View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF5459_low_5 (Length: 246)

Name: NF5459_low_5
Description: NF5459
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF5459_low_5
NF5459_low_5
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (12-236)||(15388178-15388402)
chr4 (12-236)||(14760106-14760330)
chr4 (12-236)||(14668261-14668485)
chr4 (12-236)||(5009120-5009344)
chr4 (12-236)||(6573103-6573327)
chr4 (12-236)||(17016291-17016515)
chr4 (12-236)||(34185760-34185984)
chr4 (12-236)||(18313978-18314202)
chr4 (12-236)||(24589161-24589385)
chr4 (12-236)||(54836636-54836860)
chr4 (12-236)||(14101788-14102012)
chr4 (12-232)||(20335221-20335441)
chr4 (12-236)||(24115907-24116131)
chr4 (12-225)||(39853893-39854106)
chr4 (12-236)||(15231117-15231341)
chr4 (12-236)||(27160117-27160341)
chr4 (12-236)||(36341317-36341541)
chr4 (12-235)||(1903500-1903723)
chr4 (12-225)||(18797414-18797627)
chr4 (12-236)||(33670600-33670824)
chr4 (12-234)||(15281737-15281959)
chr4 (12-236)||(21972946-21973170)
chr4 (12-236)||(30757005-30757229)
chr4 (12-236)||(31123312-31123536)
chr4 (12-236)||(40102437-40102661)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (12-236)||(27394793-27395017)
chr2 (12-236)||(23125357-23125581)
chr2 (12-236)||(12658767-12658991)
chr2 (12-236)||(34294385-34294609)
chr2 (12-236)||(37948651-37948875)
chr2 (12-234)||(27431230-27431452)
chr2 (12-225)||(27806945-27807158)
chr2 (19-236)||(28885438-28885655)
chr2 (12-236)||(20841144-20841368)
chr2 (12-236)||(39048608-39048832)
chr2 (12-225)||(13933336-13933549)
chr2 (12-236)||(11631973-11632197)
chr2 (12-225)||(257442-257655)
chr2 (12-225)||(12590050-12590263)
chr2 (12-236)||(39893300-39893524)
chr2 (12-236)||(40236739-40236963)
chr2 (12-236)||(16826127-16826351)
chr2 (12-236)||(16895129-16895353)
chr2 (12-236)||(19413290-19413514)
chr2 (12-236)||(31879517-31879741)
chr2 (12-236)||(32053034-32053258)
chr2 (12-236)||(34864915-34865139)
chr2 (12-236)||(37380908-37381132)
chr2 (12-236)||(37682684-37682908)
chr2 (12-236)||(37697949-37698173)
chr2 (12-236)||(37928600-37928824)
chr2 (12-225)||(9346775-9346988)
chr2 (12-225)||(21673964-21674177)
chr2 (12-236)||(12713390-12713614)
chr2 (12-215)||(21699960-21700163)
chr2 (12-234)||(19453212-19453434)
chr2 (17-126)||(31890285-31890394)
chr2 (17-126)||(3785834-3785943)
chr2 (17-126)||(16164821-16164930)
chr2 (17-126)||(22924942-22925051)
chr2 (17-126)||(27779575-27779684)
chr2 (17-126)||(27819332-27819441)
chr2 (23-126)||(34158185-34158288)
chr2 (17-126)||(27119865-27119974)
chr2 (12-86)||(27827841-27827915)
chr2 (133-195)||(12383932-12383994)
chr2 (133-195)||(22949665-22949727)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (12-236)||(22077672-22077896)
chr8 (12-236)||(27605666-27605890)
chr8 (12-236)||(18793935-18794159)
chr8 (12-236)||(14560855-14561079)
chr8 (12-236)||(2134021-2134245)
chr8 (12-236)||(19691329-19691553)
chr8 (12-225)||(19205123-19205336)
chr8 (12-236)||(9357856-9358080)
chr8 (12-236)||(29832557-29832781)
chr8 (12-225)||(28358713-28358926)
chr8 (12-236)||(19677678-19677902)
chr8 (12-236)||(18712715-18712939)
chr8 (12-236)||(12089484-12089708)
chr8 (12-236)||(31357759-31357983)
chr8 (12-236)||(33261965-33262189)
chr8 (12-236)||(31486632-31486856)
chr8 (17-126)||(15770915-15771024)
chr8 (17-126)||(44564325-44564434)
chr8 (23-110)||(21344943-21345030)
chr8 (175-236)||(16286632-16286694)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (12-236)||(27287107-27287331)
chr6 (12-236)||(27022365-27022589)
chr6 (12-236)||(29552786-29553010)
chr6 (12-236)||(13295694-13295918)
chr6 (12-236)||(15421063-15421287)
chr6 (12-236)||(22931627-22931851)
chr6 (12-236)||(23854072-23854296)
chr6 (12-236)||(24866945-24867169)
chr6 (12-232)||(27626454-27626674)
chr6 (12-236)||(16677369-16677593)
chr6 (12-236)||(27179685-27179909)
chr6 (12-236)||(27269330-27269554)
chr6 (12-236)||(3699312-3699536)
chr6 (12-236)||(4760992-4761216)
chr6 (12-232)||(17089186-17089406)
chr6 (12-236)||(27010960-27011184)
chr6 (12-236)||(34461249-34461473)
chr6 (23-236)||(26921606-26921819)
chr6 (23-236)||(16753050-16753263)
chr6 (12-236)||(27060735-27060959)
chr6 (12-236)||(4528514-4528738)
chr6 (12-236)||(4542517-4542741)
chr6 (12-236)||(4720878-4721102)
chr6 (12-236)||(27488362-27488586)
chr6 (12-236)||(29504645-29504869)
chr6 (12-236)||(29576243-29576467)
chr6 (12-236)||(30554759-30554983)
chr6 (12-215)||(20171797-20172000)
chr6 (12-215)||(22163991-22164194)
chr6 (12-236)||(16940770-16940994)
chr6 (12-236)||(26113155-26113379)
chr6 (12-236)||(28210683-28210907)
chr6 (12-236)||(4776109-4776333)
chr6 (12-126)||(22455857-22455971)
chr6 (12-164)||(26992096-26992248)
chr6 (12-126)||(26775370-26775484)
chr6 (12-126)||(27358853-27358967)
chr6 (12-126)||(27449196-27449310)
chr6 (17-126)||(14142142-14142251)
chr6 (17-126)||(26789155-26789264)
chr6 (17-126)||(27197524-27197633)
chr6 (17-126)||(27251602-27251711)
chr6 (17-120)||(8902451-8902554)
chr6 (12-137)||(33373174-33373299)
chr6 (12-120)||(28163836-28163944)
chr6 (17-126)||(13520940-13521048)
chr6 (133-195)||(9136217-9136279)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (12-236)||(5593200-5593424)
chr3 (12-236)||(18054455-18054679)
chr3 (12-236)||(18273895-18274119)
chr3 (12-236)||(18289196-18289420)
chr3 (12-236)||(18304497-18304721)
chr3 (12-235)||(4793478-4793701)
chr3 (12-234)||(8286313-8286535)
chr3 (12-241)||(18333818-18334047)
chr3 (12-236)||(6205096-6205320)
chr3 (12-236)||(8299164-8299388)
chr3 (12-236)||(21677896-21678120)
chr3 (12-241)||(35883954-35884183)
chr3 (12-236)||(4686848-4687072)
chr3 (12-236)||(4724824-4725048)
chr3 (12-236)||(15737937-15738161)
chr3 (12-236)||(15889548-15889772)
chr3 (12-236)||(22384421-22384645)
chr3 (12-236)||(29145599-29145823)
chr3 (12-236)||(29661813-29662037)
chr3 (12-225)||(32442355-32442568)
chr3 (12-236)||(8214928-8215152)
chr3 (12-236)||(20069233-20069457)
chr3 (12-225)||(20573686-20573899)
chr3 (12-236)||(7076399-7076623)
chr3 (12-236)||(28112797-28113021)
chr3 (12-236)||(47026646-47026870)
chr3 (12-236)||(48469120-48469344)
chr3 (12-236)||(5606157-5606381)
chr3 (12-236)||(10399337-10399561)
chr3 (12-236)||(28342370-28342594)
chr3 (12-225)||(18245945-18246158)
chr3 (12-236)||(4343519-4343743)
chr3 (12-236)||(4420108-4420332)
chr3 (12-236)||(5016907-5017131)
chr3 (12-236)||(5470181-5470405)
chr3 (12-236)||(6539585-6539809)
chr3 (12-236)||(7999753-7999977)
chr3 (12-236)||(10646266-10646490)
chr3 (12-236)||(22867691-22867915)
chr3 (12-236)||(22882750-22882974)
chr3 (12-236)||(28024475-28024699)
chr3 (12-234)||(16621333-16621555)
chr3 (12-236)||(24331356-24331580)
chr3 (12-236)||(31961298-31961522)
chr3 (12-236)||(51785216-51785440)
chr3 (12-236)||(17981792-17982016)
chr3 (12-236)||(18228389-18228613)
chr3 (12-232)||(19697687-19697907)
chr3 (43-236)||(11107226-11107419)
chr3 (17-126)||(17992779-17992888)
chr3 (12-126)||(4627088-4627202)
chr3 (17-126)||(32293931-32294040)
chr3 (12-126)||(5714376-5714490)
chr3 (12-126)||(5725286-5725400)
chr3 (12-126)||(5766968-5767082)
chr3 (17-126)||(31033084-31033193)
chr3 (133-195)||(15592875-15592937)
chr3 (26-195)||(15918751-15918920)
chr3 (12-99)||(6963276-6963363)
chr3 (133-195)||(5950766-5950828)
chr3 (139-195)||(20443351-20443407)
chr3 (139-195)||(41440477-41440533)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (12-236)||(10913554-10913778)
chr7 (12-236)||(2157803-2158027)
chr7 (12-236)||(26534558-26534782)
chr7 (12-236)||(2106848-2107072)
chr7 (12-236)||(11421464-11421688)
chr7 (12-236)||(26271771-26271995)
chr7 (12-236)||(26438486-26438710)
chr7 (12-236)||(45390449-45390673)
chr7 (12-234)||(16515115-16515337)
chr7 (12-225)||(26516032-26516245)
chr7 (12-236)||(5131225-5131449)
chr7 (12-236)||(5144025-5144249)
chr7 (12-236)||(22145424-22145648)
chr7 (12-236)||(26316533-26316757)
chr7 (12-234)||(10844851-10845073)
chr7 (12-225)||(31561075-31561288)
chr7 (12-236)||(3448535-3448759)
chr7 (12-236)||(4141931-4142155)
chr7 (12-236)||(4202618-4202842)
chr7 (12-236)||(11444116-11444340)
chr7 (26-234)||(16044550-16044758)
chr7 (12-234)||(10842679-10842901)
chr7 (12-225)||(16748202-16748415)
chr7 (12-236)||(26666599-26666823)
chr7 (12-236)||(24589219-24589443)
chr7 (12-215)||(16446691-16446894)
chr7 (89-236)||(9621879-9622026)
chr7 (17-126)||(2776593-2776702)
chr7 (17-126)||(26512386-26512495)
chr7 (17-126)||(26681796-26681905)
chr7 (17-126)||(31127246-31127355)
chr7 (17-126)||(39209829-39209938)
chr7 (17-120)||(45734658-45734761)
chr7 (17-126)||(31087312-31087421)
chr7 (133-195)||(9469590-9469652)
chr7 (133-195)||(16393240-16393302)
chr7 (133-195)||(30369752-30369814)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (12-236)||(15655455-15655679)
chr5 (12-236)||(41677944-41678168)
chr5 (12-236)||(11552594-11552818)
chr5 (12-236)||(24973145-24973369)
chr5 (12-236)||(33295767-33295991)
chr5 (12-236)||(33780728-33780952)
chr5 (12-236)||(22995814-22996038)
chr5 (12-236)||(23629209-23629433)
chr5 (12-236)||(24684842-24685066)
chr5 (12-225)||(40470247-40470460)
chr5 (12-236)||(18372231-18372455)
chr5 (12-236)||(31434703-31434927)
chr5 (12-236)||(37355340-37355564)
chr5 (12-234)||(23895447-23895669)
chr5 (12-236)||(3792780-3793004)
chr5 (12-236)||(9320715-9320939)
chr5 (12-236)||(12135414-12135638)
chr5 (12-236)||(26483633-26483857)
chr5 (17-236)||(43081494-43081713)
chr5 (12-236)||(13321527-13321751)
chr5 (12-236)||(18497422-18497646)
chr5 (12-236)||(28652481-28652705)
chr5 (12-236)||(37767688-37767912)
chr5 (12-236)||(6877544-6877768)
chr5 (12-236)||(8662172-8662396)
chr5 (12-236)||(24586613-24586837)
chr5 (12-236)||(30032667-30032891)
chr5 (12-236)||(30155270-30155494)
chr5 (12-236)||(30171708-30171932)
chr5 (12-236)||(30937874-30938098)
chr5 (12-236)||(31823104-31823328)
chr5 (12-236)||(33519619-33519843)
chr5 (12-236)||(34619757-34619981)
chr5 (12-236)||(37668183-37668407)
chr5 (12-236)||(37758222-37758446)
chr5 (12-231)||(22891707-22891926)
chr5 (12-234)||(25203519-25203741)
chr5 (12-234)||(25267674-25267896)
chr5 (12-225)||(15755549-15755762)
chr5 (12-236)||(24727208-24727432)
chr5 (12-236)||(32592971-32593195)
chr5 (12-236)||(5641027-5641251)
chr5 (12-236)||(28956482-28956706)
chr5 (12-236)||(2514301-2514525)
chr5 (12-129)||(13439380-13439497)
chr5 (12-126)||(18125113-18125227)
chr5 (12-137)||(13183490-13183615)
chr5 (17-126)||(9547411-9547520)
chr5 (17-126)||(11326986-11327095)
chr5 (17-126)||(29887899-29888008)
chr5 (17-126)||(33878480-33878588)
chr5 (12-99)||(351912-351999)
chr5 (133-195)||(5440043-5440105)
chr5 (133-195)||(11944240-11944302)
chr5 (133-195)||(15784543-15784605)
chr5 (133-195)||(17957376-17957438)
chr5 (133-195)||(36375780-36375842)
chr5 (133-195)||(37000434-37000496)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (12-234)||(3301-3523)
scaffold0089 (98-236)||(43877-44015)
scaffold0089 (163-234)||(32096-32167)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (12-236)||(9268-9492)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (12-236)||(30525-30749)
scaffold0143 (12-234)||(19304-19526)
scaffold0143 (12-126)||(7302-7416)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (12-225)||(21894549-21894762)
chr1 (12-236)||(51641452-51641676)
chr1 (12-231)||(20339101-20339320)
chr1 (12-225)||(10965910-10966123)
chr1 (12-236)||(28588219-28588443)
chr1 (12-225)||(41790110-41790323)
chr1 (12-236)||(10948311-10948535)
chr1 (12-236)||(3644366-3644593)
chr1 (12-233)||(16204834-16205055)
chr1 (26-234)||(20464212-20464420)
chr1 (17-126)||(28153080-28153189)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (12-236)||(15813-16037)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (12-231)||(1424-1643)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (12-236)||(12803-13027)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (12-236)||(22991-23215)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (12-236)||(9254-9478)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (12-236)||(11728-11952)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (12-236)||(11181-11405)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (12-236)||(5979-6203)
scaffold0159 (164-236)||(23111-23183)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (12-234)||(9279-9501)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (12-234)||(5471-5693)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (23-226)||(43541-43754)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (128-236)||(1155-1263)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (133-195)||(35161-35223)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (12-195)||(29443-29626)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (161-222)||(33706-33770)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 15388178 - 15388402
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15388178 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 15388277  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15388278 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 15388377  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15388378 cctcggacttgcttttcggtctgtg 15388402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 14760106 - 14760330
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14760106 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 14760205  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14760206 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 14760305  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  14760306 cctctgacttgcttctcggtctgtg 14760330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14668485 - 14668261
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14668485 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 14668386  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14668385 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 14668286  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||    
T  14668285 tctctgacttgcttctcggtctgtg 14668261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5009344 - 5009120
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5009344 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5009245  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5009244 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 5009145  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5009144 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5009120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6573327 - 6573103
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  6573327 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6573228  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6573227 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 6573128  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  6573127 cctctgacttgcttctctgtctgtg 6573103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17016515 - 17016291
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  17016515 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 17016416  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17016415 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 17016316  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  17016315 cctctgacttgcttctcggtctgtg 17016291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 34185760 - 34185984
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  34185760 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 34185859  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34185860 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34185959  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  34185960 cctctgacttgcttctcggtctgtg 34185984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 18313978 - 18314202
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  18313978 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 18314077  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18314078 tacaataggctgattcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18314177  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  18314178 cctctgacttgcttctctgtctgtg 18314202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 24589161 - 24589385
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24589161 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 24589260  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24589261 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 24589360  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  24589361 cctctgacttgcttctcagtctgtg 24589385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 54836860 - 54836636
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  54836860 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 54836761  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  54836760 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaa 54836661  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  54836660 cctctgacttgcttctcggtctgtg 54836636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14102012 - 14101788
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14102012 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 14101913  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  14101912 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 14101813  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  14101812 cctctgacttgcttctctgtctgtg 14101788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Original strand, 20335221 - 20335441
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  20335221 acataatcaaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20335320  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20335321 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20335420  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtc 232  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  20335421 cctctgacttgcttctcggtc 20335441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24116131 - 24115907
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24116131 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24116032  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     || | ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24116031 tacgacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24115932  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  24115931 cctctgacttgcttctcggtctgtg 24115907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 39854106 - 39853893
