View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5434-Insertion-4 (Length: 1000)

Name: NF5434-Insertion-4
Description: NF5434
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5434-Insertion-4
NF5434-Insertion-4
[»] chr1 (18 HSPs)
chr1 (8-579)||(2070209-2070779)
chr1 (8-557)||(2074555-2075103)
chr1 (569-954)||(2071557-2071945)
chr1 (578-954)||(2075096-2075475)
chr1 (640-940)||(3774414-3774715)
chr1 (495-653)||(2073323-2073479)
chr1 (495-653)||(2076855-2077011)
chr1 (548-852)||(15629358-15629660)
chr1 (656-860)||(11993424-11993624)
chr1 (559-812)||(10354203-10354454)
chr1 (537-653)||(6696015-6696126)
chr1 (669-746)||(9167904-9167981)
chr1 (807-901)||(9167991-9168085)
chr1 (581-747)||(11749642-11749805)
chr1 (573-653)||(15630178-15630257)
chr1 (573-665)||(23825341-23825433)
chr1 (744-791)||(29958913-29958959)
chr1 (599-656)||(9168491-9168548)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (59-446)||(23636134-23636521)
chr8 (599-860)||(20242521-20242781)
chr8 (599-860)||(20250379-20250639)
chr8 (547-833)||(16578792-16579071)
chr8 (640-819)||(5616765-5616942)
chr8 (573-737)||(43615374-43615537)
chr8 (620-756)||(2098468-2098605)
chr8 (581-737)||(20093337-20093493)
chr8 (714-832)||(16583694-16583810)
chr8 (626-722)||(24726606-24726702)
chr8 (615-678)||(5017857-5017920)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (547-901)||(24137350-24137699)
chr5 (288-467)||(42268175-42268353)
chr5 (640-826)||(27315079-27315265)
chr5 (13-202)||(42267988-42268177)
chr5 (627-844)||(9512272-9512484)
chr5 (599-737)||(40784074-40784212)
chr5 (742-922)||(11320621-11320800)
chr5 (548-667)||(11320486-11320599)
[»] chr4 (9 HSPs)
chr4 (537-849)||(16871456-16871762)
chr4 (598-816)||(54148114-54148330)
chr4 (640-844)||(24225863-24226065)
chr4 (639-746)||(24131717-24131825)
chr4 (750-860)||(7259055-7259163)
chr4 (581-654)||(14458538-14458611)
chr4 (573-653)||(16543360-16543439)
chr4 (574-646)||(16869513-16869584)
chr4 (697-735)||(7258651-7258689)
[»] chr2 (13 HSPs)
chr2 (537-849)||(8986732-8987038)
chr2 (547-860)||(32290949-32291256)
chr2 (598-860)||(38583547-38583807)
chr2 (588-774)||(29409118-29409303)
chr2 (589-860)||(1172812-1173078)
chr2 (334-472)||(9911224-9911357)
chr2 (724-860)||(42633118-42633252)
chr2 (696-874)||(20593563-20593736)
chr2 (645-765)||(34172013-34172133)
chr2 (537-654)||(8985573-8985685)
chr2 (641-733)||(42631686-42631777)
chr2 (581-638)||(32276954-32277010)
chr2 (695-815)||(34169381-34169500)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (537-849)||(46963064-46963370)
chr7 (573-860)||(15614282-15614567)
chr7 (575-860)||(17921232-17921515)
chr7 (583-758)||(21814322-21814496)
chr7 (599-860)||(44338844-44339104)
chr7 (630-887)||(11827994-11828263)
chr7 (581-857)||(3889998-3890276)
chr7 (8-201)||(24718621-24718816)
chr7 (646-857)||(3902040-3902248)
chr7 (8-191)||(43031873-43032055)
chr7 (582-746)||(48643528-48643691)
chr7 (700-774)||(26403381-26403455)
chr7 (716-859)||(24486650-24486790)
chr7 (651-906)||(3889499-3889758)
chr7 (547-653)||(2628253-2628354)
chr7 (548-653)||(46964429-46964529)
chr7 (584-661)||(3902377-3902454)
chr7 (499-575)||(26403520-26403594)
chr7 (583-653)||(21811668-21811737)
chr7 (576-653)||(6841471-6841547)
chr7 (587-657)||(3889908-3889978)
chr7 (569-654)||(5763595-5763680)
chr7 (547-642)||(6840616-6840706)
chr7 (614-653)||(33651301-33651340)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (630-882)||(28063086-28063338)
chr6 (537-799)||(18984353-18984608)
chr6 (644-856)||(21862363-21862574)
chr6 (573-805)||(33424009-33424242)
chr6 (548-771)||(10741661-10741871)
chr6 (634-818)||(9290732-9290915)
chr6 (619-797)||(2131623-2131804)
chr6 (715-860)||(13098037-13098180)
chr6 (638-733)||(9365197-9365292)
chr6 (537-624)||(22868490-22868572)
chr6 (573-653)||(21862689-21862768)
chr6 (642-735)||(8701721-8701813)
chr6 (640-735)||(5986843-5986937)
chr6 (715-773)||(13109451-13109509)
chr6 (742-805)||(3900639-3900701)
chr6 (606-653)||(21858039-21858086)
chr6 (746-799)||(9365292-9365344)
chr6 (620-653)||(10740574-10740607)
chr6 (547-653)||(18792853-18792954)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (583-758)||(16462862-16463036)
chr3 (547-846)||(42531098-42531390)
chr3 (640-819)||(22820957-22821134)
chr3 (537-746)||(814385-814591)
chr3 (13-157)||(31699680-31699824)
chr3 (583-746)||(814167-814329)
chr3 (547-730)||(46691459-46691636)
chr3 (575-733)||(50297380-50297537)
chr3 (629-810)||(2593180-2593355)
chr3 (732-822)||(50296116-50296205)
chr3 (548-653)||(18088145-18088244)
chr3 (576-691)||(17065516-17065630)
chr3 (729-797)||(34338082-34338149)
chr3 (775-819)||(46691665-46691709)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (598-858)||(14309-14568)
[»] scaffold0499 (1 HSPs)
scaffold0499 (715-860)||(7028-7171)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (550-654)||(14539-14639)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (695-792)||(61985-62081)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (742-798)||(31956-32011)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (573-653)||(406277-406356)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (715-772)||(153482-153539)
scaffold0025 (750-860)||(154697-154804)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (547-653)||(11187-11288)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 504; Significance: 0; HSPs: 18)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 504; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 579
Target Start/End: Original strand, 2070209 - 2070779
Alignment:
Q  8 gtgcaatgatgtcatcactccgcaccaccgttccactacatcgaagtaactgttaacatcctttcttccggtagtcgccatctttttcttcacatcgtgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2070209 gtgcaatgatgtcatcactccgcaccaccgttccactacatcgaagtaactattaacatcctttcttccggtagtcgccatctttttcttcacgtcgtgg 2070308  T
Q  108 catgtgttttctctcttttgggttgtacaatcaaacacgagtaaccctccaccgtcgttgcttttgggttgctgttatcgagatcagattccaggtttgt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2070309 catgtgttttctctcttttgggttgtacaatcaaacacgagtaaccctccaccgttgttgcttttgggttgctgttatcgagatcggattccaggtttgt 2070408  T
Q  208 ctgattttcagatctaattcgtgatttttggcttttgcctctcttttgctttaattatgtttttaaggcattaatggtctaggatcaaggtgtcgtgctc 307  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2070409 ccgattttcagatctaatttgtgatttttggcttttgcctctcttttgctttaattatgtttttaaggcattaatggtctaggatcaaggtgtcgtgctc 2070508  T
Q  308 tgtttgtacgtattttgaaggtgttgagtttggatggtatttgagacctgttatgttttccattttttgggaggttattgtgatggggtggtattgggag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2070509 tgtttgtacgtattttgaaggtgttgagtttgga-ggtatttgagtcctattgtgttttccattttttgggaggttattgtgatggggtggtattgggag 2070607  T
Q  408 tttattttgttgtctttggatgcagttgatagtttatttttgagggaatttattctctttagtggaggttgttaacaatttagagatataaagaacaaat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2070608 tttattttgttgtctttggatgcagttggtagtttatttttgagggaatttattctctttaatggaggttgttaacaatttagggatataaagaacaaat 2070707  T
Q  508 agacgactaggtttccaatatgataacaaaatagcatagcattacaaaaagttataagagaatatatatata 579  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2070708 agacggctaggtttccagtatgataacaaaatagcataacattacaaaaagttataagagaatatatatata 2070779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 490; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 557
Target Start/End: Original strand, 2074555 - 2075103
Alignment:
Q  8 gtgcaatgatgtcatcactccgcaccaccgttccactacatcgaagtaactgttaacatcctttcttccggtagtcgccatctttttcttcacatcgtgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2074555 gtgcaatgatgtcatcactccgcaccaccgttccactacatcgaagtaactgttaacatcctttcttccggtagtcgccatctttttcttcacgtcgtgg 2074654  T
Q  108 catgtgttttctctcttttgggttgtacaatcaaacacgagtaaccctccaccgtcgttgcttttgggttgctgttatcgagatcagattccaggtttgt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2074655 catgtgttttctctcttttgggttgtacaatcaaacacgagtaaccctccaccgttgttgcttttgggttgcagttatcgagatcggattccaggtttgt 2074754  T
Q  208 ctgattttcagatctaattcgtgatttttggcttttgcctctcttttgctttaattatgtttttaaggcattaatggtctaggatcaaggtgtcgtgctc 307  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2074755 ccgattttcagatctaattcgtgatttttggcttttgcctctcttttgctttaattatgtttttaaggcattaatggtctaggatcaaggtgtcgtgctc 2074854  T
Q  308 tgtttgtacgtattttgaaggtgttgagtttggatggtatttgagacctgttatgttttccattttttgggaggttattgtgatggggtggtattgggag 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2074855 tgtttgtacgtattttgaaggtgttgagtttgga-ggtatttgagtcctattgtgttttccattttttgggaggttattgtgatggggtggtattgggag 2074953  T
Q  408 tttattttgttgtctttggatgcagttgatagtttatttttgagggaatttattctctttagtggaggttgttaacaatttagagatataaagaacaaat 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2074954 tttattttgttgtctttggatgcagttggtagtttatttttgagggaatttattctctttagtggaggttgttaacaatttagggatataaagaacaaat 2075053  T
Q  508 agacgactaggtttccaatatgataacaaaatagcatagcattacaaaaa 557  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2075054 agacggctaggtttccaatatgataacaaaatagcataacattactaaaa 2075103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 569 - 954
Target Start/End: Original strand, 2071557 - 2071945
Alignment:
Q  569 atatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactc 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2071557 atatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctgccctcaaactc 2071656  T
Q  669 atgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagctta 768  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2071657 atgatgcattaacaagaagcattctgagtttgtcaaacaaaatacgaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagctta 2071756  T
Q  769 ctaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagttttcgtcat 868  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2071757 ctaagcgtttaagcttgttacaaattaaaccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagttgtcgtcat 2071856  T
Q  869 tgagagtgtaacaagaaccgtcaccattaaccatcc-aagagagcaaccatct-aacagaaccaagttaaacc-aatcaaacatgttca 954  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2071857 tgagagtgtaacaagaaccatcaccattaaccatccaaagagagcaaccatctaaacagaaccaagttaaaccaaatcaaacatgttca 2071945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 578 - 954
Target Start/End: Original strand, 2075096 - 2075475
Alignment:
Q  578 tactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcat 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2075096 tactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctgccctcaaactcatgatgcat 2075195  T
Q  678 taacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatt 777  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2075196 taacaagaagcattctgagtttgtcaaacaaaatacgaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcgtt 2075295  T
Q  778 taagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagttttcgtcattgagagtgt 877  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2075296 taagcttgttacaaattaaaccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatagagagcaacaaccaaagtgagttgtcgtcattgagagtgt 2075395  T
