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Alignment Overview

Query: NF5442_low_9 (Length: 378)

Name: NF5442_low_9
Description: NF5442
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5442_low_9
NF5442_low_9
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (1-342)||(28421158-28421512)
chr7 (1-341)||(3811368-3811721)
chr7 (1-342)||(5979373-5979730)
chr7 (1-342)||(3817510-3817864)
chr7 (1-342)||(351393-351747)
chr7 (1-342)||(338987-339340)
chr7 (22-343)||(5849135-5849469)
chr7 (29-343)||(35148236-35148564)
chr7 (22-342)||(22742149-22742483)
chr7 (61-342)||(26383275-26383569)
chr7 (127-338)||(35152864-35153078)
chr7 (22-342)||(43539601-43539919)
chr7 (1-126)||(20238785-20238911)
chr7 (1-122)||(15843785-15843907)
chr7 (1-122)||(15860894-15861016)
chr7 (22-127)||(35150761-35150866)
chr7 (22-110)||(26380935-26381023)
chr7 (153-343)||(8824416-8824595)
chr7 (32-261)||(18656883-18657120)
chr7 (137-225)||(42767547-42767636)
chr7 (282-336)||(7608060-7608114)
chr7 (21-110)||(3677876-3677965)
chr7 (23-97)||(7608306-7608381)
chr7 (217-305)||(26380751-26380838)
chr7 (261-312)||(30219547-30219598)
chr7 (22-67)||(12803893-12803938)
chr7 (22-55)||(24690848-24690881)
chr7 (127-215)||(7608163-7608251)
chr7 (178-217)||(24690652-24690691)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (1-342)||(12686378-12686732)
chr5 (1-342)||(12692480-12692834)
chr5 (1-342)||(32094420-32094775)
chr5 (1-342)||(32097221-32097575)
chr5 (1-342)||(41296885-41297243)
chr5 (1-342)||(28525585-28525939)
chr5 (1-342)||(28531681-28532035)
chr5 (1-342)||(7389746-7390101)
chr5 (22-337)||(19059991-19060322)
chr5 (22-339)||(20499747-20500078)
chr5 (22-336)||(19066332-19066655)
chr5 (22-342)||(30771889-30772221)
chr5 (3-341)||(30384586-30384936)
chr5 (1-212)||(14609909-14610129)
chr5 (194-342)||(14609737-14609888)
chr5 (230-315)||(22647928-22648014)
chr5 (34-125)||(26318492-26318582)
chr5 (261-341)||(25408437-25408514)
chr5 (28-338)||(26509468-26509781)
chr5 (152-318)||(8706749-8706916)
chr5 (154-314)||(33021223-33021383)
chr5 (268-342)||(33753710-33753784)
chr5 (267-311)||(26318721-26318765)
chr5 (43-118)||(33753476-33753551)
chr5 (22-55)||(8706639-8706672)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (1-342)||(12001-12356)
scaffold0208 (1-342)||(6128-6483)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (1-342)||(11839924-11840279)
chr3 (1-342)||(42191419-42191774)
chr3 (1-342)||(42197361-42197716)
chr3 (1-342)||(10238411-10238766)
chr3 (1-342)||(10244533-10244888)
chr3 (1-342)||(17055992-17056345)
chr3 (24-343)||(26429639-26429972)
chr3 (1-342)||(55003611-55003955)
chr3 (1-342)||(10769168-10769523)
chr3 (1-342)||(10760849-10761204)
chr3 (1-342)||(38449262-38449617)
chr3 (1-342)||(30051301-30051654)
chr3 (1-342)||(38455749-38456104)
chr3 (1-342)||(49151218-49151572)
chr3 (1-342)||(49157285-49157639)
chr3 (1-342)||(8331393-8331747)
chr3 (22-342)||(28964486-28964811)
chr3 (153-342)||(17601897-17602087)
chr3 (148-341)||(11846335-11846530)
chr3 (152-342)||(23138779-23138970)
chr3 (3-101)||(13837534-13837632)
chr3 (22-203)||(48128260-48128451)
chr3 (178-330)||(53071640-53071793)
chr3 (1-166)||(13444840-13445018)
chr3 (267-342)||(9586491-9586566)
chr3 (191-342)||(24643890-24644044)
chr3 (22-126)||(53069279-53069373)
chr3 (25-333)||(46656306-46656610)
chr3 (35-341)||(2982458-2982779)
chr3 (22-343)||(12108891-12109221)
chr3 (1-78)||(11846262-11846340)
chr3 (192-341)||(34300045-34300197)
chr3 (251-341)||(8474596-8474688)
chr3 (78-186)||(13367114-13367233)
chr3 (22-64)||(24643773-24643815)
chr3 (22-103)||(34300348-34300429)
chr3 (346-378)||(53524293-53524325)
chr3 (126-186)||(9760481-9760543)
chr3 (345-377)||(20196876-20196908)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (1-342)||(32896618-32896973)
chr8 (1-342)||(32890494-32890849)
chr8 (1-342)||(36818578-36818932)
chr8 (1-342)||(42993202-42993553)
chr8 (1-341)||(5542359-5542714)
chr8 (1-342)||(9934889-9935239)
chr8 (1-342)||(10699635-10699990)
chr8 (1-342)||(10705444-10705798)
chr8 (1-342)||(22219926-22220281)
chr8 (1-342)||(14417567-14417901)
chr8 (22-342)||(42033403-42033740)
chr8 (22-342)||(39727528-39727838)
chr8 (22-341)||(39735768-39736091)
chr8 (107-336)||(1883158-1883385)
chr8 (22-126)||(1883039-1883143)
chr8 (152-338)||(17954116-17954305)
chr8 (22-106)||(1171215-1171285)
chr8 (233-290)||(30890535-30890593)
chr8 (208-315)||(45365390-45365497)
chr8 (259-330)||(33630872-33630943)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (1-342)||(13455705-13456060)
chr2 (1-342)||(13461646-13462001)
chr2 (1-342)||(36750020-36750375)
chr2 (16-342)||(35084893-35085233)
chr2 (16-342)||(35090866-35091206)
chr2 (1-343)||(28683144-28683499)
chr2 (1-342)||(30964933-30965288)
chr2 (1-342)||(44717004-44717359)
chr2 (1-342)||(31001982-31002337)
chr2 (1-342)||(13149883-13150243)
chr2 (1-313)||(31007989-31008315)
chr2 (22-343)||(23343168-23343493)
chr2 (24-342)||(19879200-19879536)
chr2 (127-342)||(35439706-35439924)
chr2 (27-225)||(11048776-11048988)
chr2 (152-342)||(35442195-35442386)
chr2 (22-111)||(35438925-35439014)
chr2 (237-342)||(23283849-23283955)
chr2 (127-324)||(7771522-7771722)
chr2 (23-85)||(29034697-29034759)
chr2 (127-214)||(23284680-23284769)
chr2 (287-335)||(38731147-38731195)
chr2 (22-84)||(29833079-29833142)
chr2 (308-342)||(11049012-11049046)
chr2 (149-225)||(31651357-31651431)
chr2 (153-225)||(1388382-1388454)
chr2 (192-244)||(16361738-16361789)
chr2 (152-282)||(28765248-28765379)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (1-342)||(25381734-25382089)
chr1 (1-342)||(1077850-1078205)
chr1 (1-342)||(25387703-25388056)
chr1 (1-342)||(50305803-50306150)
chr1 (1-342)||(31051150-31051505)
chr1 (1-342)||(34739592-34739946)
chr1 (1-342)||(31057650-31058005)
chr1 (22-342)||(44409606-44409940)
chr1 (22-342)||(8093066-8093399)
chr1 (164-342)||(25275421-25275600)
chr1 (33-341)||(27954768-27955088)
chr1 (22-326)||(38152184-38152495)
chr1 (22-337)||(24926981-24927317)
chr1 (33-336)||(24963940-24964252)
chr1 (153-342)||(12183975-12184150)
chr1 (251-341)||(33458371-33458459)
chr1 (251-317)||(4280191-4280258)
chr1 (179-261)||(23253826-23253907)
chr1 (33-80)||(12183820-12183867)
chr1 (41-110)||(33458149-33458218)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (1-342)||(4580520-4580875)
chr6 (1-342)||(25353819-25354172)
chr6 (1-342)||(25343233-25343585)
chr6 (1-342)||(8651002-8651357)
chr6 (1-341)||(21191065-21191423)
chr6 (22-341)||(21197250-21197594)
chr6 (22-342)||(21770787-21771118)
chr6 (29-343)||(21783545-21783880)
chr6 (1-298)||(31756417-31756728)
chr6 (41-342)||(30905821-30906134)
chr6 (29-225)||(21789768-21789982)
chr6 (149-337)||(12801899-12802087)
chr6 (199-342)||(17581210-17581356)
chr6 (22-203)||(17581384-17581572)
chr6 (195-342)||(6096916-6097067)
chr6 (25-186)||(28728047-28728218)
chr6 (233-315)||(13007348-13007431)
chr6 (21-124)||(20745394-20745497)
chr6 (267-336)||(1105925-1105994)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (1-342)||(24287593-24287947)
chr4 (1-342)||(10733551-10733903)
chr4 (1-342)||(10947320-10947672)
chr4 (1-342)||(6257404-6257758)
chr4 (1-342)||(10739538-10739890)
chr4 (1-342)||(10953307-10953659)
chr4 (1-342)||(48166784-48167139)
chr4 (1-342)||(48160565-48160920)
chr4 (22-342)||(26957023-26957357)
chr4 (71-342)||(26971824-26972108)
chr4 (23-342)||(50168201-50168532)
chr4 (1-185)||(33458466-33458662)
chr4 (1-185)||(33461591-33461787)
chr4 (1-329)||(44831816-44832155)
chr4 (22-337)||(49976213-49976524)
chr4 (23-225)||(50155687-50155897)
chr4 (154-341)||(17627139-17627327)
chr4 (1-325)||(35177413-35177759)
chr4 (4-126)||(4632216-4632339)
chr4 (271-342)||(33461797-33461868)
chr4 (251-316)||(50426879-50426945)
chr4 (271-342)||(33458672-33458743)
chr4 (1-63)||(10733445-10733507)
chr4 (1-63)||(10947214-10947276)
chr4 (22-97)||(3769434-3769509)
chr4 (153-247)||(28704234-28704328)
chr4 (195-336)||(4631987-4632128)
chr4 (32-106)||(19686551-19686625)
chr4 (21-99)||(32284542-32284620)
chr4 (24-97)||(17627002-17627075)
chr4 (21-121)||(33045085-33045185)
chr4 (146-249)||(9237084-9237185)
chr4 (304-342)||(532100-532138)
chr4 (127-322)||(19686653-19686854)
chr4 (303-341)||(19686866-19686905)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-342)||(173089-173443)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-342)||(818-1152)
[»] scaffold0440 (1 HSPs)
scaffold0440 (1-342)||(1393-1741)
[»] scaffold0185 (2 HSPs)
scaffold0185 (127-339)||(5576-5792)
scaffold0185 (17-80)||(5826-5889)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (127-342)||(13879-14097)
[»] scaffold1114 (2 HSPs)
scaffold1114 (75-342)||(669-949)
scaffold1114 (22-95)||(950-1023)
[»] scaffold0085 (1 HSPs)
scaffold0085 (41-338)||(38038-38347)
[»] scaffold0449 (1 HSPs)
scaffold0449 (291-341)||(1281-1331)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 28421158 - 28421512
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421158 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 28421257  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421258 tttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 28421357  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcaca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  28421358 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcaca 28421457  T
Q  288 attgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28421458 attgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 28421512  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 3811368 - 3811721
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811368 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 3811467  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3811468 tttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 3811567  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggct 283  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  3811568 at--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcc 3811663  T
Q  284 cacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3811664 cacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatat 3811721  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 5979373 - 5979730
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5979373 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 5979472  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttat-attggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 186  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||          ||||| |||||||| |||||||   |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||     
T  5979473 tattgtcgtgtacggtgtattggggaccataacctcttttattattggatgaccattagactttcccattattctgttaattggccatccgaacatccat 5979572  T
Q  187 tcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaa-ggctc 284  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  5979573 ccatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagggctc 5979672  T
Q  285 acaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5979673 taaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 5979730  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 3817510 - 3817864
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817510 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 3817609  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3817610 tttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 3817709  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaattg-ataactaatcaattaaggct 283  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||||  || ||||||||| ||||||     
T  3817710 at--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttcatcactaatcaactaaggcc 3817805  T
Q  284 cacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  3817806 cacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcctacataatgatatt 3817864  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 351747 - 351393
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  351747 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 351648  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  351647 tttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccagtaatgggccatccggacatccactc 351548  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctc 284  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   || |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||     
T  351547 at--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctg 351451  T
Q  285 acaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  351450 acaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 351393  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 339340 - 338987
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339340 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 339241  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattaggtt-cccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 189  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  339240 tttgtcgtgtacggtatattggggaccatgacctcttttatattggatggccattaggtttcccattattccagtaatgggccatccggacatccactca 339141  T
Q  190 tgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctca 285  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   || |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |    
T  339140 t--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctga 339044  T
Q  286 caattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  339043 caattgataaatagctaatataattattgttatgatatttgcccacataatgatatt 338987  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5849469 - 5849135
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  5849469 gttagcggcgtctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttatcttcagatggggagaaaagagagtttgccgtgtacggtatattg 5849370  T
Q  122 gggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaacta 209  Q
     ||||          ||||||||||||| |||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5849369 aggaccatagcctcttttatattggatgaccattaaggtttctcattattccgttaatggaccatccgaacatccactcat--tgagtccatatcaacta 5849272  T
Q  210 attaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaat 304  Q
    ||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5849271 attaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaataactaat 5849174  T
Q  305 ataattattattacgatatttgcccacataatgatatta 343  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5849173 ataattattgttacgatatttacccacataatgatatta 5849135  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Original strand, 35148236 - 35148564
Alignment:
Q  29 gcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac-- 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  35148236 gcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattggggatca 35148335  T
Q  127 --------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaat 216  Q
            |||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35148336 tagcctcttttatattggatggccattagagtttcccattattctgttaatgagccatccggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaat 35148433  T
Q  217 a----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataatta 311  Q
    |    |||||||||||||  |||||||| ||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35148434 atttaattaattatccaat-tagaaatccaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcataattgataaatagctaatataatta 35148531  T
Q  312 ttattacgatatttg-cccacataatgatatta 343  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35148532 ttgttacgatatttgccccacataatgatatta 35148564  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Original strand, 22742149 - 22742483
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtgtatt 120  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  22742149 gttagcggcggctgatttggtttttcatcaactggtacctttatgcctcaagttctcttcagattgggagaagagagagttttgccatgtacggtatatt 22742248  T
Q  121 ggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaact 208  Q
    || |||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22742249 ggagaccatagtctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat--tgagtccatatcaact 22742346  T
Q  209 aattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaattg-ataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaa 303  Q
    | ||| |||    |||||||||| ||  |||||||||||| || | ||||||||||||  || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22742347 acttatatatttaattaattatctaat-tagaaatctaat-agccttattacttaattttatcactaatcaactaaggctcacagttgataaataactaa 22742444  T
Q  304 tataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  22742445 tataattattgttacggtatttgcctacataataatatt 22742483  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26383569 - 26383275
Alignment:
Q  61 tttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg-- 148  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||          ||||||||||||| ||||||||      
T  26383569 tttatgcctcaagttctcttcaaatagggagaagagagagtttgccgtgtccggtgtattagggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggt 26383470  T
Q  149 ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaat 244  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||||    |||||||||||||  ||||||||||||    
T  26383469 ttcccattattccattaatgggtcatccggacatccactcat--tgagtccatattcattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat 26383373  T
Q  245 tagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
     || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  26383372 -agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattatgatatttgcccacaaaatgatatt 26383275  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 338
Target Start/End: Original strand, 35152864 - 35153078
Alignment:
Q  127 tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----att 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||    
T  35152864 tttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaatt 35152961  T
Q  221 aattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacg 319  Q
    ||||||||||  |||||||| ||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  35152962 aattatccaat-tagaaatcgaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatatctaatataattattgttacg 35153059  T
Q  320 atatttgcccacataatga 338  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35153060 atatttgcccacataatga 35153078  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 43539919 - 43539601
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatgg---ggagaagagagagtttgccgtgtacggtgta 118  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  43539919 gttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctaaagttctcttcagatgggaaggagaagagagagtttgccgtgcacggtata 43539820  T
Q  119 ttggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 206  Q
    ||||||||          |||||||||| || ||||||||  || || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43539819 ttggggaccataacctcttttatattgggtgaccattagggttttccgttattccgttaatgggtcatccagacatccactca--ttgagtccatatcaa 43539722  T
Q  207 ctaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaata 305  Q
     |||||||||     |||||         ||||||||  |  | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  43539721 ttaattaaat-----attat---------aaatctaa--aaccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaaatgataaataattaata 43539638  T
Q  306 taattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43539637 taattatttttacgatatttgcacacataatgatatt 43539601  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20238911 - 20238785
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20238911 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 20238812  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac 126  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||    
T  20238811 tattgccgtgtacggtatattggggac 20238785  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15843907 - 15843785
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15843907 tgatcggaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagag 15843808  T
Q  101 tttgccgtgta-cggtgtattgg 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  15843807 tttgccgtgtaccggtgtattgg 15843785  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15861016 - 15860894
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15861016 tgatcggaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagag 15860917  T
Q  101 tttgccgtgta-cggtgtattgg 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  15860916 tttgccgtgtaccggtgtattgg 15860894  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 127
Target Start/End: Original strand, 35150761 - 35150866
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35150761 gttagcggcggctgatttggttattcttcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 35150860  T
Q  122 gggact 127  Q
    ||||||    
T  35150861 gggact 35150866  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 26381023 - 26380935
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  26381023 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaactgctacctttatgcctaaagttttcttcagatcgggagaagagagagtttgtcgtgt 26380935  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8824595 - 8824416
Alignment:
Q  153 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtccta 252  Q
    ||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||        ||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |  | ||    
T  8824595 cattattccgtta-tgagtcatccagacatccactcatattgagtccatat--------taattaattaattatctaaaa--gaaatctaat-atcctta 8824508  T
Q  253 ttacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatta 343  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||    
T  8824507 ttacctaattcgatcattaatcaattaagcctcacaattgataaatagctaatataattattataaagatatttgcctacataatgacatta 8824416  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 261
Target Start/End: Original strand, 18656883 - 18657120
Alignment:
Q  32 gctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----- 126  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||| |||         
T  18656883 gctgatttggttcttcctcaactgttacttttatgtctttagttctcttcagacggagagaagagaaagtttgtcgtgtatggtgcattggagacaatag 18656982  T
Q  127 ---tttatattg-gatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaa-ttaaataat 219  Q
        ||| | || ||| |||||||||  || ||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||  | |||||||||| || ||| |||||||||    
T  18656983 cctcttacagtgtgat-gccattaggatttaccattattgtattaatgggtcatccagacatccactca--tagagtccatattaattaatttaaataat 18657079  T
Q  220 taattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaat 261  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  18657080 taattatcc-aaataaaaatctaattagccttattacttaat 18657120  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 225
Target Start/End: Original strand, 42767547 - 42767636
Alignment:
Q  137 atggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 225  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42767547 atggccattagggtttcctattattccgttaatggatcatccagacatccactcat-tgaagtccatatcaactaattaaatatttaatta 42767636  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7608114 - 7608060
Alignment:
Q  282 ctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataat 336  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7608114 ctcacaattgataaataactgatataattattattatgatatttgcccatataat 7608060  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 3677965 - 3677876
Alignment:
Q  21 agttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgt 110  Q
    ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  3677965 agttaccggcagttgatttgtttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaatttctcttcagatggagagaagagaatgtttgtcgtgt 3677876  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 23 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 7608381 - 7608306
Alignment:
Q  23 ttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagat-ggggagaagaga 97  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  7608381 ttagcggcgactgatttggtacttcctaaatcggtacctttatgactcaagttctcttccgatgggggagaagaga 7608306  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26380838 - 26380751
Alignment:
Q  217 aattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaata 305  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26380838 aattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattatttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaata 26380751  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 312
Target Start/End: Original strand, 30219547 - 30219598
Alignment:
Q  261 ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattat 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  30219547 ttgatcactaatcaattaaggctcacaattaataaataactactattattat 30219598  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 12803938 - 12803893
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgc 67  Q
    ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12803938 gttagcgacgactgattaggttcttcctcaaccggtacctttatgc 12803893  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 24690881 - 24690848
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24690881 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccg 24690848  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7608251 - 7608163
Alignment:
Q  127 tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaa 215  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||    
T  7608251 tttatattggatggtcattagggtttttcattatttcattaatgggtcatccggacatccactcat--taaccccatatcaactaattaaa 7608163  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24690691 - 24690652
Alignment:
Q  178 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24690691 gacatccactcatattgagtccatattaactaattaaata 24690652  T