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  39854106 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39854007  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||| || |  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39854006 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaagataggcccgcaggttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39853907  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  39853906 cctctgacttgctt 39853893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15231341 - 15231117
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  15231341 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 15231242  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15231241 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 15231142  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| |||||| || ||||||||||    
T  15231141 cctctgacttgtttctcggtctgtg 15231117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 27160117 - 27160341
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27160117 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27160216  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27160217 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27160316  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  27160317 cctctgacttgcttctctgtctgtg 27160341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 36341317 - 36341541
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||    
T  36341317 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggctttcatcattcca 36341416  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36341417 tacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 36341516  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| |||||| || || |||||||    
T  36341517 cctctgacttgtttctctgtctgtg 36341541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1903723 - 1903500
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||   |||||    
T  1903723 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcaacgttcca 1903624  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1903623 tacaataggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 1903524  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgt 235  Q
    |||| |||||| || |||||||||    
T  1903523 cctctgacttgtttctcggtctgt 1903500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 18797414 - 18797627
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18797414 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18797513  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18797514 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18797613  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  18797614 cctctgacttgctt 18797627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 33670600 - 33670824
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33670600 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33670699  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  33670700 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 33670799  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  33670800 cctctgacttgcttctctgtctgtg 33670824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 15281737 - 15281959
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  15281737 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 15281836  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15281837 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 15281936  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  15281937 cctctgacttgtttctcggtctg 15281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21973170 - 21972946
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  21973170 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21973071  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  21973070 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 21972971  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  21972970 cctctgacttgcttctctgtctgtg 21972946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30757229 - 30757005
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30757229 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30757130  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  30757129 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 30757030  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  30757029 cctctgacttgcttctctgtctgtg 30757005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 31123312 - 31123536
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31123312 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31123411  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31123412 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31123511  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31123512 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31123536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 40102437 - 40102661
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  40102437 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 40102536  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || || || ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  40102537 tacaacaggctggttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 40102636  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  40102637 cctctgacttgcttctctgtctgtg 40102661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27395017 - 27394793
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27395017 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 27394918  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27394917 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27394818  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27394817 cctcggacttgcttttcggtctgtg 27394793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 23125357 - 23125581
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23125357 acataatcaaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23125456  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23125457 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 23125556  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  23125557 cctctgacttgcttctcggtctgtg 23125581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12658991 - 12658767
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  12658991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12658892  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  12658891 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 12658792  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  12658791 cctctgacttgcttctcggtttgtg 12658767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34294609 - 34294385
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  34294609 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 34294510  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  34294509 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 34294410  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  34294409 cctctgacttgcttctcggtctgtg 34294385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 37948651 - 37948875
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37948651 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37948750  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  37948751 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 37948850  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  37948851 cctctgacttgcttctcggtctgtg 37948875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 27431230 - 27431452
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27431230 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27431329  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| | ||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  27431330 tacaataggctaattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 27431429  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  27431430 cctctgacttgcttctcggtctg 27431452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27807158 - 27806945
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27807158 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27807059  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27807058 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27806959  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  27806958 cctctgacttgctt 27806945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28885655 - 28885438
Alignment:
Q  19 caagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaata 118  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  28885655 caagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaata 28885556  T
Q  119 ggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcgga 218  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  28885555 ggttgattctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctga 28885456  T
Q  219 cttgcttttcggtctgtg 236  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  28885455 cttgcttctcggtctgtg 28885438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20841368 - 20841144
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  20841368 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20841269  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20841268 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20841169  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  20841168 cctctgacttgcttctcggtctgtg 20841144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 39048608 - 39048832
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  39048608 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39048707  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39048708 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39048807  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    ||||  |||||||| || |||||||    
T  39048808 cctcttacttgcttctcagtctgtg 39048832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 13933336 - 13933549
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13933336 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 13933435  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13933436 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 13933535  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  13933536 cctctgacttgctt 13933549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 11631973 - 11632197
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11631973 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11632072  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  11632073 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 11632172  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  11632173 cctctgacttgcttctctgtctgtg 11632197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 257442 - 257655
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  257442 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 257541  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  257542 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 257641  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  257642 cctctgacttgctt 257655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12590263 - 12590050
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  12590263 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 12590164  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12590163 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 12590064  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  12590063 cctctgacttgctt 12590050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 39893524 - 39893300
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  39893524 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 39893425  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39893424 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 39893325  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  39893324 cctctgacttgcttctctgtctgtg 39893300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40236963 - 40236739
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  40236963 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggcattcattattcca 40236864  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  40236863 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 40236764  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  40236763 cctctgacttgcttctctgtctgtg 40236739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 16826127 - 16826351
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16826127 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16826226  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  16826227 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16826326  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  16826327 cctctgacttgcttctctgtctgtg 16826351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16895353 - 16895129
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16895353 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16895254  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  16895253 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16895154  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  16895153 cctctgacttgcttctctgtctgtg 16895129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 19413290 - 19413514
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19413290 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19413389  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  19413390 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 19413489  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  19413490 cctctgacttgcttctctgtctgtg 19413514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31879741 - 31879517
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31879741 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31879642  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31879641 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31879542  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31879541 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31879517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 32053258 - 32053034
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  32053258 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 32053159  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  32053158 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 32053059  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  32053058 cctctgacttgcttctctgtctgtg 32053034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34865139 - 34864915
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  34865139 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 34865040  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  34865039 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 34864940  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  34864939 cctctgacttgcttctctgtctgtg 34864915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37381132 - 37380908
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37381132 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37381033  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  37381032 tacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaagtgtccgaggaaa 37380933  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| |||||| || ||||||||||    
T  37380932 cctctgacttgtttctcggtctgtg 37380908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 37682684 - 37682908
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37682684 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37682783  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37682784 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37682883  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37682884 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37682908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 37697949 - 37698173
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37697949 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37698048  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37698049 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37698148  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37698149 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37698173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37928824 - 37928600
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37928824 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37928725  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37928724 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37928625  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37928624 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37928600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 9346775 - 9346988
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9346775 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9346874  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  9346875 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 9346974  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  9346975 cctctgacttgctt 9346988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 21673964 - 21674177
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  21673964 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21674063  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  21674064 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 21674163  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  21674164 cctctgacttgctt 21674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 12713390 - 12713614
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  12713390 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12713489  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  12713490 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 12713589  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  12713590 cctctgacttgcttctctgtctgtg 12713614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 21699960 - 21700163
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  21699960 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 21700059  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21700060 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 21700159  T
