/End: Original strand, 37106156 - 37106344
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106156 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 37106255  T
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  37106256 acccataaacccatttccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttgcttgtgcgattgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 191 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36178772 - 36178611
Alignment:
Q  191 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 290  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178772 gtgttagtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 36178673  T
Q  291 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36178672 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctctatgtggacg 36178611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Original strand, 29676711 - 29677064
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtg 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||| || | ||| |||||||||||||  ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29676711 tggtatcagagccccggttcaacgaagggtatgactgaggccgccgatcagttgcgcagaaagcaacaacgacagtacaagcagcaagtggctccttgtg 29676810  T
Q  109 caggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagt 206  Q
    ||| |||||  ||||| |||| || ||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||    
T  29676811 cagcaacggaaatacaagcaa-gtaaaaagcttccggtctggggggagcacgataaagtgatggactcacacttgagggggtgtgttgttgtgtgcaggt 29676909  T
Q  207 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-----cccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||     ||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  29676910 gtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggtttaacaccttataggtgagaggagaagacccataaacccattgccttaaggctttaagtaa 29677009  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||||||||| |||||    
T  29677010 gagtgtggtgtctctcttaattgtggggttgttccaacctcgatgtggatggtcc 29677064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14745833 - 14745669
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745833 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 14745734  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14745733 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcc 14745669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41283641 - 41283477
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41283641 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaagg 41283542  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41283541 ttttaggtaagagtgtggcgtctctcttgtttgtgtggttgttctagccttgatgtggacggtcc 41283477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 190 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5543166 - 5543002
Alignment:
Q  190 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5543166 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatccgataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaa 5543067  T
Q  290 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5543066 gattttgggtaagagtgtggtgtctctattgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtggacggt 5543002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 196 - 356
Target Start/End: Original strand, 37105920 - 37106080
Alignment:
Q  196 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37105920 ggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaggggacccataaactcattgccttaagatttt 37106019  T
Q  296 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106020 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37106080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 172 - 352
Target Start/End: Original strand, 15880233 - 15880415
Alignment:
Q  172 gactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 269  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880233 gactcacacttaaggggaagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 15880332  T
Q  270 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15880333 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtggacg 15880415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 128 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 36178498 - 36178320
Alignment:
Q  128 aaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatc 227  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36178498 aaagtaaaaagcttccgctcta-ggggaacacattaaagtgatggactcacacttgagggggactgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacttc 36178400  T
Q  228 ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 307  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36178399 ggataaaatagtaaaggtggaacaccttataagtaaggggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgt 36178320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 200 - 355
Target Start/End: Original strand, 962598 - 962753
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  962598 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgtcttaaggttttgggt 962697  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962698 aagagtgtgttgtcactcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 962753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 6421387 - 6421541
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6421387 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcattgccttgaggttttgggtaa 6421486  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6421487 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagtctcgatgtggacggtcc 6421541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 168 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40679818 - 40679632
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  40679818 gatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaagtaagggttgaacaccttataagtaagaga 40679720  T
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40679719 acccataaacccatcgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagtctcgatgtggacggtc 40679632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 42514649 - 42514805
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42514649 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcagatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgccttaagattttgggt 42514748  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42514749 aagagtgtggcgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42514805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Original strand, 6422084 - 6422266
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||      ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6422084 tgatggactcacacttgagggggagtcttg-tgtgcaaatgtga------tgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacacattataattaagag 6422176  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6422177 gacccataaacccatagccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggactgtcc 6422266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 207 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15511646 - 15511501
Alignment:
Q  207 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 306  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15511646 gtgagttatatgtcacacaacggataaaagagtaaaggttgaacacgttataagtaagaggacccataaacccattgtcttaagattttgggtaagagtg 15511547  T
Q  307 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15511546 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtggacg 15511501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28531504 - 28531316
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  28531504 tgatggactcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagcaaaggttgaacaccttataagtaagag 28531406  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   || ||  |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28531405 gtcccataaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgactctctcagttatgcagttgctctagcctcgatgtggatggtcc 28531316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 168 - 353
Target Start/End: Original strand, 7598577 - 7598754
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 267  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7598577 gatggactcacacttgagagggagtgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 7598676  T
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 353  Q
    ||||||||        |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7598677 acccataa--------ccttaacgtttttggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcatcgatgtggacgg 7598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35580881 - 35580726
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580881 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacaataaatgttgaacaccttataagtgagaggacc-ataaacccattgccttaaggttttgggt 35580783  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580782 aagagtgcggcgtctctcttgtttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 35580726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 218 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36178311 - 36178173
Alignment:
Q  218 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36178311 gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagggaacccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgcctctc 36178212  T
Q  318 ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  36178211 ttgcttgtgtggttgttatagcctcgatgtagacggtcc 36178173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 36006035 - 36005887
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36006035 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaa-agtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa 36005937  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 351  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36005936 aagtgtggcgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggac 36005887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 6712978 - 6713133
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggta 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  6712978 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgctttaaggtttttgggta 6713077  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6713078 agagtgtgatgtctctcttgcttatgggattgttctagcctcgatgtggacggtcc 6713133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38796778 - 38796620
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38796778 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatctgataaaacaataaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggt 38796679  T
Q  300 aagag--tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38796678 aagagtatgtggcgtctctattgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgtcgacggtcc 38796620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Original strand, 40733482 - 40733673
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40733482 tgatagactcacacttgaggggaagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtaag 40733581  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||    
T  40733582 aggacccataaacctacaaccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctctcgcttgtgtggtagttcaagtctcgatgtggatggtcc 40733673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 205 - 356
Target Start/End: Original strand, 33731653 - 33731804
Alignment:
Q  205 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 304  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33731653 gtgtgagttatatatctcacatcggataaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggatccataaacctattgccttaaggttttgggtaagag 33731752  T
Q  305 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  33731753 tatggtgtctctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtaaacggtcc 33731804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Original strand, 40733848 - 40734038
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||    
T  40733848 tgatggactcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaagatttaacaccttataagtaag 40733947  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||| | ||||| || |  ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  40733948 agggctcataa-cctacagccttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctgtctcgcttgtgtggttgttcaagtctcgatgtggacggtcc 40734038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 37632755 - 37632602
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37632755 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggtttgacattttataagtaagaggacccataaacccataactttaaggttttgggt 37632656  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 353  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37632655 aagagtgtggtgtatctcttacaagtgtgattgttctagcctcgatgtggacgg 37632602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 192 - 348
Target Start/End: Original strand, 1769884 - 1770040
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || || | |    
T  1769884 tgttggtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggactcataaactcatagctttgaag 1769983  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1769984 ctttgaataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtg 1770040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 204 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28254391 - 28254258
Alignment:
Q  204 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 303  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28254391 agtgtgacttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaaga 28254292  T
Q  304 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 339  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  28254291 gtgtggtgtctctct--cttgtggggttgttctagc 28254258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 211 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40163520 - 40163383
Alignment:
Q  211 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttgggtaagagtgtgg 309  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  40163520 gttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccattaacctagtgtctttaaggttttgggtaaaagtgtgg 40163421  T
Q  310 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40163420 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctaacctcgatgt 40163383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 213 - 355
Target Start/End: Original strand, 23346250 - 23346391
Alignment:
Q  213 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    |||||||| ||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23346250 tatatgtctcacatcgtatagaaaagtaaaggttaaacaccttataa-taagagggcccataaacccatagccttaaggttttcggtaagagtgtgatgt 23346348  T
Q  313 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  23346349 ctctcttgcttgtgcggttgttctagcctagatgtggacggtc 23346391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 7598228 - 7598384
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7598228 tgcaagtgtgaattatatgttctacatcgaatagaaaagtaaaggttcaacaccttataaataagaggacccataaactcatagccttaaggttttgggt 7598327  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| | ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7598328 aagaatatggtgtctctctcacttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcc 7598384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 202 - 344
Target Start/End: Original strand, 5367457 - 5367599
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  5367457 caagtgtgatatatatgtcccagatcggataaaagagcaaaggttgaacaccttataagtaagatgatccatgaacacataaccttaaggttttgggtaa 5367556  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 344  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5367557 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcga 5367599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 31468926 - 31468800
Alignment:
Q  180 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 277  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||||||||||    
T  31468926 cttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaatatctta----taagaggacccataaac 31468831  T
Q  278 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468830 tcattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 31468800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 168 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 38796410 - 38796298
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38796410 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaaga 38796311  T
Q  266 ggacccataaacc 278  Q
    ||||| |||||||    
T  38796310 ggacctataaacc 38796298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 356
Target Start/End: Original strand, 3673003 - 3673224
Alignment:
Q  120 atacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaag-gggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttata 216  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| | | || |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||    
T  3673003 atacatgcaaagt-aaaagcttccgcttgaagagggagcatgatgaattgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttata 3673101  T
Q  217 tgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 316  Q
    |||||||||| |||||||||                 ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  3673102 tgtcccacattggataaaat-----------------ttataagtaagaggatccataaactcattgctttaagattttggctaagagtgtgatgtctct 3673184  T
Q  317 cttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3673185 cttactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3673224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 307
Target Start/End: Original strand, 16542449 - 16542556
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||    
T  16542449 tgcaagtgtgagttataagtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataagaggacttataaactcattgccttaagattttgagt 16542548  T
Q  300 aagagtgt 307  Q
    ||||||||    
T  16542549 aagagtgt 16542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 262 - 356
Target Start/End: Original strand, 6421793 - 6421887
Alignment:
Q  262 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6421793 aagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttctggcctcgatgtggacggtcc 6421887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 208 - 356
Target Start/End: Original strand, 29676543 - 29676685
Alignment:
Q  208 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 307  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||      ||||||||||||||    
T  29676543 tgagttatatgtctcacattggataaaagagtaaagattgaacacattataagtgagagaacccataaactcattgcctt------ttgggtaagagtgt 29676636  T
Q  308 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  29676637 ggtgtctctcttgcttgtggggttattcaaacctcgatgtggacggtcc 29676685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12529186 - 12529038
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |    
T  12529186 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcaaataaaacagtaaagattgaacaccgtataagtaagaggactcataaactcattgccttaaagttttagat 12529087  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    ||||  || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||    
T  12529086 aagaacgtagtgtctctcttgtttgtgcggttgttctaacctcaatgtg 12529038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 137 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36785786 - 36785664
Alignment:
Q  137 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 234  Q
    ||||||||||  | |||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785786 agcttccgcttgagggggagcatgatgaattgatggactcacactttagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 36785687  T
Q  235 atagtaaaggttgaacaccttat 257  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  36785686 atagtaaaggttgaacaccttat 36785664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 170 - 341
Target Start/End: Original strand, 30313147 - 30313318
Alignment:
Q  170 tggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 267  Q
    ||||||||||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||||    
T  30313147 tggactcacacttgaggggaagattgttg-tgtgcaagcgtgtgttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgaacac-ttataagtgagagg 30313244  T
