View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5409-Insertion-2 (Length: 1060)

Name: NF5409-Insertion-2
Description: NF5409
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5409-Insertion-2
NF5409-Insertion-2
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (8-356)||(3593598-3593946)
chr2 (473-767)||(3594065-3594360)
chr2 (898-991)||(3594464-3594561)
chr2 (588-691)||(3673121-3673224)
chr2 (627-749)||(30313173-30313294)
chr2 (639-749)||(33561504-33561614)
chr2 (586-739)||(33731653-33731806)
chr2 (589-749)||(962593-962753)
chr2 (627-749)||(28254278-28254400)
chr2 (588-749)||(42514644-42514805)
chr2 (596-744)||(36178615-36178763)
chr2 (586-749)||(15880258-15880421)
chr2 (596-749)||(15511505-15511656)
chr2 (627-749)||(28531355-28531477)
chr2 (639-749)||(29873590-29873700)
chr2 (591-749)||(37632602-37632760)
chr2 (628-744)||(5543040-5543156)
chr2 (596-744)||(14745677-14745825)
chr2 (625-749)||(30323459-30323583)
chr2 (588-744)||(37105924-37106080)
chr2 (586-744)||(37106188-37106346)
chr2 (639-749)||(41678421-41678532)
chr2 (589-749)||(40679632-40679792)
chr2 (588-742)||(6712978-6713133)
chr2 (588-747)||(7598225-7598384)
chr2 (588-742)||(6421387-6421541)
chr2 (630-748)||(29874067-29874185)
chr2 (639-749)||(33953824-33953934)
chr2 (588-750)||(35580726-35580887)
chr2 (586-747)||(1769889-1770050)
chr2 (588-744)||(41283477-41283633)
chr2 (590-677)||(3672768-3672855)
chr2 (639-742)||(34481268-34481371)
chr2 (648-710)||(2336658-2336720)
chr2 (639-749)||(16542444-16542554)
chr2 (588-681)||(6421794-6421887)
chr2 (596-715)||(6422139-6422258)
chr2 (588-674)||(36178173-36178259)
chr2 (798-827)||(3594356-3594385)
chr2 (627-744)||(5542666-5542783)
chr2 (596-749)||(9231244-9231397)
chr2 (639-749)||(31468803-31468909)
chr2 (660-749)||(31899500-31899589)
chr2 (636-749)||(38796670-38796783)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (589-749)||(25483331-25483491)
chr4 (588-749)||(36629232-36629393)
chr4 (588-690)||(23817681-23817783)
chr4 (627-749)||(28034224-28034346)
chr4 (589-747)||(54017596-54017754)
chr4 (588-749)||(3341123-3341284)
chr4 (588-749)||(36608661-36608822)
chr4 (584-749)||(39792856-39793021)
chr4 (596-749)||(50002421-50002574)
chr4 (627-710)||(15841407-15841490)
chr4 (588-743)||(16889536-16889691)
chr4 (613-746)||(23556891-23557024)
chr4 (661-749)||(3244524-3244612)
chr4 (639-715)||(15841036-15841111)
chr4 (622-749)||(4955351-4955478)
chr4 (627-749)||(52884882-52885005)
chr4 (588-749)||(39404393-39404554)
chr4 (588-749)||(44620655-44620815)
chr4 (670-749)||(11348410-11348489)
chr4 (627-749)||(52884690-52884813)
chr4 (596-687)||(54936253-54936343)
chr4 (588-749)||(22183264-22183425)
chr4 (588-741)||(50459724-50459877)
chr4 (627-744)||(50630794-50630911)
chr4 (627-691)||(760242-760305)
chr4 (588-744)||(55933124-55933280)
chr4 (627-749)||(54108910-54109029)
chr4 (588-690)||(18932749-18932851)
chr4 (627-749)||(22028000-22028122)
chr4 (627-749)||(34646688-34646810)
chr4 (588-690)||(43827494-43827595)
chr4 (639-749)||(54741229-54741339)
chr4 (596-749)||(10245915-10246067)
chr4 (627-723)||(34544127-34544224)
chr4 (588-749)||(36572014-36572175)
chr4 (599-749)||(2740695-2740843)
chr4 (627-744)||(49880160-49880277)
chr4 (589-690)||(51768061-51768162)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (588-749)||(1085618-1085779)
chr7 (596-749)||(7517575-7517728)
chr7 (588-749)||(36622955-36623116)
chr7 (588-742)||(6054562-6054716)
chr7 (627-749)||(7554020-7554142)
chr7 (627-749)||(23418-23540)
chr7 (627-749)||(30245072-30245194)
chr7 (588-742)||(47129097-47129251)
chr7 (586-749)||(34218034-34218197)
chr7 (590-749)||(40230295-40230454)
chr7 (596-749)||(30244265-30244418)
chr7 (639-749)||(37345911-37346023)
chr7 (596-749)||(45433236-45433389)
chr7 (588-749)||(45434631-45434792)
chr7 (588-744)||(37533013-37533168)
chr7 (586-741)||(9901648-9901801)
chr7 (627-749)||(16569191-16569313)
chr7 (627-749)||(16596349-16596471)
chr7 (627-744)||(29157565-29157682)
chr7 (596-749)||(40094784-40094937)
chr7 (627-737)||(11845198-11845308)
chr7 (639-749)||(22566715-22566825)
chr7 (627-749)||(22567080-22567201)
chr7 (588-749)||(8128443-8128604)
chr7 (660-749)||(28301617-28301706)
chr7 (586-674)||(28300253-28300341)
chr7 (630-749)||(118345-118464)
chr7 (627-690)||(30253546-30253609)
chr7 (586-681)||(37167844-37167939)
chr7 (627-749)||(43241490-43241612)
chr7 (682-747)||(10341829-10341894)
[»] chr1 (42 HSPs)
chr1 (596-749)||(1188598-1188751)
chr1 (643-749)||(1187421-1187527)
chr1 (588-749)||(5319967-5320128)
chr1 (596-749)||(41156986-41157139)
chr1 (588-744)||(44290460-44290616)
chr1 (627-749)||(66513-66635)
chr1 (627-749)||(17294572-17294694)
chr1 (588-744)||(41759483-41759639)
chr1 (627-749)||(22077536-22077658)
chr1 (608-749)||(22793273-22793415)
chr1 (627-749)||(26661563-26661685)
chr1 (627-749)||(34364502-34364624)
chr1 (595-749)||(39066209-39066363)
chr1 (596-749)||(24600324-24600477)
chr1 (596-749)||(41157370-41157523)
chr1 (627-703)||(10351201-10351277)
chr1 (586-749)||(3875331-3875494)
chr1 (654-749)||(41184493-41184588)
chr1 (627-749)||(19283496-19283618)
chr1 (627-749)||(34364920-34365042)
chr1 (596-749)||(37556106-37556259)
chr1 (588-744)||(44290826-44290983)
chr1 (588-746)||(41142370-41142529)
chr1 (588-689)||(45493976-45494077)
chr1 (678-749)||(4878798-4878869)
chr1 (627-710)||(5996913-5996995)
chr1 (586-749)||(22077829-22077991)
chr1 (589-744)||(48588491-48588646)
chr1 (599-749)||(29798194-29798344)
chr1 (622-744)||(32594752-32594874)
chr1 (588-742)||(34649440-34649594)
chr1 (648-749)||(24448272-24448373)
chr1 (588-749)||(31767163-31767324)
chr1 (588-749)||(37850602-37850763)
chr1 (596-741)||(50052034-50052178)
chr1 (627-743)||(3550721-3550837)
chr1 (659-719)||(4956216-4956276)
chr1 (627-690)||(26661939-26662002)
chr1 (639-746)||(30630691-30630798)
chr1 (627-690)||(44043813-44043876)
chr1 (627-749)||(40082402-40082523)
chr1 (597-749)||(24131999-24132148)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (627-749)||(6071127-6071249)
chr6 (627-749)||(8481922-8482043)
chr6 (627-749)||(12092523-12092645)
chr6 (596-749)||(10074373-10074526)
chr6 (587-749)||(10073617-10073777)
chr6 (588-744)||(29518503-29518659)
chr6 (588-744)||(29518920-29519076)
chr6 (588-744)||(32741179-32741335)
chr6 (627-749)||(16107673-16107795)
chr6 (588-749)||(2578445-2578605)
chr6 (596-744)||(3409259-3409407)
chr6 (596-739)||(2579502-2579645)
chr6 (596-749)||(2579882-2580035)
chr6 (627-744)||(3058226-3058343)
chr6 (588-749)||(10073993-10074154)
chr6 (588-744)||(2378126-2378282)
chr6 (588-744)||(3409660-3409816)
chr6 (589-741)||(6999799-6999951)
chr6 (632-744)||(35210204-35210316)
chr6 (596-690)||(1127414-1127508)
chr6 (596-742)||(2377756-2377902)
chr6 (588-690)||(2578837-2578939)
chr6 (588-746)||(12071693-12071851)
chr6 (588-690)||(16454629-16454731)
chr6 (627-744)||(26544049-26544166)
chr6 (588-744)||(1846748-1846904)
chr6 (588-738)||(2843560-2843711)
chr6 (588-744)||(14748344-14748496)
chr6 (639-717)||(31714697-31714774)
chr6 (679-749)||(33605649-33605719)
chr6 (627-745)||(593750-593868)
chr6 (627-689)||(3415513-3415575)
chr6 (588-658)||(5832029-5832099)
chr6 (588-681)||(2579111-2579204)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (596-750)||(26074606-26074760)
chr5 (627-749)||(41632777-41632899)
chr5 (596-749)||(26074156-26074309)
chr5 (660-749)||(31509618-31509707)
chr5 (588-748)||(40296317-40296477)
chr5 (596-690)||(26590920-26591014)
chr5 (627-741)||(36522278-36522392)
chr5 (627-744)||(9498695-9498812)
chr5 (590-691)||(33747824-33747925)
chr5 (588-749)||(36492219-36492380)
chr5 (588-744)||(6500823-6500978)
chr5 (627-744)||(623818-623935)
chr5 (588-749)||(15370094-15370255)
chr5 (596-749)||(35150002-35150154)
chr5 (588-744)||(6500451-6500606)
chr5 (588-744)||(27502038-27502194)
chr5 (639-749)||(11417030-11417138)
chr5 (627-749)||(36568608-36568730)
chr5 (588-749)||(1028519-1028680)
chr5 (596-749)||(12662662-12662815)
chr5 (613-749)||(9510547-9510683)
chr5 (590-742)||(18603124-18603276)
chr5 (596-744)||(32487394-32487541)
chr5 (627-687)||(36527136-36527196)
chr5 (627-749)||(13415801-13415923)
chr5 (588-690)||(25327989-25328091)
chr5 (639-749)||(36521949-36522059)
chr5 (628-749)||(299484-299605)
chr5 (660-729)||(31509746-31509815)
chr5 (590-744)||(624196-624350)
chr5 (627-748)||(3295056-3295176)
[»] chr3 (34 HSPs)
chr3 (627-749)||(47964956-47965078)
chr3 (648-749)||(39336291-39336392)
chr3 (587-747)||(15772851-15773011)
chr3 (588-749)||(37990979-37991140)
chr3 (588-749)||(53117977-53118137)
chr3 (627-749)||(47964559-47964681)
chr3 (588-749)||(37990641-37990802)
chr3 (596-749)||(12114572-12114725)
chr3 (596-749)||(53577359-53577512)
chr3 (597-749)||(39914247-39914399)
chr3 (586-749)||(43346791-43346954)
chr3 (596-690)||(39934965-39935059)
chr3 (627-744)||(22304569-22304686)
chr3 (588-749)||(29644904-29645065)
chr3 (639-749)||(25739478-25739588)
chr3 (627-749)||(35946517-35946639)
chr3 (639-749)||(46546378-46546488)
chr3 (596-749)||(9240144-9240297)
chr3 (589-690)||(32462903-32463004)
chr3 (596-749)||(54017826-54017979)
chr3 (627-750)||(29644622-29644745)
chr3 (648-710)||(2417351-2417413)
chr3 (630-744)||(4823655-4823769)
chr3 (627-749)||(8327899-8328021)
chr3 (586-749)||(15773187-15773352)
chr3 (628-690)||(42584864-42584926)
chr3 (596-690)||(54018208-54018302)
chr3 (639-746)||(21832396-21832503)
chr3 (627-690)||(45395694-45395757)
chr3 (656-702)||(2417731-2417777)
chr3 (596-690)||(22303965-22304059)
chr3 (588-690)||(45901768-45901870)
chr3 (627-749)||(49336728-49336850)
chr3 (588-749)||(42342390-42342551)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (627-749)||(5352-5474)
scaffold0078 (627-749)||(4977-5099)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (649-749)||(9620739-9620839)
chr8 (586-749)||(3038290-3038453)
chr8 (627-749)||(4154707-4154829)
chr8 (596-749)||(45122067-45122220)
chr8 (590-749)||(30359604-30359763)
chr8 (607-749)||(33113388-33113530)
chr8 (586-744)||(20870573-20870733)
chr8 (627-749)||(4154322-4154443)
chr8 (596-746)||(45121920-45122070)
chr8 (588-749)||(9309350-9309510)
chr8 (596-744)||(3669687-3669835)
chr8 (588-748)||(34835205-34835365)
chr8 (627-690)||(18372035-18372098)
chr8 (596-674)||(6731965-6732043)
chr8 (591-749)||(9608740-9608898)
chr8 (627-749)||(30359266-30359388)
chr8 (588-690)||(34835529-34835631)
chr8 (588-690)||(34835795-34835897)
chr8 (631-741)||(43274824-43274934)
chr8 (628-749)||(5274770-5274891)
chr8 (588-681)||(5915930-5916023)
chr8 (596-749)||(34834871-34835024)
chr8 (660-749)||(41972153-41972242)
chr8 (596-749)||(45121666-45121818)
chr8 (590-744)||(3670060-3670214)
chr8 (687-749)||(20995502-20995564)
chr8 (596-690)||(30441139-30441233)
chr8 (596-742)||(37544500-37544646)
chr8 (628-742)||(40579548-40579662)
chr8 (584-749)||(40518577-40518742)
chr8 (596-744)||(1013881-1014029)
chr8 (588-749)||(40518064-40518227)
chr8 (667-710)||(34219214-34219257)
chr8 (588-749)||(6876864-6877026)
chr8 (613-663)||(16524446-16524496)
chr8 (588-658)||(41129074-41129144)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (590-749)||(1110-1269)
scaffold0391 (627-690)||(1732-1795)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (628-749)||(5772-5898)
scaffold0734 (627-749)||(5391-5514)
[»] scaffold0702 (1 HSPs)
scaffold0702 (596-742)||(524-670)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (628-749)||(17496-17619)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (666-750)||(39451-39534)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (588-748)||(47356-47516)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 341; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 356
Target Start/End: Original strand, 3593598 - 3593946
Alignment:
Q  8 agaatcattctttgttactggtccagaatgaaagaattatggttgctaatattttattgctactattatgtgggcttgtagttcataatcatcacatgat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3593598 agaatcattctttgttactggtccagaatgaaagaattatggttgctaatattttattgctactattatgtgggcttgtagttcataatcatcacatgat 3593697  T
Q  108 gttttcatttttgtcttagtttcataaattaatacaagtaacagtgtagggtatcttggtccatagtgtttatttctaatgtttgtttttgcttgtcgtt 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3593698 gttttcatttttgttttagtttcataaattaatacaagtaacagtgtagggtatcttggtccatagtgttcatttctaatgtttgtttttgcttgtcgtt 3593797  T
Q  208 acttatattattgctgagctattaaccaacaaaaaatagacctctgtagtactacatgaatttgcaccctagaagatattcttattctcagagtttggtg 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3593798 acttatattattgctgagctattaaccaacaaaaaatagacctctgtagtactacatgaatttgcaccctagaagatattcttattctcagagtttggtg 3593897  T
Q  308 atgtaactggatcacataattcacattcagatcttatttggctaaaatg 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3593898 atgtaactggatcacataattcacattcagatcttatttggctaaaatg 3593946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 473 - 767
Target Start/End: Original strand, 3594065 - 3594360
Alignment:
Q  473 ataagaaaggaacttgtttaacaatggtttgaggttatttacccttcactggttttgaattattggttattctatattggctaagaacttttgtagatat 572  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3594065 ataagaaaggaacttgtttaataatggtttgaggttatttacccttcactggttttgaattattggttattcaatattagctaagaacttttgtagatat 3594164  T
Q  573 tttatagtagacagaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttat 672  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3594165 tttatagtagatggaggaccgttcacatcgaggttagaataaacacactagtatgagagatatcacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttat 3594264  T
Q  673 ggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacac-aaagattttggtttgtcatg 767  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  3594265 ggatcctatcacttataaagtgttcgacctccacttttctattcgttgtgaaacatacaactcacactttcacacaaaagattttggtttatcatg 3594360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 898 - 991
Target Start/End: Original strand, 3594464 - 3594561
Alignment:
Q  898 gtgcaagaggtgaaata-ccataaat--agattatggtcatgactatagaacat-tgagcttataataaagtttaattatttacgtattgaggttttt 991  Q
    ||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3594464 gtgcaagaggtgaaataaccataaaataagattatggtcatgactatagaacatatgagcttataataaagtttaattatttacatattgaggttttt 3594561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 588 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 3673224 - 3673121
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3673224 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatggatcctcttactta 3673125  T
Q  688 taaa 691  Q
    ||||    
T  3673124 taaa 3673121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 30313294 - 30313173
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  30313294 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttat-aagtgttcaacctccacttttctatccgatgtgagac 30313196  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||    
T  30313195 atataacacacgcttgcacacaa 30313173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 639 - 749
Target Start/End: Original strand, 33561504 - 33561614
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||||    
T  33561504 actcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaacatataactcaca 33561603  T
Q  739 cttgcacacaa 749  Q
    |||||||||||    
T  33561604 cttgcacacaa 33561614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 586 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 33731806 - 33731653
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcact 685  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| || | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||||||||||||| |||    
T  33731806 gaggaccgtttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttact 33731707  T
Q  686 tataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacac 739  Q
    |||||  || || ||||  ||| || |||||| ||||| | ||| |||||||||    
T  33731706 tataaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 589 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 962753 - 962593
Alignment:
Q  589 gaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttat 688  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||  || | ||| |||| || |||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  962753 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttat 962654  T
Q  689 aaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||  ||||| ||||  |||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  962653 aaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcatacaa 962593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 28254278 - 28254400
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||  |||||| |||||| ||||  ||    
T  28254278 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgggac 28254377  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| || ||||||| ||||||||    
T  28254378 atataagtcacactggcacacaa 28254400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 42514805 - 42514644
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||| |||||    
T  42514805 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggtcctcttactta 42514706  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| ||||  |||||| |||| | |||   ||||| |||||||||||||| ||||    
T  42514705 taaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttgcatacaa 42514644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 596 - 744
Target Start/End: Original strand, 36178615 - 36178763
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  36178615 cacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 36178714  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  36178715 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36178763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 586 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 15880421 - 15880258
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcact 685  Q
    ||||| ||| |||||||||| || || |||| ||  || | ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||    
T  15880421 gaggaacgtccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 15880322  T
Q  686 tataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||  ||||| ||||  ||| || |||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  15880321 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaa 15880258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Original strand, 15511505 - 15511656
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||  ||||| |||||||  || | ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  15511505 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataacgtgt 15511604  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||||||||  ||||| ||||  |||||||||||||    