Q  212 cctc 215  Q
    ||||    
T  21700160 cctc 21700163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 19453212 - 19453434
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||||| |||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  19453212 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 19453311  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19453312 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 19453411  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  19453412 cctctgacttgtttctcggtctg 19453434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 31890285 - 31890394
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31890285 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattgttccatacaa 31890384  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  31890385 taggctgatt 31890394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 3785943 - 3785834
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  3785943 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 3785844  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  3785843 taggctgatt 3785834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16164930 - 16164821
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  16164930 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 16164831  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  16164830 taggctgatt 16164821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 22924942 - 22925051
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  22924942 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 22925041  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    ||||||||||    
T  22925042 taggttgatt 22925051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27779684 - 27779575
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  27779684 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27779585  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  27779584 taggctgatt 27779575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27819441 - 27819332
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  27819441 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27819342  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  27819341 taggctgatt 27819332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 23 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 34158288 - 34158185
Alignment:
Q  23 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggtt 122  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |    
T  34158288 ggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggct 34158189  T
Q  123 gatt 126  Q
    ||||    
T  34158188 gatt 34158185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27119974 - 27119865
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  27119974 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 27119875  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  27119874 taggctgatt 27119865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27827915 - 27827841
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaa 86  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  27827915 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaa 27827841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12383994 - 12383932
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12383994 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 12383932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22949727 - 22949665
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22949727 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 22949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 22077672 - 22077896
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22077672 acataatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 22077771  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22077772 cacaataggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22077871  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22077872 cctcggacttgcttttcggtctgtg 22077896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 27605666 - 27605890
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27605666 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27605765  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27605766 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27605865  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27605866 cctctgacttgcttctcggtctgtg 27605890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18794159 - 18793935
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18794159 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18794060  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18794059 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaaacgcccgaggaaa 18793960  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  18793959 cctctgacttgcttctcggtctgtg 18793935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 14561079 - 14560855
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  14561079 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 14560980  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  14560979 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 14560880  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  14560879 cctctgacttgcttctcggtctgtg 14560855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 2134021 - 2134245
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2134021 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattcca 2134120  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2134121 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 2134220  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  2134221 cctctgacttgcttctcggtctgtg 2134245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19691553 - 19691329
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19691553 acataatcaaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19691454  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  19691453 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 19691354  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  19691353 cctctgacttgcttctcggtttgtg 19691329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 19205123 - 19205336
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19205123 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19205222  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  19205223 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 19205322  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  19205323 cctctgacttgctt 19205336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9358080 - 9357856
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9358080 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9357981  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  9357980 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 9357881  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  9357880 cctctgacttgcttctctgtctgtg 9357856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29832781 - 29832557
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29832781 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29832682  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29832681 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29832582  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  29832581 cctctgacttgcttctctgtctgtg 29832557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 28358713 - 28358926
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28358713 acataatcaaaggccttccttccgcggatgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28358812  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  28358813 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28358912  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  28358913 cctctgacttgctt 28358926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19677902 - 19677678
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19677902 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 19677803  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  19677802 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 19677703  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  19677702 cctctgacttgcttctctgtctgtg 19677678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18712939 - 18712715
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  18712939 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 18712840  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  18712839 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaa 18712740  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| |||||| || ||||||||||    
T  18712739 cctctgacttgtttctcggtctgtg 18712715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 12089484 - 12089708
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  12089484 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12089583  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  12089584 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 12089683  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  12089684 cctctgacttgcttctctgtctgtg 12089708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31357983 - 31357759
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31357983 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31357884  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||| | ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31357883 tacaacagggtggttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31357784  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31357783 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31357759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33262189 - 33261965
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33262189 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33262090  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  33262089 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 33261990  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  33261989 cctctgacttgcttctctgtctgtg 33261965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 31486632 - 31486856
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31486632 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31486731  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31486732 tacaacaggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaa 31486831  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31486832 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31486856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15771024 - 15770915
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  15771024 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 15770925  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  15770924 taggctgatt 15770915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 44564434 - 44564325
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||    
T  44564434 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttctatacaa 44564335  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  44564334 taggctgatt 44564325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 21344943 - 21345030
Alignment:
Q  23 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcc 110  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  21344943 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcc 21345030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16286694 - 16286632
Alignment:
Q  175 tatgaatcgggagatgtaattaaaacgcc-cgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    ||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16286694 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 16286632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 27287107 - 27287331
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27287107 acataatcaaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27287206  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27287207 tacaataggctgattatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27287306  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27287307 cctctgacttgcttctcggtctgtg 27287331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27022589 - 27022365
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27022589 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27022490  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27022489 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatataaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27022390  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27022389 cctctgacttgcttctcggtctgtg 27022365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29553010 - 29552786
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29553010 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29552911  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29552910 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 29552811  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  29552810 cctctgacttgcttctcagtctgtg 29552786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 13295694 - 13295918
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  13295694 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagcattcatcattcca 13295793  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13295794 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 13295893  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13295894 cctctgacttgcttctcggtctgtg 13295918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 15421063 - 15421287
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15421063 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15421162  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15421163 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15421262  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  15421263 cctctgacttgcttctcggtctgtg 15421287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 22931627 - 22931851
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  22931627 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22931726  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22931727 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22931826  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  22931827 cctctgacttgcttctcggtctgtg 22931851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 23854072 - 23854296
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  23854072 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 23854171  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23854172 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 23854271  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  23854272 cctctgacttgcttctcggtctgtg 23854296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24867169 - 24866945
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24867169 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24867070  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24867069 tacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24866970  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  24866969 cctctgacttgcttctcggtctgtg 24866945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Original strand, 27626454 - 27626674
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27626454 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27626553  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  27626554 cacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 27626653  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtc 232  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  27626654 cctctgacttgcttctcggtc 27626674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16677593 - 16677369
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16677593 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16677494  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16677493 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcagattgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 16677394  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| |||||| || || |||||||    
T  16677393 cctctgacttgtttctctgtctgtg 16677369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27179909 - 27179685
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  27179909 acataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattcca 27179810  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27179809 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27179710  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27179709 cctctgacttgcttctcggtctgtg 27179685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 27269330 - 27269554
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  27269330 acataatcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattcca 27269429  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27269430 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 27269529  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  27269530 cctctgacttgcttctcggtctgtg 27269554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3699536 - 3699312
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3699536 acatgatcaaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 3699437  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3699436 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3699337  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| |||||| || || |||||||    
T  3699336 cctctgacttgtttctctgtctgtg 3699312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4761216 - 4760992
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4761216 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4761117  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4761116 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4761017  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4761016 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4760992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Original strand, 17089186 - 17089406
