View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5389_low_2 (Length: 412)

Name: NF5389_low_2
Description: NF5389
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5389_low_2
NF5389_low_2
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (1-406)||(33341812-33342217)
chr3 (1-406)||(54685220-54685625)
chr3 (4-406)||(7853913-7854315)
chr3 (1-384)||(30152893-30153278)
chr3 (1-371)||(17955903-17956274)
chr3 (1-375)||(45581591-45581967)
chr3 (1-363)||(54038043-54038406)
chr3 (1-363)||(3992522-3992886)
chr3 (1-363)||(23492346-23492709)
chr3 (1-354)||(53771022-53771378)
chr3 (1-327)||(16261463-16261790)
chr3 (1-354)||(38167896-38168250)
chr3 (1-354)||(2844172-2844527)
chr3 (1-237)||(28558271-28558507)
chr3 (1-201)||(55513006-55513206)
chr3 (4-224)||(18970034-18970254)
chr3 (118-406)||(19946629-19946918)
chr3 (207-351)||(16996176-16996321)
chr3 (207-359)||(19570805-19570957)
chr3 (207-347)||(50112168-50112309)
chr3 (210-359)||(317628-317778)
chr3 (207-359)||(22144389-22144542)
chr3 (210-353)||(16182065-16182209)
chr3 (59-224)||(48421690-48421855)
chr3 (207-331)||(12349847-12349970)
chr3 (207-359)||(13817492-13817642)
chr3 (207-359)||(35123674-35123826)
chr3 (59-221)||(15550714-15550876)
chr3 (207-359)||(6154448-6154600)
chr3 (207-359)||(14298399-14298551)
chr3 (207-359)||(14304026-14304178)
chr3 (207-354)||(53898572-53898719)
chr3 (207-375)||(17523006-17523176)
chr3 (207-359)||(6146863-6147015)
chr3 (267-406)||(47784924-47785064)
chr3 (207-359)||(14295415-14295569)
chr3 (207-353)||(17100636-17100783)
chr3 (207-353)||(17101321-17101468)
chr3 (210-363)||(11329081-11329235)
chr3 (229-370)||(17139474-17139616)
chr3 (229-363)||(14528151-14528286)
chr3 (325-406)||(9303343-9303425)
chr3 (262-354)||(28558188-28558282)
chr3 (216-363)||(12560362-12560510)
chr3 (207-363)||(54423986-54424142)
chr3 (31-175)||(11402752-11402896)
chr3 (207-354)||(19260956-19261104)
chr3 (237-363)||(55440996-55441123)
chr3 (207-359)||(14301042-14301196)
chr3 (207-354)||(12349656-12349809)
chr3 (37-181)||(17393590-17393735)
chr3 (229-379)||(12488865-12489017)
chr3 (291-354)||(14059414-14059478)
chr3 (89-177)||(14177017-14177105)
chr3 (230-369)||(17204667-17204807)
chr3 (252-378)||(38811170-38811297)
chr3 (267-379)||(1990759-1990873)
chr3 (297-378)||(17960520-17960602)
chr3 (198-260)||(34439451-34439513)
chr3 (112-224)||(8275874-8275986)
chr3 (112-224)||(9303129-9303241)
chr3 (215-326)||(8631801-8631912)
chr3 (87-177)||(12539066-12539156)
chr3 (254-370)||(9590918-9591035)
chr3 (119-224)||(16934010-16934115)
chr3 (112-224)||(8268774-8268886)
chr3 (112-224)||(14285075-14285187)
chr3 (267-384)||(12952915-12953034)
chr3 (210-329)||(17938582-17938701)
chr3 (229-370)||(15876034-15876176)
chr3 (267-354)||(3576615-3576703)
chr3 (229-329)||(16880131-16880231)
chr3 (267-378)||(34559857-34559969)
chr3 (107-158)||(37915310-37915361)
chr3 (112-191)||(38375718-38375797)
chr3 (295-369)||(17191511-17191583)
chr3 (183-224)||(39656453-39656494)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (1-371)||(35015076-35015447)
chr6 (4-406)||(18583264-18583650)
chr6 (1-371)||(19983211-19983581)
chr6 (1-354)||(26089718-26090072)
chr6 (1-363)||(18002414-18002777)
chr6 (1-354)||(23994904-23995260)
chr6 (1-363)||(15742139-15742505)
chr6 (1-406)||(4991002-4991409)
chr6 (112-406)||(18823417-18823712)
chr6 (6-224)||(22585470-22585688)
chr6 (6-224)||(22590301-22590519)
chr6 (4-247)||(15889628-15889871)
chr6 (112-406)||(18839272-18839567)
chr6 (208-359)||(25744331-25744483)
chr6 (207-347)||(32898779-32898920)
chr6 (6-248)||(15004831-15005072)
chr6 (207-359)||(22440911-22441064)
chr6 (210-359)||(31628245-31628395)
chr6 (31-247)||(25640505-25640720)
chr6 (208-363)||(18777119-18777275)
chr6 (207-359)||(13014826-13014979)
chr6 (210-353)||(16086001-16086144)
chr6 (210-353)||(18432626-18432770)
chr6 (210-384)||(18398890-18399065)
chr6 (210-371)||(18381803-18381965)
chr6 (207-344)||(18570271-18570409)
chr6 (295-406)||(17083383-17083496)
chr6 (210-378)||(22361885-22362054)
chr6 (229-354)||(25367376-25367502)
chr6 (210-359)||(16106499-16106643)
chr6 (112-221)||(19629447-19629556)
chr6 (112-221)||(32276793-32276902)
chr6 (112-191)||(16300010-16300089)
chr6 (112-177)||(21931364-21931429)
chr6 (255-363)||(28195259-28195367)
chr6 (74-181)||(17374911-17375018)
chr6 (297-354)||(15740211-15740269)
chr6 (265-370)||(18629786-18629892)
chr6 (229-375)||(25651197-25651345)
chr6 (295-378)||(25919571-25919655)
chr6 (112-177)||(19175311-19175376)
chr6 (113-177)||(16136423-16136487)
chr6 (295-354)||(33324675-33324735)
chr6 (295-354)||(35136217-35136277)
[»] chr8 (55 HSPs)
chr8 (4-363)||(41506731-41507091)
chr8 (1-371)||(24716781-24717152)
chr8 (4-344)||(39115267-39115608)
chr8 (1-363)||(274416-274779)
chr8 (1-363)||(641070-641433)
chr8 (1-363)||(826876-827239)
chr8 (1-327)||(24385671-24385988)
chr8 (117-375)||(16038916-16039176)
chr8 (73-223)||(22321437-22321587)
chr8 (210-359)||(41246635-41246785)
chr8 (207-359)||(19993171-19993324)
chr8 (207-354)||(22234920-22235068)
chr8 (6-224)||(17502274-17502492)
chr8 (4-221)||(21259413-21259630)
chr8 (6-224)||(23217990-23218208)
chr8 (207-359)||(20573309-20573461)
chr8 (31-224)||(4233968-4234161)
chr8 (207-331)||(37611675-37611798)
chr8 (207-375)||(20481565-20481735)
chr8 (210-347)||(20647949-20648087)
chr8 (210-347)||(20654025-20654163)
chr8 (216-370)||(39446892-39447046)
chr8 (291-359)||(20567200-20567268)
chr8 (267-359)||(20567335-20567427)
chr8 (267-359)||(20573528-20573620)
chr8 (255-359)||(25122513-25122618)
chr8 (216-378)||(38533607-38533770)
chr8 (60-177)||(18118259-18118376)
chr8 (274-384)||(29759893-29760005)
chr8 (229-378)||(5854572-5854722)
chr8 (218-354)||(21680984-21681121)
chr8 (298-378)||(22736046-22736127)
chr8 (210-371)||(23837163-23837325)
chr8 (112-221)||(22147555-22147664)
chr8 (295-359)||(15969796-15969860)
chr8 (117-224)||(22886440-22886547)
chr8 (229-378)||(26011452-26011602)
chr8 (112-189)||(18612555-18612632)
chr8 (112-189)||(18619460-18619537)
chr8 (300-371)||(21198362-21198434)
chr8 (229-379)||(33528383-33528533)
chr8 (117-223)||(2545061-2545167)
chr8 (229-378)||(15933256-15933406)
chr8 (119-188)||(3431317-3431386)
chr8 (210-263)||(20561751-20561804)
chr8 (118-191)||(21494496-21494569)
chr8 (254-379)||(23226240-23226368)
chr8 (112-188)||(16002147-16002223)
chr8 (170-247)||(22981281-22981358)
chr8 (253-379)||(23149736-23149865)
chr8 (302-371)||(24929018-24929087)
chr8 (254-371)||(31194488-31194606)
chr8 (295-371)||(17285232-17285309)
chr8 (265-379)||(22742717-22742833)
chr8 (267-370)||(27233244-27233348)
[»] chr5 (35 HSPs)
chr5 (4-363)||(2031783-2032143)
chr5 (1-384)||(11342635-11343021)
chr5 (1-363)||(21204898-21205262)
chr5 (1-363)||(21650668-21651031)
chr5 (1-406)||(16105573-16105980)
chr5 (207-405)||(11583982-11584184)
chr5 (207-384)||(1168321-1168500)
chr5 (207-359)||(28261498-28261651)
chr5 (207-352)||(21397073-21397222)
chr5 (208-359)||(21646857-21647009)
chr5 (207-359)||(11337303-11337455)
chr5 (207-359)||(24475560-24475708)
chr5 (207-359)||(4865239-4865393)
chr5 (207-375)||(20712036-20712206)
chr5 (60-197)||(22662653-22662790)
chr5 (59-224)||(25004929-25005094)
chr5 (208-328)||(21906729-21906846)
chr5 (112-406)||(108862-109158)
chr5 (207-331)||(24183249-24183370)
chr5 (216-370)||(19405503-19405658)
chr5 (210-378)||(7728378-7728547)
chr5 (237-359)||(23466434-23466557)
chr5 (210-379)||(3673818-3673989)
chr5 (229-378)||(21616974-21617124)
chr5 (112-221)||(17909622-17909731)
chr5 (216-379)||(23493875-23494040)
chr5 (112-224)||(7529014-7529126)
chr5 (295-370)||(16595474-16595550)
chr5 (295-378)||(32966352-32966436)
chr5 (119-224)||(9730419-9730524)
chr5 (210-362)||(19862183-19862336)
chr5 (367-405)||(24225596-24225634)
chr5 (267-379)||(6456580-6456694)
chr5 (267-378)||(37983325-37983434)
chr5 (267-370)||(29917931-29918035)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (1-384)||(14951713-14952098)
chr4 (1-371)||(5682447-5682817)
chr4 (1-371)||(25119126-25119498)
chr4 (1-354)||(15272230-15272586)
chr4 (207-359)||(53704850-53705003)
chr4 (203-384)||(55376710-55376893)
chr4 (207-371)||(34395222-34395387)
chr4 (6-213)||(19559483-19559690)
chr4 (203-359)||(23270047-23270204)
chr4 (207-359)||(44055892-44056045)
chr4 (207-359)||(16732146-16732299)
chr4 (207-347)||(44346816-44346957)
chr4 (209-359)||(53907818-53907966)
chr4 (207-359)||(30457880-30458033)
chr4 (207-344)||(21959580-21959718)
chr4 (207-353)||(820033-820177)
chr4 (112-406)||(16522748-16523044)
chr4 (31-182)||(49071842-49071993)
chr4 (207-315)||(8872588-8872699)
chr4 (1-79)||(15135926-15136005)
chr4 (112-406)||(9295624-9295920)
chr4 (207-354)||(12837317-12837464)
chr4 (207-354)||(30232613-30232761)
chr4 (229-363)||(18494467-18494602)
chr4 (59-224)||(34177617-34177781)
chr4 (216-354)||(13809636-13809775)
chr4 (208-331)||(45458973-45459096)
chr4 (230-370)||(27960938-27961078)
chr4 (112-224)||(14500246-14500358)
chr4 (295-378)||(37957230-37957314)
chr4 (229-406)||(7185983-7186159)
chr4 (108-173)||(21417471-21417536)
chr4 (112-224)||(14996241-14996353)
chr4 (269-378)||(7964890-7965000)
chr4 (210-331)||(52265628-52265749)
chr4 (112-224)||(8045058-8045170)
chr4 (107-167)||(12133626-12133686)
chr4 (295-378)||(19821981-19822065)
chr4 (210-379)||(15044784-15044955)
chr4 (200-379)||(15109458-15109640)
chr4 (295-371)||(14901197-14901274)
chr4 (118-191)||(32460743-32460816)
chr4 (295-371)||(47535251-47535328)
chr4 (253-371)||(41166109-41166228)
chr4 (267-379)||(41256546-41256660)
chr4 (230-378)||(18276392-18276541)
chr4 (112-224)||(9795330-9795442)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (1-371)||(22274688-22275058)
chr2 (1-371)||(22283921-22284291)
chr2 (1-363)||(9652815-9653179)
chr2 (1-351)||(21273967-21274319)
chr2 (1-406)||(25212977-25213385)
chr2 (177-359)||(23836791-23836975)
chr2 (207-359)||(32465835-32465988)
chr2 (1-224)||(15633327-15633550)
chr2 (207-375)||(25876036-25876206)
chr2 (253-406)||(19433495-19433649)
chr2 (208-359)||(4448251-4448402)
chr2 (203-359)||(6879414-6879571)
chr2 (207-359)||(28974026-28974179)
chr2 (207-359)||(271148-271300)
chr2 (207-371)||(25601989-25602154)
chr2 (210-375)||(36890805-36890972)
chr2 (86-247)||(7321607-7321768)
chr2 (243-359)||(27261783-27261900)
chr2 (112-406)||(24826748-24827044)
chr2 (252-378)||(3403-3529)
chr2 (60-177)||(20279571-20279688)
chr2 (230-370)||(22579999-22580140)
chr2 (207-370)||(24571408-24571572)
chr2 (344-406)||(43645824-43645886)
chr2 (295-378)||(722353-722437)
chr2 (112-224)||(33128158-33128270)
chr2 (210-375)||(67952-68119)
chr2 (119-224)||(17204445-17204550)
chr2 (338-379)||(24884643-24884684)
chr2 (140-224)||(28031296-28031380)
chr2 (295-365)||(25305416-25305487)
chr2 (252-375)||(23821767-23821892)
chr2 (252-375)||(23830846-23830971)
chr2 (112-189)||(25595168-25595245)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (1-354)||(79846-80200)
scaffold0034 (207-331)||(46171-46295)
scaffold0034 (207-331)||(40664-40788)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (1-384)||(126366-126751)
chr7 (4-363)||(111191-111550)
chr7 (1-375)||(32493965-32494341)
chr7 (1-354)||(42056207-42056563)
chr7 (1-363)||(2028893-2029257)
chr7 (1-354)||(3049565-3049918)
chr7 (1-354)||(2190104-2190460)
chr7 (1-371)||(1936936-1937290)
chr7 (210-406)||(7284180-7284376)
chr7 (207-359)||(39046740-39046893)
chr7 (207-363)||(11287390-11287547)
chr7 (1-121)||(15516780-15516901)
chr7 (31-221)||(39291458-39291648)
chr7 (207-359)||(35094794-35094946)
chr7 (207-359)||(12758965-12759117)
chr7 (31-224)||(13352065-13352258)
chr7 (207-359)||(15822548-15822701)
chr7 (229-359)||(45452305-45452435)
chr7 (207-363)||(3894998-3895155)
chr7 (207-370)||(16570122-16570287)
chr7 (207-370)||(16595375-16595540)
chr7 (210-354)||(26070384-26070529)
chr7 (210-354)||(26094171-26094316)
chr7 (207-359)||(47289758-47289911)
chr7 (207-363)||(12248237-12248395)
chr7 (207-359)||(44865204-44865360)
chr7 (229-370)||(49047813-49047955)
chr7 (207-370)||(13274753-13274918)
chr7 (61-181)||(15977820-15977940)
chr7 (253-406)||(14272049-14272203)
chr7 (207-359)||(143622-143769)
chr7 (200-371)||(17224047-17224220)
chr7 (207-375)||(12369957-12370127)
chr7 (229-378)||(16915067-16915217)
chr7 (229-378)||(48356602-48356752)
chr7 (200-379)||(13377485-13377667)
chr7 (37-177)||(18151259-18151399)
chr7 (119-224)||(371203-371308)
chr7 (112-177)||(8563369-8563434)
chr7 (267-379)||(4484683-4484797)
chr7 (115-161)||(15575874-15575920)
chr7 (87-161)||(17984753-17984827)
chr7 (300-379)||(4446168-4446249)
chr7 (300-379)||(14935319-14935400)
chr7 (300-379)||(15362912-15362993)
chr7 (295-378)||(34241393-34241477)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-371)||(31199-31570)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-371)||(41274-41645)
[»] chr1 (30 HSPs)
chr1 (1-384)||(15861345-15861728)
chr1 (1-363)||(21859984-21860347)
chr1 (1-366)||(44034890-44035255)
chr1 (59-384)||(22366970-22367296)
chr1 (207-359)||(49967628-49967780)
chr1 (207-359)||(35522436-35522588)
chr1 (207-359)||(41212046-41212202)
chr1 (207-359)||(21718206-21718358)
chr1 (207-354)||(22403227-22403375)
chr1 (207-375)||(35054716-35054886)
chr1 (231-370)||(51627805-51627945)
chr1 (207-363)||(27329872-27330026)
chr1 (295-378)||(27674755-27674838)
chr1 (4-75)||(41218667-41218738)
chr1 (295-377)||(22829629-22829712)
chr1 (229-331)||(9784239-9784341)
chr1 (229-378)||(17608886-17609036)
chr1 (295-378)||(19603055-19603139)
chr1 (298-378)||(38033882-38033962)
chr1 (267-371)||(20177140-20177245)
chr1 (112-221)||(20254430-20254539)
chr1 (119-224)||(21650076-21650181)
chr1 (295-378)||(20955644-20955728)
chr1 (267-370)||(21194980-21195084)
chr1 (112-188)||(40436291-40436367)
chr1 (253-371)||(13377003-13377122)
chr1 (252-378)||(37234022-37234149)
chr1 (210-277)||(9784184-9784248)
chr1 (40-100)||(18852668-18852728)
chr1 (300-371)||(41229149-41229221)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (4-371)||(6005-6373)
scaffold0686 (4-128)||(5799-5923)
[»] scaffold0016 (4 HSPs)
scaffold0016 (4-371)||(162100-162469)
scaffold0016 (4-371)||(166186-166547)
scaffold0016 (207-347)||(164204-164345)
scaffold0016 (267-371)||(116690-116795)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (4-371)||(30056-30427)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (1-363)||(12437-12802)
scaffold0039 (230-363)||(19049-19183)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (1-363)||(17323-17686)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (1-363)||(897-1261)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (1-363)||(55553-55917)
scaffold0032 (1-79)||(108094-108173)
scaffold0032 (291-378)||(93973-94061)
scaffold0032 (267-354)||(104799-104887)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-366)||(371-736)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (1-363)||(13304-13669)
scaffold0251 (154-354)||(21432-21634)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (1-354)||(6462-6816)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-363)||(193416-193770)
scaffold0004 (116-354)||(186560-186799)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (50-363)||(14921-15236)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-363)||(9901-10248)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (59-354)||(5-301)
scaffold0303 (1-228)||(4365-4593)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-406)||(130486-130893)
scaffold0028 (229-354)||(79521-79647)
scaffold0028 (207-276)||(89586-89655)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (207-406)||(75-274)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (229-406)||(3230-3407)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (112-363)||(9537-9789)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (207-406)||(21442-21642)
scaffold0120 (207-406)||(31141-31341)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (207-406)||(24890-25088)
scaffold0158 (207-337)||(25212-25341)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (112-363)||(94948-95204)
scaffold0037 (207-363)||(24845-25002)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (210-406)||(234-430)
scaffold0310 (330-406)||(6603-6679)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-123)||(42568-42690)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (177-359)||(32180-32363)
scaffold0091 (177-359)||(41940-42123)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (4-224)||(44036-44256)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (207-352)||(11825-11970)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (207-359)||(132367-132520)
scaffold0021 (207-363)||(11660-11818)
scaffold0021 (208-323)||(88289-88404)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (207-359)||(70739-70892)
scaffold0001 (203-359)||(60784-60940)
scaffold0001 (112-224)||(164995-165107)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (207-359)||(5363-5516)
scaffold0480 (207-363)||(8998-9156)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (207-359)||(22668-22821)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (207-359)||(6962-7118)
scaffold0673 (207-359)||(939-1092)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (210-363)||(109582-109736)
scaffold0035 (208-363)||(118081-118237)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (59-224)||(219-384)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (207-359)||(254931-255084)
scaffold0011 (207-359)||(261537-261690)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (207-359)||(14854-15004)
scaffold0083 (266-359)||(14194-14288)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (207-352)||(7556-7699)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (210-347)||(85321-85459)
scaffold0014 (199-363)||(159275-159438)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (207-359)||(693-846)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (59-224)||(1478-1643)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (207-347)||(38287-38428)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (207-371)||(253106-253271)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (207-370)||(9903-10067)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (207-375)||(15588-15761)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (207-363)||(8960-9117)
[»] scaffold0195 (1 HSPs)
scaffold0195 (207-359)||(635-788)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (210-353)||(1300-1444)
scaffold0359 (207-359)||(11771-11921)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (300-406)||(28466-28573)
scaffold0150 (356-406)||(21637-21687)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (207-359)||(112662-112812)
scaffold0022 (229-370)||(109556-109698)
scaffold0022 (291-378)||(103123-103211)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (207-375)||(146561-146731)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (233-384)||(1332-1485)
[»] scaffold0160 (2 HSPs)
scaffold0160 (207-354)||(3-151)
scaffold0160 (267-363)||(3492-3589)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (61-224)||(5996-6159)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (210-371)||(4906-5068)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (210-359)||(11688-11837)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (198-359)||(48124-48286)
scaffold0068 (198-359)||(61572-61734)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (6-222)||(3761-3981)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (216-370)||(33854-34008)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (210-331)||(33668-33789)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (265-363)||(24372-24471)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (232-370)||(31010-31149)
scaffold0031 (216-274)||(70676-70734)
scaffold0031 (295-378)||(97403-97487)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (252-363)||(1889-2001)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (210-371)||(76967-77129)
[»] scaffold0335 (2 HSPs)
scaffold0335 (112-224)||(5610-5722)
scaffold0335 (324-375)||(5823-5875)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (112-224)||(17812-17924)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (267-378)||(43975-44087)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (112-224)||(49877-49989)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (253-375)||(270-393)
[»] scaffold0740 (2 HSPs)
scaffold0740 (208-271)||(4351-4414)
scaffold0740 (291-359)||(4284-4353)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (293-363)||(7807-7878)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (237-347)||(3308-3419)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (290-375)||(6622-6708)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (229-378)||(69415-69565)
scaffold0009 (111-176)||(244855-244920)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (112-224)||(34442-34554)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (112-224)||(61256-61368)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (216-378)||(2483-2646)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (346-403)||(12990-13048)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (112-221)||(5338-5447)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (295-371)||(35444-35520)
scaffold0013 (124-177)||(7112-7165)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (119-191)||(6252-6324)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (112-220)||(11862-11970)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (124-191)||(17355-17422)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (314-371)||(1364-1422)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (112-192)||(902-982)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (366-406)||(12694-12734)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (293-363)||(22715-22786)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (210-379)||(2436-2607)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (371-406)||(3392-3427)
scaffold0090 (37-167)||(34404-34535)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (37-167)||(19881-20012)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (115-164)||(10992-11041)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (267-379)||(107967-108080)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 342; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 33342217 - 33341812
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  33342217 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 33342118  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  33342117 aatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgtttaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagttggtaa 33342018  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33342017 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattatgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 33341918  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttga 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33341917 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttga 33341818  T
Q  401 tgatgt 406  Q
    | ||||    
T  33341817 ttatgt 33341812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Original strand, 54685220 - 54685625
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54685220 tttatgataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 54685319  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  54685320 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagttggtaa 54685419  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54685420 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 54685519  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttga 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  54685520 ttcatggcttggatttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgctgttgctggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttga 54685619  T
Q  401 tgatgt 406  Q
    ||||||    
T  54685620 tgatgt 54685625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 4 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 7854315 - 7853913
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7854315 atcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttat 7854216  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||    
T  7854215 gttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggataattggtaaatt 7854116  T
Q  204 atactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7854115 atgttcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 7854016  T
Q  304 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatga 403  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7854015 atggcttgggtttgcatgaatcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 7853916  T
Q  404 tgt 406  Q
    |||    
T  7853915 tgt 7853913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30153278 - 30152893
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30153278 tttatcataatcatttaattaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 30153179  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30153178 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 30153079  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  30153078 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 30152979  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 384  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  30152978 tatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 30152893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 17955903 - 17956274
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17955903 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataatcgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 17956002  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17956003 tatgtggtagagatatgtctgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgagtagtttgtaa 17956102  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  17956103 attatactcaattggtgtattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 17956202  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  17956203 tacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 17956274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45581967 - 45581591
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45581967 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 45581868  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45581867 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgattaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 45581768  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45581767 attatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 45581668  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  45581667 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 45581591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 54038043 - 54038406
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  54038043 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaactcaatgtttgacattcgtgct 54038142  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54038143 tatattgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 54038242  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54038243 attatgctaaattggtgaattatgcatggttgttgatgaaatgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgataa 54038342  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| | ||||||| | ||||||    
T  54038343 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttaagaaataaattgttgttgttggttt 54038406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3992886 - 3992522
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  3992886 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtaattatcatgaactcaacctttgaaatccgtgct 3992787  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3992786 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaggttcatgatgtaggaaaatgggtagtttgtaa 3992687  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  3992686 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 3992587  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  3992586 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 3992522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23492709 - 23492346
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  23492709 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcttgct 23492610  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23492609 tatgttgtagagatatgtttgaatgtgttaatttgatgttaaatgaattgttgattatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 23492510  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  23492509 attatgctcaaatggtgaattatggatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 23492410  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  23492409 ttcatggcttgggtatgcatgattcatagtttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 23492346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 53771378 - 53771022
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53771378 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 53771279  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53771278 ttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgta 53771179  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| ||    
T  53771178 aattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgcta 53771079  T
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  53771078 attcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 53771022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16261790 - 16261463
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16261790 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcgtaattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 16261691  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16261690 ttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtacgaaaatgggtagtttgta 16261591  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||    
T  16261590 aattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgcta 16261491  T
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcat 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16261490 attcatggcttgggtatgcatgattcat 16261463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 38168250 - 38167896
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  38168250 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtact 38168151  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38168150 tatgttgtagaaatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 38168051  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  38168050 attatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtaataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaa 38167951  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  38167950 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 38167896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 2844527 - 2844172
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2844527 tttatcataatcatttagttgattctttttctcttattctatgcataattgattatgggaataagcgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 2844428  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | |||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2844427 tatgttgtagatttttgttttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 2844328  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  2844327 attatgctcaattggtgaattatgcatggttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 2844228  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  2844227 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaagtaagttgttgt 2844172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 28558507 - 28558271
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28558507 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttccatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacctaatctttgaaattcgtgct 28558408  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28558407 tatgtgatagagatatgtttgaatatgttaatttgatgataaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 28558308  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgat 237  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28558307 atgatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat 28558271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 55513206 - 55513006
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  55513206 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatggaaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 55513107  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55513106 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaattcgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttaatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 55513007  T
Q  201 a 201  Q
    |    
T  55513006 a 55513006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18970254 - 18970034
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    ||||||| || ||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  18970254 atcataaccacttagttagtttcttttctctttttctatgcataagtgattatttgaataagtgattattatgaacccaatctttgaaattcgtgctcat 18970155  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  18970154 gttgtagtgatatgtttaagtatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaatttcatgttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtgaatt 18970055  T
Q  204 atactcaattggtgaattatg 224  Q
    || |||||||| |||||||||    
T  18970054 atgctcaattgatgaattatg 18970034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 19946918 - 19946629
Alignment:
Q  118 tttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtg 217  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||| || |||   ||||||| || ||||| ||    
T  19946918 tttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgagtagttgtgaaattatgcttaattgatg 19946819  T
Q  218 aattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 315  Q
    | ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  19946818 atttatgacatg-ttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggcttgggtt 19946720  T