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 341  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  30313245 acccaaaaactcattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctctcacttgtgtggttgctctggcct 30313318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 167 - 317
Target Start/End: Original strand, 30323430 - 30323581
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| || | |  ||||||||||| ||| |||| ||    
T  30323430 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagtgtgtgttatatgtcccaaatcagatagaaaattggaggttgaacactttagaagtgag 30323528  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 317  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30323529 aggacctataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctc 30323581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 203 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31899581 - 31899496
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31899581 aagtgtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgcctta 31899496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33561641 - 33561491
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||  ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  33561641 tgatggacacgcacttgatggggaatgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgttccacatcagatagaaaagtggaggttaaacactttataagtgagag 33561543  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33561542 gacccataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtgatatctctct 33561491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 351
Target Start/End: Original strand, 16590888 - 16591034
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata-gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |    
T  16590888 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaaagtaaaggttgaaca------aagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttaag 16590981  T
Q  299 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 351  Q
    ||||| | |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16590982 taagaatctaatgtctctcttacttgtggggttgttctagcctcaatgtggac 16591034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 29873729 - 29873563
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| ||| |||| |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||  ||||||||  |    
T  29873729 tgatggactcacacttgagggggagattgttg-tgtgcaagggtgtgttacatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacattttataagtggg 29873631  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 332  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  29873630 aggactcataaactcattgccttaaggttttgagtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgtggttg 29873563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37895211 - 37895107
Alignment:
Q  208 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37895211 tgagttatatgtcccacatcggatagaaaaataaaagttgaaaaccttaaaagtaaaagaacacataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 37895112  T
Q  308 ggtgt 312  Q
    |||||    
T  37895111 ggtgt 37895107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 272 - 354
Target Start/End: Original strand, 3672773 - 3672855
Alignment:
Q  272 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3672773 ataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgtctctcttaattgtgtggttgttctagtctcgatgtggacggt 3672855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 29874179 - 29874025
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29874179 caagtgtgtgttatatgtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactttataattgggaggacccataaacccattgccttaaggttttggataa 29874080  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||| |||| ||   |||||| ||||| | | |||| ||||||| ||||||    
T  29874079 gagtgtggcgtctatcccacttgtgcggttgctttggcctggatgtgggcggtcc 29874025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 203 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31259774 - 31259658
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatc---ggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  31259774 aagtgcgagttatatgtctcacatcatcggataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagatgacccataaacctatcaccttaaggttttgggt 31259675  T
Q  300 aagagtgtggtgtctct 316  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259674 aagagtgtggtatctct 31259658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 37894881 - 37894732
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 267  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||| | || ||||||||||||||| |    
T  37894881 gatggactcatacttaagggggagtattg-tgtgcaaatgtgagttatatgtcccacattgaatagaaaagtaaaggctaaaaaccttataagtaagaag 37894783  T
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    || |||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||    
T  37894782 actcataaatccattgccttaagattttggttaaaagtgtggtgtgtctct 37894732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 6421688 - 6421780
Alignment:
Q  262 aagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6421688 aagaggacccataaacctattgactaaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctaacttgtgtggttgttccggcctcgatgtggacggt 6421780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 253 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 36784365 - 36784273
Alignment:
Q  253 cttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  36784365 cttataagtaagatgacccataaaccctttgtcttaaggttttggataaaagtgttgtgtctctcttgcttgtgtggttattcaagcctcgat 36784273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 181 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33953947 - 33953821
Alignment:
Q  181 ttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 280  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||| |||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||      
T  33953947 ttgagggggagtgttg-tgtgcaaatgtgagttataagtcccacatcagatagaaaagtggaggttgaacactatataagtgagaggacccataaacctg 33953849  T
Q  281 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||    
T  33953848 ttgccttaaaattttgggtaagagtgtg 33953821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41678559 - 41678419
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| || ||   ||||| ||||| |||||||| ||    
T  41678559 tgatggactcacacttgaaggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatatgtctcacatcagatagaaaaggggaggttaaacactttataagtgag 41678461  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 307  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  41678460 aggacccataaa-cctttgccttaaggttttgagtaagagtgt 41678419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 201 - 331
Target Start/End: Original strand, 31385738 - 31385868
Alignment:
Q  201 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 300  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||||| || || | |  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31385738 gcaagtgtgagttagaagtctgacatcggttagaaaaatggaggttgagcaccttataagtgaaaggacccataaacccattgccttaaggttttgggaa 31385837  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggtt 331  Q
      |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  31385838 taagtgtggtgtctctttcacttgtgtggtt 31385868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 352
Target Start/End: Original strand, 9231252 - 9231401
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  9231252 aagtatgagttatatgtctcatatcagatagaaaagtaaaggttgaacatattataaataagaggatccatcaacccaccgccttaaagttttggttaag 9231351  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    ||||| || |||||||  ||| || |||| ||||| ||| ||||||||||    
T  9231352 agtgtagtatctctctaacttatgcggttattctaaccttgatgtggacg 9231401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 216 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 28254254 - 28254165
Alignment:
Q  216 atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 305  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||    
T  28254254 atgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaacactttgccttaaagtttagggtaagagt 28254165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 262
Target Start/End: Original strand, 42514981 - 42515078
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatg----tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagta 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||    
T  42514981 gatggactcacatttgagggggagtgttg-tgtgcaggtgtgagttatatgtatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacaccttataagta 42515078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 203 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3594333 - 3594180
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    ||||||||||| |||||  |||| || ||| || |||  |||| |||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  3594333 aagtgtgagttgtatgtttcacaacgaatagaaaagtggaggtcgaacactttataagtgataggatccataaacacattgctttaagattttgagtaag 3594234  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||| | |||||| | || ||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  3594233 agtgtgatatctctcatactagtgtgtttattctaacctcgatgtgaacggtcc 3594180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 264 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 35580534 - 35580443
Alignment:
Q  264 gaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta--agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| | | | |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  35580534 gaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagagtgtggcgtctctc-tccctatgtgattgttttagcctcgatgtggacggt 35580443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 307
Target Start/End: Original strand, 12910231 - 12910335
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||||||| | | |||  |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  12910231 aagtttgagttatatgttccacatcggatggaaaagtacaggttgaaccccttataagtgaaatgacttataaattcattgtcttaaggttttgggtaag 12910330  T
Q  303 agtgt 307  Q
    |||||    
T  12910331 agtgt 12910335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31899170 - 31899104
Alignment:
Q  290 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  31899170 ggttttgggtaagagtgaggtatctctcttgcttgtggggttcttctaacctcgatgtgaacggtcc 31899104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 248
Target Start/End: Original strand, 6421306 - 6421352
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6421306 caagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttga 6421352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 33954419 - 33954279
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||| ||||   ||||| | | | ||| |||||| | | ||||||| | ||||||||    
T  33954419 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttaaacattatataacttaaatgactcataaatcta-tgccttacgattttgggt 33954321  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 341  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| | |||||||||| ||||    
T  33954320 aagagtgtggcgtctctctcacttatatggttgttctggcct 33954279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 318
Target Start/End: Original strand, 30312831 - 30312907
Alignment:
Q  242 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  30312831 aggttgaacactttataacttagatgacccataaacttatttccttaaggttttgggtaaaagtgtgtagtctctct 30312907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 36178581 - 36178513
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaa 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  | ||||| ||||||||||||| ||||    
T  36178581 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccaaggccaccggtcagttgcgcagaaagcagcaa 36178513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25390372 - 25390313
Alignment:
Q  254 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc 313  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25390372 ttataactaagaagacccataaacctattgtcttaaggttttgggtagaagtgtggtgtc 25390313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Original strand, 28226404 - 28226455
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226404 gacccataaacacattgtcttagggttttaggtaagagtgtggtgtctctct 28226455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 299
Target Start/End: Original strand, 2336666 - 2336723
Alignment:
Q  242 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| ||||||||    
T  2336666 aggttgaacactttataagtgagaggacccataaattcaatgccttaagattttgggt 2336723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 318
Target Start/End: Original strand, 8904498 - 8904546
Alignment:
Q  270 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8904498 ccataaaccaattgccatatggttttgggtaaaagtgtggtgtctctct 8904546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Original strand, 37106107 - 37106147
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggc 50  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  37106107 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgactgaggc 37106147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 318
Target Start/End: Original strand, 28226726 - 28226772
Alignment:
Q  271 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28226726 cataaacccattgtctta-ggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 28226772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Original strand, 7598409 - 7598491
Alignment:
Q  8 actggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggt-cattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 89  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  7598409 actggtatcaaagcccaggttcgacgaagggtacgactgaggtagccggtccgttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaag 7598491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 222
Target Start/End: Original strand, 40734243 - 40734300
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgt--tggtttgcaagtgtgagttatatgtccc 222  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  | || | |||||||||||||||||||||    
T  40734243 tgatggaatcacacttgagggggagtgttattgtgtacaagtgtgagttatatgtccc 40734300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13792585 - 13792536
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 316  Q
    ||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13792585 gacccgtacacccattgacttgaggttttgggtaagagtgtgatgtctct 13792536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 200 - 236
Target Start/End: Original strand, 3672719 - 3672755
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 236  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672719 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcgaataaaat 3672755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 35580699 - 35580671
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaaggg 38  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580699 tggtatcagagccccggttcgacgaaggg 35580671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 84)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Original strand, 6500634 - 6500978
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgc 109  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||     
T  6500634 tggtatcagagttccggttcgacgaagggtgcaaccgaggcagccagtcgttgcgcagaaagccgcaacggcggtataagcagcaagtggctccttatgt 6500733  T
Q  110 aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 208  Q
    ||||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||  |||||| |||| | | ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6500734 aggaacgccgatacag-caaagt-aagagcttccccttgaagggggagcatgatgaatagatggactcacacttgatggggagtgttggtttgcaagtgt 6500831  T
Q  209 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6500832 gagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataaataaaaggacccataaactcattgccttaaggttttggataagagtgtg 6500930  T
Q  309 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6500931 gtgtctctcttacttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcc 6500978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 108 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3295266 - 3295017
Alignment:
Q  108 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg----gtttgca 203  Q
    |||| |||||||||||| |||| || || ||||||||||  | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    || ||||    
T  3295266 gcagcaacggcgatacaagcaa-gt-aagagcttccgcttaagggggagcacgaaaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgtgca 3295169  T
Q  204 agtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaaga 303  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  3295168 agtgtgagt-atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaagacccataaacccattgccttgaggttttgggtatga 3295070  T
Q  304 gtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  3295069 gtgtggtgtctctcttggttgtgtggttgttgtagcctcgatgtggacagtcc 3295017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Original strand, 6500443 - 6500606
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6500443 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctttaaacccattgccttaagg 6500541  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500542 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 6500606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40296473 - 40296317
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40296473 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagaaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttgaggttttgggt 40296374  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296373 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 40296317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 137 - 354
Target Start/End: Original strand, 624134 - 624350
Alignment:
Q  137 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat 236  Q
    ||||||||||  |||||||||| | | ||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  624134 agcttccgcttaaaggggagcatgatgaatagatgga-tcacacttgaggggaagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgtataaaat 624232  T
Q  237 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 336  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  624233 agtaaaggttgaacacgttataagtaagatgacccataaacccatagccttgaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttct 624332  T
Q  337 agcctcgatgtggacggt 354  Q
    ||||||||||||||||||    
T  624333 agcctcgatgtggacggt 624350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 192 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 18603286 - 18603124
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603286 tgttagttttcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 18603187  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18603186 ttttgggtaagagtgtggcatctctcttgcttgtgtggtagttctagcctcgatgtggacggt 18603124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27502202 - 27502038
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27502202 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttaaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaga 27502103  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27502102 tttttggtaaaagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctatcctcgatgtggacggtcc 27502038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Original strand, 32487386 - 32487549
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487386 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct-ataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 32487484  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32487485 ttttgggtaagagtgtgacgtatctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggatggtcc 32487549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 197 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36492378 - 36492219
Alignment:
Q  197 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||    
T  36492378 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccaataaacacattacctttaggttttg 36492279  T
Q  297 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492278 gataagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 36492219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 193 - 356
Target Start/End: Original strand, 41170627 - 41170790
Alignment:
Q  193 gttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 292  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41170627 gttggtttgtaattgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggt 41170726  T