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Target: chr5 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 12686378 - 12686732
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686378 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 12686477  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686478 tttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 12686577  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcaca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12686578 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcaca 12686677  T
Q  288 attgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12686678 attgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 12686732  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 12692480 - 12692834
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692480 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 12692579  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692580 tttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 12692679  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcaca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12692680 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcaca 12692779  T
Q  288 attgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12692780 attgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 12692834  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 32094420 - 32094775
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094420 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 32094519  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||          |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32094520 tattgtcgtgtacggtgtatttgggaccatagcctcttttatattagatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatacact 32094619  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32094620 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 32094719  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32094720 aattgataaatagttaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 32094775  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 32097221 - 32097575
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32097221 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttagttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaatagagag 32097320  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | || ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097321 tatttccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 32097420  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32097421 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattag-cttattatttaatttgatcactaaccaattaaggctcac 32097519  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32097520 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 32097575  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 41297243 - 41296885
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagt---tctcttcagatggggagaagaga 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  41297243 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagtagttctcttcagatggggagaagaga 41297144  T
Q  98 gagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatcc 184  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  41297143 gagtattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattctgttaatgggtcatccggacatcc 41297044  T
Q  185 actcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaa 279  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  41297043 actcat--tgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaa 41296948  T
Q  280 ggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41296947 ggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 41296885  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 28525585 - 28525939
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525585 tgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagag 28525684  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28525685 tttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 28525784  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggct 283  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||  || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  28525785 at--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaac-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcc 28525880  T
Q  284 cacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28525881 cacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatatt 28525939  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 28531681 - 28532035
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531681 tgatctgaaacacacaatagagtcagcggtggctgatttgattcttcctcaaccagtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagag 28531780  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28531781 tttgccatgtacggtatattggagaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 28531880  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggct 283  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||  || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  28531881 at--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaac-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcc 28531976  T
Q  284 cacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28531977 cacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatatt 28532035  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 7389746 - 7390101
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389746 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 7389845  T
Q  101 ttt-gccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    ||| ||||||||| || ||||||| ||          |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  7389846 ttttgccgtgtacagtatattgggaaccatagcctcttttatattggatggccattagagtttcccattattccgttaatgggtcatccgaacatccact 7389945  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |    
T  7389946 cat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaagac 7390041  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7390042 tcacaattgataaatagctaatataattatcgttacgatattttcccacataatgatatt 7390101  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 22 - 337
Target Start/End: Original strand, 19059991 - 19060322
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  | |||||||    
T  19059991 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaactggtacttttatgcctcaagttctcttcatatcgggagaagagagagtttgtcgtgtctgatgtattg 19060090  T
Q  122 gggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaacta 209  Q
    |||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  19060091 gggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggacatccagacatccactcatattgagtccatatccatta 19060190  T
Q  210 attaaataattaat---tatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaata 305  Q
    ||||| ||||||||   ||| | ||||||||||||||| || | |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||    
T  19060191 attaattaattaattaatattctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagtctccaaattgacaaatagctaata 19060290  T
Q  306 taattattattacgatatttgcccacataatg 337  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19060291 taattattatggagatatttgcccacataatg 19060322  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 22 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20500078 - 20499747
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtgtatt 120  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20500078 gttagcagcggttgatttggttcttccttaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcaaatggagagaacagagagttttgccgtgtacggtgtatt 20499979  T
Q  121 ggggacttta----------tattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaact 208  Q
    ||||||  ||          ||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  20499978 ggggaccatagcctcttatttattggatgaccattagggttttccattatttcgttaatgggccatccagacatccactcat--tgagtccatatcaatt 20499881  T
Q  209 aattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaa 303  Q
    |||||||||    ||||||||||  |  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20499880 aattaaatatttaattaattatcttac-tagaaatctaat-agtcttattacttaatttgatcactaatcaattaagactcacaattgataaatagctaa 20499783  T
Q  304 tataattattattacgatatttgcccacataatgat 339  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  20499782 tataattattattacgatatttgtccatataatgat 20499747  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 336
Target Start/End: Original strand, 19066332 - 19066655
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19066332 gttagcggcagctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtccggtgtattg 19066431  T
Q  122 gggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaacta 209  Q
    |||||          |||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |    |||||||| | ||    
T  19066432 gggaccacaacctattttatattggatggtcattagggttttccattatttcgttaatgggtcatccagacatccactcatat---atccatatccatta 19066528  T
Q  210 attaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataa 308  Q
    |||||  |||||| ||| | ||||||||||||||| || | | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||    
T  19066529 attaatcaattaa-tattctaaatagaaatctaataagccttgttacttaatttgatcactaatcaattaaggctccagattgacaaataattaatataa 19066627  T
Q  309 ttattattacgatatttgcccacataat 336  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||    
T  19066628 ttattatggagatatttgcccacataat 19066655  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30772221 - 30771889
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||    
T  30772221 gttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtctgatatattg 30772122  T
Q  122 gggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaacta 209  Q
     ||||          | |||||||||||  ||| |||  ||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30772121 tggaccatagtctcttctatattggatgatcatcagggtttttcattattctgttaatgggtcatccagacatccactcatattgagtccatatcaacta 30772022  T
Q  210 attaa----ataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaat 304  Q
    |||||     ||||||||||||||| | ||||| ||   ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||   | |||||    
T  30772021 attaattatttaattaattatccaata-agaaa-ctttatagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaactgata---agctaat 30771927  T
Q  305 ataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30771926 ataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 30771889  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 341
Target Start/End: Original strand, 30384586 - 30384936
Alignment:
Q  3 atctgaaacgcacaatagag-ttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagt 101  Q
    ||||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  30384586 atctgaaacacacaacatagcttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatacctcgagttctcttcagatggggagaagagaatgt 30384685  T
Q  102 ttgccgtgtacggtgtattggggac---------tttatattggatggccattag-gttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||  |         ||||||||||||| | |||||  || ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||      
T  30384686 ttgccgtgtacggtgtattgggaccatagtctcttttatattggatgactattagattttccattattccgttaatgagtcatccagacatccactca-- 30384783  T
Q  192 ttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||| |||||||| | |||| |||    ||||||||||| | || |||||||| || ||| | |||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  30384784 ttgaatccatatctattaatgaaatatttaattaattat-ctaattagaaatccaa-tagccttattacttaatttaatcactaatcaattaaggctcac 30384881  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30384882 aactgataaatagctaatataattattattacaatatttgtccacataatgatat 30384936  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 14610129 - 14609909
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    |||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  14610129 tgatctgaaacaaacaaaagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctaaagttctcttcagatggggagaaaagaaag 14610030  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatta-ggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 189  Q
    |||||||||| |||||||||||||||          |||| ||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14610029 tttgccgtgttcggtgtattggggaccataacctcttttacattagatgaccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 14609930  T
Q  190 tgttgagtccatatcaactaatt 212  Q
      ||||||||||||||| |||||    
T  14609929 --ttgagtccatatcaattaatt 14609909  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 194 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14609888 - 14609737
Alignment:
Q  194 gagtccatatcaactaattaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaa 288  Q
    ||||||||||||| |||||||||    |||||||||||  |  |||||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14609888 gagtccatatcaattaattaaatgtttaattaattatcttac-tagaaatctaat-agttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaa 14609791  T
Q  289 ttgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14609790 ttgataagtaactaatataattattattacgatatttgcacacataatgatatt 14609737  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 230 - 315
Target Start/End: Original strand, 22647928 - 22648014
Alignment:
Q  230 aaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattat 315  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||  |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22647928 aaatagaaatctaattagtcttattacttaatttgataactaattaattaagactccaaatttataaataattaatataattattat 22648014  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 34 - 125
Target Start/End: Original strand, 26318492 - 26318582
Alignment:
Q  34 tgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattgggga 125  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || | |||||||||    
T  26318492 tgatttggttctttctcaaccggtacatttataccataagttctcttcagat-gggagaagagagagtttgtcgtttccgatatattgggga 26318582  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 261 - 341
Target Start/End: Original strand, 25408437 - 25408514
Alignment:
Q  261 ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25408437 ttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaata---tatataattacttttacgatatttgtccacataatgatat 25408514  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26509781 - 26509468
Alignment:
Q  28 ggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac- 126  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||| | ||||     
T  26509781 ggcggctgatttgatacttcctcaatcggtacctttatgcctctagttctcatcagat--ggaaaagggagagtttaccgtgtacggtatatcgtggacc 26509684  T
Q  127 -------tttatattg-ga-tggccatt--aggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaacta-attaa 214  Q
            ||||| || || | ||||||  || ||| || ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||  | |||| |||||||| ||  ||||    
T  26509683 ataacctcttatagtgtgatttgccattaaagtttctcaatattccgttgatggaccatccaaacatccactca--tagagttcatatcaattattttaa 26509586  T
Q  215 ataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattatt 313  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | || | |||||||| ||||| |||     ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||    
T  26509585 ataattaattatcc-aaatagaaatctaatcattcttgttacttaatttgatcact-----attaaggctccaaattgataaatagttaatataattatt 26509492  T
Q  314 attacgatatttgcccacataatga 338  Q
    |  | ||||||||||||| ||||||    
T  26509491 a-caagatatttgcccacttaatga 26509468  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 318
Target Start/End: Original strand, 8706749 - 8706916
Alignment:
Q  152 ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaat----tatccaaaatagaaatctaattag 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||| | | ||||||| ||  ||  |||||||||| |||||||||| |||||    |||| ||  ||||||| ||||  |    
T  8706749 ccattattccgttaatgggtcatctgcatatccacttat--tggatccatatcaattaattaaatatttaataaattatctaat-tagaaatttaatc-g 8706844  T
Q  248 tcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattac 318  Q
    || ||| |||||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8706845 tcttatcacttaatttgatcactaatcaattaagacccacagttgataaatagctaatataattattattac 8706916  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 314
Target Start/End: Original strand, 33021223 - 33021383
Alignment:
Q  154 attattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaa-ataattaattatccaaaatagaaatctaattagtccta 252  Q
    ||||||| ||||||||| |||||  |||| ||||| | |||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||  |     
T  33021223 attattctgttaatgggtcatccaaacattcactcttattgaatttatatcaattaattaagataattaattatccaaa-tgtaaatctaattagtttt- 33021320  T
Q  253 ttacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattatta 314  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||| ||  |||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33021321 ttactttatttgatcactaatcaatcaaatctcatagttgataaataattaatataattatta 33021383  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 342
Target Start/End: Original strand, 33753710 - 33753784
Alignment:
Q  268 ctaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||    
T  33753710 ctaatcaattaaagctccaaattgataaatagctaatataattatgataataatatttacccacataatgatatt 33753784  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 311
Target Start/End: Original strand, 26318721 - 26318765
Alignment:
Q  267 actaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataatta 311  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26318721 actaatcaattaagtctcagaattgatagataactaatataatta 26318765  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 118
Target Start/End: Original strand, 33753476 - 33753551
Alignment:
Q  43 tcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgta 118  Q
    |||| ||||| |||||  ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  33753476 tctttctcaaacggtatttttatgcctcaagttctccttggatggggagaagagagagtatggtgtgtacggtgta 33753551  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 55
Target Start/End: Original strand, 8706639 - 8706672
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccg 55  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8706639 gttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccg 8706672  T

