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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5387_high_9 (Length: 388)

Name: NF5387_high_9
Description: NF5387
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5387_high_9
NF5387_high_9
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (1-342)||(38526479-38526816)
chr8 (1-337)||(18916017-18916354)
chr8 (1-336)||(41486470-41486803)
chr8 (1-337)||(1197425-1197761)
chr8 (1-337)||(2734849-2735170)
chr8 (1-337)||(35563620-35563939)
chr8 (124-337)||(38567513-38567724)
chr8 (193-337)||(9686365-9686509)
chr8 (193-337)||(11661332-11661476)
chr8 (13-239)||(2001406-2001629)
chr8 (3-143)||(11661178-11661318)
chr8 (1-336)||(24697547-24697864)
chr8 (3-148)||(9686516-9686661)
chr8 (258-337)||(1996317-1996396)
chr8 (84-239)||(43596192-43596347)
chr8 (3-94)||(38567035-38567126)
chr8 (3-50)||(43596365-43596412)
chr8 (269-331)||(43596095-43596157)
chr8 (17-50)||(43595900-43595933)
[»] chr3 (24 HSPs)
chr3 (1-337)||(8082218-8082552)
chr3 (1-337)||(41957976-41958311)
chr3 (1-333)||(11685618-11685948)
chr3 (1-337)||(37608970-37609304)
chr3 (1-337)||(28246741-28247074)
chr3 (1-331)||(53151409-53151739)
chr3 (1-337)||(18996573-18996906)
chr3 (1-337)||(18999112-18999445)
chr3 (2-298)||(3777296-3777590)
chr3 (30-337)||(13696562-13696875)
chr3 (1-337)||(24373069-24373388)
chr3 (80-343)||(45572651-45572912)
chr3 (1-337)||(30800892-30801213)
chr3 (193-337)||(30260653-30260797)
chr3 (3-119)||(30260891-30261007)
chr3 (5-144)||(20329462-20329609)
chr3 (195-334)||(20307322-20307461)
chr3 (80-167)||(20307463-20307549)
chr3 (192-316)||(54162906-54163030)
chr3 (193-239)||(30260816-30260862)
chr3 (1-99)||(54162734-54162832)
chr3 (1-50)||(45572926-45572975)
chr3 (8-47)||(20307590-20307629)
chr3 (3-50)||(41296003-41296050)
[»] chr2 (7 HSPs)
chr2 (1-337)||(15805628-15805961)
chr2 (22-337)||(30518449-30518763)
chr2 (1-340)||(27641019-27641359)
chr2 (1-337)||(32597353-32597689)
chr2 (1-337)||(5614411-5614745)
chr2 (1-50)||(34580248-34580297)
chr2 (66-119)||(36871208-36871261)
[»] chr7 (18 HSPs)
chr7 (1-337)||(20372313-20372650)
chr7 (1-336)||(47266248-47266583)
chr7 (1-346)||(30586052-30586380)
chr7 (1-299)||(44079876-44080171)
chr7 (1-341)||(49141832-49142158)
chr7 (3-343)||(31293017-31293340)
chr7 (80-333)||(41743126-41743378)
chr7 (3-179)||(43174979-43175155)
chr7 (1-335)||(22916552-22916884)
chr7 (194-325)||(31577403-31577533)
chr7 (247-337)||(32031361-32031451)
chr7 (3-119)||(8047728-8047844)
chr7 (254-337)||(27620187-27620270)
chr7 (193-337)||(8048231-8048367)
chr7 (2-50)||(41743391-41743439)
chr7 (124-179)||(27620063-27620118)
chr7 (136-179)||(31577554-31577597)
chr7 (1-50)||(27619965-27620014)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (1-337)||(45360172-45360506)
chr1 (1-337)||(19565165-19565499)
chr1 (1-336)||(5555196-5555528)
chr1 (1-318)||(40125432-40125747)
chr1 (1-342)||(14236393-14236712)
chr1 (1-317)||(21620060-21620375)
chr1 (3-333)||(43068903-43069215)
chr1 (137-337)||(32550356-32550552)
chr1 (13-336)||(3656524-3656824)
chr1 (13-138)||(25473712-25473837)
chr1 (124-336)||(4643587-4643797)
chr1 (3-103)||(32550257-32550357)
chr1 (193-335)||(6694055-6694200)
chr1 (16-169)||(25304194-25304347)
chr1 (2-119)||(6693909-6694026)
chr1 (193-331)||(3027730-3027869)
chr1 (1-169)||(16296624-16296792)
chr1 (192-239)||(2782444-2782491)
chr1 (194-239)||(35371889-35371934)
chr1 (247-319)||(25304381-25304453)
chr1 (3-47)||(35371574-35371618)
chr1 (268-340)||(35371966-35372038)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (1-337)||(9033833-9034168)
chr4 (1-337)||(26695825-26696161)
chr4 (1-337)||(39502590-39502924)
chr4 (7-335)||(40590940-40591265)
chr4 (1-336)||(44506118-44506450)
chr4 (7-337)||(56080599-56080926)
chr4 (1-337)||(29051830-29052168)
chr4 (1-337)||(24072389-24072710)
chr4 (2-340)||(37995448-37995782)
chr4 (125-337)||(39499251-39499462)
chr4 (193-334)||(2623309-2623450)
chr4 (13-332)||(127841-128142)
chr4 (2-334)||(51789986-51790318)
chr4 (13-337)||(45620212-45620535)
chr4 (1-132)||(2623161-2623292)
chr4 (66-337)||(31334992-31335266)
chr4 (68-128)||(54230924-54230984)
chr4 (194-239)||(4238558-4238603)
chr4 (1-50)||(22602386-22602435)
chr4 (91-179)||(1581814-1581902)
chr4 (268-336)||(54230730-54230798)
chr4 (2-50)||(54231005-54231052)
[»] chr5 (15 HSPs)
chr5 (1-337)||(25897793-25898128)
chr5 (1-340)||(22213263-22213601)
chr5 (2-343)||(42393903-42394248)
chr5 (1-333)||(30493767-30494084)
chr5 (1-333)||(30534110-30534427)
chr5 (2-340)||(13946252-13946582)
chr5 (1-337)||(26674057-26674375)
chr5 (1-337)||(26945662-26945981)
chr5 (137-337)||(36275535-36275734)
chr5 (194-337)||(11740534-11740677)
chr5 (13-174)||(11741969-11742129)
chr5 (13-103)||(36275733-36275822)
chr5 (196-289)||(28611667-28611761)
chr5 (2-50)||(28611980-28612028)
chr5 (2-50)||(42644878-42644926)
[»] chr6 (3 HSPs)
chr6 (68-337)||(4653575-4653841)
chr6 (1-334)||(24765199-24765534)
chr6 (124-333)||(33756400-33756603)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (1-337)||(59016-59338)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 38526816 - 38526479
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  38526816 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatatttctaggtataaaggttcctgggaatggagtaacttctca 38526717  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  38526716 taacttccattattcccatgaatttattctcatgtaaagagatgagaatgtgcattcccatgatattatgcatagattttaaaaaaaa----ttgtaact 38526621  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38526620 tccaattttttcaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatactcaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcc 38526521  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccatata 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38526520 tgggaataatttatgtttcccaaaaacaaacgcccccttata 38526479  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 18916017 - 18916354
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18916017 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatatttctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttccca 18916116  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagattt-nnnnnnnnnnnntttgtaac 199  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||              |||||||    
T  18916117 taacttccattattcccatgaatttattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatacatagatttaaaaaaaataaaaattgtaac 18916216  T
Q  200 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18916217 ttccaatttttccaggaatgtcaaattatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccaggtatgttattc 18916316  T
Q  300 ttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18916317 ctcggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 18916354  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41486803 - 41486470
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  41486803 ggaatacatggctaaggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacctccca 41486704  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  41486703 taacttccattattcccatgaatttattctcatgtaaagatatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagattttaaaaaaaaaa--ttgtaact 41486606  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||     
T  41486605 tccaatttatccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatatccaagaatcaaattttcatattttcagtcccggatatgttattcc 41486506  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41486505 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccc 41486470  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 1197425 - 1197761
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1197425 ggaatacatggctagggaatgattatatccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 1197524  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagattt-nnnnnnnnnnnntttgtaac 199  Q
    ||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||              |||||||    
T  1197525 taacttctatttttcc-atgaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaataaaataaaattgtaac 1197623  T
Q  200 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattc 299  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1197624 ttccaattttttctggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaggaatcaaattttcatattttcattcccggatatgttattc 1197723  T
Q  300 ttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
     || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1197724 ctgagaataatttgtgtttcccaaaaacacacgccccc 1197761  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 2735170 - 2734849
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2735170 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaattgagtaacttccca 2735071  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||| |||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||            || ||||||    
T  2735070 taacttccattattcgcat--------------gtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagattttaaaaaaaaaaatt-gtaact 2734986  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2734985 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcc 2734886  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2734885 tgggaatagtttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 2734849  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 35563620 - 35563939
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        |||  | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35563620 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgagcttgagaaaaaaaaattcatgggtataaaggttcctgggaatggagtaatttccca 35563719  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| ||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  35563720 taacttccattattcccat--------------gtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaa---ttgtaact 35563802  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  35563803 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccggatatgttattcc 35563902  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35563903 cggaaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 35563939  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 124 - 337
Target Start/End: Original strand, 38567513 - 38567724
Alignment:
Q  124 ttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaa 223  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38567513 ttattcccatgtaaagagatggggatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaa--ttgtaacttccaatttttccaagaatgtcaa 38567610  T
Q  224 gttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaa 323  Q
    ||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38567611 gttatttgccaaacacttttttgaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcctgggaataatttgtgtttcccaa 38567710  T
Q  324 aaacaaacgccccc 337  Q
    ||||||||||||||    
T  38567711 aaacaaacgccccc 38567724  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 193 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 9686509 - 9686365
Alignment:
Q  193 ttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtat 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9686509 ttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgacaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtat 9686410  T
Q  293 gttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9686409 gttattcctgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 9686365  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 193 - 337
Target Start/End: Original strand, 11661332 - 11661476
Alignment:
Q  193 ttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtat 292  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11661332 ttgtaacttccaattttttcaagaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacttaagaatcaaattttcatattttcattcccgagtat 11661431  T
Q  293 gttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661432 cttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 11661476  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 2001629 - 2001406
Alignment:
Q  13 tagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactttcatta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       |||| ||   ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2001629 tagggaatgattatacccatgtttgttacgaggttgagaaaaaaatattcctgaatataaaggttcctaggaatggagtaacttctcataacttccatta 2001530  T