Q  293 tttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41170727 tttgggtaagagtgtggtgtttttcttgcttgtgtggttgttctagcctcggtgtagacggtcc 41170790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 168 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13415951 - 13415774
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415951 gatggactcacacttgagggg-agtgctgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaattagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 13415853  T
Q  266 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 344  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13415852 ggacccataaacctattaccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcga 13415774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 167 - 349
Target Start/End: Original strand, 26074577 - 26074761
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074577 tgatggactcacacttgagggggagtgtttttgtgtacaagtgtgagttatatgttccatatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaag 26074676  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  26074677 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 15370099 - 15370255
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  15370099 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaatccacagccttaaggttttgggt 15370198  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15370199 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggattgttctagcctcgatgtggacggtcc 15370255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 203 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3295498 - 3295347
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3295498 aagtgtgagt-atatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccaattgccttaaggtttt-ggtaag 3295401  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3295400 agtgtgttgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 3295347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 173 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 26074330 - 26074155
Alignment:
Q  173 actcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 272  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26074330 actcacacttgagggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcggataaaaaagtaaaggttgaacacctcatatgtaagaggaccca 26074232  T
Q  273 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||| |||||||||||    
T  26074231 tgaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgctctaacctcgatgtgg 26074155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 203 - 356
Target Start/End: Original strand, 25327938 - 25328091
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  25327938 aagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaacagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaatgccttaaggttttgggtaag 25328037  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25328038 agtgtggtgtctctcttgcaagtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 25328091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 191 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 9498821 - 9498657
Alignment:
Q  191 gtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 290  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9498821 gtgttggtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatcagatagaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag 9498722  T
Q  291 gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| |||||||||||||    
T  9498721 attttgggtaagagtgtggtgtctctcttgtttatgt-gctggtctagcctcaatgtggacggtcc 9498657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 41632782 - 41632938
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  41632782 tgcaagtgtaagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccaatgctttaagattttgggt 41632881  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  41632882 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagtctcgatgtggacggtcc 41632938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 42405752 - 42405600
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  42405752 caagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttacaagtaaaaggactcataaacctaatgccttaaggttttgggtaa 42405653  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42405652 gagtgtggtgt--ctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 42405600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 207 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 11417128 - 11416979
Alignment:
Q  207 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11417128 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgtgtaagagtg 11417029  T
Q  307 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    || | ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||    
T  11417028 tgatctctctcttgcttgtgggattgttctagcttcgatgtggatggtcc 11416979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 210 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 34753173 - 34753029
Alignment:
Q  210 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 309  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34753173 agttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtaagaagacccataaaccgattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 34753074  T
Q  310 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34753073 cgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggt 34753029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 201 - 356
Target Start/End: Original strand, 299490 - 299645
Alignment:
Q  201 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  299490 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgacccataaactcatagccttaaggttttgtgta 299589  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  299590 agagtgtggcgtctctattgcttgtacggttgttctagcatcgatgtggacagtcc 299645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26075318 - 26075168
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-a 300  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26075318 caagtgtgatttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 26075219  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 351  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26075218 agagtgtgtcgtctctcttgcaagtgtggttgttttagcctcgatgtggac 26075168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 12662810 - 12662654
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12662810 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacattttataagtaagaaaacccataaatccattgtcttaagtttttgggt 12662711  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  12662710 aagagtgtggtgcctttcttgcttgtggggttcttctagcctcgatgtggtcggtcc 12662654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1028673 - 1028519
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  1028673 caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggatgaacactttataagtaagaggacccataaacctataaccttaaggtttttggtaa 1028574  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028573 gagtgtggcgtctctctcacttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 1028519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 6224198 - 6224352
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  6224198 caagtgtgagttatatgtcccacttcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcatcgccttaaggtttttggtaa 6224297  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  6224298 gagtgtggtgcctcagttgcttgtgcggttggtctagcctcaatatggacggtcc 6224352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 24489394 - 24489208
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||| |||||||||| |||||||     
T  24489394 tgatggactcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagaaaaggttaaacaccttattagtaaga- 24489297  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24489296 -acccataaacccattgccttaagattttgcgtaagagtgtggcgtctcttttacttgtgcggttgttctagtctcgatgtgggcggtcc 24489208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 167 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 26074975 - 26074807
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |    
T  26074975 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacacaatataagtagg 26074876  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggt-aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 332  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  26074875 aggacccataaacctattgtcttaaggttttgggtaaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttg 26074807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36568725 - 36568571
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36568725 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttgaacaccttataagtgagatgacccgtaaacccattgccttaaggtttttggt 36568626  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36568625 aagagtgtggcgtctctct--cttgtgtggttgttctatcctcgatgtggaaggtcc 36568571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 35150007 - 35150162
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35150007 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtcaaggttgaacaccttataagtaaga-gacccataaatccattgtcttaaggttttgggt 35150105  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    || ||||||||||||||||  || |||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  35150106 aaaagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcaatgtggaccgtcc 35150162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Original strand, 623810 - 623974
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||  || |||||||||    
T  623810 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatataatagtaaaggttgaacactttacaagtaagttgagccataaacttatagccttaagg 623909  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  623910 ttttgagtaagagtgtggtgtctctctcacttgtggggttgttctagcctcaatgtagacggtcc 623974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 226 - 356
Target Start/End: Original strand, 15370428 - 15370558
Alignment:
Q  226 tcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 325  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  15370428 tcggatgaaacagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccatagccttaaggttttgcgtaagagtgtggcgtctctcttgtttgt 15370527  T
Q  326 gtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370528 ggggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 15370558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 212 - 354
Target Start/End: Original strand, 33747783 - 33747925
Alignment:
Q  212 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  33747783 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaatactttataagtaagaggatccataaactcattgccttaagattttggataagagtgtggtg 33747882  T
Q  312 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33747883 tctctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacggt 33747925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 197 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29549416 - 29549278
Alignment:
Q  197 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29549416 gtttgcaagtgtgagttatatgttccatatcagataaaatagtaaaggatgaacaccatataagtaagaagacccataaacacattaccttaaggttttg 29549317  T
Q  297 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 335  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29549316 gataagagtgtggcgtctctcttgcttatgtggttgttc 29549278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 192 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 5723957 - 5723811
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||   |||| |||||||    
T  5723957 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaataataaaagttgaacacattatatgtaagagaacccattaatttattgtcttaagg 5723858  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 338  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5723857 ttttgggaaagagtatagtgtctctcttgcttgtgcggttgttctag 5723811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 168 - 350
Target Start/End: Original strand, 38427525 - 38427697
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  38427525 gatggactcacacttgagggggagtgttg---------tgtgagttatatgtcccacattggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagta-gagg 38427614  T
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  38427615 acccattaatccattgtcttaaggttttgtgtaagagtgtgacgtctctctcacttgtgcggttgttctaacctcgatgtgga 38427697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 200 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26591068 - 26590918
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||| |||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||    
T  26591068 tgcaagtgtgatttaaatgttccatatcgaatcgaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaattcaatgccttaaggttttgagt 26590969  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    |||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  26590968 aagagtgtggcgtctctctcactagtgtggttgttctaacctcgatgtgga 26590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 300961 - 301107
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||        || ||||||||||||| |||| |||||    
T  300961 caagtgtgggttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaataccttataagtaagag--------aatccattgccttaagatttttggtaa 301052  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| |||||||    
T  301053 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggctgttcaagtctcgacgtgaacggtcc 301107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36522086 - 36521922
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||  |||||||||||  | ||| | ||||    
T  36522086 tgatggactcacacttgagggagagtgttg-tgcgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagttgaggttgaacactctttaaatgagag 36521988  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||   |||||||||||    
T  36521987 gacccataaaccaattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtcatctctctcatttgtgtggttg 36521922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 35167994 - 35167840
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||| |||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||    
T  35167994 caagtatgagttatgtatctcacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaggatgacccataaatctattgccttgatgtttttggtaa 35167895  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||| ||||||||   || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35167894 gagtgtgatgtctctcacactagtgtggttgttctagcatcgatgtggactgtcc 35167840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 9498629 - 9498496
Alignment:
Q  11 ggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgca 110  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9498629 ggtatcagagccccg-ttcgacaaagggtacgaccgaggcagccggtcgttgcgcagaaagctgcaacggcgctacaagcagcaagtggctccttgtgca 9498531  T
Q  111 ggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgct 146  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  9498530 ggaacggtgatacatgcaaagt-aagagcttccgct 9498496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 203 - 356
Target Start/End: Original strand, 2411010 - 2411163
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  2411010 aagtgtgagttatatgtcctacattggatagagaagtaaaagttgaacatcttgtaagtaagagaacccataaacttattgccttaaggttttgagtaag 2411109  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||| || ||||| || ||||  || |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  2411110 agtgtagtttctctattacttgaatgattgttctaacctcgatatggacggtcc 2411163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36522427 - 36522277
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |  | ||||||||  |||||||| ||||    
T  36522427 tgatggatttacaattgagggggagtgttg-tatgaaagtgtgagttatatgtctcacattggatagaaaaatggaagttgaacattttataagtgagag 36522329  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36522328 gaccaataaacccattatcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 36522277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 203 - 356
Target Start/End: Original strand, 35914852 - 35915005
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||  | |||| ||||    
T  35914852 aagtatgagttatatgtcacacatcggataaaagagtaaaggttgaacattttataagtaagaagacccgtaaatccattgccctaaattattggataag 35914951  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    | |||||| |||||||||||| | || ||| || | |||| |||||||||||||    
T  35914952 aatgtggtatctctcttgcttatatgattggtcaaacctcaatgtggacggtcc 35915005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 275
Target Start/End: Original strand, 7768842 - 7768925
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataa 275  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768842 tgttggttttcaagtgtgagttatatatcctacatcggataaaataataaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataa 7768925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 318
Target Start/End: Original strand, 31509589 - 31509742
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggag--tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||    
T  31509589 tgatggactcacacttgagggagagattgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgag 31509687  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  31509688 aggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtagtgtctctct 31509742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 202 - 295
Target Start/End: Original strand, 42508614 - 42508707
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 295  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42508614 caagtgtgaattatatatcccacatcggatagaaaagtaaaggttaaacatctaataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggtttt 42508707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 202 - 280
Target Start/End: Original strand, 26074320 - 26074398
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074320 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaactaaagattgaacaccttataagtaagaggacccataaaccca 26074398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26900089 - 26900019
Alignment:
Q  286 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26900089 ttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgggtttgttctagccttgatgtggacggtcc 26900019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 203 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41635346 - 41635212
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    |||| ||||||||||||  | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||  |||| ||||||    
T  41635346 aagtatgagttatatgtttcccatcagataaaagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggatccataaatccattgtcttaaaattttaggtaag 41635247  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 337  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  41635246 agtgtagtatctcttttacttgtatggttgctcta 41635212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 95
Target Start/End: Original strand, 32487575 - 32487661
Alignment:
Q  9 ctggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaa 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32487575 ctggtatcagagccccgattcgacgaagggtgcgactgaggcagccgatcgttgtgcagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaa 32487661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 325
Target Start/End: Original strand, 31509745 - 31509857
Alignment:
Q  214 atatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||  ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||    
T  31509745 atatgtctcacatcggatagaaaagtggaggttgagcactttataagtgagaggactcataaactcattgccttgaggttttttggtaagaatgtggtgt 31509844  T
Q  313 ctctcttgcttgt 325  Q
    |||||| ||||||    
T  31509845 ctctctcgcttgt 31509857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Original strand, 13042606 - 13042657
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13042606 gacccataaacccattgccttaaggttttggataagagtgtggtgtctctct 13042657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13786157 - 13786003
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 300  Q
    ||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||| |||||| ||    