Q  316 tgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19946719 tgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatatagaagtttgattttgatgatgt 19946629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 207 - 351
Target Start/End: Original strand, 16996176 - 16996321
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  16996176 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 16996275  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgt 351  Q
    ||||| |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  16996276 gcttgagtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagttgt 16996321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 19570805 - 19570957
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19570805 ctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 19570904  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19570905 gcttgagtttgcataattcttggttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19570957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 347
Target Start/End: Original strand, 50112168 - 50112309
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  50112168 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 50112267  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 347  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  50112268 gcttgagtttgcatgattcatggtttgtttttgagaaatgag 50112309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 317628 - 317778
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  317628 aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggct 317727  T
Q  310 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    || ||||| || |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  317728 tgagtttgtataattcttggtttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 317778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 22144389 - 22144542
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |  ||||||||||| ||||    
T  22144389 ctcaattggtgaagtatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagccatgttgttgatgataatacatg 22144488  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  22144489 gcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 22144542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 210 - 353
Target Start/End: Original strand, 16182065 - 16182209
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  16182065 aattggtgaattatgcattgtcgttgatgaattgtgataagtttaatgatcaattgttgttgttgttttttagtcatgttgttgatgataattcatggct 16182164  T
Q  310 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 353  Q
    ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  16182165 tgggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttg 16182209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48421855 - 48421690
Alignment:
Q  59 gaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 158  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  48421855 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcatgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttggtgat 48421756  T
Q  159 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatg 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  48421755 gaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgagaattatgttcaattggtgaattatg 48421690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 331
Target Start/End: Original strand, 12349847 - 12349970
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  12349847 ctcaattggtgaattatgcatcgtagttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 12349946  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgatt 331  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  12349947 gcttggg-ttgcatgattcatgatt 12349970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13817642 - 13817492
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  13817642 ctcaattggtgaattatgcattgttgttggtgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgt---tgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 13817546  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13817545 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 13817492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35123826 - 35123674
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  35123826 ctcaattggtgaattatgctttgttgttattgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 35123727  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35123726 gtttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35123674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15550876 - 15550714
Alignment:
Q  59 gaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 158  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||  ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  15550876 gaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgat 15550777  T
Q  159 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaatt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  15550776 gaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaatt 15550714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 6154448 - 6154600
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  6154448 ctcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 6154547  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6154548 gcttggg-ttgcatgattcataattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6154600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14298551 - 14298399
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  14298551 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattcatg 14298452  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14298451 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14298399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14304178 - 14304026
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||  |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  14304178 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgtcgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattaatatgtcatgttgttgatgataattcatg 14304079  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14304078 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 14304026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 207 - 354
Target Start/End: Original strand, 53898572 - 53898719
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||| |  ||| ||||||||||||    
T  53898572 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgttgcattgtgataagtttcatgatcaattaatgttgttgttgatatgtcatgttgttggtgataattcatg 53898671  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  53898672 gcttgggtttgcaagattcatgatttatgttgagaaatgagatgttgt 53898719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Original strand, 17523006 - 17523176
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgt-ttgatgataattcat 305  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||  | | |||||||||||||||    
T  17523006 ctcaattggtgaattatgctatgttattgatgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgctaagtcaattttgttgatgataattcat 17523105  T
Q  306 ggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||| || |||||||||    
T  17523106 ggcttgggtttgcatgatttatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggt 17523176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 6146863 - 6147015
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||    
T  6146863 ctcaattggtgaatcatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatggtcaattgttgctgttgttgttaagtcatgttgttgataataattcatg 6146962  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgt-tgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | | |||||||||| |||||| ||||    
T  6146963 gcttgggttt-catgattcatgattttgtatggagaaatgagatgttgttggtg 6147015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 267 - 406
Target Start/End: Original strand, 47784924 - 47785064
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    ||||||||||||| ||| || |  ||| | || ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||    
T  47784924 tgttgttgttgttaagtgatgttgttgttaatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttggtgagaaatgagttgttgttggtgattctg 47785023  T
Q  366 taaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47785024 taaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 47785064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14295569 - 14295415
Alignment:
Q  207 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 305  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||||||||||    
T  14295569 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgataattcat 14295470  T
Q  306 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14295469 ggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14295415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17100783 - 17100636
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  17100783 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 17100684  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 353  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17100683 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17100636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17101468 - 17101321
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  17101468 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttattgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 17101369  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 353  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  17101368 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttg 17101321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 210 - 363
Target Start/End: Original strand, 11329081 - 11329235
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  11329081 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 11329180  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  11329181 tgggtatgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagttt 11329235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 229 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17139616 - 17139474
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17139616 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatg 17139517  T
Q  329 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  17139516 atttgttgttgcgaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 17139474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 363
Target Start/End: Original strand, 14528151 - 14528286
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  14528151 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatggtaattcatggcttgggtatgaatgattcatg 14528250  T
Q  329 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14528251 atttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 14528286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 325 - 406
Target Start/End: Original strand, 9303343 - 9303425
Alignment:
Q  325 catgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9303343 catgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaacgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 9303425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 28558282 - 28558188
Alignment:
Q  262 atggttgttg-ttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||    
T  28558282 atggttgttgattgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgt 28558188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 363
Target Start/End: Original strand, 12560362 - 12560510
Alignment:
Q  216 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 315  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |  | |||| |||||| ||||||||||     
T  12560362 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatatgattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcctggcttgggta 12560461  T
Q  316 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  12560462 tgcatgattcatgatttgatgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 12560510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 207 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 54424142 - 54423986
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| | ||| |  |  | |||||| |||||||    
T  54424142 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttattgctaagtgacgttgtggatgattattcatg 54424043  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  |  |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  54424042 gcttgggtatgcatgattcatgatttgttatgagaaataagttgttgttgttggttt 54423986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 11402896 - 11402752
Alignment:
Q  31 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgtta 130  Q
    |||| |||||||||| || || ||||  ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||| | |    
T  11402896 ctctagttctatgcacaagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtgctcatattatagtgatatgtttgagtatatga 11402797  T
Q  131 atttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatg 175  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  11402796 atttgatgataattgaattgttgttgatgaaatttcatgttcatg 11402752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 354
Target Start/End: Original strand, 19260956 - 19261104
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | | || |  |  ||| |||||||||    
T  19260956 ctcaattggtgaattatactaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaaatgatgttatgaatgttaattcatg 19261055  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||  ||||| |||||||||    
T  19261056 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttatgaaataagttgttgt 19261104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 237 - 363
Target Start/End: Original strand, 55440996 - 55441123
Alignment:
Q  237 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttg 335  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| || | ||| || |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  55440996 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgatgctaagtgatgttgttgatgataattcatgacttgggtatgcataattcatgattttttg 55441095  T
Q  336 ttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  55441096 ttgagaaatgagatgttgttggtggttt 55441123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14301196 - 14301042
Alignment:
Q  207 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 305  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||| ||||||    
T  14301196 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgtttctaagtgatgttgttgatgattattcat 14301097  T
Q  306 ggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    | ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14301096 gtctttggtttgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14301042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 354
Target Start/End: Original strand, 12349656 - 12349809
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  | |||||||| |||||    
T  12349656 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgtagatgataaatcatg 12349755  T
Q  307 gcttg-----ggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||     |||||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||    
T  12349756 gcttggccatggtttgcatgattcataatttgatgatgagaaataagttgttgt 12349809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17393735 - 17393590
Alignment:
Q  37 ttctatgcataattgatta--tgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaattt 134  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||    | |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  17393735 ttctatgcataattgcttaattgaga-taagtgattattatgaacttaattgttgaaattcgtgctctagttgtagtgatatgtttgggtatgttaattt 17393637  T
Q  135 gatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtat 181  Q
    | || ||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  17393636 gttgataattgaattattgacgatgaaattgcatgttcatgctgtat 17393590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 229 - 379
Target Start/End: Original strand, 12488865 - 12489017
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  12488865 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtgttcataattcatg 12488964  T
Q  329 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 379  Q
    | ||  || || ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  12488965 atttaatgatgggaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 12489017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 291 - 354
Target Start/End: Original strand, 14059414 - 14059478
Alignment:
Q  291 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14059414 ttgatgataattcatggcttgggtttgcataattcatgatctgttgatgagaaatgagatgttgt 14059478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 177
Target Start/End: Original strand, 14177017 - 14177105
Alignment:
Q  89 gaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 177  Q
    ||||||||| || || | |||| ||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14177017 gaaattcgtcctcatgttgtagtgatatgtttcagtatgttcatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgat 14177105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 230 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17204807 - 17204667
Alignment:
Q  230 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 329  Q
    |||||| |||||| ||||| |  ||||| | ||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |  || ||||||||    
T  17204807 ttgttgttgaattgtgataggaatcatgtttaatggatgttgttgttgctaagtaatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttataattcatga 17204708  T
Q  330 tt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 369  Q
    || |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17204707 tttgttgatgagaaatgagttgttgttagtggttttgtaaa 17204667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 38811170 - 38811297
Alignment:
Q  252 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttg 350  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| || | ||||||||||||    
T  38811170 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgtgcataattcatgttttgatgatcagaaatgagttg 38811269  T
Q  351 ttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    |||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38811270 ttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38811297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 1990873 - 1990759
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt-tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtttt 364  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||| || | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1990873 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttggtttgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggtttt 1990774  T
Q  365 gtaaaatgggttgat 379  Q
    |||||||||||||||    
T  1990773 gtaaaatgggttgat 1990759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 378
Target Start/End: Original strand, 17960520 - 17960602
Alignment:
Q  297 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  17960520 ataattcatgacttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgggaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 17960602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 260
Target Start/End: Original strand, 34439451 - 34439513
Alignment:
Q  198 taaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatc 260  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34439451 taaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattatgataagtttcatgatc 34439513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 8275874 - 8275986
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  8275874 gataagtttgagtatgttaattgaacgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaa 8275973  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| |||||||||    
T  8275974 ttgatgaattatg 8275986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 9303129 - 9303241
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  9303129 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 9303228  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| ||| |||||    
T  9303229 ttgatgacttatg 9303241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8631912 - 8631801
Alignment:
Q  215 gtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggt 314  Q
    ||||||||||| | ||||||| || ||| ||||| ||||||| |  ||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||||||||||    
T  8631912 gtgaattatgctttgttgttgttggattgtgataagtttcataacaaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggt 8631813  T
Q  315 ttgcatgattca 326  Q
    ||||||||||||    
T  8631812 ttgcatgattca 8631801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 177
Target Start/End: Original strand, 12539066 - 12539156
Alignment:
Q  87 ttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 177  Q
    ||||||||||||||  | |  ||| |||||| |||| ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12539066 ttgaaattcgtgctcttgttttagtgatatggttgagtatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgat 12539156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 370
Target Start/End: Original strand, 9590918 - 9591035
Alignment:
Q  254 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgtt 352  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||| | |||  ||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  9590918 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgttcatagttcatgatttgatgatgagaaatgagttgtt 9591017  T
Q  353 gtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    || | |||||||||||||    
T  9591018 gttgttggttttgtaaaa 9591035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Original strand, 16934010 - 16934115
Alignment:
Q  119 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtga 218  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||||| |||    
T  16934010 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 16934109  T
Q  219 attatg 224  Q
     |||||    
T  16934110 cttatg 16934115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 8268774 - 8268886
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  | | |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||| ||| |||   ||||||| || ||    
T  8268774 gataagtttgagtatgttaattgaacgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaattggttgttatgaaattatgcttaa 8268873  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| |||||||||    
T  8268874 ttgatgaattatg 8268886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14285187 - 14285075
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||  ||||||||||||||| |||   ||| ||| || ||    
T  14285187 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcatagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaaatatgcttaa 14285088  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| |||||||||    
T  14285087 ttgatgaattatg 14285075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12953034 - 12952915
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12953034 tgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttg 12952935  T
Q  366 t-aaaatgggttgataatga 384  Q
    | ||||||||||||| ||||    
T  12952934 taaaaatgggttgattatga 12952915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17938701 - 17938582
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| || ||| || |   ||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||| || ||||||||||    
T  17938701 aattgatgaattatgctttgttgttgttggattgtggttattttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataatcattcatggct 17938602  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga 329  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  17938601 tgggtttacatgattcatga 17938582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15876176 - 15876034
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || ||||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  15876176 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttggtaagtgatgttgttaatgatgattcatggcttaggtattcataattcatg 15876077  T
Q  329 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    | |||| | |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||    
T  15876076 atttgtggatgagaaatgagttggtgttggtagtttggtaaaa 15876034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 354
Target Start/End: Original strand, 3576615 - 3576703
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  | | |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3576615 tgttgttgttgctaagtaatattgtggttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgt 3576703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16880231 - 16880131
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | |||| |||||| | ||| || |  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16880231 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttattgttgctaagtgatgttgtggatgataattcatggcttgggtgtgcataattcatg 16880132  T
Q  329 a 329  Q
    |    
T  16880131 a 16880131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 34559969 - 34559857
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||| ||| | || |||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  34559969 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcataatttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttg 34559870  T
Q  366 taaaatgggttga 378  Q
    |||||||||||||    
T  34559869 taaaatgggttga 34559857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 107 - 158
Target Start/End: Original strand, 37915310 - 37915361
Alignment:
Q  107 gtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 158  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37915310 gtagtgatatgtttgggtatgttaatttgttgttaattgaattgttgatgat 37915361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 38375718 - 38375797
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggt 191  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  38375718 gatatgtttgagtacatgaatttgatgataattgaattgttgtagatgaaattgcatgttcataatttgtgaaaatgggt 38375797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17191583 - 17191511
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaa 369  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  17191583 tgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtt---ggtggttttgtaaa 17191511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 39656494 - 39656453
Alignment:
Q  183 aaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatg 224  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  39656494 aaaatgggtagtttgtgaattatattcaattggtgaattatg 39656453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 35015076 - 35015447
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35015076 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 35015175  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35015176 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 35015275  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  35015276 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 35015375  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  35015376 tacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 35015447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 4 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18583650 - 18583264
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18583650 atcataatcatttagttaattctttttctcctgttctatgcatcattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttat 18583551  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18583550 gttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaatt 18583451  T
Q  204 atactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||                |||||||||||||    
T  18583450 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttg----------------ttgatgataattc 18583367  T
Q  304 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatga 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18583366 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 18583267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 19983211 - 19983581
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19983211 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaatccaatctttgaaattcgtgct 19983310  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  19983311 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagttt-aaa 19983409  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    | ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  19983410 actatgctcaattagtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatggttagtggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 19983509  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19983510 tacatggcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 19983581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 26090072 - 26089718
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26090072 tttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 26089973  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26089972 ttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcataatgtatgaaaatgggtagtttgta 26089873  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||    
T  26089872 aattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgcta 26089773  T
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  26089772 attcatggtttgggtatgcatgattcataattgttgttgtgaaataagttgttgt 26089718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 18002414 - 18002777
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18002414 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgggcataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 18002513  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18002514 ttatgttgtagagatatgtttgaatatgttcatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgta 18002613  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 299  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |  |  | |||| ||    
T  18002614 aattatgctcaattgatgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgcta 18002713  T
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18002714 attcatggcttgggtatgcatgattcatacttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18002777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 23995260 - 23994904
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||    
T  23995260 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatatttggaattcgtgc 23995161  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23995160 ttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgta 23995061  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| ||    
T  23995060 aattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgcta 23994961  T
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  23994960 attcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 23994904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 15742139 - 15742505
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15742139 tttatcataatcctttggttaattctttttctcttgttc-atgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 15742237  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatg-ttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  15742238 tatgttgtagagatatgtttgattatgttaatttgatgattaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtaatttgta 15742337  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatgg---ttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatg 296  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||| || |  |  |||    
T  15742338 tattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttgttaagtgatgttatgaatg 15742437  T
Q  297 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  15742438 ctaattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgctggttt 15742505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 4991409 - 4991002
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4991409 tttatcataatcatttgtttaattctttttctcttgattttatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 4991310  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||| |||   |    
T  4991309 ttatgttgtagagatatgtttggatatgtt-atttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtga 4991211  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatg-atcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 297  Q
    |||||| || ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||    | ||  ||| |  ||||| | ||||||||||| | ||  || |  ||||| |    
T  4991210 aattatgcttaattgatgacttatgacat-gttgttgttgaattggtgtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgatca 4991112  T
Q  298 taattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaat 396  Q
    | | |  |||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4991111 tgaattttggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgatt 4991012  T
Q  397 ttgatgatgt 406  Q
    ||||||||||    
T  4991011 ttgatgatgt 4991002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 112 - 406
Target Start/End: Original strand, 18823417 - 18823712
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   || |||| || ||    
T  18823417 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaagttatgcttaa 18823516  T
Q  212 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  18823517 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattgcggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggct 18823615  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18823616 tgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatggcttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 18823712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 22585470 - 22585688
Alignment:
Q  6 cataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatat 105  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||  ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || |    
T  22585470 cataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgt 22585569  T
Q  106 ggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattat 205  Q
     |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||    
T  22585570 tgtagtgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattat 22585669  T
Q  206 actcaattggtgaattatg 224  Q
     ||||||||  ||||||||    
T  22585670 gctcaattgaagaattatg 22585688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Original strand, 22590301 - 22590519