Q  113 ttcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttcc 212  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||| |||||||||     
T  2001529 ttcccataaatttattcccatgaaaagatatgagaatgtgcattctcatgatattatgcatagattt---taaaaaaaatttgtaactttcaatttttct 2001433  T
Q  213 aggaatgtcaagttatttgccaaacac 239  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||    
T  2001432 aagaatgtcaagttatttaccaaacac 2001406  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Original strand, 11661178 - 11661318
Alignment:
Q  3 aatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccata 102  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11661178 aatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttcccata 11661277  T
Q  103 actttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagat 143  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  11661278 acttccattattcccatgaatttattcccatgtaaatagat 11661318  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 24697864 - 24697547
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24697864 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggtagagaaaaatatattcat-ggcataaaggttcttgggaatgaagtaacttccca 24697766  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    ||||||  |||||||||||              ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||              || |||||    
T  24697765 taacttcgattattcccat--------------gtaaagagatgtgaatgtgcattcccatgatattctgcatagattaaaaa---------ttataact 24697689  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnn------aacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||             |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  24697688 tccaattttcccaggaatgtcaagttattttccaaacactttttttttttttaacaaatacccatgaatcaaattttcatattttcattcccatgtatgt 24697589  T
Q  295 tattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccc 336  Q
    ||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24697588 tattcctaggaataatttatgtttccccaaaacaaacgcccc 24697547  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 9686661 - 9686516
Alignment:
Q  3 aatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccata 102  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9686661 aatacatggctagggaataattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcttgagtataaaggttcctgggaatggagtaacttcccata 9686562  T
Q  103 actttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaa 148  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  9686561 acttccattattcccatgaatttattcctatgtaaagagatgggaa 9686516  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 258 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 1996396 - 1996317
Alignment:
Q  258 aagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1996396 aagaatcaaattttcatattttcgttcccggatatgttattcctgagaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 1996317  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43596347 - 43596192
Alignment:
Q  84 aatggagtaacttcccataactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnn 183  Q
    |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||        
T  43596347 aatgaagtatcttctcataacttccattattcccatgaatttattctcgtgtaaagagttgggaatgtgcattcccgtaatattctgcatagatttaaaa 43596248  T
Q  184 nnnnnnnntttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacac 239  Q
             ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43596247 aaaataaaattgtaactttcaattttttcaggaatgtcaaattatttgtcaaacac 43596192  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 38567035 - 38567126
Alignment:
Q  3 aatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaac 94  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38567035 aatacatggctaggggatgattatatccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaac 38567126  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 43596412 - 43596365
Alignment:
Q  3 aatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgag 50  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  43596412 aatacatggttagggaatgataatacacatttttgttatgaggttgag 43596365  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 43596157 - 43596095
Alignment:
Q  269 tttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaac 331  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||| ||  || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43596157 tttcatattttcattttcggatatgttttttctgagaataatttgtgtttccccaaaacaaac 43596095  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 50
Target Start/End: Original strand, 43595900 - 43595933
Alignment:
Q  17 gaatgattatacccatgtttgttatgaggttgag 50  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43595900 gaatgattatacccgtgtttgttatgaggttgag 43595933  T

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Target: chr3 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 24)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 8082218 - 8082552
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8082218 ggaatacatggctagggaatgattatatccatttttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttccca 8082317  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  8082318 taacttccattattcccatgaatatattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaa--ttgtaact 8082415  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8082416 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcc 8082515  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8082516 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 8082552  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 41958311 - 41957976
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41958311 ggaatacatggctagggaatgattatatccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttccca 41958212  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             | ||||||    
T  41958211 taacttccattattcccatgaatatattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaaa-tcgtaact 41958113  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41958112 tccaattttttcaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcc 41958013  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41958012 tgaaaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 41957976  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 11685618 - 11685948
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  11685618 ggaatacatggctaaggaataattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttctca 11685717  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  11685718 taacttccattattcccatgaatttattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagattttaaaaaaaaaa--ttgtaact 11685815  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  11685816 tccaatttttacaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattctcgggtatgttattcc 11685915  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgc 333  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11685916 tatgaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgc 11685948  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 37608970 - 37609304
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  37608970 ggaatacatggttagggaatgattagacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcct-ggtataaaggtttctgggaatagagtaacttccca 37609068  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||            || ||||||    
T  37609069 tgacttccattattcccataaacttattcccatgtaaagagatgagaatgtacattatcatgatattatgcatagatttttaaaaaaaaaatt-gtaact 37609167  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  37609168 tccaatttttctaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcactcccgggtatgttattcc 37609267  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37609268 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 37609304  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 28246741 - 28247074
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  28246741 ggaatacatgactagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctagatataaaggttcatgggaatggagtaacttctca 28246840  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||| || || ||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  28246841 taacttccattatgcc-atgaatttattcccatataaagatatgagaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttttaaaaaaaaa--ttgtaact 28246937  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28246938 tccaatttttccacgaatgtcaagttatttgacaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcc 28247037  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28247038 tgggaataatttgtatttcccaaaaacaaacgccccc 28247074  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Original strand, 53151409 - 53151739
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  53151409 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatcaggttgagaaaaaaatattcctaggtataaaggttcctgagaatggagtaacttccca 53151508  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagattt--nnnnnnnnnnnntttgtaa 198  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||                |||||    
T  53151509 taacttccattattcccatgaatttattcccatgtaaagagatgagaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaaaaaaatgtaa 53151608  T
Q  199 cttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttatt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53151609 cttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacattttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttatt 53151708  T
Q  299 cttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaac 331  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  53151709 cctgggaataa--tgtgtttcccaaaaacaaac 53151739  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18996906 - 18996573
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnn-tatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccc 99  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18996906 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtt-gttatgaggttgaggaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttccc 18996808  T
Q  100 ataactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaac 199  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||             |||||||    
T  18996807 ataacttccattattcccatgaatttattcccatgtaaagggatggaaatgtgcattcccatgatattatgcataaatttttaaaaaaaa---ttgtaac 18996711  T
Q  200 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18996710 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttaccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattctcgggtatgttattc 18996611  T
Q  300 ttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18996610 ctaggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 18996573  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 18999445 - 18999112
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnn-tatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccc 99  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18999445 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtt-gttatgaggttgaggaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttccc 18999347  T
Q  100 ataactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaac 199  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||             |||||||    
T  18999346 ataacttccattattcccatgaatttattcccatgtaaagggatggaaatgtgcattcccatgatattatgcataaatttttaaaaaaaa---ttgtaac 18999250  T
Q  200 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18999249 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttaccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattctcgggtatgttattc 18999150  T
Q  300 ttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18999149 ctaggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 18999112  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3777590 - 3777296
Alignment:
Q  2 gaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccat 101  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3777590 gaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctaggtataaaggttcttgagaatggagtaacctcccat 3777491  T