T  13786157 caagtgtgagtaattatgtttcacatcggataaaa-agtgatggttgaacactttataagtaagatgacccgtaaatctattgtcttaagattttggata 13786059  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||| |||||||||  ||  | || ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  13786058 agagtgtgatgtctctctcactattatgattgttctggcctcgttgtcgacggtcc 13786003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 281
Target Start/End: Original strand, 39309686 - 39309764
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccat 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39309686 caagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagggtaaatgttgaacacattataaataagagga-ccataaacccat 39309764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 287 - 356
Target Start/End: Original strand, 38427306 - 38427375
Alignment:
Q  287 taaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  38427306 taagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgttctaacctcgatgttggcggtcc 38427375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 284 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 795306 - 795254
Alignment:
Q  284 ccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 336  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  795306 ccttaaggttttaggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttct 795254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 271 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9498410 - 9498343
Alignment:
Q  271 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 338  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  9498410 cataaacccattgccttaagcatttgagtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttctag 9498343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 257 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36527196 - 36527117
Alignment:
Q  257 taagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttct 336  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||    
T  36527196 taagtgagaggatccataaacgcattgccttaagattttggataagagtgtgctgtctctctcacttgtgtggctgttct 36527117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 13785732 - 13785634
Alignment:
Q  258 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13785732 aagtaataggatctataaacccataaccttaaggttttaagtaaaagtgtggtgtttctctcgtttgtatggttgttctaacttcgatgtggacggtcc 13785634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 295
Target Start/End: Original strand, 42524719 - 42524811
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 295  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||| || ||||||||    
T  42524719 caagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaa-gttgaacatcttatgaataagaggactcataaatccattgtctgaaggtttt 42524811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 318
Target Start/End: Original strand, 32445943 - 32446003
Alignment:
Q  258 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  32445943 aagtgagaggacccataaacccaacgccttaaggttttgggttaaagtgtggtgtctctct 32446003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 314
Target Start/End: Original strand, 13112604 - 13112651
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 314  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13112604 gacccataaacccattgtcttaaggttttggataagagtgtggtgtct 13112651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13785794 - 13785732
Alignment:
Q  172 gactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaa 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13785794 gactcacatttgagggggagtgttg-tgtggaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaa 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 260
Target Start/End: Original strand, 6225047 - 6225104
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 260  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6225047 aagtctgagttatatatcccacatcagataaaagaataaaggttgaacaccttataag 6225104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 240
Target Start/End: Original strand, 5660290 - 5660338
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagta 240  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  5660290 tgttggtttgcaaatgtgagttatatgttccacatcgaataaaatagta 5660338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 237 - 325
Target Start/End: Original strand, 19275566 - 19275653
Alignment:
Q  237 agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 325  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||    
T  19275566 agtagaggttgaacac-ttataaggaagaagacccataaattcattgtcttaagattttgggtaagattgtggcgtctgtctcgcttgt 19275653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 318
Target Start/End: Original strand, 13042784 - 13042822
Alignment:
Q  280 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13042784 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13042822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 318
Target Start/End: Original strand, 13112782 - 13112820
Alignment:
Q  280 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13112782 attgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctct 13112820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 242
Target Start/End: Original strand, 35150747 - 35150789
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35150747 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35150789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 242
Target Start/End: Original strand, 35151038 - 35151080
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaa 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  35151038 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaa 35151080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 356
Target Start/End: Original strand, 42435486 - 42435583
Alignment:
Q  258 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42435486 aagtaagaggatccataatct-attaccttaaggttttgaatcagagtgtgatgtctctctcataagtgtggttgttctagcatcgatgtggacggtcc 42435583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 86 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 795249 - 795196
Alignment:
Q  86 caagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagc 139  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  795249 caagcagcaagtggctccttgtgcagcaacggtgatacagacaaagtaaaaagc 795196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 354
Target Start/End: Original strand, 24489583 - 24489635
Alignment:
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| || |||||    
T  24489583 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctaacctcgatatgaacggt 24489635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 212
Target Start/End: Original strand, 15370380 - 15370426
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  15370380 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagt 15370426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36389067 - 36389016
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  36389067 gacccataaactcagtgccttagggttttgggtcagagtgtggtgtttctct 36389016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 312
Target Start/End: Original strand, 5963765 - 5963795
Alignment:
Q  282 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963765 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 5963795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9510624 - 9510546
Alignment:
Q  254 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 332  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||| | | | ||||||||||| ||||||||||||    
T  9510624 ttataagtgagaggagccataaacctaatgccttaaaattttaggtaaaaatatagtgtctctcttacttgtgtggttg 9510546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22299014 - 22298956
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggat-aaaatagtaaaggttgaa 249  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  22299014 tgttggtttgcatgtgtgggttatatgtctcacatcagataaaaataataaaggttgaa 22298956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 795189 - 795152
Alignment:
Q  298 gtaagagtgtggtgtctctcttgc-ttgtgtggttgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  795189 gtaagagtgtggtgtctctcttgctttgtgtggttgtt 795152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 354
Target Start/End: Original strand, 5660340 - 5660405
Alignment:
Q  290 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc-gatgtggacggt 354  Q
    |||||||| ||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5660340 ggttttggataaaagtatggtgtttttcttgtttgtgtggttgttctagcctcaaatgtggacggt 5660405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 26075133 - 26075058
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggt 84  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||    
T  26075133 tggtatcagagcctcg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtctgtttgcgcagaaagcagcaacggcggt 26075058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 312
Target Start/End: Original strand, 34103625 - 34103666
Alignment:
Q  271 cataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  34103625 cataaactcattgccttaaggttttgaataagagtgtggtgt 34103666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 312
Target Start/End: Original strand, 41341523 - 41341567
Alignment:
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  41341523 acccatacactcattgccttaaggtttttggtaagaatgtggtgt 41341567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 75)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Original strand, 14681323 - 14681663
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagg 112  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  14681323 tatcagagccccggttggatgaagggtgcgaccgaggcagccggttgttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaaacagcaaatggctccttatgcagg 14681422  T
Q  113 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg--agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 210  Q
    || ||||||||| ||||||| || ||||||||||  ||||||  |||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14681423 aa-ggcgatacatgcaaagt-aagagcttccgcttgaaggggggagcatgatgaatagatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtaa 14681520  T
Q  211 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 310  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14681521 gttatatgtcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagagggcccataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggt 14681620  T
Q  311 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    |||||||   |  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14681621 gtctctca--caagtgtggttgttctagccttgatgtggacggtc 14681663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37533339 - 37533013
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||| |||||                 
T  37533339 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcagcaacgacggtacaagcagcaa------------- 37533253  T
Q  109 caggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 208  Q
          ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533252 ------cggcgatacagacaaagtaaaaagcttccgctcta-ggggaacacgttaaagtgatggactcacgcttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 37533160  T
Q  209 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37533159 gagttatatgtcccacattggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaa-agtgtg 37533061  T
Q  309 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  37533060 gtgtctctcttgcttgtgcgcttgttctaacctcgatgtggacggtcc 37533013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 22567013 - 22566702
Alignment:
Q  10 tggtatcagagcccc-ggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgt 107  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||  | ||| | ||| ||||||| | ||||   ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22567013 tggtatcagagcccccggtccgacgaagggtacgaccaaggccaccggttagttgtgcagaaaacagcaaagacggtacaagaagcaagtggctccttgt 22566914  T
Q  108 gcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaag 205  Q
    |||| |||| | ||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||    
T  22566913 gcagcaacgacaatacaagcaa-gtaaaaagcttccgctctggggggagcacgataaagtgatagactaacatttgagggggagtgttgttgtatgcaag 22566815  T
Q  206 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 305  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22566814 tgtgagtaatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 22566715  T
Q  306 gtggtgtctctctt 319  Q
    |||| |||||||||    
T  22566714 gtgg-gtctctctt 22566702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 113 - 329
Target Start/End: Original strand, 7553937 - 7554154
Alignment:
Q  113 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtga 210  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  7553937 aacggcgacacatgcaaagt-aagagcttccgcttgagggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtga 7554035  T
Q  211 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554036 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatccataaacccatagccttaaggttttgggtaagagtgtggt 7554135  T
Q  311 gtctctcttgcttgtgtgg 329  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  7554136 gtctctctcgcttgtgtgg 7554154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1085774 - 1085618
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085774 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacactttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 1085675  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085674 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 1085618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 168 - 356
Target Start/End: Original strand, 30244236 - 30244426
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30244236 gatgaactcacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaagaccttataagtaaga 30244335  T
Q  266 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30244336 ggactcataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcc 30244426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 200 - 349
Target Start/End: Original strand, 7517580 - 7517729
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517580 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 7517679  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517680 aagagtgtggtgtctgtctcacttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 7517729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 194 - 355
Target Start/End: Original strand, 29157559 - 29157720
Alignment:
Q  194 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29157559 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacaccggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagacgacccataaatccattgccttaaggtt 29157658  T
Q  294 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  29157659 ttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctcgtgtagttgctctagtcttgatgtggacggtc 29157720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23535 - 23379
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23535 tgcaattgtgagttatatgttccacatcggatacaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctattgccttaaggttttgggt 23436  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23435 aagagtgtggtgtctctcttgcatgtgcggttgttctagcctcgatttggacggtcc 23379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37533530 - 37533366
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37533530 tgttgatttgtaagtgtgagttatatgttctacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaagg 37533431  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533430 ttttgggtaagagtgtggtgtctcttttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37533366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 168 - 356
Target Start/End: Original strand, 30245043 - 30245229
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245043 gatggactcgcacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 30245142  T
Q  266 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  30245143 cgacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggatggtcc 30245229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 207 - 356
Target Start/End: Original strand, 11845198 - 11845347
Alignment:
Q  207 gtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtg 306  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845198 gtgagttatatgttccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttggataagagtg 11845297  T
Q  307 tggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11845298 tggtgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgtagacggtcc 11845347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 6054562 - 6054716
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6054562 caagtgttagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagaggacccataaacacattgccttaaggttttgggtaa 6054661  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6054662 gagtgtggtgtctctcctacttgtatggttgttctagccttgatgtggacggtcc 6054716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 40094932 - 40094776
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40094932 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttcaacaccttataagtaagaggacccataaacccatcgtcttaaggttttgggt 40094833  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40094832 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcgatgtggtcggtcc 40094776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 200 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36939891 - 36939741
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36939891 tgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcgtataaaatagtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaatccattgccttaaggttttgggt 36939792  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgga 350  Q
    || |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36939791 aaaagtgtggtgtttctcttgcttatgcggttgttctagcctcgatgtgga 36939741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 45433243 - 45433397
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45433243 caagtgtgagttatatgatccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagaactcataaacctattgccttaagattttgggtaa 45433342  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45433343 gagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggtcggtcc 45433397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 202 - 347
Target Start/End: Original strand, 45754718 - 45754862
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45754718 caagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaatgttgaacaccttataagtaagatgactcataaacccatagccttaaggttttgggtaa 45754816  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45754817 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcaagcctcgatgt 45754862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 208 - 348
Target Start/End: Original strand, 19122740 - 19122879
Alignment:
Q  208 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 307  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19122740 tgagttatatgtcc-acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaatccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 19122838  T
Q  308 ggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19122839 ggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagtctcgatgtg 19122879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22567196 - 22567041
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22567196 tgcaagtgtgagtaatatgtcc-acatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggtttttggt 22567098  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  22567097 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcgggcctcgatgtggatggtcc 22567041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 348
Target Start/End: Original strand, 45434548 - 45434784
Alignment:
Q  113 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 211  Q
    |||||||||||| ||||    |||||||||||||  |||||| |||| | | || ||| ||||||||||||| ||||| ||  | || | ||||||| ||    
T  45434548 aacggcgatacaagcaagtaaaaaagcttccgcttgaagggggagcatgatgaattgaaggactcacacttgggggggtgttgttgtgtacaagtgtaag 45434647  T
Q  212 ttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45434648 ttatatgtcccacatcggataaaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacttactgccttaaggttttgggtaagagtgtgatg 45434747  T