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  17089186 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 17089285  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17089286 cacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 17089385  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtc 232  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  17089386 cctctgacttgcttctcggtc 17089406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27011184 - 27010960
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27011184 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27011085  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  27011084 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 27010985  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  27010984 cctctgacttgcttctctgtctgtg 27010960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 34461249 - 34461473
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  34461249 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 34461348  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34461349 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34461448  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  34461449 cctctgacttgcttctcagtctgtg 34461473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26921819 - 26921606
Alignment:
Q  23 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggtt 122  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |    
T  26921819 ggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcattattccaaacaacaggct 26921720  T
Q  123 gattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttg 222  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26921719 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttg 26921620  T
Q  223 cttttcggtctgtg 236  Q
    ||| ||||||||||    
T  26921619 cttctcggtctgtg 26921606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 23 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16753263 - 16753050
Alignment:
Q  23 ggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggtt 122  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| |    
T  16753263 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggct 16753164  T
Q  123 gattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttg 222  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  16753163 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttg 16753064  T
Q  223 cttttcggtctgtg 236  Q
     || ||||||||||    
T  16753063 tttctcggtctgtg 16753050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27060959 - 27060735
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  27060959 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 27060860  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  27060859 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaa 27060760  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  27060759 cctctgacttgcttctctgtctgtg 27060735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4528738 - 4528514
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  4528738 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatccca 4528639  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4528638 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4528539  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4528538 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4528514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 4542517 - 4542741
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4542517 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4542616  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4542617 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4542716  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4542717 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4542741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 4720878 - 4721102
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4720878 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4720977  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4720978 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4721077  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4721078 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4721102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 27488586 - 27488362
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  27488586 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 27488487  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  27488486 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 27488387  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  27488386 cctctgacttgcttctctgtctgtg 27488362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29504869 - 29504645
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29504869 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29504770  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29504769 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29504670  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  29504669 cctctgacttgcttctctgtctgtg 29504645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29576467 - 29576243
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29576467 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29576368  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  29576367 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaa 29576268  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  29576267 cctctgacttgcttctctgtctgtg 29576243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 30554759 - 30554983
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30554759 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30554858  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  30554859 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30554958  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  30554959 cctctgacttgcttctctgtctgtg 30554983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 20172000 - 20171797
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  20172000 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 20171901  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
    |||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20171900 cacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 20171801  T
Q  212 cctc 215  Q
    ||||    
T  20171800 cctc 20171797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 22163991 - 22164194
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  22163991 acataatcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 22164090  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
    |||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22164091 cacaatgggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 22164190  T
Q  212 cctc 215  Q
    ||||    
T  22164191 cctc 22164194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 16940770 - 16940994
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16940770 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16940869  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  16940870 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 16940969  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  16940970 cctctgacttgcttctctgtctgtg 16940994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 26113155 - 26113379
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26113155 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26113254  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  26113255 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 26113354  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  26113355 cctctgacttgcttctctgtctgtg 26113379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28210907 - 28210683
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28210907 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28210808  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  28210807 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 28210708  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  28210707 cctctgacttgcttctctgtctgtg 28210683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4776333 - 4776109
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4776333 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4776234  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4776233 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4776134  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4776133 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4776109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 22455857 - 22455971
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22455857 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattcca 22455956  T
Q  112 cacaataggttgatt 126  Q
    |||||||||||||||    
T  22455957 cacaataggttgatt 22455971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26992248 - 26992096
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  26992248 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 26992149  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcgg 164  Q
     | |||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  26992148 tagaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 26775370 - 26775484
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  26775370 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 26775469  T
Q  112 cacaataggttgatt 126  Q
     |||||||| |||||    
T  26775470 tacaataggctgatt 26775484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 27358853 - 27358967
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  27358853 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 27358952  T
Q  112 cacaataggttgatt 126  Q
     |||||||| |||||    
T  27358953 tacaataggctgatt 27358967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 27449196 - 27449310
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  27449196 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 27449295  T
Q  112 cacaataggttgatt 126  Q
     |||||||| |||||    
T  27449296 tacaataggctgatt 27449310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 14142142 - 14142251
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  14142142 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 14142241  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  14142242 taggctgatt 14142251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 26789264 - 26789155
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  26789264 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26789165  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  26789164 taggctgatt 26789155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27197633 - 27197524
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  27197633 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27197534  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  27197533 taggctgatt 27197524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 27251602 - 27251711
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  27251602 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 27251701  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  27251702 taggctgatt 27251711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Original strand, 8902451 - 8902554
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8902451 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaa 8902550  T
Q  117 tagg 120  Q
    ||||    
T  8902551 tagg 8902554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Original strand, 33373174 - 33373299
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33373174 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33373273  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagta 137  Q
     |||| ||| || || ||||||||||    
T  33373274 tacaacaggctggttctttctgagta 33373299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 28163944 - 28163836
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28163944 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28163845  T
Q  112 cacaatagg 120  Q
     ||||||||    
T  28163844 tacaatagg 28163836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 13520940 - 13521048
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| ||||    
T  13520940 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaa 13521038  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  13521039 taggctgatt 13521048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 9136217 - 9136279
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9136217 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 5593200 - 5593424
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5593200 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 5593299  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5593300 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 5593399  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5593400 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5593424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18054679 - 18054455
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  18054679 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 18054580  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18054579 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18054480  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  18054479 cctctgacttgcttctcggtctgtg 18054455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 18273895 - 18274119
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18273895 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18273994  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18273995 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18274094  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  18274095 cctctgacttgcttctcggtctgtg 18274119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 18289196 - 18289420
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18289196 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18289295  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18289296 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18289395  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  18289396 cctctgacttgcttctcggtctgtg 18289420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 18304497 - 18304721
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18304497 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18304596  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  18304597 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 18304696  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  18304697 cctctgacttgcttctcggtctgtg 18304721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Original strand, 4793478 - 4793701
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4793478 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4793577  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4793578 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4793677  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgt 235  Q
    |||| ||||||||| |||||||||    
T  4793678 cctctgacttgcttctcggtctgt 4793701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 8286313 - 8286535
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8286313 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8286412  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286413 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 8286512  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  8286513 cctctgacttgcttctcggtctg 8286535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 18334047 - 18333818
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18334047 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18333948  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18333947 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18333848  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtgctgct 241  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  18333847 cctctgacttgcttctcggtctgtggtgct 18333818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6205320 - 6205096
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  6205320 acataatcaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6205221  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6205220 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 6205121  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  6205120 cctctgacttgcttctcagtctgtg 6205096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8299388 - 8299164
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  8299388 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 8299289  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8299288 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 8299189  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  8299188 cctctgacttgcttctcggtctgtg 8299164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21678120 - 21677896
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  21678120 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 21678021  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21678020 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 21677921  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  21677920 cctctgacttgcttctcggtctgtg 21677896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35884183 - 35883954
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  35884183 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 35884084  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  35884083 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 35883984  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtgctgct 241  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  35883983 cctctgacttgcttctcggtctgtggtgct 35883954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4687072 - 4686848
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4687072 acataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4686973  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4686972 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4686873  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4686872 cctctgacttgcttctcagtctgtg 4686848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4725048 - 4724824