Q  102 aactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaactt 201  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||             |||||||||    
T  3777490 aacttccattattcccatgaatttattcccatgtaaagagatggaaatgtgcattcccatgatattatgcatagattttaaaaaaaaaa--ttgtaactt 3777393  T
Q  202 ccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttatt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3777392 ccaatttttccaggaatgtcaagttatctgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattctcggatatgttatt 3777296  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 337
Target Start/End: Original strand, 13696562 - 13696875
Alignment:
Q  30 catgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactttcattattcccataaatttattc 129  Q
    |||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13696562 catgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttcccataacttccattattcccatgaacttattc 13696661  T
Q  130 tcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagattt------nnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaa 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                   |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13696662 ccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaaaaaaaaaattgtaacttccaattttttcaggaatgtcaa 13696761  T
Q  224 gttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaa 323  Q
    ||||||||||||||||       |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13696762 gttatttgccaaacactttttttaacaaatactcaataatcaaattttcatattttcattctcgggtatgttattcctgggaataatttgtgtttcccaa 13696861  T
Q  324 aaacaaacgccccc 337  Q
    ||||||||||||||    
T  13696862 aaacaaacgccccc 13696875  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24373388 - 24373069
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24373388 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacctccca 24373289  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||||||||||||||||              ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  24373288 taactttcattattcccat--------------gtaaagagatgagaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaa--ttgtaact 24373205  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  24373204 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattccc-gatatgttattcc 24373106  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24373105 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 24373069  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 80 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 45572912 - 45572651
Alignment:
Q  80 tgggaatggagtaacttcccataactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagattt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45572912 tgggaatggagtaacttcccataacttccattattctcatgaatatattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagattt 45572813  T
Q  180 nnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatatttt 279  Q
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  45572812 aaaaaaaaaaa--ttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatatttt 45572715  T
Q  280 cattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccatatat 343  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45572714 cattcccgggtatgttattcccgagaataatttatgtttcccaaaaacaaacgcccccttatat 45572651  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 30800892 - 30801213
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatt-tctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccc 99  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  30800892 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattctttaggtataaaggttactgggaatggagtaacttctc 30800991  T
Q  100 ataactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaac 199  Q
    ||||||| ||||||| ||||              |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||            |  |||||    
T  30800992 ataacttccattatttccat--------------gtaaagagatgggaatatgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaaat--gtaac 30801075  T
Q  200 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30801076 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattc 30801175  T
Q  300 ttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30801176 ctgagaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 30801213  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 193 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30260797 - 30260653
Alignment:
Q  193 ttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtat 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  30260797 ttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccggaaat 30260698  T
Q  293 gttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    |||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30260697 gttattccagaaaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 30260653  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 30261007 - 30260891
Alignment:
Q  3 aatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccata 102  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30261007 aatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttcccata 30260908  T
Q  103 actttcattattcccat 119  Q
    |||| ||||||||||||    
T  30260907 acttccattattcccat 30260891  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 20329609 - 20329462
Alignment:
Q  5 tacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttc---------ttgggaatggagtaact 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||       |||| || |||||||||||||         ||||||||| |||||||    
T  20329609 tacatgattaggggatgattatactcatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcct-ggtataaaggttcctaggtttcttgggaatgaagtaact 20329511  T
Q  96 tcccataactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatg 144  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20329510 tcccataactttcattattcctataaatttattcccatgtaaagagatg 20329462  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20307461 - 20307322
Alignment:
Q  195 gtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgt 294  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||       |||||||||| || |||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||    
T  20307461 gtaacttccagtttttccaagaatgttaagttatttgccaaacacttattttaacaaatacccaataatcaaatttttataatttcattctcggatatgt 20307362  T
Q  295 tattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcc 334  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20307361 tattcctgaaaataatttgtgtttctccaaaacaaacgcc 20307322  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 80 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20307549 - 20307463
Alignment:
Q  80 tgggaatggagtaacttcccataactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatatt 167  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  20307549 tgggaatgaagtaacgtcc-ataactttcattattcctatgaatttattctcatgtaaagagatgagaatgtgcattcccataatatt 20307463  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 316
Target Start/End: Original strand, 54162906 - 54163030
Alignment:
Q  192 tttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggta 291  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||       || ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  54162906 tttgtaacttctaattttcccaggaatgtcaacttattcgccaaacacttttattaaaaaatacctaggaatcaaattttcatatttttattcccggata 54163005  T
Q  292 tgttattcttgggaataatttgtgt 316  Q
     ||||||| |||| |||| ||||||    
T  54163006 agttattcctgggtataacttgtgt 54163030  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 30260862 - 30260816
Alignment:
Q  193 ttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacac 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30260862 ttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacac 30260816  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 54162734 - 54162832
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccc 99  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||       |||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  54162734 ggaatccatggttagggaatgattatacccatgtttgttataaggtcgagaaaaaaatattcctaggtacaaaggttcctgggaatgaagtaacttccc 54162832  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 45572975 - 45572926
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgag 50  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45572975 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgag 45572926  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 8 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 20307629 - 20307590
Alignment:
Q  8 atgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggtt 47  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20307629 atgattaggggatgattatactcatgtttgttatgaggtt 20307590  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 41296050 - 41296003
Alignment:
Q  3 aatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgag 50  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  41296050 aatacatgactagagaatgattatactcatgtttgttataaggttgag 41296003  T

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Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 7)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 15805628 - 15805961
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15805628 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttccca 15805727  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  15805728 taacttccattattcccatgaatatattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaa---ttgtaact 15805824  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||       |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  15805825 tccaatttttccagaaatgtcaagttatttgtcaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttaatattttcattcccgggtatgttattcc 15805924  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15805925 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 15805961  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 22 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 30518763 - 30518449
Alignment:
Q  22 attatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactttcattattcccataa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  30518763 attatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaa-tattcctgggtataaaggttcctgggaattgagtaacttcccataacttccattattcccatga 30518665  T
Q  122 atttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttccaggaatgtc 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||             |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30518664 atttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatatattttttaaaaaaaaaattgtaacttccaatttttccaggaatgtc 30518565  T
Q  222 aagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttccc 321  Q
    ||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30518564 aagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcatgggaataatttgtgtttccc 30518465  T
Q  322 aaaaacaaacgccccc 337  Q
    ||||||||||||||||    
T  30518464 aaaaacaaacgccccc 30518449  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 27641359 - 27641019
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27641359 ggaatacatgactagggaataattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatatttctgggtataaagattcctgggaatggagtaacttccca 27641260  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagattt-nnnnnnnnnnnntttgtaac 199  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||              |||||||    
T  27641259 taacttccattatttccatgaatttattctcatgtaaagagatgagaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaataaaaattgtaac 27641160  T
Q  200 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattc 299  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27641159 tttcaatttttccaggaatgccaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgagtatgttattc 27641060  T
Q  300 ttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccata 340  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27641059 ctgggaataatttttgtttcccaaaaacaaacgcccccata 27641019  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 32597689 - 32597353