Q  878 aacaagaaccgtcaccattaaccatcc-aagagagcaaccatct-aacagaaccaagttaaacc-aatcaaacatgttca 954  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2075396 aacaagaaccatcaccattaaccatccaaagagagcaaccatctaaacagaaccaagttaaaccaaatcaaacatgttca 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 640 - 940
Target Start/End: Original strand, 3774414 - 3774715
Alignment:
Q  640 tttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaact 739  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||    
T  3774414 tttattatctaacatctaccctcaaactcatgattcatcaacaagaagcattgtgagtttgtcaaacaaaataccaaaaacatattaaaaaatataaact 3774513  T
Q  740 tgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatgga 839  Q
    | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||| ||| | ||||    
T  3774514 tctaacattacccctcaagttaaagcttactaagc-tttatgcttgttacaaattaacccagaaaaataaaccatatcaactgatagcagaactagtgga 3774612  T
Q  840 gagcaacaaccaaagtgagttttcgtcattgagagtgtaacaagaaccgtcaccattaaccatcc-aagagagcaaccat-ctaacagaaccaagttaaa 937  Q
    || |||||||||||||||||  || |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||||| | |||    
T  3774613 gatcaacaaccaaagtgagtcgtcatcatagagagtgcaacaagaaccataaccattaaccagccaaagagagaaaccatgcaaacagaaccaaatcaaa 3774712  T
Q  938 cca 940  Q
    |||    
T  3774713 cca 3774715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 495 - 653
Target Start/End: Original strand, 2073323 - 2073479
Alignment:
Q  495 ataaagaacaaatagacgactaggtttccaatatgataacaaaatagcatagcattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatgga 594  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2073323 ataaagaacaaataggcggataggttttcaatatgataacaaaatagcatagcattacaaaaagttataagagaatat--atatactaaaacctaatgga 2073420  T
Q  595 ctgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaaca 653  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2073421 ctgctaacttactaatattaaggactaatagcttaagcccaatattttattatctaaca 2073479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 495 - 653
Target Start/End: Original strand, 2076855 - 2077011
Alignment:
Q  495 ataaagaacaaatagacgactaggtttccaatatgataacaaaatagcatagcattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatgga 594  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  2076855 ataaagaacaaataggcggataggttttcaatatgataacaaaatagcatagcattacaaaaagttataagagaatat--atatactaaaacctaatgga 2076952  T
Q  595 ctgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaaca 653  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2076953 ctgctaacttactaatattaaggactaatagcttaagcccaatattttattatctaaca 2077011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 548 - 852
Target Start/End: Original strand, 15629358 - 15629660
Alignment:
Q  548 attacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattat 647  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||     ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15629358 attacaaaaggttataagagaatatataa----taaaatctaatgaact-ctaacttactaatataaaggtccaataacttaagcccaatattttattat 15629452  T
Q  648 ctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataata----taaacttgta 743  Q
    |||||| | |||||||||||||  |||  | ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||  | | || | ||    | ||  | ||    
T  15629453 ctaacatccaccctcaaactcacaatgagtcaacaagaagcattgtgagtttgtcaaacaaaatacgaaaaaccaaattaacactacccctcaagctcta 15629552  T
Q  744 acactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagc 843  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||| |    
T  15629553 acactacccctcaagctgaagcttactaagc-tttaagcttgttacaaattaactcagaaaaataaactaaatcagttgtcagcaaaaccaatggagaac 15629651  T
Q  844 aacaaccaa 852  Q
    | |||||||    
T  15629652 agcaaccaa 15629660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 656 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 11993624 - 11993424
Alignment:
Q  656 taccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctc 755  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11993624 taccctcaaactcaagatgcatcaacaagaagcattgtgagtttgtcaaataaaatacgaaaa-catactaaataatataaacttctaacactacccctc 11993526  T
Q  756 aagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagt 855  Q
    ||| ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | |  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  11993525 aagttaaagcttattaag-atttaagcttgtta-aaattaa-caaagaaaataaaccaaatcagctgatagcataaccaatgaagagcatcaaccaaagt 11993429  T
Q  856 gagtt 860  Q
    |||||    
T  11993428 gagtt 11993424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 559 - 812
Target Start/End: Complemental strand, 10354454 - 10354203
Alignment:
Q  559 ttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaat-attaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacaccta 657  Q
    |||||||||||||||||||     ||| ||||| |||| |||||||| |||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||| |    
T  10354454 ttataagagaatatatata-----aaatctaatagactactaacttagtaatgataaaggcctaatagcttaagtctaatattttatcatctaacaccca 10354360  T
Q  658 ccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcag-tttgt-caaacaaaata--agaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccc 753  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | || |||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |     
T  10354359 ctctcaaacttatgatgcatcaacaagaagaattatgagttttgtgtaaacaaaatacgaaaaaaacatactaaataatataaagttctaacactactct 10354260  T
Q  754 tcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaact 812  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10354259 tcaagctaaagcttactaagc-tttaagtttgttagaaattaaccca-aaaaataaact 10354203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 537 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 6696126 - 6696015
Alignment:
Q  537 aatagcatagcattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaa 636  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||     ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  6696126 aatagcttaacattacaaaaggttataagagaatatttaa----taaaatctaatggact-ctaacttactaatataaatgcccaataacttaagcctaa 6696032  T
Q  637 tattttattatctaaca 653  Q
    || ||||||||||||||    
T  6696031 tactttattatctaaca 6696015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 669 - 746
Target Start/End: Original strand, 9167904 - 9167981
Alignment:
Q  669 atgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaaca 746  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  9167904 atgatgcatcaacaagaagcattgtgagtttgtcaaataaaatacgaaaaacaaactaaataatataaagttgaaaca 9167981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 807 - 901
Target Start/End: Original strand, 9167991 - 9168085
Alignment:
Q  807 taaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagttttcgtcattgagagtgtaacaagaaccgtcaccattaacca 901  Q
    ||||| |||| ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| | | |||||||| |||||||||||||    
T  9167991 taaacaaaattagttgttagcaaaaccaatggagagcagcaaccaaagtgagttatcttcatagagagagcatcaagaaccatcaccattaacca 9168085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 747
Target Start/End: Original strand, 11749642 - 11749805
Alignment:
Q  581 taaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaa 680  Q
    ||||||||| || |||  ||||||| |||||| |||| |   || |||||| | ||||||||||| |||||||| || | ||||| | ||||||||| ||    
T  11749642 taaaacctattgaactattaacttagtaatataaaggtcggttatcttaagtcaaatattttattttctaacacatatcatcaaatttatgatgcatcaa 11749741  T
Q  681 caagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacac 747  Q
     ||||| |||    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11749742 taagaaacatg---agtttgtcaaacaaaatacaataaacatactaaataatataaagttctaacac 11749805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 653
Target Start/End: Original strand, 15630178 - 15630257
Alignment:
Q  573 atatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaaca 653  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15630178 atatataataaaacctaatagact-ctaacttactaatataaaggcccaataatttaagctcaatactttattatttaaca 15630257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 23825433 - 23825341
Alignment:
Q  573 atatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaa 665  Q
    ||||||| || ||| ||||| |||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||   |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23825433 atatataatagaacataatgaactgctaactcaataatataaaggcccaatagtttaagttaaatactttattatctaacacccaccctcaaa 23825341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 744 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 29958959 - 29958913
Alignment:
Q  744 acactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaa 791  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  29958959 acacttcccctcaagctaaagcttactaagc-tttaagcctgttacaa 29958913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 599 - 656
Target Start/End: Original strand, 9168491 - 9168548
Alignment:
Q  599 taacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacct 656  Q
    ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  9168491 taacttactgatataaaggttcaatagcttaagtgcaatactttattatctaacacct 9168548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 232; Significance: 1e-127; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 59 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 23636521 - 23636134
Alignment:
Q  59 gttaacatcctttcttccggtagtcgccatctttttcttcacatcgtggcatgtgttttctctcttttgggttgtacaatcaaacacgagtaaccctcca 158  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||| | |||  ||||    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||    
T  23636521 gttaacatcctttcttccgtcagccgccatcttttccatcatgtcgtcatctgcgttttctctcttttgggttgtactatcaaacatgagtaacccttca 23636422  T
Q  159 ccgtcgttgcttttgggttgctgttatcgagatcagattccaggtttgtctgattttcagatctaattcgtgatttttggcttttgcctctcttttgctt 258  Q
    || | ||| |  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23636421 cctttgttacccttgggttgctgttatcgagatcgtattccaggtttgtccggttttcagatctagttcgtgatttatggcttttgcctctcttttgctc 23636322  T
Q  259 taattatgtttttaaggcattaatggtctaggatcaaggtgtcgtgctctgtttgtacgtattttgaaggtgttgagtttggatggtatttgagacctgt 358  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  23636321 taattatgtttttaaggccttaatggtctaggatcaaggtgtcgtgatctgtttgtacgtattttgaaggtgttgagtttggatggtatttgggtcctat 23636222  T
Q  359 tatgttttccattttttgggaggttattgtgatggggtggtattgggagtttattttgttgtctttggatgcagttgatagtttattt 446  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23636221 tgcattttccattttttgggaggttattgcgatggggtggtattgggagtttattttgctgtcttttgatgcagttgagagtttattt 23636134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 599 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 20242781 - 20242521
Alignment:
Q  599 taacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtt 698  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  | ||| ||||||||| | ||||    
T  20242781 taacttactaatataaaggtccaataacttaaatccaatattttattatttaacatctaccctcaaactcacaatgagtcaacgagaagcattgtgagtt 20242682  T
Q  699 tgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacc 798  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |    
T  20242681 tgtcaaacaaaatacgaaaaatatactaagtaatataaagttcaaacaccacccctcaagttgaggcttactaagc-tttaagcctattacaaattaatc 20242583  T
Q  799 cataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagtt 860  Q