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Target: scaffold0208 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12356 - 12001
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12356 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 12257  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12256 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 12157  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12156 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 12057  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12056 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 12001  T

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Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6483 - 6128
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6483 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 6384  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6383 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 6284  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||       
T  6283 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggcttta 6184  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6183 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 6128  T

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Target: chr3 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 11839924 - 11840279
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11839924 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 11840023  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840024 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 11840123  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11840124 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 11840223  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840224 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 11840279  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 42191419 - 42191774
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191419 tgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 42191518  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191519 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 42191618  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42191619 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 42191718  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42191719 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 42191774  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 42197361 - 42197716
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197361 tgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 42197460  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197461 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 42197560  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42197561 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 42197660  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42197661 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 42197716  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 10238411 - 10238766
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238411 tgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 10238510  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238511 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 10238610  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  10238611 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaacactaatcaattaaggctcac 10238710  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238711 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 10238766  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 10244533 - 10244888
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244533 tgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 10244632  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244633 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 10244732  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  10244733 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgaacactaatcaattaaggctcac 10244832  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10244833 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 10244888  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 17055992 - 17056345
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17055992 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 17056091  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17056092 tttgccgtgtacgatgtattggggaccatagcctcttttatattggatgtccattagggtttcccattattccgttaataggc-atccggacatccactc 17056190  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcaca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  17056191 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcaca 17056290  T
Q  288 attgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17056291 attgataaatagataatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 17056345  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 24 - 343
Target Start/End: Original strand, 26429639 - 26429972
Alignment:
Q  24 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattgg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26429639 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattgg 26429738  T
Q  123 ggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaa 210  Q
    ||||          |||||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26429739 ggaccatagcctcttttatactggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagcccatatcaactaa 26429838  T
Q  211 ttaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataat 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26429839 ttaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataat 26429938  T
Q  310 tattattacgatatttgcccacataatgatatta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26429939 tattattacgatatttgcccacataatgatatta 26429972  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 55003611 - 55003955
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55003611 tgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttggttc---ctcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 55003707  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattaggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat 190  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| |     | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  55003708 tttgtcgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattggatgac-----gtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcat 55003802  T
Q  191 gttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaat 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  55003803 gttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaataaattaaggctctaaat 55003902  T
Q  290 tgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55003903 tgataaataactaatataattattattacgatatttgtccacataatgatatt 55003955  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 10769168 - 10769523
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10769168 tgatctgaaatacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 10769267  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10769268 tattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 10769367  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  10769368 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 10769463  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10769464 tcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 10769523  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 10760849 - 10761204
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10760849 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 10760948  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||          |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10760949 tattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 10761048  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  10761049 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 10761144  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10761145 tcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 10761204  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 38449262 - 38449617
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449262 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 38449361  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38449362 tattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 38449461  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |    
T  38449462 cat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaagac 38449557  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38449558 tcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 38449617  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 30051301 - 30051654
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30051301 tgatctgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgggcagaagagagag 30051400  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccatta-ggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 189  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30051401 tttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactc- 30051499  T
Q  190 tgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctc 284  Q
     ||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  30051500 -gttaagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tatctttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctc 30051596  T
Q  285 acaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30051597 acaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 30051654  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 38455749 - 38456104
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38455749 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 38455848  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38455849 tattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 38455948  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||  |    
T  38455949 cat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaacac 38456044  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38456045 tcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 38456104  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 49151572 - 49151218
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49151572 tgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagag 49151473  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49151472 tttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 49151373  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggct 283  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||  || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  49151372 at--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaac-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcc 49151277  T
Q  284 cacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49151276 cacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatatt 49151218  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 49157639 - 49157285
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157639 tgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcacgttctcttcagatggggagaagagagag 49157540  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49157539 tttgccatgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 49157440  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggct 283  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||  || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  49157439 at--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaac-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcc 49157344  T
Q  284 cacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49157343 cacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatatt 49157285  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8331747 - 8331393
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331747 tgatctaaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 8331648  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    |||||||||||| |||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8331647 tttgccgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactc 8331548  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggct 283  Q
    |  || |||||||||||||| ||||||    ||||||||||||| || ||||||||| | ||  | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||      
T  8331547 a--ttaagtccatatcaactgattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctta-tatccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggtc 8331452  T
Q  284 cacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8331451 cacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgtccacataatgatatt 8331393  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28964811 - 28964486
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28964811 gttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccg--------atgcctcgagttctcttcagatggggagaagagagagttttccgtgtacggtatattg 28964720  T
Q  122 gggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaacta 209  Q
    |||||          ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28964719 gggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttctcattattccgttaatggaccatccggacatccactcat--tgagtccatatcaacta 28964622  T
Q  210 attaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaat 304  Q
    ||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| | |  |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28964621 attaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaataactt-tattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaatttataaatagctaat 28964524  T
Q  305 ataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28964523 ataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 28964486  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 153 - 342
Target Start/End: Original strand, 17601897 - 17602087
Alignment:
Q  153 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtccta 252  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17601897 cattattccgttaatgggtcattcggacatccaatcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagcctta 17601996  T
Q  253 ttacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||| |||||||    
T  17601997 ttacttaatttgaccactaatcaattaaggctctaaattgataaataactaatataattattactatgatatttacgcacatagtgatatt 17602087  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 148 - 341
Target Start/End: Original strand, 11846335 - 11846530
Alignment:
Q  148 gttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaa 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||    
T  11846335 gttctcattattccgttaatgggccatccggacatccactcat--tgactcaatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaa 11846431  T
Q  244 ttagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
    |||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11846432 ttagccttattacttaatttgatcactaatccattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 11846530  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 152 - 342
Target Start/End: Original strand, 23138779 - 23138970
Alignment:
Q  152 ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattag 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  23138779 ccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-ag 23138874  T
Q  248 tcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    || |||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23138875 tcttattacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 23138970  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13837632 - 13837534
Alignment:
Q  3 atctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagt 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13837632 atctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagt 13837534  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 22 - 203
Target Start/End: Original strand, 48128260 - 48128451
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  48128260 gttagcagcggctgatttggttcttcctcaactggtacctttatgcctttagttctcttcagacagggagaagagaatgtttgccgtgtacggtatattg 48128359  T
Q  122 gggac----------tttatattggatggccatta--ggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatat 203  Q
    |||||          ||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  48128360 gggaccatagcctcttttatattggatgaccattaaggttttccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatat 48128451  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 178 - 330
Target Start/End: Original strand, 53071640 - 53071793
Alignment:
Q  178 gacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaat 272  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||    
T  53071640 gacatccactcat--tgagttcatatcaactaattaaatattcaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaat 53071735  T
Q  273 caattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgccca 330  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  53071736 caactaaggctcacaattgataaataactaatataattattgttatgatatttgccca 53071793  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 13445018 - 13444840
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||| | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  13445018 tgatctgaaccacaaaacagggttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacttttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagaa 13444919  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaa 166  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  13444918 tatcgttgtgtacggtgtattggggaccataacctattttatattggatggccattagggtttcccattatttcgttaa 13444840  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 267 - 342
Target Start/End: Original strand, 9586491 - 9586566
Alignment:
Q  267 actaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9586491 actaatcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 9586566  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 191 - 342
Target Start/End: Original strand, 24643890 - 24644044
Alignment:
Q  191 gttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctca 285  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | | |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  24643890 gttgagtccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttgttacttaatttgatcactaatcaactaagactca 24643987  T
Q  286 caattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  24643988 caattgataaataactaatgtaattattgttaggatatttgcccacataataatatt 24644044  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Original strand, 53069279 - 53069373
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53069279 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacct----------agttctcttcagatggggagaagagagagtttgccatgtacggtgtattg 53069368  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 46656610 - 46656306
Alignment:
Q  25 agcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattgggg 124  Q
    |||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||  | |||| |||||||||||||||||||  ||||      ||||||||||||||     
T  46656610 agcggcgattgatttggctcttccttaaccggcacctttatgtctctaattctattcagatggggagaagagaatgttt------tacggtgtattggga 46656517  T
Q  125 ac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaatt 212  Q
    ||          ||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  46656516 accataacctcttttatattggataaccaatagggtttcccattattccgttaataggtcatccggacatccactcatc--gagtacatatcaactaatt 46656419  T
Q  213 aaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatata 307  Q
    |||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||   |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |           |||||||    
T  46656418 aaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agctttattacttaatttgatcactaatcaattaaagctcacagt-----------taatata 46656332  T
Q  308 attattattacgatatttgcccacat 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  46656331 attattattacgatatttgcccacat 46656306  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 341
Target Start/End: Original strand, 2982458 - 2982779
Alignment:
Q  35 gatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac-------- 126  Q
    ||||||||||||| ||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||| |||| |||||            