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32597689 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgagaatggagtaacttccca 32597590  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  32597589 taacttccattattcccatgaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagattttaaaataaaaaaattgtaact 32597490  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||      
T  32597489 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgctaaacattttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccggatatattatttc 32597390  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32597389 tgagaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 32597353  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 5614411 - 5614745
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5614411 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcttgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttccca 5614510  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  5614511 taacttccattattcccatgaatttattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaa--ttgtaact 5614608  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||     
T  5614609 ttcaatttttccaagaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatatccaagaatcaaatttttatattttcattcccgagtatattattcc 5614708  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5614709 tgggaatagtttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 5614745  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 34580297 - 34580248
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgag 50  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34580297 ggaatacatggttagggaatgattatacccatgtttgttatgagattgag 34580248  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 36871261 - 36871208
Alignment:
Q  66 ggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactttcattattcccat 119  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||||    
T  36871261 ggtatgaaggttcttgggaatagaataacttcccataacttccaatattcccat 36871208  T

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Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 18)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 20372313 - 20372650
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  20372313 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaattgagtaacttccca 20372412  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagattt-nnnnnnnnnnnntttgtaac 199  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||              |||||||    
T  20372413 taacttccattattcccatgaatttattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaaaaattgtaac 20372512  T
Q  200 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20372513 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacacaagaatcaaattttcatattttcattctcgggtatgttattc 20372612  T
Q  300 ttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20372613 ctgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 20372650  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47266583 - 47266248
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  47266583 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacctccca 47266484  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  47266483 taacttccattattcccatgaatttattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagattttaaaaaaaaaa--ttgtaact 47266386  T
Q  201 tccaa--tttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttatt 298  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47266385 tccaatttttttccaggaatgtcaagttattttccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccggatatgttatt 47266286  T
Q  299 cttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccc 336  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47266285 cctgagaataatttgtgtttcccaaaaacaaacccccc 47266248  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 30586380 - 30586052
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  30586380 ggaatacatgactagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttctca 30586281  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| ||||||||||||              ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  30586280 taacttccattattcccat--------------gtaaagagatgagaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaa---ttgtaact 30586198  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30586197 tccaattttttcaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatactcaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcc 30586098  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccatatatgtg 346  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30586097 tggaaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccttagatgtg 30586052  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 44080171 - 44079876
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44080171 ggaatacatggttagggaatgattatatccatgtttgttatgaggttgagaaaaatatattcctggatataaaggttcctgggaatggagtaacttccca 44080072  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||             ||||||||    
T  44080071 taactttcattattcccataaatttatttccatgtaaagagacgggaatgtgcattcccatgatattacgcatagatttaaaaaaaaaa---ttgtaact 44079975  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattc 299  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44079974 tccaatttttccagtaatatcaagttatttgtcaaacactttttttaacaaatacctaagaatcaaattttcatattttcattctcgggtatgttattc 44079876  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 49141832 - 49142158
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49141832 ggaatacatggctaaggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttccca 49141931  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| ||||||||              ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||              |||||||    
T  49141932 taacttccattattc--------------tcatgtaaagagatgggaatgtatattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaaaaatgtaact 49142017  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49142018 tccaattttttcaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcc 49142117  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccatat 341  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49142118 tgggaataattagtgtttcccaaaaacaaacgcccccatat 49142158  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31293340 - 31293017
Alignment:
Q  3 aatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccata 102  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||       ||||  | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  31293340 aatacatggctagggaatgat-atactcatgtttgttacgaggttgagaaaaaaatattcttcggtataaaggttcatgagaatggagtaacttcccata 31293242  T
Q  103 actttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttc 202  Q
    |||| ||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||||    
T  31293241 acttccattattcccat--------------gtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttttaaaaaaaaa--ttgtaacttc 31293158  T
Q  203 caatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttg 302  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31293157 caattttttcgggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcctg 31293058  T
Q  303 ggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccatatat 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31293057 ggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccttatat 31293017  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 80 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 41743378 - 41743126
Alignment:
Q  80 tgggaatggagtaacttcccataactttcattattcccataaatttattctcatgta--aagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagat 177  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41743378 tgggaatgaagtaacttcccataacttccattattcctatgaatttattcacatatataaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagat 41743279  T
Q  178 ttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatatt 277  Q
    ||             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  41743278 ttaaaaaaaaaa---ttgtaacttccaattttttcaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatatccaagaatcaaattttcatatt 41743182  T
Q  278 ttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgc 333  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41743181 ttcatttccgggtatgttattcctggaaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgc 41743126  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 3 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43175155 - 43174979
Alignment:
Q  3 aatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccata 102  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||       ||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  43175155 aatacatggttaggaaatgactatacccatgtttgttatgagattgagaaaaaaatatttttagatataaaggttcctgggaatgaagtaactttccata 43175056  T
Q  103 actttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagattt 179  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  43175055 actttcaatattcccattaattttttcctatataaagagatgggaatgtgcatttccatgatattctgcatagattt 43174979  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 335
Target Start/End: Original strand, 22916552 - 22916884
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaagg-ttcttgggaatggagtaacttccc 99  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||| | ||| | |||||| | |||||| ||    
T  22916552 ggaatacatggttagagaatgattatactcatgtttgttatgaggttgagaaaaat-tattcctaggtataaaagattcctaggaatgaaataactttcc 22916650  T
Q  100 ataactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaac 199  Q
    | ||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||             |||||||    
T  22916651 agaacttcccttattcccatgaattgattcccatgtaaaaagttgggaatgtgcattcccatgatattctgcatagatttaaaaaaaaaaa--ttgtaac 22916748  T
Q  200 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattc 299  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||        |||||||||  | |||||||  |||||||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  22916749 tttcaatttttccaagaatgtcaagttatttgctaaacattttttttaacaaatactcaggaatcaaaatttcatattttcatccccagatatattattc 22916848  T
Q  300 ttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccc 335  Q
        ||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  22916849 caatgaataatttgtgttttcccaaaacaagcgccc 22916884  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 31577533 - 31577403
Alignment:
Q  194 tgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatg 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||    
T  31577533 tgtaacttccaatatttccaggaatgtcaagttatttgctaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaatttttatattttcatttccgagtatg 31577434  T
Q  294 ttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaa 325  Q
    |||||| || | |||||||||||| |||||||    
T  31577433 ttattcctgag-ataatttgtgttccccaaaa 31577403  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 247 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 32031451 - 32031361
Alignment:
Q  247 aacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32031451 aacaaatatccaagaatcaaattttcatattttcattcccagatatgttattcctaagaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 32031361  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 119
Target Start/End: Original strand, 8047728 - 8047844
Alignment:
Q  3 aatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccata 102  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  8047728 aatacatggttagagaatgattgtattcatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatatttttaggtatgaaggttcttggaaatgaagtaacttctcata 8047827  T
Q  103 actttcattattcccat 119  Q
    |||| | ||||||||||    
T  8047828 acttcctttattcccat 8047844  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 254 - 337
Target Start/End: Original strand, 27620187 - 27620270
Alignment:
Q  254 acctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27620187 acctatgaatcaaattttcatattttcatttccagatatgctattcctgtgaataatttgtgtttccctaaaacaaacgccccc 27620270  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 337
Target Start/End: Original strand, 8048231 - 8048367
Alignment:
Q  193 ttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtat 292  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |       |||||||||||| |||        |||||||||||||||||| ||     
