View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5433-Insertion-1 (Length: 1072)

Name: NF5433-Insertion-1
Description: NF5433
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5433-Insertion-1
NF5433-Insertion-1
[»] chr4 (14 HSPs)
chr4 (335-1036)||(4702530-4703222)
chr4 (23-289)||(4702178-4702448)
chr4 (790-1002)||(4701919-4702133)
chr4 (780-983)||(20599655-20599857)
chr4 (849-983)||(47878320-47878455)
chr4 (775-983)||(42278201-42278405)
chr4 (775-983)||(54574577-54574789)
chr4 (808-885)||(6039372-6039453)
chr4 (775-883)||(42278762-42278873)
chr4 (891-983)||(19050408-19050501)
chr4 (891-981)||(42391764-42391855)
chr4 (810-881)||(19050488-19050563)
chr4 (929-983)||(24745972-24746026)
chr4 (379-433)||(24837483-24837537)
[»] chr7 (34 HSPs)
chr7 (468-692)||(5929292-5929516)
chr7 (36-250)||(5929621-5929834)
chr7 (773-983)||(7509208-7509424)
chr7 (775-983)||(10898832-10899044)
chr7 (780-983)||(45584260-45584467)
chr7 (775-983)||(42477532-42477744)
chr7 (775-983)||(48788434-48788643)
chr7 (732-983)||(12223403-12223650)
chr7 (781-983)||(7258427-7258632)
chr7 (775-983)||(35727850-35728062)
chr7 (689-884)||(5929788-5929988)
chr7 (815-983)||(43457620-43457794)
chr7 (808-983)||(48647234-48647414)
chr7 (775-937)||(45583792-45583951)
chr7 (775-983)||(30924775-30924980)
chr7 (849-983)||(44333289-44333424)
chr7 (815-983)||(43461520-43461688)
chr7 (786-961)||(10894517-10894697)
chr7 (775-881)||(33607275-33607385)
chr7 (775-910)||(48646274-48646413)
chr7 (780-961)||(39708303-39708481)
chr7 (379-428)||(2622322-2622371)
chr7 (891-983)||(44334328-44334421)
chr7 (758-983)||(7259434-7259655)
chr7 (780-884)||(34707864-34707973)
chr7 (810-983)||(35728887-35729057)
chr7 (891-969)||(2677102-2677181)
chr7 (920-983)||(24287652-24287715)
chr7 (895-969)||(24935575-24935649)
chr7 (409-447)||(31890172-31890210)
chr7 (380-426)||(42313439-42313485)
chr7 (740-849)||(32793459-32793568)
chr7 (891-983)||(33607372-33607465)
chr7 (859-983)||(48777409-48777534)
[»] chr1 (25 HSPs)
chr1 (775-983)||(6612582-6612795)
chr1 (747-983)||(51450172-51450413)
chr1 (774-983)||(52439613-52439827)
chr1 (808-982)||(52440352-52440530)
chr1 (891-983)||(25038053-25038146)
chr1 (891-983)||(25043265-25043358)
chr1 (758-971)||(6613723-6613926)
chr1 (775-883)||(7945333-7945444)
chr1 (808-983)||(32665568-32665741)
chr1 (775-978)||(34088217-34088415)
chr1 (891-983)||(7944307-7944400)
chr1 (887-1002)||(22856834-22856947)
chr1 (891-983)||(9339798-9339891)
chr1 (775-983)||(32664655-32664866)
chr1 (775-854)||(34085813-34085892)
chr1 (891-984)||(39977503-39977597)
chr1 (920-981)||(1407802-1407863)
chr1 (922-983)||(9340935-9340996)
chr1 (918-983)||(29766095-29766160)
chr1 (775-875)||(9340799-9340902)
chr1 (891-984)||(16249814-16249908)
chr1 (376-426)||(16475930-16475980)
chr1 (891-983)||(3117821-3117914)
chr1 (918-983)||(8975331-8975396)
chr1 (895-983)||(34085694-34085783)
[»] chr2 (23 HSPs)
chr2 (758-983)||(32765089-32765319)
chr2 (775-983)||(24458212-24458425)
chr2 (785-983)||(2911256-2911458)
chr2 (758-960)||(2910275-2910482)
chr2 (808-983)||(39015157-39015336)
chr2 (786-983)||(40000105-40000306)
chr2 (758-971)||(31090321-31090539)
chr2 (775-983)||(31091286-31091498)
chr2 (775-983)||(14704157-14704361)
chr2 (775-983)||(24459213-24459425)
chr2 (815-980)||(7073805-7073976)
chr2 (775-883)||(32766039-32766150)
chr2 (815-983)||(17330017-17330190)
chr2 (891-970)||(21732280-21732360)
chr2 (893-983)||(33161940-33162031)
chr2 (891-984)||(31442502-31442596)
chr2 (918-983)||(39016289-39016354)
chr2 (895-983)||(43380739-43380828)
chr2 (775-877)||(38984750-38984857)
chr2 (858-978)||(5914857-5914978)
chr2 (918-983)||(12746086-12746152)
chr2 (918-984)||(31443131-31443197)
chr2 (808-849)||(43380855-43380896)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (775-983)||(32898203-32898416)
chr8 (772-983)||(5737014-5737229)
chr8 (732-961)||(5965137-5965371)
chr8 (775-978)||(35177551-35177758)
chr8 (775-983)||(35178564-35178776)
chr8 (817-983)||(1952778-1952941)
chr8 (775-959)||(28619291-28619479)
chr8 (776-881)||(32563828-32563937)
chr8 (918-981)||(45476336-45476399)
chr8 (917-983)||(31074166-31074232)
chr8 (894-983)||(41121277-41121367)
chr8 (812-983)||(5737808-5737974)
chr8 (894-984)||(8569559-8569650)
chr8 (909-983)||(41754140-41754215)
chr8 (893-978)||(30134743-30134829)
chr8 (918-983)||(10406358-10406423)
chr8 (747-824)||(30134851-30134928)
[»] chr3 (16 HSPs)
chr3 (756-983)||(55388211-55388445)
chr3 (775-983)||(17700671-17700883)
chr3 (775-983)||(48574217-48574430)
chr3 (775-983)||(55389228-55389440)
chr3 (775-983)||(36279104-36279309)
chr3 (775-983)||(48573137-48573352)
chr3 (775-983)||(36280076-36280288)
chr3 (756-983)||(52318064-52318288)
chr3 (758-945)||(17701669-17701862)
chr3 (849-983)||(48809491-48809626)
chr3 (849-983)||(53958937-53959071)
chr3 (866-978)||(33427888-33428001)
chr3 (849-983)||(2591777-2591913)
chr3 (891-983)||(48808524-48808617)
chr3 (891-983)||(53957825-53957918)
chr3 (891-967)||(47075249-47075326)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (775-983)||(2464821-2465034)
chr5 (758-983)||(40612400-40612630)
chr5 (786-983)||(8074602-8074804)
chr5 (771-983)||(25590582-25590798)
chr5 (758-983)||(28589851-28590084)
chr5 (818-983)||(14889921-14890091)
chr5 (775-983)||(28590872-28591084)
chr5 (775-983)||(40611412-40611624)
chr5 (808-983)||(8075626-8075804)
chr5 (775-983)||(9537194-9537400)
chr5 (808-980)||(32640443-32640619)
chr5 (758-849)||(32641484-32641575)
chr5 (797-982)||(18004811-18004997)
chr5 (780-983)||(2466537-2466744)
chr5 (771-983)||(4593864-4594072)
chr5 (758-971)||(4593024-4593236)
chr5 (775-983)||(544800-545011)
chr5 (808-905)||(9537846-9537947)
chr5 (775-983)||(545802-546007)
chr5 (894-980)||(34173435-34173522)
chr5 (808-881)||(21069540-21069617)
chr5 (918-983)||(32555433-32555497)
[»] scaffold0767 (2 HSPs)
scaffold0767 (808-961)||(6024-6182)
scaffold0767 (891-984)||(5768-5862)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (776-980)||(31239726-31239935)
chr6 (891-984)||(12676349-12676443)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (891-984)||(36403-36496)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 371; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 335 - 1036
Target Start/End: Original strand, 4702530 - 4703222
Alignment:
Q  335 gatcatgaccctatcctgtcatcataaaatatccttatactgttctcgtgagcttaactttgttgacaggaacaatacataaaatatgtaagatctgtga 434  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | |||||||||| ||| |||||||    
T  4702530 gatcatgaccctattatgttatcatagaatatcctcatgctgttctcgtgagcttagctctgttgataggaacaacatataaaatatgcaaggtctgtga 4702629  T
Q  435 ttcaaactccggcaatnnnnnnnnnnnnnnnnnccttatgtttgaaattcttataggtttgagttgtttgggattcacaacaaagttgcatatataacaa 534  Q
    ||||||| |||||||                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4702630 ttcaaaccccggcaa---------aaaaaaaacccttatgtttgaaattcttataggtttgagttgtttgggattcacgacaaagttgcatatataacaa 4702720  T
Q  535 gataaatcacttggtttggtgattggaagccatgagacttgatgccagttgcgggtctttcaatactcaatcatcctcggtttagagctcaatatcacct 634  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4702721 gataa-tcacctggtttggtgattggaagccatgagacttgatgcaagttgtgggtctttcaatactcagtcatcctcggtttagagctccatatcacct 4702819  T
Q  635 taggtttgttgttcaaagttttatttgttttattccttttgaactttattgttgtgatatttacattatccacttttgaaataaaaacatctttttattg 734  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  4702820 taggtttgt---tcaaagttttatttgttctattccttttgaactttattgttgtgatatttacattatcaactttggaaataaaattatctttttattg 4702916  T
Q  735 tcaaggaccttggtgagagaacatgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaag 834  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4702917 ccaaggaccttagtgagagaacatgtttactgacaatgatctaattgataataagtatacacagtcagggatataacagtaagttgatgtttaatggaag 4703016  T
Q  835 attgattttaaac--aagagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtca 931  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4703017 attgattttgaacaaaagagaattaaatgacatttagggatttgagatttagtgattcagagatttgagattcaatttggggatattgatttttgggtca 4703116  T
Q  932 gggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcatggtgccacgtcatcgt-aaactcgcaccacatc-tcactttaacgaat 1029  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||  || ||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |  ||||    
T  4703117 gggaccaaagtgacaattttatactttcactttagtccatatgacatctcat-atgtcacgtcatcataaaactcgcaccacatcatcacttaatagaat 4703215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 23 - 289
Target Start/End: Original strand, 4702178 - 4702448
Alignment:
Q  23 ctaaggtgcctggcaatcaaggaaatattttgatttcaaaagttgataatataa---tcacatgttcttattgtttaatgatgaaaacatgaaaagacaa 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4702178 ctaaggtccctggcaatcaaggaaatattttgatttcaaa-gttgataatataaatatcacatgttcttattgattaatgatgaaaacatgaaaagacaa 4702276  T
Q  120 gaaaccatttcaaaacatgtatcgtgacnnnnnnnnnnnnngatagataataaaccttttcaaactaacatattatgaccccaaaaggatttgggtacct 219  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||             ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4702277 gaaaccttttcaaaacatgtatcatgacaaaaacaaataaagatagataataaaccatttcaaactaacatattatgaccccaaaaggatttgggtacct 4702376  T
Q  220 aagaacaaaatcacatgtgctgcatacttacttagcatg--acaccattctgtgtttcttccatggcattgc 289  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4702377 aagaacaaaattgcatgtgctgcatacttacttagcatgcaatatcattctgtgtttcttccatggcattgc 4702448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 790 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 4702133 - 4701919
Alignment:
Q  790 tatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatggatttgagatttagt 885  Q
    |||| ||||||||  || |||||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||||    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||     
T  4702133 tatgtatagtcaggaatctaacagtaagtgtgtgtttaatggaagattgtttttgaacaaaatagagaattaaatgacatgtagggatttgagatctagg 4702034  T
Q  886 aattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcatg 984  Q
     ||| || |||||||||||| |||| |||||| ||| |||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||||| |||      
T  4702033 gatttagagatttgagattcaattttaggatattgacttttgtttcagggaccaaagtgactattttctactttcactttagtccatgtgacacttca-- 4701936  T
Q  985 gtgccacgtcatcgtaaa 1002  Q
     |||||||||||||||||    
T  4701935 -tgccacgtcatcgtaaa 4701919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 780 - 983
Target Start/End: Original strand, 20599655 - 20599857
Alignment:
Q  780 tgataataagtatgcatagtcagaga--tataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttatggat 873  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    ||||||||| ||||||||||  |||    
T  20599655 tgataataagtatgcacagttagggacctataacagtaagttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagagaattagatgacatttagagat 20599754  T
Q  874 ttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcccta 972  Q
    ||| |||||        ||| ||||||||||| ||||| | ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||||||     
T  20599755 ttgcgattt--------aggaatttgagattcaatttgggaatattaatttttggttcagggaccaaagtgaccattttttactttcattttagtccctg 20599846  T
Q  973 tgacacctcat 983  Q
    |||||||||||    
T  20599847 tgacacctcat 20599857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 849 - 983
Target Start/End: Original strand, 47878320 - 47878455
Alignment:
Q  849 agagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataa 947  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||  |||| ||| |||||| |||| ||||  | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  47878320 agagaattagatgagatttagggatttgtgatttaagaatttaggaatttgatattcaattttggaatattgatttttggttcagggaccaaagtgacca 47878419  T
Q  948 ttttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  47878420 ttttctactttcactttggtccctatgacacctcat 47878455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 42278405 - 42278201
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaagaga---attaaatgacatttatgg 871  Q
    |||| ||||| ||| ||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |   |||| |||||| ||| ||    
T  42278405 ctaactgatagtaaatatgcttagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagatttattttgaacaaaaaagatattagatgacagttaagg 42278306  T
Q  872 atttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccc 970  Q
    |||| ||||||||        |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||| || |||||    
T  42278305 atttaagatttag--------ggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctagtttcactttggtccc 42278214  T
Q  971 tatgacacctcat 983  Q
    | |||||||||||    
T  42278213 tgtgacacctcat 42278201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 54574789 - 54574577
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaac----aagagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| || ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||     ||||||||| |||||||||| |    