T  15511605 tcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataact--cacttgcacacaa 15511656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 28531355 - 28531477
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||  ||||| ||||   ||||| |||||| ||||  ||    
T  28531355 gagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttacttataaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggac 28531454  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  28531455 atataactcacacttgcacacaa 28531477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 639 - 749
Target Start/End: Original strand, 29873590 - 29873700
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||  ||||  ||| |||     
T  29873590 actcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatgtaacacacc 29873689  T
Q  739 cttgcacacaa 749  Q
    |||||||||||    
T  29873690 cttgcacacaa 29873700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 591 - 749
Target Start/End: Original strand, 37632602 - 37632760
Alignment:
Q  591 ccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    |||| |||||||||| ||||| || |||| | ||| |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||  ||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  37632602 ccgtccacatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataa 37632701  T
Q  691 aatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||   ||||  ||| || |||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  37632702 aatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaa 37632760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 628 - 744
Target Start/End: Original strand, 5543040 - 5543156
Alignment:
Q  628 agagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaaca 727  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||| | ||||  |||    
T  5543040 agagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggaca 5543139  T
Q  728 tacaactcacacttgca 744  Q
    || ||||||||||||||    
T  5543140 tataactcacacttgca 5543156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 744
Target Start/End: Original strand, 14745677 - 14745825
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| | | | ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  14745677 cacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 14745776  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    || ||||  ||| || |||||  ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14745777 tcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 14745825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 625 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 30323583 - 30323459
Alignment:
Q  625 atgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaa 724  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||| | | ||      
T  30323583 atgagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttggg 30323484  T
Q  725 acatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||    
T  30323483 acatataacacacacttgcacacaa 30323459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 37106080 - 37105924
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||  |  || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| || |||||    
T  37106080 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttactta 37105981  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || ||| || ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37105980 taaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 37105924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 586 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 37106346 - 37106188
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcact 685  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || | ||  || | |||| |||||| |||||||| ||||| ||||| | |||| |||||||| |||||| |||    
T  37106346 gaggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttact 37106247  T
Q  686 tataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37106246 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 37106188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 749
Target Start/End: Original strand, 41678421 - 41678532
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac--atacaactca 736  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| |||| | ||||| ||  ||| ||||||    
T  41678421 actcttactcaaaaccttaaggcaaag-gtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagacatatataactca 41678519  T
Q  737 cacttgcacacaa 749  Q
    |||||||||||||    
T  41678520 cacttgcacacaa 41678532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 749
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679792
Alignment:
Q  589 gaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttat 688  Q
    |||||| |||||||||  ||||| |||| ||  |||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| | |||| ||||||    
T  40679632 gaccgtccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttat 40679731  T
Q  689 aaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||  ||||| |||   |||||| |||||| | ||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  40679732 aaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgcacacaa 40679792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 6713133 - 6712978
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatc-ttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactt 686  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || | ||| || | |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||  |||||||| |||||| ||||    
T  6713133 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttactt 6713034  T
Q  687 ataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttg 742  Q
    ||||  ||||| || |  ||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  6713033 ataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 6712978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 7598384 - 7598225
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||| ||  |||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| |||||| | |||    
T  7598384 ggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttattta 7598285  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacac 747  Q
    |||  ||||  ||||  |||||| ||| || |||  |||||| || ||||||||||||||    
T  7598284 taaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttgcacac 7598225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 6421541 - 6421387
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||| |||||||  |||||| |||||    
T  6421541 ggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctcttactta 6421442  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttg 742  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  6421441 taaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 6421387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 748
Target Start/End: Original strand, 29874067 - 29874185
Alignment:
Q  630 agacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacata 729  Q
    |||| ||| |||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||  |||||    
T  29874067 agacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacata 29874166  T
Q  730 caactcacacttgcacaca 748  Q
     ||| |||||||| |||||    
T  29874167 taacacacacttgtacaca 29874185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 749
Target Start/End: Original strand, 33953824 - 33953934
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||| |||||| |||| ||||   |||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| | ||||  || || ||||||||    
T  33953824 actcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactcaca 33953923  T
Q  739 cttgcacacaa 749  Q
     ||||||||||    
T  33953924 tttgcacacaa 33953934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 750
Target Start/End: Original strand, 35580726 - 35580887
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  |  | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35580726 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg-tcctctcactta 35580824  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaaa 750  Q
    |||  ||||| || |  | | || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35580825 taaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaaa 35580887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 1770050 - 1769889
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcact 685  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| ||||||| |||||   | ||||| ||| |||||||  |||||| |||    
T  1770050 gaggatcgttcacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatgagtcctcttact 1769951  T
Q  686 tataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacac 747  Q
    |||||  ||||| || |  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  1769950 tataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacac 1769889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Original strand, 41283477 - 41283633
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||  |  | ||||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  41283477 ggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactta 41283576  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| | ||  ||||| ||||||||||||||    
T  41283577 taaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttgca 41283633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 590 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 3672855 - 3672768
Alignment:
Q  590 accgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatc 677  Q
    ||||| |||||||||  ||||| |||||||  | || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  3672855 accgtccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatagatc 3672768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 639 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 34481371 - 34481268
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||   ||||| ||| || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||| | ||| |||||| |    
T  34481371 actcttacccaaaaccttaaagcaataaatttatagattctatcatttataaaatattcaacctccacttttatatccgacgtgagaaatataactcata 34481272  T
Q  739 cttg 742  Q
    ||||    
T  34481271 cttg 34481268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 648 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 2336720 - 2336658
Alignment:
Q  648 caaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccactttt 710  Q
    ||||||||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  2336720 caaaatcttaaggcattgaatttatgggtcctctcacttataaagtgttcaacctccactttt 2336658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 16542554 - 16542444
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||   |||||| | ||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  || || ||||||||    
T  16542554 actcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactcaca 16542455  T
Q  739 cttgcacacaa 749  Q
    |||||||||||    
T  16542454 cttgcacacaa 16542444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 6421887 - 6421794
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctct 681  Q
    ||||||| ||||||||||  |||| |||||||  |||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  6421887 ggaccgtccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctct 6421794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 715
Target Start/End: Complemental strand, 6422258 - 6422139
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  || | ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| || ||| |||||||| |||||| | ||||||  |||    
T  6422258 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaattataatgtgt 6422159  T
Q  696 tcgacctccacttttatatc 715  Q
    || ||||  |||||| ||||    
T  6422158 tcaacctttacttttttatc 6422139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 674
Target Start/End: Original strand, 36178173 - 36178259
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatgg 674  Q
    |||||||  ||||||||| || || |||||||  || | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  36178173 ggaccgtctacatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgg 36178259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 798 - 827
Target Start/End: Original strand, 3594356 - 3594385
Alignment:
Q  798 tcatgagatccacctcagattaggtctcaa 827  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3594356 tcatgagatccacctcagattaggtctcaa 3594385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 744
Target Start/End: Original strand, 5542666 - 5542783
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || ||| || | ||  ||    
T  5542666 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggac 5542765  T
Q  727 atacaactcacacttgca 744  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  5542766 atataactcacacttgca 5542783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 9231397 - 9231244
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||  |||||| || | |||||||  |||||  |||| ||  || ||| ||||||||||| | |||||| ||||    
T  9231397 cacatcaaggttagaataaccgcataagttagagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatttataatatgt 9231298  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  |||||| |||| | | ||| ||||| |||||| |||| |||||||    
T  9231297 tcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactcatacttacacacaa 9231244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 749
Target Start/End: Original strand, 31468803 - 31468909
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    ||||| || ||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  31468803 actcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctct----tataagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 31468898  T
Q  739 cttgcacacaa 749  Q
    |||||||||||    
T  31468899 cttgcacacaa 31468909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 660 - 749
Target Start/End: Original strand, 31899500 - 31899589
Alignment:
Q  660 gcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||| || |  ||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  31899500 gcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactttcacacaa 31899589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 636 - 749
Target Start/End: Original strand, 38796670 - 38796783
Alignment:
Q  636 catactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactc 735  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  | | || |||| | ||||  ||||| |||||    
T  38796670 catactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactc 38796769  T
Q  736 acacttgcacacaa 749  Q
    ||||||||||||||    
T  38796770 acacttgcacacaa 38796783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 73; Significance: 8e-33; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 589 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 25483491 - 25483331
Alignment:
Q  589 gaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttat 688  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25483491 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttat 25483392  T
Q  689 aaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || |||||| ||||  ||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  25483391 aagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 25483331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 36629393 - 36629232
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  36629393 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactta 36629294  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||  || |  |||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  36629293 taaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgaacacaa 36629232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 588 - 690
Target Start/End: Original strand, 23817681 - 23817783
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  23817681 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttactta 23817780  T
Q  688 taa 690  Q
    |||    
T  23817781 taa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 28034346 - 28034224
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||| |||||||||||  |||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| || |  ||    
T  28034346 gagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcgggac 28034247  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| || ||||||||||||||||    
T  28034246 atataattcacacttgcacacaa 28034224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 589 - 747
Target Start/End: Original strand, 54017596 - 54017754
Alignment:
Q  589 gaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttat 688  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||| || | |||||||| || ||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  54017596 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat 54017695  T
Q  689 aaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacac 747  Q
    || |||||| ||||  ||| || |||| |  |||  ||||| |||||||||||||||||    
T  54017696 aagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttgcacac 54017754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 3341284 - 3341123
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||||||||| | || || ||||| || |||||||| |||||||||||| |||||   |||||| |||||| |||||    
T  3341284 ggaccgtctacatcgaggttaaaataaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttactta 3341185  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||| ||||  ||||  ||| || |||||  ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  3341184 taaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 3341123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 36608661 - 36608822
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||  |||||||||||||| |||||    
T  36608661 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatggatcctcttactta 36608760  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    | |  ||||| || |  ||| || |||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  36608761 tgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgcacacaa 36608822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 584 - 749
Target Start/End: Original strand, 39792856 - 39793021
Alignment:
Q  584 cagaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctca 683  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| || ||||||      
T  39792856 cagaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctcttt 39792955  T