T  8048231 ttgtaacttccaattttcccaggaatgtcaatttatttgccaaacgctttttttaacaaatacctaggaa--------tcatattttcattcccggataa 8048322  T
Q  293 gttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    ||||||   | |||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  8048323 gttatttccgagaataatttgtgtttctccgaaacaaacgccccc 8048367  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 41743439 - 41743391
Alignment:
Q  2 gaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgag 50  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41743439 gaatacatggctagggaatgattatacacatgtttgttatgaggttgag 41743391  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 179
Target Start/End: Original strand, 27620063 - 27620118
Alignment:
Q  124 ttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagattt 179  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  27620063 ttattctcatgtaaagaggtggaaatgtgcattcccataatattctgcatagattt 27620118  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31577597 - 31577554
Alignment:
Q  136 aaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagattt 179  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31577597 aaagaggtgggaatgtgcattcccatgatattatgcatatattt 31577554  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 27619965 - 27620014
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgag 50  Q
    |||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  27619965 ggaatacatggttagagaatgattgtatccatgtttgttatgaggatgag 27620014  T

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Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 45360506 - 45360172
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45360506 ggaatacatggttagggaatgattatatccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctaggtataaaggttcctgggaatggagtaacttccca 45360407  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  45360406 taacttccattatttccatgaatatattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaa--ttgtaact 45360309  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||     
T  45360308 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttgatattttcattccgaggtatgttattcc 45360209  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45360208 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 45360172  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 19565499 - 19565165
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || || |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19565499 ggaatacatggctaggaaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaa-tattcctgggcataaaggttcgtgggaatagagtaacttccca 19565401  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||             ||||||||    
T  19565400 taacttccattattcccataaatttattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcataaatttaaaaaaaaaaa--ttgtaact 19565303  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  19565302 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaagaaatacccaagaatcaaattttcatattttcatttccgaatatgttattct 19565203  T
Q  301 tgggaataa-tttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19565202 tgggaataattttgtgttttccaaaaacaaacgccccc 19565165  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 5555528 - 5555196
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |       |||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  5555528 ggaatacatggttagggaatgattatacccatgtttattatcaggttgcgaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggagtggagtaacctccta 5555429  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  5555428 taacttccattattcccatgaatttattcgcatgtaaagagatgagaatgtgcattcccatgatattatgcatagattttaaaaaaaaa---ttgtaact 5555332  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||       |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  5555331 tccaatttttccagaaatgtcaagttattcgccaaacactttttttaacaaatatccaagaatcaaatttttatattttcattcccgggtatgttatttc 5555232  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccc 336  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5555231 tgagaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccc 5555196  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 40125747 - 40125432
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  40125747 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattccttggtataaaggttcctgagaatcgagtaacttccca 40125648  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  40125647 taacttccattattcccatgaatttattcccatgtaaagatataggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaa--ttgtaact 40125550  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  40125549 tccaatttttccaggaatgtcaagttatatgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgagtatgttgttcc 40125450  T
Q  301 tgggaataatttgtgttt 318  Q
    |||||||| |||||||||    
T  40125449 tgggaatagtttgtgttt 40125432  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14236712 - 14236393
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  14236712 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctaggtataaaggttcctgggaatagagtaacttccca 14236613  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||              ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  14236612 taacttccattattcc--------------catgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagattttaaaaaaaaaaaattgtaact 14236527  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||        |||||||||||||||||||||||||     
T  14236526 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaa--------attttcattcccgggtatgttattcc 14236435  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccatata 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14236434 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccctata 14236393  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 21620375 - 21620060
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||  |||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  21620375 ggaatacatggttaggaaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgagtataaaggttcctaggaatagagtaacttccca 21620276  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||             ||||||||    
T  21620275 taacttccattattcccataaacttattcccatgtaaagagatgggaatgtacattcccatgatattatgtatagattttaaaaaaaaaa--ttgtaact 21620178  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaaca-cnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattc 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21620177 tccaatttttctaggaatgtcaagttatttgctaaacacctttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccaggtatgttattc 21620078  T
Q  300 ttgggaataatttgtgtt 317  Q
     |||||||||||||||||    
T  21620077 ctgggaataatttgtgtt 21620060  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 333
Target Start/End: Original strand, 43068903 - 43069215
Alignment:
Q  3 aatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccata 102  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43068903 aatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcct-ggtataaaggttcctgggaatggagtaacttcccata 43069001  T
Q  103 actttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttc 202  Q
    |||| ||| ||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||||    
T  43069002 acttccatcattcccat--------------gtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaa---ttgtaacttc 43069084  T
Q  203 caatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttg 302  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||        |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  43069085 caattttttcagaaatgtcaaattatttgccaaacattttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgagtatgttattcctg 43069184  T
Q  303 ggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgc 333  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43069185 ggaataatttgtgtttttcaaaaacaaacgc 43069215  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 337
Target Start/End: Original strand, 32550356 - 32550552
Alignment:
Q  137 aagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaa 236  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32550356 aagatatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttttaaaaaaa----ttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaa 32550451  T
Q  237 cacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccc 336  Q
    |||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32550452 cactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgagtatgttattcctgtgaattatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccc 32550551  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3656824 - 3656524
Alignment:
Q  13 tagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactttcatta 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  3656824 tagggaatgattataccaatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcatgggaatggagtaacttctcataacttccatta 3656725  T
Q  113 ttcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttcc 212  Q
    ||||              |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||| ||||||||||    
T  3656724 ttcc--------------catgtacagagatgggaatatgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaaa-ttgtaactttcaatttttcc 3656640  T
Q  213 aggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataattt 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       |||||| ||| |||||||||        ||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  3656639 aggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaacacccaagaatcaa--------attttcattccctaatatgttattcctgggaataattt 3656548  T
Q  313 gtgtttcccaaaaacaaacgcccc 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3656547 gtgtttcccaaaaacaaacgcccc 3656524  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 25473712 - 25473837
Alignment:
Q  13 tagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactttcatta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25473712 tagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttcccataacttccatta 25473811  T
Q  113 ttcccataaatttattctcatgtaaa 138  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  25473812 ttcccatgaatatattcccatgtaaa 25473837  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4643797 - 4643587
Alignment:
Q  124 ttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaa 223  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||  |||             |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  4643797 ttattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattctacataatttttttaaaaaaaa--ttgtaacttccaattttcttaggaatgtcaa 4643700  T
Q  224 gttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaa 323  Q
     ||||| |||||||||       |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4643699 attattcgccaaacactttttttaacaaatacccatgaatcaaattttcatattttcattcctggatatgttattcttgggaataatttgtgtttccccg 4643600  T
Q  324 aaacaaacgcccc 336  Q
    |||||||| ||||    
T  4643599 aaacaaacacccc 4643587  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 3 - 103
Target Start/End: Original strand, 32550257 - 32550357
Alignment:
Q  3 aatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccata 102  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32550257 aatacatggctagggaatgattatacccatgtttattatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttcccata 32550356  T
Q  103 a 103  Q
    |    
T  32550357 a 32550357  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 193 - 335
Target Start/End: Original strand, 6694055 - 6694200
Alignment:
Q  193 ttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaata-cctaagaatcaatttttcatattttcattccc--ggg 289  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||       |||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||| |  |||    
T  6694055 ttgtaacttccaattttttcaggaatgtcaagttatttgctaaacactttttttaacaaataccccacgaatcaaattttcatattttcattctcagggg 6694154  T
Q  290 tatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccc 335  Q
    |   |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  6694155 ttgtttattcctgggaataatttgtgtttccccaaagcaagcgccc 6694200  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 169
Target Start/End: Original strand, 25304194 - 25304347
