View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5388-Insertion-2 (Length: 1040)

Name: NF5388-Insertion-2
Description: NF5388
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5388-Insertion-2
NF5388-Insertion-2
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (15-1040)||(2137805-2138827)
chr7 (76-1040)||(2065109-2066070)
chr7 (9-1040)||(2097921-2098949)
chr7 (9-1040)||(2072217-2073244)
chr7 (15-977)||(2691736-2692692)
chr7 (79-1040)||(2245625-2246583)
chr7 (19-1040)||(2055819-2056831)
chr7 (9-809)||(2125431-2126230)
chr7 (575-984)||(2121959-2122362)
chr7 (164-633)||(2113785-2114254)
chr7 (165-727)||(2134891-2135453)
chr7 (297-904)||(1696958-1697563)
chr7 (881-1040)||(2134688-2134846)
chr7 (926-1040)||(2125291-2125408)
chr7 (150-262)||(1696739-1696851)
chr7 (9-125)||(2135468-2135584)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 535; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 535; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 1040
Target Start/End: Complemental strand, 2138827 - 2137805
Alignment:
Q  15 ggcgacccttctgcatccctggcaaatcttacccagctaagcatattagttgttgctgcagatgaatttactatcaaaacgttctcttgggtaggtaagc 114  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||    |||||||||||||| ||||  |||| |||||||||| ||    
T  2138827 ggcgacccttccgcatccttggcaaatcttaccaagctaaccatcttgagtgttgctttgaatgaatttactatcgaaaccatctcgtgggtaggtaggc 2138728  T
Q  115 tttcatcattaactgttctggatatatcatcggtcaatattggcagtgacatcccatcatcttttgcaaatctcacccaactagaatatttaaatgcagt 214  Q
    |||||||||||| ||   |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||      
T  2138727 tttcatcattaattggcttggacatatcatcagtcaaaattggcagtgacattccattatcttttgcaaatctcacccagctacaatttttaagtgcaaa 2138628  T
Q  215 aaatagcaatatgaagggtgaaattccatcttggataatgaacctaacaaatttaaatgccttggacctaggctttaattctttgcatggaaagctagag 314  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2138627 aaatagcaatattaagggtgaaattccgtcttggataatgaacctaacaaatttagttgtcttgaacctaggctttaattctttgcatggaaagctagag 2138528  T
Q  315 cttgacacgtttctgaagctcaaaaagctactttttctaaatttagcatttaacaaactgtcattgtatagcggaaaaagttcttcgcatatgacttatt 414  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  2138527 cttgacacatttctgaagcttaaaaagctactttttctaaatttagcattcaacaaactgtcattgtatagcggaaaaagttcttcccataggactgatt 2138428  T
Q  415 ctcgaattcaatatttagaattggattcatgcaatttagttgagattccaacatttataagagatatggttgatctggaatttcttatgttgtcaaacaa 514  Q
    ||| |||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2138427 ctcaaattcaaatcttacaattggattcatgcaatttagttgagattccaacatttataagagatatggttgatctggaatttcttatgttgccaaacaa 2138328  T
Q  515 caatataacgtcgatacccaattggctgtcgaagaaagaaagtctacaaggcataactgttaaccacaatacattaacaggagaaatatccccatccata 614  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  2138327 caatataacatcgatacccaattggttgtggaagaaagaaagtctacaaggctttgttgttaaccacaattcattgacaggagaaataaacccatccata 2138228  T
Q  615 tgcaatctcaaatcactcacagaacttgatttatcattcaacaacttaagtggcaatgttccttcatgtctagggaactttagccaatcattagaaagtc 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||     
T  2138227 tgcaatctcaaatcactcacagaacttgatttatcgttcaacaacttaagcggcaatgttccttcatgtctggggaactttagcaaatctttggaaagtt 2138128  T
Q  715 tggatctaaaaggggaatgaattgtctggccaaattcctcaaacatacatgataggaaattccctacagcagattgatttcagcaacaacaatcttcaga 814  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||| ||||      
T  2138127 tggatctaaaa-gggaataaattgtctggcctcattcctcaaacatacatgataggaaattcccttcaaaagattgatctcagtaacaacaatattcacg 2138029  T
Q  815 gtcagttgcctagggcaattggtcaacagcagaaggctagagttcttttgatgttagttataac-acatcaatgattcatttccattctgggatggggag 913  Q
    ||| |||||| | ||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  2138028 gtcggttgccaatggc-attgatcaacaacagaaggctagaattc-tttgatattagttacaacaatatcaatgattcatttccatt-ttggat-gggag 2137933  T
Q  914 aattaacccgaggttgaaggtattgtttttaagtaacaatgaaatccatggagacattaggtgctctggc-aca-gacatgccacattt-ccaagcctca 1010  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||| ||| |||||| |||    
T  2137932 aatt-acccga-gttgaaagtattgtctttaagtaacaataaatttcatggagacattaggtgctctagcaacatgacatg-cacgtttcccaagcttca 2137836  T
Q  1011 catcattga-ctttctcacaatcagttctct 1040  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  2137835 catcattgacctttctcacaatgagttctct 2137805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 76 - 1040
Target Start/End: Complemental strand, 2066070 - 2065109
Alignment:
Q  76 atgaatttactatcaaaacgttctcttgggtaggtaagctttcatcattaactgttctggatatatcatcggtcaatattggcagtgacatcccatcatc 175  Q
    |||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  2066070 atgaatttactattgagaccttctcatgggtaggtaagctctcatcattaaatgtcttggacatatcctcagtcaatattggcagtgacatctcattatc 2065971  T