Q  684 cttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||||  ||||| || |  |||||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  39792956 cttataaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaa 39793021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 50002574 - 50002421
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||  ||||||| |||||| ||||| ||| |||    
T  50002574 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttacttaaaaagtgt 50002475  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  50002474 tcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaacaa 50002421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 627 - 710
Target Start/End: Original strand, 15841407 - 15841490
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccactttt 710  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  15841407 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacctccactttt 15841490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 588 - 743
Target Start/End: Original strand, 16889536 - 16889691
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||  || | |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |  ||||||| ||||||| |||||    
T  16889536 ggaccgtccacatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttactta 16889635  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgc 743  Q
    |||  | ||| ||||  |||||| |||||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  16889636 taaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactcacacttgc 16889691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 613 - 746
Target Start/End: Original strand, 23556891 - 23557024
Alignment:
Q  613 aaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttat 712  Q
    |||||||  |||| |||||||  || |||||||  |||||  |||| ||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||| |    
T  23556891 aaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttct 23556990  T
Q  713 atccgttgtgaaacatacaactcacacttgcaca 746  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  23556991 atccgatgtaaaacatttaactcacacttgcaca 23557024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 661 - 749
Target Start/End: Original strand, 3244524 - 3244612
Alignment:
Q  661 caatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3244524 caatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 3244612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 639 - 715
Target Start/End: Original strand, 15841036 - 15841111
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatc 715  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  15841036 actcttacccaaaa-cttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatc 15841111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 622 - 749
Target Start/End: Original strand, 4955351 - 4955478
Alignment:
Q  622 agtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgt 721  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| | |    
T  4955351 agtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaaccttaactattttatccgatat 4955450  T
Q  722 gaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  4955451 gagacatataactcacacttgcacacaa 4955478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 52885005 - 52884882
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactc-aaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaa 725  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  |    
T  52885005 gagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 52884906  T
Q  726 catacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  52884905 catataactcacacttgcacacaa 52884882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 39404554 - 39404393
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||  || | ||||||||||| | |||| | ||||| ||||| || ||  |||||||| |||||| |||||    
T  39404554 ggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttactta 39404455  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  39404454 taaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaa 39404393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 44620815 - 44620655
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| || || |||| ||  || | |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| |  ||| |||||||| |||||| |||||    
T  44620815 ggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttatg-gtttatgggtcctcttactta 44620717  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||| ||||| ||||| ||| ||  ||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  44620716 taaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 44620655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 670 - 749
Target Start/End: Original strand, 11348410 - 11348489
Alignment:
Q  670 tatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| | |||  |||||| |||||||| ||||||||||    
T  11348410 tatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcacaattgcacacaa 11348489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 52884813 - 52884690
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactc-aaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaa 725  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||| ||||| |||||| |||||| |||| ||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  |    
T  52884813 gagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 52884714  T
Q  726 catacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  52884713 catataactcacacttgcacacaa 52884690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 54936343 - 54936253
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  54936343 cacatcgaggctagaacaaccacat-agtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 54936253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 22183264 - 22183425
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||  |  |||  ||||||| ||| |||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| | |||||    
T  22183264 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttactta 22183363  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||| ||||| || |  ||| || |||||| ||||  | ||| |||||||||||||||||||    
T  22183364 taaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgcacacaa 22183425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 50459877 - 50459724
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  || | |||||||||||  |||||||  |||| |||||   |||| |||||||  |||||| |||||    
T  50459877 ggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttactta 50459778  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacactt 741  Q
    ||| |||||| ||||  ||| || || ||| |||| |||||| |||||||||||    
T  50459777 taagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 627 - 744
Target Start/End: Original strand, 50630794 - 50630911
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| |||   ||    
T  50630794 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggac 50630893  T
Q  727 atacaactcacacttgca 744  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  50630894 atataactcacgcttgca 50630911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 627 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 760305 - 760242
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaa 691  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  760305 gagagacaccacacttttac-caaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaa 760242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Original strand, 55933124 - 55933280
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||   |  |||| ||||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  55933124 ggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 55933223  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||| |||   ||| || |||||| |||   ||||| ||||||||||||||    
T  55933224 taaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 55933280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 54109029 - 54108910
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||    
T  54109029 gagagacaccacactcttacccaaaa-cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 54108931  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||  |||| ||||||||||||||    
T  54108930 at--aactgacacttgcacacaa 54108910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 690
Target Start/End: Original strand, 18932749 - 18932851
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| || || ||||||   |||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||| |||||| | |||    
T  18932749 ggaccgtacacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttattta 18932848  T
Q  688 taa 690  Q
    |||    
T  18932849 taa 18932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 22028000 - 22028122
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||    | || |||||| ||||  ||    
T  22028000 gagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggac 22028099  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| || ||||||||||||||||    
T  22028100 atataagtcacacttgcacacaa 22028122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 34646688 - 34646810
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |||||| | ||||||  ||||| || |  ||| || |||||| ||||  ||    
T  34646688 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggac 34646787  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  34646788 atataactcacacttgtacacaa 34646810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 43827595 - 43827494
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||  |||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||||| ||||||  ||||||| |||||| | |||    
T  43827595 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactctta-tccaaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttattta 43827497  T
Q  688 taa 690  Q
    |||    
T  43827496 taa 43827494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 749
Target Start/End: Original strand, 54741229 - 54741339
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||  ||||| |||||  |||| ||| ||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||| |||||| ||||| ||||| || |||||    
T  54741229 actcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataattcaca 54741328  T
Q  739 cttgcacacaa 749  Q
    |||||||||||    
T  54741329 cttgcacacaa 54741339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 10246067 - 10245915
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |  || | | ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  || |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  10246067 cacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttatgg-tcctcttacttataaggtgt 10245969  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  10245968 tcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgcacacaa 10245915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 34544224 - 34544127
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatc-ttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtga 723  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||| || || |||||||||||| ||| || |||||    
T  34544224 gagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacctccacttttctattcgatgtga 34544127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 36572175 - 36572014
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||| ||  ||   ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||  ||||||| || ||| |||||    
T  36572175 ggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttactta 36572076  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| || |  ||| || ||| || ||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  36572075 taaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaa 36572014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 599 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 2740843 - 2740695
Alignment:
Q  599 atcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcg 698  Q
    ||||||| ||||| |||||||  |||  ||||||| ||| ||||||||  |||| ||||| ||  || |||||| | |||||| ||||||||  |||||     
T  2740843 atcgaggctagaacaaccaca--agtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttataggtcctcttacttataaggtgttca 2740746  T
Q  699 acctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  2740745 acctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 2740695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 49880277 - 49880160
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || ||| |  ||||  ||    
T  49880277 gagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtgggac 49880178  T
Q  727 atacaactcacacttgca 744  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  49880177 atataactcacacttgca 49880160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 589 - 690
Target Start/End: Original strand, 51768061 - 51768162
Alignment:
Q  589 gaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttat 688  Q
    |||||| |||||||||||||||| || | ||| |||| |||||||| | |||| |||| ||||| |||||  ||||| |||||||  |||||| | ||||    
T  51768061 gaccgtccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttat 51768160  T
Q  689 aa 690  Q
    ||    
T  51768161 aa 51768162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 1085618 - 1085779
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  1085618 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 1085717  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||| ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  1085718 taaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 1085779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 7517728 - 7517575
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  |||  || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  7517728 cacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 7517629  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  7517628 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 7517575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 36623116 - 36622955
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||| |||| |||| || ||||  |||| ||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||||||  |||||    
T  36623116 ggaccgtccacatcaaggtcagaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctactta 36623017  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||||||  ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  36623016 taaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 36622955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 588 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 6054716 - 6054562
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| ||||| |  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6054716 ggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttactta 6054617  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttg 742  Q
    |||  ||||| || |  ||| || |||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  6054616 taaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttg 6054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 7554142 - 7554020
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||    
T  7554142 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 7554043  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  7554042 atataactcacacttgcacacaa 7554020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 23418 - 23540
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| |||| |||    
T  23418 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaac 23517  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||| ||||||||||    
T  23518 atataactcacaattgcacacaa 23540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 30245194 - 30245072
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| |||| |||    
T  30245194 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaac 30245095  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  30245094 atataactcacacttgtacacaa 30245072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 588 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 47129251 - 47129097
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||||  |||| |||| ||||| ||||||| | ||  ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||| |||||| |||||    
T  47129251 ggaccgtctacattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttatgggtcctcttactta 47129152  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttg 742  Q
    ||| | |||| ||||  ||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  47129151 taagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 47129097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 749
Target Start/End: Original strand, 34218034 - 34218197
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcact 685  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| |  ||   ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||  ||||||||||    
T  34218034 gaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcact 34218133  T
Q  686 tataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||  ||||| || |  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  34218134 tataaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaa 34218197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 590 - 749
Target Start/End: Original strand, 40230295 - 40230454
Alignment:
Q  590 accgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttata 689  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| | | | ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  | ||| |||||||| |||||| |||||||    
T  40230295 accgtccacatagaggttagaataactacacttgcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttata 40230394  T
Q  690 aaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    | |||||| || |  |||||| ||| || ||||  ||||| |||| ||||||||||||||    
T  40230395 agatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggacatataacttacacttgcacacaa 40230454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 30244418 - 30244265
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| | ||| |||||||  |||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||  | |    
T  30244418 cacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtct 30244319  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  30244318 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaa 30244265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 639 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 37346023 - 37345911