Q  312 tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45434748 tctctcttacttgtggagttgttctagcctcgatgtg 45434784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 206 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34218186 - 34218036
Alignment:
Q  206 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 305  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34218186 tgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaatgttgaacaccttataagtgagaggactcataaacccattgtcttaaggttttgggtaagagt 34218087  T
Q  306 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34218086 gtggtgtctctctcgcttgtatggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 34218036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 24177435 - 24177591
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24177435 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggctgaacaccttataagtaagcggacccataaacccattgccttaaagtttttggt 24177534  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  24177535 aagagtgtggcgtctctcttgcttgtgcggttgtcttagcctcgacgtggacggtcc 24177591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 47129097 - 47129251
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||     
T  47129097 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacctcttataagtaagaggacccataaacccatcgctttaaggttttgggtag 47129196  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  47129197 gagtgtggtgtctctctcacaagtgtggttgttctagcctcaatgtagacggtcc 47129251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 118459 - 118301
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  118459 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaaggttgaacacctaataagtaagaggatccataaacccattaccgtaaggttttgggt 118360  T
Q  300 aagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  118359 aagagtgtggcgtctatctcttgcttgtgtggttgttctagctttgatgtggacggtcc 118301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8128599 - 8128451
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  8128599 tgcaagtgtgagttatatgtcccatatcggatagaaaaataaaggttgaacaccttatatgtaagaggacccataaacccataaccttaaggttttggtt 8128500  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  8128499 aagagtgtggtgtcactctcgcttatgtggttgttctagcatcgatgtg 8128451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 36622960 - 36623116
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36622960 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttaaacattttataagtaggaggatccataaatccattgccttaaggttttgggt 36623059  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    | |||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  36623060 aggagtatggtgcctctcttacttgtgtgattgttctgaccttgatgtggacggtcc 36623116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 205 - 356
Target Start/End: Original strand, 30032572 - 30032723
Alignment:
Q  205 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  30032572 gtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaagtgttgaacaccttataagtaagagtatccataaacctatagccttaaggttttgggtaagag 30032671  T
Q  305 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30032672 tgtgacatctctcttgcttgtgcggttgttctatcctcgatgtggacggtcc 30032723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 203 - 356
Target Start/End: Original strand, 9901648 - 9901799
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9901648 aagtgtgagttatatgtcc-acatcggataaaacagtaaaggttgaacatcttatacgta-gaggatccataaactcattgtcttaaggttttgggtaag 9901745  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9901746 agtgtggtgtctctcttgctagtgcggttgttctagcctcggtgtggactgtcc 9901799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 320
Target Start/End: Original strand, 16569196 - 16569316
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16569196 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16569295  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttg 320  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16569296 aagagtgcggtgtctctcttg 16569316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16596466 - 16596346
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16596466 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaacagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggt 16596367  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttg 320  Q
    ||||||| |||||||||||||    
T  16596366 aagagtgcggtgtctctcttg 16596346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 200 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40230449 - 40230295
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  40230449 tgcaagtgtaagttatatgtcccacatcgaataaaaaagtaaaagttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccatagtcttaaggttttgggt 40230350  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    || ||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||| |||||||||||    
T  40230349 aaaagtctggtgtctctcttgcaagtgtagttattctaacctctatgtggacggt 40230295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 173 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1085436 - 1085280
Alignment:
Q  173 actcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttat-atgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggac 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||    
T  1085436 actcacacttgaaggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagtttttatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacaactcataagtaagagaac 1085337  T
Q  270 ccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtg 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  1085336 ccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtttctcttccttgtg 1085280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 203 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24838857 - 24838724
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga-ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  24838857 aagtgtaagttatatgtctcacatcgaataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaaggatccataaacccgttgtcttaaggttttgggtaa 24838758  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttc 335  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24838757 gagtgtgacgtctctcttgcttgtgtggttgttc 24838724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 203 - 355
Target Start/End: Original strand, 20599317 - 20599471
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta-- 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||      
T  20599317 aagtgtgagttatatgtcccatatcggataaaaaagtaaaggataaacactttataaataagaggacatataaactcattgccttaacgttttgggtaag 20599416  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||| ||||||    
T  20599417 agagtgtggtgtctctcttgcttgtatggttgttttaaccttgatgtgaacggtc 20599471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 200 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 36534942 - 36534795
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||    
T  36534942 tgcaagtgtaacttatatgtcccacctcggataaaacagtagaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacctaaagtcttaaggttttgggt 36534843  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    |||||||||| |||||||   |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  36534842 aagagtgtggcgtctctc--acaagtgtggttgttccagcctcgatgtgg 36534795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 221 - 356
Target Start/End: Original strand, 37167808 - 37167937
Alignment:
Q  221 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 320  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167808 ccacatcagataaaatagtaaatgttgaacag------agtaagaggatccataaatccattgacttaaagttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 37167901  T
Q  321 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37167902 cttgtgcggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37167937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 41854635 - 41854790
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   | ||||||||||||||||||    
T  41854635 tgcaagtatgagttatatgtcccacatcag-taaaagagtaaaggttgaacaccttataagcaagatgacctataaatataatgccttaaggttttgggt 41854733  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  41854734 aagagtgtgacgtctttcttacttgtgcggttgttctagcctcaatgtagacggtcc 41854790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 168 - 270
Target Start/End: Original strand, 30244667 - 30244771
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30244667 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataaga 30244766  T
Q  266 ggacc 270  Q
    |||||    
T  30244767 ggacc 30244771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 242 - 356
Target Start/End: Original strand, 30253534 - 30253644
Alignment:
Q  242 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 341  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||    
T  30253534 aggttgaagaccttataagtaagagaacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct----cttgtgtggttgttcaagcct 30253629  T
Q  342 cgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||| |||||    
T  30253630 cgatgtggatggtcc 30253644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Original strand, 30255308 - 30255412
Alignment:
Q  171 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30255308 ggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgcgttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg 30255407  T
Q  269 cccat 273  Q
    |||||    
T  30255408 cccat 30255412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 203 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 41910749 - 41910592
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa--------ggttt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||        | |||    
T  41910749 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaataccttataactgagaggacccataaacccattggcttaagatttttggattt 41910650  T
Q  295 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    | |||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41910649 ttggtaagagtgtggtgtttctctcacaagtgtggttgttctaacctcgatgtggacg 41910592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 246 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 28300366 - 28300255
Alignment:
Q  246 tgaacaccttataagtaagaggaccc-ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcga 344  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  28300366 tgaacaccttataagtaagagaaccccataaacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggcgtctctcttgcaagtgtggttgttcgggcctcga 28300267  T
Q  345 tgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||    
T  28300266 tgtggacggtcc 28300255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 321
Target Start/End: Original strand, 43241495 - 43241616
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  43241495 tgcaagtgtgagttatatgttccacatcggataaaaaaataaaggttgaacaccttataagtaaaaggactcataaacttattgacttaaggttttaggt 43241594  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgc 321  Q
    || ||| || ||||||||||||    
T  43241595 aaaagtatgatgtctctcttgc 43241616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 273
Target Start/End: Original strand, 30245463 - 30245567
Alignment:
Q  171 ggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 268  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30245463 ggacacacacttgagggggactgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggg 30245562  T
Q  269 cccat 273  Q
    |||||    
T  30245563 cccat 30245567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 200 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28301701 - 28301613
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 288  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301701 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaagctgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 28301613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 281 - 356
Target Start/End: Original strand, 47129450 - 47129525
Alignment:
Q  281 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47129450 ttgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtggacggtcc 47129525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 283 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28300644 - 28300574
Alignment:
Q  283 gccttaaggttttggg-taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28300644 gccttaaggttttggggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttattctagcctcgatgtggacg 28300574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 200 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 36109075 - 36109007
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 268  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36109075 tgcaagtgtgagttatatttctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga 36109007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37532821 - 37532753
Alignment:
Q  288 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532821 aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctagcttgtgctgttgttctagcctcgatgtggacggtcc 37532753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 205 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 44361616 - 44361517
Alignment:
Q  205 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 304  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  44361616 gtgtgagatatatgtctcacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctt-taagtaagatgatccataaacccataaccttacggttttaggtaagag 44361518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 122 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 37532896 - 37532822
Alignment:
Q  122 acaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttgg 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37532896 acaggcaaagtaaaaagcttccgctata-ggggaacacgttaaagtgaaggactcacacttgagggggagtgttgg 37532822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 318
Target Start/End: Original strand, 37345868 - 37346036
Alignment:
Q  151 ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 248  Q
    |||||||||| | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||  | ||| |||| || |||  ||||| |    
T  37345868 ggggagcacgatgaattgatgaactcacacttgaaggggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatatgtcatatatctgatagaaaagtggaggttaa 37345966  T
Q  249 acaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    |||  |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||    
T  37345967 acattttataagtgagaagacccataaacatattgccttaaagttttgagtaagagtgtgacgtctctct 37346036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40094583 - 40094502
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaac 250  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  40094583 gatggactcacactttaggaggagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatcagataaaagagtaaaggttgaac 40094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 37532986 - 37532897
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||    
T  37532986 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgcagaaagcagcaacgactgtacaagcagcaagtg 37532897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21416232 - 21416181
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21416232 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 21416181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23569091 - 23569043
Alignment:
Q  269 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctc 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23569091 cccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctc 23569043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Original strand, 30244453 - 30244508
Alignment:
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30244453 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggacggtcc 30244508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4124246 - 4124128
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || || | |  |||||  |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |    
T  4124246 tgcaactgtgaattacatgtcctacatcggttagaaaatttgaggtttgacactttataagtgagaggaccaataaactcattgcattaaggttttggat 4124147  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctct 318  Q
    || ||||||||||||||||    
T  4124146 aaaagtgtggtgtctctct 4124128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 237
Target Start/End: Original strand, 14681281 - 14681324
Alignment:
Q  194 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14681281 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaata 14681324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Original strand, 30245256 - 30245311
Alignment:
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30245256 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcaatgtggacggtcc 30245311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 356
Target Start/End: Original strand, 30253671 - 30253726
Alignment:
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30253671 agagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagcctcgatgtggactgtcc 30253726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40094503 - 40094424
Alignment:
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgt 347  Q
    |||||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40094503 acccataaactcattactttaaagttttgggtaagagtgtgacgtctttcttacttatgtggttgttctagccccgatgt 40094424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 345
Target Start/End: Original strand, 45755010 - 45755072
Alignment:
Q  283 gccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 345  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  45755010 gccttaaaattttgggtaaaagtgtggtgtctcccttacttgtgtggttgttcaagcctcgat 45755072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21619136 - 21619091
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21619136 gacccataaacccattgtcttaaggttttgggtaaaagtgtggtgt 21619091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 108
Target Start/End: Original strand, 45697753 - 45697801
Alignment:
Q  60 ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtg 108  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45697753 ttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagaagcaagtggctccttgtg 45697801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 36967385 - 36967335
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||    
T  36967385 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaaaagtaaagattaaacac 36967335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 352
Target Start/End: Original strand, 37393114 - 37393210
Alignment:
Q  255 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||| |||| ||||||| ||||||    ||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  37393114 tataagtaagatgacc-ataaactcaatgccttgaggttttgagtaaaagtgtggcgtctcttccacttatgtggttgctctaacctcgatgtggacg 37393210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27391859 - 27391815
Alignment:
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27391859 acccataaatccactgccttaaggttttaggtaagagtgtggtgt 27391815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 242 - 349
Target Start/End: Original strand, 15902342 - 15902448
Alignment:
Q  242 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 341  Q
    ||||||||||| |||||||| | |  || ||||| | | ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  15902342 aggttgaacactttataagtgaaatcacacataagctcgttgtcttaaggttttggataaaagtgtggtgtcgctctcacttgtgtgattgttct-gcct 15902440  T
Q  342 cgatgtgg 349  Q
     |||||||    
T  15902441 ggatgtgg 15902448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 92
Target Start/End: Original strand, 45433424 - 45433505
Alignment:
Q  12 gtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag 92  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45433424 gtatcagagccc-ggttcgacaaagggtacgaccgaggcagctggtccgtttgcgcataaagcagcaacggcggttcaagtag 45433505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4719359 - 4719305
Alignment:
Q  295 tgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  4719359 tgggtaagagtgtggtatttctcttgtttgtgcggttgctctagcctcgttgtgg 4719305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 28300554 - 28300473
Alignment:
Q  8 actggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc-attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 89  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||  |||||||||    
T  28300554 actggtatcagagcct-gattcgacgaagggtacgaccgaggcagtcggtccattgcgcagaaagcagcaacgacggtacaag 28300473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 307
Target Start/End: Original strand, 27598052 - 27598092
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 307  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  27598052 gacccataaacccattgtcttagggttttgcgtaagagtgt 27598092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 40094742 - 40094664
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtaca 87  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  40094742 tggtatcagagccctg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagtagcaacggcggtaca 40094664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 48243419 - 48243356
Alignment:
Q  27 ttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 88  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  48243419 ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccgtttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaa 48243356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 320
Target Start/End: Original strand, 5181 - 5477
Alignment:
Q  26 gttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacag 125  Q
    |||||||||| ||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5181 gttcgacgaaaggtacgatcgaggcagctggtcgttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacag 5280  T
Q  126 gcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtccc 222  Q
    ||||||| || ||||||||||  |||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||| ||    
T  5281 gcaaagt-aagagcttccgcttgaagggggagcacgatgaactgatggactcacacttgagggagagttttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgttcc 5379  T
Q  223 acatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 320  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5380 acatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattttggataagagtgtggtgtctctcttg 5477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 200 - 351
Target Start/End: Original strand, 4982 - 5133
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| | || |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4982 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggagagaacagtaaaggtttaatatcttataagtaaaaagacccataaactcattgccttatggttttgggt 5081  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 351  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  5082 aagagtgtggtgtctctctcgcttatgcggttgctctagcctcgatgtggac 5133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 111)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18933102 - 18932749
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagg 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18933102 tatcagagccccggttcgacgaagtgtgcgaccgaggcagccggtggttgtgcagaaagtcgcaacggcggtacaagcagcaagtggctccttgtgcagg 18933003  T
Q  113 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgag 211  Q
    |||||||||||||| ||| | || || |||||||  |||||| |||| | | ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18933002 aacggcgatacaggtaaaat-aagagtttccgcttgaagggggagcatgatgaatagatagactcacacttgaggggg-gtgttggtttgcaagtctgag 18932905  T
Q  212 ttatatgtcccacatcgg-----------ataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 300  Q
    ||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18932904 ttatatgtcccacatcggtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaataccttataaataagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggta 18932805  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18932804 agagtgtggtgtctctcttacttgagtggttgttatagcctcgatgtgtacggtcc 18932749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 167 - 356
Target Start/End: Original strand, 36629205 - 36629393
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36629205 tgatgggctcacacttgagggggagtgttgtgtt-caagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaagttaaacaccttataagtaagag 36629303  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629304 gacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 36629393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 200 - 355
Target Start/End: Original strand, 25483336 - 25483491
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483336 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggatccataaacccattgccttaaggttttgggt 25483435  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483436 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 25483491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 190 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 50630921 - 50630755
Alignment:
Q  190 agtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 289  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630921 agtgttggtttgcaagcgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacacattataagtaagaggacccataaacccattgccttaa 50630822  T
Q  290 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50630821 ggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttttagcctcgatgtgggcggtcc 50630755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Original strand, 41370349 - 41370513
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41370349 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccaaatcggataaaatagtaaatgttgaaaaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 41370448  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370449 ttttgggtaagagtgtagtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 41370513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 192 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 55933288 - 55933124
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55933288 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaagggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaag 55933189  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933188 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtacagttgttctagcctcgatgtggacggtcc 55933124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 200 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 54017751 - 54017596
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  54017751 tgcaagtgtgagttatatgtcccacgtcagataaaatagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttaggt 54017652  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017651 aagagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 54017596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 137 - 356
Target Start/End: Original strand, 39404334 - 39404554
Alignment:
Q  137 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 234  Q
    ||||||||||  | || ||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39404334 agcttccgcttgagggagagcacgatgaattgatggact-acacttgaggaggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacatcagataaa 39404432  T
Q  235 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 334  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39404433 agagtaaaggtggaacaccttataagtaagaggacccataaacctatagccttaaggttttgggcaagaatgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 39404532  T
Q  335 ctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  39404533 ctagcctcgatgtgaacggtcc 39404554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 137 - 356
Target Start/End: Original strand, 44620595 - 44620815
Alignment:
Q  137 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 234  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44620595 agcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgaggtggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatgaa 44620694  T
Q  235 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgtt 334  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  44620695 atagtagaggttgaacactttataagtaagaggacccataaa-ccataaccttaaggttttgggtaagagtgtggtttctctcttgcttgtgcggttgtt 44620793  T
Q  335 ctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  44620794 atatcctcgatgtggacggtcc 44620815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 172 - 348
Target Start/End: Original strand, 54108888 - 54109060
Alignment:
Q  172 gactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108888 gactcacacttaagggggagtgttg-tgtgcaagtgtcagttat--gtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc 54108984  T
Q  272 ataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  54108985 ataaacccattgccttaa-gttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcttcgatgtg 54109060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 1731803 - 1731647
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1731803 tgcaaatgtgagttatatgtcccacatcagataaaacagtaaaggttgaacatcttataaataagaggacccataaaccaattgccttaaggttttgggt 1731704  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1731703 aagagtgtggtgtttctcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 1731647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 200 - 355
Target Start/End: Original strand, 3340807 - 3340962
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3340807 tgcaagtgtgagttatatgtcccgcatcagatgaaagagtaaaggttgagcaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaaggttttgggt 3340906  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3340907 aagagtgtggtgtctttcttgcttgtggggttgttctagcctcgatgtggacggtc 3340962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 197 - 356
Target Start/End: Original strand, 50002423 - 50002582
Alignment:
Q  197 gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttg 296  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  50002423 gtttgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacactttttaagtaagaggacccataaatccattgtcttaaggttttg 50002522  T
Q  297 ggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50002523 ggtaagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctagcctcgatgtgggcggtcc 50002582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39793014 - 39792860
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39793014 caagtgtgagttatatgtcccacatcagatagaaaagtaaatgttgaacaccttataagaaagaggaaccgtaaactcattgccttaaggttttgggtaa 39792915  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39792914 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 39792860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 348
Target Start/End: Original strand, 52884695 - 52884844
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt-ggg 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  52884695 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagatgatcgataaacccattgccttaaggttttgggg 52884794  T
Q  299 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  52884795 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgcggttgatctagcctcgatgtg 52884844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 170 - 348
Target Start/End: Original strand, 52884856 - 52885038
Alignment:
Q  170 tggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 267  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884856 tggactcacacttgagggg-agtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 52884954  T
Q  268 acccataaacccattgccttaaggtttt-gggtaagagtgtggtg--tctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  52884955 atccataaacccattgccttaaggttttggggtaagaatgtggtgtctctctcttatttgtgtggttgatctagcctcgatgtg 52885038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 200 - 352
Target Start/End: Original strand, 10245920 - 10246071
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10245920 tgcaagtgtgagttatatgccccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacc-ataaacccaaagccttaaggttttgggt 10246018  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10246019 aagagtgtggtgtctcccttgcttgtctggttgttctagcctcgatgtggacg 10246071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 169 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22028150 - 22027961
Alignment:
Q  169 atggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22028150 atggactcacacttaaggaggggtgttgttgtgtgcaagtgtgacttatatgtcccacatcggataaaatacgaaaggttgaacaccttataagtaagag 22028051  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  22028050 gacccataaacatattgccttaaggttttgggtaagaatgtggtgtctctctcgcttatgtggttgttttagtctcgatgtggacagtcc 22027961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 36608817 - 36608661
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  36608817 tgcaagtgtgagttatatgtccaacatcggataaaagagtaaaagttgaacacctcataagtaagaggatccataaatccattgtcttaaggttttgggt 36608718  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36608717 aagagtgtggtgtctctctcactagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 36608661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34646803 - 34646649
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34646803 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaacagtaaatgttgaacaccttataactaagaggactcataaactcattgccttaaggttttgggtaa 34646704  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34646703 gagtgtggtgtctctctggtctgtgtggttgttctagccttgttgtggacggtcc 34646649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 39404020 - 39404174
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  39404020 caagtgtgagttatatgtcctacattgaataaaagagtaaaggttgaacactttataagtaagaggactcataaactcatagcattaaggttttgggtaa 39404119  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39404120 gagtgtggcgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 39404174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 192 - 338
Target Start/End: Original strand, 49880152 - 49880297
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49880152 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacattgaataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccactgccttaagg 49880251  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctag 338  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  49880252 ttttgggtaagagcgtggtgtctctcttgtttatgt-gttgttctag 49880297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 203 - 356
Target Start/End: Original strand, 50459724 - 50459877
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaag 302  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  50459724 aagtgtgagttatatgttccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacatcttataagtaagaggactcataaacccattatcttaaggttttaggtaag 50459823  T
Q  303 agtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50459824 agcgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgcacggtcc 50459877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 210 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 54343147 - 54343008
Alignment:
Q  210 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343147 agttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccc-------cattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 54343055  T
Q  310 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54343054 tgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggatggtcc 54343008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 209 - 356
Target Start/End: Original strand, 44620362 - 44620509
Alignment:
Q  209 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620362 gagttatatgttccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagagcccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 44620461  T
Q  309 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  44620462 atgtttctcttgcttgtgtggttgttctaaccttgatgtggacggtcc 44620509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 36572021 - 36572175
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36572021 caagtgtgagttatatgtcccacatcgaataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaagaagacccataaatccattgccttaaggttttgggtta 36572120  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  36572121 gagtatggtgtctctctcgcttgtgcggttgttcaagcctcgatgtgaacggtcc 36572175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 4955473 - 4955332
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955473 tgcaagtgtgagttatatgtctcatatcggataaaatagttaaggttgaacaccttataagtaagaggactcataaacccattgccttaaggttttgggt 4955374  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 341  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  4955373 aagagtgtggcgtctctcttacttgtgcggttgctctagcct 4955332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 168 - 353
Target Start/End: Original strand, 20826186 - 20826370
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||   | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||     
T  20826186 gatggactcacacttgagggggagtgttatgtagaaa-tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaagttgaacacgttataagtaagaga 20826284  T
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 353  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  20826285 acccataaacccatagccttaacattttaggtaagagtgtgatgtctctcttccttatgcgattgttctagcctcgatgtggacgg 20826370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22183420 - 22183264
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22183420 tgcaagtgtgagttatatatcccacatcggataaaagagtaaatgttgaacaatttataagtaaaaggacccataaacccattgccttaaggttttggat 22183321  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22183320 aagagtgtggcgtctctctcacttgtacggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 22183264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 356
Target Start/End: Original strand, 44621011 - 44621158
Alignment:
Q  209 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621011 gagttgtatgacccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcacataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtg 44621110  T
Q  309 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44621111 gtgtttctcttgcttgtgcggttattctagcctcgatgtggacggtcc 44621158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 219 - 356
Target Start/End: Original strand, 54936215 - 54936351
Alignment:
Q  219 tcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54936215 tcccacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 54936314  T
Q  319 tgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
      | | ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54936315 cac-tatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcc 54936351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 49076986 - 49076831
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49076986 tgcaagtgtgagttatatgttccatattggctaaaatagtaaaggttgaacaccttata-gtaagagaacccataaacccataaccttaaggttttgggt 49076888  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49076887 tagagtgtggtgtctttcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggactgtcc 49076831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 113 - 309
Target Start/End: Original strand, 2740984 - 2741180
Alignment:
Q  113 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggag--cacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtga 210  Q
    |||||||||||  ||||||| || ||||||||||  ||||||||  || | | || |||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||    
T  2740984 aacggcgatacgagcaaagt-aagagcttccgcttgaaggggagagcatgatgaattgatggactcacacttgaaggggagtgtta-tgtgcaagtgtga 2741081  T
Q  211 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 309  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2741082 gttatatgtcccacatcagatagaatagtaaaggttgaataccttataagtaagaggacccataactccattgccttaaggttttgggtaagagtgtgg 2741180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 22028527 - 22028369
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatag--taaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgg 297  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22028527 tgcaagtgttacttatatgtcctacatcggataaaaaaaaataaaggttgaacaccttattagtaagaggacccataaactcattgtcttaatgttttgg 22028428  T
Q  298 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22028427 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgaggttgttctagcctcaatgtggacggtcc 22028369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 32941279 - 32941128