Q  176 ttttgcaaatctcacccaactagaatatttaaatgcagtaaatagcaatatgaagggtgaaattccatcttggataatgaacctaacaaatttaaatgcc 275  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||    || ||||||| |||||| |||||| | | ||||||||||| ||  | ||||||  |  |    
T  2065970 ttttgcaaatctcacccagctacaatttttaggtgcaaccgattgcaatataaagggtcaaattctaccatggataatgaatcttgccaatttagtttac 2065871  T
Q  276 ttggacctaggctttaattctttgcatggaaagctagagcttgacacgtttctgaagctcaaaaagctactttttctaaatttagcatttaacaaactgt 375  Q
    ||| |||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  2065870 ttgaacctagcctctaattttttgcatgggaaggtagagcttgacacatttctgaacctcaaaaacctaggttttctagatttatcatataacaaactgt 2065771  T
Q  376 cattgtatagcggaaaaagttcttcgcatatgacttattctcgaattcaatatttagaattggattcatgcaatttagttgagattccaacatttataag 475  Q
    |||||||||| ||||||||||| || | |||| || |||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2065770 cattgtatagtggaaaaagttcatctcgtatggctgattctctaattaaatatttagtactggattcatgcaatttcgttgagattccaacatttataag 2065671  T
Q  476 agatatggttgatctggaatttcttatgttgtcaaacaacaatataacgtcgatacccaattggctgtcgaagaaagaaagtctacaaggcataactgtt 575  Q
    |||| ||| | |||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  2065670 agatctggctaatctggaaattcttaggttgtccaataacaatataacatcgatacccaaatggttgtggaagaaagaaagtctacacggcttagctgtt 2065571  T
Q  576 aaccacaatacattaacaggagaaatatccccatccatatgcaatctcaaatcactcacagaacttgatttatcattcaacaacttaagtggcaatgttc 675  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2065570 aaccacaattcattgagaggagaaatatccccatccatatgcaatctcaaatcactcacacaacttgatttatcgttcaacaacttaagcggcaatgttc 2065471  T
Q  676 cttcatgtctagggaactttagccaatcattagaaagtctggatctaaaaggggaatgaattgtctggccaaattcctcaaacatacatgataggaaatt 775  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2065470 cttcatgtctagggaactttagccaatatttagaaagtctggatctaaaa-gggaataaattatctggcctcattcctcaaacatacatgataggaaatt 2065372  T
Q  776 ccctacagcagattgatttcagcaacaacaatcttcagagtcagttgcctagggcaattggtcaacagcagaaggctagagttcttttgatgttagttat 875  Q
    |||| || ||||| ||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  2065371 cccttcaacagatagatcttagcaacaacaatctgcagggtcagttgccaagggc-tttggtcaacaatagaaggctggaattc-tttgatgttagttat 2065274  T
Q  876 aac-acatcaatgattcatttccattctgggatggggagaattaacccgaggttgaaggtattgtttttaagtaacaatgaaatccatggagacattagg 974  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  2065273 aacaatatcaatgattcatttccattct-ggat-gggagagtt-acccga-gttgaaggtattgtctttaactaacaatgaattccatggagacattagg 2065178  T
Q  975 tgctctggc-aca-gacatgccaca-tttccaagcctcacatcattga-ctttctcacaatcagttctct 1040  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  2065177 tgctctggcaacatgacatg-cacattttccaaacttcacatcattgacctttctcacaatgacttctct 2065109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 422; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1040
Target Start/End: Complemental strand, 2098949 - 2097921
Alignment:
Q  9 tttagaggcgacccttctgcatccctggcaaatcttacccagctaagcatattagttgttgctgcagatgaatttactatcaaaacgttctcttgggtag 108  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| | | ||  |    |||||||||||||  | || ||||| |||||||    
T  2098949 tttaggggcaacccttctgcatccttggcaaatcttacccaactaagattattggatattagtcacaatgaatttactattgagacattctcatgggtag 2098850  T
Q  109 gtaagctttcatcattaactgttctggatatatcatcggtcaatattggcagtgacatcccatcatcttttgcaaatctcacccaactagaatatttaaa 208  Q
    |||||||||||||||||| |    |||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||| |  |||||     
T  2098849 gtaagctttcatcattaatttccttggagatatcctcagtcaatattggcagtgagatcccattatcttttgcaaatctcactcagctagtacttttaag 2098750  T
Q  209 tgcagtaaatagcaatatgaagggtgaaattccatcttggataatgaacctaacaaatttaaatgccttggacctaggctttaattctttgcatggaaag 308  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2098749 tgcagaaaatagcaatataaagggtgaaataccatcttggattatgaacctaacaaatttagttgtcttggacctaccctttaattctttgcatggaaag 2098650  T
Q  309 ctagagcttgacacgtttctgaagctcaaaaagctactttttctaaatttagcatttaacaaactgtcattgtatagcggaaaaagttcttcgcatatga 408  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||    
T  2098649 ctagagcttgacacgtttctgaaactcaaaaagctagctgttcttaatttatcattcaacaaactgtcattgtacagtggaaaaaggtcttcccatatga 2098550  T
Q  409 cttattctcgaattcaatatttagaattggattcatgcaatttagttgagattccaacatttataagagatatggttgatctggaatttcttatgttgtc 508  Q
    |  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||| ||||  |||| |    
T  2098549 ccgattctcgaattcaaagcttagaattggattcatgcaatttagttgagattccaacatttataagagatctcggtgagctggaatatcttgcgttggc 2098450  T
Q  509 aaacaacaatataacgtcgatacccaattggctgtcgaagaaagaaagtctacaaggcataactgttaaccacaatacattaacaggagaaatatcccca 608  Q