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccg--ttgtgaaacatacaactca 736  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |   | ||| | ||| ||||||    
T  37346023 actcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttctatcagatatatgacatatataactca 37345924  T
Q  737 cacttgcacacaa 749  Q
    |||||||||||||    
T  37345923 cacttgcacacaa 37345911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 45433389 - 45433236
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||  | |||| ||||||||  |||    
T  45433389 cacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctcttacttataaggtgt 45433290  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||| |||| | |||| |||||||||||| ||||||    
T  45433289 tcaacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttgtacacaa 45433236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 45434792 - 45434631
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||  |||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||    
T  45434792 ggaccgatcacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttactta 45434693  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| ||||  |||||| |||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||||    
T  45434692 taaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaa 45434631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Original strand, 37533013 - 37533168
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || | ||  || | ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  37533013 ggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactta 37533111  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||  ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  37533112 taaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 37533168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 9901801 - 9901648
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcact 685  Q
    |||||| || |||| ||||| ||||| |||| || ||| | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||     
T  9901801 gaggacagtccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctct-acg 9901703  T
Q  686 tataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacactt 741  Q
    ||||| |||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  9901702 tataagatgttcaacctttactgttttatccgatgtg-gacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 16569313 - 16569191
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||  ||| || |||||| ||||| ||    
T  16569313 gagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgagac 16569214  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  16569213 atataactcacacttgcatacaa 16569191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 16596349 - 16596471
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||  ||| || |||||| ||||| ||    
T  16596349 gagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtgagac 16596448  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  16596449 atataactcacacttgcatacaa 16596471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 627 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 29157682 - 29157565
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||| || ||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||    
T  29157682 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggac 29157583  T
Q  727 atacaactcacacttgca 744  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  29157582 atataactcacacttgca 29157565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Original strand, 40094784 - 40094937
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||  | ||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  40094784 cacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 40094883  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |  ||||  ||| || ||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40094884 tgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 40094937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 11845308 - 11845198
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| |||| |||    
T  11845308 gagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaac 11845209  T
Q  727 atacaactcac 737  Q
    ||| |||||||    
T  11845208 atataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 749
Target Start/End: Original strand, 22566715 - 22566825
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  |||||  |||||||    
T  22566715 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatattactcaca 22566814  T
Q  739 cttgcacacaa 749  Q
    |||||| ||||    
T  22566815 cttgcatacaa 22566825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 22567080 - 22567201
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||    
T  22567080 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtg-gac 22567178  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||||||||||| ||||    
T  22567179 atattactcacacttgcatacaa 22567201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 8128443 - 8128604
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||| ||||||||||| | ||||| |||||||| ||   ||| ||||||| |||||||  ||||| ||||| |  ||| |||||||| |||||| || ||    
T  8128443 ggactgttcacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttacata 8128542  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| ||||  | |||| |||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  8128543 taaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaa 8128604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 660 - 749
Target Start/End: Original strand, 28301617 - 28301706
Alignment:
Q  660 gcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||||  | |  |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  28301617 gcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 28301706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 586 - 674
Target Start/End: Original strand, 28300253 - 28300341
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatgg 674  Q
    ||||||||| ||||||||||   ||| ||||||| | | | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28300253 gaggaccgtccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgg 28300341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 630 - 749
Target Start/End: Original strand, 118345 - 118464
Alignment:
Q  630 agacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacata 729  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| ||||  | |||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||  |||||| |||| | ||||  |||||    
T  118345 agacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctcttacttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacata 118444  T
Q  730 caactcacacttgcacacaa 749  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  118445 taacttacacttgcacacaa 118464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 30253609 - 30253546
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| | |||| ||||||||    
T  30253609 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataa 30253546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 37167939 - 37167844
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctct 681  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| |||||  ||||  |||||  ||||||||||||||    
T  37167939 gaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctct 37167844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 43241612 - 43241490
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||| |||||  ||||  |||||||  |||| | ||||||||  ||||| ||||  | |||| |||||| |||| |||    
T  43241612 gagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtggaac 43241513  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  43241512 atataactcacacttgcacacaa 43241490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 682 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 10341894 - 10341829
Alignment:
Q  682 cacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacac 747  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||| | | ||||||||    
T  10341894 cacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataacttatatttgcacac 10341829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 42)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Original strand, 1188598 - 1188751
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||| |||| |||  |||||||| |||  ||||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| |    
T  1188598 cacatctaggtcagagcaaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcacttataaaatat 1188697  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || |||||||||||| |||||| | || |||||| |||||||||||||||||||    
T  1188698 tcaacctccacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgcacacaa 1188751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 643 - 749
Target Start/End: Original strand, 1187421 - 1187527
Alignment:
Q  643 ttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttg 742  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||    
T  1187421 ttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgagacatataattcacacttg 1187520  T
Q  743 cacacaa 749  Q
    |||||||    
T  1187521 cacacaa 1187527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 5319967 - 5320128
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||||  |||| |||| ||||| |||||||| || | ||||||||| | |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||||||||    
T  5319967 ggaccgtctacattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcactta 5320066  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| || |  |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  5320067 taaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgcatacaa 5320128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 41157139 - 41156986
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  || |  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  41157139 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 41157040  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  41157039 tcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttgcacacaa 41156986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Original strand, 44290460 - 44290616
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||  |  || | || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  44290460 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 44290559  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    ||| |||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44290560 taagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 44290616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 66513 - 66635
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||| |||||| | || |||    
T  66513 gagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaac 66612  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  66613 atataactcacacttgcacacaa 66635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 17294694 - 17294572
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||    
T  17294694 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 17294595  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  17294594 atataactcacacttgtacacaa 17294572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 41759639 - 41759483
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  41759639 ggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttactta 41759540  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||| || |  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  41759539 taaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 41759483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 22077536 - 22077658
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || | | |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||| |||||| ||||| ||    
T  22077536 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagac 22077635  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  22077636 atataactcacacttgcacacaa 22077658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 608 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 22793415 - 22793273
Alignment:
Q  608 agaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaa-tgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccac 706  Q
    |||| |||||||  |||| |||||||  || |||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||    
T  22793415 agaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataaagttttcaacctctac 22793316  T
Q  707 ttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||| ||| || ||||  ||||| ||||||||||||| |||||    
T  22793315 ttttctatacgatgtgggacatataactcacacttgctcacaa 22793273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 26661563 - 26661685
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||  ||| || || ||| ||||  ||    
T  26661563 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggac 26661662  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  26661663 atataactcacacttgtacacaa 26661685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 34364624 - 34364502
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||| ||    
T  34364624 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagac 34364525  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  34364524 atataactcacacttgcacacaa 34364502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 595 - 749
Target Start/End: Original strand, 39066209 - 39066363
Alignment:
Q  595 tcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatg 694  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||  ||||| |||||  |||||  ||||||| || ||| | ||||||  ||    
T  39066209 tcacatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagttataaggtg 39066308  T
Q  695 ttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| ||||  |||||| |||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  39066309 ttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgcacacaa 39066363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Original strand, 24600324 - 24600477
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | |||   ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||  | |||| |||||||| ||||    
T  24600324 cacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataatatgt 24600423  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  |||||| |||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  24600424 tcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaa 24600477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 41157523 - 41157370
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  || | || |||||||| |||||||||||||| || || |||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  41157523 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 41157424  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || || |  ||| || |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  41157423 tcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 41157370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 627 - 703
Target Start/End: Complemental strand, 10351277 - 10351201
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctc 703  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  10351277 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctc 10351201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 749
Target Start/End: Original strand, 3875331 - 3875494
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcact 685  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||| ||| | ||||||  |||| ||||| |||||| |||||||  |||||| |||    
T  3875331 gaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 3875430  T
Q  686 tataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||  ||| | ||||  |||||| |||||| ||||  ||||| |||| || |||||||||||    
T  3875431 tataaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgcacacaa 3875494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 654 - 749
Target Start/End: Original strand, 41184493 - 41184588
Alignment:
Q  654 cttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||  ||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  41184493 cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 41184588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 19283496 - 19283618
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||||| ||||| || ||| |||||||  |||||||| ||| ||| || || |||||||||||| |||||| ||||  ||    
T  19283496 gagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgatgagtttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggac 19283595  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  19283596 atataactcacacttgcacacaa 19283618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 34365042 - 34364920
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  | | || |||||| ||||  ||    
T  34365042 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgac 34364943  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  34364942 atataactcacacttgcacacaa 34364920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 37556259 - 37556106
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| | ||| |||||||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  37556259 cacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgg-tcctcttacttataagatgt 37556161  T
Q  696 tcgacctccact-tttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| ||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  37556160 tcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaa 37556106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Original strand, 44290826 - 44290983
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactctt-actcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactt 686  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || | |||| |||||| |||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||    
T  44290826 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 44290925  T
Q  687 ataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    ||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  44290926 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 44290983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 41142529 - 41142370
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactctt-actcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactt 686  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  || | ||||||| ||| |||||| ||  |||| ||||| |||||| |||||||| |||| | ||||    