Alignment:
Q  16 ggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactttcattattc 115  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||       |||| ||| ||| |||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||   ||||||    
T  25304194 ggaatggttatacc-atgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctaagtaaaaaggtacttgtgaatgaagtaacttctcataacttctcttattc 25304292  T
Q  116 ccataaatttattctcatgtaa-agagatgggaatgtgcattctcatgatattat 169  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||| |||||||||||    
T  25304293 ccatgaatttattctcatgtaagaaagtgggaaatgtgcattcccatgatattat 25304347  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 119
Target Start/End: Original strand, 6693909 - 6694026
Alignment:
Q  2 gaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccat 101  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |       |||| |||||||||||  ||| || ||||| ||||||||| |||    
T  6693909 gaatacatgactagggaatgattatactcatgtttgttatgaggttgtgaaaaaaatattcctaggtataaaaattcatgtgaatgaagtaacttctcat 6694008  T
Q  102 aactttcattattcccat 119  Q
    | ||||||||||| ||||    
T  6694009 acctttcattatttccat 6694026  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 3027869 - 3027730
Alignment:
Q  193 ttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnna-acaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggta 291  Q
    ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||         ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  3027869 ttgtaacttacaattttcccgtgaatgtcaagttatttgtcaaacacttttttttgacaaatacccaggaatcaaattttcatattttcattccgaggta 3027770  T
Q  292 tgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaac 331  Q
     ||||||| || |||||||||||||||| | |||||||||    
T  3027769 agttattcctgagaataatttgtgtttcactaaaacaaac 3027730  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 16296624 - 16296792
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |       |||| ||| |||||||||||||| |||||  | ||||||   |    
T  16296624 ggaatacatggctagggattgattatatccatatttgttatgaggttgggaaaaaaatattcctaagtataaaggttcttcggaattaattaacttttta 16296723  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattat 169  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||| ||| ||||  |  ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  16296724 taacttcccttattcccatgaatttattttcacgtaagaaagtggaaatgtgcattcccatgatattat 16296792  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 239
Target Start/End: Original strand, 2782444 - 2782491
Alignment:
Q  192 tttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacac 239  Q
    ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2782444 tttgtaacttttaattttttcaggaatgtcaacttatttgccaaacac 2782491  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 35371889 - 35371934
Alignment:
Q  194 tgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacac 239  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  35371889 tgtaacttccaattttttcaggaatgccaacttatttgtcaaacac 35371934  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 247 - 319
Target Start/End: Original strand, 25304381 - 25304453
Alignment:
Q  247 aacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttc 319  Q
    |||||||||| | |||| |  |||| |||||||| |||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  25304381 aacaaatacccaggaattatatttttatattttcgttcccgagtaagttatttctgggaataatttgtgtttc 25304453  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 47
Target Start/End: Original strand, 35371574 - 35371618
Alignment:
Q  3 aatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggtt 47  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35371574 aatacatggctagagaatgattatacccatgtttgttataaggtt 35371618  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 340
Target Start/End: Original strand, 35371966 - 35372038
Alignment:
Q  268 ttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccata 340  Q
    |||||||||||| |||  |||||| ||||||| |||| ||||||||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  35371966 ttttcatatttttattttcgggtaagttattcctgggtataatttgtgtgtcaccgaaacaaacgtccccata 35372038  T

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Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 9033833 - 9034168
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  9033833 ggaatacatggttagggaatgattatactcatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaactttcca 9033932  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  9033933 taacttccattattcccatgaatatattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaa--ttgtaact 9034030  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattccc-gggtatgttattc 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  9034031 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgtcaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttaatattttcattcccggggtatgttattc 9034130  T
Q  300 ttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9034131 ctgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 9034168  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26696161 - 26695825
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnn-tatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccc 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  26696161 ggaatacatgactagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaaatatttctgggtataaaggttcatggaaatagagtaacttccc 26696062  T
Q  100 ataactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaac 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||            || |||||    
T  26696061 ataacttccattattcccataaacttattcccatgtaaagagatgggaatgtacattcccatgatattatgcatagattttttttaaaaaaatt-gtaac 26695963  T
Q  200 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattc 299  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26695962 ttccaatttttctaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattc 26695863  T
Q  300 ttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26695862 ctgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgtcccc 26695825  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39502924 - 39502590
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39502924 ggaatacatgattagggaatgattatatccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaa-attcctaggtataaaggttcctgggaatggagtaacttccca 39502826  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  39502825 taacttccattattcccatgaatttattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagattttaaaaaaaaaaa-ttgtaact 39502727  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39502726 tccaattttttcaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcc 39502627  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  39502626 tgaaaataatttgtgtttcccaaaaataaacaccccc 39502590  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 335
Target Start/End: Original strand, 40590940 - 40591265
Alignment:
Q  7 catgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40590940 catgattagggaatgattatactcatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctggatataaaggttcctgggaatggagtaacttcccataactt 40591039  T
Q  107 tcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaat 206  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||||||||    
T  40591040 ccattattcccatgaatttattctcatgttaagaggtgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaa---ttgtaacttccaat 40591136  T
Q  207 ttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaa 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||       || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40591137 ttttccaggaatgtcaaattatttgccaaacactttttttaataaatacccaagaatcaaattttcatattttcattctcgggtatgttattcctgggaa 40591236  T
Q  307 taatttgtgtttcccaaaaacaaacgccc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40591237 taatttgtgtttcccaaaaacaaacgccc 40591265  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 44506450 - 44506118
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44506450 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcttgggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 44506351  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             |||||| |    
T  44506350 taacttccattattcccataaatatattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaa---ttgtaatt 44506254  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||     
T  44506253 tccaattttttcaggaatgttaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccagatatgttattcc 44506154  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccc 336  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44506153 tggaaataatttgtgttttccaaaaacaaacgcccc 44506118  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 7 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 56080926 - 56080599
Alignment:
Q  7 catgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactt 106  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  56080926 catgactagggaatgattatactcatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaactttccataactt 56080827  T
Q  107 tcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaat 206  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||||||||    
T  56080826 ccattattcccatgaatttattctcatgttaagaggtgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaa---ttgtaacttccaat 56080730  T
Q  207 ttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  56080729 ttttccaggaatgtcaagttatttgtcaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattctcgggtatgttattcctgggaa 56080630  T
Q  307 taatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  56080629 taatttgtgtttcccaaaaataaacgccccc 56080599  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 29051830 - 29052168
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  29051830 ggaatacatggctagggaatgattatacccatatttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaagttcatgggaatggagtaacttctca 29051929  T
Q  101 taactttcattattcccataaattt-attctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnnttt-gtaa 198  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||             || ||||    
T  29051930 taacttccattattcccatgaattttattcccatgtaaagagatgagaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaaaattagtaa 29052029  T
Q  199 cttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttatt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29052030 cttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggcatgttatt 29052129  T
Q  299 cttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29052130 cctgagaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 29052168  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24072710 - 24072389
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24072710 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttccca 24072611  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| ||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||            || ||||||    
T  24072610 taacttccattattcccat--------------gtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaaatt-gtaact 24072526  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24072525 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcc 24072426  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24072425 tggaaatagtttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 24072389  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 37995782 - 37995448
Alignment:
Q  2 gaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccat 101  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  37995782 gaatacatggttacggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaa-tattcatgggtataaaggttccttggaatggagtaacttcccat 37995684  T
Q  102 aactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaactt 201  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||               ||||||||    
T  37995683 aacttccattattcctatgaatttattcccatgtaaagagatgagaatgtgcattcccatgatattatacatatattctaaaaaaaaaa---tgtaactt 37995587  T
Q  202 ccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattctt 301  Q
     |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||| |    
T  37995586 tcaatttttccagaaatatcaagttatttgccaaacattttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccggataaattattcct 37995487  T