    |   ||||||||||| ||| ||||||||||| | | | | |||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||    
T  2098449 attaaacaatataacatcgctacccaattggttatgggaaaaagaaagtctacaaggcttagttgttaaccaaaattcattgacaggagaaataacccca 2098350  T
Q  609 tccatatgcaatctcaaatcactcacagaacttgatttatcattcaacaacttaagtggcaatgttccttcatgtctagggaactttagccaatcattag 708  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||     
T  2098349 ttaatatgcaatctcaaatcactcacatatcttgatttagcgttcaacaacttaagcggcaatgttccttcatgtcttggaaactttagccaatctttac 2098250  T
Q  709 aaagtctggatctaaaaggggaatgaattgtctggccaaattcctcaaacatacatgataggaaattccctacagcagattgatttcagcaacaacaatc 808  Q
    |||  || | ||||||| |||||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  2098249 aaacactagctctaaaa-gggaacaaattgtctggccccattcctcaaacatacatgataggaaattcccttcagcggattgattttagcaacaacattc 2098151  T
Q  809 ttcagagtcagttgcctagggcaattggtcaacagcagaaggctagagttcttttgatgttagttataac-acatcaatgattcatttccattctgggat 907  Q
    | ||| |||||||||| ||||| |||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||    
T  2098150 tgcagggtcagttgccaagggc-attggtaaatagcagaagcctagagttc-tttgatgttagttataacaatatcaatgattcatttccattat-ggat 2098054  T
Q  908 ggggagaattaacccgaggttgaaggtattgtttttaagtaacaatgaaatccatggagacattaggtgctctggc-aca-gacatgccacattt-ccaa 1004  Q
      | |  ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||    
T  2098053 --gaaagatttacccga-gttgaaggtattgtctttaagtaacaatgaatttcatggagacattaggtgctctgacaacatgacatg-cacatttcccaa 2097958  T
Q  1005 gcctcacatcattga-ctttctcacaatcagttctct 1040  Q
     | |||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  2097957 acttcacatcattgacctttctcacaatgaattctct 2097921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 1040
Target Start/End: Complemental strand, 2073244 - 2072217
Alignment:
Q  9 tttagaggcgacccttctgcatccctggcaaatcttacccagctaagcatattagttgttgctgcagatgaatttactatcaaaacgttctcttgggtag 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||  | |||||| | || | |||||||    |||||||||||||  | || ||||| |||||||    
T  2073244 tttaggggcgacccttctgcatccttggccaatcttacaaaactaagcgtcttggatgttgctttgaatgaatttactattgagaccttctcatgggtag 2073145  T
Q  109 gtaagctttcatcattaactgttctggatatatcatcggtcaatattggcagtgacatcccatcatcttttgcaaatctcacccaactagaatatttaaa 208  Q
    ||||||| || ||||||| ||   |||||||||| || ||||| |||| |||| |||||| || |||||||||||||||||| || |||| |  |||||     
T  2073144 gtaagctctcgtcattaattgccttggatatatcctcagtcaaaattgacagtaacatcc-attatcttttgcaaatctcactcagctagtacttttaag 2073046  T
Q  209 tgcagtaaatagcaatatgaagggtgaaattccatcttggataatgaacctaacaaatttaaatgccttggacctaggctttaattctttgcatggaaag 308  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2073045 tgcagcaaatagcaatataaagggtgaaattccatcttggattatgaacctaacaaatttagttgtcttgaacctaccctttaattctttgcatggaaag 2072946  T
Q  309 ctagagcttgacacgtttctgaagctcaaaaagctactttttctaaatttagcatttaacaaactgtcattgtatagcggaaaaagttcttcgcatatga 408  Q
    |||||| | |||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||    
T  2072945 ctagagttagacaagtttctgaacctcaaaaagctagtctttcttgatttatcatttaacaaactgtcattgtatagtggaaaaagttcatctcgtatga 2072846  T
Q  409 cttattctcgaattcaatatttagaattggattcatgcaatttagttgagattccaacatttataagagatatggttgatctggaatttcttatgttgtc 508  Q
    || |||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |   |||| |||||  |||| |  ||||    
T  2072845 ctgattctctaattcaagatttacgattggcttcatgcaattttgttgagattccaacattcataagtgatcttagtgatatggaaactcttttactgtc 2072746  T
Q  509 aaacaacaatataacgtcgatacccaattggctgtcgaagaaagaaagtctacaaggcataactgttaaccacaatacattaacaggagaaatatcccca 608  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||  | ||  ||||  | ||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  2072745 aaacaacaatataacttcgctacccaaatggttgtggaaaaaagaaagtctacaaatcttagatgtttccaacaattcattggtaggagaaatatcccca 2072646  T
Q  609 tccatatgcaatctcaaatcactcacagaacttgatttatcattcaacaacttaagtggcaatgttccttcatgtctagggaactttagccaatcattag 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  2072645 tccatatgcaatctcaaatcactcaggaaacttgatttatcattcaacaacttaagcggcaatgttccttcatgtctagggaagtttagccaatatttag 2072546  T
Q  709 aaagtctggatctaaaaggggaatgaattgtctggccaaattcctcaaacatacatgataggaaattccctacagcagattgatttcagcaacaacaatc 808  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||    
T  2072545 aaagtctggatctaaaa-gggaataaattatctggcctcattcctcaaacatacatgataggaaattcccttaaacagattgatcttagcaacaacaatc 2072447  T
Q  809 ttcagagtcagttgcctagggcaattggtcaacagcagaaggctagagttcttttgatgttagttataac-acatcaatgattcatttccattctgggat 907  Q
    | ||| |||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2072446 tgcagggtcagttgccaagggc-tttggtcaacaatagaaggctggaattc-tttgatgttagttataacaacatcaatgattcatttccattct-ggat 2072350  T