T  41142529 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttactt 41142430  T
Q  687 ataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcaca 746  Q
    ||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  41142429 ataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaca 41142370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 689
Target Start/End: Original strand, 45493976 - 45494077
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| |||||||| || | ||||||||||| |||||||  |||||  |||| |||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  45493976 ggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatcttactta 45494075  T
Q  688 ta 689  Q
    ||    
T  45494076 ta 45494077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 678 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 4878869 - 4878798
Alignment:
Q  678 ctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| || |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  4878869 ctctcacttataaaatgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgcacacaa 4878798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 710
Target Start/End: Original strand, 5996913 - 5996995
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccactttt 710  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||  | |||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||    
T  5996913 gagagacaccacactctcactcaaaaccttaaa-caatggatatatggatcctctcatttataaaatgttcaagcaccactttt 5996995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 749
Target Start/End: Original strand, 22077829 - 22077991
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcact 685  Q
    ||||||||| |||||||| | | ||| |||| ||| |||   |||||| ||| |||||||| | ||| ||||  || ||| |||||||| |||||| |||    
T  22077829 gaggaccgtccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaaccttag-gctatgagtttatgggtcctcttact 22077927  T
Q  686 tataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||||| |||||| ||||  | |||| |||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22077928 tataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacacttgcacacaa 22077991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 744
Target Start/End: Original strand, 48588491 - 48588646
Alignment:
Q  589 gaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttat 688  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||| ||  |||| ||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||  |||| || || ||| ||||||    
T  48588491 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttat 48588590  T
Q  689 aaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    ||  ||||| ||||  ||| || |||||| |||   ||||| ||||||||||||||    
T  48588591 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttgca 48588646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 29798344 - 29798194
Alignment:
Q  599 atcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcg 698  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | | ||||||||||| |||||||  ||| | ||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||  |||||     
T  29798344 atcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttca 29798245  T
Q  699 acctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||||  ||| || |||||  |||   ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29798244 acctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttgcatacaa 29798194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 622 - 744
Target Start/End: Original strand, 32594752 - 32594874
Alignment:
Q  622 agtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgt 721  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||| | |||    
T  32594752 agtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgt 32594851  T
Q  722 gaaacatacaactcacacttgca 744  Q
       ||||| ||||||||||||||    
T  32594852 aggacatataactcacacttgca 32594874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 34649594 - 34649440
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| | ||||||| ||  |||||||| ||||| ||||| ||| |  |||||||| | ||  ||||||    
T  34649594 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcactta 34649495  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttg 742  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  34649494 taaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34649440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 648 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 24448373 - 24448272
Alignment:
Q  648 caaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacac 747  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |  | |||  |||||| |||| ||||||||||||    
T  24448373 caaaatcttaagacaatgagtttatgagccctctcacttataaaatgttcaacttccacttttctttgagatgtctaacatataacttacacttgcacac 24448274  T
Q  748 aa 749  Q
    ||    
T  24448273 aa 24448272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 31767163 - 31767324
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| |||||||  || | || ||||  || |||||||| ||||| ||||| ||| |  ||| |||| |||||| |||||    
T  31767163 ggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctcttactta 31767262  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  31767263 taaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgcacacaa 31767324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 37850602 - 37850763
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  |||| ||  |||  ||||||||||| |||||||  | ||| |||||| || |  |||||||| | |||| |||||    
T  37850602 ggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttatgggttctcttactta 37850701  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| ||||| ||| || ||| || ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  37850702 taaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 37850763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 741
Target Start/End: Original strand, 50052034 - 50052178
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| |  | ||||||||||| |||||||| |||||  ||||   |||  |||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  50052034 cacatcgaggttagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatgggtcctcttacttataagatgt 50052132  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacactt 741  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||    
T  50052133 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 50052178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 627 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 3550837 - 3550721
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  |||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||| | ||||  ||    
T  3550837 gagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggac 3550738  T
Q  727 atacaactcacacttgc 743  Q
    ||| |||||||||||||    
T  3550737 atataactcacacttgc 3550721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 659 - 719
Target Start/End: Complemental strand, 4956276 - 4956216
Alignment:
Q  659 agcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgtt 719  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||  |||||| ||||||||    
T  4956276 agcaatgagtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatccgtt 4956216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 690
Target Start/End: Original strand, 26661939 - 26662002
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||    
T  26661939 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataa 26662002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 746
Target Start/End: Original strand, 30630691 - 30630798
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||   ||||  | |||| |||||| ||||| ||||| || |||||    
T  30630691 actcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgtcaaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcaca 30630790  T
Q  739 cttgcaca 746  Q
    ||||||||    
T  30630791 cttgcaca 30630798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 690
Target Start/End: Original strand, 44043813 - 44043876
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| || ||| ||||||||    
T  44043813 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataa 44043876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 40082523 - 40082402
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| |||   ||    
T  40082523 gagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatg-atcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtaggac 40082425  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  40082424 atataactcacacttgcgcacaa 40082402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 597 - 749
Target Start/End: Original strand, 24131999 - 24132148
Alignment:
Q  597 acatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgtt 696  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||  ||| ||||  ||||| |||||| |||||||||||| || | ||||||  ||||    
T  24131999 acatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaac-cttaaggcaatgagtttatggatccccttatttataaggtgtt 24132095  T
Q  697 cgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    | ||||  |||||| |||||| || |  ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  24132096 caacctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgcatacaa 24132148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 6071249 - 6071127
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |  ||||  ||    
T  6071249 gagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttctattcaatgtgggac 6071150  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  6071149 atataactcacacttgcacacaa 6071127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 8482043 - 8481922
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  || ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||    
T  8482043 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgtg-gac 8481945  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  8481944 atataactcacacttgcacacaa 8481922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 12092523 - 12092645
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||||  ||    
T  12092523 gagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggac 12092622  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||  ||| ||| |||||||||||    
T  12092623 atctaacacacccttgcacacaa 12092645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Original strand, 10074373 - 10074526
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  10074373 cacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 10074472  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  |||||| |||||| ||||  || |  |||||||||||||||||||    
T  10074473 tcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttgcacacaa 10074526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 587 - 749
Target Start/End: Original strand, 10073617 - 10073777
Alignment:
Q  587 aggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactt 686  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10073617 aggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatggatcctcttactt 10073716  T
Q  687 ataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||||  ||||| ||||  |||||  | |||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||    
T  10073717 ataaggtgttcaacctttacttt--tctccgatgtgggacatataactaacacttgcacacaa 10073777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 29518659 - 29518503
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||| |||||||| |||||| |||||    
T  29518659 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttactta 29518560  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29518559 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 29518503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 29519076 - 29518920
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||| |||||||| |||||| |||||    
T  29519076 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttactta 29518977  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  29518976 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 29518920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 32741335 - 32741179
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||| |||||||| |||||| |||||    
T  32741335 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttactta 32741236  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32741235 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 32741179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 16107795 - 16107673
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||  ||||  ||||  |||||| |||||| ||||| ||    
T  16107795 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtttaacctttacttttttatccgatgtgacac 16107696  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  16107695 atataactcacacttgtacacaa 16107673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 2578445 - 2578605
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || |  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| |||||| |||||    
T  2578445 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttactta 2578544  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||| ||||| ||||  ||| || ||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  2578545 taaagtgttcaacctttactcttttatccgt-gtgggacatataactcacacttgtacacaa 2578605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409259
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    || ||||  ||| || |||| | ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 3409259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 739
Target Start/End: Original strand, 2579502 - 2579645
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||  | |    
T  2579502 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataaggtat 2579601  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacac 739  Q
     ||||||  |||||| | |||| ||||  ||||| |||||||||    
T  2579602 ccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Original strand, 2579882 - 2580035
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| | |||||| ||||| ||||| ||  || |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  2579882 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttacttataatgtgt 2579981  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  2579982 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 2580035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 627 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 3058343 - 3058226
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||    
T  3058343 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 3058244  T
Q  727 atacaactcacacttgca 744  Q
    ||| |||| |||||||||    
T  3058243 atataactaacacttgca 3058226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 10073993 - 10074154
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||| ||||| || ||   ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  10073993 ggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 10074092  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| || |  |||||| |||||| ||||  | ||| ||||||| |||||||||||    
T  10074093 taaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgcacacaa 10074154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 2378282 - 2378126
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||   || | ||||||||||| | ||||||  |||| ||||| | |||| |||||||| |||||| |||||    
T  2378282 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttactta 2378183  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  2378182 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2378126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 3409816 - 3409660
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| |||||  | || |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  3409816 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 3409717  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    ||| |||||| || |  ||| || |||| | ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  3409716 taagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttgca 3409660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 589 - 741
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999951
Alignment:
Q  589 gaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttat 688  Q
    |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||  ||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| || |||    
T  6999799 gaccgtccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatat 6999898  T
Q  689 aaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacactt 741  Q
    ||  ||||| || |  |||||| |||||| |||   ||||| |||||||||||    
T  6999899 aaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 632 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 35210316 - 35210204
Alignment:
Q  632 acaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacataca 731  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||  ||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||| ||||| |    
T  35210316 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatata 35210217  T
Q  732 actcacacttgca 744  Q
    |||||||||||||    
T  35210216 actcacacttgca 35210204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 1127508 - 1127414
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| | |||| |||||||  |||||| ||||||||    
T  1127508 cacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataa 1127414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 2377902 - 2377756
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| ||||||   || | || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  2377902 cacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 2377803  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttg 742  Q
    || ||||  ||| || || ||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  2377802 tcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 2377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 690
Target Start/End: Original strand, 2578837 - 2578939
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||  || |  |||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| | |||    
T  2578837 ggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctcttattta 2578936  T
Q  688 taa 690  Q
    |||    
T  2578937 taa 2578939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 746
Target Start/End: Original strand, 12071693 - 12071851