T  54574789 ctaactgatagtaagtatgcacagttagggacctaacagtaagtt-gtgtttaatggaagattaattttgaactaaagagagaattagatgacatttagg 54574691  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgagga-tatgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    |||||||||||||   | | ||| |||||| |||| ||||||| | | |||||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |  ||||    
T  54574690 gatttgagatttaaggagttaggaatttgatattcaatttgagaattttgatttttggttcggggatcaaagtgatcattttctactttcacttcggtcc 54574591  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    |  |||||||||||    
T  54574590 ccgtgacacctcat 54574577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 808 - 885
Target Start/End: Complemental strand, 6039453 - 6039372
Alignment:
Q  808 taacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttatggatttgagatttagt 885  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6039453 taacagtaagttgatgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagagaattatatgacatttagggatttgagatctagt 6039372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 775 - 883
Target Start/End: Original strand, 42278762 - 42278873
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||| |||||    |||||||| |||||||||| |    
T  42278762 ctaactgatagtaagtatgcacagccagagacctaacagtaagtcg-tgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattatatgacatttagg 42278860  T
Q  871 gatttgagattta 883  Q
    |||||||||||||    
T  42278861 gatttgagattta 42278873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 891 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 19050501 - 19050408
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  19050501 agggatttgagattcaatttagggatattgatttttgcttcaaggaccaaagtgatcattttatactttcactttagtccatgtgacacctcat 19050408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 891 - 981
Target Start/End: Original strand, 42391764 - 42391855
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatatga-tttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctc 981  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| | |||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  42391764 agggatttgagactcaatttgaagatatgaatttttagttcagggactaaagtgaccattttctactttcactttagtccatgtgacacctc 42391855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 810 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 19050563 - 19050488
Alignment:
Q  810 acagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaagagaattaaatgacatttatggatttgagatt 881  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    ||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  19050563 acagtaagttggtgtttaatggaaaattgattttgaacaaaaaagagatttagatggcatttagggatttgagatt 19050488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 929 - 983
Target Start/End: Original strand, 24745972 - 24746026
Alignment:
Q  929 tcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||    
T  24745972 tcagggaccaaagtgataattttctattttcactttagtctgtgtgacacctcat 24746026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 379 - 433
Target Start/End: Complemental strand, 24837537 - 24837483
Alignment:
Q  379 ctcgtgagcttaactttgttgacaggaacaatacataaaatatgtaagatctgtg 433  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  24837537 ctcgtgagcttaacttagttgatatgaacaatacataatatatgtcagagctgtg 24837483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 134; Significance: 3e-69; HSPs: 34)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 468 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 5929516 - 5929292
Alignment:
Q  468 ccttatgtttgaaattcttataggtttgagttgtttgggattcacaacaaagttgcatatataacaagataaatcacttggtttggtgattggaagccat 567  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  5929516 ccttatgcttgaaattcttttaggtttgagttgtgtgggattaacgacaaagttgcaaatataataagataatt-acttggcttggtgattggaagccat 5929418  T
Q  568 gagacttgatgccagttgcgggtctttcaatactcaatcatcctcggtttagagctcaatatcaccttaggtttgttgttcaaagttttatttgttttat 667  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||| ||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5929417 gagacttgaagcgagttgtgggtctttcagtacccattcatcctcggctttgagctcaatatcaccttaggtttgttgttcaaagtttaatttgttctat 5929318  T
Q  668 tcctttt-gaactttattgttgtgat 692  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5929317 tccttttggaactttattgttgtgat 5929292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5929834 - 5929621
Alignment:
Q  36 caatcaaggaaatattttgatttcaaaagttgataatataa---tcacatgttcttattgtttaatgatgaaaacatgaaaagacaagaaaccatttcaa 132  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5929834 caattaagaaaatatttttatttcaaaagttgataatgtaaatatcatatgttcttattgtttaatgatgaaaacatgaaaagacaagaaaccttttcaa 5929735  T
Q  133 aacatgtatcgtgacnnnnnnnnnnnnngatagataataaaccttttcaaactaacatattatgaccccaaaaggatttgggtacctaagaacaaaatca 232  Q
    ||||||| || ||||             || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  5929734 aacatgtctcatgacaaaaacaaa----gaaagataataaaccttttcaaactaacatattatgaccccaaaaggatttgggttcctaagaacaaaatta 5929639  T
Q  233 catgtgctgcatacttac 250  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5929638 catgtgctgcatacttac 5929621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 773 - 983
Target Start/End: Original strand, 7509208 - 7509424
Alignment:
Q  773 atctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaagaga----attaaatgacattta 868  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||| |||  ||| |||| |||| | |||||| |||| |||||||| |||||||||    ||||||||| |||||    
T  7509208 atctaactgatagtaagtatgcacagtcaaagacttaagagtacgttgatatttaatggaaggttgattttgaacaagagagtgaattaaatgatattta 7509307  T
Q  869 tggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtga-taattttctactttcaccttag 966  Q
     |||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||    
T  7509308 gggatttgagatttaggggtttagggatttgagattcaatttggggatattgatttttggtttagggaccaaagtgactatttttctactttcactttag 7509407  T
Q  967 tccctatgacacctcat 983  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  7509408 tccatatgacacatcat 7509424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Original strand, 10898832 - 10899044
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    |||||||| |||||||||| |    
T  10898832 ctaactgatactaagtatgcatagtcagggacctaacagtaagttg-tgtttaatggaagattaattttgaacaaatgagagaattagatgacatttagg 10898930  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    |||||||||| ||  |||| ||| |||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||| | || ||||    
T  10898931 gatttgagatgtaagaatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcaaggaccaaagtgaccattttctactttctctttggtcc 10899030  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  10899031 ctgtgacacctcat 10899044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 780 - 983
Target Start/End: Original strand, 45584260 - 45584467
Alignment:
Q  780 tgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaagagaattaaatgacatttatggattt 875  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  45584260 tgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttgatgtttaatggaagattgattttgatcaaaaaagataattagatgacatttagggattt 45584359  T
Q  876 gagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatatgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatga 975  Q
    ||||||||   ||| ||| |||||| |||| ||||| | ||||   |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| || |||| |||||    
T  45584360 gagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgattttggttcagggaccaaagtgaccattttctacattcactttggtccttatga 45584459  T
Q  976 cacctcat 983  Q
    ||||||||    
T  45584460 cacctcat 45584467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 42477744 - 42477532
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||| || ||||| ||||||| ||||| |||||    |||||||| |||||||||| |    
T  42477744 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacattaagttg-tgcttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttagg 42477646  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatatga-tttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    |||||||||||||   ||| ||| |||||| |||| || || | |||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  42477645 gatttgagatttaagtatttaggaatttgatattcaatatgggaatattagtttttggttcagggaccaaagtgatcattttctactttcactttggtcc 42477546  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  42477545 ctgtgacacctcat 42477532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Original strand, 48788434 - 48788643
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    |||||||||||||||   | |    
T  48788434 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacaataagttg-tgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattaaatgaca---agg 48788529  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  48788530 gatttgagatttaagaatttaggaatttgatattcaatttgtgaatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 48788629  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
     | |||||||||||    
T  48788630 ttgtgacacctcat 48788643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 732 - 983
Target Start/End: Original strand, 12223403 - 12223650
Alignment:
Q  732 ttgtcaaggaccttggtgagagaacatgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcg 831  Q
    |||||| ||||||| | ||||| ||||||||| || |  ||| ||||| |||| |||||||||| | |||| ||  ||| | |||||||||||||||| |    
T  12223403 ttgtcagggaccttagcgagagtacatgtttagtgtcagggacctaat-gatagtaagtatgcacattcagggacctaataataagttggtgtttaatgg 12223501  T
Q  832 aagattgattttaaac--aagag--aattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttg 926  Q
    |||||||||||| |||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||        |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  12223502 aagattgattttgaactaaagaggtaattagatgacatttatggatttga--------aatttagggatttgagattcaatttggggatattgatttttg 12223593  T
Q  927 ggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    | ||| ||| ||| |||| |||||| ||||||||| ||||| ||| ||||| |||||    
T  12223594 gttcaaggatcaaagtgacaattttttactttcactttagttcctgtgacaactcat 12223650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 781 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 7258632 - 7258427
Alignment:
Q  781 gataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa---gagaattaaatgacatttatggatttga 877  Q
    |||| |||||||||| ||| || ||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||  ||   |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7258632 gatagtaagtatgcacagttagggatctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaatttgaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttga 7258534  T
Q  878 gatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgac 976  Q
    ||||||   ||| ||| |||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  7258533 gatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtccctgtgac 7258434  T
Q  977 acctcat 983  Q
    |||||||    
T  7258433 acctcat 7258427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 35728062 - 35727850
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    |||||||| |||||||||| |    
T  35728062 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagtgatctaacaataaattg-tgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttagg 35727964  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    |||||||||||||| |||| ||  |||||| |||| ||||| | ||| |||||||||| | | ||| ||| ||||  |||||||||| |||| || ||||    
T  35727963 gatttgagatttaggaatttagaaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttaaaggatcaaagtgaccattttctactatcactttggtcc 35727864  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  35727863 ctgtgacacctcat 35727850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 689 - 884
Target Start/End: Original strand, 5929788 - 5929988
Alignment:
Q  689 tgatatttacattatccacttttgaaataaaaacatctt-tttattgtcaaggaccttggtgagagaacatgtttactggctaggatctaattgataata 787  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || || ||||||   |||||| |||| || |||||||||||  |  ||| | |||| ||| ||    
T  5929788 tgatatttacattatcaacttttgaaataaaaatattttcttaattgtcggtgaccttagtgaaagtacatgtttactctcagggaccaaattcatagta 5929887  T
Q  788 agtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattt----taaacaagagaattaaatgacatttatggatttgagattta 883  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||| |  |||||||||  |||| ||||||    | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5929888 agtatgcacagttagagatataatagtaaatgtgtgtttaatgaaagactgattttgaatgaaagagagaattaaatgacatttatggatttgagattta 5929987  T
Q  884 g 884  Q
    |    
T  5929988 g 5929988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 815 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 43457794 - 43457620
Alignment:
Q  815 aagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa------gagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccat 908  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||      |||||||| |||| ||||| || |||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||    
T  43457794 aagttggtgtttaattgatgattgattttgaacaaaagagagagaattagatgatatttaggggtttgagatttggtgatttaaggatttgagattcaat 43457695  T
Q  909 ttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  43457694 ttagggatattgatttttgg-tcagggaccaaagtgaccattttttactttcactttagtctctgtgacacctcat 43457620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 808 - 983