T  2982458 gatttggttcttcttcaataagtatctttatgtcttaagttctcttcagatagggagaaaagagagttcgccgtatatggtatatttgggaccatgacct 2982557  T
Q  127 --tttatattggatggccattagg-ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaat 223  Q
      |||||||| | ||| ||||||| ||  ||||||||  |||||||| ||||| |||||  |||| | ||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  2982558 cttttatatttgttggtcattaggattttcattattcttttaatgggtcatcctgacatatactcgtattgagtttatatcaactaattaaatatttaat 2982657  T
Q  224 ta---tccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacg 319  Q
    ||   |   || ||||||||||| ||    ||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||     
T  2982658 taatttttcaattagaaatctaaatatctttattatttaatttgatcactaatcaaataaggctcgctattgataaatagattatataattattattaca 2982757  T
Q  320 atatttgcccacataatgatat 341  Q
    |||||||  | |||||||||||    
T  2982758 atatttgttcgcataatgatat 2982779  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 22 - 343
Target Start/End: Original strand, 12108891 - 12109221
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||     |||| || |||| ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  12108891 gttagcggcgactgatttggttcttctttaaccggtacctttatgcctcaagttc-----agatcggaagaaaagatagtttgccgtgtacgatgtattg 12108985  T
Q  122 gggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaacta 209  Q
     ||||          ||||||||| ||| |||||     ||| |||||||||||||| | | ||||  |||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  12108986 aggaccgtactctcttttatattgaatgaccattgttatttctcattattccgttaacgagtcatctagacatcaactcatattgagtccatatcaatta 12109085  T
Q  210 attaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaattg-ataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaat 304  Q
    || ||||    ||| ||||||| ||  ||||||  ||  ||    ||| ||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12109086 atcaaatgtttaatcaattatctaat-tagaaactta--taacattatcacttaattttatcactaatcaattaaagatcacaattgataaataactaat 12109182  T
Q  305 ataattattattacgatatttgcccacataatgatatta 343  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  12109183 acaattattattacgatatttactcacataataatatta 12109221  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 11846262 - 11846340
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctga-tttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctc 78  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  11846262 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgattttggttcttcctcaaccggaacctttatgccgcaagttctc 11846340  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 192 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 34300197 - 34300045
Alignment:
Q  192 ttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaattga-taactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||    |||||||||||||  || |||| |||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||||  |||||    
T  34300197 ttgagttcatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-taaaaatttaat-agtcttattacttaattcaattactaatcaattaattctcac 34300100  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  34300099 aattgataaatagttaatataattattattatgatgtttgcccacgtaatgatat 34300045  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 341
Target Start/End: Original strand, 8474596 - 8474688
Alignment:
Q  251 tattacttaatt-gataactaatcaattaa-ggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8474596 tattacttaatttgatcactaatcaattaaaggcccacaattgattaaaagttaatataattattattacgatatttgttcacataatgatat 8474688  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 186
Target Start/End: Original strand, 13367114 - 13367233
Alignment:
Q  78 cttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac---------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaa 166  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||  |||||||| ||||||||||         |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  13367114 cttcagatggggagaagagcggttttgctatgtacggtatattggggaccatagcctctttatattggatggtcattagggtttcccattattccgttaa 13367213  T
Q  167 tgggccatccggacatccac 186  Q
    ||| |||||| |||||||||    
T  13367214 tggaccatccagacatccac 13367233  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 64
Target Start/End: Original strand, 24643773 - 24643815
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtaccttta 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24643773 gttagcggcggctgatttggttctttctcaaccggtaccttta 24643815  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 34300429 - 34300348
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagttt 103  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  34300429 gttagcggcgacttatttggttattcttcaaccggtactttcatgcctcaagttctcttcatacgaggagatgagagagttt 34300348  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 53524325 - 53524293
Alignment:
Q  346 agtcgggcagaaatttgagcctcattacgatta 378  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53524325 agtcgggcagaaatttgagcctcattacgatta 53524293  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 126 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 9760543 - 9760481
Alignment:
Q  126 ctttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 186  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  9760543 ctttatattggatgaccattagggtttcctattattcctttaatggaccatccagacatccac 9760481  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 345 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20196908 - 20196876
Alignment:
Q  345 gagtcgggcagaaatttgagcctcattacgatt 377  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20196908 gagtcgggcagaaatttgtgcctcattacgatt 20196876  T

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Target: chr8 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32896973 - 32896618
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896973 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 32896874  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896873 tattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 32896774  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32896773 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 32896674  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896673 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 32896618  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 32890849 - 32890494
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890849 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 32890750  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890749 tattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 32890650  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32890649 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagggtcac 32890550  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32890549 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 32890494  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36818932 - 36818578
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36818932 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcatcagatggggagaagagagag 36818833  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||          |||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36818832 tttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 36818733  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcaca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  36818732 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattaaccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcaca 36818633  T
Q  288 attgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36818632 attgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 36818578  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 42993202 - 42993553
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||    
T  42993202 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaa---agag 42993298  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | ||||||||| |||| ||||||||||          ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42993299 tattgccgtgttcggtatattggggaccataacctcttttatattggatggcgattagggtttcccattattccgttaatgggccatc-ggacatccact 42993397  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42993398 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 42993497  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42993498 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccatataatgatatt 42993553  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 5542359 - 5542714
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542359 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 5542458  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5542459 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 5542558  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggct 283  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  5542559 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagtcttattacttaatttgatcactaatcaattaaggct 5542656  T
Q  284 cacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542657 ctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 5542714  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 9935239 - 9934889
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  9935239 tgatctgaaacacacaatagatttagcggcggctgatttggttcttcctcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagag-- 9935142  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattaggtt-cccattattccgttaatgggccatccggacatccactca 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||          ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9935141 tttgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttat-ttggatggccattaggtttcccattattccgttaatgggtcatccggatatccactca 9935043  T
Q  190 tgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaa 288  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9935042 tgttgagtccatatcaataaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagctttattacttaatttgatcactaatcaattaagactcacaa 9934943  T
Q  289 ttgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  9934942 ttgataaataactaatataattattattacaatatttacccacataatcatatt 9934889  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10699990 - 10699635
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  10699990 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttttcgtcagatggagagaagagagag 10699891  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||          |||||||| |||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10699890 tattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatatttgatgaccattagggtttcccattactccgttaatgggtcatccggacatccact 10699791  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  10699790 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agcctaattacttaatttgatcactaatcaattaaggc 10699695  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10699694 tcacaattgataaataactagtataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 10699635  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 10705798 - 10705444
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705798 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatggcttaagttctcttcagatggggagaagagagag 10705699  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg-ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    | ||| |||||||||| |||||| |||          |||||||| |||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10705698 tattgtcgtgtacggtatattggagaccatagcctcttttatatttgatgactattagggtttccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 10705599  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggct 283  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||  |||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  10705598 at--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattattcaat-tagaaatctaat-agttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggct 10705503  T
Q  284 cacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10705502 cacaattgataaatagctaatataattattgttacgatattcgcccacaaaatgatatt 10705444  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 22219926 - 22220281
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    |||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22219926 tgatctgaaacaaacaataaagttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 22220025  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22220026 tattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccatt 22220125  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |  | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  22220126 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-acccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 22220221  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22220222 ttacgattgataaatagctaatataactattgttacgatatttgcccacataatgatatt 22220281  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14417901 - 14417567
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14417901 tgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacgtttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 14417802  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggactttatattggatggccattaggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtcca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||        | |  ||   ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||    
T  14417801 tttgccgtgtacggtgtattggggaccata--------gcctctttttttcccattatttcgttaatgggacatccgaacatccactca--ttgagccca 14417712  T
Q  201 tatcaactaattaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataa 295  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14417711 tatcaactaattaaatattcaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataa 14417614  T
Q  296 ataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14417613 ataactaatataattattattacgatattttcccacataatgatatt 14417567  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 42033740 - 42033403
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42033740 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggagagaagagagagtttgccgtgtacaatgtattg 42033641  T
Q  122 gggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggc----catccggacatccactcatgttgagtccatatca 205  Q
    |||||          ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  42033640 gggaccatagcctcctttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggcgggccatccggacatccactcat--tgagtccatatca 42033543  T
Q  206 actaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataac 300  Q
    ||||||||||||    |||||||||| ||  |||||||||||| |  | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42033542 actaattaaatatttaattaattatctaat-tagaaatctaataac-cttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagc 42033445  T
Q  301 taatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  42033444 taatataattattgttacgatatttacccgcataatgatatt 42033403  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Original strand, 39727528 - 39727838
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtgtatt 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  39727528 gttagcggctgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagtactcttgagatggggagaagagagagttttgttgtgtacggtatatt 39727627  T
Q  121 ggggactttatattggatggccattaggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata--- 217  Q
    ||||||  |||         ||  |   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||       
T  39727628 ggggaccatat---------cctct---ttcccattgttccgttaatgggctatccggacatccactcat--tgagtccatatcaattaattaaatattt 39727713  T
Q  218 -attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattat 315  Q
     |||||||||||||  ||||||| |||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  39727714 aattaattatccaat-tagaaatttaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaagtctcacaattgataaatagctaatataattattgt 39727811  T
Q  316 tacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  39727812 tacgatatttgcccacataatgatatt 39727838  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 39735768 - 39736091
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtgtatt 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |      
T  39735768 gttagcggcggctgatttgattcttccttaactggtacatttatgcctcaagtactcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtacggt--acc 39735865  T
Q  121 ggggact---ttatattggatggccattagg-ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaat 216  Q
     | | ||   ||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39735866 agagcctcttttatattagatggccattagggtttcccttattccgttaatgggtcatccggacatccactgat--tgagtccatatcaactaattaaat 39735963  T
Q  217 a----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataatta 311  Q
    |    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39735964 atttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaatgctcacaattgataaatagctaatataatta 39736061  T
Q  312 ttattacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
    || |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39736062 ttgttacgatatttgtccacataataatat 39736091  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 107 - 336
Target Start/End: Original strand, 1883158 - 1883385
Alignment:
Q  107 gtgtacggtgtattggggactttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatc 204  Q
    |||||| |||||||||||||  ||   ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1883158 gtgtacagtgtattggggaccatagcctggatggccattaaggtttcccattatttcgttaatgggtcatccggacatccactcatattgagtccatatc 1883257  T
Q  205 aactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaa 303  Q
     | ||||||| ||||     || | ||||||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  1883258 cattaattaattaat-----attctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaagtaaggctccaaattgataaatagctaa 1883352  T
Q  304 tataattattattacgatatttgcccacataat 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1883353 tataattattattacgatatttgcccgcataat 1883385  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 126
Target Start/End: Original strand, 1883039 - 1883143
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  1883039 gttagcggcggctaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgtctcaagttctcttcagatggggagaagagaaagtttgccgtgtattgtgtattg 1883138  T
Q  122 gggac 126  Q
    |||||    
T  1883139 gggac 1883143  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17954305 - 17954116
Alignment:
Q  152 ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcct 251  Q
    |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||| ||| | |    
T  17954305 ccattattccgttagtgggtcatctgaacatccactcattttgagtccatatcaactaattaattaattaatta-attaaatagaaatctaa-taggctt 17954208  T
Q  252 attact----taat-tgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatga 338  Q
    ||||||    |||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||    
T  17954207 attactttagtaatctgatcactaatcaattaagtctccaaattgataaatagctaatataattattataaagatattttcccacaaaatga 17954116  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1171285 - 1171215
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcc 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1171285 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggt--------------agttctcttcagatggggagaagagagagtttgcc 1171215  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 290
Target Start/End: Original strand, 30890535 - 30890593
Alignment:
Q  233 tagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaatt 290  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30890535 tagaaatctaattagtcttattaattaatttgatcactaatcaattaagactcacaatt 30890593  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 45365497 - 45365390
Alignment:
Q  208 taattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaattga-taactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatat 306  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||||| | | ||| |||||| | | |||||||||| ||| |||| |  ||||| |||||||||||    
T  45365497 taattaaataattaattattcgaa-tggaaatctaattagacttgttagttaattcaatcactaatcaatcaagactcatatatgatagataactaatat 45365399  T
Q  307 aattattat 315  Q
    |||||||||    
T  45365398 aattattat 45365390  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 259 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 33630943 - 33630872
Alignment:
Q  259 aattgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgccca 330  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  33630943 aattgatcattaatcgattaagactctcaaattataaataactaatataaatattataaagatatttgccca 33630872  T