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||  ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |  ||  |||||||  |||| ||  |||    
T  12071693 ggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtttatgagtcctttctatta 12071792  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcaca 746  Q
    |||| ||||| | ||||| |||| |||| | || || ||||| ||||||||||||||||    
T  12071793 taaagtgttcaaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttgcaca 12071851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 16454731 - 16454629
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||| ||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  16454731 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 16454632  T
Q  688 taa 690  Q
    |||    
T  16454631 taa 16454629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 627 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 26544166 - 26544049
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||    
T  26544166 gagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 26544067  T
Q  727 atacaactcacacttgca 744  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  26544066 atataactcacacttgca 26544049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 1846904 - 1846748
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || |  |||||||||| |||||||  ||||| ||||| ||||||  ||||||| | |||| |||||    
T  1846904 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttactta 1846805  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  1846804 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttgca 1846748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 2843711 - 2843560
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatgga-tcctctcactt 686  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||   || | |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||    
T  2843711 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctcttactt 2843612  T
Q  687 ataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    ||||  ||||| || |  | | || |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2843611 ataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcaca 2843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Original strand, 14748344 - 14748496
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  || | ||||    ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| | |||    
T  14748344 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttattta 14748439  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  14748440 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 14748496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 31714774 - 31714697
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccg 717  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| ||||||    
T  31714774 actcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctctca-ttatataacgttcaacctccacttttctatccg 31714697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 679 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 33605719 - 33605649
Alignment:
Q  679 tctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  33605719 tctcaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgagacatatagctcacacttgcacacaa 33605649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 745
Target Start/End: Original strand, 593750 - 593868
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    |||||| |||| ||| |||| ||||| ||||| ||| |  |||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||    
T  593750 gagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggac 593849  T
Q  727 atacaactcacacttgcac 745  Q
    |||||||||||||||||||    
T  593850 atacaactcacacttgcac 593868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 689
Target Start/End: Complemental strand, 3415575 - 3415513
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttata 689  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  3415575 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 3415513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 658
Target Start/End: Original strand, 5832029 - 5832099
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaa 658  Q
    |||||||  ||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  5832029 ggaccgtctacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaa 5832099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 681
Target Start/End: Original strand, 2579111 - 2579204
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctct 681  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  || | ||||||||||| |||||||  ||||  |||||||  ||| |||||||| ||||||    
T  2579111 ggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagttatgggtttatggttcctct 2579204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 596 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 26074760 - 26074606
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  26074760 cacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 26074661  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaaa 750  Q
    || ||||  ||| || |||||| | || |||||| |||||||||||| |||||||    
T  26074660 tcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgtacacaaa 26074606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 41632899 - 41632777
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||| |||||| ||||| ||    
T  41632899 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagac 41632800  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||| ||||||||||||||    
T  41632799 atataacttacacttgcacacaa 41632777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Original strand, 26074156 - 26074309
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||| |||||| || ||| |  |||    
T  26074156 cacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtgt 26074255  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  |||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  26074256 tcaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacacaa 26074309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 660 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 31509707 - 31509618
Alignment:
Q  660 gcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  31509707 gcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 31509618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 588 - 748
Target Start/End: Original strand, 40296317 - 40296477
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  40296317 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 40296416  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacaca 748  Q
    |||  ||||| ||||   || || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  40296417 taaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacaca 40296477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 690
Target Start/End: Original strand, 26590920 - 26591014
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  26590920 cacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataa 26591014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 741
Target Start/End: Original strand, 36522278 - 36522392
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||| |||||| | |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||  ||||| ||    
T  36522278 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgagac 36522377  T
Q  727 atacaactcacactt 741  Q
    ||| |||||||||||    
T  36522378 atataactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 627 - 744
Target Start/End: Original strand, 9498695 - 9498812
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||| | ||||| ||    
T  9498695 gagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagac 9498794  T
Q  727 atacaactcacacttgca 744  Q
    ||| |||||||| |||||    
T  9498795 atataactcacatttgca 9498812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 590 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 33747925 - 33747824
Alignment:
Q  590 accgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttata 689  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| |||| ||| || | ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33747925 accgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttata 33747826  T
Q  690 aa 691  Q
    ||    
T  33747825 aa 33747824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 36492219 - 36492380
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  || | ||||||||||| |||||||  ||||| || || | ||||||||||| | |||||| |||||    
T  36492219 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttactta 36492318  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  36492319 taaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacaa 36492380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 6500978 - 6500823
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| | | |||    
T  6500978 ggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtccttttattta 6500879  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  6500878 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactcacacttgca 6500823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 627 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 623935 - 623818
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||  |||||||| ||  || |||| |||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||| ||    
T  623935 gagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttacttgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagac 623836  T
Q  727 atacaactcacacttgca 744  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  623835 atataactcacacttgca 623818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 15370255 - 15370094
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || | ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||  ||||||| |||||| |||||    
T  15370255 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttactta 15370156  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||| ||||  ||| || ||| || ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  15370155 taagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 15370094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 35150154 - 35150002
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||  |||||  ||||||| | |||| ||||||||  |||    
T  35150154 cacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggt-ctcttacttataaggtgt 35150056  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  35150055 tcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 35150002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 6500606 - 6500451
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||  | |||||| |||||    
T  6500606 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaaaggtcctcttactta 6500507  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  6500506 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactcacacttgca 6500451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 744
Target Start/End: Original strand, 27502038 - 27502194
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  || | ||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||    
T  27502038 ggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggcaataggtttatgggtcctcttactta 27502137  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |||  ||||  ||||  ||| || |||||  ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  27502138 taaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 27502194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 749
Target Start/End: Original strand, 11417030 - 11417138
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| |||| |||||| ||||  ||    
T  11417030 actcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataact--ca 11417127  T
Q  739 cttgcacacaa 749  Q
    |||||||||||    
T  11417128 cttgcacacaa 11417138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 36568608 - 36568730
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||  ||||| || |  |||||| |||||| ||||  ||    
T  36568608 gagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttacgggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggac 36568707  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  36568708 atataactcacacttgcacacaa 36568730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 1028519 - 1028680
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  |||  ||||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |  ||  |||||||| |||||| |||||    
T  1028519 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttatgggtcctcttactta 1028618  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||| |||||  |||  |||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1028619 taaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaa 1028680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Original strand, 12662662 - 12662815
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||  || | || || ||||| |||||||| ||||| |||||  |||||  ||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  12662662 cacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttacttataaaatgt 12662761  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  12662762 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 12662815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 613 - 749
Target Start/End: Original strand, 9510547 - 9510683
Alignment:
Q  613 aaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttat 712  Q
    |||||||  |||| ||||||||| ||| | ||||  ||||| |||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||||    || |||||||||||| |    
T  9510547 aaccacacaagtaagagagacactatatttttacctaaaattttaaggcattaggtttatggctcctctcacttataaatgactcaacctccacttttct 9510646  T
Q  713 atccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || |  ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9510647 attcaatgtgaaacatataactcacactttcacacaa 9510683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 590 - 742
Target Start/End: Original strand, 18603124 - 18603276
Alignment:
Q  590 accgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttata 689  Q
    ||||| |||||||||| |||||  ||||||  || | ||||||  ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  18603124 accgtccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 18603223  T
Q  690 aaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttg 742  Q
    |  ||||| ||||  ||| || |||| | ||||  ||||| ||||||||||||    
T  18603224 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 18603276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 596 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 32487541 - 32487394
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || | |||| ||  || |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||   |||    
T  32487541 cacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttatagg-tgt 32487443  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32487442 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 32487394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 627 - 687
Target Start/End: Original strand, 36527136 - 36527196
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  36527136 gagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggatcctctcactta 36527196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 13415801 - 13415923
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| | |||  |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  |||  | |||||| ||||  ||    
T  13415801 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactaatttatccgatgtgggac 13415900  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  13415901 atataactcacacttgcacacaa 13415923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 25328091 - 25327989
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| | | | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |  |||||||| |||||| |||||    
T  25328091 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttactta 25327992  T
Q  688 taa 690  Q
    |||    
T  25327991 taa 25327989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 639 - 749
Target Start/End: Original strand, 36521949 - 36522059
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||| ||| | | ||||| ||||| |||||| |||| | ||||  ||||| ||||||||    
T  36521949 actcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttctatctgatgtgggacatataactcaca 36522048  T
Q  739 cttgcacacaa 749  Q
    ||||| |||||    
T  36522049 cttgcgcacaa 36522059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 628 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 299605 - 299484
Alignment:
Q  628 agagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaaca 727  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  |||    
T  299605 agagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggaca 299506  T
Q  728 tacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||||||||||| |||||    
T  299505 tataactcacacttgcgcacaa 299484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 660 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 31509815 - 31509746
Alignment:
Q  660 gcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacata 729  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  31509815 gcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagacata 31509746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 590 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 624350 - 624196
Alignment:
Q  590 accgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttata 689  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||| ||  |||  ||||||||||| |||||||| ||||| || || || ||| |||||||| || ||| |||||||    
T  624350 accgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttata 624251  T
Q  690 aaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |  ||||| ||||  ||| || ||| |  ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  624250 acgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttgca 624196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 748
Target Start/End: Original strand, 3295056 - 3295176
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||| || || |||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||    
T  3295056 gagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 3295155  T
Q  727 atacaactcacacttgcacaca 748  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  3295156 ata-tactcacacttgcacaca 3295176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 59; Significance: 2e-24; HSPs: 34)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 47964956 - 47965078