Target Start/End: Original strand, 48647234 - 48647414
Alignment:
Q  808 taacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagat 903  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    ||| ||||| |||| ||||| |||||| ||||||||  ||  |||||||||  ||    
T  48647234 taacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaatagataattagatgatatttaaggatttaagatttagggatatagggatttggtat 48647333  T
Q  904 tccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    || ||||| | ||| |||||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||    
T  48647334 tcaatttgggcatattgatttttggttcagggacgaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 48647414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 775 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 45583951 - 45583792
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaagagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    ||| |||| ||||| |||||||| | |    
T  45583951 ctaactgatagtaagtatgcatagtcagggacctaacagtaagttggtgtttaatggaagattgattttgatcaaaaaagataattagatgacattaaag 45583852  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggacc 937  Q
    ||||| ||||||        |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  45583851 gatttaagattt--------agggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagggacc 45583792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Original strand, 30924775 - 30924980
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaagagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    ||| |||| ||||| |||||||||| |    
T  30924775 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacaataggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacatttaag 30924874  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||| ||||||        |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||  || ||| ||||  ||||||||||||||| ||  ||     
T  30924875 gatttaagattt--------agggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcatagatcaaagtgaccattttctactttcactttgatca 30924966  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  30924967 ctgtgacacctcat 30924980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 849 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 44333424 - 44333289
Alignment:
Q  849 agagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataa 947  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||   ||| ||| |||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  44333424 agagaattagttgaaatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcagggaccaaagtgacca 44333325  T
Q  948 ttttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  44333324 ttttctactttcacgttggtccctgtgacacctcat 44333289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 815 - 983
Target Start/End: Original strand, 43461520 - 43461688
Alignment:
Q  815 aagttggtgtttaatcgaagattgattttaaac---aagagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttg 911  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||   |||||||||| ||||||     || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||      
T  43461520 aagttggtgtttaatggatgattgattttgaacgaaaagagaattagatgacag----gggtttgagatttagtgatttagggatttgagattcaattga 43461615  T
Q  912 aggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
     |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  43461616 gggatattgatttttggttcagggatcaaagtgaccattttttactttcactttagttcatgtgacacctcat 43461688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 786 - 961
Target Start/End: Complemental strand, 10894697 - 10894517
Alignment:
Q  786 taagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaagaga-attaaatgacatttatggatttgagat 880  Q
    |||||||||| ||||||| |  ||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||    ||| || ||| |||| |||||||||| | |||| ||||    
T  10894697 taagtatgcacagtcagatacctaacattagattggtgtttaatagaagattgattttgaaaaaaaaaaagatattagatgacatttaagaatttaagat 10894598  T
Q  881 ttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatatgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcac 961  Q
    ||    ||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||  |||||||||||||||    
T  10894597 tttcggatttagggatttgatattcaatttggggatatgatttttggtccagggactaaagtgaccattttctactttcac 10894517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 775 - 881
Target Start/End: Original strand, 33607275 - 33607385
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||    ||||||||| |||||||||| |    
T  33607275 ctaactgatagtaagtatgcaaagtcagggacctaacagtaggtaggtgtttaatggaagaatgattttaaacaaaagagagaattagatgacatttagg 33607374  T
Q  871 gatttgagatt 881  Q
    ||||| |||||    
T  33607375 gatttaagatt 33607385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 775 - 910
Target Start/End: Complemental strand, 48646413 - 48646274
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaa-atgacatttat 869  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||    ||||||||| ||||||||||     
T  48646413 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaagttg-tatttaatggaagattaattttgaacaaaaaagagaattaagatgacatttag 48646315  T
Q  870 ggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccattt 910  Q
    |||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||| ||||    
T  48646314 ggatttgagatttagggatttaggaatttgatattcaattt 48646274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 780 - 961
Target Start/End: Complemental strand, 39708481 - 39708303
Alignment:
Q  780 tgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttatggattt 875  Q
    ||||| ||||||| || |||||| ||  ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||    ||||||||| |||||||||| | ||||    
T  39708481 tgatagtaagtatacacagtcagggacctaacagtaagttaatgtttaatggaagatcgattttgaacaaaagagagaattagatgacatttaagaattt 39708382  T
Q  876 gagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcac 961  Q
     ||||||        |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| | |||| |||| ||||  |||||||||||||||    
T  39708381 aagattt--------agggatttgaaattcaatttgagaatattgatttttggtttagggtccaaagtgaccattttctactttcac 39708303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 379 - 428
Target Start/End: Original strand, 2622322 - 2622371
Alignment:
Q  379 ctcgtgagcttaactttgttgacaggaacaatacataaaatatgtaagat 428  Q
    |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  2622322 ctcgtgagcttagcttagttgataggaacaatacataatatatgtaagat 2622371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 891 - 983
Target Start/End: Original strand, 44334328 - 44334421
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||| | ||||| |||||    
T  44334328 agggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcatggaccaaagtgactattttctactttcactttggtccatgtgacatctcat 44334421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 758 - 983
Target Start/End: Original strand, 7259434 - 7259655
Alignment:
Q  758 tgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaagaga 853  Q
    ||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  ||| | ||  ||| |||||||| |||||||||||||    ||| |||| |    
T  7259434 tgtttactgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaataatagattgatgtttaatagaagattgattttgagcaaaaaagata 7259533  T
Q  854 attaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatatga-tttttgggtcagggaccaaggtgataattttc 952  Q
    |||| | |||||||| |||||| ||||||||        |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||    
T  7259534 attagaggacatttaaggatttaagatttag--------ggatttgatattcaatttggggatattaatttttggttcagggaccaaagtgaccattttc 7259625  T
Q  953 tactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    || |||||| || |||| | |||||||||||    
T  7259626 ta-tttcactttggtccttgtgacacctcat 7259655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 780 - 884
Target Start/End: Complemental strand, 34707973 - 34707864
Alignment:
Q  780 tgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaa-tcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatggatt 874  Q
    ||||| |||||||||||| |||  ||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||    |||||||| |||||||||| | |||    
T  34707973 tgatagtaagtatgcataatcatggatcttatagtaagttggtgtttaaatggaaaattgattttgaacaaaagagagaattatatgacatttaagaatt 34707874  T
Q  875 tgagatttag 884  Q
    ||||||||||    
T  34707873 tgagatttag 34707864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 810 - 983
Target Start/End: Original strand, 35728887 - 35729057
Alignment:
Q  810 acagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaagaga----attaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattc 905  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| |||    |||| |||||||||| |||||| ||||||||        |||||| | ||||    
T  35728887 acagtaggttgcagtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagatgacatttaaggatttaagatttag--------ggatttaatattc 35728978  T
Q  906 catttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
     ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||| || |||| ||| |||||||||    
T  35728979 aatttgggaatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccactttctactttcactttggtccatataacacctcat 35729057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 891 - 969
Target Start/End: Complemental strand, 2677181 - 2677102
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||| | ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2677181 agggatttgagatttaatttagggatattgatttttagttcagggaacaaagtgatcattttctactttcactttagtcc 2677102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 920 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 24287715 - 24287652
Alignment:
Q  920 atttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||| |||||||| || | ||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24287715 atttttggttcagggactaaagcgaccattttctactttcactttagtccctgtgacacctcat 24287652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 895 - 969
Target Start/End: Original strand, 24935575 - 24935649
Alignment:
Q  895 atttgagattccatttgaggatatgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||| | ||||||| ||| |||| | |||| ||||||||| |||||||    
T  24935575 atttgagattcaatttggtgatatgatttttagttcagggatcaaagtgacatttttttactttcactttagtcc 24935649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 447
Target Start/End: Original strand, 31890172 - 31890210
Alignment:
Q  409 atacataaaatatgtaagatctgtgattcaaactccggc 447  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31890172 atacataacatatgtaagatccgtgattcaaactccggc 31890210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 380 - 426
Target Start/End: Original strand, 42313439 - 42313485
Alignment:
Q  380 tcgtgagcttaactttgttgacaggaacaatacataaaatatgtaag 426  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42313439 tcgtgagcttagtttagttgacaggaacaatacataatatatgtaag 42313485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 740 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 32793568 - 32793459
Alignment:
Q  740 gaccttggtgagagaacatgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattga 839  Q
    |||||||||||||  ||||||||| || |   ||||||| ||||| |||||||||| | |||||||  ||  | ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  32793568 gaccttggtgagaatacatgtttagtgtcagagatctaactgatagtaagtatgcacaatcagagacttacaaataagttggtatttaatgaaagattga 32793469  T
Q  840 ttttaaacaa 849  Q
    |||| |||||    
T  32793468 ttttgaacaa 32793459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 891 - 983
Target Start/End: Original strand, 33607372 - 33607465
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||  || ||||||| ||||  | ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  33607372 agggatttaagattcaatttggggatattgatttttggtccaaggaccaaagtgaccaatttttactttcactttagtccatttgacacctcat 33607465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 859 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 48777534 - 48777409
Alignment:
Q  859 atgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccattt-gaggatatgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactt 957  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||  ||| |||||||||| |||| |||| | ||||||   |||||| ||||| | ||| ||||  |||||||| ||    
T  48777534 atgacatttaaggatttaaaatttagggatttagggatttgaaattcaattttggggatattgattttggttcaggaatcaaagtgaccattttctattt 48777435  T
Q  958 tcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||| || |||||| |||||||||||    
T  48777434 tcactttggtccctgtgacacctcat 48777409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 97; Significance: 4e-47; HSPs: 25)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 6612795 - 6612582
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| |    
T  6612795 ctaactgatagtaagtatgcacagttaaagatcaaacagtaagttggtgtttaatggaagattgattttaaacaaaaaagagaattagatgacatttagg 6612696  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||| |  |||||||    
T  6612695 gatttgagatttaggaatttagggatttgagattcaatttggggatattgatttttggttcaaggacaaaagtgatcattttctactttgaatttagtcc 6612596  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  6612595 ctgtgacacctcat 6612582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 747 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 51450413 - 51450172