Q  908 ggggagaattaacccgaggttgaaggtattgtttttaagtaacaatgaaatccatggagacattaggtgctctggc-aca-gacatgccaca-tttccaa 1004  Q
     |||||| |||  |||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||    
T  2072349 -gggagagtta--ccggagttgaaggtattgtctttaagtaacaatgaattccatggagacattaggtgctctggcaacatgacatg-cacattttccaa 2072254  T
Q  1005 gcctcacatcattga-ctttctcacaatcagttctct 1040  Q
     | |||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  2072253 acttcacatcattgacctttctcacaatgacttctct 2072217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 977
Target Start/End: Original strand, 2691736 - 2692692
Alignment:
Q  15 ggcgacccttctgcatccctggcaaatcttacccagctaagcatattagttgttgctgcagatgaatttactatcaaaacgttctcttgggtaggtaagc 114  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| | ||   ||| | |    |||||||||||||  | ||  |||| |||||||||||||    
T  2691736 ggcgacccttctgcatccttggtaaatcttacgaagctaagcctcttgaatgtaggtttgaatgaatttactattgagaccatctcatgggtaggtaagc 2691835  T
Q  115 tttcatcattaactgttctggatatatcatcggtcaatattggcagtgacatcccatcatcttttgcaaatctcacccaactagaatatttaaatgcagt 214  Q
    | |||||| ||  ||   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||   |||| ||||      
T  2691836 tctcatcaatagttggcttggatatatcctcagtcaatattggcagtgacatcccattatcttttgcaaatctcactaaactagaagtattaattgcaag 2691935  T
Q  215 aaatagcaatatgaagggtgaaattccatcttggataatgaacctaacaaatttaaatgccttggacctaggctttaattctttgcatggaaagctagag 314  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||| || |     
T  2691936 aaatagcaatataaagggagaaattccttcttggataatgaacctaacaaatttagttggcttgaacctacgctctaattgtttgcatgaaaagataaac 2692035  T
Q  315 cttgacacgtttctgaagctcaaaaagctactttttctaaatttagcatttaacaaactgtcattgtatagcggaaaaagttcttcgcatatgacttatt 414  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| | ||||||  |||    
T  2692036 ctagacacatttttgaagctcaaaaagctagtttttcttaatttatcattcaacaaactgtcattgtacactggacaaagttcttcccttatgaccgatt 2692135  T
Q  415 ctcgaattcaatatttagaattggattcatgcaatttagttgagattccaacatttataagagatatggttgatctggaatttcttatgttgtcaaacaa 514  Q
    |||||||||||   ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2692136 ctcgaattcaagtcttacaattggcttcatgcaattttgttgagattccaacatttataagagatctggatgatctggaatttcttatgttgtcaaacaa 2692235  T
Q  515 caatataacgtcgatacccaattggctgtcgaagaaagaaagtctacaaggcataactgttaaccacaatacattaacaggagaaatatccccatccata 614  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||| || ||  ||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  2692236 caatataacatcgctacccaattggttgtggaaaaaagcaagtctacaaagcttagatgtttcccacaattcattgtcaggagaaatatccccatccata 2692335  T
Q  615 tgcaatctcaaatcactcacagaacttgatttatcattcaacaacttaagtggcaatgttccttcatgtctagggaactttagccaatcattagaaagtc 714  Q
    ||| || | ||||| ||| |    ||||||||||| |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||    
T  2692336 tgcgatttaaaatcgctcgcgactcttgatttatcgttcaacaacttaagagacaacattccttcatgtctaggaaactttagtcaatccttagaaaatc 2692435  T
Q  715 tggatctaaaaggggaatgaattgtctggccaaattcctcaaacatacatgataggaaattccctacagcagattgatttcagcaacaacaatcttcaga 814  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || |||     
T  2692436 tggatct-aaatgggaacaaattgtcaggcgtcattcctcaaacatacatgatagaaaattcccttcagcagattgatctcagtaacaacaaactgcagg 2692534  T
Q  815 gtcagttgcctagggcaattggtcaacagcagaaggctagagttcttttgatgttagttataac-acatcaatgattcatttccattctgggatggggag 913  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2692535 gtcagttgccaagggc-attggtcaacaacagaaggctagagttc-tttgatgttagttataacaatatcaatgattcatttccattct-ggat-gggag 2692630  T
Q  914 aattaacccgaggttgaaggtattgtttttaagtaacaatgaaatccatggagacattaggtgc 977  Q
    ||||  ||||| | | |||||  ||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  2692631 aatt-gcccga-gctaaaggtgctgtctttaagtaacaacgaatttcatggagacattaggtgc 2692692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 79 - 1040
Target Start/End: Original strand, 2245625 - 2246583
Alignment:
Q  79 aatttactatcaaaacgttctcttgggtaggtaagctttcatcattaactgttctggatatatcatcggtcaatattggcagtgacatcccatcatcttt 178  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||  |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  2245625 aatttactatcgaaaccttctcatgggtaggtaagctctcatcattaaatgtcttggaaatatcctcagtcaatattggcagtgacatcccattaccttt 2245724  T
Q  179 tgcaaatctcacccaactagaatatttaaatgcagtaaatagcaatatgaagggtgaaattccatcttggataatgaacctaacaaatttaaatgccttg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||    
T  2245725 tgcaaatctcacccaactagaagtattaagtgcagcaaatagcaatatgaagggtgaaattccatcttggataatgaacctaacaaatttagtcattttg 2245824  T
Q  279 gacctaggctttaattctttgcatggaaagctagagcttgacacgtttctgaagctcaaaaagctactttttctaaatttagcatttaacaaactgtcat 378  Q