     | |||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  20242582 tagaaaaataaaccaaatcagctgttagcagaaccaatgaagagcagcaaccaaagtgagtt 20242521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 599 - 860
Target Start/End: Original strand, 20250379 - 20250639
Alignment:
Q  599 taacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtt 698  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  | ||| ||||||||| | ||||    
T  20250379 taacttactaatataaaggtccaataacttaaatccaatattttattatttaacatctaccctcaaactcacaatgagtcaacgagaagcattgtgagtt 20250478  T
Q  699 tgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacc 798  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |    
T  20250479 tgtcaaacaaaatacgaaaaatatactaagtaatataaagttcaaacaccacccctcaagttgaggcttactaagc-tttaagcctattacaaattaatc 20250577  T
Q  799 cataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagtt 860  Q
     | |||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  20250578 tagaaaaataaaccaaatcagctgttagcagaaccaatgaagagcagcaaccaaagtgagtt 20250639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 547 - 833
Target Start/End: Original strand, 16578792 - 16579071
Alignment:
Q  547 cattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttatta 646  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||     ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| | | |||   |||| |||||||    
T  16578792 cattacaaaaggttacaatagaatatatata-----aaatctaatggactgctaacttagtaatataaaggttcaatggttgaagattaatactttatta 16578886  T
Q  647 tctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaaca 746  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||    
T  16578887 tctaacacataccttcaaattcatgttgcattaacaagaaacattatgagtttgtcaaacaaattacgaaaaacatcctaaataatataaa-ttccaaca 16578985  T
Q  747 c--tacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataaca 833  Q
    |  ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16578986 ctatacccctcaagttaaagcttaataagc-tttaaacttgttacaaattaacc--taaaaataaaccaaatcagttgatggcataaca 16579071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 640 - 819
Target Start/End: Complemental strand, 5616942 - 5616765
Alignment:
Q  640 tttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaact 739  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |    
T  5616942 tttattatctaaaacttactctcaaactaatgatgcataaacaagaagcattgtgagtttgtcaaacaaaatatgaaaaagatattaaataatataaagt 5616843  T
Q  740 tgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcag 819  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  5616842 tctaacactacccctaaagctaaagcctactaagc-tttaaacttgttacaaattaaccca-aaaaataaaccaaatcag 5616765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 573 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 43615537 - 43615374
Alignment:
Q  573 atatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatga 672  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || ||||| || |||  ||||||||||||||||||||  || | |||||||||  |    
T  43615537 atatataataaaatctaatggact-ctaacttactaatataaaagctcaataactaaagttcaatattttattatctaacatatatcttcaaactcacaa 43615439  T
Q  673 tgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaa 737  Q
    || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43615438 tgaatcaacaagaagcattgtgagtttgtcaaacaaaatacgaaaaacatactaaataatataaa 43615374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 620 - 756
Target Start/End: Original strand, 2098468 - 2098605
Alignment:
Q  620 caatagcttaagcccaatattttattatctaaca-cctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaa 718  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||||||||  ||||    
T  2098468 caatagcttatgactaatattttattatttaatatcctacactcaaactcatgatgcatcaacaagaaatattgtgagtttgtcaaacaaaatataaaaa 2098567  T
Q  719 acatactaaataatataaacttgtaacactacccctca 756  Q
    |  |  |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  2098568 atgtgttaaataatataaacttctatcactatccctca 2098605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 581 - 737
Target Start/End: Original strand, 20093337 - 20093493
Alignment:
Q  581 taaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaa 680  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||   |||||| |||| ||| |||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||    
T  20093337 taaaacctaatagactgctaatttagtaatataaatatccaataacttatgcctaatactttattatcgaacacttaacctcaaactcatgaagcatcaa 20093436  T
Q  681 caagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataag-aaaaacatactaaataatataaa 737  Q
    ||| || |||| | | ||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  20093437 caa-aaacattgtaaatttgtcaaataaaatacgaaaaaatatactaaataatataaa 20093493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 714 - 832
Target Start/End: Original strand, 16583694 - 16583810
Alignment:
Q  714 gaaaaacatactaaataatataaacttgta-acactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaact 812  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||  | |||||||||     
T  16583694 gaaaaacatcctaaataatataaattcctacactatacccctcaagctaaagcttactaagc-tttaaatttgatacaaattaacc--ttaaaataaacc 16583790  T
Q  813 aaatcagttgatagcataac 832  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  16583791 aaatcagttgatggcataac 16583810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 626 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 24726702 - 24726606
Alignment:
Q  626 cttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacat 722  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| | | ||||||||||||||||  ||||||||    
T  24726702 cttaagaccaatattttactatctaacacttaccttcaaactcatgatgcatcaacaaaaaatattgtgaatttgtcaaacaaaatacaaaaaacat 24726606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 615 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 5017920 - 5017857
Alignment:
Q  615 aggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcatt 678  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||    
T  5017920 aggcccaatagcttaagtccgatattttattatctaacacctcccctaaaattcatggtgcatt 5017857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 547 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 24137699 - 24137350
Alignment:
Q  547 cattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttatta 646  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||     ||||||||||| |||| ||||||||||| | | ||||||||||| || |||| ||||| ||||||     
T  24137699 cattacagaaggttataagagaatatataa----taaaacctaatagact-ctaacttactagtgtaaaggcccaataactgaagctcaatactttattg 24137605  T
Q  647 tctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaa-catactaaataatataaacttgtaac 745  Q
    ||||| | |||||||||||||||  ||| || ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||    
T  24137604 tctaaaatctaccctcaaactcacaatgaatcaacaagaaggattgtgagtttgtcaaacaaaatacgaaaaaacatactaaataatataaagttctaac 24137505  T
Q  746 actacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaa 845  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||| ||||||     
T  24137504 actacccctcaagctaaagcttactaagc-tttaagcttgttacaaattaacccagaaaaataaaccaaatcagctgctagcagaaccaatgaagagcag 24137406  T
Q  846 caaccaaagtgagttttcgtcattgagagtgtaacaagaaccgtcaccattaacca 901  Q
    |||||||| |||||| || |||| ||||| | | |||||||| ||||||| |||||    
T  24137405 caaccaaaatgagttatcttcatagagagagcagcaagaaccatcaccatcaacca 24137350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 288 - 467
Target Start/End: Original strand, 42268175 - 42268353
Alignment:
Q  288 aggatcaaggtgtcgtgctctgtttgtacgtattttgaaggtgttgagtttggatggtatttgagacctgttatgttttccattttttgggaggttattg 387  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| || | | || ||||||||||||||||||||||||||     
T  42268175 aggatcaaggtgtcgtgctctatttgtacgtactttgaaggtgttgagcttggatgatattttagtcatattgtgttttccattttttgggaggttatta 42268274  T
Q  388 tgatggggtggtattgggagtttattttgttgtctttggatgcagttgatagtttatttttgagggaatttattctcttt 467  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  42268275 tgatggggtggtatagggagtttattttgttgtcttttgatgcagttga-agtttacttttgaggaaatttattctcttt 42268353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 640 - 826
Target Start/End: Complemental strand, 27315265 - 27315079
Alignment:
Q  640 tttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaact 739  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||   ||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| || |    
T  27315265 tttattatctaacaactaccctcaaactcatgatgcatcaacaagaagtattacgagtttgtcaaacaaaataccaaaaatatattaaataatatgaagt 27315166  T
Q  740 tgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaa-ttaacccataaaaataaactaaatcagttgatag 826  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  27315165 tttaacactacccctcaaggtaaagcttactaag-ttttaagcttgttacaaatttatccaaaaaaaataaactaaatcagttgatag 27315079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 202
Target Start/End: Original strand, 42267988 - 42268177
Alignment:
Q  13 atgatgtcatcactccgcaccaccgttccactacatcgaagtaactgttaacatcctttcttccggtagtcgccatctttttcttcacatcgtggcatgt 112  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |  || |||||||| | |||||||||  | |||    
T  42267988 atgaggtcatccctccgcaccaccgttccaccgcatcgaaataaccgttaagatcctttcttccggcaaccgtcatcttttccgtcacatcgtcccctgt 42268087  T
Q  113 gttttctctcttttgggttgtacaatcaaacacgagtaaccctccaccgtcgttgcttttgggttgctgttatcgagatcagattccagg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42268088 gttttctctcttttgggttgtacaatcaaacatgactaatgctccacaattgttgctcttgggttgctgttatcgagatcggattccagg 42268177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 627 - 844
Target Start/End: Complemental strand, 9512484 - 9512272
Alignment:
Q  627 ttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatacta 726  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  9512484 ttaagtccaatactttatcatctaacatctaccctcaaactcatgatgcatcaacaagaagtattgtgagtttgtcatacaaaatatgaaaaacatacta 9512385  T
Q  727 aataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatag 826  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| ||||||| | ||||| | |    |||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||| || |  |||    
T  9512384 aataatataaagttctaacacaacccatcaagctgatgcttaatta----ttaagcttgttacaaattaaccc-cgaaaataaaccaaattagctcgtag 9512290  T
Q  827 cataacaaatggagagca 844  Q
    |||||| |||| ||||||    
T  9512289 cataaccaatgaagagca 9512272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 599 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 40784212 - 40784074
Alignment:
Q  599 taacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtt 698  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||| |||||  || || |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  40784212 taacttaataatataaaggctcaatagattaagttcagtactttattatctaatatctaccctcaaacttatgatgcattaacaagaagcattattagtt 40784113  T
Q  699 tgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaa 737  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  40784112 tgtcaaacaaaatatgaaaaacattctaaataaaataaa 40784074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 742 - 922
Target Start/End: Original strand, 11320621 - 11320800
Alignment:
Q  742 taacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggaga 841  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||  | ||||| ||| | ||||||    
T  11320621 taacactacccatcaagctgaagcttactaagc-tttaagcttgttacaaattaacccaaaaaaataaatcaaatcagcggctagcagaactagtggaga 11320719  T
Q  842 gcaacaaccaaagtgagttttcgtcattgagagtgtaacaagaaccgtcaccattaacca-tccaagagagcaaccatctaa 922  Q
    ||||||||||||||||||| || |||  ||||| | |||||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  11320720 gcaacaaccaaagtgagttatcatcaaagagagggcaacaagcaccatcaccatcaaccactcaaagagag-aaccatctaa 11320800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 548 - 667
Target Start/End: Original strand, 11320486 - 11320599
Alignment:
Q  548 attacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattat 647  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||     |||||  ||||||||| | ||||||||||||| |||  |||||| |||||| | ||||  |||||||    
T  11320486 attacaaaaggttataagagaatatataa----taaaat-taatggactcc-aacttactaatataaagagccaataacttaagtctaatacattattat 11320579  T
Q  648 ctaacacctaccctcaaact 667  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  11320580 ctaacacctactctcaaact 11320599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 9)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 537 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 16871762 - 16871456
Alignment:
Q  537 aatagcatagcattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaa 636  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||     ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  16871762 aatagcttaacattacaaaaggttataagataatatataa----taaaatctaatggact-ctaacttactaatataaatgcccaataacttaagcctaa 16871668  T
Q  637 tattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataa 736  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||  |||  | |||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16871667 tactttattatctaacatctaccctcaaactcacaatgagtcaacaagaaacattctgagtttgtcaaacaaaatacgaaaaacatactaaataatataa 16871568  T
Q  737 acttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaat 836  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||    
T  16871567 agttctaacactacccctcaagctgaagcttactaagc-tttaaacttgttacaaattaaccaagaaaaataaaccaaatcagctgtcagcaaaaccaat 16871469  T
Q  837 ggagagcaacaac 849  Q
    |||||||| ||||    
T  16871468 ggagagcagcaac 16871456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 598 - 816
Target Start/End: Complemental strand, 54148330 - 54148114
Alignment:
Q  598 ctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagt 697  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  54148330 ctaacttactaatataaaagcctaatagcttaagctcaatgctttgttatctaacacatactctcaaactcatgatgcatcaacaagaagcattgtgagt 54148231  T
Q  698 ttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaac 797  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54148230 ttgtcaaacaaaatacgaaaaacatagtaaataatataaacttttaacactacccctcaagctgaagcttactaagc-tttaagcttgttacaaattaac 54148132  T
Q  798 ccataaaaataaactaaat 816  Q
    ||  |||||||||| ||||    
T  54148131 cc-caaaaataaaccaaat 54148114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 640 - 844
Target Start/End: Complemental strand, 24226065 - 24225863
Alignment:
Q  640 tttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaact 739  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24226065 tttattatctaacacttaccctcaaactcatgatgcatcaacaagaatcattgtgggtttgtcaaacaaaatacgaaaaatatactaaataatataaact 24225966  T
Q  740 tgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatgga 839  Q
    |  |||||||||||| ||| ||||||||||||||  || |||||  ||||||||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||| |||||  |||| |    
T  24225965 tcgaacactacccctgaagttaaagcttactaag-tttgaagctcattacaaattaa-cctcgaaaataaaccaaatcagctgataacataatcaatgaa 24225868  T
Q  840 gagca 844  Q
    |||||    
T  24225867 gagca 24225863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 639 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 24131825 - 24131717
Alignment:
Q  639 ttttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataag-aaaaacatactaaataatataaa 737  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| | |||||||  ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  24131825 ttttattatctaacatctaccctcaaactcacaatgaatcaacaagaagcattgtgagtttgttcaacaaaatacgaaaaaacatacaaaataatataaa 24131726  T
Q  738 cttgtaaca 746  Q
     || |||||    
T  24131725 attctaaca 24131717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 750 - 860
Target Start/End: Original strand, 7259055 - 7259163
Alignment:
Q  750 cccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaac 849  Q
    ||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||| | | |||| |||||  |||||| ||||||||    
T  7259055 cccctcaagctgaaacttactaagt-tttaagcttgttacaaattaa-ccaggaaaataaatcaaatcggcttatagtataacctatggagtgcaacaac 7259152  T
Q  850 caaagtgagtt 860  Q
    |||| ||||||    
T  7259153 caaaatgagtt 7259163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 14458611 - 14458538
Alignment:
Q  581 taaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacac 654  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||   |||| |||||||||    
T  14458611 taaaacctaatagactactaacttagtaatataaagacacaatagcttaagcccaattccttatgatctaacac 14458538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 573 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 16543439 - 16543360
Alignment:
Q  573 atatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaaca 653  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||| |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  16543439 atatataataaaacttaatgaact-ctaacttactaatataaaaggccaataacttaagtccattactttattatctaaca 16543360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 574 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 16869584 - 16869513
Alignment:
Q  574 tatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttatta 646  Q
    |||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  16869584 tatataataaaatctaatgaact-ctaacttactaatataaaagcccaataacttaagctcaatactttatta 16869513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 697 - 735
Target Start/End: Original strand, 7258651 - 7258689
Alignment:
Q  697 tttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatata 735  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7258651 tttgtcaaataaaatacgaaaaacatactaaataatata 7258689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 13)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 537 - 849
Target Start/End: Complemental strand, 8987038 - 8986732
Alignment:
Q  537 aatagcatagcattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaa 636  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||     |||||  ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  8987038 aatagcttaacattacaaaaggttataagagaatatataa----taaaatttaatggact-ctaacttactaatataaatgcccaataacttaagcctaa 8986944  T
Q  637 tattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataa 736  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8986943 tactttattatctaacatctaccctcaaactcacaatgagtcaacaagaagcattctgagtttgtcatacaaaatacgaaaaacatactaaataatataa 8986844  T
Q  737 acttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaat 836  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||  |||| | | |||    
T  8986843 agttctaacactacccctcaagctgaagcttactaagc-tttaagcttgttacaaattaaccaagaaaaataaaccaaatcagctgtcagcaaacccaat 8986745  T
Q  837 ggagagcaacaac 849  Q
    |||||||| ||||    
T  8986744 ggagagcagcaac 8986732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 547 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 32291256 - 32290949
Alignment:
Q  547 cattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttatta 646  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||     |||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  32291256 cattacaaaaggttataagagaatatataa----taaatcttaatggact-ctaacttactaatataaagacacaataacttaagctcaatactttatta 32291162  T
Q  647 tctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaa-catactaaataatataaacttgtaac 745  Q
    |||||||  |||||||||||| |  |||  | ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||    
T  32291161 tctaacatttaccctcaaacttacaatgagtcaacaagaagcattgttagtttgtcaaacaaaatacgaaaaaacatactaaataatataaagatctaac 32291062  T
Q  746 actacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaa 845  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| || ||||| ||| | |||||||||     
T  32291061 actacccctcaagctgaagcttactaagc-tttaagcttgttaccaattaacctagaaaaataaactgaatcagctgttagca-aaccattggagagcag 32290964  T
Q  846 caaccaaagtgagtt 860  Q
    |||| ||||||||||    
T  32290963 caactaaagtgagtt 32290949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 598 - 860
Target Start/End: Original strand, 38583547 - 38583807
Alignment:
Q  598 ctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagt 697  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||  | ||||||||||||| |   |    
T  38583547 ctaacttactaatataaaggcccaataatttaagcctaatattttattatctaacatctaccttcaaactcacaatgagtcaacaagaagcattgtggat 38583646  T
Q  698 ttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaa- 796  Q
    ||| ||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  38583647 ttgccaatcaaaat-acaaaaacatactaagtaatataaagttctaacactacccctcaagctgaagcttactaagc-tttaa-cttgttacaaattaat 38583743  T
Q  797 cccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagtt 860  Q
    || | |||||||||| ||||||| || ||| | ||| |||  |||||| |||||||||||||||    
T  38583744 ccaaaaaaaataaaccaaatcagctggtagaagaaccaattaagagcagcaaccaaagtgagtt 38583807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 588 - 774
Target Start/End: Original strand, 29409118 - 29409303
Alignment:
Q  588 taatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaag 687  Q
    ||||||||| |||||||||||| || || || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29409118 taatggact-ctaacttactaaaataaatgctcaatagcttaagcacaatactttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcatcaacacgaag 29409216  T
Q  688 cattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagc 774  Q
    || | | || ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||| ||| |||||    
T  29409217 cactgtgagcttgtcaaacaaaatatgaaaaacatactaaacaatataaacttctaacactgcctctcaggctaaagtttattaagc 29409303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 589 - 860
Target Start/End: Original strand, 1172812 - 1173078
Alignment:
Q  589 aatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagc 688  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| || |    
T  1172812 aatggact-ctaatttattaatattaaggcctaatagtttaagtacaatactttattatctaacacataccttcaaattcatgatgcatcaacaaaaa-c 1172909  T
Q  689 attctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgtta 788  Q
    ||| | |||||||||||||||||| | |||||||| ||  | ||||||| || ||| |||||| |||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||    
T  1172910 attgtgagtttgtcaaacaaaatacggaaaacataata--ttatataaagttctaatactacctctcaagctgaagcttacggagc-tttaagtttgtta 1173006  T