Alignment:
Q  747 gtgagagaacatgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaa 846  Q
    ||||||| ||||||||||||    ||| |||| ||||| |||||||||| | | |||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  51450413 gtgagagtacatgtttactgttagggacctaactgatagtaagtatgcacactaagagacctaatagtaagttggtgtttaatggaagattgattttgaa 51450314  T
Q  847 ca----agagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaagg 941  Q
    ||    ||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||  | |||||||||||| | ||| ||||| | |||||||| ||| |||| |  |    
T  51450313 caaaagagataattagatgacacttacggatttgagatttagaaattttgagatttgagattcaagttggggatatttatttttggttcatggactatag 51450214  T
Q  942 tgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  51450213 tgatcattttctactttcagtttagtccctgtgacacctcat 51450172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 774 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 52439827 - 52439613
Alignment:
Q  774 tctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaagagaattaaatgacatttat 869  Q
    ||||||||||| |||||||||  |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    ||| |||| ||||| ||||||||||     
T  52439827 tctaattgatagtaagtatgcgcagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacatttaa 52439728  T
Q  870 ggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtc 968  Q
    |||||| | ||||||  ||| ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||| ||||  ||||||||||||||| || |||    
T  52439727 ggatttaaaatttagggatttaggaatttgatattcaatttgaggatattgatttttggtttagggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtc 52439628  T
Q  969 cctatgacacctcat 983  Q
    | | |||||| ||||    
T  52439627 cttgtgacacatcat 52439613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 808 - 982
Target Start/End: Original strand, 52440352 - 52440530
Alignment:
Q  808 taacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagat 903  Q
    ||||| ||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||| ||| |||||| ||    
T  52440352 taacactaagttg-tgtttaatgaaagattaattttaaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatat 52440450  T
Q  904 tccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctca 982  Q
    || ||||| | ||| | |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || | |||| ||||||||||    
T  52440451 tcaatttgggaatacttatttttggttcagggaccaaagtgactattttctactttcactttggcccctgtgacacctca 52440530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 891 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 25038146 - 25038053
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  25038146 agggatttgagattcaatttagggatattgatttttggttcagggaccaaagtgataattttctactttcactttagttcatgtgacacctcat 25038053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 891 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 25043358 - 25043265
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  25043358 agggatttgagattcaatttagggatattgatttttggttcagggaccaaagtgataattttctactttcactttagttcatgtgacacctcat 25043265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 971
Target Start/End: Original strand, 6613723 - 6613926
Alignment:
Q  758 tgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gaga 853  Q
    ||||||||| |  ||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||  ||||    ||||    
T  6613723 tgtttactgtcgtggacctaactgataataagtatgcataatcagggacttaatagtaagttgatgtttaatagaaaattgattttgtacaaaagagaga 6613822  T
Q  854 attaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttc 952  Q
    |||| |||||||||| ||||||               ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||| |    
T  6613823 attatatgacatttaaggattt---------------agggatttgagattcaatttggggatattgatttttggttcagggaacaaagtaataatttcc 6613907  T
Q  953 tactttcaccttagtccct 971  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  6613908 tactttcactttagtccct 6613926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 775 - 883
Target Start/End: Original strand, 7945333 - 7945444
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    |||||||| |||||||||| |    
T  7945333 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacaataagttg-tgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattatatgacatttagg 7945431  T
Q  871 gatttgagattta 883  Q
    |||||||||||||    
T  7945432 gatttgagattta 7945444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 808 - 983
Target Start/End: Original strand, 32665568 - 32665741
Alignment:
Q  808 taacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagat 903  Q
    |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||        |||||||| ||    
T  32665568 taacagtaggttggtgttgaatagaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacatttaaggatttaagatttag--------ggatttgatat 32665659  T
Q  904 tccatttgaggatat-gatttttgggt-cagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    || ||||| |||||| |||||||| || |||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||| | |||||||||||    
T  32665660 tcaatttggggatattgatttttgtgttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtccttgtgacacctcat 32665741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 775 - 978
Target Start/End: Original strand, 34088217 - 34088415
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||||||  |||||| | ||||||| ||||| |||||    |||||||| || |||||||      
T  34088217 ctaactgatagtaagtatgcacagtcaga--tctaacagtaagttaatgtttagtggaagattaattttgaacaaaagagagaattagataacatttaat 34088314  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||||||||||||        |||||||| |||| ||||| |||||| || |||| | ||||||||||| |||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  34088315 gatttgagatttag--------ggatttgaaattcaatttggggatattgaatttttgttcagggaccaaagtgacacatttctactttcactttagtcc 34088406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 891 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 7944400 - 7944307
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  | |||||||||||    
T  7944400 agggatttgatattcaatttggggatattgatttttggtccagggaccaaagtgataattttctactttcactttggtctatgtgacacctcat 7944307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 887 - 1002
Target Start/End: Complemental strand, 22856947 - 22856834
Alignment:
Q  887 attcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcatgg 985  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| || || ||||| ||||||||||||||| |||||  || |||||||||||      
T  22856947 attcaaggatttgagattcaatttgaggatattgaattttggttcaggaactaaagtgatcattttctactttcactttagt--ctgtgacacctcat-a 22856851  T
Q  986 tgccacgtcatcgtaaa 1002  Q
    ||||| |||||||||||    
T  22856850 tgccatgtcatcgtaaa 22856834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 891 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 9339891 - 9339798
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  9339891 agggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagagaccaaagtgaccattttctactttcactttggtccctgtgacatctcat 9339798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 32664866 - 32664655
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| | |||| ||  ||||||||||  | ||||||||  |||||| |||||||||||    ||||||||||| | ||||| |    
T  32664866 ctaactgatagtaagtatgcacaatcagggacctaacagtaagccg-tgtttaatgaaagattaattttaaacaaaagagagaattaaatcagatttagg 32664768  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    |||||||||||||   ||| ||| |||||| |||| ||||| | ||| |||||||||  |||  |||||| ||||  ||||||||||||||  || ||||    
T  32664767 gatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttgattca-agaccaaagtgactattttctactttcattttggtcc 32664669  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  32664668 ctttgacacctcat 32664655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 775 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 34085892 - 34085813
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaagagaa 854  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||||| ||||    
T  34085892 ctaactgatagtaaatatgcatagtcaaggatataacagtaagttgttgattaaaggaagattgattttgaacaaaagaa 34085813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 891 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 39977597 - 39977503
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcatg 984  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || || ||||||||| |  || ||||||| | ||||||||||||    
T  39977597 agggatttgcgattcaatttgaggatattgatttttggttcagagaccaaagttatcattttctacatctactttagtccttgtgacacctcatg 39977503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 920 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 1407863 - 1407802
Alignment:
Q  920 atttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctc 981  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  1407863 attttcggttcaaggaccaaagtgataattttctactttcactttagtccatgtgacacctc 1407802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 922 - 983
Target Start/End: Original strand, 9340935 - 9340996
Alignment:
Q  922 ttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  9340935 ttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtccctgtgacacctcat 9340996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 918 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 29766160 - 29766095
Alignment:
Q  918 tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||    
T  29766160 tgattttttgttcagggaccaaagtgacaattttctattttcactttagtaactatgacacctcat 29766095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 775 - 875
Target Start/End: Original strand, 9340799 - 9340902
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    ||| ||||| |||||||||| |    
T  9340799 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaagtt-gtgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagaaaattagatgacatttagg 9340897  T
Q  871 gattt 875  Q
    |||||    
T  9340898 gattt 9340902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 891 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 16249908 - 16249814
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcatg 984  Q
    |||||||| |||||| ||||  |||||| |||||| || |||||||| ||  |||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  16249908 agggatttaagattcaatttagggatattgattttcggttcagggactaaaatgaccattttctactttcactttagcccctatgacagctcatg 16249814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 376 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 16475980 - 16475930
Alignment:
Q  376 gttctcgtgagcttaactttgttgacaggaacaatacataaaatatgtaag 426  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  16475980 gttctcgtgagtttaacttagttggtaggaacaatacataatatatgtaag 16475930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 891 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 3117914 - 3117821
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatatga-tttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||| ||| |||| ||  |||| ||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||    
T  3117914 agggatttgatattcaatttggggatattaatttttggttcaaggactaaaatgatcattttctactttcactttagtcattgtgacacctcat 3117821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 918 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 8975396 - 8975331
Alignment:
Q  918 tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  8975396 tgatttttggtttcgggaccaaagtgaccattttctactttcactttagtccctgtgacatctcat 8975331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 895 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 34085783 - 34085694
Alignment:
Q  895 atttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||| | | ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  34085783 atttgaaattcaatttggggatattgatttttggttcaagcatcaaagtgatcattttctactttcattttagtccctatgtcacatcat 34085694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 82; Significance: 4e-38; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 758 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 32765319 - 32765089
Alignment:
Q  758 tgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gaga 853  Q
    ||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||    || |    
T  32765319 tgtttactgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttgctgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagata 32765220  T
Q  854 attaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttc 952  Q
    |||| |||||||||| |||||| | ||||||  ||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||    
T  32765219 attagatgacatttaaggatttaaaatttagggatttagggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagggaccaaagcgaccattttc 32765120  T
Q  953 tactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32765119 tactttcactttagtccctatgacacctcat 32765089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 24458425 - 24458212
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaagagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| |||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    ||| |||| ||||| |||||||||| |    