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32941279 tgcaagtgtgagttatatgtcttacatcggaaagaacagtaaaggttgaacaccttataaataagagggctcataaactcattgccttaaggttttgggt 32941180  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggac 351  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32941179 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtggac 32941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 168 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 3244638 - 3244458
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagg 267  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3244638 gatggactcacgcttaagggagagtgttg-tgtgcaagtgtgagttatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacatcttataagtaagagg 3244540  T
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3244539 acccataaactcattgtcttaaagttttgggtaagaatgtgtcgtctctctcacttgtatggttgttccagcctcgatgtgg 3244458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 163 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 49076643 - 49076451
Alignment:
Q  163 aaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49076643 aaagtgatggactcacacttgaggaggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtaccatatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataag 49076544  T
Q  261 taagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||  || | ||||||| ||| |||| || | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  49076543 taagaggacctataaacccattgtcttaaag-tttgggta--agggcggtgtctgtctcgcttatgcgattgttatagcctcgatgtggacggtcc 49076451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 203 - 352
Target Start/End: Original strand, 49302907 - 49303058
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataa--gtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49302907 aagtgtgagttatatgtcccacatcaaataaaaaagtaaaggttgaacatcttataaaagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 49303006  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacg 352  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || | |||||||| ||||||||||||||    
T  49303007 agagtgtggtgtatctcttacttatgcgattgttctatcctcgatgtggacg 49303058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 199 - 349
Target Start/End: Original strand, 54108537 - 54108686
Alignment:
Q  199 ttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc-cattgccttaaggttttgg 297  Q
    |||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54108537 ttgcaagtgtgagttat--gtcccatataggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaaaggacccataaaattcattgccttaaggttttgg 54108634  T
Q  298 gtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54108635 ctaagagtgtggtgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcaatgtgg 54108686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 201 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16889691 - 16889536
Alignment:
Q  201 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 300  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  16889691 gcaagtgtgagttatatgtctcaaatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagaggattcataaacctactgccttaaagttttgggta 16889592  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16889591 agagtatggtgtctctcttccttgtgtgattgttctaacctcgatgtggacggtcc 16889536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 157 - 356
Target Start/End: Original strand, 3341083 - 3341284
Alignment:
Q  157 cacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacacct 254  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |    
T  3341083 cacgataaagtgatggactcacacttgaggcagagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttaaacactt 3341182  T
Q  255 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||  || ||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  3341183 tataagtaagaggacccataacatcattgttttaagattttgggtaagagtgtgatgtctttcttaattatgtggttattttaacctcgatgtagacggt 3341282  T
Q  355 cc 356  Q
    ||    
T  3341283 cc 3341284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 206 - 356
Target Start/End: Original strand, 20825842 - 20825992
Alignment:
Q  206 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  20825842 tgtgagttatatgttccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccttataaataagagcacccataaacctttagccttaaggttttgggtaagagt 20825941  T
Q  306 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20825942 gtggtgtttctcttccttatgcggttgttctagccttgatgtggacagtcc 20825992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 215 - 329
Target Start/End: Original strand, 45496820 - 45496934
Alignment:
Q  215 tatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 314  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45496820 tatgtcccacatcggataaaatcgtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaactcattgtcttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 45496919  T
Q  315 ctcttgcttgtgtgg 329  Q
    |||||||||||||||    
T  45496920 ctcttgcttgtgtgg 45496934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 2740700 - 2740854
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||  ||    
T  2740700 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacctataaacccagagccttaaggttttacgt 2740799  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2740800 aagagtgtggcgtctctctcact--tgtggttgttctagcctcgatatggatggtcc 2740854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 200 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4390257 - 4390102
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||| ||||||||||||||    
T  4390257 tgcaagtgtgagttacatatcccacatcagataaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggatcctttagcacattgcgttaaggttttgggt 4390158  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  4390157 aagagtgtgacgtctctcttgcttgtgcagttgttctagcctcgatgcggacggtc 4390102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 201 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16888971 - 16888816
Alignment:
Q  201 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  16888971 gcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtaaaggttgaataccttataagtaagagaacctataaactcattgtcttacggttttgggta 16888872  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16888871 agagtgtgatgtctctcttgtttgtgcgattgttctagtttcgatgtagacggtcc 16888816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 354
Target Start/End: Original strand, 43174480 - 43174661
Alignment:
Q  176 cacacttgagggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaat-agtaaaggttgaacaccttataagtaagaggaccca 272  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43174480 cacacttgagggggagtgttgttgtgtacaagtgtgagttatatgccacacatcagataaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacaca 43174579  T
Q  273 taaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    |||||| ||  |||||| || |||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43174580 taaacctatgaccttaaagtgttgggtaagagtgtggcgtctctcttgtttatatggttgttgtagccttgatgtggacggt 43174661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 168 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 45489522 - 45489332
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgaggggg-agtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaag 264  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45489522 gatggactcacacttgaggggggagtgttgttgtgtacaagtgtgaattatatgtctcacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaag 45489423  T
Q  265 aggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    || || | |||||| | ||  ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  45489422 agaactcttaaacctactg-tttaagatttttggtaagagtgtgatgtctcttttgctagtgtgattgttctagcctcgatgtggatggtcc 45489332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 254 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 23817783 - 23817681
Alignment:
Q  254 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 353  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817783 ttataagtaagaggattcataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacgg 23817684  T
Q  354 tcc 356  Q
    |||    
T  23817683 tcc 23817681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 202 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41707618 - 41707503
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  41707618 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaacaccatataagtaaaagaacccataaactcattgtcttaaggtttt-ggtaa 41707520  T
Q  302 gagtgtggtgtctctct 318  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707519 gagtgtggtgtctctct 41707503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 6975620 - 6975489
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg 291  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||     
T  6975620 tgttagtttgcaaatgtgagttatatgtctcacatccgataaaatagtaaaggttgaatatcttataagtaagaggactcataaatccattatcttaaga 6975521  T
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgctt 323  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6975520 ttttgggtaagagtgtggcgtctctcttgctt 6975489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 200 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34004739 - 34004586
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |    
T  34004739 tgcaagtgtgagttatatgtcacacatatgataaaa-actaaaggttgaacaacttataagtaagaggacccataaactcatt-ccttaaggttttcgat 34004642  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34004641 aagagtgtgccgtctctctcccttgtgcggttgttctagcctcgatgtgaacggtc 34004586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 202 - 346
Target Start/End: Original strand, 19504707 - 19504842
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  19504707 caagtatgagttatatgtcccatatcggataaaatagtaaaagttgaacac---------aagaggacccataaatctattgccttaaagttttgggtaa 19504797  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 346  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19504798 gagtgtggcgtctatcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatg 19504842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 132
Target Start/End: Original strand, 41370543 - 41370662
Alignment:
Q  13 tatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcagg 112  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  41370543 tatcagagcccccattcgacgaagggtgcgaccgaggcagccggtcgttgcacagaaagccgcaacggcggtacaagcagcaagtagctccttgtgcagg 41370642  T
Q  113 aacggcgatacaggcaaagt 132  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  41370643 aacggcgatacaggtaaagt 41370662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 51768216 - 51768061
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  51768216 tgcaaatgtgagttatatgtcctatatcgaatataagagtaaatgttgaacaccttataaataagaggactcataaactcattgtcttaaggttttgggt 51768117  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    || |||  | |||||||||| ||| || | |||||||| |||||||||||||||||    
T  51768116 aaaagtacgatgtctctcttacttatgggattgttctaacctcgatgtggacggtc 51768061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 200 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 54741334 - 54741194
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| |    
T  54741334 tgcaagtgtgaattatatgtctcacatcggatagaaaagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatacacagattgtcttaaggttttggat 54741235  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctc 342  Q
    |||||||| || |||||||  |  |||| ||||||||||||||    
T  54741234 aagagtgtagtctctctct--cacgtgttgttgttctagcctc 54741194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 200 - 355
Target Start/End: Original strand, 3700365 - 3700512
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||        || ||||||||||||||||||| |    
T  3700365 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaagagtaaatgttgaacaccttataagtaaaagg--------actcattgccttaaggttttggat 3700456  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtc 355  Q
    |||||| || |||||||||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3700457 aagagtatgatgtctctctcatttgtgtggttattcaagcctcgatgtggacggtc 3700512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 246 - 356
Target Start/End: Original strand, 18879852 - 18879962
Alignment:
Q  246 tgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgat 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  18879852 tgaacaccttataagtaagatgacctataaacctatttccttaaggttttgggtaagagtgtgacgtctcttttggttgtgtggttgttctagcttcgat 18879951  T
Q  346 gtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||    
T  18879952 gtggacggtcc 18879962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Original strand, 31691203 - 31691306
Alignment:
Q  251 accttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtc--tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  31691203 accttataagtaagaggacccataaactcattgccttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctatctcttgcttgtacgattgttctagcctcgatgtg 31691302  T
Q  349 gacg 352  Q
    ||||    
T  31691303 gacg 31691306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 240 - 356
Target Start/End: Original strand, 43827480 - 43827595
Alignment:
Q  240 aaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagc 339  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |    
T  43827480 aaagattgaactccttataaataagaggacccataaattcattgccttaaggttt-ggataagagtgtggtgtctctcttacttgtgcggttgttctaac 43827578  T
Q  340 ctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||    
T  43827579 ctcgatgtggacggtcc 43827595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 266
Target Start/End: Original strand, 44621361 - 44621492
Alignment:
Q  137 agcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaa 234  Q
    |||||||||| |  |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44621361 agcttccgcttttgggggagcacgatgaattgatggactcacacttgagggggagtgtcgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtccaacatgggataaa 44621460  T
Q  235 atagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44621461 acagtaaaggttaaacaccttataagtaagag 44621492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 213 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 54017845 - 54017750
Alignment:
Q  213 tatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  54017845 tatatatcccacatcggataaaacagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccatattcccattgtcttaaggttttaggtaagagtgtg 54017750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 202 - 337
Target Start/End: Original strand, 40067045 - 40067181
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaag-gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggta 300  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||| |||||||||    
T  40067045 caagtgtgagttatatgttctacatcggataaaagtgtaaaaagttgaacacattataagtaagaggacacatagatccactaccttaagattttgggta 40067144  T
Q  301 agagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttcta 337  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  40067145 aaagtgtgatgtctctcttgcttatgtggttgttcta 40067181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 80 - 289
Target Start/End: Original strand, 10246240 - 10246436
Alignment:
Q  80 gcggtacaagtagcaagtggctccttgtgcaggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcaca 179  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||| |||||||              |||||||     
T  10246240 gcggtacaagcaacaagtggcttcttgtgcagcaatggctatacatgcaaagtaaaaagcttccactcta-ggggagc--------------gactcacg 10246324  T
Q  180 cttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 277  Q
    |||||||||||||| ||  || |||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  10246325 cttgagggggagtgctgttgtgtgcaagtgtctgttatatgtctcaaatcggataaaagagtaaaggttgaacatcttataagttagaggacccataaac 10246424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 28034229 - 28034385
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||    
T  28034229 tgcaagtgtgaattatatgtcccgcatcggatagaaaagtggaggttgaacactttataagtgagagaacccataaacttattgctttaaggttttaggt 28034328  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||| ||||||||  ||| || ||||| ||| | || |||||||| |||||    
T  28034329 aagagtgtggcgtctctctcacttatgcggttgctctggtctggatgtggatggtcc 28034385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 221 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 48111833 - 48111698
Alignment:
Q  221 ccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttg 320  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||      
T  48111833 ccacctcggataaaagagtaaaggttgaacacattataagtaaaaggacttataaatccattaccttaaggttttaggtatgagtgtggtgtctctctca 48111734  T
Q  321 cttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |   ||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  48111733 caaatgtggtttttctaacctcaatgtggacggtcc 48111698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 222 - 356
Target Start/End: Original strand, 3271806 - 3271945
Alignment:
Q  222 cacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttat---aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg-gtgtctctc 317  Q
    |||||| |||| || |||||| ||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3271806 cacatcagatagaaaagtaaaagttaaacaccttattataagtaagagaacccataaacctattgccttaaggttttgggtaagagtgtgtgtctctctc 3271905  T
Q  318 -ttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
     ||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3271906 gtttattatgtggttgttctagcctcgatgtggacagtcc 3271945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 205 - 332
Target Start/End: Original strand, 760194 - 760320
Alignment:
Q  205 gtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagag 304  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| || | | ||||||||  || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||    
T  760194 gtgtgagttatatgtcccacatcgaatagaaaaatgaaggttgagaactttataagtgagaggacccataaactcattgccttaagatttt-ggtaaaag 760292  T
Q  305 tgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 332  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||    
T  760293 tgtggtgtctctctcatttgtgtggttg 760320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 242 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15841482 - 15841383
Alignment:
Q  242 aggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcct 341  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  15841482 aggttgaacactttgtaagtgagaggattcataaacacattgccttaaggttttgggtaagagtgtgatgtctctctcacttgtgtggttgctctagcct 15841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 192 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 50788147 - 50788087
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 252  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50788147 tgttggtttgcaagtgtaagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacac 50788087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 266
Target Start/End: Original strand, 44620304 - 44620362
Alignment:
Q  208 tgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620304 tgagttatatgtcccacatgggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23557022 - 23556890
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||| ||||   |||||||||| || |||  ||||||||||  |||||| |||||| | |||||||  ||||||||||| ||||||| |    
T  23557022 tgcaagtgtgagttaaatgttttacatcggatagaaaagtggaggttgaacattttataaataagagaatccataaaatcattgccttaaagttttggat 23556923  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttg 332  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23556922 aagagtgtgacgtctctcttacttgtgtggttg 23556890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 206 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 45489864 - 45489721
Alignment:
Q  206 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 305  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||||| || || ||||||       |||||||||||||||| |||    
T  45489864 tgtgagttatatgtatcacattggataaaagagtaaagattgaatatcatataagtaagatgatccttaaaccttaaagtttaaggttttgggtaatagt 45489765  T
Q  306 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  45489764 gtggtgtctctctcgcttgcatggttgttctagtctcgatgtgg 45489721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 143
Target Start/End: Original strand, 10246103 - 10246237
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtg 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||| ||  |||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  10246103 tggtatcagaaccccggttcgatgaagggtacgactgaggccgcctgtcagttgtgcagaaagcagcaacgacggtacaagcaacaagtggcttcttgtg 10246202  T