Q  789 caaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagtt 860  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1173007 caaattaacccagaaaaatcaaccaaatcagctgttagcaaaaccaatggagagcagcaatcaaagtgagtt 1173078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 334 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 9911357 - 9911224
Alignment:
Q  334 agtttggatggtatttgagacctgttatgttttccattttttgggaggttattgtgatggggtggtattgggagtttattttgttgtctttggatgcagt 433  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||      
T  9911357 agtttggatggtatttgggtcctattatgttctccattttttgggaggttattatgatg----ggtattgggagtttattttgttgtcttttgatccatg 9911262  T
Q  434 tgatagtttatttttgagggaatttattctctttagtgg 472  Q
    ||  | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9911261 tgtgaattta-ttttgagggaatttattctctttggtgg 9911224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 724 - 860
Target Start/End: Original strand, 42633118 - 42633252
Alignment:
Q  724 ctaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttga 823  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| | |    
T  42633118 ctaaataatataaacttttaacactacacctcaagttaaagcttactaaac-ttttagtttattataaattaaccc-tgaaaataaactaaatcagctaa 42633215  T
Q  824 tagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagtt 860  Q
    |||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42633216 tagcatgactaatgaagaacaacaaccaaagtgagtt 42633252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 696 - 874
Target Start/End: Original strand, 20593563 - 20593736
Alignment:
Q  696 gtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaatta 795  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| || || ||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20593563 gtttgtcaaacaaaa-atgaaaaacatactacgtaatatgaagttctaa-actacccctaaagttgaagtttactaag--tttaagcttgttacaaatta 20593658  T
Q  796 acccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagttttcgtcattgagag 874  Q
    | ||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||  || | |||||| ||||||||||||||| || |||| |||||    
T  20593659 atcca-aaaaataaaccaaatcagctgatagtagaatcaacgaagagcagcaaccaaagtgagttatcatcatagagag 20593736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 645 - 765
Target Start/End: Complemental strand, 34172133 - 34172013
Alignment:
Q  645 tatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaa 744  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||  ||    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  34172133 tatctaacacatcccctcaaactcatgatgcaaaaacaagaaatatcaagagtttttcaaacaaaaaaagaaaaacatactcaataatataaacttaaaa 34172034  T
Q  745 cactacccctcaagctaaagc 765  Q
     ||| || |||||||||||||    
T  34172033 tacttcctctcaagctaaagc 34172013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 537 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 8985685 - 8985573
Alignment:
Q  537 aatagcatagcattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaa 636  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||     ||||| ||||||||||  |||||||||||||| || | |||||| |||||||| ||    
T  8985685 aatagcttaacattacaaaaggttataagagaatatataa----taaaatctaatggactt-taacttactaatataaatgtccaataacttaagcctaa 8985591  T
Q  637 tattttattatctaacac 654  Q
    || |||||||||||||||    
T  8985590 tactttattatctaacac 8985573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 641 - 733
Target Start/End: Original strand, 42631686 - 42631777
Alignment:
Q  641 ttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataata 733  Q
    |||||||||||||| || | | |||||||||||  || |||||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  42631686 ttattatctaacacttatctttaaactcatgattgatcaacaagaaacattgtgagtttgtcaaacaaaataag-aaagcatactaaataata 42631777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 581 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 32277010 - 32276954
Alignment:
Q  581 taaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaata 638  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  32277010 taaaacctaatggact-ctaacttactaatataaaggtccaataacttaagctcaata 32276954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 695 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 34169500 - 34169381
Alignment:
Q  695 agtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaatt 794  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||  |||||||||||||   || | ||||  ||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||| |    
T  34169500 agtttgtcaaacaaaaagtgaaaaacatacccaataatataaactcaaaatattacctatcaagctaaagtttactaa-cccttacgcttgttacaaaat 34169402  T
Q  795 aacccataaaaataaactaaa 815  Q
     | || |||||||||||||||    
T  34169401 tagccctaaaaataaactaaa 34169381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 537 - 849
Target Start/End: Original strand, 46963064 - 46963370
Alignment:
Q  537 aatagcatagcattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaa 636  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||     ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  46963064 aatagcttaacattacaaaaggttataagagaatatctaa----taaaatctaatggact-ctaacttactaatataaatgcccaataacttaagcctaa 46963158  T
Q  637 tattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataa 736  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  46963159 tactttattatctaacatctaccctcaaactcacaatgagtcaacaagaagcattctgagtttgtcagacaatatacgaaaaacatactaaataatataa 46963258  T
Q  737 acttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaat 836  Q
    | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||    
T  46963259 agttctaacactacccctcaagctgaagcttactaagc-tttaaacttgttacaaattaaccaagaaaaataaaccaaatcagctgtcagcaaaaccaat 46963357  T
Q  837 ggagagcaacaac 849  Q
    |||||||| ||||    
T  46963358 ggagagcagcaac 46963370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 573 - 860
Target Start/End: Original strand, 15614282 - 15614567
Alignment:
Q  573 atatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatga 672  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  15614282 atatataataaaacctaatggact-ctaacttgctaatataaaggtccaataacttaagcccaatactttattatctaacatctaccctcaaactcaaaa 15614380  T
Q  673 tgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaa-catactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttacta 771  Q
    ||  | ||||||||  ||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15614381 tgagtcaacaagaat-attgtgagtttgtcaaacaaaatatgaaaaaacatactaaataatataaagttcttacactacccctcgagctgaagcttacta 15614479  T
Q  772 agcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagtt 860  Q
    ||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15614480 agt-tttaagcttgttaaaaattaacccagaaaaataaaccaaatctgttgttagcaaaaccaatggagagcatcaaccaaagtgagtt 15614567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 575 - 860
Target Start/End: Original strand, 17921232 - 17921515
Alignment:
Q  575 atatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatg 674  Q
    ||||| ||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||| | ||||| |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  17921232 atataataaaactcaatggaccgttaacttactaatataaagacacaataacttaagtctaatactttattatctaatacctacccttaaactcatgatg 17921331  T
Q  675 cattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagc 774  Q
    ||| ||| |||| || | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17921332 catcaaccagaaacaatgtgagtttgtcaaacaaaatacgaaaaacatactaaataatttaaaatttgaacagtacccctcaagctaaagcttactaagc 17921431  T
Q  775 atttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagtt 860  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| || ||||| || ||| ||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  17921432 -tttaagcttgttacaaattaaccca-gaaaataaaacaaattagctgataacagaaccaacagagagcagcaaccgaagtgagtt 17921515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 583 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 21814496 - 21814322
Alignment:
Q  583 aaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaaca 682  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  21814496 aaacctaatggact-ctaacttactaatataaaggcttaatatcttaagctcaatactttattatctaacgcctaccctcaaactcatgatgcaacaaca 21814398  T
Q  683 agaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaag 758  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21814397 agaagcattgtgagtttgtcaaacagaatatgaaaaacatactaaataatataaagttctaacactacccctcaag 21814322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 599 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 44339104 - 44338844
Alignment:
Q  599 taacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtt 698  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  | ||| ||||||||| | ||||    
T  44339104 taacttactaatataaaggtccaataacttaaatccaatattttattatttaacatctaccctcaaactcacaatgagtcaacgagaagcattgtgagtt 44339005  T
Q  699 tgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacc 798  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||||| | ||||||||||| |    
T  44339004 tgtcaaacaaaatacgaaaaatatactaagtaatataaagttcaaacaccacccctcaagttgaggcttactaagc-tttaagcctattacaaattaatc 44338906  T
Q  799 cataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagtt 860  Q
     | |||||||||| ||||||| || ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||    
T  44338905 tagaaaaataaaccaaatcagctgttagcagaaccaatgaagagcagcaaccaaagtgagtt 44338844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 630 - 887
Target Start/End: Original strand, 11827994 - 11828263
Alignment:
Q  630 agcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaata---------agaaaaac 720  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| || |||||||         | ||||||    
T  11827994 agcccattactttattatctaacacctaccctaaaactcatgatgcatcaacaagaagcattgtgagtttgtaaatcaaaatacaaaaaaaaaaaaaaac 11828093  T
Q  721 atactaaata--atataaacttgtaacac--tacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaat 816  Q
    ||||||||||  |||| || || ||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11828094 atactaaatataatatgaagttctaacacattacccctcaagttgaagattactaagcctt-aagcttgttacaaattaacctagaaaaataaactaaat 11828192  T
Q  817 cagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagttttcgtcattgagagtgtaacaagaacc 887  Q
    || ||||||||  ||| ||||||||||| |||  |||||||||| || | || ||||| ||| ||||||||    
T  11828193 catttgatagcggaaccaatggagagcagcaaggaaagtgagttatcattatagagagagtagcaagaacc 11828263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 581 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 3890276 - 3889998
Alignment:
Q  581 taaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaa 680  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||  |||||| ||| ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||  | ||||| |||||| |||||    
T  3890276 taaatcctgatggactgcaaacttggtaatatcaagtcccaataacttaaactcaatactttattatctaacacctactttgaaacttatgatggattaa 3890177  T
Q  681 caagaagcattctcagtttgtcaaacaa----aataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaaca-ctacccctcaagctaaagcttactaagca 775  Q
    |||||||| || | ||||||| ||| ||    ||||  |||| |||| ||||||||||||| || ||||| |||| | | |||||||||||||||||||     
T  3890176 caagaagctttgtgagtttgtaaaaaaataataatacaaaaatcatattaaataatataaagttctaacaactacactttaagctaaagcttactaagc- 3890078  T