Alignment:
Q  6 cataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatat 105  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||  ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || |    
T  22590301 cataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattttgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgt 22590400  T
Q  106 ggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattat 205  Q
     |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||    
T  22590401 tgtagtgatatgtttgagtattttaatttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattat 22590500  T
Q  206 actcaattggtgaattatg 224  Q
     ||||||||  ||||||||    
T  22590501 gctcaattgaagaattatg 22590519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Original strand, 15889628 - 15889871
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||  ||||| |||||||||||| || ||||  ||||| ||||||||  |||||  || |||||||||||||||| ||    
T  15889628 atcataatcacttagttaatttcttctctctttttctatgcataagtgtttatttgaatacgtgattattgtgaacccaacctttgaaattcgtgctcat 15889727  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  15889728 gttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgatttgttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaatt 15889827  T
Q  204 atactcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgat 247  Q
    ||  |||| || ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  15889828 atgttcaactgatgaattatgacat-gttgttgatgaattgtgat 15889871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 112 - 406
Target Start/End: Original strand, 18839272 - 18839567
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  18839272 gataagtttgagtatgttaactgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 18839371  T
Q  212 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||| ||| ||||| |||| || ||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||| |||||||    
T  18839372 ttgatgacttatgacatg-ttattgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatccatggct 18839470  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||    
T  18839471 tgggtttgcatgattcatgattgttgtggagaaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatgagttgaaaaagaagaagtttgattttgatgatgt 18839567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 208 - 359
Target Start/End: Original strand, 25744331 - 25744483
Alignment:
Q  208 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 307  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  25744331 tcaagtggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatgg 25744430  T
Q  308 cttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||| |||| | | ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  25744431 cttgggtttgcataattcttggtttgttgtagagaaatgagatgttgttggtg 25744483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32898920 - 32898779
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||    
T  32898920 ctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgaagttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattaatg 32898821  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 347  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32898820 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 32898779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 248
Target Start/End: Original strand, 15004831 - 15005072
Alignment:
Q  6 cataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatat 105  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||  ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || |    
T  15004831 cataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagagattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgt 15004930  T
Q  106 ggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattat 205  Q
     |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||| ||||||    
T  15004931 tgtagtgatatgtttgagtatgt-aatttgatgttgattgaattgttgatgaggaaattgcatgtttatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattat 15005029  T
Q  206 actcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgata 248  Q
      ||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||    
T  15005030 gttcaattgatgaattatgacat-gttgttgttgaattgtgata 15005072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22441064 - 22440911
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  22441064 ctcaattggtgaattatgcattgttgttcatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 22440965  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  22440964 gcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 22440911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31628395 - 31628245
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  31628395 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggct 31628296  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  31628295 tgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtg 31628245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Original strand, 25640505 - 25640720
Alignment:
Q  31 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgtta 130  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||  ||  ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| |||||||    
T  25640505 ctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgctcatgttgtag-gatatgtttgagtatgtta 25640603  T
Q  131 atttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatg-catgg 229  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||| || ||| |    
T  25640604 atttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtagataaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaattgtgacat-g 25640702  T
Q  230 ttgttgatgaattttgat 247  Q
    |||||| |||||||||||    
T  25640703 ttgttgttgaattttgat 25640720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 208 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18777275 - 18777119
Alignment:
Q  208 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 307  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||    
T  18777275 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatgaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatgg 18777176  T
Q  308 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  18777175 cttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 18777119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 13014826 - 13014979
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||| |  ||||||||||||| ||    
T  13014826 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcaagatcaattgttgttgctgatgttaagtcatgttgttgatgataattcgtg 13014925  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  13014926 gcttggg-ttgcatgattcttgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 13014979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16086144 - 16086001
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||| ||    
T  16086144 aattggtgaattataccttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattcatgact 16086045  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttg 353  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||    
T  16086044 tgggtttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttg 16086001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 18432770 - 18432626
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | || |||||||| |  || || |  |||||||||||||||||||    
T  18432770 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgatgttgttgatatgttatgttgttgatgataattcatggct 18432671  T
Q  310 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttg 353  Q
    ||||||||||||||| || | || ||||||| ||||||| |||||    
T  18432670 tgggtttgcatgattaatggtttattgttgaaaaatgagatgttg 18432626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18399065 - 18398890
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||    
T  18399065 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggct 18398966  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 384  Q
    ||||| ||||| |||||||| |  || | |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18398965 tgggtgtgcataattcatgaattgtgataagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgattatga 18398890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 371
Target Start/End: Original strand, 18381803 - 18381965
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| ||||||||||    
T  18381803 aattgttgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 18381902  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    ||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18381903 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 18381965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 207 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 18570409 - 18570271
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  18570409 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagaagtagttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 18570310  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaat 344  Q
    || ||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  18570309 gcctgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaat 18570271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 295 - 406
Target Start/End: Original strand, 17083383 - 17083496
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagttt 392  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || | |||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17083383 tgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgattagaaatgagttgttgttgttgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagttt 17083482  T
Q  393 gaatttgatgatgt 406  Q
    || |||||||||||    
T  17083483 gattttgatgatgt 17083496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 210 - 378
Target Start/End: Original strand, 22361885 - 22362054
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||    
T  22361885 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgaaattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 22361984  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    ||||| | ||| ||||||| |||| || |||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  22361985 tgggtgttcataattcatgaattgatgatgagaattgagttgttgttgttagttttgtaaaatgggttga 22362054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 354
Target Start/End: Original strand, 25367376 - 25367502
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25367376 gttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttatcgataattcatggcttgggtgtgcatgattcatg 25367475  T
Q  329 -attgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  25367476 aattgttgatgagaaatgagatgttgt 25367502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16106643 - 16106499
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||||||||| |     
T  16106643 aattggtgaattataccttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcatttgatgttgttgttgatatgtcatgttgttaatgataattcatgac- 16106545  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
        ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16106544 ----tttgcatgattcatgatttatgtggagaaatgagatgttgttggtg 16106499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19629556 - 19629447
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  19629556 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaa 19629457  T
Q  212 ttggtgaatt 221  Q
    ||| ||||||    
T  19629456 ttgatgaatt 19629447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Original strand, 32276793 - 32276902
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  32276793 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 32276892  T
Q  212 ttggtgaatt 221  Q
    ||| ||||||    
T  32276893 ttgatgaatt 32276902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 191
Target Start/End: Original strand, 16300010 - 16300089
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggt 191  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  16300010 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggt 16300089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21931429 - 21931364
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 177  Q
    ||||||||||||||| | || |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21931429 gatatgtttgaatatatgaaattgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgat 21931364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 363
Target Start/End: Original strand, 28195259 - 28195367
Alignment:
Q  255 atgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 353  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| |||||    
T  28195259 atgatcaattgttgtggttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgagtttgcataatt-atgatttattgttgagaaatgagatgttg 28195357  T
Q  354 tcggtggttt 363  Q
    | ||| ||||    
T  28195358 ttggtagttt 28195367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 181
Target Start/End: Original strand, 17374911 - 17375018
Alignment:
Q  74 atgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 173  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||    | |||| ||||||||||| |||| ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||| || |||||    
T  17374911 atgaacttaattgttgaaattcgtgctctagttgtagtgatatgtttgagtatgctaatttgttgataattgaattattgatgatgaaattacatgttca 17375010  T
Q  174 tgatgtat 181  Q
    || |||||    
T  17375011 tggtgtat 17375018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 15740269 - 15740211
Alignment:
Q  297 ataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15740269 ataattcatggtttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgt 15740211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 370
Target Start/End: Original strand, 18629786 - 18629892
Alignment:
Q  265 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  18629786 gttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttt 18629885  T
Q  364 tgtaaaa 370  Q
    |||||||    
T  18629886 tgtaaaa 18629892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25651345 - 25651197
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  25651345 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 25651246  T
Q  329 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    ||| | || |||||| | ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  25651245 attggatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 25651197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 25919655 - 25919571
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  25919655 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgaaaaatgagttattgttggtgactttgtaaaatgagttga 25919571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19175376 - 19175311
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 177  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  19175376 gatatgtttgagtatataaaattgatgataattgaattgttgttgataaaattgcatgttcatgat 19175311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16136487 - 16136423
Alignment:
Q  113 atatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 177  Q
    |||||||||||||| | || |||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  16136487 atatgtttgaatatatgaaattgatgataattgaatagtttttgatgaaattgcatgttcatgat 16136423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 33324735 - 33324675
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  33324735 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 33324675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 354
Target Start/End: Original strand, 35136217 - 35136277
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  35136217 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattggtgatgagaaatgagttgttgt 35136277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 55)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 363
Target Start/End: Original strand, 41506731 - 41507091
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  41506731 atcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaatccgtgcttat 41506830  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41506831 gttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaatt 41506930  T
Q  204 atactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41506931 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattc 41507030  T
Q  304 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  41507031 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 41507091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 24716781 - 24717152
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |    
T  24716781 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccgatctttgaaattcgtggt 24716880  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  24716881 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgataatgaaattgcaagttcacgatgtatgaaaatggatagtttgtaa 24716980  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  24716981 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatttgtttcatgttcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatga 24717080  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  24717081 tacatggcttgggtttgcatgattcataatttgttgttgataaatggattgttgttggtggttttgtaaaat 24717152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 4 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 39115608 - 39115267
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  39115608 atcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgacattcgtgcttat 39115509  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39115508 gttgtaaagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtaatttgtaaatt 39115409  T
Q  204 atactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39115408 atgctcaattggtgaattatgcatagttgttgatgaatcgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 39115309  T
Q  304 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaat 344  Q
    ||| |||| || |||||||||||| | || ||||||||||||    
T  39115308 atgacttgtgtatgcatgattcataatttattgttgagaaat 39115267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 274779 - 274416
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  274779 tttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcg 274680  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  274679 tatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtgtagtttgtaa 274580  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | |||| |||    
T  274579 attatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaa 274480  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  274479 ttcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 274416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 641070 - 641433
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  641070 tttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcg 641169  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  641170 tatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtgtagtttgtaa 641269  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | |||| |||    
T  641270 attatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaa 641369  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  641370 ttcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 641433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 826876 - 827239
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  826876 tttatcataatcatttagttaatccattttctcttgtcctatgcataattgattatgagaataagttattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcg 826975  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  826976 tatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtgtagtttgtaa 827075  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| || |  | |||| |||    
T  827076 attatgttcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttattgttaagtgatgttatggatgctaa 827175  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  827176 ttcatggcttgggtatgcatgaatcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 827239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 327
Target Start/End: Original strand, 24385671 - 24385988
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  24385671 tttatcataatcatttagttaattccttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattattatgaacccaatctttgaaattcgtgct 24385770  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24385771 tatgttgtagagatatgtttgaatatgataatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 24385870  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||         | | ||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  24385871 attatgctcaattggtgaattaagcattgttgttgatgaat---------tgtaatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgattttatggatgctaa 24385961  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcat 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||    
T  24385962 ttcatggcttgggtatgcatgattcat 24385988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 117 - 375
Target Start/End: Original strand, 16038916 - 16039176
Alignment:
Q  117 gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggt 216  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||    
T  16038916 gtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattagt 16039015  T
Q  217 gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggttt 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||| ||||||||| | |    
T  16039016 gaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaatttatggcttggatat 16039115  T
Q  317 gcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  16039116 gcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 16039176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 223
Target Start/End: Original strand, 22321437 - 22321587
Alignment:
Q  73 catgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttc 172  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22321437 catgaacccaatctttgaaattcgtgctcaggttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaattgcaagttc 22321536  T
Q  173 atgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattat 223  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22321537 atgacgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattat 22321587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41246785 - 41246635
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  41246785 aattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatggct 41246686  T
Q  310 tgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41246685 tgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 41246635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 19993171 - 19993324
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19993171 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataaatttcatcatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 19993270  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19993271 gctagggtttgcataattcttggattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 19993324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 354
Target Start/End: Original strand, 22234920 - 22235068
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  22234920 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 22235019  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    | |||||||||||| |||| | | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  22235020 gattgggtttgcataattcttggtttgttgttgaggattgagatgttgt 22235068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17502492 - 17502274
Alignment:
Q  6 cataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatat 105  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||  ||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| || |    
T  17502492 cataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattatgaacccaatctttgaaatttgtgctcatgt 17502393  T
Q  106 ggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattat 205  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||    
T  17502392 tgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaaagggtagtttgtgaattat 17502293  T
Q  206 actcaattggtgaattatg 224  Q
      ||||||| |||||||||    
T  17502292 gttcaattgatgaattatg 17502274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 221
Target Start/End: Original strand, 21259413 - 21259630
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  |   ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||  ||  ||||||||||||||| ||    
T  21259413 atcataatcacttagttaatttctactctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgctcat 21259512  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  21259513 gttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaatttttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaatt 21259612  T
Q  204 atactcaattggtgaatt 221  Q
     | |||||||| ||||||    
T  21259613 gtgctcaattgatgaatt 21259630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23218208 - 23217990
Alignment:
Q  6 cataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatat 105  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||  ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||  ||  |||||||||||||||||| |    
T  23218208 cataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaacttttgaaattcgtgcttatgt 23218109  T
Q  106 ggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattat 205  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| | |||||| ||||||    
T  23218108 ggtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttaatgatgtatataaatggctagtttgtgaattat 23218009  T
Q  206 actcaattggtgaattatg 224  Q
      ||||||| |||||||||    
T  23218008 gttcaattgatgaattatg 23217990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 20573309 - 20573461
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  20573309 ctcaattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 20573408  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573409 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 4234161 - 4233968
Alignment:
Q  31 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgtta 130  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| ||||| || | | || ||||||||||| |||||||    
T  4234161 ctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaatttgtgctcatgttgcagtgatatgtttgagtatgtta 4234062  T
Q  131 atttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatg 224  Q
    |||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  4234061 atttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgtttatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattattttcaattgatgaattatg 4233968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 37611798 - 37611675
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  37611798 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattcatg 37611699  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgatt 331  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||    
T  37611698 gcttggg-ttgcataattcatgatt 37611675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20481735 - 20481565
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||    
T  20481735 ctcaattggtgaattatactttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattcatg 20481636  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20481635 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20481565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 347
Target Start/End: Original strand, 20647949 - 20648087
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |  |||||| |||| |||||||    
T  20647949 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaatccatggct 20648048  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20648049 tgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20648087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 347
Target Start/End: Original strand, 20654025 - 20654163
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| |  ||||| |  |||||| |||||||| |||    
T  20654025 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaggtcatgttgttgatgttaattcattgct 20654124  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  20654125 tgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaagtgag 20654163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 370
Target Start/End: Original strand, 39446892 - 39447046
Alignment:
Q  216 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 315  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||||||||||||||||     
T  39446892 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggta 39446991  T
Q  316 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  39446992 tgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 39447046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 359
Target Start/End: Original strand, 20567200 - 20567268
Alignment:
Q  291 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567200 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 359
Target Start/End: Original strand, 20567335 - 20567427
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20567335 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20567427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 359
Target Start/End: Original strand, 20573528 - 20573620
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  20573528 tgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 20573620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 25122618 - 25122513
Alignment:
Q  255 atgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgtt 352  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||    
T  25122618 atgatcaatagatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgtt 25122520  T
Q  353 gtcggtg 359  Q
    || ||||    
T  25122519 gttggtg 25122513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 38533770 - 38533607
Alignment:
Q  216 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 315  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| |  || || |  ||||||||||||||||||||||||     
T  38533770 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaggtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtg 38533671  T
Q  316 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || |  |||||||||||||||||    
T  38533670 tgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggagactttgtaaaatgggttga 38533607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 18118259 - 18118376
Alignment:
Q  60 aataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatg 159  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||  | |  ||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  18118259 aataagtgattattgtgaacttaatcgttgaaattcgtgctcgtgttatagagatatgtttgcgtatataaatttgatgataattgaattgttgttgatg 18118358  T
Q  160 aaattgcaagttcatgat 177  Q
    |||||||| |||||||||    
T  18118359 aaattgcatgttcatgat 18118376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29760005 - 29759893
Alignment:
Q  274 gttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaat 371  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| ||  ||||    
T  29760005 gttgtttagtcatattgttgatgatgatatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggtttgttgttggtgttttggtgtaaat 29759906  T
Q  372 gggttgataatga 384  Q
    |||||||| ||||    
T  29759905 gggttgattatga 29759893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 5854722 - 5854572
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  5854722 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 5854623  T
Q  329 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5854622 atttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 5854572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 21681121 - 21680984
Alignment:
Q  218 aattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttg 317  Q
    |||||||| | ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| | |||||||  || |  || || |  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21681121 aattatgctttgttgttgttgaattgtgattagtttcatgatcaattgatgttgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatg 21681022  T
Q  318 catgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||    
T  21681021 catgattcatgatttgttgtggagaaataagatgttgt 21680984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 378
Target Start/End: Original strand, 22736046 - 22736127
Alignment:
Q  298 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  22736046 taattcatggcttgggtgtgcataattcatgaattgttgatgaaaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 22736127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23837325 - 23837163
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || || |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| ||||||||||    
T  23837325 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggct 23837226  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  23837225 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttggtggtggttttgtgaaat 23837163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22147664 - 22147555
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  22147664 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaa 22147565  T
Q  212 ttggtgaatt 221  Q
    ||| ||||||    
T  22147564 ttgatgaatt 22147555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15969860 - 15969796
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||    
T  15969860 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgattgtagaggagaaatgagttgttgttggtg 15969796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22886547 - 22886440
Alignment:
Q  117 gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggt 216  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||||| |    
T  22886547 gtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgat 22886448  T
Q  217 gaattatg 224  Q
    ||| ||||    
T  22886447 gaactatg 22886440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 26011602 - 26011452
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  26011602 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttgaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 26011503  T
Q  329 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    ||| | || |||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26011502 atttgatgatgagaattaagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 26011452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18612632 - 18612555