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| | |||||   ||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  47964956 gagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcacttatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaac 47965055  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  47965056 atataactcacacttgcacacaa 47965078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 648 - 749
Target Start/End: Original strand, 39336291 - 39336392
Alignment:
Q  648 caaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacac 747  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  39336291 caaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacac 39336390  T
Q  748 aa 749  Q
    ||    
T  39336391 aa 39336392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 587 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 15773011 - 15772851
Alignment:
Q  587 aggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactt 686  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||    
T  15773011 aggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttactt 15772912  T
Q  687 ataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacac 747  Q
    ||||  ||||| || |  ||| || |||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||    
T  15772911 ataaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttgcacac 15772851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 37990979 - 37991140
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||| | |||||| |||||    
T  37990979 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttactta 37991078  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  37991079 taaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttgtacacaa 37991140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 53117977 - 53118137
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| | ||  ||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||    
T  53117977 ggaccgttcacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcactta 53118075  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||||| | || |||||| ||||||||||||| |||||    
T  53118076 taaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgcccacaa 53118137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 47964559 - 47964681
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||||| ||| |||||| || |  ||    
T  47964559 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttctatccgatgcgggac 47964658  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  47964659 atacaactcacacttgcacacaa 47964681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 37990641 - 37990802
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |||||| |||||    
T  37990641 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactta 37990740  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| || |  ||| || |||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  37990741 taaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaa 37990802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Original strand, 12114572 - 12114725
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    ||||||| || ||||| |||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  12114572 cacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 12114671  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  |||||| |||||| ||||  | ||| |||| ||||||||||||||    
T  12114672 tcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgcacacaa 12114725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 53577512 - 53577359
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||| | | | ||||||||||| |||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||| ||||    
T  53577512 cacaccgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatttttaagatgt 53577413  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  53577412 tcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacacaa 53577359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 597 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 39914399 - 39914247
Alignment:
Q  597 acatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgtt 696  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||| ||| |  |||||||| |||||| | ||||||  ||||    
T  39914399 acatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 39914300  T
Q  697 cgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    | ||||| ||| || |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  39914299 caacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 39914247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 586 - 749
Target Start/End: Original strand, 43346791 - 43346954
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcact 685  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| | |||| |||    
T  43346791 gaggaccgtccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttact 43346890  T
Q  686 tataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||  ||||| ||||  ||| || |||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  43346891 tataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaa 43346954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 596 - 690
Target Start/End: Original strand, 39934965 - 39935059
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  || | |||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  39934965 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataa 39935059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 627 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 22304686 - 22304569
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||  | ||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||    
T  22304686 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggac 22304587  T
Q  727 atacaactcacacttgca 744  Q
    ||| | ||||||||||||    
T  22304586 atatagctcacacttgca 22304569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 29644904 - 29645065
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| || || |||| ||| || | ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| |||||| |||||    
T  29644904 ggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttactta 29645003  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||  ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||| ||||||||||||||    
T  29645004 taaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgcacacaa 29645065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 749
Target Start/End: Original strand, 25739478 - 25739588
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||||| |||||||  |||||| || |  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||    
T  25739478 actcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 25739577  T
Q  739 cttgcacacaa 749  Q
    |||||||||||    
T  25739578 cttgcacacaa 25739588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 35946639 - 35946517
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||| ||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||    
T  35946639 gagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggac 35946540  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  35946539 atataactcacacttgtacacaa 35946517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 749
Target Start/End: Original strand, 46546378 - 46546488
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| |||  ||||  |||   ||||| ||||||||    
T  46546378 actcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactcaca 46546477  T
Q  739 cttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||    
T  46546478 cttacacacaa 46546488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 9240297 - 9240144
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| |||||||||| || || |  ||||||||||| | |||||  | ||||||||| | ||||  ||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  9240297 cacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgt 9240198  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||  | |  |||| | |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  9240197 tcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgcacacaa 9240144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 589 - 690
Target Start/End: Original strand, 32462903 - 32463004
Alignment:
Q  589 gaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttat 688  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||  || ||| ||||||    
T  32462903 gaccgtacacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttat 32463002  T
Q  689 aa 690  Q
    ||    
T  32463003 aa 32463004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Original strand, 54017826 - 54017979
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||| | ||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |  |||||||  |||||| ||||||||  |||    
T  54017826 cacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgagtcctcttacttataaggtgt 54017925  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  54017926 tcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgcacacaa 54017979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 750
Target Start/End: Original strand, 29644622 - 29644745
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||| | |||| ||||||||  ||||| ||||  ||| ||  ||||| ||||  ||    
T  29644622 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggac 29644721  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaaa 750  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  29644722 atataactcacacttgcacacaaa 29644745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 648 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 2417413 - 2417351
Alignment:
Q  648 caaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccactttt 710  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2417413 caaaaccttaaagcattgagtttatagattctctcacttataaaatgttcaatctccactttt 2417351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 630 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 4823769 - 4823655
Alignment:
Q  630 agacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacata 729  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||||||  ||||  || |  ||| || |||||| ||||| || ||    
T  4823769 agacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaacttttactattttatccgatgtgagactta 4823670  T
Q  730 caactcacacttgca 744  Q
     ||||||||||||||    
T  4823669 taactcacacttgca 4823655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 8328021 - 8327899
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||| |  |||||||| | |||| |||||||| || |||  |||  ||| || |||||| ||||  ||    
T  8328021 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctcttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggac 8327922  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  8327921 atataactcacacttgcacacaa 8327899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 586 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 15773352 - 15773187
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatg--agagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctca 683  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||  || | |  ||||||| || |||||||| |||||  |||| |||||| | |||||  |||||| |    
T  15773352 gaggatcgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctctta 15773253  T
Q  684 cttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||||||| |||||| || |  ||| || ||| || ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  15773252 cttataagatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 15773187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 628 - 690
Target Start/End: Original strand, 42584864 - 42584926
Alignment:
Q  628 agagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  42584864 agagacaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataa 42584926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 690
Target Start/End: Original strand, 54018208 - 54018302
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||  |  |||||||| |||||| ||||||||    
T  54018208 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttacttataa 54018302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 639 - 746
Target Start/End: Original strand, 21832396 - 21832503
Alignment:
Q  639 actcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcaca 738  Q
    |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||  |||||| ||||||||  ||||| ||||  |||||| |||||  ||||  ||||| ||||||||    
T  21832396 actcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcaca 21832495  T
Q  739 cttgcaca 746  Q
    ||||||||    
T  21832496 cttgcaca 21832503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 690
Target Start/End: Original strand, 45395694 - 45395757
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||  ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  45395694 gagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttataa 45395757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 656 - 702
Target Start/End: Complemental strand, 2417777 - 2417731
Alignment:
Q  656 taaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacct 702  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2417777 taaagcattgagtttatagatcctctcacttataaaatggtcgacct 2417731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 690
Target Start/End: Original strand, 22303965 - 22304059
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    |||||||||| ||||| ||||||   || | ||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||    
T  22303965 cacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataa 22304059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 45901870 - 45901768
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||  || |||| ||||||||||| ||||||||  ||||  |||| || ||| |||||||  |||||| |||||    
T  45901870 ggaccgtccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttactta 45901771  T
Q  688 taa 690  Q
    |||    
T  45901770 taa 45901768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 49336728 - 49336850
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||  ||||  | ||| |||||||| |||||| ||||||||  || || ||||  |||||| |||||| ||||| ||    
T  49336728 gagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataaggtggtcaacctttacttttctatccgatgtgagac 49336827  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||  |||||||||||| ||||||    
T  49336828 atgtaactcacacttgtacacaa 49336850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 42342390 - 42342551
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||| |||| ||  || | |||||||  || |||||||| ||||| |||||  |||||  ||||||| |||||| |||||    
T  42342390 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttactta 42342489  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||  ||||  ||| || |||| | ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  42342490 taaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 42342551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 55; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 5474 - 5352
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| |||| |||    
T  5474 gagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtggaac 5375  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  5374 atataactcacacttgcacacaa 5352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 5099 - 4977
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||| || | | |||||||| || ||  ||||  ||| || | |||| ||||| ||    
T  5099 gagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataagatattaaacctttactgttctctccgatgtgagac 5000  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| || ||||||||||||||||    
T  4999 atataattcacacttgcacacaa 4977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 53; Significance: 7e-21; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 649 - 749
Target Start/End: Original strand, 9620739 - 9620839
Alignment:
Q  649 aaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacaca 748  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| || || || || |||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9620739 aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttgcacaca 9620838  T
Q  749 a 749  Q
    |    
T  9620839 a 9620839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 586 - 749
Target Start/End: Original strand, 3038290 - 3038453
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcact 685  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||  || | ||||||  ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| | |||    
T  3038290 gaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttact 3038389  T
Q  686 tataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||| ||||| ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  3038390 tataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaa 3038453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 4154707 - 4154829
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| |||   |||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||  ||    
T  4154707 gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgttcaacctccacttttctatcagatgtgggac 4154806  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  4154807 atataactcacacttgcacacaa 4154829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122220
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||| |||||||| | |||| ||||||||  |||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 45122220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 590 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 30359763 - 30359604
Alignment:
Q  590 accgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttata 689  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |  ||| |||||||  |||||| |||||||    
T  30359763 accgtccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttata 30359664  T
Q  690 aaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |  ||||| || |  ||| || |||| | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  30359663 aggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaa 30359604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 607 - 749
Target Start/End: Original strand, 33113388 - 33113530
Alignment:
Q  607 tagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccac 706  Q
    ||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||| | |||| ||||  ||    