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4725048 acataatcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4724949  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4724948 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 4724849  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4724848 cctctgacttgcttctcagtctgtg 4724824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 15737937 - 15738161
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  15737937 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 15738036  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     ||| |||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15738037 tacagtaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 15738136  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  15738137 cctctgacttgcttctcggtctgtg 15738161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 15889548 - 15889772
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15889548 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15889647  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15889648 tacaataggctgattctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15889747  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  15889748 cctctgacttgcttctcggtctgtg 15889772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 22384421 - 22384645
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  22384421 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22384520  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  22384521 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgttcgaggaaa 22384620  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  22384621 cctctgacttgcttctcggtctgtg 22384645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 29145599 - 29145823
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29145599 acataatcaaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29145698  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29145699 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 29145798  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||    
T  29145799 cctctaacttgcttctcggtctgtg 29145823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 29661813 - 29662037
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  29661813 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 29661912  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  29661913 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 29662012  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  29662013 cctctgacttgcttctcggtctgtg 29662037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32442568 - 32442355
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  32442568 acataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 32442469  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||  ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32442468 tacaacagactgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 32442369  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  32442368 cctctgacttgctt 32442355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 8215152 - 8214928
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8215152 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8215053  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  8215052 cacaacaggctgattttttctgagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 8214953  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  8214952 cctctgacttgcttctctgtctgtg 8214928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20069457 - 20069233
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  20069457 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 20069358  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20069357 tacgataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 20069258  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  20069257 cctctgacttgcttctcagtctgtg 20069233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 20573686 - 20573899
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  20573686 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcctcattcca 20573785  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||| || |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20573786 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 20573885  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  20573886 cctctgacttgctt 20573899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7076623 - 7076399
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  7076623 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7076524  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  7076523 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 7076424  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  7076423 cctctgacttgcttctcggtctgtg 7076399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 28112797 - 28113021
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  28112797 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 28112896  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  28112897 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28112996  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  28112997 cctctgacttgcttctctgtctgtg 28113021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 47026870 - 47026646
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  47026870 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 47026771  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  47026770 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 47026671  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  47026670 cctctgacttgcttctctgtctgtg 47026646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 48469344 - 48469120
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  48469344 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattcca 48469245  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48469244 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 48469145  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||  |||||| || || |||||||    
T  48469144 cctatgacttgtttctctgtctgtg 48469120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 5606157 - 5606381
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5606157 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5606256  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  5606257 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5606356  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5606357 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5606381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10399561 - 10399337
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10399561 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10399462  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10399461 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 10399362  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| |||||| || || |||||||    
T  10399361 cctctgacttgtttctctgtctgtg 10399337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28342594 - 28342370
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28342594 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28342495  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  28342494 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 28342395  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  28342394 cctctgacttgcttctctgtctgtg 28342370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18246158 - 18245945
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18246158 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18246059  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  18246058 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 18245959  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  18245958 cctctgacttgctt 18245945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 4343519 - 4343743
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4343519 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4343618  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4343619 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4343718  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4343719 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4343743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4420332 - 4420108
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4420332 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4420233  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4420232 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4420133  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4420132 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4420108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5017131 - 5016907
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5017131 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5017032  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  5017031 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5016932  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5016931 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5016907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5470405 - 5470181
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5470405 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5470306  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  5470305 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5470206  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5470205 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5470181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 6539585 - 6539809
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  6539585 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 6539684  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  6539685 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6539784  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  6539785 cctctgacttgcttctctgtctgtg 6539809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 7999977 - 7999753
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  7999977 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7999878  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  7999877 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 7999778  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  7999777 cctctgacttgcttctctgtctgtg 7999753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10646490 - 10646266
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10646490 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10646391  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  10646390 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 10646291  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  10646290 cctctgacttgcttctctgtctgtg 10646266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 22867691 - 22867915
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22867691 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22867790  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  22867791 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 22867890  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  22867891 cctctgacttgcttctctgtctgtg 22867915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 22882750 - 22882974
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22882750 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22882849  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  22882850 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 22882949  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  22882950 cctctgacttgcttctctgtctgtg 22882974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28024699 - 28024475
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  28024699 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 28024600  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28024599 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 28024500  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  28024499 cctctgacttgcttctctgtctgtg 28024475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 16621333 - 16621555
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  16621333 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 16621432  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16621433 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 16621532  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  16621533 cctctgacttgtttctcggtctg 16621555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24331580 - 24331356
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  24331580 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggcattcatcattcca 24331481  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  24331480 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24331381  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  24331380 cctctgacttgcttctctgtctgtg 24331356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 31961298 - 31961522
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31961298 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31961397  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31961398 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31961497  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31961498 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31961522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 51785440 - 51785216
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  51785440 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 51785341  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  51785340 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 51785241  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  51785240 cctctgacttgcttctctgtctgtg 51785216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 17981792 - 17982016
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  17981792 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 17981891  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  17981892 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 17981991  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  17981992 cctctgacttgcttctctgtctgtg 17982016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18228613 - 18228389
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18228613 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18228514  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  18228513 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 18228414  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  18228413 cctctgacttgcttctctgtctgtg 18228389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19697907 - 19697687
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  19697907 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 19697808  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||  ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||    
T  19697807 tacaataggctgattcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 19697708  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtc 232  Q
    |||| |||||| || ||||||    
T  19697707 cctctgacttgtttctcggtc 19697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 43 - 236
Target Start/End: Original strand, 11107226 - 11107419
Alignment:
Q  43 gacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgattgtttctgagtaatttg 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||| | ||||||||||  |||    
T  11107226 gacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcttcattccatacaataggctgactctttctgagtagcttg 11107325  T
Q  143 aaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11107326 aagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 11107419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 17992779 - 17992888
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  17992779 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 17992878  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    ||||||||||    
T  17992879 taggttgatt 17992888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 4627202 - 4627088
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4627202 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4627103  T
Q  112 cacaataggttgatt 126  Q
     |||||||| |||||    
T  4627102 tacaataggctgatt 4627088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 32294040 - 32293931
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  32294040 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 32293941  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  32293940 taggctgatt 32293931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5714490 - 5714376
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  5714490 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5714391  T
Q  112 cacaataggttgatt 126  Q
     |||||||| |||||    
T  5714390 tacaataggctgatt 5714376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5725400 - 5725286
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  5725400 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5725301  T
Q  112 cacaataggttgatt 126  Q
     |||||||| |||||    
T  5725300 tacaataggctgatt 5725286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 5766968 - 5767082
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  5766968 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 5767067  T
Q  112 cacaataggttgatt 126  Q
     |||||||| |||||    
T  5767068 tacaataggctgatt 5767082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 31033084 - 31033193
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  31033084 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatataa 31033183  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  31033184 taggctgatt 31033193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 15592875 - 15592937
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    |||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15592875 gagtaatttgaatatcggcctgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaatt 15592937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15918920 - 15918751
Alignment:
Q  26 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgat 125  Q
    |||||||| ||||| ||||  || || || ||||| ||||  || ||||||||||||||||| || | |||||| || |   |||||||||||  ||| |    