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgg 189  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||    
T  18612632 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgg 18612555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18619537 - 18619460
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgg 189  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||    
T  18619537 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgg 18619460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Original strand, 21198362 - 21198434
Alignment:
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  21198362 attcatggcttgggtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtggtttggtaaaat 21198434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 33528533 - 33528383
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||  |||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  33528533 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatat-tttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 33528435  T
Q  329 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 379  Q
    ||| | || ||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||    
T  33528434 atttgatgatgagaaatgggttgttgttgttgattttgtaaaatgggttgat 33528383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2545167 - 2545061
Alignment:
Q  117 gtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggt 216  Q
    |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  ||  ||||| |||| ||||||||||| |||   ||||||| || ||||| |    
T  2545167 gtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatattcataatgtgtgaaaatgggtagttgtaaaattatgcttaattgat 2545068  T
Q  217 gaattat 223  Q
    |||||||    
T  2545067 gaattat 2545061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 15933406 - 15933256
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |   | | |||||    
T  15933406 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgtttgtaaatcatg 15933307  T
Q  329 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    ||| |  | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15933306 atttgaagatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 15933256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 188
Target Start/End: Original strand, 3431317 - 3431386
Alignment:
Q  119 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatg 188  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  3431317 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatg 3431386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 263
Target Start/End: Original strand, 20561751 - 20561804
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaat 263  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20561751 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat 20561804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Original strand, 21494496 - 21494569
Alignment:
Q  118 tttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggt 191  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||    
T  21494496 tttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaaggggt 21494569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 254 - 379
Target Start/End: Original strand, 23226240 - 23226368
Alignment:
Q  254 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgtt 352  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||| |  |||||||||  |||||    
T  23226240 catgttcaattgatgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgattatgagaaatggattgtt 23226339  T
Q  353 gtcggtggttttgta--aaatgggttgat 379  Q
    || | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23226340 gttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23226368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16002223 - 16002147
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatg 188  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| | ||||||||| | ||||||||    
T  16002223 gatatgtttgagtatatgaatttgatgataatttaattgttgttgatgaaattgtatgttcatgatatgtgaaaatg 16002147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22981358 - 22981281
Alignment:
Q  170 ttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgat 247  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  22981358 ttcatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattgtactcaattgatgaattgtgacat-gttgttgttgaattttgat 22981281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 253 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23149865 - 23149736
Alignment:
Q  253 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 351  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| | ||| || |  ||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || ||| |||||||||||    
T  23149865 tcatgttcaatagttgtttttgttgctaagtgatgttgttgttgatgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgatgatgaaaaatgagttgt 23149766  T
Q  352 tgtcggtggttttgta--aaatgggttgat 379  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||||    
T  23149765 tgttgttggttttgtaagaaatgggttgat 23149736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 371
Target Start/End: Original strand, 24929018 - 24929087
Alignment:
Q  302 tcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24929018 tcattgcttgggtatgcat-attcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 24929087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 371
Target Start/End: Original strand, 31194488 - 31194606
Alignment:
Q  254 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgtt 352  Q
    |||| ||||| | ||||||||||| | | | ||||  ||| |||| |||||| ||||||||   |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  31194488 catgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgcacatgattcatgatttgttggtgaaaaatgagttgtt 31194587  T
Q  353 gtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    || ||||  ||||||||||    
T  31194588 gttggtgactttgtaaaat 31194606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17285309 - 17285232
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||  | |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17285309 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgacttgaggatgagaaatgagttgttgttggtagttttgcaaaat 17285232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 22742833 - 22742717
Alignment:
Q  265 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||| |||||||||| | ||| | || | | |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||    
T  22742833 gttgttgttgttgttgaggaatattgttgttgatgattcgtggcttgggtgttcataaatcttggtttgttgatgagaaataagttgttgttgttggttt 22742734  T
Q  364 tgt-aaaatgggttgat 379  Q
    ||| |||||||||||||    
T  22742733 tgtaaaaatgggttgat 22742717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 370
Target Start/End: Original strand, 27233244 - 27233348
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | |  |||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  27233244 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgataatgagaaataagttgttgttgttggttttg 27233343  T
Q  366 taaaa 370  Q
    |||||    
T  27233344 taaaa 27233348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 35)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 4 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2032143 - 2031783
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2032143 atcataatcgtttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttat 2032044  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2032043 gttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaatt 2031944  T
Q  204 atactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2031943 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataattc 2031844  T
Q  304 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  2031843 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 2031783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11343021 - 11342635
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  11343021 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 11342922  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11342921 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 11342822  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg-ttgtttagtcatatgtttgatgata 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||     
T  11342821 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatg 11342722  T
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 384  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||||    
T  11342721 atatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgtcttggtgaaaatgggttgattatga 11342635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21205262 - 21204898
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21205262 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 21205163  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21205162 tatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 21205063  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| || |  || ||  |||    
T  21205062 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatatttgttgttgttgttaagtgatgttatttattctaa 21204963  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21204962 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 21204898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21651031 - 21650668
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21651031 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctgtgcatagttgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 21650932  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21650931 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 21650832  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  21650831 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 21650732  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||    
T  21650731 ttcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgtggtgaaataagttgttgttgttggttt 21650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16105980 - 16105573
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16105980 tttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 16105881  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||| |||   |    
T  16105880 ttatgttgtagagatatgtttggatatgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtga 16105782  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatg-atcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 297  Q
    |||||| || ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||  | | ||  ||| |  ||||| | ||||||||||| | ||  || |  ||||| |    
T  16105781 aattatgcttaattgatgacttatgacat-gttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgatta 16105683  T
Q  298 taattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaat 396  Q
    | | | ||||||| ||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  16105682 tgaattatggcttaggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgatt 16105583  T
Q  397 ttgatgatgt 406  Q
    ||||||||||    
T  16105582 ttgatgatgt 16105573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 207 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11584184 - 11583982
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgc---atggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    |||||||||||||||||||    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11584184 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgttgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 11584085  T
Q  304 atggcttggg-tttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatg 402  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  11584084 atggcttgggttttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttcgtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagtttgtttttgatg 11583985  T
Q  403 atg 405  Q
    |||    
T  11583984 atg 11583982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 207 - 384
Target Start/End: Original strand, 1168321 - 1168500
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  1168321 ctcaattggtgaattatgcaatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 1168420  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  1168421 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 1168500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28261651 - 28261498
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||    
T  28261651 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattgtgatatgttttatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgctgatgataattcatg 28261552  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28261551 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 28261498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 207 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 21397222 - 21397073
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttg---ttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  21397222 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttattgttgttaagtcatgttgttgatgataattc 21397123  T
Q  304 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgtt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  21397122 atggcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgtt 21397073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 208 - 359
Target Start/End: Original strand, 21646857 - 21647009
Alignment:
Q  208 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21646857 tcaattggtgaattatgtatcgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgctgttgttgtttagtcatgatg-ttgatgataattcatg 21646955  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||| || |||  | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21646956 gcttgggtttgtataattattggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 21647009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 11337303 - 11337455
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||| |||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11337303 ctcatttggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgtcgttgatgataattcatg 11337402  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11337403 gcttgagtttacatgattcatgattgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 11337455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24475708 - 24475560
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  24475708 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgt--tatgtttcatgatcaat---tgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 24475614  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24475613 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 24475560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4865393 - 4865239
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa-ttcat 305  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  |||||||||| |||||    
T  4865393 ctcaattggtgaattatgcattgtggttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttatggttgtttattcatgttgttgatgataatttcat 4865294  T
Q  306 ggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4865293 ggcttgggtttgcataattcttgaattgttgttgagagatgaggtgttgttggtg 4865239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20712206 - 20712036
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||    
T  20712206 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgataagttgcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgttaattcatg 20712107  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  20712106 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 20712036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 197
Target Start/End: Original strand, 22662653 - 22662790
Alignment:
Q  60 aataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatg 159  Q
    |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || | |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22662653 aataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatatttgaatatgttaatttgatgataattgaattgttgatgatg 22662752  T
Q  160 aaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttg 197  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||    
T  22662753 aaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtttg 22662790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25005094 - 25004929
Alignment:
Q  59 gaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 158  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || | | || ||||||||||| | ||||||||| | | ||| ||||||||| || ||    
T  25005094 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgaagtgatatgtttgagtgtgttaatttaaggataattgaattgttaattat 25004995  T
Q  159 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatg 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||| |||||    
T  25004994 gaaattgcatgttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgagaattatgctcaattggtgatttatg 25004929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21906846 - 21906729
Alignment:
Q  208 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 307  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   || |||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  21906846 tcaattgatgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaat---tgatgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatgg 21906750  T
Q  308 cttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21906749 cttgggtttgcatgattcatg 21906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 406
Target Start/End: Original strand, 108862 - 109158
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |  || |||||| |||||||||||||| | |||   ||||||| || ||    
T  108862 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaattaacatgttcataatgtatgaaaatggattgttgtgaaattatgcttaa 108961  T
Q  212 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  || |  ||||| || | | ||||||    
T  108962 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggct 109060  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||| | |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  109061 tgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgatagagaagaagtttgattttgatgatgt 109158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 331
Target Start/End: Original strand, 24183249 - 24183370
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| | || |||||||| |  ||||| |   ||||||||||| |||    
T  24183249 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatgagtttcatgatcaattgatggtgttgttgatatgtcatgt---tgatgataattaatg 24183345  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgatt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24183346 gcttgggtttgcatgattcatgatt 24183370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 216 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19405658 - 19405503
Alignment:
Q  216 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 315  Q
    |||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||  || |  || || |  ||||||||||||||||||||||||     
T  19405658 tgaattatgattcgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatattgttactggtatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggta 19405559  T
Q  316 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  19405558 tgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 19405503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 7728547 - 7728378
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||| || |||    
T  7728547 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataatttatcgct 7728448  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  7728447 tgggtgtgcataattcatgaattgttggtgagagatgaggtgttgttggtgactttgaaaaatgggttga 7728378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 237 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 23466557 - 23466434
Alignment:
Q  237 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgtt 334  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23466557 tgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgtt-gatgatagttcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgtt 23466459  T
Q  335 gttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||    
T  23466458 gttgaggaatgatatgttgttggtg 23466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 3673989 - 3673818
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||  |  || |||||||| ||||||||||    
T  3673989 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagcgaggtggttgatgatgattcatggct 3673890  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 379  Q
    ||||| | ||| | ||| || ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  3673889 tgggtgttcataaatcacgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 3673818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 21617124 - 21616974
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  21617124 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgttgattcatggcttgggtgttcataattcatg 21617025  T
Q  329 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    | ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21617024 atttgatgatgagaagtgagctgttgtggttggttttgtaaaatgggttga 21616974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17909731 - 17909622
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  17909731 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaa 17909632  T
Q  212 ttggtgaatt 221  Q
    ||| ||||||    
T  17909631 ttgatgaatt 17909622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 23494040 - 23493875
Alignment:
Q  216 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 315  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| |||||||||||||||     
T  23494040 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtg 23493941  T
Q  316 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 379  Q
    | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||| ||||||    
T  23493940 ttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgagttgat 23493875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7529126 - 7529014
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||  ||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  7529126 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcatagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 7529027  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| |||||||||    
T  7529026 ttgatgaattatg 7529014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16595550 - 16595474
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  16595550 tgataattcatgacttgggtgtgcatgattcatgaattgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 16595474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 32966352 - 32966436
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  32966352 tgataattcatggcttgagcgtgcataattcataattggttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 32966436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Original strand, 9730419 - 9730524
Alignment:
Q  119 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtga 218  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||||| |||    
T  9730419 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 9730518  T
Q  219 attatg 224  Q
     |||||    
T  9730519 cttatg 9730524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 19862336 - 19862183
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |  |||||  |||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||    
T  19862336 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagaatcatgtgcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatgact 19862237  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggtt 362  Q
    ||||| | ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  19862236 tgggtgttcataattcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttggtggtt 19862183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 367 - 405
Target Start/End: Original strand, 24225596 - 24225634
Alignment:
Q  367 aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24225596 aaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatg 24225634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 6456694 - 6456580
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | || |||||    
T  6456694 tgttgttgttgttaagagatatcgttgttgatgattcatggcttgggtgttcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttgtttttg 6456595  T
Q  366 ta-aaatgggttgat 379  Q
    || ||| ||||||||    
T  6456594 tacaaacgggttgat 6456580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 37983434 - 37983325
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||| | ||| |||| | || ||| ||||||||||||||   ||||||||    
T  37983434 tgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcaggatttgatgatgaaaaatgagttgttgt---tggttttg 37983338  T
Q  366 taaaatgggttga 378  Q
    |||||||||||||    
T  37983337 taaaatgggttga 37983325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 29918035 - 29917931
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| ||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  29918035 tgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgttgagaaataaattattgtcgttggttttg 29917936  T
Q  366 taaaa 370  Q
    |||||    
T  29917935 taaaa 29917931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14952098 - 14951713
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14952098 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 14951999  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14951998 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 14951899  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |    
T  14951898 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttatttagtcatattgttgatgatga 14951799  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 384  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  14951798 tatatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 14951713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 5682447 - 5682817
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5682447 tttatcataatcatttagttaatt-ttttcctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 5682545  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5682546 tatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaattgggtagtttgtaa 5682645  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| |    
T  5682646 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattattggttgttgttgttttttattcatattgttgatgatga 5682745  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  5682746 tatatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 5682817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 25119126 - 25119498
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||    
T  25119126 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatcttgaaaattcgtgct 25119225  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25119226 tatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggatagtttgtaa 25119325  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |    
T  25119326 attatgatcaattggtgaattatgcatggtttttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgataatga 25119425  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25119426 tacatggcttgggtttgcatgattcataattttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25119498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 15272230 - 15272586
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15272230 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 15272329  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15272330 ttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaacgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgta 15272429  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| ||    
T  15272430 aattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttccatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgcta 15272529  T
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  15272530 attcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 15272586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 53704850 - 53705003
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  53704850 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 53704949  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53704950 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53705003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 203 - 384
Target Start/End: Original strand, 55376710 - 55376893
Alignment:
Q  203 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | || |  ||||||||||||    
T  55376710 tatactcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaaattatgttgttgatgataatt 55376809  T
Q  303 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  | ||||||||||||| ||||    
T  55376810 catggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgatgttggtgttttgatgaaaatgggttgattatga 55376893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34395387 - 34395222
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  34395387 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatg 34395288  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  34395287 gcttgagtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 34395222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19559690 - 19559483
Alignment:
Q  6 cataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatat 105  Q
    |||||||| ||||||||||  ||  ||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| ||  ||  |||||||||| |||| || |    
T  19559690 cataatcaattagttaatttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattatgtacccaacttttgaaattcctgctcatgt 19559591  T
Q  106 ggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattat 205  Q
     |||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  19559590 tgtagtgatatgtttgagcatgttaatttgatgttaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtgaattat 19559491  T
Q  206 actcaatt 213  Q
     |||||||    
T  19559490 gctcaatt 19559483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 203 - 359
Target Start/End: Original strand, 23270047 - 23270204
Alignment:
Q  203 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 302  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||    
T  23270047 tatactcaattgatgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtatcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataatt 23270146  T
Q  303 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  23270147 catggcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 23270204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 44056045 - 44055892
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  44056045 ctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgtggtttagccatgttgttgatgataattcatg 44055946  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  44055945 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 44055892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16732299 - 16732146
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  16732299 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgtcgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 16732200  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  16732199 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 16732146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44346957 - 44346816
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||    
T  44346957 ctcaattggtgaattatacattgttgttcatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtgatgtcgttgatgataattcatg 44346858  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 347  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  44346857 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 44346816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 359
Target Start/End: Original strand, 53907818 - 53907966
Alignment:
Q  209 caattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggc 308  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  53907818 caattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaatgtttcatgatcaa---ttgttgttgttgattagtcatgttgttgatgataattcatggc 53907914  T
Q  309 ttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53907915 ttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 53907966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30458033 - 30457880
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  30458033 ctcaattggtgaattacgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgtggttgatgataattcatg 30457934  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||| |||||| |||||| |  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  30457933 gcttggg-ttgcataattcattattttgttatagagaaatgagatgttgttggtg 30457880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 344
Target Start/End: Original strand, 21959580 - 21959718
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  21959580 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 21959679  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaat 344  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  21959680 gcttgggcttgcatgattcatagtttgtggttgagaaat 21959718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 353
Target Start/End: Original strand, 820033 - 820177
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  820033 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaa---ttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 820129  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttg 353  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||    
T  820130 gcttggg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttg 820177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 112 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16523044 - 16522748
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  16523044 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 16522945  T
Q  212 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  || |  ||||| || | | ||||||    
T  16522944 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgattatgaattatggct 16522846  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16522845 tgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 16522748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 49071993 - 49071842