Q  776 tttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtga 857  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||  ||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  3890077 tttaaacttgttacaaattaaccaa--aaaataaaccaaatcaaatgatatcaaaactaatgaagagcaacaaccaaagtga 3889998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 24718816 - 24718621
Alignment:
Q  8 gtgcaatgatgtcatcactccgcaccaccgttccactacatcgaagtaactgttaacatcctttcttccggtagtcgccatctttttcttcacatcgtgg 107  Q
    |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||| | |||| |||| |    
T  24718816 gtgcgatgaggtcatccctccgtaccaccgttccaccgcatcgaaataaccgttaacatccttttttccggcaaccgccatcttttccgtcacgtcgtcg 24718717  T
Q  108 catgtgttttctctcttttgggttgtacaatcaa--acacgagtaaccctccaccgtcgttgcttttgggttgctgttatcgagatcagattccag 201  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||  | |||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  24718716 cctgcgttttctctcttttgggttgtacaatcaaacacacgagtaatcctccacgcttgttgctcttgggttgttgttatcgtgatcggattccag 24718621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 646 - 857
Target Start/End: Complemental strand, 3902248 - 3902040
Alignment:
Q  646 atctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaac 745  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||  ||| | ||||||| ||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||    
T  3902248 atcttacacctaccctgaaactcatgatgaatcaacaagaaatattgtgagtttgtaaaaaaaaataa-aaaatcatattaaataatataaagttctaac 3902150  T
Q  746 actacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaa 845  Q
    ||| ||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||| ||||| || ||| |||| ||||||     
T  3902149 acttccctttaagctaaagcttgctaagc-tttaaacttgttacaaattaaccga-aaaaataaaccagatcagctgatatcaaaaccaatgaagagcag 3902052  T
Q  846 caaccaaagtga 857  Q
    ||||||||||||    
T  3902051 caaccaaagtga 3902040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 191
Target Start/End: Original strand, 43031873 - 43032055
Alignment:
Q  8 gtgcaatgatgtcatcactccgcaccaccgttccactacatcgaagtaactgttaacatcctttcttccggtagtcgccatctttttcttcacatcgtgg 107  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| |||  | || |  |||||||| |||||| | || |    
T  43031873 gtgctatgaggtcatcactccgcaccaccgttccaccacatcgaagtaaccattaacctccttttttctagaagccatcatcttttccttcacgttgtcg 43031972  T
Q  108 catgtgttttctctcttttgggttgtacaatcaaacacgagtaaccctccaccgtcgttgcttttgggttgctgttatcgagat 191  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  43031973 catgcgttttctctcttttggattatacaatcaaacacgagtaa-ccttcactgttgttgctcttgagttgctgttatcgagat 43032055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 582 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 48643691 - 48643528
Alignment:
Q  582 aaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaac 681  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||  | |||    
T  48643691 aaaacctaatagact-ctaacttgctaatataaaggcccaaaaacttaaacctaatattttatcatctaacatctaccctcaaactcacaatgagtcaac 48643593  T
Q  682 aagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaaca 746  Q
    || || |||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  48643592 aataaacattgtgagtttgtcaaataaaatacgaaaaacatactaaataatataaagttctaaca 48643528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 700 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 26403455 - 26403381
Alignment:
Q  700 gtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagc 774  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26403455 gtcaaacaaaatacgaaaaacatactaaataatataaagttctaacactacccctcaagctaaagtttactaagc 26403381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 716 - 859
Target Start/End: Original strand, 24486650 - 24486790
Alignment:
Q  716 aaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaa 815  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||  |||||||||| |||    
T  24486650 aaaacatactaaataatataaacttctaacactacccttgaagttaaagcttactaagc-tttaagtttgttacaaattactcc--aaaaataaaccaaa 24486746  T
Q  816 tcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagt 859  Q
    | |  | |||||||||| |||| | |||| |||||| |||||||    
T  24486747 tgaagttatagcataaccaatgaatagcagcaaccagagtgagt 24486790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 651 - 906
Target Start/End: Complemental strand, 3889758 - 3889499
Alignment:
Q  651 acacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgt--caaacaaaataag----aaaaacatactaaataatataaacttgtaa 744  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |||||||| |||| | |||| ||  |||| |||||||     |||| |||| ||||||||||||| || |||    
T  3889758 acacctaccctgaaactcatgatgaatcaacaagaaacattgtgagttcgtaacaaaaaaaataaatacaaaaatcatattaaataatataaagttctaa 3889659  T
Q  745 cactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagca 844  Q
    |||| ||| | ||||||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||| || ||| |||| ||||||    
T  3889658 cacttccctttaagctaaagtttgctaagc-tttaaacttattacaaattaaccca-aaaaataaaccaaatcaaccgatatcaaaaccaatgaagagca 3889561  T
Q  845 acaaccaaagtgagttttcgtcattgagagtgtaacaagaaccgtcaccattaaccatccaa 906  Q
     |||||||||||| || || | || ||||| | ||||||||   ||||||| ||||| ||||    
T  3889560 gcaaccaaagtgaattatcataatagagagagcaacaagaataatcaccatcaaccaaccaa 3889499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 547 - 653
Target Start/End: Original strand, 2628253 - 2628354
Alignment:
Q  547 cattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttatta 646  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  2628253 cattacaaaaaattatgagagaatatataa----taaaacctaatggact-ctaacttactaatataaagactcaataacttaagctcaatactttatta 2628347  T
Q  647 tctaaca 653  Q
    |||||||    
T  2628348 tctaaca 2628354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 548 - 653
Target Start/End: Original strand, 46964429 - 46964529
Alignment:
Q  548 attacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattat 647  Q
    |||||||||||||||||||||    ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  46964429 attacaaaaagttataagaga----atatataataaaatctaatggact-ctaacgtactaatataaatgcccaataacttaagcctaatcctttattat 46964523  T
Q  648 ctaaca 653  Q
    ||||||    
T  46964524 ctaaca 46964529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 584 - 661
Target Start/End: Complemental strand, 3902454 - 3902377
Alignment:
Q  584 aacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccct 661  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  3902454 aacctaatggactgctaatttagtaatataaagtcccaataaattaagctcaatactttattatcttacacctaccct 3902377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26403594 - 26403520
Alignment:
Q  499 agaacaaatagacgactaggtttccaatatgataacaaaatagcatagcattacaaaaagttataagagaatatata 575  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26403594 agaacaaagagacgactaggatttcaatagaataacaa--tagcataacattacaaaaagttataagagaatatata 26403520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 583 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 21811737 - 21811668
Alignment:
Q  583 aaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaaca 653  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  21811737 aaacctaattgact-ctaacttactaatataaaggcctaatagcttaaacccaatacattattatctaaca 21811668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 576 - 653
Target Start/End: Original strand, 6841471 - 6841547
Alignment:
Q  576 tatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaaca 653  Q
    |||| ||||| |||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  6841471 tataataaaatctaacggact-ctaacttactgatataaaggcccaataacttaagtccgatattttattatctaaca 6841547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 587 - 657
Target Start/End: Complemental strand, 3889978 - 3889908
Alignment:
Q  587 ctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacaccta 657  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  3889978 ctaatggactgctaacttagcaatataaagtcccaataaattaagctcaatactttattatcttacaccta 3889908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 569 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 5763680 - 5763595
Alignment:
Q  569 atatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaa-tagcttaagcccaatattttattatctaacac 654  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5763680 atatatatata-tataacctaatggactactatcttagtaatataaagacccaaatatcttaagcccaatactttatcatctaacac 5763595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 547 - 642
Target Start/End: Original strand, 6840616 - 6840706
Alignment:
Q  547 cattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatatttt 642  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||     |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||| || |||||||    
T  6840616 cattacaaaaggttataaaagaatatataa----taaaacctaacggact-ctaacttactgatataaaggcccaataacttaagtccgatatttt 6840706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 614 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 33651340 - 33651301
Alignment:
Q  614 aaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaaca 653  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33651340 aaggcccaatagcttaagcccaataatttgttatctaaca 33651301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 5e-62; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 630 - 882
Target Start/End: Original strand, 28063086 - 28063338
Alignment:
Q  630 agcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaa-aaacatactaaa 728  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |  |||||||||| | | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  28063086 agcccgatactttattatttaacacctattgtcaaactcatgatgcatcacaaagaagcattgtgattttgttaaacaaaatacgaagaaacatactaaa 28063185  T
Q  729 taatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagca 828  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  28063186 taatataaagttctaacacttcccctcaagatgaagtttactaagc-tttaagcttgttacaaattaacccagaaaaataaaccaaatcagctgatagca 28063284  T
Q  829 taacaaatggagagcaacaaccaaagtgagttttcgtcattgagagtgtaacaa 882  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  28063285 taaccaatagagagcagcaaccaaagtgagttgtcatcatagagagtgtaacaa 28063338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 537 - 799
Target Start/End: Complemental strand, 18984608 - 18984353
Alignment:
Q  537 aatagcatagcattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaa 636  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||     |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||    
T  18984608 aatagcattgcattactaaaggttataagagaatatataa----taaaacataatgtact-ctaacttactaatataaaggcccaataatctaagcccaa 18984514  T
Q  637 tattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataa 736  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  | ||| ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  18984513 tattttattatttaacatctaccctcaaactcacaatgagtcaacgagaagcatcgtgagtttgtcaaacaaaatacgaaaaa-atactaagtaatataa 18984415  T
Q  737 acttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaaccc 799  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18984414 aattctaacaccacccctcaagctaaagcttactaag-gtttaagcttgttacaaattaaccc 18984353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 644 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 21862574 - 21862363