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Target: chr2 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13456060 - 13455705
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13456060 tgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 13455961  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13455960 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 13455861  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13455860 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 13455761  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13455760 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 13455705  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13462001 - 13461646
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13462001 tgatctgaaacacacaatagagttagcggtggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 13461902  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461901 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 13461802  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13461801 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 13461702  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13461701 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 13461646  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 36750375 - 36750020
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750375 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 36750276  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | ||| ||||||||||||||||| |||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750275 tattgtcgtgtacggtgtattggagaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 36750176  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36750175 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaaatatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 36750076  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36750075 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 36750020  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 35084893 - 35085233
Alignment:
Q  16 aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacgg 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35084893 aatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacgg 35084992  T
Q  115 tgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccata 202  Q
    | ||||||||||          |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35084993 tatattggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccata 35085092  T
Q  203 tcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataact 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35085093 tcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagct 35085192  T
Q  302 aatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35085193 aatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 35085233  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 16 - 342
Target Start/End: Original strand, 35090866 - 35091206
Alignment:
Q  16 aatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacgg 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35090866 aatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacgg 35090965  T
Q  115 tgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccata 202  Q
    | ||||||||||          |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35090966 tatattggggaccatagcctcttttatattggatagccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtctata 35091065  T
Q  203 tcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataact 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35091066 tcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagct 35091165  T
Q  302 aatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35091166 aatataattattattacgatatttacccacataatgatatt 35091206  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 343
Target Start/End: Original strand, 28683144 - 28683499
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683144 tgatctgaaacacacaatagagttaacagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 28683243  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683244 tttgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 28683343  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggct 283  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||    ||||| ||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||     
T  28683344 at--tgagtccatatcaactaattaaatgtttaattatttatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcc 28683439  T
Q  284 cacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatta 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28683440 cacaattgataaataactaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatta 28683499  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30965288 - 30964933
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30965288 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 30965189  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||          |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30965188 tattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattagatggccattaggatttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 30965089  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  ||| |||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  30965088 cat--tgaatccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agtcttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 30964993  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30964992 ccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 30964933  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 44717004 - 44717359
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44717004 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagatag 44717103  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44717104 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggttttccattattccgttaatgggccatccggacatccact 44717203  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  | ||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |    
T  44717204 cat--taagtccatatcaactaattatatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaagac 44717299  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44717300 tcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatgtgcccacataatgatatt 44717359  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31002337 - 31001982
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31002337 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 31002238  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||  ||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31002237 tattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 31002138  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  31002137 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 31002042  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31002041 ccacaattgataaatagctaatataattattgttatgatatttgcccacataatgatatt 31001982  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 13149883 - 13150243
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggg-----gagaaga 95  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |     |||||||    
T  13149883 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgagatgaggagaaga 13149982  T
Q  96 gagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacat 182  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||||||||          |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13149983 gagaatattgccgtgtacggtatattggggaccataacctcttttatattagatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccgtacat 13150082  T
Q  183 ccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaatt 277  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| | ||||||| |    
T  13150083 ccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcaataatcaact 13150178  T
Q  278 aaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13150179 aatgcccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 13150243  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31008315 - 31007989
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31008315 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccggtacttttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 31008216  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||  ||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  31008215 tattgttgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcccattattccgttaatgggtcattcggacatccact 31008116  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  31008115 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 31008020  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattatt 313  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31008019 ccacaattgataaatagctaatataattatt 31007989  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 22 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23343493 - 23343168
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23343493 gttagcagcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttcccgtgtacggtgtattg 23343394  T
Q  122 gggac----------tttatattggatggccatta-ggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaa 210  Q
    |||||          |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||||          
T  23343393 gggaccatagcctcttttatattggatggtcattagggtttccattattctgttaatgggtcatccggacatccacctatattgagtccatatc------ 23343300  T
Q  211 ttaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataat 309  Q
       | ||||||||||  | ||||||||||||||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||    
T  23343299 --cattaattaattactctaaatagaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctccaaattgataaatagttaatataat 23343202  T
Q  310 tattattacgatatttgcccacataatgatatta 343  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23343201 tattattatgatatttgtccacataatgatatta 23343168  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19879536 - 19879200
Alignment:
Q  24 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtgtattgg 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  19879536 tagcggcggctgatttgattcttcttcaatcggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacgatgtattgg 19879437  T
Q  123 ggact---------------ttatattggatggccattaggtt-cccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaa 206  Q
     |||                ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||| |||||||    
T  19879436 cgaccataacctcttttatgttatattggatggccattaagtttcccattattccgttaatgggtcatctggacattcactcat--tgagtcaatatcaa 19879339  T
Q  207 ctaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataacta 302  Q
     |||||||||| ||||||||  |   || |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  19879338 ttaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctcacaattaataaatagcta 19879240  T
Q  303 atataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19879239 atatagttattattacgatattttcccacataatgatatt 19879200  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 127 - 342
Target Start/End: Original strand, 35439706 - 35439924
Alignment:
Q  127 tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----att 220  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||||||||||    |||    
T  35439706 tttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat--taagttcatatcaactaattaaatatttaatt 35439803  T
Q  221 aattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacg 319  Q
    ||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  35439804 aattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaatcaaggctcacaattgataaataacgaatataattattgttacg 35439901  T
Q  320 atatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35439902 atatttgcccacataatgatatt 35439924  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Original strand, 11048776 - 11048988
Alignment:
Q  27 cggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagaga----gtttgccgtgtacggtgtattgg 122  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||    
T  11048776 cggcgactaatttggttcttcctcaactggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttggtttgccgtgtacgatgtattgg 11048875  T
Q  123 ggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaa 210  Q
    ||||          |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  11048876 ggaccatagcctcttttatattggatcgccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccagacatccaccca--ttgagtccatatcaactaa 11048973  T
Q  211 ttaaataattaatta 225  Q
    ||||||| |||||||    
T  11048974 ttaaatatttaatta 11048988  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 342
Target Start/End: Original strand, 35442195 - 35442386
Alignment:
Q  152 ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattag 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  35442195 ccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-ag 35442290  T
Q  248 tcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
     | |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35442291 ccttattacttaatttgatcactaatcaatcaaggctcacaattgataaatagcgaatataattattgttacgatatttacccacataatgatatt 35442386  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 111
Target Start/End: Original strand, 35438925 - 35439014
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35438925 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgta 35439014  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 237 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23283955 - 23283849
Alignment:
Q  237 aatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataa 335  Q
    |||||||| || | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23283955 aatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaagactccaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgtccacataa 23283856  T
Q  336 tgatatt 342  Q
    |||||||    
T  23283855 tgatatt 23283849  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 324
Target Start/End: Original strand, 7771522 - 7771722
Alignment:
Q  127 tttatattggatggccattaggtt-cccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtcca-tatcaactaattaaata----att 220  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||   ||||||  |||||||||||||||||    |||    
T  7771522 tttatattggatgacgattaggtttcccattattctgttaatgggtcatccggacgtccactcatc--gagtcccgtatcaactaattaaatatttaatt 7771619  T
Q  221 aattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacg 319  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||   |||||||||||| ||| | ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  7771620 aattatccaat-tagaaatctaat-agctttattacttaatttgatcagtaatcaactaagacttacaattgataaatagctaatataattattgttacg 7771717  T
Q  320 atatt 324  Q
    |||||    
T  7771718 atatt 7771722  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 29034759 - 29034697
Alignment:
Q  23 ttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagat 85  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29034759 ttagcggtggctgatttgattcttcctcaactggtacctttatgtctcaagttctcttcagat 29034697  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23284769 - 23284680
Alignment:
Q  127 tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaa 214  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| ||||| | |||||||    
T  23284769 tttatatttgatggccattagagtttcacattattccgttaatgggtcatcagaacatccacccatattgagtcaatatccattaattaa 23284680  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38731195 - 38731147
Alignment:
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataa 335  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  38731195 aattgataaatgactaatataattattataaagatatttgaccacataa 38731147  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 29833142 - 29833079
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctga-tttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcaga 84  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||||||||||||    
T  29833142 gttagcggcggctaaatttggttcttcctcaaccgatacatttatccttcaagttctcttcaga 29833079  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 342
Target Start/End: Original strand, 11049012 - 11049046
Alignment:
Q  308 attattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11049012 attattattacgatatttgcccacataataatatt 11049046  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 31651431 - 31651357
Alignment:
Q  149 ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 225  Q
    ||||||||||||  |||||||  ||||  |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31651431 ttcccattattcttttaatggatcatctagacatcgactcat--tgagtccatatcaattaattaaatatttaatta 31651357  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 225
Target Start/End: Original strand, 1388382 - 1388454
Alignment:
Q  153 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaatta 225  Q
    |||||||||||||| | | ||||  |||||| | |||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  1388382 cattattccgttaacgtgtcatctagacatcaaatcatattgagttcatatcaattaattaaaaaattaatta 1388454  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 16361789 - 16361738
Alignment:
Q  192 ttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat 244  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16361789 ttgagttcatatcaattaattatataattaattat-ctaaatagaaatctaat 16361738  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 28765379 - 28765248
Alignment:
Q  152 ccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaatta-aataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcc 250  Q
    ||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||||||| | |||| |||||||| || ||| | || |||||||||| ||||| |||| ||||||| |     
T  28765379 ccattattccgttgatgagtcatccatacattcactcatatcgagttcatatcaattatttatattagttaattatcc-aaataaaaatataattagcct 28765281  T
Q  251 tattacttaa-ttgataactaatcaattaaggc 282  Q
    ||| | |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28765280 tatcatttaatttgatcactaatcaattaaggc 28765248  T