Alignment:
Q  31 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgtta 130  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||  |||||  || | |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  49071993 ctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgatcattgtgaacccaaccgttgaaattcgtgctcatattgtagtgatatgtttgagtatgtta 49071894  T
Q  131 atttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatg 182  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  49071893 atttgatgttaattgaattattgatgatgaaattgcatgttcatgatatatg 49071842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 315
Target Start/End: Original strand, 8872588 - 8872699
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  8872588 ctcaattggtgaattatgcgttgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataactc 8872687  T
Q  304 atggcttgggtt 315  Q
    ||||||||||||    
T  8872688 atggcttgggtt 8872699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 15135926 - 15136005
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaac 79  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135926 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaac 15136005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 9295920 - 9295624
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  9295920 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtaatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 9295821  T
Q  212 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  || |  ||||| || | | ||||||    
T  9295820 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgataatgaattatggct 9295722  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9295721 tgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttatgtaaaatgagttgataaagaagaagtttgattttgatgatgt 9295624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 354
Target Start/End: Original strand, 12837317 - 12837464
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  12837317 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatggtcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 12837416  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  12837417 gcttgggtatgcatgattcatgatttgttg-tgagaaataagttgttgt 12837464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 354
Target Start/End: Original strand, 30232613 - 30232761
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  30232613 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 30232712  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||| ||||| |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  30232713 gcttgggtatgcattattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 30232761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 363
Target Start/End: Original strand, 18494467 - 18494602
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| || || | |||||||||||| |||| |||||||||| ||| || |  |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18494467 gttgttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgttgctgttgttgttaagtgatgttgttgatggtaactcatggcttgggtatgcatgattcatg 18494566  T
Q  329 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18494567 acttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 18494602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 34177617 - 34177781
Alignment:
Q  59 gaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 158  Q
    ||||||||||||||  ||||   ||||||  ||||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||    
T  34177617 gaataagtgattattgtgaatccaatcttgaaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaattacatgataattgaattgttgatgat 34177716  T
Q  159 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatg 224  Q
     |||||||| |||||||||||||  |||||||| | |||  ||||||  |||||||||||||||||    
T  34177717 aaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtag-ttgagaattatgttcaattggtgaattatg 34177781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 354
Target Start/End: Original strand, 13809636 - 13809775
Alignment:
Q  216 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 315  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | | | || |  |||||||||||||||||||||| |     
T  13809636 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaattgatgttgttgatgataattcatggcttggata 13809735  T
Q  316 tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13809736 tgcatgattcatgattggttgttgagaaatgagatgttgt 13809775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 208 - 331
Target Start/End: Original strand, 45458973 - 45459096
Alignment:
Q  208 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 307  Q
    |||||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||| |||||| |||||    
T  45458973 tcaattggtgaattatgctttgctgttgttgaattgtgataagtttcatgaccaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgaagataatccatgg 45459072  T
Q  308 cttgggtttgcatgattcatgatt 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45459073 cttgggtttgcatgattcatgatt 45459096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 230 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 27961078 - 27960938
Alignment:
Q  230 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 329  Q
    |||||| |||||| | ||| | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  27961078 ttgttgttgaattgttataagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataattcatggtttgggtatgcatgatt-atga 27960980  T
Q  330 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
     || ||||||||||||||| | |||| ||| |||| ||||||    
T  27960979 tttattgttgagaaatgagatattgttggtagtttggtaaaa 27960938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 14500246 - 14500358
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  14500246 gataagtttgagtatgttaatttaatgataaatgaattattggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 14500345  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| |||||||||    
T  14500346 ttgatgaattatg 14500358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 37957230 - 37957314
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  37957230 tgataattcacggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 37957314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 406
Target Start/End: Original strand, 7185983 - 7186159
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| | ||| | ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| |  || | |||||    
T  7185983 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgtttaattgatgttgttgttgctaagagatattattgttgatgattcatggcttgggtgtttataaatcatg 7186082  T
Q  329 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||| | || ||||| ||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7186083 atttgatgatgagatatgagttgttgt---tgtttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 7186159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21417536 - 21417471
Alignment:
Q  108 tagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttca 173  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21417536 tagagatatgtttgaatatgtgaatttgttgataattgaattgttgatgatgaaatttcatgttca 21417471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14996353 - 14996241
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  14996353 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaaagaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 14996254  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| |||||||||    
T  14996253 ttgatgaattatg 14996241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 269 - 378
Target Start/End: Original strand, 7964890 - 7965000
Alignment:
Q  269 ttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta 367  Q
    ||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7964890 ttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttgta 7964989  T
Q  368 aaatgggttga 378  Q
    |||||||||||    
T  7964990 aaatgggttga 7965000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 331
Target Start/End: Original strand, 52265628 - 52265749
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||   || |||| ||||||||||    
T  52265628 aattgttgaattatgcaatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgatgttgatgattcatggct 52265727  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgatt 331  Q
    ||||| | ||| ||||||||||    
T  52265728 tgggtgttcataattcatgatt 52265749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8045170 - 8045058
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||| ||||||| |||   ||||||| || ||    
T  8045170 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgagaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 8045071  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| ||| |||||    
T  8045070 ttgatgacttatg 8045058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Original strand, 12133626 - 12133686
Alignment:
Q  107 gtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgca 167  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12133626 gtagtgatatgtttgggtatgttaatttgttgttaattgaattgttaatgatgaaattgca 12133686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 19821981 - 19822065
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||||  ||||||||||| |||||    
T  19821981 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgtttttggtgactttgtaaaatgagttga 19822065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15044955 - 15044784
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||    
T  15044955 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggct 15044856  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 379  Q
    ||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15044855 tgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15044784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 200 - 379
Target Start/End: Original strand, 15109458 - 15109640
Alignment:
Q  200 aattatactcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 298  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||||||    
T  15109458 aattatactcaaattgataaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgat 15109557  T
Q  299 aattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 379  Q
     ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| | ||||||| | || ||| || |||||||||||||    
T  15109558 gattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataaattgttgttgttgctttggtgaaaatgggttgat 15109640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14901274 - 14901197
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14901274 tgatgattcatgacatgggtgtgcataattcatgaattgatgatgagaaatgggttgttgttggtggttttgtaaaat 14901197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 191
Target Start/End: Original strand, 32460743 - 32460816
Alignment:
Q  118 tttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggt 191  Q
    ||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||    
T  32460743 tttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaaggggt 32460816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 371
Target Start/End: Original strand, 47535251 - 47535328
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47535251 tgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgatttgttaatgagaaatgagttgttgttgatggttttgtaaaat 47535328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 253 - 371
Target Start/End: Original strand, 41166109 - 41166228
Alignment:
Q  253 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 351  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||| | ||||||||||||| | ||| | | |||||| |||| |||||||||||||||    
T  41166109 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgttgatgaatcatggcttgggtattcataacttatgatttgttgatgagaaatgagttgt 41166208  T
Q  352 tgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  41166209 tgtgggtggttttgtgaaat 41166228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 379
Target Start/End: Original strand, 41256546 - 41256660
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||||| |||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||     
T  41256546 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggtttta 41256645  T
Q  366 t-aaaatgggttgat 379  Q
    | |||||||||||||    
T  41256646 taaaaatgggttgat 41256660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 18276541 - 18276392
Alignment:
Q  230 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 329  Q
    |||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | |||||||||||   ||| ||||  ||| |||| ||| ||||||||||| | ||| | ||||||    
T  18276541 ttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgcaaagtgatattgttgttgatgattgatggcttgggtgttcataaatcatga 18276442  T
Q  330 tt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    || |  | |||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18276441 tttgacgatgagtattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 18276392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 9795442 - 9795330
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||| ||| |||||||||  || |||||| |||| | |||||| || |||   |||||||  | ||    
T  9795442 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattcttggtgatgaaataacatgttcataatgtgtcaaaatgagtagttgtgaaattatgtttaa 9795343  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    |||||||||||||    
T  9795342 ttggtgaattatg 9795330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22275058 - 22274688
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22275058 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 22274959  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22274958 tatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggttgtttgtaa 22274859  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  22274858 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatga 22274759  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22274758 tagatggcttggg-ttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 22274688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22284291 - 22283921
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22284291 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcatatttgattatgagaataagtgattatcatgaactcaatctttgaaattcgtgct 22284192  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||    
T  22284191 tatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttaatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgaatagttagtaa 22284092  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||  |||||||| |    
T  22284091 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatgtgtttcatgatcaatcgttgtttttgatgtttagtcttattgttgatgatga 22283992  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  22283991 tacatggcttggg-ttgcatgattcatgaattgctgttgagaaatgaattgttgttggtggttttgtgaaat 22283921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 9652815 - 9653179
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  9652815 tttatcataatcatttggttaattctttttttcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtggt 9652914  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9652915 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 9653014  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  9653015 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgcgatatttttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgctaa 9653114  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9653115 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9653179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 351
Target Start/End: Original strand, 21273967 - 21274319
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21273967 tttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 21274066  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21274067 ttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgta 21274166  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||    
T  21274167 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtaatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgcta 21274266  T
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgt 351  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||    
T  21274267 attcatggcttggg-tagcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgt 21274319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25213385 - 25212977
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25213385 tttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 25213286  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||| |||   |    
T  25213285 ttatgttgtagagatatgtttggatatgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtga 25213187  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatg-atcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 297  Q
    |||||| || ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||  | | ||  ||| |  ||||| | ||||||||||| | ||  || |  ||||| |    
T  25213186 aattatgcttaattgatgacttatgacat-gttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatatgttgttgataa 25213088  T
Q  298 taattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag--aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaa 395  Q
    | | | ||||||||||| | |||   |||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  25213087 tgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaaatgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaaatttgat 25212988  T
Q  396 tttgatgatgt 406  Q
    |||||||||||    
T  25212987 tttgatgatgt 25212977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Original strand, 23836791 - 23836975
Alignment:
Q  177 tgtatgaaaatgggtg-gtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 275  Q
    |||||||||||||||  || || ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23836791 tgtatgaaaatgggtatgtgtgaaaaatatgctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgt 23836890  T
Q  276 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  23836891 tgtttagtcattttgttgatgataattcatgacttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 23836975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32465988 - 32465835
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  32465988 ctcaattggtgaattatgcattgttcttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 32465889  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32465888 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32465835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15633550 - 15633327
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||| ||||||||    
T  15633550 tttatcataatcacttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattataatgaacccaattcttgaatttcgtgct 15633451  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
      | |  | | |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| ||||||||||| |||   ||    
T  15633450 cttgttttggtgataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtttgaaaatgggtagttgtgaa 15633351  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatg 224  Q
    ||||| || ||||| |||||||||    
T  15633350 attatgcttaattgatgaattatg 15633327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Original strand, 25876036 - 25876206
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  25876036 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgcttcatgatcaaatgttgttgttattgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 25876135  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  25876136 gcttgggtttgcataattcttggcttgttattgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 25876206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 253 - 406
Target Start/End: Original strand, 19433495 - 19433649
Alignment:
Q  253 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 351  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19433495 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 19433594  T
Q  352 tgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19433595 tgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 19433649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 208 - 359
Target Start/End: Original strand, 4448251 - 4448402
Alignment:
Q  208 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 307  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||    
T  4448251 tcaattggtgaatgatgctttgttgttgttgaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgg 4448350  T
Q  308 cttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  4448351 cttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaaaaatgagatgttgttggtg 4448402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 203 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 6879571 - 6879414
Alignment:
Q  203 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||     
T  6879571 tatactcaattggtgaattatgcattgttattgatgaattgtgatatgtttaatgatcaattgttgttgttgttatttagtcatgttgttgatgataata 6879472  T
Q  303 catggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||| |||||||||  || |||| | | ||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  6879471 catgtcttgggtttaaataattcttggtttgttgttgagaattgagatgttgttggtg 6879414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28974179 - 28974026
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||| |||| |||||||||   |||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  28974179 ctcatttggcgaattatgctatgttgttgatgaattgtggtaagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 28974080  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28974079 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgatgagaaatgagatgttgttggtg 28974026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 271300 - 271148
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||     
T  271300 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcata 271201  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||    
T  271200 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgaggaatgagatgttgttggtg 271148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25602154 - 25601989
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||| ||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  || ||||||| |||||    
T  25602154 ctcaattggtgagttatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatgttgtttatgataaatcatg 25602055  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  25602054 gcttaggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 25601989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 210 - 375
Target Start/End: Original strand, 36890805 - 36890972
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| || |  | |||||| ||||||||||    
T  36890805 aattggtgaattatgctatgttgttgataaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 36890904  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  36890905 tgggtatgcatgattcttgatttgttgttgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 36890972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7321768 - 7321607
Alignment:
Q  86 tttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaa 185  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| || ||| |||||||||  ||    
T  7321768 tttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattttttatgatgaaatttcatgtttatgatgtatataa 7321669  T
Q  186 atgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgat 247  Q
    |||||| |||||| |||| | |||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  7321668 atgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgaattgtgacat-gttgttgttgaattttgat 7321607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 243 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27261900 - 27261783
Alignment:
Q  243 ttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgaga 341  Q
    |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27261900 ttgataagtttcatgatcaattgatattgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttaaga 27261801  T
Q  342 aatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  27261800 aatgagatgttgttggtg 27261783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 406
Target Start/End: Original strand, 24826748 - 24827044
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  24826748 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 24826847  T
Q  212 ttggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatgat-caatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  | | ||  ||| | | |||| | ||||||||||| | ||  |  |  ||||| || | | ||||||    
T  24826848 ttgatgacttatgacatg-ttgttgttgaattgaggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgctgagatacgttgttgattatgaattatggct 24826946  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaa-tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    |||||   |||   |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  24826947 tgggtgctcatttatcatgattgttgttgagaaaatgagctgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataaagaagaagtttgatattgatgatgt 24827044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 3403 - 3529
Alignment:
Q  252 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgt 351  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3403 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgattgtagatgagaaatgagttgt 3502  T
Q  352 tgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  3503 tgttggtgactttgtaaaatgggttga 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20279688 - 20279571
Alignment:
Q  60 aataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatg 159  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  20279688 aataagtgattatggtgaacttaatcgttgaaattcgtgctcatgttatagagatatgtttgggtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatg 20279589  T
Q  160 aaattgcaagttcatgat 177  Q
    |||||||| |||||||||    
T  20279588 aaattgcatgttcatgat 20279571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 230 - 370
Target Start/End: Original strand, 22579999 - 22580140
Alignment:
Q  230 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 329  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| || || |  || || |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22579999 ttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgctgctgatatgtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatga 22580098  T
Q  330 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
     ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  22580099 tttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 22580140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 370
Target Start/End: Original strand, 24571408 - 24571572
Alignment:
Q  207 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 305  Q
    |||||||||| |||||||||   ||| ||| |||||| || || | |||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |||||||||| ||||    
T  24571408 ctcaattggttgaattatgctatgtttttgttgaattgtgttaagattcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtgatgttgttgatgataactcat 24571507  T
Q  306 ggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    | ||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  24571508 g-cttggctatgtatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 24571572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 43645886 - 43645824
Alignment:
Q  344 tgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  43645886 tgagttgttggtggtggttttgtaaaatgggttggtaatgaaaaagtttgattttgatgatgt 43645824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 722437 - 722353
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  722437 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttattgatgagatatgagttgttgttggtgactttgtaaaattggttga 722353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 33128270 - 33128158
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  33128270 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 33128171  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| ||| |||||    
T  33128170 ttgatgacttatg 33128158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 68119 - 67952
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || || | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| || | ||||||||||    
T  68119 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtaagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttggtgattcatggct 68020  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    || || | ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  68019 tgcgtgttcataattcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggttttgtgaaaatgggt 67952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17204550 - 17204445
Alignment:
Q  119 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtga 218  Q
    |||| ||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||||| |||    
T  17204550 ttgagtatgttaattgcatcataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 17204451  T
Q  219 attatg 224  Q
     |||||    
T  17204450 cttatg 17204445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 338 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 24884684 - 24884643
Alignment:
Q  338 gagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgat 379  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24884684 gagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgat 24884643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 224
Target Start/End: Original strand, 28031296 - 28031380
Alignment:
Q  140 taaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatg 224  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| ||||||||||| |||   ||||||| || ||||| |||||||||    
T  28031296 taaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtgtgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaattgatgaattatg 28031380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 295 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 25305487 - 25305416
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  25305487 tgatgattcatggcctgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtagttttg 25305416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 375
Target Start/End: Original strand, 23821767 - 23821892
Alignment:
Q  252 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 350  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  23821767 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttg 23821866  T
Q  351 ttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||    
T  23821867 ttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23821892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 375
Target Start/End: Original strand, 23830846 - 23830971
Alignment:
Q  252 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 350  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| |||||||| ||| || || ||||| |||||    
T  23830846 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcatgggtgttcataattcatgatttgatgatgtgaaataagttg 23830945  T
Q  351 ttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    |||| | ||||||||| |||||||||    
T  23830946 ttgttgttggttttgtgaaaatgggt 23830971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25595245 - 25595168
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgg 189  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| || | |||||||||    
T  25595245 gatatgtttgagtacatgaatttggtgataaatgaattgttgttgatgaaattgcatgtccataatatgtgaaaatgg 25595168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 80200 - 79846
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  80200 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaatttgtgct 80101  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  80100 tatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 80001  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  80000 attatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataa 79901  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  79900 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 79846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 46295 - 46171
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||  ||| |||| |||||||    
T  46295 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgtttctaagtgatattgttgttgatgattcatg 46196  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgatt 331  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||    
T  46195 gcttgggtgttcataattcatgatt 46171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 40788 - 40664
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||    |||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||    
T  40788 ctcaattggtgaattatgctatattgttgttacattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatg 40689  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgatt 331  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||    
T  40688 gcttgggtgttcataattcatgatt 40664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 126751 - 126366
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  126751 tttatcataatcatttagttaattctttttctattgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 126652  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  126651 tatgttgcagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 126552  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |    
T  126551 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatactgttgatgatga 126452  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg-taaaatgggttgataatga 384  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |  ||||||||||||| ||||    
T  126451 tacatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggagaaaatgggttgattatga 126366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 4 - 363
Target Start/End: Original strand, 111191 - 111550
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  111191 atcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgaaaataagtgattatcatgaacccaatatttgaaattcgtgcttat 111290  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  111291 gttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaatt 111390  T
Q  204 atactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  111391 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattc 111490  T