Q  302 gggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccata 340  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37995486 gagattaatttgtgtttcccaaaaacaaacgtccccata 37995448  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 125 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 39499462 - 39499251
Alignment:
Q  125 tattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaag 224  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||            || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39499462 tattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaaatt-gtaacttccaattttttcaggaatgtcaag 39499364  T
Q  225 ttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaa 324  Q
    |||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  39499363 ttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcctgaaaataatttgtgtttcccaaa 39499264  T
Q  325 aacaaacgccccc 337  Q
    || |||| |||||    
T  39499263 aataaacaccccc 39499251  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 2623309 - 2623450
Alignment:
Q  193 ttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtat 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2623309 ttgtaacttccaattttttcaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtat 2623408  T
Q  293 gttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcc 334  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2623409 gttattcctaggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcc 2623450  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Original strand, 127841 - 128142
Alignment:
Q  13 tagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactttcatta 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||| ||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  127841 tagggaatgattatactcatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgagtataaaggttcatgggaatgaagtaacttcccataacttctatta 127940  T
Q  113 ttcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttcc 212  Q
    |||||||              |||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||             |||||||||  ||||||||     
T  127941 ttcccat--------------gtaaagagatgggaatgtacattcccataatattatgcatagatttaaaaaaaaa----ttgtaacttttaatttttca 128022  T
Q  213 aggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataattt 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||       ||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  128023 aggaatgtcaagttatttgcaaaacacatcttttaacaaatattcaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcctgagaataattt 128122  T
Q  313 gtgtttcccaaaaacaaacg 332  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  128123 gtgtttcctaaaaacaaacg 128142  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 334
Target Start/End: Original strand, 51789986 - 51790318
Alignment:
Q  2 gaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccat 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||       |||| |||| ||||||||||  || ||||| ||||||||| |||    
T  51789986 gaatacatggttagggaatgattatactcatgtttgttatgaggtttagaaaaaaatattcctagatataaaggtttgtgagaatgaagtaacttctcat 51790085  T
Q  102 aactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaactt 201  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||| ||| ||||||               ||||||||    
T  51790086 aacttccattattcccatgaatttattctcatgtaaagaggtgaaaatgtgcattcccacgatattctgcctagattaaaaaaaaaaa----tgtaactt 51790181  T
Q  202 ccaatttttccaggaatgtca----agttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttat 297  Q
    |||||||| | |  |||||||    ||||| |||||||||||       || ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  51790182 ccaattttcctaaaaatgtcaagttagttagttgccaaacacttattttaataaatactcatgaatcaaattttcatattttcattcccatgtatgttat 51790281  T
Q  298 tcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcc 334  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51790282 tcatgggaataatttgtgtttccccaaaacaaacgcc 51790318  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 337
Target Start/End: Original strand, 45620212 - 45620535
Alignment:
Q  13 tagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactttcatta 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||       |||| ||  | || |||||||  || |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  45620212 tagggaatcattatacccatgtttgttataaggttgagaaaaaaatattcctgagcattaaggttcccggaaatgaagtaacttcccataacttccatta 45620311  T
Q  113 ttcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnnt-ttgtaacttccaatttttc 211  Q
    ||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||               ||||||||||||||||| |    
T  45620312 ttcccatgaatttattcccaa-taaagagatgagaatgtgcatttccatgatattctccatagattaaaaaaaaaaaaaaattgtaacttccaattttcc 45620410  T
Q  212 caggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatt 311  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||       | |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  45620411 caggaatgtcaagttatttgc-aaacactttttttagcaaatacccaggaatcaaattttcgtattttcattcccgtgtatgttattcctggaaataatt 45620509  T
Q  312 tgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    ||||| |||  |||||||||||||||    
T  45620510 tgtgtatcctcaaaacaaacgccccc 45620535  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 2623161 - 2623292
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2623161 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctaggtataagggttcttgggaatagagtaacttccca 2623260  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctca 132  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2623261 taacttccattattcccataaatttattctca 2623292  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 66 - 337
Target Start/End: Original strand, 31334992 - 31335266
Alignment:
Q  66 ggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgata 165  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  31334992 ggtataaaggttcctaggaatgaagtaactttccatgacttccattattcccatgaatttattctcatataaagagatggaaatgtgcattcccatgata 31335091  T
Q  166 ttatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatca 265  Q
    ||||||||||||||              ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||       || |||| |||| ||||||    
T  31335092 ttatgcatagatttaagaagtaaaaa-atgtaacttccaattttcgcatgaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaataaattcctatgaatca 31335190  T
Q  266 atttttcatattttcattcccgggtatgttattc----ttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    | |||||||||||| |||  ||  ||||||||||     || ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  31335191 aattttcatatttttattttcgactatgttattcctgactgagaataatttatgtttccccaaaacaaacgtcccc 31335266  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 68 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 54230984 - 54230924
Alignment:
Q  68 tataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactttcattattcccataaatttatt 128  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  54230984 tataaaggttcttgagaatgaagtaacttcccataactttcattattttcataaatttatt 54230924  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 239
Target Start/End: Original strand, 4238558 - 4238603
Alignment:
Q  194 tgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacac 239  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  4238558 tgtaacttccaatatttccaagaatgtcaacttatttaccaaacac 4238603  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 22602435 - 22602386
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgag 50  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22602435 ggaatacatggctagggaatgactataccaatgtttgttataaggttgag 22602386  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 91 - 179
Target Start/End: Original strand, 1581814 - 1581902
Alignment:
Q  91 taacttcccataactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagattt 179  Q
    ||||||| |||||||| | || |||||||| |||||||  ||||| |  || || |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  1581814 taacttctcataacttcccttgttcccatatatttatttccatgtgagaaggtgagaatgtgcattctcatgaaattgtgcatatattt 1581902  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 54230798 - 54230730
Alignment:
Q  268 ttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccc 336  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   | ||||||||||| ||| || |||| ||| |||||    
T  54230798 ttttcatattttcattcccggatatgttattaccgagaataatttgttttttcccaaaataaatgcccc 54230730  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 54231052 - 54231005
Alignment:
Q  2 gaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgag 50  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  54231052 gaatacatggttagggaatgattata-tcatgtttgttatgagattgag 54231005  T

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Target: chr5 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 15)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 25897793 - 25898128
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  25897793 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctaggaatggagtaacttccta 25897892  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||            || ||||||    
T  25897893 taacttccattattcccatgaatatattcccatataaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaaatt-gtaact 25897991  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25897992 tccaattttttcaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcc 25898091  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25898092 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 25898128  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22213601 - 22213263
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttc-taggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccc 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  22213601 ggaatacatggttagggaatgattatatccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatatttcctgggtataaaggttcctgggaatggagtaacttcct 22213502  T
Q  100 ataactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaac 199  Q
    |||| || |||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             |||||||    
T  22213501 ataatttccattattcccatgaatatattcccatgtaaagatatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagattttaaaaaaaaaa--ttgtaac 22213404  T
Q  200 ttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattc 299  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22213403 ttccaattttttcaagaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattc 22213304  T
Q  300 ttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccata 340  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22213303 ctgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccata 22213263  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 343
Target Start/End: Original strand, 42393903 - 42394248
Alignment:
Q  2 gaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccat 101  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||       |||| ||  |||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  42393903 gaatacatggctagggaatgattatacccatgtttattatgaggttgagaaaaaaatattcctgagtataaaggttcctgggaattaagtaacttcccat 42394002  T
Q  102 aactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaactt 201  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||             |||||||||    
T  42394003 aacttcaattattcccatgaatttattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaa----ttgtaactt 42394098  T
Q  202 ccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaa--------tttttcatattttcattcccgggtatg 293  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  42394099 tcaatttttccatgaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcatattttcattcccgggtatg 42394198  T
Q  294 ttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccatatat 343  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42394199 ttattcctggaaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccatatat 42394248  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 30493767 - 30494084
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30493767 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaagattcctgggaatggagtaacttccca 30493866  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| ||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||            || ||||||    