     |||||     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2245825 aacctacctcataattctttgcatggaaagcaagagcttgacatgtttctgaagctcaaaaagctagttgttctgaatttagcattcaacaaactgtcat 2245924  T
Q  379 tgtatagcggaaaaagttcttcgcatat-gacttattctcgaattcaatatttagaattggattcatgcaatttagttgagattccaacatttataagag 477  Q
    |||| || || ||||||||| | | | | ||||  ||||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2245925 tgtacagtgggaaaagttctaccccttttgactggttctcaatttcaagtcttagaattggattcatgcaatttagttgagattccatcatttataagag 2246024  T
Q  478 atatggttgatctggaatttcttatgttgtcaaacaacaatataacgtcgatacccaattggctgtcgaagaaagaaagtctacaaggcataactgttaa 577  Q
    || |   |||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||   | ||||||||||| ||| ||   ||  ||||||| ||  | || || ||      
T  2246025 atctccgtgatttggaaattcttatcttgtcaaacaacaacataacaatgctacccaattggttgtggagagaatcaagtctagaaatcttatctttttc 2246124  T
Q  578 ccacaatacattaacaggagaaatatccccatccatatgcaatctcaaatcactcacagaacttgatttatcattcaacaacttaagtggcaatgttcct 677  Q
    | | ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||    
T  2246125 caataattcattgaaaggagaaatatccccatccatatgcaa-ctcaaatcactcatgcaacttgatttatcattcaacaacttaagaggccgcactcct 2246223  T
Q  678 tcatgtctagggaactttagccaatcattagaaagtctggatctaaaaggggaatgaattgtctggccaaattcctcaaacatacatgataggaaattcc 777  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2246224 tcatgtctggggaactttagccaattgttagaaaggctggatctaaaatgg-aataaattgtctggcctcattcctcaaacatacatgataggaaattcc 2246322  T
Q  778 ctacagcagattgatttcagcaacaacaatcttcagagtcagttgcctagggcaattggtcaacagcagaaggctagagttcttttgatgttagttataa 877  Q
    || | |  ||||||||||| |||||||||||| |   || ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||    
T  2246323 cttcggatgattgatttcaacaacaacaatctgcttggtgagttgccaagggc-attggtaaacagcagaagtctagaattc-tttgatgttagctacaa 2246420  T
Q  878 -cacatcaatgattcatttccattctgggatggggagaattaacccgaggttgaaggtattgtttttaagtaacaatgaaatccatggagacattaggtg 976  Q
      | ||||||||||||||||| || |||    ||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2246421 taatatcaatgattcatttcctttttgg--ctgggag-atttacctga-gttgaaggtattgtctttaagtaacaatgaattccatggagacattaggtg 2246516  T
Q  977 ctctggca--cagacatgccaca-tttccaagcctcacatcattga-ctttctcacaatcagttctct 1040  Q
    ||||||||    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2246517 ctctggcaatatgacatg-cacattttccaagcttcacatcattgacctttctcacaatcagttctct 2246583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 19 - 1040
Target Start/End: Complemental strand, 2056831 - 2055819
Alignment:
Q  19 acccttctgcatccctggcaaatcttacccagctaagcatattagttgttgctgcagatgaatttactatcaaaacgttctcttgggtaggtaagctttc 118  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  || |  ||||||    |||||||||||||  |||| || || |||||||||| ||||||    
T  2056831 acccttctgcatccttggcaaatcttaccaagctacgcaccttggaggttgctttgaatgaatttactattgaaaccttttcatgggtaggtaggctttc 2056732  T
Q  119 atcattaactgttctggatatatcatcggtcaatattggcagtgacatcccatcatcttttgcaaatctcacccaactagaa-tatttaaatgcagtaaa 217  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |   ||||| ||||||  ||||  |||    
T  2056731 atcattaactggattggatatatcatcagtcaatattggcagtggaatcccattatcttttgcaaatctcacgc---tagaagtatttat-tgcaagaaa 2056636  T
Q  218 tagcaatatgaagggtgaaattccatcttggataatgaacctaacaaatttaaatgccttggacctaggctttaattctttgcatggaaagctagagctt 317  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2056635 tagcagtataatgggtgaaattccatcttggataatgaaccaaacaaatttaggtatcttgaacctagcctataattttttgcatggaaagctagagctt 2056536  T
Q  318 gacacgtttctgaagctcaaaaagctactttttctaaatttagcatttaacaaactgtcattgtatagcggaaaaagttcttcgcatatgacttattctc 417  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||| ||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || | ||||| | ||| |     
T  2056535 gacacttttttgaagttcaaaaatctaataattctaaatttatcattcaacaaactgtcattgcatagtggaaatagttcatctcgtatgattgattatg 2056436  T
Q  418 gaattcaatatttagaattggattcatgcaatttagttgagattccaacatttataagagatatggttgatctggaatttcttatgttgtcaaacaacaa 517  Q
     ||||||||  |||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||   |||||    
T  2056435 caattcaatccttagtactggcttcatgcaatttagttgagattccaacatttataagagatatggctgatctggactttcttcggttgtcattaaacaa 2056336  T
Q  518 tataacgtcgatacccaattggctgtcgaagaaagaaagtctacaaggcataactgt-taaccacaatacattaacaggagaaatatccccatccatatg 616  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| |    || |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2056335 tataacatcgctacccaattggttgtggaagaaacaaagtctacatggctt---ggtataaccacaattcattgaccggagaaatatccccatccatatg 2056239  T
Q  617 caatctcaaatcactcacaga-acttgatttatcattcaacaacttaagtggcaatgttccttcatgtctagggaactttagccaatcattagaaagtct 715  Q