Q  304 atggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  111491 atggcttgggtatgcatgattcaaatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 111550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 32493965 - 32494341
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  32493965 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgtt 32494064  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32494065 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaataaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 32494164  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32494165 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatgattgatgataa 32494264  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  32494265 ttcatggcttgtgtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 32494341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 42056207 - 42056563
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  42056207 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 42056306  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  42056307 ttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtg 42056406  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||  |  ||| ||    
T  42056407 aattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatattatgaatgcta 42056506  T
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  42056507 attcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 42056563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2029257 - 2028893
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2029257 tttatcataatcatttagttaattttttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 2029158  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  2029157 tatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtacgaaaatgggtagtttgtaa 2029058  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||| ||| || |  | |||| |||    
T  2029057 attatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgtcgttgttaagtgatgttatggatgctaa 2028958  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  2028957 ttcatgacttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 2028893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 3049918 - 3049565
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  3049918 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgtt 3049819  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3049818 tatattgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattg-ggatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaatatgggtagtttgtaa 3049720  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  3049719 attatgctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaa 3049620  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  3049619 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 3049565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 2190104 - 2190460
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  2190104 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgtacccaatctttgaaattcgtgc 2190203  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  2190204 ttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggatagtttgta 2190303  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | |||| ||    
T  2190304 aattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgatgttgttaagtgatgttatggatgcta 2190403  T
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||| | |||||||||    
T  2190404 attcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaagtaagttgttgt 2190460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 1936936 - 1937290
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1936936 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 1937035  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     ||||||||| ||||||||    
T  1937036 tatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttcatgatgaaattgcaagttcatgat-----aaaatgggtagtttgtaa 1937130  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||            |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |    
T  1937131 attatgctcaattggtgaattatgtatggttgttgatgaatt------------atgatcaatggttgttgttgatgtttagtcatattgttgatgatga 1937218  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    | |||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||  || |||| ||||||||||| ||||    
T  1937219 tacatgacttgggtttgcatgattcataattttttgttgagaaatggattattgttggtggttttgtgaaat 1937290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 210 - 406
Target Start/End: Original strand, 7284180 - 7284376
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||||||||||||| | | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||| |||||||||||||    
T  7284180 aattggtgaattatcctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgataataattcatggct 7284279  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  7284280 tgagtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgttaaatgggttgataatggagaagtttgattttgacgatgt 7284376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 39046740 - 39046893
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  39046740 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 39046839  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  39046840 gcttgggtttgcataattcttgatctgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 39046893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11287547 - 11287390
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11287547 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 11287448  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11287447 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11287390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 121
Target Start/End: Original strand, 15516780 - 15516901
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15516780 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 15516879  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttg 121  Q
    |||| | |||||||||||||||    
T  15516880 ttatgttgtagagatatgtttg 15516901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Original strand, 39291458 - 39291648
Alignment:
Q  31 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgtta 130  Q
    ||||| |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  |||||  ||  ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| |||||||    
T  39291458 ctctttttctatgcataagtacttatttgaataagtgattattgtgaacctaacttttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgtta 39291557  T
Q  131 atttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaatt 221  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39291558 atttgatgataattgaattgttgatgatgaaattgcatgttgatgatgtatataaatgggtagtttgtgaattatgctcaattggtgaatt 39291648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 35094946 - 35094794
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||    
T  35094946 ctcaattggtgaattatgcactgttgttgatgaattgttaaatgtttcatgatcaatg-ttgctgttgttgtttagtcatgttgttgatgataaatcatg 35094848  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  35094847 gcttgggtttgcataattcttgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 35094794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 12759117 - 12758965
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||    
T  12759117 ctcaattggtgaattatgctatgttgttggtgaattatgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttaagtcatgttgttggtgataattcatg 12759018  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  12759017 gcttgggtttgcaggatttatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 12758965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 13352258 - 13352065
Alignment:
Q  31 ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgtta 130  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  |||||  || | |||||||||||||| || | |||| ||||||||| | |||||||    
T  13352258 ctctttttctatgcataagtgtttatttgaataagtgattattgtgaacccaacccttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttcagtatgtta 13352159  T
Q  131 atttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatg 224  Q
    |||||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| || | | |||||| |||||||| |||||||||    
T  13352158 atttgatgatatttgatttgttgatggtgaaattgcatgttcatgatgtatataaatgggtagtattttaattatgctcaattgatgaattatg 13352065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 15822548 - 15822701
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||    
T  15822548 ctcaaatggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatg 15822647  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  15822648 gcttgggtttgcatgattcatggtttgtggttgagaaatgagatgttgttggtg 15822701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 229 - 359
Target Start/End: Original strand, 45452305 - 45452435
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45452305 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgtcgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggttggcatgattcatg 45452404  T
Q  329 attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  45452405 atttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 45452435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3895155 - 3894998
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  3895155 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 3895056  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  3895055 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 3894998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 370
Target Start/End: Original strand, 16570122 - 16570287
Alignment:
Q  207 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 305  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||||||    
T  16570122 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcat 16570221  T
Q  306 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16570222 ggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16570287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16595540 - 16595375
Alignment:
Q  207 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 305  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||||||||||    
T  16595540 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgagataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtcgtggatgataattcat 16595441  T
Q  306 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  16595440 ggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtgggtgttttggtaaaa 16595375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 354
Target Start/End: Original strand, 26070384 - 26070529
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||| ||||||||||    
T  26070384 aattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 26070483  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26070484 tgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26070529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 210 - 354
Target Start/End: Original strand, 26094171 - 26094316
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||||| ||||||||||    
T  26094171 aattggtgaattatgttatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgattattcatggct 26094270  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26094271 tgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaataagttgttgt 26094316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 47289911 - 47289758
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||| |   |||||||||||||||    
T  47289911 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttgctgttgctgttaagtcatgttgatgatgataattcatg 47289812  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||| | |||||||||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  47289811 gcttgtg-ttgcatgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 47289758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 363
Target Start/End: Original strand, 12248237 - 12248395
Alignment:
Q  207 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 305  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||| || |  | ||||||||| |||    
T  12248237 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaatggatgttgttgttgctaagtgatgttgtggatgataatgcat 12248336  T
Q  306 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12248337 gacttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 12248395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 44865360 - 44865204
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgttt---agtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||    |||||| |  || ||||||||||    
T  44865360 ctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaattgttgttgttgttgttgttaagtcatgtagtttatgataattc 44865261  T
Q  304 atggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  44865260 atggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 44865204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 370
Target Start/End: Original strand, 49047813 - 49047955
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49047813 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgctgataattcatggcttgggtatgcatgattcatg 49047912  T
Q  329 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  49047913 atttgttgttgagaaacgagatgttgttggtagtttggtaaaa 49047955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 13274918 - 13274753
Alignment:
Q  207 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 305  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||    
T  13274918 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcat 13274819  T
Q  306 ggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  13274818 ggctttggtatgcatgattcatgttttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 13274753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 61 - 181
Target Start/End: Original strand, 15977820 - 15977940
Alignment:
Q  61 ataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatga 160  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    | |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||    
T  15977820 ataagtgattattatgaactaaatgtttgaaattcatgctctagttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgttgataattgaattattgatgatga 15977919  T
Q  161 aattgcaagttcatgatgtat 181  Q
    ||||||| ||||||| |||||    
T  15977920 aattgcatgttcatggtgtat 15977940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 253 - 406
Target Start/End: Original strand, 14272049 - 14272203
Alignment:
Q  253 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 351  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | | | ||||  ||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||||||| | || |||||||||||||||    
T  14272049 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaaatgatattgttgttgatgattcatggcttgagtgttcataattcatgattagatgatgagaaatgagttgt 14272148  T
Q  352 tgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  14272149 tggtggtggttttgtaaaatgggttgatgatgaagaagttttattttaatgatgt 14272203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 143769 - 143622
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||      ||||||||||| |||||| |  || |||||||||||||    
T  143769 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa------ttgttgttgttaagtcatgttgttaatgataattcatg 143676  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  143675 gcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 200 - 371
Target Start/End: Original strand, 17224047 - 17224220
Alignment:
Q  200 aattatactcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 298  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||   ||||||| |||||| |  || |  ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  || |||||    
T  17224047 aattatactcaaattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgttgtaagagtcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttaatgat 17224146  T
Q  299 aattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
     ||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17224147 gattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaat 17224220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Original strand, 12369957 - 12370127
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||| | ||||||||||| | ||| || |  |  || || |||||||    
T  12369957 ctcaattggtgaattatgccttgttgttgttgaattgtgataactttcatgattaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgtgcataattattcatg 12370056  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    |||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| || | |||||| || |||||||||    
T  12370057 gcttaggtatgcatgattcatgatttgttattgagaaataagttgtagttgttggtttggtgaaaatgggt 12370127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 378
Target Start/End: Original strand, 16915067 - 16915217
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  16915067 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtcatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 16915166  T
Q  329 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    | ||| ||  ||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16915167 atttgatgaagagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 16915217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 48356752 - 48356602
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  48356752 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 48356653  T
Q  329 att-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    ||| | || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48356652 atttgatgatgagaattgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 48356602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 200 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 13377667 - 13377485
Alignment:
Q  200 aattatactcaa-ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 298  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||||||    
T  13377667 aattatactcaaattgattaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtaatgttgttgatgat 13377568  T
Q  299 aattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 379  Q
     ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  13377567 gattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 13377485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 177
Target Start/End: Original strand, 18151259 - 18151399
Alignment:
Q  37 ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttga 136  Q
    |||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  |||||| || | |||||||||||||| || | |||| |||||| ||   ||||||||||||     
T  18151259 ttctatgcataaattcttatttgaataagtgattattgtgaacttaaccgttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgattaggtatgttaatttgt 18151358  T
Q  137 tgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 177  Q
    || ||| |||||||||||||| ||| ||| | |||||||||    
T  18151359 tgataattgaattgttgatgacgaatttgtatgttcatgat 18151399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 371308 - 371203
Alignment:
Q  119 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtga 218  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||||| |||    
T  371308 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 371209  T
Q  219 attatg 224  Q
     |||||    
T  371208 cttatg 371203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 177
Target Start/End: Original strand, 8563369 - 8563434
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 177  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8563369 gatatgtttgagtatatgaatttgatgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcatgat 8563434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4484797 - 4484683
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||||| |||||| ||| || |||||||| |||||||||   ||||||||    
T  4484797 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatagcttgggtattcatgaatcatgatttgatgatgagaaataagttgttgtgcttggttttg 4484698  T
Q  366 t-aaaatgggttgat 379  Q
    | |||||||||||||    
T  4484697 taaaaatgggttgat 4484683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 115 - 161
Target Start/End: Original strand, 15575874 - 15575920
Alignment:
Q  115 atgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaa 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  15575874 atgtttggatatgttaatttgatgttaattaagttgttgatgatgaa 15575920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 161
Target Start/End: Original strand, 17984753 - 17984827
Alignment:
Q  87 ttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaa 161  Q
    ||||||||||||||  | |  ||| ||||||||||  |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  17984753 ttgaaattcgtgctcttgttttagtgatatgtttgggtatgttaatttgttgataattgaattgttgatgatgaa 17984827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 4446249 - 4446168
Alignment:
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 379  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||| ||| || || ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  4446249 attcatggcttgggtgttcataaatcatgaattgatgatgtgaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 4446168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 14935400 - 14935319
Alignment:
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 379  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  14935400 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 14935319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15362993 - 15362912
Alignment:
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 379  Q
    |||||||| |||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  15362993 attcatggtttgggtgttcataaatcatgatttgttgatgagaaatcagttgttgttgttggttttgtaaaaatgggttgat 15362912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 34241393 - 34241477
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    |||| |||||||||||| || | ||| | |||||||| | || ||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  34241393 tgatgattcatggcttgagtgttcataaatcatgatttgatgatgaaaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaaagggttga 34241477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Original strand, 31199 - 31570
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31199 tttatcacaatcatttagttaattcattttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 31298  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31299 tatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 31398  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  31399 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 31498  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  31499 tacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 31570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41645 - 41274
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41645 tttatcacaatcatttagttaattcattttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 41546  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41545 tatgttgtagacatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 41446  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  41445 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 41346  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  41345 tacatggcttaggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 41274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 30)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 384
Target Start/End: Original strand, 15861345 - 15861728
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15861345 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 15861444  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15861445 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 15861544  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| |    
T  15861545 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgt--ttgtttagtcatattgttgatgatga 15861642  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 384  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  15861643 tgcatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 15861728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21860347 - 21859984
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  21860347 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtact 21860248  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  21860247 tatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttaatgatgaaattgcaagttcatgatgaatgaaaatgagtagtttgtaa 21860148  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  21860147 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatga 21860048  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21860047 tacatggctcgggtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatgaattgttgttgttggttt 21859984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 44034890 - 44035255
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |    
T  44034890 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcttgtt 44034989  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44034990 tatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgtttaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 44035089  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  44035090 attatgctcatttggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatagttgatgatga 44035189  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 366  Q
     | |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  44035190 -taatggcttgagtttgcatgattcataatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgt 44035255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 59 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22367296 - 22366970
Alignment:
Q  59 gaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 158  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367296 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 22367197  T
Q  159 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatga 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22367196 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgagtagtttgtaaattatgctcaattggtgaa-tatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatga 22367098  T
Q  259 tcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcgg 357  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  22367097 tcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgatgatacatgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttgg 22366998  T
Q  358 tggttttgt-aaaatgggttgataatga 384  Q
    || ||| || ||||||||||||| ||||    
T  22366997 tgttttggtgaaaatgggttgattatga 22366970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 49967780 - 49967628
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||     
T  49967780 ctcaattggtgaattatacattgttgttgatgaattgtgatacgtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatt 49967681  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  49967680 gcttcggtttgcatgattcatggttgttgttgaggaatgagatgttgttggtg 49967628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 35522436 - 35522588
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  35522436 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatacgtcatgttgttgatgataattcatg 35522535  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  35522536 gcttgggtttgcatgattcatgatttgtgttgagaaatgagatgttgttggtg 35522588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 41212202 - 41212046
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt---tgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  41212202 ctcaattagtgaattatgcactgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 41212103  T
Q  304 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41212102 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 41212046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21718358 - 21718206
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  21718358 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 21718259  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  21718258 gcttgggtttgcatgattcatggttgttcttgagaaatgagatgttgttggtg 21718206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 354
Target Start/End: Original strand, 22403227 - 22403375
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  22403227 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattaactgttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 22403326  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||    
T  22403327 gcttgggttt-catgattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgt 22403375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35054886 - 35054716
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  35054886 ctcaattggtgaattatgctatgtagttgatgaactgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatg 35054787  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  35054786 gcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtggaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 35054716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 370
Target Start/End: Original strand, 51627805 - 51627945
Alignment:
Q  231 tgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcat-atgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 329  Q
    ||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51627805 tgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgatgtt-gatgataattcatggcttgggtatgcatgattcatga 51627903  T
Q  330 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  51627904 tttgctgttgagaaatgagatgttgttggtggtttggtaaaa 51627945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 363
Target Start/End: Original strand, 27329872 - 27330026
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||    
T  27329872 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcatg 27329971  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||| |||||||||||| ||  ||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  27329972 gcttgggtatgcatgattcataat--ttgttgtcaaataagttgttgttgttggttt 27330026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 27674838 - 27674755
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  27674838 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 27674755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 41218738 - 41218667
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcat 75  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41218738 atcatgatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattctcat 41218667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 295 - 377
Target Start/End: Original strand, 22829629 - 22829712
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttg 377  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||    
T  22829629 tgataattcatggcttgggtgtgcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttg 22829712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 331
Target Start/End: Original strand, 9784239 - 9784341
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9784239 gttgttgttgaattgtgataagtttcaagatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggcttgggcttgcatgattcatg 9784338  T
Q  329 att 331  Q
    |||    
T  9784339 att 9784341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 229 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 17609036 - 17608886
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  17609036 gttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgttgttgttgttgttaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 17608937  T
Q  329 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    | ||| |  |||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  17608936 atttgattatgagaattgagttgttgttgttggttttggaaaatgggttga 17608886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 19603139 - 19603055
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    |||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  19603139 tgataattcatgacttgggtgtgaataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 19603055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 378
Target Start/End: Original strand, 38033882 - 38033962
Alignment:
Q  298 taattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  38033882 taattcatggcttgggtgtgcatagttcacgattgttgatgagaaataagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 38033962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20177245 - 20177140
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    ||||||||||| | ||| || |  |||||||| ||||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20177245 tgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgatgattcatggcttggatattcataattcatgatttgttgaagagaaatgagttgttgttggtggttttg 20177146  T
Q  366 taaaat 371  Q
    | ||||    
T  20177145 tgaaat 20177140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20254539 - 20254430
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||| || |||   ||||||| || ||    
T  20254539 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgagttgttatgaaattatgcttaa 20254440  T
Q  212 ttggtgaatt 221  Q
    ||| ||||||    
T  20254439 ttgatgaatt 20254430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 224
Target Start/End: Original strand, 21650076 - 21650181
Alignment:
Q  119 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtga 218  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||||| |||    
T  21650076 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaattgatga 21650175  T
Q  219 attatg 224  Q
     |||||    
T  21650176 cttatg 21650181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 20955644 - 20955728
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    |||||||||||||||| ||| || || |||| ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  20955644 tgataattcatggcttcggtgtgaataattcgtgaattgttggtgtgaaatgagttgttgtgggtgactttgtaaaaggggttga 20955728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21195084 - 21194980
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | |||||||     
T  21195084 tgttgttgttgttaagagatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggtttta 21194985  T
Q  366 taaaa 370  Q
    |||||    
T  21194984 taaaa 21194980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 188
Target Start/End: Original strand, 40436291 - 40436367
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatg 188  Q
    ||||||||||||||| | || ||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||||||||    
T  40436291 gatatgtttgaatatatgaaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatg 40436367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 253 - 371
Target Start/End: Original strand, 13377003 - 13377122
Alignment:
Q  253 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgt 351  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||| | |||||||||||| || | ||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  13377003 tcatgctcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgttgattcatggcttgagtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgaattgt 13377102  T
Q  352 tgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    ||| || |||||||| ||||    
T  13377103 tgttggcggttttgtgaaat 13377122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 252 - 378
Target Start/End: Original strand, 37234022 - 37234149
Alignment:
Q  252 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttg 350  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||| ||||||| | ||| | |||||||| | || ||| || ||||||     
T  37234022 ttcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatgacttgggtgtccataaatcatgatttgatgatgaaaattgagttt 37234121  T
Q  351 ttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||    
T  37234122 ttgtggttggttttgtaaaatgggttga 37234149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 277
Target Start/End: Original strand, 9784184 - 9784248
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttg 277  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  9784184 aattggtgaattatgctttgttgttga---attgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttg 9784248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 100
Target Start/End: Original strand, 18852668 - 18852728
Alignment:
Q  40 tatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||    
T  18852668 tatgcataagtgcttatttgaataagtgattatcgtgtacttaatcgttgaaattcgtgct 18852728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Original strand, 41229149 - 41229221
Alignment:
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    |||||||||||| || | ||| |||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  41229149 attcatggcttgagtgttcataattcatgatttgtggatgagaaatgagttgttgttggtagtttggtaaaat 41229221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 4 - 371
Target Start/End: Original strand, 6005 - 6373
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6005 atcataatcatatagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttat 6104  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6105 gttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgatttgttaatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaatt 6204  T
Q  204 atactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |    
T  6205 atgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtaatattgttgatgatgatac 6304  T
Q  304 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  6305 atgacttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 6373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Original strand, 5799 - 5923
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  5799 atcataatcatatagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttct 5898  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgt 128  Q
     | |||||||| |||||||||||||    
T  5899 gttgtagagatgtgtttgaatatgt 5923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 4)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 4 - 371
Target Start/End: Original strand, 162100 - 162469
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  162100 atcataatcatctagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttat 162199  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  162200 gttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatattaaatgatttgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtaaatt 162299  T
Q  204 atactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg-ttgtttagtcatatgtttgatgataatt 302  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||     
T  162300 atgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtttgtttagtcatattgttgatgatgata 162399  T
Q  303 catggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  162400 tatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 162469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 4 - 371
Target Start/End: Original strand, 166186 - 166547
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  166186 atcataatcatctagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttat 166285  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  166286 gttgtagagatgtgtttgaatatgttaatttgatattaaatgatttgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgtaaatgggtagtttgtaaatt 166385  T
Q  204 atactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||  |||||||| || |    
T  166386 atgctcaattggtgaattctgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt-------taatattgttgatgatgatac 166478  T
Q  304 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  166479 atggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgaaaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 166547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 164345 - 164204
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  164345 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaaatgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatggtaattcatg 164246  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 347  Q
    |||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  164245 gcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgag 164204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 371
Target Start/End: Original strand, 116690 - 116795
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| ||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  116690 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataattcatgatttgttgatgaaaaatggattgttgttggtggttttg 116789  T
Q  366 taaaat 371  Q
    ||||||    
T  116790 taaaat 116795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 4 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30427 - 30056
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||    
T  30427 atcataatcatttagttaattatttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaaccctatctttgaaattcatgcttat 30328  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30327 gttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaatt 30228  T
Q  204 atactcaattggtgaatta---tgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    || |||||||| ||  | |   || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30227 atgctcaattgttgtttgaaattgtatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatattgttgatgataa 30128  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  30127 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 30056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 12437 - 12802
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  12437 tttatcataatcatttagttaattctttttcttttgttctatgcataattgattatgggaataagttattatcatgaacccaatctttgaaatttgtgct 12536  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatg--aattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgt 198  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12537 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgattaatgtgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgt 12636  T
Q  199 aaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgat 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12637 aaattatgctcaattggtgaattatgcatgattgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgat 12736  T
Q  299 aattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  12737 aattcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 12802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 230 - 363
Target Start/End: Original strand, 19049 - 19183
Alignment:
Q  230 ttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  19049 ttgttgatgaattgtgatatgtttcatgattaatggttgttgttgttgtttagtcatatggttgatgataattcatggcttgggtatgcatgattcataa 19148  T
Q  330 -ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||    
T  19149 tttgttgttgagaaataaattgttgttgttggttt 19183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 17323 - 17686
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  17323 tttatcataatcatttaggtaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataattgattatcatgaacccaatctttgaaattagtgct 17422  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17423 tatgtggtagagatatgtttgaatatgttaatttgattttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 17522  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  17523 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 17622  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatgat-tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  17623 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatatgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 17686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 897 - 1261
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  897 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 996  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  997 tatgttgtagaggtttgttttaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 1096  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||    
T  1097 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaa 1196  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  1197 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgagaaataagttgttgttgttggttt 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 55917 - 55553
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  55917 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 55818  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  55817 tatgttgtagatatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtaggaaaatgggtagtttgtaa 55718  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  55717 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 55618  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||  |||| ||||||||| | ||||||    
T  55617 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtaaaataagttgttgttgttggttt 55553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 108094 - 108173
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaac 79  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108094 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttcattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaac 108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 378
Target Start/End: Original strand, 93973 - 94061
Alignment:
Q  291 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    ||||||||||||||||  ||||||   ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  93973 ttgatgataattcatgatttgggtgaacataattcatgatttgttggtgagaaatgagatgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 94061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 267 - 354
Target Start/End: Original strand, 104799 - 104887
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| || ||| ||||||||||||||    
T  104799 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatgaattgatgatgataaatgagttgttgt 104887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 366
Target Start/End: Original strand, 371 - 736
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  371 tttatcataatcatctagttaattctttt-ctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatatttgaaatttgtgct 469  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  470 tatgttgtagagatatatttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgtagatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgaatagtttgtaa 569  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||||| |    
T  570 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgatatttactcatattgttgatgatga 669  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 366  Q
    | |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  670 tacatggcttgggtttgcatgattaataatttgttgttgagaaatggattattgttggtggttttgt 736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 13304 - 13669
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13304 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 13403  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13404 ttatgttgtagagatatgtttggatatgttaatttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgta 13503  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 299  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||    
T  13504 aattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgcta 13603  T
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  13604 attcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 13669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 154 - 354
Target Start/End: Original strand, 21432 - 21634
Alignment:
Q  154 atgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgttt 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21432 atgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatatgttt 21531  T
Q  254 catgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgt 351  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||    
T  21532 catgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgaatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgt 21631  T
Q  352 tgt 354  Q
    |||    
T  21632 tgt 21634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Original strand, 6462 - 6816
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6462 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgataataggtgcttatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 6561  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6562 tatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgtcaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 6661  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | | ||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  6662 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttgatgatcaatagatcttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 6761  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  6762 ttcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgt 6816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 193416 - 193770
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||     
T  193416 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatcattgaaattcgtgc- 193514  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaa 200  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  193515 --------agagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaa 193606  T
Q  201 attatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataa 300  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||    
T  193607 attatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaa 193705  T
Q  301 ttcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  193706 ttcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgcgaaataagttgttgttgttggttt 193770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 116 - 354
Target Start/End: Original strand, 186560 - 186799
Alignment:
Q  116 tgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattgg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  186560 tgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattgg 186659  T
Q  216 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 315  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||||||||||     
T  186660 tgaattatgcatggttgttgat-tattgtgatatgtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggta 186758  T
Q  316 tgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||||||||| |  ||||||||| ||||| |||||||||    
T  186759 tgcatgattcataattttgttgttgtgaaataagttgttgt 186799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 50 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15236 - 14921
Alignment:
Q  50 tgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatt 149  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15236 tgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgtcgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaatt 15137  T
Q  150 gttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15136 gttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgtttattttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgatat 15037  T
Q  250 gtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgag 347  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||| ||    
T  15036 gtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgggtatgcatgattcataattttgttgttgtgaaataag 14937  T
Q  348 ttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||||| | ||||||    
T  14936 ttgttgttgttggttt 14921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 9901 - 10248
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataa-ttgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9901 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttgttctatgcataaattgattatgaaaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 10000  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  10001 ttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatggg--------- 10091  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgata 299  Q
            | |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || |  | |||| ||    
T  10092 --------taaattggcgaattatgcttggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatggatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgcta 10183  T
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  10184 attcatggcttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgatggttt 10248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 177; Significance: 3e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 59 - 354
Target Start/End: Original strand, 5 - 301
Alignment:
Q  59 gaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 158  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5 gaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgcttatgttgtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 104  T
Q  159 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatga 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||| |||||||||    
T  105 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaattggtgaattatgcataataattgatgaattatgataagtttcatga 204  T
Q  259 tcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    |||||   ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  205 tcaataaatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgctaattcatggcttgagtatgcatgattcataatttattgttgtgaaataagttgttgt 301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 7e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4365 - 4593
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  4365 tttatcataatcatttggttaattctttttctcttcattctatgcataattgattatgggaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattagtgc 4464  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4465 ttatgttgtagagatatgtttaaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtagtttgta 4564  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatgcatg 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4565 aattatgctcaattggtgaattatgcatg 4593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 130893 - 130486
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttg-ttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgc 99  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  130893 tttatcataatcatttgattaattctttttctcttgattctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgc 130794  T
Q  100 ttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgta 199  Q
    | || | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||||| |||||||||||||||| |||   |    
T  130793 tcatgttgtagagatatgtttggatacgttaa-ttgatgttaaatgaatggttgatgatgaaataatatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtga 130695  T
Q  200 aattatactcaattggtgaattatg-catggttgttgatgaattttgatatgtttcatg-atcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 297  Q
    |||||| || ||||| ||| ||||| ||| ||||||| ||||||  | | ||  ||| |  ||||| | ||||||||||||| ||  || |  ||||| |    
T  130694 aattatgcttaattgatgacttatgacat-gttgttgttgaattggggtgtgaatcaagtttcaattgatgttgttgttgttgagatatgttgttgatta 130596  T
Q  298 taattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgag-aaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaat 396  Q
    | | | ||||||||||| | |||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |    
T  130595 tgaattatggcttgggtgttcatatatcatgattgttgttgagaaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttaataaagaagaagtttgatt 130496  T
Q  397 ttgatgatgt 406  Q
    ||||||||||    
T  130495 ttgatgatgt 130486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 79647 - 79521
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| |||| ||   |||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  79647 gttgttgttgaattatgatgtgaaccatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattattgttgatgattcatggcttgggtattcataattcatg 79548  T
Q  329 -attgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
     |||| || ||||||||||||||||||    
T  79547 aattggtgatgagaaatgagttgttgt 79521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 276
Target Start/End: Original strand, 89586 - 89655
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgtt 276  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  89586 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttaaattgtgataagtttcatgaacaattgatgttgttgtt 89655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 207 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 274 - 75
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  274 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 175  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  174 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgctgagaaatgagttgttgttgttggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 75  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 229 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 3407 - 3230
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407 gttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 3308  T
Q  329 attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3307 attgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 112 - 363
Target Start/End: Original strand, 9537 - 9789
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9537 gataagtttgagtatgttaattgattgctaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagtttatgatgtatgaaaatgggtagtttgtaaattatgctcaa 9636  T
Q  212 ttggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttg 311  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |  |  | |||| ||||||||||||||    
T  9637 ttagtgacttatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgacgttatggatgctaattcatggcttg 9736  T
Q  312 ggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  9737 ggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 9789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 207 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21642 - 21442
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| | | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  21642 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgattatttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 21543  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 405  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21542 gcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttaagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatg 21443  T
Q  406 t 406  Q
    |    
T  21442 t 21442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 207 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31341 - 31141
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||| |||||| |   |||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| | |||| |||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  31341 ctcaattggtaaattatactatgttgttgatgaattgtgataagtttcattatcaattgatgtttttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 31242  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatg 405  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31241 gcttgggtttgcatgattcatgaattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaaaaagtttgattttgatgatg 31142  T
Q  406 t 406  Q
    |    
T  31141 t 31141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 207 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 25088 - 24890
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |  ||||||||||||||||    
T  25088 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattcatg 24989  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24988 gcttgggtt-gcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 24890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25341 - 25212
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||| |  ||||||||||||||||    
T  25341 ctcaattggtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttcacgatcaattgttgttgttgttgatatggcatgttgttgatgataattcatg 25242  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgtt 337  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25241 gcttggg-ttgcatgattcatgattgttgtt 25212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 112 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 95204 - 94948
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggttt----gtaaattatac 207  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    ||||||||| |    
T  95204 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatagatagtttatttgtaaattatgc 95105  T
Q  208 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 307  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  | |||| ||||||||||    
T  95104 tcaattagtgaattatgcatggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgataagtgatgttatggatgctaattcatgg 95005  T
Q  308 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
     |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  95004 tttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 94948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 363
Target Start/End: Original strand, 24845 - 25002
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  | |||| |||||| ||    
T  24845 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatggatgttaattcttg 24944  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||| | |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  24945 gcttgggtattcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 25002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 210 - 406
Target Start/End: Original strand, 234 - 430
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||| |||    
T  234 aattcgtgaattatgttttgttgttgttgaattgtgataagtttaatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatagct 333  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  334 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagcttttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 330 - 406
Target Start/End: Original strand, 6603 - 6679
Alignment:
Q  330 ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6603 ttgttgttgagaattgagttgttcttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 6679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 42690 - 42568
Alignment:
Q  1 tttatcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42690 tttatcataatcatttagttaattctttttctcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaacccaatctttgaaattcgtgct 42591  T
Q  101 tatatggtagagatatgtttgaa 123  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  42590 tatgtggtagagatatggttgaa 42568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 32363 - 32180
Alignment:
Q  177 tgtatgaaaatgggtg-gtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 275  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32363 tgtatgaaaatgggtatgtttgaaaat-atgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgt 32265  T
Q  276 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32264 tgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 32180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 177 - 359
Target Start/End: Original strand, 41940 - 42123
Alignment:
Q  177 tgtatgaaaatgggtg-gtttgtaaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgt 275  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41940 tgtatgaaaatgggtatgtttgaaaat-atgctcaattggtgaattatgaattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgt 42038  T
Q  276 tgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  42039 tgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataatccttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 42123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 224
Target Start/End: Original strand, 44036 - 44256
Alignment:
Q  4 atcataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttat 103  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||  ||||| | |||||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  44036 atcataatcacttagttaatttcttctctcttttgctatgcataagtgattatttgaataagtgattattgtgaacctaatctttgaaattcgtgctcat 44135  T
Q  104 atggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaatt 203  Q
     | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  || |||||| | ||    
T  44136 gttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatggtaattgaattgttgatgatgaaattgcatgttcatgatgtatgtaaataagtagtttgtgagtt 44235  T
Q  204 atactcaattggtgaattatg 224  Q
    || ||||||||  ||||||||    
T  44236 atgctcaattgacgaattatg 44256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 207 - 352
Target Start/End: Original strand, 11825 - 11970
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11825 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 11924  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 352  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11925 gcttgagtttgcatggttcatgattggtgttgagaaatgagatgtt 11970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 132367 - 132520
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  132367 ctcaattggtgaattatgcatcgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 132466  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  132467 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgaaatgttgttggtg 132520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11818 - 11660
Alignment:
Q  207 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 305  Q
    |||||||||| |||||||||   |||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |  |  |||||||||||||||    
T  11818 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgtagaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgacgttgttgatgataattcat 11719  T
Q  306 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11718 ggcttggttatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 11660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 208 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 88404 - 88289
Alignment:
Q  208 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 307  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| || |  | |||| |||||| |||    
T  88404 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgctgttgttaagtgatgttatggatgctaattcttgg 88305  T
Q  308 cttgggtttgcatgat 323  Q
    ||||||| ||||||||    
T  88304 cttgggtatgcatgat 88289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 70739 - 70892
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  70739 ctcaattggtgaattatgcattattgttgatgaattgtgataagtttcatgatcattggatgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 70838  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
     |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  70839 acttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 70892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 203 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 60940 - 60784
Alignment:
Q  203 tatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataatt 302  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||    
T  60940 tatacttaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataatt 60841  T
Q  303 catggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  60840 catgacttgggtttgcatgattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 60784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 164995 - 165107
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||  ||   ||||||| || ||    
T  164995 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttcttatgaaattatgcttaa 165094  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| |||||||||    
T  165095 ttgatgaattatg 165107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 5363 - 5516
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  5363 ctcaattggtgaattaggcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 5462  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5463 gtttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 5516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 207 - 363
Target Start/End: Original strand, 8998 - 9156
Alignment:
Q  207 ctcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcat 305  Q
    |||||||||| |||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||    
T  8998 ctcaattggttgaattatgctatgttgttgttaaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcat 9097  T
Q  306 ggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9098 ggcttaggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgtcggtggttt 9156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22821 - 22668
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||    
T  22821 ctcaattggtgaattatgcatttttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttttgtcatgttgttgatgataattcatg 22722  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  22721 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttattgagaaatgagatgttgttggtg 22668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 6962 - 7118
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  6962 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattc 7061  T