T  24458425 ctaactgatagtaagtatgcacagtaagagacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacatttaag 24458326  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||| | ||||||  ||| |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  24458325 gatttaaaatttagggatttagggatctgatattcaatttgaggatattgatttttgattgagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 24458226  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  24458225 ctgtgacacctcat 24458212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 785 - 983
Target Start/End: Original strand, 2911256 - 2911458
Alignment:
Q  785 ataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatggatttgagat 880  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    |||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  2911256 ataagtatgcacagtcagagacctaacagtaagttg-tgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttaggaatttgagat 2911354  T
Q  881 ttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacc 979  Q
    |||   ||| ||| |||||| |||| |||||   |||| ||||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  2911355 ttaaggatttaggaatttgatattcaatttggaaatattgatttttggttaagagaccaaagtgacaattttctactttcactttggttcctatgacacc 2911454  T
Q  980 tcat 983  Q
    ||||    
T  2911455 tcat 2911458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 758 - 960
Target Start/End: Complemental strand, 2910482 - 2910275
Alignment:
Q  758 tgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaagaga 853  Q
    ||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||    |||||||| |    
T  2910482 tgtttactgtcagggacctaactgatattaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatgtaagattgattttgaacaaacaagata 2910383  T
Q  854 attaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttc 952  Q
    | || |||||||||| |||||||| |||||   ||| ||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||    
T  2910382 actagatgacatttaaggatttgaaatttacggatttagggattcgatattcaatttggggatattgatttttggttcatggaccaaagtgatcattttc 2910283  T
Q  953 tactttca 960  Q
     |||||||    
T  2910282 gactttca 2910275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 808 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 39015336 - 39015157
Alignment:
Q  808 taacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagat 903  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||  || |||||| ||    
T  39015336 taacaataagttg-tgtttaatggaagattaattttaaacaaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttagggattttggaatttgatat 39015238  T
Q  904 tccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    || ||||| | |||| ||||||||| ||| |||||||  |||  ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  39015237 tcaatttgggaatattgatttttggttcaaggaccaaactgaccattttctactttcactttggtccctgtgacacctcat 39015157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 786 - 983
Target Start/End: Original strand, 40000105 - 40000306
Alignment:
Q  786 taagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatggatttgagatt 881  Q
    ||||||| ||||||||| ||   | |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||    |||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  40000105 taagtatacatagtcagggaccgatcagtaagttg-tgtttaatgaaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacacttatggatttgagatt 40000203  T
Q  882 tagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacct 980  Q
    ||   ||| ||  |||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  40000204 taaggatttagaaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcaaggaccaaagtgatcattttctactttcactttggtccctctgacacct 40000303  T
Q  981 cat 983  Q
    |||    
T  40000304 cat 40000306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 758 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 31090539 - 31090321
Alignment:
Q  758 tgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gaga 853  Q
    ||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||  |  ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    || |    
T  31090539 tgtttactgtcagggacctaaatgatagtaagtatgcacagtcaggaacctaatagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagggata 31090440  T
Q  854 attaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttc 952  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  |||||  ||| | |||||||| |||| ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||| | |   ||||||    
T  31090439 attagatgacatttatggatttaaattttagggatttaaggatttgatattcaatttggggatattaatttttggttcagggaccaaagcggccattttc 31090340  T
Q  953 tactttcaccttagtccct 971  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  31090339 tactttcactttggtccct 31090321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Original strand, 31091286 - 31091498
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||| |||||    |||||||| |||||||||| |    
T  31091286 ctaactgatagtaagtatgcgcagtcagagatctaacagtaagttg-tgtttaatgaatgattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttacg 31091384  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    |||||||||||||   ||| ||| |||||| |||| || |  | ||| |||||||||| |||  |||||| ||||  ||||||||||||||| || |||     
T  31091385 gatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatctcggaatattgatttttggttcaaagaccaaagtgaccattttctactttcactttggtct 31091484  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  31091485 ctgtgacacctcat 31091498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 14704361 - 14704157
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaagaga----attaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| || ||  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |    |||| |||||||||| |    
T  14704361 ctaactgatagtaagtatgcacagt-agggaactaacaataggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaatataattagatgacatttaag 14704263  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||| ||||||||        |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  14704262 gatttaagatttag--------ggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcatggaccaaagtgactattttctactttcactttggtcc 14704171  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  14704170 ctgtgacacctcat 14704157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Original strand, 24459213 - 24459425
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaagaga----attaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||  ||| || ||  ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||| |||    |||| | |||||||| |    
T  24459213 ctaactgatagtaagtatgcgcagttagggacctaacagtaagttg-tgtttaatgaaagattaattttgaacaaaagagataattagacgacatttagg 24459311  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||| |||||||   ||| | | |||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  24459312 gatttcagatttaaggatttacgaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcagggatcaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 24459411  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    ||||||||||||||    
T  24459412 ctatgacacctcat 24459425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 815 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 7073976 - 7073805
Alignment:
Q  815 aagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccattt 910  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||| ||| |    |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| ||||    
T  7073976 aagttgatgtttaatggatgattgattttgaacgaaagagagaattagatgatatttagggatttgagatatagtgatttaaggatttgagattcaattt 7073877  T
Q  911 gaggatat--gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacct 980  Q
      | ||||   |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||| | ||||||||| ||||||||    
T  7073876 aggaatattgaatttttggttcagggaccaaagtgatcattttttattttcgctttagtccctgtgacacct 7073805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 775 - 883
Target Start/End: Original strand, 32766039 - 32766150
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaagaga----attaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||    ||||||||||||||| |    
T  32766039 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacaataagttg-tgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagaaaattaaatgacatttagg 32766137  T
Q  871 gatttgagattta 883  Q
    |||||||||||||    
T  32766138 gatttgagattta 32766150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 815 - 983
Target Start/End: Original strand, 17330017 - 17330190
Alignment:
Q  815 aagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccattt 910  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||| |||||    |||||||| |||||||| | || ||||| ||||||  ||| |  |||||||||||| ||||    
T  17330017 aagttggtgtttaatggatgcttggttttgaacaaaagagagaattatatgacattcaggggtttgaaatttagggatttaatgatttgagattcaattt 17330116  T
Q  911 gaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
      |||||| |||||| || ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  17330117 agggatattgattttgggttcagggaccaaagtgaccattttttactttcactttagtctctgtgacacctcat 17330190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 891 - 970
Target Start/End: Complemental strand, 21732360 - 21732280
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatatga-tttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccc 970  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  21732360 agggatttgagattcaatttggggatattaatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttagtccc 21732280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 893 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 33162031 - 33161940
Alignment:
Q  893 ggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||    
T  33162031 ggatttgagattcgatttggggatatcgatttttggttcagggactaaagtgatgattttctactttcattttagtctttgtgacacctcat 33161940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 891 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 31442596 - 31442502
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcatg 984  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| || ||||||||||| ||| | |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31442596 agggatttgagattcaatttagggatattgattttcggttcagggaccaatgtgttcatttttgactttcactttagtccttatgacacctcatg 31442502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 918 - 983
Target Start/End: Original strand, 39016289 - 39016354
Alignment:
Q  918 tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||    
T  39016289 tgatttttggttcagggaccaaagtgacaattttctactttcactttggtccatgtgacacctcat 39016354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 895 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 43380828 - 43380739
Alignment:
Q  895 atttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||    
T  43380828 atttgaaattcaatttggggatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttagttcatgtgacacctcat 43380739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 775 - 877
Target Start/End: Original strand, 38984750 - 38984857
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaat-cgaagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttat 869  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||    ||||||||| ||||||||||     
T  38984750 ctaactgataataagtatgcacaatcaaagatctaacaataagttggtgtttaatgaaaagatttattttgaacaaaagagagaattagatgacatttac 38984849  T
Q  870 ggatttga 877  Q
    ||||||||    
T  38984850 ggatttga 38984857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 858 - 978
Target Start/End: Original strand, 5914857 - 5914978
Alignment:
Q  858 aatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctact 956  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  ||| || ||||| |||||| |  || ||||| |||||||||| |||||||| || |||| |||||| ||||    
T  5914857 aatgacatttaggaatttgagatttagggatttagagattttagattcaagctggggatattgatttttggttcagggactaaagtgacaattttttact 5914956  T
Q  957 ttcaccttagtccctatgacac 978  Q
    ||||  |||||| || ||||||    
T  5914957 ttcattttagtctctgtgacac 5914978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 918 - 983
Target Start/End: Original strand, 12746086 - 12746152
Alignment:
Q  918 tgatttttgggtc-agggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||| |||| ||||| |||  |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  12746086 tgatttttcggtctagggatcaaaatgatcattttctactttcactttagtccctgtgacacctcat 12746152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 918 - 984
Target Start/End: Original strand, 31443131 - 31443197
Alignment:
Q  918 tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcatg 984  Q
    ||||||| || ||||| |||||  ||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  31443131 tgattttcggttcaggaaccaaaatgacaattttctactttcactttagtcactgtgacacctcatg 31443197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 808 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 43380896 - 43380855
Alignment:
Q  808 taacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa 849  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  43380896 taacagtaagttggtgtttaatggaatattgattttgaacaa 43380855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Original strand, 32898203 - 32898416
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaagagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    ||| |||| ||||| |||||||||| |    