T  15918920 cttccttcaactggagggatgagaatcggaggttctagcaagtactctttgatgctatcaaaagccttctggcaatcctctgtccacacaatatcttgtt 15918821  T
Q  126 tgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
      || | ||||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15918820 ctttgcggagtagtttgaatatcggtccgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaatt 15918751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 6963276 - 6963363
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggca 99  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | || |||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  6963276 acatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 6963363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 5950766 - 5950828
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5950766 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5950828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20443407 - 20443351
Alignment:
Q  139 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20443407 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaatt 20443351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 41440533 - 41440477
Alignment:
Q  139 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41440533 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaatt 41440477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 10913554 - 10913778
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  10913554 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 10913653  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10913654 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 10913753  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  10913754 cctctgacttgcttctcggtctgtg 10913778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2158027 - 2157803
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  2158027 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 2157928  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2157927 tacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 2157828  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  2157827 cctctgacttgcttctcggtctgtg 2157803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 26534558 - 26534782
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26534558 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26534657  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26534658 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26534757  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  26534758 cctctgacttgcttctcggtttgtg 26534782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 2106848 - 2107072
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  2106848 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 2106947  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  2106948 tacaataggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 2107047  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  2107048 cctctgacttgcttctcggtatgtg 2107072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 11421464 - 11421688
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  11421464 acataatcaaaggtcttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 11421563  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  11421564 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaac 11421663  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  11421664 cctctgacttgcttctcggtctgtg 11421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 26271771 - 26271995
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26271771 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattcca 26271870  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26271871 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26271970  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  26271971 cctctgacttgcttctctgtctgtg 26271995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26438710 - 26438486
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26438710 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26438611  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26438610 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 26438511  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| |||||| || ||||||||||    
T  26438510 cctctgacttgtttctcggtctgtg 26438486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 45390673 - 45390449
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  45390673 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 45390574  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  45390573 tacaacaggctgattctttctgagtagtttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 45390474  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  45390473 cctctgacttgcttctctgtctgtg 45390449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 16515115 - 16515337
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||    
T  16515115 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggcattcatcattcca 16515214  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  16515215 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 16515314  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  16515315 cctctgacttgcttctcggtctg 16515337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 26516245 - 26516032
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26516245 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26516146  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26516145 tacaataggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 26516046  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  26516045 cctctgacttgctt 26516032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5131449 - 5131225
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5131449 acataatcaaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5131350  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5131349 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 5131250  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5131249 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5131225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 5144025 - 5144249
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  5144025 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 5144124  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  5144125 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaaacgtccgaggaaa 5144224  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  5144225 cctctgacttgcttctcggtctgtg 5144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 22145648 - 22145424
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22145648 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 22145549  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  22145548 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaa 22145449  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    ||||  ||||| || ||||||||||    
T  22145448 cctctaacttgtttctcggtctgtg 22145424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 26316533 - 26316757
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26316533 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26316632  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  26316633 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 26316732  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  26316733 cctctgacttgcttctctgtctgtg 26316757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10845073 - 10844851
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  10845073 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 10844974  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10844973 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 10844874  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  10844873 cctctgacttgtttctcggtctg 10844851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 31561075 - 31561288
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31561075 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31561174  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31561175 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31561274  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  31561275 cctctgacttgctt 31561288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3448759 - 3448535
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  3448759 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 3448660  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  3448659 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 3448560  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  3448559 cctctgacttgcttctctgtctgtg 3448535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 4141931 - 4142155
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4141931 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4142030  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  4142031 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 4142130  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  4142131 cctctgacttgcttctctgtctgtg 4142155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4202842 - 4202618
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  4202842 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 4202743  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||  | ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  4202742 tacaataggctggctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 4202643  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    ||||  |||||||| || |||||||    
T  4202642 cctctaacttgcttctctgtctgtg 4202618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11444340 - 11444116
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11444340 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11444241  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  11444240 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 11444141  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  11444140 cctctgacttgcttctctgtctgtg 11444116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16044758 - 16044550
Alignment:
Q  26 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgat 125  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| ||| || || ||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  16044758 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctattaaaagcctcttggcattcatcgttccatacaataggctgat 16044659  T
Q  126 tgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 225  Q
    | || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||    
T  16044658 tcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 16044559  T
Q  226 ttcggtctg 234  Q
     ||||||||    
T  16044558 ctcggtctg 16044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 10842679 - 10842901
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  10842679 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 10842778  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  10842779 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaatcgcccgaggaaa 10842878  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    ||||  ||||| || ||||||||    
T  10842879 cctctaacttgtttctcggtctg 10842901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 16748202 - 16748415
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16748202 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 16748301  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||||||||| || |||||||  ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  16748302 tacaacaggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 16748401  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  16748402 cctctgacttgctt 16748415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 26666599 - 26666823
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26666599 acataatcaaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26666698  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     || | ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  26666699 tacgacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 26666798  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  26666799 cctctgacttgcttctctgtctgtg 26666823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 24589219 - 24589443
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24589219 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24589318  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  24589319 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24589418  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  24589419 cctctgacttgcttctctgtctgtg 24589443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 16446691 - 16446894
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  | ||||||||||  |||||    
T  16446691 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggcattcatcgttcca 16446790  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||  ||||| || |||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  16446791 tacaatagtctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcacccgaggaaa 16446890  T
Q  212 cctc 215  Q
    ||||    
T  16446891 cctc 16446894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9622026 - 9621879
Alignment:
Q  89 gcttcctggcattcattattccacacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggaga 188  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9622026 gcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagaga 9621927  T
Q  189 tgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||    
T  9621926 tgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 9621879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 2776702 - 2776593
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  2776702 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 2776603  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  2776602 taggctgatt 2776593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 26512386 - 26512495
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  26512386 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26512485  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  26512486 taggctgatt 26512495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 26681796 - 26681905
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  26681796 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 26681895  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  26681896 taggctgatt 26681905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 31127355 - 31127246
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  31127355 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 31127256  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  31127255 taggctgatt 31127246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 39209829 - 39209938
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  39209829 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 39209928  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    ||||||||||    
T  39209929 taggttgatt 39209938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 45734761 - 45734658
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  45734761 atcaaaggtcttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 45734662  T
Q  117 tagg 120  Q
    ||||    
T  45734661 tagg 45734658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 31087312 - 31087421
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  31087312 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaa 31087411  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  31087412 taggctgatt 31087421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 9469652 - 9469590
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9469652 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9469590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 16393240 - 16393302
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16393240 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 16393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 30369752 - 30369814
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30369752 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 30369814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 15655455 - 15655679
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15655455 acataatcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15655554  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     ||||| || ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15655555 tacaatgggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15655654  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  15655655 cctctgacttgcttctcggtctgtg 15655679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41678168 - 41677944
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  41678168 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 41678069  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  41678068 tacaataggctgattctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 41677969  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    ||||  |||||||| ||||||||||    
T  41677968 cctctaacttgcttctcggtctgtg 41677944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11552818 - 11552594
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11552818 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11552719  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11552718 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 11552619  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  11552618 cctctgacttgcttctcagtctgtg 11552594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24973369 - 24973145
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24973369 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattcca 24973270  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  24973269 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaagcgtccgaggaaa 24973170  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  24973169 cctctgacttgcttctcggtctgtg 24973145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33295991 - 33295767
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33295991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33295892  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33295891 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 33295792  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  33295791 cctctgacttgcttctcggtctgtg 33295767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33780952 - 33780728