Q  304 atggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7062 atggcttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 7118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 939 - 1092
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  939 ctcaattggtgaattatgcattgttattgatgatttgtgataagtttcatgatcaattgttgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 1038  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1039 gcttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 1092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 210 - 363
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109736
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  109582 aattggtgaattatgctaagttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggct 109681  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  109682 tgggattgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 109736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 208 - 363
Target Start/End: Original strand, 118081 - 118237
Alignment:
Q  208 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatgg 307  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||    
T  118081 tcaattggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatgg 118180  T
Q  308 cttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  118181 cttggggttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 118237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 384 - 219
Alignment:
Q  59 gaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 158  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  384 gaataagtgattattgtgaacccaatctttgaaattcttgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgat 285  T
Q  159 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatg 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||| || |||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  284 gaaattgcatgttcatgatgtatataaatgtgtagtttgtgaattatgctcaattgttgaattatg 219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 86; Significance: 6e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 254931 - 255084
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  254931 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 255030  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  255031 gcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 255084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 261537 - 261690
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  261537 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatg 261636  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  261637 gcttgagtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 261690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 84; Significance: 9e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15004 - 14854
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  15004 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgt---tgtttagtcatgttgttgatgataattcatg 14908  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14907 gcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 266 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14288 - 14194
Alignment:
Q  266 ttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattc-atgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14288 ttgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcatggcttgggtttgcataattctcggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 14194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 207 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7699 - 7556
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  7699 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgataaattatgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 7600  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgtt 352  Q
    |||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| ||||    
T  7599 gcttgggtttgcatgattc--gttggttgttgagaaatgagatgtt 7556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 210 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 85459 - 85321
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| |    
T  85459 aattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggtt 85360  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgag 347  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  85359 tgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgag 85321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 199 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 159438 - 159275
Alignment:
Q  199 aaattatactcaattggt-gaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 297  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||   |||| || |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |   ||||||    
T  159438 aaattatgctcaattggttgaattatgctatgttgatgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgt---tgatga 159342  T
Q  298 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  159341 taatttttggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 159275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 693 - 846
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  693 ctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 792  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  793 gcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 59 - 224
Target Start/End: Original strand, 1478 - 1643
Alignment:
Q  59 gaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgat 158  Q
    |||||| |||||||  |||||  ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1478 gaataaatgattattgtgaacccaatctttgaaattcgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaatttgatgataattgaattgttgatgat 1577  T
Q  159 gaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatg 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||||    
T  1578 gaaattgcatgttcatgatgtatataaatgagtagtttgagaattatgctcaattgatgaattatg 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38428 - 38287
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||     
T  38428 ctcaattggcgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgacgttgttgttgtttagtcatgttgttgatgataattcata 38329  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgag 347  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  38328 acttgggtttgcatgattcatggtttgttgttgagaaatgag 38287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 371
Target Start/End: Original strand, 253106 - 253271
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||| |    
T  253106 ctcaattggtgaatcatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgttgttgtttttgttaagtcatgttgttgatgataattcaag 253205  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  253206 gcttgggtttgcatgattcatgatttcttgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 253271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 207 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10067 - 9903
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| |||||||    
T  10067 ctcaattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgattattcatg 9968  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  9967 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgtggagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 9903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Original strand, 15588 - 15761
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaa---tggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattc 303  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||| |  | |||| ||||||    
T  15588 ctcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgatatgtttcatgatcaattgttgttgttgttgttgtttagtcatgttatagatgctaattc 15687  T
Q  304 atggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||| | |||||| || |||||||||    
T  15688 atggcttgggtatgcatgattcataattttttgttgagaaataaattgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9117 - 8960
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||| |||||| ||||| | | ||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  9117 ctcaattggtgaattatgctatgttgttgatgatttgtgataagtttcaagatcacttgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatg 9018  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  9017 gcttgggtttgcttgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtggttt 8960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 635 - 788
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||| ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||||| |  ||||||||||||||||    
T  635 ctcatttggtgaattatgctatgttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttactaagtcatgttgttgatgataattcatg 734  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  735 gcttgggttggcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 210 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1444 - 1300
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  1444 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgatcattcatggct 1345  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttg 353  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1344 tgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttg 1300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 11771 - 11921
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||   |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||    
T  11771 ctcaattagtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaa---ttgttgttgttgttaagtcatgttgttgatgataattcatg 11867  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||| |||||| | ||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  11868 gcttggg-ttgcataactcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 11921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 300 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28573 - 28466
Alignment:
Q  300 attcatggcttgggtttgcatgattcatgattg-ttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaattt 398  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28573 attcatggcttgggtgttcataattcatgatttattggtgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgatttt 28474  T
Q  399 gatgatgt 406  Q
    ||||||||    
T  28473 gatgatgt 28466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 356 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21687 - 21637
Alignment:
Q  356 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21687 ggtggttttgtaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 21637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 207 - 359
Target Start/End: Original strand, 112662 - 112812
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||||| |   || ||||||||||||    
T  112662 ctcaattagtgaattatgctatgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatttatgttgttgttgttaagtcatgt---tgttgataattcatg 112758  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  112759 gcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 112812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 109698 - 109556
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||| | ||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  109698 gttgttgttgaattgtgataagattcatgatcagttgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgatgataattcatggcttgggtatgcacgattcatg 109599  T
Q  329 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  109598 atttgttgatgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 109556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 378
Target Start/End: Original strand, 103123 - 103211
Alignment:
Q  291 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  103123 ttgatgataattcatggtttgggtgtgcataattcatgaattgttggtgataaatgagttgttgttggtgactttgtaaaatgggttga 103211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 146731 - 146561
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |  |  ||| |||||||||    
T  146731 ctcaattggtgaattatgctaggttgttgatgaattgtgataagtttcatgatcaatagatgttgttgttgttaagtgatgttatgcatgttaattcatg 146632  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggt 375  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||    
T  146631 gcttgggtatgcatgattcataatttgtttttgtgaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggt 146561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 233 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1485 - 1332
Alignment:
Q  233 ttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-tt 331  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||| ||||| |  ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1485 ttgatgaattgtgataagtttcatgatcaataaatgttgctgttgctatgtcatgttgttgatgataaatcatggcttgggtttgcatgattcatgattt 1386  T
Q  332 gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatga 384  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||||    
T  1385 gttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtgaaaatgggttgattatga 1332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 207 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 151 - 3
Alignment:
Q  207 ctcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatg 306  Q
    ||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  151 ctcaattcgtgaattatgctacgtggttgatgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatg 52  T
Q  307 gcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgt 354  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||  |||||||    
T  51 gcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggattgttgt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3589 - 3492
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||||||||| |  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||| ||||||||    
T  3589 tgttgttgttgctatgtcatcttgttgatgataattcatggcttgggtttgcatgtttcattatttgttgttgagaaatggaatgttgttggtggttt 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6159 - 5996
Alignment:
Q  61 ataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatga 160  Q
    |||||||||||| |||||||   |  |||||||| ||||| || | |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  6159 ataagtgattattatgaacttgcttgttgaaatttgtgctcatgttgtagtgatatgtttgagtatgttaaattgatgataattgaattgttgatgatga 6060  T
Q  161 aattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaattggtgaattatg 224  Q
    ||||||| ||||||||| || | |||||||| |||||| |||| | |||||||| ||| |||||    
T  6059 aattgcatgttcatgatataagtaaatgggtagtttgtgaattgtgctcaattgatgatttatg 5996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 210 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5068 - 4906
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||||||||||||||  | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  5068 aattggtgaattatgatttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgttgatgataattcatggct 4969  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    ||| | | ||| |||||||| ||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4968 tggttgttcataattcatgatttgctgatgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 4906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 359
Target Start/End: Original strand, 11688 - 11837
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||| ||    
T  11688 aattggtgaattatgctttgttgttgttgaattgtgatcagtttcatgatcaatttatgttgttgttgatatgtcatgttgttgatgataattcatgact 11787  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||    
T  11788 tgggtttgcataattcatgatttgtgtggagaaatgagatgttgttggtg 11837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 48286 - 48124
Alignment:
Q  198 taaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 297  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |  |||||||    
T  48286 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatga 48187  T
Q  298 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  48186 taattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 48124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 198 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 61734 - 61572
Alignment:
Q  198 taaattatactcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatga 297  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || ||| |  |||||||    
T  61734 taaaatatgctcaattggtgaattatgttttgttgttgatgaattgtgaaaagtttcatgatcaattgttattattgttgttaagccatgttgttgatga 61635  T
Q  298 taattcatggcttgggtttgcatgattcatga--ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| | |||||||||| |||||| ||||    
T  61634 taattcatggcttggg-ttgcataattcatgattttgttatggagaaatgagatgttgttggtg 61572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 222
Target Start/End: Original strand, 3761 - 3981
Alignment:
Q  6 cataatcatttagttaattcttttactcttgttctatgcataattgattatgagaataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatat 105  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||  ||||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||  ||||   ||  ||||||||||||||| || |    
T  3761 cataatcacttagttagtttcttctctctttttctatgcataagtgcttatttgaataagtgattattgtgaaaccaacttttgaaattcgtgctcatgt 3860  T
Q  106 ggtag----agatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaa 201  Q
     ||||    | |||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||  |||||||| |||||| ||    
T  3861 tgtagtgatatatatgtttgagtatgttaatttgatgatgattgaattgttaatgatgaaattgcatgttcatgatatatataaatgggtagtttgtgaa 3960  T
Q  202 ttatactcaattggtgaatta 222  Q
    ||||  ||||||| |||||||    
T  3961 ttatgttcaattgatgaatta 3981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 370
Target Start/End: Original strand, 33854 - 34008
Alignment:
Q  216 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 315  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||| | ||| || |  ||||| ||||||||||||||||||     
T  33854 tgaattatgctatgttgttgttgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatgttgttgataataattcatggcttgggta 33953  T
Q  316 tgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  33954 tgcatgatt-atgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagtttggtaaaa 34008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 33789 - 33668
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||    
T  33789 aattggtgaattatgctatgttgttgatgaattttgataagtttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggct 33690  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgatt 331  Q
     |||| | ||| ||||||||||    
T  33689 agggtgttcataattcatgatt 33668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 265 - 363
Target Start/End: Original strand, 24372 - 24471
Alignment:
Q  265 gttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  24372 gttgttgttgttgctatgtcatgttgttgatgataattcatgtcttgggtttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttt 24471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 232 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31149 - 31010
Alignment:
Q  232 gttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-t 330  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||| || |  || |  | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31149 gttgttgaattgtgataagtttcatgattaattgatgttgttgctgatatgtgaggtttttgatgataatttatggcttgggtatgcatgattcatgact 31050  T
Q  331 tgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaa 370  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  31049 tgttgttgagaaatgagatgttgttggtgttttggtaaaa 31010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 70734 - 70676
Alignment:
Q  216 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttg 274  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  70734 tgaattatgctttgttgttgttgaattgtgataagtttcatgatcaattgatgttgttg 70676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 378
Target Start/End: Original strand, 97403 - 97487
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    |||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||| | || | |||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  97403 tgatgattcatgccttgggttttcataaatcatgatttgatgataagaattgagttgttgttattggttttgtaaaatgggttga 97487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 252 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2001 - 1889
Alignment:
Q  252 ttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttg 350  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | |||||| |   |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  2001 ttcatgatcaattgatgttgttgttgctaagtcatgttgatgatgataattcttggcttgagtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatg 1902  T
Q  351 ttgtcggtggttt 363  Q
    ||||  |||||||    
T  1901 ttgttagtggttt 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 210 - 371
Target Start/End: Original strand, 76967 - 77129
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| || |  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||  |||| ||||||||||    
T  76967 aattgttgaattatgctatgttgttgttgaattgtggtgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttattgatgattcatggct 77066  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    ||||| | ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  77067 tgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtgaaat 77129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 5610 - 5722
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||    
T  5610 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttttgaaattatgcttaa 5709  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||  |||||||||    
T  5710 ttaatgaattatg 5722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Original strand, 5823 - 5875
Alignment:
Q  324 tcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgta-aaatgggt 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5823 tcatgattgttggtgagaaatgagatgttgttggttgttttgtataaatgggt 5875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 17924 - 17812
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  17924 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 17825  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| |||||||||    
T  17824 ttgatgaattatg 17812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 378
Target Start/End: Original strand, 43975 - 44087
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttg 365  Q
    ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||| | || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43975 tgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgagttgttgttgttggttttg 44074  T
Q  366 taaaatgggttga 378  Q
    |||||||||||||    
T  44075 taaaatgggttga 44087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 49877 - 49989
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || ||||||  ||||||||||||||| |||   |||||||||| ||    
T  49877 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcatagtgtatgaaaatgggtagttgtgaaattatacttaa 49976  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| |||||||||    
T  49977 ttgatgaattatg 49989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 393 - 270
Alignment:
Q  253 tcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgt 351  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| | ||| || | |||| |||| ||||||| |||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  393 tcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatgtttttgttgattattcatgccttgggtgctcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgt 294  T
Q  352 tgtcggtggttttgtaaaatgggt 375  Q
    ||| |||||||||||||| |||||    
T  293 tgttggtggttttgtaaactgggt 270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 208 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4414 - 4351
Alignment:
Q  208 tcaattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttg 271  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  4414 tcaattggtgaattatgcattgttgttgatgaattgtgataagttttatgatcaattgttgttg 4351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 4353 - 4284
Alignment:
Q  291 ttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcat-gattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtg 359  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4353 ttgatgataattcatggtttgggtttgcataattcttggtttgttgttgagaaatgagatgttgttggtg 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7878 - 7807
Alignment:
Q  293 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  7878 gatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttgttgagaaatgagatgttgttggtagttt 7807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 237 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3419 - 3308
Alignment:
Q  237 tgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttg 335  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||| | ||||| ||||| | ||| || |  | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3419 tgaattgtgataagattcatgatcaattgatgttgatgttgctaagtgatgttgtggatgttaattcatggcttgggtatgcatgattcatgatttgttg 3320  T
Q  336 ttgagaaatgag 347  Q
    ||||||||||||    
T  3319 ttgagaaatgag 3308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 290 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6708 - 6622
Alignment:
Q  290 tttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggt 375  Q
    |||| |||| |||||||||||||||   ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6708 tttgttgatgattcatggcttgggtggtcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttgttgttggtggttttgtaaactgggt 6622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 69565 - 69415
Alignment:
Q  229 gttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatg 328  Q
    ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| ||||||||||||||| | ||| | |||||    
T  69565 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggcttgggtgttcataaatcatg 69466  T
Q  329 a-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    | ||| || |||||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||    
T  69465 atttgatgatgagaattgaggtgttgttgttggttttgtaaaatgggttga 69415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 176
Target Start/End: Original strand, 244855 - 244920
Alignment:
Q  111 agatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatga 176  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||| | ||||||||||||| | ||||||||    
T  244855 agatatgtttgggtatgttaatttgttgataattgaattatggatgatgaaattgtatgttcatga 244920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 34442 - 34554
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| ||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  34442 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtgtgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 34541  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| |||||||||    
T  34542 ttgatgaattatg 34554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 224
Target Start/End: Original strand, 61256 - 61368
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  61256 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttgtgaaattatgcttaa 61355  T
Q  212 ttggtgaattatg 224  Q
    ||| ||| |||||    
T  61356 ttgatgacttatg 61368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 2646 - 2483
Alignment:
Q  216 tgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtt 315  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||| ||||  | |||||| ||||| | ||||||||||| | ||| ||||  ||| |||| |||||||| ||||||     
T  2646 tgaattatgctatgttgttgttgaattatgatgagattcatgttcaattgatgttgttgttgctaagtgatattgttgttgatgattcatggtttgggtg 2547  T
Q  316 tgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaatgggttga 378  Q
    | ||| | |||||||| | || |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  2546 ttcataaatcatgatttgatgatgagaaatgacttgttgttgttggttttctaaaatgggttga 2483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 403
Target Start/End: Original strand, 12990 - 13048
Alignment:
Q  346 agttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatga 403  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12990 agttgttgttgatggttttgtgaaaatgggttgataatgaagaagtttgattttgatga 13048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5447 - 5338
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  5447 gataagtttgagtatgttaattgattgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggttgttatgaaattatgcttaa 5348  T
Q  212 ttggtgaatt 221  Q
    ||| ||||||    
T  5347 ttgatgaatt 5338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35520 - 35444
Alignment:
Q  295 tgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35520 tgatgattcatggcttgggtattcataattcatgatttgttgatgagaaatgagttg-tgttggtggttttgtaaaat 35444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 177
Target Start/End: Original strand, 7112 - 7165
Alignment:
Q  124 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgat 177  Q
    |||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  7112 tatgttaacttgttgataattgaattgttgatgatgaatttgcatgttcatgat 7165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 191
Target Start/End: Original strand, 6252 - 6324
Alignment:
Q  119 ttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggt 191  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  6252 ttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggt 6324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11970 - 11862
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtggtttgtaaattatactcaa 211  Q
    |||| |||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||| ||||||||||| |||   ||||||| || ||    
T  11970 gataagtttgagtatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtttgaaaatgggtagttgtgaaattatgcttaa 11871  T
Q  212 ttggtgaat 220  Q
    ||| |||||    
T  11870 ttgatgaat 11862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 191
Target Start/End: Original strand, 17355 - 17422
Alignment:
Q  124 tatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggt 191  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  17355 tatgttaattgaatgataaatgaattgttggtgatgaaataacatgttcataatgtatgaaaatgggt 17422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1422 - 1364
Alignment:
Q  314 tttgcatgattcatgatt-gttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgtaaaat 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  1422 tttgcatgattcatgatttgttgttgagaaatggattgttgttggtggttttgtgaaat 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 192
Target Start/End: Original strand, 902 - 982
Alignment:
Q  112 gatatgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaattgcaagttcatgatgtatgaaaatgggtg 192  Q
    ||||||||||| ||  | |||||| || ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||    
T  902 gatatgtttgagtaaatgaatttggtgataattgaattgttgttgatgaaattgcatgttcataatatgtgaaaatgggtg 982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 366 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 12734 - 12694
Alignment:
Q  366 taaaatgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12734 taaaatgggttgatagtgaagaagtttgattttgatgatgt 12694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 293 - 363
Target Start/End: Original strand, 22715 - 22786
Alignment:
Q  293 gatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatga-ttgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttt 363  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||    
T  22715 gatgctaattcatggtttgggtatgcatgattcataatttgttgttgtgaaataagttgttgttgttggttt 22786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 379
Target Start/End: Original strand, 2436 - 2607
Alignment:
Q  210 aattggtgaattatgcatggttgttgatgaattttgatatgtttcatgatcaatggttgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggct 309  Q
    ||||| ||||||||||   ||||||| |||||| ||||| |  ||||| ||||| | ||||||||||  | ||| || |  |||||||| ||||||||||    
T  2436 aattgatgaattatgctatgttgttgttgaattatgataagactcatgttcaattgatgttgttgttcctaagtgatgttgttgatgatgattcatggct 2535  T
Q  310 tgggtttgcatgattcatg-attgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt-aaaatgggttgat 379  Q
    ||||  | ||| |||||||  ||| || |||||||| ||||||||| | |||||| || |||||||||||||    
T  2536 tgggcgttcataattcatgttttgatgatgagaaataagttgttgttgttggtttggtgaaaatgggttgat 2607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 371 - 406
Target Start/End: Original strand, 3392 - 3427
Alignment:
Q  371 tgggttgataatgaagaagtttgaatttgatgatgt 406  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3392 tgggttgataatgaagaagtttgattttgatgatgt 3427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 167
Target Start/End: Original strand, 34404 - 34535
Alignment:
Q  37 ttctatgcataattgattatgaga-ataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttg 135  Q
    |||||||||||| || ||||  || ||||||||||||  |||||| |||  ||||||||||||||    | |||| ||||||||||| ||||| || |||    
T  34404 ttctatgcataagtgcttatttgagataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtgctctagttgtagtgatatgtttgagtatgtgaaattg 34503  T
Q  136 atgttaaatgaattgttgatgatgaaattgca 167  Q
    ||| ||| |||| ||||||||  |||||||||    
T  34504 atgataactgaactgttgatgtggaaattgca 34535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 37 - 167
Target Start/End: Original strand, 19881 - 20012
Alignment:
Q  37 ttctatgcataattgattatgaga-ataagtgattatcatgaactaaatctttgaaattcgtgcttatatggtagagatatgtttgaatatgttaatttg 135  Q
    |||||||||||| || ||||  || ||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||| || |  ||| | ||||||||  ||||| || |||    
T  19881 ttctatgcataagtgtttatttgagataagtgattattgtgaacttaattgttgaaattcgtgctcatgttttagtgttatgtttgggtatgtgaaattg 19980  T
Q  136 atgttaaatgaattgttgatgatgaaattgca 167  Q
    ||| ||| |||||||||||||  |||||||||    
T  19981 atgataattgaattgttgatgtggaaattgca 20012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 164
Target Start/End: Original strand, 10992 - 11041
Alignment:
Q  115 atgtttgaatatgttaatttgatgttaaatgaattgttgatgatgaaatt 164  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  10992 atgtttgagtatgtgaatttgatgttgattgagttgttgatgatgaaatt 11041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 108080 - 107967
Alignment:
Q  267 tgttgttgttgtttagtcatatgtttgatgataattcatggcttgggtttgcatgattcatgattgttgttgagaaatgagttgttgtcggtggttttgt 366  Q
    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||| |||||| |||||||| | ||| | |||||| | ||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |    
T  108080 tgttgttgttgttaagatatattgttgttgatgattcatagcttgggtgttcataaatcatgaattttgatgagaaataagttgttgttgttggtttttt 107981  T
Q  367 -aaaatgggttgat 379  Q
     |||||||||||||    
T  107980 aaaaatgggttgat 107967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University