Alignment:
Q  644 ttatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgta 743  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||  |||  | ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  21862574 ttatctaacatctagcctcagactcacaatgagtcaacaagaagcattgtgagtttgtcaagcaaaatacgaaaaacatactaaataatataaagttcta 21862475  T
Q  744 acactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagc 843  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||| || ||||| ||| |||||||||     
T  21862474 acacttcccctcaagctgaagcatactaaac-tttaagcttgttacaaattaacctagaaatataaaccaaatcagctgttagcaaaaccaatggagagt 21862376  T
Q  844 aacaaccaaagtg 856  Q
    | | |||||||||    
T  21862375 agcgaccaaagtg 21862363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 573 - 805
Target Start/End: Original strand, 33424009 - 33424242
Alignment:
Q  573 atatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatga 672  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||||||  |    
T  33424009 atatataataaaacctaatgaactt-taacttactaatataaagacgcaataacttaagctcaatactttattatctaacgtcaaccctcaaactcacaa 33424107  T
Q  673 tgcattaacaagaa---gcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttac 769  Q
    ||  | ||||||||   |||||   | ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33424108 tgagtcaacaagaataagcattacgaatttttcaatcaaaatacgaaaaacatactaaataatataaagttctaacactacccctcaagttgaagcttac 33424207  T
Q  770 taagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaa 805  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  33424208 taagc-tttaagtttgttacaaattaatccagaaaa 33424242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 548 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 10741871 - 10741661
Alignment:
Q  548 attacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattat 647  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||    || |||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10741871 attacaaaatgttatgagagaatatata-ata----aatctaatggact-ctaactttctaatataaagacccaataacttaagcccaatattttattat 10741778  T
Q  648 ctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacac 747  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||  | ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||       |||||||||| || |||| |    
T  10741777 ctaacatctaccctcaaactcacaatgagtcaacaagaagcattgtaagtttgtcaaacaaaatacgaaaaac-------ataatataaagttctaacgc 10741685  T
Q  748 tacccctcaagctaaagcttacta 771  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  10741684 tacccctcaagctgaagctcacta 10741661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 634 - 818
Target Start/End: Original strand, 9290732 - 9290915
Alignment:
Q  634 caatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataata 733  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||  | ||||||||||||| | |||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9290732 caatactttattatctaacatctaccctcaaactcacaatgagtcaacaagaagcattgtgagtttgtttgacaaaatacgaaaagcatactaaataata 9290831  T
Q  734 taaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatca 818  Q
    |||| || ||||| ||| ||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  9290832 taaagttctaacattactcctgaagctgaagtttaccaagc-tttaagcttgttacaaattaacctaaaaaaataaaccaaatca 9290915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 619 - 797
Target Start/End: Original strand, 2131623 - 2131804
Alignment:
Q  619 ccaatagcttaagcccaatat-tttattatctaacac--ctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataaga 715  Q
    ||||||||||||| || |||  |||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||    
T  2131623 ccaatagcttaagtccgataggtttattatctaacacacctatcctcaaagtcattatttattaacaagaagcattatgagtttgtcaaacaaaatatga 2131722  T
Q  716 aaaaca-tactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaac 797  Q
    |||||| | |  |||||||||||||  ||| | ||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2131723 aaaacattgcacaataatataaactcctaatattacccttcaagttgaagcttactaagc-tttaagcttgttacaaattaac 2131804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 715 - 860
Target Start/End: Complemental strand, 13098180 - 13098037
Alignment:
Q  715 aaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaa 814  Q
    ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||    
T  13098180 aaaaacatactaaaatgtataaacttctaacactaccccttaagctaaggcttactaag-gtttaagctcgttacaaattaaccc-tgaaaataaaccaa 13098083  T
Q  815 atcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagtt 860  Q
    ||||| | || ||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  13098082 atcagctcatggcataatcaatgaagagcaacacccaaagtgagtt 13098037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 638 - 733
Target Start/End: Original strand, 9365197 - 9365292
Alignment:
Q  638 attttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataata 733  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||    
T  9365197 attttattatctaacacctcctctcaaattcatgatgcatcaacaagaagtattatgagtttgtcaaacgaaaaacaaaaaacatattaaataata 9365292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 537 - 624
Target Start/End: Complemental strand, 22868572 - 22868490
Alignment:
Q  537 aatagcatagcattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaata 624  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  22868572 aatagcataacattacaaaaagttataagagaata----tataataaaacctaatggact-ctaacttactaatataaaagcccaata 22868490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 573 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 21862768 - 21862689
Alignment:
Q  573 atatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaaca 653  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21862768 atatataataaaacctaatgcact-ctaacttgctaatataaagacccaatagcttaagctcaatactttattatctaaca 21862689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 642 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 8701813 - 8701721
Alignment:
Q  642 tattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatata 735  Q
    ||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||    
T  8701813 tattatctaatgcctatccttaaactcatgatacatca-caagaagcattgtgagtttgtcaaacaaaacacaaacaacatactaaataatata 8701721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 640 - 735
Target Start/End: Original strand, 5986843 - 5986937
Alignment:
Q  640 tttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatata 735  Q
    ||||||||||||  |||| ||| ||||||||||| ||| |  |||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  5986843 tttattatctaatgcctatccttaaactcatgatacatcat-aagaagcattgtgagtttgtgaaacaaaatacgaacaacatattaaataatata 5986937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 715 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 13109509 - 13109451
Alignment:
Q  715 aaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaag 773  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| || |||| | ||||||||||||||||||    
T  13109509 aaaaacatactaaataatataaatttctaatacaacccattaagctaaagcttactaag 13109451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 742 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 3900701 - 3900639
Alignment:
Q  742 taacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaa 805  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  3900701 taacactacccctcaatccaaagcttactaagc-tttaaacttgttgcgaattaacccttaaaa 3900639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 606 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 21858086 - 21858039
Alignment:
Q  606 ctaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaaca 653  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21858086 ctaatataaagacccaatagcttaagctcaatactttattatctaaca 21858039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 746 - 799
Target Start/End: Original strand, 9365292 - 9365344
Alignment:
Q  746 actacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaaccc 799  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||    
T  9365292 actacccctcaagttaaagcttactaaac-tttaaacttattacaaattaaccc 9365344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 620 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 10740607 - 10740574
Alignment:
Q  620 caatagcttaagcccaatattttattatctaaca 653  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10740607 caataacttaagcccaatattttattatctaaca 10740574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 547 - 653
Target Start/End: Original strand, 18792853 - 18792954
Alignment:
Q  547 cattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttatta 646  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |     |||||| ||||| |||  ||||||||||||||   ||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  18792853 cattacaaaaggttataagagaatatacaa----taaaacttaatgcactt-taacttactaatatattggctcaataactgaagcccaatagtttatta 18792947  T
Q  647 tctaaca 653  Q
    |||||||    
T  18792948 tctaaca 18792954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 108; Significance: 1e-53; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 583 - 758
Target Start/End: Complemental strand, 16463036 - 16462862
Alignment:
Q  583 aaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaaca 682  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||    
T  16463036 aaacctaatggact-ctaacttactaatataaaggcttaatatcttaagctcaatactttattatctaacgcctaccctcaaactcatgatgcaacaaca 16462938  T
Q  683 agaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaag 758  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16462937 agaagcattgtgagtttgtcaaacagaatatgaaaaacatactaaataatataaagttctaacactacccctcaag 16462862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 547 - 846
Target Start/End: Complemental strand, 42531390 - 42531098
Alignment:
Q  547 cattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttatta 646  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||     |||||||||||| |||  |||||||||||||| || | |||||| || |||||||||  |||||||    
T  42531390 cattacaaaaggttataagagaatatataa----taaaacctaatgaactt-taacttactaatataaaagtccaataactcaagcccaatcctttatta 42531296  T
Q  647 tctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaaca 746  Q
    ||||||| |||||||||||||||  |||  | ||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  42531295 tctaacatctaccctcaaactcacaatgagtcaacaa-aagcattgtgagtttttcaaacaaaatatgaaaaacatactaaatagtataaagttctaaca 42531197  T
Q  747 ctacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaac 846  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| || |||| | ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||||||||    
T  42531196 ctaaccctcaaactgaagcttactaagc-tttaaactagttatagattaatccagaaaaataaaccaaatcaggtgtcagcaaaaccaatggagagcaac 42531098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 640 - 819
Target Start/End: Original strand, 22820957 - 22821134
Alignment:
Q  640 tttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaact 739  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |    
T  22820957 tttattatctaaaacttactctcaaactaatgatgcataaacaagaagcattgtgagtttgtcaaacaaaatatgaaaaagatattaaataatataaagt 22821056  T