Q  109 caggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttcc 143  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  10246203 cagcaacggctatacatgcaaagtaaaaagcttcc 10246237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 356
Target Start/End: Original strand, 43174233 - 43174297
Alignment:
Q  292 ttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43174233 ttttgggtaagagtgtggtgtctctctcacttgtgtggttgttcaagccttgatgtggacggtcc 43174297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Original strand, 11197293 - 11197344
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11197293 gacccataaacccattgccttagggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 11197344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 203 - 318
Target Start/End: Original strand, 34544107 - 34544225
Alignment:
Q  203 aagtgtgagttatatgt--cccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagg-ttttgggt 299  Q
    ||||||||||||||| |  | ||||||| ||| || |||  ||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  34544107 aagtgtgagttatatatatctcacatcgaatagaaaagtggaggttgatcactttataaatgagaggacccataaactcattgccttaaggtttttgggt 34544206  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  34544207 aagagtgtggtatctctct 34544225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 39699077 - 39698944
Alignment:
Q  225 atcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt--aaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgct 322  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||| || |  | ||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  39699077 atcggatataaaagtaaaggttgaacatattctaagtaagaggatccataaatccgtgtcgttttaaggttttgagtaagagtgtagcatctctcttgct 39698978  T
Q  323 tgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  39698977 tgtgcggttattctagtctcgatgtggacagtcc 39698944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 266
Target Start/End: Original strand, 44620926 - 44621011
Alignment:
Q  184 agggggagtgttggtttg--caagtgtgagttatatgtccca-catcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620926 agggggagtgttgttgtggacaagtgtgagttagatgtcccaacatcggataaaactgtaaaggttgaacaccttataagtaagag 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 237
Target Start/End: Original strand, 41370673 - 41370738
Alignment:
Q  171 ggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaata 237  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41370673 ggactcacacttgagggg-agtgttggtttgaaagagtgagttatatatcccatatcggataaaata 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 280 - 354
Target Start/End: Original strand, 41370738 - 41370812
Alignment:
Q  280 attgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41370738 attgccttaagattttaggtaaaaatgtgatgtctctcttacttgagtggttgttctaacctcgatgtggacggt 41370812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 102
Target Start/End: Original strand, 3340990 - 3341083
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||  | ||||||||||    
T  3340990 tggtatcagagccccggttcgacgaacggtacgaccgaggtcgctggtcagttgcgcagaaagcagcaacgacggtacaaacaacaagtggctc 3341083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 78
Target Start/End: Original strand, 45496734 - 45496803
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca-ttgcgcagaaagccgcaac 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  45496734 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcgaccgaggccgccggtcagttgcgtagaaagcagcaac 45496803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11348484 - 11348396
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctta 288  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||    
T  11348484 tgcaattgtgagttatatgttctacatcagataaaatagtggaggttgaacactttataagtgagaggatccatatattcattgcctta 11348396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15841134 - 15841023
Alignment:
Q  206 tgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagt 305  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||| || |||  ||| ||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15841134 tgtgaattatatgtcccatatcagatagaaaagtggaggctgaacattttataagtgagaggatctataaacccattgctttaa-gttttgggtaagagt 15841036  T
Q  306 gtggtgtctctct 318  Q
    ||  |||||||||    
T  15841035 gtattgtctctct 15841023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16889375 - 16889315
Alignment:
Q  137 agcttccgctctaaggggagcacg-ttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 196  Q
    ||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16889375 agcttccgcttgagggggagcacgattaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg 16889315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Original strand, 10396198 - 10396249
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  10396198 gacccataaacccattgccttagggttttaggtaagagggtggtgtctctct 10396249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Original strand, 10396483 - 10396534
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  10396483 gacccataaacccattgccttagggttttggataagagtgtggtctctctct 10396534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11783646 - 11783560
Alignment:
Q  263 agaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | |||| |||||||| |||||||    
T  11783646 agaggacccatacacctattgccataaagttttgggtaagagtgtgtcgtttctctcgcttgtatagttgctctagcctagatgtgg 11783560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 88
Target Start/End: Original strand, 2740874 - 2740953
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtca--ttgcgcagaaagccgcaacagcggtacaa 88  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| | ||   ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2740874 tggtatcagagccccg-ttcgacgaagggtacgaccgaggcagccgatccgtttgcgcagaaagcagcaacagcggtacaa 2740953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 23817498 - 23817457
Alignment:
Q  313 ctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23817498 ctctcttgctagtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 23817457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 319
Target Start/End: Original strand, 922485 - 922537
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctctt 319  Q
    ||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  922485 gacccataaacccattgtcttaggggtttggataagagtgtggtgtctctctt 922537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 307
Target Start/End: Original strand, 1868119 - 1868158
Alignment:
Q  268 acccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgt 307  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1868119 acccataaacccattgccttaaagttttgggtaagagtgt 1868158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 310 - 349
Target Start/End: Original strand, 19895406 - 19895445
Alignment:
Q  310 tgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19895406 tgtctctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtgg 19895445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 11706641 - 11706584
Alignment:
Q  258 aagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctct 316  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11706641 aagtaagaggact-ataaactcattgctttaaggttttgggtaagagtgtggcgtctct 11706584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 20826024 - 20826101
Alignment:
Q  14 atcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaag 89  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20826024 atcagagccccaattcgacgaagggtacgaccgaggcagccggtccatttgcgcagaaagcagcaacggcggtacaag 20826101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 312
Target Start/End: Original strand, 51681604 - 51681650
Alignment:
Q  266 ggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgt 312  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51681604 ggactcatatacccattgccttaagattttgggtaagagtgtggtgt 51681650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 2891924 - 2891864
Alignment:
Q  254 ttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtct 314  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  2891924 ttataagtaagaggatccataaacctaatgtcttaaggttttgggttaaagtgtgatgtct 2891864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 200 - 248
Target Start/End: Original strand, 45050601 - 45050649
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttga 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  45050601 tgcaagtgtgagttatatgtctcacatcaaataaaagagtaaaggttga 45050649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 50788072 - 50787996
Alignment:
Q  278 ccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||| | |||||| |||| | || |||| ||||||    
T  50788072 ccattgccttaaggttttagataagagtgtggtgtctctgtcgcttatttggttgctctaacttcaatgtagacggt 50787996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Original strand, 11197003 - 11197054
Alignment:
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||    
T  11197003 gacccttaaacccattgccttaggattttaggtaagagtgaggtgtctctct 11197054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18933134 - 18933103
Alignment:
Q  192 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933134 tgttggtttgcaagtgtgagttatatgtccca 18933103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 255 - 298
Target Start/End: Original strand, 45484774 - 45484817
Alignment:
Q  255 tataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttggg 298  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45484774 tataagtgagagaacccataaacccaatgccttaaggttttggg 45484817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 314 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 11702341 - 11702307
Alignment:
Q  314 tctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11702341 tctcttgcttgtgcggttgttctagcctcgatgtg 11702307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 31249970 - 31249896
Alignment:
Q  244 gttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | || | | | ||||||||| | |||||||| |||||||    
T  31249970 gttgaacactttataagttagaggacccataaacctaatgacgtcaagttttgggttaaagtgtggtctctctct 31249896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 41707321 - 41707279
Alignment:
Q  276 acccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  41707321 acccattaccttaaggttttgggtaaaagtgtggtatctctct 41707279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 11706677 - 11706636
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaa 241  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11706677 tgcaagggtgagttgtatgtcccacatcggataaaaaagtaa 11706636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 348
Target Start/End: Original strand, 19895533 - 19895570
Alignment:
Q  311 gtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtg 348  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19895533 gtctatcttgcttgtgtggttgttctagcttcgatgtg 19895570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 296
Target Start/End: Original strand, 29802604 - 29802637
Alignment:
Q  263 agaggacccataaacccattgccttaaggttttg 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29802604 agaggacccataaacccaatgccttaaggttttg 29802637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 92
Target Start/End: Original strand, 44621182 - 44621266
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtag 92  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| |||| ||||   || |||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  44621182 tggtatcagagccctggtttgacgaagggtacgaccgagacagccggtccgttttcgcagaaagcagcaacggcgatacaagtag 44621266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 282 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34946187 - 34946151
Alignment:
Q  282 tgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  34946187 tgccttaggattttgggtaagagtgtggtgtctctct 34946151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 489 - 149
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtcattgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgtgc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||  |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  489 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtgcaaccgaggtagtcggtcgttgcgaagaaagtcgcaacagcagtacaagcagcaagtggctccttgtgc 390  T
Q  110 aggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaagggg-agcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgt 208  Q
    ||||||   |||||||| ||| | || ||||||||||  |||||| |||| | | ||   ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  389 aggaacaatgatacaggtaaact-aagagcttccgcttgaagggggagcatgatgaataaatggactcacatttg-gggggagtgttggtttgcaagtgt 292  T
Q  209 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtg 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| ||| ||| ||||||| ||||    
T  291 gagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagga-ccataaa-ccat--actttagg-tttaggtaagaatgtg 197  T
Q  309 gtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  196 gtgtctctcttgcttgagtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 670 - 516
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670 caagtgtgagttatatgtcccacatcggttaaaagagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 571  T
Q  302 gagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  570 gagtgtggtgtctttcttgcttgagtggtttttctagcctcgatgtggaaggtcc 516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1464 - 1110
Alignment:
Q  10 tggtatcagagccccggttcgacgaagggagcgaccgaggcagctggtc--attgcgcagaaagccgcaacagcggtacaagtagcaagtggctccttgt 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||   ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   || | ||| | |    
T  1464 tggtatcagagccccggttcgacgaagggtatgaccgaggcagccggtccgtttgtgcagaaagcagcaacggcggtacaagtag--tgtcggtccgttt 1367  T
Q  108 g---------caggaacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaa-ggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg- 196  Q
    |         ||| |||| ||||||| || |||| || ||||||||||| || |||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  1366 gcggagaaaccagcaacgacgatacaagc-aagt-aagagcttccgctcgaagggggagcatgatcaaaagatggactcacacttgagggggaatgttgt 1269  T
Q  197 -gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggtttt 295  Q
     || | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1268 tgtgtacaagtgtgagttatatgtcccacattggataaaagagtaaaggttgaacaccttataagaaaaaggactcataaacccattgccttaaggtttt 1169  T
Q  296 gggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 354  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1168 gggtaagagtatggtgtctctcttgtttatgtggttgttctagcctcgatgtggacggt 1110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1802 - 1731
Alignment:
Q  247 gaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctct 318  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1802 gaacaccttataagtgagaggacccataaacccattgccttaaggtttttggtaagagtgtggtgtctctct 1731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3178 - 3092
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaaca 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3178 tgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaggtgtgagttatatgtcccacatcggataaaagagtaaaggttgaaca 3092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 113 - 349
Target Start/End: Original strand, 5689 - 5931
Alignment:
Q  113 aacggcgatacaggcaaagtcaaaagcttccgctctaaggggagcacgttaaagtgatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtga 210  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||  | |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  5689 aacggcgacacatgcaaagt-aagagcttccgcttgagggggagcaagatgaattgatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtga 5787  T
Q  211 gttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaag-----gttttgggtaagagt 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||| ||||||||    
T  5788 gttatatgtcgcacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaagattaaattttgagtaagagt 5887  T
Q  306 gtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| | | |||||||||    
T  5888 gtggtgtctcttttacttgtggggttgttcaaacttcgatgtgg 5931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 200 - 349
Target Start/End: Original strand, 5396 - 5546
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgcctt-aaggttttggg 298  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||| |||||||    
T  5396 tgcaagtgtgagttatatgtcctacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagagggcccataaacatattgtcttaaagtttttggg 5495  T
Q  299 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtgg 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  5496 taagagtgtggtgtctctcttgcttgtggggttgttcaagcctcgatgtgg 5546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 168 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 17648 - 17496
Alignment:
Q  168 gatggactcacacttgagggggagtgttg--gtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaaga 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17648 gatggactcacacttgagggggagtgttgttgtgtgcaagtgtgagttatatgtcacacatcagataaaatagtaaaggttgaacaccttgtaagtaaga 17549  T
Q  266 ggacccataaacccattgccttaagg--ttttgggtaagagtgtggtgtctct 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  17548 ggacccataaacccatagccttaaggttttttgggtaagagtatggtgtctct 17496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 200 - 356
Target Start/End: Original strand, 47360 - 47516
Alignment:
Q  200 tgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggt 299  Q
    ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47360 tgcaagtgtgaattaaatgtctcacatccgataaaatagtaaagtttgaacaccttataagtaagagaatccataaacccattgccttaaagttttgggt 47459  T
Q  300 aagagtgtggtgtctctcttgcttgtgtggttgttctagcctcgatgtggacggtcc 356  Q
    || | |||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47460 aaaaatgtggtgtctctcttgcttgcgcggttgttctaacctcgatgtggacggtcc 47516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 202 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10267 - 10192
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10267 caagtgtgagttatatgtctcacatcggataaaatggtaaaagttgaacaccttataagtaagaggacccataaac 10192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 332
Target Start/End: Original strand, 39459 - 39588
Alignment:
Q  202 caagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacccattgccttaaggttttgggtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||  ||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||   |||||||||| ||||||||||    
T  39459 caagtgtgagttatatgtctcaca-cgcatagaaaagtggaggttgaactccttataagtgagaggaactataaacatgttgccttaag-ttttgggtaa 39556  T
Q  302 gagtgt-ggtgtctctcttgcttgtgtggttg 332  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39557 aagtgttggcgtctctcttgcttgtgtggttg 39588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 325
Target Start/End: Original strand, 39805 - 39963
Alignment:
Q  167 tgatggactcacacttgagggggagtgttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagag 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  | || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||   ||||| || | |||||||| |||     
T  39805 tgatgaactcacacttgagggggaattgttgtgttcaagtgtgagttatatgtcccacatcggatagaaaagtggtggttggactctttataagtgagat 39904  T
Q  267 gacccataaacccattgccttaaggttttgggtaagagtgtggtgtctctcttgcttgt 325  Q
    ||   ||||||  ||| ||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  39905 gagatataaacttattaccttaaaattttggttaaaaatgtggtgtctctctcgcttgt 39963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Original strand, 2869 - 2953
Alignment:
Q  194 ttggtttgcaagtgtgagttatatgtcccacatcggataaaatagtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 278  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||  ||||| |  |||||  ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  2869 ttggattgcaagtatgagttataagtttcacattgtttaaaaatgtaaaggttgaacactttatatataagaggatccataaacc 2953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10446 - 10406
Alignment:
Q  238 gtaaaggttgaacaccttataagtaagaggacccataaacc 278  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  10446 gtaaaggttgaacactttatatgtaagaggatccataaacc 10406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University