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33780952 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33780853  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33780852 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 33780753  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  33780752 cctctgacttgcttctcggtctgtg 33780728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 22995814 - 22996038
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  22995814 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 22995913  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22995914 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22996013  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  22996014 cctctgacttgcttctcagtctgtg 22996038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23629433 - 23629209
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  23629433 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23629334  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23629333 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 23629234  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  23629233 cctctgacttgcttctcggtctgtg 23629209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 24684842 - 24685066
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24684842 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24684941  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24684942 tacaataggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 24685041  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  24685042 cctctgacttgcttctcggtctgtg 24685066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 40470247 - 40470460
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40470247 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 40470346  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40470347 tacaataggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 40470446  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  40470447 cctctgacttgctt 40470460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 18372231 - 18372455
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18372231 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 18372330  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  18372331 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 18372430  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  18372431 cctctgacttgcttctctgtctgtg 18372455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31434927 - 31434703
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31434927 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31434828  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31434827 tacaataggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31434728  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31434727 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31434703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 37355340 - 37355564
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37355340 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37355439  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37355440 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37355539  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37355540 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37355564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23895669 - 23895447
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||  |||||    
T  23895669 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataagcttcttggcattcatcgttcca 23895570  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  23895569 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 23895470  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  23895469 cctctgacttgtttctcggtctg 23895447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3793004 - 3792780
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3793004 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 3792905  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3792904 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3792805  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  3792804 cctctgacttgcttctctgtctgtg 3792780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9320939 - 9320715
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9320939 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9320840  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  9320839 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 9320740  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  9320739 cctctgacttgcttctctgtctgtg 9320715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12135638 - 12135414
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  12135638 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12135539  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  12135538 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 12135439  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  12135438 cctctgacttgcttctctgtctgtg 12135414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26483857 - 26483633
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  26483857 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 26483758  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  26483757 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 26483658  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  26483657 cctctgacttgcttctctgtctgtg 26483633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43081713 - 43081494
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  43081713 atcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaa 43081614  T
Q  117 taggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcg 216  Q
     ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||     
T  43081613 caggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctct 43081514  T
Q  217 gacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  43081513 gacttgcttctcggtctgtg 43081494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 13321527 - 13321751
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13321527 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 13321626  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  13321627 tacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 13321726  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  13321727 cctctgacttgcttctctgtctgtg 13321751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 18497422 - 18497646
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18497422 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 18497521  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18497522 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 18497621  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| |||||| || || |||||||    
T  18497622 cctctgacttgtttctctgtctgtg 18497646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28652705 - 28652481
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28652705 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28652606  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  28652605 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 28652506  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  28652505 cctctgacttgcttctcggtctgtg 28652481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 37767688 - 37767912
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37767688 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37767787  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37767788 tacaacaggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37767887  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37767888 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37767912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 6877768 - 6877544
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||    
T  6877768 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatccca 6877669  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  6877668 tacaacaggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6877569  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  6877568 cctctgacttgcttctctgtctgtg 6877544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 8662172 - 8662396
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  8662172 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 8662271  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  8662272 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 8662371  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  8662372 cctctgacttgcttctctgtctgtg 8662396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24586837 - 24586613
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24586837 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24586738  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  24586737 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24586638  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  24586637 cctctgacttgcttctctgtctgtg 24586613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30032891 - 30032667
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30032891 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30032792  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||| || |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  30032791 tacaataggctggttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30032692  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  30032691 cctctgacttgcttctctgtctgtg 30032667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30155494 - 30155270
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30155494 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30155395  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  30155394 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 30155295  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  30155294 cctctgacttgcttctctgtctgtg 30155270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30171932 - 30171708
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  30171932 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcactcatcattcca 30171833  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||| || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30171832 tacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 30171733  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  30171732 cctctgacttgcttctctgtctgtg 30171708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30938098 - 30937874
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||   ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  30938098 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 30937999  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30937998 tacaataggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 30937899  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  30937898 cctctgacttgcttctcggtctgtg 30937874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 31823104 - 31823328
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  31823104 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 31823203  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  31823204 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 31823303  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  31823304 cctctgacttgcttctctgtctgtg 31823328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33519843 - 33519619
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33519843 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 33519744  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  33519743 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 33519644  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  33519643 cctctgacttgcttctctgtctgtg 33519619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 34619981 - 34619757
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  34619981 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 34619882  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34619881 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 34619782  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  34619781 cctctgacttgcttctctgtctgtg 34619757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 37668183 - 37668407
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37668183 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37668282  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37668283 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37668382  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37668383 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37668407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37758446 - 37758222
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  37758446 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 37758347  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  37758346 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 37758247  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  37758246 cctctgacttgcttctctgtctgtg 37758222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22891926 - 22891707
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  22891926 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 22891827  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22891826 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 22891727  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggt 231  Q
    |||| |||||| || |||||    
T  22891726 cctctgacttgtttctcggt 22891707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25203741 - 25203519
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||| ||||  |||||    
T  25203741 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttcca 25203642  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  25203641 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 25203542  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  25203541 cctctgacttgtttctcggtctg 25203519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25267896 - 25267674
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||| ||||  |||||    
T  25267896 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttcca 25267797  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  25267796 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaa 25267697  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  25267696 cctctgacttgtttctcggtctg 25267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 15755549 - 15755762
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  15755549 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15755648  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  15755649 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 15755748  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  15755749 cctctgacttgctt 15755762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24727432 - 24727208
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  24727432 acatgatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 24727333  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  24727332 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 24727233  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  24727232 cctctgacttgcttctctgtctgtg 24727208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 32592971 - 32593195
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  32592971 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 32593070  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  32593071 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 32593170  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  32593171 cctctgacttgcttctctgtctgtg 32593195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5641251 - 5641027
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  5641251 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 5641152  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  5641151 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 5641052  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  5641051 cctctgacttgcttctctgtctgtg 5641027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 28956482 - 28956706
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  28956482 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 28956581  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| || || ||||| || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28956582 tacaataggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 28956681  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  28956682 cctctgacttgcttctctgtctgtg 28956706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 2514525 - 2514301
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||   |||||||||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  2514525 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 2514426  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  2514425 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 2514326  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  2514325 cctctgacttgcttctctgtctgtg 2514301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Original strand, 13439380 - 13439497
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  13439380 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 13439479  T
Q  112 cacaataggttgattgtt 129  Q
     |||||||| ||||||||    
T  13439480 tacaataggctgattgtt 13439497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 18125113 - 18125227
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||    
T  18125113 acataatcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttcca 18125212  T
Q  112 cacaataggttgatt 126  Q
     |||||||| |||||    
T  18125213 tacaataggctgatt 18125227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Original strand, 13183490 - 13183615
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  13183490 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggaattcatcgttcca 13183589  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagta 137  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13183590 tacaataggctgattctttctgagta 13183615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 9547411 - 9547520