    ||||||| ||||||| |  ||  ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  2056238 caatctc-aatcact-attgattcttgatttatcgttcaacaacttaagcggtaatgttccttcatgtctggggaactttagccaatctttagaaaatct 2056141  T
Q  716 ggatctaaaaggggaatgaattgtctggccaaattcctcaaacatacatgataggaaattccctacagcagattgatttcagcaacaacaatcttcagag 815  Q
    |||||| |   | |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || |||  ||||||| |||| ||||||||||| ||| |    
T  2056140 ggatct-aggtgtgaacaaattgtctggcctcattcctcaaacatacatgataggaaattatcttcagatgattgatctcagtaacaacaatctgcaggg 2056042  T
Q  816 tcagttgcctagggcaattggtcaacagcagaaggctagagttcttttgatgttagttataac-acatcaatgattcatttccattctgggatggggaga 914  Q
    | ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    ||||||    
T  2056041 tgagttgccaaggg-aattggtaaacaacagaaggctagagttc-atcgatgttagtcataacaatatcaatgattcatttccattctgg--ctgggaga 2055946  T
Q  915 attaacccgaggttgaaggtattgtttttaagtaacaatgaaatccatggagacattaggtgctctggc-acagacatgccaca-tttccaagcctcaca 1012  Q
     |||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| | |   |||| ||||||||| |||||    
T  2055945 ttta--ccga-gttgaaggtattgtctttaagtaacaatgaattccatggagacattaggtgttctggcaacataaaatgcacattttccaagcttcaca 2055849  T
Q  1013 tcattga--ctttctcacaatcagttctct 1040  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  2055848 tcattgaccctttctcacaatgagttctct 2055819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 809
Target Start/End: Complemental strand, 2126230 - 2125431
Alignment:
Q  9 tttagaggcgacccttctgcatccctggcaaatcttacccagctaagcatattagttgttgctgcagatgaatttactatcaaaacgttctcttgggtag 108  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||   |||||||    |||||||||||||  | ||  |||| ||||| |    
T  2126230 tttaggggtgacccttctgcatccttggcaaatattacccaactaagcatgttgagtgttgcttggaatgaatttactattgagaccatctcatgggtcg 2126131  T
Q  109 gtaagctttcatcattaactgttctggatatatcatcggtcaatattggcagtgacatcccatcatcttttgcaaatctcacccaactagaatatttaaa 208  Q
    ||||||| ||||||||||||    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||      
T  2126130 gtaagctctcatcattaacttccttggatatatcctcagtcaatattggcagtgacatcccattatcttttgcaaatctcacccaactagaacttctagg 2126031  T
Q  209 tgcagtaaatagcaatatgaagggtgaaattccatcttggataatgaacctaacaaatttaaatgccttggacctaggctttaattctttgcatggaaag 308  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||  |  ||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  2126030 tgcaacaaatagcaatataaagggtgaaattccatcatggataatgaatctagcaaatttagcttacttgagcctacgctctaattttttgcatggaaag 2125931  T
Q  309 ctagagcttgacacgtttctgaagctcaaaaagctactttttctaaatttagcatttaacaaactgtcattgtatagcggaaaaagttcttcgcatatga 408  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  2125930 ctagagcttgacacatttctgaacctcaaaaagctagtttttctagatttatcattcaacaaattgtcattgtatagtggaaaaagttcttcccatagga 2125831  T
Q  409 cttattctcgaattcaatatttagaattggattcatgcaatttagttgagattccaacatttataagagatatggttgatctggaatttcttatgttgtc 508  Q
    |  |||||| ||||| |   ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2125830 ccgattctcaaattcgagtcttacaattggcttcatgcaatttagttgagattccaacatttataagagacatgcctgatctggaatttcttatgttgtc 2125731  T
Q  509 aaacaacaatataacgtcgatacccaattggctgtcgaagaaagaaagtctacaaggcataactgttaaccacaatacattaacaggagaaatatcccca 608  Q
    |||||||||||| || | | | ||||||||| ||| ||| |||| |||||||  | || ||  ||||  ||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  2125730 aaacaacaatatgacattgctgcccaattggttgtggaaaaaagcaagtctaataagcttacttgtttcccacaattcattgacaggagaaataccccca 2125631  T
Q  609 tccatatgcaatctcaaatcactcacagaacttgatttatcattcaacaacttaagtggcaatgttccttcatgtctagggaactttagccaatcattag 708  Q
    ||||||||||||||||||||||||      |||||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  2125630 tccatatgcaatctcaaatcactcgtgactcttgatttatcgatcaacaacttaagcggcaacattccttcatgtctgggtaactttagccaatctttag 2125531  T
Q  709 aaagtctggatctaaaaggggaatgaattgtctggccaaattcctcaaacatacatgataggaaattccctacagcagattgatttcagcaacaacaatc 808  Q
    ||| | |    |||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||||||||||| |||||||||||    
T  2125530 aaaatataatgctaaaa-gggaataaattgtctggcctcattcctcaaacatacatgataggaagttcccttcagatgattgatttcaacaacaacaatc 2125432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 575 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 2122362 - 2121959
Alignment:
Q  575 taaccacaatacattaacaggagaaatatccccatccatatgcaatctcaaatcactcacagaacttgatttatcattcaacaacttaagtggcaatgtt 674  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  2122362 taaccacaattcattgacaggagaaatatccccatccatatgcaatctcaaatcactcacacaacttgatttatcgttcaacaacttaagcggcaatgtt 2122263  T