T  30493867 taacttccattattcccat--------------gtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaaatt-gtaact 30493951  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  30493952 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaataatcaaattttcatattttcattcccgggtatattattcc 30494051  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgc 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30494052 tgggaataatttgtgttttccaaaaacaaacgc 30494084  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 30534110 - 30534427
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30534110 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtataaagattcctgggaatggagtaacttccca 30534209  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| ||||||||||||              |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||            || ||||||    
T  30534210 taacttccattattcccat--------------gtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaaaaaaaaaatt-gtaact 30534294  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  30534295 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacccaataatcaaattttcatattttcattcccgggtatattattcc 30534394  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgc 333  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30534395 tgggaataatttgtgttttccaaaaacaaacgc 30534427  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 2 - 340
Target Start/End: Original strand, 13946252 - 13946582
Alignment:
Q  2 gaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccat 101  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13946252 gaatacatggctagggaatgattatatc-atgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctaggtataaaggttcctgagaatggagtaacttcccat 13946350  T
Q  102 aactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagattt---nnnnnnnnnnnntttgtaa 198  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||                ||||||    
T  13946351 aacttccattatttccatgaatttattcccatgtaaagagatgagaatgtgcattcccatgatattatgcatagatttaaaattaaaaaaaaaattgtaa 13946450  T
Q  199 cttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttatt 298  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  13946451 cttccaatttttccagaaatgtcaagttatttgccaaacattttttttaacaaatacccaagaatcaa--------attttcattctcgggtatgttatt 13946542  T
Q  299 cttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccccata 340  Q
    | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13946543 cctgggaataa--tatgtttcccaaaaacaaacgcccccata 13946582  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26674375 - 26674057
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26674375 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgagattgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctaggaatggagtaacttccca 26674276  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| ||||||||||||              ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||             ||||||||    
T  26674275 taacttccattattcccat--------------gtaaagagatgggaatgtgcagtcccataatattatgcatagatttaaaaaaaaa----ttgtaact 26674194  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||      
T  26674193 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacacaagaatcaaattttcatattttcattcccatatatgttatttc 26674094  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26674093 tggaaataatttgtgtttccccaaaacaaacgccccc 26674057  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 26945981 - 26945662
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26945981 ggaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgttatgagattgagaaaaaaatattcctgggtataaaggttcctaggaatggagtaacttccca 26945882  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| ||||||||||||              ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||             ||||||||    
T  26945881 taacttccattattcccat--------------gtaaagagatgggaatgtgcagtcccataatattatgcatagatttaaaaaaaaaa---ttgtaact 26945799  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||      
T  26945798 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacacaagaatcaaattttcatattttcattcccatatatgttatttc 26945699  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26945698 tggaaataatttgtgtttccccaaaacaaacgccccc 26945662  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 137 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 36275734 - 36275535
Alignment:
Q  137 aagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaa 236  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||            || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36275734 aagatatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatagattttttttaaaaaaatt-gtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaa 36275636  T
Q  237 cacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccc 336  Q
    |||       |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36275635 cactttttttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgagtatgttattcctggaaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcccc 36275536  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 194 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 11740677 - 11740534
Alignment:
Q  194 tgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatg 293  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  11740677 tgtaacttcctattttccaaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacacaggaatcaaattttcatattttcattcccgagtatg 11740578  T
Q  294 ttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    |||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11740577 ttatttctgagagtaatttgtgtttccccaaaacaaacgccccc 11740534  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11742129 - 11741969
Alignment:
Q  13 tagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtat-aaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactttcatt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||| | ||    
T  11742129 tagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgag-aaaaaatattcctgggtataaaagattcatgggaatgaagtaactt-tcataacttccctt 11742032  T
Q  112 attcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcata 174  Q
    ||||  || ||||||||| || | |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11742031 attcaaatgaatttattcccaagaaaagaggttggaatgtgcattgtcatgatgttatgcata 11741969  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 36275822 - 36275733
Alignment:
Q  13 tagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataa 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       |||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36275822 tagggaatgattatacacatgtttgttatgaggttgag-aaaaaatattcctgggtataaaggttcctcggaatggagtaacttcccataa 36275733  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 28611761 - 28611667
Alignment:
Q  196 taacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacac-nnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccggg 289  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||    
T  28611761 taacttccaatttttccatgaatgtcaagttatttgccaaacacttttttttaacaaatacctaggaatcaaatttttattttttcatttccggg 28611667  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 28612028 - 28611980
Alignment:
Q  2 gaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgag 50  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28612028 gaatacatggctagggaatgattatacccatgtttgctgtgaggttgag 28611980  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 42644878 - 42644926
Alignment:
Q  2 gaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgag 50  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42644878 gaatacatgggtagagaatgattatacccatgtttattatgaggttgag 42644926  T

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Target: chr6 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 3)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 68 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 4653841 - 4653575
Alignment:
Q  68 tataaaggttcttgggaatggagtaacttcccataactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatatt 167  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4653841 tataaaggttcctgggaatggagtaacttcccataacttccattattcccatgaacttattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatatt 4653742  T
Q  168 atgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaat 267  Q
    ||||||||||||             |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||     
T  4653741 atgcatagattttaaaaaaaaa---ttgtaacttccaattttttcaggaatgtcaagttatttgccaaacactttttttaacaaatacctaagaatcaaa 4653645  T
Q  268 ttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4653644 ttttcatattttcattctcgggtatgttattcctgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 4653575  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24765534 - 24765199
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||       |||| || ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||    
T  24765534 ggaatacatggttagggaatgatta--cccatgtttgttatgaggctgagaaaaaattattcctgggtataaagattcctgagaatgaagtaacttccca 24765437  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||              |||||||    
T  24765436 taacttccattattcccatgaacttattcccatgtaaagagatgggaatgtgcattcccatgatattttgcatagattttaaaaaagaaaa-ctgtaact 24765338  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgcc-----aaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgtt 295  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||||| |||     ||||||       |||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  24765337 ttcaattttcccatgaatgtcaagttattcgccaaattaaacactttttttaacaaatatccaggaatcaaattttcatattttcattcccgagtatatt 24765238  T
Q  296 attcttgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgcc 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24765237 attcctgggaataatttgtgtttccccaaaacaaacgcc 24765199  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 124 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33756603 - 33756400
Alignment:
Q  124 ttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaacttccaatttttccaggaatgtcaa 223  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||              |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33756603 ttattctcatgtaaa-agatgggaatgtgcattcccatgatattatgcatatatttaaaaaaaaa-----tgtaacttccaatttttttaggaatgtcaa 33756510  T
Q  224 gttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattcttgggaataatttgtgtttcccaa 323  Q
    ||||||||||||| ||       ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  33756509 gttatttgccaaatactttttttaacaaatacccgagaatcaaattttcatattttcattcccggatatgttattcctggaaataatttgtgtttcccaa 33756410  T
Q  324 aaacaaacgc 333  Q
    ||||||||||    
T  33756409 aaacaaacgc 33756400  T

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Target: scaffold0051 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 59338 - 59016
Alignment:
Q  1 ggaatacatgattagggaatgattatacccatgtttgttatgaggttgagnnnnnnntatttctaggtataaaggttcttgggaatggagtaacttccca 100  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||       |||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  59338 ggaatacatggctagggaattattatacccatgtttgttatgaggttgagaaaaaaatattcctgggtttaaaggttcatgggaatggagtaacttccca 59239  T
Q  101 taactttcattattcccataaatttattctcatgtaaagagatgggaatgtgcattctcatgatattatgcatagatttnnnnnnnnnnnntttgtaact 200  Q
    |||||| ||||||||||||              ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||             ||||||||    
T  59238 taacttccattattcccat--------------gtaaagagatgagaatgttcattcccatgatattatgcatagatttttaaaaaaaaaaattgtaact 59153  T
Q  201 tccaatttttccaggaatgtcaagttatttgccaaacacnnnnnnnaacaaatacctaagaatcaatttttcatattttcattcccgggtatgttattct 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  59152 tccaatttttccaggaacgtcaagttatttgcaaaacacttttcttaacaaatacccaagaatcaaattttcatattttcattcccgggtatgttattcc 59053  T
Q  301 tgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 337  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59052 cgggaataatttgtgtttcccaaaaacaaacgccccc 59016  T

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