T  32898203 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgatattgaacaaaaaagataattagatgacatttaag 32898302  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||| | ||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  32898303 gatttaaaatttagggatttagggatttgatattcaatttgaggatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 32898402  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
     | |||||||||||    
T  32898403 ttgtgacacctcat 32898416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 772 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 5737229 - 5737014
Alignment:
Q  772 gatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacattt 867  Q
    ||||||||||||| |||||| | | |||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||    |||||||| |||||||||    
T  5737229 gatctaattgatagtaagta-gtacagtcagggacctaacaataagttggtgtttaatggaagattaattttgaaaaaaagggagaattagatgacattt 5737131  T
Q  868 atggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata--tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcacctta 965  Q
    | |||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||    
T  5737130 agggatttcagatttagagatttaaggatttgagattcaatttggggatatttgatttttggatcagggaccaaagtgataa-tttctacttttacttta 5737032  T
Q  966 gtccctatgacacctcat 983  Q
    |||| | |||||||||||    
T  5737031 gtccttgtgacacctcat 5737014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 732 - 961
Target Start/End: Original strand, 5965137 - 5965371
Alignment:
Q  732 ttgtcaaggaccttggtgagagaacatgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcg 831  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||  |  ||| |||||||||| |||||||||| |||||  ||  ||||| |||||||||||||||| |    
T  5965137 ttgtcagggaccttagtgagagtacatgtttactctcagggacctaattgatagtaagtatgcacagtcatggacttaacactaagttggtgtttaatgg 5965236  T
Q  832 aagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttg 926  Q
    |||||||||||| ||||    ||| ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| |||| || ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||     
T  5965237 aagattgattttgaacaaaagagataattagatgacacttagggatttaagatttaggaatttagagatttgaaattcaatttgtggatattgattttta 5965336  T
Q  927 ggtcagggaccaaggtgataattttctactttcac 961  Q
      |||  ||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  5965337 cttcatagaccaaaatgacaattttctactttcac 5965371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 775 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 35177758 - 35177551
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||    || |||||  ||||||||| |    
T  35177758 ctaactgatagtaagtatgcatagtcagggacctaacaataggttggtgttta-tagaagattgattttgaacaaaaaagataattaggtgacatttaag 35177660  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||||||| || ||||    
T  35177659 gatttaagatttaggaatttagggatttgatattcaatttggggatactgatttttggttcagggaccaaagtaaccattttctactttcactttggtcc 35177560  T
Q  970 ctatgacac 978  Q
     | ||||||    
T  35177559 ttgtgacac 35177551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Original strand, 35178564 - 35178776
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||| || ||  |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    |||||||| |||||||||| |    
T  35178564 ctaattgatagtaaatatgcacagtgagggacctaacggtaagttg-tgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttagg 35178662  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||| |||||||   ||| | | |||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||| |||||| || ||||    
T  35178663 gattttagatttaaggatttaagaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcaggggccaaagtgatcattttctagtttcactttggtcc 35178762  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    ||||||||||||||    
T  35178763 ctatgacacctcat 35178776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 817 - 983
Target Start/End: Original strand, 1952778 - 1952941
Alignment:
Q  817 gttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaagaga----attaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttga 912  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||    |||| |||||||||| |||||| ||||||||        |||||||| |||| |||||     
T  1952778 gttgttgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagataattagatgacatttaaggatttaagatttag--------ggatttgatattcaatttgg 1952869  T
Q  913 ggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1952870 gcatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtccctatgacacctcat 1952941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 775 - 959
Target Start/End: Original strand, 28619291 - 28619479
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaagagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| |||||  ||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||    ||| |||||||||| |||||||||| |    
T  28619291 ctaaatgatagtaagtatgcacagttagagacctaatagtaagttg-tgtttaatgaaagattgatttttaataaaaaagagaattagatgacatttagg 28619389  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttc 959  Q
     |||||  ||||||  ||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||  || ||||| |||||||||||||    
T  28619390 aatttgcaatttagggatttagggatttgaaattcaatttggggatattgatttttggttcatggattaaagtgatcattttctactttc 28619479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 776 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 32563937 - 32563828
Alignment:
Q  776 taattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttatgg 871  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||  ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||    ||||||||| ||| |||||| ||    
T  32563937 taattgatattaagtatgcacaatcatggatctaacagtaagttagtgtttaatagaagattaattttgaacaaaagagagaattagatggcatttaggg 32563838  T
Q  872 atttgagatt 881  Q
    ||||||||||    
T  32563837 atttgagatt 32563828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 918 - 981
Target Start/End: Complemental strand, 45476399 - 45476336
Alignment:
Q  918 tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctc 981  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| || |||||||||    
T  45476399 tgatttttggttcagggaccaaagtgacaattttctactttcactttggtctctgtgacacctc 45476336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 917 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 31074232 - 31074166
Alignment:
Q  917 atgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  31074232 atgattttcaggtcagggaccaaagtgatcattttctattttcactttagtccccgtgacacctcat 31074166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 894 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 41121367 - 41121277
Alignment:
Q  894 gatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || | | |||||||||    
T  41121367 gatttgaaattcaatttggggatattgatttttggttcaaggaccaaagtgacaattttctactttcactttagcccttgttacacctcat 41121277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 812 - 983
Target Start/End: Original strand, 5737808 - 5737974
Alignment:
Q  812 agtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaagaga----attaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattcca 907  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| |||    |||| ||||||||||  ||||||||||||||        ||||||||||||| |    
T  5737808 agtaagttgatgtttaatggaatattgattttgaacaaaagagataattagatgacattta--gatttgagatttag--------ggatttgagattcaa 5737897  T
Q  908 tttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||| ||||| |||||||||  | || |||||| ||||  ||||| |||||| || ||||||| | |||||||||||    
T  5737898 tttggggatattgatttttgatttagagaccaaagtgaccattttttacttttactttagtccatgtgacacctcat 5737974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 894 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 8569650 - 8569559
Alignment:
Q  894 gatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcatg 984  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||  |||||||||| | ||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  8569650 gatttgagattcaatttgtggatattgatttttagttcagggatcaaaatgataattttttcctttcattttagtccatgtgacacctcatg 8569559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 909 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 41754215 - 41754140
Alignment:
Q  909 ttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41754215 ttgaggatattgattttcgattcagggaccaaagtgactattttttactttcactttagtccctatgacacgtcat 41754140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 893 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 30134829 - 30134743
Alignment:
Q  893 ggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacac 978  Q
    |||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  30134829 ggatttgaaattcaatttgtgaatattgatttttggttaaaggaccaaagtgacaattttctactttcactttagtctctgtgacac 30134743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 918 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 10406423 - 10406358
Alignment:
Q  918 tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||||| |||| || |||||| |||||||||||    
T  10406423 tgatttttggttcagagaccaaagtgactattttctactatcactttggtccctgtgacacctcat 10406358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 747 - 824
Target Start/End: Complemental strand, 30134928 - 30134851
Alignment:
Q  747 gtgagagaacatgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgt 824  Q
    ||||||| |||||||| ||| |  ||| |||| ||||| |||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    
T  30134928 gtgagagtacatgtttgctgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacaatcagagacctaacagtaagttggtgt 30134851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 16)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 756 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 55388445 - 55388211
Alignment:
Q  756 catgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa------ 849  Q
    ||||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||| ||||||  |  |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||          
T  55388445 catgtttactgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcaggaacttaacagtaggttggtgtttaatagaatattgattttgaacaaaaaaaa 55388346  T
Q  850 gagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataat 948  Q
    || ||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||    
T  55388345 gataattagatgacatttaaggatttaagatttaggaatttagggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccat 55388246  T
Q  949 tttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| ||||    
T  55388245 tttctactttcactttggtccctgtgacacatcat 55388211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 17700883 - 17700671
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    |||||||| |||||||||| |    
T  17700883 ctaactgatagtaagtatgtacagtcagggacctaacagtaagttg-tgtttaatggaagattaattttgaacaaaatagagaattatatgacatttaag 17700785  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||||| |||| ||||  |  || |||||||| | ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  17700784 gatttgagatttaagaatttaggaatttgatattcaattttggattattgattttttgttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 17700685  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  17700684 ctgtgacacctcat 17700671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Original strand, 48574217 - 48574430
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  ||||| || ||| ||||||||| || |||||||||| |||||    || ||||| |||||||||| |    
T  48574217 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacaataggttagtgtttaatggatgattgattttgaacaaaaaagataattatatgacatttaag 48574316  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||| ||||||||  ||| || ||||||| |||| ||||| |||||| || |||||| ||| |||| || ||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  48574317 gatttaagatttagggatttagagatttgatattcaatttggggatattgaattttggttcaaggactaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 48574416  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  48574417 ctgtgacacctcat 48574430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Original strand, 55389228 - 55389440
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| ||| |||||| |||||| ||  ||| ||||||||| |||||||| ||| ||| ||||| |||||    |||||||| |||||||||| |    
T  55389228 ctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacctaagagtaagttg-tgtttaatggaatattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatttagg 55389326  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    |||||||||||||   ||| ||| |||||| |||| ||||| | |||| |||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  55389327 gatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgattttcggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 55389426  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  55389427 ctgtgacacctcat 55389440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 36279309 - 36279104
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaagagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    ||| |||| ||||| ||||| |||| |    