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Target: chr1 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 25381734 - 25382089
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25381734 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 25381833  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25381834 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggccatccggacatccact 25381933  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25381934 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 25382033  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25382034 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 25382089  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1078205 - 1077850
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1078205 tgatctgaaacacacaatagagttagcggccgctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggtgagaagagagag 1078106  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1078105 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 1078006  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1078005 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 1077906  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1077905 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 1077850  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 25387703 - 25388056
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25387703 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 25387802  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25387803 tattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggccatccggacatccact 25387902  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25387903 cat--taagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 25388000  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25388001 aattgataaataaataatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 25388056  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 50306150 - 50305803
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  50306150 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggta-------gcctcaagttctcttcagatggggagaagagagaa 50306058  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50306057 tttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 50305958  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcaca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  50305957 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcaca 50305858  T
Q  288 attgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50305857 attgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 50305803  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31051505 - 31051150
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051505 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttccttaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 31051406  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051405 tattgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 31051306  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  31051305 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 31051210  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31051209 ccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 31051150  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34739946 - 34739592
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34739946 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagattgggagaagagagag 34739847  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34739846 tttgtcgtgtacggtatattggggaccacagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 34739747  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctc 284  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |   || |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |    
T  34739746 at--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggccc 34739650  T
Q  285 acaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34739649 tcaatttataaatagctaatataattattgttacgatattttcccacataatgatatt 34739592  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 31058005 - 31057650
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31058005 tgatctaaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggttcttccttaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 31057906  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||           ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31057905 tattgtcgtgtacggtatattggggatcatagcctcttttatattgtatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccact 31057806  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  31057805 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 31057710  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31057709 ccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 31057650  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 44409940 - 44409606
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtgtatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  44409940 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtatagtgtatt 44409841  T
Q  121 ggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaact 208  Q
    ||||||          ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  44409840 ggggaccataacctcttttatattggatggccattagggtttctcattattccgttaatgggccatccggacatccactcat--tgagtccatattaact 44409743  T
Q  209 aattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaattga-taactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaa 303  Q
    |||||||||    |||||||||||||  |||||| ||||| || | |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44409742 aattaaatatttaattaattatccaat-tagaaacctaat-agccttattacctaatttaatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaa 44409645  T
Q  304 tataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44409644 tataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 44409606  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Original strand, 8093066 - 8093399
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  8093066 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaaagagagtttgccgtgttcggtatattg 8093165  T
Q  122 gggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaacta 209  Q
    |||||          |||||||| ||||  | |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8093166 gggaccatagcctcttttatatttgatgatcgttagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcat--tgagtccatatcaacta 8093263  T
Q  210 attaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaat 304  Q
    ||||||    |||||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8093264 attaaacatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgattattaatcaactaagactcacaattgataaataactaat 8093361  T
Q  305 ataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||    
T  8093362 ataattattgttacggcatttgcccggataatgatatt 8093399  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 164 - 342
Target Start/End: Original strand, 25275421 - 25275600
Alignment:
Q  164 taatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-tt 262  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||    
T  25275421 taatgggtcatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaattt 25275520  T
Q  263 gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25275521 gatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 25275600  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 27955088 - 27954768
Alignment:
Q  33 ctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----- 126  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  || ||| |||||   ||||||||||||          
T  27955088 ctgatttagttattcctcaaccggtacctttatgtcttaagttctct-cagatggggagaagagaatgtattgtcgtgt---gtgtattggggatcataa 27954993  T
Q  127 -----tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata-- 217  Q
         ||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  27954992 catcttttatattggatgaccattatgatttcccattattccactaatgagccatccatacatccactcatattgagtccatatcaactaattaaatatt 27954893  T
Q  218 --attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattatta 314  Q
      |||||||||| ||| |||||||||||| || | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27954892 taattaattatc-aaattagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaattaagcctcacaattgataaataactaatataattagta 27954795  T
Q  315 ttacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27954794 ttacgatttttgcccacgtaatgatat 27954768  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 326
Target Start/End: Original strand, 38152184 - 38152495
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  38152184 gttagcggcagctaatttggttcttcttcaaccggtacctttatgcttcaagttttctttagatggggagaagaacgagtttgtcgtgtacggtgtattg 38152283  T
Q  122 gggac----------tttatattggatggccattagg-ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaa 210  Q
    || ||          |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||| ||||||||||||    
T  38152284 ggaaccatagcctcttttatattggatggtcattaggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatc-------attgagttcatatcaactaa 38152376  T
Q  211 ttaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaata 305  Q
    |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  38152377 ttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcccacaattgataaataattaata 38152474  T
Q  306 taattattattacgatatttg 326  Q
    |||||||| |||| |||||||    
T  38152475 taattattgttacaatatttg 38152495  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 337
Target Start/End: Original strand, 24926981 - 24927317
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || ||||||    
T  24926981 gttagtggcagctgatttggttcttcctcaaccggtacctatatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttccacgtatggagtattg 24927080  T
Q  122 gggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaacta 209  Q
    || ||          ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||| | ||    
T  24927081 ggaaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccagacatccac-ca--ttgagtccatatccatta 24927177  T
Q  210 attaaataattaat-----------tatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaat 297  Q
    ||||| ||||||||           ||| | |||||||||||| || || | | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  24927178 attaattaattaattaattaattaatattctaaatagaaatcttataagccttgttacttaatttgatcactaatcaattaagactccaaattgataaat 24927277  T
Q  298 aactaatataattattattacgatatttgcccacataatg 337  Q
    | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24927278 agctaatataattattatagagatatttgcccacataatg 24927317  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 336
Target Start/End: Original strand, 24963940 - 24964252
Alignment:
Q  33 ctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac------ 126  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||| ||           
T  24963940 ctgatttggttcttcctcaaccagtacatttatgcctcaagtcctcttcagatggggagaagagagagtttgccacatacggtgtcttggtgatcatagc 24964039  T
Q  127 ----tttatattggatggccattagg-ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataatta 221  Q
        |||||||| |||| | |||||| || ||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||  ||||| |||||| | ||||||| ||||||    
T  24964040 atcttttatattagatgacaattagggtttccatttttccgttaatgggtcattcagacatccacccat--tgagttcatatccattaattaattaatta 24964137  T
Q  222 attatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacga 320  Q
    || || | |||||||||||| || ||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||   ||    
T  24964138 at-attctaaatagaaatcttataagctttattacttaatttgatcactaatcaattaaggcttcaaattgataaatagctaatataattattatagaga 24964236  T
Q  321 tatttgcccacataat 336  Q
    ||||| ||||||||||    
T  24964237 tatttacccacataat 24964252  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 153 - 342
Target Start/End: Original strand, 12183975 - 12184150
Alignment:
Q  153 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagt 248  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  12183975 cattattccgttaattggccatccggacatctactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaaa-tagaaatctaattag- 12184072  T
Q  249 cctattacttaattgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||| |||||               ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12184073 cct-ttact---------------caattaaggctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 12184150  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 251 - 341
Target Start/End: Original strand, 33458371 - 33458459
Alignment:
Q  251 tattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||||| ||||||| ||||||    
T  33458371 tattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataaccaatataactattat---gatatttgtccacatactgatat 33458459  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 251 - 317
Target Start/End: Original strand, 4280191 - 4280258
Alignment:
Q  251 tattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattatta 317  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4280191 tattacttaatttgatcactaatcaattaaggttcacaattgataaatagttaatataattattatta 4280258  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23253907 - 23253826
Alignment:
Q  179 acatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaat 261  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  23253907 acatctactcatatcgagtccatatcaattaattaattaattaattat-ctaaatagaaattcaattagtcttatcacttaat 23253826  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 80
Target Start/End: Original strand, 12183820 - 12183867
Alignment:
Q  33 ctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctctt 80  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12183820 ctgatttggttatttctcaaccgctacctttatgcctcaagttctctt 12183867  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 110
Target Start/End: Original strand, 33458149 - 33458218
Alignment:
Q  41 gttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgt 110  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||| ||  |||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33458149 gttctttctcaactggtagctttatgtctatagttctattcgtatgggaagaagagagagtttgccgtgt 33458218  T

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Target: chr6 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 4580520 - 4580875
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580520 tgatctgaaacacgcaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 4580619  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  4580620 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccattaatgggtcatccggacatccact 4580719  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4580720 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 4580819  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4580820 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 4580875  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25354172 - 25353819
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25354172 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 25354073  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||          |||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25354072 tattgtcgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattagatgaccattagagtttcccattattccgttaatgggccatccggatatccact 25353973  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcac 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25353972 catgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaat--aaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcac 25353875  T
Q  287 aattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25353874 aattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 25353819  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25343585 - 25343233
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25343585 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 25343486  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac---------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  25343485 tattgtcgtgtacggtgtattggggacatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatggaccatccgaacatccactc 25343386  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcaca 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||    
T  25343385 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaat--aaatctaattagccttattacttaatttaatcactaatcaattaaggttcaca 25343288  T
Q  288 attgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25343287 attgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 25343233  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 8651002 - 8651357
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8651002 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 8651101  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8651102 tattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 8651201  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |    
T  8651202 cat--taagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agtcttattacttaatttgatcactaatcaactaagac 8651297  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8651298 tcacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 8651357  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 341
Target Start/End: Original strand, 21191065 - 21191423
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctta---agttctcttcagatggggagaagaga 97  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21191065 tgatatgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcatcaagttctcttcagatggggagaagaga 21191164  T
Q  98 gagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatcc 184  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||          |||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21191165 gagtattgccgtgtaaggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattatggtttcacattattccgttaatgggccatccgaacatcc 21191264  T
Q  185 actcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaag 280  Q
    ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21191265 actcat--tgaatccatatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagccatattacttaatttgatcactaatcaattaag 21191362  T
Q  281 gctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21191363 gctctaaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 21191423  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 22 - 341
Target Start/End: Original strand, 21197250 - 21197594
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagt-----------ttgccgtgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||    
T  21197250 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgagtattgccgtgt 21197349  T
Q  111 acggtgtattggggac----------tttatattggatggccattaggtt--cccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtc 198  Q
    ||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21197350 acggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggttttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat--tgagtc 21197447  T
Q  199 catatcaactaattaaataattaattatcca---aaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgata 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  |   || ||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||    
T  21197448 catatcaactaattaaatatttaattatttatccaattagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcagttaaggctctaaattgata 21197547  T
Q  295 aataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21197548 aataactaatataattattattacgatatttacccacataatgatat 21197594  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Original strand, 21770787 - 21771118
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtgtatt 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21770787 gttagcagcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatgg--agaagagagagttttgccgtgtacggtgtatt 21770884  T
Q  121 ggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaact 208  Q
    ||||||          |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  21770885 ggggaccgtagcctcttttatattggttggccattagggtttcccattattccgttaatggtc-atccggacatccactcat--taagtccatatcaact 21770981  T
Q  209 aattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaa 303  Q
    |||||||||    ||||||||| |||  |||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21770982 aattaaatatttaattaattattcaat-tagaaatctaat-agttttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaatagctaa 21771079  T
Q  304 tataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21771080 tataattattgttacgatatttgtccacataatgatatt 21771118  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 29 - 343
Target Start/End: Original strand, 21783545 - 21783880
Alignment:
Q  29 gcggctgatttggttcttcctcaaccgg------tacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagttt-gccgtgtacggtgtattg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21783545 gcggctgatttggttcttcctcaaccggcacctttacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattg 21783644  T
Q  122 gggac------------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaac 207  Q
    |||||            ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  21783645 gggacaccatagcctcttttatattggatg-ccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcat--taagtccatatcaac 21783741  T
Q  208 taattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataacta 302  Q
    ||||||||||    |||||||||||||  ||||||| |||| |||  |||||||||||| ||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||    
T  21783742 taattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatttaat-agttttattacttaatttgatcactaatccactaagactcacaattgataaatagtta 21783839  T
Q  303 atataattattattacgatatttgcccacataatgatatta 343  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  21783840 atataattattattacgatatttacccacataataatatta 21783880  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 31756417 - 31756728
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagag--ttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagag 98  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31756417 tgatctgaaacacacaatatagggttagcggcggctgatttggttcttcctcaacaggtacctttatacctcaagttctcttcagatggggagaagagag 31756516  T
Q  99 agtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 186  Q
    |||||| |||||  | | ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31756517 agtttgtcgtgtttgatatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattcc-ttaatgggtcatccggacatccac 31756615  T
Q  187 tcatgttgagtccatatcaactaattaa----ataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaagg 281  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||     
T  31756616 tca--ttgagtccatatcaactaattaattatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaga 31756711  T
Q  282 ctcacaattgataaata 298  Q
    | |||||||||||||||    
T  31756712 cccacaattgataaata 31756728  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 41 - 342
Target Start/End: Original strand, 30905821 - 30906134
Alignment:
Q  41 gttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------ttta 130  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| ||          ||||    
T  30905821 gttcttcctcaattggtatatttatgcctcaagttctcttcagatgggg-gaagagagagtttgtcgagtacggtgtattgggaaccatagcctctttta 30905919  T
Q  131 tattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaatt 224  Q
    ||||||||| |||||| |  |||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  30905920 tattggatgaccattatggtttcccattattctgttaaaggatcatccagacatctactcata--gagtccatatcaactaattaaatatttaattaatt 30906017  T
Q  225 atccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatat 323  Q
    ||||||  |||||||||||| || | |||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30906018 atccaat-tagaaatctaat-agccttattactttatttggttactaatcaactaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatat 30906115  T
Q  324 ttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30906116 ttgcccacataatgatatt 30906134  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 225
Target Start/End: Original strand, 21789768 - 21789982
Alignment:
Q  29 gcggctgatttggttcttcctcaaccgg------tacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21789768 gcggctgatttggttcttcctcaaccggcacctttacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgccgtgtacggtgtattg 21789867  T
Q  122 gggac------------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaac 207  Q
    |||||            |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  21789868 gggacaccatagcctcttttatattggat-gccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttaagtccatatcaac 21789964  T
Q  208 taattaaataattaatta 225  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21789965 taattaaatatttaatta 21789982  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 149 - 337
Target Start/End: Original strand, 12801899 - 12802087
Alignment:
Q  149 ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagt 248  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| ||| |||||||| || | ||||||||||||||| ||     
T  12801899 ttcccattattccattaatgggtcatccagacatccactcatattgagtccaaatccattaaataattaattaat-attctaaatagaaatctaataagc 12801997  T
Q  249 cctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatg 337  Q
      |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  12801998 tttattacttaaattgatcactaatcaattaaggctccaaattgacaaatagctaatataattattatagagatatttgcccacgtaatg 12802087  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 199 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17581356 - 17581210
Alignment:
Q  199 catatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgat 293  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||   |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  17581356 catatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaccataat-agtcttattacttaatttgatcactaatcaattgaggctcacaattgat 17581259  T
Q  294 aaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17581258 aaatagttaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 17581210  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17581572 - 17581384
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag-tttgccgtgtacggtgtatt 120  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||   ||    
T  17581572 gttagtggcagctgatttggttcttcctcaacttgtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagttttgtcgtgtacagt---tt 17581476  T
Q  121 ggggac----------tttatattggatggccattagg-ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatat 203  Q
    ||||||          ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17581475 ggggaccatagcctcttttatattggacggttattaggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactca--ttgagtccatat 17581384  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 195 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 6097067 - 6096916
Alignment:
Q  195 agtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaattg-ataactaatcaattaaggctcacaat 289  Q
    |||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||| ||||||| |||| || | ||||||||||||  || ||||||||| ||||||| |||||    
T  6097067 agtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcaaaattagaaatttaat-agccttattacttaatttcatcactaatcaagtaaggctgacaat 6096969  T
Q  290 tgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6096968 tgacaaataagtaatataattattgttactatatttgcccacataatgatatt 6096916  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 28728218 - 28728047
Alignment:
Q  25 agcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattgggg 124  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | | ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  28728218 agcggcggctagttaggttcttcctcaaccggtacctcgatgccctaa-tgcgcttcagatggggagaagagcggttttgctgtgtacggtatattgggg 28728120  T
Q  125 act---------ttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 186  Q
    ||          |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28728119 accatagcctcattatataggatggccattagggtttcccattattccgttaatggaccatccggacatccac 28728047  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 233 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 13007431 - 13007348
Alignment:
Q  233 tagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattat 315  Q
    ||||||| ||||||||| ||||  |||||| ||| | |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13007431 tagaaatttaattagtcttattgtttaatttgatcattaatcaattagggctccaaattgataaataactaatataattattat 13007348  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 20745497 - 20745394
Alignment:
Q  21 agttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtatt 120  Q
    ||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||  | ||| |||| | |||| |||||||||||||    
T  20745497 agttagcggtgactaatttggtttttcctcaatcggtacttttaagccccaagttctcttcagatggaaataagtgagaatatgccatgtacggtgtatt 20745398  T
Q  121 gggg 124  Q
    ||||    
T  20745397 gggg 20745394  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 267 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1105994 - 1105925
Alignment:
Q  267 actaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataat 336  Q
    ||||||||| |||  || |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1105994 actaatcaaataaaacttacaattgataaatatcaaatataattattactaccatatttgcccacataat 1105925  T