Q  675 ccttcatgtctagggaactttagccaatcattagaaagtctggatctaaaaggggaatgaattgtctggccaaattcctcaaacatacatgataggaaat 774  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  2122262 ccttcatgtctagggaactttagccaatatttataaagtctggatctaaaa-gggaataaattatctggcctcattcctcaaacatacatgataggaaat 2122164  T
Q  775 tccctacagcagattgatttcagcaacaacaatcttcagagtcagttgcctagggcaattggtcaacagcagaaggctagagttcttttgatgttagtta 874  Q
    ||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  2122163 tcccttcaacagattgatcttagcaacaacaatctgcagggtcagttgccaagggc-tttggtcaacaatagaaggctggaattc-tttgatgttagtta 2122066  T
Q  875 taac-acatcaatgattcatttccattctgggatggggagaattaacccgaggttgaaggtattgtttttaagtaacaatgaaatccatggagacattag 973  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2122065 taacaacatcaatgattcatttccattct-ggat-gggagagtt-acccga-gttgaaggtattgtctttaagtaacaatgaattccatggagacattag 2121970  T
Q  974 gtgctctggca 984  Q
    |||||||||||    
T  2121969 gtgctctggca 2121959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 164 - 633
Target Start/End: Complemental strand, 2114254 - 2113785
Alignment:
Q  164 catcccatcatcttttgcaaatctcacccaactagaatatttaaatgcagtaaatagcaatatgaagggtgaaattccatcttggataatgaacctaaca 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||  | || ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |   |     
T  2114254 catcccattatcttttgcaaatctcacccagctacactatttagatgcaacagattgcaatataaagggtcaaattccatcatggataatgaatcattcc 2114155  T
Q  264 aatttaa-atgccttggacctaggctttaattctttgcatggaaagctagagcttgacacgtttctgaagctcaaaaagctactttttctaaatttagca 362  Q
    ||||||  |||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||    
T  2114154 aatttagcatgc-ttgaacctacgctctaattttttgcatggaaagctagagcttgacacgtttctgaagctcagaaagctagtttttctagatttatca 2114056  T
Q  363 tttaacaaactgtcattgtatagcggaaaaagttcttcgcatatgacttattctcgaattcaatatttagaattggattcatgcaatttagttgagattc 462  Q
    || |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2114055 ttcaacaaactgtcattgtatagtgggaaaagttcttcaaatatgaccgattctcgtattcaaatcttacaattggattcatgcaatttagttgagattc 2113956  T
Q  463 caacatttataagagatatggttgatctggaatttcttatgttgtcaaacaacaatataacgtcgatacccaattggctgtcgaagaaagaaagtctaca 562  Q
    |||||| ||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |    
T  2113955 caacatatataagatatctggatgatctggaatctcttatgttgtcaaacaacaatataacatcgctacccaattggttgtggaagaaagcaagtctaaa 2113856  T
Q  563 aggcataactgttaaccacaatacattaacaggagaaatatccccatccatatgcaatctcaaatcactca 633  Q
    |  | ||  ||||   || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2113855 aaacttagatgtttctcaaaattcattgacaggagaaatatccccatccatatgcaatctcaagtcactca 2113785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 165 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 2135453 - 2134891
Alignment:
Q  165 atcccatcatcttttgcaaatctcacccaactagaatatttaaatgcagtaaatagcaatatgaagggtgaaattccatcttggataatgaacctaacaa 264  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||   |||| ||||  ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |    
T  2135453 atcccattatctttcgcaaatctcacgcaactagaagtattaagtgcaacaaatagctatataaagggtcaaattccatcttggttaatgaatctaacca 2135354  T
Q  265 atttaaatgccttggacctaggctttaattctttgcatggaaagctagagcttgacacgtttctgaagctcaaaaagctactttttctaaatttagcatt 364  Q
    |||||  |  |||| |||||  || ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  2135353 atttagcttacttgaacctacactctaattttctgcatggaaagcttgagcttgacacgtttctgaatctcaaaaagctagtttttttagatttatcatt 2135254  T
Q  365 taacaaactgtcattgtatagcggaaaaagttcttcgcatatgacttattctcgaattcaatatttagaattggattcatgcaatttagttgagattcca 464  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| | ||| || ||| | ||  ||||| || |||||   ||| | |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  2135253 taacaaactgtcattgttaagtggaaacaattcatcccatttaacaaattctggacttcaaatattacagttggctgaatgcaatttagttgagattcca 2135154  T
Q  465 acatttataagagatatggttgatctggaatttcttatgttgtcaaacaacaatataacgtcgatacccaattggctgtcgaagaaagaaagtctacaag 564  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  | ||| ||| ||| |||| ||| ||| ||     
T  2135153 acatttataagagatttggctgagatggaatttcttacgttgtcaaacaacaatataacatcgctacctgaatggttgtggaaaaaagcaaggctaaaaa 2135054  T
Q  565 gcataactgttaaccacaatacattaacaggagaaatatccccatccatatgcaatctcaaatcactcacagaacttgatttatcattcaacaacttaag 664  Q
    || ||  ||||  ||| | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||  | |||||||||||| |    
T  2135053 gcttagatgtttcccatagttcattgacaggagaaatatccccatccatatgcaatctcaaatcactcgtgatgcttgatttcacgttcaacaacttagg 2134954  T
Q  665 tggcaatgttccttcatgtctagggaactttagccaatcattagaaagtctggatctaaaagg 727  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2134953 tggcaacattccttcatgtctagggaactttagccaacctttagaaagtctggatctaaaagg 2134891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 297 - 904