T  36279309 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaagataattagatgacttttaag 36279210  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||| ||||||        |||||||||| |||| ||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  36279209 gatttaagattt--------agggatttgatattcaatttggggatatttttttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 36279118  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  36279117 ctgtgacacctcat 36279104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 48573352 - 48573137
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttg--gtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacattta 868  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||| ||  |||||||||||||  ||||||||| |||| || ||||| || ||    |||||||| ||||||||||    
T  48573352 ctaactgatagtaagtatgtacagtcagggacctaacagtaagttgttgtgtttaatggaaggttaattttgaataaaagagagaattagatgacattta 48573253  T
Q  869 tggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagt 967  Q
     ||||||||||||||  |||| ||| |||||| |||| ||||  | |||| ||||||||| ||| ||| ||| ||||  ||||||||||||||| || ||    
T  48573252 gggatttgagatttaagaatttaggaatttgatattcaattttggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgaccattttctactttcactttggt 48573153  T
Q  968 ccctatgacacctcat 983  Q
    |||| |||||||||||    
T  48573152 ccctgtgacacctcat 48573137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Original strand, 36280076 - 36280288
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| ||| |||||| |||||| ||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    ||||||||||||||||||| |    
T  36280076 ctaactgatagtaattatgcacagtcagggacctaacattaagttg-tgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattaaatgacatttagg 36280174  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    |||||||||||||   ||| ||| |||||| |||| ||||| | ||| |||||||||| | |||||| || ||||  ||||||| ||||||  || ||||    
T  36280175 gatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggtttagggactaaagtgaccattttcttctttcattttggtcc 36280274  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
     | |||||||||||    
T  36280275 gtgtgacacctcat 36280288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 756 - 983
Target Start/End: Original strand, 52318064 - 52318288
Alignment:
Q  756 catgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaaga 851  Q
    ||||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||| ||| | |||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    ||| ||||    
T  52318064 catgtttactgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagttaaagacctaacaataggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaaga 52318163  T
Q  852 gaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattt 950  Q
     ||||| |||||||||| |||||| ||||||        |||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||  ||||    
T  52318164 taattagatgacatttaaggatttaagattt--------agggatttgatattcaatttggggatattgttttttggttcatggaccaaagtgaccattt 52318255  T
Q  951 tctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||||||||| || | || | |||||||||||    
T  52318256 tctactttcactttggaccttgtgacacctcat 52318288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 758 - 945
Target Start/End: Original strand, 17701669 - 17701862
Alignment:
Q  758 tgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt-----aaacaagag 852  Q
    ||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||     ||| ||||     
T  17701669 tgtttactgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattaattttataacaaaaaagat 17701768  T
Q  853 aattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgat 945  Q
    ||||  ||||||| || |||||| |||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  17701769 aattgtatgacatgtaaggatttaagatttaggaattttgggatttgatattcaatttgggaatattgatttttgcttcagggaccaaagtgat 17701862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 849 - 983
Target Start/End: Original strand, 48809491 - 48809626
Alignment:
Q  849 agagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataa 947  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||| ||| |||||| |||| ||||  | |||| ||||||||| ||| ||| ||| ||||  |    
T  48809491 agagaattagatgacatttagggatttgagatttaagtatttaggaatttgatattcaatttaggaatattgatttttggttcatggatcaaagtgacca 48809590  T
Q  948 ttttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  48809591 ttttctactttcactttagtccttctgacacctcat 48809626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 849 - 983
Target Start/End: Original strand, 53958937 - 53959071
Alignment:
Q  849 agagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataa 947  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||   ||| ||| |||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| |||||| |||| |||| ||    
T  53958937 agagaattagatgacatttaag-atttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcaggggccaaagtgacaa 53959035  T
Q  948 ttttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  53959036 ttttctactttcactttggtccctgtgacagctcat 53959071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 866 - 978
Target Start/End: Complemental strand, 33428001 - 33427888
Alignment:
Q  866 ttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcacctt 964  Q
    |||||||||||||||||   | || |||||||| |||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||| ||    
T  33428001 ttatggatttgagattttcaatttaagggatttaagattcaagttggggatattgatttttggttcaggggctaaagtgataattttctactttcacttt 33427902  T
Q  965 agtccctatgacac 978  Q
    ||||| | ||||||    
T  33427901 agtccatgtgacac 33427888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 849 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 2591913 - 2591777
Alignment:
Q  849 agagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgag-gatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgata 946  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||  |||| ||| |||||||||| || ||  | ||||| ||||||||  ||||||||||| |||  |    
T  2591913 agagaattagatgacatttagagatttgagatttaagaatttaggaatttgagatttcaatttcgagatattgatttttgcttcagggaccaaagtggca 2591814  T
Q  947 attttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  2591813 attttttactttcactttagtccatgtgacacctcat 2591777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 891 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 48808617 - 48808524
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||    
T  48808617 agggatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtctctgtgacacctcat 48808524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 891 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 53957918 - 53957825
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||| || || || ||||||||||||||| || |||||  |||||||||||    
T  53957918 agggatttgacattcaatttggggatattgatttttggttcatggactaaagtaatcattttctactttcactttggtccccgtgacacctcat 53957825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 891 - 967
Target Start/End: Original strand, 47075249 - 47075326
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagt 967  Q
    |||||||| |||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| || |||||    
T  47075249 agggatttaagattcaagttggggatattgatttttggttcagggactaaagtgacaattttctactttaactttagt 47075326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 73; Significance: 8e-33; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 2465034 - 2464821
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| ||| |||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||    || ||||| |||||||||| |    
T  2465034 ctaactgatagtaaatatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgactttgaacaaaaaagataattagatgacatttaag 2464935  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||| |||||||   ||| |||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  2464934 gatttaagatttaaggatttagggatttgatattcaatttggggatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtcc 2464835  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  2464834 ctgtgacacctcat 2464821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 758 - 983
Target Start/End: Original strand, 40612400 - 40612630
Alignment:
Q  758 tgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agaga 853  Q
    ||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||    ||| |    
T  40612400 tgtttactgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagagata 40612499  T
Q  854 attaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttc 952  Q
    |||| |||| ||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||||  |||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| || |  ||||||    
T  40612500 attagatgatatttagggatttaagatttagggatttagggatttgttattcaatttgggcatattgatttttggttcagggaccaaagtaaccattttc 40612599  T
Q  953 tactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||||||| || |||| | |||||||||||    
T  40612600 tactttcactttggtccttgtgacacctcat 40612630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 786 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 8074804 - 8074602
Alignment:
Q  786 taagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttatggatttgagatt 881  Q
    |||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||    ||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  8074804 taagtatgcacagtcagggagctaacagtaggttggtgtttaatgtaagattgattttgaacagaagagataattagatgacatttaaagatttaagatt 8074705  T
Q  882 tagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacct 980  Q
    |||  |||  ||||||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || || ||| ||||||||    
T  8074704 tagggatttggggatttgatattcaatttgggcatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtacctgtgacacct 8074605  T
Q  981 cat 983  Q
    |||    
T  8074604 cat 8074602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 771 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 25590798 - 25590582
Alignment:
Q  771 ggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatt 866  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||| || ||  ||||| |||| |  |||||||| ||||||| ||||| |||||    |||||||| ||||||||    
T  25590798 ggatctaactgatagtaagtatgcacagttagggacctaacaataagatt-tgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacatt 25590700  T
Q  867 tatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcacctta 965  Q
    |||||||||||||||||   ||| ||| |||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| |||| |||||| ||||  ||||||||||||||| ||     
T  25590699 tatggatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcagagaccaaagtgaccattttctactttcactttg 25590600  T
Q  966 gtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||| |||||||||||    
T  25590599 gtccctgtgacacctcat 25590582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 758 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 28590084 - 28589851
Alignment:
Q  758 tgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt-------aaacaag 850  Q
    ||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||       ||| ||     
T  28590084 tgtttactgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaaaaaaaa 28589985  T
Q  851 agaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataatt 949  Q
    | ||||| |||||||||| |||||| || |||||  ||| || ||||||| |||| ||||  | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||    
T  28589984 ataattacatgacatttaaggatttaaggtttagagatttagtgatttgatattcaattttggtatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccatt 28589885  T
Q  950 ttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  28589884 ttctacttttactttggtccctatgacccctcat 28589851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 818 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 14890091 - 14889921
Alignment:
Q  818 ttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaagagaattaa----atgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgag 913  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||    |||||||||| |||||| ||||||||  ||| || || |||| |||| ||||| |    
T  14890091 ttggtgtttaatggaagattgattttgaacaaaagaaataactagatgacatttaaggatttaagatttagggatttagcgaattgatattcaatttggg 14889992  T
Q  914 gatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  14889991 catattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttctacttttactttggtccctatgacacctcat 14889921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Original strand, 28590872 - 28591084
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    |||||||| |||||||||| |    
T  28590872 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagggac-taacagtaagttg-tgtttaatggaagattaattttgaacaaaaaagagaattatatgacatttagg 28590969  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tga-tttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtc 968  Q
    |||||||||||||   ||| | | |||||| |||| ||||| | ||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||    
T  28590970 gatttgagatttaaggatttaagaatttgatattcaatttgggaatattgattttttggttcagggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtc 28591069  T
Q  969 cctatgacacctcat 983  Q
    ||| |||||||||||    
T  28591070 cctgtgacacctcat 28591084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 40611624 - 40611412
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||| | |||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||    |||||||| |||||||||| |    