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Target: chr4 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24287947 - 24287593
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287947 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 24287848  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac---------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    | |||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287847 tattgccgtgtacggtgtattggggacatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 24287748  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcaca 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24287747 atgttgagtccatatcaactaattaaatatttaaatatccaaaatagaaatctaattagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcaca 24287648  T
Q  288 attgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24287647 atttataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 24287593  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 10733551 - 10733903
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10733551 tgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagag 10733650  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggact--------ttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733651 tttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat 10733750  T
Q  191 gttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctca 285  Q
      | ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  10733751 --taagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctca 10733846  T
Q  286 caattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733847 caattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 10733903  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 10947320 - 10947672
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10947320 tgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagag 10947419  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggact--------ttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10947420 tttgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat 10947519  T
Q  191 gttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctca 285  Q
      | ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  10947520 --taagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctca 10947615  T
Q  286 caattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10947616 caattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 10947672  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 6257404 - 6257758
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257404 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 6257503  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg-ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    | |||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6257504 tattgccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccattattccgttaatgggccatccggatatccactc 6257603  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggct 283  Q
    ||  |||| ||||||||| ||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| ||   |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  6257604 at--tgagcccatatcaattaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agctttattacttaatttgatcactaatcaactaaggct 6257699  T
Q  284 cacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6257700 cacaattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 6257758  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 10739538 - 10739890
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10739538 tgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagag 10739637  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggact--------ttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat 190  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10739638 tttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcat 10739737  T
Q  191 gttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctca 285  Q
      | ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||   ||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  10739738 --taagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaatc-agaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctca 10739833  T
Q  286 caattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10739834 caattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 10739890  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 10953307 - 10953659
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  10953307 tgatttgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccgatacctttatgcctcaaattctcttcagatggggagaagagagag 10953406  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggact--------ttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcat 190  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10953407 tttaccgtgtacggtgtattggggaccatagcctcttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcat 10953506  T
Q  191 gttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctca 285  Q
      | ||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||   ||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  10953507 --taagtccatatcaactaatcaaatacttaattaattatccaatc-agaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggctca 10953602  T
Q  286 caattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953603 caattgataaatagctaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 10953659  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48167139 - 48166784
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48167139 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 48167040  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48167039 tattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccgaacatccact 48166940  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  48166939 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 48166844  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48166843 ccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 48166784  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48160920 - 48160565
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160920 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactaatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 48160821  T
Q  101 t-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccact 187  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||          |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48160820 tattgccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgggccatccgaacatccact 48160721  T
Q  188 catgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggc 282  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  48160720 cat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggc 48160625  T
Q  283 tcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48160624 ccacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 48160565  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 22 - 342
Target Start/End: Original strand, 26957023 - 26957357
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtatt 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  26957023 gttagcggcgactgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatatt 26957122  T
Q  121 ggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaact 208  Q
    ||||||          |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26957123 ggggaccatagcctcttttatatttgatggccattagggtttcccattattccgttaatgagccatccggacatccactcat--tgagtccatatcaact 26957220  T
Q  209 aattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaa 303  Q
    |||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26957221 aattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-agtcttattacttaatttgatcactaattaattaaggctcacaattgataaatagctaa 26957318  T
Q  304 tataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26957319 tataattattgttacgatatttgcccacataatgatatt 26957357  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 71 - 342
Target Start/End: Original strand, 26971824 - 26972108
Alignment:
Q  71 aagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg-ttcccattat 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||          |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26971824 aagttctcttcagatggggagaagagagagtattgccgtgtacggtatattggggaccatagtctcttttatattggatggccattagggtttccattat 26971923  T
Q  159 tccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtcctatt 254  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  |||||||||||| |  | |||     
T  26971924 tccgttaatggaccatccagacatccactcat--tgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatccaat-tagaaatctaat-atccttatc 26972019  T
Q  255 acttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26972020 acttaatttgatcactaatcaattaagactcacaattgataaatagctaatataattattgttacaatatttgcccacataatgatatt 26972108  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 23 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 50168532 - 50168201
Alignment:
Q  23 ttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattgg 122  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  50168532 ttagcggcggttgatttagttcttcctcaac-ggtacctttatgcctcaagttctcttcagatggagagaaaagagagttttgcgtgtacggtgtattgg 50168434  T
Q  123 ggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaa 210  Q
    ||||          ||||||||| ||| ||||||||  || |||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  50168433 ggaccatagcctcttttatattgaatgaccattagggttttccattatttcgttaatgggtcattcggtcatccactca--ttgagtccatatcaactaa 50168336  T
Q  211 ttaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattactt-aattgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaata 305  Q
    |||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | | |||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  50168335 ttaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttgttacttgatttgaccactaatcaattaagactcacaattgataaatagctaata 50168238  T
Q  306 taattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  50168237 taattattattacgatattttccgacgtaatgttatt 50168201  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 33458466 - 33458662
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33458466 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttctttctcaaccgatacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagaaag 33458565  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatcca 185  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||          ||||||||||||| || |||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  33458566 tttgtcgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccgttagggtttcgcattatttcgttaatgggccatccagacatcca 33458662  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 33461591 - 33461787
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33461591 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttgattcttcctcaaccggtacctttatgcctcaagttcttttcagatggggagaagagagag 33461690  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatcca 185  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||          |||||||||||||  ||| |||  |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  33461691 tttaccgtgtacggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgatcatcagggtttcccattatcccgttaatgagtcatccggacatcca 33461787  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 329
Target Start/End: Original strand, 44831816 - 44832155
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaa--tagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagag 98  Q
    ||||||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  44831816 tgatctgaaacacacaaaatagggttagcgacggctgatgtggttcttcctcaaccggtatttttatgcctcaagttctcttcggatgcggagaagagag 44831915  T
Q  99 agtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccac 186  Q
    ||||    |||| |||| ||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  44831916 agtt----gtgttcggtatattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttccaattattccgttaatggaccatccggacatgcac 44832011  T
Q  187 tcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaagg 281  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| | || || |||||| | ||  | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||     
T  44832012 tca--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattat-ctaattaaaaatctta-taaccttattacttaatttgatcactaatcaactaaga 44832107  T
Q  282 ctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgccc 329  Q
       | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44832108 tctataattgataaataactaatataattattgttacaatatttgccc 44832155  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 22 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 49976524 - 49976213
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtg----- 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  49976524 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaac-ggtac-tttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtggagac 49976427  T
Q  117 tattggggactttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaa 214  Q
     ||       ||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||        ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| | |||||||    
T  49976426 cataacctcttttatattggatggccattagggttttccattattacgt--------catccagacatccacccatattgaatccatatccattaattaa 49976335  T
Q  215 ataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattatt 313  Q
     ||||||| ||| | ||| | ||||||||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  49976334 ttaattaa-tattctaaacaaaaatctaataagccttattacttaatttgatcactaatcaattaaggctccaaattaataaatagctaatataattatt 49976236  T
Q  314 attacgatatttgcccacataatg 337  Q
    ||   |||| ||||||||||||||    
T  49976235 atagagata-ttgcccacataatg 49976213  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50155897 - 50155687
Alignment:
Q  23 ttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggag-aagagagagtttgccgtgtacggtgtattg 121  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  50155897 ttagcggcggctgatttgattctttctcgactggtacctttatgccttaagttcttttcagatgaggagaaagagagagttttgcgtgtacggtgtattg 50155798  T
Q  122 gggac----------tttatattggatggccatta--ggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaacta 209  Q
    |||||          |||||||||||||  |||||  | ||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  50155797 gggaccataacttcttttatattggatgatcattatggtttctcattagttcgttaatggatcatccggacatccactc-----gagtccatatcaacta 50155703  T
Q  210 attaaataattaatta 225  Q
    |||||||| |||||||    
T  50155702 attaaatatttaatta 50155687  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 341
Target Start/End: Original strand, 17627139 - 17627327
Alignment:
Q  154 attattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----attaattatccaaaatagaaatctaattagtc 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||||||||||| || |||| |||||    |||||||||| ||  | |||||||||| || |    
T  17627139 attattccgttaatgggtcatcctgacatcccctcat--tgagtccatattaattaatcaaatatttaattaattatctaat-tggaaatctaat-aggc 17627234  T
Q  250 ctattacttaattga-taactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
     |||||||||||| | | ||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17627235 ttattacttaatttaatcactaatcaattcagactcacaatcgataaatagctaatataattattattacgatattttcccacataatgatat 17627327  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 35177759 - 35177413
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaa--tagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaaga-ga 97  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  | ||    
T  35177759 tgatctgaaacacacaacatagagttagcggcgcctgatttgattatttctcaaccgatacatttatgcctcaagttctcttcagatgaggagaccatga 35177660  T
Q  98 gagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatcca 185  Q
        |||  ||||||||||||||| ||||          ||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||    
T  35177659 tttattgttgtgtacggtgtattgaggactataacctcttttatattggatgaccattagggtttctcattattcctttaataggtcatccagacataca 35177560  T
Q  186 ctcatgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaag 280  Q
    ||| | |||||||||| ||||| |||||||    ||| ||||||| | || |||||| ||||  || | |||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  35177559 ctcgtattgagtccatgtcaacaaattaaatatttaaataattat-ctaattagaaaactaa-cagccttattacttaatttgatcactaatcaattaat 35177462  T
Q  281 gc----tcacaattgataaataactaatataattattattacgatattt 325  Q
    ||    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35177461 gctcgttcataattgataaatatctaatataattattattacgatattt 35177413  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4632339 - 4632216
Alignment:
Q  4 tctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagt-t 102  Q
    |||||||| || || | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| |    
T  4632339 tctgaaacacaaaacatagttagcggcttctgatttggttcttcctcaaccggtatctttatgcctcaagttctcttcagatgagaagaagagaaagtat 4632240  T
Q  103 tgccgtgtacggtgtattggggac 126  Q
    || | ||||| || ||||||||||    
T  4632239 tgtcatgtactgtatattggggac 4632216  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 342
Target Start/End: Original strand, 33461797 - 33461868
Alignment:
Q  271 atcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33461797 atcaactaaggctcacaattgataaatagctaatataattattgttacgataattgcccacataaagatatt 33461868  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 251 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 50426945 - 50426879
Alignment:
Q  251 tattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattatt 316  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50426945 tattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacacttgataaataactaatataattattatt 50426879  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 271 - 342
Target Start/End: Original strand, 33458672 - 33458743
Alignment:
Q  271 atcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33458672 atcaactaaggctcacaattgataaatagttaatataattattgttacgataattgcccacataaggatatt 33458743  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 10733445 - 10733507
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtaccttt 63  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10733445 tgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgataccttt 10733507  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 10947214 - 10947276
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtaccttt 63  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10947214 tgatttgaaacacacaatagagttagcgacggctgatttggttcttcctcaaccgataccttt 10947276  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 3769509 - 3769434
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagaga 97  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||    
T  3769509 gttagtggcggctgatttggttcttcctcaacccgtatatttatgcctatagttcttttcagatagggagaagaga 3769434  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28704328 - 28704234
Alignment:
Q  153 cattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaatt-aaataattaattatccaaaatagaaatctaattag 247  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  28704328 cattattcagttaatgagtcatccagacatccactcatattgagttcatatcagttaattaaaataattaattatcc-aaataaaaatctaattag 28704234  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4632128 - 4631987
Alignment:
Q  195 agtccatatcaactaattaaataattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgat 293  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||  || ||  |||||||||||| |  | |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||   |||||||    
T  4632128 agtccatatccactaattaattaattaatactctaag-tagaaatctaataaaccttattacttaatttgattactaatcaattaagacttcaaattgat 4632030  T
Q  294 aaataactaatataattattattacgatatttgcccacataat 336  Q
    |||||||||||||||||| |||   ||||| ||| ||||||||    
T  4632029 aaataactaatataattactatagagatatatgctcacataat 4631987  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Original strand, 19686551 - 19686625
Alignment:
Q  32 gctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgcc 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  19686551 gctgatttggttcgttctcaaccggtaccattatgcctcaatttctcttgggatgaggagaagagagagtttgcc 19686625  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32284620 - 32284542
Alignment:
Q  21 agttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagaga 99  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  32284620 agttagtggcgactgatttggttcttcctcgatcggtacctttaggcctcaagttttcttcagatgaggagaatagaga 32284542  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 24 - 97
Target Start/End: Original strand, 17627002 - 17627075
Alignment:
Q  24 tagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagaga 97  Q
    ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  17627002 tagcgacggctagttttgttcttcctcaaccggtacttttatgcttctagttctcttcagatggggagaagaga 17627075  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 33045185 - 33045085
Alignment:
Q  21 agttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtatt 120  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||  || ||||||||||||   | |||||||||||| || | |||| ||||||||||    
T  33045185 agttaacggcggctgatttagttctttctcaaccggtacttttatatctcaagttctcttcaatcgcggagaagagagaattcgtcgtgaacggtgtatt 33045086  T
Q  121 g 121  Q
    |    
T  33045085 g 33045085  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9237185 - 9237084
Alignment:
Q  146 aggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaact-aattaaataattaattatccaaaatagaaatctaat 244  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  9237185 aggtttccattatcccgttaattggtcatccagacatccactca--tagagtccatatcacttcaattaaataattaattatcc-caatagaaatataat 9237089  T
Q  245 tagtc 249  Q
    |||||    
T  9237088 tagtc 9237084  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 342
Target Start/End: Original strand, 532100 - 532138
Alignment:
Q  304 tataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  532100 tataattattattacgatatttgcctacataatgatatt 532138  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 127 - 322
Target Start/End: Original strand, 19686653 - 19686854
Alignment:
Q  127 tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----att 220  Q
    |||||||||||||| || ||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |  ||||| |||||||| ||||||||||    |||    
T  19686653 tttatattggatggtcagtagggtttctcattatttcgttaatgggtcatccagacatccactgct--tgagttcatatcaattaattaaatattcaatt 19686750  T
Q  221 aattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataacta---atataattattatt 316  Q
    ||||||   |  || |||| |||  |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||   ||||||||||||||    
T  19686751 aattattttat-tataaatttaac-agtcttattatttaatttgatcactaatcaattaagacacacaatcgataaatagctaattatataattattatt 19686848  T
Q  317 acgata 322  Q
    ||||||    
T  19686849 acgata 19686854  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 303 - 341
Target Start/End: Original strand, 19686866 - 19686905
Alignment:
Q  303 atataattattattacgatatttgcccac-ataatgatat 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19686866 atataattattattacgatatttgcccacaataatgatat 19686905  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 173089 - 173443
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  173089 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccagtacctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 173188  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    |||||||| |||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  173189 tttgccgtatacggtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatagaacatccggacatccactc 173288  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggct 283  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||| |     
T  173289 a--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagacc 173384  T
Q  284 cacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  173385 cacaattgataaatcgctaatataattattattacgatatttgcccacataataatatt 173443  T