T  33113388 tagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagacgttcaacctttac 33113487  T
Q  707 ttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    | || |||||| |||   ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  33113488 tattttatccgatgtaggacatataactcaaacttgtacacaa 33113530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 586 - 744
Target Start/End: Original strand, 20870573 - 20870733
Alignment:
Q  586 gaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcact 685  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||| |||||||  || | ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| || |||||||| |||||| |||    
T  20870573 gaggaccgtccatatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatgggtcctcttact 20870672  T
Q  686 tataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac--atacaactcacacttgca 744  Q
    ||||| |||||| ||||  ||| || |||| | |||| |||  ||| ||||||||||||||    
T  20870673 tataagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaacatatataactcacacttgca 20870733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Original strand, 4154322 - 4154443
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    |||||||| || || ||||| |||||| |||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| | |||   ||    
T  4154322 gagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgggtc-tctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtaggac 4154420  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||| ||||||||||    
T  4154421 atataactcacatttgcacacaa 4154443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 596 - 746
Target Start/End: Original strand, 45121920 - 45122070
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| | |||||||||||  || |  |||||| ||| ||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||    
T  45121920 cacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgt 45122019  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcaca 746  Q
    || ||||  ||| || ||| || ||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  45122020 tcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacacttgcaca 45122070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 9309510 - 9309350
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||| | |  ||||||||||| |||||||| | | | ||||| |||||| ||||| || |||||| |||||    
T  9309510 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacat-actgagagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttactta 9309412  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| || |  ||| || |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  9309411 taaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 9309350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 596 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 3669835 - 3669687
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |||||| ||||||||  |||    
T  3669835 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgt 3669736  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    || ||||  ||| || |||| | ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  3669735 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 3669687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 34835365 - 34835205
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||  || | ||| ||||||| |||||||| |||||  |||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  34835365 ggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactta 34835266  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacaca 748  Q
    |||  ||||| ||||  ||| || |||| | ||||  ||||| ||||||| |||| |||||    
T  34835265 taaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttgtacaca 34835205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 690
Target Start/End: Original strand, 18372035 - 18372098
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18372035 gagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataa 18372098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 6732043 - 6731965
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatgg 674  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  6732043 cacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgg 6731965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 9608898 - 9608740
Alignment:
Q  591 ccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||| || ||| | ||||||| ||| |||| ||| ||||| ||||| |  ||| |||||||| || ||| ||||||||    
T  9608898 ccgtccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttacttataa 9608799  T
Q  691 aatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
      ||||| ||||  |||||| |||||| | ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  9608798 ggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgcacacaa 9608740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 30359388 - 30359266
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac 726  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||| |||||||| ||||||  |||||||  ||||| || |  ||| || |||||| ||||| ||    
T  30359388 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagac 30359289  T
Q  727 atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  30359288 atataactcacacttgtacacaa 30359266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 34835631 - 34835529
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||  || | ||| ||||||| |||||||| |||||  |||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  34835631 ggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactta 34835532  T
Q  688 taa 690  Q
    |||    
T  34835531 taa 34835529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 588 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 34835897 - 34835795
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||  || | ||| ||||||| |||||||| |||||  |||| |||||| |||||||| |||||| |||||    
T  34835897 ggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactta 34835798  T
Q  688 taa 690  Q
    |||    
T  34835797 taa 34835795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 631 - 741
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274934
Alignment:
Q  631 gacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatac 730  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||  |||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||  ||| || |||| | |||||||||||     
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  731 aactcacactt 741  Q
    |||||||||||    
T  43274924 aactcacactt 43274934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 628 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 5274891 - 5274770
Alignment:
Q  628 agagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaaca 727  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| || || || ||||||| ||||| |||||  ||||| ||| |  |||  ||||    
T  5274891 agagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttttattcaatgtagaaca 5274792  T
Q  728 tacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || |||||| ||||||||||||    
T  5274791 tataactcatacttgcacacaa 5274770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 681
Target Start/End: Complemental strand, 5916023 - 5915930
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctct 681  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  5916023 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctct 5915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 34835024 - 34834871
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||||||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  || ||| ||||||||  |||    
T  34835024 cacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggtgt 34834925  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |  ||||  ||| || |||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  34834924 ttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaa 34834871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 660 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 41972242 - 41972153
Alignment:
Q  660 gcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||  |||||| |||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  41972242 gcaatgggtttatgggtcctatcacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaa 41972153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 749
Target Start/End: Original strand, 45121666 - 45121818
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||| |||| |||||| | || |||||||||||||| ||||| ||  |  ||||||||||||||| ||||||||  ||     
T  45121666 cacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataaggtga 45121765  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  45121766 tcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttgtacacaa 45121818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 590 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 3670214 - 3670060
Alignment:
Q  590 accgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttata 689  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||  |||||||| |||||  |||||||    
T  3670214 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatacttata 3670115  T
Q  690 aaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    |  ||||  ||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||||||||||||||    
T  3670114 aggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 3670060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 687 - 749
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995564
Alignment:
Q  687 ataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttgcacacaa 20995564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 30441233 - 30441139
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||  || | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||    
T  30441233 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataa 30441139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 596 - 742
Target Start/End: Original strand, 37544500 - 37544646
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||  |||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||  |||||||  |||    
T  37544500 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttcttataatgtgt 37544599  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttg 742  Q
    || ||||  ||| || |||||| ||||  || || ||||||||||||    
T  37544600 tcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttg 37544646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 628 - 742
Target Start/End: Original strand, 40579548 - 40579662
Alignment:
Q  628 agagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaaca 727  Q
    |||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||  | |||||||    
T  40579548 agagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatatgaaaca 40579647  T
Q  728 tacaactcacacttg 742  Q
    || || |||||||||    
T  40579648 tataattcacacttg 40579662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 584 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 40518742 - 40518577
Alignment:
Q  584 cagaggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctca 683  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||  || | ||| |||  || |||||||| ||||| |||||  || || |||||||| |||||| |    
T  40518742 cagaggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctctta 40518643  T
Q  684 cttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
     ||||||  ||||| ||||  |||||| |||| | ||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  40518642 tttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgaacacaa 40518577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 596 - 744
Target Start/End: Original strand, 1013881 - 1014029
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||  ||||  ||||||| || ||||||||||||||   ||| |||||| |||||| | |||||| |||||||   |||    
T  1013881 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggtgt 1013980  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgca 744  Q
    || || |  ||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  1013981 tcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgca 1014029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 40518227 - 40518064
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||  || | ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||| |||  | |||||    
T  40518227 ggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttactta 40518128  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttat--atccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| ||||  |||||| |  ||||  |||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  40518127 taaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttgaacacaa 40518064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 667 - 710
Target Start/End: Original strand, 34219214 - 34219257
Alignment:
Q  667 gtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccactttt 710  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34219214 gtttatggatcctctctcttataaagtgttcaacctccactttt 34219257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 749
Target Start/End: Original strand, 6876864 - 6877026
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||  |  | |||| |||||| |||||||| ||||| | |||  ||||| || ||||| || ||| | |||    
T  6876864 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttattta 6876963  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaac-atacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||  ||||| ||||  |||||| |||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||    
T  6876964 taaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgcacacaa 6877026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 613 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 16524496 - 16524446
Alignment:
Q  613 aaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaa 663  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  16524496 aaccacacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaagcaa 16524446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 588 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 41129144 - 41129074
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaa 658  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||| |||| ||| ||||| |||||    
T  41129144 ggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaa 41129074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 590 - 749
Target Start/End: Original strand, 1110 - 1269
Alignment:
Q  590 accgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttata 689  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||  |||| |  ||||||    
T  1110 accgtccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctttttcttata 1209  T
Q  690 aaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |  ||||| ||||  ||| || |||||  ||||  ||||| |||||||||||| ||||||    
T  1210 aggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaa 1269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 690
Target Start/End: Original strand, 1732 - 1795
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataa 690  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1732 gagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataa 1795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 628 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 5898 - 5772
Alignment:
Q  628 agagacaccatactcttactcaaaat-----cttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtg 722  Q
    |||||||||| |||||||||||||||     ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| ||||    
T  5898 agagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 5799  T
Q  723 aaacatacaactcacacttgcacacaa 749  Q
      ||||| |||||||||||||||||||    
T  5798 cgacatataactcacacttgcacacaa 5772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 5514 - 5391
Alignment:
Q  627 gagagacaccatactcttactcaaaatcttaaag-caatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaa 725  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||  ||||| ||||||||  ||||| ||||  ||| || |||||| |||   |    
T  5514 gagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtagga 5415  T
Q  726 catacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  5414 catataactcacacttgcacacaa 5391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 742
Target Start/End: Original strand, 524 - 670
Alignment:
Q  596 cacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgt 695  Q
    |||||||||| ||||| ||||||   || | || |||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||    
T  524 cacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 623  T
Q  696 tcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttg 742  Q
    || ||||  ||| || || ||| ||||  ||||| ||||||||||||    
T  624 tcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 628 - 749
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17619
Alignment:
Q  628 agagacaccatactcttactcaaaat--cttaaagcaatgtgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaa 725  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   ||||| || ||| |||||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||  ||| || |||| | ||||  |    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  726 catacaactcacacttgcacacaa 749  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  17596 catataactcacacttgcacacaa 17619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 666 - 750
Target Start/End: Complemental strand, 39534 - 39451
Alignment:
Q  666 tgtttatggatcctctcacttataaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacacaaa 750  Q
    ||||||| | |||||||||||||||   |||| |||||||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  39534 tgtttatagttcctctcacttataaggagttcaacctccacttttctatgcg-tgtgagacatataactcacacttgaacacaaa 39451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 588 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 47516 - 47356
Alignment:
Q  588 ggaccgttcacatcgaggttagaataaccacattagtatgagagacaccatactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctctcactta 687  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| |   || | ||||||||||| | | |||| |||||  |||| |||||| |||||||||| |||| |||||    
T  47516 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttactta 47417  T
Q  688 taaaatgttcgacctccacttttatatccgttgtgaaacatacaactcacacttgcacaca 748  Q
    |||  ||||| | ||  ||| || |||| | ||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  47416 taaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgcacaca 47356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University