T  40611624 ctaactgatagtaagtatgtacagtcagggacctaacactaagttg-tgtttaatgaaagattaattttgaacaaaagagagaattatatgacatttagg 40611526  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    |||||||||||||   ||| ||| |||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  40611525 gatttgagatttaaggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcagggacccaagtgaccattttctactttcactttggtcc 40611426  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  40611425 ctgtgacacctcat 40611412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 808 - 983
Target Start/End: Original strand, 8075626 - 8075804
Alignment:
Q  808 taacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagat 903  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||  ||| |||||| ||    
T  8075626 taacagtaagttg-tgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagagaattagatgacattta-ggatttgagatttagggatataggaatttgatat 8075723  T
Q  904 tccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    || ||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || |||| | |||||||||||    
T  8075724 tcaatttgggaatattgatttttggttcagggaccaaagtgatcattttcgactttcactttggtccttgtgacacctcat 8075804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 9537400 - 9537194
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcg-aagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttat 869  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||  ||  ||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||    |||||||| |||||||||||    
T  9537400 ctaaatgatagtaagtatgcacagtcaaggacctaatagtaagttggtgtttaatgggaagattgactttgaacaaaagagagaattagatgacatttat 9537301  T
Q  870 ggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtc 968  Q
    |||||| ||||||||        ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  9537300 ggattttagatttag--------ggatttgagattcaatttggggatattgatttttgattcagggatcaaagtgactattttctactttcactttagtc 9537209  T
Q  969 cctatgacacctcat 983  Q
     || |||||| ||||    
T  9537208 actgtgacacatcat 9537194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 808 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 32640619 - 32640443
Alignment:
Q  808 taacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagat 903  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||| ||| |||||| ||    
T  32640619 taacagtaagttg-tgtttaatggaagattaattttgaataaaagagagaattagatgacatttagggatttgagatttaaggatttaggaatttgatat 32640521  T
Q  904 tccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacct 980  Q
    || ||||  | |||| ||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  32640520 tcaattttggaatattgatttttggttcaaggaccaaagtgaccattttctactttcactttggtccctgtgacacct 32640443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 849
Target Start/End: Original strand, 32641484 - 32641575
Alignment:
Q  758 tgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa 849  Q
    ||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||| || ||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  32641484 tgtttactgtcaaggacctaactgataataagtatgcacagttagggacctaacagtaggttggtgtttaatggaagattgattttgaacaa 32641575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 797 - 982
Target Start/End: Complemental strand, 18004997 - 18004811
Alignment:
Q  797 agtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaagaga----attaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcag 892  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||| || || |||||||||    |||| || ||||||| |||||||||||  |    || ||    
T  18004997 agtcagagacttaacagtaaattggtatttaatggaagattaatattgaacaagagagagaattagataacatttaaggatttgagatgga----tttag 18004902  T
Q  893 ggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctca 982  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||| || |||||  ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||| || ||||||||||    
T  18004901 ggatttgatattcaatttggggatattgaattttgattcagggaccaaagtgactattttctactttcattttagtctctgtgacacctca 18004811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 780 - 983
Target Start/End: Original strand, 2466537 - 2466744
Alignment:
Q  780 tgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaa----gagaattaaatgacatttatggattt 875  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||| ||   || ||||| |||||    |||||||| |||||||||| ||||||    
T  2466537 tgatagtaagtatgcacagtcagagacctaacaataagttg-tgtttaatggagatttaattttgaacaaaaaagagaattagatgacatttagggattt 2466635  T
Q  876 gagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatg 974  Q
    ||||||||   ||| | | |||||| |||| ||||| | ||| ||| |||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||| || |||| |  |    
T  2466636 gagatttaaggatttaagaatttgatattcaatttgggaatattgaattttggttcagggaccaaaatgactattttctactttcactttggtccatggg 2466735  T
Q  975 acacctcat 983  Q
    |||||||||    
T  2466736 acacctcat 2466744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 771 - 983
Target Start/End: Original strand, 4593864 - 4594072
Alignment:
Q  771 ggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaagaga----attaaatgacatt 866  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||    |||| ||||||||    
T  4593864 ggatctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacattaagtta-tgtttaatggaagattaattttgaacaaaagagataattagatgacatt 4593962  T
Q  867 tatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcacctta 965  Q
    || |||||||||||||        ||| |||||| |||| ||||| | ||| |||||||||| ||| |||| | | |||  ||||||||||||||| ||     
T  4593963 tagggatttgagattt--------aggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcatggactacgatgaccattttctactttcactttg 4594054  T
Q  966 gtccctatgacacctcat 983  Q
    |||||| |||||||||||    
T  4594055 gtccctgtgacacctcat 4594072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 758 - 971
Target Start/End: Complemental strand, 4593236 - 4593024
Alignment:
Q  758 tgtttactggctaggatctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agaga 853  Q
    ||||||||| |  ||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||    ||| |    
T  4593236 tgtttactgtcagggacctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtatgttggtgtttaatgaaagattgattttgaacaaaagagata 4593137  T
Q  854 attaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttc 952  Q
    |||| |||||||||| | |||| ||||||||  |||      ||| |  ||| ||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||    
T  4593136 attagatgacatttaagaatttaagatttagggatt------ttttattttcaatttgggcatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttc 4593043  T
Q  953 tactttcaccttagtccct 971  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  4593042 tactttcactttggtccct 4593024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Complemental strand, 545011 - 544800
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaacaagaga----attaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||| ||||| |||    |||| ||||  |||| |    
T  545011 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacaataagttg-tgtttaatgaaagattaattttgaacaaaagagataattatatgattttta-g 544914  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| |||||| |||| ||||| | |||| ||||||||| ||||| ||| |  |||  ||||||||||||||| ||  |||    
T  544913 gatttgagatttagggatttaggaatttgatattcaatttgggaatattgatttttggttcaggaacccaaatgactattttctactttcactttgatcc 544814  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
    || |||||||||||    
T  544813 ctgtgacacctcat 544800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 808 - 905
Target Start/End: Original strand, 9537846 - 9537947
Alignment:
Q  808 taacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagat 903  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    ||||||||| || ||||||| | |||||||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  9537846 taacattaagttgatgtttaatggaagattgattttgaacaaaggagagaattagataacatttaggaatttgagatttagggatttagggaattgagat 9537945  T
Q  904 tc 905  Q
    ||    
T  9537946 tc 9537947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 775 - 983
Target Start/End: Original strand, 545802 - 546007
Alignment:
Q  775 ctaattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttatg 870  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||   ||||    ||| ||||| ||||||||||      
T  545802 ctaactgatagtaagtatgcacagtcagggacctaacagtaggttagtgtttaatggaagattgattcagaacaaaagagataattagatgacatttaac 545901  T
Q  871 gatttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtcc 969  Q
    ||||| ||||||        |||||||||  |||| ||||| | ||| |||||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||    
T  545902 gatttaagattt--------agggatttgttattcaatttgggcatattgatttttggttcaaggaccaaagtgactattttctactttcactttggtcc 545993  T
Q  970 ctatgacacctcat 983  Q
     | |||||||||||    
T  545994 ttgtgacacctcat 546007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 894 - 980
Target Start/End: Complemental strand, 34173522 - 34173435
Alignment:
Q  894 gatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacct 980  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  34173522 gatttgaaattcaatttggggatattgatttttggttcagagaccaaagtgatcattttctactttcagtttagtccctgtgatacct 34173435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 808 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 21069617 - 21069540
Alignment:
Q  808 taacagtaagttggtgtttaatcgaagattgatttt----aaacaagagaattaaatgacatttatggatttgagatt 881  Q
    ||||||||||||||||||||||  || |||||||||    |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21069617 taacagtaagttggtgtttaatgaaatattgattttgaagaaaatagagaattagatgacatttagggatttgagatt 21069540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 918 - 983
Target Start/End: Original strand, 32555433 - 32555497
Alignment:
Q  918 tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcat 983  Q
    ||||||| || ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  32555433 tgattttcggttcaggaaccaag-tgacaattttctactttcactttagtccatgtgacacctcat 32555497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0767
Description:

Target: scaffold0767; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 808 - 961
Target Start/End: Original strand, 6024 - 6182
Alignment:
Q  808 taacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttatggatttgagatttagtaattcagggatttgagat 903  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||    
T  6024 taacagtaagttggtgtttaattgaagattgattttgaacaaaagagataattatatgacatttagggatttgagatttagggatttaggaatttgagat 6123  T
Q  904 tccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcac 961  Q
    |  ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  6124 tatatttggggatattgatttttggttcagggaccaaagtgaccattttttactttcac 6182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0767; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 891 - 984
Target Start/End: Complemental strand, 5862 - 5768
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcatg 984  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||  | ||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  5862 agggatttgagatttaatttgaggatattgatttttggttcagggatcaaagtgaccactttttactttcactttagtctatgtgacacctcatg 5768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 57; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 776 - 980
Target Start/End: Original strand, 31239726 - 31239935
Alignment:
Q  776 taattgataataagtatgcatagtcagagatataacagtaagttggtgtttaatcgaagattgattttaaaca----agagaattaaatgacatttatgg 871  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||| ||||    ||||||||| | || ||||| ||    
T  31239726 taattgatagtaagtatgcacagtcacagatctaacagtaagttgttgtttaatgaaaaattaattttgaacaaaagagagaattagacgatatttaagg 31239825  T
Q  872 atttgagatttagtaattcagggatttgagattccatttgaggata-tgatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccc 970  Q
    |||||||||||||  ||| | ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| | || || ||||  |||||||||||| || ||||| |     
T  31239826 atttgagatttagggatttaaggatttgagattcaatttggggatattgatttttggttcaagaacaaaagtgaccattttctactttgactttagttca 31239925  T
Q  971 tatgacacct 980  Q
    | ||||||||    
T  31239926 tgtgacacct 31239935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 891 - 984
Target Start/End: Original strand, 12676349 - 12676443
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatatgatttttgggtc-agggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcatg 984  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||| | |||| |||  |||||| || |||| ||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  12676349 agggatttgagattcaatttgtgtatattaattttcggtttagggactaaagtgacaattttctaatttaactttaatccctatgacacctcatg 12676443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 891 - 984
Target Start/End: Original strand, 36403 - 36496
Alignment:
Q  891 agggatttgagattccatttgaggatat-gatttttgggtcagggaccaaggtgataattttctactttcaccttagtccctatgacacctcatg 984  Q
    ||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||| || ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  36403 agggatttgagtttcaattttaggatattgattttcggttcagggatcaaagtgaccattttctactttca-attagtctctatgacacctcatg 36496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University