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  9547411 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 9547510  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  9547511 taggctgatt 9547520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11327095 - 11326986
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  11327095 atcaaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 11326996  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    ||||||||||    
T  11326995 taggttgatt 11326986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 29887899 - 29888008
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  29887899 atcaaaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 29887998  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  29887999 taggctgatt 29888008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 33878588 - 33878480
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| ||||    
T  33878588 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaa 33878490  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  33878489 taggctgatt 33878480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 99
Target Start/End: Original strand, 351912 - 351999
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggca 99  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | || |||  |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  351912 acatgatcaaaggccttccttcaactggagggacaagaatcggaggttctaacaaataccctttgatgctatcaaaagctttctggca 351999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 5440043 - 5440105
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5440043 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5440105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 11944240 - 11944302
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11944240 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 11944302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 15784543 - 15784605
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15784543 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 15784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17957438 - 17957376
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17957438 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 17957376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 36375780 - 36375842
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36375780 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 36375842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 37000434 - 37000496
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37000434 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 37000496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3523 - 3301
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||    
T  3523 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttcca 3424  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3423 tacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 3324  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||| ||||||||| ||||||||    
T  3323 cctctgacttgcttctcggtctg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 98 - 236
Target Start/End: Original strand, 43877 - 44015
Alignment:
Q  98 cattcattattccacacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaa 197  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43877 cattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 43976  T
Q  198 aacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  43977 aacgcccgaggaaacctctgacttgcttctgggtctgtg 44015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 163 - 234
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32167
Alignment:
Q  163 ggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 32167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9492 - 9268
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  9492 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcca 9393  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9392 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 9293  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  9292 cctctgacttgcttctcggtctgtg 9268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30749 - 30525
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  30749 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 30650  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  30649 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 30550  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  30549 cctctgacttgcttctcggtctgtg 30525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19526 - 19304
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |||||    
T  19526 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttcca 19427  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  19426 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 19327  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    ||||  ||||| || ||||||||    
T  19326 cctctaacttgtttctcggtctg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 7416 - 7302
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  7416 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 7317  T
Q  112 cacaataggttgatt 126  Q
     |||||||| |||||    
T  7316 tacaataggctgatt 7302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 21894549 - 21894762
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  21894549 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 21894648  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21894649 tacaataggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaa 21894748  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  21894749 cctctgacttgctt 21894762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 51641676 - 51641452
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51641676 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattcca 51641577  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||     
T  51641576 tacaacaggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaag 51641477  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  51641476 cctctgacttgcttctctgtctgtg 51641452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 231
Target Start/End: Original strand, 20339101 - 20339320
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  20339101 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 20339200  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  20339201 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 20339300  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggt 231  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  20339301 cctctgacttgcttttcggt 20339320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10966123 - 10965910
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10966123 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10966024  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10966023 tacaacaggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 10965924  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  10965923 cctctgacttgctt 10965910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 28588443 - 28588219
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  28588443 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 28588344  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28588343 tacaacaggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaa 28588244  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  28588243 cctctgacttgcttctctgtctgtg 28588219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 41790110 - 41790323
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  41790110 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 41790209  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||     
T  41790210 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaag 41790309  T
Q  212 cctcggacttgctt 225  Q
    |||| |||||||||    
T  41790310 cctctgacttgctt 41790323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10948535 - 10948311
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  10948535 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 10948436  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  10948435 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 10948336  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  10948335 cctctgacttgcttctctgtctgtg 10948311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 3644593 - 3644366
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataat-ctttgatgctatcaaaggcttcct-ggcattcattattc 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  3644593 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttggcattcatcattc 3644494  T
Q  110 cacacaataggttgattgttt-ctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgagg 208  Q
    || |||||||| ||||| ||| || || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3644493 catacaataggctgattcttttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgagg 3644394  T
Q  209 aaacctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    ||||||| ||||||||| || |||||||    
T  3644393 aaacctctgacttgcttctctgtctgtg 3644366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 16204834 - 16205055
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||   ||||| ||||  |||||    
T  16204834 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggcagtcatcgttcca 16204933  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||    
T  16204934 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctgaggaaa 16205033  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtct 233  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  16205034 cctctgacttgcttctcggtct 16205055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20464420 - 20464212
Alignment:
Q  26 cttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgat 125  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  20464420 cttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgat 20464321  T
Q  126 tgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 225  Q
    | || |||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||    
T  20464320 tcttcctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctcagacttgttt 20464221  T
Q  226 ttcggtctg 234  Q
     ||||||||    
T  20464220 ctcggtctg 20464212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 28153189 - 28153080
Alignment:
Q  17 atcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaa 116  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  28153189 atcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaa 28153090  T
Q  117 taggttgatt 126  Q
    |||| |||||    
T  28153089 taggctgatt 28153080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 16037 - 15813
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  16037 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 15938  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15937 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaa 15838  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||    
T  15837 cctctgacttgcttctcggtctgtg 15813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 231
Target Start/End: Original strand, 1424 - 1643
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  1424 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattcca 1523  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  1524 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaa 1623  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggt 231  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  1624 cctctgacttgcttttcggt 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13027 - 12803
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13027 acatgatcaaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 12928  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  12927 tacaacaggctggttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaa 12828  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  12827 cctctgacttgcttctctgtctgtg 12803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 22991 - 23215
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  22991 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 23090  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||    
T  23091 tacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 23190  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  23191 cctctgacttgcttctctgtctgtg 23215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9478 - 9254
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  9478 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 9379  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  9378 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 9279  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  9278 cctctgacttgcttctctgtctgtg 9254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 11728 - 11952
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11728 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11827  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  11828 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 11927  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  11928 cctctgacttgcttctctgtctgtg 11952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11405 - 11181
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  11405 acataatcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattcca 11306  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  11305 tacaacaggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 11206  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  11205 cctctgacttgcttctctgtctgtg 11181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 5979 - 6203
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||||| |||||||| || || |||||||||| ||||||    
T  5979 acatgatcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatactatcaaaagcctcttggcattcatcattcca 6078  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||| ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||    
T  6079 tacaacaggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaa 6178  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||| ||||||||| || |||||||    
T  6179 cctctgacttgcttctctgtctgtg 6203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23111
Alignment:
Q  164 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 23111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9501 - 9279
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||| ||  | || |||||||  |||||    
T  9501 acataatcaaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgacattcatcgttcca 9402  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     |||||||| ||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  9401 tacaataggctgattcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaag 9302  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||| |||||| || ||||||||    
T  9301 cctctgacttgtttctcggtctg 9279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 234
Target Start/End: Original strand, 5471 - 5693
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| || | ||| ||||  |||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||    
T  5471 acatgatcaacgaccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatttca 5570  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaa 211  Q
     || | ||||||||| || |||||||  ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| |||    
T  5571 taccacaggttgatttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtggcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaaacgcccgagaaaa 5670  T
Q  212 cctcggacttgcttttcggtctg 234  Q
    |||| ||||||||| || |||||    
T  5671 cctctgacttgcttctcagtctg 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 23 - 226
Target Start/End: Original strand, 43541 - 43754
Alignment:
Q  23 ggccttccttccactggcgggacaaggata-ggtggttccagcagataatct-ttgatgctatc--aaaggcttcctggcattcatt--attccacacaa 116  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||   ||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||    
T  43541 ggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagcaggtaatttcttgatgctatacaaaaagcttcttggcattcaattaattccatacaa 43640  T
Q  117 taggt-tgattgtttctga-gtaatttgaaaattggcccgcaggtt-gcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaa-ttaaaacgcccgaggaaac 212  Q
    ||||  ||||| ||||| | |||  ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  43641 taggactgattctttctaaagtagcttgaagatcggcccgcaggtttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattttaagcgtccgaggaaac 43740  T
Q  213 ctcggacttgcttt 226  Q
    ||| ||||||||||    
T  43741 ctctgacttgcttt 43754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1155
Alignment:
Q  128 tttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattaaaacgcccgaggaaacctcggacttgctttt 227  Q
    ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |  ||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  1263 tttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctctgacttgcttct 1164  T
Q  228 cggtctgtg 236  Q
    |||||||||    
T  1163 cggtctgtg 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 195
Target Start/End: Original strand, 35161 - 35223
Alignment:
Q  133 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35161 gagtaatttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaatt 35223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29626 - 29443
Alignment:
Q  12 acatcatcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaggcttcctggcattcattattcca 111  Q
    |||| ||||| || |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| ||||  || |  || ||||| ||||| || | |||||| || | | ||||    
T  29626 acatgatcaaaggtcttccttcaactggagggataagaatcggtggttctagcaagtacttctttatgctgtcaaaagccttctggcaatcttcagtcca 29527  T
Q  112 cacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 195  Q
    |||||||  ||| || || | ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29526 cacaataccttgttttttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 29443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33706
Alignment:
Q  161 gcggtcatatgagatat-gaa-tcgggagatgtaattaaaacg-cccgaggaaacctcggacttg 222  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctctgacttg 33706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University