Q  740 tgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcag 819  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22821057 tctaacactacccctaaagctaaagcctactaagc-tttaaacttgttacaaattaaccca-aaaaataaaccaaatcag 22821134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 537 - 746
Target Start/End: Original strand, 814385 - 814591
Alignment:
Q  537 aatagcatagcattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaa 636  Q
    |||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||    
T  814385 aatagcttaacattacaagaggttataagagaatatatata-acgaaa-cctaatggact-ctaacttactaatataaatgcccaataacttaagtccaa 814481  T
Q  637 tattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataa 736  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||  |||  | |||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  814482 tactttattatctaacatctaccctcaaactcacaatgagtcaacaagaaacattgtgagtttgtcaaacaaaatacgaaaaacatactaaataatataa 814581  T
Q  737 acttgtaaca 746  Q
    | || |||||    
T  814582 agttttaaca 814591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31699824 - 31699680
Alignment:
Q  13 atgatgtcatcactccgcaccaccgttccactacatcgaagtaactgttaacatcctttcttccggtagtcgccatctttttcttcacatcgtggcatgt 112  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||  ||||  | ||     
T  31699824 atgaggtcatccctccgcaacaccgttccaccacatcgaagtaaccgttaacatcctttttttcggtagtcgccatcttttccgtcatgtcgtcacctgc 31699725  T
Q  113 gttttctctcttttgggttgtacaatcaaacacgagtaaccctcc 157  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31699724 attttctctcttttgggttgtacaatcaaacacgagtaaccctcc 31699680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 583 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 814329 - 814167
Alignment:
Q  583 aaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaaca 682  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||   |||  | ||||    
T  814329 aaacctaatggact-ctaacttactaatataaatgcccaataacttaagtccaatactttattatctaacaactaccctcaaactctcaatgagtcaaca 814231  T
Q  683 agaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaaca 746  Q
    |||| |||| | | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  814230 agaaacattgtgactttgtcaaacaaaatacgaagaacatactaaataatataaagttctaaca 814167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 547 - 730
Target Start/End: Original strand, 46691459 - 46691636
Alignment:
Q  547 cattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttatta 646  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||     |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  46691459 cattacaaaaggttataagagaatatataa----taaaac-taatggact-ctaacttactagtataaaggtccaataacttaagttcaatactttatta 46691552  T
Q  647 tctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaata 730  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  |||  | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  46691553 tctaacatctaccctcaaacttacaatgagtcaacaagaagcattgtgagtttgttaaacaaaatacgaaaaacatactaaata 46691636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 575 - 733
Target Start/End: Complemental strand, 50297537 - 50297380
Alignment:
Q  575 atatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatg 674  Q
    ||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||  |||    
T  50297537 atataataaaacataatgaact-ctaacttactaatataaagactcaataacttaagcacaatactttattatctaacatctaccctcaaatccacaatg 50297439  T
Q  675 cattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataata 733  Q
      | |||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50297438 agtcaacaagaaacattgtgagtttgtcaaacaaaatacgaaaaacatactaaataata 50297380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 629 - 810
Target Start/End: Original strand, 2593180 - 2593355
Alignment:
Q  629 aagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaa 728  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||| | |||||| |||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||    ||    
T  2593180 aagcccagtatttgattatctaacactgcccctcaaactcatcatgcatcagcaagaaacattgtgagtttgttaaagaaaatacgaaaaacat----aa 2593275  T
Q  729 taatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaa 810  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  2593276 taatataaagttctaacaata-ccctcaagtaaaagcttactaagc-ttctagcttgttaaaaattaacctaaaaaaataaa 2593355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 732 - 822
Target Start/End: Complemental strand, 50296205 - 50296116
Alignment:
Q  732 tataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttg 822  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  50296205 tataaagttctaacattacccctcaagccgaagcttactaagc-tttaggcttgttacaaattaacccataaaaataaaccaaattagttg 50296116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 548 - 653
Target Start/End: Original strand, 18088145 - 18088244
Alignment:
Q  548 attacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattat 647  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| |||    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18088145 attacaaaatgttatgagagaatatata-ata----aacctaatggact-ctaacttactaatataaaggcctaatagcttaagcccaatactttattat 18088238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 576 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 17065630 - 17065516
Alignment:
Q  576 tatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgc 675  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17065630 tataataaaacctaattgactattaacttagaaatataaaggaccaatagcttaagctca-tactctattatctaacacctaccctcaaactcatgacgc 17065532  T
Q  676 attaacaagaagcatt 691  Q
    || || ||||| ||||    
T  17065531 atcaataagaaacatt 17065516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 729 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 34338149 - 34338082
Alignment:
Q  729 taatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaac 797  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34338149 taatataaacttttaaagctacccctcaagctaaagcttactaagc-tttaaacttgttacaaattaac 34338082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 775 - 819
Target Start/End: Original strand, 46691665 - 46691709
Alignment:
Q  775 atttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcag 819  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  46691665 atttaagcttgttacaaattatctcagaaaaataaactaaatcag 46691709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 101; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 598 - 858
Target Start/End: Original strand, 14309 - 14568
Alignment:
Q  598 ctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaacacctaccctcaaactcatgatgcattaacaagaagcattctcagt 697  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  | |||  |||||||| | | |    
T  14309 ctaacttactaatataaaggccccataatttaagcccaatattttattatttaacatctaccctcaaactcacaatgagtcaacgggaagcattgtaatt 14408  T
Q  698 ttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaac 797  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  14409 ttgtcaaacaaaatacgaaaaacatactaattaatataaaattctaacaccacctctcaagctgaagcttactaagc-tttaagcttgttacaaattgac 14507  T
Q  798 ccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgag 858  Q
    | |  ||||||||  ||||||| || ||  | ||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  14508 cgaggaaaataaatcaaatcagctgttaaaagaaccaataaagagcagcaaccaaagtgag 14568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0499 (Bit Score: 70; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0499
Description:

Target: scaffold0499; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 715 - 860
Target Start/End: Original strand, 7028 - 7171
Alignment:
Q  715 aaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaa 814  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| || | ||||||||| ||    
T  7028 aaaaacatactaaaaagtataaacttctaacactaccccttaagctaaagcttactaag-gtttaagctcgttacaaattaa-ccttgaaaataaaccaa 7125  T
Q  815 atcagttgatagcataacaaatggagagcaacaaccaaagtgagtt 860  Q
    ||||| | || ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7126 atcagctcatggcataatcaatggagagcaacacccaaagtgagtt 7171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 550 - 654
Target Start/End: Original strand, 14539 - 14639
Alignment:
Q  550 tacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaat-attaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatc 648  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||  ||||   |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14539 tacaaaaggttataagagaatatatata-----aaacctaacagactatgaacttagtaatgataaaggcccaatagcttaagcccaatactttattatc 14633  T
Q  649 taacac 654  Q
    ||||||    
T  14634 taacac 14639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 695 - 792
Target Start/End: Original strand, 61985 - 62081
Alignment:
Q  695 agtttgtcaaacaaaataagaaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaa 792  Q
    |||||||||||||||| |  ||||| ||||| |||||||||||||   ||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  61985 agtttgtcaaacaaaaaacaaaaaaaatactcaataatataaactcagaaccctacccgtcaagctaaagcttaccaag-ttttaagtttgttacaaa 62081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 742 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 32011 - 31956
Alignment:
Q  742 taacactacccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacc 798  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  32011 taacactccccctcaggctaaagcttactaagc-tttaagcttgttacaaataaacc 31956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 573 - 653
Target Start/End: Original strand, 406277 - 406356
Alignment:
Q  573 atatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttattatctaaca 653  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||    
T  406277 atatataataaaacttaaaggact-ctaacttgctaatataaaggcccaataacttaaacctaatactttattatctaaca 406356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 715 - 772
Target Start/End: Original strand, 153482 - 153539
Alignment:
Q  715 aaaaacatactaaataatataaacttgtaacactacccctcaagctaaagcttactaa 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | || | |||||||||||| ||||    
T  153482 aaaaacatactaaataatataaacttctaacacaaaccattaagctaaagcttgctaa 153539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 750 - 860
Target Start/End: Original strand, 154697 - 154804
Alignment:
Q  750 cccctcaagctaaagcttactaagcatttaagcttgttacaaattaacccataaaaataaactaaatcagttgatagcataacaaatggagagcaacaac 849  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || | || ||||||  ||| |||| ||||| |    
T  154697 ccccttaagataaagattactaagt-tttaagtttgttacaaattaaccc-taaaaataaaccaaattagctcat-gcataatcaatagagaacaacacc 154793  T
Q  850 caaagtgagtt 860  Q
    |||||||||||    
T  154794 caaagtgagtt 154804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 547 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 11288 - 11187
Alignment:
Q  547 cattacaaaaagttataagagaatatatatatactaaaacctaatggactgctaacttactaatattaaggcccaatagcttaagcccaatattttatta 646  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |     |||||| ||||| |||  ||||||||||||||   ||| ||||| || |||||||||| |||||||    
T  11288 cattacaaaaggttataagagaatatacaa----taaaacttaatgcactt-taacttactaatatattggctcaataactgaagcccaatagtttatta 11194  T
Q  647 tctaaca 653  Q
    |||||||    
T  11193 tctaaca 11187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University