Target Start/End: Original strand, 1696958 - 1697563
Alignment:
Q  297 ttgcatggaaagctagagcttgacacgtttctgaagctcaaaaagctactttttctaaatttagcatttaacaaactgtcattgtatagcggaaaaagtt 396  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| | || |||||| |||| |||    | ||||||||||    
T  1696958 ttgcatggaaagctagagtttgacatgtttctcaagttcaaaaagttaatttttctaaatttatcgttcaacaaattgtccttgctcggtggaaaaagtt 1697057  T
Q  397 cttcgcatatgacttattctcgaattcaatatttagaattggattcatgcaatttagttgagattccaacatttataagagatatggttgatctggaatt 496  Q
    ||||  |  | ||| |||||||||| ||   |||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |   |||| | | ||     
T  1697058 cttccaacgtaactgattctcgaatccatgttttacaactggcttcatgcaatttggttgagattccgacatttataagagatcttagtgatttaggatg 1697157  T
Q  497 tcttatgttgtcaaacaacaatataacgtcgatacccaattggctgtcgaagaaagaaagtctacaaggcataactgttaaccacaatacattaacagga 596  Q
    | ||||  |||||||||||| |||||| ||  |||| | |||| ||| ||  |||  |||||||||| || ||||||||  ||||  | |||| ||||||    
T  1697158 tattatcctgtcaaacaacagtataacttcactacctagttggttgtggagaaaaacaagtctacaaagcttaactgtttcccacggttcattgacagga 1697257  T
Q  597 gaaatatccccatccatatgcaatctcaaatcactcacagaacttgatttatcattcaacaacttaagtggcaatgttccttcatgtctagggaacttta 696  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1697258 gaaatatccttgtccatatgcaatctcaaatcactcatgcatcttgatttatcgttcaacaatttaagcggcaatgttccttcatgtctaggtaacttta 1697357  T
Q  697 gccaatcattagaaagtctggatctaaaaggggaatgaattgtctggccaaattcctcaaacatacatgataggaaattccctacagcagattgatttca 796  Q
    |||| || ||||||| | ||   |||||| || ||  |||| ||||| |  |||||||||||||| ||||    ||||||||| |||  ||||||  |||    
T  1697358 gccactctttagaaattttgatgctaaaa-ggaaacaaattatctggtctcattcctcaaacatatatgactcaaaattcccttcagatgattgacctca 1697456  T
Q  797 gcaacaacaatcttcagagtcagttgcctagggcaattggtcaacagcagaaggctagagttcttttgatgttagttataac-acatcaatgattcattt 895  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||| || || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||| ||||  |||    
T  1697457 gcaacaataatctgcagggtcagttgccaagagc-attggttaactgcagaaggctagagttc-tttgatgttagccataacaatatcaaagatttgttt 1697554  T
Q  896 ccattctgg 904  Q
    |||||||||    
T  1697555 ccattctgg 1697563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 881 - 1040
Target Start/End: Complemental strand, 2134846 - 2134688
Alignment:
Q  881 atcaatgattcatttccattctgggatggggagaattaacccgaggttgaaggtattgtttttaagtaacaatgaaatccatggagacattaggtgctct 980  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  2134846 atcaatgattcatttccattctggct--gggagattta-cctgag-ttgaaggtattgtctttaggtaacaatgaattccatggagacgttaggtgctct 2134751  T
Q  981 ggc-aca-gacatgccaca-tttccaagcctcacatcattga-ctttctcacaatcagttctct 1040  Q
    ||| ||| |||||| |||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2134750 ggcaacatgacatg-cacattttccaaacttcacatcattgacctttctcacaatcagttctct 2134688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 926 - 1040
Target Start/End: Complemental strand, 2125408 - 2125291
Alignment:
Q  926 gttgaaggtattgtttttaagtaacaatgaaatccatggagacattaggtgctctggc-aca-gacatgccacattt-ccaagcctcacatcattga-ct 1021  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  2125408 gttgaaggtattgtctttaagtaacaatgcattccatggagacattaggtgctctggcaacatgacatg-cacatttcccaagcttcacatcattgacct 2125310  T
Q  1022 ttctcacaatcagttctct 1040  Q
    |||||||||| | ||||||    
T  2125309 ttctcacaatgaattctct 2125291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 150 - 262
Target Start/End: Original strand, 1696739 - 1696851
Alignment:
Q  150 aatattggcagtgacatcccatcatcttttgcaaatctcacccaactagaatatttaaatgcagtaaatagcaatatgaagggtgaaattccatcttgga 249  Q
    ||||||||||| || || |||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||   |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  1696739 aatattggcagcgatataccattatcttttgcaaacctcatccacctacaatatttacgcgcagaaaatagcaatttaaggggtgaaattccatcttgga 1696838  T
Q  250 taatgaacctaac 262  Q
    |||||||||||||    
T  1696839 taatgaacctaac 1696851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 2135584 - 2135468
Alignment:
Q  9 tttagaggcgacccttctgcatccctggcaaatcttacccagctaagcatattagttgttgctgcagatgaatttactatcaaaacgttctcttgggtag 108  Q
    ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||   ||||| |    |||||||||||||  |||| ||||| |||||||    
T  2135584 tttaggggtgacccttctgcatccttggcaaatcttaccaagctaagcctcttgaatgttggtttcaatgaatttactattgaaaccttctcatgggtag 2135485  T
Q  109 gtaagctttcatcatta 125  Q
     ||||||||||||||||    
T  2135484 ataagctttcatcatta 2135468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University