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Target: scaffold0363 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 818 - 1152
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  818 tgatctgaaacacacaatagttttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacgtttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 917  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggactttatattggatggccattaggttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtcca 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||        | |  ||   ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||    
T  918 tttgccgtgtacggtgtattggggaccata--------gcctctttttttcccattatttcgttaatgggacatccgaacatccactca--ttgagccca 1007  T
Q  201 tatcaactaattaaat----aattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggctcacaattgataa 295  Q
    ||||||||||||||||    |||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  1008 tatcaactaattaaatattcaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaagactcacaattgataa 1105  T
Q  296 ataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1106 ataactaatataattattattacgatattttcccacataatgatatt 1152  T

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Target: scaffold0440 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0440
Description:

Target: scaffold0440; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 342
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1741
Alignment:
Q  1 tgatctgaaacgcacaatagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1393 tgatctgaaacacacaatagagttagcggcgactgatttggtttttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttctcttcagatggggagaagagagag 1492  T
Q  101 tttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactc 188  Q
    ||||| ||||| | | ||||||||||          ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||      ||| |||||||||||||||||    
T  1493 tttgcggtgtatgatatattggggaccatagcctcttttatattggatggccattaggattttccattattcc------gggtcatccggacatccactc 1586  T
Q  189 atgttgagtccatatcaactaattaaa----taattaattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaa-ttgataactaatcaattaaggct 283  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||     
T  1587 a--ttgagtccatatcaactaattaaatatttaattaattatcc-aattagaaatctaa-tagccttattacttaatttgatcactaatcaactaaggcc 1682  T
Q  284 cacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1683 cacaattgataaatagctaatataattattgttacgatatttacccacataataatatt 1741  T

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Target: scaffold0185 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 5792 - 5576
Alignment:
Q  127 tttatattggatggccattaggtt-cccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----atta 221  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  5792 tttatattgaatggccgttaggtttcccattattctgttaatgggtcatccgaacatccactcatattgagtccatatcaactaattaaatatttaatta 5693  T
Q  222 attatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacga 320  Q
    |||||| ||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5692 attatcgaat-tagaaatctaat-agtcatattacttaatttgatcactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattatagcga 5595  T
Q  321 tatttgcccacataatgat 339  Q
    |||||||| ||| ||||||    
T  5594 tatttgcctacaaaatgat 5576  T

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Target: scaffold0185; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 5889 - 5826
Alignment:
Q  17 atagagttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctctt 80  Q
    |||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  5889 atagggttagcgacgactaatttggttcttcctcaaccggtacatttatgcctcaagttatctt 5826  T

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Target: scaffold0064 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 127 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 14097 - 13879
Alignment:
Q  127 tttatattggatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaata----att 220  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    |||    
T  14097 tttatattggatgaccattagggtttcccattattccgttaatgggtcatccggacatccactcat--tgaatccatatcaactaattaaatatttaatt 14000  T
Q  221 aattatccaaaatagaaatctaattagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacg 319  Q
    ||||||||||  || ||||||||| ||   |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13999 aattatccaat-tacaaatctaat-agaattattacttaatttgatcactagtcaattaaggctcacgattgataaatagctaatataattattattact 13902  T
Q  320 atatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||    
T  13901 atattttcccacataatgatatt 13879  T

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Target: scaffold1114 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold1114
Description:

Target: scaffold1114; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 949 - 669
Alignment:
Q  75 tctcttcagatggggagaagagagagtttgccgtgtacggtgtattggggac----------tttatattggatggccattagg--ttcccattattccg 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |    
T  949 tctcttcagatggggagaagagagagtttgtcgtgtacagtgtattggggaccatagcctcttttatattggatgaccattagggtttcccattattctg 850  T
Q  163 ttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaat----tatccaaaatagaaatctaattagtcctattactt 258  Q
    |||||||| ||||  ||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||| |||||    ||||  |  |  ||||||||| || | ||||||||    
T  849 ttaatgggtcatctagacattcactcat--tgagtacatatcagttaattaaatatttaatcaattatctgatttt-aaatctaat-agccttattactt 754  T
Q  259 aatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatatt 342  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  753 aatttgatcactaatcaattgaggctcacaattgataaataactaatataattattattatgatattttcccacataatgatatt 669  T

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Target: scaffold1114; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 1023 - 950
Alignment:
Q  22 gttagcggcggctgatttggttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaaga 95  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1023 gttagtggcggctgatttggttcttcctcaaccgttatctttatgcctcaagttctcttcagatggggagaaga 950  T

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Target: scaffold0085 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0085
Description:

Target: scaffold0085; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 38347 - 38038
Alignment:
Q  41 gttcttcctcaaccggtacctttatgccttaagttctcttcagatggggagaagagagagt-ttgccgtgtacggtgtattggggact--------ttat 131  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||| || ||  | ||||||||||||||| |||         ||||    
T  38347 gttcttcctcaactgatacctttatgtctcaagttctcttcagatgggaagaatagagtgtattatcatgtacggtgtattggagaccataacctcttat 38248  T
Q  132 attg-gatggccattagg--ttcccattattccgttaatgggccatccggacatccactcatgttgagtccatatcaactaattaaataattaattatcc 228  Q
    | || ||||  |||||||  || | |||||||||||||| || ||||  ||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  38247 agtgtgatgatcattagggttttctattattccgttaatcggtcatctagacatccac-catattaagtccatatcaattaattaaataattaattattc 38149  T
Q  229 aaaatagaaatctaa-ttagtcctattacttaatt-gataactaatcaattaaggctcacaattgataaataactaatataattattattacgatatttg 326  Q
     || ||||||||||| |||  | | |||||||||| ||| |||| |||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |    
T  38148 gaa-tagaaatctaaattaaccttgttacttaatttgatcactattcaattaaggtttcaaattgataaataactaataaaattattattatgattttcg 38050  T
Q  327 cccacataatga 338  Q
    | ||||||||||    
T  38049 ctcacataatga 38038  T

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Target: scaffold0449 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0449
Description:

Target: scaffold0449; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 341
Target Start/End: Original strand, 1281 - 1331
Alignment:
Q  291 gataaataactaatataattattattacgatatttgcccacataatgatat 341  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1281 gataaatagctaatataattattattacgatatttgtccatataatgatat 1331  T

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